SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF377 Psest_0378 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
47% identity, 99% coverage: 4:309/309 of query aligns to 6:312/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
L
 
V
L
 
L
Q
 
M
V
 
M
A
 
C
P
 
P
L
 
M
S
 
S
A
 
T
R
 
Y
L
 
L
D
 
E
R
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
D
S
 
K
R
 
R
Y
 
F
D
 
K
I
 
L
L
 
F
S
 
R
L
 
Y
W
 
W
-
 
T
Q
 
Q
A
 
P
E
 
A
T
 
Q
A
 
R
A
 
D
R
 
F
L
 
L
D
 
A
E
 
L
L
 
Q
A
 
A
D
 
E
A
 
S
I
 
I
E
 
R
V
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
G
G
 
N
S
 
S
R
 
N
F
 
A
G
 
G
C
 
A
S
 
D
A
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
I
A
 
D
R
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
K
L
 
L
K
 
E
A
 
I
I
 
V
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
S
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
P
 
K
I
 
V
D
 
D
V
 
L
P
 
I
A
 
K
A
 
C
Q
 
E
A
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
A
 
R
I
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
D
V
 
V
L
 
L
N
 
T
D
 
D
C
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
M
 
I
G
 
G
L
 
L
I
 
I
I
 
L
D
 
A
G
 
V
R
 
L
R
 
R
Q
 
R
L
 
I
S
 
C
R
 
E
A
 
C
D
 
D
R
 
K
F
 
Y
V
 
V
R
 
R
A
 
R
G
 
G
G
 
A
W
 
W
P
 
K
S
 
F
G
 
G
N
 
D
L
 
F
P
 
K
L
 
L
A
 
T
R
 
T
R
 
K
V
 
F
T
 
S
G
 
G
S
 
K
R
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
H
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
E
G
 
A
F
 
F
S
 
D
M
 
C
P
 
P
V
 
I
R
 
S
Y
 
Y
H
 
F
N
x
S
R
|
R
R
x
S
P
 
K
L
 
K
A
 
P
D
 
N
C
 
T
P
 
N
Y
 
Y
E
 
T
Y
 
Y
A
 
Y
G
 
G
S
 
S
L
 
V
V
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
W
 
N
A
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
V
L
 
V
T
 
A
C
 
C
V
 
P
G
 
L
G
 
T
P
 
P
Q
 
E
T
 
T
R
 
T
G
 
H
L
 
I
V
 
I
S
 
N
R
 
R
E
 
E
V
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
P
V
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
E
L
 
L
V
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
V
A
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
E
 
R
E
 
E
P
 
P
Q
 
E
A
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
K
L
 
L
L
 
F
G
 
G
M
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
 
H
I
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
G
T
 
T
R
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
G
 
K
A
 
V
M
 
M
E
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
E
R
 
A
F
 
H
L
 
F
A
 
S
E
 
G
G
 
K
Q
 
P
L
 
L
V
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
47% identity, 99% coverage: 4:309/309 of query aligns to 4:310/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
L
 
V
L
 
L
Q
 
M
V
 
M
A
 
C
P
 
P
L
 
M
S
 
S
A
 
T
R
 
Y
L
 
L
D
 
E
R
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
D
S
 
K
R
 
R
Y
 
F
D
 
K
I
 
L
L
 
F
S
 
R
L
 
Y
W
 
W
-
 
T
Q
 
Q
A
 
P
E
 
A
T
 
Q
A
 
R
A
 
D
R
 
F
L
 
L
D
 
A
E
 
L
L
 
Q
A
 
A
D
 
E
A
 
S
I
 
I
E
 
R
V
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
G
G
 
N
S
 
S
R
 
N
F
 
A
G
 
G
C
 
A
S
 
D
A
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
I
A
 
D
R
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
K
L
 
L
K
 
E
A
 
I
I
 
V
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
S
V
|
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
P
 
K
I
 
V
D
 
D
V
 
L
P
 
I
A
 
K
A
 
C
Q
 
E
A
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
A
 
R
I
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
D
V
 
V
L
|
L
N
 
T
D
 
D
C
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
M
 
I
G
 
G
L
 
L
I
 
I
I
 
L
D
 
A
G
 
V
R
 
L
R
 
R
Q
 
R
L
 
I
S
 
C
R
 
E
A
 
C
D
 
D
R
 
K
F
 
Y
V
 
V
R
 
R
A
 
R
G
 
G
G
 
A
W
 
W
P
 
K
S
 
F
G
 
G
N
 
D
L
 
F
P
 
K
L
 
L
A
 
T
R
 
T
R
 
K
V
 
F
T
 
S
G
 
G
S
 
K
R
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
H
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
E
G
 
A
F
 
F
S
 
D
M
 
C
P
 
P
V
 
I
R
 
S
Y
 
Y
H
 
F
N
x
S
R
|
R
R
x
S
P
 
K
L
 
K
A
 
P
D
 
N
C
 
T
P
 
N
Y
 
Y
E
 
T
Y
 
Y
A
 
Y
G
 
G
S
 
S
L
 
V
V
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
W
 
N
A
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
V
L
 
V
T
 
A
C
|
C
V
x
P
G
 
L
G
 
T
P
 
P
Q
 
E
T
|
T
R
 
T
G
 
H
L
 
I
V
 
I
S
 
N
R
 
R
E
 
E
V
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
P
V
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
E
L
 
L
V
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
V
A
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
|
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
E
 
R
E
|
E
P
 
P
Q
 
E
A
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
K
L
 
L
L
 
F
G
 
G
M
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
V
G
|
G
S
 
S
A
 
G
T
 
T
R
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
G
 
K
A
 
V
M
 
M
E
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
E
R
 
A
F
 
H
L
 
F
A
 
S
E
 
G
G
 
K
Q
 
P
L
 
L
V
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

5v7nA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and 2-keto-d-gluconic acid (see paper)
42% identity, 97% coverage: 10:309/309 of query aligns to 11:309/319 of 5v7nA

query
sites
5v7nA
L
 
I
S
 
N
A
 
P
R
 
R
L
 
V
D
 
L
R
 
E
E
 
R
L
 
L
A
 
P
S
 
E
R
 
M
Y
 
F
D
 
E
I
 
T
L
 
V
S
 
R
L
 
I
W
 
E
Q
 
R
A
 
A
E
 
D
T
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
V
L
 
T
D
 
A
E
 
D
L
 
M
A
 
R
D
 
D
A
 
V
I
 
S
E
 
G
V
 
I
V
 
A
V
 
V
T
 
S
G
 
G
S
 
K
R
 
-
F
 
-
G
 
-
C
 
L
S
 
P
A
 
V
E
 
P
L
 
L
M
 
M
A
 
D
R
 
A
L
 
F
P
 
P
A
 
S
L
 
L
K
 
E
A
 
I
I
 
V
V
 
A
S
 
N
F
 
F
G
|
G
V
|
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
P
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
P
 
S
A
 
R
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
V
I
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
D
V
 
V
L
|
L
N
 
T
D
 
E
C
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
M
 
I
G
 
G
L
 
L
I
 
L
I
 
L
D
 
N
G
 
T
R
 
L
R
 
R
Q
 
L
L
 
L
S
 
P
R
 
Q
A
 
A
D
 
E
R
 
Q
F
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
G
 
R
W
 
W
P
 
V
-
 
R
S
 
E
G
 
G
N
 
A
L
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
S
R
 
P
-
 
L
R
 
S
V
 
L
T
 
R
G
 
G
S
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
H
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
E
 
E
G
 
A
F
 
F
S
 
G
M
 
V
P
 
S
V
 
I
R
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
R
 
T
P
 
P
L
 
R
A
 
E
D
 
G
C
 
L
P
 
G
Y
 
F
E
 
T
Y
 
Y
A
 
H
G
 
P
S
 
T
L
 
L
V
 
V
E
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
W
 
A
A
 
V
D
 
D
V
 
T
L
 
L
L
 
I
L
 
V
T
 
I
C
x
V
V
x
P
G
 
G
G
 
T
P
 
A
Q
x
S
T
|
T
R
 
L
G
 
K
L
 
A
V
 
V
S
 
N
R
 
A
E
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
|
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
A
 
N
G
 
G
R
 
T
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
E
 
N
E
|
E
P
 
P
Q
 
N
A
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
S
M
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
V
G
x
A
S
|
S
A
 
A
T
 
S
R
 
V
E
 
V
T
 
T
R
|
R
G
 
N
A
 
A
M
 
M
E
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
D
N
 
N
L
 
L
Q
 
K
R
 
A
F
 
W
L
 
F
A
 
S
E
 
T
G
 
G
Q
 
E
L
 
A
V
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

5v6qB Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and malonate (see paper)
42% identity, 97% coverage: 10:309/309 of query aligns to 12:310/319 of 5v6qB

query
sites
5v6qB
L
 
I
S
 
N
A
 
P
R
 
R
L
 
V
D
 
L
R
 
E
E
 
R
L
 
L
A
 
P
S
 
E
R
 
M
Y
 
F
D
 
E
I
 
T
L
 
V
S
 
R
L
 
I
W
 
E
Q
 
R
A
 
A
E
 
D
T
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
V
L
 
T
D
 
A
E
 
D
L
 
M
A
 
R
D
 
D
A
 
V
I
 
S
E
 
G
V
 
I
V
 
A
V
 
V
T
 
S
G
 
G
S
 
K
R
 
-
F
 
-
G
 
-
C
 
L
S
 
P
A
 
V
E
 
P
L
 
L
M
 
M
A
 
D
R
 
A
L
 
F
P
 
P
A
 
S
L
 
L
K
 
E
A
 
I
I
 
V
V
 
A
S
 
N
F
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
P
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
P
 
S
A
 
R
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
V
I
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
D
V
 
V
L
|
L
N
 
T
D
 
E
C
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
M
 
I
G
 
G
L
 
L
I
 
L
I
 
L
D
 
N
G
 
T
R
 
L
R
 
R
Q
 
L
L
 
L
S
 
P
R
 
Q
A
 
A
D
 
E
R
 
Q
F
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
G
 
R
W
 
W
P
 
V
-
 
R
S
 
E
G
 
G
N
 
A
L
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
S
R
 
P
-
 
L
R
 
S
V
 
L
T
 
R
G
 
G
S
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
x
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
H
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
E
 
E
G
 
A
F
 
F
S
 
G
M
 
V
P
 
S
V
 
I
R
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
R
 
T
P
 
P
L
 
R
A
 
E
D
 
G
C
 
L
P
 
G
Y
 
F
E
 
T
Y
 
Y
A
 
H
G
 
P
S
 
T
L
 
L
V
 
V
E
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
W
 
A
A
 
V
D
 
D
V
 
T
L
 
L
L
 
I
L
 
V
T
 
I
C
x
V
V
x
P
G
 
G
G
 
T
P
 
A
Q
x
S
T
|
T
R
 
L
G
 
K
L
 
A
V
 
V
S
 
N
R
 
A
E
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
|
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
A
 
N
G
 
G
R
 
T
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
E
 
N
E
|
E
P
 
P
Q
 
N
A
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
S
M
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
V
G
x
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
R
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
N
A
 
A
M
 
M
E
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
D
N
 
N
L
 
L
Q
 
K
R
 
A
F
 
W
L
 
F
A
 
S
E
 
T
G
 
G
Q
 
E
L
 
A
V
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

5j23A Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with 2'-phospho-adp-ribose (see paper)
42% identity, 97% coverage: 10:309/309 of query aligns to 10:308/318 of 5j23A

query
sites
5j23A
L
 
I
S
 
N
A
 
P
R
 
R
L
 
V
D
 
L
R
 
E
E
 
R
L
 
L
A
 
P
S
 
E
R
 
M
Y
 
F
D
 
E
I
 
T
L
 
V
S
 
R
L
 
I
W
 
E
Q
 
R
A
 
A
E
 
D
T
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
V
L
 
T
D
 
A
E
 
D
L
 
M
A
 
R
D
 
D
A
 
V
I
 
S
E
 
G
V
 
I
V
 
A
V
 
V
T
 
S
G
 
G
S
 
K
R
 
-
F
 
-
G
 
-
C
 
L
S
 
P
A
 
V
E
 
P
L
 
L
M
 
M
A
 
D
R
 
A
L
 
F
P
 
P
A
 
S
L
 
L
K
 
E
A
 
I
I
 
V
V
 
A
S
 
N
F
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
P
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
P
 
S
A
 
R
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
V
I
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
D
V
 
V
L
|
L
N
 
T
D
 
E
C
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
M
 
I
G
 
G
L
 
L
I
 
L
I
 
L
D
 
N
G
 
T
R
 
L
R
 
R
Q
 
L
L
 
L
S
 
P
R
 
Q
A
 
A
D
 
E
R
 
Q
F
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
G
 
R
W
 
W
P
 
V
-
 
R
S
 
E
G
 
G
N
 
A
L
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
S
R
 
P
-
 
L
R
 
S
V
 
L
T
 
R
G
 
G
S
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
H
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
E
 
E
G
 
A
F
 
F
S
 
G
M
 
V
P
 
S
V
 
I
R
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
R
 
T
P
 
P
L
 
R
A
 
E
D
 
G
C
 
L
P
 
G
Y
 
F
E
 
T
Y
 
Y
A
 
H
G
 
P
S
 
T
L
 
L
V
 
V
E
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
W
 
A
A
 
V
D
 
D
V
 
T
L
 
L
L
 
I
L
 
V
T
 
I
C
 
V
V
x
P
G
 
G
G
 
T
P
 
A
Q
x
S
T
|
T
R
 
L
G
 
K
L
 
A
V
 
V
S
 
N
R
 
A
E
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
A
 
N
G
 
G
R
 
T
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
E
 
N
E
|
E
P
 
P
Q
 
N
A
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
S
M
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
V
G
 
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
R
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
N
A
 
A
M
 
M
E
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
D
N
 
N
L
 
L
Q
 
K
R
 
A
F
 
W
L
 
F
A
 
S
E
 
T
G
 
G
Q
 
E
L
 
A
V
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

5v7gA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
42% identity, 97% coverage: 10:309/309 of query aligns to 10:308/317 of 5v7gA

query
sites
5v7gA
L
 
I
S
 
N
A
 
P
R
 
R
L
 
V
D
 
L
R
 
E
E
 
R
L
 
L
A
 
P
S
 
E
R
 
M
Y
 
F
D
 
E
I
 
T
L
 
V
S
 
R
L
 
I
W
 
E
Q
 
R
A
 
A
E
 
D
T
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
V
L
 
T
D
 
A
E
 
D
L
 
M
A
 
R
D
 
D
A
 
V
I
 
S
E
 
G
V
 
I
V
 
A
V
 
V
T
 
S
G
 
G
S
 
K
R
 
-
F
 
-
G
 
-
C
 
L
S
 
P
A
 
V
E
 
P
L
 
L
M
 
M
A
 
D
R
 
A
L
 
F
P
 
P
A
 
S
L
 
L
K
 
E
A
 
I
I
 
V
V
 
A
S
 
N
F
 
F
G
|
G
V
|
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
P
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
P
 
S
A
 
R
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
V
I
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
D
V
 
V
L
|
L
N
 
T
D
 
E
C
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
M
 
I
G
 
G
L
 
L
I
 
L
I
 
L
D
 
N
G
 
T
R
 
L
R
 
R
Q
 
L
L
 
L
S
 
P
R
 
Q
A
 
A
D
 
E
R
 
Q
F
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
G
 
R
W
 
W
P
 
V
-
 
R
S
 
E
G
 
G
N
 
A
L
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
S
R
 
P
-
 
L
R
 
S
V
 
L
T
 
R
G
 
G
S
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
x
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
H
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
E
 
E
G
 
A
F
 
F
S
 
G
M
 
V
P
 
S
V
 
I
R
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
R
 
T
P
 
P
L
 
R
A
 
E
D
 
G
C
 
L
P
 
G
Y
 
F
E
 
T
Y
 
Y
A
 
H
G
 
P
S
 
T
L
 
L
V
 
V
E
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
W
 
A
A
 
V
D
 
D
V
 
T
L
 
L
L
 
I
L
 
V
T
 
I
C
x
V
V
x
P
G
 
G
G
 
T
P
 
A
Q
x
S
T
|
T
R
 
L
G
 
K
L
 
A
V
 
V
S
 
N
R
 
A
E
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
|
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
A
 
N
G
 
G
R
 
T
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
E
 
N
E
|
E
P
 
P
Q
 
N
A
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
S
M
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
V
G
x
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
R
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
N
A
 
A
M
 
M
E
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
D
N
 
N
L
 
L
Q
 
K
R
 
A
F
 
W
L
 
F
A
 
S
E
 
T
G
 
G
Q
 
E
L
 
A
V
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
39% identity, 86% coverage: 35:299/309 of query aligns to 38:311/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
R
 
K
L
 
L
D
 
L
E
 
E
L
 
K
A
 
V
D
 
K
A
 
D
I
 
V
E
 
D
V
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
x
M
S
x
L
R
 
S
F
 
E
G
 
R
C
 
I
S
 
D
A
 
Q
E
 
E
L
 
V
M
 
F
A
 
E
R
 
N
L
 
A
P
 
P
A
 
R
L
 
L
K
 
R
A
 
I
I
 
V
V
 
A
S
 
N
F
x
Y
G
x
A
V
|
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
P
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
V
P
 
E
A
 
E
A
 
A
Q
 
T
A
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
I
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
D
V
 
V
L
|
L
N
 
T
D
 
N
C
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
L
 
H
A
 
A
M
 
F
G
 
A
L
 
L
I
 
L
I
 
L
D
 
A
G
 
T
R
 
A
R
 
R
Q
 
H
L
 
V
S
 
V
R
 
K
A
 
G
D
 
D
R
 
K
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
G
 
E
W
 
W
P
 
K
S
 
R
G
 
K
N
 
G
L
 
I
P
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
W
-
 
F
L
 
L
A
 
G
R
 
Y
R
 
E
V
 
L
T
 
Y
G
 
G
S
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
 
G
L
x
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
H
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
A
E
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
N
M
 
M
P
 
R
V
 
I
R
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
S
R
|
R
R
 
T
P
 
R
L
 
K
A
 
S
D
 
Q
C
 
A
P
 
E
Y
 
K
E
 
E
Y
 
L
A
 
G
G
 
A
S
 
E
-
 
Y
-
 
R
-
 
P
L
 
L
V
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
L
R
 
K
W
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
L
 
I
L
 
L
T
x
A
C
x
V
V
x
P
G
 
L
G
 
T
P
 
K
Q
 
E
T
|
T
R
 
M
G
 
Y
L
 
M
V
 
I
S
 
N
R
 
E
E
 
E
V
 
R
L
 
L
D
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
D
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
R
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
E
 
E
E
|
E
P
 
P
Q
 
Y
A
 
Y
P
 
N
E
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
F
G
 
S
M
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
F
E
 
E
T
 
A
R
 
R
G
 
E
A
 
A
M
 
M
E
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
A
A
 
R
N
 
N
L
 
L
Q
 
I
R
 
A
F
 
F

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
41% identity, 85% coverage: 36:299/309 of query aligns to 39:310/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
L
 
L
D
 
E
E
 
K
L
 
V
A
 
K
D
 
D
A
 
-
I
 
V
E
 
D
V
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
M
S
 
L
R
 
S
F
 
E
G
 
K
C
 
I
S
 
D
A
 
R
E
 
E
L
 
V
M
 
F
A
 
D
R
 
A
L
 
A
P
 
P
A
 
R
L
 
L
K
 
R
A
 
I
I
 
V
V
 
A
S
 
N
F
 
Y
G
 
A
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
P
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
I
P
 
E
A
 
E
A
 
A
Q
 
T
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
I
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
D
V
 
V
L
|
L
N
 
T
D
 
D
C
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
M
 
W
G
 
A
L
 
L
I
 
L
I
 
L
D
 
A
G
 
A
R
 
A
R
 
R
Q
 
H
L
 
V
S
 
V
R
 
K
A
 
G
D
 
D
R
 
K
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
G
 
E
W
 
W
P
 
K
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
S
 
H
G
 
P
N
 
K
L
 
M
P
 
F
L
 
L
A
 
G
R
 
Y
R
 
D
V
 
V
T
 
Y
G
 
G
S
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
|
G
L
x
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
H
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
A
E
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
G
M
 
M
P
 
R
V
 
I
R
 
L
Y
 
Y
-
 
T
-
x
A
H
x
R
N
x
S
R
 
R
R
x
K
P
 
P
L
 
E
A
 
A
D
 
E
C
 
K
P
 
E
Y
 
L
-
 
G
-
 
A
E
 
E
Y
 
F
A
 
K
G
 
-
S
 
P
L
 
L
V
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
L
R
 
R
W
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
L
 
V
L
 
L
T
 
A
C
x
V
V
x
P
G
 
L
G
 
T
P
 
K
Q
x
E
T
|
T
R
 
Y
G
 
H
L
 
M
V
 
I
S
 
N
R
 
E
E
 
E
V
 
R
L
 
L
D
 
R
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
D
 
T
G
 
A
L
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
I
E
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
R
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
E
 
E
E
|
E
P
 
P
Q
 
Y
A
 
Y
P
 
D
E
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
F
G
 
A
M
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
G
 
E
A
 
G
M
 
M
E
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
A
A
 
K
N
 
N
L
 
L
Q
 
I
R
 
A
F
 
F

O58320 Glyoxylate reductase; EC 1.1.1.26 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3)
42% identity, 80% coverage: 54:299/309 of query aligns to 57:311/334 of O58320

query
sites
O58320
C
 
I
S
 
D
A
 
K
E
 
E
L
 
V
M
 
F
A
 
E
R
 
N
L
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
K
 
R
A
 
I
I
 
V
V
 
A
S
 
N
F
 
Y
G
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
P
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
I
P
 
E
A
 
E
A
 
A
Q
 
T
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
I
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
D
V
 
V
L
 
L
N
 
T
D
 
D
C
 
A
V
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
M
 
F
G
 
A
L
 
L
I
 
L
I
 
L
D
 
A
G
 
T
R
 
A
R
 
R
Q
 
H
L
 
V
S
 
V
R
 
K
A
 
G
D
 
D
R
 
R
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
G
 
E
W
 
W
P
 
K
S
 
K
G
 
R
N
 
G
L
 
V
P
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
W
-
 
F
L
 
L
A
 
G
R
 
Y
R
 
D
V
 
V
T
 
Y
G
 
G
S
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
H
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
A
E
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
N
M
 
M
P
 
R
V
 
I
R
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
S
R
|
R
R
x
T
P
 
R
L
 
K
A
 
E
D
 
E
C
 
V
P
 
E
Y
 
R
E
 
E
Y
 
L
A
 
N
G
 
A
S
 
E
-
 
F
-
 
K
-
 
P
L
 
L
V
 
E
E
 
D
L
 
L
A
 
L
R
 
R
W
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
L
 
V
L
 
L
T
 
A
C
 
V
V
 
P
G
 
L
G
 
T
P
 
R
Q
 
E
T
 
T
R
 
Y
G
 
H
L
 
L
V
 
I
S
 
N
R
 
E
E
 
E
V
 
R
L
 
L
D
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
D
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
N
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
R
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
E
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
Y
A
 
Y
P
 
N
E
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
F
G
 
K
M
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
|
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
S
R
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
G
 
E
A
 
G
M
 
M
E
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
A
A
 
K
N
 
N
L
 
L
Q
 
I
R
 
A
F
 
F

2dbqA Crystal structure of glyoxylate reductase (ph0597) from pyrococcus horikoshii ot3, complexed with NADP (i41) (see paper)
42% identity, 80% coverage: 54:299/309 of query aligns to 57:311/333 of 2dbqA

query
sites
2dbqA
C
 
I
S
 
D
A
 
K
E
 
E
L
 
V
M
 
F
A
 
E
R
 
N
L
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
K
 
R
A
 
I
I
 
V
V
 
A
S
 
N
F
 
Y
G
 
A
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
P
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
I
P
 
E
A
 
E
A
 
A
Q
 
T
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
I
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
D
V
 
V
L
|
L
N
 
T
D
 
D
C
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
M
 
F
G
 
A
L
 
L
I
 
L
I
 
L
D
 
A
G
 
T
R
 
A
R
 
R
Q
 
H
L
 
V
S
 
V
R
 
K
A
 
G
D
 
D
R
 
R
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
G
 
E
W
 
W
P
 
K
S
 
K
G
 
R
N
 
G
L
 
V
P
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
W
-
 
F
L
 
L
A
 
G
R
 
Y
R
 
D
V
 
V
T
 
Y
G
 
G
S
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
H
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
A
E
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
N
M
 
M
P
 
R
V
 
I
R
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
S
R
|
R
R
x
T
P
 
R
L
 
K
A
 
E
D
 
E
C
 
V
P
 
E
Y
 
R
E
 
E
Y
 
L
A
 
N
G
 
A
S
 
E
-
 
F
-
 
K
-
 
P
L
 
L
V
 
E
E
 
D
L
 
L
A
 
L
R
 
R
W
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
L
 
V
L
 
L
T
x
A
C
x
V
V
x
P
G
 
L
G
 
T
P
 
R
Q
 
E
T
|
T
R
 
Y
G
 
H
L
 
L
V
 
I
S
 
N
R
 
E
E
 
E
V
 
R
L
 
L
D
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
D
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
N
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
R
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
E
 
E
E
|
E
P
 
P
Q
 
Y
A
 
Y
P
 
N
E
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
F
G
 
K
M
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
S
R
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
G
 
E
A
 
G
M
 
M
E
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
A
A
 
K
N
 
N
L
 
L
Q
 
I
R
 
A
F
 
F

2gcgA Ternary crystal structure of human glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase (see paper)
37% identity, 75% coverage: 65:296/309 of query aligns to 71:309/324 of 2gcgA

query
sites
2gcgA
L
 
L
K
 
K
A
 
V
I
 
I
V
 
S
S
 
T
F
 
M
G
x
S
V
|
V
G
|
G
Y
 
I
D
 
D
P
 
H
I
 
L
D
 
A
V
 
L
P
 
D
A
 
E
A
 
I
Q
 
K
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
R
I
 
V
S
 
G
N
 
Y
T
 
T
P
 
P
E
 
D
V
 
V
L
|
L
N
 
T
D
 
D
C
 
T
V
x
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
M
 
V
G
 
S
L
 
L
I
 
L
I
 
L
D
 
T
G
 
T
R
 
C
R
 
R
Q
 
R
L
 
L
S
 
P
R
 
E
A
 
A
D
 
I
R
 
E
F
 
E
V
 
V
R
 
K
A
 
N
G
 
G
G
 
G
W
 
W
P
 
T
S
 
S
G
 
W
N
 
K
L
 
-
P
 
P
L
 
L
-
 
W
-
 
L
-
 
C
A
 
G
R
 
Y
R
 
G
V
 
L
T
 
T
G
 
Q
S
 
S
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
L
 
L
G
|
G
R
 
R
I
|
I
G
 
G
H
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
E
 
K
G
 
P
F
 
F
S
 
G
M
 
V
P
 
Q
-
 
R
V
 
F
R
 
L
Y
 
Y
H
 
T
N
x
G
R
|
R
R
 
Q
P
 
P
L
x
R
A
 
P
D
 
E
C
 
E
P
 
A
Y
 
A
E
 
E
Y
 
F
A
 
Q
G
 
A
S
 
E
L
 
F
V
 
V
-
 
S
-
 
T
-
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
A
W
 
Q
A
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
I
L
 
V
L
 
V
T
 
A
C
|
C
V
x
S
G
 
L
G
 
T
P
 
P
Q
 
A
T
|
T
R
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
C
S
 
N
R
 
K
E
 
D
V
 
F
L
 
F
D
 
Q
A
 
K
L
 
M
G
 
K
P
 
E
D
 
T
G
 
A
L
 
V
L
 
F
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
S
R
|
R
G
 
G
S
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
P
 
D
A
 
D
L
 
L
V
 
Y
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
A
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
I
G
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
T
A
 
S
E
 
P
E
|
E
P
 
P
-
 
L
Q
 
P
A
 
T
P
 
N
E
 
H
A
 
P
L
 
L
L
 
L
G
 
T
M
 
L
D
 
K
N
 
N
V
 
C
V
 
V
L
 
I
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
H
E
 
R
T
 
T
R
 
R
G
 
N
A
 
T
M
 
M
E
 
S
D
 
L
L
 
L
V
 
A
L
 
A
A
 
N
N
 
N
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9UBQ7 Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase; EC 1.1.1.79; EC 1.1.1.81 from Homo sapiens (Human) (see paper)
37% identity, 75% coverage: 65:296/309 of query aligns to 75:313/328 of Q9UBQ7

query
sites
Q9UBQ7
L
 
L
K
 
K
A
 
V
I
 
I
V
 
S
S
 
T
F
 
M
G
 
S
V
|
V
G
|
G
Y
 
I
D
 
D
P
 
H
I
 
L
D
 
A
V
 
L
P
 
D
A
 
E
A
 
I
Q
 
K
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
R
I
 
V
S
 
G
N
 
Y
T
 
T
P
 
P
E
 
D
V
 
V
L
 
L
N
 
T
D
 
D
C
 
T
V
 
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
M
 
V
G
 
S
L
 
L
I
 
L
I
 
L
D
 
T
G
 
T
R
 
C
R
 
R
Q
 
R
L
 
L
S
 
P
R
 
E
A
 
A
D
 
I
R
 
E
F
 
E
V
 
V
R
 
K
A
 
N
G
 
G
G
 
G
W
 
W
P
 
T
S
 
S
G
 
W
N
 
K
L
 
-
P
 
P
L
 
L
-
 
W
-
 
L
-
 
C
A
 
G
R
 
Y
R
 
G
V
 
L
T
 
T
G
 
Q
S
 
S
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
 
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
H
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
E
 
K
G
 
P
F
 
F
S
 
G
M
 
V
P
 
Q
-
 
R
V
 
F
R
 
L
Y
 
Y
H
 
T
N
 
G
R
|
R
R
x
Q
P
|
P
L
x
R
A
 
P
D
 
E
C
 
E
P
 
A
Y
 
A
E
 
E
Y
 
F
A
 
Q
G
 
A
S
 
E
L
 
F
V
 
V
-
 
S
-
 
T
-
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
A
W
 
Q
A
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
I
L
 
V
L
 
V
T
 
A
C
 
C
V
x
S
G
 
L
G
 
T
P
 
P
Q
 
A
T
 
T
R
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
C
S
 
N
R
 
K
E
 
D
V
 
F
L
 
F
D
 
Q
A
 
K
L
 
M
G
 
K
P
 
E
D
 
T
G
 
A
L
 
V
L
 
F
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
S
R
|
R
G
 
G
S
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
P
 
D
A
 
D
L
 
L
V
 
Y
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
A
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
I
G
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
T
A
 
S
E
 
P
E
 
E
P
 
P
-
 
L
Q
 
P
A
 
T
P
 
N
E
 
H
A
 
P
L
 
L
L
 
L
G
 
T
M
 
L
D
 
K
N
 
N
V
 
C
V
 
V
L
 
I
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
|
I
G
|
G
S
|
S
A
 
A
T
 
T
R
 
H
E
 
R
T
 
T
R
 
R
G
 
N
A
 
T
M
 
M
E
 
S
D
 
L
L
 
L
V
 
A
L
 
A
A
 
N
N
 
N
L
 
L

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
37% identity, 81% coverage: 35:285/309 of query aligns to 34:287/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
R
 
R
L
 
L
D
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
V
D
 
K
A
 
D
I
 
V
E
 
E
V
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
V
G
 
R
S
 
S
R
 
K
F
 
P
G
 
K
C
 
V
S
 
T
A
 
R
E
 
R
L
 
V
M
 
I
A
 
E
R
 
S
L
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
V
I
 
I
V
 
A
S
 
R
F
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
P
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
V
P
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
A
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
E
I
 
V
S
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
E
 
A
V
 
A
L
x
S
N
 
S
D
 
R
C
 
S
V
|
V
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
M
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
M
I
 
F
D
 
S
G
 
V
R
 
A
R
 
R
Q
 
K
L
 
I
S
 
A
R
 
F
A
 
A
D
 
D
R
 
R
F
 
K
V
 
M
R
 
R
A
 
E
G
 
G
G
 
V
W
 
W
P
 
A
S
 
K
G
 
K
N
 
E
L
 
-
P
 
A
L
 
M
A
 
G
R
 
I
R
 
E
V
 
L
T
 
E
G
 
G
S
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
L
x
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
H
 
Y
A
 
Q
V
 
V
A
 
A
K
 
K
R
 
I
A
 
A
E
 
N
G
 
A
F
 
L
S
 
G
M
 
M
P
 
N
V
 
I
R
 
L
Y
 
L
H
x
Y
N
x
D
R
x
P
R
 
Y
P
 
P
L
 
N
A
 
E
D
 
E
C
 
R
P
 
A
Y
 
K
E
 
E
Y
 
V
A
 
N
G
 
G
S
 
K
L
 
F
V
 
V
E
 
D
L
 
L
A
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
L
R
 
K
W
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
V
L
 
T
L
 
I
T
 
H
C
x
V
V
x
P
G
 
L
G
 
V
P
 
E
Q
 
S
T
|
T
R
 
Y
G
 
H
L
 
L
V
 
I
S
 
N
R
 
E
E
 
E
V
 
R
L
 
L
D
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
D
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
T
A
x
S
R
|
R
G
 
G
S
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
N
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
R
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
E
 
E
E
|
E
P
 
P
Q
 
L
A
 
P
P
 
K
E
 
D
A
 
H
-
 
P
L
 
L
L
 
T
G
 
K
M
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
R
 
V
E
 
E
T
 
A
R
 
Q

2w2lA Crystal structure of the holo forms of rhodotorula graminis d- mandelate dehydrogenase at 2.5a.
34% identity, 83% coverage: 52:308/309 of query aligns to 67:337/346 of 2w2lA

query
sites
2w2lA
F
 
Y
G
 
P
C
 
W
S
 
N
A
 
A
E
 
D
L
 
L
M
 
I
A
 
S
R
 
H
L
 
L
P
 
P
A
 
S
-
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
V
I
 
F
V
 
A
S
 
A
F
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
P
 
W
I
 
L
D
 
D
V
 
L
P
 
D
A
 
A
A
 
L
Q
 
N
A
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
A
I
 
F
S
 
A
N
 
N
T
 
S
P
 
R
E
 
G
V
 
A
L
x
G
N
 
D
D
 
T
C
 
A
V
x
T
A
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
A
M
 
L
G
 
Y
L
 
L
I
 
I
I
 
L
D
 
S
G
 
V
R
 
F
R
 
R
Q
 
L
L
 
A
S
 
S
R
 
Y
A
 
S
D
 
E
R
 
R
F
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
T
G
 
G
G
 
D
W
 
P
P
 
E
S
 
T
G
 
F
N
 
N
-
 
R
-
 
V
-
 
H
L
 
L
P
 
E
L
 
I
A
 
G
R
 
K
R
 
S
V
 
A
T
 
H
G
 
N
S
 
P
R
 
R
-
 
G
-
 
H
-
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
A
L
 
V
G
 
G
L
 
L
G
|
G
R
x
A
I
|
I
G
 
Q
H
 
K
A
 
E
V
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
K
A
 
A
-
 
V
E
 
H
G
 
G
F
 
L
S
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
L
R
 
V
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
D
R
 
V
R
 
A
P
 
P
L
 
-
A
 
A
D
 
D
C
 
A
P
 
E
Y
 
T
E
 
E
Y
 
K
A
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
V
G
 
D
S
 
S
L
 
L
V
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
W
 
R
A
 
S
D
 
D
V
 
C
L
 
V
L
 
S
L
 
V
T
 
S
C
x
V
V
x
P
G
 
Y
G
 
M
P
 
K
Q
 
L
T
|
T
R
 
H
G
 
H
L
 
L
V
 
I
S
 
D
R
 
E
E
 
A
V
 
F
L
 
F
D
 
A
A
 
A
L
 
M
G
 
K
P
 
P
D
 
G
G
 
S
L
 
R
L
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
S
 
P
V
 
V
V
 
I
D
 
S
E
 
Q
P
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
I
E
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
A
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
L
G
 
S
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
H
A
 
E
E
 
F
E
|
E
P
 
P
Q
 
Q
A
 
V
P
 
S
E
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
I
G
 
E
M
 
M
D
 
K
N
 
H
V
 
V
V
 
T
L
 
L
L
 
T
P
 
T
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
x
G
A
 
V
T
 
A
R
 
I
E
 
E
T
 
T
R
 
F
G
 
H
A
 
E
M
 
F
E
 
E
D
 
R
L
 
L
V
 
T
L
 
M
A
 
T
N
 
N
L
 
I
Q
 
D
R
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
L
E
 
Q
G
 
G
Q
 
K
-
 
P
L
 
L
V
 
L
T
 
T
P
 
P

4e5pA Thermostable phosphite dehydrogenase a176r variant in complex with nad (see paper)
37% identity, 80% coverage: 55:301/309 of query aligns to 58:317/332 of 4e5pA

query
sites
4e5pA
S
 
D
A
 
A
E
 
D
L
 
F
M
 
L
A
 
Q
R
 
A
L
 
C
P
 
P
A
 
E
L
 
L
K
 
R
A
 
V
I
 
I
V
 
G
S
 
C
F
 
A
G
 
L
V
x
K
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
P
 
N
I
 
F
D
 
D
V
 
V
P
 
D
A
 
A
A
 
C
Q
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
W
I
 
L
S
 
T
N
 
F
T
 
V
P
 
P
E
 
D
V
 
L
L
|
L
N
 
T
D
 
V
C
 
P
V
x
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
M
 
I
G
 
G
L
 
L
I
 
A
I
 
V
D
 
G
G
 
L
R
 
G
R
 
R
Q
 
H
L
 
L
S
 
R
R
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
-
 
Q
-
 
F
-
 
R
G
 
G
W
 
W
P
 
Q
S
 
P
G
 
-
N
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
R
V
 
F
T
 
Y
G
 
G
S
 
T
R
 
G
L
 
L
-
 
D
-
 
N
-
 
A
-
 
T
-
 
V
G
 
G
I
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
M
G
|
G
R
x
A
I
|
I
G
 
G
H
 
L
A
 
A
V
 
M
A
 
A
K
 
D
R
 
R
A
 
L
E
 
Q
G
 
G
F
 
W
S
 
G
M
 
A
P
 
T
V
 
L
R
 
Q
Y
 
Y
H
 
H
N
x
A
R
|
R
R
 
K
P
 
A
L
 
L
A
 
D
D
 
T
C
 
Q
P
 
T
Y
 
E
E
 
Q
Y
 
R
A
 
L
G
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
S
 
A
L
 
C
V
 
S
E
 
E
L
 
L
A
 
F
R
 
A
W
 
S
A
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
T
 
A
C
x
L
V
x
P
G
 
L
G
 
N
P
 
A
Q
 
D
T
|
T
R
 
L
G
 
H
L
 
L
V
 
V
S
 
N
R
 
A
E
 
E
V
 
L
L
 
L
D
 
A
A
 
L
L
 
V
G
 
R
P
 
P
D
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
x
P
A
x
C
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
L
E
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
A
 
R
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
A
D
|
D
V
 
V
F
 
F
-
 
E
-
 
M
-
x
E
-
 
D
-
 
W
-
 
A
-
 
R
A
 
A
E
 
D
E
 
R
P
 
P
Q
 
Q
A
 
Q
P
 
I
E
 
D
-
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
A
M
 
H
D
 
P
N
 
N
V
 
T
V
 
L
L
 
F
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
 
G
S
 
S
A
 
A
T
 
V
R
 
R
E
 
A
T
 
V
R
 
R
G
 
L
A
 
E
M
 
I
E
 
E
D
 
R
L
 
C
V
 
A
L
 
A
A
 
Q
N
 
N
L
 
I
Q
 
L
R
 
Q
F
 
A
L
 
L
A
 
A

4e5mA Thermostable phosphite dehydrogenase e175a/a176r in complex with NADP (see paper)
37% identity, 80% coverage: 55:301/309 of query aligns to 58:317/329 of 4e5mA

query
sites
4e5mA
S
 
D
A
 
A
E
 
D
L
 
F
M
 
L
A
 
Q
R
 
A
L
 
C
P
 
P
A
 
E
L
 
L
K
 
R
A
 
V
I
 
I
V
 
G
S
 
C
F
 
A
G
 
L
V
x
K
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
P
 
N
I
 
F
D
 
D
V
 
V
P
 
D
A
 
A
A
 
C
Q
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
W
I
 
L
S
 
T
N
 
F
T
 
V
P
 
P
E
 
D
V
 
L
L
|
L
N
 
T
D
 
V
C
 
P
V
x
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
M
 
I
G
 
G
L
 
L
I
 
A
I
 
V
D
 
G
G
 
L
R
 
G
R
 
R
Q
 
H
L
 
L
S
 
R
R
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
-
 
Q
-
 
F
-
 
R
G
 
G
W
 
W
P
 
Q
S
 
P
G
 
-
N
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
R
V
 
F
T
 
Y
G
 
G
S
 
T
R
 
G
L
 
L
-
 
D
-
 
N
-
 
A
-
 
T
-
 
V
G
 
G
I
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
M
G
|
G
R
x
A
I
|
I
G
 
G
H
 
L
A
 
A
V
 
M
A
 
A
K
 
D
R
 
R
A
 
L
E
 
Q
G
 
G
F
 
W
S
 
G
M
 
A
P
 
T
V
 
L
R
 
Q
Y
 
Y
H
 
H
N
 
A
R
|
R
R
 
K
P
 
A
L
 
L
A
 
D
D
 
T
C
 
Q
P
 
T
Y
 
E
E
 
Q
Y
 
R
A
 
L
G
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
S
 
A
L
 
C
V
 
S
E
 
E
L
 
L
A
 
F
R
 
A
W
 
S
A
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
T
 
A
C
x
L
V
x
P
G
 
L
G
 
N
P
 
A
Q
 
D
T
|
T
R
 
L
G
 
H
L
 
L
V
 
V
S
 
N
R
 
A
E
 
E
V
 
L
L
 
L
D
 
A
A
 
L
L
 
V
G
 
R
P
 
P
D
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
x
P
A
x
C
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
L
E
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
A
 
R
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
A
D
|
D
V
 
V
F
 
F
-
 
E
-
 
M
-
x
E
-
 
D
-
 
W
-
 
A
-
 
R
A
 
A
E
 
D
E
 
R
P
 
P
Q
 
Q
A
 
Q
P
 
I
E
 
D
-
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
A
M
 
H
D
 
P
N
 
N
V
 
T
V
 
L
L
 
F
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
V
R
 
R
E
 
A
T
 
V
R
 
R
G
 
L
A
 
E
M
 
I
E
 
E
D
 
R
L
 
C
V
 
A
L
 
A
A
 
Q
N
 
N
L
 
I
Q
 
L
R
 
Q
F
 
A
L
 
L
A
 
A

4e5kA Thermostable phosphite dehydrogenase in complex with NAD and sulfite (see paper)
37% identity, 80% coverage: 55:301/309 of query aligns to 58:317/329 of 4e5kA

query
sites
4e5kA
S
 
D
A
 
A
E
 
D
L
 
F
M
 
L
A
 
Q
R
 
A
L
 
C
P
 
P
A
 
E
L
 
L
K
 
R
A
 
V
I
 
I
V
 
G
S
 
C
F
 
A
G
x
L
V
x
K
G
|
G
Y
 
F
D
 
D
P
 
N
I
 
F
D
 
D
V
 
V
P
 
D
A
 
A
A
 
C
Q
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
W
I
 
L
S
 
T
N
 
F
T
 
V
P
 
P
E
 
D
V
 
L
L
|
L
N
 
T
D
 
V
C
 
P
V
x
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
M
 
I
G
 
G
L
 
L
I
 
A
I
 
V
D
 
G
G
 
L
R
 
G
R
 
R
Q
 
H
L
 
L
S
 
R
R
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
-
 
K
-
 
F
-
 
R
G
 
G
W
 
W
P
 
Q
S
 
P
G
 
-
N
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
R
V
 
F
T
 
Y
G
 
G
S
 
T
R
 
G
L
 
L
-
 
D
-
 
N
-
 
A
-
 
T
-
 
V
G
 
G
I
 
F
L
 
L
G
|
G
L
 
M
G
|
G
R
x
A
I
|
I
G
 
G
H
 
L
A
 
A
V
 
M
A
 
A
K
 
D
R
 
R
A
 
L
E
 
Q
G
 
G
F
 
W
S
 
G
M
 
A
P
 
T
V
 
L
R
 
Q
Y
 
Y
H
|
H
N
x
E
R
x
A
R
 
K
P
 
A
L
 
L
A
 
D
D
 
T
C
 
Q
P
 
T
Y
 
E
E
 
Q
Y
 
R
A
 
L
G
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
S
 
A
L
 
C
V
 
S
E
 
E
L
 
L
A
 
F
R
 
A
W
 
S
A
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
T
x
A
C
x
L
V
x
P
G
 
L
G
 
N
P
 
A
Q
 
D
T
 
T
R
 
L
G
 
H
L
 
L
V
 
V
S
 
N
R
 
A
E
 
E
V
 
L
L
 
L
D
 
A
A
 
L
L
 
V
G
 
R
P
 
P
D
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
x
P
A
x
C
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
L
E
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
A
 
R
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
A
D
|
D
V
 
V
F
 
F
-
 
E
-
 
M
-
x
E
-
 
D
-
 
W
-
 
A
-
 
R
A
 
A
E
 
D
E
 
R
P
 
P
Q
 
Q
A
 
Q
P
 
I
E
 
D
-
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
A
M
 
H
D
 
P
N
 
N
V
 
T
V
 
L
L
 
F
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
V
R
 
R
E
 
A
T
 
V
R
 
R
G
 
L
A
 
E
M
 
I
E
 
E
D
 
R
L
 
C
V
 
A
L
 
A
A
 
Q
N
 
N
L
 
I
Q
 
L
R
 
Q
F
 
A
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
33% identity, 80% coverage: 38:285/309 of query aligns to 40:288/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
A
 
C
I
 
-
E
 
E
V
 
G
V
 
L
V
 
I
T
 
V
G
 
R
S
 
S
R
 
A
F
 
T
G
 
K
C
 
V
S
 
T
A
 
A
E
 
D
L
 
V
M
 
I
A
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
K
 
Q
A
 
V
I
 
V
V
 
G
S
 
R
F
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
P
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
P
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
L
I
 
V
S
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
N
V
 
G
L
 
N
N
 
S
D
 
L
C
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
T
M
 
C
G
 
G
L
 
M
I
 
I
I
 
M
D
 
C
G
 
L
R
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
S
 
P
R
 
Q
A
 
A
D
 
T
R
 
A
F
 
S
V
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
P
 
E
S
 
R
G
 
K
N
 
K
L
 
F
P
 
-
L
 
M
A
 
G
R
 
T
R
 
E
V
 
L
T
 
N
G
 
G
S
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
H
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
E
 
Q
G
 
S
F
 
F
S
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
R
 
I
Y
 
G
H
x
Y
N
x
D
R
x
P
R
 
I
P
 
I
L
 
S
A
 
P
D
 
E
C
 
V
P
 
S
Y
 
A
E
 
S
Y
 
F
A
 
G
G
 
V
S
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
L
|
L
V
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
W
R
 
P
W
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
L
 
T
L
 
V
T
x
H
C
x
T
V
x
P
G
 
L
G
 
L
P
 
P
Q
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
V
 
L
S
 
N
R
 
D
E
 
N
V
 
T
L
 
F
D
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
A
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
E
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
P
A
 
R
P
 
D
E
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
D
M
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
R
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
33% identity, 80% coverage: 38:285/309 of query aligns to 40:288/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
A
 
C
I
 
-
E
 
E
V
 
G
V
 
L
V
 
I
T
 
V
G
 
R
S
 
S
R
 
A
F
 
T
G
 
K
C
 
V
S
 
T
A
 
A
E
 
D
L
 
V
M
 
I
A
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
K
 
Q
A
 
V
I
 
V
V
 
G
S
 
R
F
 
A
G
 
G
V
x
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
P
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
P
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
L
I
 
V
S
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
N
V
 
G
L
 
N
N
 
S
D
 
L
C
 
S
V
x
A
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
T
M
 
C
G
 
G
L
 
M
I
 
I
I
 
M
D
 
C
G
 
L
R
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
S
 
P
R
 
Q
A
 
A
D
 
T
R
 
A
F
 
S
V
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
P
 
E
S
 
R
G
 
K
N
 
K
L
 
F
P
 
-
L
 
M
A
 
G
R
 
T
R
 
E
V
 
L
T
 
N
G
 
G
S
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
|
G
L
 
L
G
 
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
H
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
E
 
Q
G
 
S
F
 
F
S
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
R
 
I
Y
 
G
H
x
Y
N
x
D
R
x
P
R
x
I
P
 
I
L
 
S
A
 
P
D
 
E
C
 
V
P
 
S
Y
 
A
E
 
S
Y
 
F
A
 
G
G
 
V
S
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
L
 
L
V
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
W
R
 
P
W
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
L
 
T
L
 
V
T
x
H
C
x
T
V
x
P
G
 
L
G
 
L
P
 
P
Q
 
S
T
|
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
S
 
N
R
 
D
E
 
N
V
 
T
L
 
F
D
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
V
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
A
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
E
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
P
A
 
R
P
 
D
E
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
D
M
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
|
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
R
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
33% identity, 80% coverage: 38:285/309 of query aligns to 39:287/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
A
 
C
I
 
-
E
 
E
V
 
G
V
 
L
V
 
I
T
 
V
G
 
R
S
 
S
R
 
A
F
 
T
G
 
K
C
 
V
S
 
T
A
 
A
E
 
D
L
 
V
M
 
I
A
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
K
 
Q
A
 
V
I
 
V
V
 
G
S
 
R
F
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
P
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
P
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
L
I
 
V
S
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
N
V
 
G
L
 
N
N
 
S
D
 
L
C
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
T
M
 
C
G
 
G
L
 
M
I
 
I
I
 
M
D
 
C
G
 
L
R
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
S
 
P
R
 
Q
A
 
A
D
 
T
R
 
A
F
 
S
V
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
P
 
E
S
 
R
G
 
K
N
 
K
L
 
F
P
 
-
L
 
M
A
 
G
R
 
T
R
 
E
V
 
L
T
 
N
G
 
G
S
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
R
|
R
I
 
I
G
 
G
H
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
E
 
Q
G
 
S
F
 
F
S
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
R
 
I
Y
 
G
H
 
Y
N
x
D
R
x
P
R
x
I
P
x
I
L
 
S
A
 
P
D
 
E
C
 
V
P
 
S
Y
 
A
E
 
S
Y
 
F
A
 
G
G
 
V
S
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
L
 
L
V
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
W
R
 
P
W
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
L
 
T
L
 
V
T
x
H
C
x
T
V
 
P
G
 
L
G
x
L
P
 
P
Q
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
S
 
N
R
 
D
E
 
N
V
 
T
L
 
F
D
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
A
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
E
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
P
A
 
R
P
 
D
E
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
D
M
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
R
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q

Query Sequence

>GFF377 Psest_0378 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases
MAYLLQVAPLSARLDRELASRYDILSLWQAETAARLDELADAIEVVVTGSRFGCSAELMA
RLPALKAIVSFGVGYDPIDVPAAQARGIAISNTPEVLNDCVADLAMGLIIDGRRQLSRAD
RFVRAGGWPSGNLPLARRVTGSRLGILGLGRIGHAVAKRAEGFSMPVRYHNRRPLADCPY
EYAGSLVELARWADVLLLTCVGGPQTRGLVSREVLDALGPDGLLVNVARGSVVDEPALVE
ALQAGRLGGAALDVFAEEPQAPEALLGMDNVVLLPHIGSATRETRGAMEDLVLANLQRFL
AEGQLVTPV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory