SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3916 FitnessBrowser__Marino:GFF3916 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 9 hits to proteins with known functional sites (download)

2hmfA Structure of a threonine sensitive aspartokinase from methanococcus jannaschii complexed with mg-adp and aspartate (see paper)
27% identity, 95% coverage: 16:478/489 of query aligns to 2:463/464 of 2hmfA

query
sites
2hmfA
T
 
T
V
 
V
E
 
M
K
 
K
I
 
F
G
|
G
G
 
G
T
 
T
S
 
S
M
 
V
S
 
G
N
 
S
Y
 
G
E
 
E
A
 
R
V
 
I
R
 
R
D
 
H
N
 
V
I
 
A
I
 
K
I
 
I
G
 
V
N
 
T
R
 
K
K
 
R
K
 
K
D
 
K
N
 
E
L
 
D
Y
 
D
Q
 
D
R
 
V
I
 
V
F
 
V
V
 
V
V
 
V
S
|
S
A
 
A
Y
 
M
G
 
S
G
 
E
V
 
V
T
|
T
N
 
N
E
 
A
L
 
L
L
 
V
E
 
E
H
 
I
K
 
S
K
 
Q
T
 
Q
G
 
A
E
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
L
D
 
D
A
 
V
E
 
R
S
 
D
D
 
I
W
 
A
A
 
K
W
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
-
L
 
-
T
 
-
K
 
-
L
 
F
V
 
I
K
 
K
F
 
F
L
 
I
T
 
R
D
 
E
I
 
K
N
 
H
G
 
Y
E
 
K
L
 
A
F
 
I
E
 
E
D
 
E
P
 
A
M
 
I
-
 
K
-
 
S
-
 
E
-
 
E
L
 
I
K
 
K
Q
 
E
Q
 
E
A
 
V
D
 
K
Q
 
K
F
 
I
I
 
I
T
 
D
D
 
S
R
 
R
I
 
I
E
 
E
G
 
E
V
 
L
R
 
E
G
 
K
C
 
V
L
 
L
I
 
I
D
 
G
L
 
V
Q
 
A
R
 
Y
L
 
L
C
 
G
S
 
E
Y
 
L
G
 
T
Q
 
P
F
 
-
Q
 
K
L
 
S
E
 
R
E
 
D
H
 
Y
L
 
I
L
 
L
T
 
S
V
 
F
R
 
G
E
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
S
-
 
P
M
 
I
L
 
L
A
 
S
G
 
G
I
 
A
G
 
I
E
 
R
A
 
D
H
 
L
S
 
G
A
 
E
F
 
K
N
 
S
T
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
E
L
 
G
Q
 
G
Q
 
E
E
 
A
G
 
G
I
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
D
-
 
N
-
 
N
-
 
F
-
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
R
F
 
V
V
 
K
D
 
R
L
 
L
T
 
E
G
 
-
W
 
-
R
 
V
D
 
K
N
 
E
E
 
R
L
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
L
D
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
L
K
 
K
Q
 
E
A
 
G
F
 
I
D
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Y
x
F
-
 
I
A
 
G
Q
 
T
C
 
T
K
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
Y
M
 
I
R
 
T
T
 
T
F
 
L
D
 
G
R
|
R
G
|
G
Y
 
G
S
|
S
E
 
D
M
 
Y
T
 
S
F
 
A
S
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
G
V
 
Y
I
 
G
T
 
L
E
 
D
A
 
A
R
 
D
E
 
I
A
 
I
I
 
E
I
 
I
H
 
W
K
x
T
E
x
D
Y
x
V
H
 
S
-
 
G
L
 
V
S
x
Y
S
 
T
A
x
T
D
|
D
P
|
P
N
x
R
I
 
L
V
 
V
G
 
P
A
 
T
D
 
A
K
 
R
V
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
-
G
 
-
R
 
K
T
 
L
N
 
S
Y
 
Y
D
 
I
V
 
E
A
 
A
D
 
M
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
N
 
Y
L
 
F
G
 
G
M
 
A
E
x
K
A
x
V
I
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
A
 
T
G
 
I
K
 
E
G
 
P
M
 
A
R
 
M
Q
 
E
N
 
K
E
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
I
R
 
L
V
 
V
M
 
K
N
 
N
T
 
T
F
 
F
E
 
E
P
 
P
E
 
E
H
 
S
T
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
N
D
 
D
Y
 
M
V
 
E
S
 
M
E
 
S
K
 
D
P
 
S
Q
 
I
V
 
V
E
 
K
I
 
A
I
 
I
A
 
S
G
 
T
A
 
I
K
 
K
G
 
N
V
 
V
F
 
A
A
 
L
V
 
I
E
 
N
V
 
I
F
 
F
D
 
G
Q
 
A
D
 
G
M
 
M
Q
 
V
G
 
G
E
 
V
P
 
S
G
 
G
S
 
T
D
 
A
R
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
F
D
 
K
V
 
A
L
 
L
S
 
G
R
 
E
F
 
E
K
 
E
V
 
V
R
 
N
-
 
V
-
 
I
F
 
L
M
 
I
S
 
S
K
 
Q
D
 
G
T
 
S
N
 
S
A
 
E
N
 
T
T
 
N
I
 
I
T
 
S
H
 
L
Y
 
V
V
 
V
G
 
S
S
 
E
T
 
-
L
 
-
K
 
E
H
 
D
V
 
V
K
 
D
R
 
K
V
 
A
V
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
E
 
R
E
 
E
F
 
F
P
 
G
N
 
D
A
 
F
E
 
L
I
 
N
N
 
N
T
 
N
-
 
L
-
 
I
-
 
R
-
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
V
-
 
D
R
 
K
K
 
D
V
 
V
A
 
C
V
 
V
V
 
I
S
 
S
A
 
V
I
 
V
G
 
G
S
 
A
D
 
G
M
 
M
K
 
R
-
 
G
V
 
A
P
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
A
A
 
G
R
 
K
S
 
I
V
 
F
K
 
T
A
 
A
L
 
V
A
 
S
D
 
E
E
 
S
E
 
G
I
 
A
S
 
N
I
 
I
L
 
K
A
 
M
L
 
I
H
 
A
Q
 
Q
C
 
G
M
 
S
R
 
S
Q
 
E
V
 
V
D
 
N
I
 
I
Q
 
S
F
 
F
V
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
D
 
K
D
 
D
Y
 
L
E
 
L
K
 
N
A
 
C
I
 
V
V
 
R
A
 
K
L
 
L
H
 
H
G
 
E
V
 
K
L
 
F
I
 
I
E
 
E

3c1nA Crystal structure of allosteric inhibition threonine-sensitive aspartokinase from methanococcus jannaschii with l-threonine (see paper)
28% identity, 95% coverage: 16:478/489 of query aligns to 2:458/458 of 3c1nA

query
sites
3c1nA
T
 
T
V
 
V
E
 
M
K
 
K
I
 
F
G
|
G
G
|
G
T
|
T
S
|
S
M
 
V
S
 
G
N
 
S
Y
 
G
E
 
E
A
 
R
V
 
I
R
 
R
D
 
H
N
 
V
I
 
A
I
 
K
I
 
I
G
 
V
N
 
T
R
 
K
K
 
R
K
 
K
D
 
K
N
 
E
L
 
D
Y
 
D
Q
 
D
R
 
V
I
 
V
F
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
S
A
 
A
Y
 
M
G
 
S
G
 
E
V
 
V
T
 
T
N
 
N
E
 
A
L
 
L
L
 
V
E
 
E
H
 
I
K
 
S
K
 
Q
T
 
Q
G
 
A
E
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
L
D
 
D
A
 
V
E
 
R
S
 
D
D
 
I
W
 
A
A
 
K
W
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
-
L
 
-
T
 
-
K
 
-
L
 
F
V
 
I
K
 
K
F
 
F
L
 
I
T
 
R
D
 
E
I
 
K
N
 
H
G
 
Y
E
 
K
L
 
A
F
 
I
E
 
E
D
 
E
P
 
A
M
 
I
-
 
S
-
 
E
-
 
E
L
 
I
K
 
K
Q
 
E
Q
 
E
A
 
V
D
 
K
Q
 
K
F
 
I
I
 
I
T
 
D
D
 
S
R
 
R
I
 
I
E
 
E
G
 
E
V
 
L
R
 
E
G
 
K
C
 
V
L
 
L
I
 
I
D
 
G
L
 
V
Q
 
A
R
 
Y
L
 
L
C
 
G
S
 
E
Y
 
L
G
 
T
Q
 
P
F
 
-
Q
 
K
L
 
S
E
 
R
E
 
D
H
 
Y
L
 
I
L
 
L
T
 
S
V
 
F
R
 
G
E
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
S
-
 
P
M
 
I
L
 
L
A
 
S
G
 
G
I
 
A
G
 
I
E
 
R
A
 
D
H
 
L
S
 
G
A
 
E
F
 
K
N
 
S
T
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
E
L
 
G
Q
 
G
Q
 
E
E
 
A
G
 
G
I
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
D
-
 
N
-
 
N
-
 
F
-
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
R
F
 
V
V
 
K
D
 
R
L
 
L
T
 
E
G
 
-
W
 
-
R
 
V
D
 
K
N
 
E
E
 
R
L
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
L
D
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
L
K
 
K
Q
 
E
A
 
G
F
 
I
D
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Y
 
F
-
 
I
A
 
G
Q
 
T
C
 
T
K
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
Y
M
 
I
R
 
T
T
 
T
F
 
L
D
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
G
S
 
S
E
 
D
M
 
Y
T
 
S
F
 
A
S
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
G
V
 
Y
I
 
G
T
 
L
E
 
D
A
 
A
R
 
D
E
 
I
A
 
I
I
 
E
I
 
I
H
x
W
K
x
T
E
x
D
Y
 
V
H
 
S
-
 
G
L
 
V
S
 
Y
S
 
T
A
 
T
D
 
D
P
 
P
N
 
R
I
 
L
V
 
V
G
 
P
A
 
T
D
 
A
K
 
R
V
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
-
G
 
-
R
 
K
T
 
L
N
 
S
Y
 
Y
D
 
I
V
 
E
A
 
A
D
 
M
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
N
 
Y
L
 
F
G
 
G
M
 
A
E
 
K
A
 
V
I
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
A
 
T
G
 
I
K
 
E
G
 
P
M
 
A
R
 
M
Q
 
E
N
 
K
E
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
I
R
 
L
V
 
V
M
 
K
N
 
N
T
 
T
F
 
F
E
 
E
P
 
P
E
 
E
H
 
S
T
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
N
D
 
D
Y
 
M
V
 
D
S
 
S
E
 
-
K
 
-
P
 
-
Q
 
I
V
 
V
E
 
K
I
 
A
I
 
I
A
 
S
G
 
T
A
 
I
K
 
K
G
 
N
V
 
V
F
 
A
A
 
L
V
 
I
E
 
N
V
 
I
F
 
F
D
 
G
Q
 
A
D
 
G
M
 
M
Q
 
V
G
 
G
E
 
V
P
 
S
G
 
G
S
 
T
D
 
A
R
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
F
D
 
K
V
 
A
L
 
L
S
 
G
R
 
E
F
 
E
K
 
E
V
 
V
R
 
N
-
 
V
-
 
I
F
 
L
M
 
I
S
 
S
K
 
Q
D
 
G
T
 
S
N
 
S
A
 
E
N
 
T
T
 
N
I
 
I
T
 
S
H
 
L
Y
 
V
V
 
V
G
 
S
S
 
E
T
 
-
L
 
-
K
 
E
H
 
D
V
 
V
K
 
D
R
 
K
V
 
A
V
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
E
 
R
E
 
E
F
 
F
P
 
G
N
 
D
A
 
L
E
 
N
I
 
N
N
 
N
T
 
L
-
 
I
-
 
R
-
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
V
-
 
D
R
 
K
K
 
D
V
 
V
A
 
C
V
 
V
V
 
I
S
 
S
A
 
V
I
 
V
G
 
G
S
 
A
D
 
G
M
 
M
K
 
R
-
 
G
V
x
A
P
 
K
G
 
G
I
|
I
L
x
A
A
 
G
R
 
K
S
 
I
V
 
F
K
 
T
A
 
A
L
 
V
A
 
S
D
 
E
E
 
S
E
 
G
I
 
A
S
x
N
I
|
I
L
 
K
A
 
M
L
 
I
H
 
A
Q
|
Q
C
 
G
M
 
S
R
 
S
Q
x
E
V
 
V
D
 
N
I
 
I
Q
 
S
F
 
F
V
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
D
 
K
D
 
D
Y
 
L
E
 
L
K
 
N
A
 
C
I
 
V
V
 
R
A
 
K
L
 
L
H
 
H
G
 
E
V
 
K
L
 
F
I
 
I
E
 
E

3c1mC Cyrstal structure of threonine-sensitive aspartokinase from methanococcus jannaschii with mgamp-pnp and l-aspartate (see paper)
27% identity, 95% coverage: 16:478/489 of query aligns to 2:467/468 of 3c1mC

query
sites
3c1mC
T
 
T
V
 
V
E
 
M
K
|
K
I
 
F
G
|
G
G
|
G
T
 
T
S
 
S
M
 
V
S
 
G
N
 
S
Y
 
G
E
 
E
A
 
R
V
 
I
R
 
R
D
 
H
N
 
V
I
 
A
I
 
K
I
 
I
G
 
V
N
 
T
R
 
K
K
 
R
K
 
K
D
 
K
N
 
E
L
 
D
Y
 
D
Q
 
D
R
 
V
I
 
V
F
 
V
V
 
V
V
 
V
S
|
S
A
 
A
Y
 
M
G
 
S
G
 
E
V
 
V
T
|
T
N
 
N
E
 
A
L
 
L
L
 
V
E
 
E
H
 
I
K
 
S
K
 
Q
T
 
Q
G
 
A
E
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
L
D
 
D
A
 
V
E
 
R
S
 
D
D
 
I
W
 
A
A
 
K
W
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
-
L
 
-
T
 
-
K
 
-
L
 
F
V
 
I
K
 
K
F
 
F
L
 
I
T
 
R
D
 
E
I
 
K
N
 
H
G
 
Y
E
 
K
L
 
A
F
 
I
E
 
E
D
 
E
P
 
A
M
 
I
-
 
K
-
 
S
-
 
E
-
 
E
L
 
I
K
 
K
Q
 
E
Q
 
E
A
 
V
D
 
K
Q
 
K
F
 
I
I
 
I
T
 
D
D
 
S
R
 
R
I
 
I
E
 
E
G
 
E
V
 
L
R
 
E
G
 
K
C
 
V
L
 
L
I
 
I
D
 
G
L
 
V
Q
 
A
R
 
Y
L
 
L
C
 
G
S
 
E
Y
 
L
G
 
T
Q
 
P
F
 
-
Q
 
K
L
 
S
E
 
R
E
 
D
H
 
Y
L
 
I
L
 
L
T
 
S
V
 
F
R
 
G
E
|
E
-
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
S
-
 
P
M
 
I
L
 
L
A
 
S
G
 
G
I
 
A
G
 
I
E
 
R
A
 
D
H
 
L
S
 
G
A
 
E
F
 
K
N
 
S
T
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
E
L
 
G
Q
 
G
Q
 
E
E
 
A
G
 
G
I
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
D
-
 
N
-
 
N
-
 
F
-
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
R
F
 
V
V
 
K
D
 
R
L
 
L
T
 
E
G
 
-
W
 
-
R
 
V
D
 
K
N
 
E
E
 
R
L
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
L
D
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
L
K
 
K
Q
 
E
A
 
G
F
 
I
D
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Y
x
F
-
 
I
A
 
G
Q
 
T
C
 
T
K
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
Y
M
 
I
R
 
T
T
 
T
F
 
L
D
 
G
R
|
R
G
|
G
Y
 
G
S
|
S
E
 
D
M
 
Y
T
 
S
F
 
A
S
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
G
V
 
Y
I
 
G
T
 
L
E
 
D
A
 
A
R
 
D
E
 
I
A
 
I
I
 
E
I
 
I
H
 
W
K
x
T
E
x
D
Y
 
V
H
 
S
-
 
G
L
 
V
S
x
Y
S
 
T
A
 
T
D
|
D
P
|
P
N
x
R
I
 
L
V
 
V
G
 
P
A
 
T
D
 
A
K
 
R
V
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
-
G
 
-
R
 
K
T
 
L
N
 
S
Y
 
Y
D
 
I
V
 
E
A
 
A
D
 
M
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
N
 
Y
L
 
F
G
 
G
M
 
A
E
x
K
A
x
V
I
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
A
 
T
G
 
I
K
 
E
G
 
P
M
 
A
R
 
M
Q
 
E
N
 
K
E
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
I
R
 
L
V
 
V
M
 
K
N
 
N
T
 
T
F
 
F
E
 
E
P
 
P
E
 
E
H
 
S
T
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
N
D
 
D
Y
 
M
V
 
E
S
 
M
E
 
S
K
 
D
P
 
S
Q
 
I
V
 
V
E
 
K
I
 
A
I
 
I
A
 
S
G
 
T
A
 
I
K
 
K
G
 
N
V
 
V
F
 
A
A
 
L
V
 
I
E
 
N
V
 
I
F
 
F
D
 
G
Q
 
A
D
 
G
M
 
M
Q
 
V
G
 
G
E
 
V
P
 
S
G
 
G
S
 
T
D
 
A
R
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
F
D
 
K
V
 
A
L
 
L
S
 
G
R
 
E
F
 
E
K
 
E
V
 
V
R
 
N
-
 
V
-
 
I
F
 
L
M
 
I
S
 
S
K
 
Q
D
 
G
T
 
S
N
 
S
A
 
E
N
 
T
T
 
N
I
 
I
T
 
S
H
 
L
Y
 
V
V
 
V
G
 
S
S
 
E
T
 
-
L
 
-
K
 
E
H
 
D
V
 
V
K
 
D
R
 
K
V
 
A
V
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
E
 
R
E
 
E
F
 
F
P
 
G
N
 
D
A
 
G
E
 
K
-
 
K
-
 
S
-
 
F
I
 
L
N
 
N
T
 
N
-
 
N
-
 
L
-
 
I
-
 
R
-
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
V
-
 
D
R
 
K
K
 
D
V
 
V
A
 
C
V
 
V
V
 
I
S
 
S
A
 
V
I
 
V
G
 
G
S
 
A
D
 
G
M
 
M
K
 
R
-
 
G
V
 
A
P
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
A
A
 
G
R
 
K
S
 
I
V
 
F
K
 
T
A
 
A
L
 
V
A
 
S
D
 
E
E
 
S
E
 
G
I
 
A
S
 
N
I
 
I
L
 
K
A
 
M
L
 
I
H
 
A
Q
 
Q
C
 
G
M
 
S
R
 
S
Q
 
E
V
 
V
D
 
N
I
 
I
Q
 
S
F
 
F
V
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
D
 
K
D
 
D
Y
 
L
E
 
L
K
 
N
A
 
C
I
 
V
V
 
R
A
 
K
L
 
L
H
 
H
G
 
E
V
 
K
L
 
F
I
 
I
E
 
E

2cdqA Crystal structure of arabidopsis thaliana aspartate kinase complexed with lysine and s- adenosylmethionine (see paper)
23% identity, 95% coverage: 14:478/489 of query aligns to 3:460/470 of 2cdqA

query
sites
2cdqA
L
 
I
H
 
T
T
 
C
V
 
V
E
 
M
K
 
K
I
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
S
S
 
S
M
 
V
S
 
A
N
 
S
Y
 
A
E
 
E
A
 
R
V
 
M
R
 
K
D
 
E
-
 
V
-
 
A
N
 
D
I
 
L
I
 
I
I
 
L
G
 
T
N
 
F
R
 
P
K
 
E
K
 
E
D
 
S
N
 
P
L
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
I
 
V
F
 
I
V
 
V
V
 
L
S
|
S
A
|
A
Y
 
M
G
 
G
G
 
K
V
 
T
T
|
T
N
 
N
E
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
-
H
 
-
K
 
-
K
 
L
T
 
A
G
 
G
E
 
E
P
 
K
G
 
A
V
 
V
Y
 
S
A
 
C
L
 
G
F
 
V
A
 
S
D
 
N
A
 
A
E
 
S
S
 
E
D
 
I
W
 
-
A
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
E
D
 
E
L
 
L
T
 
S
K
 
I
L
 
I
V
 
K
K
 
E
F
 
L
L
 
H
T
 
I
D
 
R
I
 
T
N
 
V
G
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
N
E
 
I
D
 
D
P
 
P
M
 
S
L
 
V
K
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
D
 
-
Q
 
-
F
 
-
I
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
I
R
 
L
G
 
T
C
 
Y
L
 
L
I
 
E
D
 
E
L
 
L
Q
 
E
R
 
Q
L
 
L
C
 
L
S
 
K
Y
 
-
G
 
G
Q
 
I
F
 
A
Q
 
M
L
 
M
E
 
K
E
 
E
H
 
L
L
 
T
L
 
L
T
 
R
V
 
T
R
 
R
E
 
D
M
 
Y
L
 
L
A
 
V
G
 
S
I
 
F
G
 
G
E
|
E
A
 
C
H
 
L
S
 
S
A
 
T
F
 
R
N
 
I
T
 
F
A
 
A
L
 
A
K
 
Y
L
 
L
Q
 
N
Q
 
T
E
 
I
G
 
G
I
 
V
N
 
K
A
 
A
R
 
R
-
 
Q
-
 
Y
-
 
D
-
 
A
-
 
F
-
 
E
-
 
I
-
 
G
F
 
F
V
 
I
D
 
T
L
 
T
T
 
D
G
 
D
W
 
F
R
 
T
D
 
N
N
 
G
E
 
D
L
 
I
L
 
L
-
 
E
-
 
A
P
 
T
L
 
Y
D
 
P
E
 
A
K
 
V
L
 
A
K
 
K
Q
 
R
A
 
L
F
 
Y
D
 
D
A
 
D
V
 
W
D
 
M
L
 
H
T
 
D
R
 
P
E
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Y
 
F
-
 
L
-
 
G
A
 
K
Q
 
G
C
 
W
K
 
K
E
 
T
G
 
G
L
 
A
M
 
V
R
 
T
T
 
T
F
 
L
D
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
G
S
 
S
E
 
D
M
 
L
T
 
T
F
 
A
S
 
T
R
 
T
V
 
I
A
 
G
V
 
K
I
 
A
T
 
L
E
 
G
A
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
I
I
 
Q
I
 
V
H
 
W
K
 
K
E
 
D
Y
 
V
H
 
D
-
 
G
L
 
V
S
 
L
S
 
T
A
 
C
D
 
D
P
 
P
N
 
T
I
 
I
V
 
Y
G
 
-
A
 
-
D
 
K
K
 
R
V
 
A
V
 
T
P
 
P
L
 
V
G
 
P
R
 
Y
T
 
L
N
 
T
Y
 
F
D
 
D
V
 
E
A
 
A
D
 
A
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
N
 
Y
L
 
F
G
 
G
M
 
A
E
 
Q
A
 
V
I
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
Q
A
 
S
G
 
M
K
 
R
G
 
P
M
 
A
R
 
R
Q
 
E
N
 
G
E
 
E
I
 
I
P
 
P
L
 
V
R
 
R
V
 
V
M
 
K
N
 
N
T
 
S
F
 
Y
E
 
N
P
 
P
E
 
K
H
 
A
T
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
K
D
 
T
Y
 
R
V
 
D
S
 
M
E
 
T
K
 
K
P
 
S
Q
 
I
V
 
L
E
 
T
I
 
S
I
 
I
A
 
V
G
 
L
A
 
K
K
 
R
G
 
N
V
 
V
F
 
T
A
 
M
V
 
L
E
 
D
V
 
I
F
 
A
D
 
S
Q
 
T
D
 
R
M
|
M
Q
 
L
G
 
G
E
x
Q
P
 
V
G
 
G
S
x
F
D
x
L
R
 
A
R
 
K
I
 
V
L
 
F
D
 
S
V
 
I
L
 
F
S
 
E
R
 
E
F
 
L
K
x
G
V
x
I
R
x
S
F
x
V
M
x
D
S
 
V
K
 
V
D
 
A
T
 
T
N
 
S
A
 
E
N
 
V
T
 
S
I
 
I
T
 
S
H
 
L
Y
 
T
V
 
L
G
 
D
S
 
P
T
 
S
L
 
K
K
 
L
H
x
W
V
x
S
K
x
R
R
 
E
V
x
L
V
 
I
K
 
Q
A
 
Q
-
x
E
-
 
L
-
 
D
-
 
H
L
 
V
K
 
V
E
 
E
E
 
E
F
 
L
P
 
E
N
 
K
-
 
I
A
 
A
E
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
L
R
 
L
K
 
K
-
 
G
V
 
R
A
 
A
V
 
I
V
 
I
S
 
S
A
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
N
D
 
V
M
 
Q
K
 
H
V
 
S
P
 
S
G
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
E
R
 
R
S
 
A
V
 
F
K
 
H
A
 
V
L
 
L
A
 
Y
D
 
T
E
 
K
E
 
G
I
 
V
S
 
N
I
 
V
L
 
Q
A
 
M
L
 
I
H
 
S
Q
 
Q
C
 
G
M
 
A
R
 
S
Q
 
K
V
 
V
D
 
N
I
 
I
Q
 
S
F
 
F
V
 
I
V
 
V
D
 
N
E
 
E
D
 
A
D
 
E
Y
 
A
E
 
E
K
 
G
A
 
C
I
 
V
V
 
Q
A
 
A
L
 
L
H
 
H
G
 
K
V
 
S
L
 
F
I
 
F
E
 
E

O60163 Probable aspartokinase; Aspartate kinase; EC 2.7.2.4 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
26% identity, 75% coverage: 112:479/489 of query aligns to 94:497/519 of O60163

query
sites
O60163
Q
 
Q
Q
 
A
A
 
A
D
 
R
Q
 
D
F
 
F
I
 
I
T
 
Q
D
 
D
R
 
V
I
 
-
E
 
-
G
 
G
V
 
I
R
 
Q
G
 
D
C
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
D
-
 
A
L
 
F
Q
 
H
R
 
A
L
 
D
C
 
C
S
 
-
Y
 
-
G
 
-
Q
 
-
F
 
V
Q
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
Q
H
 
Y
L
 
L
L
 
N
T
 
A
V
 
I
R
 
R
-
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
E
-
 
V
-
 
S
-
 
P
-
 
R
-
 
T
-
 
R
E
 
D
M
 
L
L
 
V
A
 
I
G
 
G
I
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
R
H
 
L
S
 
S
A
 
C
F
 
R
N
 
F
T
 
M
A
 
A
L
 
A
K
 
V
L
 
L
Q
 
K
Q
 
D
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
N
 
D
A
 
S
R
 
E
F
 
F
V
 
I
D
 
D
L
 
M
T
 
S
G
 
H
-
 
I
-
 
I
-
 
D
-
 
E
-
 
Q
-
 
R
-
 
E
W
 
W
R
 
R
D
 
N
N
 
L
E
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
F
L
 
Y
L
 
A
P
 
Y
L
 
L
D
 
A
E
 
S
K
 
Q
L
 
L
K
 
A
Q
 
S
A
 
K
F
 
V
D
 
T
A
 
A
V
 
V
D
 
G
L
 
-
T
 
-
R
 
N
E
 
K
L
 
V
P
 
P
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Y
 
F
-
 
F
A
 
G
Q
 
M
C
 
V
K
 
P
E
 
G
G
 
G
L
 
L
M
 
L
R
 
S
T
 
Q
F
 
I
D
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
E
 
D
M
 
F
T
 
C
F
 
A
S
 
A
R
 
L
V
 
L
A
 
A
V
 
V
I
 
G
T
 
L
E
 
N
A
 
A
R
 
D
E
 
E
A
 
L
I
 
Q
I
 
I
H
 
W
K
 
K
E
 
E
Y
 
V
H
 
D
-
 
G
L
 
I
S
 
F
S
 
T
A
 
A
D
 
D
P
 
P
N
 
R
I
 
K
V
 
V
G
 
P
A
 
T
D
 
A
K
 
R
V
 
L
V
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
-
R
 
-
T
 
I
N
 
T
Y
 
P
D
 
E
V
 
E
A
 
A
D
 
A
Q
 
E
L
 
L
A
 
T
N
 
Y
L
 
Y
G
 
G
M
 
S
E
 
E
A
 
V
I
 
I
H
 
H
P
 
P
R
 
F
A
 
T
G
 
M
K
 
S
G
 
Q
M
 
V
R
 
V
Q
 
H
N
 
A
E
 
R
I
 
I
P
 
P
L
 
I
R
 
R
V
 
I
M
 
K
N
 
N
T
 
V
F
 
G
E
 
N
P
 
P
E
 
R
H
 
G
T
 
K
G
 
G
T
 
T
L
 
V
I
 
I
T
 
F
G
 
P
D
 
D
Y
 
T
V
 
I
S
 
S
E
 
R
-
 
H
-
 
G
-
x
S
-
 
A
-
x
T
-
 
P
-
 
P
-
 
H
K
 
P
P
 
P
Q
 
K
V
 
I
-
 
M
-
 
P
-
 
D
E
 
D
I
 
I
I
 
S
A
 
A
-
 
S
-
 
L
G
 
A
A
 
N
K
 
K
G
 
G
V
 
A
F
 
T
A
 
A
V
 
V
E
 
T
V
 
I
F
 
K
D
 
D
Q
 
T
D
 
I
M
 
M
Q
 
V
G
 
I
E
 
N
P
 
I
G
 
Q
S
 
S
D
 
N
R
 
R
R
 
K
-
 
I
-
 
S
-
 
A
-
 
H
-
 
G
-
 
F
-
 
L
-
 
A
-
 
S
I
 
I
L
 
F
D
 
A
V
 
I
L
 
L
S
 
D
R
 
K
F
 
Y
K
 
K
V
 
-
R
 
-
F
 
-
M
 
L
S
 
A
K
 
V
D
 
D
T
 
L
N
 
I
A
 
T
N
 
T
T
 
S
I
 
E
T
 
V
H
 
H
Y
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
-
K
 
-
H
 
-
V
 
-
K
 
-
R
 
-
V
 
V
V
 
S
K
 
M
A
 
A
L
 
L
K
 
Y
E
 
E
E
 
E
-
 
S
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
N
F
 
M
P
 
H
N
 
E
A
 
A
E
 
F
I
 
V
N
 
E
T
 
L
R
 
R
K
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
T
-
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
L
-
 
H
-
 
G
V
 
L
A
 
A
V
 
I
V
 
L
S
 
S
A
 
L
I
 
V
G
 
G
S
 
K
D
 
H
M
 
M
K
 
R
-
 
N
V
 
T
P
 
T
G
 
G
I
 
Y
L
 
A
A
 
G
R
 
R
S
 
M
V
 
F
K
 
C
A
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
E
E
 
A
E
 
Q
I
 
I
S
 
N
I
 
I
L
 
E
A
 
M
L
 
I
H
 
S
Q
 
Q
C
 
G
M
 
A
R
 
S
Q
 
E
V
 
I
D
 
N
I
 
I
Q
 
S
F
 
C
V
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
D
 
K
D
 
M
Y
 
A
E
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
L
V
 
N
A
 
V
L
 
I
H
 
H
G
 
K
V
 
E
L
 
L
I
 
L
E
 
E
P
 
P

3tviE Crystal structure of clostridium acetobutylicum aspartate kinase (caak): an important allosteric enzyme for industrial amino acids production (see paper)
25% identity, 66% coverage: 155:478/489 of query aligns to 112:438/439 of 3tviE

query
sites
3tviE
A
 
A
G
 
S
I
 
R
G
 
G
E
|
E
A
 
Y
H
 
L
S
 
N
A
 
G
F
 
V
N
 
I
T
 
L
A
 
A
L
 
K
K
 
Y
L
 
L
Q
 
N
Q
 
A
E
 
E
G
 
F
I
 
I
N
 
D
A
 
A
R
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
I
F
 
F
V
 
F
D
 
D
L
 
K
T
 
S
G
 
G
W
 
C
R
 
F
D
 
D
N
 
E
E
 
K
L
 
-
L
 
-
P
 
K
L
 
S
D
 
Y
E
 
E
K
 
K
L
 
I
K
 
K
Q
 
E
A
 
K
F
 
V
D
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
L
T
 
S
R
 
C
E
 
N
L
 
K
P
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
P
G
 
G
-
x
F
Y
 
Y
A
 
G
Q
 
S
C
 
S
K
 
F
E
 
N
G
 
G
L
 
D
M
 
V
R
 
K
T
 
T
F
 
F
D
 
S
R
 
R
G
 
G
Y
x
G
S
|
S
E
 
D
M
 
V
T
 
T
F
 
G
S
 
S
R
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
I
I
 
I
T
 
S
E
 
A
A
 
G
R
 
V
E
 
N
A
 
A
I
 
D
I
 
L
H
 
Y
K
 
E
E
 
N
Y
 
W
H
 
T
L
 
D
S
 
V
S
 
S
-
 
G
-
 
F
-
 
L
-
 
M
A
 
A
D
 
D
P
 
P
N
 
R
I
 
I
V
 
V
G
 
E
A
 
N
D
 
P
K
 
K
V
 
T
V
 
I
P
 
-
L
 
-
G
 
S
R
 
K
T
 
I
N
 
S
Y
 
Y
D
 
K
V
 
E
A
 
L
D
 
R
Q
 
E
L
 
L
A
 
S
N
 
Y
L
 
M
G
 
G
M
 
A
E
 
T
A
 
V
I
 
L
H
 
H
P
 
E
R
 
E
A
 
A
G
 
I
K
 
F
G
 
P
M
 
V
R
 
K
Q
 
D
N
 
S
E
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
I
R
 
N
V
 
I
M
 
K
N
 
N
T
 
T
F
 
N
E
 
K
P
 
P
E
 
S
H
 
D
T
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
L
G
 
S
D
 
D
Y
 
T
V
 
H
S
 
K
E
 
E
K
 
I
P
 
N
Q
 
L
V
 
G
E
 
T
I
 
I
-
 
T
-
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
K
K
 
K
G
 
N
V
 
F
F
 
T
A
 
V
V
 
I
E
 
A
V
 
I
F
 
E
D
 
K
Q
 
A
D
 
L
M
 
L
Q
 
N
G
 
S
E
 
E
P
 
V
G
 
G
S
 
F
D
 
C
R
 
R
R
 
K
I
 
I
L
 
L
D
 
S
V
 
I
L
 
L
S
 
E
R
 
M
F
 
Y
K
 
G
V
 
V
R
 
S
F
 
F
M
 
E
S
 
H
K
 
M
D
 
P
T
 
S
N
 
G
A
 
V
N
 
D
T
 
S
I
 
V
T
 
S
H
 
L
Y
 
V
V
 
I
G
 
E
S
 
D
T
 
C
L
 
K
K
 
L
H
 
D
V
 
G
K
 
K
-
 
C
-
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
I
K
 
E
A
 
E
L
 
I
K
 
K
E
 
K
E
 
Q
F
 
C
P
 
N
N
 
P
A
 
D
E
 
S
I
 
I
N
 
E
T
 
I
R
 
H
-
 
P
K
 
N
V
 
M
A
 
A
V
 
L
V
 
V
S
 
A
A
 
T
I
 
V
G
 
G
S
 
T
D
 
G
M
 
M
-
 
A
K
 
K
V
 
T
P
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
A
A
 
N
R
 
K
S
 
I
V
 
F
K
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
S
D
 
K
E
 
E
E
 
N
I
 
V
S
 
N
I
 
I
L
 
R
A
 
M
L
 
I
H
 
D
Q
 
Q
C
 
G
M
 
S
R
 
S
Q
 
E
V
 
I
D
 
N
I
 
V
Q
 
I
F
 
V
V
 
G
V
 
V
D
 
E
E
 
T
D
 
V
D
 
D
Y
 
F
E
 
E
K
 
K
A
 
A
I
 
V
V
 
K
A
 
S
L
 
I
H
 
Y
G
 
N
V
 
A
L
 
F
I
 
N
E
 
E

Sites not aligning to the query:

O81852 Bifunctional aspartokinase/homoserine dehydrogenase 2, chloroplastic; AK-HD 2; AK-HSDH 2; Beta-aspartyl phosphate homoserine 2; EC 2.7.2.4; EC 1.1.1.3 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
22% identity, 95% coverage: 8:473/489 of query aligns to 82:548/916 of O81852

query
sites
O81852
K
 
Q
I
 
I
M
 
P
T
 
K
S
 
G
Q
 
E
L
 
M
H
 
W
T
 
S
V
 
V
E
 
H
K
 
K
I
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
C
M
 
V
S
 
G
N
 
N
Y
 
S
E
 
Q
A
 
R
V
 
I
R
 
R
D
 
N
-
 
V
-
 
A
N
 
E
I
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
-
N
 
-
R
 
-
K
 
-
K
 
N
D
 
D
N
 
N
L
 
S
Y
 
E
Q
 
R
R
 
K
I
 
L
F
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
S
A
 
A
Y
 
M
G
 
S
G
 
K
V
 
V
T
 
T
N
 
D
E
 
M
L
 
M
L
 
Y
E
 
D
H
 
L
K
 
I
K
 
R
T
 
K
G
 
A
E
 
Q
P
 
S
G
 
R
V
 
D
Y
 
D
A
 
S
L
 
Y
F
 
L
A
 
S
D
 
A
A
 
L
E
 
E
S
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
R
-
 
L
-
 
T
-
 
A
-
 
R
D
 
D
W
 
L
A
 
L
W
 
D
G
 
G
D
 
D
D
 
D
L
 
L
T
 
A
K
 
S
L
 
-
V
 
-
K
 
-
F
 
F
L
 
L
T
 
S
D
 
H
I
 
L
N
 
H
G
 
N
E
 
D
L
 
-
F
 
-
E
 
-
D
 
-
P
 
-
M
 
-
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
D
 
-
Q
 
-
F
 
-
I
 
I
T
 
S
D
 
N
R
 
L
I
 
K
E
 
A
G
 
M
V
 
L
R
 
R
G
 
A
C
 
I
L
 
Y
I
 
I
D
 
A
L
 
G
Q
 
H
R
 
A
L
 
S
C
 
E
S
 
S
Y
 
F
G
 
S
Q
 
D
F
 
F
Q
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
H
G
 
G
E
 
E
A
 
L
H
 
W
S
 
S
A
 
A
F
 
Q
N
 
M
T
 
L
A
 
S
L
 
Y
K
 
V
L
 
V
Q
 
R
Q
 
K
E
 
T
G
 
G
I
 
L
N
 
E
A
 
C
R
 
K
F
 
W
V
 
M
D
 
D
-
 
T
-
 
R
-
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
I
L
 
V
T
 
N
G
 
P
W
 
T
R
 
S
D
 
S
N
 
N
E
 
Q
L
 
V
L
 
D
P
 
P
-
 
D
-
 
F
-
 
G
-
 
E
L
 
S
D
 
E
E
 
K
K
 
R
L
 
L
K
 
D
Q
 
K
A
 
W
F
 
F
D
 
S
A
 
L
V
 
N
D
 
-
L
 
-
T
 
P
R
 
S
E
 
K
L
 
I
P
 
I
I
 
I
V
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
F
-
 
I
A
 
A
Q
 
S
C
 
T
K
 
P
E
 
Q
G
 
N
L
 
I
M
 
P
R
 
T
T
 
T
F
 
L
D
 
K
R
 
R
G
 
D
Y
 
G
S
 
S
E
 
D
M
 
F
T
 
S
F
 
A
S
 
A
R
 
I
V
 
M
A
 
G
V
 
A
I
 
L
T
 
L
E
 
R
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
A
 
V
I
 
T
I
 
I
H
 
W
K
 
T
E
 
D
Y
 
V
H
 
D
-
 
G
L
 
V
S
 
Y
S
 
S
A
 
A
D
 
D
P
 
P
N
 
R
I
 
K
V
 
V
G
 
-
A
 
-
D
 
N
K
 
E
V
 
A
V
 
V
P
 
I
L
 
L
G
 
Q
R
 
T
T
 
L
N
 
S
Y
 
Y
D
 
Q
V
 
E
A
 
A
D
 
W
Q
 
E
L
 
M
A
 
S
N
 
Y
L
 
F
G
 
G
M
 
A
E
 
N
A
 
V
I
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
A
 
T
G
 
I
K
 
I
G
 
P
M
 
V
R
 
M
Q
 
R
N
 
Y
E
 
N
I
 
I
P
 
P
L
 
I
R
 
V
V
 
I
M
 
R
N
 
N
T
 
I
F
 
F
E
 
N
P
 
L
E
 
S
H
 
A
T
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
I
I
 
I
T
 
C
-
 
Q
-
 
P
-
 
P
-
 
E
G
 
D
D
 
D
Y
 
Y
-
 
D
V
 
L
S
 
K
E
 
L
K
 
T
P
 
T
Q
 
P
V
 
V
E
 
K
I
 
G
I
 
F
A
 
A
G
 
T
A
 
I
K
 
D
G
 
N
V
 
L
F
 
A
A
 
L
V
 
I
E
 
N
V
 
V
F
 
E
D
 
G
Q
 
T
D
 
G
M
 
M
Q
 
A
G
 
G
E
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
T
D
 
A
R
 
S
R
 
D
I
 
I
L
 
F
D
 
G
V
 
C
L
 
V
S
 
K
R
 
D
F
 
V
-
 
G
-
 
A
K
 
N
V
 
V
R
 
I
F
 
M
M
x
I
S
 
S
K
x
Q
D
 
A
T
 
S
N
 
S
A
 
E
N
 
H
T
 
S
I
 
V
T
 
C
H
 
F
Y
 
A
V
 
V
G
 
P
S
 
E
T
 
-
L
 
-
K
 
K
H
 
E
V
 
V
K
 
N
R
 
A
V
 
V
V
 
S
K
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
S
E
 
R
F
 
F
P
 
S
N
 
E
A
 
A
E
 
L
I
 
Q
N
 
A
T
 
G
R
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
Q
-
 
I
-
 
E
-
 
V
-
 
I
-
 
P
K
 
N
V
 
C
A
 
S
V
 
I
V
 
L
S
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
G
S
 
Q
D
 
K
M
 
M
-
 
A
K
 
S
V
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
V
L
 
S
A
 
C
R
 
T
S
 
L
V
 
F
K
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
K
E
 
A
E
 
N
I
 
I
S
 
N
I
 
V
L
 
R
A
 
A
L
x
I
H
 
S
Q
|
Q
C
 
G
M
 
C
R
 
S
Q
 
E
V
 
Y
D
 
N
I
 
V
Q
 
T
F
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
K
E
 
R
D
 
E
D
 
D
Y
 
S
E
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
L
V
 
R
A
 
A
L
 
V
H
 
H

3tviA Crystal structure of clostridium acetobutylicum aspartate kinase (caak): an important allosteric enzyme for industrial amino acids production (see paper)
24% identity, 62% coverage: 175:476/489 of query aligns to 125:428/429 of 3tviA

query
sites
3tviA
I
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
E
F
 
F
V
 
I
D
 
D
L
 
A
T
 
A
G
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
-
N
 
-
E
 
E
L
 
V
L
 
I
P
 
F
L
 
F
D
 
D
E
 
K
K
 
C
L
 
F
-
 
D
-
 
E
K
 
K
Q
 
K
A
 
S
F
 
Y
D
 
E
A
 
K
V
 
I
D
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
V
L
 
L
T
 
S
R
 
C
E
 
N
L
 
K
P
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
P
G
 
G
-
x
F
Y
 
Y
A
 
G
Q
 
S
C
 
S
K
 
F
E
 
N
G
 
G
L
 
D
M
 
V
R
 
K
T
 
T
F
 
F
D
 
S
R
 
R
G
 
G
Y
x
G
S
|
S
E
 
D
M
 
V
T
 
T
F
 
G
S
 
S
R
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
I
I
 
I
T
 
S
E
 
A
A
 
G
R
 
V
E
 
N
A
 
A
I
 
D
I
 
L
H
 
Y
K
 
E
E
 
N
Y
 
W
H
 
T
L
 
D
S
 
V
S
 
S
-
 
G
-
 
F
-
 
L
-
 
M
A
 
A
D
 
D
P
 
P
N
 
R
I
 
I
V
 
V
G
 
E
A
 
N
D
 
P
K
 
K
V
 
T
V
 
I
P
 
-
L
 
-
G
 
S
R
 
K
T
 
I
N
 
S
Y
 
Y
D
 
K
V
 
E
A
 
L
D
 
R
Q
 
E
L
 
L
A
 
S
N
 
Y
-
 
M
L
 
L
G
 
H
M
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
H
 
F
P
 
P
R
 
-
A
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
M
 
V
R
 
K
Q
 
D
N
 
S
E
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
I
R
 
N
V
 
I
M
 
K
N
 
N
T
 
T
F
 
N
E
 
K
P
 
P
E
 
S
H
 
D
T
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
L
G
 
S
D
 
D
Y
 
T
V
 
H
S
 
K
E
 
E
K
 
I
P
 
N
Q
 
L
V
 
G
E
 
T
I
 
I
-
 
T
-
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
K
K
 
K
G
 
N
V
 
F
F
 
T
A
 
V
V
 
I
E
 
A
V
 
I
F
 
E
D
 
K
Q
 
A
D
 
L
M
 
L
Q
 
N
G
 
S
E
 
E
P
 
V
G
 
G
S
x
F
D
x
C
R
 
R
R
 
K
I
 
I
L
 
L
D
 
S
V
 
I
L
 
L
S
 
E
R
 
M
F
 
Y
K
 
G
V
 
V
R
x
S
F
|
F
M
 
E
S
 
H
K
 
M
D
 
P
T
x
S
N
x
G
A
 
V
N
 
D
T
 
S
I
 
V
T
 
S
H
 
L
Y
 
V
V
 
I
G
 
E
S
 
D
T
 
C
L
 
K
K
 
L
H
 
D
V
 
G
K
 
K
-
 
C
-
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
I
K
 
E
A
 
E
L
 
I
K
 
K
E
 
K
E
 
Q
F
 
C
P
 
N
N
 
P
A
 
D
E
 
S
I
 
I
N
 
E
T
 
I
R
 
H
-
 
P
K
 
N
V
 
M
A
 
A
V
 
L
V
 
V
S
 
A
A
 
T
I
 
V
G
 
G
S
 
T
D
 
G
M
 
M
-
 
A
K
 
K
V
 
T
P
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
A
A
 
N
R
 
K
S
 
I
V
 
F
K
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
S
D
 
K
E
 
E
E
 
N
I
 
V
S
 
N
I
 
I
L
 
R
A
 
M
L
 
I
H
 
D
Q
 
Q
C
 
G
M
 
S
R
 
S
Q
 
E
V
 
I
D
 
N
I
 
V
Q
 
I
F
 
V
V
 
G
V
 
V
D
 
E
E
 
T
D
 
V
D
 
D
Y
 
F
E
 
E
K
 
K
A
 
A
I
 
V
V
 
K
A
 
S
L
 
I
H
 
Y
G
 
N
V
 
A
L
 
F

Sites not aligning to the query:

3l76A Crystal structure of aspartate kinase from synechocystis (see paper)
27% identity, 46% coverage: 261:483/489 of query aligns to 166:414/585 of 3l76A

query
sites
3l76A
P
 
P
N
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
T
A
 
T
D
 
D
-
 
P
K
 
R
V
 
L
V
 
V
P
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
L
 
M
G
 
A
R
 
E
T
 
I
N
 
T
Y
 
C
D
 
D
V
 
E
A
 
M
D
 
L
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
N
 
S
L
 
L
G
 
G
M
 
A
E
 
K
A
 
V
I
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
A
 
A
G
 
V
K
 
E
G
 
I
M
 
A
R
 
R
Q
 
N
N
 
Y
E
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
V
V
 
V
M
 
R
N
 
S
T
 
S
F
 
W
E
 
S
P
 
D
E
 
E
H
 
-
T
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
K
I
 
V
T
 
V
G
 
A
D
 
P
Y
 
P
V
 
V
S
 
Q
E
 
N
K
 
R
P
 
S
Q
 
L
V
 
V
-
 
G
-
 
L
E
 
E
I
 
I
I
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
K
 
K
G
 
A
V
 
V
F
 
D
A
 
G
V
 
V
E
 
E
V
 
-
F
 
Y
D
 
D
Q
 
A
D
 
D
-
 
Q
-
 
A
-
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
R
M
 
V
Q
 
P
G
 
D
E
x
R
P
 
P
G
 
G
S
x
V
D
x
A
R
 
S
R
 
K
I
 
L
L
 
F
D
 
R
V
 
D
L
 
I
S
 
A
R
 
Q
F
 
Q
K
 
Q
V
 
V
R
x
D
F
x
I
-
x
D
-
 
L
-
 
I
-
 
I
-
x
Q
M
 
S
S
 
I
K
 
H
D
 
D
T
 
G
N
 
N
A
 
S
N
 
N
T
 
D
I
 
I
T
 
A
H
 
F
Y
 
T
V
 
V
G
 
V
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
L
S
 
N
T
 
T
L
 
A
K
 
E
H
 
A
V
 
V
K
 
T
R
 
S
V
 
A
V
 
I
K
 
A
A
 
P
L
 
A
K
 
L
E
 
R
E
 
S
F
 
Y
P
 
P
N
 
E
A
 
A
E
 
D
-
 
Q
-
 
E
-
 
A
-
 
E
-
 
I
I
 
I
N
 
V
T
 
E
R
 
K
K
 
G
V
 
I
A
 
A
V
 
K
V
 
I
S
 
A
A
 
I
I
 
A
G
 
G
S
 
A
D
 
G
M
|
M
-
 
I
K
 
G
V
x
R
P
 
P
G
 
G
I
|
I
L
 
A
A
 
A
R
 
K
S
 
M
V
 
F
K
 
K
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
V
E
 
G
I
 
V
S
x
N
I
|
I
L
 
E
A
 
M
L
 
I
H
 
S
Q
 
-
C
 
-
M
 
T
R
x
S
Q
x
E
V
 
V
D
 
K
I
 
V
Q
 
S
F
 
C
V
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
Q
D
 
R
D
 
D
Y
 
A
E
 
D
K
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
A
A
 
A
L
 
L
H
 
S
-
 
N
-
 
A
-
 
F
G
 
G
V
 
V
L
 
T
I
 
L
E
 
S
P
 
P
H
 
P
N
 
K
H
 
N
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>GFF3916 FitnessBrowser__Marino:GFF3916
MLQDSKGKIMTSQLHTVEKIGGTSMSNYEAVRDNIIIGNRKKDNLYQRIFVVSAYGGVTN
ELLEHKKTGEPGVYALFADAESDWAWGDDLTKLVKFLTDINGELFEDPMLKQQADQFITD
RIEGVRGCLIDLQRLCSYGQFQLEEHLLTVREMLAGIGEAHSAFNTALKLQQEGINARFV
DLTGWRDNELLPLDEKLKQAFDAVDLTRELPIVTGYAQCKEGLMRTFDRGYSEMTFSRVA
VITEAREAIIHKEYHLSSADPNIVGADKVVPLGRTNYDVADQLANLGMEAIHPRAGKGMR
QNEIPLRVMNTFEPEHTGTLITGDYVSEKPQVEIIAGAKGVFAVEVFDQDMQGEPGSDRR
ILDVLSRFKVRFMSKDTNANTITHYVGSTLKHVKRVVKALKEEFPNAEINTRKVAVVSAI
GSDMKVPGILARSVKALADEEISILALHQCMRQVDIQFVVDEDDYEKAIVALHGVLIEPH
NHEYAIVAA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory