SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3551 FitnessBrowser__WCS417:GFF3551 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6j5xB Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from corynebacterium glutamicum in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
38% identity, 98% coverage: 1:278/283 of query aligns to 1:275/280 of 6j5xB

query
sites
6j5xB
M
 
M
K
 
R
L
 
L
A
 
A
S
 
T
F
 
I
I
 
R
V
 
T
H
 
N
G
 
G
R
 
T
T
 
T
T
 
I
Y
 
A
G
 
A
V
 
R
V
 
V
E
 
E
G
 
S
D
 
E
Q
 
N
L
 
T
I
 
A
D
 
T
L
 
T
E
 
I
S
 
E
V
 
G
K
 
F
S
 
A
T
 
N
F
 
V
G
 
G
A
 
E
D
 
L
L
 
L
K
 
Q
Q
 
E
A
 
S
-
 
N
-
 
W
-
 
R
-
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
E
N
 
N
R
 
A
L
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
A
T
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
V
P
 
T
L
 
F
A
 
E
D
 
N
V
 
K
T
 
E
F
 
L
L
 
D
P
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
P
N
 
A
P
 
P
G
 
K
K
 
K
V
 
I
L
 
V
C
 
C
I
x
V
G
|
G
I
 
L
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
T
 
N
H
|
H
V
 
I
R
 
K
E
 
E
T
 
M
G
 
G
R
 
R
D
 
D
M
 
L
P
 
P
T
 
D
Y
 
T
P
 
P
M
 
T
I
 
L
F
|
F
T
 
V
R
 
K
F
 
F
A
 
P
D
 
D
S
 
A
Q
 
L
V
 
I
A
 
G
H
 
P
L
 
F
Q
 
D
P
 
D
I
 
V
I
 
V
R
 
V
P
 
P
K
 
E
V
 
W
S
 
A
H
 
N
K
 
K
-
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
W
E
|
E
G
 
G
E
|
E
L
 
M
A
 
A
V
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
K
T
 
R
A
 
A
R
 
R
H
 
R
V
 
V
N
 
K
A
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
A
D
 
E
Y
 
Y
V
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
V
Y
 
M
N
 
N
D
|
D
G
 
Y
S
 
T
V
 
T
R
 
R
D
 
D
W
 
F
Q
 
Q
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
P
K
 
A
H
 
K
T
 
T
L
 
P
Q
 
Q
F
x
W
V
 
H
P
 
Q
G
 
G
K
|
K
N
 
S
F
 
L
P
 
E
Q
 
K
T
 
S
G
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
G
P
 
P
W
 
W
M
 
M
V
 
T
T
 
T
H
 
P
D
 
D
E
 
S
I
 
F
N
 
E
D
 
F
P
 
G
Q
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
-
L
 
-
T
 
A
T
 
T
R
 
Y
L
 
L
N
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
K
M
 
V
Q
 
Q
H
 
S
T
 
T
R
 
P
T
 
T
S
 
N
D
 
D
M
 
L
I
 
V
F
 
F
D
 
S
V
 
P
R
 
E
Q
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
C
 
I
S
 
T
T
 
H
F
 
I
T
 
Y
E
 
P
L
 
L
A
 
D
P
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
V
 
V
S
 
T
G
|
G
T
|
T
T
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
H
F
 
A
R
 
R
E
 
N
P
 
P
P
 
Q
V
 
R
W
 
Y
M
 
I
K
 
G
P
 
D
G
 
G
D
 
E
T
 
T
V
 
V
E
 
K
V
 
V
E
 
E
I
 
I
T
 
A
G
 
G
I
 
L
G
 
G
R
 
F
L
 
I
R
 
E
N
 
N
S
 
K

6j5xA Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from corynebacterium glutamicum in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
38% identity, 98% coverage: 1:278/283 of query aligns to 1:275/280 of 6j5xA

query
sites
6j5xA
M
 
M
K
 
R
L
 
L
A
 
A
S
 
T
F
 
I
I
 
R
V
 
T
H
 
N
G
 
G
R
 
T
T
 
T
T
 
I
Y
 
A
G
 
A
V
 
R
V
 
V
E
 
E
G
 
S
D
 
E
Q
 
N
L
 
T
I
 
A
D
 
T
L
 
T
E
 
I
S
 
E
V
 
G
K
 
F
S
 
A
T
 
N
F
 
V
G
 
G
A
 
E
D
 
L
L
 
L
K
 
Q
Q
 
E
A
 
S
-
 
N
-
 
W
-
 
R
-
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
E
N
 
N
R
 
A
L
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
A
T
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
V
P
 
T
L
 
F
A
 
E
D
 
N
V
 
K
T
 
E
F
 
L
L
 
D
P
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
P
N
 
A
P
 
P
G
 
K
K
 
K
V
 
I
L
 
V
C
 
C
I
 
V
G
 
G
I
 
L
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
T
 
N
H
 
H
V
 
I
R
 
K
E
 
E
T
 
M
G
 
G
R
 
R
D
 
D
M
 
L
P
 
P
T
 
D
Y
 
T
P
 
P
M
 
T
I
 
L
F
 
F
T
 
V
R
 
K
F
 
F
A
 
P
D
 
D
S
 
A
Q
 
L
V
 
I
A
 
G
H
 
P
L
 
F
Q
 
D
P
 
D
I
 
V
I
 
V
R
 
V
P
 
P
K
 
E
V
 
W
S
 
A
H
 
N
K
 
K
-
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
W
E
|
E
G
 
G
E
|
E
L
 
M
A
 
A
V
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
K
T
 
R
A
 
A
R
 
R
H
 
R
V
 
V
N
 
K
A
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
A
D
 
E
Y
 
Y
V
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
V
Y
 
M
N
 
N
D
|
D
G
 
Y
S
 
T
V
 
T
R
 
R
D
 
D
W
 
F
Q
 
Q
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
P
K
 
A
H
 
K
T
 
T
L
 
P
Q
 
Q
F
 
W
V
 
H
P
 
Q
G
 
G
K
 
K
N
 
S
F
 
L
P
 
E
Q
 
K
T
 
S
G
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
G
P
 
P
W
 
W
M
 
M
V
 
T
T
 
T
H
 
P
D
 
D
E
 
S
I
 
F
N
 
E
D
 
F
P
 
G
Q
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
-
L
 
-
T
 
A
T
 
T
R
 
Y
L
 
L
N
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
K
M
 
V
Q
 
Q
H
 
S
T
 
T
R
 
P
T
 
T
S
 
N
D
 
D
M
 
L
I
 
V
F
 
F
D
 
S
V
 
P
R
 
E
Q
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
C
 
I
S
 
T
T
 
H
F
 
I
T
 
Y
E
 
P
L
 
L
A
 
D
P
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
V
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
H
F
 
A
R
 
R
E
 
N
P
 
P
P
 
Q
V
 
R
W
 
Y
M
 
I
K
 
G
P
 
D
G
 
G
D
 
E
T
 
T
V
 
V
E
 
K
V
 
V
E
 
E
I
 
I
T
 
A
G
 
G
I
 
L
G
 
G
R
 
F
L
 
I
R
 
E
N
 
N
S
 
K

8skyB Crystal structure of yisk from bacillus subtilis in complex with oxalate (see paper)
35% identity, 100% coverage: 1:282/283 of query aligns to 1:303/303 of 8skyB

query
sites
8skyB
M
 
M
K
 
K
L
 
F
A
 
A
S
 
T
F
 
G
I
 
E
V
 
L
H
 
Y
G
 
N
R
 
R
T
 
M
T
 
F
Y
 
V
G
 
G
-
 
L
V
 
I
V
 
I
E
 
D
G
 
D
D
 
E
Q
 
K
L
 
I
I
 
M
D
 
D
L
 
L
E
 
Q
S
 
K
V
 
A
K
 
E
S
 
K
-
 
K
-
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
L
-
 
E
T
 
T
F
 
I
G
 
P
A
 
G
D
 
S
L
 
L
K
 
I
Q
 
E
A
 
C
I
 
I
A
 
A
A
 
E
N
 
G
R
 
D
L
 
K
G
 
F
E
 
V
L
 
A
T
 
H
P
 
A
A
 
R
V
 
Q
L
 
L
A
 
A
P
 
E
L
 
W
P
 
A
R
 
K
V
 
K
P
 
P
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
S
-
 
F
-
 
M
-
 
Y
-
 
S
L
 
L
A
 
S
D
 
E
V
 
V
T
 
K
F
 
L
L
 
H
P
 
A
V
 
P
I
 
I
A
 
P
N
 
K
P
 
P
G
 
S
K
 
K
-
 
N
V
 
I
L
 
I
C
 
C
I
|
I
G
|
G
I
 
K
N
 
N
Y
 
Y
A
 
R
T
 
D
H
|
H
V
 
A
R
 
I
E
 
E
T
 
M
G
 
G
R
 
S
-
 
E
-
 
A
D
 
D
M
 
I
P
 
P
T
 
E
Y
 
H
P
 
P
M
 
M
I
 
V
F
 
F
T
 
T
R
 
K
F
 
S
A
 
P
D
 
V
S
 
T
Q
 
V
V
 
T
A
 
G
H
 
H
L
 
-
Q
 
G
P
 
D
I
 
I
I
 
V
R
 
K
P
 
S
-
 
H
-
 
E
K
 
E
V
 
V
S
 
T
H
 
S
K
 
Q
L
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
G
 
G
E
|
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
G
R
 
T
H
 
R
V
 
I
N
 
S
A
 
K
A
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
Y
D
 
D
Y
 
H
V
 
V
A
 
F
G
 
G
Y
 
Y
A
 
T
C
 
I
Y
 
V
N
 
N
D
|
D
G
 
I
S
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
D
W
 
L
Q
 
Q
K
 
K
H
 
R
T
 
H
L
 
K
Q
 
Q
F
 
F
V
 
F
P
 
I
G
 
G
K
|
K
N
 
S
F
 
L
P
 
D
Q
 
T
T
 
T
G
 
C
G
 
P
F
 
M
G
 
G
P
 
P
W
 
V
M
 
L
V
 
V
T
 
H
H
 
K
D
 
S
E
 
S
I
 
I
N
 
Q
D
 
E
P
 
P
Q
 
E
E
 
R
L
 
L
E
 
K
L
 
V
T
 
E
T
 
T
R
 
R
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
M
 
R
Q
 
Q
H
 
S
T
 
G
R
 
S
T
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
M
I
 
I
F
 
F
D
 
S
V
 
I
R
 
P
Q
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
E
Y
 
T
C
 
L
S
 
S
T
 
K
F
 
G
T
 
M
E
 
T
L
 
L
A
 
E
P
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
I
 
I
V
 
A
S
 
T
G
|
G
T
|
T
T
 
P
G
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
K
F
 
G
R
 
F
E
 
T
P
 
P
P
 
P
V
 
K
W
 
F
M
 
L
K
 
R
P
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
K
V
 
I
E
 
D
V
 
I
E
 
T
I
 
I
T
 
D
G
 
P
I
 
I
G
 
G
R
 
T
L
 
L
R
 
S
N
 
N
S
 
Q
I
 
I
A
 
G
D
 
L
E
 
E

8sutA Crystal structure of yisk from bacillus subtilis in complex with reaction product 4-hydroxy-2-oxoglutaric acid (see paper)
35% identity, 99% coverage: 1:280/283 of query aligns to 2:302/303 of 8sutA

query
sites
8sutA
M
 
M
K
 
K
L
 
F
A
 
A
S
 
T
F
 
G
I
 
E
V
 
L
H
 
Y
G
 
N
R
 
R
T
 
M
T
 
F
Y
 
V
G
 
G
-
 
L
V
 
I
V
 
I
E
 
D
G
 
D
D
 
E
Q
 
K
L
 
I
I
 
M
D
 
D
L
 
L
E
 
Q
S
 
K
V
 
A
K
 
E
S
 
K
-
 
K
-
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
L
-
 
E
T
 
T
F
 
I
G
 
P
A
 
G
D
 
S
L
 
L
K
 
I
Q
 
E
A
 
C
I
 
I
A
 
A
A
 
E
N
 
G
R
 
D
L
 
K
G
 
F
E
 
V
L
 
A
T
 
H
P
 
A
A
 
R
V
 
Q
L
 
L
A
 
A
P
 
E
L
 
W
P
 
A
R
 
K
V
 
K
P
 
P
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
S
-
 
F
-
 
M
-
 
Y
-
 
S
L
 
L
A
 
S
D
 
E
V
 
V
T
 
K
F
 
L
L
 
H
P
 
A
V
 
P
I
 
I
A
 
P
N
 
K
P
 
P
G
 
S
K
 
K
-
 
N
V
 
I
L
 
I
C
 
C
I
|
I
G
|
G
I
x
K
N
 
N
Y
 
Y
A
 
R
T
 
D
H
|
H
V
 
A
R
 
I
E
 
E
T
 
M
G
 
G
R
 
S
-
 
E
-
 
A
D
 
D
M
 
I
P
 
P
T
 
E
Y
 
H
P
 
P
M
 
M
I
 
V
F
|
F
T
 
T
R
 
K
F
 
S
A
 
P
D
 
V
S
 
T
Q
 
V
V
 
T
A
 
G
H
 
H
L
 
-
Q
 
G
P
 
D
I
 
I
I
 
V
R
 
K
P
 
S
-
 
H
-
 
E
K
 
E
V
 
V
S
 
T
H
 
S
K
 
Q
L
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
G
 
G
E
|
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
G
R
 
T
H
 
R
V
 
I
N
 
S
A
 
K
A
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
Y
D
 
D
Y
 
H
V
 
V
A
 
F
G
 
G
Y
 
Y
A
 
T
C
 
I
Y
 
V
N
 
N
D
|
D
G
 
I
S
 
T
V
 
A
R
|
R
D
 
D
W
 
L
Q
|
Q
K
 
K
H
 
R
T
 
H
L
 
K
Q
 
Q
F
 
F
V
 
F
P
 
I
G
 
G
K
|
K
N
 
S
F
 
L
P
 
D
Q
 
T
T
 
T
G
 
C
G
 
P
F
 
M
G
 
G
P
 
P
W
 
V
M
 
L
V
 
V
T
 
H
H
 
K
D
 
S
E
 
S
I
 
I
N
 
Q
D
 
E
P
 
P
Q
 
E
E
 
R
L
 
L
E
 
K
L
 
V
T
 
E
T
 
T
R
 
R
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
M
 
R
Q
 
Q
H
 
S
T
 
G
R
 
S
T
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
M
I
 
I
F
 
F
D
 
S
V
 
I
R
 
P
Q
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
E
Y
 
T
C
 
L
S
 
S
T
 
K
F
 
G
T
 
M
E
 
T
L
 
L
A
 
E
P
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
I
 
I
V
 
A
S
 
T
G
|
G
T
|
T
T
 
P
G
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
K
F
 
G
R
 
F
E
 
T
P
 
P
P
 
P
V
 
K
W
 
F
M
 
L
K
 
R
P
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
K
V
 
I
E
 
D
V
 
I
E
 
T
I
 
I
T
 
D
G
 
P
I
 
I
G
 
G
R
 
T
L
 
L
R
 
S
N
 
N
S
 
Q
I
 
I
A
 
G

8gstC Crystal structure of l-2,4-diketo-3-deoxyrhamnonate hydrolase from sphingomonas sp. (Pyruvate bound-form) (see paper)
37% identity, 99% coverage: 2:281/283 of query aligns to 7:280/290 of 8gstC

query
sites
8gstC
K
 
K
L
 
F
A
 
C
S
 
R
F
 
F
I
 
G
V
 
Q
H
 
R
G
 
G
R
 
Q
T
 
E
T
 
K
Y
 
P
G
 
G
V
 
I
V
 
I
E
 
D
G
 
A
D
 
D
Q
 
G
L
 
N
I
 
I
-
 
R
D
 
D
L
 
L
E
 
S
S
 
G
V
 
V
K
 
V
S
 
P
T
 
E
F
 
L
G
 
T
A
 
I
D
 
D
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
N
 
A
R
 
K
L
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
G
A
 
A
V
 
D
L
 
I
A
 
A
P
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
L
V
 
V
P
 
E
L
 
G
A
 
E
D
 
P
V
 
R
T
 
Y
F
 
G
L
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
-
A
 
K
N
 
G
P
 
I
G
 
G
K
 
K
V
 
I
L
 
V
C
 
A
I
|
I
G
|
G
I
 
L
N
 
N
Y
 
Y
A
 
E
T
 
D
H
|
H
V
 
A
R
 
I
E
 
E
T
 
S
G
 
N
R
 
L
D
 
P
M
 
I
P
 
P
T
 
T
Y
 
E
P
 
P
M
 
M
I
 
M
F
 
F
T
 
M
R
 
K
F
 
A
A
 
L
D
 
S
S
 
S
Q
 
L
V
 
N
A
 
G
H
 
P
L
 
N
Q
 
D
P
 
E
I
 
V
I
 
V
R
 
L
P
 
P
K
 
K
V
 
N
S
 
S
H
 
T
K
 
H
L
 
G
D
 
D
F
 
W
E
|
E
G
 
V
E
|
E
L
 
L
A
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
E
T
 
T
A
 
C
R
 
R
H
 
F
V
 
V
N
 
S
A
 
E
A
 
D
D
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
S
Y
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
V
C
 
L
Y
 
V
N
 
N
D
|
D
G
 
V
S
 
S
V
 
E
R
 
R
D
 
F
W
 
N
Q
 
Q
K
 
K
H
 
Q
T
 
R
-
 
G
L
 
T
Q
 
Q
F
 
W
V
 
S
P
 
K
G
 
G
K
|
K
N
 
G
F
 
H
P
 
D
Q
 
T
T
 
F
G
 
C
G
 
P
F
 
V
G
 
G
P
 
P
W
 
W
M
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
P
D
 
D
E
 
E
I
 
V
N
 
G
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
E
 
D
L
 
L
E
 
D
L
 
V
T
 
H
T
 
L
R
 
D
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
R
M
 
M
Q
 
Q
H
 
T
T
 
G
R
 
N
T
 
T
S
 
K
D
 
T
M
 
M
I
 
I
F
 
F
D
 
N
V
 
V
R
 
A
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
S
Y
 
Y
C
 
V
S
 
S
T
 
E
F
 
Y
T
 
I
E
 
T
L
 
L
A
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
L
I
 
M
V
 
I
S
 
T
G
|
G
T
 
T
T
 
P
G
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
E
F
 
G
R
 
K
E
 
K
P
 
P
-
 
Q
P
 
A
V
 
I
W
 
Y
M
 
L
K
 
K
P
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
V
V
 
M
E
 
E
V
 
L
E
 
G
I
 
I
T
 
E
G
 
K
I
 
L
G
 
G
R
 
T
L
 
Q
R
 
R
N
 
Q
S
 
Q
I
 
V
A
 
S
D
 
E

8gsrA Crystal structure of l-2,4-diketo-3-deoxyrhamnonate hydrolase from sphingomonas sp. (Apo-form) (see paper)
37% identity, 99% coverage: 2:281/283 of query aligns to 7:280/290 of 8gsrA

query
sites
8gsrA
K
 
K
L
 
F
A
 
C
S
 
R
F
 
F
I
 
G
V
 
Q
H
 
R
G
 
G
R
 
Q
T
 
E
T
 
K
Y
 
P
G
 
G
V
 
I
V
 
I
E
 
D
G
 
A
D
 
D
Q
 
G
L
 
N
I
 
I
-
 
R
D
 
D
L
 
L
E
 
S
S
 
G
V
 
V
K
 
V
S
 
P
T
 
E
F
 
L
G
 
T
A
 
I
D
 
D
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
N
 
A
R
 
K
L
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
G
A
 
A
V
 
D
L
 
I
A
 
A
P
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
L
V
 
V
P
 
E
L
 
G
A
 
E
D
 
P
V
 
R
T
 
Y
F
 
G
L
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
-
A
 
K
N
 
G
P
 
I
G
 
G
K
 
K
V
 
I
L
 
V
C
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
L
N
 
N
Y
 
Y
A
 
E
T
 
D
H
 
H
V
 
A
R
 
I
E
 
E
T
 
S
G
 
N
R
 
L
D
 
P
M
 
I
P
 
P
T
 
T
Y
 
E
P
 
P
M
 
M
I
 
M
F
 
F
T
 
M
R
 
K
F
 
A
A
 
L
D
 
S
S
 
S
Q
 
L
V
 
N
A
 
G
H
 
P
L
 
N
Q
 
D
P
 
E
I
 
V
I
 
V
R
 
L
P
 
P
K
 
K
V
 
N
S
 
S
H
 
T
K
 
H
L
 
G
D
 
D
F
 
W
E
|
E
G
 
V
E
|
E
L
 
L
A
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
E
T
 
T
A
 
C
R
 
R
H
 
F
V
 
V
N
 
S
A
 
E
A
 
D
D
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
S
Y
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
V
C
 
L
Y
 
V
N
 
N
D
|
D
G
 
V
S
 
S
V
 
E
R
 
R
D
 
F
W
 
N
Q
 
Q
K
 
K
H
 
Q
T
 
R
-
 
G
L
 
T
Q
 
Q
F
 
W
V
 
S
P
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
G
F
 
H
P
 
D
Q
 
T
T
 
F
G
 
C
G
 
P
F
 
V
G
 
G
P
 
P
W
 
W
M
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
P
D
 
D
E
 
E
I
 
V
N
 
G
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
E
 
D
L
 
L
E
 
D
L
 
V
T
 
H
T
 
L
R
 
D
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
R
M
 
M
Q
 
Q
H
 
T
T
 
G
R
 
N
T
 
T
S
 
K
D
 
T
M
 
M
I
 
I
F
 
F
D
 
N
V
 
V
R
 
A
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
S
Y
 
Y
C
 
V
S
 
S
T
 
E
F
 
Y
T
 
I
E
 
T
L
 
L
A
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
L
I
 
M
V
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
P
G
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
E
F
 
G
R
 
K
E
 
K
P
 
P
-
 
Q
P
 
A
V
 
I
W
 
Y
M
 
L
K
 
K
P
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
V
V
 
M
E
 
E
V
 
L
E
 
G
I
 
I
T
 
E
G
 
K
I
 
L
G
 
G
R
 
T
L
 
Q
R
 
R
N
 
Q
S
 
Q
I
 
V
A
 
S
D
 
E

6iymA Fumarylacetoacetate hydrolase (eafah) from psychrophilic exiguobacterium antarcticum (see paper)
35% identity, 99% coverage: 1:279/283 of query aligns to 2:274/277 of 6iymA

query
sites
6iymA
M
 
M
K
 
K
L
 
W
A
 
F
S
 
R
F
 
F
I
 
E
V
 
Q
H
 
D
G
 
G
R
 
R
T
 
A
T
 
R
Y
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
E
E
 
E
G
 
A
D
 
G
Q
 
H
L
 
R
I
 
Y
D
 
D
-
 
V
-
 
T
-
 
P
-
 
Q
-
 
V
-
 
Y
-
 
T
-
 
D
-
 
S
-
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
V
V
 
I
K
 
V
S
 
R
T
 
G
F
 
F
G
 
E
A
 
M
D
 
D
L
 
V
K
 
D
Q
 
L
A
 
D
I
 
V
A
 
A
A
 
P
N
 
R
R
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
L
T
 
T
P
 
D
A
 
H
V
 
V
L
 
R
A
 
L
P
 
L
L
 
A
P
 
P
R
 
Y
V
 
L
P
 
P
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
T
 
-
F
 
-
L
 
-
P
 
-
V
 
-
I
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
P
G
 
R
K
 
N
V
 
V
L
 
I
C
 
C
I
 
V
G
 
G
I
 
K
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
T
 
D
H
 
H
V
 
I
R
 
K
E
 
E
T
 
M
G
 
D
R
 
T
D
 
A
M
 
G
P
 
A
T
 
G
Y
 
K
P
 
F
M
 
V
I
 
L
F
 
F
T
 
T
R
 
K
F
 
A
A
 
P
D
 
S
S
 
S
Q
 
I
V
 
V
A
 
G
H
 
P
L
 
F
Q
 
D
P
 
P
I
 
I
I
 
E
R
 
R
-
 
H
P
 
A
K
 
D
V
 
L
S
 
T
H
 
Q
K
 
Q
L
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
G
 
G
E
|
E
L
 
L
A
 
A
V
 
I
V
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
T
T
 
T
A
 
G
R
 
R
H
 
D
V
 
L
N
 
T
A
 
P
A
 
E
D
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
E
Y
 
H
V
 
V
A
 
F
G
 
G
Y
 
Y
A
 
S
C
 
I
Y
 
I
N
 
N
D
|
D
G
 
V
S
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
D
W
 
L
Q
 
Q
K
 
K
H
 
E
T
 
H
L
 
V
Q
 
Q
F
 
F
V
 
F
P
 
R
G
 
G
K
 
K
N
 
S
F
 
L
P
 
D
Q
 
G
T
 
F
G
 
C
G
 
P
F
 
F
G
 
G
P
 
P
W
 
V
M
 
I
V
 
V
T
 
T
H
 
E
D
 
D
E
 
A
I
 
F
N
 
-
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
E
 
D
L
 
V
E
 
L
L
 
V
T
 
E
T
 
T
R
 
R
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
M
 
R
Q
 
Q
H
 
S
T
 
G
R
 
S
T
 
T
S
 
K
D
 
L
M
 
M
I
 
L
F
 
R
D
 
D
V
 
V
R
 
V
Q
 
T
L
 
I
I
 
L
E
 
T
Y
 
E
C
 
V
S
 
S
T
 
R
F
 
G
T
 
M
E
 
T
L
 
L
A
 
E
P
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
V
 
A
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
P
G
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
H
F
 
G
R
 
M
E
 
K
P
 
P
P
 
P
V
 
V
W
 
Y
M
 
L
K
 
Q
P
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
V
V
 
I
E
 
D
V
 
V
E
 
S
I
 
I
T
 
E
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
H
L
 
L
R
 
Q
N
 
N
S
 
Q
I
 
V

6v77B Crystal structure of a putative hpce protein from mycobacterium smegmatis
38% identity, 92% coverage: 16:275/283 of query aligns to 12:271/279 of 6v77B

query
sites
6v77B
V
 
L
V
 
V
E
 
T
G
 
G
D
 
D
Q
 
G
L
 
V
I
 
V
D
 
D
L
 
V
-
 
A
E
 
K
S
 
A
V
 
S
K
 
E
S
 
Q
T
 
R
F
 
F
G
 
G
-
 
P
-
 
D
-
 
P
A
 
Q
D
 
D
L
 
L
K
 
Y
Q
 
Q
A
 
H
I
 
W
A
 
D
A
 
A
N
 
F
R
 
Q
L
 
E
G
 
W
E
 
A
L
 
R
T
 
T
P
 
A
A
 
A
V
 
L
L
 
P
A
 
A
P
 
P
L
 
S
P
 
A
R
 
R
V
 
V
P
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
G
T
 
T
F
 
I
L
 
G
P
 
S
V
 
P
I
 
A
A
 
P
N
 
L
P
 
P
G
 
R
K
 
Q
V
 
V
L
 
F
C
 
A
I
 
V
G
 
G
I
 
L
N
 
N
Y
 
Y
A
 
D
T
 
D
H
 
H
V
 
A
R
 
T
E
 
E
T
 
S
G
 
G
R
 
L
D
 
S
M
 
K
P
 
P
T
 
E
Y
 
H
P
 
P
M
 
V
I
 
I
F
 
F
T
 
T
R
 
K
F
 
F
A
 
V
D
 
S
S
 
S
Q
 
I
V
 
T
A
 
G
H
 
P
L
 
V
Q
 
E
P
 
T
I
 
V
I
 
Q
R
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
G
S
 
S
H
 
-
K
 
-
L
 
V
D
 
D
F
 
W
E
|
E
G
 
V
E
|
E
L
 
L
A
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
M
G
 
G
K
 
R
T
 
G
A
 
G
R
 
R
H
 
N
V
 
I
N
 
P
A
 
E
A
 
D
D
 
R
A
 
A
L
 
W
D
 
E
Y
 
F
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
V
A
 
S
C
 
V
Y
 
G
N
 
Q
D
|
D
G
 
L
S
 
S
V
 
E
R
 
R
D
 
D
W
 
L
Q
 
Q
-
 
L
-
 
A
K
 
G
H
 
P
T
 
A
L
 
P
Q
 
Q
F
 
F
V
 
S
P
 
L
G
 
A
K
 
K
N
 
S
F
 
H
P
 
A
Q
 
G
T
 
F
G
 
S
G
 
P
F
 
I
G
 
G
P
 
P
W
 
E
M
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
L
N
 
P
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
L
T
 
G
T
 
A
R
 
E
L
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
T
M
 
V
Q
 
Q
H
 
H
T
 
S
R
 
R
T
 
T
S
 
S
D
 
Q
M
 
L
I
 
I
F
 
F
D
 
P
V
 
V
R
 
S
Q
 
N
L
 
L
I
 
I
E
 
A
Y
 
Y
C
 
L
S
 
S
T
 
D
F
 
T
T
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
V
 
F
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
P
G
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
M
F
 
G
R
 
R
E
 
N
P
 
P
P
 
K
V
 
R
W
 
F
M
 
L
K
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
E
V
 
L
E
 
R
V
 
T
E
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
E
L
 
F

3qdfA Crystal structure of 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase from mycobacterium marinum (see paper)
42% identity, 78% coverage: 60:279/283 of query aligns to 49:247/252 of 3qdfA

query
sites
3qdfA
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
R
F
 
L
L
 
L
-
 
A
P
 
P
V
 
I
I
 
L
A
 
A
N
 
S
P
 
-
G
 
-
K
 
K
V
 
V
L
 
V
C
 
C
I
 
V
G
 
G
I
 
K
N
 
N
Y
 
Y
A
 
T
T
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
M
 
-
P
 
P
T
 
A
Y
 
D
P
 
P
M
 
V
I
 
I
F
 
F
T
 
L
R
 
K
F
 
P
A
 
N
D
 
T
S
 
A
Q
 
I
V
 
V
A
 
G
H
 
P
L
 
N
Q
 
V
P
 
P
I
 
I
I
 
R
R
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
N
S
 
A
H
 
S
K
 
P
L
 
V
D
 
H
F
 
F
E
|
E
G
 
G
E
|
E
L
 
L
A
 
A
V
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
R
T
 
P
A
 
C
R
 
K
H
 
D
V
 
V
N
 
S
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
V
D
 
D
Y
 
N
V
 
I
A
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
T
C
 
I
Y
 
G
N
 
N
D
|
D
G
 
V
S
 
S
V
 
A
R
 
R
D
 
D
W
 
Q
Q
 
Q
K
 
K
H
 
S
T
 
D
L
 
G
Q
 
Q
F
 
W
V
 
T
P
 
R
G
 
A
K
 
K
N
 
G
F
 
H
P
 
D
Q
 
T
T
 
F
G
 
C
G
 
P
F
 
V
G
 
G
P
 
P
W
 
W
M
 
I
V
 
V
T
 
T
H
 
D
D
 
-
E
 
-
I
 
-
N
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
E
 
D
L
 
L
E
|
E
L
 
L
T
 
R
T
 
T
R
 
E
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
A
V
 
V
M
 
K
Q
 
Q
H
|
H
T
 
A
R
 
R
T
 
T
S
 
S
D
 
L
M
 
M
I
 
I
F
 
H
D
 
D
V
 
V
R
 
G
Q
 
A
L
 
I
I
 
V
E
 
E
Y
 
W
C
 
I
S
 
S
T
 
A
F
 
V
T
 
M
E
 
T
L
 
L
A
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
L
I
 
I
V
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
P
G
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
P
F
 
I
R
 
E
E
 
D
P
 
-
P
 
-
V
 
-
W
 
-
M
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
G
D
 
D
T
 
T
V
 
V
E
 
S
V
 
I
E
 
T
I
 
I
T
 
E
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
T
L
 
L
R
 
T
N
 
N
S
 
P
I
 
V

3r6oA Crystal structure of a probable 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1, 7- dioateisomerase from mycobacterium abscessus (see paper)
33% identity, 93% coverage: 22:283/283 of query aligns to 15:264/265 of 3r6oA

query
sites
3r6oA
L
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
D
E
 
D
S
 
T
V
 
V
K
 
A
S
 
P
T
 
L
F
 
A
G
 
P
A
 
M
D
 
S
L
 
A
K
 
R
Q
 
E
A
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
L
N
 
-
R
 
-
L
 
L
G
 
P
E
 
Q
L
 
I
T
 
S
P
 
P
A
 
L
V
 
I
L
 
S
A
 
D
P
 
E
L
 
L
P
 
-
R
 
-
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
D
D
 
S
V
 
V
T
 
A
F
 
L
L
 
G
P
 
A
V
 
P
I
 
I
A
 
P
N
 
E
P
 
P
G
 
G
K
 
Q
V
 
V
L
 
I
C
 
A
I
 
L
G
 
G
I
 
F
N
 
N
Y
 
Y
A
 
P
T
 
T
H
 
H
V
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
M
 
-
P
 
-
T
 
-
Y
 
D
P
 
P
M
 
V
I
 
V
F
 
F
T
 
M
R
 
K
F
 
S
A
 
P
D
 
T
S
 
S
Q
 
I
V
 
S
A
 
G
H
 
P
L
 
R
Q
 
D
P
 
A
I
 
V
I
 
I
R
 
A
P
 
P
K
 
R
V
 
T
S
 
S
H
 
H
K
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
G
 
I
E
|
E
L
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
K
T
 
P
A
 
G
R
 
Y
H
 
R
V
 
I
N
 
E
A
 
R
A
 
S
D
 
Q
A
 
A
L
 
I
D
 
K
Y
 
H
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
M
C
 
L
Y
 
A
N
 
N
D
|
D
G
 
I
S
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
D
-
 
V
-
 
A
W
 
L
Q
 
P
K
 
F
H
 
G
T
 
Q
L
 
A
Q
 
Q
F
 
V
V
 
V
P
 
R
G
 
G
K
 
K
N
 
G
F
 
Y
P
 
P
Q
 
T
T
 
F
G
 
C
G
 
P
F
 
T
G
 
G
P
 
P
W
 
W
M
 
L
V
 
F
T
 
T
H
 
T
D
 
G
E
 
S
I
 
D
N
 
T
D
 
T
P
 
F
Q
 
E
E
 
T
L
 
F
E
 
D
L
 
F
T
 
E
T
 
L
R
 
R
L
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
M
 
R
Q
 
Q
H
 
S
T
 
G
R
 
S
T
 
T
S
 
V
D
 
D
M
 
M
I
 
T
F
 
L
D
 
G
V
 
F
R
 
A
Q
 
E
L
 
V
I
 
V
E
 
E
Y
 
T
C
 
V
S
 
S
T
 
A
F
 
T
T
 
I
E
 
A
L
 
L
A
 
R
P
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
I
 
I
V
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
C
G
 
G
A
 
F
F
 
Q
R
 
F
E
 
D
P
 
P
P
 
P
V
 
R
W
 
Y
M
 
L
K
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
A
E
 
H
I
 
S
T
 
A
G
 
K
I
 
L
G
 
G
R
 
K
L
 
M
R
 
R
N
 
L
S
 
P
I
 
V
A
 
H
D
 
D
E
 
E
Q
 
K

1gttA Crystal structure of hpce (see paper)
37% identity, 65% coverage: 67:250/283 of query aligns to 215:392/421 of 1gttA

query
sites
1gttA
L
 
F
P
 
P
V
 
T
I
 
L
A
 
P
N
 
H
P
 
P
-
 
H
G
 
G
K
 
T
V
 
L
L
 
F
C
 
A
I
 
L
G
 
G
I
 
L
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
T
 
D
H
 
H
V
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
M
 
-
P
 
P
T
 
E
Y
 
E
P
 
P
M
 
L
I
 
V
F
 
F
T
 
L
R
 
K
F
 
A
A
 
P
D
 
N
S
 
T
Q
 
L
V
 
T
A
 
G
H
 
D
L
 
N
Q
 
Q
P
 
T
I
 
S
I
 
V
R
 
R
P
 
P
K
 
N
V
 
N
S
 
I
H
 
E
K
 
Y
L
 
M
D
 
H
F
 
Y
E
|
E
G
 
A
E
|
E
L
 
L
A
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
K
T
 
Q
A
 
A
R
 
R
H
 
N
V
 
V
N
 
S
A
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
M
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
T
C
 
V
Y
 
C
N
 
N
D
|
D
G
 
Y
S
 
A
V
 
I
R
 
R
D
 
D
W
 
Y
Q
 
L
K
 
E
H
 
N
T
 
-
L
 
-
Q
 
Y
F
 
Y
V
 
R
P
 
P
G
 
N
K
 
L
N
 
R
F
 
V
P
 
K
Q
 
S
T
 
R
G
 
D
G
 
G
F
 
L
G
 
T
P
 
P
W
 
M
M
 
L
V
 
S
T
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
P
H
 
K
D
 
E
E
 
A
I
 
I
N
 
P
D
 
D
P
 
P
Q
 
H
E
 
N
L
 
L
E
 
T
L
 
L
T
 
R
T
 
T
R
 
F
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
M
 
R
Q
 
Q
H
 
Q
T
 
G
R
 
T
T
 
T
S
 
A
D
 
D
M
 
L
I
 
I
F
 
F
D
 
S
V
 
V
R
 
P
Q
 
F
L
 
L
I
 
I
E
 
A
Y
 
Y
C
 
L
S
 
S
T
 
E
F
 
F
T
 
M
E
 
T
L
 
L
A
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
M
I
 
I
V
 
A
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
P
G
 
K
G
 
G
V
 
L
G
 
S

4dbhA Crystal structure of cg1458 with inhibitor (see paper)
37% identity, 78% coverage: 60:281/283 of query aligns to 49:268/269 of 4dbhA

query
sites
4dbhA
P
 
P
L
 
L
A
 
K
D
 
D
V
 
V
T
 
R
F
 
L
L
 
L
-
 
A
P
 
P
V
 
M
I
 
L
A
 
-
N
 
-
P
 
P
G
 
S
K
 
K
V
 
V
L
 
V
C
 
A
I
 
I
G
|
G
I
x
R
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
T
 
D
H
|
H
V
 
V
R
 
A
E
 
E
-
 
V
-
 
F
-
 
K
-
 
K
T
 
S
G
 
A
R
 
E
D
 
S
M
 
L
P
 
P
T
 
-
Y
 
-
P
 
P
M
 
T
I
 
L
F
|
F
T
 
L
R
 
K
F
 
P
A
 
P
D
 
T
S
 
A
Q
 
V
V
 
T
A
 
G
H
 
P
L
 
E
Q
 
S
P
 
P
I
 
I
I
 
R
R
 
I
P
 
P
K
 
S
V
 
F
S
 
A
H
 
T
K
 
K
L
 
V
D
 
E
F
 
F
E
|
E
G
 
G
E
|
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
K
T
 
P
A
 
C
R
 
K
H
 
N
V
 
V
N
 
K
A
 
A
A
 
D
D
 
D
A
 
W
L
 
K
D
 
S
Y
 
V
V
 
V
A
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
T
C
 
I
Y
 
I
N
 
N
D
|
D
G
 
V
S
 
S
V
 
S
R
 
R
D
 
D
W
 
L
Q
 
Q
K
 
F
H
 
A
T
 
D
L
 
G
Q
 
Q
F
 
W
V
 
A
P
 
R
G
 
A
K
|
K
N
 
G
F
 
I
P
 
D
Q
 
T
T
 
F
G
 
G
G
 
P
F
 
I
G
 
G
P
 
P
W
 
W
M
 
I
V
 
E
T
 
T
H
 
D
D
 
I
E
 
N
I
 
S
N
 
I
D
 
D
P
 
L
Q
 
D
E
 
N
L
 
L
E
 
P
L
 
I
T
 
K
T
 
A
R
 
R
L
 
L
-
 
T
-
 
H
N
 
D
G
 
G
E
 
E
-
 
T
-
 
Q
V
 
L
M
 
K
Q
 
Q
H
 
D
T
 
S
R
 
N
T
 
S
S
 
N
D
 
Q
M
 
M
I
 
I
F
 
M
D
 
K
V
 
M
R
 
G
Q
 
E
L
 
I
I
 
I
E
 
E
Y
 
F
C
 
I
S
 
T
T
 
A
F
 
S
T
 
M
E
 
T
L
 
L
A
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
V
 
A
S
 
T
G
 
G
T
x
S
T
 
P
G
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
E
A
 
A
F
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
P
 
-
V
 
-
W
 
-
M
 
M
K
 
V
P
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
Y
V
 
I
E
 
E
V
 
I
E
 
E
I
 
I
T
 
P
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
K
L
 
L
R
 
G
N
 
N
S
 
P
I
 
V
A
 
V
D
 
D

Q6P587 Acylpyruvase FAHD1, mitochondrial; Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 1; FAH domain-containing protein 1; Oxaloacetate decarboxylase; OAA decarboxylase; YisK-like protein; EC 3.7.1.5; EC 4.1.1.112 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
36% identity, 70% coverage: 76:272/283 of query aligns to 20:212/224 of Q6P587

query
sites
Q6P587
V
 
I
L
 
V
C
 
C
I
 
V
G
 
G
I
 
R
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
T
 
D
H
|
H
V
 
V
R
 
R
E
|
E
T
 
M
G
 
R
R
 
S
D
 
A
M
 
V
P
 
L
T
 
S
Y
 
E
P
 
P
M
 
V
I
 
L
F
 
F
T
 
L
R
 
K
F
 
P
A
 
S
D
 
T
S
 
A
Q
 
Y
V
 
A
A
 
P
H
 
E
L
 
G
Q
 
S
P
 
P
I
 
I
I
 
L
R
 
M
P
 
P
K
 
A
V
 
Y
S
 
T
H
 
R
K
 
N
L
 
L
D
 
H
F
 
H
E
|
E
G
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
R
A
 
C
R
 
R
H
 
A
V
 
V
N
 
P
A
 
E
A
 
A
D
 
A
A
 
A
L
 
M
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
L
Y
 
C
N
 
L
D
|
D
G
 
M
S
 
T
V
 
A
R
|
R
D
 
D
W
 
V
Q
 
Q
-
 
D
-
 
E
-
 
C
-
 
K
K
 
K
H
 
K
T
 
G
L
 
L
Q
 
P
F
 
W
V
 
T
P
 
L
G
 
A
K
 
K
N
 
S
F
 
F
P
 
T
Q
 
A
T
 
S
G
 
C
G
 
P
F
 
V
G
 
S
P
 
A
W
 
F
M
 
-
V
 
V
T
 
P
H
 
K
D
 
E
E
 
K
I
 
I
N
 
P
D
 
D
P
 
P
Q
 
H
E
 
K
L
 
L
E
 
K
L
 
L
T
 
W
T
 
L
R
 
K
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
M
 
R
Q
 
Q
H
 
E
T
 
G
R
 
E
T
 
T
S
 
S
D
 
S
M
 
M
I
 
I
F
 
F
D
 
S
V
 
I
R
 
P
Q
 
Y
L
 
I
I
 
I
E
 
S
Y
 
Y
C
 
V
S
 
S
T
 
K
F
 
I
T
 
I
E
 
T
L
 
L
A
 
E
P
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
I
 
I
V
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
P
G
 
K
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
P
F
 
V
R
 
K
E
 
E
P
 
-
P
 
-
V
 
-
W
 
-
M
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
N
D
 
D
T
 
E
V
 
I
E
 
E
V
 
A
E
 
G
I
 
I
T
 
H
G
 
G
I
 
L

6fogA X-ray structure of homo sapiens fumarylacetoacetate hydrolase domain containing protein 1 (fahd1) in complex with inhibitor oxalate at 1.94a resolution. (see paper)
36% identity, 70% coverage: 76:272/283 of query aligns to 15:207/218 of 6fogA

query
sites
6fogA
V
 
I
L
 
V
C
 
C
I
 
V
G
|
G
I
 
R
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
T
 
D
H
 
H
V
 
V
R
 
R
E
 
E
T
 
M
G
 
R
R
 
S
D
 
A
M
 
V
P
 
L
T
 
S
Y
 
E
P
 
P
M
 
V
I
 
L
F
 
F
T
 
L
R
 
K
F
 
P
A
 
S
D
 
T
S
 
A
Q
 
Y
V
 
A
A
 
P
H
 
E
L
 
G
Q
 
S
P
 
P
I
 
I
I
 
L
R
 
M
P
 
P
K
 
A
V
 
Y
S
 
T
H
 
R
K
 
N
L
 
L
D
 
H
F
 
H
E
|
E
G
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
R
A
 
C
R
 
R
H
 
A
V
 
V
N
 
P
A
 
E
A
 
A
D
 
A
A
 
A
L
 
M
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
L
Y
 
C
N
 
L
D
|
D
G
 
M
S
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
D
W
 
V
Q
 
Q
-
 
D
-
 
E
-
 
C
-
 
K
K
 
K
H
 
K
T
 
G
L
 
L
Q
 
P
F
 
W
V
 
T
P
 
L
G
 
A
K
 
K
N
 
S
F
 
F
P
 
T
Q
 
A
T
 
S
G
 
C
G
 
P
F
 
V
G
 
S
P
 
A
W
 
F
M
 
-
V
 
V
T
 
P
H
 
K
D
 
E
E
 
K
I
 
I
N
 
P
D
 
D
P
 
P
Q
 
H
E
 
K
L
 
L
E
 
K
L
 
L
T
 
W
T
 
L
R
 
K
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
M
 
R
Q
 
Q
H
 
E
T
 
G
R
 
E
T
 
T
S
 
S
D
 
S
M
 
M
I
 
I
F
 
F
D
 
S
V
 
I
R
 
P
Q
 
Y
L
 
I
I
 
I
E
 
S
Y
 
Y
C
 
V
S
 
S
T
 
K
F
 
I
T
 
I
E
 
T
L
 
L
A
 
E
P
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
I
 
I
V
 
L
S
 
T
G
 
G
T
|
T
T
 
P
G
 
K
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
P
F
 
V
R
 
K
E
 
E
P
 
-
P
 
-
V
 
-
W
 
-
M
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
N
D
 
D
T
 
E
V
 
I
E
 
E
V
 
A
E
 
G
I
 
I
T
 
H
G
 
G
I
 
L

Sites not aligning to the query:

6sbiA X-ray structure of murine fumarylacetoacetate hydrolase domain containing protein 1 (fahd1) in complex with inhibitor oxalate (see paper)
34% identity, 71% coverage: 76:276/283 of query aligns to 14:210/216 of 6sbiA

query
sites
6sbiA
V
 
I
L
 
V
C
 
C
I
 
V
G
|
G
I
x
R
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
T
 
D
H
|
H
V
 
V
R
 
K
E
 
E
T
 
M
G
 
R
R
 
S
D
 
T
M
 
V
P
 
L
T
 
S
Y
 
E
P
 
P
M
 
V
I
 
L
F
 
F
T
 
L
R
 
K
F
 
P
A
x
S
D
 
T
S
 
A
Q
 
Y
V
 
A
A
 
P
H
 
E
L
 
G
Q
 
S
P
 
P
I
 
V
I
 
L
R
 
M
P
 
P
K
 
A
V
 
Y
S
 
C
H
 
R
K
 
N
L
 
L
D
 
H
F
 
H
E
|
E
G
 
V
E
|
E
L
 
L
A
 
G
V
 
V
V
 
L
I
 
L
G
 
G
K
 
K
T
 
R
A
 
G
R
 
E
H
 
A
V
 
I
N
 
P
A
 
E
A
 
A
D
 
A
A
 
A
L
 
M
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
L
Y
 
C
N
 
L
D
|
D
G
 
M
S
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
D
W
 
V
Q
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
C
-
 
K
K
 
K
H
 
K
T
 
G
L
 
L
Q
 
P
F
 
W
V
 
T
P
 
L
G
 
A
K
|
K
N
 
S
F
 
F
P
 
T
Q
 
S
T
 
S
G
 
C
G
 
P
F
 
V
G
 
S
P
 
A
W
 
F
M
 
-
V
 
V
T
 
P
H
 
K
D
 
E
E
 
K
I
 
I
N
 
P
D
 
D
P
 
P
Q
 
H
E
 
A
L
 
L
E
 
R
L
 
L
T
 
W
T
 
L
R
 
K
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
M
 
R
Q
 
Q
H
 
E
T
 
G
R
 
K
T
 
T
S
 
S
D
 
S
M
 
M
I
 
I
F
 
F
D
 
S
V
 
I
R
 
P
Q
 
Y
L
 
I
I
 
I
E
 
S
Y
 
Y
C
 
V
S
 
S
T
 
K
F
 
I
T
 
I
E
x
T
L
 
L
A
 
E
P
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
L
I
 
I
V
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
P
G
 
K
G
 
G
V
|
V
G
 
G
A
 
P
F
 
I
R
 
K
E
 
E
P
 
-
P
 
-
V
 
-
W
 
-
M
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
N
D
 
D
T
 
E
V
 
I
E
 
E
V
 
A
E
 
G
I
 
I
T
 
D
G
 
G
I
 
V
G
 
V
R
 
S
L
 
M
R
 
R

6jvwB Crystal structure of maleylpyruvate hydrolase from sphingobium sp. Syk-6 in complex with manganese (ii) ion and pyruvate (see paper)
31% identity, 100% coverage: 1:283/283 of query aligns to 1:264/264 of 6jvwB

query
sites
6jvwB
M
 
M
K
 
R
L
 
L
A
 
A
S
 
R
F
 
F
I
 
D
V
 
-
H
 
G
G
 
G
R
 
R
T
 
-
T
 
-
Y
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
I
G
 
G
D
 
D
Q
 
E
L
 
I
I
 
A
D
 
D
L
 
I
E
 
T
S
 
A
V
 
L
K
 
T
S
 
-
T
 
-
F
 
-
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
P
K
 
A
Q
 
Q
A
 
W
I
 
P
A
 
D
A
 
M
N
 
N
R
 
M
L
 
I
-
 
R
-
 
L
-
 
I
-
 
R
-
 
D
-
 
F
G
 
E
E
 
G
L
 
L
T
 
R
P
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
E
A
 
A
P
 
A
L
 
L
P
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
A
R
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
V
 
V
T
 
S
F
 
L
L
 
E
P
 
T
V
 
P
I
 
V
A
 
P
N
 
W
P
 
P
G
 
N
K
 
K
V
 
I
L
 
I
C
 
A
I
 
Y
G
 
P
I
x
V
N
 
N
Y
 
Y
A
 
H
T
 
A
H
 
H
V
 
G
R
 
N
E
 
Q
T
 
G
G
 
-
R
 
-
D
 
-
M
 
-
P
 
-
T
 
-
Y
 
-
P
 
-
M
 
-
I
 
F
F
|
F
T
 
L
R
 
K
F
 
P
A
 
G
D
 
S
S
 
A
Q
 
L
V
 
S
A
 
G
H
 
P
L
 
T
Q
 
D
P
 
P
I
 
V
I
 
V
R
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
-
 
P
S
 
G
H
 
R
K
 
E
L
 
V
D
 
H
F
 
H
E
|
E
G
 
S
E
|
E
L
 
L
A
 
A
V
 
I
V
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
C
R
 
R
H
 
S
V
 
V
N
 
A
A
 
R
A
 
E
D
 
D
A
 
W
L
 
K
D
 
D
Y
 
V
V
 
V
A
 
F
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
C
Y
 
L
N
 
L
D
|
D
G
 
M
S
 
V
V
 
V
R
 
R
D
 
G
-
 
R
-
 
V
W
 
F
Q
 
R
K
|
K
H
 
A
T
 
Y
L
 
D
Q
 
T
F
 
F
V
 
C
P
 
P
G
 
-
K
 
-
N
 
-
F
 
-
P
 
-
Q
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
V
G
 
G
P
 
P
W
 
W
M
 
I
V
 
T
T
 
T
H
 
A
D
 
D
E
 
A
I
 
V
N
 
N
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
E
 
T
L
 
L
E
 
D
L
 
M
T
 
K
T
 
L
R
 
W
L
 
V
N
 
N
G
 
D
E
 
D
V
 
L
M
 
R
Q
 
Q
H
 
K
T
 
A
R
 
N
T
 
T
S
 
R
D
 
D
M
 
L
I
 
V
F
 
L
D
 
D
V
 
I
R
 
P
Q
 
G
L
 
M
I
 
I
E
 
A
Y
 
T
C
 
A
S
 
S
T
 
A
F
 
V
T
 
M
E
 
T
L
 
L
A
 
Q
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
I
I
 
I
V
 
A
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
P
G
 
E
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
P
F
 
V
R
 
V
E
 
D
P
 
-
P
 
-
V
 
-
W
 
-
M
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
G
D
 
D
T
 
R
V
 
I
E
 
R
V
 
I
E
 
V
I
 
I
T
 
D
G
 
Q
I
 
V
G
 
G
R
 
E
L
 
M
R
 
A
N
 
V
S
 
D
I
 
V
A
 
V
D
 
Q
E
 
G
Q
 
Q

3v77A Crystal structure of a putative fumarylacetoacetate isomerase/hydrolase from oleispira antarctica (see paper)
30% identity, 64% coverage: 74:253/283 of query aligns to 16:200/224 of 3v77A

query
sites
3v77A
G
 
G
K
 
K
V
 
I
L
 
V
C
 
C
I
 
V
G
 
G
I
 
R
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
T
 
A
H
 
H
V
 
A
R
 
K
E
 
E
T
 
L
G
 
N
R
 
N
D
 
P
M
 
I
P
 
P
T
 
S
Y
 
S
P
 
P
M
 
I
I
 
L
F
 
F
T
 
I
R
 
K
F
 
P
A
 
A
D
 
S
S
 
S
Q
 
A
V
 
V
A
 
P
H
 
F
L
 
G
Q
 
P
P
 
V
I
 
F
I
 
S
R
 
I
P
 
P
K
 
K
V
 
D
S
 
Q
H
 
G
K
 
S
L
 
V
D
 
H
F
 
H
E
 
E
G
 
L
E
|
E
L
 
I
A
 
A
V
 
I
V
 
L
I
 
I
G
 
G
K
 
K
T
 
A
A
 
L
R
 
S
H
 
R
V
 
A
N
 
S
A
 
T
A
 
E
D
 
Q
A
 
V
L
 
A
D
 
E
Y
 
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
A
 
G
C
 
L
Y
 
G
N
 
L
D
|
D
G
 
L
S
 
T
V
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
V
Q
 
Q
K
 
D
H
 
Q
T
 
L
L
 
K
Q
 
E
-
 
K
-
 
G
-
 
H
-
 
P
F
 
W
V
 
E
P
 
R
G
 
A
K
 
K
N
 
S
F
 
F
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
C
P
 
P
Q
 
L
T
 
T
G
 
E
G
 
F
F
 
V
G
 
A
P
 
V
W
 
N
M
 
L
V
 
A
T
 
S
H
 
E
D
 
D
E
 
E
I
 
W
N
 
-
D
 
-
P
 
-
Q
 
Q
E
 
A
L
 
I
E
 
G
L
 
L
T
 
T
T
 
L
R
 
E
L
 
K
N
 
N
G
 
G
E
 
Q
V
 
F
M
 
Q
Q
 
Q
H
 
Q
T
 
G
R
 
S
T
 
S
S
 
A
D
 
E
M
 
M
I
 
L
F
 
F
D
 
P
V
 
I
R
 
L
Q
 
P
L
 
L
I
 
I
E
 
A
Y
x
H
C
 
M
S
 
S
T
 
E
F
x
H
T
 
F
E
 
S
L
 
L
A
 
Q
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
V
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
P
G
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
P
F
 
L
R
 
E

6j5yA Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from pseudomonas aeruginosa in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
30% identity, 71% coverage: 75:275/283 of query aligns to 25:226/233 of 6j5yA

query
sites
6j5yA
K
 
R
V
 
V
L
 
Y
C
 
C
I
 
V
G
|
G
I
x
R
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
T
 
A
H
|
H
V
 
A
R
 
R
E
 
E
T
 
M
G
 
G
R
 
F
D
 
D
M
 
P
P
 
E
T
 
R
Y
 
E
P
 
P
-
 
P
M
 
F
I
 
F
F
|
F
T
 
C
R
 
K
F
 
P
A
 
A
D
 
D
S
 
A
Q
 
V
V
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
A
A
 
G
H
 
S
L
 
T
Q
 
L
P
 
E
I
 
L
I
 
A
R
 
Y
P
 
P
K
 
S
V
 
Q
S
 
T
H
 
G
K
 
N
L
 
Y
D
 
H
F
 
Y
E
|
E
G
 
I
E
|
E
L
 
L
A
 
V
V
 
A
V
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
T
 
G
A
 
G
R
 
C
H
 
D
V
 
I
N
 
P
A
 
L
A
 
E
D
 
Q
A
 
A
L
 
E
D
 
E
Y
 
H
V
 
V
A
 
W
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
V
Y
 
G
N
 
L
D
|
D
G
 
M
S
 
T
V
 
R
R
 
R
D
 
D
W
 
L
Q
 
Q
K
 
M
H
 
R
T
 
M
L
 
R
Q
 
E
-
 
M
-
 
G
-
 
R
-
 
P
F
 
W
V
 
E
P
 
I
G
 
G
K
|
K
N
 
A
F
 
F
P
 
D
Q
 
R
T
 
S
G
 
A
G
 
P
F
 
I
G
 
G
P
 
P
W
 
-
M
 
L
V
 
Y
T
 
P
H
 
A
D
 
S
E
 
Q
I
 
V
N
 
G
D
 
H
P
 
P
Q
 
R
E
 
H
L
 
A
E
 
A
L
 
I
T
 
S
T
 
L
R
 
Q
L
 
V
N
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
D
M
 
R
Q
 
Q
H
 
R
T
 
S
R
 
D
T
 
I
S
 
D
D
 
Q
M
 
L
I
 
I
F
 
W
D
 
S
V
 
V
R
 
A
Q
 
E
L
 
T
I
 
V
E
 
S
Y
 
Y
C
 
L
S
 
S
T
 
R
F
 
F
T
 
F
E
 
E
L
 
L
A
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
L
I
 
V
V
 
F
S
 
T
G
 
G
T
|
T
T
 
P
G
 
E
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
A
F
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
P
 
-
V
 
-
W
 
-
M
 
V
K
 
E
P
 
R
G
 
G
D
 
E
T
 
R
V
 
M
E
 
L
V
 
G
E
 
A
I
 
I
T
 
D
G
 
G
I
 
L
G
 
G
R
 
E
L
 
L

1nkqA Crystal structure of yeast ynq8, a fumarylacetoacetate hydrolase family protein
26% identity, 69% coverage: 75:269/283 of query aligns to 10:222/247 of 1nkqA

query
sites
1nkqA
K
 
K
V
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
I
G
 
G
I
 
R
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
T
 
A
H
 
H
V
 
I
R
 
K
E
 
E
T
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
M
 
L
P
 
N
T
 
N
Y
 
Q
P
 
P
M
 
F
I
 
F
F
 
F
T
 
L
R
 
K
F
 
P
A
 
T
D
 
S
S
 
S
Q
 
I
V
 
V
A
 
T
H
 
P
L
 
L
Q
 
S
-
 
S
-
 
S
-
 
P
-
 
A
-
 
N
-
 
S
-
 
T
-
 
F
-
 
N
-
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
N
-
 
P
-
 
G
P
 
P
I
 
I
I
 
F
R
 
I
P
 
P
K
 
R
V
 
-
S
 
G
H
 
V
K
 
K
L
 
V
D
 
H
F
 
H
E
|
E
G
 
I
E
|
E
L
 
L
A
 
A
V
 
L
V
 
I
I
 
V
G
 
S
K
 
K
T
 
H
A
 
L
R
 
S
H
 
N
V
 
V
N
 
T
A
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
P
A
 
E
D
 
E
A
 
V
L
 
Y
D
 
D
Y
 
S
V
 
I
A
 
S
G
 
G
Y
 
V
A
 
A
C
 
L
Y
 
A
N
 
L