SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3638 FitnessBrowser__Phaeo:GFF3638 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5f7qE Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to operator (see paper)
28% identity, 96% coverage: 13:398/404 of query aligns to 11:396/396 of 5f7qE

query
sites
5f7qE
L
 
I
R
x
K
E
 
D
S
 
I
S
x
N
R
 
R
L
 
Y
Q
 
T
V
 
V
F
 
L
D
 
N
T
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
E
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
A
 
T
R
 
R
I
x
T
D
 
E
I
 
I
A
 
A
Q
 
K
I
 
K
T
 
C
R
 
D
I
 
F
S
 
G
P
 
M
A
x
S
T
|
T
V
 
L
T
 
T
A
 
Y
I
 
I
T
 
L
A
 
D
E
 
D
L
 
L
L
 
Q
A
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
I
I
 
I
E
 
L
E
 
E
V
 
G
S
 
A
P
 
E
D
 
T
T
 
S
V
 
S
R
x
T
G
|
G
A
x
G
K
x
R
R
|
R
G
x
A
R
x
K
P
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
L
L
 
V
K
 
R
I
 
F
R
 
N
G
 
K
S
 
D
A
 
Y
H
 
G
H
 
F
I
 
V
A
 
V
G
 
S
L
 
V
K
 
K
L
 
V
S
 
E
H
 
E
H
 
E
A
 
Q
I
 
L
T
 
L
T
 
F
L
 
A
I
 
L
T
 
T
D
 
D
F
 
L
E
 
N
G
 
A
T
 
E
E
 
I
L
 
I
I
 
E
S
 
N
H
 
T
E
 
S
M
 
I
P
 
P
L
 
F
R
 
-
G
 
S
G
 
S
Q
 
E
M
 
K
S
 
K
P
 
P
E
 
E
S
 
E
L
 
A
C
 
I
E
 
E
K
 
L
I
 
I
V
 
A
E
 
K
A
 
N
L
 
V
D
 
K
Q
 
K
S
 
M
C
 
C
A
 
-
K
 
-
G
 
G
G
 
N
L
 
R
T
 
D
R
 
M
T
 
N
Q
 
H
I
 
L
S
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
A
M
 
I
A
 
S
G
 
G
V
 
L
M
 
V
D
 
N
A
 
R
E
 
K
R
 
K
N
 
G
F
 
T
I
 
V
Y
 
I
W
 
R
S
 
S
S
 
T
S
 
M
L
 
L
N
 
G
V
 
W
R
 
E
N
 
N
I
 
V
D
 
A
L
 
L
G
 
E
S
 
A
A
 
M
L
 
L
K
 
H
S
 
A
H
 
H
L
 
F
-
 
P
S
 
D
M
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
I
 
V
D
 
D
N
 
K
D
 
N
A
 
I
N
 
N
L
 
C
V
 
Y
A
 
T
K
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
L
L
 
W
F
 
L
G
 
G
E
 
E
G
 
G
D
 
K
T
 
Q
R
 
S
S
 
N
N
 
N
F
 
F
V
 
A
V
 
T
V
 
V
T
 
S
V
 
V
E
 
G
H
 
A
G
 
G
V
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
S
I
 
V
V
 
V
I
 
I
D
 
N
N
 
R
Q
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
R
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
G
 
G
C
 
G
G
 
A
A
 
G
E
 
E
F
 
F
G
 
G
H
|
H
I
 
T
K
 
T
V
 
I
Q
 
Q
L
 
P
E
 
G
G
 
G
A
 
Y
L
 
K
C
|
C
Q
 
H
C
|
C
G
 
G
Q
 
Q
R
 
K
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
A
 
M
Y
 
Y
V
 
A
G
 
S
D
 
E
Y
 
F
A
 
Y
L
 
F
-
 
R
-
 
N
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
E
L
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
A
N
 
Y
I
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
E
V
 
L
-
 
N
E
 
D
R
 
F
H
 
H
K
 
F
D
 
D
L
 
K
A
 
V
S
 
A
L
 
K
Y
 
S
A
 
A
A
 
R
V
 
A
A
 
-
E
 
-
G
 
G
D
 
D
M
 
E
M
 
M
A
 
A
Q
 
T
S
 
E
I
 
L
L
 
M
D
 
G
R
 
K
A
 
M
G
 
G
R
 
E
M
 
Y
F
 
L
A
 
G
M
 
Y
G
 
G
L
 
I
A
 
R
N
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
T
F
 
F
D
 
N
P
 
P
Q
 
E
M
 
K
I
 
V
V
 
I
L
 
I
A
 
V
G
 
G
A
 
E
Q
 
G
L
 
L
A
 
H
F
 
H
G
 
R
Y
 
D
L
 
L
S
 
F
S
 
L
D
 
T
K
 
K
V
 
I
V
 
D
E
 
E
E
 
I
M
 
A
R
 
S
R
 
Q
W
 
N
V
 
F
V
 
F
Q
 
S
V
 
G
D
 
A
G
 
G
P
 
F
L
 
E
P
 
T
E
 
E
V
 
I
R
 
T
V
 
T
H
 
T
G
 
S
W
 
L
G
 
E
N
 
D
Q
 
P
M
 
A
W
 
W
A
 
L
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
L
Y
 
L
A
 
V
I
 
I
E
 
H
E
 
Q
V
 
L
S
 
F
A
 
Q
L
 
V
T
 
P
I
 
I
R
 
Y
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1z05A Crystal structure of the rok family transcriptional regulator, homolog of e.Coli mlc protein.
28% identity, 90% coverage: 20:384/404 of query aligns to 10:378/396 of 1z05A

query
sites
1z05A
Q
 
R
V
 
V
F
 
Y
D
 
K
T
 
L
I
 
I
R
 
D
A
 
Q
A
 
K
G
 
G
Q
 
P
I
 
I
A
 
S
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
L
A
 
S
Q
 
K
I
 
E
T
 
S
R
 
E
I
 
L
S
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
S
V
 
I
T
 
T
A
 
K
I
 
I
T
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
I
A
 
D
A
 
A
G
 
H
L
 
L
I
 
I
E
 
H
E
 
E
V
 
T
S
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
T
V
 
V
R
 
Q
G
 
E
A
 
A
-
 
I
K
 
S
R
 
R
G
 
G
R
 
R
P
 
P
R
 
A
V
 
V
A
 
G
L
 
L
K
 
Q
I
 
T
R
 
N
G
 
N
S
 
L
A
 
G
H
 
W
H
 
Q
I
 
F
A
 
L
G
 
S
L
 
M
K
 
R
L
 
L
S
 
G
H
 
R
H
 
G
A
 
Y
I
 
L
T
 
T
T
 
I
L
 
A
I
 
L
T
 
H
D
 
E
F
 
L
E
 
G
G
 
G
T
 
E
E
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
D
H
 
T
E
 
K
M
 
I
P
 
D
L
 
I
R
 
H
G
 
-
G
 
-
Q
 
E
M
 
I
S
 
D
P
 
Q
E
 
D
S
 
D
L
 
V
C
 
L
E
 
A
K
 
R
I
 
L
V
 
L
E
 
F
A
 
E
L
 
I
D
 
E
Q
 
E
S
 
F
C
 
F
A
 
Q
K
 
T
G
 
Y
G
 
A
L
 
A
T
 
Q
R
 
L
T
 
D
Q
 
R
I
 
V
S
 
T
G
 
S
V
 
I
G
 
A
I
 
I
G
 
T
M
 
L
A
 
P
G
 
G
V
 
L
M
 
V
D
 
N
A
 
S
E
 
E
R
 
Q
N
 
G
F
 
I
I
 
V
Y
 
L
W
 
Q
S
 
M
S
 
P
S
 
H
L
 
Y
N
 
N
V
 
V
R
 
K
N
 
N
I
 
L
D
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
P
A
 
E
L
 
I
K
 
Y
S
 
K
H
 
A
L
 
T
S
 
G
M
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
F
I
 
V
D
 
A
N
 
N
D
 
D
A
 
T
N
 
R
L
 
A
V
 
W
A
 
A
K
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
K
L
 
L
F
 
F
G
 
G
E
 
H
G
 
S
D
 
Q
T
 
D
R
 
V
S
 
D
N
 
N
F
 
S
V
 
V
V
 
L
V
 
I
T
 
S
V
 
I
E
 
H
H
 
H
G
 
G
V
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
V
I
 
L
D
 
D
N
 
G
Q
 
R
I
 
V
Y
 
L
R
 
Q
G
 
G
A
 
R
R
 
H
G
 
G
C
 
N
G
 
I
A
 
G
E
 
E
F
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
I
K
 
Q
V
 
I
Q
 
D
L
 
P
E
 
Q
G
 
G
A
 
K
L
 
R
C
|
C
Q
 
H
C
|
C
G
 
G
Q
 
N
R
 
Y
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
A
 
T
Y
 
V
V
 
A
G
 
S
D
 
S
Y
 
Q
A
 
A
L
 
I
L
 
R
R
 
D
E
 
Q
-
 
V
-
 
T
A
 
A
N
 
R
I
 
I
T
 
Q
S
 
A
G
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
S
-
 
C
-
 
L
-
 
A
V
 
T
E
 
V
R
 
E
H
 
E
K
 
I
D
 
S
L
 
I
A
 
E
S
 
D
L
 
I
Y
 
C
A
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
A
E
 
D
G
 
G
D
 
D
M
 
P
M
 
L
A
 
A
Q
 
V
S
 
D
I
 
V
L
 
I
D
 
Q
R
 
Q
A
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
Y
F
 
L
A
 
G
M
 
A
G
 
A
L
 
I
A
 
A
N
 
I
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
 
L
F
 
F
D
 
N
P
 
P
Q
 
E
M
 
K
I
 
I
V
 
L
L
 
I
A
 
G
G
 
G
A
 
V
-
 
I
-
 
N
-
 
Q
Q
 
A
L
 
K
A
 
S
F
 
I
G
 
L
Y
 
Y
L
 
P
S
 
S
S
 
I
D
 
E
K
 
Q
V
 
C
V
 
I
E
 
R
E
 
E
M
 
Q
R
 
S
R
 
L
W
 
P
V
 
V
V
 
Y
Q
 
H
V
 
Q
D
 
D
G
 
L
P
 
K
L
 
L
P
 
V
E
 
E
V
 
S
R
 
R
V
 
F
H
 
Y
G
 
-
W
 
-
G
 
-
N
 
K
Q
 
Q
M
 
A
W
 
T
A
 
M
K
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
A

P50456 DNA-binding transcriptional repressor Mlc; Making large colonies protein; Membrane linked control from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
27% identity, 83% coverage: 1:336/404 of query aligns to 1:340/406 of P50456

query
sites
P50456
M
 
M
V
 
V
K
 
A
S
 
E
D
 
N
R
 
Q
L
 
P
S
 
G
H
 
H
S
 
I
G
 
D
E
 
Q
L
 
I
R
 
K
E
 
Q
S
 
T
S
 
N
R
 
A
L
 
G
Q
 
A
V
 
V
F
 
Y
D
 
R
T
 
L
I
 
I
R
 
D
A
 
Q
A
 
L
G
 
G
Q
 
P
I
 
V
A
 
S
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
L
A
 
S
Q
 
R
I
 
L
T
 
A
R
 
Q
I
 
L
S
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
S
V
 
I
T
 
T
A
 
K
I
 
I
T
 
V
A
x
R
E
 
E
L
 
M
L
 
L
A
 
E
A
 
A
G
 
H
L
 
L
I
 
V
E
 
Q
E
 
E
V
 
L
S
 
-
P
 
-
D
 
E
T
 
I
V
 
K
R
 
E
G
 
A
A
 
G
K
 
N
R
 
R
G
 
G
R
 
R
P
 
P
R
 
A
V
 
V
A
 
G
L
 
L
K
 
V
I
 
V
R
 
E
G
 
T
S
 
E
A
 
A
H
 
W
H
|
H
I
 
Y
A
 
L
G
 
S
L
 
L
K
 
R
L
 
I
S
 
S
H
 
R
H
 
G
A
 
E
I
 
I
T
 
F
T
 
L
L
 
A
I
 
L
T
 
R
D
 
D
F
 
L
E
 
S
G
 
S
T
 
K
E
 
L
L
 
V
I
 
V
-
 
E
-
 
E
S
 
S
H
 
Q
E
 
E
M
 
L
P
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
D
G
 
D
Q
 
L
M
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
P
L
 
L
C
 
L
E
 
D
K
 
R
I
 
I
V
 
I
E
 
S
A
 
H
L
 
I
D
 
D
Q
 
Q
S
 
F
C
x
F
A
 
I
K
 
R
G
 
H
G
 
Q
L
 
K
T
 
K
R
 
L
T
 
E
Q
 
R
I
 
L
S
 
T
G
 
S
V
 
I
G
 
A
I
 
I
G
 
T
M
 
L
A
 
P
G
 
G
V
 
I
M
 
I
D
 
D
A
 
T
E
 
E
R
 
N
N
 
G
F
 
I
I
 
V
Y
 
H
W
 
R
S
 
M
S
 
P
S
 
F
L
 
Y
-
 
E
N
 
D
V
 
V
R
 
K
N
 
E
I
 
M
D
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
E
S
 
Q
H
 
H
L
 
T
S
 
G
M
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
I
 
I
D
 
Q
N
 
H
D
 
D
A
 
I
N
 
S
L
 
A
V
 
W
A
 
T
K
 
M
A
 
A
E
 
E
H
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
G
E
 
A
G
 
S
D
 
R
T
 
G
R
 
A
S
 
R
N
 
D
F
 
V
V
 
I
V
 
Q
V
 
V
T
 
V
V
 
I
E
 
D
H
 
H
G
 
N
V
 
V
G
 
G
M
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
I
I
 
T
D
 
D
N
 
G
Q
 
H
I
 
L
Y
 
L
R
 
H
G
 
A
A
 
G
R
 
S
G
 
S
C
 
S
G
 
L
A
 
V
E
 
E
F
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
K
 
Q
V
 
V
Q
 
D
L
 
P
E
 
Y
G
 
G
A
 
K
L
 
R
C
|
C
Q
 
Y
C
|
C
G
 
G
Q
 
N
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
A
 
T
Y
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
D
-
 
S
V
 
I
G
 
L
D
 
E
Y
 
L
A
 
A
L
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
L
A
 
N
N
 
Q
I
 
S
T
 
M
S
 
S
G
 
S
V
 
M
E
 
L
R
 
H
H
 
G
K
 
Q
D
 
P
L
 
L
A
 
T
-
 
V
-
 
D
S
 
S
L
 
L
Y
 
C
A
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
L
E
x
R
G
 
G
D
 
D
M
 
L
M
x
L
A
 
A
Q
 
K
S
 
D
I
 
I
L
 
I
D
 
T
R
 
G
A
 
V
G
 
G
R
 
A
M
 
H
F
 
V
A
 
G
M
 
R
G
 
I
L
 
L
A
 
A
N
 
I
I
 
M
V
 
V
N
 
N
I
 
L
F
 
F
D
 
N
P
 
P
Q
 
Q
M
 
K
I
 
I
V
 
L
L
 
I

5f7rA Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to inducer (see paper)
28% identity, 75% coverage: 89:391/404 of query aligns to 3:305/306 of 5f7rA

query
sites
5f7rA
I
 
V
A
 
V
G
 
S
L
 
V
K
|
K
L
 
V
S
 
E
H
x
E
H
 
E
A
 
Q
I
 
L
T
 
L
T
 
F
L
 
A
I
 
L
T
 
T
D
 
D
F
 
L
E
 
N
G
 
A
T
 
E
E
 
I
L
 
I
I
 
E
S
 
N
H
 
T
E
 
S
M
 
I
P
 
P
L
 
F
R
 
S
G
 
S
G
 
-
Q
 
E
M
 
K
S
 
K
P
 
P
E
 
E
S
 
E
L
 
A
C
 
I
E
 
E
K
 
L
I
 
I
V
 
A
E
 
K
A
 
N
L
 
V
D
 
K
Q
 
K
S
 
M
C
 
C
A
 
-
K
 
-
G
 
G
G
 
N
L
 
R
T
 
D
R
 
M
T
 
N
Q
 
H
I
 
L
S
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
A
M
 
I
A
 
S
G
|
G
V
 
L
M
 
V
D
 
N
A
 
R
E
 
K
R
 
K
N
 
G
F
 
T
I
 
V
Y
 
I
W
 
R
S
 
S
S
 
T
S
 
M
L
 
L
N
 
G
V
 
W
R
 
E
N
 
N
I
 
V
D
 
A
L
 
L
G
 
E
S
 
A
A
 
M
L
 
L
K
 
H
S
 
A
H
 
H
L
 
F
-
 
P
S
 
D
M
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
I
 
V
D
 
D
N
 
K
D
x
N
A
 
I
N
 
N
L
 
C
V
 
Y
A
 
T
K
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
L
L
 
W
F
 
L
G
 
G
E
 
E
G
 
G
D
 
K
T
 
Q
R
 
S
S
 
N
N
 
N
F
 
F
V
 
A
V
 
T
V
 
V
T
x
S
V
|
V
E
 
G
H
 
A
G
|
G
V
x
L
G
|
G
M
 
L
G
 
S
I
 
V
V
 
V
I
 
I
D
 
N
N
 
R
Q
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
R
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
G
 
G
C
 
G
G
 
A
A
 
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
H
|
H
I
 
T
K
 
T
V
 
I
Q
 
Q
L
 
P
E
 
G
G
 
G
A
 
Y
L
 
K
C
|
C
Q
 
H
C
|
C
G
 
G
Q
 
Q
R
 
K
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
|
E
A
 
M
Y
 
Y
V
 
A
G
 
S
D
 
E
Y
 
F
A
 
Y
L
 
F
-
 
R
-
 
N
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
E
L
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
A
N
 
Y
I
 
P
T
 
L
S
 
N
G
 
D
V
 
F
E
 
H
R
 
F
H
 
D
K
 
K
D
 
V
L
 
A
A
 
K
S
 
S
L
 
A
Y
 
R
A
 
A
A
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
G
D
 
D
M
 
E
M
 
M
A
 
A
Q
 
T
S
 
E
I
 
L
L
 
M
D
 
G
R
 
K
A
 
M
G
 
G
R
 
E
M
 
Y
F
 
L
A
 
G
M
 
Y
G
 
G
L
 
I
A
 
R
N
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
T
F
 
F
D
 
N
P
 
P
Q
 
E
M
 
K
I
 
V
V
 
I
L
 
I
A
 
V
G
 
G
A
x
E
Q
 
G
L
 
L
A
 
H
F
 
H
G
 
R
Y
 
D
L
 
L
S
 
F
S
 
L
D
 
T
K
 
K
V
 
I
V
 
D
E
 
E
E
 
I
M
 
A
R
 
S
R
 
Q
W
 
N
V
 
F
V
 
F
Q
 
S
V
 
G
D
 
A
G
 
G
P
 
F
L
 
E
P
 
T
E
 
E
V
 
I
R
 
T
V
 
T
H
 
T
G
 
S
W
 
L
G
 
E
N
 
D
Q
 
P
M
 
A
W
|
W
A
 
L
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
L
Y
 
L
A
 
V
I
 
I
E
 
H
E
 
Q
V
 
L

1z6rA Crystal structure of mlc from escherichia coli (see paper)
26% identity, 80% coverage: 12:336/404 of query aligns to 1:316/382 of 1z6rA

query
sites
1z6rA
E
 
Q
L
 
I
R
 
K
E
 
Q
S
 
T
S
 
N
R
 
A
L
 
G
Q
 
A
V
 
V
F
 
Y
D
 
R
T
 
L
I
 
I
R
 
D
A
 
Q
A
 
L
G
 
G
Q
 
P
I
 
V
A
 
S
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
L
A
 
S
Q
 
R
I
 
L
T
 
A
R
 
Q
I
 
L
S
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
S
V
 
I
T
 
T
A
 
K
I
 
I
T
 
V
A
 
H
E
 
E
L
 
M
L
 
L
A
 
E
A
 
A
G
 
H
L
 
L
I
 
V
E
 
Q
E
 
E
V
 
L
S
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
G
L
 
L
K
 
V
I
 
V
R
 
E
G
 
T
S
 
E
A
 
A
H
 
W
H
 
H
I
 
Y
A
 
L
G
 
S
L
 
L
K
 
R
L
 
I
S
 
S
H
 
R
H
 
G
A
 
E
I
 
I
T
 
F
T
 
L
L
 
A
I
 
L
T
 
R
D
 
D
F
 
L
E
 
S
G
 
S
T
 
K
E
 
L
L
 
V
I
 
V
-
 
E
-
 
E
S
 
S
H
 
Q
E
 
E
M
 
L
P
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
D
G
 
D
Q
 
L
M
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
P
L
 
L
C
 
L
E
 
D
K
 
R
I
 
I
V
 
I
E
 
S
A
 
H
L
 
I
D
 
D
Q
 
Q
S
 
F
C
 
F
A
 
I
K
 
R
G
 
H
G
 
Q
L
 
K
T
 
K
R
 
L
T
 
E
Q
 
R
I
 
L
S
 
T
G
 
S
V
 
I
G
 
A
I
 
I
G
 
T
M
 
L
A
 
P
G
 
G
V
 
I
M
 
I
D
 
D
A
 
T
E
 
E
R
 
N
N
 
G
F
 
I
I
 
V
Y
 
H
W
 
R
S
 
M
S
 
P
S
 
F
L
 
Y
-
 
E
N
 
D
V
 
V
R
 
K
N
 
E
I
 
M
D
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
E
S
 
Q
H
 
H
L
 
T
S
 
G
M
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
I
 
I
D
 
Q
N
 
H
D
 
D
A
 
I
N
 
S
L
 
A
V
 
W
A
 
T
K
 
M
A
 
A
E
 
E
H
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
G
E
 
A
G
 
S
D
 
R
T
 
G
R
 
A
S
 
R
N
 
D
F
 
V
V
 
I
V
 
Q
V
 
V
T
 
V
V
 
I
E
 
D
H
 
H
G
 
N
V
 
V
G
 
G
M
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
I
I
 
T
D
 
D
N
 
G
Q
 
H
I
 
L
Y
 
L
R
 
H
G
 
A
A
 
G
R
 
S
G
 
S
C
 
S
G
 
L
A
 
V
E
 
E
F
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
K
 
Q
V
 
V
Q
 
D
L
 
P
E
 
Y
G
 
G
A
 
K
L
 
R
C
|
C
Q
 
Y
C
|
C
G
 
G
Q
 
N
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
A
 
T
Y
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
D
-
 
S
V
 
I
G
 
L
D
 
E
Y
 
L
A
 
A
L
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
L
A
 
N
N
 
Q
I
 
S
T
 
M
S
 
S
G
 
S
V
 
M
E
 
L
R
 
H
H
 
G
K
 
Q
D
 
P
L
 
L
A
 
T
-
 
V
-
 
D
S
 
S
L
 
L
Y
 
C
A
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
L
E
 
R
G
 
G
D
 
D
M
 
L
M
 
L
A
 
A
Q
 
K
S
 
D
I
 
I
L
 
I
D
 
T
R
 
G
A
 
V
G
 
G
R
 
A
M
 
H
F
 
V
A
 
G
M
 
R
G
 
I
L
 
L
A
 
A
N
 
I
I
 
M
V
 
V
N
 
N
I
 
L
F
 
F
D
 
N
P
 
P
Q
 
Q
M
 
K
I
 
I
V
 
L
L
 
I

O35826 Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase; UDP-GlcNAc-2-epimerase/ManAc kinase; EC 3.2.1.183; EC 2.7.1.60 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
32% identity, 62% coverage: 98:346/404 of query aligns to 406:676/722 of O35826

query
sites
O35826
A
x
T
I
x
L
T
x
S
T
x
A
L
|
L
I
x
A
T
x
V
D
|
D
F
x
L
E
x
G
G
|
G
T
|
T
E
x
N
L
|
L
-
x
R
-
x
V
-
x
A
-
x
I
-
x
V
-
x
S
I
x
M
S
x
K
H
x
G
E
|
E
M
x
I
P
x
V
L
x
K
R
x
K
G
x
Y
G
x
T
Q
|
Q
M
x
F
S
x
N
P
|
P
E
x
K
S
x
T
L
x
Y
C
x
E
E
|
E
K
x
R
I
|
I
-
x
S
-
x
L
-
x
I
V
x
L
E
x
Q
A
x
M
L
x
C
D
x
V
Q
x
E
S
x
A
C
x
A
A
|
A
K
x
E
G
x
A
G
x
V
L
x
K
T
x
L
R
x
N
T
x
C
Q
x
R
I
|
I
S
x
L
G
|
G
V
|
V
G
|
G
I
|
I
G
x
S
M
x
T
A
x
G
G
|
G
V
x
R
M
x
V
D
x
N
A
x
P
E
x
Q
R
x
E
N
x
G
F
x
V
I
x
V
Y
x
L
W
x
H
S
|
S
S
x
T
S
x
K
L
|
L
-
x
I
-
x
Q
N
x
E
V
x
W
R
x
N
N
x
S
I
x
V
D
|
D
L
|
L
G
x
R
S
x
T
A
x
P
L
|
L
K
x
S
S
x
D
H
x
T
L
|
L
S
x
H
M
x
L
P
|
P
V
|
V
F
x
W
I
x
V
D
|
D
N
|
N
D
|
D
A
x
G
N
|
N
L
x
C
V
x
A
A
|
A
K
x
M
A
|
A
E
|
E
H
x
R
L
x
K
F
|
F
G
|
G
E
x
Q
G
|
G
D
x
K
T
x
G
R
x
Q
S
x
E
N
|
N
F
|
F
V
|
V
V
x
T
V
x
L
T
x
I
V
x
T
E
x
G
H
x
T
G
|
G
V
x
I
G
|
G
M
x
G
G
|
G
I
|
I
V
x
I
I
x
H
D
x
Q
N
x
H
Q
x
E
I
x
L
Y
x
I
R
x
H
G
|
G
A
x
S
R
x
S
G
x
F
C
|
C
G
x
A
A
|
A
E
|
E
F
x
L
G
|
G
H
|
H
I
x
L
K
x
V
V
|
V
Q
x
S
L
|
L
E
x
D
G
|
G
A
x
P
L
x
D
C
|
C
Q
x
S
C
|
C
G
|
G
Q
x
S
R
x
H
G
|
G
C
|
C
L
x
I
E
|
E
A
|
A
Y
|
Y
V
x
A
G
x
S
D
x
G
Y
x
M
A
|
A
L
|
L
L
x
Q
R
|
R
E
|
E
A
|
A
N
x
K
-
x
K
-
x
L
-
x
H
-
x
D
-
x
E
-
x
D
-
x
L
-
x
L
I
x
L
T
x
V
S
x
E
G
|
G
V
x
M
E
x
S
R
x
V
H
x
P
K
|
K
D
|
D
L
x
E
A
|
A
-
x
V
-
x
G
-
x
A
-
x
L
S
x
H
L
|
L
Y
x
I
A
x
Q
A
|
A
V
x
A
A
x
K
E
x
L
G
|
G
D
x
N
M
x
V
M
x
K
A
|
A
Q
|
Q
S
|
S
I
|
I
L
|
L
D
x
R
R
x
T
A
|
A
G
|
G
R
x
T
M
x
A
F
x
L
A
x
G
M
x
L
G
|
G
L
x
V
A
x
V
N
|
N
I
|
I
V
x
L
N
x
H
I
x
T
F
x
M
D
x
N
P
|
P
Q
x
S
M
x
L
I
x
V
V
x
I
L
|
L
A
x
S
G
|
G
A
x
V
Q
 
-
L
|
L
A
|
A
F
x
S
G
x
H
Y
|
Y
L
x
I

Sites not aligning to the query:

Q9Y223 Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase; UDP-GlcNAc-2-epimerase/ManAc kinase; EC 3.2.1.183; EC 2.7.1.60 from Homo sapiens (Human) (see 18 papers)
32% identity, 62% coverage: 98:346/404 of query aligns to 406:676/722 of Q9Y223

query
sites
Q9Y223
A
 
T
I
 
L
T
 
S
T
 
A
L
 
L
I
 
A
T
 
V
D
|
D
F
 
L
E
 
G
G
|
G
T
|
T
E
x
N
L
 
L
-
x
R
-
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
S
I
 
M
S
 
K
H
 
G
E
 
E
M
 
I
P
 
V
L
 
K
R
 
K
G
 
Y
G
 
T
Q
 
Q
M
 
F
S
 
N
P
 
P
E
 
K
S
 
T
L
 
Y
C
 
E
E
 
E
K
 
R
I
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
I
V
 
L
E
 
Q
A
 
M
L
 
C
D
 
V
Q
 
E
S
 
A
C
 
A
A
 
A
K
 
E
G
 
A
G
 
V
L
 
K
T
 
L
R
 
N
T
 
C
Q
 
R
I
 
I
S
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
|
I
G
 
S
M
 
T
A
 
G
G
|
G
V
x
R
M
 
V
D
 
N
A
 
P
E
 
R
R
 
E
N
 
G
F
 
I
I
 
V
Y
 
L
W
 
H
S
 
S
S
x
T
S
 
K
L
 
L
-
 
I
-
 
Q
N
 
E
V
 
W
R
 
N
N
 
S
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
R
S
 
T
A
 
P
L
 
L
K
 
S
S
 
D
H
 
T
L
 
L
S
 
H
M
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
W
I
 
V
D
 
D
N
|
N
D
|
D
A
 
G
N
|
N
L
 
C
V
 
A
A
 
A
K
 
L
A
|
A
E
 
E
H
 
R
L
 
K
F
|
F
G
 
G
E
 
Q
G
 
G
D
 
K
T
 
G
R
 
L
S
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
V
 
T
V
 
L
T
 
I
V
 
T
E
 
G
H
 
T
G
|
G
V
 
I
G
 
G
M
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
H
D
 
Q
N
 
H
Q
 
E
I
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
R
 
S
G
 
F
C
 
C
G
 
A
A
 
A
E
|
E
F
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
L
K
 
V
V
|
V
Q
 
S
L
 
L
E
 
D
G
|
G
A
 
P
L
 
D
C
|
C
Q
 
S
C
|
C
G
 
G
Q
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
x
I
E
|
E
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
G
 
S
D
 
G
Y
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
N
 
K
-
 
K
-
 
L
-
 
H
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
I
 
L
T
 
V
S
 
E
G
 
G
V
 
M
E
 
S
R
 
V
H
 
P
K
 
K
D
 
D
L
 
E
A
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
L
S
 
H
L
 
L
Y
 
I
A
 
Q
A
|
A
V
x
A
A
 
K
E
 
L
G
 
G
D
 
N
M
 
A
M
 
K
A
 
A
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
L
 
L
D
 
R
R
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
T
M
 
A
F
 
L
A
 
G
M
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
V
N
 
N
I
 
I
V
 
L
N
 
H
I
 
T
F
 
M
D
 
N
P
 
P
Q
 
S
M
 
L
I
 
V
V
 
I
L
 
L
A
 
S
G
 
G
A
 
V
Q
 
-
L
 
L
A
 
A
F
 
S
G
 
H
Y
 
Y
L
 
I

Sites not aligning to the query:

2yhwA High-resolution crystal structures of n-acetylmannosamine kinase: insights about substrate specificity, activity and inhibitor modelling. (see paper)
31% identity, 61% coverage: 99:346/404 of query aligns to 3:268/309 of 2yhwA

query
sites
2yhwA
I
 
L
T
 
S
T
 
A
L
 
L
I
 
A
T
 
V
D
 
D
F
 
L
E
 
G
G
 
G
T
 
T
E
 
N
L
 
L
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
S
I
 
M
S
 
K
H
 
G
E
 
E
M
 
I
P
 
V
L
 
K
R
 
K
G
 
Y
G
 
T
Q
 
Q
M
 
F
S
 
N
P
 
P
E
 
K
S
 
T
L
 
Y
C
 
E
E
 
E
K
 
R
I
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
I
V
 
L
E
 
Q
A
 
M
L
 
C
D
 
V
Q
 
E
S
 
A
C
 
A
A
 
A
K
 
E
G
 
A
G
 
V
L
 
K
T
 
L
R
 
N
T
 
C
Q
 
R
I
 
I
S
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
S
M
 
T
A
 
G
G
 
G
V
 
R
M
 
V
D
 
N
A
 
P
E
 
R
R
 
E
N
 
G
F
 
I
I
 
V
Y
 
L
W
 
H
S
 
S
S
 
T
S
 
K
L
 
L
-
 
I
-
 
Q
N
 
E
V
 
W
R
 
N
N
 
S
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
R
S
 
T
A
 
P
L
 
L
K
 
S
S
 
D
H
 
T
L
 
L
S
 
H
M
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
W
I
 
V
D
 
D
N
|
N
D
 
D
A
 
G
N
|
N
L
 
C
V
 
A
A
 
A
K
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
R
L
 
K
F
 
F
G
 
G
E
 
Q
G
 
G
D
 
K
T
 
G
R
 
L
S
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
V
 
T
V
 
L
T
 
I
V
 
T
E
 
G
H
 
T
G
 
G
V
 
I
G
 
G
M
x
G
G
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
H
D
 
Q
N
 
H
Q
 
E
I
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
R
 
S
G
 
F
C
 
C
G
 
A
A
|
A
E
 
E
F
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
L
K
 
V
V
 
V
Q
 
S
L
 
L
E
 
N
G
 
G
A
 
P
L
 
D
C
|
C
Q
 
S
C
|
C
G
 
G
Q
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
G
 
S
D
 
G
Y
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
N
 
K
-
 
K
-
 
L
-
 
H
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
I
 
L
T
 
V
S
 
E
G
 
G
V
 
M
E
 
S
R
 
V
H
 
A
K
 
V
D
 
G
L
 
A
A
 
L
S
 
H
L
 
L
Y
 
I
A
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
K
E
 
L
G
 
G
D
 
N
M
 
A
M
 
K
A
 
A
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
L
 
L
D
 
R
R
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
T
M
 
A
F
 
L
A
 
G
M
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
V
N
 
N
I
 
I
V
 
L
N
 
H
I
 
T
F
 
M
D
 
N
P
 
P
Q
 
S
M
 
L
I
 
V
V
 
I
L
 
L
A
 
S
G
 
G
A
 
V
Q
 
-
L
 
L
A
 
A
F
 
S
G
 
H
Y
 
Y
L
 
I

2yi1A Crystal structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetyl mannosamine 6-phosphate and adp. (see paper)
32% identity, 61% coverage: 99:346/404 of query aligns to 3:267/308 of 2yi1A

query
sites
2yi1A
I
 
L
T
 
S
T
 
A
L
 
L
I
 
A
T
 
V
D
 
D
F
 
L
E
x
G
G
|
G
T
|
T
E
x
N
L
 
L
-
x
R
-
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
S
I
 
M
S
 
K
H
 
G
E
 
E
M
 
I
P
 
V
L
 
K
R
 
K
G
 
Y
G
 
T
Q
 
Q
M
 
F
S
 
N
P
 
P
E
 
K
S
 
T
L
 
Y
C
 
E
E
 
E
K
 
R
I
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
I
V
 
L
E
 
Q
A
 
M
L
 
C
D
 
V
Q
 
E
S
 
A
C
 
A
A
 
A
K
 
E
G
 
A
G
 
V
L
 
K
T
 
L
R
 
N
T
 
C
Q
 
R
I
 
I
S
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
S
M
 
T
A
x
G
G
|
G
V
x
R
M
 
V
D
 
N
A
 
P
E
 
R
R
 
E
N
 
G
F
 
I
I
 
V
Y
 
L
W
 
H
S
|
S
S
x
T
S
 
K
L
|
L
-
 
I
-
 
Q
N
 
E
V
 
W
R
 
N
N
 
S
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
R
S
 
T
A
 
P
L
 
L
K
 
S
S
 
D
H
 
T
L
 
L
S
 
H
M
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
W
I
 
V
D
 
D
N
|
N
D
|
D
A
 
G
N
|
N
L
 
C
V
 
A
A
 
A
K
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
R
L
 
K
F
 
F
G
 
G
E
 
Q
G
 
G
D
 
K
T
 
G
R
 
L
S
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
V
 
T
V
 
L
T
 
I
V
 
T
E
x
G
H
x
T
G
|
G
V
x
I
G
 
G
M
x
G
G
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
H
D
 
Q
N
 
H
Q
 
E
I
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
R
 
S
G
 
F
C
 
C
G
 
A
A
|
A
E
|
E
F
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
L
K
 
V
V
 
V
Q
 
S
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
P
L
 
D
C
|
C
Q
 
S
C
|
C
G
 
G
Q
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
|
E
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
G
 
S
D
x
G
Y
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
N
 
K
I
 
K
T
 
L
S
 
H
G
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
G
H
 
M
K
 
S
D
 
A
L
 
V
A
 
G
S
 
A
L
|
L
Y
 
H
-
 
L
-
 
I
A
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
K
E
 
L
G
 
G
D
 
N
M
 
A
M
 
K
A
 
A
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
L
 
L
D
 
R
R
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
T
M
 
A
F
 
L
A
 
G
M
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
V
N
 
N
I
 
I
V
 
L
N
 
H
I
 
T
F
 
M
D
 
N
P
 
P
Q
 
S
M
 
L
I
 
V
V
 
I
L
 
L
A
 
S
G
 
G
A
x
V
Q
 
-
L
 
L
A
 
A
F
 
S
G
 
H
Y
 
Y
L
 
I

2yhyA Structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetylmannosamine and adp (see paper)
32% identity, 61% coverage: 99:346/404 of query aligns to 3:267/308 of 2yhyA

query
sites
2yhyA
I
 
L
T
 
S
T
 
A
L
 
L
I
 
A
T
 
V
D
 
D
F
 
L
E
x
G
G
|
G
T
|
T
E
x
N
L
 
L
-
x
R
-
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
S
I
 
M
S
 
K
H
 
G
E
 
E
M
 
I
P
 
V
L
 
K
R
 
K
G
 
Y
G
 
T
Q
 
Q
M
 
F
S
 
N
P
 
P
E
 
K
S
 
T
L
 
Y
C
 
E
E
 
E
K
 
R
I
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
I
V
 
L
E
 
Q
A
 
M
L
 
C
D
 
V
Q
 
E
S
 
A
C
 
A
A
 
A
K
 
E
G
 
A
G
 
V
L
 
K
T
 
L
R
 
N
T
 
C
Q
 
R
I
 
I
S
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
S
M
 
T
A
 
G
G
 
G
V
 
R
M
 
V
D
 
N
A
 
P
E
 
R
R
 
E
N
 
G
F
 
I
I
 
V
Y
 
L
W
 
H
S
 
S
S
 
T
S
 
K
L
 
L
-
 
I
-
 
Q
N
 
E
V
 
W
R
 
N
N
 
S
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
R
S
 
T
A
 
P
L
 
L
K
 
S
S
 
D
H
 
T
L
 
L
S
 
H
M
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
W
I
 
V
D
 
D
N
|
N
D
 
D
A
 
G
N
|
N
L
 
C
V
 
A
A
 
A
K
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
R
L
 
K
F
 
F
G
 
G
E
 
Q
G
 
G
D
 
K
T
 
G
R
 
L
S
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
V
 
T
V
 
L
T
 
I
V
 
T
E
 
G
H
x
T
G
 
G
V
 
I
G
 
G
M
x
G
G
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
H
D
 
Q
N
 
H
Q
 
E
I
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
R
 
S
G
 
F
C
 
C
G
 
A
A
|
A
E
 
E
F
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
L
K
 
V
V
 
V
Q
 
S
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
P
L
 
D
C
|
C
Q
 
S
C
|
C
G
 
G
Q
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
G
 
S
D
x
G
Y
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
N
 
K
I
 
K
T
 
L
S
 
H
G
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
G
H
 
M
K
 
S
D
 
A
L
 
V
A
 
G
S
 
A
L
|
L
Y
 
H
-
 
L
-
 
I
A
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
K
E
 
L
G
 
G
D
 
N
M
 
A
M
 
K
A
 
A
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
L
 
L
D
 
R
R
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
T
M
 
A
F
 
L
A
 
G
M
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
V
N
 
N
I
 
I
V
 
L
N
 
H
I
 
T
F
 
M
D
 
N
P
 
P
Q
 
S
M
 
L
I
 
V
V
 
I
L
 
L
A
 
S
G
 
G
A
x
V
Q
 
-
L
 
L
A
 
A
F
 
S
G
 
H
Y
 
Y
L
 
I

3vglA Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus in complex with glucose and amppnp (see paper)
30% identity, 67% coverage: 91:360/404 of query aligns to 5:281/312 of 3vglA

query
sites
3vglA
G
 
G
L
 
V
K
 
D
L
 
I
S
x
G
H
 
G
H
x
T
A
x
K
I
 
I
T
 
A
T
 
A
L
 
G
I
 
V
T
 
V
D
 
D
F
 
E
E
 
E
G
 
G
T
 
R
E
 
I
L
 
L
I
 
S
S
 
T
H
 
F
E
 
K
M
 
V
P
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
M
 
A
S
 
T
P
 
P
E
 
P
S
 
T
L
 
-
C
 
A
E
 
E
K
 
G
I
 
I
V
 
V
E
 
D
A
 
A
L
 
I
D
 
C
Q
 
A
S
 
A
C
 
V
A
 
A
K
 
-
G
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
E
R
 
G
T
 
H
Q
 
D
I
 
V
S
 
E
G
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
M
 
A
A
 
A
G
|
G
V
 
Y
M
 
V
D
 
D
A
 
D
E
 
K
R
 
R
N
 
A
F
 
T
I
 
V
Y
 
L
W
 
F
S
 
A
S
x
P
S
 
N
L
 
I
N
 
D
V
 
W
R
 
R
N
 
H
I
 
E
D
 
P
L
 
L
G
 
K
S
 
D
A
 
K
L
 
V
K
 
E
S
 
Q
H
 
R
L
 
V
S
 
G
M
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
V
I
 
V
D
 
E
N
|
N
D
|
D
A
 
A
N
 
N
L
 
A
V
 
A
A
 
A
K
 
W
A
 
G
E
 
E
H
 
Y
L
 
R
F
 
F
G
 
G
E
 
A
G
 
G
D
 
Q
T
 
G
R
 
H
S
 
D
N
 
D
F
 
V
V
 
I
V
 
C
V
 
I
T
 
T
V
 
L
E
x
G
H
x
T
G
 
G
V
x
L
G
|
G
M
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
I
D
 
G
N
 
N
Q
 
K
I
 
L
Y
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
R
R
 
F
G
 
G
C
 
V
G
 
A
A
 
A
E
|
E
F
 
F
G
 
G
H
|
H
I
 
I
K
 
R
V
 
V
Q
 
V
L
 
P
E
 
D
G
 
G
A
 
L
L
 
L
C
|
C
Q
 
G
C
|
C
G
 
G
Q
 
S
R
 
Q
G
 
G
C
|
C
L
 
W
E
|
E
A
 
Q
Y
 
Y
V
 
A
G
 
S
D
x
G
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
R
 
R
-
 
Y
-
 
A
-
 
K
-
 
Q
E
 
R
A
 
A
N
 
N
I
 
A
T
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
V
S
 
D
G
 
G
V
 
I
E
 
E
-
x
G
R
 
K
H
 
H
K
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
I
Y
x
S
A
 
E
A
 
A
V
 
A
A
 
R
E
 
Q
G
 
G
D
 
D
M
 
P
M
 
V
A
 
A
Q
 
V
S
 
D
I
 
S
L
 
F
D
 
R
R
 
E
A
 
L
G
 
A
R
 
R
M
 
W
F
 
A
A
 
G
M
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
D
I
 
L
V
 
A
N
 
S
I
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
P
Q
 
S
M
 
A
I
 
F
V
 
I
L
 
V
A
 
G
G
 
G
A
x
G
Q
x
V
L
 
S
A
 
D
F
x
E
G
 
G
Y
 
E
L
 
L
S
 
V
S
 
L
D
 
D
K
 
P
V
 
I
V
 
R
E
 
K
E
 
S
M
 
F
R
 
R
R
 
R
W
 
W
V
 
L
V
 
I

3vgkB Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus (see paper)
30% identity, 67% coverage: 91:360/404 of query aligns to 5:281/312 of 3vgkB

query
sites
3vgkB
G
 
G
L
 
V
K
 
D
L
 
I
S
 
G
H
 
G
H
 
T
A
 
K
I
 
I
T
 
A
T
 
A
L
 
G
I
 
V
T
 
V
D
 
D
F
 
E
E
 
E
G
 
G
T
 
R
E
 
I
L
 
L
I
 
S
S
 
T
H
 
F
E
 
K
M
 
V
P
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
M
 
A
S
 
T
P
 
P
E
 
P
S
 
T
L
 
-
C
 
A
E
 
E
K
 
G
I
 
I
V
 
V
E
 
D
A
 
A
L
 
I
D
 
C
Q
 
A
S
 
A
C
 
V
A
 
A
K
 
-
G
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
E
R
 
G
T
 
H
Q
 
D
I
 
V
S
 
E
G
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
M
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
Y
M
 
V
D
 
D
A
 
D
E
 
K
R
 
R
N
 
A
F
 
T
I
 
V
Y
 
L
W
 
F
S
 
A
S
 
P
S
 
N
L
 
I
N
 
D
V
 
W
R
 
R
N
 
H
I
 
E
D
 
P
L
 
L
G
 
K
S
 
D
A
 
K
L
 
V
K
 
E
S
 
Q
H
 
R
L
 
V
S
 
G
M
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
V
I
 
V
D
 
E
N
 
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
L
 
A
V
 
A
A
 
A
K
 
W
A
 
G
E
 
E
H
 
Y
L
 
R
F
 
F
G
 
G
E
 
A
G
 
G
D
 
Q
T
 
G
R
 
H
S
 
D
N
 
D
F
 
V
V
 
I
V
 
C
V
 
I
T
 
T
V
 
L
E
 
G
H
 
T
G
 
G
V
 
L
G
 
G
M
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
I
D
 
G
N
 
N
Q
 
K
I
 
L
Y
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
R
R
 
F
G
 
G
C
 
V
G
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
G
 
G
H
|
H
I
 
I
K
 
R
V
 
V
Q
 
V
L
 
P
E
 
D
G
 
G
A
 
L
L
 
L
C
|
C
Q
 
G
C
|
C
G
 
G
Q
 
S
R
 
Q
G
 
G
C
|
C
L
 
W
E
 
E
A
 
Q
Y
 
Y
V
 
A
G
 
S
D
 
G
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
R
 
R
-
 
Y
-
 
A
-
 
K
-
 
Q
E
 
R
A
 
A
N
 
N
I
 
A
T
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
V
S
 
D
G
 
G
V
 
I
E
 
E
-
 
G
R
 
K
H
 
H
K
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
I
Y
 
S
A
 
E
A
 
A
V
 
A
A
 
R
E
 
Q
G
 
G
D
 
D
M
 
P
M
 
V
A
 
A
Q
 
V
S
 
D
I
 
S
L
 
F
D
 
R
R
 
E
A
 
L
G
 
A
R
 
R
M
 
W
F
 
A
A
 
G
M
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
D
I
 
L
V
 
A
N
 
S
I
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
P
Q
 
S
M
 
A
I
 
F
V
 
I
L
 
V
A
 
G
G
 
G
A
 
G
Q
 
V
L
 
S
A
 
D
F
 
E
G
 
G
Y
 
E
L
 
L
S
 
V
S
 
L
D
 
D
K
 
P
V
 
I
V
 
R
E
 
K
E
 
S
M
 
F
R
 
R
R
 
R
W
 
W
V
 
L
V
 
I

3eo3A Crystal structure of the n-acetylmannosamine kinase domain of human gne protein (see paper)
38% identity, 41% coverage: 180:346/404 of query aligns to 70:247/288 of 3eo3A

query
sites
3eo3A
D
 
D
L
 
L
G
 
R
S
 
T
A
 
P
L
 
L
K
 
S
S
 
D
H
 
T
L
 
L
S
 
H
M
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
W
I
 
V
D
 
D
N
 
N
D
 
D
A
 
G
N
 
N
L
 
C
V
 
A
A
 
A
K
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
R
L
 
K
F
 
F
G
 
G
E
 
Q
G
 
G
D
 
K
T
 
G
R
 
L
S
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
V
 
T
V
 
L
T
 
I
V
 
T
E
 
G
H
 
T
G
 
G
V
 
I
G
 
G
M
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
H
D
 
Q
N
 
H
Q
 
E
I
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
R
 
S
G
 
F
C
 
C
G
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
L
K
 
V
V
 
V
Q
 
S
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
P
L
 
D
C
|
C
Q
 
S
C
|
C
G
 
G
Q
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
G
 
S
D
 
G
Y
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
N
 
K
-
 
K
-
 
L
-
 
H
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
I
 
L
T
 
V
S
 
E
G
 
G
V
 
M
E
 
S
R
 
V
H
 
P
K
 
K
D
 
D
L
 
E
A
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
L
S
 
H
L
 
L
Y
 
I
A
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
K
E
 
L
G
 
G
D
 
N
M
 
A
M
 
K
A
 
A
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
L
 
L
D
 
R
R
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
T
M
 
A
F
 
L
A
 
G
M
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
V
N
 
N
I
 
I
V
 
L
N
 
H
I
 
T
F
 
M
D
 
N
P
 
P
Q
 
S
M
 
L
I
 
V
V
 
I
L
 
L
A
 
S
G
 
G
A
 
V
Q
 
-
L
 
L
A
 
A
F
 
S
G
 
H
Y
 
Y
L
 
I

2qm1B Crystal structure of glucokinase from enterococcus faecalis
25% identity, 64% coverage: 132:389/404 of query aligns to 50:321/325 of 2qm1B

query
sites
2qm1B
I
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
S
L
 
I
D
 
R
Q
 
H
S
 
R
C
 
I
A
 
D
K
 
L
G
 
Y
G
 
N
L
 
M
T
 
K
R
 
K
T
 
E
Q
 
D
I
 
F
S
 
V
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
M
G
 
G
M
 
T
A
 
P
G
 
G
V
 
S
M
 
V
D
 
D
A
 
I
E
 
E
R
 
K
N
 
G
F
 
T
I
 
V
Y
 
V
W
 
G
S
 
A
S
 
Y
S
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
W
R
 
T
N
 
T
I
 
V
D
 
Q
-
 
P
L
 
V
G
 
K
S
 
E
A
 
Q
L
 
I
K
 
E
S
 
S
H
 
A
L
 
L
S
 
G
M
 
I
P
 
P
V
 
F
F
 
A
I
 
L
D
 
D
N
|
N
D
 
D
A
 
A
N
|
N
L
 
V
V
 
A
A
 
A
K
 
L
A
 
G
E
 
E
H
 
R
L
 
W
F
 
K
G
 
G
E
 
A
G
 
G
D
 
E
T
 
N
R
 
N
S
 
P
N
 
D
F
 
V
V
 
I
V
 
F
V
 
I
T
 
T
V
 
L
E
 
G
H
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
x
G
G
 
G
I
 
I
V
 
V
I
 
A
D
 
A
N
 
G
Q
 
K
I
 
L
Y
 
L
R
 
H
G
 
G
A
 
V
R
 
A
G
 
G
C
 
C
G
 
A
A
 
G
E
 
E
F
 
V
G
 
G
H
|
H
I
 
V
K
 
T
V
 
V
Q
 
D
L
 
P
E
 
N
G
 
G
A
 
F
L
 
D
C
|
C
Q
 
T
C
|
C
G
 
G
Q
 
K
R
 
R
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
A
 
T
Y
 
V
V
 
S
G
 
S
D
 
A
Y
 
T
A
 
G
L
 
V
L
 
V
R
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
H
-
 
L
-
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
F
-
 
A
-
 
G
E
 
D
A
 
S
N
 
E
I
 
L
T
 
K
S
 
Q
G
 
A
V
 
I
E
 
D
R
 
D
H
 
G
K
 
Q
D
 
D
L
 
V
A
 
S
S
 
S
-
 
K
-
 
D
L
 
V
Y
 
F
A
 
E
A
 
F
V
 
A
A
 
E
E
 
K
G
 
G
D
 
D
M
 
H
M
 
F
A
 
A
Q
 
L
S
 
M
I
 
V
L
 
V
D
 
D
R
 
R
A
 
V
G
 
C
R
 
F
M
 
Y
F
 
L
A
 
G
M
 
L
G
 
A
L
 
T
A
 
G
N
 
N
I
 
L
V
 
G
N
 
N
I
 
T
F
 
L
D
 
N
P
 
P
Q
 
D
M
 
S
I
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
G
G
 
G
A
 
G
Q
 
V
L
 
S
A
 
A
F
 
A
G
 
G
Y
 
E
L
 
F
S
 
L
S
 
R
D
 
S
K
 
R
V
 
V
V
 
E
E
 
K
E
 
Y
M
 
F
R
 
Q
R
 
E
W
 
F
V
 
T
V
 
F
Q
 
P
V
 
Q
D
 
V
G
 
R
P
 
N
L
 
S
P
 
T
E
 
K
V
 
I
R
 
K
V
 
L
H
 
A
G
 
E
W
 
L
G
 
G
N
 
N
Q
 
E
M
 
A
W
 
G
A
 
V
K
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
S
Y
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
Q

3vovB Crystal structure of rok hexokinase from thermus thermophilus (see paper)
35% identity, 44% coverage: 153:331/404 of query aligns to 61:236/298 of 3vovB

query
sites
3vovB
V
 
I
G
 
G
I
 
L
G
 
G
M
 
T
A
 
P
G
 
G
V
 
P
M
 
L
D
 
D
A
 
F
E
 
R
R
 
R
N
 
G
F
 
V
I
 
I
Y
 
R
W
 
-
S
 
P
S
 
N
S
 
I
L
 
P
N
 
G
V
 
V
R
 
Q
N
 
D
I
 
F
D
 
P
L
 
I
G
 
R
S
 
R
A
 
I
L
 
L
K
 
E
S
 
E
H
 
A
L
 
T
S
 
G
M
 
R
P
 
P
V
 
V
F
 
F
I
 
L
D
 
E
N
 
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
L
 
A
V
 
A
A
 
A
K
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
H
L
 
H
F
 
L
G
 
G
E
 
A
G
 
A
D
 
Q
T
 
G
R
 
E
S
 
E
N
 
S
F
 
S
V
 
L
V
 
Y
V
 
L
T
 
T
V
 
V
E
 
S
H
 
T
G
 
G
V
 
I
G
 
G
M
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
V
I
 
L
D
 
G
N
 
G
Q
 
R
I
 
V
Y
 
L
R
 
R
G
 
G
A
 
E
R
 
R
G
 
G
C
 
Q
G
 
G
A
 
G
E
 
E
F
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
L
K
 
T
V
 
L
Q
 
L
L
 
P
E
 
G
G
 
G
A
 
P
L
 
A
C
|
C
Q
 
G
C
|
C
G
 
G
Q
 
L
R
 
E
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
A
 
A
Y
 
L
V
 
A
G
 
A
D
 
G
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
E
R
 
R
E
 
D
A
 
A
N
 
-
I
 
-
T
 
T
S
 
Y
G
 
A
V
 
F
E
 
Q
R
 
R
H
 
P
K
 
V
D
 
D
L
 
T
A
 
R
S
 
E
L
 
L
Y
 
F
A
 
R
A
 
L
V
 
F
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
D
 
D
M
 
P
M
 
K
A
 
A
Q
 
E
S
 
R
I
 
L
L
 
V
D
 
L
R
 
Q
A
 
A
G
 
A
R
 
R
M
 
Y
F
 
V
A
 
G
M
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
S
I
 
L
V
 
V
N
 
K
I
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
P

6jdbA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase in complex with mannac-6p and adp from haemophilus influenzae
29% identity, 61% coverage: 102:347/404 of query aligns to 4:250/290 of 6jdbA

query
sites
6jdbA
L
 
L
I
 
A
T
 
L
D
 
D
F
 
I
E
 
G
G
 
G
T
 
T
E
x
K
L
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
I
I
 
V
S
 
K
H
 
N
E
 
E
M
 
I
P
 
E
L
 
Q
R
 
R
G
 
Q
G
 
Q
Q
 
I
M
 
H
S
 
T
P
 
P
E
 
R
S
 
-
L
 
-
C
 
-
E
 
E
K
 
N
I
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
G
L
 
M
D
 
H
Q
 
Q
S
 
A
C
 
L
A
 
G
K
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
Y
-
 
E
G
 
G
G
 
Q
L
 
F
T
 
D
R
 
Y
T
 
V
Q
 
A
I
 
V
S
 
A
G
 
S
V
x
T
G
|
G
I
 
I
G
 
I
M
 
N
A
 
N
G
 
G
V
 
I
M
 
L
D
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
N
 
-
F
 
-
I
 
-
Y
 
-
W
 
-
S
 
-
S
 
S
S
x
A
L
|
L
N
|
N
V
 
P
R
 
K
N
|
N
I
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
F
D
 
P
L
 
L
G
 
K
S
 
A
A
 
S
L
 
I
K
 
A
S
 
K
H
 
H
L
 
T
S
 
D
M
 
K
P
 
P
V
 
I
F
 
G
I
 
L
D
 
L
N
|
N
D
|
D
A
 
A
N
 
Q
L
 
A
V
 
A
A
 
T
K
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
Y
L
 
Q
F
 
L
G
 
Q
E
 
N
G
 
F
D
 
E
T
 
Q
R
 
V
S
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
V
V
 
F
V
 
I
T
 
T
V
 
V
E
x
S
H
x
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
V
I
 
L
D
 
N
N
 
Q
Q
 
I
I
 
L
Y
 
Q
R
 
T
G
 
G
A
 
S
R
 
R
G
 
G
C
 
I
G
 
A
A
 
G
E
x
H
F
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
K
 
L
V
 
A
Q
 
D
L
 
P
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
I
C
|
C
Q
 
G
C
|
C
G
 
G
Q
 
R
R
 
R
G
 
G
C
|
C
L
 
V
E
|
E
A
 
A
Y
 
I
V
 
A
G
 
S
D
 
G
Y
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
-
R
 
-
E
 
E
A
 
A
N
 
-
I
 
V
T
 
S
S
 
S
G
 
Q
V
 
W
E
 
E
R
 
D
H
 
P
K
 
C
D
 
D
L
x
P
A
x
K
S
 
E
L
 
V
Y
 
F
A
 
E
A
 
R
V
 
F
A
 
R
E
 
K
G
 
N
D
 
D
M
 
E
M
 
K
A
 
A
Q
 
T
S
 
A
I
 
L
L
 
V
D
 
E
R
 
R
A
 
S
G
 
A
R
 
K
M
 
A
F
 
I
A
 
A
M
 
N
G
 
L
L
 
I
A
 
A
N
 
D
I
 
L
V
 
V
N
 
I
I
 
S
F
 
L
D
 
D
P
 
I
Q
 
Q
M
 
K
I
 
I
V
 
A
L
 
I
A
 
G
G
 
G
A
x
S
-
 
V
Q
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
E
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S

6jdcA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase in complex with mannac from haemophilus influenzae
28% identity, 54% coverage: 130:347/404 of query aligns to 34:230/269 of 6jdcA

query
sites
6jdcA
E
 
E
K
 
N
I
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
G
L
 
M
D
 
H
Q
 
Q
S
 
A
C
 
L
A
 
G
K
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
Y
-
 
E
G
 
G
G
 
Q
L
 
F
T
 
D
R
 
Y
T
 
V
Q
 
A
I
 
V
S
 
A
G
 
S
V
 
T
G
 
G
I
 
I
G
 
I
M
 
N
A
 
N
G
 
G
V
 
I
M
 
L
D
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
N
 
-
F
 
-
I
 
-
Y
 
-
W
 
-
S
 
-
S
 
S
S
 
A
L
 
L
N
 
N
V
 
P
R
 
K
N
 
N
I
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
F
D
 
P
L
 
L
G
 
K
S
 
A
A
 
S
L
 
I
K
 
A
S
 
K
H
 
H
L
 
T
S
 
D
M
 
K
P
 
P
V
 
I
F
 
G
I
 
L
D
 
L
N
 
N
D
 
D
A
 
A
N
 
Q
L
 
A
V
 
A
A
 
T
K
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
Y
L
 
Q
F
 
L
G
 
Q
E
 
N
G
 
F
D
 
E
T
 
Q
R
 
V
S
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
V
V
 
F
V
 
I
T
 
T
V
 
V
E
 
S
H
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
V
I
 
L
D
 
N
N
 
Q
Q
 
I
I
 
L
Y
 
Q
R
 
T
G
 
G
A
 
S
R
 
R
G
 
G
C
 
I
G
 
A
A
 
G
E
 
H
F
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
K
 
L
V
 
A
Q
 
D
L
 
P
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
I
C
|
C
Q
 
G
C
|
C
G
 
G
Q
 
R
R
 
R
G
 
G
C
|
C
L
 
V
E
 
E
A
 
A
Y
 
I
V
 
A
G
 
S
D
 
G
Y
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
-
I
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
H
 
-
K
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
E
G
 
A
D
 
V
M
 
S
M
 
S
A
 
A
Q
 
T
S
 
A
I
 
L
L
 
V
D
 
E
R
 
R
A
 
S
G
 
A
R
 
K
M
 
A
F
 
I
A
 
A
M
 
N
G
 
L
L
 
I
A
 
A
N
 
D
I
 
L
V
 
V
N
 
I
I
 
S
F
 
L
D
 
D
P
 
I
Q
 
Q
M
 
K
I
 
I
V
 
A
L
 
I
A
 
G
G
 
G
A
 
S
-
 
V
Q
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
E
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S

2gupA Structural genomics, the crystal structure of a rok family protein from streptococcus pneumoniae tigr4 in complex with sucrose
27% identity, 53% coverage: 124:339/404 of query aligns to 32:233/289 of 2gupA

query
sites
2gupA
S
 
T
P
 
P
E
 
E
S
 
N
L
 
L
C
 
-
E
 
E
K
 
D
I
 
L
V
 
L
E
 
A
A
 
W
L
 
L
D
 
D
Q
 
Q
S
 
R
C
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
L
T
 
S
R
 
E
T
 
Q
Q
 
D
I
 
Y
S
 
S
G
 
G
V
 
I
G
 
A
I
 
M
G
 
S
M
 
V
A
 
P
G
 
G
V
 
A
M
 
V
D
 
N
A
 
Q
E
 
E
R
 
T
N
 
G
F
 
V
I
 
I
Y
 
D
-
 
G
W
 
F
S
 
S
S
 
A
S
 
V
L
 
P
N
 
Y
V
 
I
R
 
H
N
 
G
I
 
F
D
 
S
L
 
W
G
x
Y
S
 
E
A
 
A
L
 
L
K
x
S
S
 
S
H
 
Y
L
 
-
S
x
Q
M
 
L
P
|
P
V
|
V
F
 
H
I
 
L
D
 
E
N
 
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
L
 
C
V
|
V
A
 
G
K
 
L
A
 
S
E
 
E
H
 
L
L
 
L
F
 
-
G
 
-
E
 
A
G
 
H
D
 
P
T
 
E
R
 
L
S
 
E
N
 
N
F
 
A
V
 
A
V
 
C
V
 
V
T
 
V
V
 
I
E
 
G
H
 
T
G
 
G
V
 
I
G
 
G
M
 
G
G
 
A
I
 
M
V
 
I
I
 
I
D
 
N
N
 
G
Q
 
R
I
 
L
Y
 
H
R
 
R
G
 
G
A
 
R
R
 
H
G
 
G
C
 
L
G
 
G
A
 
G
E
 
E
F
 
F
G
 
G
H
 
Y
I
 
M
K
 
T
V
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
A
Q
 
E
L
 
K
E
 
L
G
 
N
A
 
N
L
 
W
C
 
S
Q
 
Q
C
 
L
G
 
A
Q
 
S
R
 
T
G
 
G
C
 
N
L
 
M
E
 
V
A
 
R
Y
 
Y
V
 
V
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
-
I
 
I
T
 
E
S
 
K
G
 
S
V
 
G
E
 
H
R
 
T
H
 
D
K
 
W
D
 
D
L
 
G
A
 
R
S
 
K
L
 
I
Y
 
Y
A
 
Q
A
 
E
V
 
A
A
 
A
E
 
A
G
 
G
D
 
N
M
 
I
M
 
L
A
 
C
Q
 
Q
S
 
E
I
 
A
L
 
I
D
 
E
R
 
R
A
 
M
G
 
N
R
 
R
M
 
N
F
 
L
A
 
A
M
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
L
N
 
N
I
 
I
V
 
Q
N
 
Y
I
 
L
F
 
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
G
M
 
V
I
 
I
V
 
S
L
 
L
A
 
G
G
|
G
A
 
S

Sites not aligning to the query:

6jdoA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase with amp-pnp from pasteurella multocida
28% identity, 43% coverage: 172:346/404 of query aligns to 72:250/293 of 6jdoA

query
sites
6jdoA
S
 
T
S
 
A
L
 
L
N
 
N
V
 
P
R
 
K
N
 
N
I
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
F
D
 
P
L
 
L
G
 
K
S
 
E
A
 
S
L
 
I
K
 
A
S
 
R
H
 
H
L
 
T
S
 
D
M
 
K
P
 
P
V
 
I
F
 
G
I
 
L
D
 
L
N
 
N
D
 
D
A
 
V
N
 
Q
L
 
A
V
 
A
A
 
A
K
 
C
A
 
A
E
 
E
H
 
Y
L
 
K
F
 
D
G
 
E
E
 
D
G
 
K
D
 
N
T
 
A
R
 
V
S
 
Q
N
 
N
F
 
F
V
 
V
V
 
F
V
 
I
T
 
T
V
 
V
E
x
S
H
x
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
L
D
 
E
N
 
R
Q
 
R
I
 
L
Y
 
L
R
 
T
G
 
E
A
 
P
R
 
N
G
 
G
C
 
V
G
 
A
A
 
G
E
 
H
F
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
K
 
L
V
 
A
Q
 
D
L
 
P
E
 
N
G
 
G
A
 
P
L
 
V
C
|
C
Q
 
G
C
|
C
G
 
G
Q
x
R
R
 
V
G
 
G
C
 
C
L
 
V
E
 
E
A
 
A
Y
 
V
V
 
A
G
 
A
D
x
G
Y
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
-
R
 
-
E
 
E
A
 
A
N
 
-
I
 
V
T
 
S
S
 
S
G
 
Q
V
 
W
E
 
N
R
 
P
H
 
P
K
 
C
D
 
T
L
x
P
A
 
K
S
 
Q
L
 
A
Y
x
F
A
 
E
A
 
L
V
 
F
A
 
R
E
 
K
G
 
N
D
 
D
M
 
E
M
 
K
A
 
A
Q
 
T
S
 
A
I
 
L
L
 
I
D
 
Q
R
 
R
A
 
S
G
 
A
R
 
S
M
 
A
F
 
I
A
 
A
M
 
N
G
 
L
L
 
I
A
 
A
N
 
D
I
 
L
V
 
V
N
 
I
I
 
G
F
 
L
D
 
D
P
 
V
Q
 
Q
M
 
K
I
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
G
G
 
G
A
x
S
-
 
V
Q
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
E
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L

6jdhA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase from pasteurella multocida
28% identity, 43% coverage: 172:346/404 of query aligns to 72:250/293 of 6jdhA

query
sites
6jdhA
S
 
T
S
 
A
L
 
L
N
 
N
V
 
P
R
 
K
N
 
N
I
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
F
D
 
P
L
 
L
G
 
K
S
 
E
A
 
S
L
 
I
K
 
A
S
 
R
H
 
H
L
 
T
S
 
D
M
 
K
P
 
P
V
 
I
F
 
G
I
 
L
D
 
L
N
 
N
D
 
D
A
 
V
N
 
Q
L
 
A
V
 
A
A
 
A
K
 
C
A
 
A
E
 
E
H
 
Y
L
 
K
F
 
D
G
 
E
E
 
D
G
 
K
D
 
N
T
 
A
R
 
V
S
 
Q
N
 
N
F
 
F
V
 
V
V
 
F
V
 
I
T
 
T
V
 
V
E
 
S
H
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
L
D
 
E
N
 
R
Q
 
R
I
 
L
Y
 
L
R
 
T
G
 
E
A
 
P
R
 
N
G
 
G
C
 
V
G
 
A
A
 
G
E
 
H
F
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
K
 
L
V
 
A
Q
 
D
L
 
P
E
 
N
G
 
G
A
 
P
L
 
V
C
|
C
Q
 
G
C
|
C
G
 
G
Q
 
R
R
 
V
G
 
G
C
|
C
L
 
V
E
 
E
A
 
A
Y
 
V
V
 
A
G
 
A
D
 
G
Y
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
-
R
 
-
E
 
E
A
 
A
N
 
-
I
 
V
T
 
S
S
 
S
G
 
Q
V
 
W
E
 
N
R
 
P
H
 
P
K
 
C
D
 
T
L
 
P
A
 
K
S
 
Q
L
 
A
Y
 
F
A
 
E
A
 
L
V
 
F
A
 
R
E
 
K
G
 
N
D
 
D
M
 
E
M
 
K
A
 
A
Q
 
T
S
 
A
I
 
L
L
 
I
D
 
Q
R
 
R
A
 
S
G
 
A
R
 
S
M
 
A
F
 
I
A
 
A
M
 
N
G
 
L
L
 
I
A
 
A
N
 
D
I
 
L
V
 
V
N
 
I
I
 
G
F
 
L
D
 
D
P
 
V
Q
 
Q
M
 
K
I
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
G
G
 
G
A
 
S
-
 
V
Q
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
E
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L

Query Sequence

>GFF3638 FitnessBrowser__Phaeo:GFF3638
MVKSDRLSHSGELRESSRLQVFDTIRAAGQIARIDIAQITRISPATVTAITAELLAAGLI
EEVSPDTVRGAKRGRPRVALKIRGSAHHIAGLKLSHHAITTLITDFEGTELISHEMPLRG
GQMSPESLCEKIVEALDQSCAKGGLTRTQISGVGIGMAGVMDAERNFIYWSSSLNVRNID
LGSALKSHLSMPVFIDNDANLVAKAEHLFGEGDTRSNFVVVTVEHGVGMGIVIDNQIYRG
ARGCGAEFGHIKVQLEGALCQCGQRGCLEAYVGDYALLREANITSGVERHKDLASLYAAV
AEGDMMAQSILDRAGRMFAMGLANIVNIFDPQMIVLAGAQLAFGYLSSDKVVEEMRRWVV
QVDGPLPEVRVHGWGNQMWAKGAAAYAIEEVSALTIREVASHAG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory