SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3998 FitnessBrowser__Marino:GFF3998 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7jqhA Structure of wild type glyoxylate/hydroxypyruvate reductase a from escherichia coli in complex with phosphate and NADP+
42% identity, 100% coverage: 1:309/309 of query aligns to 2:313/313 of 7jqhA

query
sites
7jqhA
M
 
M
K
 
D
I
 
I
L
 
I
F
 
F
V
 
Y
A
 
H
G
 
P
D
 
T
P
 
F
K
 
D
P
 
T
E
 
Q
R
 
W
W
 
W
T
 
I
V
 
E
P
 
A
I
 
L
K
 
R
E
 
K
L
 
A
L
 
I
P
 
P
E
 
Q
A
 
A
K
 
R
V
 
V
Y
 
R
V
 
A
W
 
W
D
 
K
P
 
-
E
 
S
G
 
G
P
 
D
A
 
N
V
 
D
D
 
S
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
I
 
L
V
 
V
W
 
W
Q
 
H
P
 
P
P
 
P
-
 
V
E
 
E
A
 
M
L
 
L
F
 
A
E
 
G
R
 
R
E
 
D
K
 
-
H
 
-
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
F
N
 
A
L
 
L
G
 
G
A
|
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
S
L
 
I
L
 
L
-
 
S
K
 
K
V
 
L
A
 
Q
N
 
A
L
 
H
P
 
P
E
 
E
A
 
M
L
 
L
T
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
V
-
 
P
V
 
L
V
 
F
R
|
R
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
T
G
 
G
M
 
M
S
 
G
V
 
E
Q
 
Q
M
|
M
A
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
V
 
A
L
 
V
H
 
S
Q
 
Q
L
 
V
L
 
L
E
 
H
A
 
W
S
 
F
R
 
R
E
 
R
M
 
F
E
 
D
T
 
D
Y
 
Y
R
 
R
E
 
I
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
N
Q
 
S
G
 
S
V
 
H
W
 
W
K
 
Q
I
 
P
H
 
L
R
 
P
P
 
E
I
 
Y
K
 
H
R
 
R
S
 
E
E
 
D
W
 
F
P
 
T
V
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
L
G
 
G
L
x
A
G
|
G
H
x
V
I
x
L
G
 
G
K
 
S
R
 
K
V
 
V
A
 
A
S
 
Q
T
 
S
L
 
L
A
 
Q
N
 
T
L
 
W
D
 
R
Y
 
F
R
 
P
V
 
L
S
 
R
G
 
C
W
|
W
A
x
S
R
|
R
G
x
T
E
 
R
H
x
K
S
 
S
L
 
W
E
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
Q
T
 
S
Y
 
F
A
 
A
G
 
G
P
 
R
D
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
S
D
 
A
F
 
F
L
 
L
K
 
S
A
 
Q
T
 
C
R
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
N
T
 
T
D
 
P
N
 
E
T
 
T
R
 
V
N
 
G
I
 
I
I
 
I
D
 
N
Y
 
Q
E
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
E
Q
 
K
L
 
L
Q
 
P
P
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
Y
L
 
L
I
 
L
N
 
N
V
x
L
G
x
A
R
|
R
G
 
G
E
 
V
H
 
H
L
 
V
V
 
V
E
 
E
D
 
D
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
S
G
 
G
T
 
K
L
 
V
L
 
K
R
 
G
A
 
A
S
 
M
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
N
K
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
P
G
 
E
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
Q
 
Q
R
 
H
K
 
P
E
 
R
I
 
V
T
 
T
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
V
S
 
A
A
|
A
R
 
I
T
 
T
L
 
R
R
 
P
D
 
A
A
 
E
T
 
A
I
 
V
E
 
E
Q
 
Y
I
 
I
T
 
S
G
 
R
K
 
T
I
 
I
R
 
A
D
 
Q
H
 
L
A
 
E
Q
 
K
G
 
G
L
 
E
A
 
K
I
 
V
T
 
C
G
 
G
I
 
Q
V
 
V
D
 
D
T
 
R
E
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y

7jqiA Structure of wild type glyoxylate/hydroxypyruvate reductase a from escherichia coli in complex with alpha-ketoglutarate and NADP+
42% identity, 100% coverage: 1:309/309 of query aligns to 1:312/312 of 7jqiA

query
sites
7jqiA
M
 
M
K
 
D
I
 
I
L
 
I
F
 
F
V
 
Y
A
 
H
G
 
P
D
 
T
P
 
F
K
 
D
P
 
T
E
 
Q
R
 
W
W
 
W
T
 
I
V
 
E
P
 
A
I
 
L
K
 
R
E
 
K
L
 
A
L
 
I
P
 
P
E
 
Q
A
 
A
K
 
R
V
 
V
Y
 
R
V
 
A
W
 
W
D
 
K
P
 
-
E
 
S
G
 
G
P
 
D
A
 
N
V
 
D
D
 
S
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
I
 
L
V
 
V
W
 
W
Q
 
H
P
 
P
P
 
P
-
 
V
E
 
E
A
 
M
L
 
L
F
 
A
E
 
G
R
 
R
E
 
D
K
 
-
H
 
-
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
F
N
 
A
L
 
L
G
|
G
A
|
A
G
|
G
I
 
V
D
 
D
G
 
S
L
 
I
L
 
L
-
 
S
K
 
K
V
 
L
A
 
Q
N
 
A
L
 
H
P
 
P
E
 
E
A
 
M
L
 
L
T
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
V
-
 
P
V
 
L
V
 
F
R
|
R
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
T
G
 
G
M
 
M
S
 
G
V
 
E
Q
 
Q
M
|
M
A
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
V
 
A
L
 
V
H
 
S
Q
 
Q
L
 
V
L
 
L
E
 
H
A
 
W
S
 
F
R
 
R
E
 
R
M
 
F
E
 
D
T
 
D
Y
 
Y
R
 
R
E
 
I
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
N
Q
 
S
G
 
S
V
 
H
W
 
W
K
 
Q
I
 
P
H
 
L
R
 
P
P
 
E
I
 
Y
K
 
H
R
 
R
S
 
E
E
 
D
W
 
F
P
 
T
V
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
L
G
 
G
L
x
A
G
|
G
H
x
V
I
x
L
G
 
G
K
 
S
R
 
K
V
 
V
A
 
A
S
 
Q
T
 
S
L
 
L
A
 
Q
N
 
T
L
 
W
D
 
R
Y
 
F
R
 
P
V
 
L
S
 
R
G
 
C
W
|
W
A
x
S
R
|
R
G
x
T
E
 
R
H
x
K
S
 
S
L
 
W
E
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
Q
T
 
S
Y
 
F
A
 
A
G
 
G
P
 
R
D
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
S
D
 
A
F
 
F
L
 
L
K
 
S
A
 
Q
T
 
C
R
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
N
T
 
T
D
 
P
N
 
E
T
 
T
R
 
V
N
 
G
I
 
I
I
 
I
D
 
N
Y
 
Q
E
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
E
Q
 
K
L
 
L
Q
 
P
P
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
Y
L
 
L
I
 
L
N
 
N
V
x
L
G
 
A
R
|
R
G
 
G
E
 
V
H
 
H
L
 
V
V
 
V
E
 
E
D
 
D
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
S
G
 
G
T
 
K
L
 
V
L
 
K
R
 
G
A
 
A
S
 
M
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
N
K
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
P
G
 
E
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
Q
 
Q
R
 
H
K
 
P
E
 
R
I
 
V
T
 
T
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
V
S
 
A
A
|
A
R
 
I
T
 
T
L
 
R
R
 
P
D
 
A
A
 
E
T
 
A
I
 
V
E
 
E
Q
 
Y
I
 
I
T
 
S
G
 
R
K
 
T
I
 
I
R
 
A
D
 
Q
H
 
L
A
 
E
Q
 
K
G
 
G
L
 
E
A
 
K
I
 
V
T
 
C
G
 
G
I
 
Q
V
 
V
D
 
D
T
 
R
E
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y

6p35A 2.5 angstrom structure of wild type glyoxylate/hydroxypyruvate reductase a from escherichia coli in complex with 2-keto arginine and NADP
42% identity, 100% coverage: 1:309/309 of query aligns to 1:312/312 of 6p35A

query
sites
6p35A
M
 
M
K
 
D
I
 
I
L
 
I
F
 
F
V
 
Y
A
 
H
G
 
P
D
 
T
P
x
F
K
x
D
P
 
T
E
 
Q
R
 
W
W
|
W
T
 
I
V
 
E
P
 
A
I
 
L
K
 
R
E
 
K
L
 
A
L
 
I
P
 
P
E
 
Q
A
 
A
K
 
R
V
 
V
Y
 
R
V
 
A
W
 
W
D
 
K
P
 
-
E
 
S
G
 
G
P
 
D
A
 
N
V
 
D
D
 
S
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
I
 
L
V
 
V
W
 
W
Q
 
H
P
 
P
P
 
P
-
 
V
E
 
E
A
 
M
L
 
L
F
 
A
E
 
G
R
 
R
E
 
D
K
 
-
H
 
-
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
F
N
 
A
L
 
L
G
 
G
A
|
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
S
L
 
I
L
 
L
-
 
S
K
 
K
V
 
L
A
 
Q
N
 
A
L
 
H
P
 
P
E
 
E
A
 
M
L
 
L
T
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
V
-
 
P
V
 
L
V
 
F
R
|
R
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
T
G
 
G
M
 
M
S
 
G
V
 
E
Q
 
Q
M
|
M
A
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
V
 
A
L
 
V
H
 
S
Q
 
Q
L
 
V
L
 
L
E
 
H
A
 
W
S
 
F
R
 
R
E
 
R
M
 
F
E
 
D
T
 
D
Y
 
Y
R
 
R
E
 
I
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
N
Q
 
S
G
 
S
V
 
H
W
 
W
K
 
Q
I
 
P
H
 
L
R
 
P
P
 
E
I
 
Y
K
 
H
R
 
R
S
 
E
E
 
D
W
 
F
P
 
T
V
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
L
G
 
G
L
x
A
G
|
G
H
x
V
I
x
L
G
 
G
K
 
S
R
 
K
V
 
V
A
 
A
S
 
Q
T
 
S
L
 
L
A
 
Q
N
 
T
L
 
W
D
 
R
Y
 
F
R
 
P
V
 
L
S
 
R
G
 
C
W
|
W
A
x
S
R
|
R
G
x
T
E
 
R
H
x
K
S
 
S
L
 
W
E
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
Q
T
 
S
Y
 
F
A
 
A
G
 
G
P
 
R
D
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
S
D
 
A
F
 
F
L
 
L
K
 
S
A
 
Q
T
 
C
R
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
N
T
 
T
D
 
P
N
 
E
T
 
T
R
 
V
N
 
G
I
 
I
I
 
I
D
 
N
Y
 
Q
E
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
E
Q
 
K
L
 
L
Q
 
P
P
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
Y
L
 
L
I
 
L
N
 
N
V
x
L
G
 
A
R
|
R
G
 
G
E
 
V
H
 
H
L
 
V
V
 
V
E
 
E
D
 
D
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
S
G
 
G
T
 
K
L
 
V
L
 
K
R
 
G
A
 
A
S
 
M
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
N
K
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
P
G
 
E
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
Q
 
Q
R
 
H
K
 
P
E
 
R
I
 
V
T
 
T
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
V
S
x
A
A
|
A
R
 
I
T
|
T
L
 
R
R
 
P
D
 
A
A
 
E
T
 
A
I
 
V
E
 
E
Q
 
Y
I
 
I
T
 
S
G
 
R
K
 
T
I
 
I
R
 
A
D
 
Q
H
 
L
A
 
E
Q
 
K
G
 
G
L
 
E
A
 
K
I
 
V
T
 
C
G
 
G
I
 
Q
V
 
V
D
 
D
T
 
R
E
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y

3kboA 2.14 angstrom crystal structure of putative oxidoreductase (ycdw) from salmonella typhimurium in complex with NADP
41% identity, 100% coverage: 1:309/309 of query aligns to 1:312/312 of 3kboA

query
sites
3kboA
M
 
M
K
 
E
I
 
I
L
 
I
F
 
F
V
 
Y
A
 
H
G
 
P
D
 
T
P
 
F
K
 
N
P
 
A
E
 
A
R
 
W
W
 
W
T
 
V
V
 
N
P
 
A
I
 
L
K
 
E
E
 
K
L
 
A
L
 
L
P
 
P
E
 
H
A
 
A
K
 
R
V
 
V
Y
 
R
V
 
E
W
 
W
D
 
K
P
 
-
E
 
V
G
 
G
P
 
D
A
x
N
V
 
N
D
 
P
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
I
 
L
V
 
V
W
 
W
Q
 
Q
P
 
P
P
 
P
E
 
V
A
 
E
L
 
M
F
 
L
E
x
A
R
 
-
E
 
G
K
x
R
H
x
R
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
F
N
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
A
L
 
I
L
 
L
K
 
S
V
 
K
A
 
L
N
 
N
-
 
A
-
 
H
-
 
P
-
 
E
-
 
M
L
 
L
P
 
D
E
 
A
A
 
S
L
 
I
T
 
P
V
 
L
V
 
F
R
|
R
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
T
G
 
G
M
|
M
S
 
G
V
 
L
Q
 
Q
M
|
M
A
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
V
 
A
L
 
V
H
 
S
Q
 
Q
L
 
V
L
 
L
E
 
H
A
 
W
S
 
F
R
 
R
E
 
R
M
 
F
E
 
D
T
 
D
Y
 
Y
R
 
Q
E
 
A
Q
 
L
Q
 
K
R
 
N
Q
 
Q
G
 
A
V
 
L
W
 
W
K
 
K
I
 
P
H
 
L
R
 
P
P
 
E
I
 
Y
K
 
T
R
 
R
S
 
E
E
 
E
W
 
F
P
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
I
M
 
M
G
|
G
L
x
A
G
|
G
H
x
V
I
x
L
G
 
G
K
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
A
S
 
E
T
 
S
L
 
L
A
 
Q
N
 
A
L
 
W
D
 
G
Y
 
F
R
 
P
V
 
L
S
 
R
G
 
C
W
|
W
A
x
S
R
|
R
G
x
S
E
 
R
H
x
K
S
 
S
L
 
W
E
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
E
T
 
S
Y
 
Y
A
 
V
G
 
G
P
 
R
D
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
R
D
 
A
F
 
F
L
 
L
K
 
N
A
 
Q
T
 
T
R
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
x
L
L
 
L
P
|
P
L
 
N
T
 
T
D
 
A
N
 
Q
T
 
T
R
 
V
N
 
G
I
 
I
I
 
I
D
 
N
Y
 
S
E
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
D
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
P
P
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
Y
L
 
V
I
 
L
N
 
N
V
x
L
G
x
A
R
|
R
G
 
G
E
 
V
H
 
H
L
 
V
V
 
Q
E
 
E
D
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
S
G
 
G
T
 
K
L
 
L
L
 
K
R
 
G
A
 
A
S
 
M
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
S
K
 
Q
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
E
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
Q
 
R
R
 
H
K
 
P
E
 
R
I
 
V
T
 
A
I
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
S
 
A
A
|
A
R
 
V
T
 
T
L
 
R
R
 
P
D
 
A
A
 
E
T
 
A
I
 
I
E
 
D
Q
 
Y
I
 
I
T
 
S
G
 
R
K
 
T
I
 
I
R
 
T
D
 
Q
H
 
L
A
 
E
Q
 
K
G
 
G
L
 
E
A
 
P
I
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
Q
V
 
V
D
 
D
T
 
R
E
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y

5vg6B Crystal structure of d-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase from xanthobacter autotrophicus py2 in complex with NADPH and mes.
40% identity, 89% coverage: 34:309/309 of query aligns to 41:315/315 of 5vg6B

query
sites
5vg6B
E
 
E
G
 
G
P
 
D
A
 
P
V
 
E
D
 
E
A
 
V
D
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
L
V
 
V
W
 
W
Q
 
K
P
 
P
P
 
P
E
 
H
A
 
G
L
 
F
F
 
F
E
 
A
R
 
R
E
 
F
K
 
P
H
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
L
V
 
V
F
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
G
A
|
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
A
V
 
R
A
 
D
N
 
D
L
 
L
P
 
P
E
 
D
A
 
-
L
 
V
T
 
P
V
 
V
V
 
T
R
|
R
L
 
L
E
 
S
D
 
D
A
 
P
G
 
N
M
|
M
S
 
S
V
 
Q
Q
 
M
M
|
M
A
 
A
E
 
S
Y
 
F
V
 
V
L
 
L
H
 
F
Q
 
C
L
 
V
L
 
L
E
 
R
A
 
H
S
 
A
R
 
R
E
 
D
M
 
I
E
 
P
T
 
T
Y
 
F
R
 
E
E
 
R
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
R
W
 
W
K
 
H
I
 
Y
H
 
V
R
 
H
P
 
P
I
 
R
K
 
T
R
 
A
S
 
A
E
 
E
W
 
I
P
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
V
M
 
L
G
 
G
L
|
L
G
|
G
H
x
D
I
x
L
G
 
G
K
 
A
R
 
A
V
 
A
A
 
A
S
 
L
T
 
E
L
 
L
A
 
A
N
 
R
L
 
H
D
 
G
Y
 
F
R
 
D
V
 
V
S
 
R
G
 
G
W
|
W
A
x
S
R
|
R
G
x
T
E
 
P
H
x
K
S
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
V
S
 
S
T
 
C
Y
 
F
A
 
H
G
 
G
P
 
L
D
 
E
E
 
A
L
 
L
G
 
P
D
 
G
F
 
F
L
 
L
K
 
A
A
 
G
T
 
S
R
 
E
V
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
V
T
 
M
L
|
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
P
N
 
E
T
|
T
R
 
R
N
 
G
I
 
L
I
 
M
D
 
N
Y
 
A
E
 
E
L
 
R
L
 
L
S
 
A
Q
 
H
L
 
L
Q
 
P
P
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
K
L
 
F
I
 
I
N
 
N
V
|
V
G
 
A
R
|
R
G
 
G
E
 
P
H
 
V
L
 
V
V
 
D
E
 
E
D
 
A
D
 
A
L
 
L
L
 
I
R
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
R
D
 
S
G
 
G
T
 
H
L
 
I
L
 
A
R
 
E
A
 
A
S
 
T
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
K
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
V
G
 
G
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
Q
 
A
R
 
M
K
 
D
E
 
N
I
 
V
T
 
L
I
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
S
x
A
A
x
S
R
 
I
T
 
A
L
 
I
R
 
P
D
 
R
A
 
T
T
 
A
I
 
A
E
 
P
Q
 
Q
I
 
I
T
 
V
G
 
E
K
 
N
I
 
I
R
 
R
D
 
R
H
 
I
A
 
E
Q
 
A
G
 
G
L
 
E
A
 
P
I
 
V
T
 
L
G
 
N
I
 
Q
V
 
V
D
 
D
T
 
P
E
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y

4z0pA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc02828 (smghra) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
37% identity, 87% coverage: 41:309/309 of query aligns to 45:316/316 of 4z0pA

query
sites
4z0pA
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
I
 
V
V
 
V
W
|
W
Q
 
K
P
 
S
P
 
A
E
 
P
A
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
S
R
 
R
E
 
A
K
 
P
H
 
D
L
 
L
K
 
K
A
 
V
V
 
V
F
 
F
N
 
S
L
 
G
G
|
G
A
|
A
G
|
G
I
 
V
D
 
D
G
 
H
L
 
V
L
 
L
K
 
T
V
 
L
A
 
P
N
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
D
A
 
-
L
 
V
T
 
P
V
 
L
V
 
V
R
|
R
L
 
F
E
 
V
D
 
D
A
 
R
G
 
T
M
x
L
S
 
T
V
 
T
Q
 
R
M
|
M
A
 
S
E
 
E
Y
 
W
V
 
V
L
 
M
H
 
M
Q
 
Q
L
 
C
L
 
L
E
 
L
A
 
H
S
 
L
R
 
R
E
 
Q
M
x
H
E
x
R
T
 
A
Y
 
Y
R
 
E
E
 
A
Q
 
L
Q
 
A
R
 
K
Q
 
K
G
 
H
V
 
E
W
 
W
K
 
R
I
 
D
H
 
L
R
 
S
P
 
Q
I
 
P
K
 
E
R
 
A
S
 
A
E
 
D
W
 
V
P
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
I
M
 
M
G
 
G
L
x
M
G
|
G
H
x
V
I
x
L
G
 
G
K
 
Q
R
 
D
V
 
A
A
 
A
S
 
R
T
 
K
L
 
L
A
 
A
N
 
A
L
 
M
D
 
G
Y
 
F
R
 
K
V
 
V
S
 
I
G
 
G
W
|
W
A
x
S
R
|
R
G
x
S
E
 
K
H
x
R
S
 
V
L
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
V
S
 
E
T
 
T
Y
 
Y
-
 
D
-
 
A
A
 
A
G
 
G
P
 
L
D
 
D
E
 
A
L
 
-
G
 
-
D
 
-
F
 
F
L
 
L
K
 
G
A
 
R
T
 
T
R
 
D
V
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
G
T
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
P
N
 
D
T
 
T
R
 
R
N
 
G
I
 
I
I
 
F
D
 
N
Y
 
A
E
 
A
L
 
L
L
 
F
S
 
A
Q
 
K
L
 
L
Q
 
S
P
 
R
G
 
N
A
 
G
-
 
P
-
 
F
-
 
G
-
 
A
-
 
P
V
 
V
L
 
F
I
 
I
N
 
N
V
x
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
E
 
G
H
 
S
L
 
Q
V
 
V
E
 
E
D
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
L
R
 
E
A
 
C
L
 
L
D
 
D
D
 
S
G
 
G
T
 
V
L
 
L
L
x
G
R
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
K
 
R
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
S
E
 
P
G
 
E
H
 
S
P
 
R
F
 
F
W
 
W
Q
 
D
R
 
M
K
 
P
E
 
N
I
 
V
T
 
Y
I
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
V
S
x
A
A
|
A
R
 
S
T
 
S
L
 
D
R
 
V
D
 
R
A
 
A
T
 
L
I
 
F
E
 
V
Q
 
H
I
 
V
T
 
E
G
 
H
K
 
Q
I
 
I
R
 
A
D
 
R
H
 
F
A
 
E
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
P
I
 
L
T
 
E
G
 
H
I
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
K
E
 
V
R
 
A
G
 
G
Y
|
Y

4weqA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc02828 (smghra) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and sulfate (see paper)
37% identity, 87% coverage: 41:309/309 of query aligns to 45:316/316 of 4weqA

query
sites
4weqA
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
I
 
V
V
 
V
W
 
W
Q
 
K
P
 
S
P
 
A
E
 
P
A
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
S
R
 
R
E
 
A
K
 
P
H
 
D
L
 
L
K
 
K
A
 
V
V
 
V
F
 
F
N
 
S
L
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
H
L
 
V
L
 
L
K
 
T
V
 
L
A
 
P
N
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
D
A
 
-
L
 
V
T
 
P
V
 
L
V
 
V
R
|
R
L
 
F
E
 
V
D
 
D
A
 
R
G
 
T
M
x
L
S
 
T
V
 
T
Q
 
R
M
|
M
A
 
S
E
 
E
Y
 
W
V
 
V
L
 
M
H
 
M
Q
 
Q
L
 
C
L
 
L
E
 
L
A
 
H
S
 
L
R
 
R
E
 
Q
M
 
H
E
 
R
T
 
A
Y
 
Y
R
 
E
E
 
A
Q
 
L
Q
 
A
R
 
K
Q
 
K
G
 
H
V
 
E
W
 
W
K
 
R
I
 
D
H
 
L
R
 
S
P
 
Q
I
 
P
K
 
E
R
 
A
S
 
A
E
 
D
W
 
V
P
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
I
M
 
M
G
 
G
L
x
M
G
|
G
H
x
V
I
x
L
G
 
G
K
 
Q
R
 
D
V
 
A
A
 
A
S
 
R
T
 
K
L
 
L
A
 
A
N
 
A
L
 
M
D
 
G
Y
 
F
R
 
K
V
 
V
S
 
I
G
 
G
W
|
W
A
x
S
R
|
R
G
x
S
E
 
K
H
x
R
S
 
V
L
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
V
S
 
E
T
 
T
Y
 
Y
-
 
D
-
 
A
A
 
A
G
 
G
P
 
L
D
 
D
E
 
A
L
 
-
G
 
-
D
 
-
F
 
F
L
 
L
K
 
G
A
 
R
T
 
T
R
 
D
V
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
G
T
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
P
N
 
D
T
 
T
R
 
R
N
 
G
I
 
I
I
 
F
D
 
N
Y
 
A
E
 
A
L
 
L
L
 
F
S
 
A
Q
 
K
L
 
L
Q
 
S
P
 
R
G
 
N
A
 
G
-
 
P
-
 
F
-
 
G
-
 
A
-
 
P
V
 
V
L
 
F
I
 
I
N
 
N
V
x
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
E
 
G
H
 
S
L
 
Q
V
 
V
E
 
E
D
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
L
R
 
E
A
 
C
L
 
L
D
 
D
D
 
S
G
 
G
T
 
V
L
 
L
L
x
G
R
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
K
 
R
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
S
E
 
P
G
 
E
H
 
S
P
 
R
F
 
F
W
 
W
Q
 
D
R
 
M
K
 
P
E
 
N
I
 
V
T
 
Y
I
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
V
S
x
A
A
 
A
R
 
S
T
 
S
L
 
D
R
 
V
D
 
R
A
 
A
T
 
L
I
 
F
E
 
V
Q
 
H
I
 
V
T
 
E
G
 
H
K
 
Q
I
 
I
R
 
A
D
 
R
H
 
F
A
 
E
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
P
I
 
L
T
 
E
G
 
H
I
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
K
E
 
V
R
 
A
G
 
G
Y
|
Y

5bqfA Probable 2-hydroxyacid dehydrogenase from rhizobium etli cfn 42 in complex with NADP, hepes and l(+)-tartaric acid
36% identity, 88% coverage: 39:309/309 of query aligns to 44:317/317 of 5bqfA

query
sites
5bqfA
D
 
E
A
 
T
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
I
 
L
V
 
L
W
 
W
Q
 
K
P
 
P
P
 
D
E
 
A
A
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
R
R
 
R
E
 
A
K
 
P
H
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
V
V
 
I
F
 
F
N
 
S
L
 
G
G
 
G
A
|
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
H
L
 
I
L
 
I
K
 
G
V
 
M
A
 
A
N
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
D
A
 
-
L
 
I
T
 
P
V
 
I
V
 
V
R
|
R
L
 
F
E
 
V
D
 
D
A
 
R
G
 
S
M
 
L
S
 
T
V
 
T
Q
 
R
M
|
M
A
 
S
E
 
E
Y
 
W
V
 
V
L
 
V
H
 
M
Q
 
Q
L
 
C
L
 
L
E
 
M
A
 
H
S
 
L
R
 
R
E
 
G
M
 
Q
E
 
Y
T
 
G
Y
 
H
R
 
D
E
 
S
Q
 
H
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
R
G
 
R
V
 
E
W
 
W
K
 
A
I
 
K
H
 
L
R
 
I
P
 
A
I
 
P
K
 
E
R
 
A
S
 
A
E
 
E
W
 
V
P
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
V
M
 
M
G
|
G
L
|
L
G
|
G
H
x
I
I
x
L
G
 
G
K
 
Q
R
 
D
V
 
A
A
 
V
S
 
A
T
 
K
L
 
L
A
 
K
N
 
V
L
 
M
D
 
G
Y
 
F
R
 
N
V
 
V
S
 
I
G
 
G
W
|
W
A
x
S
R
|
R
G
x
T
E
 
R
H
 
K
S
 
T
L
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
V
S
 
E
T
 
T
Y
 
F
-
 
D
A
 
A
G
 
G
P
 
-
D
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
D
D
 
R
F
 
F
L
 
L
K
 
A
A
 
K
T
 
T
R
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
G
T
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
P
N
 
E
T
 
T
R
 
T
N
 
G
I
 
F
I
 
Y
D
 
D
Y
 
S
E
 
E
L
 
L
L
 
F
S
 
K
Q
 
K
L
 
L
Q
 
R
-
 
R
P
 
D
G
 
G
A
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
V
 
V
L
 
F
I
 
I
N
 
N
V
x
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
E
 
K
H
 
S
L
 
Q
V
 
I
E
 
E
D
 
T
D
 
D
L
 
I
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
V
D
 
R
D
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
G
R
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
K
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
A
E
 
T
G
 
D
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
Q
 
E
R
 
L
K
 
E
E
 
N
I
 
V
T
 
F
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
D
S
 
A
A
|
A
R
 
V
T
 
S
L
 
E
R
 
E
D
 
N
A
 
A
T
 
L
I
 
F
E
 
R
Q
 
H
I
 
V
T
 
E
G
 
M
K
 
Q
I
 
I
R
 
A
D
 
R
H
 
F
A
 
E
Q
 
R
G
 
G
L
 
E
A
 
P
I
 
L
T
 
Q
G
 
F
I
 
V
V
 
I
D
 
D
T
 
R
E
 
A
R
 
A
G
 
G
Y
|
Y

4xcvA Probable 2-hydroxyacid dehydrogenase from rhizobium etli cfn 42 in complex with NADPH
36% identity, 88% coverage: 39:309/309 of query aligns to 44:317/317 of 4xcvA

query
sites
4xcvA
D
 
E
A
 
T
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
I
 
L
V
 
L
W
 
W
Q
 
K
P
 
P
P
 
D
E
 
A
A
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
R
R
 
R
E
 
A
K
 
P
H
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
V
V
 
I
F
 
F
N
 
S
L
 
G
G
 
G
A
|
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
H
L
 
I
L
 
I
K
 
G
V
 
M
A
 
A
N
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
D
A
 
-
L
 
I
T
 
P
V
 
I
V
 
V
R
|
R
L
 
F
E
 
V
D
 
D
A
 
R
G
 
S
M
 
L
S
 
T
V
 
T
Q
 
R
M
|
M
A
 
S
E
 
E
Y
 
W
V
 
V
L
 
V
H
 
M
Q
 
Q
L
 
C
L
 
L
E
 
M
A
 
H
S
 
L
R
 
R
E
 
G
M
 
Q
E
 
Y
T
 
G
Y
 
H
R
 
D
E
 
S
Q
 
H
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
R
G
 
R
V
 
E
W
 
W
K
 
A
I
 
K
H
 
L
R
 
I
P
 
A
I
 
P
K
 
E
R
 
A
S
 
A
E
 
E
W
 
V
P
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
V
M
 
M
G
|
G
L
|
L
G
|
G
H
x
I
I
x
L
G
 
G
K
 
Q
R
 
D
V
 
A
A
 
V
S
 
A
T
 
K
L
 
L
A
 
K
N
 
V
L
 
M
D
 
G
Y
 
F
R
 
N
V
 
V
S
 
I
G
 
G
W
|
W
A
x
S
R
|
R
G
x
T
E
 
R
H
x
K
S
 
T
L
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
V
S
 
E
T
 
T
Y
 
F
-
 
D
A
 
A
G
 
G
P
 
-
D
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
D
D
 
R
F
 
F
L
 
L
K
 
A
A
 
K
T
 
T
R
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
G
T
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
P
N
 
E
T
 
T
R
 
T
N
 
G
I
 
F
I
 
Y
D
 
D
Y
 
S
E
 
E
L
 
L
L
 
F
S
 
K
Q
 
K
L
 
L
Q
 
R
-
 
R
P
 
D
G
 
G
A
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
V
 
V
L
 
F
I
 
I
N
 
N
V
x
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
E
 
K
H
 
S
L
 
Q
V
 
I
E
 
E
D
 
T
D
 
D
L
 
I
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
V
D
 
R
D
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
G
R
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
K
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
A
E
 
T
G
 
D
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
Q
 
E
R
 
L
K
 
E
E
 
N
I
 
V
T
 
F
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
D
S
 
A
A
|
A
R
 
V
T
 
S
L
 
E
R
 
E
D
 
N
A
 
A
T
 
L
I
 
F
E
 
R
Q
 
H
I
 
V
T
 
E
G
 
M
K
 
Q
I
 
I
R
 
A
D
 
R
H
 
F
A
 
E
Q
 
R
G
 
G
L
 
E
A
 
P
I
 
L
T
 
Q
G
 
F
I
 
V
V
 
I
D
 
D
T
 
R
E
 
A
R
 
A
G
 
G
Y
|
Y

5tsdA Crystal structure of NADPH-dependent 2-hydroxyacid dehydrogenase from rhizobium etli cfn 42 in complex with NADPH and oxalate
36% identity, 88% coverage: 39:309/309 of query aligns to 43:316/316 of 5tsdA

query
sites
5tsdA
D
 
E
A
 
T
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
I
 
L
V
 
L
W
|
W
Q
 
K
P
 
P
P
 
D
E
 
A
A
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
R
R
 
R
E
 
A
K
 
P
H
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
V
V
 
I
F
 
F
N
 
S
L
 
G
G
|
G
A
|
A
G
|
G
I
 
V
D
 
D
G
 
H
L
 
I
L
 
I
K
 
G
V
 
M
A
 
A
N
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
D
A
 
-
L
 
I
T
 
P
V
 
I
V
 
V
R
|
R
L
 
F
E
 
V
D
 
D
A
 
R
G
 
S
M
 
L
S
 
T
V
 
T
Q
 
R
M
|
M
A
 
S
E
 
E
Y
 
W
V
 
V
L
 
V
H
 
M
Q
 
Q
L
 
C
L
 
L
E
 
M
A
 
H
S
 
L
R
 
R
E
 
G
M
 
Q
E
 
Y
T
 
G
Y
 
H
R
 
D
E
 
S
Q
 
H
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
R
G
 
R
V
 
E
W
 
W
K
 
A
I
 
K
H
 
L
R
 
I
P
 
A
I
 
P
K
 
E
R
 
A
S
 
A
E
 
E
W
 
V
P
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
V
M
 
M
G
|
G
L
|
L
G
|
G
H
x
I
I
x
L
G
 
G
K
 
Q
R
 
D
V
 
A
A
 
V
S
 
A
T
 
K
L
 
L
A
 
K
N
 
V
L
 
M
D
 
G
Y
 
F
R
 
N
V
 
V
S
 
I
G
 
G
W
|
W
A
x
S
R
|
R
G
x
T
E
 
R
H
x
K
S
 
T
L
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
V
S
 
E
T
 
T
Y
 
F
-
 
D
A
 
A
G
 
G
P
 
-
D
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
D
D
 
R
F
 
F
L
 
L
K
 
A
A
 
K
T
 
T
R
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
G
T
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
P
N
 
E
T
 
T
R
 
T
N
 
G
I
 
F
I
 
Y
D
 
D
Y
 
S
E
 
E
L
 
L
L
 
F
S
 
K
Q
 
K
L
 
L
Q
 
R
-
 
R
P
 
D
G
 
G
A
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
V
 
V
L
 
F
I
 
I
N
 
N
V
x
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
E
 
K
H
 
S
L
 
Q
V
 
I
E
 
E
D
 
T
D
 
D
L
 
I
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
V
D
 
R
D
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
G
R
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
K
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
A
E
 
T
G
 
D
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
Q
 
E
R
 
L
K
 
E
E
 
N
I
 
V
T
 
F
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
D
S
 
A
A
 
A
R
 
V
T
 
S
L
 
E
R
 
E
D
 
N
A
 
A
T
 
L
I
 
F
E
 
R
Q
 
H
I
 
V
T
 
E
G
 
M
K
 
Q
I
 
I
R
 
A
D
 
R
H
 
F
A
 
E
Q
 
R
G
 
G
L
 
E
A
 
P
I
 
L
T
 
Q
G
 
F
I
 
V
V
 
I
D
 
D
T
 
R
E
 
A
R
 
A
G
 
G
Y
|
Y

4zqbB Crystal structure of NADP-dependent dehydrogenase from rhodobactersphaeroides in complex with NADP and sulfate
36% identity, 95% coverage: 15:309/309 of query aligns to 21:316/316 of 4zqbB

query
sites
4zqbB
W
 
W
T
 
A
V
 
G
P
 
H
I
 
L
K
 
A
E
 
R
L
 
A
L
 
L
P
 
P
E
 
G
A
 
E
K
 
R
V
 
I
Y
 
D
V
 
G
W
 
F
D
 
R
P
 
E
E
 
L
G
 
S
P
 
P
A
 
A
-
 
E
-
 
R
V
 
A
D
 
E
A
 
V
D
 
D
Y
 
I
A
 
A
I
 
I
V
 
V
W
 
A
Q
 
N
P
 
P
P
 
D
E
 
P
A
 
A
L
 
D
F
 
L
E
 
A
R
 
E
E
 
L
K
 
P
H
 
N
L
 
L
K
 
V
A
 
W
V
 
I
F
 
H
N
 
S
L
 
L
G
 
W
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
E
G
 
R
L
 
L
L
 
-
K
 
-
V
 
V
A
 
A
N
 
E
L
 
L
P
 
G
E
 
H
-
 
L
A
 
A
L
 
R
T
 
P
V
 
I
V
 
V
R
|
R
L
 
L
E
 
V
D
 
D
A
 
P
G
 
E
M
x
L
S
 
A
V
 
R
Q
 
T
M
|
M
A
 
A
E
 
E
Y
 
A
V
 
A
L
 
L
H
 
A
Q
 
W
L
 
T
L
 
Y
E
 
Y
A
 
L
S
 
F
R
 
R
E
 
D
M
 
M
E
 
P
T
 
A
Y
 
Y
R
 
A
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
A
G
 
R
V
 
V
W
 
W
K
 
K
I
 
-
H
 
G
R
 
L
P
 
P
I
 
Y
K
 
K
R
 
R
S
 
P
E
 
E
-
 
R
W
 
T
P
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
V
M
 
L
G
|
G
L
|
L
G
|
G
H
x
E
I
x
L
G
 
G
K
 
A
R
 
A
V
 
A
A
 
A
S
 
L
T
 
R
L
 
L
A
 
R
N
 
D
L
 
A
D
 
G
Y
 
F
R
 
D
V
 
V
S
 
H
G
 
G
W
|
W
A
x
S
R
|
R
G
x
S
E
 
P
H
x
K
S
 
E
L
 
I
E
 
A
G
 
G
V
 
V
S
 
T
T
 
C
Y
 
H
A
 
A
G
 
G
P
 
E
D
 
E
E
 
T
L
 
L
G
 
E
D
 
R
F
 
M
L
 
L
K
 
G
A
 
Q
T
 
V
R
 
E
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
C
T
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
G
N
 
E
T
 
T
R
 
R
N
 
G
I
 
L
I
 
L
D
 
D
Y
 
A
E
 
R
L
 
R
L
 
L
S
 
A
Q
 
C
L
 
L
Q
 
P
P
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
Q
L
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
F
G
 
A
R
|
R
G
 
G
E
 
P
H
 
I
L
 
L
V
 
D
E
 
S
D
 
A
D
 
A
L
 
L
L
 
I
R
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
S
G
 
G
T
 
R
L
 
I
L
 
G
R
 
H
A
 
A
S
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
K
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
E
G
 
A
H
 
S
P
 
P
F
 
F
W
 
W
Q
 
G
R
 
H
K
 
P
E
 
K
I
 
V
T
 
T
I
 
V
T
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
I
S
|
S
A
|
A
R
 
A
T
 
T
L
 
D
R
 
P
D
 
E
A
 
T
T
 
A
I
 
S
E
 
A
Q
 
I
I
 
V
T
 
G
G
 
A
K
 
H
I
 
V
R
 
A
D
 
D
H
 
Y
A
 
R
Q
 
A
G
 
T
L
 
G
A
 
R
I
 
I
T
 
P
G
 
P
I
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
L
E
 
T
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y

5mh6A D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with 2-ketohexanoic acid and NAD+ (1.35 a resolution)
35% identity, 66% coverage: 96:298/309 of query aligns to 93:296/306 of 5mh6A

query
sites
5mh6A
M
 
V
A
 
G
E
 
E
Y
 
T
V
 
V
L
 
A
H
 
G
Q
 
Y
L
 
M
L
 
L
E
 
T
A
 
F
S
 
A
R
 
R
E
 
R
M
 
L
E
 
H
T
 
A
Y
 
Y
R
 
R
E
 
D
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
H
Q
 
D
G
 
H
V
 
A
W
 
W
K
 
D
I
 
L
H
 
P
R
 
R
-
 
Y
-
 
E
-
 
E
P
 
P
I
 
F
K
x
T
R
 
L
S
x
A
E
 
G
W
 
E
P
 
R
V
 
V
G
 
C
V
 
V
M
 
V
G
 
G
L
 
L
G
|
G
H
x
T
I
x
L
G
 
G
K
 
R
R
 
G
V
 
V
A
 
V
S
 
D
T
 
R
L
 
A
A
 
A
N
 
A
L
 
L
D
 
G
Y
 
M
R
 
E
V
 
V
S
 
V
G
 
G
W
 
V
A
 
R
R
|
R
G
 
S
E
 
G
H
 
D
S
 
P
L
 
V
E
 
D
G
 
N
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Y
 
V
A
 
Y
G
 
T
P
 
P
D
 
D
E
 
R
L
 
L
G
 
H
D
 
E
F
 
A
L
 
I
K
 
A
A
 
D
T
 
A
R
 
R
V
 
F
L
 
V
V
 
V
N
 
L
T
 
A
L
 
T
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
D
N
 
E
T
|
T
R
 
E
N
 
G
I
 
M
I
 
V
D
 
A
Y
 
A
E
 
P
L
 
E
L
x
F
S
x
E
Q
 
T
L
x
M
Q
 
R
P
 
E
G
 
D
A
 
A
V
 
S
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
|
V
G
x
A
R
|
R
G
|
G
E
x
P
H
 
V
L
x
V
V
 
V
E
|
E
D
 
S
D
 
D
L
 
L
L
 
V
R
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
S
G
 
G
T
x
D
L
 
I
L
 
A
R
 
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
x
S
K
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
E
G
 
D
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
Q
 
D
R
 
F
K
 
E
E
 
D
I
 
V
T
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
V
S
|
S
A
 
A
R
 
A
T
 
T
L
 
S
R
 
K
D
 
-
A
 
-
T
x
Y
I
 
H
E
 
E
Q
 
D
I
 
V
T
 
A
G
 
A
K
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
E
H
 
N
A
 
I
Q
 
E
G
 
K
L
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5mhaB D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with a mixture of 2-ketohexanoic acid and 2-hydroxyhexanoic acid, and NADPH (1.57 a resolution)
35% identity, 66% coverage: 96:298/309 of query aligns to 95:298/308 of 5mhaB

query
sites
5mhaB
M
 
V
A
 
G
E
 
E
Y
 
T
V
 
V
L
 
A
H
 
G
Q
 
Y
L
 
M
L
 
L
E
 
T
A
 
F
S
 
A
R
 
R
E
 
R
M
 
L
E
 
H
T
 
A
Y
 
Y
R
 
R
E
 
D
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
H
Q
 
D
G
 
H
V
 
A
W
 
W
K
 
D
I
 
L
H
 
P
R
 
R
-
 
Y
-
 
E
-
 
E
P
 
P
I
 
F
K
 
T
R
 
L
S
 
A
E
 
G
W
 
E
P
 
R
V
 
V
G
 
C
V
 
V
M
 
V
G
 
G
L
|
L
G
|
G
H
x
T
I
x
L
G
 
G
K
 
R
R
 
G
V
 
V
A
 
V
S
 
D
T
 
R
L
 
A
A
 
A
N
 
A
L
 
L
D
 
G
Y
 
M
R
 
E
V
 
V
S
 
V
G
 
G
W
 
V
A
x
R
R
|
R
G
x
S
E
 
G
H
 
D
S
 
P
L
 
V
E
 
D
G
 
N
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Y
 
V
A
 
Y
G
 
T
P
|
P
D
 
D
E
 
R
L
 
L
G
 
H
D
 
E
F
 
A
L
 
I
K
 
A
A
 
D
T
 
A
R
 
R
V
 
F
L
 
V
V
 
V
N
 
L
T
 
A
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
D
N
 
E
T
|
T
R
 
E
N
 
G
I
 
M
I
 
V
D
 
A
Y
 
A
E
 
P
L
 
E
L
x
F
S
x
E
Q
 
T
L
x
M
Q
 
R
P
 
E
G
 
D
A
 
A
V
 
S
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
|
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
E
 
P
H
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
E
D
 
S
D
 
D
L
 
L
L
 
V
R
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
S
G
 
G
T
x
D
L
 
I
L
 
A
R
 
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
S
K
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
E
G
 
D
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
Q
 
D
R
 
F
K
 
E
E
 
D
I
 
V
T
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
V
S
|
S
A
 
A
R
 
A
T
 
T
L
 
S
R
 
K
D
 
-
A
 
-
T
x
Y
I
 
H
E
 
E
Q
 
D
I
 
V
T
 
A
G
 
A
K
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
E
H
 
N
A
 
I
Q
 
E
G
 
K
L
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5mhaA D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with a mixture of 2-ketohexanoic acid and 2-hydroxyhexanoic acid, and NADPH (1.57 a resolution)
35% identity, 66% coverage: 96:298/309 of query aligns to 95:298/308 of 5mhaA

query
sites
5mhaA
M
 
V
A
 
G
E
 
E
Y
 
T
V
 
V
L
 
A
H
 
G
Q
 
Y
L
 
M
L
 
L
E
 
T
A
 
F
S
 
A
R
 
R
E
 
R
M
 
L
E
 
H
T
 
A
Y
 
Y
R
 
R
E
 
D
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
H
Q
 
D
G
 
H
V
 
A
W
 
W
K
 
D
I
 
L
H
 
P
R
 
R
-
 
Y
-
 
E
-
 
E
P
 
P
I
 
F
K
x
T
R
 
L
S
x
A
E
 
G
W
 
E
P
 
R
V
 
V
G
 
C
V
 
V
M
 
V
G
 
G
L
|
L
G
|
G
H
x
T
I
x
L
G
 
G
K
 
R
R
 
G
V
 
V
A
 
V
S
 
D
T
 
R
L
 
A
A
 
A
N
 
A
L
 
L
D
 
G
Y
 
M
R
 
E
V
 
V
S
 
V
G
 
G
W
 
V
A
x
R
R
|
R
G
x
S
E
 
G
H
 
D
S
 
P
L
 
V
E
 
D
G
 
N
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Y
 
V
A
 
Y
G
 
T
P
|
P
D
 
D
E
 
R
L
 
L
G
 
H
D
 
E
F
 
A
L
 
I
K
 
A
A
 
D
T
 
A
R
 
R
V
 
F
L
 
V
V
 
V
N
 
L
T
 
A
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
D
N
 
E
T
|
T
R
 
E
N
 
G
I
 
M
I
 
V
D
 
A
Y
 
A
E
 
P
L
 
E
L
 
F
S
 
E
Q
 
T
L
 
M
Q
 
R
P
 
E
G
 
D
A
 
A
V
 
S
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
|
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
E
 
P
H
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
E
D
 
S
D
 
D
L
 
L
L
 
V
R
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
S
G
 
G
T
 
D
L
 
I
L
 
A
R
 
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
S
K
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
E
G
 
D
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
Q
 
D
R
 
F
K
 
E
E
 
D
I
 
V
T
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
V
S
|
S
A
 
A
R
 
A
T
 
T
L
 
S
R
 
K
D
 
-
A
 
-
T
x
Y
I
 
H
E
 
E
Q
 
D
I
 
V
T
 
A
G
 
A
K
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
E
H
 
N
A
 
I
Q
 
E
G
 
K
L
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5mh5A D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with 2-keto-hexanoic acid and NADP+ (1.4 a resolution)
35% identity, 66% coverage: 96:298/309 of query aligns to 95:298/308 of 5mh5A

query
sites
5mh5A
M
 
V
A
 
G
E
 
E
Y
 
T
V
 
V
L
 
A
H
 
G
Q
 
Y
L
 
M
L
 
L
E
 
T
A
 
F
S
 
A
R
 
R
E
 
R
M
 
L
E
 
H
T
 
A
Y
 
Y
R
 
R
E
 
D
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
H
Q
 
D
G
 
H
V
 
A
W
 
W
K
 
D
I
 
L
H
 
P
R
 
R
-
 
Y
-
 
E
-
 
E
P
 
P
I
 
F
K
x
T
R
 
L
S
x
A
E
 
G
W
 
E
P
 
R
V
 
V
G
 
C
V
 
V
M
 
V
G
|
G
L
|
L
G
|
G
H
x
T
I
x
L
G
 
G
K
 
R
R
 
G
V
 
V
A
 
V
S
 
D
T
 
R
L
 
A
A
 
A
N
 
A
L
 
L
D
 
G
Y
 
M
R
 
E
V
 
V
S
 
V
G
 
G
W
 
V
A
x
R
R
|
R
G
x
S
E
 
G
H
 
D
S
 
P
L
 
V
E
 
D
G
 
N
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Y
 
V
A
 
Y
G
 
T
P
 
P
D
 
D
E
 
R
L
 
L
G
 
H
D
 
E
F
 
A
L
 
I
K
 
A
A
 
D
T
 
A
R
 
R
V
 
F
L
 
V
V
 
V
N
 
L
T
 
A
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
D
N
 
E
T
|
T
R
 
E
N
 
G
I
 
M
I
 
V
D
 
A
Y
 
A
E
 
P
L
 
E
L
x
F
S
x
E
Q
 
T
L
x
M
Q
 
R
P
 
E
G
 
D
A
 
A
V
 
S
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
|
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
E
 
P
H
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
E
D
 
S
D
 
D
L
 
L
L
 
V
R
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
S
G
 
G
T
x
D
L
 
I
L
 
A
R
 
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
S
K
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
E
G
 
D
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
Q
 
D
R
 
F
K
 
E
E
 
D
I
 
V
T
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
V
S
|
S
A
 
A
R
 
A
T
 
T
L
 
S
R
 
K
D
 
-
A
 
-
T
x
Y
I
 
H
E
 
E
Q
 
D
I
 
V
T
 
A
G
 
A
K
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
E
H
 
N
A
 
I
Q
 
E
G
 
K
L
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
31% identity, 72% coverage: 73:296/309 of query aligns to 91:305/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
L
 
V
K
 
R
V
 
V
A
 
T
N
 
N
L
 
T
P
 
P
E
 
D
A
 
V
L
 
L
T
 
T
V
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
D
D
 
D
-
 
V
A
 
A
G
 
D
M
 
L
S
 
A
V
 
I
Q
 
G
M
 
L
A
 
I
E
 
L
Y
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
R
Q
 
R
L
 
I
L
 
C
E
 
E
A
 
C
S
 
D
R
 
K
E
 
Y
M
 
V
E
 
-
T
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
Q
 
-
Q
 
-
R
 
R
Q
 
R
G
 
G
V
 
A
W
 
W
K
 
K
I
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
F
H
 
K
R
 
L
P
 
T
I
 
T
K
 
K
R
 
F
S
 
S
E
 
G
W
 
K
P
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
I
M
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
H
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
L
R
 
A
V
 
V
A
 
A
S
 
E
T
 
R
L
 
A
A
 
E
N
 
A
L
 
F
D
 
D
Y
 
C
R
 
P
V
 
I
S
 
S
G
 
Y
W
 
F
A
x
S
R
|
R
G
x
S
E
 
K
H
 
K
S
 
P
L
 
N
E
 
T
G
 
N
V
 
Y
S
 
T
T
 
Y
Y
 
Y
A
 
G
G
 
S
P
 
V
D
 
V
E
 
E
L
 
L
G
 
A
D
 
-
F
 
-
L
 
-
K
 
S
A
 
N
T
 
S
R
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
V
T
 
A
L
 
C
P
 
P
L
 
L
T
 
T
D
 
P
N
 
E
T
 
T
R
 
T
N
 
H
I
 
I
I
 
I
D
 
N
Y
 
R
E
 
E
L
 
V
L
 
I
S
 
D
Q
 
A
L
 
L
Q
 
G
P
 
P
G
 
K
A
 
G
V
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
x
I
G
 
G
R
 
R
G
 
G
E
 
P
H
 
H
L
 
V
V
 
D
E
 
E
D
 
P
D
 
E
L
 
L
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
V
D
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
L
L
 
G
R
 
G
A
 
A
S
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
K
 
R
E
 
E
P
 
P
-
 
E
L
 
V
P
 
P
E
 
E
G
 
-
H
 
-
P
 
K
F
 
L
W
 
F
Q
 
G
R
 
L
K
 
E
E
 
N
I
 
V
T
 
V
I
 
L
T
 
L
P
 
P
H
 
H
I
 
V
S
 
G
A
 
S
R
 
G
T
 
T
L
 
V
-
 
E
-
 
T
R
 
R
D
 
K
A
 
V
T
 
M
I
 
A
E
 
D
Q
 
L
I
 
V
T
 
V
G
 
G
K
 
N
I
 
L
R
 
E
D
 
A
H
 
H
A
 
F
Q
 
S
G
 
G

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
31% identity, 72% coverage: 73:296/309 of query aligns to 89:303/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
L
 
V
K
 
R
V
 
V
A
 
T
N
 
N
L
 
T
P
 
P
E
 
D
A
 
V
L
|
L
T
 
T
V
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
D
D
 
D
-
 
V
A
 
A
G
 
D
M
 
L
S
 
A
V
 
I
Q
 
G
M
 
L
A
 
I
E
 
L
Y
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
R
Q
 
R
L
 
I
L
 
C
E
 
E
A
 
C
S
 
D
R
 
K
E
 
Y
M
 
V
E
 
-
T
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
Q
 
-
Q
 
-
R
 
R
Q
 
R
G
 
G
V
 
A
W
 
W
K
 
K
I
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
F
H
 
K
R
 
L
P
 
T
I
 
T
K
 
K
R
 
F
S
 
S
E
 
G
W
 
K
P
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
I
M
 
I
G
|
G
L
|
L
G
|
G
H
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
L
R
 
A
V
 
V
A
 
A
S
 
E
T
 
R
L
 
A
A
 
E
N
 
A
L
 
F
D
 
D
Y
 
C
R
 
P
V
 
I
S
 
S
G
 
Y
W
 
F
A
x
S
R
|
R
G
x
S
E
 
K
H
 
K
S
 
P
L
 
N
E
 
T
G
 
N
V
 
Y
S
 
T
T
 
Y
Y
 
Y
A
 
G
G
 
S
P
 
V
D
 
V
E
 
E
L
 
L
G
 
A
D
 
-
F
 
-
L
 
-
K
 
S
A
 
N
T
 
S
R
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
V
T
 
A
L
x
C
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
P
N
 
E
T
|
T
R
 
T
N
 
H
I
 
I
I
 
I
D
 
N
Y
 
R
E
 
E
L
 
V
L
 
I
S
 
D
Q
 
A
L
 
L
Q
 
G
P
 
P
G
 
K
A
 
G
V
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
x
I
G
|
G
R
|
R
G
 
G
E
 
P
H
 
H
L
 
V
V
 
D
E
 
E
D
 
P
D
 
E
L
 
L
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
V
D
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
L
L
 
G
R
 
G
A
|
A
S
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
K
 
R
E
|
E
P
 
P
-
 
E
L
 
V
P
 
P
E
 
E
G
 
-
H
 
-
P
 
K
F
 
L
W
 
F
Q
 
G
R
 
L
K
 
E
E
 
N
I
 
V
T
 
V
I
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
V
S
x
G
A
 
S
R
 
G
T
 
T
L
 
V
-
 
E
-
 
T
R
 
R
D
 
K
A
 
V
T
 
M
I
 
A
E
 
D
Q
 
L
I
 
V
T
 
V
G
 
G
K
 
N
I
 
L
R
 
E
D
 
A
H
 
H
A
 
F
Q
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6t9wB Crystal structure of formate dehydrogenase fdh2 d222a/q223r enzyme from granulicella mallensis mp5actx8 in complex with NADP and azide.
27% identity, 83% coverage: 23:278/309 of query aligns to 87:338/383 of 6t9wB

query
sites
6t9wB
L
 
L
P
 
P
E
 
D
A
 
A
K
 
E
V
 
I
Y
 
V
V
 
I
W
 
S
D
 
Q
P
|
P
E
x
F
G
 
W
P
 
P
A
 
A
V
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
A
 
-
I
 
-
V
 
-
W
 
Y
Q
 
L
P
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
R
L
 
I
F
 
-
E
 
A
R
 
K
E
 
A
K
 
K
H
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
L
V
 
A
F
 
V
N
 
T
L
 
A
G
|
G
A
x
I
G
 
G
I
 
S
D
 
D
G
 
H
L
 
V
L
 
D
K
 
L
V
 
E
A
 
A
N
 
A
L
 
I
P
 
K
E
 
N
A
 
G
L
 
I
T
 
T
V
 
V
V
 
A
R
 
E
L
 
V
E
 
T
D
 
Y
A
 
S
G
x
N
M
 
-
S
|
S
V
 
I
Q
 
S
M
x
V
A
 
S
E
 
E
Y
 
H
V
 
V
L
 
V
H
 
M
Q
 
M
L
 
I
L
 
L
E
 
S
A
 
L
S
 
V
R
 
R
E
 
N
M
 
Y
E
 
I
T
 
P
Y
 
S
R
 
Y
E
 
Q
Q
 
W
Q
 
V
R
 
I
Q
 
K
G
 
G
V
 
G
W
 
W
K
 
N
I
 
I
H
 
A
R
 
D
P
 
C
I
 
V
K
 
E
R
 
R
S
 
S
-
 
Y
-
 
D
-
 
L
-
 
E
E
 
A
W
 
M
P
 
H
V
 
V
G
 
G
V
 
T
M
 
V
G
x
A
L
 
A
G
|
G
H
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
L
R
 
A
V
 
V
A
 
L
S
 
K
T
 
R
L
 
L
A
 
K
N
 
P
L
 
F
D
 
D
Y
 
V
R
 
K
V
 
L
S
 
H
G
 
Y
W
x
F
A
 
A
R
|
R
G
 
H
E
 
R
-
 
L
-
 
P
H
 
E
S
 
S
L
 
V
E
 
E
G
 
N
V
 
E
S
 
L
T
 
G
Y
 
L
A
 
T
G
 
Y
P
 
H
D
 
P
E
 
S
L
 
V
G
 
E
D
 
D
F
 
M
L
 
V
K
 
K
A
 
V
T
 
C
R
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
T
N
 
I
T
 
N
L
 
A
P
|
P
L
 
L
T
x
H
D
 
P
N
 
G
T
|
T
R
 
L
N
 
D
I
 
L
I
 
F
D
 
N
Y
 
D
E
 
E
L
 
L
L
 
I
S
 
S
Q
 
K
L
 
M
Q
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
x
T
G
x
A
R
|
R
G
 
G
E
 
K
H
 
I
L
 
C
V
 
N
E
 
R
D
 
D
D
 
A
L
 
V
L
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
E
D
 
S
G
 
G
T
 
Q
L
 
L
L
 
A
R
 
G
A
 
Y
S
 
A
L
 
G
D
|
D
V
 
V
F
 
W
R
 
F
K
 
P
E
 
Q
P
 
P
L
 
A
P
 
P
E
 
K
G
 
D
H
 
H
P
 
P
F
 
W
W
 
R
Q
 
T
R
 
M
K
 
P
E
 
H
I
 
H
T
 
G
I
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
S
|
S
A
x
G
R
 
T
T
 
S
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9UBQ7 Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase; EC 1.1.1.79; EC 1.1.1.81 from Homo sapiens (Human) (see paper)
28% identity, 72% coverage: 58:279/309 of query aligns to 74:300/328 of Q9UBQ7

query
sites
Q9UBQ7
H
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
V
V
 
I
F
 
S
N
 
T
L
 
M
G
 
S
A
x
V
G
|
G
I
 
I
D
 
D
G
 
H
L
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
K
-
 
R
-
 
G
L
 
I
K
 
R
V
 
V
A
 
G
N
 
Y
L
 
T
P
 
P
E
 
D
A
 
V
L
 
L
T
 
T
V
 
D
V
 
T
R
 
-
L
 
-
E
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
M
 
-
S
 
-
V
 
-
Q
 
-
M
 
T
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
A
L
 
V
H
 
S
Q
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
T
A
 
T
S
 
C
R
 
R
E
 
R
M
 
L
E
 
P
T
 
E
Y
 
A
R
 
I
E
 
E
Q
 
E
Q
 
V
R
 
K
Q
 
N
G
 
G
V
 
G
W
 
W
K
 
T
I
 
S
H
 
W
R
 
K
P
 
P
I
 
L
-
 
W
-
 
L
-
 
C
-
 
G
-
 
Y
K
 
G
R
 
L
S
 
T
E
 
Q
W
 
S
P
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
I
M
 
I
G
 
G
L
 
L
G
|
G
H
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
A
V
 
I
A
 
A
S
 
R
T
 
R
L
 
L
A
 
K
N
 
P
L
 
F
D
 
G
Y
 
V
R
 
Q
V
 
R
S
 
F
G
 
L
W
 
Y
A
 
T
-
 
G
-
x
R
-
x
Q
-
x
P
R
|
R
G
 
P
E
 
E
H
 
E
S
 
A
L
 
A
E
 
E
G
 
F
V
 
Q
S
 
A
T
 
E
Y
 
F
A
 
V
G
 
S
P
 
T
D
 
P
E
 
E
L
 
L
G
 
A
D
 
-
F
 
-
L
 
-
K
 
A
A
 
Q
T
 
S
R
 
D
V
 
F
L
 
I
V
 
V
N
 
V
T
 
A
L
 
C
P
x
S
L
 
L
T
 
T
D
 
P
N
 
A
T
 
T
R
 
E
N
 
G
I
 
L
I
 
C
D
 
N
Y
 
K
E
 
D
L
 
F
L
 
F
S
 
Q
Q
 
K
L
 
M
Q
 
K
P
 
E
G
 
T
A
 
A
V
 
V
L
 
F
I
 
I
N
 
N
V
x
I
G
 
S
R
|
R
G
 
G
E
 
D
H
 
V
L
 
V
V
 
N
E
 
Q
D
 
D
D
 
D
L
 
L
L
 
Y
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
A
D
 
S
G
 
G
T
 
K
L
 
I
L
 
A
R
 
A
A
 
A
S
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
T
R
 
S
K
 
P
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
T
G
 
N
H
 
H
P
 
P
F
 
L
W
 
L
Q
 
T
R
 
L
K
 
K
E
 
N
I
 
C
T
 
V
I
 
I
T
 
L
P
 
P
H
|
H
I
|
I
S
x
G
A
x
S
R
 
A
T
 
T
L
 
H
R
 
R

2gcgA Ternary crystal structure of human glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase (see paper)
28% identity, 72% coverage: 58:279/309 of query aligns to 70:296/324 of 2gcgA

query
sites
2gcgA
H
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
V
V
 
I
F
 
S
N
 
T
L
 
M
G
x
S
A
x
V
G
|
G
I
 
I
D
 
D
G
 
H
L
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
K
-
 
R
-
 
G
L
 
I
K
 
R
V
 
V
A
 
G
N
 
Y
L
 
T
P
 
P
E
 
D
A
 
V
L
|
L
T
 
T
V
 
D
V
 
T
R
 
-
L
 
-
E
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
M
 
-
S
 
-
V
 
-
Q
 
-
M
x
T
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
A
L
 
V
H
 
S
Q
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
T
A
 
T
S
 
C
R
 
R
E
 
R
M
 
L
E
 
P
T
 
E
Y
 
A
R
 
I
E
 
E
Q
 
E
Q
 
V
R
 
K
Q
 
N
G
 
G
V
 
G
W
 
W
K
 
T
I
 
S
H
 
W
R
 
K
P
 
P
I
 
L
-
 
W
-
 
L
-
 
C
-
 
G
-
 
Y
K
 
G
R
 
L
S
 
T
E
 
Q
W
 
S
P
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
I
M
 
I
G
|
G
L
 
L
G
|
G
H
 
R
I
|
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
A
V
 
I
A
 
A
S
 
R
T
 
R
L
 
L
A
 
K
N
 
P
L
 
F
D
 
G
Y
 
V
R
 
Q
V
 
R
S
 
F
G
 
L
W
 
Y
A
 
T
-
x
G
-
x
R
-
 
Q
-
 
P
R
|
R
G
 
P
E
 
E
H
 
E
S
 
A
L
 
A
E
 
E
G
 
F
V
 
Q
S
 
A
T
 
E
Y
 
F
A
 
V
G
 
S
P
 
T
D
 
P
E
 
E
L
 
L
G
 
A
D
 
-
F
 
-
L
 
-
K
 
A
A
 
Q
T
 
S
R
 
D
V
 
F
L
 
I
V
 
V
N
 
V
T
 
A
L
x
C
P
x
S
L
 
L
T
 
T
D
 
P
N
 
A
T
|
T
R
 
E
N
 
G
I
 
L
I
 
C
D
 
N
Y
 
K
E
 
D
L
 
F
L
 
F
S
 
Q
Q
 
K
L
 
M
Q
 
K
P
 
E
G
 
T
A
 
A
V
 
V
L
 
F
I
 
I
N
 
N
V
x
I
G
 
S
R
|
R
G
 
G
E
 
D
H
 
V
L
 
V
V
 
N
E
 
Q
D
 
D
D
 
D
L
 
L
L
 
Y
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
A
D
 
S
G
 
G
T
 
K
L
 
I
L
 
A
R
 
A
A
 
A
S
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
T
R
 
S
K
 
P
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
T
G
 
N
H
 
H
P
 
P
F
 
L
W
 
L
Q
 
T
R
 
L
K
 
K
E
 
N
I
 
C
T
 
V
I
 
I
T
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
I
S
x
G
A
 
S
R
 
A
T
 
T
L
 
H
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>GFF3998 FitnessBrowser__Marino:GFF3998
MKILFVAGDPKPERWTVPIKELLPEAKVYVWDPEGPAVDADYAIVWQPPEALFEREKHLK
AVFNLGAGIDGLLKVANLPEALTVVRLEDAGMSVQMAEYVLHQLLEASREMETYREQQRQ
GVWKIHRPIKRSEWPVGVMGLGHIGKRVASTLANLDYRVSGWARGEHSLEGVSTYAGPDE
LGDFLKATRVLVNTLPLTDNTRNIIDYELLSQLQPGAVLINVGRGEHLVEDDLLRALDDG
TLLRASLDVFRKEPLPEGHPFWQRKEITITPHISARTLRDATIEQITGKIRDHAQGLAIT
GIVDTERGY

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory