SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3718 FitnessBrowser__WCS417:GFF3718 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

O59010 Glutamate transporter homolog; Glt(Ph); Sodium-aspartate symporter Glt(Ph); Sodium-dependent aspartate transporter from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3) (see 3 papers)
33% identity, 95% coverage: 8:412/425 of query aligns to 12:421/425 of O59010

query
sites
O59010
L
 
V
V
 
L
W
 
Q
Q
 
K
I
 
I
M
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
I
A
 
L
G
 
G
I
 
A
A
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
L
L
 
I
L
 
L
H
 
G
Q
 
H
L
 
Y
P
 
G
E
 
Y
S
 
A
R
 
D
P
 
A
W
 
-
L
 
-
V
 
V
D
 
K
N
 
T
L
 
Y
L
 
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
F
G
 
G
D
 
D
I
 
L
F
 
F
I
 
V
K
 
R
L
 
L
M
 
L
K
 
K
M
 
M
I
 
L
V
 
V
V
 
M
P
 
P
I
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
C
x
S
M
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
A
G
 
S
H
 
I
G
 
S
D
 
P
G
 
A
K
 
R
S
 
-
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
G
A
 
V
R
 
K
S
 
I
L
 
V
G
 
V
Y
 
Y
F
 
Y
F
 
L
C
 
L
I
 
T
T
 
S
T
 
A
L
 
F
A
 
A
I
 
V
I
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
I
L
 
M
G
 
A
N
 
R
L
 
L
L
 
F
K
 
N
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
I
H
 
H
A
 
L
A
 
A
S
 
V
I
 
G
T
 
G
L
 
Q
P
 
Q
T
 
F
S
 
Q
S
 
P
G
 
K
A
 
Q
G
 
A
H
 
P
S
 
P
L
 
L
G
 
V
Q
 
K
I
 
I
I
 
L
V
 
L
G
 
D
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
T
N
 
N
V
 
P
I
 
F
S
 
G
A
 
A
M
 
L
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
S
 
Q
L
 
V
L
 
L
S
 
P
V
 
T
L
 
I
F
 
F
F
 
F
A
 
A
V
 
I
M
 
I
F
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
A
V
 
I
A
 
T
R
 
Y
L
 
L
P
 
M
A
 
N
E
 
S
R
 
E
K
 
N
D
 
E
P
 
K
V
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
E
-
 
T
-
 
L
I
 
L
A
 
D
L
 
A
L
 
I
R
 
N
G
 
G
V
 
L
S
 
A
D
 
E
A
 
A
M
 
M
F
 
Y
K
 
K
V
 
I
T
 
V
S
 
N
M
 
G
I
 
V
M
 
M
A
 
Q
Y
 
Y
S
 
A
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
F
 
F
G
 
A
M
 
L
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
T
 
V
V
 
M
A
 
A
N
 
E
F
 
Q
G
 
G
F
 
V
G
 
K
S
 
V
L
 
V
L
 
G
P
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
T
M
 
A
V
 
A
S
 
V
Y
 
Y
V
 
V
S
 
G
I
 
L
A
 
T
F
 
L
F
 
Q
V
 
I
L
 
L
V
 
L
V
 
V
L
 
Y
N
 
F
L
 
V
V
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
I
C
 
Y
G
 
G
I
 
I
N
 
D
L
 
P
F
 
I
A
 
S
L
 
F
M
 
I
R
 
K
H
 
K
I
 
A
K
 
K
D
 
D
E
 
A
L
 
M
I
 
L
L
 
T
A
 
A
F
 
F
S
 
V
T
 
T
A
x
R
S
|
S
S
|
S
A
 
S
S
 
G
V
 
T
M
 
L
P
 
P
Q
 
V
L
 
T
M
 
M
K
 
R
K
 
V
L
 
A
E
 
K
T
 
E
Y
 
M
G
 
G
V
 
I
S
 
S
P
 
E
S
 
G
L
 
I
V
 
Y
S
 
S
F
 
F
V
 
T
V
 
L
P
 
P
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
S
 
T
F
 
I
N
 
N
L
x
M
D
 
D
G
 
G
A
x
T
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
L
 
Q
G
 
G
I
 
V
G
 
C
T
 
T
L
 
F
F
 
F
V
 
I
A
 
A
Q
 
N
L
 
A
Y
 
L
G
 
G
I
 
S
D
 
H
L
 
L
S
 
T
L
 
V
G
 
G
D
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
L
 
T
L
 
I
V
 
V
V
 
L
T
 
T
M
 
A
V
 
V
L
 
L
T
 
A
S
 
S
K
 
I
G
 
G
A
 
T
A
 
A
G
 
G
V
|
V
P
 
P
G
 
G
F
 
A
M
 
G
F
 
A
V
 
I
I
 
M
L
 
L
S
 
A
A
 
M
T
 
V
L
 
L
A
 
E
S
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
E
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
A
G
 
A
I
 
Y
A
 
A
F
 
M
I
 
I
A
 
L
G
 
G
V
 
I
Y
 
D
R
 
A
L
 
I
M
 
L
E
x
D
M
|
M
P
 
G
T
x
R
T
 
T
A
 
M
L
 
V
N
|
N
V
 
V
L
 
T
G
 
G
N
x
D
A
 
L
L
 
T
A
 
G
P
 
T
L
 
A
V
 
I
I
 
V
A
 
A
K
 
K
W
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
E
D
 
L
A
 
E
K
 
K

2nwwA Crystal structure of gltph in complex with tboa (see paper)
33% identity, 94% coverage: 8:407/425 of query aligns to 3:407/407 of 2nwwA

query
sites
2nwwA
L
 
V
V
 
L
W
 
Q
Q
 
K
I
 
I
M
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
I
A
 
L
G
 
G
I
 
A
A
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
L
L
 
I
L
 
L
H
 
G
Q
 
H
L
 
Y
P
 
G
E
 
Y
S
 
A
R
 
H
P
 
A
W
 
-
L
 
-
V
 
V
D
 
H
N
 
T
L
 
Y
L
 
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
F
G
 
G
D
 
D
I
 
L
F
 
F
I
 
V
K
 
R
L
 
L
M
 
L
K
 
K
M
 
M
I
 
L
V
 
V
V
 
M
P
 
P
I
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
C
 
S
M
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
A
G
 
S
H
 
I
G
 
S
D
 
P
G
 
A
K
 
R
S
 
-
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
G
A
 
V
R
 
K
S
 
I
L
 
V
G
 
V
Y
 
Y
F
 
Y
F
 
L
C
 
L
I
 
T
T
 
S
T
 
A
L
 
F
A
 
A
I
 
V
I
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
I
L
 
M
G
 
A
N
 
R
L
 
L
L
 
F
K
 
N
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
I
H
 
H
A
 
L
A
 
A
S
 
V
I
 
G
T
 
G
L
 
Q
P
 
Q
T
 
F
S
 
Q
S
 
P
G
 
H
A
 
Q
G
 
A
H
 
P
S
 
P
L
 
L
G
 
V
Q
 
H
I
 
I
I
 
L
V
 
L
G
 
D
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
T
N
 
N
V
 
P
I
 
F
S
 
G
A
 
A
M
 
L
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
S
 
Q
L
 
V
L
 
L
S
 
P
V
 
T
L
 
I
F
 
F
F
 
F
A
 
A
V
 
I
M
 
I
F
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
A
V
 
I
A
 
T
R
 
Y
L
 
L
P
 
M
A
 
N
E
 
S
R
 
E
K
 
N
D
 
E
P
 
K
V
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
E
-
 
T
-
 
L
I
 
L
A
 
D
L
 
A
L
 
I
R
 
N
G
 
G
V
 
L
S
 
A
D
 
E
A
 
A
M
 
M
F
 
Y
K
 
K
V
 
I
T
 
V
S
 
N
M
 
G
I
 
V
M
 
M
A
 
Q
Y
 
Y
S
 
A
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
F
 
F
G
 
A
M
 
L
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
T
 
V
V
 
M
A
 
A
N
 
E
F
 
Q
G
 
G
F
 
V
G
 
H
S
 
V
L
 
V
L
 
G
P
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
T
M
 
A
V
 
A
S
 
V
Y
 
Y
V
 
V
S
 
G
I
 
L
A
 
T
F
 
L
F
 
Q
V
 
I
L
 
L
V
 
L
V
 
V
L
 
Y
N
 
F
L
 
V
V
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
I
C
 
Y
G
 
G
I
 
I
N
 
D
L
 
P
F
 
I
A
 
S
L
 
F
M
 
I
R
 
K
H
 
H
I
 
A
K
 
K
D
 
D
E
 
A
L
 
M
I
 
L
L
 
T
A
 
A
F
 
F
S
 
V
T
 
T
A
 
R
S
 
S
S
|
S
A
 
S
S
 
G
V
 
T
M
 
L
P
 
P
Q
 
V
L
 
T
M
 
M
K
 
R
K
 
V
L
 
A
E
 
K
T
 
E
Y
 
M
G
 
G
V
 
I
S
 
S
P
 
E
S
 
G
L
 
I
V
 
Y
S
 
S
F
 
F
V
 
T
V
 
L
P
 
P
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
S
 
T
F
 
I
N
 
N
L
 
M
D
 
D
G
 
G
A
x
T
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
L
 
Q
G
 
G
I
 
V
G
 
C
T
 
T
L
 
F
F
 
F
V
 
I
A
 
A
Q
 
N
L
 
A
Y
 
L
G
 
G
I
 
S
D
 
H
L
 
L
S
 
T
L
 
V
G
 
G
D
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
L
 
T
L
 
I
V
 
V
V
 
L
T
 
T
M
 
A
V
 
V
L
 
L
T
 
A
S
 
S
K
 
I
G
 
G
A
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
F
x
A
M
x
G
F
 
A
V
 
I
I
 
M
L
 
L
S
 
A
A
 
M
T
 
V
L
 
L
A
 
H
S
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
E
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
A
G
 
A
I
 
Y
A
 
A
F
 
M
I
 
I
A
 
L
G
 
G
V
 
I
Y
 
D
R
 
A
L
 
I
M
 
L
E
x
D
M
 
M
P
 
G
T
x
R
T
|
T
A
 
M
L
 
V
N
|
N
V
 
V
L
 
T
G
 
G
N
 
D
A
 
L
L
 
T
A
 
G
P
 
T
L
 
A
V
 
I
I
 
V
A
 
A
K
 
K
W
 
T
E
 
E

6bavA Crystal structure of gltph r397c in complex with s-benzyl-l-cysteine (see paper)
33% identity, 94% coverage: 8:408/425 of query aligns to 4:409/409 of 6bavA

query
sites
6bavA
L
 
V
V
 
L
W
 
Q
Q
 
K
I
 
I
M
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
I
A
 
L
G
 
G
I
 
A
A
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
L
L
 
I
L
 
L
H
 
G
Q
 
H
L
 
Y
P
 
G
E
 
Y
S
 
A
R
 
D
P
 
A
W
 
-
L
 
-
V
 
V
D
 
K
N
 
T
L
 
Y
L
 
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
F
G
 
G
D
 
D
I
 
L
F
 
F
I
 
V
K
 
R
L
 
L
M
 
L
K
 
K
M
 
M
I
 
L
V
 
V
V
 
M
P
 
P
I
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
C
 
S
M
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
A
G
 
S
H
 
I
G
 
S
D
 
P
G
 
A
K
 
R
S
 
-
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
G
A
 
V
R
 
K
S
 
I
L
 
V
G
 
V
Y
 
Y
F
 
Y
F
 
L
C
 
L
I
 
T
T
 
S
T
 
A
L
 
F
A
 
A
I
 
V
I
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
I
L
 
M
G
 
A
N
 
R
L
 
L
L
 
F
K
 
N
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
I
H
 
H
A
 
L
A
 
A
S
 
V
I
 
G
T
 
G
L
 
Q
P
 
Q
T
 
F
S
 
Q
S
 
P
G
 
K
A
 
Q
G
 
A
H
 
P
S
 
P
L
 
L
G
 
V
Q
 
K
I
 
I
I
 
L
V
 
L
G
 
D
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
T
N
 
N
V
 
P
I
 
F
S
 
G
A
 
A
M
 
L
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
S
 
Q
L
 
V
L
 
L
S
 
P
V
 
T
L
 
I
F
 
F
F
 
F
A
 
A
V
 
I
M
 
I
F
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
A
V
 
I
A
 
T
R
 
Y
L
 
L
P
 
M
A
 
N
E
 
S
R
 
E
K
 
N
D
 
E
P
 
K
V
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
E
-
 
T
-
 
L
I
 
L
A
 
D
L
 
A
L
 
I
R
 
N
G
 
G
V
 
L
S
 
A
D
 
E
A
 
A
M
 
M
F
 
Y
K
 
K
V
 
I
T
 
V
S
 
N
M
 
G
I
 
V
M
 
M
A
 
Q
Y
 
Y
S
 
A
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
F
 
F
G
 
A
M
 
L
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
T
 
V
V
 
M
A
 
A
N
 
E
F
 
Q
G
 
G
F
 
V
G
 
K
S
 
V
L
 
V
L
 
G
P
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
T
M
 
A
V
 
A
S
 
V
Y
 
Y
V
 
V
S
 
G
I
 
L
A
 
T
F
 
L
F
 
Q
V
 
I
L
 
L
V
 
L
V
 
V
L
 
Y
N
 
F
L
 
V
V
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
I
C
 
Y
G
 
G
I
 
I
N
 
D
L
 
P
F
 
I
A
 
S
L
 
F
M
 
I
R
 
K
H
 
K
I
 
A
K
 
K
D
 
D
E
 
A
L
 
M
I
 
L
L
 
T
A
 
A
F
 
F
S
 
V
T
 
T
A
x
R
S
 
S
S
|
S
A
 
S
S
 
G
V
 
T
M
 
L
P
 
P
Q
 
V
L
 
T
M
 
M
K
 
R
K
 
V
L
 
A
E
 
K
T
 
E
Y
 
M
G
 
G
V
 
I
S
 
S
P
 
E
S
 
G
L
 
I
V
 
Y
S
 
S
F
 
F
V
 
T
V
 
L
P
 
P
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
S
 
T
F
 
I
N
 
N
L
 
M
D
 
D
G
 
G
A
x
T
S
 
A
L
 
L
F
x
Y
L
 
Q
G
 
G
I
 
V
G
 
C
T
 
T
L
 
F
F
 
F
V
 
I
A
 
A
Q
 
N
L
 
A
Y
 
L
G
 
G
I
 
S
D
 
H
L
 
L
S
 
T
L
 
V
G
 
G
D
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
L
 
T
L
 
I
V
 
V
V
 
L
T
 
T
M
 
A
V
 
V
L
 
L
T
 
A
S
 
S
K
 
I
G
 
G
A
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
A
M
 
G
F
 
A
V
 
I
I
 
M
L
 
L
S
 
A
A
 
M
T
 
V
L
 
L
A
 
E
S
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
E
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
A
G
 
A
I
 
Y
A
 
A
F
 
M
I
 
I
A
 
L
G
 
G
V
 
I
Y
x
D
R
 
A
L
 
I
M
 
L
E
x
D
M
 
M
P
 
G
T
x
C
T
|
T
A
 
M
L
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
T
G
 
G
N
 
D
A
 
L
L
 
T
A
 
G
P
 
T
L
 
A
V
 
I
I
 
V
A
 
A
K
 
K
W
 
T
E
 
E
G
 
G

6x15A Inward-facing state of the glutamate transporter homologue gltph in complex with l-aspartate and sodium ions (see paper)
33% identity, 94% coverage: 8:408/425 of query aligns to 12:417/419 of 6x15A

query
sites
6x15A
L
 
V
V
 
L
W
 
Q
Q
 
K
I
 
I
M
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
I
A
 
L
G
 
G
I
 
A
A
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
L
L
 
I
L
 
L
H
 
G
Q
 
H
L
 
Y
P
 
G
E
 
Y
S
 
A
R
 
H
P
 
A
W
 
-
L
 
-
V
 
V
D
 
H
N
 
T
L
 
Y
L
 
V
Q
 
K
P
 
P
A
x
F
G
 
G
D
 
D
I
 
L
F
 
F
I
 
V
K
 
R
L
 
L
M
 
L
K
 
C
M
 
M
I
 
L
V
 
V
V
 
M
P
 
P
I
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
C
 
S
M
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
A
G
 
S
H
 
I
G
 
S
D
x
P
G
 
A
K
 
R
S
 
-
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
G
A
 
V
R
 
K
S
 
I
L
 
V
G
 
V
Y
 
Y
F
x
Y
F
 
L
C
x
L
I
x
T
T
x
S
T
 
A
L
x
F
A
 
A
I
 
V
I
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
I
L
 
M
G
 
A
N
 
R
L
 
L
L
 
F
K
 
N
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
I
H
 
H
A
 
L
A
 
A
S
 
V
I
 
G
T
 
G
L
 
Q
P
 
Q
T
 
F
S
 
Q
S
 
P
G
 
H
A
 
Q
G
 
A
H
 
P
S
 
P
L
|
L
G
 
V
Q
 
H
I
|
I
I
 
L
V
 
L
G
 
D
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
T
N
 
N
V
 
P
I
 
F
S
 
G
A
 
A
M
 
L
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
S
 
Q
L
 
V
L
 
L
S
 
P
V
 
T
L
 
I
F
 
F
F
 
F
A
 
A
V
x
I
M
 
I
F
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
A
V
 
I
A
 
T
R
x
Y
L
 
L
P
 
M
A
 
N
E
 
S
R
 
E
K
 
N
D
 
E
P
 
K
V
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
E
-
 
T
-
 
L
I
 
L
A
 
D
L
 
A
L
 
I
R
 
N
G
 
G
V
 
L
S
 
A
D
 
E
A
 
A
M
 
M
F
 
Y
K
|
K
V
 
I
T
 
V
S
 
N
M
x
G
I
 
V
M
 
M
A
 
Q
Y
 
Y
S
 
A
P
 
P
I
|
I
G
 
G
V
 
V
F
|
F
G
 
A
M
 
L
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
T
 
V
V
 
M
A
 
A
N
 
E
F
 
Q
G
 
G
F
 
V
G
 
H
S
 
V
L
 
V
L
 
G
P
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
T
M
 
A
V
 
A
S
 
V
Y
 
Y
V
 
V
S
 
G
I
 
L
A
 
T
F
 
L
F
 
Q
V
 
I
L
 
L
V
 
L
V
 
V
L
 
Y
N
 
F
L
 
V
V
x
L
A
 
L
R
 
K
L
 
I
C
 
Y
G
 
G
I
 
I
N
 
D
L
 
P
F
 
I
A
 
S
L
 
F
M
x
I
R
 
K
H
 
H
I
 
A
K
 
K
D
 
D
E
 
A
L
x
M
I
 
L
L
 
T
A
 
A
F
 
F
S
 
V
T
 
T
A
 
R
S
|
S
S
|
S
A
 
S
S
 
G
V
 
T
M
 
L
P
 
P
Q
 
V
L
 
T
M
 
M
K
 
R
K
 
V
L
 
A
E
 
K
T
 
E
Y
 
M
G
 
G
V
 
I
S
 
S
P
 
E
S
 
G
L
 
I
V
 
Y
S
 
S
F
 
F
V
 
T
V
 
L
P
 
P
V
 
L
G
|
G
Y
 
A
S
x
T
F
 
I
N
|
N
L
x
M
D
|
D
G
 
G
A
x
T
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
L
 
Q
G
 
G
I
 
V
G
 
A
T
 
T
L
 
F
F
 
F
V
 
I
A
 
A
Q
 
N
L
 
A
Y
 
L
G
 
G
I
 
S
D
 
H
L
 
L
S
x
T
L
x
V
G
|
G
D
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
L
x
T
L
 
I
V
 
V
V
x
L
T
 
T
M
 
A
V
 
V
L
 
L
T
 
A
S
|
S
K
x
I
G
 
G
A
x
T
A
 
A
G
|
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
F
x
A
M
x
G
F
 
A
V
 
I
I
 
M
L
 
L
S
 
C
A
 
M
T
 
V
L
 
L
A
 
H
S
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
E
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
A
G
 
A
I
 
Y
A
 
A
F
 
M
I
 
I
A
 
L
G
 
G
V
 
I
Y
 
D
R
 
A
L
 
I
M
 
L
E
x
D
M
 
M
P
 
G
T
x
R
T
|
T
A
x
M
L
 
V
N
|
N
V
|
V
L
 
T
G
 
G
N
x
D
A
 
L
L
 
T
A
 
G
P
 
T
L
 
A
V
 
I
I
 
V
A
 
A
K
 
K
W
 
T
E
 
E
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6bauA Crystal structure of gltph r397c in complex with l-cysteine (see paper)
32% identity, 94% coverage: 8:407/425 of query aligns to 4:408/408 of 6bauA

query
sites
6bauA
L
 
V
V
 
L
W
 
Q
Q
 
K
I
 
I
M
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
I
A
 
L
G
 
G
I
 
A
A
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
L
L
 
I
L
 
L
H
 
G
Q
 
H
L
 
Y
P
 
G
E
 
Y
S
 
A
R
 
D
P
 
A
W
 
-
L
 
-
V
 
V
D
 
K
N
 
T
L
 
Y
L
 
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
F
G
 
G
D
 
D
I
 
L
F
 
F
I
 
V
K
 
R
L
 
L
M
 
L
K
 
K
M
 
M
I
 
L
V
 
V
V
 
M
P
 
P
I
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
C
 
S
M
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
A
G
 
S
H
 
I
G
 
S
D
 
P
G
 
A
K
 
R
S
 
-
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
G
A
 
V
R
 
K
S
 
I
L
 
V
G
 
V
Y
 
Y
F
 
Y
F
 
L
C
 
L
I
 
T
T
 
S
T
 
A
L
 
F
A
 
A
I
 
V
I
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
I
L
 
M
G
 
A
N
 
R
L
 
L
L
 
F
K
 
N
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
I
H
 
H
A
 
L
A
 
A
S
 
V
I
 
G
T
 
G
L
 
Q
P
 
Q
T
 
F
S
 
Q
S
 
P
G
 
K
A
 
Q
G
 
A
H
 
P
S
 
P
L
 
L
G
 
V
Q
 
K
I
 
I
I
 
L
V
 
L
G
 
D
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
T
N
 
N
V
 
P
I
 
F
S
 
G
A
 
A
M
 
L
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
S
 
Q
L
 
V
L
 
L
S
 
P
V
 
T
L
 
I
F
 
F
F
 
F
A
 
A
V
 
I
M
 
I
F
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
A
V
 
I
A
 
T
R
 
Y
L
 
L
P
 
M
A
 
N
E
 
S
R
 
E
K
 
N
D
 
E
P
 
K
V
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
E
-
 
T
-
 
L
I
 
L
A
 
D
L
 
A
L
 
I
R
 
N
G
 
G
V
 
L
S
 
A
D
 
E
A
 
A
M
 
M
F
 
Y
K
 
K
V
 
I
T
 
V
S
 
N
M
 
G
I
 
V
M
 
M
A
 
Q
Y
 
Y
S
 
A
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
F
 
F
G
 
A
M
 
L
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
T
 
V
V
 
M
A
 
A
N
 
E
F
 
Q
G
 
G
F
 
V
G
 
K
S
 
V
L
 
V
L
 
G
P
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
T
M
 
A
V
 
A
S
 
V
Y
 
Y
V
 
V
S
 
G
I
 
L
A
 
T
F
 
L
F
 
Q
V
 
I
L
 
L
V
 
L
V
 
V
L
 
Y
N
 
F
L
 
V
V
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
I
C
 
Y
G
 
G
I
 
I
N
 
D
L
 
P
F
 
I
A
 
S
L
 
F
M
 
I
R
 
K
H
 
K
I
 
A
K
 
K
D
 
D
E
 
A
L
 
M
I
 
L
L
 
T
A
 
A
F
 
F
S
 
V
T
 
T
A
 
R
S
 
S
S
|
S
A
 
S
S
 
G
V
 
T
M
 
L
P
 
P
Q
 
V
L
 
T
M
 
M
K
 
R
K
 
V
L
 
A
E
 
K
T
 
E
Y
 
M
G
 
G
V
 
I
S
 
S
P
 
E
S
 
G
L
 
I
V
 
Y
S
 
S
F
 
F
V
 
T
V
 
L
P
 
P
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
S
 
T
F
 
I
N
 
N
L
x
M
D
 
D
G
 
G
A
x
T
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
L
 
Q
G
 
G
I
 
V
G
 
C
T
 
T
L
 
F
F
 
F
V
 
I
A
 
A
Q
 
N
L
 
A
Y
 
L
G
 
G
I
 
S
D
 
H
L
 
L
S
 
T
L
 
V
G
 
G
D
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
L
 
T
L
 
I
V
 
V
V
 
L
T
 
T
M
 
A
V
 
V
L
 
L
T
 
A
S
 
S
K
 
I
G
 
G
A
 
T
A
|
A
G
|
G
V
|
V
P
 
P
G
 
G
F
 
A
M
x
G
F
 
A
V
 
I
I
 
M
L
 
L
S
 
A
A
 
M
T
 
V
L
 
L
A
 
E
S
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
E
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
A
G
 
A
I
 
Y
A
 
A
F
 
M
I
 
I
A
 
L
G
 
G
V
 
I
Y
 
D
R
 
A
L
 
I
M
 
L
E
x
D
M
 
M
P
 
G
T
x
C
T
|
T
A
 
M
L
 
V
N
|
N
V
 
V
L
 
T
G
 
G
N
 
D
A
 
L
L
 
T
A
 
G
P
 
T
L
 
A
V
 
I
I
 
V
A
 
A
K
 
K
W
 
T
E
 
E

6x14A Inward-facing state of the glutamate transporter homologue gltph in complex with tfb-tboa (see paper)
32% identity, 94% coverage: 8:407/425 of query aligns to 9:413/413 of 6x14A

query
sites
6x14A
L
 
V
V
 
L
W
 
Q
Q
 
K
I
|
I
M
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
I
A
 
L
G
 
G
I
 
A
A
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
L
L
 
I
L
 
L
H
 
G
Q
 
H
L
 
Y
P
 
G
E
 
Y
S
 
A
R
 
H
P
 
A
W
 
-
L
 
-
V
 
V
D
 
H
N
 
T
L
 
Y
L
 
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
F
G
 
G
D
 
D
I
 
L
F
 
F
I
 
V
K
 
R
L
 
L
M
 
L
K
 
C
M
 
M
I
 
L
V
 
V
V
 
M
P
 
P
I
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
C
 
S
M
 
L
V
 
V
V
 
V
G
|
G
I
 
A
A
 
A
G
 
S
H
 
I
G
 
S
D
 
P
G
 
A
K
 
R
S
 
-
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
G
A
 
V
R
 
K
S
 
I
L
x
V
G
 
V
Y
 
Y
F
 
Y
F
 
L
C
 
L
I
 
T
T
 
S
T
 
A
L
 
F
A
 
A
I
 
V
I
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
I
L
 
M
G
 
A
N
 
R
L
 
L
L
 
F
K
 
N
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
I
H
 
H
A
 
L
A
 
A
S
 
V
I
 
G
T
 
G
L
 
Q
P
 
Q
T
 
F
S
 
Q
S
 
P
G
 
H
A
 
Q
G
 
A
H
 
P
S
 
P
L
 
L
G
 
V
Q
 
H
I
 
I
I
 
L
V
 
L
G
 
D
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
T
N
 
N
V
 
P
I
 
F
S
 
G
A
 
A
M
 
L
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
S
 
Q
L
 
V
L
 
L
S
 
P
V
 
T
L
 
I
F
 
F
F
 
F
A
 
A
V
 
I
M
x
I
F
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
A
V
 
I
A
 
T
R
x
Y
L
 
L
P
 
M
A
 
N
E
 
S
R
 
E
K
 
N
D
 
E
P
 
K
V
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
E
-
 
T
-
 
L
I
 
L
A
 
D
L
 
A
L
 
I
R
 
N
G
 
G
V
 
L
S
 
A
D
 
E
A
 
A
M
 
M
F
 
Y
K
|
K
V
 
I
T
 
V
S
 
N
M
 
G
I
 
V
M
|
M
A
 
Q
Y
 
Y
S
 
A
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
F
 
F
G
 
A
M
 
L
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
T
 
V
V
 
M
A
 
A
N
 
E
F
 
Q
G
 
G
F
 
V
G
 
H
S
 
V
L
 
V
L
 
G
P
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
T
M
 
A
V
 
A
S
 
V
Y
 
Y
V
 
V
S
 
G
I
 
L
A
 
T
F
 
L
F
 
Q
V
 
I
L
 
L
V
 
L
V
 
V
L
 
Y
N
 
F
L
 
V
V
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
I
C
 
Y
G
 
G
I
 
I
N
 
D
L
 
P
F
 
I
A
 
S
L
 
F
M
 
I
R
 
K
H
 
H
I
 
A
K
 
K
D
 
D
E
 
A
L
 
M
I
 
L
L
 
T
A
 
A
F
 
F
S
 
V
T
 
T
A
 
R
S
 
S
S
|
S
A
 
S
S
 
G
V
 
T
M
 
L
P
 
P
Q
 
V
L
 
T
M
 
M
K
 
R
K
 
V
L
 
A
E
 
K
T
 
E
Y
 
M
G
 
G
V
 
I
S
 
S
P
 
E
S
 
G
L
 
I
V
 
Y
S
 
S
F
 
F
V
 
T
V
 
L
P
 
P
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
S
x
T
F
x
I
N
 
N
L
 
M
D
 
D
G
 
G
A
x
T
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
L
 
Q
G
 
G
I
 
V
G
 
A
T
 
T
L
 
F
F
 
F
V
 
I
A
 
A
Q
 
N
L
 
A
Y
 
L
G
 
G
I
 
S
D
 
H
L
 
L
S
 
T
L
 
V
G
 
G
D
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
L
 
T
L
 
I
V
 
V
V
 
L
T
 
T
M
 
A
V
 
V
L
 
L
T
 
A
S
 
S
K
x
I
G
 
G
A
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
A
M
x
G
F
 
A
V
 
I
I
 
M
L
 
L
S
 
C
A
 
M
T
 
V
L
 
L
A
 
H
S
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
E
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
A
G
 
A
I
 
Y
A
 
A
F
 
M
I
 
I
A
x
L
G
 
G
V
 
I
Y
 
D
R
 
A
L
 
I
M
 
L
E
x
D
M
 
M
P
 
G
T
x
R
T
 
T
A
 
M
L
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
T
G
 
G
N
 
D
A
 
L
L
 
T
A
 
G
P
 
T
L
 
A
V
 
I
I
 
V
A
 
A
K
 
K
W
 
T
E
 
E

Sites not aligning to the query:

6zgbA Glutamate transporter homologue glttk in complex with a photo cage compound (see paper)
33% identity, 94% coverage: 8:407/425 of query aligns to 8:414/425 of 6zgbA

query
sites
6zgbA
L
 
V
V
 
L
W
 
W
Q
 
K
I
 
I
M
 
L
I
 
W
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
L
G
 
G
I
 
A
A
 
V
I
 
F
G
 
G
A
 
L
L
 
I
L
 
A
H
 
G
Q
 
H
L
 
F
P
 
G
E
 
Y
S
 
A
R
 
G
P
 
A
W
 
-
L
 
-
V
 
V
D
 
K
N
 
T
L
 
Y
L
 
I
Q
 
K
P
 
P
A
 
F
G
 
G
D
 
D
I
 
L
F
 
F
I
 
V
K
 
R
L
 
L
M
 
L
K
 
K
M
 
M
I
 
L
V
 
V
V
 
M
P
 
P
I
 
I
V
 
V
F
 
L
A
 
A
C
 
S
M
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
A
G
 
S
H
 
I
G
 
S
D
 
P
G
 
A
K
 
R
S
 
-
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
G
A
 
V
R
 
K
S
 
I
L
 
V
G
 
V
Y
 
Y
F
 
Y
F
 
L
C
 
A
I
 
T
T
 
S
T
 
A
L
 
M
A
 
A
I
 
V
I
 
F
V
 
F
G
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
G
N
 
R
L
 
L
L
 
F
K
 
N
P
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
N
T
 
V
E
 
N
L
 
L
S
 
G
S
 
S
L
 
G
H
 
T
A
 
G
A
 
K
S
 
A
I
 
I
T
 
-
L
 
-
P
 
-
T
 
-
S
 
-
S
 
E
G
 
A
A
 
Q
G
 
P
H
 
P
S
 
S
L
 
L
G
 
V
Q
 
Q
I
 
T
I
 
L
V
 
L
G
 
N
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
T
N
 
N
V
 
P
I
 
F
S
 
A
A
 
S
M
 
L
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
S
 
E
L
 
V
L
 
L
S
 
P
V
 
V
L
 
I
F
 
F
F
 
F
A
 
A
V
 
I
M
 
I
F
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
A
V
 
I
A
 
T
R
 
Y
L
 
L
P
 
M
A
 
N
E
 
R
R
 
N
K
 
E
D
 
E
P
 
R
V
 
V
I
 
R
-
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
-
 
V
-
 
F
-
 
D
G
 
G
V
 
L
S
 
A
D
 
E
A
 
A
M
 
M
F
 
Y
K
 
L
V
 
I
T
 
V
S
 
G
M
 
G
I
 
V
M
 
M
A
 
Q
Y
 
Y
S
 
A
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
F
 
F
G
 
A
M
 
L
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
T
 
V
V
 
M
A
 
A
N
 
E
F
 
Q
G
 
G
F
 
V
G
 
R
S
 
V
L
 
V
L
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
V
M
 
G
V
 
A
S
 
V
Y
 
Y
V
 
T
S
 
G
I
 
L
A
 
F
F
 
L
F
 
Q
V
 
I
L
 
V
V
 
I
V
 
T
L
 
Y
N
 
F
L
 
I
V
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
V
C
 
F
G
 
G
I
 
I
N
 
D
L
 
P
F
 
I
A
 
K
L
 
F
M
 
I
R
 
R
H
 
K
I
 
A
K
 
K
D
 
D
E
 
A
L
 
M
I
 
I
L
 
T
A
 
A
F
 
F
S
 
V
T
 
T
A
x
R
S
|
S
S
|
S
A
 
S
S
 
G
V
 
T
M
 
L
P
 
P
Q
 
V
L
 
T
M
 
M
K
 
R
-
 
V
K
 
A
L
 
E
E
 
E
T
 
E
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
D
P
 
K
S
 
G
L
 
I
V
 
F
S
 
S
F
 
F
V
 
T
V
 
L
P
 
P
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
S
 
T
F
 
I
N
 
N
L
x
M
D
 
D
G
 
G
A
 
T
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
L
 
Q
G
 
G
I
 
V
G
 
T
T
 
V
L
 
L
F
 
F
V
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
A
Y
 
I
G
 
G
I
 
H
D
 
P
L
 
L
S
 
T
L
 
L
G
 
G
D
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
L
 
V
L
 
V
V
 
V
V
 
L
T
 
T
M
 
A
V
 
V
L
 
L
T
 
A
S
 
S
K
 
I
G
 
G
A
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
A
M
 
G
F
 
A
V
 
I
I
 
M
L
 
L
S
 
A
A
 
M
T
 
V
L
 
L
A
 
Q
S
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
D
L
 
L
E
 
T
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
L
G
 
A
I
 
Y
A
 
A
F
 
M
I
 
I
A
 
L
G
 
G
V
 
I
Y
 
D
R
 
A
L
 
I
M
 
L
E
x
D
M
 
M
P
 
G
T
x
R
T
|
T
A
 
M
L
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
T
G
 
G
N
 
D
A
 
L
L
 
A
A
 
G
P
 
T
L
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
A
K
 
K
W
 
T
E
 
E

6zl4A The structure of glutamate transporter homologue glttk in complex with the photo switchable compound (cis) (see paper)
33% identity, 94% coverage: 8:407/425 of query aligns to 7:413/424 of 6zl4A

query
sites
6zl4A
L
 
V
V
 
L
W
 
W
Q
 
K
I
 
I
M
 
L
I
 
W
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
L
G
 
G
I
 
A
A
 
V
I
 
F
G
 
G
A
 
L
L
 
I
L
 
A
H
 
G
Q
 
H
L
 
F
P
 
G
E
 
Y
S
 
A
R
 
G
P
 
A
W
 
-
L
 
-
V
 
V
D
 
K
N
 
T
L
 
Y
L
 
I
Q
 
K
P
 
P
A
 
F
G
 
G
D
 
D
I
 
L
F
 
F
I
 
V
K
 
R
L
 
L
M
 
L
K
 
K
M
 
M
I
 
L
V
 
V
V
 
M
P
 
P
I
 
I
V
 
V
F
 
L
A
 
A
C
 
S
M
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
A
G
 
S
H
 
I
G
 
S
D
 
P
G
 
A
K
 
R
S
 
-
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
G
A
 
V
R
 
K
S
 
I
L
 
V
G
 
V
Y
 
Y
F
 
Y
F
 
L
C
 
A
I
 
T
T
 
S
T
 
A
L
 
M
A
 
A
I
 
V
I
 
F
V
 
F
G
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
G
N
 
R
L
 
L
L
 
F
K
 
N
P
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
N
T
 
V
E
 
N
L
 
L
S
 
G
S
 
S
L
 
G
H
 
T
A
 
G
A
 
K
S
 
A
I
 
I
T
 
-
L
 
-
P
 
-
T
 
-
S
 
-
S
 
E
G
 
A
A
 
Q
G
 
P
H
 
P
S
 
S
L
 
L
G
 
V
Q
 
Q
I
 
T
I
 
L
V
 
L
G
 
N
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
T
N
 
N
V
 
P
I
 
F
S
 
A
A
 
S
M
 
L
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
S
 
E
L
 
V
L
 
L
S
 
P
V
 
V
L
 
I
F
 
F
F
 
F
A
 
A
V
 
I
M
 
I
F
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
A
V
 
I
A
 
T
R
 
Y
L
 
L
P
 
M
A
 
N
E
 
R
R
 
N
K
 
E
D
 
E
P
 
R
V
 
V
I
 
R
-
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
-
 
V
-
 
F
-
 
D
G
 
G
V
 
L
S
 
A
D
 
E
A
 
A
M
 
M
F
 
Y
K
x
L
V
 
I
T
 
V
S
 
G
M
x
G
I
 
V
M
 
M
A
 
Q
Y
 
Y
S
 
A
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
F
 
F
G
 
A
M
 
L
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
T
 
V
V
 
M
A
 
A
N
 
E
F
 
Q
G
 
G
F
 
V
G
 
R
S
 
V
L
 
V
L
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
V
M
 
G
V
 
A
S
 
V
Y
 
Y
V
 
T
S
 
G
I
 
L
A
 
F
F
 
L
F
 
Q
V
 
I
L
 
V
V
 
I
V
 
T
L
 
Y
N
 
F
L
 
I
V
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
V
C
 
F
G
 
G
I
 
I
N
 
D
L
 
P
F
 
I
A
 
K
L
 
F
M
 
I
R
 
R
H
 
K
I
 
A
K
 
K
D
 
D
E
 
A
L
 
M
I
 
I
L
 
T
A
 
A
F
 
F
S
 
V
T
 
T
A
x
R
S
|
S
S
|
S
A
 
S
S
 
G
V
 
T
M
 
L
P
 
P
Q
 
V
L
 
T
M
 
M
K
x
R
-
 
V
K
 
A
L
 
E
E
 
E
T
 
E
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
D
P
 
K
S
 
G
L
 
I
V
 
F
S
 
S
F
 
F
V
 
T
V
 
L
P
 
P
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
S
 
T
F
 
I
N
 
N
L
x
M
D
 
D
G
 
G
A
x
T
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
L
 
Q
G
 
G
I
 
V
G
 
T
T
 
V
L
 
L
F
 
F
V
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
A
Y
 
I
G
 
G
I
 
H
D
 
P
L
 
L
S
 
T
L
 
L
G
 
G
D
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
L
 
V
L
 
V
V
 
V
V
 
L
T
 
T
M
 
A
V
 
V
L
 
L
T
 
A
S
 
S
K
 
I
G
 
G
A
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
|
G
F
x
A
M
 
G
F
 
A
V
 
I
I
 
M
L
 
L
S
 
A
A
 
M
T
 
V
L
 
L
A
 
Q
S
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
D
L
 
L
E
 
T
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
L
G
 
A
I
 
Y
A
 
A
F
 
M
I
 
I
A
 
L
G
 
G
V
 
I
Y
 
D
R
 
A
L
 
I
M
 
L
E
 
D
M
 
M
P
 
G
T
x
R
T
|
T
A
 
M
L
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
T
G
 
G
N
 
D
A
 
L
L
 
A
A
 
G
P
 
T
L
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
A
K
 
K
W
 
T
E
 
E

Sites not aligning to the query:

6xwnB Structure of glutamate transporter homologue glttk in the presence of tboa inhibitor (see paper)
33% identity, 94% coverage: 8:407/425 of query aligns to 10:416/426 of 6xwnB

query
sites
6xwnB
L
 
V
V
 
L
W
 
W
Q
 
K
I
 
I
M
 
L
I
 
W
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
L
G
 
G
I
 
A
A
 
V
I
 
F
G
 
G
A
 
L
L
 
I
L
 
A
H
 
G
Q
 
H
L
 
F
P
 
G
E
 
Y
S
 
A
R
 
G
P
 
A
W
 
-
L
 
-
V
 
V
D
 
K
N
 
T
L
 
Y
L
 
I
Q
 
K
P
 
P
A
 
F
G
 
G
D
 
D
I
 
L
F
 
F
I
 
V
K
 
R
L
 
L
M
 
L
K
 
K
M
 
M
I
 
L
V
 
V
V
 
M
P
 
P
I
 
I
V
 
V
F
 
L
A
 
A
C
 
S
M
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
A
G
 
S
H
 
I
G
 
S
D
 
P
G
 
A
K
 
R
S
 
-
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
G
A
 
V
R
 
K
S
 
I
L
 
V
G
 
V
Y
 
Y
F
 
Y
F
 
L
C
 
A
I
 
T
T
 
S
T
 
A
L
 
M
A
 
A
I
 
V
I
 
F
V
 
F
G
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
G
N
 
R
L
 
L
L
 
F
K
 
N
P
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
N
T
 
V
E
 
N
L
 
L
S
 
G
S
 
S
L
 
G
H
 
T
A
 
G
A
 
K
S
 
A
I
 
I
T
 
-
L
 
-
P
 
-
T
 
-
S
 
-
S
 
E
G
 
A
A
 
Q
G
 
P
H
 
P
S
 
S
L
 
L
G
 
V
Q
 
Q
I
 
T
I
 
L
V
 
L
G
 
N
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
T
N
 
N
V
 
P
I
 
F
S
 
A
A
 
S
M
 
L
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
S
 
E
L
 
V
L
 
L
S
 
P
V
 
V
L
 
I
F
 
F
F
 
F
A
 
A
V
 
I
M
 
I
F
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
A
V
 
I
A
 
T
R
 
Y
L
 
L
P
 
M
A
 
N
E
 
R
R
 
N
K
 
E
D
 
E
P
 
R
V
 
V
I
 
R
-
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
-
 
V
-
 
F
-
 
D
G
 
G
V
 
L
S
 
A
D
 
E
A
 
A
M
 
M
F
 
Y
K
 
L
V
 
I
T
 
V
S
 
G
M
 
G
I
 
V
M
 
M
A
 
Q
Y
 
Y
S
 
A
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
F
 
F
G
 
A
M
 
L
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
T
 
V
V
 
M
A
 
A
N
 
E
F
 
Q
G
 
G
F
 
V
G
 
R
S
 
V
L
 
V
L
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
V
M
 
G
V
 
A
S
 
V
Y
 
Y
V
 
T
S
 
G
I
 
L
A
 
F
F
 
L
F
 
Q
V
 
I
L
 
V
V
 
I
V
 
T
L
 
Y
N
 
F
L
 
I
V
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
V
C
 
F
G
 
G
I
 
I
N
 
D
L
 
P
F
 
I
A
 
K
L
 
F
M
 
I
R
 
R
H
 
K
I
 
A
K
 
K
D
 
D
E
 
A
L
 
M
I
 
I
L
 
T
A
 
A
F
 
F
S
 
V
T
 
T
A
 
R
S
|
S
S
|
S
A
 
S
S
 
G
V
 
T
M
 
L
P
 
P
Q
 
V
L
 
T
M
 
M
K
 
R
-
 
V
K
 
A
L
 
E
E
 
E
T
 
E
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
D
P
 
K
S
 
G
L
 
I
V
 
F
S
 
S
F
 
F
V
 
T
V
 
L
P
 
P
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
S
 
T
F
 
I
N
 
N
L
x
M
D
 
D
G
 
G
A
x
T
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
L
 
Q
G
 
G
I
 
V
G
 
T
T
 
V
L
 
L
F
 
F
V
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
A
Y
 
I
G
 
G
I
 
H
D
 
P
L
 
L
S
 
T
L
 
L
G
 
G
D
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
L
 
V
L
 
V
V
 
V
V
 
L
T
 
T
M
 
A
V
 
V
L
 
L
T
 
A
S
 
S
K
 
I
G
 
G
A
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
A
M
 
G
F
 
A
V
 
I
I
 
M
L
 
L
S
 
A
A
 
M
T
 
V
L
 
L
A
 
Q
S
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
D
L
 
L
E
 
T
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
L
G
 
A
I
 
Y
A
 
A
F
 
M
I
 
I
A
 
L
G
 
G
V
 
I
Y
 
D
R
 
A
L
 
I
M
 
L
E
x
D
M
 
M
P
 
G
T
x
R
T
 
T
A
 
M
L
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
T
G
 
G
N
 
D
A
 
L
L
 
A
A
 
G
P
 
T
L
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
A
K
 
K
W
 
T
E
 
E

5e9sA Crystal structure of substrate-bound glutamate transporter homologue glttk (see paper)
33% identity, 94% coverage: 8:407/425 of query aligns to 10:416/427 of 5e9sA

query
sites
5e9sA
L
 
V
V
 
L
W
 
W
Q
 
K
I
 
I
M
 
L
I
 
W
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
L
G
 
G
I
 
A
A
 
V
I
 
F
G
 
G
A
 
L
L
 
I
L
 
A
H
 
G
Q
 
H
L
 
F
P
 
G
E
 
Y
S
 
A
R
 
G
P
 
A
W
 
-
L
 
-
V
 
V
D
 
K
N
 
T
L
 
Y
L
 
I
Q
 
K
P
 
P
A
 
F
G
 
G
D
 
D
I
 
L
F
 
F
I
 
V
K
 
R
L
 
L
M
 
L
K
 
K
M
 
M
I
 
L
V
 
V
V
 
M
P
 
P
I
 
I
V
 
V
F
 
L
A
 
A
C
 
S
M
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
A
G
 
S
H
 
I
G
 
S
D
 
P
G
 
A
K
 
R
S
 
-
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
G
A
 
V
R
 
K
S
 
I
L
 
V
G
 
V
Y
 
Y
F
x
Y
F
 
L
C
 
A
I
x
T
T
x
S
T
 
A
L
 
M
A
 
A
I
 
V
I
 
F
V
 
F
G
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
G
N
 
R
L
 
L
L
 
F
K
 
N
P
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
N
T
 
V
E
 
N
L
 
L
S
 
G
S
 
S
L
 
G
H
 
T
A
 
G
A
 
K
S
 
A
I
 
I
T
 
-
L
 
-
P
 
-
T
 
-
S
 
-
S
 
E
G
 
A
A
 
Q
G
 
P
H
 
P
S
 
S
L
 
L
G
 
V
Q
 
Q
I
 
T
I
 
L
V
 
L
G
 
N
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
T
N
 
N
V
 
P
I
 
F
S
 
A
A
 
S
M
 
L
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
S
 
E
L
 
V
L
 
L
S
 
P
V
 
V
L
 
I
F
 
F
F
 
F
A
 
A
V
 
I
M
 
I
F
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
A
V
 
I
A
 
T
R
 
Y
L
 
L
P
 
M
A
 
N
E
 
R
R
 
N
K
 
E
D
 
E
P
 
R
V
 
V
I
 
R
-
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
-
 
V
-
 
F
-
 
D
G
 
G
V
 
L
S
 
A
D
 
E
A
 
A
M
 
M
F
 
Y
K
x
L
V
 
I
T
 
V
S
 
G
M
x
G
I
 
V
M
 
M
A
 
Q
Y
|
Y
S
 
A
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
F
 
F
G
 
A
M
 
L
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
T
 
V
V
 
M
A
 
A
N
 
E
F
 
Q
G
 
G
F
 
V
G
 
R
S
 
V
L
 
V
L
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
V
M
 
G
V
 
A
S
 
V
Y
 
Y
V
 
T
S
 
G
I
 
L
A
 
F
F
 
L
F
 
Q
V
 
I
L
 
V
V
 
I
V
 
T
L
 
Y
N
 
F
L
 
I
V
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
V
C
 
F
G
 
G
I
 
I
N
 
D
L
 
P
F
 
I
A
 
K
L
 
F
M
 
I
R
 
R
H
 
K
I
 
A
K
 
K
D
 
D
E
 
A
L
 
M
I
 
I
L
 
T
A
 
A
F
 
F
S
 
V
T
 
T
A
x
R
S
|
S
S
|
S
A
 
S
S
 
G
V
 
T
M
 
L
P
 
P
Q
 
V
L
 
T
M
 
M
K
 
R
-
 
V
K
 
A
L
 
E
E
 
E
T
 
E
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
D
P
 
K
S
 
G
L
 
I
V
 
F
S
 
S
F
 
F
V
 
T
V
 
L
P
 
P
V
 
L
G
|
G
Y
x
A
S
x
T
F
 
I
N
|
N
L
x
M
D
|
D
G
 
G
A
x
T
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
L
 
Q
G
 
G
I
 
V
G
 
T
T
 
V
L
 
L
F
 
F
V
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
A
Y
 
I
G
 
G
I
 
H
D
 
P
L
 
L
S
 
T
L
 
L
G
 
G
D
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
L
 
V
L
 
V
V
 
V
V
 
L
T
 
T
M
 
A
V
 
V
L
 
L
T
 
A
S
|
S
K
x
I
G
|
G
A
x
T
A
 
A
G
|
G
V
|
V
P
 
P
G
 
G
F
x
A
M
x
G
F
 
A
V
 
I
I
 
M
L
 
L
S
 
A
A
 
M
T
 
V
L
 
L
A
 
Q
S
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
D
L
 
L
E
 
T
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
L
G
 
A
I
 
Y
A
 
A
F
 
M
I
 
I
A
 
L
G
 
G
V
 
I
Y
 
D
R
 
A
L
 
I
M
 
L
E
x
D
M
 
M
P
 
G
T
x
R
T
|
T
A
 
M
L
 
V
N
|
N
V
|
V
L
 
T
G
 
G
N
x
D
A
 
L
L
 
A
A
 
G
P
 
T
L
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
A
K
 
K
W
 
T
E
 
E

6r7rA Crystal structure of the glutamate transporter homologue glttk in complex with d-aspartate (see paper)
33% identity, 94% coverage: 8:407/425 of query aligns to 3:405/416 of 6r7rA

query
sites
6r7rA
L
 
V
V
 
L
W
 
W
Q
 
K
I
 
I
M
 
L
I
 
W
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
L
G
 
G
I
 
A
A
 
V
I
 
F
G
 
G
A
 
L
L
 
I
L
 
A
H
 
G
Q
x
H
L
 
F
P
 
G
E
 
Y
S
 
A
R
 
G
P
 
A
W
 
-
L
 
-
V
 
V
D
 
K
N
 
T
L
 
Y
L
 
I
Q
 
K
P
 
P
A
 
F
G
 
G
D
 
D
I
 
L
F
 
F
I
 
V
K
 
R
L
 
L
M
 
L
K
 
K
M
 
M
I
 
L
V
 
V
V
 
M
P
 
P
I
 
I
V
 
V
F
 
L
A
 
A
C
 
S
M
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
A
G
 
S
H
 
I
G
 
S
D
 
P
G
 
A
K
 
R
S
 
-
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
G
A
 
V
R
 
K
S
 
I
L
 
V
G
 
V
Y
 
Y
F
 
Y
F
 
L
C
 
A
I
 
T
T
 
S
T
 
A
L
 
M
A
 
A
I
 
V
I
 
F
V
 
F
G
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
G
N
 
R
L
 
L
L
 
F
K
 
N
P
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
N
T
 
V
E
 
N
L
 
L
S
 
G
S
 
S
L
 
-
H
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
I
 
-
T
 
-
L
 
-
P
 
-
T
 
-
S
 
G
S
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
Q
H
 
P
-
 
P
S
 
S
L
 
L
G
 
V
Q
 
Q
I
 
T
I
 
L
V
 
L
G
 
N
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
T
N
 
N
V
 
P
I
 
F
S
 
A
A
 
S
M
 
L
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
S
 
E
L
 
V
L
 
L
S
 
P
V
 
V
L
 
I
F
 
F
F
 
F
A
 
A
V
 
I
M
 
I
F
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
A
V
 
I
A
 
T
R
 
Y
L
 
L
P
 
M
A
 
N
E
 
R
R
 
N
K
 
E
D
 
E
P
 
R
V
 
V
I
 
R
-
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
-
 
V
-
 
F
-
 
D
G
 
G
V
 
L
S
 
A
D
 
E
A
 
A
M
 
M
F
 
Y
K
 
L
V
 
I
T
 
V
S
 
G
M
 
G
I
 
V
M
 
M
A
 
Q
Y
 
Y
S
 
A
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
F
 
F
G
 
A
M
 
L
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
T
 
V
V
 
M
A
 
A
N
 
E
F
 
Q
G
 
G
F
 
V
G
 
R
S
 
V
L
x
V
L
 
G
P
 
P
L
 
L
A
|
A
K
 
K
L
 
V
I
 
V
M
 
G
V
 
A
S
 
V
Y
 
Y
V
 
T
S
 
G
I
 
L
A
 
F
F
 
L
F
 
Q
V
 
I
L
 
V
V
 
I
V
 
T
L
 
Y
N
 
F
L
 
I
V
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
V
C
 
F
G
 
G
I
 
I
N
 
D
L
 
P
F
 
I
A
 
K
L
 
F
M
 
I
R
 
R
H
 
K
I
 
A
K
 
K
D
 
D
E
 
A
L
 
M
I
 
I
L
 
T
A
 
A
F
 
F
S
 
V
T
 
T
A
x
R
S
 
S
S
|
S
A
 
S
S
 
G
V
 
T
M
 
L
P
 
P
Q
 
V
L
 
T
M
 
M
K
 
R
-
 
V
K
 
A
L
 
E
E
 
E
T
 
E
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
D
P
 
K
S
 
G
L
 
I
V
 
F
S
 
S
F
 
F
V
 
T
V
 
L
P
 
P
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
S
 
T
F
 
I
N
 
N
L
x
M
D
 
D
G
 
G
A
x
T
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
L
 
Q
G
 
G
I
 
V
G
 
T
T
 
V
L
 
L
F
 
F
V
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
A
Y
 
I
G
 
G
I
 
H
<