SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3809 FitnessBrowser__WCS417:GFF3809 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6rl5G The first crystal structure of the daba aminotransferase ectb in the ectoine biosynthesis pathway of the model organism chromohalobacter salexigens dsm 3034 (see paper)
37% identity, 94% coverage: 22:456/464 of query aligns to 1:422/422 of 6rl5G

query
sites
6rl5G
E
 
Q
T
 
T
P
 
Q
L
 
I
L
 
L
A
 
E
R
 
R
Q
 
M
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
E
 
E
S
 
S
N
 
E
A
 
V
R
 
R
S
 
T
Y
 
Y
P
x
S
R
 
R
R
 
S
I
 
F
P
 
P
L
 
T
A
 
V
L
 
F
K
 
T
R
 
E
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
A
Y
 
R
V
 
L
E
 
H
D
 
A
V
 
E
E
 
D
G
 
G
R
 
N
R
 
Q
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
C
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
N
L
 
Y
G
 
G
H
 
H
N
 
N
H
 
H
P
 
P
V
 
K
V
 
L
I
 
K
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
Q
 
A
Q
 
D
V
 
Y
L
 
I
A
 
A
D
 
S
E
 
D
L
 
G
P
 
I
L
 
V
H
 
H
T
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
M
T
 
W
T
 
S
P
 
A
V
 
A
K
 
K
D
 
R
Q
 
D
F
 
Y
V
 
L
Q
 
E
D
 
T
L
 
L
F
 
E
G
 
E
L
 
V
L
 
I
P
 
L
P
 
K
A
 
P
L
 
R
A
 
G
R
 
L
E
 
D
A
 
Y
K
 
K
I
 
V
Q
 
H
F
 
L
C
 
P
G
 
G
P
 
P
T
|
T
G
|
G
T
|
T
D
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
R
L
 
L
V
 
A
R
 
R
T
 
N
A
 
A
T
 
K
G
 
G
R
 
R
S
 
H
T
 
N
V
 
I
L
 
V
S
 
T
F
 
F
Q
 
T
G
 
N
G
 
G
Y
x
F
H
|
H
G
|
G
M
 
V
S
 
T
Q
 
M
G
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
A
L
 
T
M
 
T
G
 
G
S
 
N
L
 
R
G
 
K
P
 
F
K
 
R
K
 
E
P
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
G
L
 
I
L
 
P
G
 
T
N
 
Q
G
 
G
V
 
A
Q
 
S
F
 
F
L
 
M
P
 
P
Y
 
F
P
 
D
Y
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
C
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
G
L
 
Y
G
 
M
G
 
G
A
 
-
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
D
V
 
T
N
 
-
L
 
L
H
 
S
Y
 
Y
L
 
F
D
 
E
N
 
K
L
 
L
L
 
L
N
 
G
D
 
D
P
 
N
E
 
S
A
 
G
G
 
G
V
 
L
L
 
D
L
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
I
E
|
E
V
 
T
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
G
L
 
I
D
 
P
W
 
W
L
 
L
R
 
Q
G
 
R
L
 
L
R
 
E
R
 
K
I
 
I
T
 
C
E
 
R
Q
 
D
A
 
H
G
 
D
V
 
M
A
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
V
D
|
D
E
 
D
I
|
I
Q
|
Q
S
 
A
G
 
G
F
 
C
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
F
F
 
F
A
 
S
F
 
F
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
I
V
 
V
V
 
T
M
 
N
S
 
S
K
|
K
A
 
S
I
 
L
G
 
S
G
 
G
-
 
F
S
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
F
A
 
A
V
 
H
V
 
V
V
 
L
Y
 
M
R
 
R
D
 
P
W
 
E
L
 
L
D
 
D
T
 
I
W
 
W
L
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
Q
H
 
Y
A
 
N
G
|
G
T
|
T
F
|
F
R
 
R
G
 
G
N
 
F
Q
 
N
M
 
L
A
 
A
M
 
F
A
 
V
A
 
T
G
 
A
S
 
A
A
 
A
V
 
A
M
 
M
R
 
R
Y
 
H
L
 
F
K
 
W
D
 
S
H
 
D
D
 
D
L
 
T
A
 
F
G
 
E
H
 
R
A
 
D
A
 
V
A
 
Q
M
 
R
G
 
K
E
 
G
R
 
R
L
 
V
G
 
V
E
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
F
-
 
Q
H
 
K
L
 
L
R
 
A
I
 
S
L
 
F
Q
 
M
R
 
T
D
 
E
F
 
K
P
 
G
H
 
H
L
 
P
G
 
A
D
 
S
I
 
E
R
 
R
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
M
L
 
R
G
 
G
V
 
L
E
 
D
L
 
V
V
 
G
D
 
D
P
 
G
N
 
D
G
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
-
P
 
-
V
 
-
H
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
M
A
 
A
P
 
D
L
 
K
V
 
I
Q
 
T
R
 
A
E
 
Q
C
 
A
L
 
F
K
 
K
R
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
I
L
 
I
E
 
E
L
 
T
G
 
S
G
 
G
R
 
H
H
 
S
G
 
G
S
 
Q
V
 
V
V
 
I
R
 
K
F
 
C
L
 
L
P
 
C
P
 
P
L
 
L
V
 
T
I
 
I
T
 
T
A
 
D
V
 
E
E
 
D
V
 
L
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
L
-
 
E
D
 
Q
L
 
S
V
 
V
A
 
K
D
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
R
 
Q
A
 
A

1wkhA Acetylornithine aminotransferase from thermus thermophilus hb8
38% identity, 89% coverage: 45:458/464 of query aligns to 21:387/387 of 1wkhA

query
sites
1wkhA
L
 
L
A
 
L
L
 
I
K
 
V
R
 
R
A
 
G
K
 
Q
G
 
G
L
 
A
Y
 
R
V
 
V
E
 
W
D
 
D
V
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
N
R
 
E
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
C
 
C
L
 
V
A
 
G
G
 
G
A
x
Y
G
 
G
T
 
V
L
 
A
A
 
N
L
 
L
G
 
G
H
 
H
N
 
G
H
 
N
P
 
P
V
 
E
V
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
V
Q
 
K
Q
 
R
V
 
-
L
 
Q
A
 
A
D
 
E
E
 
T
L
 
L
P
 
M
L
 
A
H
 
M
T
 
P
L
 
Q
D
 
T
L
 
L
T
 
P
T
 
T
P
 
P
V
 
M
K
 
R
D
 
G
Q
 
E
F
 
F
V
 
Y
Q
 
R
D
 
T
L
 
L
F
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
L
P
 
P
P
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
N
R
 
R
E
 
-
A
 
-
K
 
-
I
 
-
Q
 
V
F
 
F
C
 
P
G
 
V
P
 
N
T
x
S
G
|
G
T
|
T
D
 
E
A
 
A
V
x
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
F
V
 
A
R
 
R
T
 
A
A
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
K
T
 
K
V
 
F
L
 
V
S
 
A
F
 
A
Q
 
M
G
 
R
G
 
G
Y
x
F
H
x
S
G
|
G
M
 
R
S
 
T
Q
 
M
G
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
S
L
 
V
M
 
T
G
 
W
S
 
E
L
 
P
G
 
K
P
 
Y
K
 
R
K
 
E
P
 
P
L
 
F
G
 
L
A
 
P
L
 
L
L
 
V
G
 
-
N
 
E
G
 
P
V
 
V
Q
 
E
F
 
F
L
 
I
P
 
P
Y
 
Y
P
 
N
Y
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
C
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
V
 
-
N
 
D
L
 
V
H
 
E
Y
 
A
L
 
L
D
 
K
N
 
R
L
 
A
L
 
V
N
 
D
D
 
E
P
 
E
E
 
T
A
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
|
E
V
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
R
P
 
P
A
 
A
D
 
T
L
 
P
D
 
E
W
 
F
L
 
L
R
 
R
G
 
A
L
 
A
R
 
R
R
 
E
I
 
I
T
 
T
E
 
Q
Q
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
A
A
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
|
D
E
 
E
I
|
I
Q
|
Q
S
 
T
G
 
G
F
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
R
F
 
F
A
 
A
F
 
F
E
 
E
H
 
H
A
 
F
G
 
G
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
T
M
 
L
S
 
A
K
|
K
A
 
A
I
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
G
V
 
V
V
 
A
V
 
V
Y
 
M
R
 
R
D
 
E
W
 
E
L
 
V
D
 
A
T
 
R
W
 
S
L
 
M
P
 
P
-
 
K
G
 
G
A
 
G
H
 
H
A
 
G
G
x
T
T
|
T
F
 
F
R
 
G
G
 
G
N
 
N
Q
 
P
M
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
V
A
 
A
V
 
A
M
 
I
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
K
 
E
D
 
R
H
 
T
D
 
R
L
 
L
A
 
W
G
 
E
H
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
E
M
 
L
G
 
G
E
 
P
R
 
W
L
 
F
G
 
M
E
 
E
H
 
K
L
 
L
R
 
R
I
 
A
L
 
I
Q
 
P
R
 
S
D
 
-
F
 
-
P
 
P
H
 
K
L
 
I
G
 
R
D
 
E
I
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
M
G
 
G
L
 
L
M
 
M
L
 
V
G
 
G
V
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
K
D
 
E
P
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
-
P
 
-
V
 
-
H
 
-
R
 
-
Q
 
K
L
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
V
 
I
Q
 
A
R
 
R
-
 
L
E
 
E
C
 
K
L
 
E
K
 
H
R
 
R
G
 
V
L
 
L
I
 
A
L
 
L
E
 
Q
L
 
A
G
 
G
G
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
P
S
 
T
V
 
V
V
 
I
R
|
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
I
T
 
E
A
 
K
V
 
E
E
 
D
V
 
L
D
 
E
L
 
R
V
 
V
A
 
V
D
 
E
I
 
A
F
 
V
G
 
R
R
 
A
A
 
V
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1wkgA Acetylornithine aminotransferase from thermus thermophilus hb8
38% identity, 89% coverage: 45:458/464 of query aligns to 21:387/387 of 1wkgA

query
sites
1wkgA
L
 
L
A
 
L
L
 
I
K
 
V
R
 
R
A
 
G
K
 
Q
G
 
G
L
 
A
Y
 
R
V
 
V
E
 
W
D
 
D
V
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
N
R
 
E
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
C
 
C
L
 
V
A
 
G
G
 
G
A
x
Y
G
 
G
T
 
V
L
 
A
A
 
N
L
 
L
G
 
G
H
 
H
N
 
G
H
 
N
P
 
P
V
 
E
V
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
V
Q
 
K
Q
 
R
V
 
-
L
 
Q
A
 
A
D
 
E
E
 
T
L
 
L
P
 
M
L
 
A
H
 
M
T
 
P
L
 
Q
D
 
T
L
 
L
T
 
P
T
 
T
P
 
P
V
 
M
K
 
R
D
 
G
Q
 
E
F
 
F
V
 
Y
Q
 
R
D
 
T
L
 
L
F
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
L
P
 
P
P
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
N
R
 
R
E
 
-
A
 
-
K
 
-
I
 
-
Q
 
V
F
 
F
C
 
P
G
 
V
P
 
N
T
x
S
G
|
G
T
|
T
D
 
E
A
 
A
V
x
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
F
V
 
A
R
 
R
T
 
A
A
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
K
T
 
K
V
 
F
L
 
V
S
 
A
F
 
A
Q
 
M
G
 
R
G
 
G
Y
x
F
H
x
S
G
|
G
M
x
R
S
 
T
Q
 
M
G
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
S
L
 
V
M
 
T
G
 
W
S
 
E
L
 
P
G
 
K
P
 
Y
K
 
R
K
 
E
P
 
P
L
 
F
G
 
L
A
 
P
L
 
L
L
 
V
G
 
-
N
 
E
G
 
P
V
 
V
Q
 
E
F
 
F
L
 
I
P
 
P
Y
 
Y
P
 
N
Y
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
C
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
V
 
-
N
 
D
L
 
V
H
 
E
Y
 
A
L
 
L
D
 
K
N
 
R
L
 
A
L
 
V
N
 
D
D
 
E
P
 
E
E
 
T
A
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
|
E
V
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
R
P
 
P
A
 
A
D
 
T
L
 
P
D
 
E
W
 
F
L
 
L
R
 
R
G
 
A
L
 
A
R
 
R
R
 
E
I
 
I
T
 
T
E
 
Q
Q
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
A
A
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
|
D
E
 
E
I
|
I
Q
|
Q
S
 
T
G
 
G
F
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
R
F
 
F
A
 
A
F
 
F
E
 
E
H
 
H
A
 
F
G
 
G
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
T
M
 
L
S
 
A
K
|
K
A
 
A
I
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
G
V
 
V
V
 
A
V
 
V
Y
 
M
R
 
R
D
 
E
W
 
E
L
 
V
D
 
A
T
 
R
W
 
S
L
 
M
P
 
P
-
 
K
G
 
G
A
 
G
H
 
H
A
x
G
G
x
T
T
|
T
F
 
F
R
 
G
G
 
G
N
 
N
Q
 
P
M
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
V
A
 
A
V
 
A
M
 
I
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
K
 
E
D
 
R
H
 
T
D
 
R
L
 
L
A
 
W
G
 
E
H
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
E
M
 
L
G
 
G
E
 
P
R
 
W
L
 
F
G
 
M
E
 
E
H
 
K
L
 
L
R
 
R
I
 
A
L
 
I
Q
 
P
R
 
S
D
 
-
F
 
-
P
 
P
H
 
K
L
 
I
G
 
R
D
 
E
I
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
M
G
 
G
L
 
L
M
 
M
L
 
V
G
 
G
V
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
K
D
 
E
P
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
-
P
 
-
V
 
-
H
 
-
R
 
-
Q
 
K
L
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
V
 
I
Q
 
A
R
 
R
-
 
L
E
 
E
C
 
K
L
 
E
K
 
H
R
 
R
G
 
V
L
 
L
I
 
A
L
 
L
E
 
Q
L
 
A
G
 
G
G
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
P
S
 
T
V
 
V
V
 
I
R
|
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
I
T
 
E
A
 
K
V
 
E
E
 
D
V
 
L
D
 
E
L
 
R
V
 
V
A
 
V
D
 
E
I
 
A
F
 
V
G
 
R
R
 
A
A
 
V
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1vefA Acetylornithine aminotransferase from thermus thermophilus hb8
38% identity, 89% coverage: 45:458/464 of query aligns to 21:387/387 of 1vefA

query
sites
1vefA
L
 
L
A
 
L
L
 
I
K
 
V
R
 
R
A
 
G
K
 
Q
G
 
G
L
 
A
Y
 
R
V
 
V
E
 
W
D
 
D
V
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
N
R
 
E
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
C
 
C
L
 
V
A
 
G
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
T
 
V
L
 
A
A
 
N
L
 
L
G
 
G
H
 
H
N
 
G
H
 
N
P
 
P
V
 
E
V
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
V
Q
 
K
Q
 
R
V
 
-
L
 
Q
A
 
A
D
 
E
E
 
T
L
 
L
P
 
M
L
 
A
H
 
M
T
 
P
L
 
Q
D
 
T
L
 
L
T
 
P
T
 
T
P
 
P
V
 
M
K
 
R
D
 
G
Q
 
E
F
 
F
V
 
Y
Q
 
R
D
 
T
L
 
L
F
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
L
P
 
P
P
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
N
R
 
R
E
 
-
A
 
-
K
 
-
I
 
-
Q
 
V
F
 
F
C
 
P
G
 
V
P
 
N
T
x
S
G
|
G
T
|
T
D
 
E
A
 
A
V
x
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
F
V
 
A
R
 
R
T
 
A
A
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
K
T
 
K
V
 
F
L
 
V
S
 
A
F
 
A
Q
 
M
G
 
R
G
 
G
Y
x
F
H
x
S
G
|
G
M
 
R
S
 
T
Q
 
M
G
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
S
L
 
V
M
 
T
G
 
W
S
 
E
L
 
P
G
 
K
P
 
Y
K
 
R
K
 
E
P
 
P
L
 
F
G
 
L
A
 
P
L
 
L
L
 
V
G
 
-
N
 
E
G
 
P
V
 
V
Q
 
E
F
 
F
L
 
I
P
 
P
Y
 
Y
P
 
N
Y
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
C
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
V
 
-
N
 
D
L
 
V
H
 
E
Y
 
A
L
 
L
D
 
K
N
 
R
L
 
A
L
 
V
N
 
D
D
 
E
P
 
E
E
 
T
A
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
|
E
V
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
R
P
 
P
A
 
A
D
 
T
L
 
P
D
 
E
W
 
F
L
 
L
R
 
R
G
 
A
L
 
A
R
 
R
R
 
E
I
 
I
T
 
T
E
 
Q
Q
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
A
A
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
|
D
E
 
E
I
|
I
Q
|
Q
S
 
T
G
 
G
F
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
R
F
 
F
A
 
A
F
 
F
E
 
E
H
 
H
A
 
F
G
 
G
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
T
M
 
L
S
 
A
K
|
K
A
 
A
I
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
G
V
 
V
V
 
A
V
 
V
Y
 
M
R
 
R
D
 
E
W
 
E
L
 
V
D
 
A
T
 
R
W
 
S
L
 
M
P
 
P
-
 
K
G
 
G
A
 
G
H
 
H
A
 
G
G
x
T
T
|
T
F
 
F
R
 
G
G
 
G
N
 
N
Q
 
P
M
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
V
A
 
A
V
 
A
M
 
I
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
K
 
E
D
 
R
H
 
T
D
 
R
L
 
L
A
 
W
G
 
E
H
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
E
M
 
L
G
 
G
E
 
P
R
 
W
L
 
F
G
 
M
E
 
E
H
 
K
L
 
L
R
 
R
I
 
A
L
 
I
Q
 
P
R
 
S
D
 
-
F
 
-
P
 
P
H
 
K
L
 
I
G
 
R
D
 
E
I
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
M
G
 
G
L
 
L
M
 
M
L
 
V
G
 
G
V
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
K
D
 
E
P
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
-
P
 
-
V
 
-
H
 
-
R
 
-
Q
 
K
L
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
V
 
I
Q
 
A
R
 
R
-
 
L
E
 
E
C
 
K
L
 
E
K
 
H
R
 
R
G
 
V
L
 
L
I
 
A
L
 
L
E
 
Q
L
 
A
G
 
G
G
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
P
S
 
T
V
 
V
V
 
I
R
|
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
I
T
 
E
A
 
K
V
 
E
E
 
D
V
 
L
D
 
E
L
 
R
V
 
V
A
 
V
D
 
E
I
 
A
F
 
V
G
 
R
R
 
A
A
 
V
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q5SHH5 [LysW]-aminoadipate semialdehyde transaminase; EC 2.6.1.118 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8)
38% identity, 89% coverage: 45:458/464 of query aligns to 29:395/395 of Q5SHH5

query
sites
Q5SHH5
L
 
L
A
 
L
L
 
I
K
 
V
R
 
R
A
 
G
K
 
Q
G
 
G
L
 
A
Y
 
R
V
 
V
E
 
W
D
 
D
V
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
N
R
 
E
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
C
 
C
L
 
V
A
 
G
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
T
 
V
L
 
A
A
 
N
L
 
L
G
 
G
H
 
H
N
 
G
H
 
N
P
 
P
V
 
E
V
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
V
Q
 
K
Q
 
R
V
 
-
L
 
Q
A
 
A
D
 
E
E
 
T
L
 
L
P
 
M
L
 
A
H
 
M
T
 
P
L
 
Q
D
 
T
L
 
L
T
 
P
T
 
T
P
 
P
V
 
M
K
 
R
D
 
G
Q
 
E
F
 
F
V
 
Y
Q
 
R
D
 
T
L
 
L
F
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
L
P
 
P
P
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
N
R
 
R
E
 
-
A
 
-
K
 
-
I
 
-
Q
 
V
F
 
F
C
 
P
G
 
V
P
 
N
T
 
S
G
|
G
T
|
T
D
 
E
A
 
A
V
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
F
V
 
A
R
 
R
T
 
A
A
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
K
T
 
K
V
 
F
L
 
V
S
 
A
F
 
A
Q
 
M
G
 
R
G
 
G
Y
 
F
H
 
S
G
 
G
M
 
R
S
 
T
Q
 
M
G
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
S
L
 
V
M
 
T
G
 
W
S
 
E
L
 
P
G
 
K
P
 
Y
K
 
R
K
 
E
P
 
P
L
 
F
G
 
L
A
 
P
L
 
L
L
 
V
G
 
-
N
 
E
G
 
P
V
 
V
Q
 
E
F
 
F
L
 
I
P
 
P
Y
 
Y
P
 
N
Y
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
C
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
V
 
-
N
 
D
L
 
V
H
 
E
Y
 
A
L
 
L
D
 
K
N
 
R
L
 
A
L
 
V
N
 
D
D
 
E
P
 
E
E
 
T
A
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
 
E
V
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
R
P
 
P
A
 
A
D
 
T
L
 
P
D
 
E
W
 
F
L
 
L
R
 
R
G
 
A
L
 
A
R
 
R
R
 
E
I
 
I
T
 
T
E
 
Q
Q
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
A
A
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
S
 
T
G
 
G
F
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
R
F
 
F
A
 
A
F
 
F
E
 
E
H
 
H
A
 
F
G
 
G
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
T
M
 
L
S
 
A
K
|
K
A
 
A
I
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
G
V
 
A
V
 
A
V
 
V
Y
 
M
R
 
R
D
 
E
W
 
E
L
 
V
D
 
A
T
 
R
W
 
S
L
 
M
P
 
P
-
 
K
G
 
G
A
 
G
H
 
H
A
 
G
G
 
T
T
|
T
F
 
F
R
 
G
G
 
G
N
 
N
Q
 
P
M
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
V
A
 
A
V
 
A
M
 
I
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
K
 
E
D
 
R
H
 
T
D
 
R
L
 
L
A
 
W
G
 
E
H
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
E
M
 
L
G
 
G
E
 
P
R
 
W
L
 
F
G
 
M
E
 
E
H
 
K
L
 
L
R
 
R
I
 
A
L
 
I
Q
 
P
R
 
S
D
 
-
F
 
-
P
 
P
H
 
K
L
 
I
G
 
R
D
 
E
I
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
M
G
 
G
L
 
L
M
 
M
L
 
V
G
 
G
V
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
K
D
 
E
P
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
-
P
 
-
V
 
-
H
 
-
R
 
-
Q
 
K
L
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
V
 
I
Q
 
A
R
 
R
-
 
L
E
 
E
C
 
K
L
 
E
K
 
H
R
 
R
G
 
V
L
 
L
I
 
A
L
 
L
E
 
Q
L
 
A
G
 
G
G
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
P
S
 
T
V
 
V
V
 
I
R
 
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
I
T
 
E
A
 
K
V
 
E
E
 
D
V
 
L
D
 
E
L
 
R
V
 
V
A
 
V
D
 
E
I
 
A
F
 
V
G
 
R
R
 
A
A
 
V
L
 
L
A
 
A

7vo1A Structure of aminotransferase-substrate complex (see paper)
33% identity, 90% coverage: 40:457/464 of query aligns to 31:440/452 of 7vo1A

query
sites
7vo1A
P
 
P
R
 
N
R
 
E
I
 
Y
P
 
F
L
 
L
A
 
V
L
 
I
K
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
E
G
 
G
L
 
V
Y
 
Y
V
 
W
E
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
D
G
 
G
R
 
N
R
 
V
F
 
L
I
 
L
D
 
D
C
 
F
L
 
S
A
 
S
G
 
G
A
x
I
G
 
G
T
 
V
L
 
M
A
 
N
L
 
V
G
 
G
H
 
L
N
 
R
H
 
N
P
 
P
V
 
K
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
Q
 
K
Q
 
K
V
 
Q
L
 
L
A
 
-
D
 
-
E
 
D
L
 
L
P
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
A
-
 
A
-
 
G
L
 
T
D
 
D
L
 
Y
T
 
Y
T
 
N
P
 
P
V
 
Y
K
 
Q
D
 
V
Q
 
E
F
 
L
V
 
A
Q
 
K
D
 
K
L
 
L
F
 
V
G
 
E
L
 
I
L
 
A
P
 
P
P
 
G
A
 
D
L
 
I
A
 
E
R
 
R
E
 
K
A
 
V
K
 
-
I
 
-
Q
 
-
F
 
F
C
 
L
G
 
S
P
 
N
T
x
S
G
|
G
T
|
T
D
 
E
A
 
A
V
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
I
V
 
A
R
 
K
T
 
W
A
 
S
T
 
T
G
 
N
R
 
R
S
 
K
T
 
M
V
 
F
L
 
I
S
 
A
F
 
F
Q
 
I
G
 
G
G
 
A
Y
x
F
H
|
H
G
|
G
M
x
R
S
 
T
Q
 
H
G
 
G
A
 
T
L
 
M
S
 
S
L
 
L
M
 
T
G
 
A
S
 
S
L
 
K
G
 
P
P
 
V
K
 
Q
K
 
R
P
 
S
L
 
R
G
 
M
A
 
F
L
 
P
L
 
T
G
 
M
N
 
P
G
 
G
V
 
V
Q
 
V
F
 
H
L
 
V
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
N
D
 
P
Y
 
Y
R
 
R
C
 
N
P
 
P
F
 
W
G
 
G
L
 
I
G
 
D
G
 
G
A
 
Y
E
 
E
G
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
L
V
 
I
R
 
N
V
 
R
N
 
V
L
 
I
H
 
D
Y
 
Y
L
 
I
D
 
E
N
 
E
L
 
Y
L
 
L
N
 
F
D
 
E
P
 
H
E
 
Y
A
 
V
G
 
P
V
 
A
L
 
E
L
 
E
P
 
V
A
 
A
A
 
G
V
 
I
I
 
F
V
 
F
E
|
E
V
 
P
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
I
 
V
P
 
V
A
 
P
D
 
P
L
 
K
D
 
N
W
 
F
L
 
F
R
 
K
G
 
E
L
 
L
R
 
K
R
 
K
I
 
L
T
 
A
E
 
D
Q
 
K
A
 
H
G
 
G
V
 
I
A
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
D
D
|
D
E
 
E
I
x
V
Q
|
Q
S
 
M
G
 
G
F
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
R
L
 
M
F
 
W
A
 
A
F
 
I
E
 
E
H
 
H
A
 
F
G
 
D
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
I
V
 
V
V
 
T
M
 
V
S
 
A
K
|
K
A
 
A
I
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
G
L
 
I
P
 
P
L
 
I
A
 
G
V
 
A
V
 
T
V
 
I
Y
 
F
R
 
R
D
 
A
W
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
F
W
 
G
L
 
V
P
 
S
G
 
G
A
 
V
H
 
H
A
x
S
G
x
N
T
|
T
F
|
F
R
 
G
G
 
G
N
 
N
Q
 
T
M
 
V
A
 
A
M
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
A
S
 
L
A
 
A
V
 
V
M
 
I
R
 
E
Y
 
E
L
 
L
K
 
Q
D
 
N
H
 
-
D
 
G
L
 
L
A
 
I
G
 
E
H
 
N
A
 
A
A
 
Q
A
 
K
M
 
L
G
 
E
E
 
P
R
 
L
L
 
F
G
 
R
E
 
E
H
 
R
L
 
L
R
 
E
I
 
E
L
 
M
Q
 
K
R
 
E
D
 
K
F
 
Y
P
 
E
H
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
I
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
L
 
W
G
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
F
V
 
V
D
 
K
P
 
D
N
 
R
G
 
K
T
 
T
L
 
K
D
 
E
V
 
Y
Q
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
-
P
 
-
V
 
A
H
 
T
R
 
K
Q
 
E
L
 
R
A
 
G
P
 
E
L
 
I
V
 
V
Q
 
V
R
 
-
E
 
E
C
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
A
L
 
L
E
 
L
L
 
G
G
 
C
G
 
G
R
 
K
H
 
-
G
 
-
S
 
S
V
 
A
V
 
I
R
|
R
F
 
L
L
 
I
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
E
V
 
E
E
 
E
V
 
A
D
 
K
L
 
M
V
 
G
A
 
L
D
 
D
I
 
I
F
 
F
G
 
E
R
 
E
A
 
A
L
 
I

7vntA Structure of aminotransferase-substrate complex (see paper)
33% identity, 90% coverage: 40:457/464 of query aligns to 31:440/452 of 7vntA

query
sites
7vntA
P
 
P
R
 
N
R
 
E
I
 
Y
P
 
F
L
 
L
A
 
V
L
 
I
K
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
E
G
 
G
L
 
V
Y
 
Y
V
 
W
E
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
D
G
 
G
R
 
N
R
 
V
F
 
L
I
 
L
D
 
D
C
 
F
L
 
S
A
 
S
G
 
G
A
x
I
G
 
G
T
 
V
L
 
M
A
 
N
L
 
V
G
 
G
H
 
L
N
 
R
H
 
N
P
 
P
V
 
K
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
Q
 
K
Q
 
K
V
 
Q
L
 
L
A
 
-
D
 
-
E
 
D
L
 
L
P
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
A
-
 
A
-
 
G
L
 
T
D
 
D
L
 
Y
T
 
Y
T
 
N
P
 
P
V
 
Y
K
 
Q
D
 
V
Q
 
E
F
 
L
V
 
A
Q
 
K
D
 
K
L
 
L
F
 
V
G
 
E
L
 
I
L
 
A
P
 
P
P
 
G
A
 
D
L
 
I
A
 
E
R
 
R
E
 
K
A
 
V
K
 
-
I
 
-
Q
 
-
F
 
F
C
 
L
G
 
S
P
 
N
T
x
S
G
|
G
T
|
T
D
 
E
A
 
A
V
x
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
I
V
 
A
R
 
K
T
 
W
A
 
S
T
 
T
G
 
N
R
 
R
S
 
K
T
 
M
V
 
F
L
 
I
S
 
A
F
 
F
Q
 
I
G
 
G
G
 
A
Y
x
F
H
|
H
G
|
G
M
x
R
S
 
T
Q
 
H
G
 
G
A
 
T
L
 
M
S
 
S
L
 
L
M
 
T
G
 
A
S
 
S
L
 
K
G
 
P
P
 
V
K
 
Q
K
 
R
P
 
S
L
 
R
G
 
M
A
 
F
L
 
P
L
 
T
G
 
M
N
 
P
G
 
G
V
 
V
Q
 
V
F
 
H
L
 
V
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
N
D
 
P
Y
 
Y
R
 
R
C
 
N
P
 
P
F
 
W
G
 
G
L
 
I
G
 
D
G
 
G
A
 
Y
E
 
E
G
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
L
V
 
I
R
 
N
V
 
R
N
 
V
L
 
I
H
 
D
Y
 
Y
L
 
I
D
 
E
N
 
E
L
 
Y
L
 
L
N
 
F
D
 
E
P
 
H
E
 
Y
A
 
V
G
 
P
V
 
A
L
 
E
L
 
E
P
 
V
A
 
A
A
 
G
V
 
I
I
 
F
V
 
F
E
|
E
V
 
P
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
I
 
V
P
 
V
A
 
P
D
 
P
L
 
K
D
 
N
W
 
F
L
 
F
R
 
K
G
 
E
L
 
L
R
 
K
R
 
K
I
 
L
T
 
A
E
 
D
Q
 
K
A
 
H
G
 
G
V
 
I
A
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
D
D
|
D
E
 
E
I
x
V
Q
|
Q
S
 
M
G
 
G
F
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
R
L
 
M
F
 
W
A
 
A
F
 
I
E
 
E
H
 
H
A
 
F
G
 
D
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
I
V
 
V
V
 
T
M
 
V
S
 
A
K
|
K
A
 
A
I
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
G
L
 
I
P
 
P
L
 
I
A
 
G
V
 
A
V
 
T
V
 
I
Y
 
F
R
 
R
D
 
A
W
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
F
W
 
G
L
 
V
P
 
S
G
 
G
A
 
V
H
 
H
A
 
S
G
x
N
T
|
T
F
 
F
R
 
G
G
 
G
N
 
N
Q
 
T
M
 
V
A
 
A
M
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
A
S
 
L
A
 
A
V
 
V
M
 
I
R
 
E
Y
 
E
L
 
L
K
 
Q
D
 
N
H
 
-
D
 
G
L
 
L
A
 
I
G
 
E
H
 
N
A
 
A
A
 
Q
A
 
K
M
 
L
G
 
E
E
 
P
R
 
L
L
 
F
G
 
R
E
 
E
H
 
R
L
 
L
R
 
E
I
 
E
L
 
M
Q
 
K
R
 
E
D
 
K
F
 
Y
P
 
E
H
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
I
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
L
 
W
G
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
F
V
 
V
D
 
K
P
 
D
N
 
R
G
 
K
T
 
T
L
 
K
D
 
E
V
 
Y
Q
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
-
P
 
-
V
 
A
H
 
T
R
 
K
Q
 
E
L
 
R
A
 
G
P
 
E
L
 
I
V
 
V
Q
 
V
R
 
-
E
 
E
C
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
A
L
 
L
E
 
L
L
 
G
G
 
C
G
 
G
R
 
K
H
 
-
G
 
-
S
 
S
V
 
A
V
 
I
R
 
R
F
 
L
L
 
I
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
E
V
 
E
E
 
E
V
 
A
D
 
K
L
 
M
V
 
G
A
 
L
D
 
D
I
 
I
F
 
F
G
 
E
R
 
E
A
 
A
L
 
I

Sites not aligning to the query:

7vnoA Structure of aminotransferase (see paper)
33% identity, 90% coverage: 40:457/464 of query aligns to 31:440/452 of 7vnoA

query
sites
7vnoA
P
 
P
R
 
N
R
 
E
I
 
Y
P
 
F
L
 
L
A
 
V
L
 
I
K
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
E
G
 
G
L
 
V
Y
 
Y
V
 
W
E
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
D
G
 
G
R
 
N
R
 
V
F
 
L
I
 
L
D
 
D
C
 
F
L
 
S
A
 
S
G
 
G
A
 
I
G
 
G
T
 
V
L
 
M
A
 
N
L
 
V
G
 
G
H
 
L
N
 
R
H
 
N
P
 
P
V
 
K
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
Q
 
K
Q
 
K
V
 
Q
L
 
L
A
 
-
D
 
-
E
 
D
L
 
L
P
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
A
-
 
A
-
 
G
L
 
T
D
 
D
L
 
Y
T
 
Y
T
 
N
P
 
P
V
 
Y
K
 
Q
D
 
V
Q
 
E
F
 
L
V
 
A
Q
 
K
D
 
K
L
 
L
F
 
V
G
 
E
L
 
I
L
 
A
P
 
P
P
 
G
A
 
D
L
 
I
A
 
E
R
 
R
E
 
K
A
 
V
K
 
-
I
 
-
Q
 
-
F
 
F
C
 
L
G
 
S
P
 
N
T
x
S
G
|
G
T
|
T
D
 
E
A
 
A
V
x
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
I
V
 
A
R
 
K
T
 
W
A
 
S
T
 
T
G
 
N
R
 
R
S
 
K
T
 
M
V
 
F
L
 
I
S
 
A
F
 
F
Q
 
I
G
 
G
G
 
A
Y
x
F
H
|
H
G
|
G
M
 
R
S
 
T
Q
 
H
G
 
G
A
 
T
L
 
M
S
 
S
L
 
L
M
 
T
G
 
A
S
 
S
L
 
K
G
 
P
P
 
V
K
 
Q
K
 
R
P
 
S
L
 
R
G
 
M
A
 
F
L
 
P
L
 
T
G
 
M
N
 
P
G
 
G
V
 
V
Q
 
V
F
 
H
L
 
V
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
N
D
 
P
Y
 
Y
R
 
R
C
 
N
P
 
P
F
 
W
G
 
G
L
 
I
G
 
D
G
 
G
A
 
Y
E
 
E
G
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
L
V
 
I
R
 
N
V
 
R
N
 
V
L
 
I
H
 
D
Y
 
Y
L
 
I
D
 
E
N
 
E
L
 
Y
L
 
L
N
 
F
D
 
E
P
 
H
E
 
Y
A
 
V
G
 
P
V
 
A
L
 
E
L
 
E
P
 
V
A
 
A
A
 
G
V
 
I
I
 
F
V
 
F
E
|
E
V
 
P
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
I
 
V
P
 
V
A
 
P
D
 
P
L
 
K
D
 
N
W
 
F
L
 
F
R
 
K
G
 
E
L
 
L
R
 
K
R
 
K
I
 
L
T
 
A
E
 
D
Q
 
K
A
 
H
G
 
G
V
 
I
A
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
D
D
|
D
E
 
E
I
x
V
Q
|
Q
S
 
M
G
 
G
F
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
R
L
 
M
F
 
W
A
 
A
F
 
I
E
 
E
H
 
H
A
 
F
G
 
D
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
I
V
 
V
V
 
T
M
 
V
S
 
A
K
|
K
A
 
A
I
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
G
L
 
I
P
 
P
L
 
I
A
 
G
V
 
A
V
 
T
V
 
I
Y
 
F
R
 
R
D
 
A
W
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
F
W
 
G
L
 
V
P
 
S
G
 
G
A
 
V
H
 
H
A
 
S
G
x
N
T
|
T
F
|
F
R
 
G
G
 
G
N
 
N
Q
 
T
M
 
V
A
 
A
M
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
A
S
 
L
A
 
A
V
 
V
M
 
I
R
 
E
Y
 
E
L
 
L
K
 
Q
D
 
N
H
 
-
D
 
G
L
 
L
A
 
I
G
 
E
H
 
N
A
 
A
A
 
Q
A
 
K
M
 
L
G
 
E
E
 
P
R
 
L
L
 
F
G
 
R
E
 
E
H
 
R
L
 
L
R
 
E
I
 
E
L
 
M
Q
 
K
R
 
E
D
 
K
F
 
Y
P
 
E
H
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
I
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
L
 
W
G
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
F
V
 
V
D
 
K
P
 
D
N
 
R
G
 
K
T
 
T
L
 
K
D
 
E
V
 
Y
Q
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
-
P
 
-
V
 
A
H
 
T
R
 
K
Q
 
E
L
 
R
A
 
G
P
 
E
L
 
I
V
 
V
Q
 
V
R
 
-
E
 
E
C
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
A
L
 
L
E
 
L
L
 
G
G
 
C
G
 
G
R
 
K
H
 
-
G
 
-
S
 
S
V
 
A
V
 
I
R
 
R
F
 
L
L
 
I
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
E
V
 
E
E
 
E
V
 
A
D
 
K
L
 
M
V
 
G
A
 
L
D
 
D
I
 
I
F
 
F
G
 
E
R
 
E
A
 
A
L
 
I

P42588 Putrescine aminotransferase; PAT; PATase; Cadaverine transaminase; Diamine transaminase; Putrescine transaminase; Putrescine--2-oxoglutaric acid transaminase; Putrescine:2-OG aminotransferase; EC 2.6.1.82; EC 2.6.1.29 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
32% identity, 88% coverage: 57:464/464 of query aligns to 78:456/459 of P42588

query
sites
P42588
D
 
D
V
 
T
E
 
Q
G
 
G
R
 
Q
R
 
E
F
 
F
I
 
I
D
 
D
C
 
C
L
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
F
G
 
G
T
 
I
L
 
F
A
 
N
L
 
V
G
 
G
H
 
H
N
 
R
H
 
N
P
 
P
V
 
V
V
 
V
I
 
V
E
 
S
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
Q
 
N
V
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
K
E
 
Q
L
 
-
P
 
P
L
 
L
H
 
H
T
 
S
L
 
Q
D
 
E
L
 
L
T
 
L
T
 
D
P
 
P
V
 
L
K
 
R
D
 
A
Q
 
M
F
 
L
V
 
A
Q
 
K
D
 
T
L
 
L
F
 
A
G
 
A
L
 
L
L
 
T
P
 
P
P
 
G
A
 
K
L
 
L
A
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
K
I
 
Y
Q
 
S
F
 
F
C
 
F
G
 
C
P
 
N
T
 
S
G
|
G
T
|
T
D
 
E
A
 
S
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
L
V
 
A
R
 
K
-
 
A
-
 
Y
-
 
Q
T
 
S
A
 
P
T
 
R
G
 
G
R
 
K
S
 
F
T
 
T
V
 
F
L
 
I
S
 
A
F
 
T
Q
 
S
G
 
G
G
 
A
Y
 
F
H
 
H
G
 
G
M
 
K
S
 
S
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
A
M
 
T
G
 
A
S
 
K
L
 
S
G
 
T
P
 
F
K
 
R
K
 
K
P
 
P
L
 
F
G
 
M
A
 
P
L
 
L
L
 
L
G
 
P
N
 
-
G
 
G
V
 
F
Q
 
R
F
 
H
L
 
V
P
 
P
Y
 
F
P
 
-
Y
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
C
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
G
G
 
N
A
 
I
E
 
E
G
 
A
V
 
M
R
 
R
V
 
T
N
 
A
L
 
L
H
 
N
Y
 
E
L
 
C
D
 
K
N
 
K
L
 
T
L
 
G
N
 
D
D
 
D
P
 
V
E
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
 
E
V
 
P
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
P
 
L
A
 
P
D
 
P
L
 
P
D
 
G
W
 
Y
L
 
L
R
 
T
G
 
A
L
 
V
R
 
R
R
 
K
I
 
L
T
 
C
E
 
D
Q
 
E
A
 
F
G
 
G
V
 
A
A
 
L
L
 
M
I
 
I
V
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
V
Q
|
Q
S
 
T
G
 
G
F
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
M
F
 
F
A
 
A
F
 
C
E
 
E
H
 
H
A
 
E
G
 
N
I
 
V
I
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
C
M
 
L
S
 
A
K
|
K
A
 
A
I
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
G
-
 
V
L
 
M
P
 
P
L
 
I
A
 
G
V
 
A
V
 
T
V
 
I
Y
 
A
R
 
T
D
 
E
W
 
E
L
 
V
D
 
F
T
 
S
W
 
V
L
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
N
P
 
P
G
 
F
A
 
L
H
 
H
A
 
T
G
 
T
T
|
T
F
 
F
R
 
G
G
 
G
N
 
N
Q
 
P
M
 
L
A
 
A
M
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
A
S
 
L
A
 
A
V
 
T
M
 
I
R
 
N
Y
 
V
L
 
L
K
 
L
D
 
E
H
 
Q
D
 
N
L
 
L
A
 
P
G
 
A
H
 
Q
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
D
R
 
M
L
 
L
G
 
L
E
 
D
H
 
G
L
 
F
R
 
R
I
 
Q
L
 
L
Q
 
A
R
 
R
D
 
E
F
 
Y
P
 
P
H
 
D
L
 
L
-
 
V
G
 
Q
D
 
E
I
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
G
L
 
M
M
 
L
L
 
M
G
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
F
V
 
V
D
 
D
P
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
-
P
 
-
V
 
-
H
 
-
R
 
N
Q
 
E
L
 
I
A
 
G
P
 
Y
L
 
N
V
 
F
Q
 
A
R
 
S
E
 
E
C
 
M
L
 
F
K
 
R
R
 
Q
G
 
R
L
 
V
I
 
L
L
 
V
E
 
A
L
 
G
G
 
T
G
 
L
R
 
N
H
 
N
G
 
A
S
 
K
V
 
T
V
 
I
R
 
R
F
 
I
L
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
T
I
 
L
T
 
T
A
 
I
V
 
E
E
 
Q
V
 
C
D
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
I
D
 
K
I
 
A
F
 
A
G
 
R
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
M
V
 
R
A
 
V
S
 
S
L
 
V

4uoxC Crystal structure of ygjg in complex with pyridoxal-5'-phosphate and putrescine (see paper)
32% identity, 88% coverage: 57:464/464 of query aligns to 76:454/456 of 4uoxC

query
sites
4uoxC
D
 
D
V
 
T
E
 
Q
G
 
G
R
 
Q
R
 
E
F
 
F
I
 
I
D
 
D
C
 
C
L
 
L
A
 
G
G
 
G
A
x
F
G
 
G
T
 
I
L
 
F
A
 
N
L
 
V
G
 
G
H
 
H
N
 
R
H
 
N
P
 
P
V
 
V
V
 
V
I
 
V
E
 
S
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
Q
 
N
V
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
K
E
 
Q
L
 
-
P
 
P
L
 
L
H
 
H
T
 
S
L
 
Q
D
 
E
L
 
L
T
 
L
T
 
D
P
 
P
V
 
L
K
 
R
D
 
A
Q
 
M
F
 
L
V
 
A
Q
 
K
D
 
T
L
 
L
F
 
A
G
 
A
L
 
L
L
 
T
P
 
P
P
 
G
A
 
K
L
 
L
A
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
K
I
 
Y
Q
 
S
F
 
F
C
 
F
G
 
C
P
 
N
T
x
S
G
|
G
T
|
T
D
 
E
A
 
S
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
L
V
 
A
R
 
K
-
 
A
-
 
Y
-
 
Q
T
 
S
A
 
P
T
 
R
G
 
G
R
 
K
S
 
F
T
 
T
V
 
F
L
 
I
S
 
A
F
 
T
Q
 
S
G
 
G
G
 
A
Y
x
F
H
|
H
G
|
G
M
 
K
S
 
S
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
A
M
 
T
G
 
A
S
 
K
L
 
S
G
 
T
P
 
F
K
 
R
K
 
K
P
 
P
L
 
F
G
 
M
A
 
P
L
 
L
L
 
L
G
 
-
N
 
P
G
 
G
V
 
F
Q
 
R
F
 
H
L
 
V
P
 
P
Y
 
F
P
 
-
Y
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
C
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
G
G
 
N
A
 
I
E
 
E
G
 
A
V
 
M
R
 
R
V
 
T
N
 
A
L
 
L
H
 
N
Y
 
E
L
 
C
D
 
K
N
 
K
L
 
T
L
 
G
N
 
D
D
 
D
P
 
V
E
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
|
E
V
 
P
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
P
 
L
A
 
P
D
 
P
L
 
P
D
 
G
W
 
Y
L
 
L
R
 
T
G
 
A
L
 
V
R
 
R
R
 
K
I
 
L
T
 
C
E
 
D
Q
 
E
A
 
F
G
 
G
V
 
A
A
 
L
L
 
M
I
 
I
V
 
L
D
|
D
E
 
E
I
x
V
Q
|
Q
S
 
T
G
 
G
F
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
M
F
 
F
A
 
A
F
 
C
E
 
E
H
 
H
A
 
E
G
 
N
I
 
V
I
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
C
M
 
L
S
 
A
K
|
K
A
 
A
I
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
G
-
 
V
L
 
M
P
 
P
L
 
I
A
 
G
V
 
A
V
 
T
V
 
I
Y
 
A
R
 
T
D
 
E
W
 
E
L
 
V
D
 
F
T
 
S
W
 
V
L
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
N
P
 
P
G
 
F
A
 
L
H
 
H
A
 
T
G
x
T
T
|
T
F
 
F
R
 
G
G
 
G
N
 
N
Q
 
P
M
 
L
A
 
A
M
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
A
S
 
L
A
 
A
V
 
T
M
 
I
R
 
N
Y
 
V
L
 
L
K
 
L
D
 
E
H
 
Q
D
 
N
L
 
L
A
 
P
G
 
A
H
 
Q
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
D
R
 
M
L
 
L
G
 
L
E
 
D
H
 
G
L
 
F
R
 
R
I
 
Q
L
 
L
Q
 
A
R
 
R
D
 
E
F
 
Y
P
 
P
H
 
D
L
 
L
-
 
V
G
 
Q
D
 
E
I
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
G
L
 
M
M
 
L
L
 
M
G
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
F
V
 
V
D
 
D
P
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
-
P
 
-
V
 
-
H
 
-
R
 
N
Q
 
E
L
 
I
A
 
G
P
 
Y
L
 
N
V
 
F
Q
 
A
R
 
S
E
 
E
C
 
M
L
 
F
K
 
R
R
 
Q
G
 
R
L
 
V
I
 
L
L
 
V
E
 
A
L
 
G
G
 
T
G
 
L
R
 
N
H
 
N
G
 
A
S
 
K
V
 
T
V
 
I
R
|
R
F
 
I
L
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
T
I
 
L
T
 
T
A
 
I
V
 
E
E
 
Q
V
 
C
D
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
I
D
 
K
I
 
A
F
 
A
G
 
R
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
M
V
 
R
A
 
V
S
 
S
L
 
V

Sites not aligning to the query:

P50457 4-aminobutyrate aminotransferase PuuE; GABA aminotransferase; GABA-AT; Gamma-amino-N-butyrate transaminase; GABA transaminase; Glutamate:succinic semialdehyde transaminase; EC 2.6.1.19 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
34% identity, 93% coverage: 29:458/464 of query aligns to 8:420/421 of P50457

query
sites
P50457
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
R
Q
 
L
E
 
S
S
 
A
N
 
T
A
 
P
R
 
R
S
 
G
Y
 
V
P
 
G
R
 
V
R
 
M
I
 
C
P
 
N
L
 
F
A
 
F
L
 
A
K
 
Q
R
 
S
A
 
A
K
 
E
G
 
N
L
 
A
Y
 
T
V
 
L
E
 
K
D
 
D
V
 
V
E
 
E
G
 
G
R
 
N
R
 
E
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
C
 
F
L
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
I
G
 
A
T
 
V
L
 
L
A
 
N
L
 
T
G
 
G
H
 
H
N
 
R
H
 
H
P
 
P
V
 
D
V
 
L
I
 
V
E
 
A
A
 
A
I
 
V
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
Q
L
 
L
A
 
-
D
 
-
E
 
Q
L
 
Q
P
 
F
L
 
T
H
 
H
T
 
T
L
 
A
D
 
Y
L
 
Q
T
 
I
T
 
V
P
 
P
V
 
Y
K
 
E
D
 
S
-
 
Y
-
 
V
Q
 
T
F
 
L
V
 
A
Q
 
E
D
 
K
L
 
I
F
 
N
G
 
A
L
 
L
L
 
A
P
 
P
P
 
-
A
 
-
L
 
V
A
 
S
R
 
G
E
 
Q
A
 
A
K
 
K
I
 
T
Q
 
A
F
 
F
C
 
F
G
 
-
P
 
T
T
 
T
G
 
G
T
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
N
A
 
A
L
 
V
K
 
K
L
 
I
V
 
A
R
 
R
T
 
A
A
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
P
T
 
G
V
 
V
L
 
I
S
 
A
F
 
F
Q
 
S
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
H
 
H
G
 
G
M
 
R
S
 
T
Q
 
Y
G
 
M
A
 
T
L
 
M
S
 
A
L
 
L
M
 
T
G
 
G
S
 
K
L
 
V
G
 
A
P
 
P
K
 
Y
K
 
K
P
 
I
L
 
G
G
 
F
A
 
G
L
 
P
L
 
F
G
 
P
N
 
G
G
 
S
V
 
V
Q
 
Y
F
 
H
L
 
V
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
S
D
 
D
Y
 
L
R
 
H
C
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
G
L
 
I
G
 
S
G
 
T
A
 
Q
E
 
D
G
 
-
V
 
-
R
 
-
V
 
-
N
 
S
L
 
L
H
 
D
Y
 
A
L
 
I
D
 
E
N
 
R
L
 
L
L
 
F
-
 
K
N
 
S
D
 
D
P
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
K
V
 
Q
L
 
V
L
 
-
P
 
-
A
 
A
A
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
F
E
 
E
V
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
F
I
 
N
P
 
V
A
 
A
D
 
P
L
 
K
D
 
E
W
 
L
L
 
V
R
 
A
G
 
A
L
 
I
R
 
R
R
 
R
I
 
L
T
 
C
E
 
D
Q
 
E
A
 
H
G
 
G
V
 
I
A
 
V
L
 
M
I
 
I
V
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
A
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
A
F
 
M
E
 
D
H
 
H
A
 
Y
G
 
A
I
 
D
I
 
K
P
 
P
D
 
D
V
 
L
V
 
M
V
 
T
M
 
M
S
 
A
K
|
K
A
 
S
I
 
L
G
 
A
G
 
G
S
 
G
L
 
M
P
 
P
L
 
L
A
 
S
-
 
G
V
 
V
V
 
V
V
 
G
Y
 
N
R
 
A
D
 
N
W
 
I
L
 
M
D
 
D
T
 
A
W
 
P