SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3849 FitnessBrowser__Phaeo:GFF3849 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7d5mA Crystal structure of inositol dehydrogenase homolog complexed with NAD+ from azotobacter vinelandii
36% identity, 97% coverage: 9:372/374 of query aligns to 12:387/389 of 7d5mA

query
sites
7d5mA
L
 
I
K
 
R
L
 
W
G
 
A
M
 
M
V
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
Q
 
R
G
 
N
A
x
S
F
x
Q
I
|
I
G
 
G
A
 
Y
V
 
I
H
 
H
R
 
R
I
 
S
A
 
A
A
 
A
R
 
L
M
 
R
D
 
D
D
 
Q
R
 
S
F
 
F
Q
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
F
S
x
D
S
x
I
D
 
D
P
 
P
A
 
G
R
 
R
A
 
G
S
 
R
A
 
E
S
 
F
A
 
G
A
 
V
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
V
D
 
D
P
 
P
D
 
Q
R
 
R
S
 
C
Y
 
Y
A
 
P
S
 
D
F
 
Y
A
 
R
E
 
T
M
 
L
A
 
F
E
 
E
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
R
R
 
R
E
 
P
D
 
D
G
 
G
I
 
I
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
S
I
 
V
V
 
A
T
|
T
P
|
P
N
|
N
H
 
G
L
 
T
H
|
H
A
 
F
G
 
A
P
 
I
S
 
T
I
 
R
A
 
A
F
 
A
L
 
L
N
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
L
H
 
H
V
 
V
I
 
V
C
 
C
D
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
C
A
 
F
S
 
T
V
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
T
I
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
I
A
 
A
R
 
L
S
 
A
S
 
N
S
 
N
A
 
R
R
 
V
F
 
V
F
 
G
L
 
V
T
 
T
H
 
Y
N
 
G
Y
 
Y
T
 
A
G
 
G
Y
 
H
P
 
Q
L
 
L
L
 
I
R
 
E
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
M
V
 
I
A
 
A
R
 
D
G
 
G
D
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
M
V
 
V
Q
 
H
A
 
M
E
 
Q
Y
 
F
A
 
A
Q
 
H
D
 
G
W
 
F
L
 
H
T
 
S
N
 
A
V
 
P
I
 
V
E
 
E
Q
 
G
E
 
Q
G
 
-
H
 
N
K
 
E
Q
 
A
A
 
T
A
 
K
W
|
W
R
|
R
T
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
R
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
P
G
 
S
-
 
Y
A
 
V
I
 
L
G
 
G
D
 
D
I
 
V
G
 
G
T
 
T
H
|
H
A
 
P
F
 
L
N
 
Y
I
 
L
A
 
S
-
 
E
C
 
V
F
 
M
V
 
L
S
 
P
G
 
E
L
 
F
A
 
R
P
 
I
Q
 
K
A
 
R
L
 
L
S
 
M
A
 
C
E
 
S
L
 
R
H
 
Q
S
 
S
F
 
F
G
 
V
P
 
K
G
 
S
R
 
R
Q
 
A
-
 
P
V
 
L
D
 
E
D
 
D
N
 
N
A
 
A
H
 
Y
I
 
T
L
 
L
L
 
M
R
 
E
Y
 
Y
A
 
E
E
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
M
G
 
G
M
 
L
L
 
V
W
 
W
A
 
S
S
 
S
Q
 
A
I
 
V
A
 
N
V
 
A
G
 
G
C
 
S
E
 
M
N
 
H
S
 
G
L
 
Q
R
 
K
L
 
I
R
 
R
I
 
V
Y
 
I
G
 
G
D
 
S
K
 
R
G
 
A
G
 
S
L
 
L
E
 
E
W
 
W
E
 
W
H
 
D
Q
 
E
D
 
H
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
M
 
L
T
 
A
F
 
F
T
 
E
R
 
I
F
 
Q
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
K
 
V
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
T
 
E
R
 
R
G
 
G
G
 
M
A
 
G
N
 
Y
I
 
L
G
 
H
P
 
P
D
 
G
W
 
A
T
 
L
-
 
L
-
 
D
-
 
D
R
 
R
V
 
I
P
 
G
P
 
A
G
 
G
H
 
H
P
 
P
E
 
E
G
 
G
Y
 
L
L
 
F
E
 
E
G
 
A
F
x
W
A
 
S
T
 
N
L
 
L
Y
 
Y
T
 
Y
D
 
R
I
 
F
A
 
A
E
 
M
V
 
A
I
 
M
E
 
D
T
 
A
G
 
T
T
 
E
-
 
R
-
 
G
D
 
D
N
 
G
P
 
A
M
 
L
L
 
L
P
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
R
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
-
 
I
-
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
E
G
 
G
M
 
V
W
 
R
F
 
W
I
 
V
S
 
E
A
 
R
A
 
C
Q
 
V
T
 
Q
S
 
S
S
 
A
A
 
D
E
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
V
W
 
W
I
 
V

7d5nB Crystal structure of inositol dehydrogenase homolog complexed with nadh and myo-inositol from azotobacter vinelandii
36% identity, 97% coverage: 9:372/374 of query aligns to 11:386/389 of 7d5nB

query
sites
7d5nB
L
 
I
K
 
R
L
 
W
G
 
A
M
 
M
V
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
Q
 
R
G
 
N
A
x
S
F
x
Q
I
|
I
G
 
G
A
 
Y
V
 
I
H
 
H
R
 
R
I
 
S
A
 
A
A
 
A
R
 
L
M
 
R
D
 
D
D
 
Q
R
 
S
F
 
F
Q
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
F
S
x
D
S
x
I
D
 
D
P
 
P
A
 
G
R
 
R
A
 
G
S
 
R
A
 
E
S
 
F
A
 
G
A
 
V
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
V
D
 
D
P
 
P
D
 
Q
R
 
R
S
 
C
Y
 
Y
A
 
P
S
 
D
F
 
Y
A
 
R
E
 
T
M
 
L
A
 
F
E
 
E
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
R
R
 
R
E
 
P
D
 
D
G
 
G
I
 
I
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
S
I
 
V
V
 
A
T
|
T
P
|
P
N
|
N
H
 
G
L
 
T
H
|
H
A
 
F
G
 
A
P
 
I
S
 
T
I
 
R
A
 
A
F
 
A
L
 
L
N
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
L
H
 
H
V
 
V
I
 
V
C
 
C
D
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
C
A
 
F
S
 
T
V
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
T
I
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
I
A
 
A
R
 
L
S
 
A
S
 
N
S
 
N
A
 
R
R
 
V
F
 
V
F
 
G
L
 
V
T
 
T
H
 
Y
N
 
G
Y
|
Y
T
 
A
G
 
G
Y
 
H
P
 
Q
L
 
L
L
 
I
R
 
E
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
M
V
 
I
A
 
A
R
 
D
G
 
G
D
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
M
V
 
V
Q
 
H
A
 
M
E
 
Q
Y
 
F
A
 
A
Q
 
H
D
 
G
W
 
F
L
 
H
T
 
S
N
 
A
V
 
P
I
 
V
E
 
E
Q
 
G
E
 
Q
G
 
-
H
 
N
K
 
E
Q
 
A
A
 
T
A
 
K
W
|
W
R
|
R
T
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
R
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
P
G
 
S
-
 
Y
A
 
V
I
 
L
G
 
G
D
|
D
I
 
V
G
 
G
T
 
T
H
|
H
A
 
P
F
 
L
N
 
Y
I
 
L
A
 
S
-
 
E
C
 
V
F
 
M
V
 
L
S
 
P
G
 
E
L
 
F
A
 
R
P
 
I
Q
 
K
A
 
R
L
 
L
S
 
M
A
 
C
E
 
S
L
 
R
H
 
Q
S
 
S
F
 
F
G
 
V
P
 
K
G
 
S
R
 
R
Q
 
A
-
 
P
V
 
L
D
 
E
D
 
D
N
 
N
A
 
A
H
 
Y
I
 
T
L
 
L
L
 
M
R
 
E
Y
 
Y
A
 
E
E
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
M
G
 
G
M
 
L
L
 
V
W
 
W
A
 
S
S
 
S
Q
 
A
I
 
V
A
 
N
V
 
A
G
 
G
C
 
S
E
 
M
N
 
H
S
 
G
L
 
Q
R
 
K
L
 
I
R
 
R
I
 
V
Y
 
I
G
 
G
D
 
S
K
 
R
G
 
A
G
 
S
L
 
L
E
 
E
W
 
W
E
 
W
H
 
D
Q
 
E
D
 
H
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
M
 
L
T
 
A
F
 
F
T
 
E
R
 
I
F
 
Q
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
K
 
V
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
T
 
E
R
 
R
G
 
G
G
 
M
A
 
G
N
 
Y
I
 
L
G
 
H
P
 
P
D
 
G
W
 
A
T
 
L
-
 
L
-
 
D
-
 
D
R
 
R
V
 
I
P
 
G
P
 
A
G
 
G
H
 
H
P
 
P
E
 
E
G
 
G
Y
 
L
L
 
F
E
 
E
G
 
A
F
x
W
A
 
S
T
 
N
L
 
L
Y
 
Y
T
 
Y
D
 
R
I
 
F
A
 
A
E
 
M
V
 
A
I
 
M
E
 
D
T
 
A
G
 
T
T
 
E
-
 
R
-
 
G
D
 
D
N
 
G
P
 
A
M
 
L
L
 
L
P
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
R
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
-
 
I
-
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
E
G
 
G
M
 
V
W
 
R
F
 
W
I
 
V
S
 
E
A
 
R
A
 
C
Q
 
V
T
 
Q
S
 
S
S
 
A
A
 
D
E
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
V
W
 
W
I
 
V

7d5nA Crystal structure of inositol dehydrogenase homolog complexed with nadh and myo-inositol from azotobacter vinelandii
35% identity, 97% coverage: 9:372/374 of query aligns to 11:377/379 of 7d5nA

query
sites
7d5nA
L
 
I
K
 
R
L
 
W
G
 
A
M
 
M
V
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
Q
 
R
G
 
N
A
x
S
F
x
Q
I
|
I
G
 
G
A
 
Y
V
 
I
H
 
H
R
 
R
I
 
S
A
 
A
A
 
A
R
 
L
M
 
R
D
 
D
D
 
Q
R
 
S
F
 
F
Q
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
F
S
x
D
S
x
I
D
 
D
P
 
P
A
 
G
R
 
R
A
 
G
S
 
R
A
 
E
S
 
F
A
 
G
A
 
V
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
V
D
 
D
P
 
P
D
 
Q
R
 
R
S
 
C
Y
 
Y
A
 
P
S
 
D
F
 
Y
A
 
R
E
 
T
M
 
L
A
 
F
E
 
E
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
R
R
 
R
E
 
P
D
 
D
G
 
G
I
 
I
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
S
I
 
V
V
 
A
T
|
T
P
|
P
N
|
N
H
 
G
L
 
T
H
|
H
A
 
F
G
 
A
P
 
I
S
 
T
I
 
R
A
 
A
F
 
A
L
 
L
N
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
L
H
 
H
V
 
V
I
 
V
C
 
C
D
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
C
A
 
F
S
 
T
V
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
T
I
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
I
A
 
A
R
 
L
S
 
A
S
 
N
S
 
N
A
 
R
R
 
V
F
 
V
F
 
G
L
 
V
T
 
T
H
 
Y
N
 
G
Y
 
Y
T
 
A
G
 
G
Y
 
H
P
 
Q
L
 
L
L
 
I
R
 
E
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
M
V
 
I
A
 
A
R
 
D
G
 
G
D
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
M
V
 
V
Q
 
H
A
 
M
E
 
Q
Y
 
F
A
 
A
Q
 
H
D
 
G
W
 
F
L
 
H
T
 
S
N
 
A
V
 
P
I
 
V
E
 
E
Q
 
-
E
 
-
G
 
-
H
 
-
K
 
-
Q
 
A
A
 
T
A
 
K
W
|
W
R
|
R
T
 
V
D
 
G
P
 
P
A
 
S
Q
 
Y
S
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
V
I
 
L
G
 
G
D
 
D
I
 
V
G
 
G
T
 
T
H
|
H
A
 
P
F
 
L
N
 
Y
I
 
L
A
 
S
-
 
E
C
 
V
F
 
M
V
 
L
S
 
P
G
 
E
L
 
F
A
 
R
P
 
I
Q
 
K
A
 
R
L
 
L
S
 
M
A
 
C
E
 
S
L
 
R
H
 
Q
S
 
S
F
 
F
G
 
V
P
 
K
G
 
S
R
 
R
Q
 
A
-
 
P
V
 
L
D
 
E
D
 
D
N
 
N
A
 
A
H
 
Y
I
 
T
L
 
L
L
 
M
R
 
E
Y
 
Y
A
 
E
E
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
M
G
 
G
M
 
L
L
 
V
W
 
W
A
 
S
S
 
S
Q
 
A
I
 
V
A
 
N
V
 
A
G
 
G
C
 
S
E
 
M
N
 
H
S
 
G
L
 
Q
R
 
K
L
 
I
R
 
R
I
 
V
Y
 
I
G
 
G
D
 
S
K
 
R
G
 
A
G
 
S
L
 
L
E
 
E
W
 
W
E
 
W
H
 
D
Q
 
E
D
 
H
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
M
 
L
T
 
A
F
 
F
T
 
E
R
 
I
F
 
Q
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
K
 
V
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
T
 
E
R
 
R
G
 
G
G
 
M
A
 
G
N
 
Y
I
 
L
G
 
H
P
 
P
D
 
G
W
 
A
T
 
L
-
 
L
-
 
D
-
 
D
R
 
R
V
 
I
P
 
G
P
 
A
G
 
G
H
 
H
P
 
P
E
 
E
G
 
G
Y
 
L
L
 
F
E
 
E
G
 
A
F
x
W
A
 
S
T
 
N
L
 
L
Y
 
Y
T
 
Y
D
 
R
I
 
F
A
 
A
E
 
M
V
 
A
I
 
M
E
 
D
T
 
A
G
 
T
T
 
E
-
 
R
-
 
G
D
 
D
N
 
G
P
 
A
M
 
L
L
 
L
P
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
R
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
-
 
I
-
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
E
G
 
G
M
 
V
W
 
R
F
 
W
I
 
V
S
 
E
A
 
R
A
 
C
Q
 
V
T
 
Q
S
 
S
S
 
A
A
 
D
E
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
V
W
 
W
I
 
V

3dtyA Crystal structure of an oxidoreductase from pseudomonas syringae
35% identity, 97% coverage: 9:372/374 of query aligns to 7:364/374 of 3dtyA

query
sites
3dtyA
L
 
I
K
 
R
L
 
W
G
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
S
G
 
Q
A
 
S
F
 
Q
I
 
I
G
 
G
A
 
Y
V
 
I
H
 
H
R
 
R
I
 
C
A
 
A
A
 
A
R
 
L
M
 
R
D
 
D
D
 
N
R
 
T
F
 
F
Q
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
F
S
 
D
S
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
I
R
 
R
A
 
G
S
 
S
A
 
A
S
 
F
A
 
G
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
V
D
 
D
P
 
S
D
 
E
R
 
R
S
 
C
Y
 
Y
A
 
A
S
 
D
F
 
Y
A
 
L
E
 
S
M
 
M
A
 
F
E
 
E
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
R
R
 
R
E
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
I
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
S
I
 
I
V
 
A
T
 
T
P
 
P
N
 
N
H
 
G
L
 
T
H
 
H
A
 
Y
G
 
S
P
 
I
S
 
T
I
 
K
A
 
A
F
 
A
L
 
L
N
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
L
H
 
H
V
 
V
I
 
V
C
 
C
D
 
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
C
A
 
F
S
 
T
V
 
V
A
x
E
E
 
Q
A
 
A
E
 
E
A
x
N
I
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
L
A
 
S
R
 
H
S
 
K
S
 
H
S
 
N
A
 
R
R
 
I
F
 
V
F
 
G
L
 
V
T
 
T
H
 
Y
N
 
G
Y
 
Y
T
 
A
G
 
G
Y
 
H
P
 
Q
L
 
L
L
 
I
R
 
E
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
E
M
 
M
V
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
G
D
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
D
I
 
V
R
 
R
L
 
M
V
 
V
Q
 
H
A
 
M
E
 
Q
Y
 
F
A
 
A
Q
 
H
D
 
G
W
 
F
L
 
H
T
 
S
N
 
-
V
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
E
 
-
G
 
-
H
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
W
 
-
R
 
-
T
 
A
D
 
G
P
 
P
A
 
S
Q
 
Y
S
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
V
I
 
L
G
 
G
D
 
D
I
 
V
G
 
G
T
 
T
H
|
H
A
 
P
F
 
L
N
 
Y
I
 
L
A
 
S
-
 
E
C
 
V
F
 
M
V
 
L
S
 
P
G
 
D
L
 
L
A
 
K
P
 
I
Q
 
K
A
 
R
L
 
L
S
 
M
A
 
C
E
 
S
L
 
R
H
 
Q
S
 
S
F
 
F
G
 
V
P
 
A
G
 
S
R
 
R
Q
 
A
-
 
P
V
 
L
D
 
E
D
 
D
N
 
N
A
 
A
H
 
Y
I
 
T
L
 
L
L
 
M
R
 
E
Y
 
Y
A
 
E
E
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
M
G
 
G
M
 
M
L
 
V
W
 
W
A
 
S
S
 
S
Q
 
A
I
 
V
A
 
N
V
 
A
G
 
G
C
 
S
E
 
M
N
 
H
S
 
G
L
 
Q
R
 
K
L
 
I
R
 
R
I
 
V
Y
 
I
G
 
G
D
 
S
K
 
R
G
 
A
G
 
S
L
 
L
E
 
E
W
 
W
E
 
W
H
 
D
Q
 
E
D
 
R
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
M
 
L
T
 
S
F
 
F
T
 
E
R
 
V
F
 
Q
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
K
 
A
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
T
 
E
R
 
R
G
 
G
G
 
M
A
 
G
N
 
Y
I
 
L
G
 
H
P
 
P
D
 
N
W
 
A
T
 
L
-
 
I
-
 
D
-
 
D
R
 
R
V
 
I
P
 
G
P
 
G
G
 
G
H
 
H
P
 
P
E
 
E
G
 
G
Y
 
L
L
 
F
E
 
E
G
 
A
F
 
W
A
 
A
T
 
N
L
 
L
Y
 
Y
T
 
Y
D
 
R
I
 
F
A
 
A
E
 
L
V
 
A
I
 
M
E
 
D
T
 
A
G
 
T
-
 
D
-
 
R
T
 
S
D
 
D
N
 
T
P
 
Q
M
 
A
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
V
-
 
R
-
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
I
Q
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
E
G
 
G
M
 
V
W
 
R
F
 
W
I
 
V
S
 
E
A
 
R
A
 
C
Q
 
V
T
 
L
S
 
S
S
 
A
A
 
D
E
 
N
G
 
D
G
 
S
A
 
I
W
 
W
I
 
V

6a3iA Levoglucosan dehydrogenase, complex with nadh and levoglucosan (see paper)
32% identity, 75% coverage: 9:289/374 of query aligns to 3:284/372 of 6a3iA

query
sites
6a3iA
L
 
L
K
 
N
L
 
V
G
 
G
M
 
L
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
F
|
F
I
x
M
G
 
G
A
 
K
V
 
A
H
 
H
R
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
Y
R
 
A
M
 
A
D
 
M
D
 
P
R
 
M
F
 
F
Q
 
F
L
 
W
V
 
P
A
 
A
G
 
P
A
 
A
L
 
L
S
 
P
S
 
V
D
 
R
P
 
K
A
 
V
R
 
I
A
 
A
S
x
E
A
|
A
S
 
N
A
 
P
A
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
A
I
 
A
D
 
E
P
 
A
D
 
A
R
 
R
S
 
R
Y
 
F
A
 
G
S
 
F
F
 
E
A
 
N
E
 
S
M
 
T
A
 
S
E
 
D
A
 
W
E
 
R
A
 
S
A
 
I
R
 
I
E
 
D
D
 
D
-
 
P
G
 
D
I
 
I
D
 
H
A
 
V
V
 
V
A
 
D
I
 
I
V
 
A
T
 
T
P
|
P
N
|
N
H
 
H
L
|
L
H
|
H
A
 
A
G
 
E
P
 
I
S
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
A
L
 
A
N
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
K
H
 
H
V
 
I
I
 
I
C
 
C
D
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
A
 
R
S
 
T
V
 
G
A
 
E
E
 
E
A
 
S
E
 
K
A
 
A
I
 
M
K
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
V
R
 
K
S
 
D
S
 
K
S
 
N
A
 
I
R
 
V
F
 
H
F
 
M
L
 
V
T
 
A
H
 
F
N
 
N
Y
|
Y
T
 
R
G
 
R
Y
 
T
P
 
P
L
 
A
L
 
V
R
 
A
Q
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
K
M
 
Y
V
 
I
A
 
E
R
 
E
G
 
G
D
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
L
L
 
S
V
 
F
Q
 
R
A
 
G
E
 
T
Y
|
Y
A
 
L
Q
|
Q
D
 
D
W
 
W
L
 
-
T
 
-
N
 
-
V
 
-
I
 
-
E
 
S
Q
 
A
E
 
D
G
 
P
H
 
N
K
 
S
Q
 
P
A
 
L
A
 
S
W
|
W
R
|
R
T
 
F
D
 
Q
P
 
K
A
 
S
Q
 
I
S
 
A
G
 
G
A
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
L
G
 
G
D
|
D
I
 
I
G
 
A
T
 
T
H
|
H
A
 
V
F
 
I
N
 
D
I
 
M
A
 
A
C
 
R
F
 
Y
V
 
L
S
 
V
G
 
G
L
 
E
A
 
F
P
 
-
Q
 
S
A
 
A
L
 
V
S
 
N
A
 
A
E
 
V
L
 
L
H
 
S
S
 
T
F
 
W
G
 
I
P
 
P
G
 
E
R
 
R
-
 
P
-
 
L
-
 
Q
-
 
S
-
 
K
-
 
G
-
 
P
-
 
V
Q
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
D
N
 
E
A
 
V
H
 
M
I
 
T
L
 
M
L
 
I
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
V
G
 
G
M
 
S
L
 
V
W
 
E
A
 
A
S
 
T
Q
 
R
I
 
N
A
 
A
V
 
H
G
 
G
C
 
R
E
 
N
N
 
N
S
 
Y
L
 
I
R
 
T
L
 
F
R
 
E
I
 
I
Y
 
H
G
 
G
D
 
T
K
 
E
G
 
G
G
 
S
L
 
I
-
 
V
-
 
F
E
 
N
W
 
Y
E
 
E
H
 
R
Q
 
R
D
 
D
P
 
E
N
 
L
Q
 
Q
M
 
V
T
 
A
F
 
F

6a3jC Levoglucosan dehydrogenase, complex with nadh and l-sorbose (see paper)
31% identity, 75% coverage: 9:289/374 of query aligns to 2:288/378 of 6a3jC

query
sites
6a3jC
L
 
L
K
 
N
L
 
V
G
 
G
M
 
L
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
F
|
F
I
x
M
G
 
G
A
 
K
V
 
A
H
 
H
R
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
Y
R
 
A
M
 
A
D
 
M
D
 
P
R
 
M
F
 
F
Q
 
F
L
 
W
V
 
P
A
 
A
G
 
P
A
 
A
L
 
L
S
 
P
S
 
V
D
 
R
P
 
K
A
 
V
R
 
I
A
 
A
S
x
E
A
 
A
S
 
N
A
 
P
A
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
A
I
 
A
D
 
E
P
 
A
D
 
A
R
 
R
S
 
R
Y
 
F
A
 
G
S
 
F
F
 
E
A
 
N
E
 
S
M
 
T
A
 
S
E
 
D
A
 
W
E
 
R
A
 
S
A
 
I
R
 
I
E
 
D
D
 
D
-
 
P
G
 
D
I
 
I
D
 
H
A
 
V
V
 
V
A
 
D
I
 
I
V
 
A
T
|
T
P
|
P
N
|
N
H
 
H
L
 
L
H
|
H
A
 
A
G
 
E
P
 
I
S
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
A
L
 
A
N
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
K
H
 
H
V
 
I
I
 
I
C
 
C
D
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
A
 
R
S
 
T
V
 
G
A
 
E
E
 
E
A
 
S
E
 
K
A
 
A
I
 
M
K
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
V
R
 
K
S
 
D
S
 
K
S
 
N
A
 
I
R
 
V
F
 
H
F
 
M
L
 
V
T
 
A
H
 
F
N
 
N
Y
|
Y
T
 
R
G
 
R
Y
 
T
P
 
P
L
 
A
L
 
V
R
 
A
Q
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
K
M
 
Y
V
 
I
A
 
E
R
 
E
G
 
G
D
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
L
L
 
S
V
 
F
Q
 
R
A
 
G
E
 
T
Y
|
Y
A
 
L
Q
|
Q
D
 
D
W
|
W
L
 
-
T
 
-
N
 
-
V
 
-
I
 
-
E
 
S
Q
 
A
E
 
D
G
 
P
H
 
N
K
 
S
Q
 
P
A
 
L
A
 
S
W
|
W
R
|
R
T
 
F
D
 
Q
P
 
K
A
 
S
Q
 
I
S
 
A
G
 
G
A
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
L
G
 
G
D
|
D
I
 
I
G
 
A
T
 
T
H
 
H
A
 
V
F
 
I
N
 
D
I
 
M
A
 
A
C
 
R
F
 
Y
V
 
L
S
 
V
G
 
G
L
 
E
A
 
F
P
 
-
Q
 
S
A
 
A
L
 
V
S
 
N
A
 
A
E
 
V
L
 
L
H
 
S
S
 
T
F
 
W
G
 
I
P
 
P
G
 
E
R
 
R
-
 
P
-
 
L
-
 
Q
-
 
R
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
P
-
 
K
-
 
G
-
 
P
-
 
V
Q
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
D
N
 
E
A
 
V
H
 
M
I
 
T
L
 
M
L
 
I
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
V
G
 
G
M
 
S
L
 
V
W
 
E
A
 
A
S
 
T
Q
 
R
I
 
N
A
 
A
V
 
H
G
 
G
C
 
R
E
 
N
N
 
N
S
 
Y
L
 
I
R
 
T
L
 
F
R
 
E
I
 
I
Y
 
H
G
 
G
D
 
T
K
 
E
G
 
G
G
 
S
L
 
I
-
 
V
-
 
F
E
 
N
W
 
Y
E
 
E
H
 
R
Q
 
R
D
 
D
P
 
E
N
 
L
Q
 
Q
M
 
V
T
 
A
F
 
F

F0M433 Levoglucosan dehydrogenase; LGDH; 1,6-anhydro-beta-D-glucose dehydrogenase; PpLGDH; EC 1.1.1.425 from Pseudarthrobacter phenanthrenivorans (strain DSM 18606 / JCM 16027 / LMG 23796 / Sphe3) (Arthrobacter phenanthrenivorans) (see paper)
30% identity, 75% coverage: 9:289/374 of query aligns to 4:300/390 of F0M433

query
sites
F0M433
L
 
L
K
 
N
L
 
V
G
 
G
M
 
L
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
F
|
F
I
x
M
G
 
G
A
 
K
V
 
A
H
 
H
R
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
Y
R
 
A
M
 
A
D
 
M
D
 
P
R
 
M
F
 
F
Q
 
F
L
 
W
V
 
P
A
 
A
G
 
P
A
 
A
L
 
L
S
 
P
S
 
V
D
 
R
P
 
K
A
 
V
R
 
I
A
 
A
S
x
E
A
 
A
S
 
N
A
 
P
A
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
A
I
 
A
D
 
E
P
 
A
D
 
A
R
 
R
S
 
R
Y
 
F
A
 
G
S
 
F
F
 
E
A
 
N
E
 
S
M
 
T
A
 
S
E
 
D
A
 
W
E
 
R
A
 
S
A
 
I
R
 
I
E
 
D
D
 
D
-
 
P
G
 
D
I
 
I
D
 
H
A
 
V
V
 
V
A
 
D
I
 
I
V
 
A
T
|
T
P
 
P
N
|
N
H
 
H
L
 
L
H
|
H
A
 
A
G
 
E
P
 
I
S
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
A
L
 
A
N
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
K
H
 
H
V
 
I
I
 
I
C
 
C
D
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
A
 
R
S
 
T
V
 
G
A
 
E
E
 
E
A
 
S
E
 
K
A
 
A
I
 
M
K
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
V
R
 
K
S
 
D
S
 
K
S
 
N
A
 
I
R
 
V
F
 
H
F
 
M
L
 
V
T
x
A
H
 
F
N
|
N
Y
|
Y
T
 
R
G
 
R
Y
 
T
P
 
P
L
 
A
L
 
V
R
 
A
Q
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
K
M
 
Y
V
 
I
A
 
E
R
 
E
G
 
G
D
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
L
L
 
S
V
 
F
Q
 
R
A
 
G
E
 
T
Y
 
Y
A
 
L
Q
|
Q
D
 
D
W
 
W
L
 
-
T
 
-
N
 
-
V
 
-
I
 
-
E
 
S
Q
 
A
E
 
D
G
 
P
H
 
N
K
 
S
Q
 
P
A
 
L
A
 
S
W
|
W
R
|
R
T
 
F
D
 
Q
P
 
K
A
 
S
Q
 
I
S
 
A
G
 
G
A
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
L
G
 
G
D
|
D
I
 
I
G
 
A
T
 
T
H
|
H
A
 
V
F
 
I
N
 
D
I
 
M
A
 
A
C
 
R
F
 
Y
V
 
L
S
 
V
G
 
G
L
 
E
A
 
F
P
 
-
Q
 
S
A
 
A
L
 
V
S
 
N
A
 
A
E
 
V
L
 
L
H
 
S
S
 
T
F
 
W
G
 
I
P
 
P
G
 
E
R
 
R
-
 
P
-
 
L
-
 
Q
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
R
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
P
-
 
K
-
 
G
-
 
P
-
 
V
Q
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
D
N
 
E
A
 
V
H
 
M
I
 
T
L
 
M
L
 
I
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
V
G
 
G
M
 
S
L
 
V
W
 
E
A
 
A
S
 
T
Q
 
R
I
 
N
A
 
A
V
 
H
G
 
G
C
 
R
E
 
N
N
 
N
S
 
Y
L
 
I
R
 
T
L
 
F
R
 
E
I
 
I
Y
 
H
G
 
G
D
 
T
K
 
E
G
 
G
G
 
S
L
 
I
-
 
V
-
 
F
E
 
N
W
 
Y
E
 
E
H
 
R
Q
 
R
D
 
D
P
 
E
N
 
L
Q
 
Q
M
 
V
T
 
A
F
 
F

Sites not aligning to the query:

1h6dA Oxidized precursor form of glucose-fructose oxidoreductase from zymomonas mobilis complexed with glycerol (see paper)
30% identity, 51% coverage: 39:228/374 of query aligns to 61:241/383 of 1h6dA

query
sites
1h6dA
V
 
I
A
 
E
G
 
A
A
 
L
L
 
V
S
|
S
S
x
G
D
 
N
P
 
A
A
 
E
R
x
K
A
 
A
S
 
K
A
 
I
S
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
I
 
V
D
 
D
P
 
P
D
 
R
R
 
K
-
 
I
-
 
Y
S
 
D
Y
|
Y
A
 
S
S
 
N
F
 
F
A
 
D
E
 
K
M
 
I
A
 
A
E
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
K
E
 
D
D
 
P
G
 
K
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
Y
I
 
I
V
x
I
T
x
L
P
|
P
N
|
N
H
 
S
L
 
L
H
|
H
A
 
A
G
 
E
P
 
F
S
 
A
I
 
I
A
 
R
F
 
A
L
 
F
N
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
K
H
 
H
V
 
V
I
 
M
C
 
C
D
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
M
A
 
A
A
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
C
E
 
Q
A
 
R
I
 
M
K
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
K
S
 
A
S
 
A
S
 
N
A
 
K
R
 
K
F
 
L
F
 
M
L
 
I
T
 
G
H
 
Y
N
x
R
Y
 
C
T
 
H
G
 
Y
Y
 
D
P
 
P
L
 
M
L
 
N
R
 
R
Q
 
A
A
 
A
R
 
V
A
 
K
M
 
L
V
 
I
A
 
R
R
 
E
G
 
N
D
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
K
I
 
L
R
 
G
L
 
M
V
 
V
Q
 
T
A
 
T
E
 
D
Y
 
N
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
W
 
-
L
 
-
T
 
S
N
 
D
V
 
V
I
 
M
E
 
D
Q
 
Q
E
 
N
G
 
D
H
 
P
K
x
A
Q
 
Q
A
 
-
A
 
Q
W
|
W
R
|
R
T
 
L
D
 
R
P
 
R
A
 
E
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
L
G
 
M
D
|
D
I
 
I
G
 
G
T
 
I
H
x
Y
A
 
G
F
 
L
N
 
N
I
 
G
A
 
T
C
 
R
F
 
Y
V
 
L
S
 
L
G
 
G
L
 
E
A
 
E
P
 
P
Q
 
I
A
 
E
L
 
V
S
 
R
A
 
A
E
 
Y
L
 
T
H
 
Y
S
 
S

Sites not aligning to the query:

1rydA Crystal structure of glucose-fructose oxidoreductase from zymomonas mobilis
30% identity, 51% coverage: 39:228/374 of query aligns to 59:239/381 of 1rydA

query
sites
1rydA
V
 
I
A
 
E
G
 
A
A
 
L
L
 
V
S
|
S
S
x
G
D
 
N
P
 
A
A
 
E
R
x
K
A
 
A
S
 
K
A
 
I
S
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
I
 
V
D
 
D
P
 
P
D
 
R
R
 
K
-
 
I
-
 
Y
S
 
D
Y
|
Y
A
 
S
S
 
N
F
 
F
A
 
D
E
 
K
M
 
I
A
 
A
E
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
K
E
 
D
D
 
P
G
 
K
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
Y
I
 
I
V
 
I
T
x
L
P
|
P
N
|
N
H
 
S
L
|
L
H
|
H
A
 
A
G
 
E
P
 
F
S
 
A
I
 
I
A
 
R
F
 
A
L
 
F
N
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
K
H
 
H
V
 
V
I
 
M
C
 
C
D
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
M
A
 
A
A
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
C
E
 
Q
A
 
R
I
 
M
K
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
K
S
 
A
S
 
A
S
 
N
A
 
K
R
 
K
F
 
L
F
 
M
L
 
I
T
 
G
H
 
Y
N
x
R
Y
 
C
T
 
H
G
 
Y
Y
 
D
P
 
P
L
 
M
L
 
N
R
 
R
Q
 
A
A
 
A
R
 
V
A
 
K
M
 
L
V
 
I
A
 
R
R
 
E
G
 
N
D
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
K
I
 
L
R
 
G
L
 
M
V
 
V
Q
 
T
A
 
T
E
 
D
Y
 
N
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
W
 
-
L
 
-
T
 
S
N
 
D
V
 
V
I
 
M
E
 
D
Q
 
Q
E
 
N
G
 
D
H
 
P
K
x
A
Q
 
Q
A
 
-
A
 
Q
W
|
W
R
|
R
T
 
L
D
 
R
P
 
R
A
 
E
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
L
G
 
M
D
 
D
I
 
I
G
 
G
T
 
I
H
x
Y
A
 
G
F
 
L
N
 
N
I
 
G
A
 
T
C
 
R
F
 
Y
V
 
L
S
 
L
G
 
G
L
 
E
A
 
E
P
 
P
Q
 
I
A
 
E
L
 
V
S
 
R
A
 
A
E
x
Y
L
 
T
H
 
Y
S
 
S

Sites not aligning to the query:

1evjA Crystal structure of glucose-fructose oxidoreductase (gfor) delta1-22 s64d (see paper)
31% identity, 48% coverage: 49:228/374 of query aligns to 40:210/340 of 1evjA

query
sites
1evjA
R
 
K
A
 
A
S
 
K
A
 
I
S
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
I
 
V
D
 
D
P
 
P
D
 
R
R
 
K
-
 
I
-
 
Y
S
 
D
Y
 
Y
A
 
S
S
 
N
F
 
F
A
 
D
E
 
K
M
 
I
A
 
A
E
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
K
E
 
D
D
 
P
G
 
K
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
Y
I
 
I
V
 
I
T
x
L
P
|
P
N
|
N
H
 
S
L
 
L
H
|
H
A
 
A
G
 
E
P
 
F
S
 
A
I
 
I
A
 
R
F
 
A
L
 
F
N
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
K
H
 
H
V
 
V
I
 
M
C
 
C
D
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
M
A
 
A
A
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
C
E
 
Q
A
 
R
I
 
M
K
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
K
S
 
A
S
 
A
S
 
N
A
 
K
R
 
K
F
 
L
F
 
M
L
 
I
T
 
G
H
 
Y
N
x
R
Y
 
C
T
 
H
G
 
Y
Y
 
D
P
 
P
L
 
M
L
 
N
R
 
R
Q
 
A
A
 
A
R
 
V
A
 
K
M
 
L
V
 
I
A
 
R
R
 
E
G
 
N
D
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
K
I
 
L
R
 
G
L
 
M
V
 
V
Q
 
T
A
 
T
E
 
D
Y
 
N
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
W
 
-
L
 
-
T
 
S
N
 
D
V
 
V
I
 
M
E
 
D
Q
 
Q
E
 
N
G
 
D
H
 
P
K
 
A
Q
 
Q
A
 
-
A
 
Q
W
|
W
R
|
R
T
 
L
D
 
R
P
 
R
A
 
E
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
L
G
 
M
D
 
D
I
 
I
G
 
G
T
 
I
H
x
Y
A
 
G
F
 
L
N
 
N
I
 
G
A
 
T
C
 
R
F
 
Y
V
 
L
S
 
L
G
 
G
L
 
E
A
 
E
P
 
P
Q
 
I
A
 
E
L
 
V
S
 
R
A
 
A
E
 
Y
L
 
T
H
 
Y
S
 
S

Sites not aligning to the query:

5yaqB Crystal structure of scyllo-inositol dehydrogenase with l-glucose dehydrogenase activity complexed with scyllo-inosose (see paper)
30% identity, 78% coverage: 9:300/374 of query aligns to 2:296/366 of 5yaqB

query
sites
5yaqB
L
 
L
K
 
G
L
 
V
G
 
A
M
 
L
V
 
I
G
|
G
G
x
T
G
|
G
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
F
|
F
I
x
M
G
 
G
A
 
K
V
 
C
H
 
H
R
 
A
I
 
M
A
 
A
A
 
W
R
 
R
M
 
N
D
 
-
D
 
-
R
 
-
F
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
V
A
 
A
G
 
T
A
 
A
L
 
F
S
 
G
S
 
G
D
 
L
P
 
P
A
 
P
R
 
R
A
 
L
S
 
E
A
 
V
S
 
-
A
 
L
A
 
A
E
x
D
L
x
M
G
 
P
I
 
A
D
 
D
P
 
K
D
 
A
R
 
H
S
 
S
Y
 
L
A
 
A
S
 
S
F
 
S
A
 
F
E
 
G
M
 
F
A
 
A
E
 
R
A
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
W
-
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
V
R
 
S
E
 
D
D
 
P
G
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
V
V
 
V
A
 
S
I
 
I
V
x
T
T
|
T
P
 
P
N
|
N
H
 
G
L
 
L
H
|
H
A
 
R
G
 
E
P
 
M
S
 
A
I
 
E
A
 
A
F
 
A
L
 
L
N
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
K
H
 
H
V
 
V
I
 
W
C
 
L
D
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
M
A
 
A
A
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
E
E
 
D
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
I
 
M
K
 
E
D
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
S
 
A
S
 
S
S
 
D
A
 
R
R
 
R
F
 
T
F
 
I
L
 
I
T
 
G
H
 
Y
N
|
N
Y
|
Y
T
 
T
G
 
R
Y
 
S
P
 
P
L
 
A
L
 
F
R
 
R
Q
 
A
A
 
A
R
 
V
A
 
D
M
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
E
G
 
G
D
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
P
R
 
I
L
 
H
V
 
F
Q
 
R
A
 
G
E
 
M
Y
|
Y
A
 
D
Q
x
E
D
 
D
W
 
Y
L
 
M
T
 
A
N
 
D
V
 
P
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
E
 
-
G
 
-
H
 
D
K
 
L
Q
 
P
A
 
W
A
 
S
W
 
W
R
|
R
T
 
L
D
 
T
P
 
R
A
 
K
Q
 
D
S
 
G
G
 
G
A
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
L
G
 
G
D
|
D
I
 
L
G
 
G
T
 
C
H
|
H
A
 
L
F
 
-
N
 
-
I
 
V
A
 
S
C
 
V
F
 
M
V
 
V
S
 
S
G
 
L
L
 
M
A
 
G
P
 
P
Q
 
V
A
 
A
-
 
R
-
 
V
-
 
Y
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
V
L
 
I
S
 
T
A
 
D
E
 
R
L
 
P
H
 
H
S
 
Q
F
 
G
G
 
G
P
 
T
G
 
A
R
 
R
-
 
V
Q
 
E
V
 
N
D
 
E
D
 
D
N
 
Q
A
 
A
H
 
Q
I
 
A
L
 
L
L
 
I
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
T
R
 
S
G
 
G
M
 
E
L
 
F
W
 
S
A
 
C
S
 
S
Q
 
R
I
 
V
A
 
A
V
 
R
G
 
G
C
 
Y
E
 
R
N
 
C
S
 
R
L
 
L
R
 
A
L
 
W
R
 
E
I
 
V
Y
 
Q
G
 
G
D
 
T
K
 
E
G
 
G
G
 
T
L
 
L
E
 
R
W
 
F
E
 
D
H
 
Q
Q
 
E
D
 
R
P
 
M
N
 
N
Q
 
E
M
 
L
T
 
W
F
 
L
T
 
Y
R
 
Q
F
 
P
G
 
G
E
 
R
P
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
G
-
 
F
K
 
R
Q
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T

5ya8A Crystal structure of scyllo-inositol dehydrogenase with l-glucose dehydrogenase activity complexed with myo-inositol (see paper)
30% identity, 78% coverage: 9:300/374 of query aligns to 2:296/366 of 5ya8A

query
sites
5ya8A
L
 
L
K
 
G
L
 
V
G
 
A
M
 
L
V
 
I
G
 
G
G
x
T
G
|
G
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
F
|
F
I
x
M
G
 
G
A
 
K
V
 
C
H
 
H
R
 
A
I
 
M
A
 
A
A
 
W
R
 
R
M
 
N
D
 
-
D
 
-
R
 
-
F
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
V
A
 
A
G
 
T
A
 
A
L
 
F
S
 
G
S
 
G
D
 
L
P
 
P
A
 
P
R
 
R
A
 
L
S
 
E
A
 
V
S
 
-
A
 
L
A
 
A
E
x
D
L
x
M
G
 
P
I
 
A
D
 
D
P
 
K
D
 
A
R
 
H
S
 
S
Y
 
L
A
 
A
S
 
S
F
 
S
A
 
F
E
 
G
M
 
F
A
 
A
E
 
R
A
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
W
-
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
V
R
 
S
E
 
D
D
 
P
G
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
V
V
 
V
A
 
S
I
 
I
V
x
T
T
|
T
P
|
P
N
|
N
H
 
G
L
 
L
H
|
H
A
 
R
G
 
E
P
 
M
S
 
A
I
 
E
A
 
A
F
 
A
L
 
L
N
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
K
H
 
H
V
 
V
I
 
W
C
 
L
D
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
M
A
 
A
A
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
E
E
 
D
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
I
 
M
K
 
E
D
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
S
 
A
S
 
S
S
 
D
A
 
R
R
 
R
F
 
T
F
 
I
L
 
I
T
 
G
H
 
Y
N
|
N
Y
|
Y
T
 
T
G
 
R
Y
 
S
P
 
P
L
 
A
L
 
F
R
 
R
Q
 
A
A
 
A
R
 
V
A
 
D
M
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
E
G
 
G
D
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
P
R
 
I
L
 
H
V
 
F
Q
 
R
A
 
G
E
 
M
Y
|
Y
A
 
D
Q
x
E
D
 
D
W
 
Y
L
 
M
T
 
A
N
 
D
V
 
P
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
E
 
-
G
 
-
H
 
D
K
 
L
Q
 
P
A
 
W
A
 
S
W
 
W
R
|
R
T
 
L
D
 
T
P
 
R
A
 
K
Q
 
D
S
 
G
G
 
G
A
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
L
G
 
G
D
|
D
I
 
L
G
 
G
T
 
C
H
|
H
A
 
L
F
 
-
N
 
-
I
 
V
A
 
S
C
 
V
F
 
M
V
 
V
S
 
S
G
 
L
L
 
M
A
 
G
P
 
P
Q
 
V
A
 
A
-
 
R
-
 
V
-
 
Y
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
V
L
 
I
S
 
T
A
 
D
E
 
R
L
 
P
H
 
H
S
 
Q
F
 
G
G
 
G
P
 
T
G
 
A
R
 
R
-
 
V
Q
 
E
V
 
N
D
 
E
D
 
D
N
 
Q
A
 
A
H
 
Q
I
 
A
L
 
L
L
 
I
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
T
R
 
S
G
 
G
M
 
E
L
 
F
W
 
S
A
 
C
S
 
S
Q
 
R
I
 
V
A
 
A
V
 
R
G
 
G
C
 
Y
E
 
R
N
 
C
S
 
R
L
 
L
R
 
A
L
 
W
R
 
E
I
 
V
Y
 
Q
G
 
G
D
 
T
K
 
E
G
 
G
G
 
T
L
 
L
E
 
R
W
 
F
E
 
D
H
 
Q
Q
 
E
D
 
R
P
 
M
N
 
N
Q
 
E
M
 
L
T
 
W
F
 
L
T
 
Y
R
 
Q
F
 
P
G
 
G
E
 
R
P
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
G
-
 
F
K
 
R
Q
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T

6ktkC Crystal structure of scyllo-inositol dehydrogenase r178a mutant, complexed with nadh and l-glucono-1,5-lactone, from paracoccus laeviglucosivorans (see paper)
28% identity, 78% coverage: 9:300/374 of query aligns to 3:297/368 of 6ktkC

query
sites
6ktkC
L
 
L
K
 
G
L
 
V
G
 
A
M
 
L
V
 
I
G
 
G
G
x
T
G
|
G
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
F
|
F
I
x
M
G
 
G
A
 
K
V
 
C
H
 
H
R
 
A
I
 
M
A
 
A
A
 
W
R
 
R
M
 
N
D
 
-
D
 
-
R
 
-
F
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
V
A
 
A
G
 
T
A
 
A
L
 
F
S
 
G
S
 
G
D
 
L
P
 
P
A
 
P
R
 
R
A
 
L
S
 
E
A
 
V
S
 
-
A
 
L
A
 
A
E
x
D
L
x
M
G
 
P
I
 
A
D
 
D
P
 
K
D
 
A
R
 
H
S
 
S
Y
 
L
A
 
A
S
 
S
F
 
S
A
 
F
E
 
G
M
 
F
A
 
A
E
 
R
A
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
W
-
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
V
R
 
S
E
 
D
D
 
P
G
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
V
V
 
V
A
 
S
I
 
I
V
x
T
T
|
T
P
 
P
N
|
N
H
 
G
L
 
L
H
|
H
A
 
R
G
 
E
P
 
M
S
 
A
I
 
E
A
 
A
F
 
A
L
 
L
N
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
K
H
 
H
V
 
V
I
 
W
C
 
L
D
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
M
A
 
A
A
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
E
E
 
D
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
I
 
M
K
 
E
D
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
S
 
A
S
 
S
S
 
D
A
 
R
R
 
R
F
 
T
F
 
I
L
 
I
T
 
G
H
 
Y
N
|
N
Y
|
Y
T
 
T
G
 
R
Y
 
S
P
 
P
L
 
A
L
 
F
R
 
R
Q
 
A
A
 
A
R
 
V
A
 
D
M
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
E
G
 
G
D
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
P
R
 
I
L
 
H
V
 
F
Q
 
R
A
 
G
E
 
M
Y
|
Y
A
 
D
Q
x
E
D
 
D
W
x
Y
L
 
M
T
 
A
N
 
D
V
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
E
 
-
G
 
-
H
 
-
K
 
P
Q
 
D
A
 
L
A
 
P
W
 
W
R
 
S
T
 
W
D
 
A
P
 
L
A
 
T
Q
 
R
S
 
K
G
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
L
I
 
G
G
 
A
D
 
L
I
 
G
G
x
D
T
 
L
H
 
G
A
 
C
F
x
H
N
 
L
I
 
V
A
 
S
C
 
V
F
 
M
V
 
V
S
 
S
G
 
L
L
 
M
A
 
G
P
 
P
Q
 
V
A
 
A
-
 
R
-
 
V
-
 
Y
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
V
L
 
I
S
 
T
A
 
D
E
 
R
L
 
P
H
 
H
S
 
Q
F
 
G
G
 
G
P
 
T
G
 
A
R
 
R
-
 
V
Q
 
E
V
 
N
D
 
E
D
 
D
N
 
Q
A
 
A
H
 
Q
I
 
A
L
 
L
L
 
I
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
T
R
 
S
G
 
G
M
 
E
L
 
F
W
 
S
A
 
C
S
 
S
Q
 
R
I
 
V
A
 
A
V
 
R
G
 
G
C
 
Y
E
 
R
N
 
C
S
 
R
L
 
L
R
 
A
L
 
W
R
 
E
I
 
V
Y
 
Q
G
 
G
D
 
T
K
 
E
G
 
G
G
 
T
L
 
L
E
 
R
W
 
F
E
 
D
H
 
Q
Q
 
E
D
 
R
P
 
M
N
 
N
Q
 
E
M
 
L
T
 
W
F
 
L
T
 
Y
R
 
Q
F
 
P
G
 
G
E
 
R
P
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
G
-
 
F
K
 
R
Q
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T

6jw6A The crystal structure of kand2 in complex with NAD (see paper)
30% identity, 72% coverage: 9:278/374 of query aligns to 2:250/341 of 6jw6A

query
sites
6jw6A
L
 
V
K
 
R
L
 
V
G
 
G
M
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
|
G
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
F
|
F
I
x
M
G
 
G
A
 
G
V
 
V
H
 
H
R
 
A
-
 
E
-
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
H
M
 
P
D
 
G
D
 
A
R
 
R
F
 
L
Q
 
E
L
 
A
V
 
V
A
 
H
G
 
-
A
 
-
L
 
-
S
x
D
S
x
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
R
 
A
A
 
A
S
 
R
A
 
D
S
 
L
A
 
A
A
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
E
R
 
R
S
 
F
Y
 
R
A
 
A
S
 
E
F
 
R
A
 
A
E
 
E
M
 
P
A
 
S
E
 
W
A
 
A
E
 
D
A
 
L
A
 
L
R
 
A
E
 
D
D
 
P
G
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
L
V
 
L
A
 
I
I
 
I
V
x
T
T
|
T
P
|
P
N
|
N
H
 
G
L
|
L
H
|
H
A
 
H
G
 
R
P
x
Q
S
 
A
I
 
A
A
 
E
F
 
A
L
 
L
N
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
K
H
 
H
V
 
V
I
 
L
C
 
V
D
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
G
A
 
V
S
 
T
V
 
P
A
 
E
E
 
Q
-
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
L
I
 
V
K
 
E
D
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
R
S
 
H
S
 
D
S
 
R
A
 
-
R
 
-
F
 
-
F
 
V
L
 
L
T
 
A
H
 
H
-
 
G
-
 
S
N
|
N
Y
 
F
T
 
V
G
 
H
Y
 
S
P
 
P
L
 
K
L
 
F
R
 
V
Q
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
Q
M
 
L
V
 
V
A
 
A
R
 
D
G
 
T
D
 
E
-
 
A
L
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
P
R
 
H
L
 
L
V
 
V
Q
 
R
A
 
-
E
 
-
Y
 
-
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
W
 
-
L
 
-
T
 
-
N
 
-
V
 
V
I
 
V
E
 
F
Q
 
R
E
 
N
G
 
S
H
 
G
K
 
P
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
W
|
W
R
 
A
T
 
A
D
 
S
P
 
K
A
 
D
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
L
G
 
L
D
 
D
I
 
L
G
 
G
T
 
C
H
|
H
A
 
A
F
 
V
N
 
E
I
 
L
A
 
C
-
 
R
C
 
W
F
 
L
V
 
L
S
 
D
G
 
G
L
 
A
A
 
D
P
 
V
Q
 
E
A
 
S
L
 
V
S
 
S
A
 
A
E
 
R
L
 
L
H
 
Q
S
 
R
F
 
V
G
 
R
P
 
P
G
 
-
R
 
P
Q
 
A
V
 
L
D
 
E
D
 
D
N
 
Q
A
 
A
H
 
L
I
 
L
L
 
V
L
 
M
R
 
E
Y
 
F
A
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
V
G
 
G
M
 
Q
L
 
C
W
 
D
A
 
V
S
 
S
Q
 
W
I
 
V
A
 
T
V
 
Q
G
 
G
C
 
G
E
 
E
N
 
Q
S
 
-
L
 
V
R
 
T
L
 
A
R
 
E
I
 
I
Y
 
I
G
 
G
D
 
T
K
 
K
G
 
G
G
 
R
L
 
V
E
 
E

Sites not aligning to the query:

5a05A Crystal structure of aldose-aldose oxidoreductase from caulobacter crescentus complexed with maltotriose (see paper)
26% identity, 88% coverage: 39:368/374 of query aligns to 30:330/335 of 5a05A

query
sites
5a05A
V
 
L
A
 
A
G
 
A
A
 
L
L
 
V
S
|
S
S
x
G
D
x
T
P
 
P
A
 
E
R
x
K
A
 
L
S
 
K
A
 
T
S
 
Y
A
 
G
A
 
E
E
 
Q
L
 
Y
G
 
G
I
 
I
D
 
P
P
 
E
D
 
T
R
 
H
-
 
R
-
 
Y
S
 
S
Y
|
Y
A
 
E
S
 
T
F
 
F
A
 
D
E
 
R
M
 
I
A
 
I
E
 
D
A
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
N
D
 
P
G
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
I
V
 
V
A
 
Y
I
 
V
V
x
I
T
|
T
P
|
P
N
|
N
H
 
S
L
|
L
H
|
H
A
 
R
G
 
P
P
 
F
S
 
T
I
 
E
A
 
R
F
 
A
L
 
A
N
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
K
H
 
H
V
 
V
I
 
M
C
 
C
D
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
M
A
 
A
A
 
N
S
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
A
I
 
M
K
 
I
D
 
A
A
 
A
A
 
C
R
 
K
S
 
K
S
 
A
S
 
G
A
 
R
R