SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3782 FitnessBrowser__Marino:GFF3782 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2jgvB Structure of staphylococcus aureus d-tagatose-6-phosphate kinase in complex with adp (see paper)
31% identity, 95% coverage: 4:307/321 of query aligns to 6:311/314 of 2jgvB

query
sites
2jgvB
I
 
I
L
 
L
T
 
T
I
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
S
L
 
V
D
 
D
L
 
I
S
 
S
V
 
Y
E
 
P
T
 
L
A
 
T
P
 
A
L
 
L
A
 
K
L
 
L
G
 
D
E
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
T
 
V
G
 
Q
H
 
E
T
 
V
L
 
S
M
 
K
E
 
T
P
 
A
A
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
I
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
T
R
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
L
 
V
G
 
G
H
 
E
S
 
P
V
 
V
T
 
L
V
 
A
A
 
S
G
 
G
L
 
F
L
 
I
G
 
G
D
 
G
A
 
E
N
 
L
A
 
G
A
 
Q
P
 
F
F
 
I
E
 
A
R
 
K
L
 
K
F
 
L
E
 
D
A
 
H
E
 
A
G
 
D
L
 
I
Q
 
K
D
 
H
S
 
A
F
 
F
V
 
Y
R
 
N
V
 
I
P
 
K
G
 
G
Q
 
E
N
 
T
R
 
R
N
 
N
N
 
C
I
 
I
K
 
A
I
 
I
A
 
L
E
 
H
A
 
E
G
 
G
G
 
Q
R
 
Q
V
 
T
T
 
E
D
 
I
L
 
L
-
 
E
N
 
Q
G
 
G
P
 
P
G
 
E
F
 
I
R
 
D
A
 
N
P
 
Q
E
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
-
Q
 
-
R
 
G
L
 
F
Q
 
I
L
 
K
R
 
H
L
 
F
K
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
E
E
 
K
C
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
A
I
 
I
G
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
K
G
 
G
F
 
L
P
 
N
P
 
Q
S
 
D
G
 
Y
L
 
Y
A
 
A
I
 
Q
L
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
R
A
 
C
S
 
Q
R
 
N
A
 
K
D
 
G
K
 
V
P
 
P
V
 
V
W
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
C
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
T
L
 
L
K
 
Q
A
 
T
G
 
V
I
 
L
K
 
E
-
 
N
-
 
P
A
 
Y
G
 
K
P
 
P
Y
 
T
A
 
V
I
 
I
K
 
K
P
 
P
N
 
N
T
 
I
D
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
Y
D
 
Q
W
 
L
A
 
L
G
 
N
T
 
Q
P
 
P
L
 
L
K
 
D
D
 
E
-
 
S
L
 
L
A
 
E
S
 
S
V
 
L
A
 
K
A
 
Q
T
 
A
V
 
V
D
 
S
G
 
Q
I
 
P
R
 
L
A
 
F
G
 
E
G
 
G
V
 
I
S
 
E
H
 
W
V
 
I
V
 
I
V
 
V
S
|
S
M
 
L
G
 
G
A
|
A
D
 
Q
G
 
G
V
 
A
F
 
F
W
 
A
S
 
K
S
 
H
P
 
N
A
 
H
G
 
T
I
 
F
L
 
Y
R
 
R
S
 
V
R
 
N
V
 
I
P
 
P
P
 
T
V
x
I
S
 
S
L
 
V
V
 
L
S
 
N
T
x
P
V
 
V
C
x
G
A
x
S
G
|
G
D
|
D
T
 
S
L
 
T
L
 
V
A
 
A
G
 
G
M
 
I
L
 
T
H
 
S
G
 
A
V
 
I
L
 
L
G
 
N
E
 
H
Q
 
E
S
 
N
E
 
D
D
 
H
T
 
D
V
 
L
L
 
L
A
 
K
F
 
K
A
 
A
T
x
N
A
 
T
L
 
L
S
x
G
A
x
M
E
 
L
C
 
N
V
 
A
Q
 
Q
H
 
E
I
 
A
G
 
Q
V
 
T
G
 
G
D
 
Y
P
 
V
G
 
N
A
 
L
P
 
N
D
 
N
F
 
Y
H
 
D
S
 
D
L
 
L
L
 
F
Q
 
N
Q
 
Q
T
 
I
R
 
E
V
 
V

2jg1A Structure of staphylococcus aureus d-tagatose-6-phosphate kinase with cofactor and substrate (see paper)
30% identity, 95% coverage: 4:307/321 of query aligns to 10:315/318 of 2jg1A

query
sites
2jg1A
I
 
I
L
 
L
T
 
T
I
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
S
L
 
V
D
 
D
L
 
I
S
 
S
V
 
Y
E
 
P
T
 
L
A
 
T
P
 
A
L
 
L
A
 
K
L
 
L
G
 
D
E
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
T
 
V
G
 
Q
H
 
E
T
 
V
L
 
S
M
 
K
E
 
T
P
 
A
A
 
G
G
 
G
K
|
K
G
 
G
I
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
T
R
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
L
 
V
G
 
G
H
 
E
S
 
P
V
 
V
T
 
L
V
 
A
A
 
S
G
 
G
L
 
F
L
 
I
G
 
G
D
 
G
A
 
E
N
 
L
A
 
G
A
 
Q
P
 
F
F
 
I
E
 
A
R
 
K
L
 
K
F
 
L
E
 
D
A
 
H
E
 
A
G
 
D
L
 
I
Q
 
K
D
 
H
S
 
A
F
 
F
V
 
Y
R
 
N
V
 
I
P
 
K
G
 
G
Q
 
E
N
 
T
R
 
R
N
 
N
N
 
C
I
 
I
K
 
A
I
 
I
A
 
L
E
 
H
A
 
E
G
 
G
G
 
Q
R
 
Q
V
 
T
T
 
E
D
 
I
L
 
L
-
 
E
N
 
Q
G
 
G
P
 
P
G
 
E
F
 
I
R
 
D
A
 
N
P
 
Q
E
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
-
Q
 
-
R
 
G
L
 
F
Q
 
I
L
 
K
R
 
H
L
 
F
K
 
E
S
 
Q
L
 
M
L
 
M
P
 
E
E
 
K
C
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
A
I
 
I
G
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
K
G
 
G
F
 
L
P
 
N
P
 
Q
S
 
D
G
 
Y
L
 
Y
A
 
A
I
 
Q
L
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
R
A
 
C
S
 
Q
R
 
N
A
 
K
D
 
G
K
 
V
P
 
P
V
 
V
W
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
C
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
T
L
 
L
K
 
Q
A
 
T
G
 
V
I
 
L
K
 
E
-
 
N
-
 
P
A
 
Y
G
 
K
P
 
P
Y
 
T
A
 
V
I
 
I
K
 
K
P
 
P
N
|
N
T
 
I
D
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
Y
D
 
Q
W
 
L
A
 
L
G
 
N
T
 
Q
P
 
P
L
 
L
K
 
D
D
 
E
-
 
S
L
 
L
A
 
E
S
 
S
V
 
L
A
 
K
A
 
Q
T
 
A
V
 
V
D
 
S
G
 
Q
I
 
P
R
 
L
A
 
F
G
 
E
G
 
G
V
 
I
S
 
E
H
 
W
V
 
I
V
 
I
V
 
V
S
|
S
M
 
L
G
|
G
A
 
A
D
 
Q
G
|
G
V
 
A
F
 
F
W
 
A
S
 
K
S
 
H
P
 
N
A
 
H
G
 
T
I
 
F
L
 
Y
R
 
R
S
 
V
R
 
N
V
 
I
P
 
P
P
 
T
V
x
I
S
 
S
L
x
V
V
 
L
S
 
N
T
 
P
V
 
V
C
x
G
A
x
S
G
|
G
D
|
D
T
 
S
L
x
T
L
 
V
A
 
A
G
 
G
M
 
I
L
 
T
H
 
S
G
 
A
V
 
I
L
 
L
G
 
N
E
 
H
Q
 
E
S
 
N
E
 
D
D
 
H
T
 
D
V
 
L
L
 
L
A
 
K
F
 
K
A
 
A
T
x
N
A
 
T
L
 
L
S
x
G
A
x
M
E
 
L
C
 
N
V
 
A
Q
 
Q
H
 
E
I
 
A
G
 
Q
V
 
T
G
 
G
D
 
Y
P
 
V
G
 
N
A
 
L
P
 
N
D
 
N
F
 
Y
H
 
D
S
 
D
L
 
L
L
 
F
Q
 
N
Q
 
Q
T
 
I
R
 
E
V
 
V

2jg1C Structure of staphylococcus aureus d-tagatose-6-phosphate kinase with cofactor and substrate (see paper)
30% identity, 95% coverage: 4:307/321 of query aligns to 7:312/315 of 2jg1C

query
sites
2jg1C
I
 
I
L
 
L
T
 
T
I
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
S
L
 
V
D
|
D
L
 
I
S
 
S
V
 
Y
E
 
P
T
 
L
A
 
T
P
 
A
L
 
L
A
 
K
L
 
L
G
 
D
E
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
T
 
V
G
 
Q
H
 
E
T
 
V
L
 
S
M
 
K
E
 
T
P
 
A
A
 
G
G
|
G
K
|
K
G
 
G
I
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
T
R
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
L
 
V
G
 
G
H
 
E
S
 
P
V
 
V
T
 
L
V
 
A
A
 
S
G
 
G
L
 
F
L
 
I
G
 
G
D
 
G
A
 
E
N
 
L
A
 
G
A
 
Q
P
 
F
F
 
I
E
 
A
R
 
K
L
 
K
F
 
L
E
 
D
A
 
H
E
 
A
G
 
D
L
 
I
Q
 
K
D
 
H
S
 
A
F
 
F
V
 
Y
R
 
N
V
 
I
P
 
K
G
 
G
Q
 
E
N
 
T
R
|
R
N
 
N
N
x
C
I
 
I
K
 
A
I
 
I
A
 
L
E
 
H
A
 
E
G
 
G
G
 
Q
R
 
Q
V
 
T
T
 
E
D
 
I
L
|
L
-
 
E
N
 
Q
G
 
G
P
 
P
G
 
E
F
 
I
R
 
D
A
 
N
P
 
Q
E
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
-
Q
 
-
R
 
G
L
 
F
Q
 
I
L
 
K
R
 
H
L
 
F
K
 
E
S
 
Q
L
 
M
L
 
M
P
 
E
E
 
K
C
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
A
I
 
I
G
 
S
G
|
G
S
|
S
L
 
L
P
 
P
D
 
K
G
 
G
F
 
L
P
 
N
P
 
Q
S
 
D
G
 
Y
L
 
Y
A
 
A
I
 
Q
L
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
R
A
 
C
S
 
Q
R
 
N
A
 
K
D
 
G
K
 
V
P
 
P
V
 
V
W
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
C
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
T
L
 
L
K
 
Q
A
 
T
G
 
V
I
 
L
K
 
E
-
 
N
-
 
P
A
 
Y
G
 
K
P
 
P
Y
 
T
A
 
V
I
 
I
K
 
K
P
 
P
N
 
N
T
 
I
D
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
Y
D
 
Q
W
 
L
A
 
L
G
 
N
T
 
Q
P
 
P
L
 
L
K
 
D
D
 
E
-
 
S
L
 
L
A
 
E
S
 
S
V
 
L
A
 
K
A
 
Q
T
 
A
V
 
V
D
 
S
G
 
Q
I
 
P
R
 
L
A
 
F
G
 
E
G
 
G
V
 
I
S
 
E
H
 
W
V
 
I
V
 
I
V
 
V
S
|
S
M
 
L
G
|
G
A
|
A
D
 
Q
G
|
G
V
 
A
F
 
F
W
 
A
S
 
K
S
 
H
P
 
N
A
 
H
G
 
T
I
 
F
L
 
Y
R
 
R
S
 
V
R
 
N
V
x
I
P
 
P
P
 
T
V
x
I
S
 
S
L
x
V
V
 
L
S
 
N
T
 
P
V
|
V
C
x
G
A
x
S
G
|
G
D
|
D
T
 
S
L
x
T
L
 
V
A
 
A
G
 
G
M
 
I
L
 
T
H
 
S
G
 
A
V
 
I
L
 
L
G
 
N
E
 
H
Q
 
E
S
 
N
E
 
D
D
 
H
T
 
D
V
 
L
L
 
L
A
 
K
F
 
K
A
 
A
T
x
N
A
 
T
L
 
L
S
x
G
A
x
M
E
 
L
C
 
N
V
 
A
Q
 
Q
H
 
E
I
 
A
G
 
Q
V
 
T
G
 
G
D
 
Y
P
 
V
G
 
N
A
 
L
P
 
N
D
 
N
F
 
Y
H
 
D
S
 
D
L
 
L
L
 
F
Q
 
N
Q
 
Q
T
 
I
R
 
E
V
 
V

2f02A Crystal structure of lacc from enterococcus faecalis in complex with atp
31% identity, 81% coverage: 4:264/321 of query aligns to 3:266/319 of 2f02A

query
sites
2f02A
I
 
I
L
 
V
T
 
T
I
 
V
T
 
T
L
 
M
N
 
N
P
 
P
A
 
S
L
 
I
D
 
D
L
 
I
S
 
S
V
 
Y
E
 
L
T
 
L
A
 
D
P
 
H
L
 
L
A
 
K
L
 
L
G
 
D
E
 
T
V
 
V
N
 
N
R
 
R
T
 
T
G
 
S
H
 
Q
T
 
V
L
 
T
M
 
K
E
 
T
P
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
I
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
T
R
 
R
V
 
V
L
 
I
A
 
H
R
 
D
L
 
L
G
 
G
H
 
G
S
 
D
V
 
V
T
 
I
V
 
A
A
 
T
G
 
G
L
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
G
A
 
F
N
 
H
A
 
G
A
 
A
P
 
F
F
 
I
E
 
A
R
 
N
L
 
E
F
 
L
E
 
K
A
 
K
E
 
A
G
 
N
L
 
I
Q
 
P
D
 
Q
S
 
A
F
 
F
V
 
T
R
 
S
V
 
I
P
 
K
G
 
E
Q
 
E
N
 
T
R
 
R
N
 
D
N
 
S
I
 
I
K
 
A
I
 
I
A
 
L
E
 
H
A
 
E
G
 
G
G
 
N
R
 
Q
V
 
T
T
 
E
D
 
I
L
 
L
N
 
E
G
 
A
P
 
G
G
 
P
F
 
T
R
 
V
A
 
S
P
 
P
E
 
E
D
 
E
A
 
I
L
 
S
Q
 
N
R
 
F
L
 
L
Q
 
E
L
 
-
R
 
N
L
 
F
K
 
D
S
 
Q
L
 
L
L
 
I
P
 
K
E
 
Q
C
 
A
D
 
E
A
 
I
V
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
A
D
 
K
G
 
G
F
 
L
P
 
P
P
 
S
S
 
D
G
 
F
L
 
Y
A
 
Q
I
 
E
L
 
L
V
 
V
E
 
Q
Q
 
K
A
 
A
S
 
H
R
 
A
A
 
Q
D
 
E
K
 
V
P
 
K
V
 
V
W
 
L
L
 
L
D
 
D
T
 
T
S
 
S
G
 
G
A
 
D
G
 
S
L
 
L
K
 
R
A
 
Q
G
 
V
I
 
L
K
 
Q
A
 
G
-
 
P
-
 
W
G
 
K
P
 
P
Y
 
Y
A
 
L
I
 
I
K
 
K
P
 
P
N
|
N
T
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
E
D
 
G
W
 
L
A
 
L
G
 
G
T
 
Q
P
 
D
L
 
F
K
 
S
D
 
E
-
 
N
-
 
P
L
 
L
A
 
A
S
 
A
V
 
V
A
 
Q
A
 
T
T
 
A
V
 
L
D
 
T
G
 
K
I
 
P
R
 
M
A
 
F
G
 
A
G
 
G
V
 
I
S
 
E
H
 
W
V
 
I
V
 
V
V
 
I
S
|
S
M
 
L
G
|
G
A
 
K
D
 
D
G
 
G
V
 
A
F
 
I
W
 
A
S
 
K
S
 
H
P
 
H
A
 
D
G
 
Q
I
 
F
L
 
Y
R
 
R
S
 
V
R
 
K
V
x
I
P
 
P
P
 
T
V
x
I
S
 
Q
L
 
A
V
 
K
S
 
N
T
 
P
V
 
V
C
x
G
A
x
S
G
|
G
D
 
D
T
 
A
L
x
T
L
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
L
L
 
A
H
 
Y
G
 
G
V
 
L

Sites not aligning to the query:

3uqdB Crystal structure of the phosphofructokinase-2 from escherichia coli in complex with substrates and products (see paper)
31% identity, 87% coverage: 1:279/321 of query aligns to 1:281/309 of 3uqdB

query
sites
3uqdB
M
 
M
A
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
Y
T
 
T
I
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
|
D
L
 
S
S
 
A
V
 
T
E
 
I
T
 
T
A
 
P
P
 
Q
L
 
I
A
x
Y
L
 
P
G
 
E
E
 
G
V
x
K
N
 
L
R
|
R
T
 
C
G
 
T
H
 
A
T
 
P
L
 
V
M
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
G
G
|
G
K
 
G
G
 
G
I
 
I
N
|
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
H
L
 
L
G
 
G
H
 
G
S
 
S
V
 
A
T
 
T
V
 
A
A
 
I
G
 
F
L
 
P
L
 
A
G
 
G
D
 
G
A
 
A
N
 
T
A
 
G
A
 
E
P
 
H
F
 
L
E
 
V
R
 
S
L
 
L
F
 
L
E
 
A
A
 
D
E
 
E
G
 
N
L
 
V
Q
 
P
D
 
V
S
 
A
F
 
T
V
 
V
R
 
E
V
 
A
P
 
K
G
 
D
Q
 
W
N
 
T
R
|
R
N
 
Q
N
 
N
I
 
L
K
 
H
I
 
V
-
 
H
A
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
S
G
 
G
R
 
E
V
 
Q
T
 
Y
D
x
R
L
 
F
N
 
V
G
 
M
P
 
P
G
 
G
F
 
A
R
 
A
A
 
L
P
 
N
E
 
E
D
 
D
A
 
E
L
 
F
Q
 
R
R
 
Q
L
 
L
Q
 
E
L
 
E
R
 
Q
L
 
V
K
 
L
S
 
E
L
 
I
L
 
-
P
 
-
E
 
E
C
 
S
D
 
G
A
 
A
V
 
I
-
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
S
G
 
G
S
|
S
L
 
L
P
 
P
D
 
P
G
 
G
F
 
V
P
 
K
P
 
L
S
 
E
G
 
K
L
 
L
A
 
T
I
 
Q
L
 
L
V
 
I
E
 
S
Q
 
A
A
 
A
S
 
Q
R
 
K
A
 
Q
D
 
G
K
 
I
P
 
R
V
 
C
W
 
I
L
 
V
D
 
D
T
 
S
S
 
S
G
 
G
A
 
E
G
 
A
L
 
L
K
 
S
A
 
A
G
 
A
I
 
L
K
 
A
A
 
I
G
 
G
P
 
N
Y
 
I
A
 
E
-
 
L
I
 
V
K
|
K
P
 
P
N
|
N
T
 
Q
D
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
S
D
 
A
W
 
L
A
 
V
G
 
N
T
 
R
P
 
E
L
 
L
K
 
T
D
 
Q
L
 
P
A
 
D
S
 
D
V
 
V
-
 
R
A
 
K
A
 
A
T
 
A
V
 
Q
D
 
E
G
 
I
I
 
V
R
 
N
A
 
S
G
 
G
G
 
K
V
 
A
S
 
K
H
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
V
S
|
S
M
 
L
G
|
G
A
x
P
D
 
Q
G
|
G
V
 
A
F
 
L
W
 
G
S
 
V
S
 
D
P
 
S
A
 
E
G
 
N
I
 
C
L
 
I
R
 
Q
S
 
V
R
 
V
V
 
P
P
 
P
P
 
P
V
 
V
S
 
K
L
x
S
V
 
Q
S
 
S
T
 
T
V
 
V
C
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
S
L
x
M
L
 
V
A
 
G
G
 
A
M
 
M
L
 
T
H
 
L
G
 
K
V
 
L
L
 
A
G
 
E
E
 
N
Q
 
A
S
 
S
E
 
L
D
 
E
T
 
E
V
 
M
L
 
V
A
 
R
F
 
F
A
 
G
T
x
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3uqdA Crystal structure of the phosphofructokinase-2 from escherichia coli in complex with substrates and products (see paper)
31% identity, 87% coverage: 1:279/321 of query aligns to 1:281/309 of 3uqdA

query
sites
3uqdA
M
 
M
A
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
Y
T
 
T
I
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
|
D
L
 
S
S
 
A
V
 
T
E
 
I
T
 
T
A
 
P
P
 
Q
L
 
I
A
 
Y
L
 
P
G
 
E
E
 
G
V
x
K
N
 
L
R
|
R
T
 
C
G
 
T
H
 
A
T
 
P
L
 
V
M
 
F
E
 
E
P
 
P
A
x
G
G
|
G
K
 
G
G
 
G
I
 
I
N
|
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
H
L
 
L
G
 
G
H
 
G
S
 
S
V
 
A
T
 
T
V
 
A
A
 
I
G
 
F
L
 
P
L
 
A
G
 
G
D
 
G
A
 
A
N
 
T
A
 
G
A
 
E
P
 
H
F
 
L
E
 
V
R
 
S
L
 
L
F
 
L
E
 
A
A
 
D
E
 
E
G
 
N
L
 
V
Q
 
P
D
 
V
S
 
A
F
 
T
V
 
V
R
 
E
V
 
A
P
 
K
G
 
D
Q
 
W
N
 
T
R
|
R
N
 
Q
N
 
N
I
 
L
K
 
H
I
 
V
-
 
H
A
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
S
G
 
G
R
 
E
V
 
Q
T
 
Y
D
 
R
L
 
F
N
 
V
G
 
M
P
 
P
G
 
G
F
 
A
R
 
A
A
 
L
P
 
N
E
 
E
D
 
D
A
 
E
L
 
F
Q
 
R
R
 
Q
L
 
L
Q
 
E
L
 
E
R
 
Q
L
 
V
K
 
L
S
 
E
L
 
I
L
 
-
P
 
-
E
 
E
C
 
S
D
 
G
A
 
A
V
 
I
-
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
S
G
 
G
S
|
S
L
 
L
P
 
P
D
 
P
G
 
G
F
 
V
P
 
K
P
 
L
S
 
E
G
 
K
L
 
L
A
 
T
I
 
Q
L
 
L
V
 
I
E
 
S
Q
 
A
A
 
A
S
 
Q
R
 
K
A
 
Q
D
 
G
K
 
I
P
 
R
V
 
C
W
 
I
L
 
V
D
 
D
T
 
S
S
 
S
G
 
G
A
 
E
G
 
A
L
 
L
K
 
S
A
 
A
G
 
A
I
 
L
K
 
A
A
 
I
G
 
G
P
 
N
Y
 
I
A
 
E
-
 
L
I
 
V
K
|
K
P
 
P
N
 
N
T
 
Q
D
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
S
D
 
A
W
 
L
A
 
V
G
 
N
T
 
R
P
 
E
L
 
L
K
 
T
D
 
Q
L
 
P
A
 
D
S
 
D
V
 
V
-
 
R
A
 
K
A
 
A
T
 
A
V
 
Q
D
 
E
G
 
I
I
 
V
R
 
N
A
 
S
G
 
G
G
 
K
V
 
A
S
 
K
H
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
V
S
|
S
M
 
L
G
|
G
A
x
P
D
 
Q
G
|
G
V
 
A
F
 
L
W
 
G
S
 
V
S
 
D
P
 
S
A
 
E
G
 
N
I
 
C
L
 
I
R
 
Q
S
 
V
R
 
V
V
 
P
P
 
P
P
 
P
V
 
V
S
 
K
L
 
S
V
 
Q
S
 
S
T
|
T
V
 
V
C
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
S
L
x
M
L
 
V
A
 
G
G
 
A
M
 
M
L
 
T
H
 
L
G
 
K
V
 
L
L
 
A
G
 
E
E
 
N
Q
 
A
S
 
S
E
 
L
D
 
E
T
 
E
V
 
M
L
 
V
A
 
R
F
 
F
A
 
G
T
x
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3n1cA Crystal structure of the phosphofructokinase-2 from escherichia coli in complex with fructose-6-phosphate (see paper)
31% identity, 87% coverage: 1:279/321 of query aligns to 1:281/309 of 3n1cA

query
sites
3n1cA
M
 
M
A
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
Y
T
 
T
I
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
|
D
L
 
S
S
 
A
V
 
T
E
 
I
T
 
T
A
 
P
P
 
Q
L
 
I
A
 
Y
L
 
P
G
 
E
E
 
G
V
x
K
N
 
L
R
|
R
T
 
C
G
 
T
H
 
A
T
 
P
L
 
V
M
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
G
G
|
G
K
 
G
G
 
G
I
 
I
N
|
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
H
L
 
L
G
 
G
H
 
G
S
 
S
V
 
A
T
 
T
V
 
A
A
 
I
G
 
F
L
 
P
L
 
A
G
 
G
D
 
G
A
 
A
N
 
T
A
 
G
A
 
E
P
 
H
F
 
L
E
 
V
R
 
S
L
 
L
F
 
L
E
 
A
A
 
D
E
 
E
G
 
N
L
 
V
Q
 
P
D
 
V
S
 
A
F
 
T
V
 
V
R
 
E
V
 
A
P
 
K
G
 
D
Q
 
W
N
 
T
R
|
R
N
 
Q
N
 
N
I
 
L
K
 
H
I
 
V
-
 
H
A
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
S
G
 
G
R
 
E
V
 
Q
T
 
Y
D
 
R
L
 
F
N
 
V
G
 
M
P
 
P
G
 
G
F
 
A
R
 
A
A
 
L
P
 
N
E
 
E
D
 
D
A
 
E
L
 
F
Q
 
R
R
 
Q
L
 
L
Q
 
E
L
 
E
R
 
Q
L
 
V
K
 
L
S
 
E
L
 
I
L
 
-
P
 
-
E
 
E
C
 
S
D
 
G
A
 
A
V
 
I
-
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
S
G
|
G
S
|
S
L
 
L
P
 
P
D
 
P
G
 
G
F
 
V
P
 
K
P
 
L
S
 
E
G
 
K
L
 
L
A
 
T
I
 
Q
L
 
L
V
 
I
E
 
S
Q
 
A
A
 
A
S
 
Q
R
 
K
A
 
Q
D
 
G
K
 
I
P
 
R
V
 
C
W
 
I
L
 
V
D
 
D
T
 
S
S
 
S
G
 
G
A
 
E
G
 
A
L
 
L
K
 
S
A
 
A
G
 
A
I
 
L
K
 
A
A
 
I
G
 
G
P
 
N
Y
 
I
A
 
E
-
 
L
I
 
V
K
 
K
P
 
P
N
 
N
T
 
Q
D
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
S
D
 
A
W
 
L
A
 
V
G
 
N
T
 
R
P
 
E
L
 
L
K
 
T
D
 
Q
L
 
P
A
 
D
S
 
D
V
 
V
-
 
R
A
 
K
A
 
A
T
 
A
V
 
Q
D
 
E
G
 
I
I
 
V
R
 
N
A
 
S
G
 
G
G
 
K
V
 
A
S
 
K
H
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
 
L
G
 
G
A
 
P
D
 
Q
G
 
G
V
 
A
F
 
L
W
 
G
S
 
V
S
 
D
P
 
S
A
 
E
G
 
N
I
 
C
L
 
I
R
 
Q
S
 
V
R
 
V
V
 
P
P
 
P
P
 
P
V
 
V
S
 
K
L
 
S
V
 
Q
S
 
S
T
 
T
V
 
V
C
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
S
L
 
M
L
 
V
A
 
G
G
 
A
M
 
M
L
 
T
H
 
L
G
 
K
V
 
L
L
 
A
G
 
E
E
 
N
Q
 
A
S
 
S
E
 
L
D
 
E
T
 
E
V
 
M
L
 
V
A
 
R
F
 
F
A
 
G
T
 
V
A
 
A

P06999 ATP-dependent 6-phosphofructokinase isozyme 2; ATP-PFK 2; Phosphofructokinase 2; 6-phosphofructokinase isozyme II; Phosphohexokinase 2; EC 2.7.1.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
31% identity, 87% coverage: 1:279/321 of query aligns to 1:281/309 of P06999

query
sites
P06999
M
 
M
A
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
Y
T
 
T
I
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
S
S
 
A
V
 
T
E
 
I
T
 
T
A
 
P
P
 
Q
L
 
I
A
 
Y
L
 
P
G
 
E
E
 
G
V
x
K
N
 
L
R
 
R
T
 
C
G
 
T
H
 
A
T
 
P
L
 
V
M
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
H
L
 
L
G
 
G
H
 
G
S
 
S
V
 
A
T
 
T
V
 
A
A
 
I
G
 
F
L
 
P
L
 
A
G
 
G
D
 
G
A
 
A
N
 
T
A
 
G
A
 
E
P
 
H
F
 
L
E
 
V
R
 
S
L
 
L
F
 
L
E
 
A
A
 
D
E
 
E
G
 
N
L
 
V
Q
 
P
D
 
V
S
 
A
F
 
T
V
 
V
R
 
E
V
 
A
P
 
K
G
 
D
Q
 
W
N
 
T
R
 
R
N
 
Q
N
 
N
I
 
L
K
 
H
I
 
V
-
 
H
A
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
S
G
 
G
R
 
E
V
 
Q
T
 
Y
D
 
R
L
 
F
N
 
V
G
 
M
P
 
P
G
 
G
F
 
A
R
 
A
A
 
L
P
 
N
E
 
E
D
 
D
A
 
E
L
 
F
Q
 
R
R
 
Q
L
 
L
Q
 
E
L
 
E
R
 
Q
L
 
V
K
 
L
S
 
E
L
 
I
L
 
-
P
 
-
E
 
E
C
 
S
D
 
G
A
 
A
V
 
I
-
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
P
G
 
G
F
 
V
P
 
K
P
 
L
S
 
E
G
 
K
L
 
L
A
 
T
I
 
Q
L
 
L
V
 
I
E
 
S
Q
 
A
A
 
A
S
 
Q
R
 
K
A
 
Q
D
 
G
K
 
I
P
 
R
V
 
C
W
 
I
L
 
V
D
 
D
T
 
S
S
 
S
G
 
G
A
 
E
G
 
A
L
 
L
K
 
S
A
 
A
G
 
A
I
 
L
K
 
A
A
 
I
G
 
G
P
 
N
Y
 
I
A
 
E
-
 
L
I
 
V
K
|
K
P
|
P
N
|
N
T
x
Q
D
x
K
E
|
E
L
 
L
S
 
S
D
 
A
W
 
L
A
 
V
G
 
N
T
 
R
P
 
E
L
 
L
K
 
T
D
 
Q
L
 
P
A
 
D
S
 
D
V
 
V
-
 
R
A
 
K
A
 
A
T
 
A
V
 
Q
D
 
E
G
 
I
I
 
V
R
 
N
A
 
S
G
 
G
G
 
K
V
 
A
S
 
K
H
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
V
S
|
S
M
x
L
G
|
G
A
x
P
D
x
Q
G
|
G
V
 
A
F
 
L
W
 
G
S
 
V
S
 
D
P
 
S
A
 
E
G
 
N
I
 
C
L
 
I
R
 
Q
S
 
V
R
 
V
V
 
P
P
 
P
P
 
P
V
 
V
S
 
K
L
x
S
V
 
Q
S
|
S
T
 
T
V
|
V
C
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
S
L
 
M
L
 
V
A
 
G
G
 
A
M
 
M
L
 
T
H
 
L
G
 
K
V
 
L
L
 
A
G
 
E
E
 
N
Q
 
A
S
 
S
E
 
L
D
 
E
T
 
E
V
 
M
L
 
V
A
 
R
F
 
F
A
 
G
T
x
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3cqdA Structure of the tetrameric inhibited form of phosphofructokinase-2 from escherichia coli (see paper)
31% identity, 87% coverage: 1:279/321 of query aligns to 1:281/304 of 3cqdA

query
sites
3cqdA
M
 
M
A
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
Y
T
 
T
I
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
S
S
 
A
V
 
T
E
 
I
T
 
T
A
 
P
P
 
Q
L
 
I
A
x
Y
L
 
P
G
 
E
E
x
G
V
x
K
N
 
L
R
 
R
T
 
C
G
 
T
H
 
A
T
 
P
L
 
V
M
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
H
L
 
L
G
 
G
H
 
G
S
 
S
V
 
A
T
 
T
V
 
A
A
 
I
G
 
F
L
 
P
L
 
A
G
 
G
D
 
G
A
 
A
N
 
T
A
 
G
A
 
E
P
 
H
F
 
L
E
 
V
R
 
S
L
 
L
F
 
L
E
 
A
A
 
D
E
 
E
G
 
N
L
 
V
Q
 
P
D
 
V
S
 
A
F
 
T
V
 
V
R
 
E
V
 
A
P
 
K
G
 
D
Q
 
W
N
 
T
R
 
R
N
 
Q
N
 
N
I
 
L
K
 
H
I
 
V
-
 
H
A
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
S
G
 
G
R
 
E
V
 
Q
T
 
Y
D
 
R
L
 
F
N
 
V
G
 
M
P
 
P
G
 
G
F
 
A
R
 
A
A
 
L
P
 
N
E
 
E
D
 
D
A
 
E
L
 
F
Q
 
R
R
 
Q
L
 
L
Q
 
E
L
 
E
R
 
Q
L
 
V
K
 
L
S
 
E
L
 
I
L
 
-
P
 
-
E
 
E
C
 
S
D
 
G
A
 
A
V
 
I
-
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
P
G
 
G
F
 
V
P
 
K
P
 
L
S
 
E
G
 
K
L
 
L
A
 
T
I
 
Q
L
 
L
V
 
I
E
 
S
Q
 
A
A
 
A
S
 
Q
R
 
K
A
 
Q
D
 
G
K
 
I
P
 
R
V
 
C
W
 
I
L
 
V
D
 
D
T
 
S
S
 
S
G
 
G
A
 
E
G
 
A
L
 
L
K
 
S
A
 
A
G
 
A
I
 
L
K
 
A
A
 
I
G
 
G
P
 
N
Y
 
I
A
 
E
-
 
L
I
 
V
K
|
K
P
 
P
N
|
N
T
 
Q
D
x
K
E
 
E
L
 
L
S
 
S
D
 
A
W
 
L
A
 
V
G
 
N
T
 
R
P
 
E
L
 
L
K
 
T
D
 
Q
L
 
P
A
 
D
S
 
D
V
 
V
-
 
R
A
 
K
A
 
A
T
 
A
V
 
Q
D
 
E
G
 
I
I
 
V
R
 
N
A
 
S
G
 
G
G
 
K
V
 
A
S
 
K
H
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
V
S
|
S
M
 
L
G
|
G
A
x
P
D
 
Q
G
|
G
V
 
A
F
 
L
W
 
G
S
 
V
S
 
D
P
 
S
A
 
E
G
 
N
I
 
C
L
 
I
R
 
Q
S
 
V
R
 
V
V
 
P
P
 
P
P
 
P
V
 
V
S
 
K
L
x
S
V
 
Q
S
 
S
T
|
T
V
 
V
C
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
S
L
x
M
L
 
V
A
 
G
G
 
A
M
 
M
L
 
T
H
 
L
G
 
K
V
 
L
L
 
A
G
 
E
E
 
N
Q
 
A
S
 
S
E
 
L
D
 
E
T
 
E
V
 
M
L
 
V
A
 
R
F
 
F
A
 
G
T
x
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3uqeA Crystal structure of the phosphofructokinase-2 mutant y23d from escherichia coli
31% identity, 87% coverage: 1:279/321 of query aligns to 1:281/307 of 3uqeA

query
sites
3uqeA
M
 
M
A
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
Y
T
 
T
I
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
S
S
 
A
V
 
T
E
 
I
T
 
T
A
 
P
P
 
Q
L
 
I
A
 
D
L
 
P
G
 
E
E
 
G
V
 
K
N
 
L
R
 
R
T
 
C
G
 
T
H
 
A
T
 
P
L
 
V
M
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
H
L
 
L
G
 
G
H
 
G
S
 
S
V
 
A
T
 
T
V
 
A
A
 
I
G
 
F
L
 
P
L
 
A
G
 
G
D
 
G
A
 
A
N
 
T
A
 
G
A
 
E
P
 
H
F
 
L
E
 
V
R
 
S
L
 
L
F
 
L
E
 
A
A
 
D
E
 
E
G
 
N
L
 
V
Q
 
P
D
 
V
S
 
A
F
 
T
V
 
V
R
 
E
V
 
A
P
 
K
G
 
D
Q
 
W
N
 
T
R
 
R
N
 
Q
N
 
N
I
 
L
K
 
H
I
 
V
-
 
H
A
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
S
G
 
G
R
 
E
V
 
Q
T
 
Y
D
 
R
L
 
F
N
 
V
G
 
M
P
 
P
G
 
G
F
 
A
R
 
A
A
 
L
P
 
N
E
 
E
D
 
D
A
 
E
L
 
F
Q
 
R
R
 
Q
L
 
L
Q
 
E
L
 
E
R
 
Q
L
 
V
K
 
L
S
 
E
L
 
I
L
 
-
P
 
-
E
 
E
C
 
S
D
 
G
A
 
A
V
 
I
-
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
P
G
 
G
F
 
V
P
 
K
P
 
L
S
 
E
G
 
K
L
 
L
A
 
T
I
 
Q
L
 
L
V
 
I
E
 
S
Q
 
A
A
 
A
S
 
Q
R
 
K
A
 
Q
D
 
G
K
 
I
P
 
R
V
 
C
W
 
I
L
 
V
D
 
D
T
 
S
S
 
S
G
 
G
A
 
E
G
 
A
L
 
L
K
 
S
A
 
A
G
 
A
I
 
L
K
 
A
A
 
I
G
 
G
P
 
N
Y
 
I
A
 
E
-
 
L
I
 
V
K
|
K
P
 
P
N
|
N
T
 
Q
D
x
K
E
 
E
L
 
L
S
 
S
D
 
A
W
 
L
A
 
V
G
 
N
T
 
R
P
 
E
L
 
L
K
 
T
D
 
Q
L
 
P
A
 
D
S
 
D
V
 
V
-
 
R
A
 
K
A
 
A
T
 
A
V
 
Q
D
 
E
G
 
I
I
 
V
R
 
N
A
 
S
G
 
G
G
 
K
V
 
A
S
 
K
H
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
V
S
|
S
M
 
L
G
|
G
A
x
P
D
 
Q
G
|
G
V
 
A
F
 
L
W
 
G
S
 
V
S
 
D
P
 
S
A
 
E
G
 
N
I
 
C
L
 
I
R
 
Q
S
 
V
R
 
V
V
 
P
P
 
P
P
 
P
V
 
V
S
 
K
L
x
S
V
 
Q
S
 
S
T
 
T
V
 
V
C
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
S
L
x
M
L
 
V
A
 
G
G
 
A
M
 
M
L
 
T
H
 
L
G
 
K
V
 
L
L
 
A
G
 
E
E
 
N
Q
 
A
S
 
S
E
 
L
D
 
E
T
 
E
V
 
M
L
 
V
A
 
R
F
 
F
A
 
G
T
x
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P9WID3 ATP-dependent 6-phosphofructokinase isozyme 2; ATP-PFK 2; Phosphofructokinase 2; Phosphofructokinase B; Phosphohexokinase 2; Tagatose-6-phosphate kinase; EC 2.7.1.11; EC 2.7.1.144 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
29% identity, 82% coverage: 3:264/321 of query aligns to 13:275/339 of P9WID3

query
sites
P9WID3
R
 
R
I
 
I
L
 
I
T
 
T
I
 
L
T
 
T
L
 
M
N
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
I
S
 
T
V
 
T
E
 
S
T
 
V
A
 
D
P
 
V
L
 
V
A
 
R
L
 
P
G
 
T
E
 
E
V
 
K
N
 
M
R
 
R
T
 
C
G
 
G
H
 
A
T
 
P
L
 
R
M
 
Y
E
 
D
P
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
I
L
 
V
A
 
H
R
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
G
S
 
C
V
 
S
T
 
T
-
 
A
-
 
L
-
 
F
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
T
-
 
G
-
 
S
-
 
L
V
 
L
A
 
M
G
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
N
 
G
A
 
-
A
 
V
P
 
P
F
 
F
E
 
R
R
 
V
L
 
I
F
 
P
E
 
I
A
 
A
E
 
A
G
 
S
L
 
T
Q
 
R
D
 
E
S
 
S
F
 
F
V
 
T
R
 
V
V
 
N
P
 
E
G
 
S
Q
 
R
N
 
T
R
 
A
N
 
K
N
 
Q
I
 
Y
K
 
R
I
 
F
A
 
V
E
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
L
N
 
P
G
 
G
P
 
P
G
 
S
F
 
L
R
 
T
A
 
V
P
 
A
E
 
E
D
 
Q
A
 
-
L
 
-
Q
 
E
R
 
Q
L
 
C
Q
 
L
L
 
D
R
 
E
L
 
L
K
 
R
S
 
G
L
 
A
L
 
A
P
 
A
E
 
S
C
 
A
D
 
A
A
 
F
V
 
V
V
 
V
I
 
A
G
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
P
G
 
G
F
 
V
P
 
A
P
 
A
S
 
D
G
 
Y
L
 
Y
A
 
Q
I
 
R
L
 
V
V
 
A
E
 
D
Q
 
I
A
 
C
S
 
R
R
 
R
A
 
S
D
 
S
K
 
T
P
 
P
V
 
L
W
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
T
S
 
S
G
 
G
A
 
G
G
 
G
L
 
L
K
 
Q
A
 
H
G
 
-
I
 
I
K
 
S
A
 
S
G
 
G
P
 
V
Y
 
F
A
 
L
I
 
L
K
 
K
P
 
A
N
 
S
T
 
V
D
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
R
D
 
E
W
 
C
A
 
V
G
 
G
T
 
S
P
 
E
-
 
L
L
 
L
K
 
T
D
 
E
L
 
P
A
 
E
S
 
Q
V
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
A
V
 
H
D
 
E
G
 
L
I
 
I
R
 
D
A
 
R
G
 
G
G
 
R
V
 
A
S
 
E
H
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
 
L
G
 
G
A
 
S
D
 
Q
G
 
G
V
 
A
F
 
L
W
 
L
S
 
A
S
 
T
P
 
R
A
 
H
G
 
A
I
 
S
L
 
H
R
 
R
S
 
F
R
 
S
V
 
S
P
 
I
P
 
P
V
 
M
S
 
T
L
 
A
V
 
V
S
 
S
T
 
G
V
 
V
C
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
A
L
 
M
L
 
V
A
 
A
G
 
A
M
 
I
L
 
T
H
 
V
G
 
G
V
 
L

Sites not aligning to the query:

2ajrA Crystal structure of possible 1-phosphofructokinase (ec 2.7.1.56) (tm0828) from thermotoga maritima at 2.46 a resolution
28% identity, 87% coverage: 4:282/321 of query aligns to 3:293/320 of 2ajrA

query
sites
2ajrA
I
 
V
L
 
L
T
 
T
I
 
V
T
 
T
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
R
S
 
E
V
 
I
E
 
F
T
 
I
A
 
E
P
 
D
L
 
F
A
 
Q
-
 
V
-
 
N
-
 
R
L
 
L
G
 
Y
E
 
R
V
 
I
N
 
N
R
 
D
T
 
L
G
 
S
H
 
K
T
 
T
L
 
Q
M
 
M
E
 
S
P
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
S
R
 
I
V
 
A
L
 
L
A
 
S
R
 
K
L
 
L
G
 
G
H
 
V
-
 
P
S
 
S
V
 
V
T
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
L
 
Y
L
 
M
G
 
G
D
 
K
A
 
I
N
 
L
A
 
V
A
 
E
P
 
E
F
 
L
E
 
R
R
 
K
L
 
I
F
 
-
E
 
-
A
 
S
E
 
K
G
 
L
L
 
I
Q
 
T
D
 
T
S
 
N
F
 
F
V
 
V
R
 
Y
V
 
V
P
 
E
G
 
G
Q
 
E
N
 
T
R
 
R
N
 
E
N
 
N
I
 
I
K
 
E
I
 
I
A
 
I
-
 
D
E
 
E
A
 
K
G
 
N
G
 
K
R
 
T
V
 
I
T
 
T
D
 
A
L
 
I
N
 
N
G
 
F
P
 
P
G
 
G
F
 
P
R
 
D
A
 
V
P
 
T
E
 
D
D
 
M
A
 
D
L
 
V
Q
 
N
R
 
H
L
 
F
Q
 
L
L
 
R
R
 
R
L
 
Y
K
 
K
S
 
M
L
 
T
L
 
L
P
 
S
E
 
K
C
 
V
D
 
D
A
 
C
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
I
P
 
P
D
 
P
G
 
G
F
 
V
P
 
N
P
 
E
S
 
G
G
 
I
L
 
C
A
 
N
I
 
E
L
 
L
V
 
V
E
 
R
Q
 
L
A
 
A
S
 
R
R
 
E
A
 
R
D
 
G
K
 
V
P
 
F
V
 
V
W
 
F
L
 
V
D
 
E
T
 
Q
S
 
T
G
 
P
A
 
R
G
 
L
L
 
L
K
 
E
A
 
R
G
 
-
I
 
I
K
 
Y
A
 
E
G
 
G
P
 
P
Y
 
E
-
 
F
-
 
P
-
 
N
A
 
V
I
 
V
K
 
K
P
 
P
N
 
D
T
 
L
D
 
R
-
 
G
E
 
N
L
 
H
S
 
A
D
 
S
W
 
F
A
 
L
G
 
G
T
 
V
P
 
D
L
 
L
K
 
K
D
 
T
L
 
F
A
 
D
S
 
D
V
 
Y
A
 
V
A
 
K
T
 
L
V
 
A
D
 
E
G
 
K
I
 
L
-
 
A
R
 
E
A
 
K
G
 
S
G
 
Q
V
 
V
S
 
S
H
 
V
V
 
V
V
 
S
V
 
Y
S
 
E
M
 
V
G
 
K
A
 
N
D
 
D
G
 
I
V
 
V
F
 
A
W
 
T
S
 
R
S
 
E
P
 
G
A
 
V
G
 
W
I
 
L
L
 
I
R
 
R
S
 
S
R
 
K
V
 
-
P
 
E
P
 
E
V
 
I
S
 
D
L
 
T
V
 
S
S
x
H
T
 
L
V
 
L
C
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
A
L
 
Y
L
 
V
A
 
A
G
 
G
M
 
M
L
 
V
H
 
Y
G
 
Y
V
 
F
L
 
I
G
 
K
E
 
H
Q
 
G
S
 
A
-
 
N
-
 
F
-
 
L
E
 
E
D
 
M
T
 
A
V
 
K
L
 
F
A
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3ie7A The crystal structure of phosphofructokinase (lin2199) from listeria innocua in complex with atp at 1.6a
25% identity, 88% coverage: 4:287/321 of query aligns to 3:285/309 of 3ie7A

query
sites
3ie7A
I
 
I
L
 
Y
T
 
T
I
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
I
D
 
D
-
 
R
L
 
L
S
 
L
V
 
F
E
 
I
T
 
R
A
 
G
P
 
E
L
 
L
A
 
E
L
 
K
G
 
R
E
 
K
V
 
T
N
 
N
R
 
R
T
 
V
G
 
I
H
 
K
T
 
T
L
 
E
M
 
F
E
 
D
P
 
C
A
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
I
 
L
N
 
H
V
 
V
A
 
S
R
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
S
R
 
K
L
 
F
G
 
G
H
 
I
S
 
K
V
 
N
T
 
E
V
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
I
L
 
A
G
 
G
D
 
S
A
 
D
N
 
N
A
 
L
A
 
D
P
 
K
F
 
L
E
 
Y
R
 
A
L
 
I
F
 
L
E
 
K
A
 
E
E
 
K
G
 
H
L
 
I
Q
 
N
D
 
H
S
 
D
F
 
F
V
 
L
R
 
V
V
 
E
P
 
A
G
 
G
Q
 
T
N
 
S
R
 
T
N
 
R
N
 
E
I
 
C
K
 
F
I
 
V
A
 
V
E
 
L
A
 
S
G
 
D
G
 
-
R
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
D
L
 
T
N
 
N
G
 
G
P
 
S
-
 
T
-
 
M
-
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
A
G
 
G
F
 
F
R
 
T
A
 
V
P
 
S
E
 
Q
D
 
T
A
 
N
L
 
K
Q
 
D
R
 
N
L
 
L
Q
 
L
L
 
K
R
 
Q
L
 
I
K
 
A
S
 
K
L
 
K
L
 
V
P
 
K
E
 
K
C
 
E
D
 
D
A
 
M
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
P
P
 
P
D
 
P
G
 
H
F
 
Y
P
 
T
P
 
L
S
 
S
G
 
D
L
 
F
A
 
K
I
 
E
L
 
L
V
 
L
E
 
R
Q
 
T
A
 
V
S
 
K
R
 
A
A
 
T
D
 
G
K
 
A
P
 
F
V
 
L
W
 
G
L
 
C
D
 
D
T
 
N
S
 
S
G
 
G
A
 
E
G
 
Y
L
 
L
K
 
N
A
 
L
G
 
A
I
 
V
K
 
E
A
 
M
G
 
G
P
 
V
Y
 
D
A
 
F
I
 
I
K
 
K
P
 
P
N
|
N
T
 
E
D
 
D
E
 
E
L
 
V
S
 
I
D
 
A
W
 
I
A
 
L
G
 
D
T
 
E
P
 
K
L
 
T
K
 
N
D
 
S
L
 
L
A
 
E
S
 
E
V
 
N
A
 
I
A
 
R
T
 
T
V
 
L
D
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
A
G
 
E
G
 
K
V
 
I
S
 
P
H
 
Y
V
 
L
V
 
V
V
 
V
S
|
S
M
 
L
G
|
G
A
|
A
D
 
K
G
|
G
V
 
S
F
 
I
W
 
C
S
 
A
S
 
H
P
 
N
A
 
G
G
 
K
I
 
L
L
 
Y
R
 
Q
S
 
V
R
 
I
V
 
P
P
 
P
P
 
K
V
|
V
S
 
Q
L
 
E
V
 
R
S
 
N
T
 
D
V
 
T
C
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
V
L
 
F
L
 
V
A
 
G
G
 
A
M
 
F
L
 
I
H
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
A
G
 
M
E
 
N
Q
 
M
S
 
P
E
 
I
D
 
T
T
 
E
V
 
T
L
 
L
A
 
K
F
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
G
L
 
C
S
|
S
A
 
A
E
 
S
C
 
K
V
|
V
Q
 
M
H
 
Q

3julA Crystal structure of listeria innocua d-tagatose-6-phosphate kinase bound with substrate
26% identity, 88% coverage: 4:287/321 of query aligns to 3:278/298 of 3julA

query
sites
3julA
I
 
I
L
 
Y
T
 
T
I
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
I
D
|
D
-
 
R
L
 
L
S
 
L
V
 
F
E
 
I
T
 
R
A
 
G
P
 
E
L
 
L
A
 
E
L
 
K
G
 
R
E
 
K
V
 
T
N
 
N
R
 
R
T
 
V
G
 
I
H
 
K
T
 
T
L
 
E
M
 
F
E
 
D
P
 
C
A
 
G
G
 
G
K
|
K
G
 
G
I
 
L
N
x
H
V
 
V
A
 
S
R
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
S
R
 
K
L
 
F
G
 
G
H
 
I
S
 
K
V
 
N
T
 
E
V
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
I
L
 
A
G
 
G
D
 
S
A
 
D
N
 
N
A
 
L
A
 
D
P
 
K
F
 
L
E
 
Y
R
 
A
L
 
I
F
 
L
E
 
K
A
 
E
E
 
K
G
 
H
L
 
I
Q
 
N
D
 
H
S
 
D
F
 
F
V
 
L
R
 
V
V
 
E
P
 
A
G
 
G
Q
 
T
N
 
S
R
 
T
N
x
R
N
 
E
I
 
C
K
 
F
I
 
V
A
 
V
E
 
L
A
 
S
G
 
D
G
 
-
R
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
D
L
 
T
N
 
N
G
 
G
P
 
S
-
 
T
-
x
M
-
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
A
G
 
G
F
 
F
R
 
T
A
 
V
P
 
S
E
 
Q
D
 
T
A
 
N
L
 
K
Q
 
D
R
 
N
L
 
L
Q
 
L
L
 
K
R
 
Q
L
 
I
K
 
A
S
 
K
L
 
K
L
 
V
P
 
K
E
 
K
C
 
E
D
 
D
A
 
M
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
A
G
|
G
S
 
S
L
 
P
P
 
P
D
 
P
G
 
H
F
 
Y
P
 
T
P
 
L
S
 
S
G
 
D
L
 
F
A
 
K
I
 
E
L
 
L
V
 
L
E
 
R
Q
 
T
A
 
V
S
 
K
R
 
A
A
 
T
D
 
G
K
 
A
P
 
F
V
 
L
W
 
G
L
 
C
D
 
D
T
 
N
S
 
S
G
 
G
A
 
E
G
 
Y
L
 
L
K
 
N
A
 
L
G
 
A
I
 
V
K
 
E
A
 
M
G
 
G
P
 
V
Y
 
D
A
 
F
I
 
I
K
 
K
P
 
P
N
 
N
T
 
E
D
 
D
E
 
E
L
 
V
S
 
I
D
 
A
W
 
I
A
 
L
G
 
D
T
 
E
P
 
K
L
 
T
K
 
N
D
 
S
L
 
L
A
 
E
S
 
E
V
 
N
A
 
I
A
 
R
T
 
T
V
 
L
D
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
A
G
 
E
G
 
K
V
 
I
S
 
P
H
 
Y
V
 
L
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
K
G
 
G
V
 
S
F
 
I
W
 
C
S
 
A
S
 
H
P
 
N
A
 
-
G
 
G
I
 
K
L
 
L
R
 
Y
S
 
Q
R
 
V
V
 
I
P
 
P
P
 
P
V
 
T
S
 
G
L
 
-
V
 
-
S
 
-
T
 
-
V
 
-
C
 
-
A
 
A
G
 
G
D
|
D
T
 
V
L
 
F
L
 
V
A
 
G
G
 
A
M
 
F
L
 
I
H
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
A
G
 
M
E
 
N
Q
 
M
S
 
P
E
 
I
D
 
T
T
 
E
V
 
T
L
 
L
A
 
K
F
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
G
L
 
C
S
 
S
A
 
A
E
 
S
C
 
K
V
 
V
Q
 
M
H
 
Q

A1A6H3 Ribokinase; AtRBSK; RK; EC 2.7.1.15 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
30% identity, 49% coverage: 146:303/321 of query aligns to 212:373/379 of A1A6H3

query
sites
A1A6H3
P
 
P
S
 
D
G
 
S
L
 
I
A
 
N
I
 
I
L
 
Q
V
 
V
E
 
A
Q
 
K
A
 
A
-
 
V
S
 
K
R
 
K
A
 
A
D
 
G
K
 
V
P
 
P
V
 
V
W
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
V
S
 
G
G
 
G
A
 
M
G
 
D
-
 
T
-
 
P
L
 
I
K
 
P
A
 
N
G
 
E
I
 
L
K
 
L
A
 
D
G
 
S
P
 
I
Y
 
D
A
 
I
I
 
L
K
 
S
P
 
P
N
 
N
T
 
E
D
 
T
E
 
E
L
 
L
S
 
S
D
 
R
W
 
L
A
 
T
G
 
G
T
 
M
P
 
P
L
 
T
K
 
E
D
 
T
L
 
F
A
 
E
S
 
Q
V
 
I
A
 
S
A
 
Q
T
 
A
V
 
V
D
 
A
G
 
K
I
 
C
R
 
H
A
 
K
G
 
L
G
 
G
V
 
V
S
 
K
H
 
Q
V
 
V
V
 
L
V
 
V
S
 
K
M
 
L
G
 
G
A
 
S
D
 
K
G
 
G
-
 
S
-
 
A
V
 
L
F
 
F
W
 
I
S
 
Q
S
 
G
P
 
E
A
 
K
G
 
P
I
 
I
L
 
Q
R
 
Q
S
 
S
R
 
I
V
 
I
P
 
P
P
 
A
V
 
A
S
 
Q
L
 
V
V
 
V
S
 
D
T
 
T
V
 
T
C
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
T
L
 
F
L
 
T
A
 
A
G
 
A
M
 
F
L
 
A
H
 
V
G
 
A
V
 
M
L
 
V
G
 
E
E
 
G
Q
 
K
S
 
S
E
 
H
D
 
E
T
 
E
V
 
C
L
 
L
A
 
R
F
 
F
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
A
S
 
A
A
 
S
E
 
L
C
 
C
V
 
V
Q
 
Q
H
 
V
I
 
K
G
 
G
V
 
-
G
 
A
D
 
I
P
 
P
G
 
S
A
 
M
P
 
P
D
 
D
F
 
R
H
 
K
S
 
S
L
 
V
L
 
L
Q
 
K

Sites not aligning to the query:

6ilsB Structure of arabidopsis thaliana ribokinase complexed with ribose and atp (see paper)
30% identity, 49% coverage: 146:303/321 of query aligns to 146:307/313 of 6ilsB

query
sites
6ilsB
P
 
P
S
 
D
G
 
S
L
 
I
A
 
N
I
 
I
L
 
Q
V
 
V
E
 
A
Q
 
K
A
 
A
-
 
V
S
 
K
R
 
K
A
 
A
D
 
G
K
 
V
P
 
P
V
 
V
W
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
V
S
 
G
G
 
G
A
 
M
G
 
D
-
 
T
-
 
P
L
 
I
K
 
P
A
 
N
G
 
E
I
 
L
K
 
L
A
 
D
G
 
S
P
 
I
Y
 
D
A
 
I
I
 
L
K
 
S
P
 
P
N
|
N
T
 
E
D
 
T
E
 
E
L
 
L
S
 
S
D
 
R
W
 
L
A
 
T
G
 
G
T
 
M
P
 
P
L
 
T
K
 
E
D
 
T
L
 
F
A
 
E
S
 
Q
V
 
I
A
 
S
A
 
Q
T
 
A
V
 
V
D
 
A
G
 
K
I
 
C
R
 
H
A
 
K
G
 
L
G
 
G
V
 
V
S
 
K
H
 
Q
V
 
V
V
 
L
V
 
V
S
x
K
M
 
L
G
|
G
A
 
S
D
 
K
G
 
G
-
 
S
-
 
A
V
 
L
F
 
F
W
 
I
S
 
Q
S
 
G
P
 
E
A
 
K
G
 
P
I
 
I
L
 
Q
R
 
Q
S
 
S
R
 
I
V
x
I
P
 
P
P
x
A
V
 
A
S
 
Q
L
 
V
V
 
V
S
 
D
T
 
T
V
 
T
C
 
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
T
L
x
F
L
 
T
A
 
A
G
 
A
M
 
F
L
 
A
H
 
V
G
 
A
V
 
M
L
 
V
G
 
E
E
 
G
Q
 
K
S
 
S
E
 
H
D
 
E
T
 
E
V
 
C
L
 
L
A
 
R
F
 
F
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
A
S
x
A
A
x
S
E
 
L
C
 
C
V
 
V
Q
 
Q
H
 
V
I
 
K