SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3790 FitnessBrowser__Marino:GFF3790 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4yslA Crystal structure of sdoa from pseudomonas putida in complex with glutathione (see paper)
51% identity, 93% coverage: 16:296/302 of query aligns to 8:294/294 of 4yslA

query
sites
4yslA
N
 
H
V
 
V
A
 
D
G
 
A
F
 
F
F
 
Y
D
 
D
P
 
E
R
 
A
T
 
T
F
 
S
S
 
T
V
 
I
Q
 
S
Y
 
Y
V
 
L
V
 
V
S
 
M
D
 
D
P
 
R
E
 
E
T
 
T
K
 
R
Q
 
Q
C
 
C
A
 
A
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
E
 
P
K
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
R
T
 
T
A
 
C
T
 
S
H
 
A
H
 
S
A
 
A
D
 
D
E
 
R
L
 
L
L
 
V
A
 
E
F
 
R
I
 
V
R
 
N
E
 
E
Q
 
L
G
 
N
F
 
A
E
 
S
V
 
V
Q
 
R
W
 
W
I
 
V
L
 
L
D
 
E
T
 
T
H
|
H
P
 
V
H
 
H
A
 
A
D
 
D
H
 
H
F
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
E
 
E
Q
 
K
T
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
H
T
 
T
A
 
A
I
 
I
G
 
G
G
 
A
Y
 
H
V
 
I
T
 
T
G
 
Q
V
 
V
Q
 
Q
E
 
K
L
 
V
W
 
F
K
 
G
G
 
A
I
 
L
Y
 
F
N
 
N
W
 
A
-
 
E
P
 
P
D
 
G
F
 
F
P
 
A
A
 
R
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
W
 
F
D
 
D
H
 
V
L
 
L
F
 
L
R
 
E
A
 
D
G
 
E
D
 
E
E
 
G
F
 
F
R
 
R
V
 
I
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
G
 
A
R
 
R
V
 
A
M
 
L
F
 
H
S
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
L
 
P
A
 
A
S
 
C
V
 
M
T
 
S
Y
 
F
V
 
M
I
 
I
G
 
E
D
 
D
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
I
A
 
A
A
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
G
D
|
D
T
 
T
I
 
L
F
 
F
Q
 
M
P
 
P
D
 
D
F
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
|
A
R
|
R
A
 
C
D
 
D
F
 
F
P
 
P
G
 
G
G
 
A
D
 
D
A
 
A
H
 
R
Q
 
T
L
 
L
W
 
Y
D
 
R
S
 
S
I
 
I
Q
 
R
A
 
R
I
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
F
P
 
P
D
 
D
E
 
Q
T
 
T
R
 
R
L
 
L
F
 
F
T
 
M
G
 
C
H
 
H
D
 
D
Y
|
Y
M
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
D
P
 
M
E
 
Q
W
 
Y
E
 
V
S
 
T
T
 
T
V
 
V
G
 
A
E
 
E
Q
 
Q
K
 
R
Q
 
A
A
 
S
N
 
N
K
 
I
H
 
H
L
 
I
A
 
H
E
 
Q
-
 
G
T
 
I
S
 
D
E
 
E
A
 
D
E
 
S
Y
 
F
V
 
V
E
 
A
L
 
M
R
 
R
N
 
E
T
 
A
R
 
R
D
 
D
S
 
K
E
 
T
L
 
L
P
 
E
M
 
M
P
|
P
K
x
V
L
 
L
I
 
I
L
 
L
H
 
P
A
 
S
L
 
V
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
T
 
M
R
 
R
G
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
E
 
P
P
 
P
E
 
E
A
 
A
N
 
N
G
 
G
K
 
V
R
 
S
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
I
 
I
P
 
P
L
 
L
D
 
N
A
 
K
L
 
L

4yskA Crystal structure of apo-form sdoa from pseudomonas putida (see paper)
51% identity, 93% coverage: 16:296/302 of query aligns to 8:294/294 of 4yskA

query
sites
4yskA
N
 
H
V
 
V
A
 
D
G
 
A
F
 
F
F
 
Y
D
 
D
P
 
E
R
 
A
T
 
T
F
 
S
S
 
T
V
 
I
Q
 
S
Y
 
Y
V
 
L
V
 
V
S
 
M
D
 
D
P
 
R
E
 
E
T
 
T
K
 
R
Q
 
Q
C
 
C
A
 
A
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
E
 
P
K
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
R
T
 
T
A
 
C
T
 
S
H
 
A
H
 
S
A
 
A
D
 
D
E
 
R
L
 
L
L
 
V
A
 
E
F
 
R
I
 
V
R
 
N
E
 
E
Q
 
L
G
 
N
F
 
A
E
 
S
V
 
V
Q
 
R
W
 
W
I
 
V
L
 
L
D
 
E
T
 
T
H
|
H
P
 
V
H
 
H
A
 
A
D
 
D
H
 
H
F
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
E
 
E
Q
 
K
T
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
H
T
 
T
A
 
A
I
 
I
G
 
G
G
 
A
Y
 
H
V
 
I
T
 
T
G
 
Q
V
 
V
Q
 
Q
E
 
K
L
 
V
W
 
F
K
 
G
G
 
A
I
 
L
Y
 
F
N
 
N
W
 
A
-
 
E
P
 
P
D
 
G
F
 
F
P
 
A
A
 
R
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
W
 
F
D
 
D
H
 
V
L
 
L
F
 
L
R
 
E
A
 
D
G
 
E
D
 
E
E
 
G
F
 
F
R
 
R
V
 
I
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
G
 
A
R
 
R
V
 
A
M
 
L
F
 
H
S
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
L
 
P
A
 
A
S
 
C
V
 
M
T
 
S
Y
 
F
V
 
M
I
 
I
G
 
E
D
 
D
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
I
A
 
A
A
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
G
D
|
D
T
 
T
I
 
L
F
 
F
Q
 
M
P
 
P
D
 
D
F
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
C
D
 
D
F
 
F
P
 
P
G
 
G
G
 
A
D
 
D
A
 
A
H
 
R
Q
 
T
L
 
L
W
 
Y
D
 
R
S
 
S
I
 
I
Q
 
R
A
 
R
I
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
F
P
 
P
D
 
D
E
 
Q
T
 
T
R
 
R
L
 
L
F
 
F
T
 
M
G
 
C
H
 
H
D
 
D
Y
 
Y
M
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
D
P
 
M
E
 
Q
W
 
Y
E
 
V
S
 
T
T
 
T
V
 
V
G
 
A
E
 
E
Q
 
Q
K
 
R
Q
 
A
A
 
S
N
 
N
K
 
I
H
 
H
L
 
I
A
 
H
E
 
Q
-
 
G
T
 
I
S
 
D
E
 
E
A
 
D
E
 
S
Y
 
F
V
 
V
E
 
A
L
 
M
R
 
R
N
 
E
T
 
A
R
 
R
D
 
D
S
 
K
E
 
T
L
 
L
P
 
E
M
 
M
P
 
P
K
 
V
L
 
L
I
 
I
L
 
L
H
 
P
A
 
S
L
 
V
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
T
 
M
R
 
R
G
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
E
 
P
P
 
P
E
 
E
A
 
A
N
 
N
G
 
G
K
 
V
R
 
S
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
I
 
I
P
 
P
L
 
L
D
 
N
A
 
K
L
 
L

4efzA Crystal structure of a hypothetical metallo-beta-lactamase from burkholderia pseudomallei
49% identity, 94% coverage: 13:296/302 of query aligns to 3:295/295 of 4efzA

query
sites
4efzA
G
 
G
T
 
S
P
 
M
N
 
T
V
 
V
A
 
E
G
 
G
F
 
F
F
 
F
D
 
D
P
 
P
R
 
A
T
 
T
F
 
C
S
 
T
V
 
I
Q
 
S
Y
 
Y
V
 
L
V
 
L
S
 
F
D
 
D
P
 
S
E
 
G
T
 
S
K
 
G
Q
 
E
C
 
C
A
 
A
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
E
 
P
K
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
R
T
 
T
A
 
R
T
 
T
H
 
A
H
 
S
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
L
 
L
L
 
I
A
 
A
F
 
R
I
 
V
R
 
A
E
 
A
Q
 
L
G
 
G
F
 
A
E
 
R
V
 
V
Q
 
R
W
 
W
I
 
L
L
 
L
D
 
E
T
 
T
H
|
H
P
 
V
H
|
H
A
 
A
D
|
D
H
|
H
F
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
A
Q
 
P
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
E
 
T
Q
 
R
T
 
V
G
 
G
A
 
G
P
 
E
T
 
I
A
 
A
I
 
I
G
 
G
G
 
R
Y
 
H
V
 
V
T
 
T
G
 
R
V
 
V
Q
 
Q
E
 
D
L
 
V
W
 
F
K
 
G
G
 
K
I
 
L
Y
 
F
N
 
N
W
 
A
-
 
G
P
 
P
D
 
A
F
 
F
P
 
A
A
 
H
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
W
 
F
D
 
D
H
 
R
L
 
L
F
 
L
R
 
D
A
 
D
G
 
G
D
 
D
E
 
T
F
 
L
R
 
A
V
 
L
G
 
G
N
 
A
L
 
L
Q
 
S
G
 
I
R
 
R
V
 
A
M
 
M
F
 
H
S
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
L
 
P
A
 
A
S
 
C
V
 
M
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
G
 
T
D
 
E
-
 
A
-
 
H
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
D
-
 
A
-
 
R
-
 
D
-
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
H
 
G
D
|
D
T
 
T
I
 
L
F
 
F
Q
 
M
P
 
P
D
 
D
F
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
C
D
 
D
F
 
F
P
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
D
A
 
A
H
 
R
Q
 
S
L
 
L
W
 
Y
D
 
R
S
 
S
I
 
I
Q
 
R
A
 
K
I
 
V
L
 
L
A
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
P
E
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
L
F
 
Y
T
 
M
G
 
C
H
 
H
D
 
D
Y
 
Y
M
 
Q
P
 
P
G
 
A
G
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
I
E
 
Q
W
 
Y
E
 
A
S
 
S
T
 
T
V
 
V
G
 
A
E
 
D
Q
 
E
K
 
L
Q
 
R
A
 
E
N
 
N
K
 
V
H
 
H
L
 
I
A
 
R
E
 
E
-
 
G
T
 
V
S
 
T
E
 
E
A
 
D
E
 
D
Y
 
F
V
 
V
E
 
A
L
 
M
R
 
R
N
 
T
T
 
A
R
 
R
D
 
D
S
 
A
E
 
T
L
 
L
P
 
D
M
 
M
P
 
P
K
 
V
L
 
L
I
 
M
L
 
L
H
 
P
A
 
S
L
 
V
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
T
 
M
R
 
R
G
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
A
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
V
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
I
 
I
P
 
P
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
I

4ysbA Crystal structure of ethe1 from myxococcus xanthus (see paper)
33% identity, 85% coverage: 20:276/302 of query aligns to 6:224/225 of 4ysbA

query
sites
4ysbA
F
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
S
R
 
E
T
 
S
F
 
S
S
 
T
V
 
Y
Q
 
T
Y
 
Y
V
 
L
V
 
I
S
 
G
D
 
D
P
 
E
E
 
A
T
 
T
K
 
R
Q
 
Q
C
 
A
A
 
V
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
L
D
 
E
Y
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
H
 
Q
A
 
V
D
 
D
E
 
R
L
 
D
L
 
L
A
 
Q
F
 
M
I
 
V
R
 
A
E
 
E
Q
 
L
G
 
D
F
 
L
E
 
T
V
 
L
Q
 
T
W
 
H
I
 
V
L
 
F
D
 
D
T
 
T
H
|
H
P
 
V
H
|
H
A
 
A
D
|
D
H
|
H
F
 
I
S
 
T
A
 
A
A
 
S
Q
 
G
Y
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
E
Q
 
R
T
 
T
G
 
Q
A
 
A
P
 
-
T
 
-
A
 
T
I
 
V
G
 
V
G
 
G
Y
 
S
V
 
V
T
 
N
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
E
 
-
L
 
-
W
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
W
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
A
S
 
S
Q
 
C
W
 
A
D
 
N
H
 
V
L
 
Q
F
 
V
R
 
R
A
 
H
G
 
G
D
 
D
E
 
E
F
 
V
R
 
R
V
 
V
G
 
G
N
 
Q
L
 
L
Q
 
V
G
 
F
R
 
Q
V
 
V
M
 
L
F
 
A
S
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
L
 
D
A
 
D
S
 
S
V
 
I
T
 
S
Y
 
Y
V
 
L
I
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
R
A
 
V
F
 
F
V
 
T
H
 
G
D
|
D
T
 
A
I
 
L
F
 
L
Q
 
V
P
 
R
D
 
-
F
 
-
G
 
G
T
 
N
A
 
G
R
 
R
A
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
G
 
N
G
 
G
D
 
N
A
 
A
H
 
S
Q
 
Q
L
 
L
W
 
Y
D
 
D
S
 
S
I
 
L
Q
 
T
A
 
R
I
 
V
L
 
L
-
 
F
A
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
D
E
 
E
T
 
T
R
 
L
L
 
V
F
 
Y
T
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
D
Y
 
Y
M
 
-
P
 
-
G
 
K
G
 
G
R
 
R
E
 
T
P
 
V
E
 
-
W
 
-
E
 
-
S
 
T
T
 
S
V
 
I
G
 
A
E
 
E
Q
 
E
K
 
K
Q
 
R
A
 
H
N
 
N
K
 
P
H
 
R
L
 
V
A
 
A
E
 
G
T
 
K
S
 
S
E
 
R
A
 
E
E
 
E
Y
 
F
V
 
I
E
 
H
L
 
I
R
 
-
N
 
-
T
 
M
R
 
E
D
 
N
S
 
L
E
 
N
L
 
L
P
 
P
M
 
R
P
 
P
K
 
K
L
 
L
I
 
I
L
 
D
H
 
A
A
 
A
L
 
V
Q
 
P
V
 
A
N
 
N
T
 
R
R
 
A
G
 
C
G
 
G

O95571 Persulfide dioxygenase ETHE1, mitochondrial; Ethylmalonic encephalopathy protein 1; Hepatoma subtracted clone one protein; Sulfur dioxygenase ETHE1; EC 1.13.11.18 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
29% identity, 85% coverage: 20:276/302 of query aligns to 28:248/254 of O95571

query
sites
O95571
F
 
M
F
 
F
D
 
E
P
 
P
R
 
V
T
 
S
F
 
C
S
 
T
V
 
F
Q
 
T
Y
 
Y
V
 
L
V
 
L
S
 
G
D
 
D
P
 
R
E
 
E
T
 
S
K
 
R
Q
 
E
C
 
A
A
 
V
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
|
L
D
 
E
Y
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
T
A
 
A
T
 
P
H
 
R
H
 
D
A
 
A
D
 
Q
E
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
F
 
L
I
 
I
R
 
K
E
 
E
Q
 
L
G
 
G
F
 
L
E
 
R
V
 
L
Q
 
L
W
 
Y
I
 
A
L
 
V
D
 
N
T
 
T
H
|
H
P
 
C
H
 
H
A
 
A
D
 
D
H
 
H
F
 
I
S
 
T
A
 
G
A
 
S
Q
 
G
Y
 
L
L
 
L
K
 
R
E
 
S
Q
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
L
V
 
L
T
 
P
G
 
G
V
 
C
Q
 
Q
E
 
S
L
 
V
W
 
I
K
 
S
G
 
R
I
 
L
Y
 
-
N
 
-
W
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
S
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
W
 
A
D
 
D
H
 
L
L
 
H
F
 
I
R
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
D
E
 
S
F
 
I
R
 
R
V
 
F
G
 
G
N
 
R
L
 
F
Q
 
A
G
 
L
R
 
E
V
 
T
M
 
R
F
 
A
S
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
L
 
P
A
 
G
S
 
C
V
 
V
T
 
T
Y
 
F
V
 
V
I
 
L
G
 
N
D
 
D
-
 
H
-
 
S
A
 
M
A
 
A
F
 
F
V
x
T
H
 
G
D
|
D
T
 
A
I
 
L
F
 
L
Q
 
I
P
 
R
D
 
-
F
 
-
G
 
G
T
 
C
A
 
G
R
 
R
A
x
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
G
 
Q
G
 
G
D
 
C
A
 
A
H
 
K
Q
 
T
L
 
L
W
 
Y
D
 
H
S
 
S
I
 
V
-
 
H
Q
 
E
A
 
K
I
 
I
L
 
F
A
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
G
E
 
D
T
 
C
R
 
L
L
 
I
F
 
Y
T
 
P
G
 
A
H
 
H
D
|
D
Y
 
Y
M
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
H
P
 
G
E
 
F
W
 
T
E
 
V
S
 
S
T
 
T
V
 
V
G
 
E
E
 
E
Q
 
E
K
 
R
Q
 
T
A
 
L
N
 
N
K
 
P
H
 
R
L
 
L
A
 
T
E
 
L
T
 
S
S
 
C
E
 
E
A
 
-
E
 
E
Y
 
F
V
 
V
E
 
K
L
 
I
R
 
M
N
 
G
T
 
-
R
 
-
D
 
N
S
 
L
E
 
N
L
 
L
P
 
P
M
 
K
P
 
P
K
 
Q
L
 
Q
I
 
I
L
 
D
H
 
F
A
 
A
L
 
V
Q
 
P
V
 
A
N
 
N
T
 
M
R
 
R
G
 
C
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4chlB Human ethylmalonic encephalopathy protein 1 (hethe1) (see paper)
29% identity, 85% coverage: 20:276/302 of query aligns to 12:232/237 of 4chlB

query
sites
4chlB
F
 
M
F
 
F
D
 
E
P
 
P
R
 
V
T
 
S
F
 
C
S
 
T
V
 
F
Q
 
T
Y
 
Y
V
 
L
V
 
L
S
 
G
D
 
D
P
 
R
E
 
E
T
 
S
K
 
R
Q
 
E
C
 
A
A
 
V
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
L
D
 
E
Y
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
T
A
 
A
T
 
P
H
 
R
H
 
D
A
 
A
D
 
Q
E
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
F
 
L
I
 
I
R
 
K
E
 
E
Q
 
L
G
 
G
F
 
L
E
 
R
V
 
L
Q
 
L
W
 
Y
I
 
A
L
 
V
D
 
N
T
 
T
H
|
H
P
 
C
H
|
H
A
 
A
D
|
D
H
|
H
F
 
I
S
 
T
A
 
G
A
 
S
Q
 
G
Y
 
L
L
 
L
K
 
R
E
 
S
Q
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
L
V
 
L
T
 
P
G
 
G
V
 
C
Q
 
Q
E
 
S
L
 
V
W
 
I
K
 
S
G
 
R
I
 
L
Y
 
-
N
 
-
W
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
S
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
W
 
A
D
 
D
H
 
L
L
 
H
F
 
I
R
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
D
E
 
S
F
 
I
R
 
R
V
 
F
G
 
G
N
 
R
L
 
F
Q
 
A
G
 
L
R
 
E
V
 
T
M
 
R
F
 
A
S
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
L
 
P
A
 
G
S
 
C
V
 
V
T
 
T
Y
 
F
V
 
V
I
 
L
G
 
N
D
 
D
-
 
H
-
 
S
A
 
M
A
 
A
F
 
F
V
 
T
H
 
G
D
|
D
T
 
A
I
 
L
F
 
L
Q
 
I
P
 
R
D
 
-
F
 
-
G
 
G
T
 
C
A
 
G
R
 
R
A
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
G
 
Q
G
 
G
D
 
C
A
 
A
H
 
K
Q
 
T
L
 
L
W
 
Y
D
 
H
S
 
S
I
 
V
-
 
H
Q
 
E
A
 
K
I
 
I
L
 
F
A
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
G
E
 
D
T
 
C
R
 
L
L
 
I
F
 
Y
T
 
P
G
 
A
H
|
H
D
 
D
Y
 
Y
M
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
H
P
 
G
E
 
F
W
 
T
E
 
V
S
 
S
T
 
T
V
 
V
G
 
E
E
 
E
Q
 
E
K
 
R
Q
 
T
A
 
L
N
 
N
K
 
P
H
 
R
L
 
L
A
 
T
E
 
L
T
 
S
S
 
C
E
 
E
A
 
-
E
 
E
Y
 
F
V
 
V
E
 
K
L
 
I
R
 
M
N
 
G
T
 
-
R
 
-
D
 
N
S
 
L
E
 
N
L
 
L
P
 
P
M
 
K
P
 
P
K
 
Q
L
 
Q
I
 
I
L
 
D
H
 
F
A
 
A
L
 
V
Q
 
P
V
 
A
N
 
N
T
 
M
R
 
R
G
 
C
G
 
G

5ve5A Crystal structure of persulfide dioxygenase rhodanese fusion protein with rhodanese domain inactivating mutation (c314s) from burkholderia phytofirmans in complex with glutathione (see paper)
28% identity, 87% coverage: 20:282/302 of query aligns to 9:236/350 of 5ve5A

query
sites
5ve5A
F
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
Q
R
 
Q
T
 
S
F
 
S
S
 
T
V
 
Y
Q
 
T
Y
 
Y
V
 
L
V
 
L
S
 
A
D
 
D
P
 
S
E
 
T
T
 
T
K
x
R
Q
 
E
C
 
A
A
 
V
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
F
D
 
E
Y
 
Q
D
 
V
E
 
R
K
 
R
S
 
D
G
 
A
A
 
A
T
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
F
 
L
I
 
I
R
 
E
E
 
E
Q
 
L
G
 
G
F
 
L
E
 
H
V
 
L
Q
 
L
W
 
Y
I
 
T
L
 
I
D
 
D
T
 
T
H
|
H
P
 
V
H
|
H
A
 
A
D
|
D
H
|
H
F
 
V
S
 
T
A
 
G
A
 
A
Q
 
W
Y
 
M
L
 
L
K
 
N
E
 
R
Q
 
R
T
 
I
G
 
G
A
 
S
P
 
R
T
 
I
A
 
A
I
 
I
G
 
S
G
 
A
Y
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
-
V
 
-
Q
 
-
E
 
-
L
 
-
W
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
W
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
A
D
 
S
G
 
G
S
 
A
Q
 
E
W
 
G
-
 
A
D
 
D
H
 
R
L
 
Y
F
 
L
R
 
S
A
 
H
G
 
G
D
 
D
E
 
K
F
 
V
R
 
E
V
 
F
G
 
G
N
 
T
L
 
R
Q
 
Y
G
 
L
R
 
T
V
 
V
M
 
R
F
 
A
S
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
L
 
D
A
 
G
S
 
C
V
 
I
T
 
T
Y
 
L
V
 
V
I
 
L
G
 
D
D
 
N
-
 
E
-
 
T
A
 
M
A
 
A
F
 
F
V
 
T
H
 
G
D
|
D
T
 
C
I
 
L
F
 
L
Q
 
I
P
 
R
D
 
-
F
 
-
G
 
G
T
 
T
A
x
G
R
|
R
A
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
G
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
A
H
 
H
Q
 
T
L
 
M
W
 
F
D
 
R
S
 
A
I
 
V
Q
 
H
A
 
G
-
 
Q
I
 
I
L
 
F
A
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
T
E
 
A
T
 
C
R
 
L
L
 
L
F
 
Y
T
 
P
G
 
A
H
|
H
D
 
D
Y
|
Y
M
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
R
P
 
G
E
 
L
W
 
T
E
 
V
S
 
T
T
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
E
Q
 
E
K
 
R
Q
 
R
A
 
F
N
 
N
K
 
P
H
 
R
L
 
L
-
 
G
A
 
G
E
 
E
T
 
L
S
 
C
E
 
E
A
 
E
E
 
D
Y
 
F
V
 
T
E
 
G
L
 
Y
R
 
M
N
 
T
T
 
-
R
 
-
D
 
N
S
 
L
E
 
H
L
|
L
P
 
P
M
 
H
P
|
P
K
|
K
L
 
Q
I
 
I
L
 
D
H
 
V
A
 
A
L
 
V
Q
 
P
V
 
A
N
 
N
T
 
L
R
 
K
G
 
C
G
 
G
R
 
-
L
 
L
P
 
A
E
 
E
P
 
P
E
 
D

Q9C8L4 Persulfide dioxygenase ETHE1 homolog, mitochondrial; Glyoxalase II; Glx II; Sulfur dioxygenase ETHE1; EC 1.13.11.18 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
31% identity, 81% coverage: 32:276/302 of query aligns to 72:285/294 of Q9C8L4

query
sites
Q9C8L4
V
 
V
S
 
S
D
 
H
P
 
P
E
 
D
T
 
-
K
 
K
Q
 
P
C
 
A
A
 
L
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
-
E
 
D
K
 
K
S
 
T
G
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
V
D
 
D
E
 
R
L
 
D
L
 
L
A
 
K
F
 
L
I
 
I
R
 
D
E
 
E
Q
 
L
G
 
G
F
 
L
E
 
K
V
 
L
Q
 
I
W
 
Y
I
 
A
L
 
M
D
 
N
T
 
T
H
|
H
P
 
V
H
 
H
A
 
A
D
 
D
H
 
H
F
 
V
S
 
T
A
 
G
A
 
T
Q
 
G
Y
 
L
L
 
L
K
 
K
E
 
T
Q
 
K
T
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
V
 
L
T
 
P
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
E
 
S
L
 
V
W
 
I
K
 
S
G
 
K
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
W
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
A
D
 
S
G
 
G
S
 
S
Q
 
K
W
 
A
D
 
D
H
 
L
L
 
F
F
 
L
R
 
E
A
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
K
F
 
V
R
 
S
V
 
I
G
 
G
N
 
D
L
 
I
Q
 
Y
G
 
L
R
 
E
V
 
V
M
 
R
F
 
A
S
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
L
 
A
A
 
G
S
 
C
V
 
V
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
I
 
T
G
 
G
D
 
E
A
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
Q
-
 
P
-
 
Q
-
 
P
-
 
R
-
 
M
A
 
A
F
 
F
V
 
T
H
 
G
D
|
D
T
 
A
I
 
V
F
 
L
Q
 
I
P
 
-
D
 
-
F
 
R
G
 
G
T
 
C
A
 
G
R
 
R
A
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
G
 
E
G
 
G
D
 
S
A
 
S
H
 
D
Q
 
Q
L
 
L
W
 
Y
D
 
E
S
 
S
I
 
V
Q
 
H
A
 
S
-
 
Q
I
 
I
L
 
F
A
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
K
E
 
D
T
 
T
R
 
L
L
 
I
F
 
Y
T
 
P
G
 
A
H
 
H
D
 
D
Y
 
Y
M
 
-
P
 
-
G
 
K
G
 
G
R
 
F
E
 
E
P
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
V
S
 
S
T
 
T
V
 
V
G
 
G
E
 
E
Q
 
E
K
 
M
Q
 
Q
A
 
H
N
 
N
K
 
P
H
 
R
L
 
L
A
 
T
E
 
K
T
 
D
S
 
K
E
 
E
A
 
T
E
 
F
Y
 
K
V
 
T
E
 
I
L
 
M
R
 
S
N
 
N
T
 
L
R
 
-
D
 
-
S
 
-
E
 
N
L
 
L
P
 
S
M
 
Y
P
 
P
K
 
K
L
 
M
I
 
I
L
 
D
H
 
V
A
 
A
L
 
V
Q
 
P
V
 
A
N
 
N
T
 
M
R
 
V
G
 
C
G
 
G

2gcuA X-ray structure of gene product from arabidopsis thaliana at1g53580 (see paper)
29% identity, 85% coverage: 20:276/302 of query aligns to 8:236/244 of 2gcuA

query
sites
2gcuA
F
 
L
F
 
F
D
 
E
P
 
N
R
 
E
T
 
S
F
 
S
S
 
T
V
 
F
Q
 
T
Y
 
Y
V
 
L
V
 
L
S
 
A
D
 
D
P
 
V
E
 
S
-
 
H
-
 
P
T
 
D
K
 
K
Q
 
P
C
 
A
A
 
L
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
-
E
 
D
K
 
K
S
 
T
G
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
V
D
 
D
E
 
R
L
 
D
L
 
L
A
 
K
F
 
L
I
 
I
R
 
D
E
 
E
Q
 
L
G
 
G
F
 
L
E
 
K
V
 
L
Q
 
I
W
 
Y
I
 
A
L
 
M
D
 
N
T
 
T
H
|
H
P
 
V
H
|
H
A
 
A
D
|
D
H
|
H
F
 
V
S
 
T
A
 
G
A
 
T
Q
 
G
Y
 
L
L
 
L
K
 
K
E
 
T
Q
 
K
T
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
V
 
L
T
 
P
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
E
 
S
L
 
V
W
 
I
K
 
S
G
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
W
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
K
A
 
A
D
 
S
G
 
G
S
 
S
Q
 
K
W
 
A
D
 
D
H
 
L
L
 
F
F
 
L
R
 
E
A
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
K
F
 
V
R
 
S
V
 
I
G
 
G
N
 
D
L
 
I
Q
 
Y
G
 
L
R
 
E
V
 
V
M
 
R
F
 
A
S
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
L
 
A
A
 
G
S
 
C
V
 
V
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
I
 
T
G
 
G
D
 
E
A
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
Q
-
 
P
-
 
Q
-
 
P
-
 
R
-
 
M
A
 
A
F
 
F
V
 
T
H
 
G
D
|
D
T
 
A
I
 
V
F
 
L
Q
 
I
P
 
R
D
 
-
F
 
-
G
 
G
T
 
C
A
 
G
R
 
R
A
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
G
 
E
G
 
G
D
 
S
A
 
S
H
 
D
Q
 
Q
L
 
L
W
 
Y
D
 
E
S
 
S
I
 
V
Q
 
H
A
 
S
-
 
Q
I
 
I
L
 
F
A
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
K
E
 
D
T
 
T
R
 
L
L
 
I
F
 
Y
T
 
P
G
 
A
H
|
H
D
 
D
Y
 
Y
M
 
-
P
 
-
G
 
K
G
 
G
R
 
F
E
 
E
P
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
V
S
 
S
T
 
T
V
 
V
G
 
G
E
 
E
Q
 
E
K
 
M
Q
 
Q
A
 
H
N
 
N
K
 
P
H
 
R
L
 
L
A
 
T
E
 
K
T
 
D
S
 
K
E
 
E
A
 
T
E
 
F
Y
 
K
V
 
T
E
 
I
L
 
M
R
 
S
N
 
N
T
 
L
R
 
N
D
 
-
S
 
-
E
 
-
L
 
L
P
 
S
M
 
Y
P
 
P
K
 
K
L
 
M
I
 
I
L
 
D
H
 
V
A
 
A
L
 
V
Q
 
P
V
 
A
N
 
N
T
 
M
R
 
V
G
 
C
G
 
G

3r2uB 2.1 angstrom resolution crystal structure of metallo-beta-lactamase from staphylococcus aureus subsp. Aureus col
27% identity, 87% coverage: 20:281/302 of query aligns to 10:252/336 of 3r2uB

query
sites
3r2uB
F
 
F
F
 
Y
D
 
D
P
 
K
R
 
H
T
 
L
F
 
S
S
 
Q
V
 
A
Q
 
S
Y
 
Y
V
 
L
V
 
I
S
 
G
D
 
C
P
 
Q
E
 
K
T
 
T
K
 
G
Q
 
E
C
 
A
A
 
M
I
 
I
I
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
I
L
 
R
D
 
D
Y
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
L
 
L
L
 
S
A
 
S
F
 
Y
I
 
I
R
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
D
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
F
 
L
E
 
T
V
 
I
Q
 
T
W
 
H
I
 
A
L
 
A
D
 
E
T
 
T
H
|
H
P
 
I
H
|
H
A
 
A
D
|
D
H
x
F
F
 
A
S
 
S
A
 
G
A
 
I
Q
 
R
Y
 
D
L
 
V
K
 
A
E
 
I
Q
 
K
T
 
L
G
 
N
A
 
A
P
 
N
T
 
I
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
Y
V
 
V
T
 
S
G
 
G
V
 
E
Q
 
S
E
 
D
L
 
D
W
 
T
K
 
L
G
 
G
I
 
Y
Y
 
K
N
 
N
W
 
M
P
 
P
D
 
N
F
 
H
P
 
T
A
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
Q
 
-
W
 
-
D
 
-
H
 
H
L
 
F
F
 
V
R
 
Q
A
 
H
G
 
N
D
 
D
E
 
D
F
 
I
R
 
Y
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
I
Q
 
K
G
 
L
R
 
K
V
 
V
M
 
L
F
 
H
S
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
L
 
P
A
 
E
S
 
S
V
 
I
T
 
S
Y
 
F
V
 
L
I
 
L
G
 
T
D
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
Q
-
 
V
-
 
P
-
 
M
A
 
G
A
 
L
F
 
F
V
 
S
H
 
G
D
|
D
T
 
F
I
 
I
F
 
F
Q
 
V
P
 
G
D
 
D
F
 
I
G
 
G
T
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
P
D
 
D
F
 
L
P
 
S
G
 
E
G
 
I
D
 
G
A
 
A
H
 
K
Q
 
Q
L
 
M
W
 
F
D
 
K
S
 
S
I
 
I
Q
 
E
A
 
S
I
 
I
L
 
K
A
 
D
L
 
L
P
 
P
D
 
D
E
 
Y
T
 
I
R
 
Q
L
 
I
F
 
W
T
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
G
Y
 
A
M
 
G
P
 
S
G
 
S
-
 
L
G
 
G
R
 
A
E
 
I
P
 
P
E
 
-
W
 
-
E
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
L
G
 
G
E
 
Y
Q
 
E
K
 
K
Q
 
Q
A
 
T
N
 
N
K
 
W
H
 
A
L
 
F
A
 
S
E
 
E
T
 
N
S
 
N
E
 
E
A
 
A
E
 
T
Y
 
F
V
 
I
E
 
D
L
 
-
R
 
K
N
 
L
T
 
I
R
 
S
D
 
D
S
 
Q
E
 
P
L
 
A
P
 
P
M
 
-
P
 
P
K
 
H
L
 
H
I
 
F
L
 
A
H
 
Q
A
 
M
L
 
K
Q
 
K
V
 
I
N
 
N
T
 
Q
R
 
F
G
 
G
G
 
M
R
 
N
L
 
L
P
 
Y
E
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3r2uA 2.1 angstrom resolution crystal structure of metallo-beta-lactamase from staphylococcus aureus subsp. Aureus col
26% identity, 87% coverage: 20:281/302 of query aligns to 8:264/348 of 3r2uA

query
sites
3r2uA
F
 
F
F
 
Y
D
 
D
P
 
K
R
 
H
T
 
L
F
 
S
S
 
Q
V
 
A
Q
 
S
Y
 
Y
V
 
L
V
 
I
S
 
G
D
 
C
P
 
Q
E
 
K
T
 
T
K
 
G
Q
 
E
C
 
A
A
 
M
I
 
I
I
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
I
L
 
R
D
 
D
Y
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
L
 
L
L
 
S
A
 
S
F
 
Y
I
 
I
R
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
D
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
F
 
L
E
 
T
V
 
I
Q
 
T
W
 
H
I
 
A
L
 
A
D
 
E
T
 
T
H
|
H
P
 
I
H
|
H
A
 
A
D
|
D
H
x
F
F
 
A
S
 
S
A
 
G
A
 
I
Q
 
R
Y
 
D
L
 
V
K
 
A
E
 
I
Q
 
K
T
 
L
G
 
N
A
 
A
P
 
N
T
 
I
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
Y
V
 
V
T
 
S
G
 
G
V
 
E
Q
 
S
E
 
D
L
 
D
W
 
T
K
 
L
G
 
G
I
 
Y
Y
 
K
N
 
N
W
 
M
P
 
P
D
 
N
F
 
H
P
 
T
A
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
Q
 
-
W
 
-
D
 
-
H
 
H
L
 
F
F
 
V
R
 
Q
A
 
H
G
 
N
D
 
D
E
 
D
F
 
I
R
 
Y
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
I
Q
 
K
G
 
L
R
 
K
V
 
V
M
 
L
F
 
H
S
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
L
 
P
A
 
E
S
 
S
V
 
I
T
 
S
Y
 
F
V
 
L
I
 
L
-
 
T
-
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
Q
-
 
V
-
 
P
-
 
M
-
 
G
-
 
L
-
 
F
-
 
S
G
 
G
D
|
D
A
 
F
A
 
I
F
 
F
V
 
V
H
 
G
D
 
D
T
 
-
I
 
I
F
 
G
Q
 
R
P
 
P
D
 
D
F
 
L
G
 
L
T
 
E
A
 
K
R
 
A
A
 
V
D
 
K
F
 
V
P
 
E
G
 
G
G
 
S
D
 
S
-
 
E
-
 
I
-
 
G
A
 
A
H
 
K
Q
 
Q
L
 
M
W
 
F
D
 
K
S
 
S
I
 
I
Q
 
E
A
 
S
I
 
I
L
 
K
A
 
D
L
 
L
P
 
P
D
 
D
E
 
Y
T
 
I
R
 
Q
L
 
I
F
 
W
T
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
G
Y
 
A
-
 
G
M
 
S
P
 
P
G
 
C
G
 
G
R
 
K
E
 
S
P
 
L
E
 
G
W
 
A
-
 
I
-
 
P
E
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
L
G
 
G
E
 
Y
Q
 
E
K
 
K
Q
 
Q
A
 
T
N
 
N
K
 
W
H
 
A
L
 
F
A
 
S
E
 
E
T
 
N
S
 
N
E
 
E
A
 
A
E
 
T
Y
 
F
V
 
I
E
 
D
L
 
-
R
 
K
N
 
L
T
 
I
R
 
S
D
 
D
S
 
Q
E
 
P
L
 
A
P
 
P
M
 
-
P
 
P
K
 
H
L
 
H
I
 
F
L
 
A
H
 
Q
A
 
M
L
 
K
Q
 
K
V
 
I
N
 
N
T
 
Q
R
 
F
G
 
G
G
 
M
R
 
N
L
 
L
P
 
Y
E
 
Q
P
 
P

3tp9A Crystal structure of alicyclobacillus acidocaldarius protein with beta-lactamase and rhodanese domains
27% identity, 86% coverage: 20:278/302 of query aligns to 8:262/473 of 3tp9A

query
sites
3tp9A
F
 
F
F
 
Y
D
 
D
P
 
E
R
 
G
T
 
L
F
 
A
S
 
H
V
 
A
Q
 
S
Y
 
Y
V
 
L
V
 
V
S
 
G
D
 
C
P
 
Q
E
 
E
T
 
T
K
 
G
Q
 
E
C
 
A
A
 
C
I
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
A
L
 
R
D
 
D
Y
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
V
D
 
E
E
 
P
L
 
Y
L
 
L
A
 
L
F
 
T
I
 
A
R
 
K
E
 
R
Q
 
E
G
 
G
F
 
L
E
 
R
V
 
I
Q
 
V
W
 
A
I
 
A
L
 
L
D
 
E
T
 
T
H
|
H
P
 
I
H
|
H
A
 
A
D
|
D
H
x
F
F
 
V
S
 
S
A
 
G
A
 
A
Q
 
R
Y
 
E
L
 
M
K
 
A
E
 
D
Q
 
R
T
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
A
T
 
I
A
 
C
I
 
V
G
 
S
G
 
D
Y
 
-
V
 
-
T
 
E
G
 
G
V
 
P
Q
 
P
E
 
E
L
 
-
W
 
W
K
 
K
G
 
S
I
 
E
Y
 
Y
N
 
V
W
 
-
P
 
K
D
 
A
F
 
Y
P
 
P
A
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
Q
 
-
W
 
-
D
 
H
H
 
R
L
 
L
F
 
L
R
 
K
A
 
D
G
 
G
D
 
D
E
 
E
F
 
L
R
 
H
V
 
F
G
 
G
N
 
N
L
 
V
Q
 
R
G
 
I
R
 
V
V
 
V
M
 
M
F
 
H
S
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
L
 
P
A
 
E
S
 
H
V
 
V
T
 
S
Y
 
Y
V
 
L
I
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
M
-
 
A
-
 
L
-
 
F
-
 
S
G
 
G
D
|
D
A
 
F
A
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
G
D
 
D
T
 
-
I
 
V
F
 
G
Q
 
R
P
 
P
D
 
D
F
 
L
G
 
L
T
 
E
A
 
R
R
 
V
A
 
A
D
 
G
F
 
E
P
 
S
G
 
G
G
 
S
D
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
L
A
 
A
H
 
R
Q
 
Q
L
 
M
W
 
F
D
 
R
S
 
S
I
 
L
Q
 
R
A
 
K
I
 
F
L
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
D
E
 
H
T
 
V
R
 
Q
L
 
V
F
 
L
T
 
P
G
 
A
H
 
H
D
 
G
Y
 
A
M
 
G
P
 
S
G
 
A
-
 
C
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
L
G
 
G
R
 
A
E
 
V
P
 
P
E
 
-
W
 
-
E
 
S
S
 
S
T
 
T
V
 
V
G
 
G
E
 
Y
Q
 
E
K
 
K
Q
 
L
A
 
V
N
 
N
K
 
W
H
 
A
L
 
L
A
 
Q
E
 
H
T
 
K
S
 
D
E
 
E
A
 
D
E
 
A
Y
 
F
V
 
V
E
 
Q
L
 
A
R
 
L
N
 
L
T
 
A
R
 
G
D
 
Q
S
 
P
E
 
E
L
 
A
P
 
P
M
 
I
P
 
-
K
 
-
L
 
Y
I
 
F
L
 
A
H
 
R
A
 
M
L
 
K
Q
 
L
V
 
V
N
 
N
T
 
K
R
 
V
G
 
G
G
 
P
R
 
R
L
 
L

2q42A Ensemble refinement of the protein crystal structure of glyoxalase ii from arabidopsis thaliana gene at2g31350 (see paper)
24% identity, 90% coverage: 30:301/302 of query aligns to 15:244/254 of 2q42A

query
sites
2q42A
Y
 
Y
V
 
I
V
 
L
S
 
H
D
 
D
P
 
E
E
 
D
T
 
T
K
 
G
Q
 
T
C
 
V
A
 
G
I
 
V
I
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
-
L
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
S
H
 
E
A
 
A
D
 
E
E
 
P
L
 
I
L
 
I
A
 
D
F
 
S
I
 
L
R
 
K
E
 
R
Q
 
S
G
 
G
F
 
R
E
 
N
V
 
L
Q
 
T
W
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
N
T
 
T
H
|
H
P
 
H
H
|
H
A
 
Y
D
|
D
H
|
H
F
 
T
S
 
G
A
 
G
A
 
N
Q
 
L
Y
 
E
L
 
L
K
 
K
E
 
D
Q
 
R
T
 
Y
G
 
G
A
 
A
P
 
-
T
 
K
A
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
S
Y
 
A
V
 
M
T
 
D
G
 
-
V
 
-
Q
 
K
E
 
D
L
 
R
W
 
I
K
 
P
G
 
G
I
 
I
Y
 
-
N
 
-
W
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
Q
 
-
W
 
-
D
 
D
H
 
M
L
 
A
F
 
L
R
 
K
A
 
D
G
 
G
D
 
D
E
 
K
F
 
W
R
 
M
V
 
F
G
 
A
N
 
G
L
 
H
Q
 
E
G
 
V
R
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
D
S
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
L
 
K
A
 
G
S
 
H
V
 
I
T
 
S
-
 
L
Y
 
Y
V
 
F
I
 
P
G
 
G
D
 
S
-
 
R
A
 
A
A
 
I
F
 
F
V
 
T
H
 
G
D
|
D
T
 
T
I
 
M
F
 
F
Q
 
S
P
 
L
D
 
S
F
 
C
G
 
G
T
 
K
A
 
L
R
 
F
A
 
E
D
 
G
F
 
T
P
 
P
G
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
H
 
K
Q
 
Q
L
 
M
W
 
L
D
 
A
S
 
S
I
 
L
Q
 
Q
A
 
K
I
 
I
L
 
T
A
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
D
E
 
D
T
 
T
R
 
S
L
 
I
F
 
Y
T
 
C
G
 
G
H
|
H
D
 
E
Y
 
Y
M
 
T
P
 
L
G
 
S
G
 
N
R
 
-
E
 
-
P
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
-
S
 
S
T
 
K
V
 
F
G
 
A
E
 
L
Q
 
S
K
 
L
Q
 
E
A
 
P
N
 
N
K
 
N
H
 
E
L
 
V
A
 
L
E
 
Q
T
 
S
S
 
Y
E
 
A
A
 
A
E
 
H
Y
 
V
V
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
R
N
 
S
T
 
K
R
 
K
D
 
L
S
 
P
E
 
T
L
 
I
P
 
P
M
 
T
P
 
T
K
 
V
L
 
K
I
 
M
L
 
E
H
 
K
A
 
A
L
 
C
Q
 
N
V
 
P
N
 
F
T
 
L
R
 
R
G
 
S
G
 
S
R
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
P
 
-
E
 
N
A
 
T
N
 
D
G
 
I
K
 
R
R
 
R
Y
 
A
L
 
L
K
 
R
I
 
I
P
 
P
L
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
D
E
 
E
G
 
A
A
 
E
A
 
A
W
 
L

Q9SID3 Hydroxyacylglutathione hydrolase 2, mitochondrial; Glyoxalase II; Glx II; EC 3.1.2.6 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
24% identity, 90% coverage: 30:301/302 of query aligns to 85:314/324 of Q9SID3

query
sites
Q9SID3
Y
 
Y
V
 
I
V
 
L
S
 
H
D
 
D
P
 
E
E
 
D
T
 
T
K
 
G
Q
 
T
C
 
V
A
 
G
I
 
V
I
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
-
L
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
S
H
 
E
A
 
A
D
 
E
E
 
P
L
 
I
L
 
I
A
 
D
F
 
S
I
 
L
R
 
K
E
 
R
Q
 
S
G
 
G
F
 
R
E
 
N
V
 
L
Q
 
T
W
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
N
T
 
T
H
|
H
P
 
H
H
|
H
A
 
Y
D
|
D
H
|
H
F
 
T
S
 
G
A
 
G
A
 
N
Q
 
L
Y
 
E
L
 
L
K
 
K
E
 
D
Q
 
R
T
 
Y
G
 
G
A
 
A
P
 
K
T
 
-
A
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
S
Y
 
A
V
 
M
T
 
D
G
 
-
V
 
-
Q
 
K
E
 
D
L
 
R
W
 
I
K
 
P
G
 
G
I
 
I
Y
 
-
N
 
-
W
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
Q
 
-
W
 
-
D
 
D
H
 
M
L
 
A
F
 
L
R
 
K
A
 
D
G
 
G
D
 
D
E
 
K
F
 
W
R
 
M
V
 
F
G
 
A
N
 
G
L
 
H
Q
 
E
G
 
V
R
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
D
S
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
L
 
K
A
 
G
S
 
H
V
 
I
T
 
S
-
 
L
Y
 
Y
V
 
F
I
 
P
G
 
G
D
 
S
-
 
R
A
 
A
A
 
I
F
 
F
V
 
T
H
 
G
D
|
D
T
 
T
I
 
M
F
 
F
Q
 
S
P
 
L
D
 
S
F
 
C
G
 
G
T
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
K
F
 
L
P
 
F
G
 
E
G
 
G
D
 
T
A
 
P
H
 
K
Q
 
Q
L
 
M
W
 
L
D
 
A
S
 
S
I
 
L
Q
 
Q
A
 
K
I
 
I
L
 
T
A
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
D
E
 
D
T
 
T
R
 
S
L
 
I
F
 
Y
T
 
C
G
 
G
H
|
H
D
 
E
Y
 
Y
M
 
T
P
 
L
G
 
S
G
 
N
R
 
-
E
 
-
P
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
-
S
 
S
T
 
K
V
 
F
G
 
A
E
 
L
Q
 
S
K
 
L
Q
 
E
A
 
P
N
 
N
K
 
N
H
 
E
L
 
V
A
 
L
E
 
Q
T
 
S
S
 
Y
E
 
A
A
 
A
E
 
H
Y
 
V
V
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
R
N
 
S
T
 
K
R
 
K
D
 
L
S
 
P
E
 
T
L
 
I
P
 
P
M
 
T
P
 
T
K
 
V
L
 
K
I
 
M
L
 
E
H
 
K
A
 
A
L
 
C
Q
 
N
V
 
P
N
 
F
T
 
L
R
 
R
G
 
S
G
 
S
R
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
P
 
-
E
 
N
A
 
T
N
 
D
G
 
I
K
 
R
R
 
R
Y
 
A
L
 
L
K
 
R
I
 
I
P
 
P
L
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
D
E
 
E
G
 
A
A
 
E
A
 
A
W
 
L

2xf4A Crystal structure of salmonella enterica serovar typhimurium ycbl (see paper)
29% identity, 69% coverage: 36:242/302 of query aligns to 22:210/210 of 2xf4A

query
sites
2xf4A
E
 
Q
T
 
T
K
 
R
Q
 
L
C
 
A
A
 
A
I
 
L
I
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
G
L
 
G
D
 
D
Y
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
A
D
 
E
E
 
K
L
 
I
L
 
K
A
 
Q
F
 
E
I
 
V
R
 
D
E
 
A
Q
 
S
G
 
G
F
 
V
E
 
T
V
 
L
Q
 
M
W
 
Q
I
 
I
L
 
L
D
 
L
T
 
T
H
 
H
P
 
G
H
 
H
A
 
L
D
|
D
H
|
H
F
 
V
S
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
S
Y
 
E
L
 
L
K
 
A
E
 
Q
Q
 
H
T
 
Y
G
 
G
A
 
V
P
 
P
T
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
V
 
V
T
 
I
G
 
G
V
 
P
Q
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
D
E
 
E
L
 
F
W
 
W
K
 
-
G
 
-
I
 
L
Y
 
Q
N
 
G
W
 
L
P
 
P
D
 
A
-
 
Q
-
 
S
-
 
R
-
 
M
F
 
F
P
 
G
A
 
L
D
 
D
G
 
E
S
 
C
Q
 
Q
-
 
P
-
 
L
-
 
T
W
 
P
D
 
D
H
 
R
L
 
W
F
 
L
R
 
N
A
 
D
G
 
G
D
 
D
E
 
R
F
 
V
R
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
V
Q
 
T
G
 
L
R
 
Q
V
 
V
M
 
L
F
 
H
S
 
C
P
 
P
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
P
A
 
G
S
 
H
V
 
V
T
 
V
Y
 
F
V
 
F
I
 
D
G
 
E
D
 
Q
A
 
S
A
 
Q
F
 
L
V
 
L
-
 
I
-
 
S
H
 
G
D
|
D
T
 
V
I
 
I
F
 
F
Q
 
K
P
 
G
D
 
-
F
 
-
G
 
G
T
 
V
A
 
G
R
 
R
A
 
S
D
 
D
F
 
F
P
 
P
G
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
H
H
 
T
Q
 
Q
L
 
L
W
 
I
D
 
D
S
 
A
I
 
I
Q
 
K
-
 
R
A
 
K
I
 
L
L
 
L
A
 
P
L
 
L
P
 
G
D
 
D
E
 
D
T
 
V
R
 
T
L
 
F
F
 
I
T
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
G
Y
 
P
M
 
L
P
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
-
S
 
S
T
 
T
V
 
L
G
 
G
E
 
Y
Q
 
E
K
 
R
Q
 
L
A
 
H
N
 
N
K
 
P
H
 
F
L
 
L
A
 
Q
E
 
D

O24496 Hydroxyacylglutathione hydrolase cytoplasmic; Glyoxalase II; Glx II; EC 3.1.2.6 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
25% identity, 88% coverage: 30:296/302 of query aligns to 15:246/258 of O24496

query
sites
O24496
Y
 
Y
V
 
L
V
 
I
S
 
I
D
 
D
P
 
E
E
 
S
T
 
T
K
 
G
Q
 
D
C
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
-
D
 
-
Y
 
D
D
 
P
E
 
E
K
 
K
S
 
V
G
 
I
A
 
A
T
 
S
A
 
A
T
 
E
H
 
K
H
 
H
A
 
Q
D
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
F
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
F
 
A
E
 
K
V
 
I
Q
 
K
W
 
F
I
 
V
L
 
L
D
 
T
T
 
T
H
|
H
P
 
H
H
 
H
A
 
W
D
|
D
H
 
H
F
 
A
S
 
G
A
 
G
A
 
N
Q
 
E
Y
 
K
L
 
I
K
 
K
E
 
Q
Q
 
L
T
 
V
G
 
P
A
 
D
P
 
I
T
 
K
A
 
V
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
Y
 
S
V
 
L
T
 
D
G
 
K
V
 
V
Q
 
K
E
 
G
L
 
C
W
 
T
K
 
D
G
 
A
I
 
V
Y
 
D
N
 
N
W
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
Q
 
-
W
 
-
D
 
-
H
 
-
L
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
D
E
 
K
F
 
L
R
 
T
V
 
L
G
 
G
-
 
Q
N
 
D
L
 
I
Q
 
N
G
 
I
R
 
L
V
 
A
M
 
L
F
 
H
S
 
T
P
 
P
G
 
C
H
 
H
T
 
T
L
 
K
A
 
G
S
 
H
V
 
I
T
 
S
Y
 
Y
V
 
Y
I
 
V
G
 
N
D
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
N
-
 
P
A
 
A
A
 
V
F
 
F
V
 
T
H
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
L
F
 
F
Q
 
V
P
 
A
D
 
G
F
x
C
G
 
G
T
x
K
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
F
P
 
F
G
 
E
G
 
G
D
 
T
A
 
A
H
 
E
Q
 
Q
L
 
M
W
 
Y
D
 
Q
S
 
S
I
 
L
Q
 
C
A
 
V
I
 
T
L
 
L
-
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
K
E
 
P
T
 
T
R
 
Q
L
 
V
F
 
Y
T
 
C
G
 
G
H
 
H
D
 
E
Y
 
Y
M
 
T
P
 
V
G
 
-
G
 
-
R
 
K
E
x
N
P
 
L
E
 
E
W
 
F
E
 
A
S
 
L
T
 
T
V
 
V
G
 
E
E
 
P
Q
 
N
K
 
N
-
 
G
Q
 
K
A
 
I
N
 
Q
K
 
Q
H
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
W
T
 
A
S
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
Y
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
-
R
 
R
N
 
Q
T
 
Q
R
 
R
D
 
Q
S
 
A
E
 
D
L
 
L
P
 
P
-
 
T
M
 
I
P
 
P
K
 
S
L
 
T
I
 
L
L
 
E
H
 
E
A
 
E
L
 
L
Q
 
E
V
 
T
N
 
N
T
 
P
R
 
F
G
 
-
G
 
M
R
|
R
L
 
V
P
 
D
E
 
K
P
 
P
E
 
E
A
 
I
N
 
Q
G
 
E
K
 
K
R
 
L
Y
 
G
L
 
C
K
 
K
I
 
S
P
 
P
L
 
I
D
 
D
A
 
T
L
 
M

Sites not aligning to the query:

7ev5A Crystal structure of bleg-1 b3 metallo-beta-lactamase (see paper)
26% identity, 70% coverage: 30:241/302 of query aligns to 15:208/209 of 7ev5A

query
sites
7ev5A
Y
 
Y
V
 
V
V
 
L
S
 
Y
D
 
N
P
 
-
E
 
D
T
 
D
K
 
K
Q
 
E
C
 
A
A
 
V
I
 
I
I
 
F
D
 
D
P
 
P
V
 
G
L
 
G
D
 
D
Y
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
A
D
 
E
E
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
T
F
 
W
I
 
L
R
 
K
E
 
R
Q
 
E
G
 
Q
F
 
L
E
 
T
V
 
P
Q
 
L
W
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
L
T
 
T
H
|
H
P
 
A
H
|
H
A
 
F
D
|
D
H
|
H
F
 
I
S
 
G
A
 
A
A
 
V
Q
 
D
Y
 
A
L
 
V
K
 
R
E
 
D
Q
 
T
T
 
F
G
 
S
A
 
I
P
 
P
T
 
V
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
Y
V
 
L
T
 
H
G
 
T
V
 
K
Q
 
E
E
 
R
L
 
H
W
 
W
-
 
L
-
 
E
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
L
K
 
N
G
 
G
I
 
S
Y
 
S
N
 
R
W
 
L
P
 
T
D
 
G
F
 
R
P
 
P
A
 
I
D
 
T
G
 
T
S
 
A
Q
 
K
-
 
P
W
 
A
D
 
D
H
 
H
L
 
L
F
 
L
R
 
T
A
 
N
G
 
E
D
 
K
E
 
S
F
 
L
R
 
T
V
 
I
G
 
G
N
 
T
L
 
F
Q
 
T
G
 
F
R
 
S
V
 
V
M
 
F
F
 
H
S
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
L
 
P
A
 
G
S
 
S
V
 
V
T
 
S
Y
 
Y
V
 
Y
I
 
Y
G
 
Q
D
 
K
A
 
E
A
 
A
-
 
V
-
 
L
F
 
F
V
 
S
H
 
G
D
|
D
T
 
V
I
 
L
F
 
F
Q
 
Q
P
 
Q
D
 
S
F
 
I
G
 
G
T
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
T
D
 
D
F
 
L
P
 
R
G
 
G
G
 
G
D
 
D
A
 
H
H
 
T
Q
 
L
L
 
L
W
 
L
D
 
A
S
 
S
I
 
I
-
 
H
Q
 
N
A
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
E
E
 
R
T
 
T
R
 
I
L
 
V
F
 
A
T
 
S
G
 
G
H
|
H
D
 
G
Y
 
P
M
 
L
P
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
-
S
 
T
T
 
T
V
 
I
G
 
G
E
 
Q
Q
 
E
K
 
M
Q
 
D
A
 
H
N
 
N
K
 
P
H
 
F
L
 
L
A
 
T

2zwrB Crystal structure of ttha1623 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
28% identity, 59% coverage: 62:240/302 of query aligns to 34:200/207 of 2zwrB

query
sites
2zwrB
D
 
E
E
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
F
 
L
I
 
F
R
 
Q
E
 
T
Q
 
T
G
 
G
F
 
L
E
 
I
V
 
P
Q
 
L
W
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
L
T
 
T
H
|
H
P
 
A
H
|
H
A
 
F
D
|
D
H
|
H
F
 
V
S
 
G
A
 
A
A
 
V
Q
 
A
Y
 
P
L
 
L
K
 
V
E
 
E
Q
 
A
T
 
L
G
 
D
A
 
L
P
 
P
T
 
V
A
 
Y
I
 
L
G
 
H
G
 
P
Y
 
L
V
 
D
T
 
L
G
 
P
V
 
L
Q
 
Y
E
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
R
L
 
A
W
 
W
K
 
G
G
 
L
I
 
A
Y
 
I
N
 
P
W
 
K
P
 
P
D
 
P
F
 
L
P
 
P
A
 
V
D
 
R
G
 
P
S
 
L
Q
 
E
W
 
-
D
 
-
H
 
-
L
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
E
E
 
G
F
 
M
R
 
R
V
 
L
G
 
F
N
 
G
L
 
F
Q
 
Q
G
 
-
R
 
-
V
 
V
M
 
L
F
 
H
S
 
L
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
L
 
P
A
 
G
S
 
H
V
 
V
T
 
A
Y
 
F
V
 
Y
I
 
D
G
 
P
D
 
E
A
 
G
A
 
A
-
 
Q
-
 
V
F
 
F
V
 
S
H
 
G
D
|
D
T
 
L
I
 
L
F
 
F
Q
 
R
P
 
G
D
 
S
F
 
V
G
 
G
T
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
Y
D
 
D
F
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
A
D
 
D
A
 
P
H
 
K
Q
 
A
L
 
L
W
 
F
D
 
A
S
 
S
I
 
L
Q
 
K
A
 
R
I
 
L
L
 
L
A
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
P
E
 
E
T
 
T
R
 
R
L
 
V
F
 
H
T
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
G
Y
 
-
M
 
-
P
 
P
G
 
G
G
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
-
S
 
T
T
 
T
V
 
L
G
 
G
E
 
L
Q
 
E
K
 
A
Q
 
R
A
 
T
N
 
N
K
 
P
H
 
F
L
 
L

2zziA Crystal structure of ttha1623 in a di-iron-bound form (see paper)
28% identity, 59% coverage: 62:240/302 of query aligns to 32:198/198 of 2zziA

query
sites
2zziA
D
 
E
E
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
F
 
L
I
 
F
R
 
Q
E
 
T
Q
 
T
G
 
G
F
 
L
E
 
I
V
 
P
Q
 
L
W
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
L
T
 
T
H
|
H
P
 
A
H
|
H
A
 
F
D
|
D
H
|
H
F
 
V
S
 
G
A
 
A
A
 
V
Q
 
A
Y
 
P
L
 
L
K
 
V
E
 
E
Q
 
A
T
 
L
G
 
D
A
 
L
P
 
P
T
 
V
A
 
Y
I
 
L
G
 
H
G
 
P
Y
 
L
V
 
D
T
 
L
G
 
P
V
 
L
Q
 
Y
E
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
R
L
 
A
W
 
W
K
 
G
G
 
L
I
 
A
Y
 
I
N
 
P
W
 
K
P
 
P
D
 
P
F
 
L
P
 
P
A
 
V
D
 
R
G
 
P
S
 
L
Q
 
E
W
 
-
D
 
-
H
 
-
L
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
E
E
 
G
F
 
M
R
 
R
V
 
L
G
 
F
N
 
G
L
 
F
Q
 
Q
G
 
-
R
 
-
V
 
V
M
 
L
F
 
H
S
 
L
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
L
 
P
A
 
G
S
 
H
V
 
V
T
 
A
Y
 
F
V
 
Y
I
 
D
G
 
P
D
 
E
A
 
G
A
 
A
-
 
Q
-
 
V
F
 
F
V
 
S
H
 
G
D
|
D
T
 
L
I
 
L
F
 
F
Q
 
R
P
 
G
D
 
S
F
 
V
G
 
G
T
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
Y
D
 
D
F
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
A
D
 
D
A
 
P
H
 
K
Q
 
A
L
 
L
W
 
F
D
 
A
S
 
S
I
 
L
Q
 
K
A
 
R
I
 
L
L
 
L
A
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
P
E
 
E
T
 
T
R
 
R
L
 
V
F
 
H
T
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
G
Y
 
-
M
 
-
P
 
P
G
 
G
G
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
-
S
 
T
T
 
T
V
 
L
G
 
G
E
 
L
Q
 
E
K
 
A
Q
 
R
A
 
T
N
 
N
K
 
P
H
 
F
L
 
L

7l0bA Crystal structure of hydroxyacyl glutathione hydrolase (glob) from staphylococcus aureus, apoenzyme (see paper)
26% identity, 65% coverage: 19:215/302 of query aligns to 10:185/202 of 7l0bA

query
sites
7l0bA
G
 
G
F
 
L
F
 
V
D
 
D
P
 
T
R
 
N
T
 
T
F
 
Y
S
 
F
V
 
I
Q
 
E
Y
 
-
V
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
N
T
 
D
K
 
K
Q
 
A
C
 
V
A
 
I
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
-
L
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
S
G
 
G
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
H
 
E
A
 
S
D
 
E
E
 
K
L
 
I
L
 
I
A
 
K
F
 
K
I
 
L
R
 
N
E
 
Q
Q
 
I
G
 
N
F
 
K
E
 
P
V
 
L
Q
 
K
W
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
L
T
 
T
H
|
H
P
 
A
H
|
H
A
 
F
D
|
D
H
|
H
F
 
I
S
 
G
A
 
A
A
 
V
Q
 
D
Y
 
D
L
 
I
K
 
V
E
 
D
Q
 
R
T
 
F
G
 
D
A
 
V
P
 
P
T
 
V
A
 
Y
I
 
M
G
 
-
G
 
-
Y
 
H
V
 
E
T
 
A
G
 
E
V
 
F
Q
 
D
E
 
F
L
 
L
W
 
K
K
 
D
G
 
P
I
 
V
Y
 
K
N
 
N
W
 
G
P
 
A
D
 
D
-
 
K
F
 
L
P
 
P
A
 
I
D
 
T
G
 
S
S
 
K
Q
 
V
W
 
T
D
 
P
H
 
E
L
 
K
F
 
L
R
 
N
A
 
E
G
 
G
D
 
S
E
 
T
F
 
-
R
 
E
V
 
I
G
 
E
N
 
G
L
 
F
Q
 
K
G
 
F
R
 
N
V
 
V
M
 
L
F
 
H
S
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
L
 
P
A
 
G
S
 
S
V
 
L
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
I
 
F
G
 
D
D
 
E
A
 
F
A
 
A
F
 
V
V
 
V
H
 
G
D
|
D
T
 
T
I
 
L
F
 
F
Q
 
N
P
 
N
D
 
-
F
 
-
G
 
G
T
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
D
 
D
F
 
L
P
 
Y
G
 
K
G
 
G
D
 
D
A
 
Y
H
 
E
Q
 
T
L
 
L
W
 
V
D
 
D
S
 
S
I
 
I
Q
 
Q
-
 
D
A
 
K
I
 
I
L
 
F
A
 
E
L
 
L
P
 
E
D
 
G
E
 
D
T
 
L
R
 
P
L
 
L
F
 
F
T
 
P
G
 
G
H
|
H

Query Sequence

>GFF3790 FitnessBrowser__Marino:GFF3790
MRTFQQSPAKHAGTPNVAGFFDPRTFSVQYVVSDPETKQCAIIDPVLDYDEKSGATATHH
ADELLAFIREQGFEVQWILDTHPHADHFSAAQYLKEQTGAPTAIGGYVTGVQELWKGIYN
WPDFPADGSQWDHLFRAGDEFRVGNLQGRVMFSPGHTLASVTYVIGDAAFVHDTIFQPDF
GTARADFPGGDAHQLWDSIQAILALPDETRLFTGHDYMPGGREPEWESTVGEQKQANKHL
AETSEAEYVELRNTRDSELPMPKLILHALQVNTRGGRLPEPEANGKRYLKIPLDALEGAA
WE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory