SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF4159 FitnessBrowser__Marino:GFF4159 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
48% identity, 91% coverage: 2:245/269 of query aligns to 4:239/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
E
 
D
A
 
I
L
 
V
L
 
L
E
 
E
I
 
V
D
 
Q
N
 
S
I
 
L
E
 
H
V
 
V
V
 
Y
Y
|
Y
N
 
G
K
 
-
S
 
A
V
 
I
Q
 
H
V
 
A
L
 
I
R
 
K
G
 
G
L
 
I
S
 
D
L
 
L
R
 
K
V
 
V
P
 
P
K
 
R
G
 
G
A
 
Q
I
 
I
V
 
V
A
 
T
L
 
L
L
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
L
 
L
K
 
S
S
 
A
V
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
V
T
 
R
L
 
A
E
 
Q
D
 
K
G
 
G
E
 
K
V
 
I
T
 
I
A
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
F
R
 
N
G
 
G
K
 
Q
D
 
D
V
 
I
K
 
T
G
 
N
V
 
K
P
 
P
P
 
A
E
 
H
R
 
V
L
 
I
V
 
N
R
 
R
D
 
M
G
 
G
L
 
I
F
 
A
H
 
L
V
 
V
M
 
P
E
|
E
G
 
G
R
 
R
R
 
R
V
 
I
F
 
F
E
 
P
D
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
V
E
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
L
I
 
M
A
 
M
A
 
G
T
 
A
Y
 
Y
A
 
N
L
 
-
S
 
R
G
 
K
S
 
D
K
 
K
P
 
E
S
 
G
L
 
I
S
 
K
D
 
R
S
 
D
Y
 
L
E
 
E
L
 
W
V
 
I
Y
 
F
N
 
S
Y
 
L
F
 
F
P
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
K
E
 
E
R
 
R
R
 
L
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
A
 
G
G
 
G
Y
 
T
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
A
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
M
A
 
S
Q
 
R
P
 
P
D
 
K
L
 
L
I
 
L
M
 
M
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
S
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
I
L
 
L
V
 
V
E
 
S
E
 
E
I
 
V
F
 
F
T
 
E
I
 
V
V
 
I
A
 
Q
R
 
K
I
 
I
N
 
N
R
 
Q
E
 
E
Q
 
-
G
 
G
T
 
T
A
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
N
 
N
A
 
A
A
 
L
V
 
G
S
 
A
L
 
L
A
 
K
I
 
V
A
 
A
S
 
H
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
I
 
V
M
 
L
E
 
E
N
 
T
G
 
G
K
 
Q
I
 
I
V
 
V
I
 
L
D
 
E
G
 
G
P
 
K
A
 
A
D
 
S
K
 
E
L
 
L
T
 
L
A
 
D
N
 
N
E
 
E
D
 
M
V
 
V
Q
 
R
E
 
K
F
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
V

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
30% identity, 90% coverage: 3:244/269 of query aligns to 1:235/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
A
 
A
L
 
I
L
 
L
E
 
K
I
 
A
D
 
Q
N
 
H
I
 
L
E
 
A
V
 
K
V
 
S
Y
 
Y
N
 
K
K
 
K
S
 
R
V
 
-
Q
 
K
V
 
V
L
 
V
R
 
S
G
 
D
L
 
V
S
 
S
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
P
 
E
K
 
S
G
 
G
A
 
Q
I
 
I
V
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
T
 
S
L
 
F
K
 
Y
S
 
M
V
 
I
S
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
V
T
 
A
L
 
R
E
 
D
D
 
E
G
 
G
E
 
T
V
 
I
T
 
T
A
 
I
G
 
D
E
 
D
V
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
G
 
-
K
 
N
D
 
D
V
 
I
K
 
S
G
 
I
V
 
L
P
 
P
P
 
M
E
 
H
R
 
S
L
 
R
V
 
S
R
 
R
D
 
M
G
 
G
L
 
I
F
 
G
H
 
Y
V
 
L
M
 
P
E
 
Q
G
 
E
R
 
A
R
 
S
V
 
I
F
 
F
E
 
R
D
 
K
L
 
L
T
 
S
V
 
V
E
 
E
E
 
D
N
 
N
L
 
I
I
 
M
A
 
A
A
 
V
T
 
L
Y
 
Q
A
 
T
L
 
R
S
 
E
G
 
E
-
 
L
S
 
T
K
 
H
P
x
E
S
 
E
L
 
R
S
 
Q
D
|
D
S
 
K
Y
 
L
E
 
E
L
 
D
V
 
L
Y
 
L
N
 
E
Y
 
E
F
 
F
P
 
-
R
 
H
L
 
I
K
 
Q
E
 
H
R
 
I
R
 
R
K
 
K
Q
 
S
L
 
A
A
 
G
G
 
M
Y
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
Q
 
N
P
 
P
D
 
Q
L
 
F
I
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
D
P
 
P
L
 
I
L
 
S
V
 
V
E
 
I
E
 
D
I
 
I
F
 
K
T
 
K
I
 
I
V
 
I
A
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
Q
 
R
G
 
G
T
 
L
A
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
A
 
V
A
 
R
V
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
D
I
 
V
A
 
C
S
 
E
Y
 
K
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
M
 
V
E
 
S
N
 
Q
G
 
G
K
 
R
I
 
L
V
 
I
I
 
A
D
 
E
G
 
G
P
 
T
A
 
P
D
 
Q
K
 
D
L
 
V
T
 
L
A
 
N
N
 
N
E
 
E
D
 
Q
V
 
V
Q
 
K
E
 
Q
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
30% identity, 90% coverage: 4:244/269 of query aligns to 4:253/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
L
 
I
L
 
L
E
 
R
I
 
T
D
 
E
N
 
N
I
 
I
E
 
-
V
 
V
V
 
K
Y
 
Y
N
x
F
K
 
G
S
 
E
V
x
F
Q
 
K
V
 
A
L
 
L
R
 
D
G
 
G
L
 
V
S
 
S
L
 
I
R
 
S
V
 
V
P
 
N
K
 
K
G
 
G
A
 
D
I
 
V
V
 
T
A
 
L
L
 
I
L
 
I
G
 
G
S
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
L
L
 
I
K
 
N
S
 
V
V
 
I
S
 
T
G
 
G
L
 
F
L
 
L
T
 
K
L
 
A
E
 
D
D
 
E
G
 
G
E
 
R
V
 
V
T
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
Y
F
 
F
R
 
E
G
 
N
K
 
K
D
 
D
V
 
I
K
 
T
G
 
N
V
 
K
P
 
E
P
 
P
E
 
A
R
 
E
L
 
L
V
 
Y
R
 
H
D
 
Y
G
 
G
L
 
I
F
 
V
H
 
R
V
 
T
M
 
F
E
 
Q
G
 
T
R
 
P
R
 
Q
V
 
P
F
 
L
E
 
K
D
 
E
L
 
M
T
 
T
V
 
V
E
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
I
 
L
A
 
I
A
 
G
T
 
E
Y
 
I
A
 
C
L
 
-
S
 
P
G
 
G
S
 
E
K
 
S
P
 
P
S
 
L
L
 
N
S
 
S
D
 
L
S
 
F
Y
 
Y
-
 
K
-
 
K
-
 
W
-
 
I
-
 
P
-
 
K
-
 
E
-
 
E
E
 
E
L
 
M
V
 
V
Y
 
E
N
 
K
Y
 
A
F
 
F
P
 
K
-
 
I
-
 
L
-
 
E
-
 
F
-
 
L
R
 
K
L
 
L
K
 
S
E
 
H
R
 
L
R
 
Y
K
 
D
Q
 
R
L
 
K
A
 
A
G
 
G
Y
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
M
Q
 
K
M
 
L
L
 
V
A
 
E
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
M
A
 
T
Q
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
M
I
 
I
M
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
I
L
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
G
L
 
L
V
 
A
E
 
H
E
 
D
I
 
I
F
 
F
T
 
N
I
 
H
V
 
V
A
 
L
R
 
E
I
 
L
N
 
-
R
 
K
E
 
A
Q
 
K
G
 
G
T
 
I
A
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
H
N
 
R
A
 
L
A
 
D
V
 
I
S
 
V
L
 
L
A
 
N
I
 
Y
A
 
I
S
 
D
Y
 
H
G
 
L
Y
 
Y
I
 
V
M
 
M
E
 
F
N
 
N
G
 
G
K
 
Q
I
 
I
V
 
I
I
 
A
D
 
E
G
 
G
P
 
R
A
 
G
D
 
E
K
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
L
 
V
T
 
L
A
 
S
N
 
D
E
 
P
D
 
K
V
 
V
Q
 
V
E
 
E
F
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
30% identity, 90% coverage: 4:244/269 of query aligns to 4:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
L
 
I
L
 
L
E
 
R
I
 
T
D
 
E
N
 
N
I
 
I
E
 
-
V
 
V
V
 
K
Y
 
Y
N
x
F
K
 
G
S
 
E
V
x
F
Q
 
K
V
 
A
L
 
L
R
 
D
G
 
G
L
 
V
S
 
S
L
 
I
R
 
S
V
 
V
P
 
C
K
 
K
G
 
G
A
 
D
I
 
V
V
 
T
A
 
L
L
 
I
L
 
I
G
 
G
S
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
L
L
 
I
K
 
N
S
 
V
V
 
I
S
 
T
G
 
G
L
 
F
L
 
L
T
 
K
L
 
A
E
 
D
D
 
E
G
 
G
E
 
R
V
 
V
T
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
Y
F
 
F
R
 
E
G
 
N
K
 
K
D
 
D
V
 
I
K
 
T
G
 
N
V
 
K
P
 
E
P
 
P
E
 
A
R
 
E
L
 
L
V
 
Y
R
 
H
D
 
Y
G
 
G
L
 
I
F
 
V
H
 
R
V
 
T
M
 
F
E
 
Q
G
 
T
R
 
P
R
 
Q
V
 
P
F
 
L
E
 
K
D
 
E
L
 
M
T
 
T
V
 
V
E
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
I
 
L
A
 
I
A
 
G
T
 
E
Y
 
I
A
 
N
L
 
-
S
 
P
G
 
G
S
 
E
K
 
S
P
 
P
S
 
L
L
 
N
S
 
S
D
 
L
S
 
F
Y
 
Y
-
 
K
-
 
K
-
 
W
-
 
I
-
 
P
-
 
K
-
 
E
-
 
E
E
 
E
L
 
M
V
 
V
Y
 
E
N
 
K
Y
 
A
F
 
F
P
 
K
-
 
I
-
 
L
-
 
E
-
 
F
-
 
L
R
 
K
L
 
L
K
 
S
E
 
H
R
 
L
R
 
Y
K
 
D
Q
 
R
L
 
K
A
 
A
G
 
G
Y
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
M
Q
 
K
M
 
L
L
 
V
A
 
E
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
M
A
 
T
Q
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
M
I
 
I
M
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
S
 
I
L
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
G
L
 
L
V
 
A
E
 
H
E
 
D
I
 
I
F
 
F
T
 
N
I
 
H
V
 
V
A
 
L
R
 
E
I
 
L
N
 
-
R
 
K
E
 
A
Q
 
K
G
 
G
T
 
I
A
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
H
N
 
R
A
 
L
A
 
D
V
 
I
S
 
V
L
 
L
A
 
N
I
 
Y
A
 
I
S
 
D
Y
 
H
G
 
L
Y
 
Y
I
 
V
M
 
M
E
 
F
N
 
N
G
 
G
K
 
Q
I
 
I
V
 
I
I
 
A
D
 
E
G
 
G
P
 
R
A
 
G
D
 
E
K
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
L
 
V
T
 
L
A
 
S
N
 
D
E
 
P
D
 
K
V
 
V
Q
 
V
E
 
E
F
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
31% identity, 90% coverage: 3:244/269 of query aligns to 1:235/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
A
 
A
L
 
T
L
 
L
E
 
T
I
 
A
D
 
K
N
 
N
I
 
L
E
 
A
V
 
K
V
 
A
Y
 
Y
N
 
-
K
 
K
S
 
G
V
 
R
Q
 
R
V
 
V
L
 
V
R
 
E
G
 
D
L
 
V
S
 
S
L
 
L
R
 
T
V
 
V
P
 
N
K
 
S
G
 
G
A
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
T
 
T
L
 
F
K
 
Y
S
 
M
V
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
V
T
 
P
L
 
R
E
 
D
D
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
A
G
 
G
E
 
N
V
 
I
R
 
I
F
 
I
R
 
D
G
 
D
K
 
D
D
 
D
V
 
I
K
 
S
G
 
L
V
 
L
P
 
P
P
 
L
E
 
H
R
 
A
L
 
R
V
 
A
R
 
R
D
 
R
G
 
G
L
 
I
F
 
G
H
 
Y
V
 
L
M
 
P
E
 
Q
G
 
E
R
 
A
R
 
S
V
 
I
F
 
F
E
x
R
D
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
E
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
I
 
M
A
 
A
A
 
V
T
 
L
Y
 
Q
A
 
I
L
 
R
S
 
D
G
 
D
-
 
L
S
 
S
K
 
A
P
 
E
S
 
Q
L
 
R
S
 
E
D
 
D
S
 
R
Y
 
A
E
 
N
L
 
E
V
 
L
Y
 
M
N
 
E
Y
 
E
F
 
F
P
 
-
R
 
H
L
 
I
K
 
E
E
 
H
R
 
L
R
 
R
K
 
D
Q
 
S
L
x
M
A
x
G
G
x
Q
Y
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
Q
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
F
I
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
D
P
 
P
L
 
I
L
 
S
V
 
V
E
 
I
E
 
D
I
 
I
F
 
K
T
 
R
I
 
I
V
 
I
A
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
Q
 
S
G
 
G
T
 
L
A
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
A
 
V
A
 
R
V
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
C
S
 
E
Y
 
R
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
M
 
V
E
 
S
N
 
Q
G
 
G
K
 
H
I
 
L
V
 
I
I
 
A
D
 
H
G
 
G
P
 
T
A
 
P
D
 
T
K
 
E
L
 
I
T
 
L
A
 
Q
N
 
D
E
 
E
D
 
H
V
 
V
Q
 
K
E
 
R
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6s8gA Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with amp-pnp (see paper)
31% identity, 90% coverage: 3:244/269 of query aligns to 1:235/238 of 6s8gA

query
sites
6s8gA
A
 
A
L
 
T
L
 
L
E
 
T
I
 
A
D
 
K
N
 
N
I
 
L
E
 
A
V
 
K
V
 
A
Y
|
Y
N
 
-
K
 
K
S
 
G
V
x
R
Q
 
R
V
 
V
L
 
V
R
 
E
G
 
D
L
 
V
S
 
S
L
 
L
R
 
T
V
 
V
P
 
N
K
 
S
G
 
G
A
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
L
 
F
K
 
Y
S
 
M
V
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
V
T
 
P
L
 
R
E
 
D
D
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
A
G
 
G
E
 
N
V
 
I
R
 
I
F
 
I
R
 
D
G
 
D
K
 
D
D
 
D
V
 
I
K
 
S
G
 
L
V
 
L
P
 
P
P
 
L
E
 
H
R
 
A
L
 
R
V
 
A
R
 
R
D
 
R
G
 
G
L
 
I
F
 
G
H
 
Y
V
 
L
M
 
P
E
x
Q
G
 
E
R
 
A
R
 
S
V
 
I
F
 
F
E
 
R
D
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
E
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
I
 
M
A
 
A
A
 
V
T
 
L
Y
 
Q
A
 
I
L
 
R
S
 
D
G
 
D
-
 
L
S
 
S
K
 
A
P
 
E
S
 
Q
L
 
R
S
 
E
D
 
D
S
 
R
Y
 
A
E
 
N
L
 
E
V
 
L
Y
 
M
N
 
E
Y
 
E
F
 
F
P
 
-
R
 
H
L
 
I
K
 
E
E
 
H
R
 
L
R
 
R
K
 
D
Q
 
S
L
 
M
A
 
G
G
 
Q
Y
x
S
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
|
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
Q
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
F
I
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
D
P
 
P
L
 
I
L
 
S
V
 
V
E
 
I
E
 
D
I
 
I
F
 
K
T
 
R
I
 
I
V
 
I
A
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
Q
 
S
G
 
G
T
 
L
A
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
A
 
V
A
 
R
V
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
C
S
 
E
Y
 
R
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
M
 
V
E
 
S
N
 
Q
G
 
G
K
 
H
I
 
L
V
 
I
I
 
A
D
 
H
G
 
G
P
 
T
A
 
P
D
 
T
K
 
E
L
 
I
T
 
L
A
 
Q
N
 
D
E
 
E
D
 
H
V
 
V
Q
 
K
E
 
R
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6mhzA Vanadate trapped cryo-em structure of e.Coli lptb2fg transporter (see paper)
31% identity, 90% coverage: 3:244/269 of query aligns to 1:235/235 of 6mhzA

query
sites
6mhzA
A
 
A
L
 
T
L
 
L
E
 
T
I
 
A
D
 
K
N
 
N
I
 
L
E
 
A
V
 
K
V
 
A
Y
|
Y
N
 
-
K
 
K
S
 
G
V
 
R
Q
 
R
V
 
V
L
 
V
R
 
E
G
 
D
L
 
V
S
 
S
L
 
L
R
 
T
V
 
V
P
 
N
K
 
S
G
 
G
A
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
L
 
F
K
 
Y
S
 
M
V
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
V
T
 
P
L
 
R
E
 
D
D
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
A
G
 
G
E
 
N
V
 
I
R
 
I
F
 
I
R
 
D
G
 
D
K
 
D
D
 
D
V
 
I
K
 
S
G
 
L
V
 
L
P
 
P
P
 
L
E
 
H
R
 
A
L
 
R
V
 
A
R
 
R
D
 
R
G
 
G
L
 
I
F
 
G
H
 
Y
V
 
L
M
 
P
E
x
Q
G
 
E
R
 
A
R
 
S
V
 
I
F
 
F
E
 
R
D
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
E
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
I
 
M
A
 
A
A
 
V
T
 
L
Y
 
Q
A
 
I
L
 
R
S
 
D
G
 
D
-
 
L
S
 
S
K
 
A
P
 
E
S
 
Q
L
 
R
S
 
E
D
 
D
S
 
R
Y
 
A
E
 
N
L
 
E
V
 
L
Y
 
M
N
 
E
Y
 
E
F
 
F
P
 
-
R
 
H
L
 
I
K
 
E
E
 
H
R
 
L
R
 
R
K
 
D
Q
 
S
L
 
M
A
 
G
G
 
Q
Y
x
S
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
Q
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
F
I
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
|
G
L
 
V
A
 
D
P
 
P
L
 
I
L
 
S
V
 
V
E
 
I
E
 
D
I
 
I
F
 
K
T
 
R
I
 
I
V
 
I
A
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
Q
 
S
G
 
G
T
 
L
A
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
x
H
N
 
N
A
 
V
A
 
R
V
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
C
S
 
E
Y
 
R
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
M
 
V
E
 
S
N
 
Q
G
 
G
K
 
H
I
 
L
V
 
I
I
 
A
D
 
H
G
 
G
P
 
T
A
 
P
D
 
T
K
 
E
L
 
I
T
 
L
A
 
Q
N
 
D
E
 
E
D
 
H
V
 
V
Q
 
K
E
 
R
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6mbnA Lptb e163q in complex with atp (see paper)
30% identity, 90% coverage: 3:244/269 of query aligns to 2:236/241 of 6mbnA

query
sites
6mbnA
A
 
A
L
 
T
L
 
L
E
 
T
I
 
A
D
 
K
N
 
N
I
 
L
E
 
A
V
 
K
V
 
A
Y
|
Y
N
 
-
K
 
K
S
 
G
V
x
R
Q
 
R
V
|
V
L
 
V
R
 
E
G
 
D
L
 
V
S
 
S
L
 
L
R
 
T
V
 
V
P
 
N
K
 
S
G
 
G
A
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
L
 
F
K
 
Y
S
 
M
V
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
V
T
 
P
L
 
R
E
 
D
D
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
A
G
 
G
E
 
N
V
 
I
R
 
I
F
 
I
R
 
D
G
 
D
K
 
D
D
 
D
V
 
I
K
 
S
G
 
L
V
 
L
P
 
P
P
 
L
E
 
H
R
 
A
L
 
R
V
 
A
R
 
R
D
 
R
G
 
G
L
 
I
F
 
G
H
 
Y
V
 
L
M
 
P
E
 
Q
G
 
E
R
 
A
R
 
S
V
 
I
F
 
F
E
 
R
D
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
E
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
I
 
M
A
 
A
A
 
V
T
 
L
Y
 
Q
A
 
I
L
 
R
S
 
D
G
 
D
-
 
L
S
 
S
K
 
A
P
 
E
S
 
Q
L
 
R
S
 
E
D
 
D
S
 
R
Y
 
A
E
 
N
L
 
E
V
 
L
Y
 
M
N
 
E
Y
 
E
F
 
F
P
 
-
R
 
H
L
 
I
K
 
E
E
 
H
R
 
L
R
 
R
K
 
D
Q
 
S
L
 
M
A
 
G
G
 
Q
Y
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
Q
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
F
I
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
D
P
 
P
L
 
I
L
 
S
V
 
V
E
 
I
E
 
D
I
 
I
F
 
K
T
 
R
I
 
I
V
 
I
A
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
Q
 
S
G
 
G
T
 
L
A
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
x
H
N
 
N
A
 
V
A
 
R
V
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
C
S
 
E
Y
 
R
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
M
 
V
E
 
S
N
 
Q
G
 
G
K
 
H
I
 
L
V
 
I
I
 
A
D
 
H
G
 
G
P
 
T
A
 
P
D
 
T
K
 
E
L
 
I
T
 
L
A
 
Q
N
 
D
E
 
E
D
 
H
V
 
V
Q
 
K
E
 
R
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6b89A E. Coli lptb in complex with adp and novobiocin (see paper)
31% identity, 90% coverage: 3:243/269 of query aligns to 1:234/234 of 6b89A

query
sites
6b89A
A
 
A
L
 
T
L
 
L
E
 
T
I
 
A
D
 
K
N
 
N
I
 
L
E
 
A
V
 
K
V
 
A
Y
|
Y
N
 
-
K
 
K
S
 
G
V
x
R
Q
 
R
V
|
V
L
 
V
R
 
E
G
 
D
L
 
V
S
 
S
L
 
L
R
 
T
V
 
V
P
 
N
K
 
S
G
 
G
A
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
L
 
F
K
 
Y
S
 
M
V
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
V
T
 
P
L
 
R
E
 
D
D
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
A
G
 
G
E
 
N
V
 
I
R
 
I
F
 
I
R
 
D
G
 
D
K
 
D
D
 
D
V
 
I
K
 
S
G
 
L
V
 
L
P
 
P
P
x
L
E
x
H
R
 
A
L
 
R
V
 
A
R
 
R
D
 
R
G
 
G
L
 
I
F
 
G
H
 
Y
V
 
L
M
x
P
E
x
Q
G
 
E
R
x
A
R
x
S
V
 
I
F
|
F
E
x
R
D
x
R
L
|
L
T
 
S
V
 
V
E
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
I
 
M
A
 
A
A
x
V
T
 
L
Y
 
Q
A
 
I
L
 
R
S
 
D
G
 
D
-
 
L
S
 
S
K
 
A
P
 
E
S
 
Q
L
 
R
S
 
E
D
 
D
S
 
R
Y
 
A
E
 
N
L
 
E
V
 
L
Y
 
M
N
 
E
Y
 
E
F
 
F
P
 
-
R
 
H
L
 
I
K
 
E
E
 
H
R
 
L
R
 
R
K
 
D
Q
 
S
L
 
M
A
 
G
G
x
Q
Y
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
L
 
I
G
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
Q
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
F
I
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
D
P
 
P
L
 
I
L
 
S
V
 
V
E
 
I
E
 
D
I
 
I
F
 
K
T
 
R
I
 
I
V
 
I
A
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
Q
 
S
G
 
G
T
 
L
A
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
A
 
V
A
 
R
V
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
C
S
 
E
Y
 
R
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
M
 
V
E
 
S
N
 
Q
G
 
G
K
 
H
I
 
L
V
 
I
I
 
A
D
 
H
G
 
G
P
 
T
A
 
P
D
 
T
K
 
E
L
 
I
T
 
L
A
 
Q
N
 
D
E
 
E
D
 
H
V
 
V
Q
 
K
E
 
R
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L

4p31A Crystal structure of a selenomethionine derivative of e. Coli lptb in complex with adp-magensium (see paper)
31% identity, 90% coverage: 3:243/269 of query aligns to 1:234/234 of 4p31A

query
sites
4p31A
A
 
A
L
 
T
L
 
L
E
 
T
I
 
A
D
 
K
N
 
N
I
 
L
E
 
A
V
 
K
V
 
A
Y
|
Y
N
 
-
K
 
K
S
 
G
V
x
R
Q
 
R
V
|
V
L
 
V
R
 
E
G
 
D
L
 
V
S
 
S
L
 
L
R
 
T
V
 
V
P
 
N
K
 
S
G
 
G
A
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
L
 
F
K
 
Y
S
 
M
V
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
V
T
 
P
L
 
R
E
 
D
D
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
A
G
 
G
E
 
N
V
 
I
R
 
I
F
 
I
R
 
D
G
 
D
K
 
D
D
 
D
V
 
I
K
 
S
G
 
L
V
 
L
P
 
P
P
 
L
E
 
H
R
 
A
L
 
R
V
 
A
R
 
R
D
 
R
G
 
G
L
 
I
F
 
G
H
 
Y
V
 
L
M
 
P
E
x
Q
G
 
E
R
 
A
R
 
S
V
 
I
F
 
F
E
 
R
D
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
E
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
I
 
M
A
 
A
A
 
V
T
 
L
Y
 
Q
A
 
I
L
 
R
S
 
D
G
 
D
-
 
L
S
 
S
K
 
A
P
 
E
S
 
Q
L
 
R
S
 
E
D
 
D
S
 
R
Y
 
A
E
 
N
L
 
E
V
 
L
Y
 
M
N
 
E
Y
 
E
F
 
F
P
 
-
R
 
H
L
 
I
K
 
E
E
 
H
R
 
L
R
 
R
K
 
D
Q
 
S
L
 
M
A
 
G
G
 
Q
Y
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
Q
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
F
I
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
D
P
 
P
L
 
I
L
 
S
V
 
V
E
 
I
E
 
D
I
 
I
F
 
K
T
 
R
I
 
I
V
 
I
A
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
Q
 
S
G
 
G
T
 
L
A
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
A
 
V
A
 
R
V
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
C
S
 
E
Y
 
R
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
M
 
V
E
 
S
N
 
Q
G
 
G
K
 
H
I
 
L
V
 
I
I
 
A
D
 
H
G
 
G
P
 
T
A
 
P
D
 
T
K
 
E
L
 
I
T
 
L
A
 
Q
N
 
D
E
 
E
D
 
H
V
 
V
Q
 
K
E
 
R
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L

6b8bA E. Coli lptb in complex with adp and a novobiocin derivative (see paper)
30% identity, 89% coverage: 3:242/269 of query aligns to 1:233/233 of 6b8bA

query
sites
6b8bA
A
 
A
L
 
T
L
 
L
E
 
T
I
 
A
D
 
K
N
 
N
I
 
L
E
 
A
V
 
K
V
 
A
Y
|
Y
N
 
-
K
 
K
S
 
G
V
x
R
Q
 
R
V
|
V
L
 
V
R
 
E
G
 
D
L
 
V
S
 
S
L
 
L
R
 
T
V
 
V
P
 
N
K
 
S
G
 
G
A
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
L
 
F
K
 
Y
S
 
M
V
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
V
T
 
P
L
 
R
E
 
D
D
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
A
G
 
G
E
 
N
V
 
I
R
 
I
F
 
I
R
 
D
G
 
D
K
 
D
D
 
D
V
 
I
K
 
S
G
 
L
V
 
L
P
 
P
P
 
L
E
 
H
R
 
A
L
 
R
V
 
A
R
 
R
D
 
R
G
 
G
L
 
I
F
 
G
H
 
Y
V
 
L
M
 
P
E
 
Q
G
 
E
R
 
A
R
 
S
V
 
I
F
|
F
E
x
R
D
x
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
E
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
I
 
M
A
 
A
A
 
V
T
 
L
Y
 
Q
A
 
I
L
 
R
S
 
D
G
 
D
-
 
L
S
 
S
K
 
A
P
 
E
S
 
Q
L
 
R
S
 
E
D
 
D
S
 
R
Y
 
A
E
 
N
L
 
E
V
 
L
Y
 
M
N
 
E
Y
 
E
F
 
F
P
 
-
R
 
H
L
 
I
K
 
E
E
 
H
R
 
L
R
 
R
K
 
D
Q
 
S
L
 
M
A
 
G
G
 
Q
Y
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
Q
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
F
I
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
D
P
 
P
L
 
I
L
 
S
V
 
V
E
 
I
E
 
D
I
 
I
F
 
K
T
 
R
I
 
I
V
 
I
A
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
Q
 
S
G
 
G
T
 
L
A
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
A
 
V
A
 
R
V
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
C
S
 
E
Y
 
R
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
M
 
V
E
 
S
N
 
Q
G
 
G
K
 
H
I
 
L
V
 
I
I
 
A
D
 
H
G
 
G
P
 
T
A
 
P
D
 
T
K
 
E
L
 
I
T
 
L
A
 
Q
N
 
D
E
 
E
D
 
H
V
 
V
Q
 
K
E
 
R
F
 
V
Y
 
Y

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
30% identity, 84% coverage: 17:241/269 of query aligns to 13:235/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
S
 
S
V
 
L
Q
 
E
V
|
V
L
 
L
R
 
K
G
 
G
L
 
V
S
 
T
L
 
L
R
 
K
V
 
V
P
 
N
K
 
K
G
 
G
A
 
E
I
 
V
V
 
V
A
 
V
L
 
I
L
 
I
G
 
G
S
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
C
V
 
I
S
 
N
G
 
L
L
 
L
L
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
E
E
 
E
V
 
P
T
 
T
A
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
V
R
 
F
F
 
I
R
 
D
G
 
G
K
 
V
D
 
K
V
 
I
K
 
N
-
 
N
G
 
G
V
 
K
P
 
V
P
 
N
E
 
I
R
 
N
L
 
K
V
 
V
R
 
R
D
 
Q
G
 
K
L
 
V
F
 
G
H
 
M
V
 
V
M
 
F
E
 
Q
G
 
H
R
 
F
R
 
N
V
 
L
F
 
F
E
 
P
D
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
A
E
 
I
E
 
E
N
 
N
L
 
I
I
 
T
A
 
L
A
 
A
T
 
P
Y
 
V
A
 
K
L
 
V
S
 
K
G
 
-
S
 
-
K
 
K
P
 
M
S
 
N
L
 
K
S
 
K
D
 
E
S
 
A
Y
 
E
E
 
E
L
 
L
V
 
A
Y
 
V
N
 
D
Y
 
L
F
 
L
P
 
A
R
 
K
-
 
V
-
 
G
L
 
L
K
 
L
E
 
D
R
 
K
R
 
K
K
 
D
Q
 
Q
L
 
Y
A
 
P
G
 
I
Y
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
M
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
M
Q
 
Q
P
 
P
D
 
E
L
 
V
I
 
M
M
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
S
 
T
L
 
S
G
 
A
L
 
L
A
 
D
P
 
P
L
 
E
L
 
M
V
 
V
E
 
K
E
 
E
I
 
V
F
 
L
T
 
N
I
 
V
V
 
M
A
 
K
R
 
Q
I
 
L
N
 
A
R
 
N
E
 
E
Q
 
-
G
 
G
T
 
M
A
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
Q
x
H
N
 
E
A
 
M
A
 
G
V
 
F
S
 
A
L
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
G
S
 
D
Y
 
R
G
 
V
Y
 
I
I
 
F
M
 
M
E
 
D
N
 
D
G
 
G
K
 
V
I
 
I
V
 
V
I
 
E
D
 
E
G
 
G
P
 
T
A
 
P
D
 
E
K
 
E
L
 
I
-
 
F
-
 
Y
-
 
R
T
 
A
A
 
K
N
 
N
E
 
E
D
 
R
V
 
T
Q
 
R
E
 
E
F
 
F

Sites not aligning to the query:

6z67B Ftse structure of streptococcus pneumoniae in complex with amppnp at 2.4 a resolution (see paper)
28% identity, 83% coverage: 3:226/269 of query aligns to 2:220/229 of 6z67B

query
sites
6z67B
A
 
S
L
 
I
L
 
I
E
 
E
I
 
M
D
 
R
N
 
D
I
 
V
E
 
V
V
 
K
V
 
K
Y
|
Y
N
 
D
K
 
N
S
x
G
V
 
T
Q
 
T
V
x
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
V
S
 
S
L
 
V
R
 
S
V
 
V
P
 
Q
K
 
P
G
 
G
A
 
E
I
 
F
V
 
A
A
 
Y
L
 
I
L
 
V
G
 
G
S
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
F
L
 
I
K
 
R
S
 
S
V
 
L
S
 
Y
G
 
R
L
 
E
L
 
V
T
 
K
L
 
I
E
 
D
D
 
K
G
 
G
E
 
S
V
 
L
T
 
S
A
 
V
G
 
A
E
 
G
V
 
F
R
 
N
F
 
L
R
 
V
G
 
K
K
 
I
D
 
K
V
 
K
K
 
K
G
 
D
V
 
V
P
 
P
P
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
L
V
 
L
R
 
R
D
 
R
G
 
S
L
 
V
F
 
G
H
 
V
V
 
V
M
 
F
E
 
Q
G
 
D
R
 
Y
R
 
K
V
 
L
F
 
L
E
 
P
D
 
K
L
 
K
T
 
T
V
 
V
E
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
I
I
 
A
A
 
Y
A
 
A
T
 
M
Y
 
E
A
 
V
L
 
I
S
 
G
G
 
E
S
 
N
K
 
R
P
 
R
S
 
N
L
 
I
S
 
K
D
 
R
S
 
R
Y
 
V
E
 
M
L
 
E
V
 
V
Y
 
L
N
 
D
Y
 
L
F
 
V
P
 
G
R
 
-
L
 
L
K
 
K
E
 
H
R
 
K
R
 
V
K
 
R
Q
 
S
L
 
F
A
 
P
G
 
N
Y
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
L
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
I
 
V
A
 
N
Q
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
V
I
 
L
M
 
I
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
T
L
 
G
G
 
N
L
 
L
A
 
D
P
 
P
L
 
D
L
 
N
V
 
S
E
 
W
E
 
E
I
 
I
F
 
M
T
 
N
I
 
L
V
 
L
A
 
E
R
 
R
I
 
I
N
 
N
R
 
L
E
 
-
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
M
V
 
A
E
 
T
Q
 
H
N
 
N
A
 
S
A
 
Q
V
 
I
S
 
V
L
 
N
A
 
T
I
 
L
A
 
R
S
 
H
Y
 
R
G
 
V
Y
 
I
I
 
A
M
 
I
E
 
E
N
 
N
G
 
G
K
 
R
I
 
V
V
 
V
I
 
R
D
 
D

6z4wA Ftse structure from streptococcus pneumoniae in complex with adp (space group p 1) (see paper)
28% identity, 83% coverage: 3:226/269 of query aligns to 2:220/230 of 6z4wA

query
sites
6z4wA
A
 
S
L
 
I
L
 
I
E
 
E
I
 
M
D
 
R
N
 
D
I
 
V
E
 
V
V
 
K
V
 
K
Y
|
Y
N
 
D
K
 
N
S
 
G
V
x
T
Q
 
T
V
x
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
V
S
 
S
L
 
V
R
 
S
V
 
V
P
 
Q
K
 
P
G
 
G
A
 
E
I
 
F
V
 
A
A
 
Y
L
 
I
L
 
V
G
 
G
S
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
F
L
 
I
K
 
R
S
 
S
V
 
L
S
 
Y
G
 
R
L
 
E
L
 
V
T
 
K
L
 
I
E
 
D
D
 
K
G
 
G
E
 
S
V
 
L
T
 
S
A
 
V
G
 
A
E
 
G
V
 
F
R
 
N
F
 
L
R
 
V
G
 
K
K
 
I
D
 
K
V
 
K
K
 
K
G
 
D
V
 
V
P
 
P
P
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
L
V
 
L
R
 
R
D
 
R
G
 
S
L
 
V
F
 
G
H
 
V
V
 
V
M
 
F
E
 
Q
G
 
D
R
 
Y
R
 
K
V
 
L
F
 
L
E
 
P
D
 
K
L
 
K
T
 
T
V
 
V
E
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
I
I
 
A
A
 
Y
A
 
A
T
 
M
Y
 
E
A
 
V
L
 
I
S
 
G
G
 
E
S
 
N
K
 
R
P
 
R
S
 
N
L
 
I
S
 
K
D
 
R
S
 
R
Y
 
V
E
 
M
L
 
E
V
 
V
Y
 
L
N
 
D
Y
 
L
F
 
V
P
 
G
R
 
-
L
 
L
K
 
K
E
 
H
R
 
K
R
 
V
K
 
R
Q
 
S
L
 
F
A
 
P
G
 
N
Y
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
L
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
I
 
V
A
 
N
Q
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
V
I
 
L
M
 
I
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
T
L
 
G
G
 
N
L
 
L
A
 
D
P
 
P
L
 
D
L
 
N
V
 
S
E
 
W
E
 
E
I
 
I
F
 
M
T
 
N
I
 
L
V
 
L
A
 
E
R
 
R
I
 
I
N
 
N
R
 
L
E
 
-
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
M
V
 
A
E
 
T
Q
 
H
N
 
N
A
 
S
A
 
Q
V
 
I
S
 
V
L
 
N
A
 
T
I
 
L
A
 
R
S
 
H
Y
 
R
G
 
V
Y
 
I
I
 
A
M
 
I
E
 
E
N
 
N
G
 
G
K
 
R
I
 
V
V
 
V
I
 
R
D
 
D

6xgyA Crystal structure of e. Coli mlafb abc transport subunits in the dimeric state (see paper)
29% identity, 84% coverage: 20:245/269 of query aligns to 19:243/264 of 6xgyA

query
sites
6xgyA
V
 
I
L
 
F
R
 
D
G
 
N
L
 
I
S
 
S
L
 
L
R
 
T
V
 
V
P
 
P
K
 
R
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
M
G
 
G
S
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
I
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
L
V
 
I
S
 
G
G
 
G
L
 
Q
L
 
I
T
 
A
L
 
P
E
 
D
D
 
H
G
 
G
E
 
E
V
 
I
T
 
L
A
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
F
R
 
D
G
 
G
K
 
E
D
 
N
V
 
I
K
 
P
G
 
A
V
 
M
P
 
S
P
 
R
E
 
S
R
 
R
L
 
L
-
 
Y
-
 
T
V
 
V
R
 
R
D
 
K
G
 
R
L
 
M
F
 
S
H
 
M
V
 
L
M
 
F
E
 
Q
G
 
S
R
 
G
R
 
A
V
 
L
F
 
F
E
 
T
D
 
D
L
 
M
T
 
N
V
 
V
E
 
F
E
 
D
N
 
N
L
 
V
I
 
A
A
 
Y
A
 
P
T
 
L
Y
 
R
A
 
E
L
 
H
S
 
T
G
 
Q
S
 
L
K
 
P
P
 
A
S
 
P
L
 
L
S
 
L
D
 
H
S
 
S
Y
 
T
E
 
V
L
 
M
V
 
M
Y
 
K
N
 
L
Y
 
E
F
 
A
P
 
V
R
 
G
L
 
L
K
 
R
E
 
G
R
 
A
R
 
A
K
 
K
Q
 
L
L
 
M
A
 
P
G
 
S
Y
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
M
Q
 
A
Q
 
R
M
 
R
L
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
I
 
A
A
 
L
Q
 
E
P
 
P
D
 
D
L
 
L
I
 
I
M
 
M
L
 
F
D
|
D
E
|
E
P
 
P
S
 
F
L
 
V
G
 
G
L
 
Q
A
 
D
P
 
P
L
 
I
L
 
T
V
 
M
E
 
G
E
 
V
I
 
L
F
 
V
T
 
K
I
 
L
V
 
I
A
 
S
R
 
E
I
 
L
N
 
N
R
 
S
E
 
A
Q
 
L
G
 
G
T
 
V
A
 
T
I
 
C
L
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
S
Q
 
H
N
 
D
A
 
V
A
 
P
V
 
E
S
 
V
L
 
L
A
 
S
I
 
I
A
 
A
S
 
D
Y
 
H
G
 
A
Y
 
W
I
 
I
M
 
L
E
 
A
N
 
D
G
 
K
K
 
K
I
 
I
V
 
V
I
 
A
D
 
H
G
 
G
P
 
S
A
 
A
D
 
Q
K
 
A
L
 
L
T
 
Q
A
 
A
N
 
N
E
 
P
D
 
D
-
 
P
-
 
R
V
 
V
Q
 
R
E
 
Q
F
 
F
Y
 
L
L
 
D
G
 
G
V
 
I

Sites not aligning to the query:

7ch6C Cryo-em structure of e.Coli mlafeb with amppnp (see paper)
29% identity, 84% coverage: 20:245/269 of query aligns to 19:243/265 of 7ch6C

query
sites
7ch6C
V
 
I
L
 
F
R
 
D
G
 
N
L
 
I
S
 
S
L
 
L
R
 
T
V
 
V
P
 
P
K
 
R
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
M
G
 
G
S
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
I
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
 
T
T
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
L
V
 
I
S
 
G
G
 
G
L
 
Q
L
 
I
T
 
A
L
 
P
E
 
D
D
 
H
G
 
G
E
 
E
V
 
I
T
 
L
A
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
F
R
 
D
G
 
G
K
 
E
D
 
N
V
 
I
K
 
P
G
 
A
V
 
M
P
 
S
P
 
R
E
 
S
R
 
R
L
 
L
-
 
Y
-
 
T
V
 
V
R
 
R
D
 
K
G
 
R
L
 
M
F
 
S
H
 
M
V
 
L
M
 
F
E
 
Q
G
 
S
R
 
G
R
 
A
V
 
L
F
 
F
E
 
T
D
 
D
L
 
M
T
 
N
V
 
V
E
 
F
E
 
D
N
 
N
L
 
V
I
 
A
A
 
Y
A
 
P
T
 
L
Y
 
R
A
 
E
L
 
H
S
 
T
G
 
Q
S
 
L
K
 
P
P
 
A
S
 
P
L
 
L
S
 
L
D
 
H
S
 
S
Y
 
T
E
 
V
L
 
M
V
 
M
Y
 
K
N
 
L
Y
 
E
F
 
A
P
 
V
R
 
G
L
 
L
K
 
R
E
 
G
R
 
A
R
 
A
K
 
K
Q
 
L
L
 
M
A
 
P
G
 
S
Y
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
M
Q
 
A
Q
 
R
M
 
R
L
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
I
 
A
A
 
L
Q
 
E
P
 
P
D
 
D
L
 
L
I
 
I
M
 
M
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
S
 
F
L
 
V
G
 
G
L
 
Q
A
 
D
P
 
P
L
 
I
L
 
T
V
 
M
E
 
G
E
 
V
I
 
L
F
 
V
T
 
K
I
 
L
V
 
I
A
 
S
R
 
E
I
 
L
N
 
N
R
 
S
E
 
A
Q
 
L
G
 
G
T
 
V
A
 
T
I
 
C
L
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
S
Q
 
H
N
 
D
A
 
V
A
 
P
V
 
E
S
 
V
L
 
L
A
 
S
I
 
I
A
 
A
S
 
D
Y
 
H
G
 
A
Y
 
W
I
 
I
M
 
L
E
 
A
N
 
D
G
 
K
K
 
K
I
 
I
V
 
V
I
 
A
D
 
H
G
 
G
P
 
S
A
 
A
D
 
Q
K
 
A
L
 
L
T
 
Q
A
 
A
N
 
N
E
 
P
D
 
D
-
 
P
-
 
R
V
 
V
Q
 
R
E
 
Q
F
 
F
Y
 
L
L
 
D
G
 
G
V
 
I

Sites not aligning to the query:

7cgnB The overall structure of the mlafedb complex in atp-bound eqtall conformation (mutation of e170q on mlaf) (see paper)
29% identity, 84% coverage: 20:246/269 of query aligns to 19:244/263 of 7cgnB

query
sites
7cgnB
V
 
I
L
 
F
R
 
D
G
 
N
L
 
I
S
 
S
L
 
L
R
 
T
V
 
V
P
 
P
K
 
R
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
M
G
 
G
S
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
I
G
 
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
L
V
 
I
S
 
G
G
 
G
L
 
Q
L
 
I
T
 
A
L
 
P
E
 
D
D
 
H
G
 
G
E
 
E
V
 
I
T
 
L
A
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
F
R
 
D
G
 
G
K
 
E
D
 
N
V
 
I
K
 
P
G
 
A
V
 
M
P
 
S
P
 
R
E
 
S
R
 
R
L
 
L
-
 
Y
-
 
T
V
 
V
R
 
R
D
 
K
G
 
R
L
 
M
F
 
S
H
 
M
V
 
L
M
 
F
E
 
Q
G
 
S
R
 
G
R
 
A
V
 
L
F
 
F
E
 
T
D
 
D
L
 
M
T
 
N
V
 
V
E
 
F
E
 
D
N
 
N
L
 
V
I
 
A
A
 
Y
A
 
P
T
 
L
Y
 
R
A
 
E
L
 
H
S
 
T
G
 
Q
S
 
L
K
 
P
P
 
A
S
 
P
L
 
L
S
 
L
D
 
H
S
 
S
Y
 
T
E
 
V
L
 
M
V
 
M
Y
 
K
N
 
L
Y
 
E
F
 
A
P
 
V
R
 
G
L
 
L
K
 
R
E
 
G
R
 
A
R
 
A
K
 
K
Q
 
L
L
 
M
A
 
P
G
 
S
Y
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
M
Q
 
A
Q
 
R
M
 
R
L
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
I
 
A
A
 
L
Q
 
E
P
 
P
D
 
D
L
 
L
I
 
I
M
 
M
L
 
F
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
S
 
F
L
 
V
G
 
G
L
 
Q
A
 
D
P
 
P
L
 
I
L
 
T
V
 
M
E
 
G
E
 
V
I
 
L
F
 
V
T
 
K
I
 
L
V
 
I
A
 
S
R
 
E
I
 
L
N
 
N
R
 
S
E
 
A
Q
 
L
G
 
G
T
 
V
A
 
T
I
 
C
L
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
S
Q
 
H
N
 
D
A
 
V
A
 
P
V
 
E
S
 
V
L
 
L
A
 
S
I
 
I
A
 
A
S
 
D
Y
 
H
G
 
A
Y
 
W
I
 
I
M
 
L
E
 
A
N
 
D
G
 
K
K
 
K
I
 
I
V
 
V
I
 
A
D
 
H
G
 
G
P
 
S
A
 
A
D
 
Q
K
 
A
L
 
L
T
 
Q
A
 
A
N
 
N
E
 
P
D
 
D
-
 
P
-
 
R
V
 
V
Q
 
R
E
 
Q
F
 
F
Y
 
L
L
 
D
G
 
G
V
 
I
G
 
A

Sites not aligning to the query:

7mdyC Lolcde nucleotide-bound
33% identity, 75% coverage: 4:204/269 of query aligns to 2:202/226 of 7mdyC

query
sites
7mdyC
L
 
L
L
 
L
E
 
Q
I
 
C
D
 
D
N
 
N
I
 
L
E
 
C
V
 
K
V
 
R
Y
|
Y
N
 
Q
K
 
E
-
 
G
S
 
S
V
 
V
Q
 
Q
-
 
T
-
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
H
G
 
N
L
 
V
S
 
S
L
 
F
R
 
S
V
 
V
P
 
G
K
 
E
G
 
G
A
 
E
I
 
M
V
 
M
A
 
A
L
 
I
L
 
V
G
 
G
S
 
S
N
 
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
L
L
 
L
K
 
H
S
 
L
V
 
L
S
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
D
T
 
T
L
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
V
R
 
I
F
 
F
R
 
N
G
 
G
K
 
Q
-
 
P
-
 
M
-
 
S
D
 
K
V
 
L
K
 
S
G
 
S
V
 
A
P
 
A
P
 
K
E
 
A
R
 
E
L
 
L
V
 
R
R
 
N
D
 
Q
G
 
K
L
 
L
F
 
G
H
 
F
V
 
I
M
 
Y
E
x
Q
G
 
F
R
 
H
R
 
H
V
 
L
F
 
L
E
 
P
D
 
D
L
 
F
T
 
T
V
 
A
E
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
-
I
 
V
A
 
A
A
 
M
T
 
P
Y
 
L
A
 
L
L
 
I
S
 
G
G
 
K
S
 
K
K
 
K
P
 
P
S
 
A
L
 
E
S
 
I
D
 
N
S
 
S
Y
 
R
E
 
A
L
 
L
V
 
E
Y
 
M
N
 
L
Y
 
K
F
 
A
P
 
V
R
 
G
L
 
L
K
 
D
E
 
H
R
 
R
R
 
A
K
 
N
Q
x
H
L
 
R
A
 
P
G
 
S
Y
x
E
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
A
 
N
Q
 
N
P
 
P
D
 
R
L
 
L
I
 
V
M
 
L
L
 
A
D
 
D
E
|
E
P
 
P
S
 
T
L
 
G
G
x
N
L
 
L
A
 
D
P
 
A
L
 
R
L
 
N
V
 
A
E
 
D
E
 
S
I
 
I
F
 
F
T
 
Q
I
 
L
V
 
L
A
 
G
R
 
E
I
 
L
N
 
N
R
 
R
E
 
L
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
F
L
 
L
L
 
V
V
 
V
E
 
T
Q
x
H
N
 
D

P75957 Lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD; EC 7.6.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
33% identity, 75% coverage: 4:204/269 of query aligns to 5:205/233 of P75957

query
sites
P75957
L
 
L
L
 
L
E
 
Q
I
 
C
D
 
D
N
 
N
I
 
L
E
 
C
V
 
K
V
 
R
Y
 
Y
N
 
Q
K
 
E
-
 
G
S
 
S
V
 
V
Q
 
Q
-
 
T
-
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
H
G
 
N
L
 
V
S
 
S
L
 
F
R
 
S
V
 
V
P
 
G
K
 
E
G
 
G
A
 
E
I
 
M
V
 
M
A
 
A
L
 
I
L
 
V
G
|
G
S
 
S
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
T
 
L
L
 
L
K
 
H
S
 
L
V
 
L
S
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
D
T
 
T
L
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
V
R
 
I
F
 
F
R
 
N
G
 
G
K
 
Q
-
 
P
-
 
M
-
 
S
D
 
K
V
 
L
K
 
S
G
 
S
V
 
A
P
 
A
P
 
K
E
 
A
R
 
E
L
 
L
V
 
R
R
 
N
D
 
Q
G
 
K
L
 
L
F
 
G
H
 
F
V
 
I
M
 
Y
E
 
Q
G
 
F
R
 
H
R
 
H
V
 
L
F
 
L
E
 
P
D
 
D
L
 
F
T
 
T
V
 
A
E
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
-
I
 
V
A
 
A
A
 
M
T
 
P
Y
 
L
A
 
L
L
 
I
S
 
G
G
 
K
S
 
K
K
 
K
P
 
P
S
 
A
L
 
E
S
 
I
D
 
N
S
 
S
Y
 
R
E
 
A
L
 
L
V
 
E
Y
 
M
N
 
L
Y
 
K
F
 
A
P
 
V
R
 
G
L
 
L
K
 
D
E
 
H
R
 
R
R
 
A
K
 
N
Q
 
H
L
 
R
A
 
P
G
 
S
Y
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
A
 
N
Q
 
N
P
 
P
D
 
R
L
 
L
I
 
V
M
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
T
L
 
G
G
 
N
L
 
L
A
 
D
P
 
A
L
 
R
L
 
N
V
 
A
E
 
D
E
 
S
I
 
I
F
 
F
T
 
Q
I
 
L
V
 
L
A
 
G
R
 
E
I
 
L
N
 
N
R
 
R
E
 
L
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
F
L
 
L
L
 
V
V
 
V
E
 
T
Q
 
H
N
 
D

7arlD Lolcde in complex with lipoprotein and adp (see paper)
33% identity, 75% coverage: 4:204/269 of query aligns to 2:202/222 of 7arlD

query
sites
7arlD
L
 
L
L
 
L
E
 
Q
I
 
C
D
 
D
N
 
N
I
 
L
E
 
C
V
 
K
V
 
R
Y
 
Y
N
 
Q
K
 
E
-
 
G
S
 
S
V
 
V
Q
 
Q
-
 
T
-
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
H
G
 
N
L
 
V
S
 
S
L
 
F
R
 
S
V
 
V
P
 
G
K
 
E
G
 
G
A
 
E
I
 
M
V
 
M
A
 
A
L
 
I
L
 
V
G
 
G
S
 
S
N
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
T
 
L
L
 
L
K
 
H
S
 
L
V
 
L
S
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
D
T
 
T
L
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
V
R
 
I
F
 
F
R
 
N
G
 
G
K
 
Q
-
 
P
-
 
M
-
 
S
D
 
K
V
 
L
K
 
S
G
 
S
V
 
A
P
 
A
P
 
K
E
 
A
R
 
E
L
 
L
V
 
R
R
 
N
D
 
Q
G
 
K
L
 
L
F
 
G
H
 
F
V
 
I
M
 
Y
E
 
Q
G
 
F
R
 
H
R
 
H
V
 
L
F
 
L
E
 
P
D
 
D
L
 
F
T
 
T
V
 
A
E
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
-
I
 
V
A
 
A
A
 
M
T
 
P
Y
 
L
A
 
L
L
 
I
S
 
G
G
 
K
S
 
K
K
 
K
P
 
P
S
 
A
L
 
E
S
 
I
D
 
N
S
 
S
Y
 
R
E
 
A
L
 
L
V
 
E
Y
 
M
N
 
L
Y
 
K
F
 
A
P
 
V
R
 
G
L
 
L
K
 
D
E
 
H
R
 
R
R
 
A
K
 
N
Q
 
H
L
 
R
A
 
P
G
 
S
Y
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
A
 
N
Q
 
N
P
 
P
D
 
R
L
 
L
I
 
V
M
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
T
L
 
G
G
 
N
L
 
L
A
 
D
P
 
A
L
 
R
L
 
N
V
 
A
E
 
D
E
 
S
I
 
I
F
 
F
T
 
Q
I
 
L
V
 
L
A
 
G
R
 
E
I
 
L
N
 
N
R
 
R
E
 
L
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
F
L
 
L
L
 
V
V
 
V
E
 
T
Q
 
H
N
 
D

Query Sequence

>GFF4159 FitnessBrowser__Marino:GFF4159
MEALLEIDNIEVVYNKSVQVLRGLSLRVPKGAIVALLGSNGAGKSTTLKSVSGLLTLEDG
EVTAGEVRFRGKDVKGVPPERLVRDGLFHVMEGRRVFEDLTVEENLIAATYALSGSKPSL
SDSYELVYNYFPRLKERRKQLAGYLSGGEQQMLALGRALIAQPDLIMLDEPSLGLAPLLV
EEIFTIVARINREQGTAILLVEQNAAVSLAIASYGYIMENGKIVIDGPADKLTANEDVQE
FYLGVGGKEGEARSYRDIKHYKRRKRWLS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory