SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3407 FitnessBrowser__WCS417:GFF3407 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6zcvA Crystal structure of lanthanide-dependent alcohol dehydrogenase pedh from pseudomonas putida kt2440
94% identity, 95% coverage: 28:587/591 of query aligns to 1:560/562 of 6zcvA

query
sites
6zcvA
S
 
A
V
 
V
T
 
S
D
 
N
E
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
K
 
K
N
 
N
P
 
P
G
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
L
 
L
D
 
D
T
 
L
L
 
L
N
 
N
V
 
V
D
 
N
N
 
N
V
 
V
K
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
R
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
F
 
F
S
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
Q
|
Q
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
M
 
L
I
 
I
K
 
K
D
 
D
G
 
G
V
 
V
M
 
M
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
V
 
V
F
 
F
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
K
K
 
K
L
 
L
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
R
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
D
I
 
I
R
 
R
P
 
P
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
V
I
|
I
N
 
N
R
|
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
D
 
N
L
 
L
V
 
V
F
 
F
F
 
F
G
 
G
T
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
N
K
 
K
D
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
V
W
 
W
S
 
S
K
 
K
K
 
K
V
 
V
A
 
A
D
 
D
H
 
H
K
 
K
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
S
|
S
A
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
M
V
 
I
I
 
V
N
|
N
G
 
G
K
|
K
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
V
A
 
A
G
|
G
G
|
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
K
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
D
 
N
P
 
P
K
 
E
N
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
W
 
W
S
 
M
R
 
R
P
 
P
T
 
T
V
 
V
E
 
E
G
 
G
H
 
H
M
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
I
E
 
E
N
 
N
G
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
W
 
W
P
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
L
W
 
W
K
 
K
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
A
P
 
P
W
|
W
L
 
L
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
I
L
 
L
F
 
F
G
 
G
T
 
T
G
 
G
N
|
N
P
 
P
A
 
A
P
 
P
W
 
W
N
 
N
S
 
S
H
 
H
L
 
L
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
S
 
S
R
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
L
N
 
N
P
|
P
D
|
D
D
 
D
G
 
G
T
 
T
I
 
I
K
 
K
W
 
W
H
 
H
F
 
F
Q
 
Q
T
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
G
 
G
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
|
D
G
 
G
V
 
V
N
 
N
E
 
E
L
 
L
V
 
I
S
 
S
F
 
F
N
 
N
Y
 
Y
T
 
K
E
 
D
G
 
G
G
 
G
K
 
K
E
 
E
I
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
D
 
D
R
 
R
T
 
T
N
 
N
G
 
G
K
 
K
F
 
F
I
 
I
R
 
R
G
 
G
F
 
F
P
 
P
F
 
F
V
 
V
D
 
D
K
 
K
I
 
I
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
D
 
D
K
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
A
 
A
S
 
S
R
 
R
P
 
P
G
 
G
A
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
G
 
G
T
 
S
S
 
S
V
 
V
F
 
F
V
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
F
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
K
N
|
N
W
 
W
M
 
M
P
 
P
M
 
M
A
 
A
Y
 
Y
N
 
N
R
 
K
D
 
D
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
S
 
S
N
 
N
E
 
E
W
 
W
G
 
G
M
 
M
D
 
D
M
 
I
W
 
W
N
 
N
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
K
 
K
K
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
T
I
 
I
K
 
K
P
 
P
L
 
L
N
 
N
E
 
E
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
I
D
 
D
P
 
P
K
 
V
T
 
S
G
 
G
K
 
K
E
 
E
V
 
V
W
 
W
R
 
R
H
 
H
K
 
K
N
 
N
F
 
Y
A
 
A
P
 
P
L
 
L
W
|
W
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
T
 
T
K
 
K
G
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
F
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
N
 
N
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
W
 
W
E
 
E
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
S
 
S
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
V
T
 
T
W
 
W
E
 
E
M
 
M
D
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
V
 
V
L
 
V
S
 
S
G
 
G
W
 
W
G
 
G
G
|
G
A
|
A
V
 
V
P
 
P
L
 
L
W
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
K
R
 
R
I
 
V
K
 
K
D
 
D
F
 
F
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
M
 
M
L
 
L
W
 
W
T
 
T
F
 
F
K
 
K
L
 
L
P
 
P
K
 
K
E
 
Q
L
 
L

Q9Z4J7 Quinoprotein ethanol dehydrogenase; QEDH; Quinoprotein alcohol dehydrogenase (cytochrome c); Quinoprotein alcohol dehydrogenase (cytochrome c550); EC 1.1.2.8 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see 4 papers)
53% identity, 94% coverage: 29:584/591 of query aligns to 37:614/623 of Q9Z4J7

query
sites
Q9Z4J7
V
 
V
T
 
T
D
 
W
E
 
E
E
 
D
I
 
I
L
 
A
Q
 
N
D
|
D
P
 
D
K
 
K
N
x
T
P
 
T
G
 
G
Q
x
D
I
 
V
V
 
L
T
 
Q
N
 
Y
G
 
G
L
 
M
G
 
G
V
 
T
Q
 
H
G
 
A
Q
 
Q
R
 
R
Y
 
W
S
 
S
P
 
P
L
 
L
D
 
K
T
 
Q
L
 
V
N
 
N
V
 
A
D
 
D
N
 
N
V
 
V
K
 
F
E
 
K
L
 
L
R
 
T
P
 
P
V
 
A
W
 
W
A
 
S
F
 
Y
S
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
D
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
Q
x
E
A
 
S
Q
 
Q
P
 
A
M
 
I
I
 
V
K
 
S
D
 
D
G
 
G
V
 
V
M
 
I
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
G
 
A
S
 
S
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
V
 
L
F
 
F
A
 
A
V
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
K
 
R
L
 
L
W
 
W
Q
 
T
Y
 
Y
D
 
N
A
 
H
R
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
D
I
 
I
R
 
R
P
 
P
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
V
 
A
A
 
A
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
L
 
K
V
 
V
F
 
F
F
 
F
G
 
G
T
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
A
K
 
S
L
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
N
K
 
K
D
 
N
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
V
W
 
W
S
 
K
K
 
K
K
 
K
V
 
F
A
 
A
D
 
D
H
 
H
K
 
G
E
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
I
 
M
S
x
T
A
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
T
V
 
I
I
 
V
-
 
K
N
 
D
G
 
G
K
 
K
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
L
L
 
L
I
 
I
T
x
H
G
|
G
V
x
S
A
 
S
G
 
G
G
 
D
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
R
I
 
L
E
 
F
A
 
A
Y
 
R
D
 
D
P
 
P
K
 
D
N
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
E
L
 
I
W
 
W
S
 
M
R
 
R
P
 
P
T
 
F
V
 
V
E
 
E
G
 
G
H
 
H
M
 
M
G
 
G
Y
 
R
V
 
L
Y
 
-
K
 
-
D
 
N
G
 
G
K
 
K
A
 
-
V
 
-
E
 
D
N
 
S
G
 
T
I
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
D
E
 
V
A
 
K
G
 
A
K
 
P
T
 
S
W
 
W
P
 
P
G
 
D
D
 
D
L
 
R
-
 
N
-
 
S
-
 
P
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
E
-
 
S
W
 
W
K
 
S
T
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
G
A
 
A
P
 
P
W
 
W
L
 
Q
G
 
S
G
 
A
Y
 
S
Y
 
F
D
 
D
P
 
A
E
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
T
L
 
I
L
 
I
F
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
N
|
N
P
 
P
A
 
G
P
 
P
W
 
W
N
 
N
S
 
T
H
 
W
L
 
A
R
 
R
P
 
T
G
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
H
-
 
D
-
 
Y
D
 
D
N
 
S
L
 
L
Y
 
Y
S
 
T
S
 
S
S
 
G
R
 
Q
L
 
V
A
 
G
L
 
V
N
 
D
P
 
P
D
 
S
D
 
S
G
 
G
T
 
E
I
 
V
K
 
K
W
 
W
H
 
F
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
H
T
 
T
P
 
P
H
 
N
D
 
D
G
 
A
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
 
S
G
 
G
V
 
N
N
 
N
E
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
L
F
 
F
N
 
D
Y
 
Y
-
 
K
T
 
A
E
 
K
G
 
D
G
 
G
K
 
K
E
 
I
I
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
T
A
 
A
T
 
H
A
 
A
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
D
R
 
R
T
 
S
N
 
N
G
 
G
K
 
K
F
 
L
I
 
Q
R
 
N
G
 
A
F
 
F
P
 
P
F
 
F
V
 
V
D
 
D
K
 
N
I
 
I
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
S
G
 
H
L
 
I
D
 
D
-
 
L
K
 
K
D
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
V
Y
 
E
N
 
R
D
 
E
A
 
G
S
 
Q
R
 
R
P
 
P
G
 
P
A
 
L
P
 
P
G
 
E
-
 
P
S
 
G
E
 
Q
A
 
K
K
 
H
G
 
G
T
 
K
S
 
A
V
 
V
F
 
E
V
 
V
A
 
S
P
 
P
A
 
P
F
 
F
L
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
K
N
 
N
W
 
W
M
 
N
P
 
P
M
 
M
A
 
A
Y
 
Y
N
 
S
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
S
 
A
N
 
N
E
 
H
W
 
W
G
 
K
M
 
E
D
 
D
M
 
Y
W
 
W
N
 
T
E
 
E
G
 
E
I
 
V
A
 
S
Y
 
Y
K
 
T
K
 
K
G
 
G
A
 
S
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
M
G
 
G
F
 
F
T
 
R
I
 
I
K
 
K
P
 
R
L
 
M
N
 
Y
E
 
D
D
 
D
Y
 
H
I
 
V
G
 
G
V
 
S
L
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
M
D
 
D
P
 
P
K
 
V
T
 
S
G
 
G
K
 
K
E
 
V
V
 
V
W
 
W
R
 
E
H
 
H
K
 
K
N
 
E
F
 
H
A
 
L
P
 
P
L
 
L
W
|
W
G
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
A
T
 
T
K
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
F
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
G
E
 
D
G
 
G
F
 
Y
L
 
F
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
N
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
S
G
 
G
E
 
K
K
 
E
V
 
L
W
 
W
E
 
K
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
S
 
S
G
 
G
V
 
I
L
 
V
G
 
S
S
 
P
P
 
P
V
 
I
T
 
T
W
 
W
E
 
E
M
 
Q
D
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
L
S
 
G
V
 
V
L
 
T
S
 
V
G
 
G
W
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
|
A
V
 
V
P
 
P
L
 
L
W
 
W
G
 
G
G
 
G
E
 
D
V
 
M
A
 
A
K
 
D
R
 
L
I
 
T
K
 
R
D
 
P
F
 
V
N
 
A
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
M
 
S
L
 
F
W
 
W
T
 
V
F
 
F
K
 
K
L
 
L
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1flgA Crystal structure of the quinoprotein ethanol dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa (see paper)
53% identity, 94% coverage: 29:584/591 of query aligns to 3:580/582 of 1flgA

query
sites
1flgA
V
 
V
T
 
T
D
 
W
E
 
E
E
 
D
I
 
I
L
 
A
Q
 
N
D
|
D
P
 
D
K
 
K
N
x
T
P
 
T
G
 
G
Q
x
D
I
 
V
V
 
L
T
 
Q
N
 
Y
G
 
G
L
 
M
G
 
G
V
 
T
Q
 
H
G
 
A
Q
 
Q
R
 
R
Y
 
W
S
 
S
P
 
P
L
 
L
D
 
K
T
 
Q
L
 
V
N
 
N
V
 
A
D
 
D
N
 
N
V
 
V
K
 
F
E
 
K
L
 
L
R
 
T
P
 
P
V
 
A
W
 
W
A
 
S
F
 
Y
S
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
D
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
Q
x
E
A
 
S
Q
 
Q
P
 
A
M
 
I
I
 
V
K
 
S
D
 
D
G
 
G
V
 
V
M
 
I
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
G
 
A
S
 
S
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
V
 
L
F
 
F
A
 
A
V
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
K
 
R
L
 
L
W
 
W
Q
 
T
Y
 
Y
D
 
N
A
 
H
R
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
D
I
 
I
R
 
R
P
 
P
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
V
 
A
A
 
A
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
L
 
K
V
 
V
F
 
F
F
 
F
G
 
G
T
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
A
K
 
S
L
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
N
K
 
K
D
 
N
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
V
W
 
W
S
 
K
K
 
K
K
 
K
V
 
F
A
 
A
D
 
D
H
 
H
K
 
G
E
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
I
 
M
S
x
T
A
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
T
V
 
I
I
 
V
-
 
K
N
 
D
G
 
G
K
 
K
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
L
L
 
L
I
 
I
T
 
H
G
 
G
V
 
S
A
x
S
G
|
G
G
x
D
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
R
I
 
L
E
 
F
A
 
A
Y
 
R
D
 
D
P
 
P
K
 
D
N
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
E
L
 
I
W
 
W
S
 
M
R
 
R
P
 
P
T
 
F
V
 
V
E
 
E
G
 
G
H
 
H
M
 
M
G
 
G
Y
 
R
V
 
L
Y
 
-
K
 
-
D
 
N
G
 
G
K
 
K
A
 
-
V
 
-
E
 
D
N
 
S
G
 
T
I
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
D
E
 
V
A
 
K
G
 
A
K
 
P
T
 
S
W
 
W
P
 
P
G
 
D
D
 
D
L
 
R
-
 
N
-
 
S
-
 
P
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
E
-
 
S
W
 
W
K
 
S
T
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
G
A
 
A
P
 
P
W
|
W
L
 
Q
G
 
S
G
 
A
Y
 
S
Y
 
F
D
 
D
P
 
A
E
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
T
L
 
I
L
 
I
F
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
N
|
N
P
 
P
A
 
G
P
 
P
W
 
W
N
 
N
S
 
T
H
 
W
L
 
A
R
 
R
P
 
T
G
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
H
-
 
D
-
 
Y
D
 
D
N
 
S
L
 
L
Y
 
Y
S
 
T
S
 
S
S
 
G
R
 
Q
L
 
V
A
 
G
L
 
V
N
 
D
P
 
P
D
 
S
D
 
S
G
 
G
T
 
E
I
 
V
K
 
K
W
 
W
H
 
F
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
H
T
 
T
P
 
P
H
 
N
D
 
D
G
 
A
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
 
S
G
 
G
V
 
N
N
 
N
E
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
L
F
 
F
N
 
D
Y
 
Y
-
 
K
T
 
A
E
 
K
G
 
D
G
 
G
K
 
K
E
 
I
I
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
T
A
 
A
T
 
H
A
 
A
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
D
R
 
R
T
 
S
N
 
N
G
 
G
K
 
K
F
 
L
I
 
Q
R
 
N
G
 
A
F
 
F
P
 
P
F
 
F
V
 
V
D
 
D
K
 
N
I
 
I
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
S
G
 
H
L
 
I
D
 
D
-
 
L
K
 
K
D
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
V
Y
 
E
N
 
R
D
 
E
A
 
G
S
 
Q
R
 
R
P
 
P
G
 
P
A
 
L
P
 
P
G
 
E
-
 
P
S
 
G
E
 
Q
A
 
K
K
 
H
G
 
G
T
 
K
S
 
A
V
 
V
F
 
E
V
 
V
A
 
S
P
 
P
A
 
P
F
 
F
L
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
K
N
|
N
W
|
W
M
 
N
P
 
P
M
 
M
A
 
A
Y
 
Y
N
 
S
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
S
 
A
N
 
N
E
 
H
W
 
W
G
 
K
M
 
E
D
 
D
M
 
Y
W
 
W
N
 
T
E
 
E
G
 
E
I
 
V
A
 
S
Y
 
Y
K
 
T
K
 
K
G
 
G
A
 
S
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
M
G
 
G
F
 
F
T
 
R
I
 
I
K
 
K
P
 
R
L
 
M
N
 
Y
E
 
D
D
 
D
Y
 
H
I
 
V
G
 
G
V
 
S
L
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
M
D
 
D
P
 
P
K
 
V
T
 
S
G
 
G
K
 
K
E
 
V
V
 
V
W
 
W
R
 
E
H
 
H
K
 
K
N
 
E
F
 
H
A
 
L
P
 
P
L
 
L
W
|
W
G
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
A
T
 
T
K
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
F
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
G
E
 
D
G
 
G
F
 
Y
L
 
F
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
N
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
S
G
 
G
E
 
K
K
 
E
V
 
L
W
 
W
E
 
K
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
S
 
S
G
 
G
V
 
I
L
 
V
G
 
S
S
 
P
P
 
P
V
 
I
T
 
T
W
 
W
E
 
E
M
 
Q
D
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
L
S
 
G
V
 
V
L
 
T
S
 
V
G
 
G
W
 
Y
G
 
G
G
|
G
A
|
A
V
 
V
P
 
P
L
 
L
W
 
W
G
 
G
G
 
G
E
 
D
V
 
M
A
 
A
K
 
D
R
 
L
I
 
T
K
 
R
D
 
P
F
 
V
N
 
A
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
M
 
S
L
 
F
W
 
W
T
 
V
F
 
F
K
 
K
L
 
L
P
 
P

Q8GR64 Quinohemoprotein alcohol dehydrogenase ADH IIB; ADH IIB; Alcohol dehydrogenase (azurin); EC 1.1.9.1 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see 3 papers)
40% identity, 94% coverage: 7:564/591 of query aligns to 2:554/690 of Q8GR64

query
sites
Q8GR64
R
x
K
Q
x
K
P
|
P
F
x
L
A
x
R
L
x
T
S
|
S
V
x
L
L
|
L
L
x
M
G
x
L
A
x
C
I
x
L
L
x
A
L
x
T
S
x
P
G
x
L
Q
x
A
A
|
A
M
x
L
A
|
A
S
x
A
V
x
G
T
x
V
D
|
D
E
|
E
E
x
A
I
x
A
L
x
I
Q
x
R
D
x
A
P
x
T
K
x
E
N
x
Q
P
x
A
G
|
G
-
x
G
Q
x
E
I
x
W
V
x
L
T
x
S
N
x
H
G
|
G
L
x
R
G
x
T
V
x
Y
Q
x
A
G
x
E
Q
|
Q
R
|
R
Y
x
F
S
|
S
P
|
P
L
|
L
D
x
K
T
x
Q
L
x
I
N
x
D
V
x
A
D
x
S
N
|
N
V
|
V
K
x
R
E
x
S
L
|
L
R
x
G
P
x
L
V
x
A
W
|
W
A
x
Y
F
x
M
S
x
D
F
x
L
G
 
-
G
 
-
E
x
D
K
x
N
Q
x
T
R
|
R
G
|
G
Q
x
L
Q
x
E
A
|
A
Q
x
T
P
|
P
M
x
L
I
x
F
K
x
H
D
|
D
G
|
G
V
|
V
M
x
I
Y
|
Y
L
x
T
T
x
S
G
x
M
S
|
S
Y
x
W
S
|
S
R
|
R
V
|
V
F
x
I
A
|
A
V
|
V
D
|
D
A
|
A
R
x
A
T
x
S
G
|
G
K
|
K
K
x
E
L
|
L
W
|
W
Q
x
R
Y
|
Y
D
|
D
A
x
P
R
x
E
L
x
V
P
x
A
D
x
K
-
x
V
-
x
K
D
x
A
I
x
R
R
x
T
P
x
S
C
|
C
C
|
C
D
|
D
V
x
A
I
x
V
N
|
N
R
|
R
G
|
G
V
|
V
A
|
A
L
|
L
Y
x
W
G
|
G
D
|
D
L
x
K
V
|
V
F
x
Y
F
x
V
G
|
G
T
|
T
L
|
L
D
|
D
A
x
G
K
x
R
L
|
L
V
x
I
A
|
A
L
|
L
N
x
D
K
x
A
D
x
K
T
|
T
G
|
G
K
|
K
V
x
A
V
x
I
W
|
W
S
|
S
K
x
Q
K
x
Q
V
x
T
A
x
T
D
|
D
H
x
P
K
x
A
E
x
K
G
x
P
Y
|
Y
S
|
S
I
|
I
S
x
T
A
x
G
A
|
A
P
|
P
L
x
R
V
|
V
I
x
V
N
x
K
G
|
G
K
|
K
L
x
V
I
|
I
T
x
I
G
|
G
V
x
N
A
x
G
G
|
G
G
x
A
E
|
E
F
x
Y
G
|
G
V
|
V
V
x
R
G
|
G
K
x
F
I
x
V
E
x
S
A
|
A
Y
|
Y
D
|
D
P
x
A
K
x
D
N
x
T
G
|
G
E
x
K
L
|
L
L
x
A
W
|
W
S
x
R
R
x
F
P
x
Y
T
|
T
V
|
V
E
x
P
G
|
G
H
x
D
M
x
P
G
x
A
Y
x
L
V
x
P
Y
|
Y
K
x
E
D
x
H
G
x
P
K
x
E
A
x
L
V
x
R
E
 
-
N
 
-
G
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
|
E
A
|
A
G
x
A
K
|
K
T
|
T
W
|
W
P
x
Q
G
|
G
D
|
D
-
x
Q
L
x
Y
W
|
W
K
|
K
T
x
L
G
|
G
G
|
G
A
x
G
A
x
G
P
x
T
-
x
V
W
|
W
L
x
D
G
x
S
G
x
M
Y
x
A
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
E
|
E
T
x
L
N
x
D
L
|
L
L
|
L
L
x
Y
F
x
V
G
|
G
T
|
T
G
|
G
N
|
N
P
x
G
A
x
S
P
|
P
W
|
W
N
|
N
S
x
R
H
x
E
L
x
V
R
|
R
P
x
S
-
x
P
-
x
G
-
x
G
G
|
G
D
|
D
N
|
N
L
|
L
Y
|
Y
S
x
L
S
|
S
S
|
S
R
x
I
L
|
L
A
|
A
L
x
I
N
x
R
P
|
P
D
|
D
D
x
T
G
|
G
T
x
K
I
x
L
K
x
A
W
|
W
H
|
H
F
x
Y
Q
|
Q
T
x
V
T
|
T
P
|
P
H
x
G
D
|
D
G
x
S
W
|
W
D
|
D
Y
x
F
D
x
T
G
x
A
V
x
T
N
x
Q
E
x
Q
L
x
I
V
x
T
S
x
L
F
x
A
N
x
E
Y
x
L
T
x
N
E
x
I
G
x
D
G
|
G
K
|
K
E
x
P
I
x
R
K
|
K
A
x
V
A
x
L
A
x
M
T
x
Q
A
|
A
D
x
P
R
x
K
N
|
N
G
|
G
F
|
F
F
|
F
Y
|
Y
V
|
V
L
|
L
D
|
D
R
|
R
T
|
T
N
|
N
G
|
G
K
|
K
F
x
L
I
|
I
R
x
S
G
x
A
F
x
E
P
x
K
F
|
F
V
 
-
D
x
G
K
|
K
I
x
V
T
|
T
W
|
W
A
|
A
T
x
E
G
x
K
L
x
V
D
|
D
-
x
L
K
x
A
D
x
T
G
|
G
R
|
R
P
|
P
I
x
V
Y
x
E
N
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
|
A
P
|
P
G
|
G
S
x
V
E
x
R
A
x
Y
K
x
E
G
x
K
T
x
E
S
x
P
V
x
I
F
x
V
V
x
M
A
x
W
P
|
P
A
x
S
F
x
P
L
x
F
G
|
G
A
|
A
K
x
H
N
|
N
W
|
W
M
x
H
P
x
S
M
|
M
A
x
S
Y
x
F
N
|
N
R
x
P
D
x
G
T
|
T
G
|
G
L
|
L
F
x
V
Y
|
Y
V
x
I
P
|
P
S
x
Y
N
x
Q
E
|
E
W
x
V
G
x
P
M
x
G
D
x
V
M
x
Y
W
x
R
N
|
N
E
|
E
G
|
G
I
x
K
A
x
D
Y
x
F
K
x
V
K
x
T
G
x
R
A
x
K
A
|
A
F
|
F
-
x
N
L
x
T
G
x
A
A
|
A
G
|
G
F
|
F
T
x
A
I
x
D
K
x
A
P
x
T
L
x
D
N
x
V
E
x
P
D
x
A
Y
x
A
I
x
V
-
x
V
-
x
S
G
|
G
V
x
A
L
|
L
R
x
L
A
|
A
I
x
W
D
|
D
P
|
P
K
x
V
T
x
K
G
x
Q
K
|
K
E
x
A
V
x
A
W
|
W
R
x
K
H
x
V
K
x
P
N
x
Y
F
x
P
A
x
T
P
x
H
L
x
W
W
x
N
G
|
G
G
|
G
V
x
T
L
|
L
T
x
S
T
|
T
K
x
A
G
|
G
N
|
N
L
|
L
V
|
V
F
|
F
T
x
Q
G
|
G
T
|
T
P
x
A
E
x
A
G
|
G
F
x
Q
L
x
M
Q
x
H
A
|
A
F
x
Y
N
x
S
A
|
A
K
x
D
T
x
K
G
|
G
E
|
E
K
x
A
V
x
L
W
|
W
E
x
Q
F
|
F
Q
x
E
T
x
A
G
x
Q
S
|
S
G
|
G
V
x
I
L
x
V
G
x
A
S
x
A
P
|
P
V
x
M
T
|
T
W
x
F
E
|
E
M
x
L
D
x
A
G
|
G
E
x
R
Q
|
Q
Y
|
Y
V
|
V
S
x
A
V
x
I
L
x
M
S
x
A
G
|
G
W
|
W
G
|
G
G
|
G
A
x
V
V
x
A
P
x
T
L
|
L
W
x
T
G
|
G
G
|
G
E
|
E

Sites not aligning to the query:

1kv9A Structure at 1.9 a resolution of a quinohemoprotein alcohol dehydrogenase from pseudomonas putida hk5 (see paper)
41% identity, 91% coverage: 27:564/591 of query aligns to 1:532/664 of 1kv9A

query
sites
1kv9A
A
 
A
S
 
G
V
 
V
T
 
D
D
 
E
E
 
A
E
 
A
I
 
I
L
 
R
Q
 
A
D
 
T
P
 
E
K
 
Q
N
 
A
P
 
G
G
 
G
Q
 
E
I
 
W
V
 
L
T
 
S
N
 
H
G
 
G
L
 
R
G
 
T
V
 
Y
Q
 
A
G
 
E
Q
 
Q
R
 
R
Y
 
F
S
 
S
P
 
P
L
 
L
D
 
K
T
 
Q
L
 
I
N
 
D
V
 
A
D
 
S
N
 
N
V
 
V
K
 
R
E
 
S
L
 
L
R
 
G
P
 
L
V
 
A
W
 
W
A
 
Y
F
 
M
S
 
D
F
 
L
G
 
-
G
 
-
E
 
D
K
 
N
Q
 
T
R
 
R
G
 
G
Q
 
L
Q
x
E
A
 
A
Q
 
T
P
 
P
M
 
L
I
 
F
K
 
H
D
 
D
G
 
G
V
 
V
M
 
I
Y
 
Y
L
 
T
T
 
S
G
 
M
S
 
S
Y
 
W
S
 
S
R
 
R
V
 
V
F
 
I
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
R
 
A
T
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
E
L
 
L
W
 
W
Q
 
R
Y
 
Y
D
 
D
A
 
P
R
 
E
L
 
V
P
 
A
D
 
K
-
 
V
-
 
K
D
x
A
I
x
R
R
 
T
P
 
S
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
A
I
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
Y
 
W
G
 
G
D
 
D
L
 
K
V
 
V
F
 
Y
F
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
G
K
 
R
L
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
L
N
 
D
K
 
A
D
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
A
V
 
I
W
 
W
S
 
S
K
 
Q
K
 
Q
V
 
T
A
 
T
D
 
D
H
 
P
K
 
A
E
 
K
G
 
P
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
S
x
T
A
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
R
V
 
V
I
 
V
N
 
K
G
 
G
K
 
K
L
 
V
I
 
I
T
 
I
G
 
G
V
 
N
A
x
G
G
 
G
G
x
A
E
|
E
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
R
G
 
G
K
 
F
I
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
A
K
 
D
N
 
T
G
 
G
E
 
K
L
 
L
L
 
A
W
 
W
S
 
R
R
 
F
P
 
Y
T
 
T
V
 
V
E
 
P
G
 
G
H
 
D
M
 
P
G
 
A
Y
 
L
V
 
P
Y
 
Y
K
 
E
D
 
H
G
 
P
K
 
E
A
 
L
V
 
R
E
 
-
N
 
-
G
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
E
A
 
A
G
 
A
K
 
K
T
 
T
W
 
W
P
 
Q
G
 
G
D
 
D
-
 
Q
L
 
Y
W
 
W
K
 
K
T
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
G
A
 
G
P
x
T
-
 
V
W
|
W
L
 
D
G
 
S
G
 
M
Y
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
L
N
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
Y
F
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
N
|
N
P
 
G
A
 
S
P
 
P
W
 
W
N
 
N
S
 
R
H
 
E
L
 
V
R
 
R
P
 
S
-
 
P
-
 
G
-
 
G
G
 
G
D
 
D
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
S
 
L
S
 
S
S
 
S
R
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
I
N
 
R
P
 
P
D
 
D
D
 
T
G
 
G
T
 
K
I
 
L
K
 
A
W
 
W
H
 
H
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
V
T
 
T
P
 
P
H
 
G
D
 
D
G
 
S
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
 
T
G
 
A
V
 
T
N
 
Q
E
 
Q
L
 
I
V
 
T
S
 
L
F
 
A
N
 
E
Y
 
L
T
 
N
E
 
I
G
 
D
G
 
G
K
 
K
E
 
P
I
 
R
K
 
K
A
 
V
A
 
L
A
 
M
T
 
Q
A
 
A
D
 
P
R
x
K
N
 
N
G
 
G
F
 
F
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
D
 
D
R
 
R
T
 
T
N
 
N
G
 
G
K
 
K
F
 
L
I
 
I
R
 
S
G
 
A
F
 
E
P
 
K
F
 
F
V
 
-
D
 
G
K
 
K
I
 
V
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
E
G
 
K
L
 
V
D
 
D
-
 
L
K
 
A
D
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
V
Y
 
E
N
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
V
E
 
R
A
 
Y
K
 
E
G
 
K
T
 
E
S
 
P
V
 
I
F
 
V
V
 
M
A
 
W
P
 
P
A
 
S
F
 
P
L
 
F
G
 
G
A
 
A
K
 
H
N
|
N
W
|
W
M
 
H
P
 
S
M
 
M
A
 
S
Y
 
F
N
 
N
R
 
P
D
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
V
Y
 
Y
V
 
I
P
 
P
S
 
Y
N
 
Q
E
 
E
W
 
V
G
 
P
M
 
G
D
 
V
M
 
Y
W
 
R
N
 
N
E
 
E
G
 
G
I
 
K
A
 
D
Y
 
F
K
 
V
K
 
T
G
 
R
A
 
K
A
 
A
F
 
F
-
 
N
L
 
T
G
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
A
I
 
D
K
 
A
P
 
T
L
 
D
N
 
V
E
 
P
D
 
A
Y
 
A
I
 
V
-
 
V
-
 
S
G
 
G
V
 
A
L
 
L
R
 
L
A
 
A
I
 
W
D
 
D
P
 
P
K
 
V
T
 
K
G
 
Q
K
 
K
E
 
A
V
 
A
W
 
W
R
 
K
H
 
V
K
 
P
N
 
Y
F
 
P
A
 
T
P
 
H
L
x
W
W
 
N
G
 
G
G
 
G
V
 
T
L
 
L
T
 
S
T
 
T
K
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
F
 
F
T
 
Q
G
 
G
T
 
T
P
 
A
E
 
A
G
 
G
F
 
Q
L
 
M
Q
 
H
A
 
A
F
 
Y
N
 
S
A
 
A
K
 
D
T
 
K
G
 
G
E
 
E
K
 
A
V
 
L
W
 
W
E
 
Q
F
 
F
Q
 
E
T
 
A
G
 
Q
S
 
S
G
 
G
V
 
I
L
 
V
G
 
A
S
 
A
P
 
P
V
 
M
T
 
T
W
 
F
E
 
E
M
 
L
D
 
A
G
 
G
E
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
S
 
A
V
 
I
L
 
M
S
 
A
G
 
G
W
 
W
G
 
G
G
 
G
A
x
V
V
 
A
P
 
T
L
 
L
W
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
E

Sites not aligning to the query:

6damA Crystal structure of lanthanide-dependent methanol dehydrogenase xoxf from methylomicrobium buryatense 5g (see paper)
39% identity, 94% coverage: 31:584/591 of query aligns to 1:562/563 of 6damA

query
sites
6damA
D
 
N
E
 
S
E
 
E
I
 
V
L
 
E
Q
 
K
D
 
L
P
 
T
K
 
K
N
 
N
P
 
P
G
 
A
Q
 
N
I
 
W
V
 
A
T
 
T
N
 
W
G
 
G
L
 
G
G
 
N
V
 
Y
Q
 
H
G
 
G
Q
 
T
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
P
 
E
L
 
L
D
 
K
T
 
Q
L
 
I
N
 
N
V
 
T
D
 
S
N
 
N
V
 
V
K
 
K
E
 
N
L
 
L
R
 
Q
P
 
P
V
 
A
W
 
W
A
 
T
F
 
F
S
 
S
F
 
T
G
 
G
G
 
-
E
 
-
K
 
V
Q
 
L
R
 
R
G
 
G
Q
 
H
Q
x
E
A
 
G
Q
 
G
P
 
P
M
 
L
I
 
V
K
 
V
D
 
N
G
 
D
V
 
V
M
 
M
Y
 
Y
L
 
I
T
 
H
G
 
T
S
 
P
Y
 
F
-
 
P
S
 
N
R
 
T
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
V
 
I
D
 
D
A
 
Q
R
 
K
T
 
T
G
 
Q
K
 
A
K
 
V
L
 
I
W
 
W
Q
 
E
Y
 
Y
D
 
T
A
 
P
R
 
Q
L
 
Q
P
 
D
D
 
A
D
 
D
I
 
V
R
 
T
-
 
I
-
 
P
-
 
V
P
 
M
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
T
I
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
V
 
L
A
 
A
L
 
-
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
-
 
G
L
 
K
V
 
I
F
 
F
F
 
L
G
 
Q
T
 
Q
L
 
S
D
 
D
A
 
T
K
 
V
L
 
L
V
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
D
K
 
A
D
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
R
V
 
V
W
 
W
S
 
S
K
 
V
K
 
Q
V
 
N
A
 
G
D
 
D
H
 
P
K
 
K
E
 
L
G
 
G
Y
 
M
S
 
T
I
 
N
S
x
T
A
 
Q
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
N
 
K
G
 
D
K
 
K
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
I
A
x
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
R
G
 
G
K
 
F
I
 
L
E
 
A
A
 
A
Y
 
Y
D
 
N
P
 
I
K
 
R
N
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
D
W
 
W
-
 
K
-
 
G
-
 
Y
-
 
S
-
 
M
-
 
G
-
 
P
-
 
D
S
 
A
R
 
D
P
 
T
T
 
L
V
 
I
E
 
N
G
 
P
H
 
T
M
 
K
G
 
T
Y
 
T
V
 
T
Y
 
W
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
A
 
V
V
 
Q
E
 
P
N
 
V
G
 
G
I
 
K
S
 
D
G
 
S
G
 
S
E
 
T
A
 
S
G
 
-
K
 
-
T
 
T
W
 
W
P
 
E
G
 
G
D
 
D
L
 
Q
W
 
W
K
 
K
T
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
G
A
x
T
P
 
T
W
|
W
L
 
G
G
 
W
G
 
Y
Y
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
V
L
 
Y
F
 
Y
G
 
G
T
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
A
 
S
P
 
T
W
 
W
N
 
N
S
 
P
H
 
A
L
 
Q
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
L
 
K
Y
 
W
S
 
S
S
 
M
S
 
S
R
 
L
L
 
W
A
 
A
L
 
R
N
 
N
P
 
A
D
 
D
D
 
T
G
 
G
T
 
E
I
 
V
K
 
K
W
 
W
H
 
V
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
M
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
G
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
G
 
G
V
 
I
N
 
N
E
 
E
L
 
V
V
 
A
S
 
L
F
 
V
N
 
D
Y
 
Q
T
 
E
E
 
I
G
 
K
G
 
G
K
 
Q
E
 
M
I
 
R
K
 
K
A
 
T
A
 
A
A
 
V
T
 
H
A
 
F
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
F
 
G
Y
 
Y
V
 
T
L
 
L
D
 
D
R
 
R
T
 
V
N
 
T
G
 
G
K
 
E
F
 
L
I
 
L
R
 
V
G
 
A
F
 
E
P
 
K
F
 
F
V
 
D
D
 
K
K
 
A
I
 
V
T
 
N
W
 
W
A
 
A
T
 
S
G
 
H
L
 
V
D
 
D
-
 
M
K
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
Q
Y
 
V
N
 
V
D
 
S
A
 
Q
S
 
Y
R
 
S
P
 
T
G
 
E
A
 
Y
P
 
N
G
 
G
S
 
E
E
 
D
A
 
V
K
 
N
G
 
T
T
 
E
S
 
G
V
 
-
F
 
-
V
 
V
A
 
C
P
 
P
A
 
A
F
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
S
K
 
K
N
|
N
W
 
Q
M
 
Q
P
 
P
M
 
V
A
 
S
Y
 
Y
N
 
S
R
 
P
D
 
Q
T
 
T
G
 
G
L
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
V
 
I
P
 
S
S
 
G
N
 
N
E
 
H
W
 
V
G
 
C
M
 
M
D
 
D
M
 
Y
W
 
E
N
 
P
E
 
F
G
 
E
I
 
V
A
 
E
Y
 
Y
K
 
T
K
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
P
F
 
Y
L
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
T
F
 
L
T
 
S
I
 
M
K
 
F
P
 
P
L
 
A
N
 
G
E
 
K
D
 
D
Y
 
V
I
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
N
-
 
N
-
 
L
G
 
G
V
 
Q
L
 
F
R
 
T
A
 
A
I
 
W
D
 
D
P
 
A
K
 
T
T
 
T
G
 
G
K
 
K
E
 
I
V
 
I
W
 
W
R
 
S
H
 
N
K
 
K
N
 
E
F
 
Q
A
 
F
P
 
S
L
 
V
W
|
W
G
 
S
G
 
G
V
 
S
L
 
L
T
 
A
T
 
T
K
 
A
G
 
G
N
 
G
L
 
V
V
 
V
F
 
F
T
 
Y
G
 
G
T
 
T
P
 
L
E
 
E
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
F
 
V
N
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
K
K
 
E
V
 
L
W
 
Y
E
 
R
F
 
F
Q
 
K
T
 
T
G
 
P
S
 
S
G
 
G
V
 
I
L
 
I
G
 
G
S
 
N
P
 
V
V
 
N
T
 
T
W
 
W
E
 
E
M
 
Y
D
 
E
G
 
G
E
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
S
 
G
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
V
G
 
G
G
|
G
A
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
-
W
|
W
G
 
S
G
 
L
E
 
S
V
 
S
A
 
Y
K
 
T
R
 
K
I
 
L
K
 
-
D
 
-
F
 
-
N
 
-
Q
 
-
G
 
G
G
 
G
M
 
T
L
 
L
W
 
T
T
 
V
F
 
F
K
 
A
L
 
L
P
 
P

1kb0A Crystal structure of quinohemoprotein alcohol dehydrogenase from comamonas testosteroni (see paper)
39% identity, 91% coverage: 46:581/591 of query aligns to 31:563/670 of 1kb0A

query
sites
1kb0A
T
 
T
N
 
I
G
 
G
L
 
V
G
 
D
V
 
Y
Q
 
A
G
 
E
Q
 
T
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
P
 
R
L
 
L
D
 
D
T
 
Q
L
 
I
N
 
N
V
 
A
D
 
A
N
 
N
V
 
V
K
 
K
E
 
D
L
 
L
R
 
G
P
 
L
V
 
A
W
 
W
A
 
S
F
 
Y
S
 
N
F
 
L
G
 
-
G
 
-
E
 
E
K
 
S
Q
 
T
R
 
R
G
 
G
Q
 
V
Q
x
E
A
 
A
Q
 
T
P
 
P
M
 
V
I
 
V
K
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
I
M
 
M
Y
 
Y
L
 
V
T
 
S
G
 
A
S
 
S
Y
 
W
S
 
S
R
 
V
V
 
V
F
 
H
A
 
A
V
 
I
D
 
D
A
 
T
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
N
K
 
R
L
 
I
W
 
W
Q
 
T
Y
 
Y
D
 
D
A
 
P
R
 
Q
L
 
I
P
 
D
D
 
R
D
 
S
-
 
T
-
 
G
I
 
F
R
 
K
P
 
G
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
Y
 
W
G
 
K
D
 
G
L
 
K
V
 
V
F
 
Y
F
 
V
G
 
G
T
 
A
L
 
W
D
 
D
A
 
G
K
 
R
L
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
L
N
 
D
K
 
A
D
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
E
V
 
V
W
 
W
S
 
H
K
 
Q
K
 
N
V
 
T
A
 
F
D
 
E
H
 
G
K
 
Q
E
 
K
G
 
G
-
 
S
Y
 
L
S
 
T
I
 
I
S
x
T
A
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
R
V
 
V
I
 
F
N
 
K
G
 
G
K
 
K
L
 
V
I
 
I
T
 
I
G
 
G
V
 
N
A
x
G
G
|
G
G
x
A
E
|
E
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
R
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
E
 
T
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
A
K
 
E
N
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
R
L
 
K
W
 
W
S
 
R
R
 
W
P
 
F
T
 
S
V
 
V
E
 
P
G
 
G
H
 
D
M
 
P
G
 
S
Y
 
K
V
 
P
Y
 
F
K
 
E
D
 
D
G
 
E
K
 
-
A
 
-
V
 
-
E
 
-
N
 
-
G
 
-
I
 
-
S
 
S
G
 
M
G
 
K
E
 
R
A
 
A
G
 
A
K
 
R
T
 
T
W
 
W
-
 
D
-
 
P
P
 
S
G
 
G
D
 
K
L
 
W
W
 
W
K
 
E
T
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
G
A
 
G
P
x
T
-
 
M
W
|
W
L
 
D
G
 
S
G
 
M
Y
 
T
Y
 
F
D
 
D
P
 
A
E
 
E
T
 
L
N
 
N
L
 
T
L
 
M
L
 
Y
F
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
N
|
N
P
 
G
A
 
S
P
 
P
W
 
W
N
 
S
S
 
H
H
 
K
L
 
V
R
 
R
P
 
S
-
 
P
-
 
K
-
 
G
G
 
G
D
 
D
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
S
 
L
S
 
A
S
 
S
R
 
I
L
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
D
P
 
P
D
 
D
D
 
T
G
 
G
T
 
K
I
 
Y
K
 
K
W
 
W
H
 
H
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
E
T
 
T
P
 
P
H
 
G
D
 
D
G
 
N
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
T
G
 
S
V
 
T
N
 
Q
E
 
P
L
 
M
V
 
I
S
 
L
F
 
A
N
 
D
Y
 
I
T
 
K
E
 
I
G
 
A
G
 
G
K
 
K
E
 
P
I
 
R
K
 
K
A
 
V
A
 
I
A
 
L
T
 
H
A
 
A
D
 
P
R
x
K
N
 
N
G
 
G
F
 
F
F
 
F<