SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF4005 FitnessBrowser__psRCH2:GFF4005 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P0A962 L-asparaginase 1; L-asparaginase I; L-ASNase I; L-asparagine amidohydrolase I; EC 3.5.1.1 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
36% identity, 98% coverage: 6:326/327 of query aligns to 4:335/338 of P0A962

query
sites
P0A962
E
 
K
R
 
S
L
 
I
L
 
Y
V
 
V
L
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
I
 
I
G
 
G
M
 
M
Q
 
Q
Q
 
R
S
 
S
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
L
 
Y
M
 
I
P
 
P
A
 
V
S
 
S
G
 
G
-
 
H
F
 
L
E
 
Q
A
 
R
R
 
Q
L
 
L
R
 
A
A
 
L
Q
 
M
Q
 
P
A
 
E
L
 
F
E
 
H
T
 
R
G
 
P
P
 
E
L
 
M
P
 
P
S
 
D
W
 
F
T
 
T
F
 
I
R
 
H
E
 
E
L
 
Y
Q
 
T
P
 
P
L
 
L
L
 
M
D
 
D
S
 
S
A
 
S
N
 
D
M
 
M
Q
 
T
P
 
P
S
 
E
H
 
D
W
 
W
L
 
Q
Q
 
H
M
 
I
A
 
A
T
 
E
A
 
D
V
 
I
R
 
K
E
 
-
A
 
-
V
 
A
A
 
H
Q
 
Y
S
 
D
D
 
D
C
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
F
L
 
V
L
 
I
L
 
L
H
 
H
G
 
G
T
|
T
D
 
D
T
 
T
L
 
M
A
 
A
Y
 
Y
S
 
T
A
 
A
A
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
F
 
F
L
 
M
L
 
L
L
 
E
D
 
N
L
 
L
E
 
G
I
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
I
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
M
x
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
L
G
 
A
S
 
E
P
 
L
G
 
R
S
 
S
D
 
D
A
 
G
W
 
Q
P
 
I
N
 
N
L
 
L
F
 
L
G
 
N
A
 
A
M
 
L
R
 
Y
A
 
V
L
 
A
Q
 
A
A
 
N
G
 
Y
R
 
P
V
 
I
E
 
N
G
 
E
V
 
V
R
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
F
N
 
N
G
 
N
V
 
R
L
 
L
L
 
Y
H
 
R
G
 
G
A
 
N
R
 
R
V
 
T
S
x
T
K
 
K
L
 
A
R
 
H
S
 
A
D
 
D
A
 
G
F
 
F
D
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
A
-
 
S
-
 
P
E
 
N
A
 
L
P
 
P
R
 
P
K
 
L
R
 
L
S
 
E
A
 
A
T
 
G
V
 
I
V
 
H
G
 
I
E
 
R
R
 
R
-
 
L
-
 
N
-
 
T
P
 
P
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
H
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
L
M
 
I
L
 
V
L
 
H
P
 
P
Q
 
I
Q
 
T
P
 
P
A
 
Q
Q
 
P
V
 
I
V
 
G
V
 
V
L
 
V
P
 
T
L
 
I
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
I
G
 
S
A
 
A
A
 
D
Q
 
V
V
 
V
Q
 
R
A
 
N
L
 
F
V
 
L
A
 
R
S
 
Q
G
 
P
A
 
V
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
E
x
R
C
 
S
Y
 
Y
G
 
G
S
 
V
G
 
G
T
 
N
G
 
A
P
 
P
A
 
Q
G
 
N
D
 
K
A
 
A
P
 
-
F
 
F
I
 
L
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
R
 
Q
Q
 
E
A
 
A
H
 
S
R
 
D
Q
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
V
L
 
V
A
 
V
A
 
N
I
 
L
S
 
T
Q
 
Q
C
 
C
P
 
M
G
 
S
G
 
G
H
 
K
V
 
V
D
 
N
F
 
M
G
 
G
V
 
G
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
N
G
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
S
 
G
G
 
G
G
 
A
G
 
D
M
 
M
T
 
T
R
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
T
L
 
L
G
 
T
K
 
K
L
 
L
F
 
H
A
 
Y
L
 
L
L
 
L
T
 
S
A
 
Q
G
 
E
L
 
L
N
 
D
Q
 
T
A
 
E
Q
 
T
V
 
I
E
 
R
H
 
K
W
 
A
F
 
M
C
 
S
R
 
Q
D
 
N
L
 
L
C
 
R
G
 
G
E
 
E
M
 
L
A
 
T

6nxcB Ecai(t162a) mutant in complex with citrate at ph 4 (see paper)
35% identity, 98% coverage: 6:326/327 of query aligns to 11:334/336 of 6nxcB

query
sites
6nxcB
E
 
K
R
 
S
L
 
I
L
 
Y
V
 
V
L
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
I
 
I
G
 
G
M
 
M
Q
 
Q
Q
 
R
S
 
S
A
 
G
A
 
H
G
 
-
L
 
-
M
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
L
E
 
Q
A
 
R
R
 
Q
L
 
L
R
 
A
A
 
L
Q
 
M
Q
 
P
A
 
E
L
 
F
E
 
H
T
 
R
G
 
P
P
 
E
L
 
M
P
 
P
S
 
D
W
 
F
T
 
T
F
 
I
R
 
H
E
 
E
L
 
Y
Q
 
T
P
 
P
L
 
L
L
 
M
D
 
D
S
 
S
A
 
S
N
 
D
M
 
M
Q
 
T
P
 
P
S
 
E
H
 
D
W
 
W
L
 
Q
Q
 
H
M
 
I
A
 
A
T
 
E
A
 
D
V
 
I
R
 
K
E
 
-
A
 
-
V
 
A
A
 
H
Q
 
Y
S
 
D
D
 
D
C
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
F
L
 
V
L
 
I
L
 
L
H
 
H
G
 
G
T
|
T
D
|
D
T
 
T
L
 
M
A
 
A
Y
 
Y
S
 
T
A
 
A
A
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
F
 
F
L
 
M
L
 
L
L
 
E
D
 
N
L
 
L
E
 
G
I
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
I
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
M
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
L
G
 
A
S
 
E
P
 
L
G
 
R
S
 
S
D
 
D
A
 
G
W
 
Q
P
 
I
N
 
N
L
 
L
F
 
L
G
 
N
A
 
A
M
 
L
R
 
Y
A
 
V
L
 
A
Q
 
A
A
 
N
G
 
Y
R
 
P
V
 
I
E
 
N
G
 
E
V
 
V
R
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
F
N
 
N
G
 
N
V
 
R
L
 
L
L
 
Y
H
 
R
G
 
G
A
 
N
R
 
R
V
 
T
S
 
A
K
|
K
L
 
A
R
 
H
S
 
A
D
 
D
A
 
G
F
 
F
D
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
A
-
 
S
-
 
P
E
 
N
A
 
L
P
 
P
R
 
P
K
 
L
R
 
L
S
 
E
A
 
A
T
 
G
V
 
I
V
 
H
G
 
I
E
 
R
R
 
R
-
 
L
-
 
N
-
 
T
P
 
P
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
H
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
L
M
 
I
L
 
V
L
 
H
P
 
P
Q
 
I
Q
 
T
P
 
P
A
 
Q
Q
 
P
V
 
I
V
 
G
V
 
V
L
 
V
P
 
T
L
 
I
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
I
G
 
S
A
 
A
A
 
D
Q
 
V
V
 
V
Q
 
R
A
 
N
L
 
F
V
 
L
A
 
R
S
 
Q
G
 
P
A
 
V
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
E
x
R
C
 
S
Y
 
Y
G
 
G
S
 
V
G
 
G
T
 
N
G
 
A
P
 
P
A
 
Q
G
 
N
D
 
K
A
 
A
P
 
-
F
 
F
I
 
L
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
R
 
Q
Q
 
E
A
 
A
H
 
S
R
 
D
Q
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
V
L
 
V
A
 
V
A
 
N
I
 
L
S
 
T
Q
|
Q
C
|
C
P
 
M
G
 
S
G
 
G
H
 
K
V
 
V
D
 
N
F
 
M
G
 
G
V
 
G
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
G
|
G
S
 
N
G
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
S
 
G
G
 
G
G
 
A
G
 
D
M
 
M
T
|
T
R
x
V
E
|
E
A
 
A
A
 
T
L
 
L
G
 
T
K
 
K
L
 
L
F
 
H
A
 
Y
L
 
L
L
 
L
T
 
S
A
 
Q
G
 
E
L
 
L
N
 
D
Q
 
T
A
 
E
Q
 
T
V
 
I
E
 
R
H
 
K
W
 
A
F
 
M
C
 
S
R
 
Q
D
 
N
L
 
L
C
 
R
G
 
G
E
 
E
M
 
L
A
 
T

2himA Crystal structure and allosteric regulation of the cytoplasmic escherichia coli l-asparaginase i (see paper)
34% identity, 98% coverage: 6:326/327 of query aligns to 2:323/324 of 2himA

query
sites
2himA
E
 
K
R
 
S
L
 
I
L
 
Y
V
 
V
L
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
I
 
I
G
 
G
M
 
M
Q
 
Q
Q
 
R
S
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
M
 
I
P
 
P
A
 
V
S
 
S
G
 
G
-
 
H
F
 
L
E
 
Q
A
 
R
R
 
Q
L
 
L
R
 
A
A
 
L
Q
 
M
Q
 
P
A
 
E
L
 
F
E
 
H
T
 
R
G
 
P
P
 
E
L
 
M
P
 
P
S
 
D
W
 
F
T
 
T
F
 
I
R
 
H
E
 
E
L
 
Y
Q
 
T
P
 
P
L
 
L
L
 
M
D
|
D
S
|
S
A
x
S
N
 
D
M
 
M
Q
 
T
P
 
P
S
 
E
H
 
D
W
 
W
L
 
Q
Q
 
H
M
 
I
A
 
A
T
 
E
A
 
D
V
 
I
R
 
K
E
 
-
A
 
-
V
 
A
A
 
H
Q
 
Y
S
 
D
D
 
D
C
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
F
L
 
V
L
 
I
L
 
L
H
 
H
G
|
G
T
|
T
D
|
D
T
 
T
L
 
M
A
 
A
Y
 
Y
S
 
T
A
 
A
A
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
F
 
F
L
 
M
L
 
L
L
 
E
D
 
N
L
 
L
E
 
G
I
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
I
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
M
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
L
G
 
A
S
 
E
P
 
L
G
 
R
S
 
S
D
 
D
A
 
G
W
 
Q
P
 
I
N
 
N
L
 
L
F
 
L
G
 
N
A
 
A
M
 
L
R
 
Y
A
 
V
L
 
A
Q
 
A
A
 
N
G
 
Y
R
 
P
V
 
I
E
 
N
G
 
E
V
 
V
R
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
F
N
 
N
G
 
N
V
 
R
L
 
L
L
 
Y
H
 
R
G
 
G
A
 
N
R
 
R
V
 
T
S
 
A
K
|
K
L
 
A
R
 
H
S
 
A
D
 
D
A
 
G
F
 
F
D
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
A
-
 
S
-
 
P
E
 
N
A
 
L
P
 
P
R
 
P
K
 
L
R
 
L
S
 
E
A
 
A
T
 
G
V
 
I
V
 
H
G
 
I
E
 
R
R
 
R
-
 
L
-
 
N
-
 
T
P
 
P
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
H
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
L
M
 
I
L
 
V
L
 
H
P
 
P
Q
 
I
Q
 
T
P
 
P
A
 
Q
Q
 
P
V
 
I
V
 
G
V
 
V
L
 
V
P
 
T
L
 
I
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
I
G
 
S
A
 
A
A
 
D
Q
 
V
V
 
V
Q
 
R
A
 
N
L
 
F
V
 
L
A
 
R
S
 
Q
G
 
P
A
 
V
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
E
x
R
C
 
S
Y
 
Y
G
 
G
S
 
V
G
 
G
T
 
N
G
 
A
P
 
P
A
 
Q
G
 
N
D
 
K
A
 
A
P
 
-
F
 
F
I
 
L
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
R
 
Q
Q
 
E
A
 
A
H
 
S
R
 
D
Q
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
V
L
 
V
A
 
V
A
 
N
I
 
L
S
 
T
Q
 
Q
C
|
C
P
 
M
G
 
S
G
 
G
H
 
K
V
 
V
D
 
N
F
 
M
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
A
 
-
T
 
-
G
|
G
S
 
N
G
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
S
 
G
G
 
G
G
 
A
G
 
D
M
 
M
T
|
T
R
x
V
E
|
E
A
 
A
A
 
T
L
 
L
G
 
T
K
 
K
L
 
L
F
 
H
A
 
Y
L
 
L
L
 
L
T
 
S
A
 
Q
G
 
E
L
 
L
N
 
D
Q
 
T
A
 
E
Q
 
T
V
 
I
E
 
R
H
 
K
W
 
A
F
 
M
C
 
S
R
 
Q
D
 
N
L
 
L
C
 
R
G
 
G
E
 
E
M
 
L
A
 
T

7r6bB Crystal structure of mutant r43d/l124d/r125a/c273s of l-asparaginase i from yersinia pestis (see paper)
33% identity, 98% coverage: 6:327/327 of query aligns to 2:301/301 of 7r6bB

query
sites
7r6bB
E
 
K
R
 
S
L
 
I
L
 
Y
V
 
V
L
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
M
 
M
Q
 
Q
Q
 
R
S
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
Y
M
 
I
P
 
P
A
 
V
S
 
S
G
 
G
-
 
H
F
 
L
E
 
Q
A
 
R
R
 
Q
L
 
L
R
 
A
A
 
L
Q
 
M
Q
 
P
A
 
E
L
 
F
E
 
H
T
 
D
G
 
P
P
 
E
L
 
M
P
 
P
S
 
D
W
 
F
T
 
T
F
 
I
R
x
H
E
 
E
L
x
Y
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
I
D
 
D
S
 
S
A
 
S
N
 
D
M
 
M
Q
 
T
P
 
P
S
 
E
H
 
D
W
 
W
L
 
Q
Q
x
H
M
 
I
A
 
A
T
 
N
A
 
D
V
 
I
R
 
Q
E
 
Q
A
 
N
V
 
Y
A
 
D
Q
 
L
S
 
-
D
 
-
C
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
F
L
 
V
L
 
I
L
 
L
H
 
H
G
 
G
T
 
T
D
 
D
T
 
T
L
 
M
A
 
A
Y
 
F
S
 
T
A
 
A
A
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
F
 
F
L
 
M
L
 
L
L
 
E
D
 
N
L
 
L
E
 
A
I
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
M
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
L
G
 
A
S
 
E
P
 
D
G
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
G
W
 
Q
P
 
T
N
 
N
L
 
L
F
 
L
G
 
N
A
 
A
M
 
L
R
 
Y
A
 
L
L
 
A
Q
 
A
A
 
N
G
 
H
R
 
P
V
 
V
E
 
N
G
 
E
V
 
V
R
 
S
L
 
L
F
 
F
F
 
F
N
 
N
G
 
N
V
 
Q
L
 
L
L
 
F
H
 
R
G
 
G
A
 
N
R
 
R
V
 
T
S
 
T
K
 
K
L
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
-
D
 
-
A
 
A
F
 
F
A
 
A
E
 
S
A
 
P
P
 
-
R
 
-
K
 
-
R
 
-
S
 
N
A
 
L
T
 
S
V
 
V
V
 
L
G
 
L
E
 
N
R
 
G
P
 
P
P
 
L
M
 
I
L
 
V
L
 
H
P
 
R
Q
 
I
Q
 
T
P
 
P
A
 
Q
Q
 
P
V
 
I
V
 
G
V
 
V
L
 
V
P
 
T
L
 
I
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
I
G
 
S
A
 
G
A
 
A
Q
 
V
V
 
V
Q
 
R
A
 
N
L
 
F
V
 
L
A
 
L
S
 
Q
G
 
P
A
 
V
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
E
 
R
C
 
S
Y
 
Y
G
 
G
S
 
V
G
 
G
T
 
N
G
 
A
P
 
P
A
 
Q
G
 
-
D
 
K
A
 
A
P
 
E
F
 
L
I
 
L
E
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
K
Q
 
N
A
 
A
H
 
S
R
 
D
Q
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
V
L
 
V
A
 
V
A
 
N
I
 
L
S
 
T
Q
 
Q
C
 
S
P
 
I
G
 
S
G
 
G
H
 
S
V
 
V
D
 
N
F
 
M
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
N
G
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
F
G
 
D
M
 
M
T
 
T
R
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
T
K
 
K
L
 
L
F
 
H
A
 
Y
L
 
L
L
 
L
T
 
S
A
 
Q
G
 
S
L
 
L
N
 
S
Q
 
P
A
 
N
Q
 
E
V
 
I
E
 
R
H
 
Q
W
 
L
F
 
M
C
 
Q
R
 
Q
D
 
N
L
 
L
C
 
R
G
 
G
E
 
E
M
 
L
A
 
T
N
 
D

4r8lA Crystal structure of the asp-bound guinea pig l-asparaginase 1 catalytic domain (see paper)
34% identity, 98% coverage: 6:326/327 of query aligns to 2:352/354 of 4r8lA

query
sites
4r8lA
E
 
R
R
 
H
L
 
L
L
 
L
V
 
L
L
 
I
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
I
 
L
G
 
G
M
 
M
Q
 
Q
Q
 
S
S
 
K
A
 
G
A
 
G
G
x
V
L
 
L
M
 
V
P
 
P
A
 
G
S
 
P
G
 
G
F
 
L
E
 
V
A
 
T
R
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
T
-
 
L
-
 
P
-
 
M
-
 
F
-
 
H
-
 
D
-
 
K
-
 
E
-
 
F
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
P
Q
 
D
Q
 
H
A
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
A
E
 
S
T
 
H
G
 
G
P
 
P
L
 
R
P
 
V
S
 
L
W
 
Y
T
 
T
F
 
V
R
 
L
E
 
E
L
 
C
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
L
 
L
D
|
D
S
|
S
A
 
S
N
 
D
M
 
M
Q
 
T
P
 
I
S
 
D
H
 
D
W
 
W
L
 
I
Q
 
R
M
 
I
A
 
A
T
 
K
A
 
I
V
 
I
R
 
E
E
 
R
A
 
H
V
 
Y
A
 
E
Q
 
Q
S
 
Y
D
 
Q
C
 
-
D
 
-
A
 
G
V
 
F
L
 
V
L
 
V
L
 
I
H
 
H
G
|
G
T
|
T
D
|
D
T
 
T
L
 
M
A
 
A
Y
 
S
S
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
M
L
 
L
S
 
S
F
 
F
L
 
M
L
 
L
L
 
E
D
 
N
L
 
L
E
 
H
I
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
Q
L
 
V
P
 
P
A
 
I
G
 
R
S
 
V
P
 
L
G
 
W
S
 
N
D
 
D
A
 
A
W
 
R
P
 
E
N
 
N
L
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
A
M
 
L
R
 
L
A
 
V
L
 
A
Q
 
G
A
 
Q
G
 
Y
R
 
I
V
 
I
E
 
P
G
 
E
V
 
V
R
 
C
L
 
L
F
 
F
F
 
M
N
 
N
G
 
S
V
 
Q
L
 
L
L
 
F
H
 
R
G
 
G
A
 
N
R
 
R
V
 
V
S
 
T
K
|
K
L
 
V
R
 
D
S
 
S
D
 
Q
A
 
K
F
 
F
D
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
C
E
 
S
A
 
P
P
 
N
R
 
L
K
 
S
R
 
P
S
 
L
A
 
A
T
 
T
V
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
T
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
D
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
K
V
 
V
G
 
K
E
 
W
R
 
K
P
 
D
P
 
P
M
 
L
L
 
V
L
 
V
-
 
H
P
 
S
Q
 
N
Q
 
M
P
 
E
A
 
H
Q
 
D
V
 
V
V
 
A
V
 
L
L
 
L
P
 
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
I
G
 
P
A
 
A
A
 
S
Q
 
L
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
L
 
F
V
 
L
A
 
Q
S
 
P
G
 
P
A
 
L
Q
 
K
A
 
G
L
 
V
L
 
V
L
 
L
E
 
E
C
 
T
Y
 
F
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
N
G
 
G
P
 
P
A
 
S
G
 
-
D
 
K
A
 
P
P
 
D
F
 
L
I
 
L
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
R
 
R
Q
 
A
A
 
A
H
 
A
R
 
Q
Q
 
R
G
 
G
V
 
L
V
 
I
L
 
M
A
 
V
A
 
N
I
 
C
S
 
S
Q
 
Q
C
 
C
P
 
L
G
 
R
G
 
G
H
 
S
V
 
V
D
 
T
F
 
P
G
 
G
V
 
-
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
G
 
-
S
 
-
G
 
S
L
 
L
R
 
A
D
 
G
A
 
A
G
 
N
L
 
I
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
L
G
 
D
M
 
M
T
 
T
R
 
S
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
K
 
K
L
 
L
-
 
S
F
 
Y
A
 
V
L
 
L
L
 
G
T
 
L
A
 
P
G
 
E
L
 
L
N
 
S
Q
 
L
A
 
E
Q
 
R
V
 
R
E
 
Q
H
 
E
W
 
L
F
 
L
C
 
A
R
 
K
D
 
D
L
 
L
C
 
R
G
 
G
E
 
E
M
 
M
A
 
T

5dndD Crystal structure of the asn-bound guinea pig l-asparaginase 1 catalytic domain active site mutant t116a (see paper)
34% identity, 98% coverage: 6:326/327 of query aligns to 2:352/357 of 5dndD

query
sites
5dndD
E
 
R
R
 
H
L
 
L
L
 
L
V
 
L
L
 
I
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
I
 
L
G
 
G
M
 
M
Q
 
Q
Q
 
S
S
 
K
A
 
G
A
 
G
G
x
V
L
 
L
M
 
V
P
 
P
A
 
G
S
 
P
G
 
G
F
 
L
E
 
V
A
 
T
R
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
T
-
 
L
-
 
P
-
 
M
-
 
F
-
 
H
-
 
D
-
 
K
-
 
E
-
 
F
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
P
Q
 
D
Q
 
H
A
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
A
E
 
S
T
 
H
G
 
G
P
 
P
L
 
R
P
 
V
S
 
L
W
 
Y
T
 
T
F
 
V
R
 
L
E
 
E
L
 
C
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
L
 
L
D
|
D
S
|
S
A
 
S
N
 
D
M
 
M
Q
 
T
P
 
I
S
 
D
H
 
D
W
 
W
L
 
I
Q
 
R
M
 
I
A
 
A
T
 
K
A
 
I
V
 
I
R
 
E
E
 
R
A
 
H
V
 
Y
A
 
E
Q
 
Q
S
 
Y
D
 
Q
C
 
-
D
 
-
A
 
G
V
 
F
L
 
V
L
 
V
L
 
I
H
 
H
G
|
G
T
x
A
D
|
D
T
 
T
L
 
M
A
 
A
Y
 
S
S
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
M
L
 
L
S
 
S
F
 
F
L
 
M
L
 
L
L
 
E
D
 
N
L
 
L
E
 
H
I
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
|
A
M
 
Q
L
 
V
P
 
P
A
 
I
G
 
R
S
 
V
P
 
L
G
 
W
S
 
N
D
 
D
A
 
A
W
 
R
P
 
E
N
 
N
L
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
A
M
 
L
R
 
L
A
 
V
L
 
A
Q
 
G
A
 
Q
G
 
Y
R
 
I
V
 
I
E
 
P
G
 
E
V
 
V
R
 
C
L
 
L
F
 
F
F
 
M
N
 
N
G
 
S
V
 
Q
L
 
L
L
 
F
H
 
R
G
 
G
A
 
N
R
 
R
V
 
V
S
 
T
K
|
K
L
 
V
R
 
D
S
 
S
D
 
Q
A
 
K
F
 
F
D
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
C
E
 
S
A
 
P
P
 
N
R
 
L
K
 
S
R
 
P
S
 
L
A
 
A
T
 
T
V
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
T
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
D
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
K
V
 
V
G
 
K
E
 
W
R
 
K
P
 
D
P
 
P
M
 
L
L
 
V
L
 
V
-
 
H
P
 
S
Q
 
N
Q
 
M
P
 
E
A
 
H
Q
 
D
V
 
V
V
 
A
V
 
L
L
 
L
P
 
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
I
G
 
P
A
 
A
A
 
S
Q
 
L
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
L
 
F
V
 
L
A
 
Q
S
 
P
G
 
P
A
 
L
Q
 
K
A
 
G
L
 
V
L
 
V
L
 
L
E
 
E
C
 
T
Y
 
F
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
N
G
 
G
P
 
P
A
 
S
G
 
-
D
 
K
A
 
P
P
 
D
F
 
L
I
 
L
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
R
 
R
Q
 
A
A
 
A
H
 
A
R
 
Q
Q
 
R
G
 
G
V
 
L
V
 
I
L
 
M
A
 
V
A
 
N
I
 
C
S
 
S
Q
 
Q
C
 
C
P
 
L
G
 
R
G
 
G
H
 
S
V
 
V
D
 
T
F
 
P
G
 
G
V
 
-
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
G
 
-
S
 
-
G
 
S
L
 
L
R
 
A
D
 
G
A
 
A
G
 
N
L
 
I
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
L
G
 
D
M
 
M
T
 
T
R
 
S
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
K
 
K
L
 
L
-
 
S
F
 
Y
A
 
V
L
 
L
L
 
G
T
 
L
A
 
P
G
 
E
L
 
L
N
 
S
Q
 
L
A
 
E
Q
 
R
V
 
R
E
 
Q
H
 
E
W
 
L
F
 
L
C
 
A
R
 
K
D
 
D
L
 
L
C
 
R
G
 
G
E
 
E
M
 
M
A
 
T

5ot0A The thermostable l-asparaginase from thermococcus kodakarensis (see paper)
32% identity, 98% coverage: 7:326/327 of query aligns to 2:326/328 of 5ot0A

query
sites
5ot0A
R
 
K
L
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
L
Y
 
G
T
 
T
G
 
G
G
|
G
T
|
T
I
 
I
G
 
A
M
 
S
Q
 
A
Q
 
K
S
 
T
A
 
E
A
 
M
G
 
G
L
 
-
M
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
F
x
Y
E
 
K
A
 
A
R
 
A
L
 
L
R
 
S
A
 
A
Q
 
D
Q
 
D
A
 
I
L
 
L
E
 
Q
T
 
L
G
 
A
P
 
G
L
 
I
P
 
R
S
 
R
W
 
E
T
 
D
F
 
G
R
 
A
E
 
K
L
 
I
Q
 
E
P
 
T
L
 
R
-
 
D
-
 
I
-
 
L
-
 
N
L
 
L
D
 
D
S
|
S
A
 
T
N
 
L
M
 
I
Q
 
Q
P
 
P
S
 
E
H
 
D
W
 
W
L
 
V
Q
 
T
M
 
I
A
 
G
T
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
F
E
 
E
A
 
A
V
 
F
A
 
-
Q
 
-
S
 
D
D
 
E
C
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
I
L
 
V
L
 
I
L
 
T
H
 
H
G
|
G
T
|
T
D
|
D
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
S
 
T
A
 
S
A
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
F
 
F
L
 
M
L
 
I
L
 
R
D
 
N
L
 
P
E
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
S
M
 
M
L
 
L
P
 
P
A
 
I
G
 
T
S
 
E
P
 
P
G
 
N
S
 
S
D
 
D
A
 
A
W
 
P
P
 
R
N
 
N
L
 
L
F
 
R
G
 
T
A
 
A
M
 
L
R
 
T
A
 
F
L
 
A
Q
 
R
A
 
K
G
 
G
R
 
-
V
 
F
E
 
P
G
 
G
V
 
I
R
 
Y
L
 
V
F
 
A
F
 
F
N
 
M
G
 
D
V
 
K
L
 
I
L
 
M
H
 
L
G
 
G
A
 
T
R
 
R
V
 
V
S
 
S
K
|
K
L
 
V
R
 
H
S
 
S
D
 
L
A
 
G
F
 
L
D
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
Q
E
 
S
A
 
I
P
 
N
R
 
Y
K
 
P
R
 
D
S
 
I
A
 
A
T
 
Y
V
 
V
V
 
K
G
 
G
E
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
H
R
 
K
P
 
P
-
 
R
-
 
I
-
 
G
-
 
N
-
 
G
-
 
E
P
 
P
M
 
L
L
 
F
L
 
D
P
 
P
Q
 
E
Q
 
L
P
 
D
A
 
P
Q
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
H
L
 
I
P
 
R
L
 
L
Y
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
L
G
 
S
A
 
P
A
 
E
Q
 
V
V
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
-
V
 
V
A
 
A
S
 
R
G
 
A
A
 
T
Q
 
D
A
 
G
L
 
I
L
 
V
L
 
L
E
 
E
C
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
A
G
 
G
T
 
G
G
 
I
P
 
P
A
 
Y
G
 
R
D
 
G
A
 
R
P
 
N
F
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
V
L
 
V
R
 
S
Q
 
E
A
 
T
H
 
A
R
 
R
Q
 
E
G
 
K
V
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
M
A
 
T
I
 
T
S
 
Q
Q
 
A
C
 
L
P
 
Y
G
 
G
G
 
G
H
 
-
V
 
V
D
 
D
F
 
L
G
 
T
V
 
R
Y
 
Y
A
 
E
T
 
V
G
|
G
S
 
R
G
 
R
L
 
A
R
 
L
D
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
S
 
P
G
 
A
G
 
G
G
 
D
M
 
M
T
 
T
R
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
T
L
 
L
G
 
T
K
 
K
L
 
L
F
 
M
A
 
W
L
 
A
L
 
L
T
 
G
A
 
H
G
 
T
L
 
R
N
 
D
Q
 
L
A
 
E
Q
 
E
V
 
I
E
 
R
H
 
K
W
 
I
F
 
M
C
 
E
R
 
R
D
 
N
L
 
I
C
 
A
G
 
G
E
 
E
M
 
I
A
 
T

Q8TZE8 L-asparaginase; EC 3.5.1.1 from Pyrococcus furiosus (strain ATCC 43587 / DSM 3638 / JCM 8422 / Vc1) (see 2 papers)
29% identity, 95% coverage: 17:327/327 of query aligns to 6:326/326 of Q8TZE8

query
sites
Q8TZE8
I
 
I
G
 
G
M
 
M
Q
 
G
Q
 
G
S
x
T
A
 
I
A
 
A
G
 
S
L
 
V
M
 
K
P
 
G
A
 
E
S
 
N
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
R
 
S
L
 
L
R
 
S
A
 
V
Q
 
K
Q
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
D
T
 
I
G
 
A
P
 
G
L
 
I
P
 
K
S
 
D
W
 
C
-
 
E
-
 
D
-
 
C
T
 
D
F
 
F
R
 
L
E
 
D
L
 
L
Q
 
K
P
 
N
L
 
V
L
 
-
D
|
D
S
|
S
A
x
T
N
 
L
M
 
I
Q
 
Q
P
 
P
S
 
E
H
 
D
W
 
W
L
 
V
Q
 
D
M
 
L
A
 
A
T
 
E
A
 
T
V
 
L
R
 
Y
E
 
K
A
 
N
V
 
V
A
 
K
Q
 
K
S
 
-
D
 
-
C
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
I
L
 
I
L
 
V
L
 
T
H
 
H
G
 
G
T
|
T
D
|
D
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
S
 
T
A
 
S
A
 
S
A
 
M
L
 
I
S
 
S
F
 
F
L
 
M
L
 
L
L
 
R
D
 
N
L
 
P
E
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
V
L
 
F
T
 
T
G
 
G
A
 
S
M
 
M
L
 
I
P
 
P
A
 
A
G
 
T
S
 
E
P
 
E
G
 
N
S
 
S
D
 
D
A
 
A
W
 
P
P
 
L
N
 
N
L
 
L
F
 
Q
G
 
T
A
 
A
M
 
I
R
 
K
A
 
F
L
 
A
Q
 
T
A
 
S
G
 
G
R
 
-
V
 
I
E
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
Y
L
 
V
F
 
A
F
 
F
N
 
N
G
 
G
V
 
K
L
 
V
L
 
M
H
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
R
V
 
T
S
 
S
K
 
K
L
 
V
R
 
R
S
 
T
D
 
M
A
 
S
F
 
R
D
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
E
E
 
S
A
 
I
P
 
N
R
 
Y
K
 
P
R
 
I
S
 
I
A
 
A
T
 
E
V
 
L
V
 
R
G
 
G
E
 
E
R
 
D
P
 
L
P
 
V
M
 
V
-
 
N
L
 
F
L
 
I
P
 
P
Q
 
K
-
 
F
-
 
N
-
 
N
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
D
-
 
L
-
 
R
Q
 
H
P
 
D
A
 
P
Q
 
K
V
 
V
V
 
L
V
 
V
L
 
I
P
 
K
L
 
L
Y
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
L
G
 
S
A
 
G
A
 
D
Q
 
I
V
 
F
Q
 
R
A
 
A
L
 
A
V
 
V
A
 
E
S
 
L
G
 
G
A
 
Y
Q
 
R
A
 
G
L
 
I
L
 
V
L
 
I
E
 
E
C
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
A
G
 
G
T
 
G
G
 
I
P
 
P
A
 
Y
G
 
R
D
 
G
A
 
S
P
 
D
F
 
L
I
 
L
E
 
Q
A
 
T
L
 
I
R
 
E
Q
 
E
A
 
L
H
 
S
R
 
K
Q
 
E
G
 
-
V
 
I
V
 
P
L
 
I
A
 
V
A
 
M
I
 
T
S
 
T
Q
 
Q
C
 
A
P
 
M
G
 
Y
G
 
D
H
 
G
V
 
V
D
 
D
F
 
L
G
 
T
V
 
R
Y
|
Y
A
x
K
T
 
V
G
 
G
S
 
R
G
 
L
L
 
A
R
 
L
D
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
S
 
P
G
 
A
G
 
G
G
 
D
M
 
M
T
 
T
R
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
T
L
 
V
G
 
T
K
 
K
L
 
L
F
 
M
A
 
W
L
 
I
L
 
L
T
 
G
A
 
H
G
 
T
L
 
N
N
 
N
Q
 
V
A
 
E
Q
 
E
V
 
I
E
 
K
H
 
V
W
 
L
F
 
M
C
 
R
R
 
K
D
 
N
L
 
L
C
 
V
G
 
G
E
 
E
M
 
L
A
 
R
N
 
D

4q0mA Crystal structure of pyrococcus furiosus l-asparaginase (see paper)
29% identity, 95% coverage: 17:327/327 of query aligns to 7:327/327 of 4q0mA

query
sites
4q0mA
I
 
I
G
 
G
M
 
M
Q
 
G
Q
 
G
S
x
T
A
 
I
A
 
A
G
 
S
L
 
V
M
 
K
P
 
G
A
 
E
S
 
N
G
 
G
F
x
Y
E
 
E
A
 
A
R
 
S
L
 
L
R
 
S
A
 
V
Q
 
K
Q
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
D
T
 
I
G
 
A
P
 
G
L
 
I
P
 
K
S
 
D
W
 
C
-
 
E
-
 
D
-
 
C
T
 
D
F
 
F
R
 
L
E
 
D
L
 
L
Q
 
K
P
 
N
L
 
V
L
 
-
D
 
D
S
 
S
A
 
T
N
 
L
M
 
I
Q
 
Q
P
 
P
S
 
E
H
 
D
W
 
W
L
 
V
Q
 
D
M
 
L
A
 
A
T
 
E
A
 
T
V
 
L
R
x
Y
E
 
K
A
 
N
V
 
V
A
 
K
Q
 
K
S
 
-
D
 
-
C
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
I
L
 
I
L
 
V
L
 
T
H
 
H
G
 
G
T
|
T
D
|
D
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
S
 
T
A
 
S
A
 
S
A
 
M
L
 
I
S
 
S
F
 
F
L
 
M
L
 
L
L
 
R
D
 
N
L
 
P
E
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
V
L
 
F
T
 
T
G
 
G
A
 
S
M
 
M
L
 
I
P
 
P
A
 
A
G
 
T
S
 
E
P
 
E
G
 
N
S
 
S
D
 
D
A
 
A
W
 
P
P
 
L
N
 
N
L
 
L
F
 
Q
G
 
T
A
 
A
M
 
I
R
 
K
A
 
F
L
 
A
Q
 
T
A
 
S
G
 
G
R
 
-
V
 
I
E
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
Y
L
 
V
F
 
A
F
 
F
N
 
N
G
 
G
V
 
K
L
 
V
L
 
M
H
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
R
V
 
T
S
 
S
K
|
K
L
 
V
R
 
R
S
 
T
D
 
M
A
 
S
F
 
R
D
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
E
E
 
S
A
 
I
P
 
N
R
 
Y
K
 
P
R
 
I
S
 
I
A
 
A
T
 
E
V
 
L
V
 
R
G
 
G
E
 
E
R
 
D
P
 
L
P
 
V
M
 
V
-
 
N
L
 
F
L
 
I
P
 
P
Q
 
K
-
 
F
-
 
N
-
 
N
-
 
G
-
 
E
-
x
V
-
x
T
-
x
L
-
 
D
-
 
L
-
 
R
Q
 
H
P
 
D
A
 
P
Q
 
K
V
 
V
V
 
L
V
 
V
L
 
I
P
 
K
L
 
L
Y
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
L
G
 
S
A
 
G
A
 
D
Q
 
I
V
 
F
Q
 
R
A
 
A
L
 
A
V
 
V
A
 
E
S
 
L
G
 
G
A
 
Y
Q
 
R
A
 
G
L
 
I
L
 
V
L
 
I
E
 
E
C
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
A
G
 
G
T
 
G
G
 
I
P
 
P
A
 
Y
G
 
R
D
 
G
A
 
S
P
 
D
F
 
L
I
 
L
E
 
Q
A
 
T
L
 
I
R
 
E
Q
 
E
A
 
L
H
 
S
R
 
K
Q
 
E
G
 
-
V
 
I
V
 
P
L
 
I
A
 
V
A
 
M
I
 
T
S
 
T
Q
 
Q
C
 
A
P
 
M
G
 
Y
G
 
D
H
 
G
V
 
V
D
 
D
F
 
L
G
 
T
V
 
R
Y
 
Y
A
 
K
T
 
V
G
|
G
S
 
R
G
 
L
L
 
A
R
 
L
D
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
S
 
P
G
 
A
G
 
G
G
 
D
M
 
M
T
 
T
R
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
T
L
 
V
G
 
T
K
 
K
L
 
L
F
 
M
A
 
W
L
 
I
L
 
L
T
 
G
A
 
H
G
 
T
L
 
N
N
 
N
Q
 
V
A
 
E
Q
 
E
V
 
I
E
 
K
H
 
V
W
 
L
F
 
M
C
 
R
R
 
K
D
 
N
L
 
L
C
 
V
G
 
G
E
 
E
M
 
L
A
 
R
N
 
D

1zq1A Structure of gatde tRNA-dependent amidotransferase from pyrococcus abyssi (see paper)
32% identity, 81% coverage: 61:326/327 of query aligns to 145:427/437 of 1zq1A

query
sites
1zq1A
S
|
S
A
x
E
N
 
D
M
 
M
Q
 
K
P
 
P
S
 
K
H
 
H
W
 
W
L
 
V
Q
 
K
M
 
I
A
 
A
T
 
H
A
 
E
V
 
V
R
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
N
Q
 
S
S
 
G
D
 
D
C
 
Y
D
 
-
A
 
G
V
 
V
L
 
V
L
 
V
L
 
A
H
 
H
G
 
G
T
|
T
D
|
D
T
 
T
L
 
M
A
 
G
Y
 
Y
S
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
S
F
 
F
L
 
M
L
 
L
L
 
R
D
 
N
L
 
L
E
 
G
I
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
V
L
 
L
T
 
V
G
 
G
A
 
A
M
 
Q
L
 
R
P
 
S
A
 
S
G
 
D
S
 
R
P
 
P
G
 
S
S
 
S
D
 
D
A
 
A
W
 
A
P
 
M
N
 
N
L
 
L
F
 
I
G
 
C
A
 
S
M
 
V
R
 
R
A
 
-
L
 
M
Q
 
A
A
 
T
G
 
S
R
 
E
V
 
V
E
 
A
G
 
E
V
 
V
R
 
M
L
 
V
F
 
V
F
 
M
N
 
H
G
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
T
-
 
Y
V
 
C
L
 
L
L
 
A
H
 
H
-
 
R
G
 
G
A
 
T
R
 
K
V
 
V
S
 
R
K
|
K
L
 
M
-
 
H
-
 
T
-
 
S
R
 
R
S
 
R
D
 
D
A
 
A
F
 
F
D
 
R
A
 
S
F
 
I
A
 
N
E
 
D
A
 
V
P
 
P
-
 
I
-
 
A
-
 
K
-
 
I
-
 
W
-
 
P
-
 
N
-
 
G
-
 
E
-
 
I
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
R
-
 
K
-
 
D
-
 
Y
R
 
R
K
 
K
R
 
R
S
 
S
A
 
D
T
 
E
V
 
E
V
 
V
G
 
E
E
 
-
R
 
-
P
 
-
P
 
-
M
 
-
L
 
V
L
 
D
P
 
D
Q
 
K
Q
 
I
P
 
E
A
 
E
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
L
L
 
V
P
 
K
L
 
V
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
I
G
 
S
A
 
S
A
 
E
Q
 
I
V
 
I
Q
 
D
A
 
F
L
 
L
V
 
V
A
 
D
S
 
K
G
 
G
A
 
Y
Q
 
K
A
 
G
L
 
I
L
 
V
L
 
I
E
 
E
C
 
G
Y
 
T
G
 
G
S
 
L
G
 
G
T
 
H
G
 
T
P
 
P
A
 
N
G
 
D
D
 
I
A
 
I
P
 
P
F
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
R
A
 
A
H
 
V
R
 
E
Q
 
E
G
 
G
V
 
V
V
 
A
L
 
V
A
 
C
A
 
M
I
 
T
S
 
S
Q
 
Q
C
 
C
P
 
I
G
 
Y
G
 
G
H
 
R
V
 
V
D
 
N
F
 
L
G
 
N
V
 
V
Y
 
Y
A
 
S
T
 
T
G
|
G
S
 
R
G
 
K
L
 
L
R
 
L
D
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
S
 
P
G
 
C
G
 
E
G
 
D
M
 
M
T
 
L
R
 
P
E
 
E
A
 
T
A
 
A
L
 
Y
G
 
V
K
 
K
L
 
L
F
 
M
A
 
W
L
 
V
L
 
L
T
 
G
A
 
H
G
 
T
L
 
Q
N
 
N
Q
 
L
A
 
E
Q
 
E
V
 
V
E
 
R
H
 
K
W
 
M
F
 
M
C
 
L
R
 
T
D
 
N
L
 
Y
C
 
A
G
 
G
E
 
E
M
 
I
A
 
T

Sites not aligning to the query:

4njeA Crystal structure of pyrococcus furiosus l-asparaginase with ligand (see paper)
35% identity, 49% coverage: 17:175/327 of query aligns to 6:163/182 of 4njeA

query
sites
4njeA
I
 
I
G
 
G
M
 
M
Q
 
G
Q
 
G
S
x
T
A
 
I
A
 
A
G
 
S
L
 
V
M
 
K
P
 
G
A
 
E
S
 
N
G
 
G
F
x
Y
E
 
E
A
 
A
R
 
S
L
 
L
R
 
S
A
 
V
Q
 
K
Q
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
D
T
 
I
G
 
A
P
 
G
L
 
I
P
 
K
S
 
D
W
 
C
-
 
E
-
 
D
-
 
C
T
 
D
F
 
F
R
 
L
E
 
D
L
 
L
Q
 
K
P
 
N
L
 
V
L
 
-
D
|
D
S
|
S
A
 
T
N
 
L
M
 
I
Q
 
Q
P
 
P
S
 
E
H
 
D
W
 
W
L
 
V
Q
 
D
M
 
L
A
 
A
T
 
E
A
 
T
V
 
L
R
 
Y
E
 
K
A
 
N
V
 
V
A
 
K
Q
 
K
S
 
-
D
 
-
C
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
I
L
 
I
L
 
V
L
 
T
H
 
H
G
|
G
T
|
T
D
|
D
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
S
 
T
A
 
S
A
 
S
A
 
M
L
 
I
S
 
S
F
 
F
L
 
M
L
 
L
L
 
R
D
 
N
L
 
P
E
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
V
L
 
F
T
 
T
G
 
G
A
 
S
M
 
M
L
 
I
P
 
P
A
 
A
G
 
T
S
 
E
P
 
E
G
 
N
S
 
S
D
 
D
A
 
A
W
 
P
P
 
L
N
 
N
L
 
L
F
 
Q
G
 
T
A
 
A
M
 
I
R
 
K
A
 
F
L
 
A
Q
 
T
A
 
S
G
 
G
R
 
-
V
 
I
E
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
Y
L
 
V
F
 
A
F
 
F
N
 
N
G
 
G
V
 
K
L
 
V
L
 
M
H
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
R
V
 
T
S
 
S
K
|
K
L
 
V
R
 
R
S
 
T
D
 
M
A
 
S
F
 
R
D
 
D
A
 
A
F
 
F

5b5uA Crystal structure of truncated pyrococcus furiosus l-asparaginase with peptide (see paper)
35% identity, 49% coverage: 17:175/327 of query aligns to 6:163/175 of 5b5uA

query
sites
5b5uA
I
 
I
G
 
G
M
 
M
Q
 
G
Q
 
G
S
x
T
A
 
I
A
 
A
G
 
S
L
 
V
M
 
K
P
 
G
A
 
E
S
 
N
G
 
G
F
x
Y
E
 
E
A
 
A
R
 
S
L
 
L
R
 
S
A
 
V
Q
 
K
Q
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
D
T
 
I
G
 
A
P
 
G
L
 
I
P
 
K
S
 
D
W
 
C
-
 
E
-
 
D
-
 
C
T
x
D
F
|
F
R
 
L
E
 
D
L
 
L
Q
 
K
P
 
N
L
 
V
L
 
-
D
|
D
S
|
S
A
 
T
N
 
L
M
 
I
Q
 
Q
P
 
P
S
 
E
H
 
D
W
 
W
L
 
V
Q
 
D
M
 
L
A
 
A
T
 
E
A
 
T
V
 
L
R
 
Y
E
 
K
A
 
N
V
 
V
A
 
K
Q
 
K
S
 
-
D
 
-
C
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
I
L
 
I
L
 
V
L
 
T
H
 
H
G
|
G
T
|
T
D
|
D
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
S
 
T
A
 
S
A
 
S
A
 
M
L
 
I
S
 
S
F
 
F
L
 
M
L
 
L
L
 
R
D
 
N
L
 
P
E
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
V
L
 
F
T
 
T
G
 
G
A
x
S
M
|
M
L
 
I
P
 
P
A
 
A
G
 
T
S
 
E
P
 
E
G
 
N
S
 
S
D
 
D
A
 
A
W
 
P
P
 
L
N
 
N
L
 
L
F
 
Q
G
 
T
A
 
A
M
 
I
R
 
K
A
 
F
L
 
A
Q
 
T
A
 
S
G
 
G
R
 
-
V
 
I
E
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
Y
L
 
V
F
 
A
F
 
F
N
 
N
G
 
G
V
 
K
L
 
V
L
 
M
H
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
R
V
 
T
S
 
S
K
|
K
L
 
V
R
 
R
S
 
T
D
 
M
A
 
S
F
 
R
D
 
D
A
 
A
F
 
F

Sites not aligning to the query:

5k45A Wolinella succinogenes l-asparaginase p121 + l-glutamic acid (see paper)
30% identity, 63% coverage: 61:267/327 of query aligns to 58:278/328 of 5k45A

query
sites
5k45A
S
|
S
A
x
Q
N
 
E
M
 
M
Q
 
T
P
 
G
S
 
K
H
 
V
W
 
W
L
 
L
Q
 
K
M
 
L
A
 
A
T
 
K
A
 
R
V
 
V
R
 
N
E
 
E
A
 
L
V
 
L
A
 
A
Q
 
Q
S
 
K
D
 
E
C
 
T
D
 
E
A
 
A
V
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
T
H
 
H
G
|
G
T
|
T
D
|
D
T
 
T
L
 
M
A
 
E
Y
 
E
S
 
T
A
 
A
A
 
F
A
 
F
L
 
L
S
 
N
F
 
-
L
 
L
L
 
T
L
 
V
D
 
K
L
 
S
E
 
Q
I
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
V
L
 
L
T
 
V
G
 
G
A
|
A
M
 
M
L
 
R
P
 
P
A
 
G
G
 
S
S
 
S
P
 
M
G
 
S
S
 
A
D
 
D
A
 
G
W
 
P
P
 
M
N
 
N
L
 
L
F
 
Y
G
 
N
A
 
A
M
 
V
R
 
N
A
 
V
L
 
A
-
 
I
-
 
N
Q
 
K
A
 
A
G
 
S
R
 
T
V
 
N
E
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
V
L
 
I
F
 
V
F
 
M
N
 
N
G
 
D
V
 
-
L
 
E
L
 
I
H
 
H
G
 
A
A
 
A
R
 
R
-
 
E
V
 
A
S
 
T
K
|
K
L
 
L
R
 
N
S
 
T
D
 
T
A
 
A
F
 
V
D
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
A
E
 
S
A
 
P
P
 
N
R
 
T
K
 
G
R
 
K
S
 
I
A
 
G
T
 
T
V
 
V
V
 
Y
-
 
Y
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
E
-
 
Y
-
 
F
-
 
T
-
 
Q
G
 
S
E
 
V
R
 
R
P
 
P
P
 
H
M
 
T
L
 
L
L
 
A
P
 
S
-
 
E
-
 
F
-
 
D
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
I
Q
 
E
Q
 
E
P
 
L
A
 
P
Q
 
R
V
 
V
V
 
D
V
 
I
L
 
L
P
 
Y
L
 
A
Y
 
H
P
 
P
G
 
D
V
 
D
G
 
T
A
 
D
A
 
V
Q
 
L
V
 
V
Q
 
N
A
 
A
L
 
A
V
 
L
A
 
Q
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
A
 
G
L
 
I
L
 
I
L
 
H
E
 
A
C
 
G
Y
 
M
G
 
G
S
 
N
G
 
G
T
 
N
G
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
P
F
 
F
-
 
P
-
 
L
-
 
T
I
 
Q
E
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
E
Q
 
K
A
 
A
H
 
A
R
 
K
Q
 
S
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
A
 
R
I
 
S
S
 
S
Q
 
R
C
 
V
P
 
G
G
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5k3oA Wolinella succinogenes l-asparaginase p121 and l-aspartic acid (see paper)
30% identity, 63% coverage: 61:267/327 of query aligns to 58:278/328 of 5k3oA

query
sites
5k3oA
S
|
S
A
x
Q
N
 
E
M
 
M
Q
 
T
P
 
G
S
 
K
H
 
V
W
 
W
L
 
L
Q
 
K
M
 
L
A
 
A
T
 
K
A
 
R
V
 
V
R
 
N
E
 
E
A
 
L
V
 
L
A
 
A
Q
 
Q
S
 
K
D
 
E
C
 
T
D
 
E
A
 
A
V
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
T
H
 
H
G
|
G
T
|
T
D
|
D
T
 
T
L
 
M
A
 
E
Y
 
E
S
 
T
A
 
A
A
 
F
A
 
F
L
 
L
S
 
N
F
 
-
L
 
L
L
 
T
L
 
V
D
 
K
L
 
S
E
 
Q
I
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
V
L
 
L
T
 
V
G
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
R
P
 
P
A
 
G
G
 
S
S
 
S
P
 
M
G
 
S
S
 
A
D
 
D
A
 
G
W
 
P
P
 
M
N
 
N
L
 
L
F
 
Y
G
 
N
A
 
A
M
 
V
R
 
N
A
 
V
L
 
A
-
 
I
-
 
N
Q
 
K
A
 
A
G
 
S
R
 
T
V
 
N
E
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
V
L
 
I
F
 
V
F
 
M
N
 
N
G
 
D
V
 
-
L
 
E
L
 
I
H
 
H
G
 
A
A
 
A
R
 
R
-
 
E
V
 
A
S
 
T
K
|
K
L
 
L
R
 
N
S
 
T
D
 
T
A
 
A
F
 
V
D
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
A
E
 
S
A
 
P
P
 
N
R
 
T
K
 
G
R
 
K
S
 
I
A
 
G
T
 
T
V
 
V
V
 
Y
-
 
Y
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
E
-
 
Y
-
 
F
-
 
T
-
 
Q
G
 
S
E
 
V
R
 
R
P
 
P
P
 
H
M
 
T
L
 
L
L
 
A
P
 
S
-
 
E
-
 
F
-
 
D
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
I
Q
 
E
Q
 
E
P
 
L
A
 
P
Q
 
R
V
 
V
V
 
D
V
 
I
L
 
L
P
 
Y
L
 
A
Y
 
H
P
 
P
G
 
D
V
 
D
G
 
T
A
 
D
A
 
V
Q
 
L
V
 
V
Q
 
N
A
 
A
L
 
A
V
 
L
A
 
Q
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
A
 
G
L
 
I
L
 
I
L
 
H
E
 
A
C
 
G
Y
 
M
G
 
G
S
 
N
G
 
G
T
 
N
G
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
P
F
 
F
-
 
P
-
 
L
-
 
T
I
 
Q
E
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
E
Q
 
K
A
 
A
H
 
A
R
 
K
Q
 
S
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
A
 
R
I
 
S
S
 
S
Q
 
R
C
 
V
P
 
G
G
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2hlnA L-asparaginase from erwinia carotovora in complex with glutamic acid (see paper)
27% identity, 56% coverage: 7:190/327 of query aligns to 4:173/308 of 2hlnA

query
sites
2hlnA
R
 
N
L
 
I
L
 
V
V
 
I
L
 
L
Y
 
A
T
 
T
G
 
G
G
|
G
T
|
T
I
 
I
G
 
A
M
 
G
Q
 
V
Q
 
E
S
 
T
A
 
L
A
 
I
G
 
Q
L
 
A
M
 
V
P
 
P
A
 
E
S
 
L
G
 
K
F
 
T
E
 
L
A
 
A
R
 
N
L
 
I
R
 
K
A
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
A
 
V
L
 
A
E
 
S
T
 
I
G
|
G
P
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
-
W
 
-
T
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
S
|
S
A
x
E
N
 
N
M
 
M
Q
 
T
P
 
S
S
 
D
H
 
V
W
 
L
L
 
L
Q
 
T
M
 
L
A
 
S
T
 
K
A
 
R
V
 
V
R
 
N
E
 
E
A
 
L
V
 
L
A
 
A
Q
 
R
S
 
S
D
 
D
C
 
V
D
 
D
A
 
G
V
 
V
L
 
V
L
 
I
L
 
T
H
 
H
G
|
G
T
|
T
D
|
D
T
 
T
L
 
L
A
 
D
Y
 
E
S
 
S
A
 
P
A
 
Y
A
 
F
L
 
L
S
 
N
F
 
-
L
 
L
L
 
T
L
 
V
D
 
K
L
 
S
E
 
D
I
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
V
L
 
F
T
 
V
G
 
A
A
 
A
M
 
M
L
 
R
P
 
P
A
 
A
G
 
T
S
 
A
P
 
I
G
 
S
S
 
A
D
 
D
A
 
G
W
 
P
P
 
M
N
 
N
L
 
L
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
M
 
V
R
 
K
-
 
V
-
 
A
A
 
A
L
 
D
Q
 
K
A
 
N
G
 
S
R
 
R
V
 
G
E
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
L
L
 
V
F
 
V
F
 
L
N
 
N
G
 
D
V
 
R
L
 
I
L
 
G
H
 
S
G
 
A
A
 
R
R
 
F
V
 
I
S
 
S
K
|
K
L
 
T
R
 
N
S
 
A
D
 
S
A
 
T
F
 
L
D
 
D
A
 
T
F
 
F
A
 
K
E
 
A
A
 
P
P
 
E
R
 
E
K
 
G
R
 
Y
S
 
L
A
 
G
T
 
V
V
 
I
V
 
I
G
 
G
E
 
D
R
 
K

7c8qA Blasnase-t13a with d-asn (see paper)
24% identity, 96% coverage: 6:318/327 of query aligns to 2:320/321 of 7c8qA

query
sites
7c8qA
E
 
K
R
 
K
L
 
V
L
 
A
V
 
L
L
 
I
Y
 
T
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
x
A
I
 
I
G
 
A
M
 
S
Q
 
R
Q
 
K
S
 
T
A
 
E
A
 
S
G
 
G
L
 
R
M
x
L
P
 
A
A
 
A
S
 
G
G
 
A
F
 
-
E
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
I
R
 
S
A
 
G
Q
 
P
Q
 
E
A
 
L
L
 
A
E
|
E
T
 
M
G
 
C
P
 
S
L
 
L
P
 
P
S
 
E
W
 
D
T
 
V
F
 
Q
R
 
I
E
 
D
L
 
V
Q
 
Y
P
 
P
L
 
A
-
 
F
-
 
Q
L
 
L
D
 
P
S
|
S
A
 
M
N
 
H
M
 
I
Q
 
T
P
 
F
S
 
Q
H
 
H
W
 
L
L
 
L
Q
 
E
M
 
L
A
 
K
T
 
Q
A
 
T
V
 
V
R
 
E
E
 
R
A
 
V
V
 
F
A
 
Q
Q
 
D
S
 
G
D
 
S
C
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
V
L
 
V
L
 
V
L
 
T
H
 
H
G
|
G
T
|
T
D
|
D
T
 
T
L
 
L
A
 
E
Y
 
E
S
 
T
A
 
A
A
 
Y
A
 
F
L
 
L
S
 
D
F
 
L
L
 
T
L
 
L
L
 
Q
D
 
D
L
 
-
E
 
E
I
 
R
P
 
P
V
 
V
L
 
V
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
M
 
Q
L
 
R
P
 
A
A
 
P
G
 
E
S
 
Q
P
 
Q
G
 
G
S
 
T
D
 
D
A
 
A
W
 
Y
P
 
T
N
 
N
L
 
I
F
 
R
G
 
H
A
 
A
M
 
V
R
 
Y
A
 
T
L
 
A
Q
 
C
A
 
S
G
 
P
R
 
D
V
 
I
E
 
K
-
 
G
-
 
A
G
 
G
V
 
T
R
 
V
L
 
V
F
 
V
F
 
F
N
 
N
G
 
E
V
 
R
L
 
I
L
 
F
H
x
N
G
 
A
A
 
R
R
 
Y
V
 
V
S
 
K
K
|
K
L
 
V
R
 
H
S
 
A
D
 
S
-
 
N
-
 
L
-
 
Q
A
 
G
F
 
F
D
 
D
A
 
V
F
 
F
A
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
I
-
 
D
-
 
N
-
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
Y
-
 
V
-
 
Y
E
 
Q
A
 
K
P
 
P
R
 
L
K
 
K
R
 
R
S
 
D
A
 
V
T
 
H
V
 
Q
V
 
L
G
 
-
E
 
Q
R
 
R
P
 
P
P
 
-
M
 
-
L
 
-
L
 
L
P
 
P
Q
 
-
Q
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
E
V
 
V
V
 
D
V
 
I
L
 
V
P
 
K
L
 
C
Y
 
Y
P
 
L
G
 
D
V
 
G
G
 
D
A
 
G
A
 
K
Q
 
F
V
 
I
Q
 
R
A
 
A
L
 
A
V
 
V
A
 
R
S
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
A
 
G
L
 
I
L
 
V
L
 
L
E
 
E
C
 
G
Y
 
V
G
 
G
S
 
R
G
 
G
T
 
Q
G
 
V
P
 
P
A
 
P
G
x
N
D
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
M
I
 
V
E
 
G
A
x
D
L
 
I
R
 
E
Q
 
Q
A
 
A
H
 
L
R
 
H
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
Y
L
 
I
A
 
V
A
 
I
I
 
T
S
 
T
Q
 
S
C
 
A
P
 
E
G
 
E
G
 
G
H
 
E
V
 
V
-
 
Y
-
x
T
D
 
T
F
x
Y
G
 
D
V
x
Y
Y
x
A
A
x
G
T
 
S
G
x
S
S
 
Y
G
 
D
L
 
L
R
 
A
D
 
K
A
 
K
G
 
G
L
 
V
V
 
I
S
 
L
G
 
G
G
 
K
G
 
D
M
 
Y
T
 
D
R
 
S
E
 
K
A
 
K
A
 
A
L
 
R
G
 
M
K
 
K
L
 
L
F
 
A
A
 
V
L
 
L
L
 
L
T
 
A
A
 
S
G
 
-
L
 
-
N
 
Y
Q
 
E
A
 
E
Q
 
G
V
 
I
E
 
K
H
 
D
W
 
K
F
 
F
C
 
C

8h4aB Blasnase-t13a/m57p
24% identity, 96% coverage: 6:318/327 of query aligns to 2:320/328 of 8h4aB

query
sites
8h4aB
E
 
K
R
 
K
L
 
V
L
 
A
V
 
L
L
 
I
Y
 
T
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
A
I
 
I
G
 
A
M
 
S
Q
 
R
Q
 
K
S
 
T
A
 
E
A
 
S
G
 
G
L
 
R
M
 
L
P
 
A
A
 
A
S
 
G
G
 
A
F
 
-
E
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
I
R
 
S
A
 
G
Q
 
P
Q
 
E
A
 
L
L
 
A
E
 
E
T
 
M
G
 
C
P
 
S
L
 
L
P
 
P
S
 
E
W
 
D
T
 
V
F
 
Q
R
 
I
E
 
D
L
 
V
Q
 
Y
P
 
P
L
 
A
-
 
F
-
 
Q
L
 
L
D
 
P
S
 
S
A
 
P
N
 
H
M
 
I
Q
 
T
P
 
F
S
 
Q
H
 
H
W
 
L
L
 
L
Q
 
E
M
 
L
A
 
K
T
 
Q
A
 
T
V
 
V
R
 
E
E
 
R
A
 
V
V
 
F
A
 
Q
Q
 
D
S
 
G
D
 
S
C
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
V
L
 
V
L
 
V
L
 
T
H
 
H
G
 
G
T
 
T
D
 
D
T
 
T
L
 
L
A
 
E
Y
 
E
S
 
T
A
 
A
A
 
Y
A
 
F
L
 
L
S
 
D
F
 
L
L
 
T
L
 
L
L
 
Q
D
 
D
L
 
-
E
 
E
I
 
R
P
 
P
V
 
V
L
 
V
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
M
 
Q
L
 
R
P
 
A
A
 
P
G
 
E
S
 
Q
P
 
Q
G
 
G
S
 
T
D
 
D
A
 
A
W
 
Y
P
 
T
N
 
N
L
 
I
F
 
R
G
 
H
A
 
A
M
 
V
R
 
Y
A
 
T
L
 
A
Q
 
C
A
 
S
G
 
P
R
 
D
V
 
I
E
 
K
-
 
G
-
 
A
G
 
G
V
 
T
R
 
V
L
 
V
F
 
V
F
 
F
N
 
N
G
 
E
V
 
R
L
 
I
L
 
F
H
 
N
G
 
A
A
 
R
R
 
Y
V
 
V
S
 
K
K
 
K
L
 
V
R
 
H
S
 
A
D
 
S
-
 
N
-
 
L
-
 
Q
A
 
G
F
 
F
D
 
D
A
 
V
F
 
F
A
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
I
-
 
D
-
 
N
-
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
Y
-
 
V
-
 
Y
E
 
Q
A
 
K
P
 
P
R
 
L
K
 
K
R
 
R
S
 
D
A
 
V
T
 
H
V
 
Q
V
 
L
G
 
-
E
 
Q
R
 
R
P
 
P
P
 
-
M
 
-
L
 
-
L
 
L
P
 
P
Q
 
-
Q
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
x
E
V
 
V
V
 
D
V
 
I
L
 
V
P
 
K
L
 
C
Y
 
Y
P
 
L
G
 
D
V
 
G
G
 
D
A
 
G
A
 
K
Q
 
F
V
 
I
Q
 
R
A
 
A
L
 
A
V
 
V
A
 
R
S
x
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
A
 
G
L
 
I
L
 
V
L
 
L
E
 
E
C
 
G
Y
 
V
G
 
G
S
 
R
G
 
G
T
 
Q
G
 
V
P
 
P
A
 
P
G
x
N
D
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
M
I
 
V
E
 
G
A
x
D
L
 
I
R
 
E
Q
 
Q
A
 
A
H
 
L
R
 
H
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
Y
L
 
I
A
 
V
A
 
I
I
 
T
S
 
T
Q
 
S
C
 
A
P
x
E
G
 
E
G
 
G
H
 
E
V
 
V
-
 
Y
-
 
T
D
 
T
F
 
Y
G
 
D
V
 
Y
Y
 
A
A
 
G
T
 
S
G
 
S
S
 
Y
G
 
D
L
 
L
R
 
A
D
 
K
A
 
K
G
 
G
L
 
V
V
 
I
S
 
L
G
 
G
G
 
K
G
x
D
M
 
Y
T
 
D
R
 
S
E
 
K
A
 
K
A
 
A
L
 
R
G
 
M
K
 
K
L
 
L
F
 
A
A
 
V
L
 
L
L
 
L
T
 
A
A
 
S
G
 
-
L
 
-
N
 
Y
Q
 
E
A
 
E
Q
 
G
V
 
I
E
 
K
H
 
D
W
 
K
F
 
F
C
 
C

2gvnA L-asparaginase from erwinia carotovora in complex with aspartic acid (see paper)
29% identity, 56% coverage: 7:190/327 of query aligns to 4:190/325 of 2gvnA

query
sites
2gvnA
R
 
N
L
 
I
L
 
V
V
 
I
L
 
L
Y
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
I
 
I
G
 
A
M
 
-
Q
 
-
Q
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
N
M
 
T
P
 
Q
A
 
T
S
 
T
G
 
G
F
x
Y
E
 
K
A
 
A
-
 
G
R
 
A
L
 
L
R
 
G
A
 
V
Q
 
E
Q
 
T
A
 
L
L
 
I
E
 
Q
T
 
A
G
 
V
P
 
P
L
 
-
P
 
-
S
 
-
W
 
-
T
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
E
L
 
L
Q
 
K
P
 
T
L
 
L
-
 
A
-
 
N
-
 
I
-
 
K
-
 
G
-
 
E
-
 
Q
-
 
V
-
 
A
-
 
S
L
 
I
D
x
G
S
|
S
A
x
E
N
 
N
M
 
M
Q
 
T
P
 
S
S
 
D
H
 
V
W
 
L
L
 
L
Q
 
T
M
 
L
A
 
S
T
 
K
A
 
R
V
 
V
R
 
N
E
 
E
A
 
L
V
 
L
A
 
A
Q
 
R
S
 
S
D
 
D
C
 
V
D
 
D
A
 
G
V
 
V
L
 
V
L
 
I
L
 
T
H
 
H
G
|
G
T
|
T
D
|
D
T
 
T
L
 
L
A
 
D
Y
 
E
S
 
S
A
 
P
A
 
Y
A
 
F
L
 
L
S
 
N
F
 
-
L
 
L
L
 
T
L
 
V
D
 
K
L
 
S
E
 
D
I
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
V
L
 
F
T
 
V
G
 
A
A
 
A
M
 
M
L
 
R
P
 
P
A
 
A
G
 
T
S
 
A
P
 
I
G
 
S
S
 
A
D
 
D
A
 
G
W
 
P
P
 
M
N
 
N
L
 
L
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
M
 
V
R
 
K
-
 
V
-
 
A
A
 
A
L
 
D
Q
 
K
A
 
N
G
 
S
R
 
R
V
 
G
E
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
L
L
 
V
F
 
V
F
 
L
N
 
N
G
 
D
V
 
R
L
 
I
L
 
G
H
 
S
G
 
A
A
 
R
R
 
F
V
 
I
S
 
S
K
|
K
L
 
T
R
 
N
S
 
A
D
 
S
A
 
T
F
 
L
D
 
D
A
 
T
F
 
F
A
 
K
E
 
A
A
 
P
P
 
E
R
 
E
K
 
G
R
 
Y
S
 
L
A
 
G
T
 
V
V
 
I
V
 
I
G
 
G
E
 
D
R
 
K

6wyyA Crystal structure of pseudomonas 7a glutaminase-asparaginase in complex with l-glu at ph 6.5
26% identity, 80% coverage: 7:269/327 of query aligns to 4:267/315 of 6wyyA

query
sites
6wyyA
R
 
N
L
 
V
L
 
V
V
 
I
L
 
L
Y
 
A
T
 
T
G
 
G
G
|
G
T
|
T
I
 
I
-
 
A
-
 
G
-
 
L
G
 
G
M
 
V
Q
 
D
Q
 
K
S
 
L
A
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
M
 
-
P
 
P
A
 
E
S
 
L
G
 
A
F
 
D
E
 
I
A
 
A
R
 
N
L
 
V
R
 
R
A
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
A
 
V
L
 
M
E
 
Q
T
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
-
W
 
-
T
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
I
D
 
A
S
|
S
A
x
E
N
 
S
M
 
I
Q
 
S
P
 
N
S
 
D
H
 
D
W
 
L
L
 
L
Q
 
K
M
 
L
A
 
G
T
 
K
A
 
R
V
 
V
R
 
A
E
 
E
A
 
L
V
 
A
A
 
E
Q
 
S
S
 
K
D
 
D
C
 
V
D
 
D
A
 
G
V
 
I
L
 
V
L
 
I
L
 
T
H
 
H
G
|
G
T
|
T
D
|
D
T
 
T
L
 
L
A
 
E
Y
 
E
S
 
T
A
 
A
A
 
F
A
 
F
L
 
L
S
 
N
F
 
-
L
 
L
L
 
V
L
 
E
D
 
K
L
 
T
E
 
D
I
 
K
P
 
P
V
 
I
L
 
V
L
 
V
T
 
V
G
 
G
A
 
S
M
 
M
L
 
R
P
 
P
A
 
G
G
 
T
S
 
A
P
 
M
G
 
S
S
 
A
D
 
D
A
 
G
W
 
M
P
 
L
N
 
N
L
 
L
F
 
Y
G
 
N
-
 
A
-
 
V
A
 
A
M
 
V
R
 
A
A
 
S
L
 
D
Q
 
K
A
 
Q
G
 
S
R
 
R
V
 
G
E
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
L
L
 
V
F
 
T
F
 
M
N
 
N
G
 
D
V
 
E
L
 
I
L
 
Q
H
 
S
G
 
G
A
 
R
R
 
D
V
 
V
S
 
S
K
|
K
L
 
A
R
 
V
S
 
N
D
 
I
A
 
K
F
 
T
D
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
K
E
 
S
A
 
A
-
 
W
-
 
G
-
 
P
-
 
M
-
 
G
-
 
M
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
S
-
 
Y
-
 
W
-
 
F
-
 
R
-
 
L
P
 
P
R
 
A
K
 
K
R
 
R
S
 
H
A
 
-
T
 
T
V
 
V
V
 
N
G
 
S
E
 
E
R
 
F
P
 
D
P
 
I
M
 
K
L
 
Q
L
 
I
P
 
S
Q
 
S
Q
 
L
P
 
P
A
 
-
Q
 
Q
V
 
V
V
 
D
V
 
I
L
 
A
P
 
Y
L
 
G
Y
 
Y
P
 
G
G
 
N
V
 
V
G
 
T
A
 
D
A
 
T
Q
 
A
V
 
Y
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
Q
S
 
N
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
H
E
 
A
C
 
G
Y
 
T
G
 
G
S
 
N
G
 
G
T
 
S
G
 
V
P
 
S
A
 
S
G
 
R
D
 
V
A
 
V
P
 
P
F
 
A
I
 
L
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
R
 
R
Q
 
K
A
 
N
H
 
G
R
 
V
Q
 
Q
G
 
I
V
 
I
V
 
R
L
 
S
A
 
S
A
 
H
I
 
V
S
 
N
Q
 
Q
C
 
-
P
 
-
G
 
G
G
 
G
H
 
F
V
 
V

Sites not aligning to the query:

7c8xA Blasnase-t13a with l-asn (see paper)
23% identity, 96% coverage: 6:318/327 of query aligns to 2:319/319 of 7c8xA

query
sites
7c8xA
E
 
K
R
 
K
L
 
V
L
 
A
V
 
L
L
 
I
Y
 
T
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
x
A
I
 
I
G
 
A
M
 
S
Q
 
R
Q
 
K
S
 
T
A
 
S
A
 
G
G
 
R
L
|
L
M
 
A
P
 
A
A
 
G
S
 
A
G
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
I
R
 
S
A
 
G
Q
 
P
Q
 
E
A
 
L
L
 
A
E
|
E
T
 
M
G
 
C
P
 
S
L
 
L
P
 
P
S
 
E
W
 
D
T
 
V
F
 
Q
R
 
I
E
 
D
L
 
V
Q
 
Y
P
 
P
L
 
A
-
 
F
-
 
Q
L
 
L
D
 
P
S
|
S
A
 
M
N
 
H
M
 
I
Q
 
T
P
 
F
S
 
Q
H
 
H
W
 
L
L
 
L
Q
 
E
M
 
L
A
 
K
T
 
Q
A
 
T
V
 
V
R
 
E
E
 
R
A
 
V
V
 
F
A
 
Q
Q
 
D
S
 
G
D
 
S
C
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
V
L
 
V
L
 
V
L
 
T
H
 
H
G
|
G
T
|
T
D
|
D
T
 
T
L
 
L
A
 
E
Y
 
E
S
 
T
A
 
A
A
 
Y
A
 
F
L
 
L
S
 
D
F
 
L
L
 
T
L
 
L
L
 
Q
D
 
D
L
 
-
E
 
E
I
 
R
P
 
P
V
 
V
L
 
V
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
M
 
Q
L
 
R
P
 
A
A
 
P
G
 
E
S
 
Q
P
 
Q
G
 
G
S
 
T
D
 
D
A
 
A
W
 
Y
P
 
T
N
 
N
L
 
I
F
 
R
G
 
H
A
 
A
M
 
V
R
 
Y
A
 
T
L
 
A
Q
 
C
A
 
S
G
 
P
R
 
D
V
 
I
E
 
K
-
 
G
-
 
A
G
 
G
V
 
T
R
 
V
L
 
V
F
 
V
F
 
F
N
 
N
G
 
E
V
 
R
L
 
I
L
 
F
H
x
N
G
 
A
A
 
R
R
 
Y
V
 
V
S
 
K
K
|
K
L
 
V
R
 
H
S
 
A
D
 
S
-
 
N
-
 
L
-
 
Q
A
 
G
F
 
F
D
 
D
A
 
V
F
 
F
A
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
I
-
 
D
-
 
N
-
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
Y
-
 
V
-
 
Y
E
 
Q
A
 
K
P
 
P
R
 
L
K
 
K
R
 
R
S
 
D
A
 
V
T
 
H
V
 
Q
V
 
L
G
 
-
E
 
Q
R
 
R
P
 
P
P
 
-
M
 
-
L
 
-
L
 
L
P
 
P
Q
 
-
Q
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
E
V
 
V
V
 
D
V
 
I
L
 
V
P
 
K
L
 
C
Y
 
Y
P
 
L
G
 
D
V
 
G
G
 
D
A
 
G
A
 
K
Q
 
F
V
 
I
Q
 
R
A
 
A
L
 
A
V
 
V
A
 
R
S
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
A
 
G
L
 
I
L
 
V
L
 
L
E
 
E
C
 
G
Y
 
V
G
 
G
S
 
R
G
 
G
T
 
Q
G
 
V
P
 
P
A
 
P
G
x
N
D
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
M
I
 
V
E
 
G
A
x
D
L
 
I
R
 
E
Q
 
Q
A
 
A
H
 
L
R
 
H
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
Y
L
 
I
A
 
V
A
 
I
I
 
T
S
 
T
Q
 
S
C
 
A
P
 
E
G
 
E
G
 
G
H
 
E
V
 
V
-
 
Y
-
x
T
D
 
T
F
 
Y
G
 
D
V
 
Y
Y
x
A
A
x
G
T
 
S
G
x
S
S
 
Y
G
 
D
L
 
L
R
 
A
D
 
K
A
 
K
G
 
G
L
 
V
V
 
I
S
 
L
G
 
G
G
 
K
G
 
D
M
 
Y
T
 
D
R
 
S
E
 
K
A
 
K
A
 
A
L
 
R
G
 
M
K
 
K
L
 
L
F
 
A
A
 
V
L
 
L
L
 
L
T
 
A
A
 
S
G
 
-
L
 
-
N
 
Y
Q
 
E
A
 
E
Q
 
G
V
 
I
E
 
K
H
 
D
W
 
K
F
 
F
C
 
C

Query Sequence

>GFF4005 FitnessBrowser__psRCH2:GFF4005
MNQPIERLLVLYTGGTIGMQQSAAGLMPASGFEARLRAQQALETGPLPSWTFRELQPLLD
SANMQPSHWLQMATAVREAVAQSDCDAVLLLHGTDTLAYSAAALSFLLLDLEIPVLLTGA
MLPAGSPGSDAWPNLFGAMRALQAGRVEGVRLFFNGVLLHGARVSKLRSDAFDAFAEAPR
KRSATVVGERPPMLLPQQPAQVVVLPLYPGVGAAQVQALVASGAQALLLECYGSGTGPAG
DAPFIEALRQAHRQGVVLAAISQCPGGHVDFGVYATGSGLRDAGLVSGGGMTREAALGKL
FALLTAGLNQAQVEHWFCRDLCGEMAN

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory