SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF356 FitnessBrowser__psRCH2:GFF356 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P40288 Glucose 1-dehydrogenase; EC 1.1.1.47 from Priestia megaterium (Bacillus megaterium) (see 2 papers)
39% identity, 96% coverage: 3:248/255 of query aligns to 5:250/261 of P40288

query
sites
P40288
L
 
L
Q
 
E
N
 
G
Q
 
K
V
 
V
A
 
V
L
x
V
V
x
I
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
x
S
Q
x
T
G
|
G
I
x
L
G
|
G
R
x
K
G
x
S
I
x
M
A
|
A
L
x
I
R
|
R
L
x
F
A
|
A
E
x
T
E
|
E
G
x
K
A
|
A
D
x
K
I
x
V
V
|
V
I
 
V
N
 
N
G
 
Y
R
 
R
Q
 
S
D
 
K
D
 
E
E
 
D
Q
 
E
A
 
A
R
 
N
E
 
S
S
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
V
 
I
H
 
K
A
 
K
R
 
V
G
 
G
R
 
G
R
 
E
V
 
A
C
 
I
F
 
A
I
 
V
A
 
K
A
 
G
D
 
D
V
 
V
G
 
T
D
 
V
V
 
E
E
 
S
Q
 
D
C
 
V
Q
 
I
R
 
N
L
 
L
V
 
V
R
 
Q
E
 
S
G
 
A
I
 
I
E
 
K
Q
 
E
M
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
x
E
R
 
N
H
 
P
A
 
V
A
 
S
F
 
S
L
 
H
D
 
E
A
 
M
Q
 
S
A
 
L
D
 
S
D
|
D
Y
 
W
D
 
N
Q
 
K
V
|
V
L
 
I
N
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
P
 
A
F
 
F
F
 
L
L
 
G
A
 
S
Q
 
R
A
 
E
F
 
A
A
 
I
R
 
K
Y
 
Y
L
 
F
R
 
V
E
|
E
H
 
N
G
 
D
R
 
I
G
 
K
G
 
G
R
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
N
N
 
M
S
 
S
S
 
S
V
 
V
H
 
H
E
 
E
E
 
K
L
 
I
P
 
P
H
 
W
P
 
P
N
 
L
F
 
F
T
 
V
A
 
H
Y
 
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
 
K
G
 
G
G
 
G
L
 
M
K
 
K
M
 
L
L
 
M
M
 
T
R
 
E
N
 
T
I
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
Y
A
 
A
P
 
P
L
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
R
V
|
V
N
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
A
V
 
I
E
 
N
T
 
T
P
|
P
I
 
I
N
 
N
R
 
A
E
 
E
L
 
K
M
 
F
N
 
A
Q
 
D
P
 
P
E
 
E
K
 
Q
L
 
R
A
 
A
S
 
D
L
 
V
L
x
E
Q
 
S
N
 
M
I
 
I
P
 
P
A
 
M
G
 
G
R
x
Y
L
 
I
G
 
G
R
 
E
P
 
P
H
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
A
V
 
V
V
 
A
A
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
S
D
 
E
A
 
A
E
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
I
T
 
T
L
 
L
V
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

Sites not aligning to the query:

1g6kA Crystal structure of glucose dehydrogenase mutant e96a complexed with NAD+
39% identity, 96% coverage: 3:248/255 of query aligns to 5:250/261 of 1g6kA

query
sites
1g6kA
L
 
L
Q
 
E
N
 
G
Q
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
S
Q
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
K
G
 
S
I
 
M
A
 
A
L
 
I
R
 
R
L
 
F
A
 
A
E
 
T
E
 
E
G
 
K
A
 
A
D
 
K
I
 
V
V
 
V
I
 
V
N
 
N
G
 
Y
R
|
R
Q
 
S
D
 
K
D
 
E
E
 
D
Q
 
E
A
 
A
R
 
N
E
 
S
S
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
V
 
I
H
 
K
A
 
K
R
 
V
G
 
G
R
 
G
R
 
E
V
 
A
C
 
I
F
 
A
I
 
V
A
 
K
A
 
G
D
|
D
V
|
V
G
 
T
D
 
V
V
 
E
E
 
S
Q
 
D
C
 
V
Q
 
I
R
 
N
L
 
L
V
 
V
R
 
Q
E
 
S
G
 
A
I
 
I
E
 
K
Q
 
E
M
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
L
Q
 
A
R
 
N
H
 
P
A
 
V
A
 
S
F
 
S
L
 
H
D
 
E
A
 
M
Q
 
S
A
 
L
D
 
S
D
 
D
Y
 
W
D
 
N
Q
 
K
V
 
V
L
 
I
N
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
P
 
A
F
 
F
F
 
L
L
 
G
A
 
S
Q
 
R
A
 
E
F
 
A
A
 
I
R
 
K
Y
 
Y
L
 
F
R
 
V
E
 
E
H
 
N
G
 
D
R
 
I
G
 
K
G
 
G
R
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
N
N
x
M
S
 
S
S
|
S
V
 
V
H
 
H
E
 
E
E
 
K
L
 
I
P
 
P
H
 
W
P
 
P
N
 
L
F
 
F
T
 
V
A
 
H
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
L
 
M
K
 
K
M
 
L
L
 
M
M
 
T
R
 
E
N
 
T
I
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
Y
A
 
A
P
 
P
L
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
G
P
|
P
G
|
G
A
 
A
V
x
I
E
 
N
T
|
T
P
 
P
I
 
I
N
 
N
R
 
A
E
 
E
L
 
K
M
 
F
N
 
A
Q
 
D
P
 
P
E
 
E
K
 
Q
L
 
R
A
 
A
S
 
D
L
 
V
L
 
E
Q
 
S
N
 
M
I
 
I
P
 
P
A
 
M
G
 
G
R
 
Y
L
 
I
G
 
G
R
 
E
P
 
P
H
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
A
V
 
V
V
 
A
A
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
S
D
 
E
A
 
A
E
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
I
T
 
T
L
 
L
V
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
40% identity, 96% coverage: 3:248/255 of query aligns to 11:256/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
L
 
L
Q
 
K
N
 
D
Q
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
G
T
 
S
Q
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
R
G
 
A
I
 
M
A
 
A
L
 
V
R
 
R
L
 
F
A
 
G
E
 
Q
E
 
E
G
 
E
A
 
A
D
 
K
I
 
V
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
Y
R
x
Y
Q
 
N
D
 
N
D
 
E
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
R
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
K
E
 
K
Q
 
E
V
 
V
H
 
E
A
 
E
R
 
A
G
 
G
R
 
G
R
 
Q
V
 
A
C
 
I
F
 
I
I
 
V
A
 
Q
A
 
G
D
|
D
V
|
V
G
 
T
D
 
K
V
 
E
E
 
E
Q
 
D
C
 
V
Q
 
V
R
 
N
L
 
L
V
 
V
R
 
Q
E
 
T
G
 
A
I
 
I
E
 
K
Q
 
E
M
 
F
G
 
G
R
 
T
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
|
V
Q
x
E
R
 
N
H
 
P
A
 
V
A
 
P
F
 
S
L
 
H
D
 
E
A
 
L
Q
 
S
A
 
L
D
 
D
D
 
N
Y
 
W
D
 
N
Q
 
K
V
 
V
L
 
I
N
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
P
 
A
F
 
F
F
 
L
L
 
G
A
 
S
Q
 
R
A
 
E
F
 
A
A
 
I
R
 
K
Y
 
Y
L
 
F
R
 
V
E
 
E
H
 
N
G
 
D
R
 
I
G
 
K
G
 
G
R
 
N
I
 
V
I
 
I
N
 
N
N
x
M
S
 
S
S
|
S
V
 
V
H
|
H
E
 
E
E
 
M
L
 
I
P
 
P
H
x
W
P
 
P
N
 
L
F
 
F
T
 
V
A
 
H
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
L
 
M
K
 
K
M
 
L
L
 
M
M
 
T
R
 
E
N
 
T
I
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
Y
A
 
A
P
 
P
L
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
G
P
|
P
G
|
G
A
 
A
V
x
M
E
 
N
T
|
T
P
|
P
I
|
I
N
|
N
R
 
A
E
 
E
L
x
K
M
 
F
N
 
A
Q
 
D
P
 
P
E
 
V
K
 
Q
L
 
R
A
 
A
S
 
D
L
 
V
L
 
E
Q
 
S
N
 
M
I
 
I
P
 
P
A
 
M
G
 
G
R
 
Y
L
 
I
G
 
G
R
 
K
P
 
P
H
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
A
V
 
V
V
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
S
D
 
Q
A
 
A
E
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
I
T
 
T
L
 
L
V
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
41% identity, 98% coverage: 1:249/255 of query aligns to 1:246/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
R
 
T
L
 
L
Q
 
Q
N
 
G
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
T
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
G
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
I
R
 
N
L
 
L
A
 
A
E
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
N
I
 
I
V
 
F
I
 
F
N
|
N
G
x
Y
R
x
N
Q
x
G
D
x
S
D
 
P
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
R
 
E
E
 
E
S
 
T
L
 
A
E
 
K
Q
 
L
V
 
V
H
 
A
A
 
E
R
 
H
G
 
G
R
 
V
R
 
E
V
 
V
C
 
E
F
 
A
I
 
M
A
 
K
A
 
A
D
x
N
V
|
V
G
 
A
D
 
I
V
 
A
E
 
E
Q
 
D
C
 
V
Q
 
D
R
 
A
L
 
F
V
 
F
R
 
K
E
 
Q
G
 
A
I
 
I
E
 
E
Q
 
R
M
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
Q
 
T
R
 
R
H
 
D
A
 
N
A
 
L
F
 
L
L
 
M
D
 
R
A
 
M
Q
 
K
A
 
E
D
 
D
D
 
E
Y
 
W
D
 
D
Q
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
T
F
 
F
F
 
L
L
 
C
A
 
T
Q
 
K
A
 
A
F
 
V
A
 
S
R
 
R
Y
 
T
L
 
M
R
 
M
E
 
K
H
 
Q
G
 
-
R
 
R
G
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
N
 
M
S
 
A
S
|
S
V
 
V
H
 
V
E
 
G
E
 
L
L
 
I
P
 
G
H
 
N
P
 
A
N
 
G
F
x
Q
T
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
K
 
I
M
 
G
L
 
L
M
 
T
R
 
K
N
 
T
I
 
T
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
N
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
A
 
F
V
x
I
E
 
T
T
|
T
P
 
D
I
 
M
N
 
T
R
 
D
E
 
K
L
 
L
M
 
D
N
 
E
Q
 
K
P
 
T
E
 
K
K
 
E
L
 
-
A
 
-
S
 
A
L
 
M
L
 
L
Q
 
A
N
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
L
G
 
G
R
 
A
L
 
Y
G
 
G
R
 
T
P
 
T
H
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
A
A
 
S
E
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
L
 
L
V
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
V

7do7A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NAD and l-rhamnose bound-form) (see paper)
40% identity, 98% coverage: 3:251/255 of query aligns to 3:254/256 of 7do7A

query
sites
7do7A
L
 
L
Q
 
I
N
 
D
Q
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
 
S
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
G
 
A
I
 
A
A
 
A
L
 
R
R
 
E
L
 
C
A
 
A
E
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
R
I
 
V
V
 
V
I
 
I
N
 
G
G
 
H
R
x
S
Q
 
G
D
 
S
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
R
R
 
A
E
 
G
S
 
A
L
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
A
E
 
E
Q
 
E
V
 
I
H
 
A
A
 
A
R
 
F
G
 
G
R
 
G
R
 
T
V
 
A
C
 
I
F
 
A
I
 
V
A
 
G
A
 
A
D
|
D
V
x
A
G
 
A
D
 
D
V
 
L
E
 
D
Q
 
S
C
 
G
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
V
 
V
R
 
A
E
 
A
G
 
A
I
 
V
E
 
E
Q
 
A
M
 
F
G
 
G
R
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
Q
 
C
R
 
P
H
x
F
A
 
H
A
 
S
F
 
F
L
 
L
D
 
D
A
 
M
Q
 
P
A
 
R
D
 
E
D
 
L
Y
 
Y
D
 
L
Q
 
K
V
 
T
L
 
V
N
 
G
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
N
G
 
G
P
 
A
F
 
Y
F
 
F
L
 
T
A
 
V
Q
 
Q
A
 
A
F
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
R
L
 
M
R
 
K
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
R
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
N
x
V
S
|
S
S
|
S
V
 
I
H
x
S
E
 
A
E
 
L
L
 
V
P
 
G
H
 
G
P
 
A
N
 
M
F
x
Q
T
 
T
A
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
L
M
 
S
L
 
L
M
 
M
R
 
Q
N
 
S
I
 
C
A
 
A
I
 
I
E
 
A
L
 
L
A
 
G
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
I
 
I
T
 
R
V
 
C
N
 
N
N
 
A
V
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
T
V
x
I
E
 
A
T
|
T
P
 
D
I
|
I
N
|
N
R
 
K
E
 
E
L
 
D
M
 
L
N
 
S
Q
 
D
P
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
R
A
 
E
S
 
R
L
 
M
L
 
T
Q
 
S
N
 
R
I
 
V
P
 
P
A
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
P
H
 
D
D
 
D
V
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
P
V
 
I
A
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
x
D
D
x
M
A
 
A
E
x
R
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
T
 
S
L
 
L
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
F
W
 
V
N
 
N

7b81A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD bound-form) (see paper)
40% identity, 98% coverage: 3:251/255 of query aligns to 3:254/256 of 7b81A

query
sites
7b81A
L
 
L
Q
 
I
N
 
D
Q
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
G
 
A
I
 
A
A
 
A
L
 
R
R
 
E
L
 
C
A
 
A
E
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
R
I
 
V
V
 
V
I
 
I
N
 
G
G
 
H
R
 
S
Q
 
G
D
 
S
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
R
R
 
A
E
 
G
S
 
A
L
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
A
E
 
E
Q
 
E
V
 
I
H
 
A
A
 
A
R
 
F
G
 
G
R
 
G
R
 
T
V
 
A
C
 
I
F
 
A
I
 
V
A
 
G
A
 
A
D
|
D
V
x
A
G
 
A
D
 
D
V
 
L
E
 
D
Q
 
S
C
 
G
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
V
 
V
R
 
A
E
 
A
G
 
A
I
 
V
E
 
E
Q
 
A
M
 
F
G
 
G
R
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
Q
 
C
R
 
P
H
 
F
A
 
H
A
 
S
F
 
F
L
 
L
D
 
D
A
 
M
Q
 
P
A
 
R
D
 
E
D
 
L
Y
 
Y
D
 
L
Q
 
K
V
 
T
L
 
V
N
 
G
V
x
T
N
 
N
L
 
L
R
 
N
G
 
G
P
 
A
F
 
Y
F
 
F
L
 
T
A
 
V
Q
 
Q
A
 
A
F
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
R
L
 
M
R
 
K
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
R
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
N
x
V
S
 
S
S
|
S
V
 
I
H
 
S
E
 
A
E
 
L
L
 
V
P
 
G
H
 
G
P
 
A
N
 
M
F
 
Q
T
 
T
A
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
L
M
 
S
L
 
L
M
 
M
R
 
Q
N
 
S
I
 
C
A
 
A
I
 
I
E
 
A
L
 
L
A
 
G
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
I
 
I
T
 
R
V
 
C
N
 
N
N
 
A
V
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
T
V
x
I
E
 
A
T
|
T
P
 
D
I
|
I
N
 
N
R
 
K
E
 
E
L
 
D
M
 
L
N
 
S
Q
 
D
P
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
R
A
 
E
S
 
R
L
 
M
L
 
T
Q
 
S
N
 
R
I
 
V
P
 
P
A
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
P
H
 
D
D
 
D
V
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
P
V
 
I
A
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
M
A
 
A
E
 
R
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
T
 
S
L
 
L
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
F
W
 
V
N
 
N

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
42% identity, 97% coverage: 1:247/255 of query aligns to 1:242/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
M
|
M
R
 
G
L
 
I
Q
 
Q
N
 
N
Q
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
A
Q
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
R
 
K
G
 
Q
I
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
F
A
 
A
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
A
I
 
V
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
-
R
x
D
Q
 
I
D
 
D
D
 
A
E
 
E
Q
 
K
A
 
V
R
 
R
E
 
A
S
 
T
L
 
V
E
 
D
Q
 
E
V
 
F
H
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
H
R
 
R
V
 
V
C
 
L
F
 
G
I
 
A
A
 
V
A
 
A
D
|
D
V
x
I
G
 
G
D
 
N
V
 
K
E
 
A
Q
 
A
C
 
V
Q
 
D
R
 
G
L
 
M
V
 
V
R
 
K
E
 
Q
G
 
T
I
 
I
E
 
D
Q
 
A
M
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
M
Q
 
E
R
 
R
H
 
A
A
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
R
D
 
K
A
 
L
Q
 
S
A
 
E
D
 
A
D
 
D
Y
 
W
D
 
D
Q
 
V
V
 
T
L
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
T
F
 
F
F
 
L
L
 
C
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
F
 
V
A
 
H
R
 
G
Y
 
H
L
 
M
R
 
V
E
 
E
H
 
N
G
 
-
R
 
K
G
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
N
 
I
S
 
A
S
 
S
V
 
-
H
 
R
E
 
A
E
 
W
L
 
L
P
 
G
H
 
G
P
 
A
N
 
G
F
 
Q
T
 
T
A
 
P
Y
|
Y
C
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
K
 
V
M
 
G
L
 
M
M
 
T
R
 
R
N
 
A
I
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
R
L
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
N
 
C
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
L
V
 
I
E
 
H
T
 
T
P
 
P
I
 
M
N
 
W
R
 
D
E
 
E
L
 
L
M
 
P
N
 
E
Q
 
K
P
 
D
E
 
Q
K
 
Q
L
 
F
A
 
-
S
 
-
L
 
L
L
 
L
Q
 
S
N
 
R
I
 
Q
P
 
P
A
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
P
H
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
N
V
 
T
V
 
L
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
P
 
D
D
 
D
A
 
S
E
 
G
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
V
L
 
L
V
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
42% identity, 96% coverage: 3:247/255 of query aligns to 2:241/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
Q
 
Q
N
 
N
Q
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
A
Q
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
R
 
K
G
 
Q
I
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
F
A
 
A
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
A
I
 
V
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
-
R
x
D
Q
x
I
D
 
D
D
 
A
E
 
E
Q
 
K
A
 
V
R
 
R
E
 
A
S
 
T
L
 
V
E
 
D
Q
 
E
V
 
F
H
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
H
R
 
R
V
 
V
C
 
L
F
 
G
I
 
A
A
 
V
A
 
A
D
 
D
V
x
I
G
 
G
D
 
N
V
 
K
E
 
A
Q
 
A
C
 
V
Q
 
D
R
 
G
L
 
M
V
 
V
R
 
K
E
 
Q
G
 
T
I
 
I
E
 
D
Q
 
A
M
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
M
Q
 
E
R
 
R
H
 
A
A
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
R
D
 
K
A
 
L
Q
 
S
A
 
E
D
 
A
D
 
D
Y
 
W
D
 
D
Q
 
V
V
 
T
L
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
T
F
 
F
F
 
L
L
 
C
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
F
 
V
A
 
H
R
 
G
Y
 
H
L
 
M
R
 
V
E
 
E
H
 
N
G
 
-
R
 
K
G
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
N
x
I
S
 
A
S
|
S
V
 
-
H
 
R
E
 
A
E
 
W
L
 
L
P
 
G
H
 
G
P
 
A
N
 
G
F
 
Q
T
 
T
A
 
P
Y
|
Y
C
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
K
 
V
M
 
G
L
 
M
M
 
T
R
 
R
N
 
A
I
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
R
L
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
N
 
C
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
L
V
x
I
E
 
H
T
 
T
P
 
P
I
 
M
N
 
W
R
 
D
E
 
E
L
 
L
M
 
P
N
 
E
Q
 
K
P
 
D
E
 
Q
K
 
Q
L
 
F
A
 
-
S
 
-
L
 
L
L
 
L
Q
 
S
N
 
R
I
 
Q
P
 
P
A
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
P
H
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
N
V
 
T
V
 
L
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
P
 
D
D
 
D
A
 
S
E
 
G
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
V
L
 
L
V
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

6oz7A Putative oxidoreductase from escherichia coli str. K-12
39% identity, 96% coverage: 6:249/255 of query aligns to 2:233/242 of 6oz7A

query
sites
6oz7A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
I
T
 
T
G
 
A
S
 
S
T
 
D
Q
 
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
K
G
 
E
I
 
C
A
 
A
L
 
L
R
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
E
 
Q
G
 
G
A
 
F
D
 
D
I
 
I
V
 
G
I
 
I
N
 
T
G
 
W
R
 
H
Q
 
S
D
 
D
D
 
E
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
R
 
K
E
x
D
S
 
T
L
 
A
E
 
R
Q
x
E
V
 
V
H
 
V
A
 
S
R
 
H
G
 
G
R
 
V
R
 
R
V
 
A
C
 
E
F
 
I
I
 
V
A
 
Q
A
 
L
D
 
D
V
 
L
G
 
G
D
 
N
V
 
L
E
 
P
Q
 
E
C
 
G
Q
 
A
R
 
L
L
 
A
V
 
L
R
 
E
E
 
K
G
 
L
I
 
I
E
 
Q
Q
 
R
M
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
A
Q
 
M
R
 
T
H
 
K
A
 
A
A
 
P
F
 
F
L
 
L
D
 
D
A
 
M
Q
 
A
A
 
F
D
 
D
D
 
E
Y
 
W
D
 
R
Q
 
K
V
 
I
L
 
F
N
 
T
V
 
V
N
 
D
L
 
V
R
 
D
G
 
G
P
 
A
F
 
F
F
 
L
L
 
C
A
 
S
Q
 
Q
A
 
I
F
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
Q
L
 
M
R
 
V
E
 
K
H
 
Q
G
 
G
R
 
Q
G
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
N
 
I
S
 
T
S
|
S
V
 
V
H
 
H
E
 
E
E
 
H
L
 
T
P
 
P
H
 
L
P
 
P
N
 
D
F
 
A
T
 
S
A
 
A
Y
|
Y
C
 
T
A
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
H
G
 
A
L
 
L
K
 
G
M
 
G
L
 
L
M
 
T
R
 
K
N
 
A
I
 
M
A
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
V
P
 
R
L
 
H
G
 
K
I
 
I
T
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
A
V
 
I
E
 
A
T
 
T
P
 
P
I
 
P
N
 
D
R
 
A
E
 
E
L
 
-
M
 
-
N
 
-
Q
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
-
Q
 
P
N
 
S
I
 
I
P
 
P
A
 
L
G
 
R
R
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
A
P
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
S
V
 
L
V
 
V
A
 
V
F
 
W
L
 
L
A
 
C
S
 
S
P
 
E
D
 
G
A
 
A
E
 
N
Y
 
Y
I
 
T
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
S
L
 
L
V
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
F
L
 
M

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
41% identity, 95% coverage: 8:248/255 of query aligns to 4:237/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
G
 
S
I
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
D
 
N
I
 
V
V
 
A
I
 
V
N
|
N
G
x
Y
R
x
A
Q
x
G
D
x
S
D
 
K
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
R
 
E
E
 
A
S
 
V
L
 
V
E
 
E
Q
 
E
V
 
I
H
 
K
A
 
A
R
 
K
G
 
G
R
 
V
R
 
D
V
 
S
C
 
F
F
 
A
I
 
I
A
 
Q
A
|
A
D
x
N
V
|
V
G
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
D
Q
 
E
C
 
V
Q
 
K
R
 
A
L
 
M
V
 
I
R
 
K
E
 
E
G
 
V
I
 
V
E
 
S
Q
 
Q
M
 
F
G
 
G
R
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
Q
 
T
R
 
R
H
 
D
A
 
N
A
 
L
F
 
L
L
 
M
D
 
R
A
 
M
Q
 
K
A
 
E
D
 
Q
D
 
E
Y
 
W
D
 
D
Q
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
D
V
x
T
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
V
F
 
F
-
 
N
F
 
C
L
 
I
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
F
 
T
A
 
P
R
 
Q
Y
 
M
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
H
 
-
G
 
-
R
 
R
G
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
N
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
H
 
V
E
 
G
E
 
A
L
 
V
P
 
G
H
 
N
P
 
P
N
 
G
F
x
Q
T
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
K
 
I
M
 
G
L
 
L
M
 
T
R
 
K
N
 
S
I
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
S
L
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
N
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
A
 
F
V
 
I
E
 
V
T
 
S
P
 
D
I
 
M
N
 
T
R
 
D
E
 
E
L
 
L
M
 
K
N
 
E
Q
 
Q
P
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
M
L
 
L
Q
 
T
N
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
Q
P
 
D
H
 
T
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
N
V
 
T
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
K
A
 
A
E
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
L
 
I
V
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
40% identity, 95% coverage: 8:248/255 of query aligns to 7:244/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
S
Q
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
G
 
S
I
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
D
 
N
I
 
V
V
 
A
I
 
V
N
 
N
G
 
Y
R
 
A
Q
 
G
D
 
S
D
 
K
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
R
 
E
E
 
A
S
 
V
L
 
V
E
 
E
Q
 
E
V
 
I
H
 
K
A
 
A
R
 
K
G
 
G
R
 
V
R
 
D
V
 
S
C
 
F
F
 
A
I
 
I
A
 
Q
A
 
A
D
 
N
V
 
V
G
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
D
Q
 
E
C
 
V
Q
 
K
R
 
A
L
 
M
V
 
I
R
 
K
E
 
E
G
 
V
I
 
V
E
 
S
Q
 
Q
M
 
F
G
 
G
R
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
Q
 
T
R
 
R
H
 
D
A
 
N
A
 
L
F
 
L
L
 
M
D
 
R
A
 
M
Q
 
K
A
 
E
D
 
Q
D
 
E
Y
 
W
D
 
D
Q
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
V
F
 
F
-
 
N
F
 
C
L
 
I
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
F
 
T
A
 
P
R
 
Q
Y
 
M
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
H
 
-
G
 
-
R
 
R
G
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
N
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
H
 
V
E
 
G
E
 
A
L
 
V
P
 
G
H
 
N
P
 
P
N
 
G
F
x
Q
T
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
K
 
I
M
 
G
L
 
L
M
 
T
R
 
K
N
 
S
I
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
S
L
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
N
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
F
V
 
I
E
 
V
T
 
S
P
 
D
I
 
M
N
 
T
R
 
D
E
 
A
L
 
L
M
 
S
N
 
D
Q
 
E
P
 
L
E
 
K
K
 
E
L
 
-
A
 
-
S
 
Q
L
 
M
L
 
L
Q
 
T
N
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
Q
P
 
D
H
 
T
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
N
V
 
T
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
K
A
 
A
E
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
L
 
I
V
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
38% identity, 98% coverage: 3:251/255 of query aligns to 4:252/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
L
 
L
Q
 
R
N
 
G
Q
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
T
 
S
Q
x
R
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
F
G
 
G
I
 
I
A
 
A
L
 
Q
R
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
A
G
 
G
A
 
C
D
 
S
I
 
V
V
 
V
I
 
V
N
 
A
G
x
S
R
|
R
Q
 
N
D
 
L
D
 
E
E
 
E
Q
 
A
A
 
S
R
 
E
E
 
A
S
 
A
L
 
Q
E
 
K
Q
 
L
V
 
T
H
 
E
A
 
K
R
 
Y
G
 
G
R
 
V
R
 
E
V
 
T
C
 
M
F
 
A
I
 
F
A
 
R
A
x
C
D
|
D
V
|
V
G
 
S
D
 
N
V
 
Y
E
 
E
Q
 
E
C
 
V
Q
 
K
R
 
K
L
 
L
V
 
L
R
 
E
E
 
A
G
 
V
I
 
K
E
 
E
Q
 
K
M
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
V
x
I
Q
 
N
R
 
R
H
 
R
A
 
H
A
 
P
F
 
A
L
 
E
D
 
E
A
 
F
Q
 
P
A
 
L
D
 
D
D
 
E
Y
 
F
D
 
R
Q
 
Q
V
 
V
L
 
I
N
 
E
V
|
V
N
 
N
L
 
L
R
 
F
G
 
G
P
 
T
F
 
Y
F
 
Y
L
 
V
A
 
C
Q
 
R
A
 
E
F
 
A
A
 
F
R
 
S
Y
 
L
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
S
G
 
D
R
 
N
G
 
P
G
 
S
R
 
I
I
 
I
I
 
N
N
x
I
N
 
G
S
|
S
S
 
L
V
 
T
H
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
V
P
 
T
H
 
M
P
 
P
N
 
N
F
x
I
T
 
S
A
 
A
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
L
 
V
K
 
A
M
 
S
L
 
L
M
 
T
R
 
K
N
 
A
I
 
L
A
 
A
I
 
K
E
 
E
L
 
W
A
 
G
P
 
R
L
 
Y
G
 
G
I
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
N
 
V
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
A
 
W
V
x
Y
E
 
R
T
|
T
P
 
K
I
x
M
N
x
T
R
 
E
E
 
A
L
 
V
M
 
F
N
 
S
Q
 
D
P
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
D
S
 
Y
L
 
M
L
 
L
Q
 
K
N
 
R
I
 
I
P
 
P
A
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
T
G
 
G
R
 
V
P
 
P
H
 
E
D
 
D
V
 
L
A
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
E
D
 
E
A
 
A
E
 
K
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
I
L
 
I
V
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
W
L
 
T
W
 
A
N
 
N

Q9BTZ2 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4; NADPH-dependent carbonyl reductase; CR; NADPH-dependent retinol dehydrogenase/reductase; NRDR; humNRDR; Peroxisomal short-chain alcohol dehydrogenase; PSCD; SCAD-SRL; Short chain dehydrogenase/reductase family 25C member 2; Protein SDR25C2; Short-chain dehydrogenase/reductase family member 4; EC 1.1.1.184 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
39% identity, 96% coverage: 3:247/255 of query aligns to 30:273/278 of Q9BTZ2

query
sites
Q9BTZ2
L
 
L
Q
 
A
N
 
N
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
A
S
 
S
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
F
G
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
E
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
H
I
 
V
V
 
V
I
 
V
N
 
S
G
 
S
R
 
R
Q
 
K
D
 
Q
D
 
-
E
 
Q
Q
 
N
A
 
V
R
 
D
E
 
Q
S
 
A
L
 
V
E
 
A
Q
 
T
V
 
L
H
 
Q
A
 
G
R
 
E
G
 
G
R
 
L
R
 
S
V
 
V
C
 
T
F
 
G
I
 
T
A
 
V
A
 
C
D
 
H
V
 
V
G
 
G
D
 
K
V
 
A
E
 
E
Q
 
D
C
 
R
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
V
 
V
R
 
A
E
 
T
G
 
A
I
 
V
E
 
K
Q
 
L
M
 
H
G
 
G
R
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
 
N
A
 
A
G
 
A
V
 
V
Q
 
N
R
 
P
H
 
F
-
 
F
A
 
G
A
 
S
F
 
I
L
 
M
D
 
D
A
 
V
Q
 
T
A
 
E
D
 
E
D
 
V
Y
 
W
D
 
D
Q
 
K
V
 
T
L
 
L
N
 
D
V
 
I
N
 
N
L
 
V
R
 
K
G
 
A
P
 
P
F
 
A
F
 
L
L
 
M
A
 
T
Q
 
K
A
 
A
F
 
V
A
 
V
R
 
P
Y
 
E
L
 
M
R
 
E
E
 
K
H
 
R
G
 
G
R
 
-
G
 
G
G
 
G
R
 
S
I
 
V
I
 
V
N
 
I
N
 
V
S
 
S
S
 
S
V
 
I
H
 
A
E
 
A
E
 
F
L
 
S
P
 
P
H
x
S
P
 
P
N
 
G
F
|
F
T
 
S
A
 
P
Y
 
Y
C
 
N
A
 
V
S
 
S
K
 
K
G
 
T
G
 
A
L
 
L
K
 
L
M
 
G
L
 
L
M
 
T
R
 
K
N
x
T
I
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
R
G
 
N
I
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
N
 
C
V
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
L
V
 
I
E
 
K
T
 
T
P
 
S
I
 
F
N
 
S
R
 
R
E
 
M
L
 
L
M
 
W
N
 
M
Q
 
D
P
 
K
E
 
E
K
 
K
L
 
E
A
 
E
S
 
S
L
 
M
L
 
K
Q
 
E
N
 
T
I
 
L
P
 
R
A
 
I
G
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
P
H
 
E
D
 
D
V
 
C
A
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
V
A
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
P
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
E
T
 
T
L
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

4za2D Crystal structure of pectobacterium carotovorum 2-keto-3-deoxy-d- gluconate dehydrogenase complexed with NAD+ (see paper)
38% identity, 97% coverage: 3:249/255 of query aligns to 8:245/247 of 4za2D

query
sites
4za2D
L
 
L
Q
 
Q
N
 
G
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
C
T
x
D
Q
 
T
G
 
G
I
x
L
G
 
G
R
 
Q
G
 
G
I
 
M
A
 
A
L
 
I
R
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
V
I
 
-
N
 
-
G
 
-
R
 
G
Q
 
V
D
 
N
D
x
I
E
 
V
Q
 
E
A
 
P
R
 
K
E
 
D
S
 
T
L
 
I
E
 
E
Q
 
K
V
 
V
H
 
T
A
 
A
R
 
L
G
 
G
R
 
R
R
 
R
V
 
F
C
 
L
F
 
S
I
 
L
A
 
T
A
 
A
D
|
D
V
x
M
G
 
S
D
 
N
V
 
V
E
 
S
Q
 
G
C
 
H
Q
 
A
R
 
E
L
 
L
V
 
V
R
 
E
E
 
K
G
 
A
I
 
V
E
 
A
Q
 
E
M
 
F
G
 
G
R
 
H
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
Q
 
I
R
 
R
H
 
R
A
 
E
A
 
D
F
 
A
L
 
I
D
 
E
A
 
F
Q
 
S
A
 
E
D
 
K
D
 
N
Y
 
W
D
 
D
Q
 
D
V
 
V
L
 
M
N
 
N
V
x
L
N
 
N
L
 
I
R
 
K
G
 
S
P
 
V
F
 
F
F
 
F
L
 
M
A
 
S
Q
 
Q
A
 
T
F
 
V
A
 
A
R
 
R
Y
 
Q
L
 
F
R
 
I
E
 
K
H
 
Q
G
 
G
R
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
N
x
I
S
 
A
S
|
S
V
 
M
H
 
L
E
 
S
E
 
F
L
 
Q
P
 
G
H
 
G
P
 
I
N
 
R
F
 
V
T
 
P
A
 
S
Y
|
Y
C
 
T
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
S
G
 
A
L
 
V
K
 
M
M
 
G
L
 
V
M
 
T
R
 
R
N
 
L
I
 
M
A
 
A
I
 
N
E
 
E
L
 
W
A
 
A
P
 
K
L
 
H
G
 
G
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
N
 
A
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
|
G
A
 
Y
V
x
M
E
 
A
T
|
T
P
 
N
I
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
M
 
-
N
|
N
Q
 
T
P
 
Q
E
 
E
K
 
R
L
 
S
A
 
K
S
 
E
L
 
I
L
 
L
Q
 
D
N
 
R
I
 
I
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
W
G
 
G
R
 
L
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
V
 
L
A
 
M
G
 
G
V
 
P
V
 
S
A
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
S
D
 
A
A
 
S
E
 
D
Y
 
Y
I
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
Y
T
 
T
L
 
I
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
W
L
 
L

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
41% identity, 97% coverage: 2:249/255 of query aligns to 4:243/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
N
 
D
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
 
A
Q
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
G
 
E
I
 
A
A
 
A
L
 
R
R
 
V
L
 
F
A
 
M
E
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
I
 
V
V
 
V
I
 
I
N
 
-
G
 
A
R
x
D
Q
x
F
D
 
N
D
 
E
E
 
A
Q
 
A
A
 
G
R
 
K
E
 
E
S
 
A
L
 
V
E
 
E
Q
 
A
V
 
-
H
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
N
R
 
P
R
 
G
V
 
V
C
 
V
F
 
F
I
 
I
A
 
R
A
x
V
D
|
D
V
|
V
G
 
S
D
 
D
V
 
R
E
 
E
Q
 
S
C
 
V
Q
 
H
R
 
R
L
 
L
V
 
V
R
 
E
E
 
N
G
 
V
I
 
A
E
 
E
Q
 
R
M
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
Q
 
T
R
 
R
H
x
D
A
 
S
A
 
M
F
 
L
L
 
S
D
x
K
A
 
M
Q
 
T
A
 
V
D
 
D
D
 
Q
Y
 
F
D
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
L
 
I
N
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
P
 
V
F
 
F
F
 
H
L
 
C
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
F
 
V
A
 
L
R
 
P
Y
 
Y
L
 
M
R
 
A
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
R
 
K
G
 
-
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
N
x
T
S
 
S
S
|
S
V
 
V
H
 
T
E
 
G
E
 
T
L
 
Y
P
 
G
H
x
N
P
x
V
N
 
G
F
x
Q
T
 
T
A
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
K
 
I
M
 
G
L
 
M
M
 
T
R
 
K
N
 
T
I
 
W
A
 
A
I
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
N
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
A
x
F
V
x
T
E
 
E
T
|
T
P
 
A
I
x
M
N
 
V
R
 
A
E
 
E
L
 
V
M
 
-
N
 
-
Q
 
-
P
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
V
A
 
I
S
 
E
L
x
K
L
 
M
Q
 
K
-
 
A
N
 
Q
I
 
V
P
 
P
A
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
H
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
N
V
 
A
V
 
Y
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
H
D
 
E
A
 
S
E
 
D
Y
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
T
 
H
T
 
V
L
 
L
V
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I
L
 
M

3o4rA Crystal structure of human dehydrogenase/reductase (sdr family) member 4 (dhrs4)
39% identity, 96% coverage: 3:247/255 of query aligns to 6:249/254 of 3o4rA

query
sites
3o4rA
L
 
L
Q
 
A
N
 
N
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
x
A
S
 
S
T
|
T
Q
x
D
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
F
G
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
E
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
H
I
 
V
V
 
V
I
 
V
N
 
S
G
x
S
R
|
R
Q
x
K
D
 
Q
D
 
-
E
 
Q
Q
x
N
A
 
V
R
 
D
E
 
Q
S
 
A
L
 
V
E
 
A
Q
 
T
V
 
L
H
 
Q
A
 
G
R
 
E
G
 
G
R
 
L
R
 
S
V
 
V
C
 
T
F
 
G
I
 
T
A
 
V
A
 
C
D
x
H
V
|
V
G
 
G
D
 
K
V
 
A
E
 
E
Q
 
D
C
 
R
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
V
 
V
R
 
A
E
 
T
G
 
A
I
 
V
E
 
K
Q
 
L
M
 
H
G
 
G
R
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
|
N
A
 
A
G
x
A
V
 
V
Q
 
N
R
 
P
H
 
F
-
 
F
A
 
G
A
 
S
F
 
I
L
 
M
D
 
D
A
 
V
Q
 
T
A
 
E
D
 
E
D
 
V
Y
 
W
D
 
D
Q
 
K
V
 
T
L
 
L
N
 
D
V
 
I
N
 
N
L
 
V
R
 
K
G
 
A
P
 
P
F
 
A
F
 
L
L
 
M
A
 
T
Q
 
K
A
 
A
F
 
V
A
 
V
R
 
P
Y
 
E
L
 
M
R
 
E
E
 
K
H
 
R
G
 
G
R
 
-
G
 
G
G
 
G
R
 
S
I
 
V
I
 
V
N
 
I
N
 
V
S
 
S
S
|
S
V
 
I
H
 
A
E
 
A
E
 
F
L
 
S
P
 
P
H
 
S
P
 
P
N
 
G
F
|
F
T
 
S
A
 
P
Y
|
Y
C
 
N
A
 
V
S
 
S
K
|
K
G
 
T
G
 
A
L
 
L
K
 
L
M
 
G
L
 
L
M
 
T
R
 
K
N
 
T
I
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
R
G
 
N
I
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
N
 
C
V
 
L
A
 
A
P
|
P
G
|
G
A
x
L
V
x
I
E
 
K
T
|
T
P
 
S
I
x
F
N
x
S
R
 
R
E
 
M
L
 
L
M
 
W
N
 
M
Q
 
D
P
x
K
E
 
E
K
 
K
L
 
E
A
 
E
S
 
S
L
 
M
L
 
K
Q
 
E
N
 
T
I
 
L
P
 
R
A
 
I
G
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
P
H
 
E
D
 
D
V
 
C
A
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
V
A
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
P
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
E
T
 
T
L
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

7do6A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NADP bound-form) (see paper)
39% identity, 98% coverage: 3:251/255 of query aligns to 3:245/247 of 7do6A

query
sites
7do6A
L
 
L
Q
 
I
N
 
D
Q
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
G
 
A
I
 
A
A
 
A
L
 
R
R
 
E
L
 
C
A
 
A
E
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
R
I
 
V
V
 
V
I
 
I
N
 
G
G
x
H
R
x
S
Q
 
G
D
 
S
D
 
D
E
 
E
Q
x
G
A
 
R
R
 
A
E
 
G
S
 
A
L
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
A
E
 
E
Q
 
E
V
 
I
H
 
A
A
 
A
R
 
F
G
 
G
R
 
G
R
 
T
V
 
A
C
 
I
F
 
A
I
 
V
A
 
G
A
 
A
D
|
D
V
x
A
G
 
A
D
 
D
V
 
L
E
 
D
Q
 
S
C
 
G
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
V
 
V
R
 
A
E
 
A
G
 
A
I
 
V
E
 
E
Q
 
A
M
 
F
G
 
G
R
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
Q
 
C
R
 
P
H
 
F
A
 
H
A
 
S
F
 
F
L
 
L
D
 
D
A
 
M
Q
 
P
A
 
R
D
 
E
D
 
L
Y
 
Y
D
 
L
Q
 
K
V
 
T
L
 
V
N
 
G
V
x
T
N
 
N
L
 
L
R
 
N
G
 
G
P
 
A
F
 
Y
F
 
F
L
 
T
A
 
V
Q
 
Q
A
 
A
F
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
R
L
 
M
R
 
K
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
R
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
N
 
V
S
 
S
S
|
S
V
 
I
H
 
S
E
 
A
E
 
L
L
 
V
P
 
G
H
 
G
P
 
A
N
 
M
F
 
Q
T
 
T
A
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
L
M
 
S
L
 
L
M
 
M
R
 
Q
N
 
S
I
 
C
A
 
A
I
 
I
E
 
A
L
 
L
A
 
G
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
I
 
I
T
 
R
V
 
C
N
 
N
N
 
A
V
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
T
V
x
I
E
 
A
T
 
D
P
 
L
I
 
E
N
 
K
R
 
R
E
 
E
L
 
R
M
 
M
N
 
T
Q
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
-
Q
 
S
N
 
R
I
 
V
P
 
P
A
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
P
H
 
D
D
 
D
V
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
P
V
 
I
A
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
M
A
 
A
E
 
R
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
T
 
S
L
 
L
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
F
W
 
V
N
 
N

Q48436 Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; Acetoin(diacetyl) reductase; AR; Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; EC 1.1.1.304 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
36% identity, 97% coverage: 5:251/255 of query aligns to 2:256/256 of Q48436

query
sites
Q48436
N
 
K
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
L
|
L
V
|
V
T
|
T
G
|
G
S
x
A
T
x
G
Q
|
Q
G
|
G
I
|
I
G
|
G
R
x
K
G
x
A
I
|
I
A
|
A
L
|
L
R
|
R
L
|
L
A
x
V
E
x
K
E
x
D
G
|
G
A
x
F
D
x
A
I
x
V
V
x
A
I
|
I
N
 
-
G
x
A
R
x
D
Q
 
Y
D
 
N
D
 
D
E
 
A
Q
 
T
A
 
A
R
 
K
E
 
A
S
 
V
L
 
A
E
 
S
Q
 
E
V
 
I
H
 
N
A
 
Q
R
 
A
G
 
G
R
 
G
R
 
R
V
 
A
C
 
M
F
 
A
I
 
V
A
 
K
A
 
V
D
|
D
V
 
V
G
 
S
D
 
D
V
 
R
E
 
D
Q
 
Q
C
 
V
Q
 
F
R
 
A
L
 
A
V
 
V
R
 
E
E
 
Q
G
 
A
I
 
R
E
 
K
Q
 
T
M
 
L
G
 
G
R
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
Q
 
A
R
 
P
H
 
S
A
 
T
A
 
P
F
 
I
L
 
E
D
 
S
A
 
I
Q
 
T
A
 
P
D
 
E
D
 
I
Y
 
V
D
 
D
Q
 
K
V
 
V
L
 
Y
N
 
N
V
 
I
N
 
N
L
 
V
R
 
K
G
 
G
P
 
V
F
 
I
F
 
W
L
 
G
A
 
I
Q
 
Q
A
 
A
F
 
A
A
 
V
R
 
E
Y
 
A
L
 
F
R
 
K
E
 
K
H
 
E
G
 
G
R
 
H
G
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
N
 
A
S
 
C
S
 
S
V
 
Q
H
 
A
E
 
G
E
 
H
L
 
V
P
 
G
H
 
N
P
 
P
N
 
E
F
 
L
T
 
A
A
 
V
Y
 
Y
C
 
S
A
 
S
S
 
S
K
|
K
G
 
F
G
 
A
L
 
V
K
 
R
M
 
G
L
 
L
M
 
T
R
 
Q
N
 
T
I
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
N
 
G
V
 
Y
A
 
C
P
 
P
G
 
G
A
 
I
V
 
V
E
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
M
N
 
W
R
 
A
E
 
E
L
 
I
M
 
D
N
 
R
Q
 
Q
P
 
V
E
 
S
K
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
L
 
T
A
 
A
S
 
E
L
 
F
L
 
A
Q
 
K
N
 
R
I
 
I
P
 
T
A
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
S
R
 
E
P
 
P
H
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
A
V
 
C
V
 
V
A
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
D
 
D
A
 
S
E
 
D
Y
 
Y
I
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
S
L
 
L
V
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
V
W
 
F
N
 
N

1gegE Cryatal structure analysis of meso-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
36% identity, 97% coverage: 5:251/255 of query aligns to 2:256/256 of 1gegE

query
sites
1gegE
N
 
K
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
 
G
Q
|
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
G
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
V
E
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
D
 
A
I
 
V
V
 
A
I
 
I
N
 
-
G
 
A
R
x
D
Q
x
Y
D
 
N
D
 
D
E
 
A
Q
 
T
A
 
A
R
 
K
E
 
A
S
 
V
L
 
A
E
 
S
Q
 
E
V
 
I
H
 
N
A
 
Q
R
 
A
G
 
G
R
 
G
R
 
H
V
 
A
C
 
V
F
 
A
I
 
V
A
 
K
A
x
V
D
|
D
V
|
V
G
 
S
D
 
D
V
x
R
E
x
D
Q
 
Q
C
 
V
Q
x
F
R
 
A
L
 
A
V
 
V
R
 
E
E
 
Q
G
 
A
I
 
R
E
 
K
Q
 
T
M
 
L
G
 
G
R
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
V
Q
 
A
R
 
P
H
 
S
A
 
T
A
 
P
F
 
I
L
 
E
D
 
S
A
 
I
Q
 
T
A
 
P
D
 
E
D
 
I
Y
 
V
D
 
D
Q
 
K
V
 
V
L
 
Y
N
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
V
R
 
K
G
 
G
P
 
V
F
 
I
F
 
W
L
 
G
A
 
I
Q
 
Q
A
 
A
F
 
A
A
 
V
R
x
E
Y
 
A
L
 
F
R
 
K
E
 
K
H
 
E
G
 
G
R
 
H
G
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
N
 
A
S
 
C
S
|
S
V
 
Q
H
 
A
E
 
G
E
 
H
L
 
V
P
 
G
H
 
N
P
 
P
N
 
E
F
 
L
T
 
A
A
 
V
Y
|
Y
C
 
S
A
 
S
S
 
S
K
|
K
G
 
F
G
 
A
L
 
V
K
 
R
M
 
G
L
 
L
M
 
T
R
 
Q
N
 
T
I
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
N
 
G
V
 
Y
A
 
C
P
|
P
G
 
G
A
 
I
V
|
V
E
 
K
T
|
T
P
 
P
I
x
M
N
 
W
R
 
A
E
 
E
L
 
I
M
 
D
N
 
R
Q
 
Q
P
x
V
E
 
S
K
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
L
 
T
A
 
A
S
 
E
L
 
F
L
 
A
Q
 
K
N
 
R
I
 
I
P
 
T
A
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
S
R
 
E
P
 
P
H
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
A
V
 
C
V
 
V
A
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
D
 
D
A
 
S
E
 
D
Y
 
Y
I
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
S
L
 
L
V
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
V
W
 
F
N
 
N

5u9pB Crystal structure of a gluconate 5-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia j2315 in complex with NADP and tartrate
40% identity, 97% coverage: 1:248/255 of query aligns to 12:257/261 of 5u9pB

query
sites
5u9pB
M
 
F
R
 
R
L
 
L
Q
 
D
N
 
G
Q
 
R
V
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
G
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
G
 
T
I
 
L
A
 
A
L
 
R
R
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
D
R
|
R
Q
 
-
D
 
N
D
 
E
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
R
 
A
E
 
T
S
 
L
L
 
A
E
 
R
Q
 
R
V
 
F
H
 
R
A
 
D
R
 
E
G
 
G
R
 
F
R
 
A
V
 
A
C
 
D
F
 
H
I
 
A
A
 
V
A
 
F
D
|
D
V
|
V
G
 
A
D
 
E
V
 
H
E
 
A
Q
 
Q
C
 
V
Q
 
R
R
 
A
L
 
A
V
 
I
R
 
D
E
 
E
G
 
F
I
 
E
E
 
A
Q
 
R
M
 
V
G
 
G
R
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
R
 
R
H
 
R
A
 
A
A
 
P
F
 
L
L
 
D
D
 
A
A
 
F
Q
 
E
A
 
P
D
 
D
D
 
D
Y
 
W
D
 
H
Q
 
A
V
 
L
L
 
M
N
 
R
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
D
G
 
G
P
 
V
F
 
F
F
 
N
L
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
V
A
 
A
R
 
R
Y
 
H
L
 
M
R
 
I
E
 
A
H
 
R
G
 
G
R
 
H
G
 
G
G
 
-
R
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
N
x
I
S
 
C
S
|
S
V
 
V
H
 
Q
E
 
S
E
 
E
L
 
L
P
 
A
H
 
R
P
 
P
N
 
T
F
 
I
T
 
A
A
 
P
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
V
K
 
R
M
 
M
L
 
L
M
 
T
R
 
K
N
 
G
I
 
M
A
 
C
I
 
A
E
 
D
L
 
W
A
 
A
P
 
R
L
 
Y
G
 
G
I
 
I
T
 
Q
V
 
A
N
 
N
N
 
G
V
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
A
 
Y
V
x
F
E
 
E
T
|
T
P
 
E
I
x
L
N
|
N
R
 
R
E
 
A
L
 
L
M
 
V
N
 
D
Q
 
D
P
 
A
E
 
A
K
 
F
L
 
S
A
 
D
S
 
W
L
 
L
L
 
C
Q
 
K
N
 
R
I
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
W
G
 
G
R
 
Q
P
 
V
H
 
D
D
 
E
V
 
L
A
 
C
G
 
G
V
 
A
V
 
A
A
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
A
D
 
A
A
 
S
E
 
D
Y
 
F
I
 
V
T
 
N
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
L
 
L
V
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L

Query Sequence

>GFF356 FitnessBrowser__psRCH2:GFF356
MRLQNQVALVTGSTQGIGRGIALRLAEEGADIVINGRQDDEQARESLEQVHARGRRVCFI
AADVGDVEQCQRLVREGIEQMGRLDILVNNAGVQRHAAFLDAQADDYDQVLNVNLRGPFF
LAQAFARYLREHGRGGRIINNSSVHEELPHPNFTAYCASKGGLKMLMRNIAIELAPLGIT
VNNVAPGAVETPINRELMNQPEKLASLLQNIPAGRLGRPHDVAGVVAFLASPDAEYITGT
TLVVDGGLLWNYSEQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory