SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3576 FitnessBrowser__Phaeo:GFF3576 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 11 hits to proteins with known functional sites (download)

3tdtA Complex of tetrahydrodipicolinate n-succinyltransferase with 2-amino- 6-oxopimelate and coenzyme a (see paper)
64% identity, 98% coverage: 5:274/275 of query aligns to 3:271/274 of 3tdtA

query
sites
3tdtA
Q
 
Q
L
 
L
E
 
Q
T
 
N
A
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
S
A
 
A
W
 
F
E
 
E
A
 
R
R
 
R
D
 
A
T
 
D
I
 
I
T
 
T
S
 
P
A
 
A
T
 
N
T
 
V
G
 
D
E
 
T
-
 
V
Q
 
T
R
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
N
E
 
Q
T
 
V
L
 
I
N
 
G
A
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
S
G
 
G
K
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
K
Q
 
I
D
 
D
S
 
-
G
 
G
N
 
Q
W
 
W
H
 
V
V
 
T
N
 
H
Q
 
Q
W
 
W
A
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
S
F
 
F
R
 
R
I
 
I
K
 
N
D
 
D
M
 
N
E
 
K
E
 
V
Q
 
M
S
 
D
G
 
G
G
 
A
P
 
E
Q
 
-
G
 
-
S
 
T
G
 
R
W
 
Y
W
 
Y
D
 
D
K
 
K
V
 
V
D
 
P
S
 
M
K
 
K
F
 
F
K
 
A
G
 
D
W
 
Y
G
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
R
W
 
F
K
 
Q
E
 
K
A
 
E
G
 
G
F
 
F
R
|
R
A
 
V
V
 
V
P
 
P
N
 
P
C
 
A
V
 
T
V
 
V
R
 
R
K
 
Q
S
 
G
A
 
A
Y
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
R
G
 
N
V
 
T
V
 
V
L
 
L
M
|
M
P
 
P
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
I
G
 
G
A
 
A
H
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
G
 
G
T
 
T
M
|
M
V
 
V
D
|
D
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
S
 
S
C
 
C
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
V
 
V
H
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
|
G
V
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
M
 
L
Q
 
Q
A
 
A
G
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
D
 
D
N
 
N
C
 
C
F
 
F
I
 
I
G
|
G
A
|
A
R
 
R
S
 
S
E
|
E
V
 
V
V
 
V
E
 
E
G
 
G
C
 
V
I
 
I
V
 
V
R
 
E
E
 
E
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
I
G
x
S
M
|
M
G
 
G
V
 
V
F
 
Y
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
K
 
R
I
 
I
V
 
Y
D
 
D
R
|
R
E
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
M
 
H
Y
 
Y
G
 
G
E
 
R
V
 
V
P
 
P
P
 
A
Y
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
V
|
V
A
 
S
G
 
G
S
 
N
M
 
L
P
 
P
S
 
S
K
 
K
N
 
D
G
 
G
-
 
S
I
 
Y
N
 
S
L
 
L
Y
 
Y
C
 
C
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
V
K
|
K
R
 
K
V
 
V
D
 
D
E
 
A
R
x
K
T
|
T
R
 
R
S
 
G
K
|
K
T
 
V
G
 
G
I
 
I
N
 
N
E
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
R

2tdtA Complex of tetrahydrodipicolinate n-succinyltransferase with 2- aminopimelate and coenzyme a (see paper)
64% identity, 98% coverage: 5:274/275 of query aligns to 3:271/274 of 2tdtA

query
sites
2tdtA
Q
 
Q
L
 
L
E
 
Q
T
 
N
A
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
S
A
 
A
W
 
F
E
 
E
A
 
R
R
 
R
D
 
A
T
 
D
I
 
I
T
 
T
S
 
P
A
 
A
T
 
N
T
 
V
G
 
D
E
 
T
-
 
V
Q
 
T
R
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
N
E
 
Q
T
 
V
L
 
I
N
 
G
A
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
S
G
 
G
K
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
K
Q
 
I
D
 
D
S
 
-
G
 
G
N
 
Q
W
 
W
H
 
V
V
 
T
N
 
H
Q
 
Q
W
 
W
A
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
S
F
 
F
R
 
R
I
 
I
K
 
N
D
 
D
M
 
N
E
 
K
E
 
V
Q
 
M
S
 
D
G
 
G
G
 
A
P
 
E
Q
 
-
G
 
-
S
 
T
G
 
R
W
 
Y
W
 
Y
D
 
D
K
 
K
V
 
V
D
 
P
S
 
M
K
 
K
F
 
F
K
 
A
G
 
D
W
 
Y
G
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
R
W
 
F
K
 
Q
E
 
K
A
 
E
G
 
G
F
 
F
R
|
R
A
 
V
V
 
V
P
 
P
N
 
P
C
 
A
V
 
T
V
 
V
R
 
R
K
 
Q
S
 
G
A
 
A
Y
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
R
G
 
N
V
 
T
V
 
V
L
 
L
M
|
M
P
 
P
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
I
G
 
G
A
 
A
H
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
G
 
G
T
 
T
M
|
M
V
 
V
D
|
D
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
S
 
S
C
 
C
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
V
 
V
H
 
H
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
|
G
V
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
M
 
L
Q
 
Q
A
 
A
G
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
D
 
D
N
 
N
C
 
C
F
|
F
I
 
I
G
|
G
A
 
A
R
 
R
S
 
S
E
|
E
V
 
V
V
 
V
E
 
E
G
 
G
C
 
V
I
 
I
V
 
V
R
 
E
E
 
E
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
I
G
x
S
M
|
M
G
 
G
V
 
V
F
 
Y
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
K
 
R
I
 
I
V
 
Y
D
 
D
R
|
R
E
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
M
 
H
Y
 
Y
G
 
G
E
 
R
V
 
V
P
 
P
P
 
A
Y
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
S
G
 
G
S
 
N
M
 
L
P
 
P
S
 
S
K
 
K
N
 
D
G
 
G
-
 
S
I
 
Y
N
 
S
L
 
L
Y
 
Y
C
 
C
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
V
K
|
K
R
 
K
V
 
V
D
 
D
E
 
A
R
x
K
T
|
T
R
 
R
S
 
G
K
|
K
T
 
V
G
 
G
I
 
I
N
 
N
E
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
R

1kgtA Crystal structure of tetrahydrodipicolinate n-succinyltransferase in complex with pimelate and succinyl-coa (see paper)
64% identity, 98% coverage: 5:274/275 of query aligns to 3:271/274 of 1kgtA

query
sites
1kgtA
Q
 
Q
L
 
L
E
 
Q
T
 
N
A
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
S
A
 
A
W
 
F
E
 
E
A
 
R
R
 
R
D
 
A
T
 
D
I
 
I
T
 
T
S
 
P
A
 
A
T
 
N
T
 
V
G
 
D
E
 
T
-
 
V
Q
 
T
R
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
N
E
 
Q
T
 
V
L
 
I
N
 
G
A
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
S
G
 
G
K
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
K
Q
 
I
D
 
D
S
 
-
G
 
G
N
 
Q
W
 
W
H
 
V
V
 
T
N
 
H
Q
 
Q
W
 
W
A
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
S
F
 
F
R
 
R
I
 
I
K
 
N
D
 
D
M
 
N
E
 
K
E
 
V
Q
 
M
S
 
D
G
 
G
G
 
A
P
 
E
Q
 
-
G
 
-
S
 
T
G
 
R
W
 
Y
W
 
Y
D
 
D
K
 
K
V
 
V
D
 
P
S
 
M
K
 
K
F
 
F
K
 
A
G
 
D
W
 
Y
G
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
R
W
 
F
K
 
Q
E
 
K
A
 
E
G
 
G
F
 
F
R
|
R
A
 
V
V
 
V
P
 
P
N
 
P
C
 
A
V
 
T
V
 
V
R
 
R
K
 
Q
S
 
G
A
 
A
Y
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
R
G
 
N
V
 
T
V
 
V
L
 
L
M
|
M
P
 
P
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
I
G
 
G
A
 
A
H
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
G
 
G
T
 
T
M
|
M
V
 
V
D
|
D
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
S
 
S
C
 
C
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
V
 
V
H
 
H
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
|
G
V
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
M
 
L
Q
 
Q
A
 
A
G
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
D
 
D
N
 
N
C
 
C
F
 
F
I
 
I
G
 
G
A
|
A
R
 
R
S
 
S
E
|
E
V
 
V
V
 
V
E
 
E
G
 
G
C
 
V
I
 
I
V
 
V
R
 
E
E
 
E
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
I
G
x
S
M
 
M
G
 
G
V
 
V
F
 
Y
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
K
 
R
I
 
I
V
 
Y
D
 
D
R
|
R
E
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
M
 
H
Y
 
Y
G
 
G
E
 
R
V
 
V
P
 
P
P
 
A
Y
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
S
G
 
G
S
 
N
M
 
L
P
 
P
S
 
S
K
 
K
N
 
D
G
 
G
-
 
S
I
 
Y
N
 
S
L
 
L
Y
 
Y
C
 
C
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
V
K
 
K
R
 
K
V
 
V
D
 
D
E
 
A
R
x
K
T
|
T
R
 
R
S
 
G
K
|
K
T
 
V
G
 
G
I
 
I
N
 
N
E
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
R

1kgqA Crystal structure of tetrahydrodipicolinate n-succinyltransferase in complex with l-2-aminopimelate and succinamide-coa (see paper)
64% identity, 98% coverage: 5:274/275 of query aligns to 3:271/274 of 1kgqA

query
sites
1kgqA
Q
 
Q
L
 
L
E
 
Q
T
 
N
A
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
S
A
 
A
W
 
F
E
 
E
A
 
R
R
 
R
D
 
A
T
 
D
I
 
I
T
 
T
S
 
P
A
 
A
T
 
N
T
 
V
G
 
D
E
 
T
-
 
V
Q
 
T
R
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
N
E
 
Q
T
 
V
L
 
I
N
 
G
A
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
S
G
 
G
K
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
K
Q
 
I
D
 
D
S
 
-
G
 
G
N
 
Q
W
 
W
H
 
V
V
 
T
N
 
H
Q
 
Q
W
 
W
A
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
S
F
 
F
R
 
R
I
 
I
K
 
N
D
 
D
M
 
N
E
 
K
E
 
V
Q
 
M
S
 
D
G
 
G
G
 
A
P
 
E
Q
 
-
G
 
-
S
 
T
G
 
R
W
 
Y
W
 
Y
D
 
D
K
 
K
V
 
V
D
 
P
S
 
M
K
 
K
F
 
F
K
 
A
G
 
D
W
 
Y
G
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
R
W
 
F
K
 
Q
E
 
K
A
 
E
G
 
G
F
 
F
R
|
R
A
 
V
V
 
V
P
 
P
N
 
P
C
 
A
V
 
T
V
 
V
R
 
R
K
 
Q
S
 
G
A
 
A
Y
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
R
G
 
N
V
 
T
V
 
V
L
 
L
M
|
M
P
 
P
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
I
G
 
G
A
 
A
H
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
G
 
G
T
 
T
M
|
M
V
 
V
D
|
D
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
S
 
S
C
 
C
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
V
 
V
H
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
|
G
V
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
M
 
L
Q
 
Q
A
 
A
G
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
D
 
D
N
 
N
C
 
C
F
|
F
I
 
I
G
|
G
A
 
A
R
 
R
S
 
S
E
|
E
V
 
V
V
 
V
E
 
E
G
 
G
C
 
V
I
 
I
V
 
V
R
 
E
E
 
E
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
I
G
x
S
M
|
M
G
 
G
V
 
V
F
 
Y
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
K
 
R
I
 
I
V
 
Y
D
 
D
R
|
R
E
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
M
 
H
Y
 
Y
G
 
G
E
 
R
V
 
V
P
 
P
P
 
A
Y
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
V
|
V
A
 
S
G
 
G
S
 
N
M
 
L
P
 
P
S
 
S
K
 
K
N
 
D
G
 
G
-
 
S
I
 
Y
N
 
S
L
 
L
Y
 
Y
C
 
C
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
V
K
|
K
R
 
K
V
 
V
D
 
D
E
 
A
R
x
K
T
|
T
R
 
R
S
 
G
K
|
K
T
 
V
G
 
G
I
 
I
N
 
N
E
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
R

3r8yA Structure of the bacillus anthracis tetrahydropicolinate succinyltransferase
39% identity, 33% coverage: 108:198/275 of query aligns to 77:168/203 of 3r8yA

query
sites
3r8yA
R
 
R
A
 
I
V
 
E
P
 
P
N
 
G
C
 
A
V
 
I
V
 
I
R
 
R
K
 
D
S
 
H
A
 
V
Y
 
E
I
 
I
A
 
G
P
 
D
-
 
N
G
 
A
V
 
V
V
 
I
L
 
M
M
 
M
P
 
N
S
 
A
F
 
T
V
 
I
N
 
N
L
 
I
G
 
G
A
 
A
H
 
V
V
 
I
D
 
G
E
 
E
G
 
G
T
 
S
M
 
M
V
 
I
D
|
D
T
 
M
W
 
N
A
 
A
T
 
V
V
 
L
G
|
G
S
x
G
C
 
R
A
 
A
Q
 
T
I
 
V
G
 
G
K
 
K
N
 
N
V
 
C
H
 
H
L
 
V
S
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
V
I
 
L
G
 
A
G
|
G
V
 
V
L
 
I
E
 
E
P
 
P
M
 
P
Q
 
S
A
 
A
G
 
K
P
 
P
T
 
V
I
 
I
I
 
V
E
 
E
D
 
D
N
 
D
C
 
V
F
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
N
S
 
V
E
x
V
V
 
V
V
 
L
E
 
E
G
 
G
C
 
V

3bsyA Pgld from campylobacter jejuni, nctc 11168, in complex with acetyl coenzyme a (see paper)
26% identity, 58% coverage: 58:217/275 of query aligns to 23:191/193 of 3bsyA

query
sites
3bsyA
N
 
N
Q
 
M
W
 
G
A
 
Y
K
 
K
K
 
E
A
 
C
V
 
I
L
 
F
L
 
L
G
 
D
F
 
-
R
 
D
I
 
F
K
 
K
D
 
G
M
 
M
E
 
K
E
 
F
Q
 
E
S
 
S
G
 
T
G
 
L
P
 
P
Q
 
K
G
 
Y
S
 
D
G
 
F
W
 
F
W
 
I
D
 
A
K
 
I
V
 
G
D
 
N
S
 
N
K
 
E
F
 
I
K
 
R
G
 
K
W
 
K
G
 
I
E
 
Y
A
 
Q
E
 
K
W
 
I
K
 
S
E
 
E
A
 
N
G
 
G
F
 
F
R
 
K
A
 
I
V
 
V
P
 
N
N
 
-
C
 
-
V
 
L
V
 
I
R
 
H
K
 
K
S
 
S
A
 
A
Y
 
L
I
 
I
A
 
S
P
 
P
-
 
S
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
N
-
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
L
L
 
I
M
 
M
P
 
P
S
 
Y
F
 
V
V
 
V
-
 
I
N
 
N
L
 
A
G
 
K
A
 
A
H
 
K
V
 
I
D
 
E
E
 
K
G
 
G
T
 
V
M
 
I
V
 
L
D
 
N
T
 
T
W
 
S
A
 
S
T
 
V
V
 
I
G
 
E
S
 
H
C
 
E
A
 
C
Q
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
E
N
 
F
V
 
S
H
|
H
L
 
V
S
|
S
G
x
V
G
 
G
V
 
A
G
 
K
I
 
C
G
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
|
A
G
 
G
P
 
N
T
 
V
I
 
K
I
 
I
E
 
G
D
 
K
N
 
N
C
 
C
F
|
F
I
 
L
G
|
G
A
x
I
R
 
N
S
 
S
E
 
C
V
 
V
V
x
L
E
 
P
G
 
N
C
 
L
I
 
S
V
 
L
R
 
A
E
 
D
G
 
D
S
 
S
V
 
I
L
 
L
G
|
G
-
x
G
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
L
-
x
V
-
 
K
-
 
N
-
 
Q
-
 
D
-
 
E
M
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
I
x
V
G
 
G
Q
 
V
S
x
P
T
 
A
K
 
K

3bssA Pgld from campylobacter jejuni, nctc 11168, with native substrate (see paper)
26% identity, 58% coverage: 58:217/275 of query aligns to 24:192/194 of 3bssA

query
sites
3bssA
N
 
N
Q
 
M
W
 
G
A
 
Y
K
 
K
K
 
E
A
 
C
V
 
I
L
 
F
L
 
L
G
x
D
F
 
-
R
x
D
I
x
F
K
 
K
D
 
G
M
 
M
E
 
K
E
 
F
Q
 
E
S
 
S
G
 
T
G
 
L
P
 
P
Q
 
K
G
 
Y
S
 
D
G
 
F
W
 
F
W
 
I
D
 
A
K
x
I
V
x
G
D
 
N
S
 
N
K
 
E
F
x
I
K
 
R
G
 
K
W
 
K
G
 
I
E
 
Y
A
 
Q
E
 
K
W
 
I
K
 
S
E
 
E
A
 
N
G
 
G
F
 
F
R
 
K
A
 
I
V
 
V
P
 
N
N
 
-
C
 
-
V
 
L
V
 
I
R
 
H
K
 
K
S
 
S
A
 
A
Y
 
L
I
 
I
A
 
S
P
 
P
-
 
S
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
N
-
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
L
L
 
I
M
 
M
P
 
P
S
 
Y
F
 
V
V
 
V
-
 
I
N
 
N
L
 
A
G
 
K
A
 
A
H
 
K
V
 
I
D
 
E
E
 
K
G
 
G
T
 
V
M
 
I
V
 
L
D
 
N
T
 
T
W
 
S
A
 
S
T
 
V
V
 
I
G
 
E
S
 
H
C
 
E
A
 
C
Q
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
E
N
 
F
V
 
S
H
 
H
L
 
V
S
 
S
G
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
K
I
 
C
G
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
A
G
 
G
P
 
N
T
 
V
I
 
K
I
 
I
E
 
G
D
 
K
N
 
N
C
 
C
F
 
F
I
 
L
G
 
G
A
 
I
R
 
N
S
 
S
E
 
C
V
 
V
V
 
L
E
 
P
G
 
N
C
 
L
I
 
S
V
 
L
R
 
A
E
 
D
G
 
D
S
 
S
V
 
I
L
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
L
-
 
V
-
 
K
-
 
N
-
 
Q
-
 
D
-
 
E
M
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
I
 
V
G
 
G
Q
 
V
S
 
P
T
 
A
K
 
K

Sites not aligning to the query:

2vheA Pgld-coa complex: an acetyl transferase from campylobacter jejuni (see paper)
26% identity, 58% coverage: 58:217/275 of query aligns to 24:192/194 of 2vheA

query
sites
2vheA
N
 
N
Q
 
M
W
 
G
A
 
Y
K
 
K
K
 
E
A
 
C
V
 
I
L
 
F
L
 
L
G
 
D
F
 
-
R
 
D
I
 
F
K
 
K
D
 
G
M
 
M
E
 
K
E
 
F
Q
 
E
S
 
S
G
 
T
G
 
L
P
 
P
Q
 
K
G
 
Y
S
 
D
G
 
F
W
 
F
W
 
I
D
 
A
K
 
I
V
 
G
D
 
N
S
 
N
K
 
E
F
 
I
K
 
R
G
 
K
W
 
K
G
 
I
E
 
Y
A
 
Q
E
 
K
W
 
I
K
 
S
E
 
E
A
 
N
G
 
G
F
 
F
R
 
K
A
 
I
V
 
V
P
 
N
N
 
-
C
 
-
V
 
L
V
 
I
R
 
H
K
 
K
S
 
S
A
 
A
Y
 
L
I
 
I
A
 
S
P
 
P
-
 
S
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
N
-
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
L
L
 
I
M
 
M
P
 
P
S
 
Y
F
 
V
V
 
V
-
 
I
N
 
N
L
 
A
G
 
K
A
 
A
H
 
K
V
 
I
D
 
E
E
 
K
G
 
G
T
 
V
M
 
I
V
 
L
D
 
N
T
 
T
W
 
S
A
 
S
T
 
V
V
 
I
G
 
E
S
 
H
C
 
E
A
 
C
Q
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
E
N
 
F
V
 
S
H
 
H
L
 
V
S
|
S
G
x
V
G
 
G
V
 
A
G
 
K
I
 
C
G
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
A
G
 
G
P
 
N
T
 
V
I
 
K
I
 
I
E
 
G
D
 
K
N
 
N
C
 
C
F
|
F
I
 
L
G
|
G
A
x
I
R
 
N
S
 
S
E
 
C
V
 
V
V
 
L
E
 
P
G
 
N
C
 
L
I
 
S
V
 
L
R
 
A
E
 
D
G
 
D
S
 
S
V
 
I
L
 
L
G
|
G
-
x
G
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
L
-
 
V
-
 
K
-
 
N
-
 
Q
-
 
D
-
 
E
M
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
I
x
V
G
 
G
Q
 
V
S
 
P
T
 
A
K
 
K

Sites not aligning to the query:

Q0P9D1 UDP-N-acetylbacillosamine N-acetyltransferase; Protein glycosylation D; UDP-4-amino-4,6-dideoxy-N-acetyl-alpha-D-glucosamine N-acetyltransferase; EC 2.3.1.203 from Campylobacter jejuni subsp. jejuni serotype O:2 (strain ATCC 700819 / NCTC 11168) (see 2 papers)
26% identity, 58% coverage: 58:217/275 of query aligns to 25:193/195 of Q0P9D1

query
sites
Q0P9D1
N
 
N
Q
 
M
W
 
G
A
 
Y
K
 
K
K
 
E
A
 
C
V
 
I
L
 
F
L
 
L
G
 
D
F
 
-
R
 
D
I
 
F
K
 
K
D
 
G
M
 
M
E
 
K
E
 
F
Q
 
E
S
 
S
G
 
T
G
 
L
P
 
P
Q
 
K
G
 
Y
S
 
D
G
 
F
W
 
F
W
 
I
D
 
A
K
 
I
V
 
G
D
 
N
S
 
N
K
 
E
F
 
I
K
 
R
G
 
K
W
 
K
G
 
I
E
 
Y
A
 
Q
E
 
K
W
 
I
K
 
S
E
 
E
A
 
N
G
 
G
F
 
F
R
 
K
A
 
I
V
 
V
P
 
N
N
 
-
C
 
-
V
 
L
V
 
I
R
 
H
K
 
K
S
 
S
A
 
A
Y
 
L
I
 
I
A
 
S
P
 
P
-
 
S
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
N
-
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
L
L
 
I
M
 
M
P
 
P
S
 
Y
F
 
V
V
 
V
-
 
I
N
 
N
L
 
A
G
 
K
A
 
A
H
 
K
V
 
I
D
 
E
E
 
K
G
 
G
T
 
V
M
 
I
V
 
L
D
x
N
T
 
T
W
 
S
A
 
S
T
 
V
V
 
I
G
x
E
S
x
H
C
 
E
A
 
C
Q
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
E
N
 
F
V
 
S
H
|
H
L
 
V
S
 
S
G
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
K
I
 
C
G
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
A
G
 
G
P
 
N
T
 
V
I
 
K
I
 
I
E
 
G
D
 
K
N
 
N
C
 
C
F
 
F
I
 
L
G
 
G
A
x
I
R
 
N
S
 
S
E
 
C
V
 
V
V
 
L
E
 
P
G
 
N
C
 
L
I
 
S
V
 
L
R
 
A
E
 
D
G
 
D
S
 
S
V
 
I
L
 
L
G
 
G
-
x
G
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
L
-
 
V
-
 
K
-
 
N
-
 
Q
-
 
D
-
 
E
M
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
I
 
V
G
 
G
Q
 
V
S
 
P
T
 
A
K
 
K

Sites not aligning to the query:

5tyhA Pgld from campylobacter jejuni nctc 11168 in complex with 5-(2- furanyl)-1h-pyrazole-3-carboxylic acid (see paper)
29% identity, 41% coverage: 104:217/275 of query aligns to 60:183/185 of 5tyhA

query
sites
5tyhA
E
 
E
A
 
N
G
 
G
F
 
F
R
 
K
A
 
I
V
 
V
P
 
N
N
 
-
C
 
-
V
 
L
V
 
I
R
 
H
K
 
K
S
 
S
A
 
A
Y
 
L
I
|
I
A
x
S
P
 
P
-
 
S
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
N
-
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
L
L
 
I
M
 
M
P
 
P
S
 
Y
F
 
V
V
 
V
-
 
I
N
|
N
L
 
A
G
 
K
A
 
A
H
 
K
V
 
I
D
 
E
E
 
K
G
 
G
T
 
V
M
 
I
V
 
L
D
x
N
T
 
T
W
 
S
A
 
S
T
 
V
V
 
I
G
 
E
S
 
H
C
 
E
A
 
C
Q
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
E
N
 
F
V
 
S
H
 
H
L
 
V
S
|
S
G
x
V
G
 
G
V
 
A
G
 
K
I
 
C
G
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
A
G
 
G
P
 
N
T
 
V
I
 
K
I
 
I
E
 
G
D
 
K
N
 
N
C
 
C
F
|
F
I
 
L
G
|
G
A
x
I
R
 
N
S
 
S
E
 
C
V
 
V
V
 
L
E
 
P
G
 
N
C
 
L
I
 
S
V
 
L
R
 
A
E
 
D
G
 
D
S
 
S
V
 
I
L
 
L
G
 
G
-
x
G
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
L
-
 
V
-
 
K
-
 
N
-
 
Q
-
 
D
-
 
E
M
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
I
 
V
G
 
G
Q
 
V
S
 
P
T
 
A
K
 
K

5t2yA Crystal structure of c. Jejuni pgld in complex with 5-methyl-4- (methylamino)-2-phenethylthieno[2,3-d]pyrimidine-6-carboxylic acid (see paper)
29% identity, 41% coverage: 104:217/275 of query aligns to 67:190/192 of 5t2yA

query
sites
5t2yA
E
 
E
A
 
N
G
 
G
F
 
F
R
 
K
A
 
I
V
 
V
P
 
N
N
 
-
C
 
-
V
 
L
V
 
I
R
 
H
K
 
K
S
 
S
A
 
A
Y
 
L
I
 
I
A
 
S
P
 
P
-
 
S
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
N
-
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
L
L
 
I
M
 
M
P
 
P
S
 
Y
F
 
V
V
 
V
-
 
I
N
 
N
L
 
A
G
 
K
A
 
A
H
 
K
V
 
I
D
 
E
E
 
K
G
 
G
T
 
V
M
 
I
V
 
L
D
 
N
T
 
T
W
 
S
A
 
S
T
 
V
V
 
I
G
 
E
S
 
H
C
 
E
A
 
C
Q
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
E
N
 
F
V
 
S
H
 
H
L
 
V
S
|
S
G
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
K
I
 
C
G
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
A
G
 
G
P
 
N
T
 
V
I
 
K
I
 
I
E
 
G
D
 
K
N
 
N
C
 
C
F
|
F
I
 
L
G
|
G
A
x
I
R
 
N
S
 
S
E
 
C
V
 
V
V
 
L
E
 
P
G
 
N
C
 
L
I
 
S
V
 
L
R
 
A
E
 
D
G
 
D
S
 
S
V
 
I
L
 
L
G
 
G
-
x
G
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
L
-
 
V
-
 
K
-
 
N
-
 
Q
-
 
D
-
 
E
M
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
I
x
V
G
 
G
Q
 
V
S
 
P
T
 
A
K
 
K

Query Sequence

>GFF3576 FitnessBrowser__Phaeo:GFF3576
MSNAQLETAIEAAWEARDTITSATTGEQRDAIEETLNALDSGKLRVAERQDSGNWHVNQW
AKKAVLLGFRIKDMEEQSGGPQGSGWWDKVDSKFKGWGEAEWKEAGFRAVPNCVVRKSAY
IAPGVVLMPSFVNLGAHVDEGTMVDTWATVGSCAQIGKNVHLSGGVGIGGVLEPMQAGPT
IIEDNCFIGARSEVVEGCIVREGSVLGMGVFIGQSTKIVDRETGEVMYGEVPPYSVVVAG
SMPSKNGINLYCAVIVKRVDERTRSKTGINELLRD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory