SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3619 PGA1_262p00230 betaine aldehyde dehydrogenase BetB to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P49189 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase; TMABA-DH; TMABALDH; Aldehyde dehydrogenase E3 isozyme; Aldehyde dehydrogenase family 9 member A1; Formaldehyde dehydrogenase; Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase; R-aminobutyraldehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.47; EC 1.2.1.3; EC 1.2.1.46; EC 1.2.1.19 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
39% identity, 93% coverage: 34:494/494 of query aligns to 25:487/494 of P49189

query
sites
P49189
A
 
A
G
 
S
G
 
G
R
 
T
M
 
E
E
 
K
S
 
A
F
 
F
D
 
E
P
 
P
G
 
A
R
 
T
G
 
G
T
 
R
A
 
V
F
 
I
D
 
A
D
 
T
F
 
F
A
 
T
A
 
C
G
 
S
D
 
G
A
 
E
A
 
K
D
 
E
V
 
V
D
 
N
H
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
Q
S
 
N
A
 
A
V
 
K
A
 
A
G
 
A
F
 
F
E
 
K
I
 
I
W
 
W
S
 
S
A
 
Q
T
 
K
P
 
S
P
 
G
A
 
M
R
 
E
R
 
R
C
 
C
A
 
R
I
 
I
L
 
L
N
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
I
M
 
I
R
 
R
H
 
E
E
 
R
A
 
E
E
 
D
H
 
E
L
 
I
A
 
A
V
 
T
V
 
M
E
 
E
C
 
C
V
 
I
D
 
N
S
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
S
L
 
I
A
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
R
G
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
D
G
 
I
S
 
S
A
 
W
R
 
Q
L
x
C
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
A
D
 
A
K
 
S
L
 
M
D
 
A
G
 
G
R
 
E
S
 
H
V
 
I
N
 
Q
L
 
L
G
 
P
N
 
G
D
 
G
N
 
S
A
 
F
A
 
G
F
 
Y
T
 
T
L
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
C
A
 
V
H
 
G
I
 
I
V
 
G
P
 
A
W
 
W
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
S
 
F
S
 
Q
T
 
I
L
 
A
V
 
S
R
 
W
G
 
K
I
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
C
G
 
G
C
 
N
S
 
A
A
 
M
V
 
V
V
 
F
K
 
K
P
 
P
A
 
S
E
 
P
T
 
F
T
 
T
P
 
P
F
 
V
T
 
S
A
 
A
L
 
L
M
 
L
I
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
I
L
 
Y
I
 
S
R
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
P
G
 
G
V
 
L
V
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
V
T
 
Q
G
 
G
T
 
-
G
 
G
I
 
A
A
 
A
A
 
T
G
 
G
A
 
Q
P
 
F
L
 
L
V
 
C
R
 
Q
D
 
H
P
 
P
R
 
D
V
 
V
R
 
A
H
 
K
V
 
V
T
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
V
A
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
M
G
 
K
V
 
I
M
 
M
Q
 
E
S
 
M
V
 
S
A
 
A
P
 
K
N
 
G
V
 
I
T
 
K
G
 
P
L
 
V
T
 
T
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
A
 
I
F
 
F
G
 
S
D
 
D
A
 
C
N
 
D
V
 
M
D
 
N
A
 
N
V
 
A
V
 
V
E
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
L
W
 
M
A
 
A
I
 
N
F
 
F
S
 
L
N
 
T
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
C
 
C
S
 
C
A
 
N
G
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
V
V
 
F
I
 
V
H
 
Q
R
 
K
S
 
E
L
 
I
H
 
L
A
 
D
E
 
K
V
 
F
R
 
T
D
 
E
K
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
K
R
 
Q
A
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
R
 
K
V
 
I
G
 
G
H
 
D
G
 
P
-
 
L
L
 
L
R
 
E
G
 
D
P
 
T
D
 
R
I
 
M
G
 
G
A
 
P
V
 
L
N
 
I
S
 
N
A
 
R
R
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
E
Q
 
R
I
 
V
D
 
L
D
 
G
H
 
F
V
 
V
S
 
K
R
 
V
A
 
A
R
 
K
T
 
E
R
 
Q
G
 
G
V
 
A
E
 
K
I
 
V
V
 
L
T
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
D
I
 
I
L
 
Y
T
 
V
-
 
P
-
 
E
D
 
D
V
 
P
E
 
K
S
 
L
G
 
K
K
 
D
G
 
G
W
 
Y
F
 
Y
Y
 
M
A
 
R
P
 
P
T
 
C
I
 
V
L
 
L
D
 
T
D
 
N
L
 
C
A
 
R
A
 
D
N
 
D
D
 
M
D
 
T
A
 
C
V
 
V
L
 
K
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
A
 
S
I
 
I
Q
 
L
V
 
S
F
 
F
E
 
D
D
 
T
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
E
L
 
R
A
 
A
N
 
N
G
 
D
T
 
T
E
 
T
F
 
F
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
F
T
 
T
R
 
R
D
 
D
I
 
I
A
 
Q
T
 
R
A
 
A
L
 
H
R
 
R
M
 
V
A
 
V
R
 
A
R
 
E
V
 
L
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Q
 
T
V
 
C
T
 
F
V
 
I
N
 
N
D
 
N
Y
 
Y
W
 
N
A
 
V
G
 
S
G
 
P
I
 
V
E
 
E
L
 
L
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
Y
R
 
K
K
 
K
S
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
E
 
E
K
 
N
G
 
G
L
 
R
E
 
V
G
 
T
L
 
I
D
 
E
A
 
Y
Y
 
Y
T
 
S
R
 
Q
S
 
L
K
 
K
A
 
T
V
 
V
T
 
C
L
 
V
A
 
E
V
 
M

Sites not aligning to the query:

6vr6D Structure of aldh9a1 complexed with NAD+ in space group p1 (see paper)
39% identity, 93% coverage: 34:494/494 of query aligns to 24:486/493 of 6vr6D

query
sites
6vr6D
A
 
A
G
 
S
G
 
G
R
 
T
M
 
E
E
 
K
S
 
A
F
 
F
D
 
E
P
 
P
G
 
A
R
 
T
G
 
G
T
 
R
A
 
V
F
 
I
D
 
A
D
 
T
F
 
F
A
 
T
A
 
C
G
 
S
D
 
G
A
 
E
A
 
K
D
 
E
V
 
V
D
 
N
H
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
Q
S
 
N
A
 
A
V
 
K
A
 
A
G
 
A
F
 
F
E
 
K
I
 
I
W
 
W
S
 
S
A
 
Q
T
 
K
P
 
S
P
 
G
A
 
M
R
 
E
R
 
R
C
 
C
A
 
R
I
 
I
L
 
L
N
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
I
M
 
I
R
 
R
H
 
E
E
 
R
A
 
E
E
 
D
H
 
E
L
 
I
A
 
A
V
 
T
V
 
M
E
 
E
C
 
C
V
 
I
D
 
N
S
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
S
L
 
I
A
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
R
G
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
D
G
 
I
S
 
S
A
 
W
R
 
Q
L
 
C
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
A
D
 
A
K
 
S
L
 
M
D
 
A
G
 
G
R
 
E
S
 
H
V
 
I
N
 
Q
L
 
L
G
 
P
N
 
G
D
 
G
N
 
S
A
 
F
A
 
G
F
 
Y
T
 
T
L
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
C
A
 
V
H
 
G
I
|
I
V
x
G
P
 
A
W
|
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
S
 
F
S
 
Q
T
 
I
L
 
A
V
 
S
R
 
W
G
 
K
I
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
C
G
 
G
C
 
N
S
 
A
A
 
M
V
 
V
V
 
F
K
|
K
P
 
P
A
 
S
E
 
P
T
 
F
T
 
T
P
 
P
F
 
V
T
 
S
A
 
A
L
 
L
M
 
L
I
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
I
L
 
Y
I
 
S
R
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
P
G
 
G
V
 
L
V
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
V
T
 
Q
G
 
G
T
 
-
G
 
G
I
x
A
A
 
A
A
 
T
G
|
G
A
x
Q
P
 
F
L
 
L
V
 
C
R
 
Q
D
 
H
P
 
P
R
 
D
V
 
V
R
 
A
H
 
K
V
 
V
T
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
V
 
V
A
 
P
T
|
T
G
 
G
V
 
M
G
 
K
V
x
I
M
 
M
Q
 
E
S
 
M
V
 
S
A
 
A
P
 
K
N
 
G
V
 
I
T
 
K
G
 
P
L
 
V
T
 
T
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
A
 
I
F
 
F
G
 
S
D
 
D
A
 
C
N
 
D
V
 
M
D
 
N
A
 
N
V
 
A
V
 
V
E
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
L
W
 
M
A
 
A
I
 
N
F
 
F
S
 
L
N
 
T
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
C
|
C
S
 
C
A
 
N
G
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
V
V
 
F
I
 
V
H
 
Q
R
 
K
S
 
E
L
 
I
H
 
L
A
 
D
E
 
K
V
 
F
R
 
T
D
 
E
K
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
K
R
 
Q
A
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
R
 
K
V
 
I
G
 
G
H
 
D
G
 
P
-
 
L
L
 
L
R
 
E
G
 
D
P
 
T
D
 
R
I
 
M
G
 
G
A
 
P
V
 
L
N
 
I
S
 
N
A
 
R
R
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
E
Q
 
R
I
 
V
D
 
L
D
 
G
H
 
F
V
 
V
S
 
K
R
 
V
A
 
A
R
 
K
T
 
E
R
 
Q
G
 
G
V
 
A
E
 
K
I
 
V
V
 
L
T
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
D
I
 
I
L
 
Y
T
 
V
-
 
P
-
 
E
D
 
D
V
 
P
E
 
K
S
 
L
G
 
K
K
 
D
G
 
G
W
 
Y
F
 
Y
Y
 
M
A
 
R
P
 
P
T
 
C
I
 
V
L
 
L
D
 
T
D
 
N
L
 
C
A
 
R
A
 
D
N
 
D
D
 
M
D
 
T
A
 
C
V
 
V
L
 
K
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
A
 
S
I
 
I
Q
 
L
V
 
S
F
 
F
E
 
D
D
 
T
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
E
L
 
R
A
 
A
N
 
N
G
 
D
T
 
T
E
 
T
F
 
F
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
F
T
 
T
R
 
R
D
 
D
I
 
I
A
 
Q
T
 
R
A
 
A
L
 
H
R
 
R
M
 
V
A
 
V
R
 
A
R
 
E
V
 
L
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Q
 
T
V
 
C
T
 
F
V
 
I
N
 
N
D
 
N
Y
 
Y
W
 
N
A
 
V
G
 
S
G
 
P
I
 
V
E
 
E
L
 
L
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
Y
R
 
K
K
 
K
S
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
E
|
E
K
 
N
G
 
G
L
 
R
E
 
V
G
 
T
L
 
I
D
 
E
A
 
Y
Y
 
Y
T
 
S
R
 
Q
S
 
L
K
 
K
A
 
T
V
 
V
T
 
C
L
 
V
A
 
E
V
 
M

4cazA Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa in complex with nadh
39% identity, 95% coverage: 24:494/494 of query aligns to 9:482/489 of 4cazA

query
sites
4cazA
F
 
Y
I
 
I
D
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
Y
V
 
V
A
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
S
G
 
G
G
 
A
R
 
T
M
 
F
E
 
E
S
 
T
F
 
I
D
 
N
P
 
P
G
 
A
R
 
N
G
 
G
T
 
E
A
 
V
F
 
L
D
 
A
D
 
K
F
 
V
A
 
Q
A
 
R
G
 
A
D
 
S
A
 
R
A
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
E
H
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
Q
S
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
E
G
 
G
F
 
Q
E
 
K
I
 
V
W
 
W
S
 
A
A
 
A
T
 
M
P
 
T
P
 
A
A
 
M
R
 
Q
R
 
R
C
 
S
A
 
R
I
 
I
L
 
L
N
 
R
E
 
R
A
 
A
A
 
V
R
 
D
L
 
I
M
 
L
R
 
R
H
 
E
E
 
R
A
 
N
E
 
D
H
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
A
V
 
L
E
 
E
C
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
T
R
 
R
G
 
S
-
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
V
G
 
T
S
 
G
A
 
A
R
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
V
D
 
P
K
 
A
L
 
I
D
 
E
G
 
G
R
 
E
S
 
Q
V
 
I
N
 
P
L
 
L
G
 
R
N
 
E
D
 
T
N
 
S
A
 
F
A
 
V
F
 
Y
T
 
T
L
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
A
H
 
G
I
|
I
V
x
G
P
 
A
W
|
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
S
 
V
S
 
Q
T
 
I
L
 
A
V
 
L
R
 
W
G
 
K
I
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
S
 
A
A
 
M
V
 
I
V
 
F
K
|
K
P
 
P
A
 
S
E
|
E
T
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
K
I
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
I
L
 
Y
I
 
T
R
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
S
G
|
G
I
 
R
A
 
E
A
 
V
G
|
G
A
 
Q
P
 
W
L
 
L
V
 
T
R
 
E
D
 
H
P
 
P
R
 
L
V
 
I
R
 
E
H
 
K
V
 
I
T
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
x
G
V
 
T
A
 
S
T
|
T
G
 
G
V
 
K
G
 
K
V
|
V
M
 
M
Q
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
S
P
 
S
N
 
S
-
 
S
V
 
L
T
 
K
G
 
E
L
 
V
T
 
T
L
 
M
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
A
 
I
F
 
F
G
 
P
D
 
D
A
 
A
N
 
D
V
 
L
D
 
D
A
 
R
V
 
A
V
 
A
E
 
D
G
 
I
A
 
A
L
 
V
W
 
M
A
 
A
I
 
N
F
 
F
S
 
F
N
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
C
|
C
S
 
T
A
 
N
G
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
V
V
 
F
I
 
I
H
 
H
R
 
R
S
 
S
L
 
Q
H
 
Q
A
 
A
E
 
R
V
 
F
R
 
E
D
 
A
K
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
E
R
 
R
A
 
V
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
R
 
R
V
 
L
G
 
G
H
 
D
G
 
P
L
 
Q
-
 
D
R
 
E
G
 
N
P
 
T
D
 
N
I
 
F
G
 
G
A
 
P
V
 
L
N
 
V
S
 
S
A
 
F
R
 
P
H
 
H
L
 
M
A
 
E
Q
 
S
I
 
V
D
 
L
D
 
G
H
 
Y
V
 
I
S
 
E
R
 
S
A
 
G
R
 
K
T
 
A
R
 
Q
G
 
K
V
 
A
E
 
R
I
 
L
V
 
L
T
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
E
I
 
R
L
 
V
T
 
T
D
 
D
V
 
G
E
 
A
S
 
F
G
 
G
K
 
K
G
 
G
W
 
A
F
 
Y
Y
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
D
 
T
D
 
D
L
 
C
A
 
R
A
 
D
N
 
D
D
 
M
D
 
T
A
 
I
V
 
V
L
 
R
Q
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
A
 
S
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
F
 
Y
E
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
N
 
N
G
 
D
T
 
T
E
 
E
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
V
T
 
T
R
 
Q
D
 
D
I
 
L
A
 
A
T
 
R
A
 
A
L
 
H
R
 
R
M
 
A
A
 
I
R
 
H
R
 
R
V
 
L
D
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
I
V
 
C
T
 
W
V
 
I
N
 
N
D
 
T
Y
 
W
W
 
G
A
 
E
G
 
S
G
 
P
I
 
A
E
 
E
L
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
Y
R
 
K
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
F
 
V
G
 
G
R
 
R
E
|
E
K
 
N
G
 
G
L
 
L
E
 
T
G
 
T
L
 
L
D
 
A
A
 
H
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
S
 
I
K
 
K
A
 
S
V
 
V
T
 
Q
L
 
V
A
 
E
V
 
L

2woxA Betaine aldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa with NAD(p) h-catalytic thiol adduct. (see paper)
39% identity, 95% coverage: 24:494/494 of query aligns to 9:482/489 of 2woxA

query
sites
2woxA
F
 
Y
I
 
I
D
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
Y
V
 
V
A
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
S
G
 
G
G
 
A
R
 
T
M
 
F
E
 
E
S
 
T
F
 
I
D
 
N
P
 
P
G
 
A
R
 
N
G
 
G
T
 
E
A
 
V
F
 
L
D
 
A
D
 
K
F
 
V
A
 
Q
A
 
R
G
 
A
D
 
S
A
 
R
A
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
E
H
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
Q
S
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
E
G
 
G
F
 
Q
E
 
K
I
 
V
W
 
W
S
 
A
A
 
A
T
 
M
P
 
T
P
 
A
A
 
M
R
 
Q
R
 
R
C
 
S
A
 
R
I
 
I
L
 
L
N
 
R
E
 
R
A
 
A
A
 
V
R
 
D
L
 
I
M
 
L
R
 
R
H
 
E
E
 
R
A
 
N
E
 
D
H
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
A
V
 
L
E
 
E
C
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
T
R
 
R
G
 
S
-
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
V
G
 
T
S
 
G
A
 
A
R
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
V
D
 
P
K
 
A
L
 
I
D
 
E
G
 
G
R
 
E
S
 
Q
V
 
I
N
 
P
L
 
L
G
 
R
N
 
E
D
 
T
N
 
S
A
 
F
A
 
V
F
 
Y
T
 
T
L
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
A
H
 
G
I
|
I
V
x
G
P
 
A
W
|
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
S
 
V
S
 
Q
T
 
I
L
 
A
V
 
L
R
 
W
G
 
K
I
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
S
 
A
A
 
M
V
 
I
V
 
F
K
|
K
P
 
P
A
x
S
E
|
E
T
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
K
I
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
I
L
 
Y
I
 
T
R
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
S
G
|
G
I
 
R
A
 
E
A
 
V
G
|
G
A
 
Q
P
 
W
L
 
L
V
 
T
R
 
E
D
 
H
P
 
P
R
 
L
V
 
I
R
 
E
H
 
K
V
 
I
T
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
x
G
V
 
T
A
 
S
T
|
T
G
 
G
V
 
K
G
 
K
V
|
V
M
 
M
Q
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
S
P
 
S
N
 
S
-
 
S
V
 
L
T
 
K
G
 
E
L
 
V
T
 
T
L
 
M
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
A
 
I
F
 
F
G
 
P
D
 
D
A
 
A
N
 
D
V
 
L
D
 
D
A
 
R
V
 
A
V
 
A
E
 
D
G
 
I
A
 
A
L
 
V
W
 
M
A
 
A
I
 
N
F
 
F
S
 
F
N
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
C
|
C
S
 
T
A
 
N
G
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
V
V
 
F
I
 
I
H
 
H
R
 
R
S
 
S
L
 
Q
H
 
Q
A
 
A
E
 
R
V
 
F
R
 
E
D
 
A
K
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
E
R
 
R
A
 
V
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
R
 
R
V
 
L
G
 
G
H
 
D
G
 
P
L
 
Q
-
 
D
R
 
E
G
 
N
P
 
T
D
 
N
I
 
F
G
 
G
A
 
P
V
 
L
N
 
V
S
 
S
A
 
F
R
 
P
H
 
H
L
 
M
A
 
E
Q
 
S
I
 
V
D
 
L
D
 
G
H
 
Y
V
 
I
S
 
E
R
 
S
A
 
G
R
 
K
T
 
A
R
 
Q
G
 
K
V
 
A
E
 
R
I
 
L
V
 
L
T
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
E
I
 
R
L
 
V
T
 
T
D
 
D
V
 
G
E
 
A
S
 
F
G
 
G
K
 
K
G
 
G
W
 
A
F
 
Y
Y
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
D
 
T
D
 
D
L
 
C
A
 
R
A
 
D
N
 
D
D
 
M
D
 
T
A
 
I
V
 
V
L
 
R
Q
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
A
 
S
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
F
 
Y
E
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
N
 
N
G
 
D
T
 
T
E
 
E
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
V
T
 
T
R
 
Q
D
 
D
I
 
L
A
 
A
T
 
R
A
 
A
L
 
H
R
 
R
M
 
A
A
 
I
R
 
H
R
 
R
V
 
L
D
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
I
V
 
C
T
 
W
V
 
I
N
 
N
D
 
T
Y
 
W
W
 
G
A
 
E
G
 
S
G
 
P
I
 
A
E
 
E
L
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
Y
R
 
K
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
F
 
V
G
 
G
R
 
R
E
|
E
K
 
N
G
 
G
L
 
L
E
 
T
G
 
T
L
 
L
D
 
A
A
 
H
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
S
 
I
K
 
K
A
 
S
V
 
V
T
 
Q
L
 
V
A
 
E
V
 
L

2wmeA Crystallographic structure of betaine aldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa (see paper)
39% identity, 95% coverage: 24:494/494 of query aligns to 9:482/489 of 2wmeA

query
sites
2wmeA
F
 
Y
I
 
I
D
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
Y
V
 
V
A
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
S
G
 
G
G
 
A
R
 
T
M
 
F
E
 
E
S
 
T
F
 
I
D
 
N
P
 
P
G
 
A
R
 
N
G
 
G
T
 
E
A
 
V
F
 
L
D
 
A
D
 
K
F
 
V
A
 
Q
A
 
R
G
 
A
D
 
S
A
 
R
A
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
E
H
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
Q
S
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
E
G
 
G
F
 
Q
E
 
K
I
 
V
W
 
W
S
 
A
A
 
A
T
 
M
P
 
T
P
 
A
A
 
M
R
 
Q
R
 
R
C
 
S
A
 
R
I
 
I
L
 
L
N
 
R
E
 
R
A
 
A
A
 
V
R
 
D
L
 
I
M
 
L
R
 
R
H
 
E
E
 
R
A
 
N
E
 
D
H
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
A
V
 
L
E
 
E
C
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
T
R
 
R
G
 
S
-
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
V
G
 
T
S
 
G
A
 
A
R
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
V
D
 
P
K
 
A
L
 
I
D
 
E
G
 
G
R
 
E
S
 
Q
V
 
I
N
 
P
L
 
L
G
 
R
N
 
E
D
 
T
N
 
S
A
 
F
A
 
V
F
 
Y
T
 
T
L
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
A
H
 
G
I
 
I
V
x
G
P
 
A
W
|
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
S
 
V
S
 
Q
T
 
I
L
 
A
V
 
L
R
 
W
G
 
K
I
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
S
 
A
A
 
M
V
 
I
V
 
F
K
|
K
P
 
P
A
x
S
E
|
E
T
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
K
I
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
I
L
 
Y
I
 
T
R
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
S
G
|
G
I
 
R
A
 
E
A
 
V
G
|
G
A
 
Q
P
 
W
L
 
L
V
 
T
R
 
E
D
 
H
P
 
P
R
 
L
V
 
I
R
 
E
H
 
K
V
 
I
T
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
V
 
T
A
 
S
T
|
T
G
 
G
V
 
K
G
 
K
V
|
V
M
 
M
Q
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
S
P
 
S
N
 
S
-
 
S
V
 
L
T
 
K
G
 
E
L
 
V
T
 
T
L
 
M
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
A
 
I
F
 
F
G
 
P
D
 
D
A
 
A
N
 
D
V
 
L
D
 
D
A
 
R
V
 
A
V
 
A
E
 
D
G
 
I
A
 
A
L
 
V
W
 
M
A
 
A
I
 
N
F
 
F
S
 
F
N
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
C
|
C
S
 
T
A
 
N
G
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
V
V
 
F
I
 
I
H
 
H
R
 
R
S
 
S
L
 
Q
H
 
Q
A
 
A
E
 
R
V
 
F
R
 
E
D
 
A
K
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
E
R
 
R
A
 
V
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
R
 
R
V
 
L
G
 
G
H
 
D
G
 
P
L
 
Q
-
 
D
R
 
E
G
 
N
P
 
T
D
 
N
I
 
F
G
 
G
A
 
P
V
 
L
N
 
V
S
 
S
A
 
F
R
 
P
H
 
H
L
 
M
A
 
E
Q
 
S
I
 
V
D
 
L
D
 
G
H
 
Y
V
 
I
S
 
E
R
 
S
A
 
G
R
 
K
T
 
A
R
 
Q
G
 
K
V
 
A
E
 
R
I
 
L
V
 
L
T
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
E
I
 
R
L
 
V
T
 
T
D
 
D
V
 
G
E
 
A
S
 
F
G
 
G
K
 
K
G
 
G
W
 
A
F
 
Y
Y
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
D
 
T
D
 
D
L
 
C
A
 
R
A
 
D
N
 
D
D
 
M
D
 
T
A
 
I
V
 
V
L
 
R
Q
 
E
E
|
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
A
 
S
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
F
 
Y
E
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
N
 
N
G
 
D
T
 
T
E
 
E
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
V
T
 
T
R
 
Q
D
 
D
I
 
L
A
 
A
T
 
R
A
 
A
L
 
H
R
 
R
M
 
A
A
 
I
R
 
H
R
 
R
V
 
L
D
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
I
V
 
C
T
 
W
V
 
I
N
 
N
D
 
T
Y
 
W
W
 
G
A
 
E
G
 
S
G
 
P
I
 
A
E
 
E
L
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
Y
R
 
K
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
F
 
V
G
 
G
R
 
R
E
|
E
K
 
N
G
 
G
L
 
L
E
 
T
G
 
T
L
 
L
D
 
A
A
 
H
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
S
 
I
K
 
K
A
 
S
V
 
V
T
 
Q
L
 
V
A
 
E
V
 
L

Q9HTJ1 NAD/NADP-dependent betaine aldehyde dehydrogenase; BADH; EC 1.2.1.8 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see 2 papers)
39% identity, 95% coverage: 24:494/494 of query aligns to 10:483/490 of Q9HTJ1

query
sites
Q9HTJ1
F
 
Y
I
 
I
D
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
Y
V
 
V
A
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
S
G
 
G
G
 
A
R
 
T
M
 
F
E
 
E
S
 
T
F
 
I
D
 
N
P
 
P
G
 
A
R
 
N
G
 
G
T
 
E
A
 
V
F
 
L
D
 
A
D
 
K
F
 
V
A
 
Q
A
 
R
G
 
A
D
 
S
A
 
R
A
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
E
H
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
Q
S
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
E
G
 
G
F
 
Q
E
 
K
I
 
V
W
 
W
S
 
A
A
 
A
T
 
M
P
 
T
P
 
A
A
 
M
R
 
Q
R
 
R
C
 
S
A
 
R
I
 
I
L
 
L
N
 
R
E
 
R
A
 
A
A
 
V
R
 
D
L
 
I
M
 
L
R
 
R
H
 
E
E
 
R
A
 
N
E
 
D
H
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
A
V
 
L
E
 
E
C
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
T
R
 
R
G
 
S
-
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
V
G
 
T
S
 
G
A
 
A
R
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
V
D
 
P
K
 
A
L
 
I
D
 
E
G
 
G
R
 
E
S
 
Q
V
 
I
N
 
P
L
 
L
G
 
R
N
 
E
D
 
T
N
 
S
A
 
F
A
 
V
F
 
Y
T
 
T
L
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
A
H
 
G
I
 
I
V
x
G
P
x
A
W
|
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
S
 
V
S
 
Q
T
 
I
L
 
A
V
 
L
R
 
W
G
x
K
I
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
S
 
A
A
 
M
V
 
I
V
 
F
K
|
K
P
|
P
A
x
S
E
|
E
T
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
K
I
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
I
L
 
Y
I
 
T
R
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
S
G
|
G
I
 
R
A
 
E
A
 
V
G
 
G
A
 
Q
P
 
W
L
 
L
V
 
T
R
 
E
D
 
H
P
 
P
R
 
L
V
 
I
R
 
E
H
 
K
V
 
I
T
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
x
G
V
x
T
A
x
S
T
|
T
G
 
G
V
 
K
G
 
K
V
 
V
M
 
M
Q
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
S
P
 
S
N
 
S
-
 
S
V
 
L
T
 
K
G
 
E
L
 
V
T
 
T
L
 
M
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
A
 
I
F
 
F
G
 
P
D
 
D
A
 
A
N
 
D
V
 
L
D
 
D
A
 
R
V
 
A
V
 
A
E
 
D
G
 
I
A
 
A
L
 
V
W
 
M
A
 
A
I
 
N
F
 
F
S
 
F
N
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
C
|
C
S
 
T
A
 
N
G
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
V
V
 
F
I
 
I
H
 
H
R
 
R
S
 
S
L
 
Q
H
 
Q
A
 
A
E
 
R
V
 
F
R
 
E
D
 
A
K
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
E
R
 
R
A
 
V
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
R
 
R
V
 
L
G
 
G
H
 
D
G
 
P
L
 
Q
-
 
D
R
 
E
G
 
N
P
 
T
D
 
N
I
 
F
G
 
G
A
 
P
V
 
L
N
 
V
S
 
S
A
 
F
R
 
P
H
 
H
L
 
M
A
 
E
Q
 
S
I
 
V
D
 
L
D
 
G
H
 
Y
V
 
I
S
 
E
R
 
S
A
 
G
R
 
K
T
 
A
R
 
Q
G
 
K
V
 
A
E
 
R
I
 
L
V
 
L
T
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
E
I
 
R
L
 
V
T
 
T
D
 
D
V
 
G
E
 
A
S
 
F
G
 
G
K
 
K
G
 
G
W
 
A
F
 
Y
Y
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
D
 
T
D
 
D
L
 
C
A
 
R
A
 
D
N
 
D
D
 
M
D
 
T
A
 
I
V
 
V
L
 
R
Q
 
E
E
|
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
A
 
S
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
F
 
Y
E
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
N
 
N
G
 
D
T
 
T
E
 
E
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
V
T
 
T
R
 
Q
D
 
D
I
 
L
A
 
A
T
 
R
A
 
A
L
 
H
R
 
R
M
 
A
A
 
I
R
 
H
R
 
R
V
 
L
D
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
I
V
 
C
T
 
W
V
 
I
N
 
N
D
 
T
Y
 
W
W
 
G
A
 
E
G
 
S
G
 
P
I
 
A
E
 
E
L
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
Y
R
 
K
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
F
 
V
G
 
G
R
 
R
E
|
E
K
 
N
G
 
G
L
 
L
E
 
T
G
 
T
L
 
L
D
 
A
A
 
H
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
S
 
I
K
 
K
A
 
S
V
 
V
T
 
Q
L
 
V
A
 
E
V
 
L

4yweA Crystal structure of a putative aldehyde dehydrogenase from burkholderia cenocepacia
44% identity, 95% coverage: 22:492/494 of query aligns to 2:473/476 of 4yweA

query
sites
4yweA
D
 
K
H
 
H
F
 
F
I
 
I
D
 
A
G
 
G
R
 
E
A
 
W
V
 
T
A
 
L
P
 
P
G
 
A
A
 
Q
G
 
L
G
 
E
R
 
T
M
 
I
E
 
P
S
 
V
F
x
V
D
 
D
P
 
P
G
 
S
R
 
D
G
 
G
T
 
Q
A
 
P
F
 
F
D
 
A
D
 
T
F
 
I
A
 
A
A
 
R
G
 
G
D
 
T
A
 
A
A
 
P
D
 
D
V
 
I
D
 
E
H
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
A
S
 
A
A
 
A
V
 
R
A
 
D
G
 
A
F
 
F
E
 
A
-
 
G
I
 
P
W
 
W
S
 
G
A
 
A
T
 
A
P
 
S
P
 
A
A
 
A
R
 
E
R
 
R
C
 
G
A
 
R
I
 
V
L
 
L
N
 
M
E
 
R
A
 
L
A
 
S
R
 
A
L
 
R
M
 
V
R
 
T
H
 
D
E
 
S
A
 
I
E
 
E
H
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
A
V
 
I
E
 
E
C
 
A
V
 
R
D
|
D
S
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
P
L
 
L
A
 
K
E
 
Q
A
 
A
R
 
R
G
 
A
D
 
D
I
 
A
A
 
A
G
 
A
S
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
Y
L
 
F
E
 
E
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
K
 
K
L
 
L
D
 
H
G
 
G
R
 
E
S
 
T
V
 
L
N
 
P
L
 
Y
G
 
Q
N
 
A
D
 
G
N
 
Y
A
 
T
A
 
V
F
 
L
T
 
T
L
 
V
R
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
T
A
 
G
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
W
 
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
S
 
M
S
 
Q
T
 
I
L
 
F
V
 
G
R
 
R
G
 
S
I
 
V
A
 
G
P
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
S
 
A
A
 
C
V
 
V
V
 
V
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
 
E
T
x
D
T
 
A
P
 
C
F
 
L
T
 
S
A
 
V
L
 
L
M
 
R
I
 
V
A
 
A
D
 
E
L
 
L
L
 
A
I
 
A
R
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
A
V
 
L
N
 
N
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Y
G
 
G
I
 
H
A
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
A
L
 
L
V
 
A
R
 
R
D
 
H
P
 
P
R
 
G
V
 
I
R
 
D
H
 
H
V
 
I
T
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
P
A
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
K
G
 
L
V
 
V
M
 
T
Q
 
Q
S
 
M
V
 
A
A
 
A
P
 
E
N
 
N
V
 
H
T
 
V
G
 
P
L
 
V
T
 
T
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
Q
V
 
I
A
 
V
F
 
F
G
 
A
D
 
D
A
 
A
N
 
D
V
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
A
V
 
L
E
 
P
G
 
V
A
 
L
L
 
V
W
 
S
A
 
A
I
 
I
F
 
V
S
 
Q
N
 
N
A
 
G
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
C
|
C
S
 
S
A
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
V
V
 
L
I
 
I
H
 
E
R
 
R
S
 
A
L
 
V
H
 
Y
A
 
E
E
 
P
V
 
L
R
 
V
D
 
E
K
 
R
L
 
L
V
 
A
A
 
T
R
 
A
A
 
F
Q
 
N
R
 
G
L
 
L
R
 
R
V
 
V
G
 
G
H
 
P
G
 
S
L
 
R
R
 
A
G
 
D
P
 
L
D
 
D
I
 
C
G
 
G
A
 
P
V
 
L
N
 
I
S
 
N
A
 
A
R
 
K
H
 
Q
L
 
Q
A
 
Q
Q
 
R
I
 
V
D
 
W
D
 
D
H
 
F
V
 
L
S
 
S
R
 
D
A
 
A
R
 
Q
T
 
H
R
 
D
G
 
G
V
 
I
E
 
P
I
 
M
V
 
A
T
 
A
G
 
H
G
 
G
E
 
Q
I
 
V
L
 
V
T
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
P
S
 
E
G
 
-
K
 
S
G
 
G
W
 
F
F
 
Y
Y
 
Q
A
 
A
P
 
P
T
 
A
I
 
L
L
 
L
D
 
R
D
 
D
L
 
V
A
 
P
A
 
P
N
 
S
D
 
H
D
 
R
A
 
L
V
 
A
L
 
Q
Q
 
E
E
|
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
I
 
A
Q
 
M
V
 
R
F
 
F
E
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
N
G
 
G
T
 
T
E
 
P
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
A
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
I
Y
 
W
T
 
T
R
 
R
D
 
D
I
 
G
A
 
A
T
 
R
A
 
Q
L
 
M
R
 
R
M
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
V
 
L
D
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
T
 
F
V
 
I
N
 
N
D
 
N
Y
 
Y
W
 
G
A
 
A
-
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
L
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
V
R
x
G
K
 
H
S
 
S
G
|
G
F
 
H
G
 
G
R
 
R
E
|
E
K
 
K
G
 
G
L
 
F
E
 
E
G
 
A
L
 
L
D
 
Y
A
 
G
Y
 
F
T
 
T
R
 
A
S
 
L
K
 
K
A
 
T
V
 
I
T
 
A
L
 
I

1bpwA Betaine aldehyde dehydrogenase from cod liver (see paper)
39% identity, 96% coverage: 23:494/494 of query aligns to 22:496/503 of 1bpwA

query
sites
1bpwA
H
 
N
F
 
Y
I
 
W
D
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
R
V
 
I
A
 
K
P
 
S
G
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
A
R
 
T
M
 
T
E
 
E
S
 
P
-
 
V
F
 
F
D
 
E
P
 
P
G
 
A
R
 
T
G
 
G
T
 
R
A
 
V
F
 
L
D
 
C
D
 
Q
F
 
M
A
 
V
A
 
P
G
 
C
D
 
G
A
 
A
A
 
E
D
 
E
V
 
V
D
 
D
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
T
 
Q
S
 
S
A
 
A
V
 
Q
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
E
 
L
I
 
K
W
 
W
S
 
S
A
 
K
T
 
M
P
 
A
P
 
G
A
 
I
R
 
E
R
 
R
C
 
S
A
 
R
I
 
V
L
 
M
N
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
I
M
 
I
R
 
R
H
 
E
E
 
R
A
 
R
E
 
D
H
 
N
L
 
I
A
 
A
V
 
K
V
 
L
E
 
E
C
 
V
V
 
I
D
 
N
S
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
A
 
T
E
 
E
A
 
A
R
 
E
G
 
Y
D
 
D
I
 
I
A
 
D
G
 
A
S
 
A
A
 
W
R
 
Q
L
 
C
L
 
I
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
A
D
 
P
K
 
T
L
 
L
D
 
S
G
 
G
R
 
Q
S
 
H
V
 
I
N
 
Q
L
 
L
G
 
P
N
 
G
D
 
G
N
 
A
A
 
F
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
L
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
C
A
 
A
H
 
G
I
|
I
V
x
L
P
 
A
W
|
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
S
 
F
S
 
M
T
 
I
L
 
A
V
 
A
R
 
W
G
 
K
I
 
C
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
C
G
 
G
C
 
N
S
 
A
A
 
V
V
 
V
V
 
F
K
|
K
P
 
P
A
 
S
E
 
P
T
 
M
T
 
T
P
 
P
F
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
V
M
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
I
L
 
F
I
 
H
R
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
V
G
 
G
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
T
 
Q
G
 
G
T
 
-
G
|
G
I
 
A
A
 
E
A
 
T
G
|
G
A
 
S
P
 
L
L
 
L
V
 
C
R
 
H
D
 
H
P
 
P
R
 
N
V
 
V
R
 
A
H
 
K
V
 
V
T
 
S
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
V
 
V
A
 
P
T
|
T
G
 
G
V
 
K
G
 
K
V
 
V
M
 
M
Q
 
E
S
 
M
V
 
S
A
 
A
P
 
K
N
 
T
V
 
V
T
 
K
G
 
H
L
 
V
T
 
T
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
L
A
 
I
F
 
F
G
 
K
D
 
D
A
 
C
N
 
E
V
 
L
D
 
E
A
 
N
V
 
A
V
 
V
E
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
W
 
M
A
 
A
I
 
N
F
 
F
S
 
L
N
 
T
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
C
|
C
S
 
T
A
 
N
G
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
V
V
 
F
I
 
V
H
 
Q
R
 
R
S
 
E
L
 
I
H
 
M
A
 
P
E
 
Q
V
 
F
R
 
L
D
 
E
K
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
K
R
 
R
A
 
T
Q
 
K
R
 
A
L
 
I
R
 
V
V
 
V
G
 
G
H
 
D
G
 
P
L
 
L
R
 
L
G
 
T
P
 
E
D
 
T
-
 
R
I
 
M
G
 
G
A
 
G
V
 
L
N
 
I
S
 
S
A
 
K
R
 
P
H
 
Q
L
 
L
A
 
D
Q
 
K
I
 
V
D
 
L
D
 
G
H
 
F
V
 
V
S
 
A
R
 
Q
A
 
A
R
 
K
T
 
K
R
 
E
G
 
G
V
 
A
E
 
R
I
 
V
V
 
L
T
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
E
I
 
P
L
 
L
T
 
T
-
 
P
-
 
S
D
 
D
V
 
P
E
 
K
S
 
L
G
 
K
K
 
N
G
 
G
W
 
Y
F
 
F
Y
 
M
A
 
S
P
 
P
T
 
C
I
 
V
L
 
L
D
 
D
D
 
N
L
 
C
A
 
R
A
 
D
N
 
D
D
 
M
D
 
T
A
 
C
V
 
V
L
 
K
Q
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
A
 
S
I
 
V
Q
 
L
V
 
P
F
 
F
E
 
D
D
 
T
E
 
E
A
 
E
E
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
Q
L
 
R
A
 
A
N
 
N
G
 
N
T
 
T
E
 
T
F
 
F
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
S
G
 
G
I
 
V
Y
 
F
T
 
T
R
 
R
D
 
D
I
 
I
A
 
S
T
 
R
A
 
A
L
 
H
R
 
R
M
 
V
A
 
A
R
 
A
R
 
N
V
 
L
D
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
T
V
 
C
T
 
Y
V
 
I
N
 
N
D
 
T
Y
 
Y
W
 
S
A
 
I
G
 
S
G
 
P
I
 
V
E
 
E
L
 
V
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
N
 
Y
R
 
K
K
 
M
S
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
E
|
E
K
 
N
G
 
G
L
 
Q
E
 
A
G
 
T
L
 
V
D
 
D
A
 
Y
Y
 
Y
T
 
S
R
 
Q
S
 
L
K
 
K
A
 
T
V
 
V
T
 
I
L
 
V
A
 
E
V
 
M

P56533 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase; TMABA-DH; TMABADH; Aldehyde dehydrogenase family 9 member A1; Betaine aldehyde dehydrogenase; BADH; EC 1.2.1.47; EC 1.2.1.3 from Gadus morhua subsp. callarias (Baltic cod) (Gadus callarias) (see paper)
39% identity, 96% coverage: 23:494/494 of query aligns to 22:496/503 of P56533

query
sites
P56533
H
 
N
F
 
Y
I
 
W
D
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
R
V
 
I
A
 
K
P
 
S
G
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
A
R
 
T
M
 
T
E
 
E
S
 
P
-
 
V
F
 
F
D
 
E
P
 
P
G
 
A
R
 
T
G
 
G
T
 
R
A
 
V
F
 
L
D
 
C
D
 
Q
F
 
M
A
 
V
A
 
P
G
 
C
D
 
G
A
 
A
A
 
E
D
 
E
V
 
V
D
 
D
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
T
 
Q
S
 
S
A
 
A
V
 
Q
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
E
 
L
I
 
K
W
 
W
S
 
S
A
 
K
T
 
M
P
 
A
P
 
G
A
 
I
R
 
E
R
 
R
C
 
S
A
 
R
I
 
V
L
 
M
N
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
I
M
 
I
R
 
R
H
 
E
E
 
R
A
 
R
E
 
D
H
 
N
L
 
I
A
 
A
V
 
K
V
 
L
E
 
E
C
 
V
V
 
I
D
 
N
S
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
A
 
T
E
 
E
A
 
A
R
 
E
G
 
Y
D
 
D
I
 
I
A
 
D
G
 
A
S
 
A
A
 
W
R
 
Q
L
 
C
L
 
I
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
A
D
 
P
K
 
T
L
 
L
D
 
S
G
 
G
R
 
Q
S
 
H
V
 
I
N
 
Q
L
 
L
G
 
P
N
 
G
D
 
G
N
 
A
A
 
F
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
L
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
C
A
 
A
H
 
G
I
 
I
V
 
L
P
 
A
W
 
W
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
S
 
F
S
 
M
T
 
I
L
 
A
V
 
A
R
 
W
G
 
K
I
 
C
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
C
G
 
G
C
 
N
S
 
A
A
 
V
V
 
V
V
 
F
K
|
K
P
 
P
A
 
S
E
 
P
T
 
M
T
 
T
P
 
P
F
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
V
M
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
I
L
 
F
I
 
H
R
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
V
G
 
G
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
T
 
Q
G
 
G
T
 
-
G
 
G
I
 
A
A
 
E
A
 
T
G
 
G
A
 
S
P
 
L
L
 
L
V
 
C
R
 
H
D
 
H
P
 
P
R
 
N
V
 
V
R
 
A
H
 
K
V
 
V
T
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
V
|
V
A
x
P
T
|
T
G
 
G
V
 
K
G
 
K
V
 
V
M
 
M
Q
 
E
S
 
M
V
 
S
A
 
A
P
 
K
N
 
T
V
 
V
T
 
K
G
 
H
L
 
V
T
 
T
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
L
A
 
I
F
 
F
G
 
K
D
 
D
A
 
C
N
 
E
V
 
L
D
 
E
A
 
N
V
 
A
V
 
V
E
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
W
 
M
A
 
A
I
 
N
F
 
F
S
 
L
N
 
T
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
C
 
C
S
 
T
A
 
N
G
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
V
V
 
F
I
 
V
H
 
Q
R
 
R
S
 
E
L
 
I
H
 
M
A
 
P
E
 
Q
V
 
F
R
 
L
D
 
E
K
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
K
R
 
R
A
 
T
Q
 
K
R
 
A
L
 
I
R
 
V
V
 
V
G
 
G
H
 
D
G
 
P
L
 
L
R
 
L
G
 
T
P
 
E
D
 
T
-
 
R
I
 
M
G
 
G
A
 
G
V
 
L
N
 
I
S
 
S
A
 
K
R
 
P
H
 
Q
L
 
L
A
 
D
Q
 
K
I
 
V
D
 
L
D
 
G
H
 
F
V
 
V
S
 
A
R
 
Q
A
 
A
R
 
K
T
 
K
R
 
E
G
 
G
V
 
A
E
 
R
I
 
V
V
 
L
T
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
E
I
 
P
L
 
L
T
 
T
-
 
P
-
 
S
D
 
D
V
 
P
E
 
K
S
 
L
G
 
K
K
 
N
G
 
G
W
 
Y
F
 
F
Y
 
M
A
 
S
P
 
P
T
 
C
I
 
V
L
 
L
D
 
D
D
 
N
L
 
C
A
 
R
A
 
D
N
 
D
D
 
M
D
 
T
A
 
C
V
 
V
L
 
K
Q
 
E
E
|
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
A
 
S
I
 
V
Q
 
L
V
 
P
F
 
F
E
 
D
D
 
T
E
 
E
A
 
E
E
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
Q
L
 
R
A
 
A
N
 
N
G
 
N
T
 
T
E
 
T
F
 
F
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
S
G
 
G
I
 
V
Y
 
F
T
 
T
R
 
R
D
 
D
I
 
I
A
 
S
T
 
R
A
 
A
L
 
H
R
 
R
M
 
V
A
 
A
R
 
A
R
 
N
V
 
L
D
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
T
V
 
C
T
 
Y
V
 
I
N
 
N
D
 
T
Y
 
Y
W
 
S
A
 
I
G
 
S
G
 
P
I
 
V
E
 
E
L
 
V
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
Y
R
 
K
K
 
M
S
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
E
 
E
K
 
N
G
 
G
L
 
Q
E
 
A
G
 
T
L
 
V
D
 
D
A
 
Y
Y
 
Y
T
 
S
R
 
Q
S
 
L
K
 
K
A
 
T
V
 
V
T
 
I
L
 
V
A
 
E
V
 
M

P17202 Aminoaldehyde dehydrogenase BADH; 4-trimethylammoniobutyraldehyde dehydrogenase BADH; Aminobutyraldehyde dehydrogenase BADH; Betaine aldehyde dehydrogenase; SoBADH; EC 1.2.1.-; EC 1.2.1.47; EC 1.2.1.19; EC 1.2.1.8 from Spinacia oleracea (Spinach) (see 3 papers)
40% identity, 97% coverage: 15:491/494 of query aligns to 2:483/497 of P17202

query
sites
P17202
A
 
A
L
 
F
P
 
P
D
 
I
L
 
P
P
 
A
R
 
R
D
 
Q
H
 
L
F
 
F
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
E
A
 
W
V
 
R
A
 
E
P
 
P
G
 
I
A
 
K
G
 
K
G
 
N
R
 
R
M
 
I
E
 
P
S
 
V
F
x
I
D
 
N
P
 
P
G
 
S
R
 
T
G
 
E
T
 
E
A
 
I
F
 
I
D
 
G
D
 
D
F
 
I
A
 
P
A
 
A
G
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
E
H
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
V
S
 
A
A
 
A
V
 
R
A
 
R
G
 
A
F
 
F
-
 
R
-
 
R
E
 
N
I
 
N
W
 
W
S
 
S
A
 
A
T
 
T
P
 
S
P
 
G
A
 
A
R
 
H
R
 
R
C
 
A
A
 
T
I
 
Y
L
 
L
N
 
R
E
 
A
A
 
I
A
 
A
R
 
A
L
 
K
M
 
I
R
 
T
H
 
E
E
 
K
A
 
K
E
 
D
H
 
H
L
 
F
A
 
V
V
 
K
V
 
L
E
 
E
C
 
T
V
 
I
D
|
D
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
P
L
 
F
A
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
V
G
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
D
G
 
D
S
 
V
A
 
A
R
 
S
L
 
C
L
 
F
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
D
 
E
K
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
G
R
 
K
S
 
Q
-
 
K
-
 
A
-
 
P
V
 
V
N
 
T
L
 
L
G
 
P
N
 
M
D
 
E
N
 
R
-
 
F
A
 
K
A
 
S
F
 
H
T
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
P
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
G
H
 
L
I
 
I
V
x
S
P
|
P
W
|
W
N
 
N
Y
|
Y
P
 
P
S
 
L
S
 
L
T
 
M
L
 
A
V
 
T
R
x
W
G
 
K
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
S
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
L
K
|
K
P
|
P
A
x
S
E
|
E
T
x
L
T
 
A
P
 
S
F
 
V
T
 
T
A
 
C
L
 
L
M
 
E
I
 
F
A
 
G
D
 
E
L
 
V
L
 
C
I
 
N
R
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
L
N
 
N
V
 
I
V
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
L
G
 
G
I
 
P
A
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
R
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
D
V
 
V
R
 
D
H
 
K
V
 
I
T
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
V
x
S
A
|
A
T
|
T
G
 
G
V
 
S
G
 
K
V
 
V
M
 
M
Q
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
P
 
Q
N
 
L
V
|
V
T
 
K
G
 
P
L
 
V
T
 
T
L
 
L
E
 
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
I
V
 
V
A
 
V
F
 
F
G
 
E
D
 
D
A
 
V
N
 
D
V
 
I
D
 
D
A
 
K
V
 
V
V
 
V
E
 
E
G
 
W
A
 
T
L
 
I
W
 
F
A
 
G
I
 
C
F
 
F
S
x
W
N
 
T
A
 
N
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
C
 
C
S
 
S
A
 
A
G
 
T
S
 
S
R
 
R
L
 
L
V
 
L
I
 
V
H
 
H
R
 
E
S
 
S
L
 
I
H
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
F
R
 
V
D
 
D
K
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
K
R
 
W
A
 
T
Q
 
K
R
 
N
L
 
I
R
 
K
V
 
I
G
 
S
H
 
D
G
 
P
L
 
F
-
 
E
R
 
E
G
 
G
P
 
C
D
 
R
I
 
L
G
 
G
A
 
P
V
 
V
N
 
I
S
 
S
A
 
K
R
 
G
H
 
Q
L
 
Y
A
 
D
Q
 
K
I
 
I
D
 
M
D
 
K
H
 
F
V
 
I
S
 
S
R
 
T
A
 
A
R
 
K
T
 
S
R
 
E
G
 
G
V
 
A
E
 
T
I
 
I
V
 
L
T
 
Y
G
 
G
G
 
G
E
 
S
I
 
R
L
 
P
T
 
E
D
 
H
V
 
L
E
 
K
S
 
-
G
 
-
K
 
K
G
 
G
W
 
Y
F
 
Y
Y
 
I
A
 
E
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
V
D
 
T
D
 
D
L
 
I
A
 
S
A
 
T
N
 
S
D
 
M
D
 
Q
A
 
I
V
 
W
L
 
K
Q
 
E
E
|
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
C
I
 
V
Q
 
K
V
 
T
F
 
F
E
 
S
D
 
S
E
 
E
A
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
N
G
 
D
T
 
T
E
 
E
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
V
Y
 
F
T
 
S
R
 
N
D
 
D
I
 
L
A
 
E
T
 
R
A
 
C
L
 
E
R
 
R
M
 
I
A
 
T
R
 
K
R
 
A
V
 
L
D
 
E
A
 
V
G
 
G
Q
x
A
V
 
V
T
 
W
V
 
V
N
 
N
D
 
C
Y
 
S
W
 
Q
A
 
P
G
x
C
G
 
F
I
 
V
E
 
Q
L
 
A
P
 
P
F
x
W
G
 
G
G
 
G
N
 
I
R
x
K
K
 
R
S
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
E
 
E
K
 
L
G
 
G
L
 
E
E
 
W
G
 
G
L
 
I
D
 
Q
A
 
N
Y
 
Y
T
 
L
R
 
N
S
 
I
K
 
K
A
 
Q
V
 
V
T
 
T

O24174 Betaine aldehyde dehydrogenase 1; OsBADH1; EC 1.2.1.8 from Oryza sativa subsp. japonica (Rice) (see paper)
38% identity, 95% coverage: 21:491/494 of query aligns to 10:488/505 of O24174

query
sites
O24174
R
 
R
D
 
G
H
 
L
F
 
F
I
 
I
D
 
G
G
 
G
R
 
G
A
 
W
V
 
R
A
 
E
P
 
P
G
 
S
A
 
L
G
 
G
G
 
R
R
 
R
M
 
L
E
 
P
S
 
V
F
 
V
D
 
N
P
 
P
G
 
A
R
 
T
G
 
E
T
 
A
A
 
T
F
 
I
D
 
G
D
 
D
F
 
I
A
 
P
A
 
A
G
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
E
H
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
S
S
 
A
A
 
A
V
 
R
A
 
D
G
 
A
F
 
F
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
G
-
 
G
E
 
R
I
 
H
W
 
W
S
 
S
A
 
R
T
 
A
P
 
P
P
 
G
A
 
A
R
 
V
R
 
R
C
 
A
A
 
K
I
 
Y
L
 
L
N
 
K
E
 
A
A
 
I
A
 
A
R
 
A
L
 
K
M
 
I
R
 
K
H
 
D
E
 
K
A
 
K
E
 
S
H
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
L
V
 
L
E
 
E
C
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
P
L
 
L
A
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
M
A
 
E
G
 
D
S
 
V
A
 
A
R
 
A
L
 
C
L
 
F
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
G
 
D
A
 
L
A
 
A
D
 
E
K
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
G
R
 
K
S
 
Q
-
 
R
-
 
A
-
 
P
V
 
I
N
 
S
L
 
L
G
 
P
N
 
M
D
 
E
N
 
N
-
 
F
A
 
E
A
 
S
F
 
Y
T
 
V
L
 
L
R
 
K
E
 
E
P
 
P
V
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
G
H
 
L
I
 
I
V
 
T
P
 
P
W
 
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
S
 
L
S
 
L
T
 
M
L
 
A
V
 
T
R
x
W
G
 
K
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
S
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
L
K
 
K
P
 
P
A
 
S
E
 
E
T
 
L
T
 
A
P
 
S
F
 
L
T
 
T
A
 
C
L
 
L
M
 
E
I
 
L
A
 
G
D
 
G
L
 
I
L
 
C
I
 
A
R
 
E
A
 
I
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
L
N
 
N
V
 
I
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
L
G
 
G
I
 
T
A
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
A
R
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
H
V
 
V
R
 
D
H
 
K
V
 
I
T
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
T
A
 
E
T
 
T
G
 
G
V
 
K
G
 
R
V
 
I
M
 
M
Q
 
I
S
 
T
V
 
A
A
 
S
P
 
Q
N
 
M
V
 
V
T
 
K
G
 
P
L
 
V
T
 
S
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
A
 
V
F
 
F
G
 
D
D
 
D
A
 
V
N
 
D
V
 
I
D
 
D
A
 
K
V
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
W
A
 
A
L
 
M
W
 
F
A
 
G
I
 
C
F
 
F
S
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
C
 
C
S
 
S
A
 
A
G
 
T
S
 
S
R
 
R
L
 
L
V
 
L
I
 
L
H
 
H
R
 
E
S
 
K
L
 
I
H
 
A
A
 
K
E
 
R
V
 
F
R
 
L
D
 
D
K
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
A
R
 
W
A
 
A
Q
 
K
R
 
S
L
 
I
R
 
K
V
 
I
G
 
S
H
 
D
G
 
P
L
 
L
-
 
E
R
 
E
G
 
G
P
 
C
D
 
R
I
 
L
G
 
G
A
 
S
V
 
V
N
 
V
S
 
S
A
 
E
R
 
G
H
 
Q
L
 
Y
A
 
Q
Q
 
K
I
 
I
D
 
M
D
 
K
H
 
F
V
 
I
S
 
S
R
 
T
A
 
A
R
 
R
T
 
C
R
 
E
G
 
G
V
 
A
E
 
T
I
 
I
V
 
L
T
 
Y
G
 
G
G
 
G
E
 
A
I
 
R
L
 
P
T
 
Q
D
 
H
V
 
L
E
 
K
S
 
-
G
 
-
K
 
R
G
 
G
W
 
F
F
 
F
Y
 
I
A
 
E
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
I
D
 
T
D
 
N
L
 
V
A
 
S
A
 
T
N
 
S
D
 
M
D
 
Q
A
 
I
V
 
W
L
 
R
Q
 
E
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
C
I
 
V
Q
 
K
V
 
E
F
 
F
E
 
R
D
 
T
E
 
E
A
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
E
L
 
L
A
 
A
N
 
N
G
 
D
T
 
T
E
 
H
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
G
G
 
A
I
 
V
Y
 
I
T
 
S
R
 
N
D
 
D
I
 
L
A
 
E
T
 
R
A
 
C
L
 
E
R
 
R
M
 
I
A
 
S
R
 
K
R
 
A
V
 
I
D
 
Q
A
 
S
G
 
G
Q
 
I
V
 
V
T
 
W
V
 
I
N
 
N
D
 
C
Y
 
S
W
 
Q
A
 
P
G
 
C
G
 
F
I
 
V
E
 
Q
L
 
A
P
 
P
F
 
W
G
 
G
G
 
G
N
 
N
R
 
K
K
 
R
S
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
E
 
E
K
 
L
G
 
G
L
 
Q
E
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
N
Y
 
Y
T
 
L
R
 
S
S
 
V
K
 
K
A
 
Q
V
 
V
T
 
T

4o6rA Crystal structure of a putative aldehyde dehydrogenase from burkholderia cenocepacia
40% identity, 95% coverage: 24:494/494 of query aligns to 7:479/489 of 4o6rA

query
sites
4o6rA
F
 
F
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
R
A
 
F
V
 
V
A
 
D
P
 
A
G
 
V
A
 
D
G
 
R
G
 
G
R
 
T
M
 
I
E
 
D
S
 
V
F
 
L
D
 
N
P
 
P
G
 
H
R
 
D
G
 
G
T
 
S
A
 
V
F
 
I
D
 
T
D
 
K
F
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
V
D
 
D
H
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
D
S
 
A
A
 
A
V
 
T
A
 
R
G
 
A
F
 
F
E
 
P
I
 
A
W
 
W
S
 
S
A
 
A
T
 
M
P
 
P
P
 
A
A
 
A
R
 
E
R
 
R
C
 
G
A
 
R
I
 
L
L
 
L
N
 
L
E
 
R
A
 
L
A
 
A
R
 
D
L
 
A
M
 
I
R
 
E
H
 
A
E
 
N
A
 
T
E
 
E
H
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
Q
V
 
L
E
 
E
C
 
S
V
 
L
D
 
D
S
 
T
G
 
G
K
 
H
T
 
P
L
 
I
A
 
R
E
 
D
A
 
S
R
 
R
G
 
A
-
 
L
D
 
D
I
 
V
A
 
P
G
 
R
S
 
T
A
 
A
R
 
A
L
 
C
L
 
F
E
 
R
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
G
G
 
G
A
 
M
A
 
A
D
 
D
K
 
K
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
R
 
S
S
 
V
V
 
I
N
 
P
L
 
V
G
 
D
N
 
T
D
 
G
N
 
F
A
 
L
A
 
N
F
 
Y
T
 
V
L
 
Q
R
 
R
E
 
A
P
 
P
V
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
G
H
 
Q
I
|
I
V
|
V
P
 
P
W
 
W
N
|
N
Y
 
F
P
 
P
S
 
L
S
 
M
T
 
F
L
 
T
V
 
S
R
 
W
G
 
K
I
 
M
A
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
S
 
T
A
 
V
V
 
V
V
 
L
K
|
K
P
 
P
A
 
S
E
 
E
T
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
L
T
 
S
A
 
T
L
 
L
M
 
R
I
 
I
A
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
M
I
 
A
R
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
F
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
I
V
 
V
T
 
P
G
 
G
T
 
Y
G
|
G
I
 
H
A
 
T
A
 
A
G
|
G
A
x
Q
P
 
R
L
 
L
V
 
A
R
 
E
D
 
H
P
 
P
R
 
G
V
 
V
R
 
G
H
 
K
V
 
I
T
 
A
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
V
 
T
A
 
A
T
|
T
G
 
G
V
 
R
G
x
R
V
 
I
M
 
V
Q
 
E
S
 
A
V
 
S
A
 
Q
P
 
G
N
 
N
V
 
L
T
 
K
G
 
R
L
 
V
T
 
Q
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
G
P
 
A
L
 
N
V
 
I
A
 
V
F
 
F
G
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
N
V
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
A
V
 
I
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
A
W
 
W
A
 
A
I
 
I
F
 
F
S
 
H
N
 
N
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
C
|
C
S
 
I
A
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
L
V
 
V
I
 
L
H
 
H
R
 
E
S
 
R
L
 
I
H
 
A
A
 
D
E
 
A
V
 
F
R
 
L
D
 
E
K
 
R
L
 
F
V
 
V
A
 
A
R
 
L
A
 
A
Q
 
S
R
 
S
L
 
I
R
 
R
V
 
I
G
 
G
H
 
N
G
 
P
L
 
L
R
 
D
-
 
P
G
 
N
P
 
T
D
 
E
I
 
M
G
 
G
A
 
P
V
 
L
N
 
T
S
 
S
A
 
K
R
 
Q
H
 
H
L
 
L
A
 
D
Q
 
R
I
 
V
D
 
L
D
 
S
H
 
Y
V
 
V
S
 
D
R
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
E
R
 
Q
G
 
G
V
 
G
E
 
R
I
 
V
V
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
S
I
 
A
L
 
P
T
 
Q
D
 
D
V
 
P
E
 
A
S
 
L
G
 
A
K
 
N
G
 
G
W
 
Y
F
 
Y
Y
 
V
A
 
R
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
V
D
 
E
D
 
A
L
 
K
A
 
H
A
 
A
N
 
T
D
 
D
D
 
R
A
 
V
V
 
A
L
 
Q
Q
 
E
E
|
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
F
L
 
V
A
 
T
I
 
V
Q
 
L
V
 
R
F
 
F
E
 
G
D
 
S
E
 
D
A
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
A
N
 
N
G
 
A
T
 
T
E
 
E
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
A
 
G
A
 
S
G
 
G
I
 
L
Y
 
W
T
 
T
R
 
N
D
 
D
I
 
L
A
 
S
T
 
R
A
 
A
L
 
H
R
 
R
M
 
M
A
 
A
R
 
A
R
 
R
V
 
I
D
 
D
A
 
A
G
 
G
Q
 
M
V
 
C
T
 
W
V
 
I
N
 
N
D
 
C
Y
 
Y
W
 
K
A
 
R
G
 
V
G
 
N
I
 
P
E
 
G
L
 
S
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
V
R
 
G
K
 
K
S
 
S
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
E
|
E
K
 
M
G
 
G
L
 
F
E
 
E
G
 
A
L
 
M
D
 
H
A
 
D
Y
 
Y
T
 
T
R
 
E
S
 
A
K
 
R
A
 
S
V
 
V
T
 
W
L
 
V
A
 
N
V
 
V

4pxlA Structure of zm aldh2-3 (rf2c) in complex with NAD (see paper)
40% identity, 95% coverage: 24:490/494 of query aligns to 9:476/486 of 4pxlA

query
sites
4pxlA
F
 
F
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
K
A
 
F
V
 
V
A
 
D
P
 
A
G
 
V
A
 
S
G
 
G
G
 
K
R
 
T
M
 
F
E
 
E
S
 
T
F
 
R
D
 
D
P
 
P
G
 
R
R
 
T
G
 
G
T
 
E
A
 
V
F
 
I
D
 
A
D
 
S
F
 
I
A
 
A
A
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
K
A
 
A
D
 
D
V
 
V
D
 
D
H
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
K
S
 
A
A
 
A
V
 
R
A
 
E
G
 
A
F
 
F
E
 
D
-
 
N
-
 
G
I
 
P
W
 
W
S
 
P
A
 
R
T
 
M
P
 
T
P
 
G
A
 
Y
R
 
E
R
 
R
C
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
L
N
 
H
E
 
R
A
 
F
A
 
A
R
 
D
L
 
L
M
 
I
R
 
D
H
 
E
E
 
H
A
 
V
E
 
E
H
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
A
V
 
L
E
 
D
C
 
T
V
 
V
D
 
D
S
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
L
L
 
F
A
 
A
E
 
V
A
 
G
R
 
K
G
 
A
-
 
R
D
 
D
I
 
I
A
 
P
G
 
G
S
 
A
A
 
A
R
 
H
L
 
L
L
 
L
E
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
K
 
K
L
 
V
D
 
H
G
 
G
R
 
A
S
 
T
V
 
L
N
 
K
L
 
M
G
 
A
N
 
Q
D
 
R
N
 
M
A
 
H
A
 
G
F
 
Y
T
 
T
L
 
L
R
 
K
E
 
E
P
 
P
V
 
V
G
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
G
H
 
H
I
|
I
V
|
V
P
|
P
W
|
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
S
 
T
S
 
T
T
 
M
L
 
F
V
 
F
R
 
F
G
 
K
I
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
S
 
A
A
 
V
V
 
V
V
 
V
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
|
E
T
 
Q
T
 
T
P
 
P
F
 
L
T
 
S
A
 
A
L
 
L
M
 
F
I
 
Y
A
 
A
D
 
H
L
 
L
L
 
A
I
 
R
R
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
L
N
 
N
V
 
V
V
 
V
T
 
P
G
 
G
T
 
F
G
|
G
I
 
P
A
 
T
A
 
A
G
|
G
A
|
A
P
 
A
L
 
V
V
 
A
R
 
A
D
 
H
P
 
M
R
 
D
V
 
V
R
 
D
H
 
K
V
 
V
T
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
V
 
T
A
 
E
T
x
V
G
 
G
V
 
R
G
 
L
V
 
V
M
 
M
Q
 
R
S
 
A
V
 
A
A
 
A
-
 
E
P
 
S
N
 
N
V
 
L
T
 
K
G
 
P
L
 
V
T
 
S
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
|
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
V
V
 
I
A
 
V
F
 
F
G
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
D
V
 
L
D
 
D
A
 
M
V
 
A
V
 
V
E
 
N
G
 
L
A
 
V
L
 
N
W
 
F
A
 
A
I
 
T
F
 
Y
S
 
T
N
 
N
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
C
|
C
S
 
V
A
 
A
G
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
I
V
 
Y
I
 
V
H
 
Q
R
 
E
S
 
G
L
 
I
H
 
Y
A
 
D
E
 
E
V
 
F
R
 
V
D
 
K
K
 
K
L
 
A
V
 
A
A
 
E
R
 
L
A
 
A
Q
 
S
R
 
K
L
 
S
R
 
V
V
 
V
G
 
G
H
 
D
G
 
P
L
 
F
-
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
V
-
 
S
R
 
Q
G
 
G
P
 
P
D
 
Q
I
 
V
G
 
D
A
 
K
V
 
D
N
x
Q
S
 
Y
A
 
E
R
x
K
H
 
V
L
 
L
A
 
R
Q
 
Y
I
 
I
D
 
D
D
 
-
H
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
I
A
 
G
R
 
K
T
 
R
R
 
E
G
 
G
V
 
A
E
 
T
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
K
I
 
P
L
 
C
T
 
G
D
 
D
V
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
K
G
 
G
W
 
Y
F
 
Y
Y
 
I
A
 
E
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
F
D
 
T
D
 
D
L
 
V
A
 
K
A
 
D
N
 
D
D
 
M
D
 
T
A
 
I
V
 
A
L
 
Q
Q
 
D
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
A
 
A
I
 
L
Q
 
M
V
 
K
F
 
F
E
 
K
D
 
T
E
 
V
A
 
E
E
 
E
A
 
V
L
 
I
A
 
Q
L
 
K
A
 
A
N
 
N
G
 
N
T
 
T
E
 
R
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
Y
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
N
I
 
I
A
 
D
T
 
V
A
 
A
L
 
N
R
 
T
M
 
V
A
 
S
R
 
R
R
 
S
V
 
I
D
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
V
 
I
T
 
W
V
 
I
N
 
N
D
 
C
Y
 
Y
W
 
F
A
 
A
G
 
F
G
 
D
I
 
P
E
 
D
L
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
Y
R
 
K
K
 
M
S
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
K
E
x
D
K
 
M
G
 
G
L
 
M
E
 
D
G
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
K
Y
 
Y
T
 
L
R
 
Q
S
 
T
K
 
K
A
 
T
V
 
V

4v37A Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase from spinach showing a thiohemiacetal with 3-aminopropionaldehyde
40% identity, 96% coverage: 16:491/494 of query aligns to 1:481/495 of 4v37A

query
sites
4v37A
L
 
F
P
 
P
D
 
I
L
 
P
P
 
A
R
 
R
D
 
Q
H
 
L
F
 
F
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
E
A
 
W
V
 
R
A
 
E
P
 
P
G
 
I
A
 
K
G
 
K
G
 
N
R
 
R
M
 
I
E
 
P
S
 
V
F
 
I
D
 
N
P
 
P
G
 
S
R
 
T
G
 
E
T
 
E
A
 
I
F
 
I
D
 
G
D
 
D
F
 
I
A
 
P
A
 
A
G
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
E
H
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
V
S
 
A
A
 
A
V
 
R
A
 
R
G
 
A
F
 
F
-
 
R
-
 
R
E
 
N
I
 
N
W
 
W
S
 
S
A
 
A
T
 
T
P
 
S
P
 
G
A
 
A
R
 
H
R
 
R
C
 
A
A
 
T
I
 
Y
L
 
L
N
 
R
E
 
A
A
 
I
A
 
A
R
 
A
L
 
K
M
 
I
R
 
T
H
 
E
E
 
K
A
 
K
E
 
D
H
 
H
L
 
F
A
 
V
V
 
K
V
 
L
E
 
E
C
 
T
V
 
I
D
 
D
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
P
L
 
F
A
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
V
G
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
D
G
 
D
S
 
V
A
 
A
R
 
S
L
 
C
L
 
F
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
D
 
E
K
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
G
R
 
K
S
 
Q
-
 
K
-
 
A
-
 
P
V
 
V
N
 
T
L
 
L
G
 
P
N
 
M
D
 
E
N
 
R
-
 
F
A
 
K
A
 
S
F
 
H
T
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
P
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
G
H
 
L
I
|
I
V
x
S
P
|
P
W
|
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
S
 
L
S
 
L
T
x
M
L
 
A
V
 
T
R
 
W
G
 
K
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
S
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
L
K
|
K
P
 
P
A
x
S
E
|
E
T
 
L
T
 
A
P
 
S
F
 
V
T
 
T
A
 
C
L
 
L
M
 
E
I
 
F
A
 
G
D
 
E
L
 
V
L
 
C
I
 
N
R
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
L
N
 
N
V
 
I
V
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
L
G
|
G
I
 
P
A
 
D
A
 
A
G
|
G
A
|
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
R
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
D
V
 
V
R
 
D
H
 
K
V
 
I
T
 
A
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
V
 
S
A
 
A
T
|
T
G
 
G
V
 
S
G
 
K
V
 
V
M
 
M
Q
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
P
 
Q
N
 
L
V
 
V
T
 
K
G
 
P
L
 
V
T
 
T
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
I
V
 
V
A
 
V
F
 
F
G
 
E
D
 
D
A
 
V
N
 
D
V
 
I
D
 
D
A
 
K
V
 
V
V
 
V
E
 
E
G
 
W
A
 
T
L
 
I
W
 
F
A
 
G
I
 
C
F
 
F
S
 
W
N
 
T
A
 
N
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
C
x
A
S
 
S
A
 
A
G
 
T
S
 
S
R
 
R
L
 
L
V
 
L
I
 
V
H
 
H
R
 
E
S
 
S
L
 
I
H
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
F
R
 
V
D
 
D
K
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
K
R
 
W
A
 
T
Q
 
K
R
 
N
L
 
I
R
 
K
V
 
I
G
 
S
H
 
D
G
 
P
L
 
F
-
 
E
R
 
E
G
 
G
P
 
C
D
 
R
I
 
L
G
 
G
A
 
P
V
 
V
N
 
I
S
 
S
A
 
K
R
 
G
H
 
Q
L
 
Y
A
 
D
Q
 
K
I
 
I
D
 
M
D
 
K
H
 
F
V
 
I
S
 
S
R
 
T
A
 
A
R
 
K
T
 
S
R
 
E
G
 
G
V
 
A
E
 
T
I
 
I
V
 
L
T
 
Y
G
 
G
G
 
G
E
 
S
I
 
R
L
 
P
T
 
E
D
 
H
V
 
L
E
 
K
S
 
-
G
 
-
K
 
K
G
 
G
W
 
Y
F
 
Y
Y
 
I
A
 
E
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
V
D
 
T
D
 
D
L
 
I
A
 
S
A
 
T
N
 
S
D
 
M
D
 
Q
A
 
I
V
 
W
L
 
K
Q
 
E
E
|
E
I
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
C
I
 
V
Q
 
K
V
 
T
F
 
F
E
 
S
D
 
S
E
 
E
A
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
N
G
 
D
T
 
T
E
 
E
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
V
Y
 
F
T
 
S
R
 
N
D
 
D
I
 
L
A
 
E
T
 
R
A
 
C
L
 
E
R
 
R
M
 
I
A
 
T
R
 
K
R
 
A
V
 
L
D
 
E
A
 
V
G
 
G
Q
 
A
V
 
V
T
 
W
V
 
V
N
 
N
D
 
C
Y
 
S
W
 
Q
A
 
P
G
x
C
G
 
F
I
 
V
E
 
Q
L
 
A
P
 
P
F
x
W
G
 
G
G
 
G
N
 
I
R
 
K
K
 
R
S
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
E
|
E
K
 
L
G
 
G
L
 
E
E
 
W
G
 
G
L
 
I
D
 
Q
A
 
N
Y
 
Y
T
 
L
R
 
N
S
 
I
K
 
K
A
 
Q
V
 
V
T
 
T

Q56YU0 Aldehyde dehydrogenase family 2 member C4; ALDH1a; Protein REDUCED EPIDERMAL FLUORESCENCE 1; EC 1.2.1.3 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
37% identity, 97% coverage: 13:492/494 of query aligns to 11:493/501 of Q56YU0

query
sites
Q56YU0
T
 
T
G
 
V
A
 
K
L
 
L
P
 
P
D
 
E
L
 
I
P
 
K
R
 
F
D
 
T
H
 
K
-
 
L
F
 
F
I
 
I
D
 
N
G
 
G
R
 
Q
A
 
F
V
 
I
A
 
D
P
 
A
G
 
A
A
 
S
G
 
G
G
 
K
R
 
T
M
 
F
E
 
E
S
 
T
F
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
R
R
 
N
G
 
G
T
 
E
A
 
V
F
 
I
D
 
A
D
 
T
F
 
I
A
 
A
A
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
K
A
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
H
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
N
S
 
A
A
 
A
V
 
R
A
 
Y
G
 
A
F
 
F
E
 
D
-
 
H
-
 
G
I
 
P
W
 
W
S
 
P
A
 
R
T
 
M
P
 
T
P
 
G
A
 
F
R
 
E
R
 
R
C
 
A
A
 
K
I
 
L
L
 
I
N
 
N
E
 
K
A
 
F
A
 
A
R
 
D
L
 
L
M
 
I
R
 
E
H
 
E
E
 
N
A
 
I
E
 
E
H
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
V
 
L
E
 
D
C
 
A
V
 
V
D
 
D
S
 
G
G
 
G
K
 
K
T
 
L
L
 
F
A
 
Q
E
 
L
A
 
G
R
 
K
-
 
Y
G
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
P
G
 
A
S
 
T
A
 
A
R
 
G
L
 
H
L
 
F
E
 
R
Y
 
Y
Y
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
K
 
K
L
 
I
D
 
H
G
 
G
R
 
E
S
 
T
V
 
L
N
 
K
L
 
M
G
 
T
N
 
R
D
 
Q
N
 
S
A
 
L
-
 
F
A
x
G
F
 
Y
T
 
T
L
 
L
R
 
K
E
 
E
P
 
P
V
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
G
H
 
N
I
 
I
V
 
I
P
 
P
W
 
W
N
 
N
Y
 
F
P
 
P
S
 
S
S
 
I
T
 
M
L
 
F
V
 
A
R
 
T
G
 
K
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
S
 
T
A
 
M
V
 
V
V
 
V
K
 
K
P
 
P
A
 
A
E
 
E
T
 
Q
T
 
T
P
 
S
F
 
L
T
 
S
A
 
A
L
 
L
M
 
F
I
 
Y
A
 
A
D
 
H
L
 
L
L
 
S
I
 
K
R
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
I
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
L
N
 
N
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
F
G
 
G
I
 
S
A
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
A
L
 
I
V
 
A
R
 
S
D
 
H
P
 
M
R
 
D
V
 
V
R
 
D
H
 
K
V
 
V
T
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
T
A
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
R
G
 
K
V
 
I
M
 
M
Q
 
Q
-
 
A
S
 
A
V
 
A
A
 
A
P
 
S
N
 
N
V
 
L
T
 
K
G
 
K
L
 
V
T
 
S
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
L
A
 
I
F
 
F
G
 
N
D
 
D
A
 
A
N
 
D
V
 
I
D
 
D
A
 
K
V
 
A
V
 
A
E
 
D
G
 
L
A
 
A
L
 
L
W
 
L
A
 
G
I
 
C
F
 
F
S
 
Y
N
 
N
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
C
 
C
S
 
V
A
 
A
G
 
S
S
 
S
R
 
R
L
 
V
V
 
F
I
 
V
H
 
Q
R
 
E
S
 
G
L
 
I
H
 
Y
A
 
D
E
 
K
V
 
V
R
 
V
D
 
E
K
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
R
 
D
L
 
W
R
 
T
V
 
V
G
 
G
H
 
D
G
 
P
L
 
F
-
 
D
-
 
S
-
 
T
-
 
A
-
 
R
R
 
Q
G
 
G
P
 
P
D
 
Q
I
 
V
G
 
-
A
 
-
V
 
-
N
 
-
S
 
D
A
 
K
R
 
R
H
 
Q
L
 
F
A
 
E
Q
 
K
I
 
I
D
 
L
D
 
S
H
 
Y
V
 
I
S
 
E
R
 
H
A
 
G
R
 
K
T
 
N
R
 
E
G
 
G
V
 
A
E
 
T
I
 
L
V
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
K
I
 
A
L
 
I
T
 
G
D
 
D
V
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
K
G
 
G
W
 
Y
F
 
F
Y
 
I
A
 
Q
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
F
D
 
A
D
 
D
L
 
V
A
 
T
A
 
E
N
 
D
D
 
M
D
 
K
A
 
I
V
 
Y
L
 
Q
Q
 
D
E
 
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
A
 
S
I
 
L
Q
 
M
V
 
K
F
 
F
E
 
K
D
 
T
E
 
V
A
 
E
E
 
E
A
x
G
L
 
I
A
 
K
L
 
C
A
 
A
N
 
N
G
 
N
T
 
T
E
 
K
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
Y
 
L
T
 
S
R
 
Q
D
 
D
I
 
I
A
 
D
T
 
L
A
 
I
L
 
N
R
 
T
M
 
V
A
 
S
R
 
R
R
 
S
V
 
I
D
 
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
I
V
 
I
T
 
W
V
 
V
N
 
N
D
 
C
Y
 
Y
W
 
F
A
 
G
G
 
F
G
 
D
I
 
L
E
 
D
L
 
C
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
N
 
Y
R
 
K
K
 
M
S
 
S
G
 
G
F
 
N
G
 
C
R
 
R
E
 
E
K
 
S
G
 
G
L
 
M
E
 
D
G
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
N
Y
 
Y
T
 
L
R
 
Q
S
 
T
K
 
K
A
 
S
V
 
V
T
 
V
L
 
M

Q84LK3 Betaine aldehyde dehydrogenase 2; OsBADH2; EC 1.2.1.8 from Oryza sativa subsp. japonica (Rice) (see paper)
41% identity, 95% coverage: 21:491/494 of query aligns to 8:486/503 of Q84LK3

query
sites
Q84LK3
R
 
R
D
 
Q
H
 
L
F
 
F
I
 
V
D
 
A
G
 
G
R
 
E
A
 
W
V
 
R
A
 
A
P
 
P
G
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
R
R
 
R
M
 
L
E
 
P
S
 
V
F
 
V
D
 
N
P
 
P
G
 
A
R
 
T
G
 
E
T
 
S
A
 
P
F
 
I
D
 
G
D
 
E
F
 
I
A
 
P
A
 
A
G
 
G
D
 
T
A
 
A
A
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
H
 
A
A
 
A
V
 
V
T
 
A
S
 
A
A
 
A
V
 
R
A
 
E
G
 
A
F
 
L
E
 
K
I
 
R
-
 
N
-
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
D
W
 
W
S
 
A
A
 
R
T
 
A
P
 
P
P
 
G
A
 
A
R
 
V
R
 
R
C
 
A
A
 
K
I
 
Y
L
 
L
N
 
R
E
 
A
-
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
K
L
 
I
M
 
I
R
 
E
H
 
R
E
 
K
A
 
S
E
 
E
H
 
-
L
 
L
A
 
A
V
 
R
V
 
L
E
 
E
C
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
C
G
 
G
K
 
K
T
 
P
L
 
L
A
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
A
G
 
W
D
 
D
I
 
M
A
 
D
G
 
D
S
 
V
A
 
A
R
 
G
L
 
C
L
 
F
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
A
G
 
D
A
 
L
A
 
A
D
 
E
K
 
S
L
 
L
D
 
D
G
 
K
R
 
R
S
 
Q
-
 
N
-
 
A
-
 
P
V
 
V
N
 
S
L
 
L
G
 
P
N
 
M
D
 
E
N
 
N
A
 
F
A
 
K
F
 
C
T
 
Y
L
 
L
R
 
R
-
 
K
E
 
E
P
 
P
V
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
G
H
 
L
I
 
I
V
 
T
P
 
P
W
 
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
S
 
L
S
 
L
T
 
M
L
 
A
V
 
T
R
x
W
G
 
K
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
S
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
L
K
 
K
P
 
P
A
 
S
E
 
E
T
 
L
T
 
A
P
 
S
F
 
V
T
 
T
A
 
C
L
 
L
M
 
E
I
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
V
L
 
C
I
 
K
R
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
S
G
 
G
V
 
V
V
 
L
N
 
N
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
L
G
 
G
I
 
S
A
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
S
R
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
G
V
 
V
R
 
D
H
 
K
V
 
V
T
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
Y
A
 
E
T
 
T
G
 
G
V
 
K
G
 
K
V
 
I
M
 
M
Q
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
P
 
P
N
 
M
V
 
V
T
 
K
G
 
P
L
 
V
T
 
S
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
I
V
 
V
A
 
V
F
 
F
G
 
D
D
 
D
A
 
V
N
 
D
V
 
V
D
 
E
A
 
K
V
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
W
A
 
T
L
 
L
W
 
F
A
 
G
I
 
C
F
 
F
S
 
W
N
 
T
A
 
N
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
C
 
C
S
 
S
A
 
A
G
 
T
S
 
S
R
 
R
L
 
L
V
 
I
I
 
L
H
 
H
R
 
K
S
 
K
L
 
I
H
 
A
A
 
K
E
 
E
V
 
F
R
 
Q
D
 
E
K
 
R
L
 
M
V
 
V
A
 
A
R
 
W
A
 
A
Q
 
K
R
 
N
L
 
I
R
 
K
V
 
V
G
 
S
H
 
D
G
 
P
L
 
L
-
 
E
R
 
E
G
 
G
P
 
C
D
 
R
I
 
L
G
 
G
A
 
P
V
 
V
N
 
V
S
 
S
A
 
E
R
 
G
H
 
Q
L
 
Y
A
 
E
Q
 
K
I
 
I
D
 
K
D
 
Q
H
 
F
V
 
V
S
 
S
R
 
T
A
 
A
R
 
K
T
 
S
R
 
Q
G
 
G
V
 
A
E
 
T
I
 
I
V
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
V
I
 
R
L
 
P
T
 
K
D
 
H
V
 
L
E
 
E
S
 
-
G
 
-
K
 
K
G
 
G
W
 
F
F
 
Y
Y
 
I
A
 
E
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
I
D
 
T
D
 
D
L
 
V
A
 
D
A
 
T
N
 
S
D
 
M
D
 
Q
A
 
I
V
 
W
L
 
R
Q
 
E
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
C
I
 
V
Q
 
K
V
 
E
F
 
F
E
 
S
D
 
T
E
 
E
A
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
A
N
 
N
G
 
D
T
 
T
E
 
H
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
G
G
 
A
I
 
V
Y
 
L
T
 
S
R
 
G
D
 
D
I
 
R
A
 
E
T
 
R
A
 
C
L
 
Q
R
 
R
M
 
L
A
 
T
R
 
E
R
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
A
G
 
G
Q
 
I
V
 
I
T
 
W
V
 
V
N
 
N
D
 
C
Y
 
S
W
 
Q
A
 
P
G
 
C
G
 
F
I
 
C
E
 
Q
L
 
A
P
 
P
F
 
W
G
 
G
G
 
G
N
 
N
R
 
K
K
 
R
S
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
E
 
E
K
 
L
G
 
G
L
 
E
E
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
A
 
N
Y
 
Y
T
 
L
R
 
S
S
 
V
K
 
K
A
 
Q
V
 
V
T
 
T

8skfA Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (lattice translocation disorder)
37% identity, 95% coverage: 24:494/494 of query aligns to 17:490/497 of 8skfA

query
sites
8skfA
F
 
Y
I
 
I
D
 
H
G
 
G
R
 
K
A
 
F
V
 
V
A
 
A
P
 
A
G
 
T
A
 
S
G
 
G
G
 
K
R
 
T
M
 
F
E
 
E
S
x
T
F
x
I
D
 
N
P
 
P
G
 
A
R
 
T
G
 
G
T
 
E
A
 
V
F
 
L
D
 
A
D
 
T
F
 
V
A
 
Q
A
 
A
G
 
A
D
 
G
A
 
R
A
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
H
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
K
S
 
S
A
 
A
V
 
Q
A
 
Q
G
 
G
F
 
Q
E
 
K
I
 
V
W
 
W
S
 
A
A
 
A
T
 
M
P
 
S
P
 
A
A
 
M
R
 
A
R
 
R
C
 
S
A
 
R
I
 
I
L
 
L
N
 
R
E
 
K
A
 
A
A
 
V
R
 
D
L
 
I
M
 
L
R
 
R
H
 
E
E
 
R
A
 
N
E
 
D
H
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
R
V
 
L
E
 
E
C
 
T
V
 
L
D
|
D
S
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
P
L
 
L
A
 
S
E
 
E
-
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
V
G
 
T
S
 
G
A
 
A
R
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
I
D
 
P
K
 
A
L
 
L
D
 
E
G
 
G
R
 
S
S
 
Q
V
 
I
N
 
P
L
 
L
G
 
R
N
 
D
D
 
S
N
 
S
A
 
F
A
 
V
F
 
Y
T
 
T
L
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
A
H
 
G
I
|
I
V
x
G
P
x
A
W
|
W
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
S
 
I
S
 
Q
T
 
I
L
 
A
V
 
L
R
 
W
G
 
K
I
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
S
 
A
A
 
M
V
 
I
V
 
F
K
|
K
P
 
P
A
 
S
E
|
E
T
x
V
T
 
T
P
 
P
F
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
K
I
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
I
L
 
Y
I
 
R
R
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
L
T
 
P
G
 
G
T
 
I
G
|
G
I
 
A
A
 
E
A
 
T
G
|
G
A
 
Q
P
 
Y
L
 
L
V
 
T
R
 
E
D
 
H
P
 
P
R
 
D
V
 
I
R
 
A
H
 
K
V
 
I
T
 
S
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
x
G
V
 
V
A
 
A
T
x
S
G
 
G
V
 
K
G
x
K
V
 
V
M
 
M
-
 
A
Q
 
N
S
 
S
V
 
A
A
 
A
P
 
S
N
 
S
V
 
L
T
 
K
G
 
E
L
 
V
T
 
T
L
 
M
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
A
 
I
F
 
A
G
 
E
D
 
D
A
 
A
N
 
N
V
 
L
D
 
D
A
 
L
V
 
A
V
 
A
E
 
D
G
 
I
A
 
A
L
 
M
W
 
M
A
 
A
I
 
N
F
 
F
S
 
Y
N
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
C
|
C
S
 
T
A
 
N
G
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
V
V
 
F
I
 
V
H
 
P
R
 
A
S
 
K
L
 
F
H
 
K
A
 
A
E
 
E
V
 
F
R
 
E
D
 
H
K
 
K
L
 
I
V
 
L
A
 
E
R
 
R
A
 
V
Q
 
G
R
 
R
L
 
I
R
 
R
V
 
A
G
 
G
H
 
D
G
 
L
L
 
F
-
 
A
R
 
D
G
 
D
P
 
T
D
 
N
I
 
F
G
 
G
A
 
P
V
 
L
N
 
V
S
 
S
A
 
F
R
 
P
H
 
H
L
 
R
A
 
Q
Q
 
N
I
 
V
D
 
L
D
 
R
H
 
Y
V
 
I
S
 
E
R
 
S
A
 
G
R
 
K
T
 
S
R
 
E
G
 
G
V
 
A
E
 
R
I
 
L
V
 
L
T
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
D
I
 
V
L
 
L
T
 
K
D
 
G
V
 
E
E
 
G
S
 
F
G
 
D
K
 
N
G
 
G
W
 
A
F
 
W
Y
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
D
 
T
D
 
D
L
 
C
A
 
T
A
 
D
N
 
D
D
 
M
D
 
T
A
 
I
V
 
V
L
 
R
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
A
 
S
I
 
I
Q
 
L
V
 
S
F
 
Y
E
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
V
L
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
N
 
N
G
 
A
T
 
T
E
 
E
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
V
T
 
T
R
 
P
D
 
D
I
 
L
A
 
N
T
 
R
A
 
A
L
 
H
R
 
R
M
 
I
A
 
I
R
 
H
R
 
Q
V
 
L
D
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
I
V
 
C
T
 
W
V
 
I
N
 
N
D
 
S
Y
 
W
W
 
G
A
 
E
G
 
S
G
 
P
I
 
A
E
 
E
L
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
Y
R
 
K
K
 
H
S
 
S
G
 
G
F
 
I
G
 
G
R
 
R
E
 
E
K
 
N
G
 
G
L
 
V
E
 
M
G
 
T
L
 
L
D
 
Q
A
 
S
Y
 
Y
T
 
T
R
 
Q
S
 
V
K
 
K
A
 
S
V
 
I
T
 
Q
L
 
V
A
 
E
V
 
M

P54115 Magnesium-activated aldehyde dehydrogenase, cytosolic; Mg(2+)-activated acetaldehyde dehydrogenase; Mg(2+)-ACDH; EC 1.2.1.-; EC 1.2.1.4 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 2 papers)
36% identity, 98% coverage: 13:494/494 of query aligns to 18:500/500 of P54115

query
sites
P54115
T
 
N
G
 
G
A
 
L
L
 
T
P
 
Y
D
 
E
L
 
Q
P
 
P
R
 
T
D
 
G
H
 
L
F
 
F
I
 
I
D
 
N
G
 
N
R
 
K
A
 
F
V
 
M
A
 
K
P
 
A
G
 
Q
A
 
D
G
 
G
G
 
K
R
 
T
M
 
Y
E
 
P
S
 
V
F
 
E
D
 
D
P
 
P
G
 
S
R
 
T
G
 
E
T
 
N
A
 
T
F
 
V
D
 
C
D
 
E
F
 
V
A
 
S
A
 
S
G
 
A
D
 
T
A
 
T
A
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
E
H
 
Y
A
 
A
V
 
I
T
 
E
S
 
C
A
 
A
V
 
D
A
 
R
G
 
A
F
 
F
E
 
H
-
 
D
-
 
T
I
 
E
W
 
W
S
 
A
A
 
T
T
 
Q
P
 
D
P
 
P
A
 
R
R
 
E
R
 
R
C
 
G
A
 
R
I
 
L
L
 
L
N
 
S
E
 
K
A
 
L
A
 
A
R
 
D
L
 
E
M
 
L
R
 
E
H
 
S
E
 
Q
A
 
I
E
 
D
H
 
L
L
 
V
A
 
S
V
 
S
V
 
I
E
 
E
C
 
A
V
 
L
D
 
D
S
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
G
D
 
D
I
 
V
A
 
T
G
 
I
S
 
A
A
 
I
R
 
N
L
 
C
L
 
L
E
 
R
Y
 
D
Y
 
A
A
 
A
G
 
A
A
 
Y
A
 
A
D
 
D
K
 
K
L
 
V
D
 
N
G
 
G
R
 
R
S
 
T
V
 
I
N
 
N
L
 
T
G
 
G
N
 
D
D
 
G
N
 
Y
A
 
M
A
 
N
F
 
F
T
 
T
L
 
T
R
 
L
E
 
E
P
 
P
V
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
C
A
 
G
H
 
Q
I
 
I
V
 
I
P
 
P
W
 
W
N
 
N
Y
 
F
P
 
P
S
 
I
S
 
M
T
 
M
L
 
L
V
 
A
R
 
W
G
 
K
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
M
G
 
G
C
 
N
S
 
V
A
 
C
V
 
I
V
 
L
K
 
K
P
 
P
A
 
A
E
 
A
T
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
L
T
 
N
A
 
A
L
 
L
M
 
Y
I
 
F
A
 
A
D
 
S
L
 
L
L
 
C
I
 
K
R
 
K
A
 
V
G
 
G
L
 
I
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
I
V
 
V
T
 
P
G
 
G
T
 
P
G
 
G
I
 
R
A
 
T
A
 
V
G
 
G
A
 
A
P
 
A
L
 
L
V
 
T
R
 
N
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
I
R
 
R
H
 
K
V
 
L
T
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
T
A
 
E
T
 
V
G
 
G
V
 
K
G
 
S
V
 
V
-
 
A
M
 
V
Q
 
D
S
 
S
V
 
S
A
 
E
P
 
S
N
 
N
V
 
L
T
 
K
G
 
K
L
 
I
T
 
T
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
A
L
 
H
V
 
L
A
 
V
F
 
F
G
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
N
V
 
I
D
 
K
A
 
K
V
 
T
V
 
L
E
 
P
G
 
N
A
 
L
L
 
V
W
 
N
A
 
G
I
 
I
F
 
F
S
 
K
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
C
 
C
S
 
S
A
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
I
V
 
Y
I
 
V
H
 
Q
R
 
E
S
 
G
L
 
I
H
 
Y
A
 
D
E
 
E
V
 
L
R
 
L
D
 
A
K
 
A
L
 
F
V
 
K
A
 
A
R
 
Y
A
 
L
Q
 
E
-
 
T
R
 
E
L
 
I
R
 
K
V
 
V
G
 
G
H
 
N
G
 
P
L
 
F
R
 
D
G
 
K
P
 
A
D
 
N
I
 
F
-
 
Q
G
 
G
A
 
A
V
 
I
N
 
T
S
 
N
A
 
R
R
 
Q
H
 
Q
L
 
F
A
 
D
Q
 
T
I
 
I
D
 
M
D
 
N
H
 
Y
V
 
I
S
 
D
R
 
I
A
 
G
R
 
K
T
 
K
R
 
E
G
 
G
V
 
A
E
 
K
I
 
I
V
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
E
I
 
K
L
 
V
T
 
G
D
 
D
V
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
K
G
 
G
W
 
Y
F
 
F
Y
 
I
A
 
R
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
D
 
Y
D
 
D
L
 
V
A
 
N
A
 
E
N
 
D
D
 
M
D
 
R
A
 
I
V
 
V
L
 
K
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
T
I
 
V
Q
 
A
V
 
K
F
 
F
E
 
K
D
 
T
E
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
G
L
 
V
A
 
E
L
 
M
A
 
A
N
 
N
G
 
S
T
 
S
E
 
E
F
 
F
A
 
G
L
 
L
A
 
G
A
 
S
G
 
G
I
 
I
Y
 
E
T
 
T
R
 
E
D
 
S
I
 
L
A
 
S
T
 
T
A
 
G
L
 
L
R
 
K
M
 
V
A
 
A
R
 
K
R
 
M
V
 
L
D
 
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
T
 
W
V
 
I
N
 
N
D
 
T
Y
 
Y
W
 
N
A
 
D
G
 
F
G
 
D
I
 
S
E
 
R
L
 
V
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
V
R
 
K
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
E
 
E
K
 
M
G
 
G
L
 
E
E
 
E
G
 
V
L
 
Y
D
 
H
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
R
 
E
S
 
V
K
 
K
A
 
A
V
 
V
T
 
R
L
 
I
A
 
K
V
 
L

Sites not aligning to the query:

8vr1A Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (ctp bound)
37% identity, 95% coverage: 24:494/494 of query aligns to 8:481/488 of 8vr1A

query
sites
8vr1A
F
 
Y
I
 
I
D
 
H
G
 
G
R
 
K
A
 
F
V
 
V
A
 
A
P
 
A
G
 
T
A
 
S
G
 
G
G
 
K
R
 
T
M
 
F
E
 
E
S
 
T
F
 
I
D
 
N
P
 
P
G
 
A
R
 
T
G
 
G
T
 
E
A
 
V
F
 
L
D
 
A
D
 
T
F
 
V
A
 
Q
A
 
A
G
 
A
D
 
G
A
 
R
A
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
H
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
K
S
 
S
A
 
A
V
 
Q
A
 
Q
G
 
G
F
 
Q
E
 
K
I
 
V
W
 
W
S
 
A
A
 
A
T
 
M
P
 
S
P
 
A
A
 
M
R
 
A
R
 
R
C
 
S
A
 
R
I
 
I
L
 
L
N
 
R
E
 
K
A
 
A
A
 
V
R
 
D
L
 
I
M
 
L
R
 
R
H
 
E
E
 
R
A
 
N
E
 
D
H
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
R
V
 
L
E
 
E
C
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
P
L
 
L
A
 
S
E
 
E
-
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
V
G
 
T
S
 
G
A
 
A
R
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
I
D
 
P
K
 
A
L
 
L
D
 
E
G
 
G
R
 
S
S
 
Q
V
 
I
N
 
P
L
 
L
G
 
R
N
 
D
D
 
S
N
 
S
A
 
F
A
 
V
F
 
Y
T
 
T
L
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
A
H
 
G
I
 
I
V
 
G
P
 
A
W
|
W
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
S
 
I
S
 
Q
T
 
I
L
 
A
V
 
L
R
 
W
G
 
K
I
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
S
 
A
A
 
M
V
 
I
V
 
F
K
 
K
P
 
P
A
 
S
E
 
E
T
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
K
I
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
I
L
 
Y
I
 
R
R
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
L
T
 
P
G
 
G
T
 
I
G
 
G
I
 
A
A
 
E
A
 
T
G
 
G
A
 
Q
P
 
Y
L
 
L
V
 
T
R
 
E
D
 
H
P
 
P
R
 
D
V
 
I
R
 
A
H
 
K
V
 
I
T
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
V
 
V
A
|
A
T
x
S
G
 
G
V
 
K
G
 
K
V
 
V
M
 
M
-
 
A
Q
 
N
S
 
S
V
 
A
A
 
A
P
 
S
N
 
S
V
 
L
T
 
K
G
 
E
L
 
V
T
 
T
L
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
A
 
I
F
 
A
G
 
E
D
 
D
A
 
A
N
 
N
V
 
L
D
 
D
A
 
L
V
 
A
V
 
A
E
 
D
G
 
I
A
 
A
L
 
M
W
 
M
A
 
A
I
 
N
F
 
F
S
 
Y
N
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
C
 
C
S
 
T
A
 
N
G
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
V
V
 
F
I
 
V
H
 
P
R
 
A
S
 
K
L
 
F
H
 
K
A
 
A
E
 
E
V
 
F
R
 
E
D
 
H
K
 
K
L
 
I
V
 
L
A
 
E
R
 
R
A
 
V
Q
 
G
R
 
R
L
 
I
R
 
R
V
 
A
G
 
G
H
 
D
G
 
L
L
 
F
-
 
A
R
 
D
G
 
D
P
 
T
D
 
N
I
 
F
G
 
G
A
 
P
V
 
L
N
 
V
S
 
S
A
 
F
R
 
P
H
 
H
L
 
R
A
 
Q
Q
 
N
I
 
V
D
 
L
D
 
R
H
 
Y
V
 
I
S
 
E
R
 
S
A
 
G
R
 
K
T
 
S
R
 
E
G
 
G
V
 
A
E
 
R
I
 
L
V
 
L
T
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
D
I
 
V
L
 
L
T
 
K
D
 
G
V
 
E
E
 
G
S
 
F
G
 
D
K
 
N
G
 
G
W
 
A
F
 
W
Y
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
D
 
T
D
 
D
L
 
C
A
 
T
A
 
D
N
 
D
D
 
M
D
 
T
A
 
I
V
 
V
L
 
R
Q
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
A
 
S
I
 
I
Q
 
L
V
 
S
F
 
Y
E
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
V
L
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
N
 
N
G
 
A
T
 
T
E
 
E
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
V
T
 
T
R
 
P
D
 
D
I
 
L
A
 
N
T
 
R
A
 
A
L
 
H
R
 
R
M
 
I
A
 
I
R
 
H
R
 
Q
V
 
L
D
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
I
V
 
C
T
 
W
V
 
I
N
 
N
D
 
S
Y
 
W
W
 
G
A
 
E
G
 
S
G
 
P
I
 
A
E
 
E
L
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
Y
R
 
K
K
 
H
S
 
S
G
 
G
F
 
I
G
 
G
R
 
R
E
 
E
K
 
N
G
 
G
L
 
V
E
 
M
G
 
T
L
 
L
D
 
Q
A
 
S
Y
 
Y
T
 
T
R
 
Q
S
 
V
K
 
K
A
 
S
V
 
I
T
 
Q
L
 
V
A
 
E
V
 
M

8vr0A Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (gmp bound)
37% identity, 95% coverage: 24:494/494 of query aligns to 8:481/488 of 8vr0A

query
sites
8vr0A
F
 
Y
I
 
I
D
 
H
G
 
G
R
 
K
A
 
F
V
 
V
A
 
A
P
 
A
G
 
T
A
 
S
G
 
G
G
 
K
R
 
T
M
 
F
E
 
E
S
 
T
F
 
I
D
 
N
P
 
P
G
 
A
R
 
T
G
 
G
T
 
E
A
 
V
F
 
L
D
 
A
D
 
T
F
 
V
A
 
Q
A
 
A
G
 
A
D
 
G
A
 
R
A
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
H
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
K
S
 
S
A
 
A
V
 
Q
A
 
Q
G
 
G
F
 
Q
E
 
K
I
 
V
W
 
W
S
 
A
A
 
A
T
 
M
P
 
S
P
 
A
A
 
M
R
 
A
R
 
R
C
 
S
A
 
R
I
 
I
L
 
L
N
 
R
E
 
K
A
 
A
A
 
V
R
 
D
L
 
I
M
 
L
R
 
R
H
 
E
E
 
R
A
 
N
E
 
D
H
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
R
V
 
L
E
 
E
C
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
P
L
 
L
A
 
S
E
 
E
-
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
V
G
 
T
S
 
G
A
 
A
R
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
I
D
 
P
K
 
A
L
 
L
D
 
E
G
 
G
R
 
S
S
 
Q
V
 
I
N
 
P
L
 
L
G
 
R
N
 
D
D
 
S
N
 
S
A
 
F
A
 
V
F
 
Y
T
 
T
L
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
A
H
 
G
I
 
I
V
 
G
P
 
A
W
|
W
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
S
 
I
S
 
Q
T
 
I
L
 
A
V
 
L
R
 
W
G
 
K
I
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
S
 
A
A
 
M
V
 
I
V
 
F
K
 
K
P
 
P
A
 
S
E
 
E
T
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
K
I
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
I
L
 
Y
I
 
R
R
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
L
T
 
P
G
 
G
T
 
I
G
 
G
I
 
A
A
 
E
A
 
T
G
 
G
A
 
Q
P
 
Y
L
 
L
V
 
T
R
 
E
D
 
H
P
 
P
R
 
D
V
 
I
R
 
A
H
 
K
V
 
I
T
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
V
 
V
A
 
A
T
 
S
G
 
G
V
 
K
G
 
K
V
 
V
M
 
M
-
 
A
Q
 
N
S
 
S
V
 
A
A
 
A
P
 
S
N
 
S
V
 
L
T
 
K
G
 
E
L
 
V
T
 
T
L
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
A
 
I
F
 
A
G
 
E
D
 
D
A
 
A
N
 
N
V
 
L
D
 
D
A
 
L
V
 
A
V
 
A
E
 
D
G
 
I
A
 
A
L
 
M
W
 
M
A
 
A
I
 
N
F
 
F
S
 
Y
N
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
C
 
C
S
 
T
A
 
N
G
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
V
V
 
F
I
 
V
H
 
P
R
 
A
S
 
K
L
 
F
H
 
K
A
 
A
E
 
E
V
 
F
R
 
E
D
 
H
K
 
K
L
 
I
V
 
L
A
 
E
R
 
R
A
 
V
Q
 
G
R
 
R
L
 
I
R
 
R
V
 
A
G
 
G
H
 
D
G
 
L
L
 
F
-
 
A
R
 
D
G
 
D
P
 
T
D
 
N
I
 
F
G
 
G
A
 
P
V
 
L
N
 
V
S
 
S
A
 
F
R
 
P
H
|
H
L
 
R
A
 
Q
Q
 
N
I
 
V
D
 
L
D
 
R
H
 
Y
V
 
I
S
 
E
R
 
S
A
 
G
R
 
K
T
 
S
R
 
E
G
 
G
V
 
A
E
 
R
I
 
L
V
 
L
T
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
D
I
 
V
L
 
L
T
 
K
D
 
G
V
 
E
E
 
G
S
 
F
G
 
D
K
 
N
G
 
G
W
 
A
F
 
W
Y
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
D
 
T
D
 
D
L
 
C
A
 
T
A
 
D
N
 
D
D
 
M
D
 
T
A
 
I
V
 
V
L
 
R
Q
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
A
 
S
I
 
I
Q
 
L
V
 
S
F
 
Y
E
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
V
L
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
N
 
N
G
 
A
T
 
T
E
 
E
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
V
T
 
T
R
 
P
D
 
D
I
 
L
A
 
N
T
 
R
A
 
A
L
 
H
R
 
R
M
 
I
A
 
I
R
 
H
R
 
Q
V
 
L
D
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
I
V
 
C
T
 
W
V
 
I
N
 
N
D
 
S
Y
 
W
W
 
G
A
 
E
G
 
S
G
 
P
I
 
A
E
 
E
L
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
Y
R
 
K
K
 
H
S
 
S
G
 
G
F
 
I
G
 
G
R
 
R
E
 
E
K
 
N
G
 
G
L
 
V
E
 
M
G
 
T
L
 
L
D
 
Q
A
 
S
Y
 
Y
T
 
T
R
 
Q
S
 
V
K
 
K
A
 
S
V
 
I
T
 
Q
L
 
V
A
 
E
V
 
M

Query Sequence

>GFF3619 PGA1_262p00230 betaine aldehyde dehydrogenase BetB
MSVDGLIAAYFDTGALPDLPRDHFIDGRAVAPGAGGRMESFDPGRGTAFDDFAAGDAADV
DHAVTSAVAGFEIWSATPPARRCAILNEAARLMRHEAEHLAVVECVDSGKTLAEARGDIA
GSARLLEYYAGAADKLDGRSVNLGNDNAAFTLREPVGVTAHIVPWNYPSSTLVRGIAPAL
AAGCSAVVKPAETTPFTALMIADLLIRAGLPAGVVNVVTGTGIAAGAPLVRDPRVRHVTF
TGSVATGVGVMQSVAPNVTGLTLELGGKSPLVAFGDANVDAVVEGALWAIFSNAGQICSA
GSRLVIHRSLHAEVRDKLVARAQRLRVGHGLRGPDIGAVNSARHLAQIDDHVSRARTRGV
EIVTGGEILTDVESGKGWFYAPTILDDLAANDDAVLQEIFGPVLAIQVFEDEAEALALAN
GTEFALAAGIYTRDIATALRMARRVDAGQVTVNDYWAGGIELPFGGNRKSGFGREKGLEG
LDAYTRSKAVTLAV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory