SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3684 FitnessBrowser__Marino:GFF3684 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4cazA Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa in complex with nadh
61% identity, 98% coverage: 11:489/489 of query aligns to 9:489/489 of 4cazA

query
sites
4cazA
F
 
Y
V
 
I
H
 
G
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
L
 
V
A
 
E
N
 
A
S
 
S
T
 
S
G
 
G
E
 
A
T
 
T
F
 
F
P
 
E
V
 
T
V
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
I
 
L
Y
 
A
E
 
K
V
 
V
E
 
Q
V
 
R
A
 
A
D
 
S
E
 
R
S
 
E
V
 
D
Q
 
V
Q
 
E
A
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
Q
S
 
S
A
 
A
R
 
V
A
 
E
G
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
S
 
A
A
 
A
M
 
M
T
 
T
A
 
A
I
 
M
E
 
Q
R
 
R
S
 
S
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
N
 
N
D
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
E
V
 
T
R
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
L
Q
 
A
E
 
E
A
 
T
E
 
R
A
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
L
E
 
E
F
 
Y
F
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
V
P
 
P
S
 
A
I
 
I
E
 
E
G
 
G
N
 
E
Q
 
Q
Q
 
I
D
 
P
L
 
L
G
 
R
-
 
E
G
 
T
D
 
S
F
 
F
Y
 
V
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
V
C
 
V
A
 
A
G
 
G
I
|
I
G
|
G
A
 
A
W
|
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
I
 
V
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
C
 
L
W
 
W
K
 
K
S
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
|
E
E
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
L
G
 
T
A
 
A
V
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
F
 
Y
T
 
T
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
L
Q
 
T
G
 
G
A
 
S
A
x
G
-
 
R
E
 
E
V
 
V
G
|
G
Q
 
Q
W
 
W
L
 
L
T
 
T
H
 
E
H
 
H
P
 
P
E
 
L
I
 
I
A
 
E
K
 
K
V
 
I
S
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
E
x
G
V
 
T
A
 
S
T
|
T
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
|
V
M
 
M
A
 
A
A
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
S
T
 
S
-
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
E
V
 
V
T
 
T
M
 
M
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
F
 
F
D
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
D
N
 
R
A
 
A
I
 
A
S
 
D
A
 
I
A
 
A
M
 
V
V
 
M
G
 
A
N
 
N
F
 
F
Y
 
F
T
 
S
Q
 
S
G
 
G
E
 
Q
I
 
V
C
|
C
T
 
T
N
 
N
G
 
G
T
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
V
 
I
H
 
H
E
 
R
D
 
S
L
 
Q
Y
 
Q
P
 
A
R
 
R
F
 
F
I
 
E
E
 
A
R
 
K
L
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
R
T
 
V
R
 
Q
N
 
R
N
 
-
I
 
I
K
 
R
P
 
L
G
 
G
D
 
D
P
 
P
M
 
Q
N
 
D
P
 
E
D
 
N
T
 
T
N
 
N
F
 
F
G
 
G
A
 
P
L
 
L
I
 
V
S
 
S
A
 
F
K
 
P
H
 
H
R
 
M
D
 
E
L
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
G
Y
 
Y
I
 
I
A
 
E
K
 
S
G
 
G
L
 
K
S
 
A
E
 
Q
G
 
K
A
 
A
T
 
R
L
 
L
S
 
L
H
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
E
A
 
R
F
 
V
E
 
T
P
 
D
E
 
G
D
 
A
S
 
F
K
 
G
G
 
K
G
 
G
Y
 
A
F
 
Y
V
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
T
 
T
D
 
D
C
 
C
T
 
R
D
 
D
D
 
D
M
 
M
T
 
T
I
 
I
V
 
V
K
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
V
 
I
L
 
L
T
 
V
F
 
Y
R
 
D
D
 
D
E
 
E
D
 
D
E
 
E
V
 
A
I
 
I
A
 
R
R
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
D
 
E
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
V
T
 
T
N
 
Q
D
 
D
I
 
L
R
 
A
R
 
R
A
 
A
H
 
H
R
 
R
V
 
A
I
 
I
H
 
H
Q
 
R
I
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
C
 
C
W
 
W
I
 
I
N
 
N
S
 
T
Y
 
W
G
 
G
A
 
E
S
 
S
P
 
P
A
 
A
E
 
E
M
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
L
 
Q
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
R
E
|
E
N
 
N
G
 
G
R
 
L
E
 
T
T
 
T
I
 
L
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
R
I
 
I
K
 
K
S
 
S
V
 
V
Y
 
Q
V
 
V
G
 
E
M
 
L
E
 
G
D
 
D
L
 
Y
D
 
A
A
 
S
P
 
V
F
 
F

2woxA Betaine aldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa with NAD(p) h-catalytic thiol adduct. (see paper)
61% identity, 98% coverage: 11:489/489 of query aligns to 9:489/489 of 2woxA

query
sites
2woxA
F
 
Y
V
 
I
H
 
G
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
L
 
V
A
 
E
N
 
A
S
 
S
T
 
S
G
 
G
E
 
A
T
 
T
F
 
F
P
 
E
V
 
T
V
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
I
 
L
Y
 
A
E
 
K
V
 
V
E
 
Q
V
 
R
A
 
A
D
 
S
E
 
R
S
 
E
V
 
D
Q
 
V
Q
 
E
A
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
Q
S
 
S
A
 
A
R
 
V
A
 
E
G
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
S
 
A
A
 
A
M
 
M
T
 
T
A
 
A
I
 
M
E
 
Q
R
 
R
S
 
S
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
N
 
N
D
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
E
V
 
T
R
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
L
Q
 
A
E
 
E
A
 
T
E
 
R
A
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
L
E
 
E
F
 
Y
F
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
V
P
 
P
S
 
A
I
 
I
E
 
E
G
 
G
N
 
E
Q
 
Q
Q
 
I
D
 
P
L
 
L
G
 
R
-
 
E
G
 
T
D
 
S
F
 
F
Y
 
V
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
V
C
 
V
A
 
A
G
 
G
I
|
I
G
|
G
A
 
A
W
|
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
I
 
V
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
C
 
L
W
 
W
K
 
K
S
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
|
S
E
|
E
E
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
L
G
 
T
A
 
A
V
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
F
 
Y
T
 
T
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
L
Q
 
T
G
 
G
A
 
S
A
x
G
-
 
R
E
 
E
V
 
V
G
|
G
Q
 
Q
W
 
W
L
 
L
T
 
T
H
 
E
H
 
H
P
 
P
E
 
L
I
 
I
A
 
E
K
 
K
V
 
I
S
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
E
x
G
V
 
T
A
 
S
T
|
T
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
|
V
M
 
M
A
 
A
A
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
S
T
 
S
-
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
E
V
 
V
T
 
T
M
 
M
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
F
 
F
D
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
D
N
 
R
A
 
A
I
 
A
S
 
D
A
 
I
A
 
A
M
 
V
V
 
M
G
 
A
N
 
N
F
 
F
Y
 
F
T
 
S
Q
 
S
G
 
G
E
 
Q
I
 
V
C
|
C
T
 
T
N
 
N
G
 
G
T
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
V
 
I
H
 
H
E
 
R
D
 
S
L
 
Q
Y
 
Q
P
 
A
R
 
R
F
 
F
I
 
E
E
 
A
R
 
K
L
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
R
T
 
V
R
 
Q
N
 
R
N
 
-
I
 
I
K
 
R
P
 
L
G
 
G
D
 
D
P
 
P
M
 
Q
N
 
D
P
 
E
D
 
N
T
 
T
N
 
N
F
 
F
G
 
G
A
 
P
L
 
L
I
 
V
S
 
S
A
 
F
K
 
P
H
 
H
R
 
M
D
 
E
L
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
G
Y
 
Y
I
 
I
A
 
E
K
 
S
G
 
G
L
 
K
S
 
A
E
 
Q
G
 
K
A
 
A
T
 
R
L
 
L
S
 
L
H
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
E
A
 
R
F
 
V
E
 
T
P
 
D
E
 
G
D
 
A
S
 
F
K
 
G
G
 
K
G
 
G
Y
 
A
F
 
Y
V
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
T
 
T
D
 
D
C
 
C
T
 
R
D
 
D
D
 
D
M
 
M
T
 
T
I
 
I
V
 
V
K
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
V
 
I
L
 
L
T
 
V
F
 
Y
R
 
D
D
 
D
E
 
E
D
 
D
E
 
E
V
 
A
I
 
I
A
 
R
R
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
D
 
E
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
V
T
 
T
N
 
Q
D
 
D
I
 
L
R
 
A
R
 
R
A
 
A
H
 
H
R
 
R
V
 
A
I
 
I
H
 
H
Q
 
R
I
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
C
 
C
W
 
W
I
 
I
N
 
N
S
 
T
Y
 
W
G
 
G
A
 
E
S
 
S
P
 
P
A
 
A
E
 
E
M
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
L
 
Q
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
R
E
|
E
N
 
N
G
 
G
R
 
L
E
 
T
T
 
T
I
 
L
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
R
I
 
I
K
 
K
S
 
S
V
 
V
Y
 
Q
V
 
V
G
 
E
M
 
L
E
 
G
D
 
D
L
 
Y
D
 
A
A
 
S
P
 
V
F
 
F

2wmeA Crystallographic structure of betaine aldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa (see paper)
61% identity, 98% coverage: 11:489/489 of query aligns to 9:489/489 of 2wmeA

query
sites
2wmeA
F
 
Y
V
 
I
H
 
G
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
L
 
V
A
 
E
N
 
A
S
 
S
T
 
S
G
 
G
E
 
A
T
 
T
F
 
F
P
 
E
V
 
T
V
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
I
 
L
Y
 
A
E
 
K
V
 
V
E
 
Q
V
 
R
A
 
A
D
 
S
E
 
R
S
 
E
V
 
D
Q
 
V
Q
 
E
A
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
Q
S
 
S
A
 
A
R
 
V
A
 
E
G
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
S
 
A
A
 
A
M
 
M
T
 
T
A
 
A
I
 
M
E
 
Q
R
 
R
S
 
S
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
N
 
N
D
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
E
V
 
T
R
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
L
Q
 
A
E
 
E
A
 
T
E
 
R
A
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
L
E
 
E
F
 
Y
F
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
V
P
 
P
S
 
A
I
 
I
E
 
E
G
 
G
N
 
E
Q
 
Q
Q
 
I
D
 
P
L
 
L
G
 
R
-
 
E
G
 
T
D
 
S
F
 
F
Y
 
V
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
V
C
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
|
G
A
 
A
W
|
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
I
 
V
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
C
 
L
W
 
W
K
 
K
S
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
|
S
E
|
E
E
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
L
G
 
T
A
 
A
V
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
F
 
Y
T
 
T
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
L
Q
 
T
G
 
G
A
 
S
A
x
G
-
 
R
E
 
E
V
 
V
G
|
G
Q
 
Q
W
 
W
L
 
L
T
 
T
H
 
E
H
 
H
P
 
P
E
 
L
I
 
I
A
 
E
K
 
K
V
 
I
S
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
E
x
G
V
 
T
A
 
S
T
|
T
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
|
V
M
 
M
A
 
A
A
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
S
T
 
S
-
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
E
V
 
V
T
 
T
M
 
M
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
F
 
F
D
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
D
N
 
R
A
 
A
I
 
A
S
 
D
A
 
I
A
 
A
M
 
V
V
 
M
G
 
A
N
 
N
F
 
F
Y
 
F
T
 
S
Q
 
S
G
 
G
E
 
Q
I
 
V
C
|
C
T
 
T
N
 
N
G
 
G
T
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
V
 
I
H
 
H
E
 
R
D
 
S
L
 
Q
Y
 
Q
P
 
A
R
 
R
F
 
F
I
 
E
E
 
A
R
 
K
L
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
R
T
 
V
R
 
Q
N
 
R
N
 
-
I
 
I
K
 
R
P
 
L
G
 
G
D
 
D
P
 
P
M
 
Q
N
 
D
P
 
E
D
 
N
T
 
T
N
 
N
F
 
F
G
 
G
A
 
P
L
 
L
I
 
V
S
 
S
A
 
F
K
 
P
H
 
H
R
 
M
D
 
E
L
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
G
Y
 
Y
I
 
I
A
 
E
K
 
S
G
 
G
L
 
K
S
 
A
E
 
Q
G
 
K
A
 
A
T
 
R
L
 
L
S
 
L
H
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
E
A
 
R
F
 
V
E
 
T
P
 
D
E
 
G
D
 
A
S
 
F
K
 
G
G
 
K
G
 
G
Y
 
A
F
 
Y
V
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
T
 
T
D
 
D
C
 
C
T
 
R
D
 
D
D
 
D
M
 
M
T
 
T
I
 
I
V
 
V
K
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
V
 
I
L
 
L
T
 
V
F
 
Y
R
 
D
D
 
D
E
 
E
D
 
D
E
 
E
V
 
A
I
 
I
A
 
R
R
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
D
 
E
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
V
T
 
T
N
 
Q
D
 
D
I
 
L
R
 
A
R
 
R
A
 
A
H
 
H
R
 
R
V
 
A
I
 
I
H
 
H
Q
 
R
I
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
C
 
C
W
 
W
I
 
I
N
 
N
S
 
T
Y
 
W
G
 
G
A
 
E
S
 
S
P
 
P
A
 
A
E
 
E
M
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
L
 
Q
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
R
E
|
E
N
 
N
G
 
G
R
 
L
E
 
T
T
 
T
I
 
L
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
R
I
 
I
K
 
K
S
 
S
V
 
V
Y
 
Q
V
 
V
G
 
E
M
 
L
E
 
G
D
 
D
L
 
Y
D
 
A
A
 
S
P
 
V
F
 
F

Q9HTJ1 NAD/NADP-dependent betaine aldehyde dehydrogenase; BADH; EC 1.2.1.8 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see 2 papers)
61% identity, 98% coverage: 11:489/489 of query aligns to 10:490/490 of Q9HTJ1

query
sites
Q9HTJ1
F
 
Y
V
 
I
H
 
G
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
L
 
V
A
 
E
N
 
A
S
 
S
T
 
S
G
 
G
E
 
A
T
 
T
F
 
F
P
 
E
V
 
T
V
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
I
 
L
Y
 
A
E
 
K
V
 
V
E
 
Q
V
 
R
A
 
A
D
 
S
E
 
R
S
 
E
V
 
D
Q
 
V
Q
 
E
A
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
Q
S
 
S
A
 
A
R
 
V
A
 
E
G
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
S
 
A
A
 
A
M
 
M
T
 
T
A
 
A
I
 
M
E
 
Q
R
 
R
S
 
S
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
N
 
N
D
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
E
V
 
T
R
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
L
Q
 
A
E
 
E
A
 
T
E
 
R
A
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
L
E
 
E
F
 
Y
F
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
V
P
 
P
S
 
A
I
 
I
E
 
E
G
 
G
N
 
E
Q
 
Q
Q
 
I
D
 
P
L
 
L
G
 
R
-
 
E
G
 
T
D
 
S
F
 
F
Y
 
V
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
V
C
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
|
G
A
|
A
W
|
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
I
 
V
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
C
 
L
W
 
W
K
|
K
S
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
F
 
F
K
|
K
P
|
P
S
|
S
E
|
E
E
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
L
G
 
T
A
 
A
V
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
F
 
Y
T
 
T
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
L
Q
 
T
G
 
G
A
 
S
A
x
G
-
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
W
 
W
L
 
L
T
 
T
H
 
E
H
 
H
P
 
P
E
 
L
I
 
I
A
 
E
K
 
K
V
 
I
S
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
x
G
V
x
T
A
x
S
T
|
T
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
V
M
 
M
A
 
A
A
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
S
T
 
S
-
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
E
V
 
V
T
 
T
M
 
M
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
F
 
F
D
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
D
N
 
R
A
 
A
I
 
A
S
 
D
A
 
I
A
 
A
M
 
V
V
 
M
G
 
A
N
 
N
F
 
F
Y
 
F
T
 
S
Q
 
S
G
 
G
E
 
Q
I
 
V
C
|
C
T
 
T
N
 
N
G
 
G
T
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
V
 
I
H
 
H
E
 
R
D
 
S
L
 
Q
Y
 
Q
P
 
A
R
 
R
F
 
F
I
 
E
E
 
A
R
 
K
L
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
R
T
 
V
R
 
Q
N
 
R
N
 
-
I
 
I
K
 
R
P
 
L
G
 
G
D
 
D
P
 
P
M
 
Q
N
 
D
P
 
E
D
 
N
T
 
T
N
 
N
F
 
F
G
 
G
A
 
P
L
 
L
I
 
V
S
 
S
A
 
F
K
 
P
H
 
H
R
 
M
D
 
E
L
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
G
Y
 
Y
I
 
I
A
 
E
K
 
S
G
 
G
L
 
K
S
 
A
E
 
Q
G
 
K
A
 
A
T
 
R
L
 
L
S
 
L
H
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
E
A
 
R
F
 
V
E
 
T
P
 
D
E
 
G
D
 
A
S
 
F
K
 
G
G
 
K
G
 
G
Y
 
A
F
 
Y
V
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
T
 
T
D
 
D
C
 
C
T
 
R
D
 
D
D
 
D
M
 
M
T
 
T
I
 
I
V
 
V
K
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
V
 
I
L
 
L
T
 
V
F
 
Y
R
 
D
D
 
D
E
 
E
D
 
D
E
 
E
V
 
A
I
 
I
A
 
R
R
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
D
 
E
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
V
T
 
T
N
 
Q
D
 
D
I
 
L
R
 
A
R
 
R
A
 
A
H
 
H
R
 
R
V
 
A
I
 
I
H
 
H
Q
 
R
I
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
C
 
C
W
 
W
I
 
I
N
 
N
S
 
T
Y
 
W
G
 
G
A
 
E
S
 
S
P
 
P
A
 
A
E
 
E
M
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
L
 
Q
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
R
E
|
E
N
 
N
G
 
G
R
 
L
E
 
T
T
 
T
I
 
L
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
R
I
 
I
K
 
K
S
 
S
V
 
V
Y
 
Q
V
 
V
G
 
E
M
 
L
E
 
G
D
 
D
L
 
Y
D
 
A
A
 
S
P
 
V
F
 
F

8skfA Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (lattice translocation disorder)
61% identity, 98% coverage: 9:489/489 of query aligns to 15:497/497 of 8skfA

query
sites
8skfA
Q
 
Q
N
 
L
F
 
Y
V
 
I
H
 
H
G
 
G
R
 
K
F
 
F
L
 
V
A
 
A
N
 
A
S
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
T
F
 
F
P
 
E
V
x
T
V
x
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
I
 
L
Y
 
A
E
 
T
V
 
V
E
 
Q
V
 
A
A
 
A
D
 
G
E
 
R
S
 
E
V
 
D
Q
 
V
Q
 
D
A
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
K
S
 
S
A
 
A
R
 
Q
A
 
Q
G
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
S
 
A
A
 
A
M
 
M
T
 
S
A
 
A
I
 
M
E
 
A
R
 
R
S
 
S
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
R
R
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
N
 
N
D
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
L
E
 
E
V
 
T
R
 
L
D
|
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
L
Q
 
S
E
 
E
A
 
T
E
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
L
E
 
E
F
 
Y
F
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
P
 
P
S
 
A
I
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
S
Q
 
Q
Q
 
I
D
 
P
L
 
L
-
 
R
G
 
D
G
 
S
D
 
S
F
 
F
Y
 
V
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
V
C
 
V
A
 
A
G
 
G
I
|
I
G
|
G
A
|
A
W
|
W
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
C
 
L
W
 
W
K
 
K
S
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
|
E
E
x
V
T
 
T
P
 
P
M
 
L
G
 
T
A
 
A
V
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
F
 
Y
T
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
L
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
L
Q
 
P
G
 
G
-
 
I
A
x
G
A
 
A
E
 
E
V
 
T
G
|
G
Q
 
Q
W
 
Y
L
 
L
T
 
T
H
 
E
H
 
H
P
 
P
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
V
 
I
S
 
S
F
 
F
T
|
T
G
|
G
E
x
G
V
 
V
A
 
A
T
x
S
G
 
G
K
 
K
K
|
K
V
 
V
M
 
M
A
 
A
-
 
N
A
 
S
A
 
A
S
 
A
S
 
S
T
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
E
V
 
V
T
 
T
M
 
M
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
F
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
N
L
 
L
E
 
D
N
 
L
A
 
A
I
 
A
S
 
D
A
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
M
G
 
A
N
 
N
F
 
F
Y
 
Y
T
 
S
Q
 
S
G
 
G
E
 
Q
I
 
V
C
|
C
T
 
T
N
 
N
G
 
G
T
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
P
E
 
A
D
 
K
L
 
F
Y
 
K
P
 
A
R
 
E
F
 
F
I
 
E
E
 
H
R
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
E
R
 
R
T
 
V
R
 
-
N
 
G
N
 
R
I
 
I
K
 
R
P
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
L
M
 
F
N
 
A
P
 
D
D
 
D
T
 
T
N
 
N
F
 
F
G
 
G
A
 
P
L
 
L
I
 
V
S
 
S
A
 
F
K
 
P
H
 
H
R
 
R
D
 
Q
L
 
N
V
 
V
L
 
L
D
 
R
Y
 
Y
I
 
I
A
 
E
K
 
S
G
 
G
L
 
K
S
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
R
L
 
L
S
 
L
H
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
D
A
 
V
F
 
L
E
 
K
P
 
G
E
 
E
D
 
G
S
 
F
K
 
D
G
 
N
G
 
G
Y
 
A
F
 
W
V
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
T
 
T
D
 
D
C
 
C
T
 
T
D
 
D
D
 
D
M
 
M
T
 
T
I
 
I
V
 
V
K
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
V
 
I
L
 
L
T
 
S
F
 
Y
R
 
D
D
 
D
E
 
E
D
 
A
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
R
R
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
A
T
 
T
D
 
E
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
V
T
 
T
N
 
P
D
 
D
I
 
L
R
 
N
R
 
R
A
 
A
H
 
H
R
 
R
V
 
I
I
 
I
H
 
H
Q
 
Q
I
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
C
 
C
W
 
W
I
 
I
N
 
N
S
 
S
Y
 
W
G
 
G
A
 
E
S
 
S
P
 
P
A
 
A
E
 
E
M
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
L
 
H
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
E
 
E
N
 
N
G
 
G
R
 
V
E
 
M
T
 
T
I
 
L
A
 
Q
H
 
S
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
I
 
V
K
 
K
S
 
S
V
 
I
Y
 
Q
V
 
V
G
 
E
M
 
M
E
 
G
D
 
P
L
 
F
D
 
Q
A
 
S
P
 
I
F
 
F

8vr1A Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (ctp bound)
61% identity, 98% coverage: 9:489/489 of query aligns to 6:488/488 of 8vr1A

query
sites
8vr1A
Q
 
Q
N
 
L
F
 
Y
V
 
I
H
 
H
G
 
G
R
 
K
F
 
F
L
 
V
A
 
A
N
 
A
S
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
T
F
 
F
P
 
E
V
 
T
V
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
I
 
L
Y
 
A
E
 
T
V
 
V
E
 
Q
V
 
A
A
 
A
D
 
G
E
 
R
S
 
E
V
 
D
Q
 
V
Q
 
D
A
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
K
S
 
S
A
 
A
R
 
Q
A
 
Q
G
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
S
 
A
A
 
A
M
 
M
T
 
S
A
 
A
I
 
M
E
 
A
R
 
R
S
 
S
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
R
R
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
N
 
N
D
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
L
E
 
E
V
 
T
R
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
L
Q
 
S
E
 
E
A
 
T
E
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
L
E
 
E
F
 
Y
F
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
P
 
P
S
 
A
I
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
S
Q
 
Q
Q
 
I
D
 
P
L
 
L
-
 
R
G
 
D
G
 
S
D
 
S
F
 
F
Y
 
V
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
V
C
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
W
|
W
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
C
 
L
W
 
W
K
 
K
S
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
F
 
F
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
E
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
L
G
 
T
A
 
A
V
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
F
 
Y
T
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
L
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
L
Q
 
P
G
 
G
-
 
I
A
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
T
G
 
G
Q
 
Q
W
 
Y
L
 
L
T
 
T
H
 
E
H
 
H
P
 
P
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
V
 
I
S
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
E
x
G
V
 
V
A
|
A
T
x
S
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
V
M
 
M
A
 
A
-
 
N
A
 
S
A
 
A
S
 
A
S
 
S
T
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
E
V
 
V
T
 
T
M
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
F
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
N
L
 
L
E
 
D
N
 
L
A
 
A
I
 
A
S
 
D
A
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
M
G
 
A
N
 
N
F
 
F
Y
 
Y
T
 
S
Q
 
S
G
 
G
E
 
Q
I
 
V
C
 
C
T
 
T
N
 
N
G
 
G
T
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
P
E
 
A
D
 
K
L
 
F
Y
 
K
P
 
A
R
 
E
F
 
F
I
 
E
E
 
H
R
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
E
R
 
R
T
 
V
R
 
-
N
 
G
N
 
R
I
 
I
K
 
R
P
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
L
M
 
F
N
 
A
P
 
D
D
 
D
T
 
T
N
 
N
F
 
F
G
 
G
A
 
P
L
 
L
I
 
V
S
 
S
A
 
F
K
 
P
H
 
H
R
 
R
D
 
Q
L
 
N
V
 
V
L
 
L
D
 
R
Y
 
Y
I
 
I
A
 
E
K
 
S
G
 
G
L
 
K
S
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
R
L
 
L
S
 
L
H
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
D
A
 
V
F
 
L
E
 
K
P
 
G
E
 
E
D
 
G
S
 
F
K
 
D
G
 
N
G
 
G
Y
 
A
F
 
W
V
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
T
 
T
D
 
D
C
 
C
T
 
T
D
 
D
D
 
D
M
 
M
T
 
T
I
 
I
V
 
V
K
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
V
 
I
L
 
L
T
 
S
F
 
Y
R
 
D
D
 
D
E
 
E
D
 
A
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
R
R
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
A
T
 
T
D
 
E
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
V
T
 
T
N
 
P
D
 
D
I
 
L
R
 
N
R
 
R
A
 
A
H
 
H
R
 
R
V
 
I
I
 
I
H
 
H
Q
 
Q
I
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
C
 
C
W
 
W
I
 
I
N
 
N
S
 
S
Y
 
W
G
 
G
A
 
E
S
 
S
P
 
P
A
 
A
E
 
E
M
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
L
 
H
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
E
 
E
N
 
N
G
 
G
R
 
V
E
 
M
T
 
T
I
 
L
A
 
Q
H
 
S
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
I
 
V
K
 
K
S
 
S
V
 
I
Y
 
Q
V
 
V
G
 
E
M
 
M
E
 
G
D
 
P
L
 
F
D
 
Q
A
 
S
P
 
I
F
 
F

8vr0A Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (gmp bound)
61% identity, 98% coverage: 9:489/489 of query aligns to 6:488/488 of 8vr0A

query
sites
8vr0A
Q
 
Q
N
 
L
F
 
Y
V
 
I
H
 
H
G
 
G
R
 
K
F
 
F
L
 
V
A
 
A
N
 
A
S
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
T
F
 
F
P
 
E
V
 
T
V
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
I
 
L
Y
 
A
E
 
T
V
 
V
E
 
Q
V
 
A
A
 
A
D
 
G
E
 
R
S
 
E
V
 
D
Q
 
V
Q
 
D
A
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
K
S
 
S
A
 
A
R
 
Q
A
 
Q
G
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
S
 
A
A
 
A
M
 
M
T
 
S
A
 
A
I
 
M
E
 
A
R
 
R
S
 
S
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
R
R
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
N
 
N
D
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
L
E
 
E
V
 
T
R
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
L
Q
 
S
E
 
E
A
 
T
E
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
L
E
 
E
F
 
Y
F
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
P
 
P
S
 
A
I
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
S
Q
 
Q
Q
 
I
D
 
P
L
 
L
-
 
R
G
 
D
G
 
S
D
 
S
F
 
F
Y
 
V
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
V
C
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
W
|
W
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
C
 
L
W
 
W
K
 
K
S
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
F
 
F
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
E
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
L
G
 
T
A
 
A
V
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
F
 
Y
T
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
L
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
L
Q
 
P
G
 
G
-
 
I
A
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
T
G
 
G
Q
 
Q
W
 
Y
L
 
L
T
 
T
H
 
E
H
 
H
P
 
P
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
V
 
I
S
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
E
x
G
V
 
V
A
 
A
T
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
V
M
 
M
A
 
A
-
 
N
A
 
S
A
 
A
S
 
A
S
 
S
T
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
E
V
 
V
T
 
T
M
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
F
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
N
L
 
L
E
 
D
N
 
L
A
 
A
I
 
A
S
 
D
A
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
M
G
 
A
N
 
N
F
 
F
Y
 
Y
T
 
S
Q
 
S
G
 
G
E
 
Q
I
 
V
C
 
C
T
 
T
N
 
N
G
 
G
T
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
P
E
 
A
D
 
K
L
 
F
Y
 
K
P
 
A
R
 
E
F
 
F
I
 
E
E
 
H
R
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
E
R
 
R
T
 
V
R
 
-
N
 
G
N
 
R
I
 
I
K
 
R
P
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
L
M
 
F
N
 
A
P
 
D
D
 
D
T
 
T
N
 
N
F
 
F
G
 
G
A
 
P
L
 
L
I
 
V
S
 
S
A
 
F
K
 
P
H
|
H
R
 
R
D
 
Q
L
 
N
V
 
V
L
 
L
D
 
R
Y
 
Y
I
 
I
A
 
E
K
 
S
G
 
G
L
 
K
S
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
R
L
 
L
S
 
L
H
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
D
A
 
V
F
 
L
E
 
K
P
 
G
E
 
E
D
 
G
S
 
F
K
 
D
G
 
N
G
 
G
Y
 
A
F
 
W
V
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
T
 
T
D
 
D
C
 
C
T
 
T
D
 
D
D
 
D
M
 
M
T
 
T
I
 
I
V
 
V
K
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
V
 
I
L
 
L
T
 
S
F
 
Y
R
 
D
D
 
D
E
 
E
D
 
A
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
R
R
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
A
T
 
T
D
 
E
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
V
T
 
T
N
 
P
D
 
D
I
 
L
R
 
N
R
 
R
A
 
A
H
 
H
R
 
R
V
 
I
I
 
I
H
 
H
Q
 
Q
I
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
C
 
C
W
 
W
I
 
I
N
 
N
S
 
S
Y
 
W
G
 
G
A
 
E
S
 
S
P
 
P
A
 
A
E
 
E
M
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
L
 
H
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
E
 
E
N
 
N
G
 
G
R
 
V
E
 
M
T
 
T
I
 
L
A
 
Q
H
 
S
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
I
 
V
K
 
K
S
 
S
V
 
I
Y
 
Q
V
 
V
G
 
E
M
 
M
E
 
G
D
 
P
L
 
F
D
 
Q
A
 
S
P
 
I
F
 
F

8vqzA Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (cmp bound)
61% identity, 98% coverage: 9:489/489 of query aligns to 6:488/488 of 8vqzA

query
sites
8vqzA
Q
 
Q
N
 
L
F
 
Y
V
 
I
H
 
H
G
 
G
R
 
K
F
 
F
L
 
V
A
 
A
N
 
A
S
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
T
F
 
F
P
 
E
V
 
T
V
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
I
 
L
Y
 
A
E
 
T
V
 
V
E
 
Q
V
 
A
A
 
A
D
 
G
E
 
R
S
 
E
V
 
D
Q
 
V
Q
 
D
A
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
K
S
 
S
A
 
A
R
 
Q
A
 
Q
G
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
S
 
A
A
 
A
M
 
M
T
 
S
A
 
A
I
 
M
E
 
A
R
 
R
S
 
S
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
R
R
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
N
 
N
D
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
L
E
 
E
V
 
T
R
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
L
Q
 
S
E
 
E
A
 
T
E
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
L
E
 
E
F
 
Y
F
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
P
 
P
S
 
A
I
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
S
Q
 
Q
Q
 
I
D
 
P
L
 
L
-
 
R
G
 
D
G
 
S
D
 
S
F
 
F
Y
 
V
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
V
C
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
W
|
W
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
C
 
L
W
 
W
K
 
K
S
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
F
 
F
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
E
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
L
G
 
T
A
 
A
V
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
F
 
Y
T
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
L
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
L
Q
 
P
G
 
G
-
 
I
A
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
T
G
 
G
Q
 
Q
W
 
Y
L
 
L
T
 
T
H
 
E
H
 
H
P
 
P
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
V
 
I
S
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
E
x
G
V
 
V
A
 
A
T
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
V
M
 
M
A
 
A
-
 
N
A
 
S
A
 
A
S
 
A
S
 
S
T
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
E
V
 
V
T
 
T
M
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
F
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
N
L
 
L
E
 
D
N
 
L
A
 
A
I
 
A
S
 
D
A
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
M
G
 
A
N
 
N
F
 
F
Y
 
Y
T
 
S
Q
 
S
G
 
G
E
 
Q
I
 
V
C
 
C
T
 
T
N
 
N
G
 
G
T
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
P
E
 
A
D
 
K
L
 
F
Y
 
K
P
 
A
R
 
E
F
 
F
I
 
E
E
 
H
R
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
E
R
 
R
T
 
V
R
 
-
N
 
G
N
 
R
I
 
I
K
 
R
P
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
L
M
 
F
N
 
A
P
 
D
D
 
D
T
 
T
N
 
N
F
 
F
G
 
G
A
 
P
L
 
L
I
 
V
S
 
S
A
 
F
K
 
P
H
|
H
R
 
R
D
 
Q
L
x
N
V
 
V
L
 
L
D
 
R
Y
 
Y
I
 
I
A
 
E
K
 
S
G
 
G
L
 
K
S
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
R
L
 
L
S
 
L
H
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
D
A
 
V
F
 
L
E
 
K
P
 
G
E
 
E
D
 
G
S
 
F
K
 
D
G
 
N
G
 
G
Y
 
A
F
 
W
V
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
T
 
T
D
 
D
C
 
C
T
 
T
D
 
D
D
 
D
M
 
M
T
 
T
I
 
I
V
 
V
K
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
V
 
I
L
 
L
T
 
S
F
 
Y
R
 
D
D
 
D
E
 
E
D
 
A
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
R
R
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
A
T
 
T
D
 
E
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
V
T
 
T
N
 
P
D
 
D
I
 
L
R
 
N
R
 
R
A
 
A
H
 
H
R
 
R
V
 
I
I
 
I
H
 
H
Q
 
Q
I
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
C
 
C
W
 
W
I
 
I
N
 
N
S
 
S
Y
 
W
G
 
G
A
 
E
S
 
S
P
 
P
A
 
A
E
 
E
M
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
L
 
H
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
E
 
E
N
 
N
G
 
G
R
 
V
E
 
M
T
 
T
I
 
L
A
 
Q
H
 
S
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
I
 
V
K
 
K
S
 
S
V
 
I
Y
 
Q
V
 
V
G
 
E
M
 
M
E
 
G
D
 
P
L
 
F
D
 
Q
A
 
S
P
 
I
F
 
F

8vqwC Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (coa bound)
61% identity, 98% coverage: 9:489/489 of query aligns to 6:488/488 of 8vqwC

query
sites
8vqwC
Q
 
Q
N
 
L
F
 
Y
V
 
I
H
 
H
G
 
G
R
 
K
F
 
F
L
 
V
A
 
A
N
 
A
S
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
T
F
 
F
P
 
E
V
 
T
V
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
I
 
L
Y
 
A
E
 
T
V
 
V
E
 
Q
V
 
A
A
 
A
D
 
G
E
 
R
S
 
E
V
 
D
Q
 
V
Q
 
D
A
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
K
S
 
S
A
 
A
R
 
Q
A
 
Q
G
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
S
 
A
A
 
A
M
 
M
T
 
S
A
 
A
I
 
M
E
 
A
R
 
R
S
 
S
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
R
R
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
N
 
N
D
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
L
E
 
E
V
 
T
R
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
L
Q
 
S
E
 
E
A
 
T
E
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
L
E
 
E
F
 
Y
F
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
P
 
P
S
 
A
I
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
S
Q
 
Q
Q
 
I
D
 
P
L
 
L
-
 
R
G
 
D
G
 
S
D
 
S
F
 
F
Y
 
V
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
V
C
 
V
A
 
A
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
W
|
W
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
C
 
L
W
 
W
K
 
K
S
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
|
S
E
|
E
E
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
L
G
 
T
A
 
A
V
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
F
 
Y
T
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
L
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
L
Q
 
P
G
 
G
-
 
I
A
x
G
A
 
A
E
 
E
V
 
T
G
|
G
Q
 
Q
W
 
Y
L
 
L
T
 
T
H
 
E
H
 
H
P
 
P
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
V
 
I
S
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
E
x
G
V
 
V
A
 
A
T
x
S
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
V
M
 
M
A
 
A
-
 
N
A
 
S
A
 
A
S
 
A
S
 
S
T
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
E
V
 
V
T
 
T
M
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
F
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
N
L
 
L
E
 
D
N
 
L
A
 
A
I
 
A
S
 
D
A
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
M
G
 
A
N
 
N
F
 
F
Y
 
Y
T
 
S
Q
 
S
G
 
G
E
 
Q
I
 
V
C
 
C
T
 
T
N
 
N
G
 
G
T
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
P
E
 
A
D
 
K
L
 
F
Y
 
K
P
 
A
R
 
E
F
 
F
I
 
E
E
 
H
R
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
E
R
 
R
T
 
V
R
 
-
N
 
G
N
 
R
I
 
I
K
 
R
P
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
L
M
 
F
N
 
A
P
 
D
D
 
D
T
 
T
N
 
N
F
 
F
G
 
G
A
 
P
L
 
L
I
 
V
S
 
S
A
 
F
K
 
P
H
|
H
R
 
R
D
 
Q
L
 
N
V
 
V
L
 
L
D
 
R
Y
 
Y
I
 
I
A
 
E
K
 
S
G
 
G
L
 
K
S
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
R
L
 
L
S
 
L
H
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
D
A
 
V
F
 
L
E
 
K
P
 
G
E
 
E
D
 
G
S
 
F
K
 
D
G
 
N
G
 
G
Y
 
A
F
 
W
V
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
T
 
T
D
 
D
C
 
C
T
 
T
D
 
D
D
 
D
M
 
M
T
 
T
I
 
I
V
 
V
K
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
V
 
I
L
 
L
T
 
S
F
 
Y
R
 
D
D
 
D
E
 
E
D
 
A
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
R
R
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
A
T
 
T
D
 
E
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
V
T
 
T
N
 
P
D
 
D
I
 
L
R
 
N
R
 
R
A
 
A
H
 
H
R
 
R
V
 
I
I
 
I
H
 
H
Q
 
Q
I
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
C
 
C
W
 
W
I
 
I
N
 
N
S
 
S
Y
 
W
G
 
G
A
 
E
S
 
S
P
 
P
A
 
A
E
 
E
M
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
L
 
H
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
E
 
E
N
 
N
G
 
G
R
 
V
E
 
M
T
 
T
I
 
L
A
 
Q
H
 
S
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
I
 
V
K
 
K
S
 
S
V
 
I
Y
 
Q
V
 
V
G
 
E
M
 
M
E
 
G
D
 
P
L
 
F
D
 
Q
A
 
S
P
 
I
F
 
F

8vj3A Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (fad bound)
61% identity, 98% coverage: 9:489/489 of query aligns to 6:488/488 of 8vj3A

query
sites
8vj3A
Q
 
Q
N
 
L
F
 
Y
V
 
I
H
 
H
G
 
G
R
 
K
F
 
F
L
 
V
A
 
A
N
 
A
S
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
T
F
 
F
P
 
E
V
 
T
V
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
I
 
L
Y
 
A
E
 
T
V
 
V
E
 
Q
V
 
A
A
 
A
D
 
G
E
 
R
S
 
E
V
 
D
Q
 
V
Q
 
D
A
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
K
S
 
S
A
 
A
R
 
Q
A
 
Q
G
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
S
 
A
A
 
A
M
 
M
T
 
S
A
 
A
I
 
M
E
 
A
R
 
R
S
 
S
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
R
R
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
N
 
N
D
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
L
E
 
E
V
 
T
R
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
L
Q
 
S
E
 
E
A
 
T
E
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
L
E
 
E
F
 
Y
F
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
P
 
P
S
 
A
I
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
S
Q
 
Q
Q
 
I
D
 
P
L
 
L
-
 
R
G
 
D
G
 
S
D
 
S
F
 
F
Y
 
V
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
V
C
 
V
A
 
A
G
 
G
I
|
I
G
|
G
A
 
A
W
|
W
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
I
 
I
A</