SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF4012 FitnessBrowser__psRCH2:GFF4012 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7kctA Crystal structure of the hydrogenobacter thermophilus 2-oxoglutarate carboxylase (ogc) biotin carboxylase (bc) domain dimer in complex with adenosine 5'-diphosphate magnesium salt (mgadp), adenosine 5'- diphosphate (adp, and bicarbonate anion (hydrogen carbonate/hco3-) (see paper)
54% identity, 95% coverage: 1:449/471 of query aligns to 3:452/453 of 7kctA

query
sites
7kctA
M
 
M
I
 
F
K
 
K
K
 
K
L
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
C
R
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
A
C
 
C
A
 
K
E
 
E
M
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
Q
S
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
I
F
 
Y
S
 
N
E
 
E
A
 
I
D
 
E
R
 
S
H
 
T
A
 
A
L
 
R
H
 
H
V
 
V
K
 
K
R
 
M
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
A
H
 
Y
F
 
M
I
 
I
G
 
G
E
 
V
D
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
D
G
 
T
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
P
 
A
R
 
E
K
 
R
L
 
I
V
 
V
N
 
D
L
 
L
A
 
A
V
 
L
E
 
E
T
 
V
G
 
G
C
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
A
E
 
E
N
 
N
A
 
E
E
 
H
L
 
F
A
 
A
D
 
R
I
 
L
C
 
C
A
 
E
E
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
T
F
 
F
V
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
H
A
 
W
E
 
K
V
 
V
I
 
I
R
 
E
R
 
L
M
 
M
G
 
G
D
|
D
K
|
K
T
 
A
E
x
R
A
 
S
R
 
K
R
 
E
S
 
V
M
 
M
I
 
K
K
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
T
T
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
S
E
 
D
G
 
G
N
 
I
V
 
L
R
 
K
D
 
D
L
 
V
A
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
K
R
 
R
E
 
I
A
 
A
E
 
K
R
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
M
x
L
L
 
L
K
|
K
A
 
A
T
 
S
S
 
A
G
 
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
R
 
R
G
 
G
I
|
I
R
 
R
R
 
I
C
 
C
N
 
R
S
 
N
Q
 
E
A
 
E
E
 
E
L
 
L
E
 
V
S
 
R
A
 
N
Y
 
Y
P
 
E
R
 
N
V
 
A
I
 
Y
S
 
N
E
 
E
A
 
A
T
 
V
K
 
K
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
R
A
 
G
E
 
D
V
 
L
F
 
L
L
 
L
E
|
E
K
 
K
C
x
Y
I
|
I
V
 
E
E
 
N
P
 
P
K
 
K
H
|
H
I
 
I
E
 
E
A
 
F
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
A
 
G
D
 
D
S
 
K
F
 
Y
G
 
G
N
 
N
T
 
V
V
 
I
H
 
H
L
 
L
F
 
G
E
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
I
 
I
Q
|
Q
R
 
R
R
 
R
N
 
N
Q
|
Q
K
|
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
S
P
 
L
Q
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
R
 
R
A
 
E
Y
 
Y
I
 
Y
G
 
G
D
 
S
L
 
L
A
 
V
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
E
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
E
 
Y
N
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
M
E
|
E
F
 
F
L
x
I
L
 
A
A
 
D
D
 
E
-
 
K
G
 
G
E
 
N
V
 
L
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I
E
|
E
M
 
M
N
|
N
T
 
T
R
|
R
V
 
I
Q
|
Q
V
|
V
E
|
E
H
 
H
T
 
P
I
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
M
I
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
V
R
 
K
E
 
W
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
Q
 
E
P
 
R
L
 
L
S
 
R
V
 
Y
K
 
S
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
I
 
I
Q
 
R
H
 
F
R
 
N
G
 
G
F
 
Y
S
 
S
L
 
I
Q
 
E
F
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
K
N
 
K
N
 
G
F
 
F
L
 
A
P
 
P
C
 
S
F
 
I
G
 
G
K
 
T
I
 
I
T
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
G
P
 
F
G
 
G
V
 
I
R
 
R
T
 
V
D
 
E
T
 
H
A
 
A
I
 
S
Y
 
S
T
 
K
G
 
G
Y
 
Y
T
 
E
I
 
I
P
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
M
 
L
C
 
I
L
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
I
V
 
V
W
 
W
A
 
A
L
 
P
T
 
L
W
 
W
E
 
E
E
 
V
A
 
A
L
 
V
A
 
D
R
 
R
G
 
M
S
 
R
R
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
E
D
 
T
M
 
Y
R
 
E
V
 
I
Q
 
S
G
 
G
V
 
V
K
 
K
T
 
T
T
 
T
A
 
I
T
 
P
Y
 
L
Y
 
L
Q
 
I
Q
 
N
I
 
I
L
 
M
A
 
K
N
 
D
P
 
K
D
 
D
F
 
F
R
 
R
S
 
D
G
 
G
Q
 
K
F
 
F
N
 
T
T
 
T
S
 
R
F
 
Y
V
 
L
D
 
E
N
 
E
H
 
H
P
 
P
E
 
H
L
 
V
L
 
F
N
 
D
Y
 
Y
S
 
A

2vpqB Crystal structure of biotin carboxylase from s. Aureus complexed with amppnp (see paper)
53% identity, 93% coverage: 3:442/471 of query aligns to 1:443/448 of 2vpqB

query
sites
2vpqB
K
 
K
K
 
K
L
 
V
L
 
L
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
V
R
 
R
I
 
I
V
 
I
R
 
R
A
 
A
C
 
C
A
 
R
E
 
D
M
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
Q
S
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
I
F
 
Y
S
 
S
E
 
E
A
 
G
D
 
D
R
 
K
H
 
D
A
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
T
K
 
Q
R
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
A
H
 
Y
F
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
P
D
 
T
-
 
L
P
 
S
L
 
K
A
 
D
G
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
P
 
I
R
 
P
K
 
N
L
 
I
V
 
L
N
 
S
L
 
I
A
 
A
V
 
T
E
 
S
T
 
T
G
 
G
C
 
C
D
 
D
A
 
G
L
 
V
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
A
E
 
E
N
 
N
A
 
A
E
 
D
L
 
F
A
 
A
D
 
E
I
 
L
C
 
C
A
 
E
E
 
A
R
 
C
G
 
Q
I
 
L
K
 
K
F
 
F
V
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
S
A
 
Y
E
 
Q
V
 
S
I
 
I
R
 
Q
R
 
K
M
 
M
G
 
G
D
 
I
K
|
K
T
 
D
E
x
V
A
 
A
R
 
K
R
 
A
S
 
E
M
 
M
I
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
S
E
 
D
G
 
G
N
 
L
V
 
M
R
 
K
D
 
D
L
 
V
A
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
K
R
 
K
E
 
I
A
 
A
E
 
K
R
 
K
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
M
x
I
L
 
I
K
|
K
A
 
A
T
 
T
S
 
A
G
 
G
G
|
G
G
 
G
G
|
G
R
 
K
G
 
G
I
|
I
R
 
R
R
 
V
C
 
A
N
 
R
S
 
D
Q
 
E
A
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
S
 
T
A
 
G
Y
 
F
P
 
R
R
 
M
V
 
T
I
 
E
S
 
Q
E
 
E
A
 
A
T
 
Q
K
 
T
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
N
A
 
G
E
 
G
V
 
L
F
 
Y
L
 
M
E
 
E
K
 
K
C
x
F
I
|
I
V
 
E
E
 
N
P
 
F
K
 
R
H
|
H
I
 
I
E
 
E
A
 
I
Q
 
Q
I
 
I
L
 
V
A
 
G
D
 
D
S
 
S
F
 
Y
G
 
G
N
 
N
T
 
V
V
 
I
H
 
H
L
 
L
F
 
G
E
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
T
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
R
|
R
N
 
M
Q
 
Q
K
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
I
 
E
A
 
A
P
 
P
S
 
S
P
 
P
Q
 
I
L
 
L
T
 
D
P
 
D
E
 
E
Q
 
T
R
 
R
A
 
R
Y
 
E
I
 
M
G
 
G
D
 
N
L
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
N
Y
 
Y
E
 
E
N
 
N
A
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
I
E
|
E
F
 
F
L
x
I
-
 
Y
-
 
D
L
 
L
A
 
N
D
 
D
G
 
N
E
 
K
V
 
F
Y
 
Y
F
 
F
M
|
M
E
|
E
M
 
M
N
|
N
T
 
T
R
|
R
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
T
 
P
I
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
L
Q
 
Q
I
 
L
R
 
Q
I
 
V
A
 
A
S
 
M
G
 
G
Q
 
D
P
 
V
L
 
L
S
 
P
V
 
Y
K
 
K
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
I
 
I
Q
 
K
H
 
L
R
 
T
G
 
G
F
 
H
S
 
A
L
 
I
Q
 
E
F
 
F
R
|
R
I
 
I
N
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
N
P
 
P
R
 
Y
N
 
K
N
 
N
F
 
F
L
 
M
P
 
P
C
 
S
F
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
T
 
E
R
 
Q
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
P
 
Y
G
 
G
V
 
V
R
 
R
T
 
I
D
 
E
T
 
S
A
 
A
I
 
C
Y
 
Y
T
 
T
G
 
N
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
M
 
M
C
 
V
L
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
H
A
 
E
L
 
P
T
 
T
W
 
R
E
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
M
R
 
A
G
 
G
S
 
I
R
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
S
D
 
E
M
 
F
R
 
V
V
 
V
Q
 
L
G
 
G
V
 
I
K
 
D
T
 
T
T
 
T
A
 
I
T
 
P
Y
 
F
Y
 
H
Q
 
I
Q
 
K
I
 
L
L
 
L
A
 
N
N
 
N
P
 
D
D
 
I
F
 
F
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
F
 
F
N
 
N
T
 
T
S
 
N
F
 
F
V
 
L
D
 
E
N
 
Q
H
 
N

A0A0H3JRU9 Pyruvate carboxylase; EC 6.4.1.1 from Staphylococcus aureus (strain Mu50 / ATCC 700699) (see 2 papers)
48% identity, 95% coverage: 2:447/471 of query aligns to 4:458/1150 of A0A0H3JRU9

query
sites
A0A0H3JRU9
I
 
I
K
 
K
K
 
K
L
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
I
R
 
R
I
 
I
V
 
F
R
|
R
A
 
A
C
 
A
A
 
A
E
 
E
M
 
L
G
 
D
V
 
I
R
 
S
S
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
I
F
 
Y
S
 
S
E
 
N
A
 
E
D
 
D
R
 
K
H
 
S
A
 
S
L
 
L
H
 
H
V
 
R
K
 
Y
R
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
S
H
 
Y
F
 
L
I
 
V
G
 
G
E
 
S
D
 
D
-
 
L
-
 
G
P
 
P
L
 
A
A
 
E
G
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
P
 
I
R
 
E
K
 
R
L
 
I
V
 
I
N
 
D
L
 
V
A
 
A
V
 
K
E
 
Q
T
 
A
G
 
N
C
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
A
 
E
E
 
Q
L
 
F
A
 
A
D
 
R
I
 
R
C
 
C
A
 
A
E
 
E
R
 
E
G
 
G
I
 
I
K
 
K
F
 
F
V
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
H
A
 
L
E
 
E
V
 
H
I
 
L
R
 
D
R
 
M
M
 
F
G
 
G
D
 
D
K
|
K
T
 
V
E
 
K
A
 
A
R
 
R
R
 
T
S
 
T
M
 
A
I
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
D
V
 
L
P
 
P
V
 
V
T
 
I
P
 
P
G
 
G
T
 
T
E
 
D
G
 
G
N
 
P
V
 
I
R
 
K
D
 
S
L
 
Y
A
 
E
E
 
L
A
 
A
L
 
K
R
 
E
E
 
F
A
 
A
E
 
E
R
 
E
I
 
A
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
V
 
L
M
 
M
L
 
I
K
|
K
A
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
K
G
 
G
I
 
M
R
 
R
R
 
I
C
 
V
N
 
R
S
 
E
Q
 
E
A
 
S
E
 
E
L
 
L
E
 
E
S
 
D
A
 
A
Y
 
F
P
 
H
R
 
R
V
 
A
I
 
K
S
 
S
E
 
E
A
 
A
T
 
E
K
 
K
A
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
N
A
 
S
E
 
E
V
 
V
F
 
Y
L
 
I
E
 
E
K
 
R
C
 
Y
I
 
I
V
 
D
E
 
N
P
 
P
K
 
K
H
|
H
I
 
I
E
 
E
A
 
V
Q
 
Q
I
 
V
L
 
I
A
 
G
D
 
D
S
 
E
F
 
H
G
 
G
N
 
N
T
 
I
V
 
V
H
 
H
L
 
L
F
 
F
E
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
I
 
V
Q
 
Q
R
 
R
R
 
R
N
 
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
I
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
S
P
 
V
Q
 
G
L
 
L
T
 
S
P
 
P
E
 
T
Q
 
L
R
 
R
A
 
Q
Y
 
R
I
 
I
G
 
C
D
 
D
L
 
A
A
 
A
V
 
I
R
 
Q
A
 
L
A
 
M
K
 
E
A
 
N
V
 
I
G
 
K
Y
 
Y
E
 
V
N
 
N
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
L
 
L
L
 
V
A
 
S
D
 
G
G
 
D
E
 
E
V
 
F
Y
 
F
F
 
F
M
 
I
E
 
E
M
 
V
N
 
N
T
 
P
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
H
 
H
T
 
T
I
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
V
R
 
K
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
R
 
L
I
 
V
A
 
A
S
 
A
G
 
G
Q
 
A
P
 
D
L
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
N
S
 
M
V
 
P
K
 
Q
Q
 
Q
E
 
K
D
 
D
I
 
I
Q
 
T
H
 
T
R
 
L
G
 
G
F
 
Y
S
 
A
L
 
I
Q
 
Q
F
 
C
R
 
R
I
 
I
N
 
T
A
 
T
E
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
L
N
 
N
N
 
D
F
 
F
L
 
M
P
 
P
C
 
D
F
 
T
G
 
G
K
 
T
I
 
I
T
 
I
R
 
A
Y
 
Y
Y
 
R
A
 
S
P
 
S
G
 
G
G
 
G
P
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
T
 
L
D
 
D
T
 
A
A
 
G
I
 
D
-
 
G
Y
 
F
T
 
Q
G
 
G
Y
 
A
T
 
E
I
 
I
P
 
S
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
M
 
L
C
 
L
L
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
S
V
 
T
W
 
H
A
 
A
L
 
I
T
 
S
W
 
F
E
 
K
E
 
Q
A
 
A
L
 
E
A
 
E
R
x
K
G
 
M
S
 
V
R
 
R
A
 
S
L
 
L
D
 
R
D
 
E
M
 
M
R
 
R
V
 
I
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
K
 
K
T
 
T
T
 
N
A
 
I
T
 
P
Y
 
F
Y
 
L
Q
 
I
Q
 
N
I
 
V
L
 
M
A
 
K
N
 
N
P
 
K
D
 
K
F
 
F
R
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
D
F
 
Y
N
 
T
T
 
T
S
 
K
F
 
F
V
 
I
D
 
E
N
 
E
H
 
T
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
F
N
 
D

Sites not aligning to the query:

2vr1A Crystal structure of biotin carboxylase from e. Coli in complex with atp analog, adpcf2p. (see paper)
50% identity, 93% coverage: 1:440/471 of query aligns to 1:439/444 of 2vr1A

query
sites
2vr1A
M
 
M
I
 
L
K
 
D
K
 
K
L
 
I
L
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
L
R
 
R
I
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
A
C
 
C
A
 
K
E
 
E
M
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
K
S
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
H
S
 
S
E
 
S
A
 
A
D
 
D
R
 
R
H
 
D
A
 
L
L
 
K
H
 
H
V
 
V
K
 
L
R
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
T
H
 
V
F
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
P
D
 
A
P
 
P
-
 
S
L
 
V
A
 
K
G
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
P
 
I
R
 
P
K
 
A
L
 
I
V
 
I
N
 
S
L
 
A
A
 
A
V
 
E
E
 
I
T
 
T
G
 
G
C
 
A
D
 
V
A
 
A
L
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
A
 
A
E
 
N
L
 
F
A
 
A
D
 
E
I
 
Q
C
 
V
A
 
E
E
 
R
R
 
S
G
 
G
I
 
F
K
 
I
F
 
F
V
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
K
A
 
A
E
 
E
V
 
T
I
 
I
R
 
R
R
 
L
M
 
M
G
 
G
D
 
D
K
|
K
T
 
V
E
 
S
A
 
A
R
 
I
R
 
A
S
 
A
M
 
M
I
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
C
T
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
S
E
 
D
G
 
G
N
 
P
V
 
L
R
 
G
D
 
D
L
 
D
A
 
M
E
 
D
A
 
K
L
 
N
R
 
R
E
 
A
-
 
I
A
 
A
E
 
K
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
M
 
I
L
 
I
K
|
K
A
 
A
T
 
S
S
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
|
R
G
 
G
I
x
M
R
 
R
R
 
V
C
 
V
N
 
R
S
 
G
Q
 
D
A
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
A
S
 
Q
A
 
S
Y
 
I
P
 
S
R
 
M
V
 
T
I
 
R
S
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
K
K
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
S
S
 
N
A
x
D
E
 
M
V
 
V
F
 
Y
L
 
M
E
 
E
K
 
K
C
x
Y
I
x
L
V
 
E
E
 
N
P
 
P
K
 
R
H
|
H
I
 
V
E
 
E
A
 
I
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
S
 
G
F
 
Q
G
 
G
N
 
N
T
 
A
V
 
I
H
 
Y
L
 
L
F
 
A
E
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
I
 
M
Q
 
Q
R
 
R
R
|
R
N
 
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
I
 
V
E
 
E
I
 
E
A
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
P
Q
 
G
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
L
R
 
R
A
 
R
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
D
 
E
L
 
R
A
 
C
V
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
C
K
 
V
A
 
D
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
E
 
R
N
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
F
E
|
E
F
 
F
L
|
L
L
 
F
A
 
E
D
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
F
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I
E
|
E
M
 
M
N
|
N
T
 
T
R
|
R
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
T
 
P
I
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
M
I
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
I
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
I
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
S
 
S
V
 
I
K
 
K
Q
 
Q
E
 
E
D
 
E
I
 
V
Q
 
H
H
 
V
R
 
R
G
 
G
F
 
H
S
 
A
L
 
V
Q
 
E
F
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
-
N
 
N
N
 
T
F
 
F
L
 
L
P
 
P
C
 
S
F
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
T
 
T
R
 
R
Y
 
F
Y
 
H
A
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
P
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
T
 
W
D
 
E
T
 
S
A
 
H
I
 
I
Y
 
Y
T
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
I
 
V
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
M
 
M
C
 
I
L
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
I
V
 
C
W
 
Y
A
 
G
L
 
E
T
 
N
W
 
R
E
 
D
E
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
M
S
 
K
R
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
D
 
E
M
 
L
R
 
I
V
 
I
Q
 
D
G
 
G
V
 
I
K
 
K
T
 
T
T
 
N
A
 
V
T
 
D
Y
 
L
Y
 
Q
Q
 
I
Q
 
R
I
 
I
L
 
M
A
 
N
N
 
D
P
 
E
D
 
N
F
 
F
R
 
Q
S
 
H
G
 
G
Q
 
G
F
 
T
N
 
N
T
x
I
S
 
H
F
 
Y
V
 
L
D
 
E

4mv4A Crystal structure of biotin carboxylase from haemophilus influenzae in complex with amppcp and mg2 (see paper)
50% identity, 93% coverage: 1:440/471 of query aligns to 1:438/442 of 4mv4A

query
sites
4mv4A
M
 
M
I
 
L
K
 
E
K
 
K
L
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
L
R
 
R
I
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
A
C
 
C
A
 
K
E
 
E
M
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
K
S
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
H
S
 
S
E
 
T
A
 
A
D
 
D
R
 
R
H
 
D
A
 
L
L
 
K
H
 
H
V
 
V
K
 
L
R
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
T
H
 
I
F
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
P
D
 
A
P
 
P
L
 
S
A
 
A
-
 
K
G
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
P
 
I
R
 
P
K
 
A
L
 
I
V
 
I
N
 
A
L
 
A
A
 
A
V
 
E
E
 
V
T
 
T
G
 
G
C
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
A
 
A
E
 
D
L
 
F
A
 
A
D
 
E
I
 
Q
C
 
V
A
 
E
E
 
R
R
 
S
G
 
G
I
 
F
K
 
T
F
 
F
V
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
T
A
 
A
E
 
D
V
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
L
M
 
M
G
 
G
D
 
D
K
|
K
T
 
V
E
 
S
A
 
A
R
 
I
R
 
K
S
 
A
M
 
M
I
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
C
T
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
S
E
 
D
G
 
G
N
 
P
V
 
V
-
 
S
R
 
N
D
 
D
L
 
I
A
 
A
E
 
K
A
 
N
L
 
K
R
 
E
E
 
I
A
 
A
E
 
K
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
I
M
 
I
L
 
I
K
|
K
A
 
A
T
 
S
S
 
G
G
 
G
G
|
G
G
 
G
G
x
M
R
 
R
G
 
V
I
 
V
R
 
R
R
 
-
C
 
-
N
 
-
S
 
S
Q
 
E
A
 
D
E
 
A
L
 
L
E
 
E
S
 
E
A
 
S
Y
 
I
P
 
A
R
 
M
V
 
T
I
 
K
S
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
K
K
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
N
S
 
N
A
x
D
E
 
M
V
 
V
F
 
Y
L
 
M
E
|
E
K
 
K
C
x
Y
I
x
L
V
 
E
E
 
N
P
 
P
K
 
R
H
|
H
I
 
V
E
 
E
A
 
I
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
S
 
T
F
 
H
G
 
G
N
 
N
T
 
A
V
 
V
H
 
Y
L
 
L
F
 
A
E
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
I
 
M
Q
 
Q
R
 
R
R
|
R
N
x
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
I
 
V
E
 
E
I
 
E
A
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
P
Q
 
G
L
 
I
T
 
T
P
 
E
E
 
E
Q
 
V
R
 
R
A
 
R
Y
 
D
I
 
I
G
 
G
D
 
S
L
 
R
A
 
C
V
 
A
R
 
N
A
 
A
A
 
C
K
 
V
A
 
E
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
E
 
R
N
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
F
E
|
E
F
 
F
L
|
L
L
 
Y
A
 
E
D
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
F
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I
E
|
E
M
 
M
N
|
N
T
 
T
R
|
R
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
T
 
P
I
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
M
I
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
I
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
L
 
I
S
 
S
V
 
F
K
 
K
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
I
 
I
Q
 
K
H
 
V
R
 
K
G
 
G
F
 
H
S
 
A
L
 
M
Q
 
E
F
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
K
N
 
-
N
 
T
F
 
F
L
 
L
P
 
P
C
 
S
F
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
T
 
N
R
 
H
Y
 
L
Y
 
H
A
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
P
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
T
 
W
D
 
D
T
 
S
A
 
H
I
 
V
Y
 
Y
T
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
I
 
V
P
 
P
P
 
P
Y
 
H
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
M
 
M
C
 
I
L
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
I
V
 
T
W
 
Y
A
 
G
L
 
D
T
 
T
W
 
R
E
 
E
E
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
R
R
 
R
G
 
M
S
 
Q
R
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
S
D
 
E
M
 
T
R
 
I
V
 
I
Q
 
D
G
 
G
V
 
I
K
 
K
T
 
T
T
 
N
A
 
I
T
 
P
Y
 
L
Y
 
H
Q
 
E
Q
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
E
N
 
D
P
 
E
D
 
N
F
 
F
R
 
Q
S
 
K
G
 
G
Q
 
G
F
 
T
N
 
N
T
 
I
S
 
H
F
 
Y
V
 
L
D
 
E

8hz4A The tetrameric structure of biotin carboxylase from chloroflexus aurantiacus in complex with bicarbonate
50% identity, 96% coverage: 1:454/471 of query aligns to 1:452/456 of 8hz4A

query
sites
8hz4A
M
 
M
I
 
F
K
 
R
K
 
T
L
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
L
R
 
R
I
 
V
V
 
M
R
 
R
A
 
A
C
 
C
A
 
R
E
 
E
M
 
L
G
 
G
V
 
L
R
 
R
S
 
C
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
x
Y
S
 
S
E
 
E
A
 
A
D
 
D
R
|
R
H
 
D
A
 
A
L
 
P
H
 
H
V
 
V
K
 
A
R
 
Y
A
 
A
D
 
D
E
x
D
A
|
A
H
x
F
F
x
L
I
 
I
G
 
G
E
 
P
-
 
P
D
 
S
P
 
P
L
 
A
A
 
E
G
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
P
 
I
R
 
D
K
 
A
L
 
I
V
 
I
N
 
R
L
 
A
A
 
A
V
 
K
E
 
A
T
 
T
G
 
G
C
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
A
E
 
E
N
 
N
A
 
A
E
 
S
L
 
F
A
 
V
D
 
R
I
 
A
C
 
V
A
 
T
E
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
L
K
 
I
F
 
F
V
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
P
A
 
A
E
 
E
V
 
A
I
 
M
R
 
E
R
 
R
M
 
M
G
 
G
D
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
R
S
 
E
M
 
A
I
 
T
K
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
V
E
 
L
G
 
E
N
 
P
V
 
V
R
 
T
D
 
D
L
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
V
L
 
R
R
 
R
E
 
L
A
 
G
E
 
K
R
 
E
I
 
F
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
I
M
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
A
T
 
V
S
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
L
R
 
R
R
 
V
C
 
V
N
 
R
S
 
S
Q
 
P
A
 
E
E
 
E
L
 
V
E
 
D
S
 
E
A
 
A
Y
 
F
P
 
A
R
 
A
V
 
A
I
 
R
S
 
R
E
 
E
A
 
A
T
 
E
K
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
K
S
 
N
A
 
G
E
 
E
V
 
L
F
 
Y
L
 
V
E
 
E
K
 
K
C
 
Y
I
 
L
V
 
D
E
 
D
P
 
P
K
 
R
H
 
H
I
 
I
E
 
E
A
 
I
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
S
 
R
F
 
Y
G
 
G
N
 
N
T
 
A
V
 
V
H
 
A
L
 
L
F
 
G
E
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
I
 
V
Q
 
Q
R
 
R
R
 
R
N
 
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
E
I
 
E
A
 
C
P
 
P
S
 
S
P
 
P
Q
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
L
R
 
R
A
 
A
Y
 
E
I
 
M
G
 
G
D
 
A
L
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
E
 
V
N
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
F
A
 
Q
D
 
D
G
 
G
E
 
R
V
 
Y
Y
 
Y
F
 
F
M
 
L
E
 
E
M
 
M
N
 
N
T
 
T
R
|
R
V
 
I
Q
|
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
T
 
T
I
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
M
I
 
V
T
 
Y
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
L
V
 
V
R
 
A
E
 
A
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
Q
G
 
G
Q
 
E
P
 
K
L
 
L
S
 
W
V
 
F
K
 
K
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
I
 
V
Q
 
V
H
 
P
R
 
R
G
 
G
F
 
H
S
 
A
L
 
I
Q
 
E
F
 
C
R
 
R
I
 
I
N
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
L
N
 
H
N
 
N
F
 
F
L
 
R
P
 
P
C
 
A
F
 
L
G
 
G
K
 
T
I
 
I
T
 
G
R
 
E
Y
 
Y
Y
 
H
A
 
E
P
 
P
G
 
V
G
 
G
P
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
T
 
V
D
 
D
T
 
S
A
 
G
I
 
V
Y
 
R
T
 
A
G
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
I
 
V
P
 
P
P
 
S
Y
 
H
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
M
 
L
C
 
L
L
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
I
V
 
T
W
 
W
A
 
G
L
 
S
T
 
D
W
 
R
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
M
S
 
R
R
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
A
D
 
E
M
 
Y
R
 
R
V
 
I
Q
 
E
G
 
G
V
 
V
K
 
T
T
 
T
T
 
I
A
 
I
T
 
P
Y
 
F
Y
 
H
Q
 
Q
Q
 
A
I
 
A
L
 
L
A
 
E
N
 
H
P
 
P
D
 
V
F
 
F
R
 
T
S
 
A
G
 
G
Q
 
A
F
 
A
N
 
T
T
 
V
S
 
N
F
 
F
V
 
I
D
 
P
N
 
R
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
F
N
 
S
Y
 
R
S
 
A
I
 
A
K
 
E
R
 
L
K
 
T
P
 
P

P24182 Biotin carboxylase; Acetyl-coenzyme A carboxylase biotin carboxylase subunit A; EC 6.3.4.14 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
51% identity, 93% coverage: 1:440/471 of query aligns to 1:441/449 of P24182

query
sites
P24182
M
 
M
I
 
L
K
 
D
K
 
K
L
 
I
L
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
L
R
 
R
I
 
I
V
 
L
R
|
R
A
 
A
C
 
C
A
 
K
E
|
E
M
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
K
S
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
H
S
 
S
E
 
S
A
 
A
D
 
D
R
 
R
H
 
D
A
 
L
L
 
K
H
 
H
V
 
V
K
 
L
R
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
T
H
 
V
F
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
P
D
 
A
P
 
P
-
 
S
L
 
V
A
 
K
G
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
P
 
I
R
 
P
K
 
A
L
 
I
V
 
I
N
 
S
L
 
A
A
 
A
V
 
E
E
 
I
T
 
T
G
 
G
C
 
A
D
 
V
A
 
A
L
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
A
 
A
E
 
N
L
 
F
A
 
A
D
 
E
I
 
Q
C
 
V
A
 
E
E
 
R
R
 
S
G
 
G
I
 
F
K
 
I
F
 
F
V
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
K
A
 
A
E
 
E
V
 
T
I
 
I
R
 
R
R
 
L
M
 
M
G
 
G
D
 
D
K
|
K
T
 
V
E
 
S
A
 
A
R
 
I
R
 
A
S
 
A
M
 
M
I
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
C
T
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
S
E
 
D
G
 
G
N
 
P
V
 
L
R
 
G
D
 
D
L
 
D
A
 
M
E
 
D
A
 
K
L
 
N
R
 
R
E
 
A
-
 
I
A
 
A
E
 
K
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
M
 
I
L
 
I
K
|
K
A
 
A
T
 
S
S
 
G
G
 
G
G
 
G
G
|
G
G
|
G
R
 
R
G
 
G
I
 
M
R
 
R
R
 
V
C
 
V
N
 
R
S
 
G
Q
 
D
A
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
A
S
 
Q
A
 
S
Y
 
I
P
 
S
R
 
M
V
 
T
I
 
R
S
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
K
K
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
S
S
 
N
A
 
D
E
 
M
V
 
V
F
 
Y
L
 
M
E
|
E
K
|
K
C
x
Y
I
x
L
V
 
E
E
 
N
P
 
P
K
 
R
H
|
H
I
 
V
E
 
E
A
 
I
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
S
 
G
F
 
Q
G
 
G
N
 
N
T
 
A
V
 
I
H
 
Y
L
 
L
F
 
A
E
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
I
 
M
Q
 
Q
R
 
R
R
 
R
N
x
H
Q
 
Q
K
|
K
L
 
V
I
 
V
E
 
E
I
 
E
A
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
P
Q
 
G
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
L
R
 
R
A
 
R
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
D
 
E
L
 
R
A
 
C
V
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
C
K
 
V
A
 
D
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
E
 
R
N
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
F
E
|
E
F
 
F
L
 
L
L
 
F
A
 
E
D
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
F
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I
E
|
E
M
 
M
N
 
N
T
 
T
R
|
R
V
 
I
Q
 
Q
V
|
V
E
|
E
H
 
H
T
 
P
I
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
M
I
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
I
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
I
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
S
 
S
V
 
I
K
 
K
Q
 
Q
E
 
E
D
 
E
I
 
V
Q
 
H
H
 
V
R
 
R
G
 
G
F
 
H
S
 
A
L
 
V
Q
 
E
F
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
-
N
 
N
N
 
T
F
 
F
L
 
L
P
 
P
C
 
S
F
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
T
 
T
R
 
R
Y
 
F
Y
 
H
A
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
P
x
F
G
 
G
V
 
V
R
|
R
T
 
W
D
 
E
T
 
S
A
 
H
I
 
I
Y
 
Y
T
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
I
 
V
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
M
 
M
C
 
I
L
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
I
V
 
C
W
 
Y
A
 
G
L
 
E
T
 
N
W
 
R
E
 
D
E
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
M
S
 
K
R
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
D
 
E
M
 
L
R
 
I
V
 
I
Q
 
D
G
 
G
V
 
I
K
 
K
T
 
T
T
 
N
A
 
V
T
 
D
Y
 
L
Y
 
Q
Q
 
I
Q
 
R
I
 
I
L
 
M
A
 
N
N
 
D
P
 
E
D
 
N
F
 
F
R
 
Q
S
 
H
G
 
G
Q
 
G
F
 
T
N
 
N
T
 
I
S
 
H
F
 
Y
V
 
L
D
 
E

3bg5A Crystal structure of staphylococcus aureus pyruvate carboxylase (see paper)
47% identity, 95% coverage: 2:447/471 of query aligns to 2:449/1137 of 3bg5A

query
sites
3bg5A
I
 
I
K
 
K
K
 
K
L
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
I
R
 
R
I
 
I
V
 
F
R
 
R
A
 
A
C
 
A
A
 
A
E
 
E
M
 
L
G
 
D
V
 
I
R
 
S
S
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
I
F
 
Y
S
 
S
E
 
N
A
 
E
D
 
D
R
 
K
H
 
S
A
 
S
L
 
L
H
 
H
V
 
R
K
 
Y
R
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
S
H
 
Y
F
 
L
I
 
V
G
 
G
E
 
S
D
 
D
-
 
L
-
 
G
P
 
P
L
 
A
A
 
E
G
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
P
 
I
R
 
E
K
 
R
L
 
I
V
 
I
N
 
D
L
 
V
A
 
A
V
 
K
E
 
Q
T
 
A
G
 
N
C
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
A
 
E
E
 
Q
L
 
F
A
 
A
D
 
R
I
 
R
C
 
C
A
 
A
E
 
E
R
 
E
G
 
G
I
 
I
K
 
K
F
 
F
V
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
H
A
 
L
E
 
E
V
 
H
I
 
L
R
 
D
R
 
M
M
 
F
G
 
G
D
 
D
K
|
K
T
 
V
E
 
K
A
 
A
R
 
R
R
 
T
S
 
T
M
 
A
I
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
D
V
 
L
P
 
P
V
 
V
T
 
I
P
 
P
G
 
G
T
 
T
E
 
D
G
 
G
N
 
P
V
 
I
R
 
K
D
 
S
L
 
Y
A
 
E
E
 
L
A
 
A
L
 
K
R
 
E
E
 
F
A
 
A
E
 
E
R
 
E
I
 
A
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
V
 
L
M
|
M
L
 
I
K
|
K
A
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
R
R
 
I
C
 
V
N
 
R
S
 
E
Q
 
E
A
 
S
E
 
E
L
 
L
E
 
E
S
 
D
A
 
A
Y
 
F
P
 
H
R
 
R
V
 
A
I
 
K
S
 
S
E
 
E
A
 
A
T
 
E
K
 
K
A
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
N
A
x
S
E
 
E
V
 
V
F
 
Y
L
 
I
E
 
E
K
 
R
C
x
Y
I
|
I
V
 
D
E
 
N
P
 
P
K
 
K
H
|
H
I
 
I
E
 
E
A
 
V
Q
 
Q
I
 
V
L
 
I
A
 
G
D
 
D
S
 
E
F
 
H
G
 
G
N
 
N
T
 
I
V
 
V
H
 
H
L
 
L
F
 
F
E
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
I
 
V
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
x
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
I
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
S
P
 
V
Q
 
G
L
 
L
T
 
S
P
 
P
E
 
T
Q
 
L
R
 
R
A
 
Q
Y
 
R
I
 
I
G
 
C
D
 
D
L
 
A
A
 
A
V
 
I
R
 
Q
A
 
L
A
 
M
K
 
E
A
 
N
V
 
I
G
 
K
Y
 
Y
E
 
V
N
 
N
A
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
L
|
L
L
 
V
A
 
S
D
 
G
G
 
D
E
 
E
V
 
F
Y
 
F
F
 
F
M
 
I
E
|
E
M
 
V
N
|
N
T
 
P
R
|
R
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
T
 
T
I
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
V
R
 
K
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
R
 
L
I
 
V
A
 
A
S
 
A
G
 
G
Q
 
A
P
 
D
L
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
N
S
 
M
V
 
P
K
 
Q
Q
 
Q
E
 
K
D
 
D
I
 
I
Q
 
T
H
 
T
R
 
L
G
 
G
F
 
Y
S
 
A
L
 
I
Q
 
Q
F
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
T
A
 
T
E
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
L
N
 
N
N
 
D
F
 
F
L
 
M
P
 
P
C
 
D
F
 
T
G
 
G
K
 
T
I
 
I
T
 
I
R
 
A
Y
 
Y
Y
 
R
A
 
S
P
 
S
G
 
G
G
 
G
P
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
T
 
L
D
 
D
T
 
A
A
 
G
I
 
D
-
 
G
Y
 
F
T
 
Q
G
 
G
Y
 
A
T
 
E
I
 
I
P
 
S
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
M
 
L
C
 
L
L
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
S
V
 
T
W
 
H
A
 
A
L
 
I
T
 
S
W
 
F
E
 
K
E
 
Q
A
 
A
L
 
E
A
 
E
R
 
K
G
 
M
S
 
V
R
 
R
A
 
S
L
 
L
D
 
R
D
 
E
M
 
M
R
 
R
V
 
I
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
K
 
K
T
 
T
T
 
N
A
 
I
T
 
P
Y
 
F
Y
 
L
Q
 
I
Q
 
N
I
 
V
L
 
M
A
 
K
N
 
N
P
 
K
D
 
K
F
 
F
R
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
D
F
 
Y
N
 
T
T
 
T
S
 
K
F
 
F
V
 
I
D
 
E
N
 
E
H
 
T
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
F
N
 
D

Sites not aligning to the query:

3rupA Crystal structure of e.Coli biotin carboxylase in complex with two adp and two ca ions (see paper)
51% identity, 93% coverage: 1:440/471 of query aligns to 1:441/444 of 3rupA

query
sites
3rupA
M
 
M
I
 
L
K
 
D
K
 
K
L
 
I
L
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
L
R
 
R
I
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
A
C
 
C
A
 
K
E
 
E
M
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
K
S
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
H
S
 
S
E
 
S
A
 
A
D
 
D
R
 
R
H
 
D
A
 
L
L
 
K
H
 
H
V
 
V
K
 
L
R
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
T
H
 
V
F
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
P
D
 
A
P
 
P
-
 
S
L
 
V
A
 
K
G
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
P
 
I
R
 
P
K
 
A
L
 
I
V
 
I
N
 
S
L
 
A
A
 
A
V
 
E
E
 
I
T
 
T
G
 
G
C
 
A
D
 
V
A
 
A
L
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
|
Y
G
|
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
|
E
N
 
N
A
 
A
E
 
N
L
 
F
A
 
A
D
 
E
I
 
Q
C
 
V
A
 
E
E
 
R
R
 
S
G
 
G
I
 
F
K
 
I
F
 
F
V
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
K
A
 
A
E
 
E
V
 
T
I
 
I
R
 
R
R
 
L
M
 
M
G
 
G
D
 
D
K
|
K
T
 
V
E
 
S
A
 
A
R
 
I
R
 
A
S
 
A
M
 
M
I
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
C
T
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
S
E
 
D
G
 
G
N
 
P
V
 
L
R
 
G
D
 
D
L
 
D
A
 
M
E
 
D
A
 
K
L
 
N
R
 
R
E
 
A
-
 
I
A
 
A
E
 
K
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
M
 
I
L
 
I
K
|
K
A
 
A
T
 
S
S
 
G
G
 
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
R
|
R
G
 
G
I
x
M
R
 
R
R
 
V
C
 
V
N
 
R
S
 
G
Q
 
D
A
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
A
S
 
Q
A
 
S
Y
 
I
P
 
S
R
 
M
V
 
T
I
 
R
S
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
K
K
 
A
A
 
A
F
|
F
G
 
S
S
 
N
A
x
D
E
 
M
V
 
V
F
 
Y
L
 
M
E
|
E
K
|
K
C
x
Y
I
x
L
V
 
E
E
 
N
P
 
P
K
 
R
H
|
H
I
 
V
E
 
E
A
 
I
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
S
 
G
F
 
Q
G
 
G
N
 
N
T
 
A
V
 
I
H
 
Y
L
 
L
F
 
A
E
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
I
 
M
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
x
H
Q
 
Q
K
|
K
L
 
V
I
 
V
E
 
E
I
 
E
A
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
P
Q
 
G
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
L
R
 
R
A
 
R
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
D
 
E
L
 
R
A
 
C
V
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
C
K
 
V
A
 
D
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
E
 
R
N
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
F
E
|
E
F
 
F
L
|
L
L
 
F
A
 
E
D
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
F
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I
E
|
E
M
 
M
N
|
N
T
 
T
R
|
R
V
 
I
Q
 
Q
V
|
V
E
|
E
H
 
H
T
 
P
I
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
M
I
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
I
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
I
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
S
 
S
V
 
I
K
 
K
Q
 
Q
E
 
E
D
 
E
I
 
V
Q
 
H
H
 
V
R
 
R
G
 
G
F
 
H
S
 
A
L
 
V
Q
 
E
F
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
-
N
 
N
N
 
T
F
 
F
L
 
L
P
 
P
C
 
S
F
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
T
 
T
R
 
R
Y
 
F
Y
 
H
A
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
P
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
T
 
W
D
 
E
T
 
S
A
 
H
I
 
I
Y
 
Y
T
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
I
 
V
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
D
|
D
S
 
S
M
 
M
C
 
I
L
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
I
V
 
C
W
 
Y
A
 
G
L
 
E
T
 
N
W
 
R
E
 
D
E
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
M
S
 
K
R
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
D
 
E
M
 
L
R
 
I
V
 
I
Q
 
D
G
 
G
V
 
I
K
 
K
T
 
T
T
 
N
A
 
V
T
 
D
Y
 
L
Y
 
Q
Q
 
I
Q
 
R
I
 
I
L
 
M
A
 
N
N
 
D
P
 
E
D
 
N
F
 
F
R
 
Q
S
 
H
G
 
G
Q
 
G
F
 
T
N
 
N
T
x
I
S
 
H
F
 
Y
V
 
L
D
 
E

3g8cA Crystal structure of biotin carboxylase in complex with biotin, bicarbonate, adp and mg ion (see paper)
51% identity, 93% coverage: 1:440/471 of query aligns to 1:441/444 of 3g8cA

query
sites
3g8cA
M
 
M
I
 
L
K
 
D
K
 
K
L
 
I
L
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
L
R
 
R
I
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
A
C
 
C
A
 
K
E
 
E
M
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
K
S
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
H
S
 
S
E
 
S
A
 
A
D
 
D
R
 
R
H
 
D
A
 
L
L
 
K
H
 
H
V
 
V
K
 
L
R
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
T
H
 
V
F
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
P
D
 
A
P
 
P
-
 
S
L
 
V
A
 
K
G
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
P
 
I
R
 
P
K
 
A
L
 
I
V
 
I
N
 
S
L
 
A
A
 
A
V
 
E
E
 
I
T
 
T
G
 
G
C
 
A
D
 
V
A
 
A
L
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
F
|
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
A
 
A
E
 
N
L
 
F
A
 
A
D
 
E
I
 
Q
C
 
V
A
 
E
E
 
R
R
 
S
G
 
G
I
 
F
K
 
I
F
 
F
V
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
K
A
 
A
E
 
E
V
 
T
I
 
I
R
 
R
R
 
L
M
 
M
G
 
G
D
 
D
K
|
K
T
 
V
E
 
S
A
 
A
R
 
I
R
 
A
S
 
A
M
 
M
I
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
C
T
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
S
E
 
D
G
 
G
N
 
P
V
 
L
R
 
G
D
 
D
L
 
D
A
 
M
E
 
D
A
 
K
L
 
N
R
 
R
E
 
A
-
 
I
A
 
A
E
 
K
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
M
x
I
L
 
I
K
|
K
A
 
A
T
 
S
S
 
G
G
 
G
G
|
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
x
M
R
 
R
R
 
V
C
 
V
N
 
R
S
 
G
Q
 
D
A
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
A
S
 
Q
A
 
S
Y
 
I
P
 
S
R
 
M
V
 
T
I
 
R
S
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
K
K
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
S
S
 
N
A
x
D
E
 
M
V
 
V
F
 
Y
L
 
M
E
|
E
K
|
K
C
x
Y
I
x
L
V
 
E
E
 
N
P
 
P
K
 
R
H
|
H
I
 
V
E
 
E
A
 
I
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
S
 
G
F
 
Q
G
 
G
N
 
N
T
 
A
V
 
I
H
 
Y
L
 
L
F
 
A
E
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
I
 
M
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
x
H
Q
 
Q
K
|
K
L
 
V
I
 
V
E
 
E
I
 
E
A
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
P
Q
 
G
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
L
R
 
R
A
 
R
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
D
 
E
L
 
R
A
 
C
V
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
C
K
 
V
A
 
D
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
E
 
R
N
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
F
E
|
E
F
 
F
L
|
L
L
 
F
A
 
E
D
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
F
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I