SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3777 FitnessBrowser__Marino:GFF3777 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5bt9C Crystal structure of folm alternative dihydrofolate reductase 1 from brucella canis complexed with NADP (see paper)
26% identity, 99% coverage: 2:234/235 of query aligns to 7:242/250 of 5bt9C

query
sites
5bt9C
T
 
N
A
 
C
P
 
P
I
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
G
 
A
Q
 
R
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
F
 
I
A
 
V
R
 
E
A
 
D
C
 
L
L
 
A
D
 
S
R
 
H
G
 
G
Q
 
F
P
 
P
I
 
V
I
 
A
V
 
I
T
 
H
Y
x
C
R
x
N
T
x
R
Y
x
S
R
 
L
P
 
D
A
 
E
I
 
G
D
 
E
A
 
A
L
 
I
-
 
A
-
 
N
-
 
R
-
 
I
-
 
N
Q
 
D
K
 
S
A
 
G
G
 
G
A
 
N
V
 
A
C
 
C
L
 
V
-
 
V
H
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
A
x
E
T
 
G
N
 
D
A
 
-
G
 
-
I
 
V
D
 
R
D
 
G
F
 
L
I
 
V
Q
 
K
A
 
Q
L
 
A
K
 
S
S
 
D
R
 
R
T
 
I
D
 
G
T
 
P
L
 
I
R
 
R
A
 
L
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
D
 
L
W
 
F
I
 
Q
P
 
E
E
 
D
S
 
K
E
 
V
D
 
G
S
 
A
D
 
L
P
 
D
A
 
M
D
 
A
V
 
L
M
 
W
N
 
D
A
 
R
M
 
H
M
 
F
Q
 
A
I
 
V
H
 
H
V
 
L
M
 
K
T
 
T
P
 
P
Y
 
V
R
 
I
I
 
L
N
 
A
L
 
E
T
 
D
C
 
M
R
 
R
S
 
K
M
 
A
L
 
L
-
 
P
-
 
E
E
 
D
Q
 
Q
E
 
D
G
 
G
S
 
L
T
 
V
T
 
V
D
 
N
I
|
I
I
 
I
H
 
-
M
 
-
T
 
-
D
 
D
Y
 
Q
V
 
R
V
 
V
E
 
W
K
 
K
G
 
L
S
 
N
A
 
P
K
 
Q
H
 
F
I
 
F
A
 
S
Y
|
Y
A
 
T
A
 
L
S
 
S
K
|
K
A
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
W
N
 
N
L
 
A
T
 
T
L
 
R
S
 
T
F
 
L
A
 
A
R
 
Q
L
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
|
P
S
x
G
L
 
P
I
x
T
M
x
L
F
 
P
N
 
S
Q
 
E
G
 
R
D
 
Q
S
 
R
Q
 
P
A
 
E
Y
 
D
R
 
F
E
 
E
K
 
R
T
 
Q
L
 
V
K
 
S
K
 
K
S
 
L
L
 
P
M
 
L
G
 
Q
I
 
R
E
 
A
P
 
P
G
 
E
A
 
L
E
 
P
V
 
E
A
 
F
V
 
G
A
 
R
T
 
T
L
 
V
Q
 
R
F
 
Y
L
 
F
L
 
W
D
 
E
N
 
N
P
 
R
Y
 
S
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
T
 
M
L
 
I
P
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
H
 
H
L
 
L

Q8N4T8 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase beta subunit; KAR beta subunit; Carbonyl reductase family member 4; CBR4; Quinone reductase CBR4; Short chain dehydrogenase/reductase family 45C member 1; EC 1.1.1.100; EC 1.6.5.10 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
34% identity, 52% coverage: 114:235/235 of query aligns to 113:236/237 of Q8N4T8

query
sites
Q8N4T8
L
 
L
T
 
T
C
 
C
-
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
M
R
 
R
S
 
T
M
 
M
L
 
I
E
 
Q
Q
 
Q
E
 
Q
G
 
G
S
 
G
T
 
S
T
 
-
D
 
-
I
 
I
I
 
V
H
 
N
M
 
V
T
 
G
D
x
S
Y
 
I
V
 
V
V
 
G
E
 
L
K
 
K
G
 
G
S
 
N
A
 
S
K
 
G
H
 
Q
I
 
S
A
 
V
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
L
 
L
T
 
V
N
 
G
L
 
F
T
 
S
L
 
R
S
 
A
F
 
L
A
 
A
R
 
K
L
 
E
L
 
V
A
 
A
-
x
R
P
x
K
R
 
K
V
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
G
L
 
F
I
x
V
M
x
H
F
x
T
N
 
D
Q
 
M
G
 
-
D
 
-
S
 
T
Q
 
K
A
 
D
Y
 
L
R
 
K
E
 
E
K
 
E
T
 
H
L
 
L
K
 
K
K
 
K
S
 
N
L
 
I
M
 
P
G
 
L
I
 
G
E
 
R
P
 
F
G
 
G
A
 
E
E
 
T
V
 
I
A
 
E
V
 
V
A
 
A
-
 
H
T
 
A
L
 
V
Q
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
E
N
 
S
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
H
T
 
V
L
 
L
P
 
V
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
Q
L
 
L
V
 
I

Sites not aligning to the query:

4cqmF Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP (see paper)
34% identity, 52% coverage: 114:235/235 of query aligns to 117:240/241 of 4cqmF

query
sites
4cqmF
L
 
L
T
 
T
C
 
C
-
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
M
R
 
R
S
 
T
M
 
M
L
 
I
E
 
Q
Q
 
Q
E
 
Q
G
 
G
S
 
G
T
 
S
T
 
-
D
 
-
I
 
I
I
 
V
H
 
N
M
x
V
T
 
G
D
x
S
Y
 
I
V
 
V
V
 
G
E
 
L
K
 
K
G
 
G
S
 
N
A
 
S
K
 
G
H
x
Q
I
 
S
A
 
V
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
L
 
L
T
 
V
N
 
G
L
 
F
T
 
S
L
 
R
S
 
A
F
 
L
A
 
A
R
 
K
L
 
E
L
 
V
A
 
A
-
 
R
P
 
K
R
 
K
V
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
G
L
 
F
I
x
V
M
 
H
F
x
T
N
 
D
Q
x
M
G
 
-
D
 
-
S
 
T
Q
 
K
A
 
D
Y
 
L
R
 
K
E
 
E
K
 
E
T
 
H
L
 
L
K
 
K
K
 
K
S
 
N
L
 
I
M
 
P
G
 
L
I
 
G
E
 
R
P
 
F
G
 
G
A
 
E
E
 
T
V
 
I
A
 
E
V
 
V
A
 
A
-
 
H
T
 
A
L
 
V
Q
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
E
N
 
S
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
H
T
 
V
L
 
L
P
 
V
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
Q
L
 
L
V
 
I

Sites not aligning to the query:

5iz4A Crystal structure of a putative short-chain dehydrogenase/reductase from burkholderia xenovorans
29% identity, 71% coverage: 65:231/235 of query aligns to 85:243/247 of 5iz4A

query
sites
5iz4A
I
 
I
Q
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
I
S
 
N
R
 
C
T
x
A
D
x
G
T
 
T
L
 
T
R
 
R
A
 
V
I
 
I
I
 
P
H
 
H
N
 
N
A
 
A
S
 
F
D
 
D
W
 
Q
I
 
I
P
 
D
E
 
D
S
 
F
E
 
E
D
 
-
S
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
M
 
F
N
 
E
A
 
R
M
 
V
M
 
Y
Q
 
R
I
x
V
H
 
N
V
 
L
M
 
I
T
 
G
P
 
L
Y
 
Y
R
 
Q
I
 
M
N
 
T
L
 
R
T
 
A
C
 
A
R
 
V
S
 
P
M
 
L
L
 
L
E
 
R
Q
 
E
E
 
S
G
 
A
S
 
S
-
 
A
-
 
T
-
 
R
T
 
S
T
 
T
D
 
S
I
 
V
I
 
V
H
 
N
M
 
V
T
 
S
D
x
S
Y
 
L
V
 
A
V
 
G
E
 
L
K
 
N
G
 
G
S
 
T
A
 
G
K
x
S
H
 
S
I
 
I
A
 
A
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
V
T
 
N
N
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
S
F
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
N
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
H
V
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
A
P
 
P
S
 
G
L
 
M
I
 
V
M
 
-
F
 
-
N
 
-
Q
 
-
G
 
D
D
 
D
S
 
G
Q
 
G
A
 
V
Y
 
L
R
 
S
E
 
R
K
 
M
T
 
T
L
 
E
K
 
S
K
 
A
S
 
P
L
 
L
M
 
K
G
 
R
I
 
V
E
 
S
P
 
R
G
 
P
A
 
A
E
 
E
V
 
I
A
 
A
V
 
E
A
 
L
T
 
A
L
 
W
Q
 
F
F
 
L
L
 
T
L
 
A
D
 
H
N
 
A
P
 
P
Y
 
A
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
T
 
V
L
 
I
P
 
A
L
 
A
D
 
E
G
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
27% identity, 100% coverage: 1:234/235 of query aligns to 3:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
M
 
M
T
 
T
A
 
K
P
 
S
I
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
S
Q
 
R
R
x
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
S
F
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
Q
C
 
L
L
 
A
D
 
E
R
 
E
G
 
G
Q
 
Y
P
 
N
I
 
V
I
 
A
V
 
V
T
 
N
Y
 
Y
R
 
A
T
 
G
Y
 
S
R
 
K
P
 
E
A
 
K
I
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
V
Q
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
K
A
 
G
V
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
F
C
 
A
L
 
I
H
 
Q
A
 
A
D
 
N
F
 
V
A
 
A
T
 
D
N
 
A
A
 
D
G
 
E
I
 
V
D
 
K
D
 
A
F
 
M
I
 
I
Q
 
K
A
 
E
L
 
V
K
 
V
S
 
S
R
 
Q
T
 
F
D
 
G
T
 
S
L
 
L
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
R
-
 
D
D
 
N
W
 
L
I
 
L
P
 
M
E
 
R
S
 
M
E
 
K
D
 
E
S
 
Q
D
 
E
P
 
W
A
 
D
D
 
D
V
 
V
M
 
I
N
 
D
A
 
T
M
 
N
M
 
L
Q
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
F
-
 
N
-
 
C
I
 
I
H
 
Q
V
 
K
M
 
A
T
 
T
P
 
P
Y
 
-
R
 
-
I
 
-
N
 
-
L
 
-
T
 
-
C
 
-
R
 
-
S
 
Q
M
 
M
L
 
L
E
 
R
Q
 
Q
E
 
R
G
 
S
S
 
G
T
 
A
T
 
-
D
 
-
I
 
I
I
 
I
H
 
N
M
 
L
T
 
S
D
x
S
Y
 
V
V
 
V
V
 
G
E
 
A
K
 
V
G
 
G
S
 
N
A
 
P
K
 
G
H
x
Q
I
 
A
A
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
V
T
 
I
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
S
 
S
F
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
S
R
 
R
-
 
G
V
 
I
K
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
G
L
 
F
I
 
I
M
 
V
F
 
S
N
 
D
Q
 
M
G
 
T
D
 
D
S
 
A
Q
 
L
A
 
S
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
K
 
D
T
 
E
L
 
L
K
 
K
K
 
E
S
 
Q
L
 
M
M
 
L
G
 
T
I
 
Q
E
 
I
P
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
F
G
 
G
A
 
Q
E
 
D
V
 
T
A
 
D
V
 
I
A
 
A
-
 
N
T
 
T
L
 
V
Q
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
D
 
S
N
 
D
-
 
K
-
 
A
P
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
T
 
T
L
 
I
P
 
H
L
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
M
H
 
Y
L
 
M

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
27% identity, 98% coverage: 6:235/235 of query aligns to 12:243/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
Q
x
R
R
x
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
F
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
L
C
 
L
L
 
A
D
 
E
R
 
R
G
 
G
Q
 
A
P
 
K
I
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
V
 
A
T
|
T
Y
 
S
R
 
E
T
 
S
Y
 
G
R
 
A
P
 
Q
A
 
A
I
 
I
D
 
S
A
 
D
L
 
Y
Q
 
L
K
 
G
A
 
D
G
 
N
A
 
G
V
 
K
C
 
G
L
 
M
H
 
A
A
 
L
D
x
N
F
x
V
A
 
T
T
 
N
N
 
P
A
 
E
G
 
S
I
 
I
D
 
E
D
 
A
F
 
V
I
 
L
Q
 
K
A
 
A
L
 
I
K
 
T
S
 
D
R
 
E
T
 
F
D
 
G
T
 
G
L
 
V
R
 
D
A
 
I
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
R
-
 
D
D
 
N
W
 
L
I
 
L
P
 
M
E
 
R
S
 
M
E
 
K
D
 
E
S
 
E
D
 
E
P
 
W
A
 
S
D
 
D
V
 
I
M
 
-
N
 
-
A
 
-
M
 
-
M
 
M
Q
 
E
I
 
T
H
x
N
V
 
L
M
 
T
T
 
S
P
 
I
Y
 
F
R
 
R
I
 
L
N
 
S
-
 
K
L
 
A
T
 
V
C
 
L
R
 
R
S
 
G
M
 
M
L
 
M
E
 
K
Q
 
K
E
 
R
G
 
-
S
 
-
T
 
Q
T
 
G
D
 
R
I
 
I
I
 
I
H
 
N
M
 
V
T
x
G
D
x
S
Y
 
V
V
 
V
V
 
G
E
 
T
K
 
M
G
 
G
S
 
N
A
 
A
K
 
G
H
x
Q
I
 
A
A
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
V
T
 
I
N
 
G
L
 
F
T
 
T
L
 
K
S
 
S
F
 
M
A
 
A
R
 
R
L
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
R
 
R
-
 
G
V
 
V
K
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
S
x
G
L
 
F
I
 
I
M
 
E
F
x
T
N
 
D
Q
 
M
G
 
N
D
 
D
S
 
E
Q
 
Q
A
 
-
Y
 
-
R
 
R
E
 
T
K
 
A
T
 
T
L
 
L
K
 
A
K
 
Q
S
 
V
L
 
P
M
 
A
G
 
G
I
 
-
E
 
R
P
 
L
G
 
G
A
 
D
E
 
P
V
 
R
A
 
E
V
 
I
A
 
A
T
 
S
L
 
A
Q
 
V
F
 
A
L
 
F
L
 
L
D
 
A
N
 
S
P
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
E
T
 
T
L
 
L
P
 
H
L
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
M
H
 
Y
L
 
M
V
 
I

8bcjB Crystal structure of short-chain dehydrogenase pa3128 from pseudomonas aeruginosa pao1 in complex with NADP+
28% identity, 99% coverage: 1:232/235 of query aligns to 3:250/250 of 8bcjB

query
sites
8bcjB
M
 
M
T
 
R
A
 
N
P
 
V
I
 
M
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
Q
x
R
R
x
G
I
|
I
G
 
G
L
 
A
A
 
A
F
 
T
A
 
A
R
 
L
A
 
L
C
 
A
L
 
A
D
 
E
R
 
R
G
 
G
Q
 
Y
P
 
A
I
 
V
I
 
V
V
 
L
T
 
N
Y
 
Y
R
x
L
T
x
R
Y
x
N
R
 
R
P
 
E
A
 
A
I
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
R
Q
 
Q
K
 
G
A
 
G
G
 
E
A
 
A
V
 
L
C
 
A
L
 
V
H
 
A
A
|
A
D
|
D
F
x
V
A
 
A
T
 
E
N
 
E
A
 
G
G
 
D
I
 
V
D
 
E
D
 
R
F
 
L
I
 
F
Q
 
A
A
 
S
L
 
I
K
 
D
S
 
E
R
 
R
T
 
F
D
 
G
T
 
R
L
 
L
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
x
G
D
 
M
W
 
L
I
 
E
P
 
A
E
 
Q
S
 
T
-
 
R
-
 
L
E
 
E
D
 
N
S
 
I
D
 
D
P
 
A
A
 
A
D
 
R
V
 
-
M
 
L
N
 
H
A
 
R
M
 
V
M
 
F
Q
 
A
I
x
T
H
 
N
V
 
V
M
 
T
T
 
G
P
 
S
Y
 
F
R
 
-
I
 
-
N
 
-
L
 
L
T
 
C
C
 
A
R
 
R
S
 
E
M
 
A
L
 
V
E
 
K
Q
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
T
-
 
R
-
 
H
E
 
G
G
 
G
S
 
R
T
 
G
T
 
G
D
 
S
I
 
I
I
 
V
H
 
N
M
x
V
T
 
S
D
x
S
Y
 
M
V
 
A
V
 
S
E
 
R
K
 
L
G
 
G
S
 
S
-
 
P
A
 
N
K
 
E
H
 
Y
I
 
I
A
 
D
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
I
T
 
D
N
 
S
L
 
M
T
 
T
L
 
I
S
 
G
F
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
A
R
 
E
-
 
G
V
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
R
P
|
P
S
x
G
L
 
L
I
|
I
-
 
D
-
x
T
M
 
E
F
x
I
N
x
H
Q
 
A
G
 
S
D
 
G
S
 
G
Q
 
E
A
 
P
Y
 
G
R
 
R
E
 
I
K
 
E
T
 
R
L
 
L
K
 
K
K
 
G
S
 
G
L
 
I
-
 
P
M
 
L
G
 
G
I
 
R
E
 
G
P
 
G
G
 
T
A
 
A
-
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
V
 
R
A
 
A
T
 
I
L
 
L
Q
 
W
F
 
L
L
 
A
L
 
S
D
 
D
N
 
E
-
 
A
P
 
S
Y
 
Y
I
 
S
T
 
T
G
 
G
R
 
T
T
 
F
L
 
I
P
 
D
L
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G
R
 
R

5jdcA Trypanosoma brucei ptr1 in complex with inhibitor np-13 (hesperetin) (see paper)
26% identity, 98% coverage: 6:235/235 of query aligns to 6:247/249 of 5jdcA

query
sites
5jdcA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
A
R
 
V
A
 
K
C
 
L
L
 
H
D
 
Q
R
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
I
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
Y
x
S
R
 
A
P
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
I
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
N
K
 
K
A
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
C
 
V
L
 
C
H
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
A
 
T
T
 
N
N
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
D
 
E
D
 
E
F
 
I
I
 
I
Q
 
N
A
 
S
L
 
C
K
 
F
S
 
R
R
 
A
T
 
F
D
 
G
T
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
D
 
A
W
x
F
I
 
Y
P
 
P
E
 
T
S
 
P
E
 
L
D
 
V
S
 
G
D
 
K
P
 
T
A
 
V
D
 
E
V
 
T
M
 
Q
N
 
V
A
 
A
-
 
E
M
 
L
M
 
I
Q
 
G
I
x
T
H
 
N
V
 
A
M
 
I
T
 
A
P
 
P
Y
 
F
R
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
T
 
S
C
 
-
R
 
-
S
 
-
M
 
-
L
 
F
E
 
A
Q
 
Q
E
 
R
G
 
Q
S
 
S
T
 
N
T
 
L
D
 
S
I
 
I
I
 
V
H
 
N
M
x
L
T
 
C
D
|
D
Y
 
A
V
x
M
V
 
V
E
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
A
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
T
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
R
 
L
L
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
x
G
L
 
V
I
x
S
M
x
L
F
x
L
N
x
P
Q
 
V
G
 
A
D
 
M
S
 
G
Q
 
E
A
 
E
Y
 
E
R
 
K
E
 
D
K
 
K
T
x
W
L
 
R
K
 
R
K
 
K
S
 
V
L
 
P
M
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
A
 
I
V
 
A
A
 
D
T
 
A
L
 
V
Q
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
S
T
 
I
L
 
I
P
 
K
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
V
 
V

5jcxA Trypanosoma brucei ptr1 in complex with inhibitor np-29 (see paper)
26% identity, 98% coverage: 6:235/235 of query aligns to 6:247/249 of 5jcxA

query
sites
5jcxA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
A
R
 
V
A
 
K
C
 
L
L
 
H
D
 
Q
R
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
I
 
V
I
 
V
V
 
I
T
x
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
Y
x
S
R
 
A
P
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
I
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
N
K
 
K
A
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
C
 
V
L
 
C
H
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
A
 
T
T
 
N
N
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
D
 
E
D
 
E
F
 
I
I
 
I
Q
 
N
A
 
S
L
 
C
K
 
F
S
 
R
R
 
A
T
 
F
D
 
G
T
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
D
 
A
W
x
F
I
 
Y
P
 
P
E
 
T
S
 
P
E
 
L
D
 
V
S
 
G
D
 
K
P
 
T
A
 
V
D
 
E
V
 
T
M
 
Q
N
 
V
A
 
A
-
 
E
M
 
L
M
 
I
Q
 
G
I
x
T
H
 
N
V
 
A
M
 
I
T
 
A
P
 
P
Y
 
F
R
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
T
 
S
C
 
-
R
 
-
S
 
-
M
 
-
L
 
F
E
 
A
Q
 
Q
E
 
R
G
 
Q
S
 
S
T
 
N
T
 
L
D
 
S
I
 
I
I
 
V
H
 
N
M
x
L
T
 
C
D
|
D
Y
 
A
V
 
M
V
 
V
E
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
A
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
T
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
R
 
L
L
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
S
x
G
L
 
V
I
x
S
M
x
L
F
 
L
N
x
P
Q
 
V
G
 
A
D
x
M
S
 
G
Q
 
E
A
 
E
Y
 
E
R
 
K
E
 
D
K
 
K
T
x
W
L
 
R
K
 
R
K
 
K
S
 
V
L
 
P
M
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
A
 
I
V
 
A
A
 
D
T
 
A
L
 
V
Q
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
S
T
 
I
L
 
I
P
 
K
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
V
 
V

5jcjA Trypanosoma brucei ptr1 in complex with inhibitor nmt-h037 (compound 7) (see paper)
26% identity, 98% coverage: 6:235/235 of query aligns to 6:247/249 of 5jcjA

query
sites
5jcjA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
A
R
 
V
A
 
K
C
 
L
L
 
H
D
 
Q
R
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
I
 
V
I
 
V
V
 
I
T
x
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
Y
x
S
R
 
A
P
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
I
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
N
K
 
K
A
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
C
 
V
L
 
C
H
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
A
 
T
T
 
N
N
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
D
 
E
D
 
E
F
 
I
I
 
I
Q
 
N
A
 
S
L
 
C
K
 
F
S
 
R
R
 
A
T
 
F
D
 
G
T
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
D
 
A
W
x
F
I
 
Y
P
 
P
E
 
T
S
 
P
E
 
L
D
 
V
S
 
G
D
 
K
P
 
T
A
 
V
D
 
E
V
 
T
M
 
Q
N
 
V
A
 
A
-
 
E
M
 
L
M
 
I
Q
 
G
I
x
T
H
 
N
V
 
A
M
 
I
T
 
A
P
 
P
Y
 
F
R
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
T
 
S
C
 
-
R
 
-
S
 
-
M
 
-
L
 
F
E
 
A
Q
 
Q
E
 
R
G
 
Q
S
 
S
T
 
N
T
 
L
D
 
S
I
 
I
I
 
V
H
 
N
M
x
L
T
 
C
D
|
D
Y
 
A
V
 
M
V
 
V
E
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
A
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
T
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
R
 
L
L
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
x
G
L
 
V
I
x
S
M
x
L
F
x
L
N
 
P
Q
 
V
G
 
A
D
 
M
S
 
G
Q
 
E
A
 
E
Y
 
E
R
 
K
E
 
D
K
 
K
T
x
W
L
 
R
K
 
R
K
 
K
S
 
V
L
 
P
M
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
A
 
I
V
 
A
A
 
D
T
 
A
L
 
V
Q
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
S
T
 
I
L
 
I
P
 
K
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
V
 
V

5izcA Trypanosoma brucei ptr1 in complex with inhibitor f032 (see paper)
26% identity, 98% coverage: 6:235/235 of query aligns to 6:247/249 of 5izcA

query
sites
5izcA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
x
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
A
R
 
V
A
 
K
C
 
L
L
 
H
D
 
Q
R
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
I
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
Y
x
S
R
 
A
P
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
I
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
N
K
 
K
A
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
C
 
V
L
 
C
H
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
A
 
T
T
 
N
N
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
D
 
E
D
 
E
F
 
I
I
 
I
Q
 
N
A
 
S
L
 
C
K
 
F
S
 
R
R
 
A
T
 
F
D
 
G
T
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
D
 
A
W
x
F
I
 
Y
P
 
P
E
 
T
S
 
P
E
 
L
D
 
V
S
 
G
D
 
K
P
 
T
A
 
V
D
 
E
V
 
T
M
 
Q
N
 
V
A
 
A
-
 
E
M
 
L
M
 
I
Q
 
G
I
x
T
H
 
N
V
 
A
M
 
I
T
 
A
P
 
P
Y
 
F
R
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
T
 
S
C
 
-
R
 
-
S
 
-
M
 
-
L
 
F
E
 
A
Q
 
Q
E
 
R
G
 
Q
S
 
S
T
 
N
T
 
L
D
 
S
I
 
I
I
 
V
H
 
N
M
x
L
T
 
C
D
|
D
Y
 
A
V
 
M
V
 
V
E
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
A
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
T
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
R
 
L
L
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
S
x
G
L
x
V
I
x
S
M
x
L
F
x
L
N
x
P
Q
 
V
G
 
A
D
 
M
S
 
G
Q
 
E
A
 
E
Y
 
E
R
 
K
E
 
D
K
 
K
T
 
W
L
 
R
K
 
R
K
 
K
S
 
V
L
 
P
M
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
A
 
I
V
 
A
A
 
D
T
 
A
L
 
V
Q
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
S
T
 
I
L
 
I
P
 
K
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
V
 
V

4wcfA Trypanosoma brucei ptr1 in complex with inhibitor 9 (see paper)
26% identity, 98% coverage: 6:235/235 of query aligns to 6:247/249 of 4wcfA

query
sites
4wcfA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
A
R
 
V
A
 
K
C
 
L
L
 
H
D
 
Q
R
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
I
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
Y
x
S
R
 
A
P
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
I
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
N
K
 
K
A
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
C
 
V
L
 
C
H
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
A
 
T
T
 
N
N
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
D
 
E
D
 
E
F
 
I
I
 
I
Q
 
N
A
 
S
L
 
C
K
 
F
S
 
R
R
 
A
T
 
F
D
 
G
T
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
D
 
A
W
x
F
I
 
Y
P
 
P
E
 
T
S
 
P
E
 
L
D
 
V
S
 
G
D
 
K
P
 
T
A
 
V
D
 
E
V
 
T
M
 
Q
N
 
V
A
 
A
-
 
E
M
 
L
M
 
I
Q
 
G
I
x
T
H
 
N
V
 
A
M
 
I
T
 
A
P
 
P
Y
 
F
R
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
T
 
S
C
 
-
R
 
-
S
 
-
M
 
-
L
 
F
E
 
A
Q
 
Q
E
 
R
G
 
Q
S
 
S
T
 
N
T
 
L
D
 
S
I
 
I
I
 
V
H
 
N
M
x
L
T
x
C
D
|
D
Y
 
A
V
 
M
V
 
V
E
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
A
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
T
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
R
 
L
L
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
x
G
L
x
V
I
x
S
M
 
L
F
 
L
N
x
P
Q
 
V
G
 
A
D
 
M
S
 
G
Q
 
E
A
 
E
Y
 
E
R
 
K
E
 
D
K
 
K
T
 
W
L
 
R
K
 
R
K
 
K
S
 
V
L
 
P
M
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
A
 
I
V
 
A
A
 
D
T
 
A
L
 
V
Q
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
S
T
 
I
L
 
I
P
 
K
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
V
 
V

4cmeA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
26% identity, 98% coverage: 6:235/235 of query aligns to 6:247/249 of 4cmeA

query
sites
4cmeA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
A
R
 
V
A
 
K
C
 
L
L
 
H
D
 
Q
R
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
I
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
 
Y
R
x
H
T
x
N
Y
x
S
R
 
A
P
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
I
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
N
K
 
K
A
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
C
 
V
L
 
C
H
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
A
 
T
T
 
N
N
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
D
 
E
D
 
E
F
 
I
I
 
I
Q
 
N
A
 
S
L
 
C
K
 
F
S
 
R
R
 
A
T
 
F
D
 
G
T
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
D
 
A
W
x
F
I
 
Y
P
 
P
E
 
T
S
 
P
E
 
L
D
 
V
S
 
G
D
 
K
P
 
T
A
 
V
D
 
E
V
 
T
M
 
Q
N
 
V
A
 
A
-
 
E
M
 
L
M
 
I
Q
 
G
I
x
T
H
 
N
V
 
A
M
 
I
T
 
A
P
 
P
Y
 
F
R
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
T
 
S
C
 
-
R
 
-
S
 
-
M
 
-
L
 
F
E
 
A
Q
 
Q
E
 
R
G
 
Q
S
 
S
T
 
N
T
 
L
D
 
S
I
 
I
I
 
V
H
 
N
M
x
L
T
 
C
D
|
D
Y
 
A
V
x
M
V
 
V
E
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
A
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
T
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
R
 
L
L
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
S
x
G
L
x
V
I
x
S
M
 
L
F
x
L
N
 
P
Q
 
V
G
 
A
D
 
M
S
 
G
Q
 
E
A
 
E
Y
 
E
R
 
K
E
 
D
K
 
K
T
 
W
L
 
R
K
 
R
K
 
K
S
 
V
L
 
P
M
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
A
 
I
V
 
A
A
 
D
T
 
A
L
 
V
Q
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
S
T
 
I
L
 
I
P
 
K
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
V
 
V

4cm9A Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
26% identity, 98% coverage: 6:235/235 of query aligns to 6:247/249 of 4cm9A

query
sites
4cm9A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
A
R
 
V
A
 
K
C
 
L
L
 
H
D
 
Q
R
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
I
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
Y
x
S
R
 
A
P
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
I
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
N
K
 
K
A
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
C
 
V
L
 
C
H
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
A
 
T
T
 
N
N
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
D
 
E
D
 
E
F
 
I
I
 
I
Q
 
N
A
 
S
L
 
C
K
 
F
S
 
R
R
 
A
T
 
F
D
 
G
T
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
D
 
A
W
x
F
I
 
Y
P
 
P
E
 
T
S
 
P
E
 
L
D
 
V
S
 
G
D
 
K
P
 
T
A
 
V
D
 
E
V
 
T
M
 
Q
N
 
V
A
 
A
-
 
E
M
 
L
M
 
I
Q
 
G
I
x
T
H
 
N
V
 
A
M
 
I
T
 
A
P
 
P
Y
 
F
R
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
T
 
S
C
 
-
R
 
-
S
 
-
M
 
-
L
 
F
E
 
A
Q
 
Q
E
 
R
G
 
Q
S
 
S
T
 
N
T
 
L
D
 
S
I
 
I
I
 
V
H
 
N
M
x
L
T
 
C
D
|
D
Y
 
A
V
x
M
V
 
V
E
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
A
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
T
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
R
 
L
L
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
S
x
G
L
x
V
I
x
S
M
 
L
F
x
L
N
x
P
Q
 
V
G
 
A
D
x
M
S
 
G
Q
 
E
A
 
E
Y
 
E
R
 
K
E
 
D
K
 
K
T
 
W
L
 
R
K
 
R
K
 
K
S
 
V
L
 
P
M
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
A
 
I
V
 
A
A
 
D
T
 
A
L
 
V
Q
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
S
T
 
I
L
 
I
P
 
K
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
V
 
V

3jqgA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor (NADP+) and inhibitor 6-[(4- methoxybenzyl)sulfanyl]pyrimidine-2,4-diamine (ax6) (see paper)
26% identity, 98% coverage: 6:235/235 of query aligns to 6:247/249 of 3jqgA

query
sites
3jqgA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
A
R
 
V
A
 
K
C
 
L
L
 
H
D
 
Q
R
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
I
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
Y
x
S
R
 
A
P
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
I
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
N
K
 
K
A
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
C
 
V
L
 
C
H
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
A
 
T
T
 
N
N
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
D
 
E
D
 
E
F
 
I
I
 
I
Q
 
N
A
 
S
L
 
C
K
 
F
S
 
R
R
 
A
T
 
F
D
 
G
T
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
D
 
A
W
x
F
I
 
Y
P
 
P
E
 
T
S
 
P
E
 
L
D
 
V
S
 
G
D
 
K
P
 
T
A
 
V
D
 
E
V
 
T
M
 
Q
N
 
V
A
 
A
-
 
E
M
 
L
M
 
I
Q
 
G
I
x
T
H
 
N
V
 
A
M
 
I
T
 
A
P
 
P
Y
 
F
R
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
T
 
S
C
 
-
R
 
-
S
 
-
M
 
-
L
 
F
E
 
A
Q
 
Q
E
 
R
G
 
Q
S
 
S
T
 
N
T
 
L
D
 
S
I
 
I
I
 
V
H
 
N
M
x
L
T
x
C
D
|
D
Y
 
A
V
 
M
V
 
V
E
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
A
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
T
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
R
 
L
L
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
S
x
G
L
x
V
I
x
S
M
 
L
F
 
L
N
x
P
Q
 
V
G
 
A
D
 
M
S
 
G
Q
 
E
A
 
E
Y
 
E
R
 
K
E
 
D
K
 
K
T
x
W
L
 
R
K
 
R
K
 
K
S
 
V
L
 
P
M
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
A
 
I
V
 
A
A
 
D
T
 
A
L
 
V
Q
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
S
T
 
I
L
 
I
P
 
K
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
V
 
V

3jqfA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor (NADP+) and inhibitor 1,3,5- triazine-2,4,6-triamine (ax2) (see paper)
26% identity, 98% coverage: 6:235/235 of query aligns to 6:247/249 of 3jqfA

query
sites
3jqfA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
A
R
 
V
A
 
K
C
 
L
L
 
H
D
 
Q
R
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
I
 
V
I
 
V
V
 
I
T
x
H
Y
 
Y
R
x
H
T
x
N
Y
x
S
R
 
A
P
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
I
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
N
K
 
K
A
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
C
 
V
L
 
C
H
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
A
 
T
T
 
N
N
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
D
 
E
D
 
E
F
 
I
I
 
I
Q
 
N
A
 
S
L
 
C
K
 
F
S
 
R
R
 
A
T
 
F
D
 
G
T
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
D
 
A
W
x
F
I
 
Y
P
 
P
E
 
T
S
 
P
E
 
L
D
 
V
S
 
G
D
 
K
P
 
T
A
 
V
D
 
E
V
 
T
M
 
Q
N
 
V
A
 
A
-
 
E
M
 
L
M
 
I
Q
 
G
I
x
T
H
 
N
V
 
A
M
 
I
T
 
A
P
 
P
Y
 
F
R
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
T
 
S
C
 
-
R
 
-
S
 
-
M
 
-
L
 
F
E
 
A
Q
 
Q
E
 
R
G
 
Q
S
 
S
T
 
N
T
 
L
D
 
S
I
 
I
I
 
V
H
 
N
M
x
L
T
 
C
D
|
D
Y
 
A
V
 
M
V
 
V
E
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
A
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
T
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
R
 
L
L
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
S
x
G
L
 
V
I
x
S
M
x
L
F
 
L
N
 
P
Q
 
V
G
 
A
D
 
M
S
 
G
Q
 
E
A
 
E
Y
 
E
R
 
K
E
 
D
K
 
K
T
 
W
L
 
R
K
 
R
K
 
K
S
 
V
L
 
P
M
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
A
 
I
V
 
A
A
 
D
T
 
A
L
 
V
Q
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
S
T
 
I
L
 
I
P
 
K
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
V
 
V

3jqeA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor (NADP+) and inhibitor 2- amino-6-(4-methoxyphenyl)-4-oxo-4,7-dihydro-3h-pyrrolo[2,3- d]pyrimidine-5-carbonitrile (dx8) (see paper)
26% identity, 98% coverage: 6:235/235 of query aligns to 6:247/249 of 3jqeA

query
sites
3jqeA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
A
R
 
V
A
 
K
C
 
L
L
 
H
D
 
Q
R
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
I
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
 
Y
R
x
H
T
x
N
Y
x
S
R
 
A
P
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
I
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
N
K
 
K
A
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
C
 
V
L
 
C
H
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
A
 
T
T
 
N
N
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
D
 
E
D
 
E
F
 
I
I
 
I
Q
 
N
A
 
S
L
 
C
K
 
F
S
 
R
R
 
A
T
 
F
D
 
G
T
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
D
 
A
W
x
F
I
 
Y
P
 
P
E
 
T
S
 
P
E
 
L
D
 
V
S
 
G
D
 
K
P
 
T
A
 
V
D
 
E
V
 
T
M
 
Q
N
 
V
A
 
A
-
 
E
M
 
L
M
 
I
Q
 
G
I
x
T
H
 
N
V
 
A
M
 
I
T
 
A
P
 
P
Y
 
F
R
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
T
 
S
C
 
-
R
 
-
S
 
-
M
 
-
L
 
F
E
 
A
Q
 
Q
E
 
R
G
 
Q
S
 
S
T
 
N
T
 
L
D
 
S
I
 
I
I
 
V
H
 
N
M
x
L
T
 
C
D
|
D
Y
 
A
V
x
M
V
 
V
E
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
A
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
T
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
R
 
L
L
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
S
x
G
L
x
V
I
x
S
M
x
L
F
 
L
N
x
P
Q
 
V
G
 
A
D
 
M
S
 
G
Q
 
E
A
 
E
Y
 
E
R
 
K
E
 
D
K
 
K
T
 
W
L
 
R
K
 
R
K
 
K
S
 
V
L
 
P
M
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
A
 
I
V
 
A
A
 
D
T
 
A
L
 
V
Q
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
S
T
 
I
L
 
I
P
 
K
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
V
 
V

3jqdA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor (NADP+) and inhibitor 2- amino-4-oxo-6-phenyl-4,7-dihydro-3h-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5- carbonitrile (dx7) (see paper)
26% identity, 98% coverage: 6:235/235 of query aligns to 6:247/249 of 3jqdA

query
sites
3jqdA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
A
R
 
V
A
 
K
C
 
L
L
 
H
D
 
Q
R
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
I
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
 
Y
R
x
H
T
x
N
Y
x
S
R
 
A
P
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
I
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
N
K
 
K
A
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
C
 
V
L
 
C
H
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
A
 
T
T
 
N
N
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
D
 
E
D
 
E
F
 
I
I
 
I
Q
 
N
A
 
S
L
 
C
K
 
F
S
 
R
R
 
A
T
 
F
D
 
G
T
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
D
 
A
W
x
F
I
 
Y
P
 
P
E
 
T
S
 
P
E
 
L
D
 
V
S
 
G
D
 
K
P
 
T
A
 
V
D
 
E
V
 
T
M
 
Q
N
 
V
A
 
A
-
 
E
M
 
L
M
 
I
Q
 
G
I
x
T
H
 
N
V
 
A
M
 
I
T
 
A
P
 
P
Y
 
F
R
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
T
 
S
C
 
-
R
 
-
S
 
-
M
 
-
L
 
F
E
 
A
Q
 
Q
E
 
R
G
 
Q
S
 
S
T
 
N
T
 
L
D
 
S
I
 
I
I
 
V
H
 
N
M
x
L
T
 
C
D
|
D
Y
 
A
V
 
M
V
 
V
E
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
A
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
T
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
R
 
L
L
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
S
x
G
L
x
V
I
x
S
M
 
L
F
 
L
N
x
P
Q
 
V
G
 
A
D
 
M
S
 
G
Q
 
E
A
 
E
Y
 
E
R
 
K
E
 
D
K
 
K
T
 
W
L
 
R
K
 
R
K
 
K
S
 
V
L
 
P
M
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
A
 
I
V
 
A
A
 
D
T
 
A
L
 
V
Q
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
S
T
 
I
L
 
I
P
 
K
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
V
 
V

3jqcA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor (NADP+) and inhibitor 2- amino-6-bromo-4-oxo-4,7-dihydro-3h-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5- carbonitrile (ju2) (see paper)
26% identity, 98% coverage: 6:235/235 of query aligns to 6:247/249 of 3jqcA

query
sites
3jqcA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
A
R
 
V
A
 
K
C
 
L
L
 
H
D
 
Q
R
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
I
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
Y
x
S
R
 
A
P
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
I
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
N
K
 
K
A
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
C
 
V
L
 
C
H
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
A
 
T
T
 
N
N
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
D
 
E
D
 
E
F
 
I
I
 
I
Q
 
N
A
 
S
L
 
C
K
 
F
S
 
R
R
 
A
T
 
F
D
 
G
T
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
D
 
A
W
x
F
I
 
Y
P
 
P
E
 
T
S
 
P
E
 
L
D
 
V
S
 
G
D
 
K
P
 
T
A
 
V
D
 
E
V
 
T
M
 
Q
N
 
V
A
 
A
-
 
E
M
 
L
M
 
I
Q
 
G
I
x
T
H
 
N
V
 
A
M
 
I
T
 
A
P
 
P
Y
 
F
R
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
T
 
S
C
 
-
R
 
-
S
 
-
M
 
-
L
 
F
E
 
A
Q
 
Q
E
 
R
G
 
Q
S
 
S
T
 
N
T
 
L
D
 
S
I
 
I
I
 
V
H
 
N
M
x
L
T
 
C
D
|
D
Y
 
A
V
 
M
V
 
V
E
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
A
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
T
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
R
 
L
L
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
S
x
G
L
x
V
I
x
S
M
x
L
F
 
L
N
x
P
Q
 
V
G
 
A
D
 
M
S
 
G
Q
 
E
A
 
E
Y
 
E
R
 
K
E
 
D
K
 
K
T
 
W
L
 
R
K
 
R
K
 
K
S
 
V
L
 
P
M
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
A
 
I
V
 
A
A
 
D
T
 
A
L
 
V
Q
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
S
T
 
I
L
 
I
P
 
K
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
V
 
V

3jqbA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor (NADP+) and inhibitor 2- amino-5-(2-phenylethyl)-3,7-dihydro-4h-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-one (dx6) (see paper)
26% identity, 98% coverage: 6:235/235 of query aligns to 6:247/249 of 3jqbA

query
sites
3jqbA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
A
R
 
V
A
 
K
C
 
L
L
 
H
D
 
Q
R
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
I
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
Y
x
S
R
 
A
P
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
I
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
N
K
 
K
A
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
C
 
V
L
 
C
H
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
A
 
T
T
 
N
N
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
D
 
E
D
 
E
F
 
I
I
 
I
Q
 
N
A
 
S
L
 
C
K
 
F
S
 
R
R
 
A
T
 
F
D
 
G
T
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
D
 
A
W
x
F
I
 
Y
P
 
P
E
 
T
S
 
P
E
 
L
D
 
V
S
 
G
D
 
K
P
 
T
A
 
V
D
 
E
V
 
T
M
 
Q
N
 
V
A
 
A
-
 
E
M
 
L
M
 
I
Q
 
G
I
x
T
H
 
N
V
 
A
M
 
I
T
 
A
P
 
P
Y
 
F
R
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
T
 
S
C
 
-
R
 
-
S
 
-
M
 
-
L
 
F
E
 
A
Q
 
Q
E
 
R
G
 
Q
S
 
S
T
 
N
T
 
L
D
 
S
I
 
I
I
 
V
H
 
N
M
x
L
T
x
C
D
|
D
Y
 
A
V
 
M
V
 
V
E
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
A
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
T
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
R
 
L
L
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
S
x
G
L
 
V
I
x
S
M
x
L
F
 
L
N
 
P
Q
 
V
G
 
A
D
x
M
S
 
G
Q
 
E
A
 
E
Y
 
E
R
 
K
E
 
D
K
 
K
T
x
W
L
 
R
K
 
R
K
 
K
S
 
V
L
 
P
M
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
A
 
I
V
 
A
A
 
D
T
 
A
L
 
V
Q
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
S
T
 
I
L
 
I
P
 
K
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
V
 
V

Query Sequence

>GFF3777 FitnessBrowser__Marino:GFF3777
MTAPILITGAGQRIGLAFARACLDRGQPIIVTYRTYRPAIDALQKAGAVCLHADFATNAG
IDDFIQALKSRTDTLRAIIHNASDWIPESEDSDPADVMNAMMQIHVMTPYRINLTCRSML
EQEGSTTDIIHMTDYVVEKGSAKHIAYAASKAALTNLTLSFARLLAPRVKVNAVAPSLIM
FNQGDSQAYREKTLKKSLMGIEPGAEVAVATLQFLLDNPYITGRTLPLDGGRHLV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory