SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF4203 FitnessBrowser__Marino:GFF4203 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
36% identity, 95% coverage: 11:263/265 of query aligns to 2:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
R
 
S
G
 
R
L
 
L
E
 
Q
G
 
D
K
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
G
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
V
 
A
C
 
A
L
 
R
R
 
V
F
 
F
A
 
M
E
 
K
E
 
E
G
 
G
S
 
A
L
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
L
 
A
D
|
D
R
x
F
D
 
N
E
 
E
S
 
A
T
 
A
A
 
G
R
 
K
A
 
E
T
 
A
A
 
-
D
 
-
L
 
-
I
 
-
T
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
N
G
 
P
R
 
G
A
 
V
K
 
V
A
 
F
Y
 
I
A
 
R
A
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
Y
 
R
A
 
E
M
 
S
I
 
V
T
 
H
D
 
R
T
 
L
V
 
V
A
 
E
A
 
N
I
 
V
E
 
A
S
 
E
D
 
R
L
 
F
G
 
G
V
 
K
P
 
I
T
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
F
x
I
D
 
T
R
 
R
F
x
D
M
 
S
P
 
M
F
 
L
L
 
S
K
|
K
T
 
M
E
 
T
P
 
V
K
 
D
L
 
Q
W
 
F
D
 
Q
Q
 
Q
L
 
V
I
 
I
A
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
V
L
 
F
N
 
H
M
 
C
H
 
T
H
 
Q
V
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
Y
M
 
M
I
 
A
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
G
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
T
A
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
T
A
 
G
R
 
T
V
 
Y
G
 
G
S
x
N
S
x
V
G
 
G
E
x
Q
S
 
T
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
M
S
 
T
K
 
K
T
 
T
V
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
T
 
R
K
 
K
N
 
G
V
 
I
C
 
N
L
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
P
x
F
T
|
T
D
 
E
T
|
T
A
 
A
L
x
M
L
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
V
A
 
A
E
 
E
T
 
V
A
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
V
L
 
I
E
 
E
A
x
K
F
 
M
R
 
K
N
 
A
A
 
Q
V
 
V
P
 
P
M
 
M
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
D
Y
 
I
P
 
A
G
 
N
L
 
A
I
 
Y
A
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
D
 
E
A
 
S
N
 
D
F
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
V
 
V
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
M
M
 
M

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
36% identity, 94% coverage: 14:263/265 of query aligns to 6:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
I
C
 
A
L
 
E
R
 
L
F
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
R
G
 
G
S
 
A
L
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
L
 
T
D
 
A
R
x
T
D
 
S
E
 
E
S
 
S
T
 
G
A
 
A
R
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
S
D
 
D
L
 
Y
I
 
L
T
 
G
E
 
D
A
 
N
G
 
G
G
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
K
A
 
G
Y
 
M
A
 
A
A
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
N
Y
 
P
A
 
E
M
 
S
I
 
I
T
 
E
D
 
A
T
 
V
V
 
L
A
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
T
S
 
D
D
 
E
L
 
F
G
 
G
V
 
G
P
 
V
T
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
F
x
I
D
 
T
R
 
R
F
 
D
M
 
N
P
 
L
F
 
L
L
 
M
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
E
K
 
E
L
 
E
W
 
W
D
 
S
Q
 
D
L
 
I
I
 
M
A
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
A
 
I
L
 
F
N
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
V
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
R
G
 
G
M
 
M
I
 
M
A
 
K
A
 
K
G
 
R
G
 
Q
G
 
G
K
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
N
V
|
V
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
S
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
F
S
 
T
K
 
K
T
 
S
V
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
T
 
S
K
 
R
N
 
G
V
 
V
C
 
T
L
 
V
N
 
N
V
 
T
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
T
x
I
D
 
E
T
|
T
A
 
D
L
x
M
L
 
T
K
 
K
G
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
A
P
 
L
N
 
N
P
 
D
E
 
E
K
 
Q
L
 
R
L
 
T
E
 
A
A
 
T
F
 
L
R
 
A
N
 
Q
A
 
-
V
 
V
P
 
P
M
 
A
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
E
 
R
D
 
E
Y
 
I
P
 
A
G
 
S
L
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
D
 
E
A
 
A
N
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
36% identity, 94% coverage: 14:263/265 of query aligns to 6:242/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
I
C
 
A
L
 
E
R
 
L
F
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
R
G
 
G
S
 
A
L
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
L
 
T
D
 
A
R
x
T
D
 
S
E
 
E
S
 
S
T
 
G
A
 
A
R
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
S
D
 
D
L
 
Y
I
 
L
T
 
G
E
 
D
A
 
N
G
 
G
G
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
K
A
 
G
Y
 
M
A
 
A
A
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
N
Y
 
P
A
 
E
M
 
S
I
 
I
T
 
E
D
 
A
T
 
V
V
 
L
A
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
T
S
 
D
D
 
E
L
 
F
G
 
G
V
 
G
P
 
V
T
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
F
 
I
D
 
T
R
 
R
F
 
D
M
 
N
P
 
L
F
 
L
L
 
M
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
E
K
 
E
L
 
E
W
 
W
D
 
S
Q
 
D
L
 
I
I
 
M
A
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
A
 
I
L
 
F
N
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
V
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
R
G
 
G
M
 
M
I
 
M
A
 
K
A
 
K
G
 
R
G
 
Q
G
 
G
K
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
V
A
x
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
x
Q
S
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
F
S
 
T
K
 
K
T
 
S
V
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
T
 
S
K
 
R
N
 
G
V
 
V
C
 
T
L
 
V
N
 
N
V
 
T
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
-
P
 
-
T
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
G
|
G
V
 
F
A
 
I
E
 
E
T
|
T
A
 
D
P
 
M
N
 
N
P
 
D
E
 
E
K
 
Q
L
 
R
L
 
T
E
 
A
A
 
T
F
 
L
R
 
A
N
 
Q
A
 
-
V
 
V
P
 
P
M
 
A
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
E
 
R
D
 
E
Y
 
I
P
 
A
G
 
S
L
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
D
 
E
A
 
A
N
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
33% identity, 94% coverage: 14:263/265 of query aligns to 3:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
L
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
I
C
 
A
L
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
V
E
 
A
E
 
R
G
 
G
S
 
A
L
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
L
 
T
D
 
A
R
x
T
D
 
S
E
 
E
S
 
S
T
 
G
A
 
A
R
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
S
D
 
D
L
 
Y
I
 
L
T
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
A
R
 
N
A
 
G
K
 
K
A
 
G
Y
 
L
A
 
M
A
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
Y
 
P
A
 
A
M
 
S
I
 
I
T
 
E
D
 
S
T
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
N
I
 
V
E
 
R
S
 
A
D
 
E
L
 
F
G
 
G
V
 
E
P
 
V
T
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
F
x
I
D
 
T
R
 
R
F
 
D
M
 
N
P
 
L
F
 
L
L
 
M
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
D
K
 
D
L
 
E
W
 
W
D
 
N
Q
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
N
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
V
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
I
 
M
A
 
K
A
 
K
G
 
R
G
 
H
G
 
G
K
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
T
V
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
S
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
F
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
V
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
T
 
S
K
 
R
N
 
G
V
 
I
C
 
T
L
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
E
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
T
K
 
R
G
 
A
V
 
L
A
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
T
E
 
D
K
 
E
L
 
Q
L
 
R
E
 
A
A
 
G
F
 
T
R
 
L
N
 
A
A
 
A
V
 
V
P
 
P
M
 
A
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
N
D
 
E
Y
 
I
P
 
A
G
 
S
L
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
N
 
S
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

4k6fB X-ray crystal structure of a putative acetoacetyl-coa reductase from burkholderia cenocepacia bound to the co-factor NADP
35% identity, 93% coverage: 17:263/265 of query aligns to 2:244/245 of 4k6fB

query
sites
4k6fB
K
 
R
T
 
I
V
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
M
G
 
G
G
|
G
I
 
L
G
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
V
C
 
S
L
 
I
R
 
R
F
 
L
A
 
N
E
 
D
E
 
A
G
 
G
S
 
H
L
 
R
V
 
V
A
 
V
V
 
V
L
 
T
D
x
Y
R
x
S
D
 
P
E
 
N
S
x
N
T
 
T
A
 
G
R
 
A
A
 
D
T
 
R
A
 
W
D
 
L
L
 
T
I
 
E
T
 
M
E
 
H
A
 
A
G
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
E
-
 
F
K
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
P
A
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
A
D
 
D
Y
 
H
A
 
D
M
 
S
I
 
C
T
 
Q
D
 
Q
T
 
C
V
 
I
A
 
E
A
 
K
I
 
I
E
 
V
S
 
R
D
 
D
L
 
V
G
 
G
V
 
P
P
 
V
T
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
F
x
I
D
 
T
R
 
R
F
 
D
M
 
M
P
 
T
F
 
L
L
 
R
K
 
K
T
 
L
E
 
D
P
 
K
K
 
V
L
x
N
W
 
W
D
 
D
Q
 
A
L
 
V
I
 
I
A
 
R
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
D
G
 
S
A
 
V
L
 
F
N
 
N
M
 
M
H
 
T
H
 
K
V
 
P
V
 
V
L
 
C
P
 
D
G
 
G
M
 
M
I
 
V
A
 
E
A
 
R
G
 
G
G
 
W
G
 
G
K
 
R
V
 
I
I
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
N
A
 
G
R
 
S
V
 
K
G
 
G
S
 
S
S
 
V
G
 
G
E
 
Q
S
 
T
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
M
V
 
H
G
 
G
F
 
F
S
 
T
K
 
K
T
 
S
V
 
L
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
R
K
 
K
N
 
G
V
 
V
C
 
T
L
 
V
N
 
N
V
 
T
V
 
V
C
 
S
P
 
P
G
 
G
P
 
Y
T
 
L
D
 
A
T
 
T
A
 
K
L
 
M
L
 
V
K
 
T
G
 
A
V
 
I
A
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
Q
K
 
D
L
 
I
L
 
L
E
 
D
A
 
T
-
 
K
F
 
I
R
 
L
N
 
P
A
 
Q
V
 
I
P
 
P
M
 
A
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
E
Y
 
V
P
 
A
G
 
A
L
 
L
I
 
V
A
 
A
L
 
Y
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
E
D
 
E
A
 
A
N
 
G
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
N
I
 
I
S
 
A
V
 
I
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
Q
T
 
H
M
 
M

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
35% identity, 93% coverage: 17:263/265 of query aligns to 5:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
T
 
S
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
S
G
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
V
 
I
C
 
A
L
 
L
R
 
Q
F
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
S
 
Y
L
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
-
 
N
L
 
Y
D
 
A
R
 
G
D
 
S
E
 
K
S
 
E
T
 
K
A
 
A
R
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
V
D
 
E
L
 
E
I
 
I
T
 
K
E
 
A
A
 
K
G
 
G
G
 
V
R
 
D
A
 
S
K
 
F
A
 
A
Y
 
I
A
 
Q
A
 
A
D
 
N
I
 
V
T
 
A
D
 
D
Y
 
A
A
 
D
M
 
E
I
 
V
T
 
K
D
 
A
T
 
M
V
 
I
A
 
K
A
 
E
I
 
V
E
 
V
S
 
S
D
 
Q
L
 
F
G
 
G
V
 
S
P
 
L
T
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
F
 
I
D
 
T
R
 
R
F
 
D
M
 
N
P
 
L
F
 
L
L
 
M
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
E
K
 
Q
L
 
E
W
 
W
D
 
D
Q
 
D
L
 
V
I
 
I
A
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
F
N
 
N
M
 
C
H
 
I
H
 
Q
V
 
K
V
 
A
L
 
T
P
 
P
G
 
Q
M
 
M
I
 
L
A
 
R
A
 
Q
G
 
R
G
 
S
G
 
G
K
 
A
V
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
L
A
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
N
S
 
P
G
 
G
E
x
Q
S
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
C
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
S
V
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
T
 
S
K
 
R
N
 
G
V
 
I
C
 
T
L
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
V
T
 
S
A
 
D
L
 
M
L
 
T
K
 
D
G
 
A
V
 
L
A
 
S
E
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
D
K
 
E
L
 
L
L
 
K
E
 
E
A
 
Q
F
 
M
R
 
L
N
 
T
A
 
Q
V
 
I
P
 
P
M
 
L
K
 
A
R
 
R
L
 
F
A
 
G
Q
 
Q
P
 
D
E
 
T
D
 
D
Y
 
I
P
 
A
G
 
N
L
 
T
I
 
V
A
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
N
 
K
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
I
 
I
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
35% identity, 95% coverage: 12:263/265 of query aligns to 1:239/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
R
 
K
G
 
K
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
G
x
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
V
 
I
C
 
A
L
 
L
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
S
 
A
L
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
A
L
 
G
D
|
D
R
x
L
D
 
G
E
 
D
S
 
-
T
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
I
 
L
T
 
T
E
 
Y
A
 
S
G
 
H
G
 
P
R
 
N
A
 
V
K
 
E
A
 
G
Y
 
M
A
 
Y
A
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
Y
 
V
A
 
T
M
 
G
I
 
V
T
 
E
D
 
K
T
 
F
V
 
Y
A
 
Q
A
 
S
I
 
V
E
 
I
S
 
D
D
 
K
L
 
Y
G
 
G
V
 
K
P
 
I
T
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
F
 
I
D
 
T
R
 
K
F
 
D
M
 
A
P
 
M
F
 
T
L
 
R
K
 
K
T
 
M
E
 
T
P
 
E
K
 
A
L
 
Q
W
 
W
D
 
D
Q
 
A
L
 
V
I
 
I
A
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
F
N
 
N
M
 
L
H
 
T
H
 
R
V
 
L
V
 
V
L
 
G
P
 
P
G
 
Q
M
 
M
I
 
Q
A
 
T
A
 
N
G
 
G
G
 
Y
G
 
G
K
 
S
V
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
V
V
 
F
G
 
G
S
 
N
S
 
I
G
 
G
E
 
Q
S
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
L
S
 
T
K
 
M
T
 
T
V
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
F
A
 
A
T
 
L
K
 
K
-
 
G
-
 
A
N
 
N
V
 
V
C
 
R
L
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
I
C
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
Y
T
x
I
D
 
M
T
|
T
A
 
D
L
 
I
L
 
L
K
 
K
G
 
T
V
 
V
A
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
Q
K
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
D
A
 
K
F
 
F
R
 
A
N
 
A
A
 
L
V
 
T
P
 
M
M
 
L
K
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
D
 
E
Y
 
I
P
 
A
G
 
K
L
 
V
I
 
A
A
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
S
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
I
 
I
S
 
N
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
R
M
 
L

5vt6A Crystal structure of acetoacetyl-coa reductase from burkholderia pseudomallei 1710b complexed with NADP
35% identity, 94% coverage: 17:264/265 of query aligns to 2:245/245 of 5vt6A

query
sites
5vt6A
K
 
R
T
 
V
V
 
A
I
 
F
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
M
G
|
G
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
A
A
 
A
V
 
I
C
 
S
L
 
R
R
 
R
F
 
L
A
 
H
E
 
D
E
 
A
G
 
G
S
 
M
L
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
-
D
 
S
R
x
H
D
x
S
E
 
E
S
 
R
T
x
N
A
 
D
R
 
H
A
 
V
T
 
S
A
 
T
D
 
W
L
 
L
I
 
M
T
 
H
E
 
E
-
 
R
-
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
R
R
 
D
A
 
F
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
A
D
 
D
Y
 
F
A
 
E
M
 
S
I
 
C
T
 
E
D
 
R
T
 
C
V
 
A
A
 
E
A
 
K
I
 
V
E
 
L
S
 
A
D
 
D
L
 
F
G
 
G
V
 
K
P
 
V
T
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
F
x
I
D
 
T
R
 
R
F
 
D
M
 
A
P
 
T
F
 
F
L
 
M
K
 
K
T
 
M
E
 
T
P
 
K
K
 
G
L
x
D
W
 
W
D
 
D
Q
 
A
L
 
V
I
 
M
A
 
R
V
 
T
N
 
D
L
 
L
T
 
D
G
 
A
A
 
M
L
 
F
N
 
N
M
 
V
H
 
T
H
 
K
V
 
Q
V
 
F
L
 
I
P
 
A
G
 
G
M
 
M
I
 
V
A
 
E
A
 
R
G
 
R
G
 
F
G
 
G
K
 
R
V
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
N
A
 
G
R
 
S
V
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
F
G
 
G
E
 
Q
S
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
S
C
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
V
 
H
G
 
G
F
 
F
S
 
T
K
 
K
T
 
T
V
 
L
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
T
A
 
A
T
 
K
K
 
R
N
 
G
V
 
I
C
 
T
L
 
V
N
 
N
V
 
T
V
 
V
C
 
S
P
|
P
G
 
G
P
x
Y
T
x
L
D
 
A
T
|
T
A
 
A
L
 
M
L
 
V
K
 
E
G
 
A
V
 
V
A
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
Q
K
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
A
-
 
K
F
 
I
R
 
L
N
 
P
A
 
Q
V
 
I
P
 
P
M
 
V
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
R
P
 
P
E
 
D
D
 
E
Y
 
V
P
 
A
G
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
G
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
D
I
 
L
S
 
A
V
 
I
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
H
M
 
M
A
 
S

4cqlI Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD (see paper)
35% identity, 94% coverage: 14:263/265 of query aligns to 6:251/251 of 4cqlI

query
sites
4cqlI
L
 
L
E
 
R
G
 
S
K
 
A
T
 
L
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
G
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
C
 
S
L
 
V
R
 
R
F
 
L
A
 
A
E
 
G
E
 
E
G
 
G
S
 
A
L
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
A
L
 
C
D
|
D
R
x
L
D
 
D
E
 
R
S
 
A
T
 
A
A
 
A
R
 
Q
A
 
E
T
 
T
A
 
V
D
 
R
L
 
L
I
 
L
T
 
G
E
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
S
R
 
N
A
 
H
K
 
A
A
 
A
Y
 
F
A
 
Q
A
|
A
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
E
Y
 
A
A
 
R
M
 
A
I
 
A
T
 
R
D
 
C
T
 
L
V
 
L
A
 
E
A
 
Q
I
 
V
E
 
Q
S
 
A
D
 
C
L
 
F
G
 
S
V
 
R
P
 
P
-
 
P
T
 
S
V
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
F
x
I
D
 
T
R
 
Q
F
 
D
M
 
E
P
 
F
F
 
L
L
 
L
K
 
H
T
 
M
E
 
S
P
 
E
K
 
D
L
 
D
W
 
W
D
 
D
Q
 
K
L
 
V
I
 
I
A
 
A
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
T
L
 
F
N
 
L
M
 
V
H
 
T
H
 
Q
V
 
A
V
 
A
L
 
A
P
 
Q
G
 
A
M
 
L
I
 
V
A
 
S
A
 
N
G
 
G
G
 
C
-
 
R
G
 
G
K
 
S
V
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
S
S
|
S
D
 
I
A
 
V
A
 
G
R
 
K
V
 
V
G
 
G
S
 
N
S
 
V
G
 
G
E
 
Q
S
 
T
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
L
S
 
T
K
 
Q
T
 
T
V
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
T
 
R
K
 
H
N
 
G
V
 
I
C
 
R
L
 
C
N
 
N
V
 
S
V
 
V
C
 
L
P
|
P
G
|
G
P
 
F
T
x
I
D
 
A
T
|
T
A
 
P
L
x
M
L
 
T
K
 
Q
G
 
K
V
 
V
A
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
Q
K
 
K
L
 
V
L
 
V
E
 
D
A
 
K
F
 
I
R
 
T
N
 
E
A
 
M
V
 
I
P
 
P
M
 
M
K
 
G
R
 
H
L
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
E
 
E
D
 
D
Y
 
V
P
 
A
G
 
D
L
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
D
 
D
A
 
S
N
 
G
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
S
I
 
V
S
 
E
V
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
F
M
 
M

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
36% identity, 94% coverage: 14:263/265 of query aligns to 6:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
L
 
L
E
 
A
G
 
S
K
 
K
T
 
T
V
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
F
A
 
G
V
 
I
C
 
A
L
 
Q
R
 
V
F
 
L
A
 
A
E
 
R
E
 
E
G
 
G
S
 
A
L
 
R
V
 
V
A
 
I
V
 
I
L
 
A
D
|
D
R
|
R
D
 
D
E
 
A
S
 
H
T
 
G
A
 
E
R
 
A
A
 
A
T
 
A
A
 
A
D
 
S
L
 
L
I
 
-
T
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
A
R
 
Q
A
 
A
K
 
L
A
 
F
Y
 
I
A
 
S
A
x
C
D
 
N
I
|
I
T
 
A
D
 
E
Y
 
K
A
 
T
M
 
Q
I
 
V
T
 
E
D
 
A
T
 
L
V
 
F
A
 
S
A
 
Q
I
 
A
E
 
E
S
 
E
D
 
A
L
 
F
G
 
G
V
 
P
P
 
V
T
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
F
x
I
D
 
N
R
 
R
F
 
D
M
 
A
P
 
M
F
 
L
L
 
H
K
 
K
T
 
L
E
 
T
P
 
E
K
 
A
L
 
D
W
 
W
D
 
D
Q
 
T
L
 
V
I
 
I
A
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
T
L
 
F
N
 
L
M
 
C
H
 
M
H
 
Q
V
 
Q
V
 
A
L
 
A
P
 
I
G
 
R
M
 
M
I
 
R
A
 
E
A
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
G
K
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
 
S
D
 
-
A
 
A
A
 
S
R
 
W
V
 
L
G
 
G
S
 
N
S
 
V
G
 
G
E
 
Q
S
 
T
V
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
C
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
M
S
 
T
K
 
K
T
 
T
V
 
A
A
 
C
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
T
 
K
K
 
K
N
 
G
V
 
V
C
 
T
L
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
x
I
D
 
D
T
|
T
A
 
D
L
 
M
L
x
T
K
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
E
K
 
N
L
 
V
L
 
W
E
 
Q
A
 
I
F
 
M
R
 
V
N
 
S
A
 
K
V
 
I
P
 
P
M
 
A
K
 
G
R
 
Y
L
 
A
A
 
G
Q
 
E
P
 
A
E
 
K
D
 
D
Y
 
V
P
 
G
G
 
E
L
 
C
I
 
V
A
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
A
N
 
R
F
 
Y
I
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
I
 
I
S
 
N
V
 
V
S
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
V
M
 
L

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
35% identity, 93% coverage: 17:263/265 of query aligns to 2:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
T
 
S
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
V
 
I
C
 
A
L
 
L
R
 
Q
F
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
S
 
Y
L
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
-
x
N
L
x
Y
D
x
A
R
x
G
D
x
S
E
 
K
S
 
E
T
 
K
A
 
A
R
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
V
D
 
E
L
 
E
I
 
I
T
 
K
E
 
A
A
 
K
G
 
G
G
 
V
R
 
D
A
 
S
K
 
F
A
 
A
Y
 
I
A
 
Q
A
|
A
D
x
N
I
x
V
T
 
A
D
 
D
Y
 
A
A
 
D
M
 
E
I
 
V
T
 
K
D
 
A
T
 
M
V
 
I
A
 
K
A
 
E
I
 
V
E
 
V
S
 
S
D
 
Q
L
 
F
G
 
G
V
 
S
P
 
L
T
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
F
 
I
D
 
T
R
 
R
F
 
D
M
 
N
P
 
L
F
 
L
L
 
M
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
E
K
 
Q
L
 
E
W
 
W
D
 
D
Q
 
D
L
 
V
I
 
I
A
 
D
V
x
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
F
N
 
N
M
 
C
H
 
I
H
 
Q
V
 
K
V
 
A
L
 
T
P
 
P
G
 
Q
M
 
M
I
 
L
A
 
R
A
 
Q
G
 
R
G
 
S
G
 
G
K
 
A
V
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
L
A
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
N
S
 
P
G
 
G
E
x
Q
S
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
C
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
S
V
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
T
 
S
K
 
R
N
 
G
V
 
I
C
 
T
L
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
T
 
I
D
 
V
T
 
S
A
 
D
L
 
M
L
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
T
E
 
D
K
 
E
L
 
L
L
 
K
E
 
E
A
 
Q
F
 
M
R
 
L
N
 
T
A
 
Q
V
 
I
P
 
P
M
 
L
K
 
A
R
 
R
L
 
F
A
 
G
Q
 
Q
P
 
D
E
 
T
D
 
D
Y
 
I
P
 
A
G
 
N
L
 
T
I
 
V
A
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
N
 
K
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
I
 
I
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

4urfB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
35% identity, 93% coverage: 14:260/265 of query aligns to 3:244/248 of 4urfB

query
sites
4urfB
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
T
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
|
G
G
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
V
 
I
C
 
A
L
 
L
R
 
T
F
 
Y
A
 
A
E
 
A
E
 
E
G
 
G
S
 
A
L
 
N
V
 
V
A
 
V
V
 
V
L
 
S
D
|
D
R
x
I
D
 
S
E
 
D
S
 
E
T
 
W
A
 
G
R
 
R
A
 
E
T
 
T
A
 
L
D
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
E
E
 
G
A
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
A
K
 
V
A
 
F
Y
 
Q
A
 
H
A
 
A
D
|
D
I
x
T
T
 
A
D
 
H
Y
 
P
A
 
E
M
 
D
I
 
H
T
 
D
D
 
E
T
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
A
E
 
K
S
 
R
D
 
A
L
 
F
G
 
G
V
 
R
P
 
L
T
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
F
x
I
D
 
S
-
x
G
R
 
E
F
 
F
M
 
T
P
 
P
F
 
T
L
 
A
K
 
E
T
 
T
E
 
T
P
 
D
K
 
A
L
 
Q
W
 
W
D
 
Q
Q
x
R
L
 
V
I
 
I
A
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
G
A
 
V
L
 
F
N
 
Y
M
 
G
H
 
V
H
 
R
V
 
A
V
 
Q
L
 
I
P
 
R
G
 
A
M
 
M
I
 
L
A
 
E
A
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
 
A
V
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
I
A
 
S
S
|
S
D
 
I
A
 
A
A
 
G
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
S
 
I
S
 
E
G
 
G
E
x
I
S
 
T
V
 
P
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
C
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
A
R
 
W
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
T
 
S
K
 
K
N
 
G
V
 
I
C
x
R
L
 
I
N
 
N
V
 
S
V
 
V
C
 
G
P
|
P
G
x
A
P
 
F
T
x
I
D
 
N
T
|
T
A
 
T
L
 
L
L
 
V
K
 
Q
G
 
N
V
 
V
A
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
L
K
 
E
L
 
T
L
 
R
E
 
R
A
 
Q
F
 
L
R
 
E
N
 
Q
A
 
M
V
 
H
P
 
A
M
x
L
K
x
R
R
|
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
P
 
T
E
 
E
D
 
E
Y
 
V
P
 
A
G
 
N
L
 
L
I
 
V
A
 
A
L
 
W
L
 
L
A
 
S
S
|
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
N
 
S
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
Y
I
 
Y
S
 
A
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G

4urfA Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
35% identity, 93% coverage: 14:260/265 of query aligns to 3:244/248 of 4urfA

query
sites
4urfA
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
T
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
|
G
G
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
V
 
I
C
 
A
L
 
L
R
 
T
F
 
Y
A
 
A
E
 
A
E
 
E
G
 
G
S
 
A
L
 
N
V
 
V
A
 
V
V
 
V
L
 
S
D
|
D
R
x
I
D
 
S
E
 
D
S
 
E
T
x
W
A
 
G
R
 
R
A
 
E
T
 
T
A
 
L
D
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
E
E
 
G
A
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
A
K
 
V
A
 
F
Y
 
Q
A
 
H
A
 
A
D
|
D
I
x
T
T
 
A
D
 
H
Y
 
P
A
 
E
M
 
D
I
 
H
T
 
D
D
 
E
T
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
A
E
 
K
S
 
R
D
 
A
L
 
F
G
 
G
V
 
R
P
 
L
T
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
F
x
I
D
x
S
-
x
G
R
x
E
F
 
F
M
x
T
P
 
P
F
 
T
L
 
A
K
x
E
T
 
T
E
x
T
P
 
D
K
 
A
L
x
Q
W
 
W
D
 
Q
Q
x
R
L
 
V
I
 
I
A
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
G
A
 
V
L
 
F
N
 
Y
M
 
G
H
 
V
H
 
R
V
 
A
V
 
Q
L
 
I
P
 
R
G
 
A
M
 
M
I
 
L
A
 
E
A
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
 
A
V
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
I
A
 
S
S
|
S
D
 
I
A
 
A
A
 
G
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
S
 
I
S
 
E
G
 
G
E
x
I
S
 
T
V
 
P
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
C
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
A
R
 
W
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
T
x
S
K
 
K
N
x
G
V
 
I
C
 
R
L
 
I
N
 
N
V
 
S
V
 
V
C
 
G
P
|
P
G
 
A
P
 
F
T
x
I
D
 
N
T
|
T
A
 
T
L
 
L
L
 
V
K
 
Q
G
 
N
V
 
V
A
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
L
K
 
E
L
 
T
L
 
R
E
 
R
A
 
Q
F
 
L
R
 
E
N
 
Q
A
 
M
V
 
H
P
 
A
M
 
L
K
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
P
 
T
E
 
E
D
 
E
Y
 
V
P
 
A
G
 
N
L
 
L
I
 
V
A
 
A
L
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
N
 
S
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
x
S
V
x
Y
I
 
Y
S
 
A
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G

4ureB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
35% identity, 93% coverage: 14:260/265 of query aligns to 3:244/248 of 4ureB

query
sites
4ureB
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
T
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
G
G
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
V
 
I
C
 
A
L
 
L
R
 
T
F
 
Y
A
 
A
E
 
A
E
 
E
G
 
G
S
 
A
L
 
N
V
 
V
A
 
V
V
 
V
L
 
S
D
 
D
R
 
I
D
 
S
E
 
D
S
 
E
T
 
W
A
 
G
R
 
R
A
 
E
T
 
T
A
 
L
D
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
E
E
 
G
A
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
A
K
 
V
A
 
F
Y
 
Q
A
 
H
A
 
A
D
 
D
I
 
T
T
 
A
D
 
H
Y
 
P
A
 
E
M
 
D
I
 
H
T
 
D
D
 
E
T
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
A
E
 
K
S
 
R
D
 
A
L
 
F
G
 
G
V
 
R
P
 
L
T
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
F
 
I
D
 
S
-
 
G
R
 
E
F
 
F
M
 
T
P
 
P
F
 
T
L
 
A
K
 
E
T
 
T
E
 
T
P
 
D
K
 
A
L
 
Q
W
 
W
D
 
Q
Q
 
R
L
 
V
I
 
I
A
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
G
A
 
V
L
 
F
N
 
Y
M
 
G
H
 
V
H
 
R
V
 
A
V
 
Q
L
 
I
P
 
R
G
 
A
M
 
M
I
 
L
A
 
E
A
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
 
A
V
 
I
I
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
S
S
|
S
D
 
I
A
 
A
A
 
G
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
S
 
I
S
 
E
G
 
G
E
x
I
S
 
T
V
 
P
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
C
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
A
R
 
W
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
T
 
S
K
 
K
N
 
G
V
 
I
C
 
R
L
 
I
N
 
N
V
 
S
V
 
V
C
 
G
P
|
P
G
x
A
P
 
F
T
 
I
D
 
N
T
 
T
A
 
T
L
 
L
L
 
V
K
 
Q
G
 
N
V
 
V
A
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
L
K
 
E
L
 
T
L
 
R
E
 
R
A
 
Q
F
 
L
R
 
E
N
 
Q
A
 
M
V
 
H
P
 
A
M
 
L
K
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
P
 
T
E
 
E
D
 
E
Y
 
V
P
 
A
G
 
N
L
 
L
I
 
V
A
 
A
L
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
N
 
S
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
Y
I
 
Y
S
 
A
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G

4cqmA Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP (see paper)
35% identity, 94% coverage: 14:263/265 of query aligns to 4:248/248 of 4cqmA

query
sites
4cqmA
L
 
L
E
 
R
G
 
S
K
 
A
T
 
L
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
C
 
S
L
 
V
R
 
R
F
 
L
A
 
A
E
 
G
E
 
E
G
 
G
S
 
A
L
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
A
L
 
C
D
|
D
R
x
L
D
 
D
E
 
R
S
 
A
T
 
A
A
 
A
R
 
Q
A
 
E
T
 
T
A
 
V
D
 
R
L
 
L
I
 
L
T
 
P
E
 
P
A
 
R
G
 
G
G
 
N
R
 
H
A
 
A
K
 
-
A
 
A
Y
 
F
A
 
Q
A
|
A
D
 
D
I
x
V
T
 
S
D
 
E
Y
 
A
A
 
R
M
 
A
I
 
A
T
 
R
D
 
C
T
 
L
V
 
L
A
 
E
A
 
Q
I
 
V
E
 
Q
S
 
A
D
 
C
L
 
F
G
 
S
V
 
R
P
 
P
-
 
P
T
 
S
V
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
F
x
I
D
 
T
R
 
Q
F
 
D
M
 
E
P
 
F
F
 
L
L
 
L
K
 
H
T
 
M
E
 
S
P
 
E
K
 
D
L
 
D
W
 
W
D
 
D
Q
 
K
L
 
V
I
 
I
A
 
A
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
T
L
 
F
N
 
L
M
 
V
H
 
T
H
 
Q
V
 
A
V
 
A
L
 
A
P
 
Q
G
 
A
M
 
L
I
 
V
A
 
S
A
 
N
G
 
G
G
 
C
-
 
R
G
 
G
K
 
S
V
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
S
S
|
S
D
 
I
A
 
V
A
 
G
R
 
K
V
 
V
G
 
G
S
 
N
S
 
V
G
 
G
E
 
Q
S
 
T
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
L
S
 
T
K
 
Q
T
 
T
V
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
T
 
R
K
 
H
N
 
G
V
 
I
C
 
R
L
 
C
N
 
N
V
 
S
V
 
V
C
 
L
P
|
P
G
|
G
P
 
F
T
x
I
D
 
A
T
|
T
A
x
P
L
x
M
L
x
T
K
 
Q
G
 
K
V
 
V
A
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
Q
K
 
K
L
 
V
L
 
V
E
 
D
A
 
K
F
 
I
R
 
T
N
 
E
A
 
M
V
 
I
P
 
P
M
 
M
K
 
G
R
 
H
L
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
E
 
E
D
 
D
Y
 
V
P
 
A
G
 
D
L
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
D
 
D
A
 
S
N
 
G
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
S
I
 
V
S
 
E
V
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
F
M
 
M

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
33% identity, 94% coverage: 14:263/265 of query aligns to 2:242/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
L
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
I
C
 
A
L
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
A
E
 
A
E
 
R
G
 
G
S
 
A
L
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
L
 
T
D
 
A
R
x
T
D
 
S
E
 
E
S
 
N
T
 
G
A
 
A
R
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
S
D
 
D
L
 
Y
I
 
L
T
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
A
R
 
N
A
 
G
K
 
K
A
 
G
Y
 
L
A
 
M
A
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
Y
 
P
A
 
A
M
 
S
I
 
I
T
 
E
D
 
S
T
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
K
I
 
I
E
 
R
S
 
A
D
 
E
L
 
F
G
 
G
V
 
E
P
 
V
T
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
F
x
I
D
 
T
R
 
R
F
 
D
M
 
N
P
 
L
F
 
L
L
 
M
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
D
K
 
E
L
x
E
W
 
W
D
 
N
Q
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
N
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
V
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
I
 
M
A
 
K
A
 
K
G
 
R
G
 
H
G
 
G
K
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
T
V
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
G
G
 
G
E
x
Q
S
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
F
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
V
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
T
 
S
K
 
R
N
 
G
V
 
I
C
 
T
L
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
T
x
I
D
 
E
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
T
K
 
R
G
 
A
V
 
L
A
 
S
E
 
D
T
 
D
A
 
Q
P
 
R
N
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
A
A
 
G
F
 
I
R
 
L
N
 
A
A
 
Q
V
 
V
P
 
P
M
 
A
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
Y
 
I
P
 
A
G
 
N
L
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
N
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
x
E
V
x
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
33% identity, 94% coverage: 14:263/265 of query aligns to 3:243/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
L
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
x
A
G
x
S
G
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
I
C
 
A
L
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
A
E
 
A
E
 
R
G
 
G
S
 
A
L
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
L
 
T
D
 
A
R
x
T
D
 
S
E
 
E
S
 
N
T
 
G
A
 
A
R
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
S
D
 
D
L
 
Y
I
 
L
T
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
A
R
 
N
A
 
G
K
 
K
A
 
G
Y
 
L
A
 
M
A
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
Y
 
P
A
 
A
M
 
S
I
 
I
T
 
E
D
 
S
T
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
K
I
 
I
E
 
R
S
 
A
D
 
E
L
 
F
G
 
G
V
 
E
P
 
V
T
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
F
 
I
D
 
T
R
 
R
F
 
D
M
 
N
P
 
L
F
 
L
L
 
M
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
D
K
 
E
L
 
E
W
 
W
D
 
N
Q
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
N
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
V
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
I
 
M
A
 
K
A
 
K
G
 
R
G
 
H
G
 
G
K
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
T
V
 
I
A
 
G
S
 
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
G
G
 
G
E
 
Q
S
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
|
A
A
|
A
C
x
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
F
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
V
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
T
 
S
K
 
R
N
 
G
V
 
I
C
 
T
L
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
x
I
D
 
E
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
T
K
 
R
G
 
A
V
 
L
A
 
S
E
 
D
T
 
D
A
 
Q
P
 
R
N
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
A
A
 
G
F
 
I
R
 
L
N
 
A
A
 
Q
V
 
V
P
 
P
M
 
A
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
Y
 
I
P
 
A
G
 
N
L
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
N
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
x
E
V
 
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

4ag3A Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with NADPH at 1.8a resolution (see paper)
32% identity, 95% coverage: 14:264/265 of query aligns to 10:254/254 of 4ag3A

query
sites
4ag3A
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
V
 
I
C
 
A
L
 
L
R
 
E
F
 
L
A
 
G
E
 
R
E
 
L
G
 
G
S
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
I
V
 
G
L
 
T
D
 
A
R
x
T
D
 
S
E
 
A
S
 
S
T
 
G
A
 
A
R
 
E
A
 
K
T
 
I
A
 
A
D
 
E
L
 
T
I
 
L
T
 
K
E
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
V
R
 
E
A
 
G
K
 
A
A
 
G
Y
 
L
A
 
V
A
x
L
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
S
Y
 
D
A
 
E
M
 
S
I
 
V
T
 
A
D
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
E
A
 
H
I
 
I
E
 
Q
S
 
Q
D
 
H
L
 
L
G
 
G
V
 
Q
P
 
P
T
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
F
 
I
D
 
T
R
 
R
F
 
D
M
 
N
P
 
L
F
 
L
L
 
V
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
D
K
 
D
L
 
E
W
 
W
D
 
F
Q
 
D
L
 
V
I
 
V
A
 
N
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
N
G
 
S
A
 
L
L
 
Y
N
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
V
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
R
G
 
G
M
 
M
I
 
T
A
 
K
A
 
A
G
 
R
G
 
W
G
 
G
K
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
A
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
S
 
T
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
E
G
 
G
F
 
F
S
 
T
K
 
R
T
 
A
V
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
G
T
 
S
K
 
R
N
 
A
V
 
I
C
 
T
L
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
P
x
F
T
x
I
D
 
D
T
|
T
A
 
D
L
x
M
L
x
T
K
 
R
G
 
E
V
 
L
A
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
E
K
 
A
L
 
Q
L
 
R
E
 
E
A
 
A
F
 
L
R
 
L
N
 
G
A
 
Q
V
 
I
P
 
P
M
 
L
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
Q
P
 
A
E
 
E
D
 
E
Y
 
I
P
 
A
G
 
K
L
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
A
N
 
A
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
T
I
 
V
S
 
P
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M
A
 
S

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
34% identity, 94% coverage: 14:263/265 of query aligns to 2:242/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
L
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
I
C
 
A
L
 
E
R
 
T
F
 
F
A
 
V
E
 
A
E
 
R
G
 
G
S
 
A
L
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
L
 
T
D
 
A
R
x
T
D
 
S
E
 
E
S
 
S
T
 
G
A
 
A
R
 
E
A
 
A
T
 
I
A
 
S
D
 
G
L
 
Y
I
 
L
T
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
A
R
 
N
A
 
G
K
 
K
A
 
G
Y
 
F
A
 
M
A
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
K
D
 
D
Y
 
A
A
 
Q
M
 
S
I
 
I
T
 
D
D
 
S
T
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
S
I
 
I
E
 
R
S
 
A
D
 
E
L
 
F
G
 
G
V
 
E
P
 
I
T
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
F
x
I
D
 
T
R
 
R
F
 
D
M
 
N
P
 
L
F
 
L
L
 
M
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
D
K
 
D
L
 
E
W
 
W
D
 
E
Q
 
D
L
 
I
I
 
L
A
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
A
 
V
L
 
F
N
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
V
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
C
G
 
A
M
 
M
I
 
M
A
 
K
A
 
K
G
 
R
G
 
F
G
 
G
K
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
T
V
 
I
A
 
G
S
 
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
S
 
A
V
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
F
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
V
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
T
 
S
K
 
R
N
 
G
V
 
I
C
 
T
L
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
Y
T
 
I
D
 
E
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
T
K
 
R
G
 
-
V
 
-
A
 
A
E
 
L
T
 
T
A
 
D
P
 
D
N
 
Q
P
 
R
E
 
A
K
 
G
L
 
I
L
 
L
E
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
N
 
S
A
 
S
V
 
V
P
 
P
M
 
A
K
 
N
R
 
R
L
 
P
A
 
G
Q
 
D
P
 
A
E
 
K
D
 
E
Y
 
I
P
 
A
G
 
S
L
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
N
 
G
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
32% identity, 94% coverage: 14:263/265 of query aligns to 2:242/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
L
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
I
C
 
A
L
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
A
E
 
A
E
 
R
G
 
G
S
 
A
L
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
L
 
T
D
x
A
R
x
T
D
 
S
E
 
E
S
 
N
T
 
G
A
 
A
R
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
S
D
 
D
L
 
Y
I
 
L
T
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
A
R
 
N
A
 
G
K
 
K
A
 
G
Y
 
L
A
 
M
A
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
Y
 
P
A
 
A
M
 
S
I
 
I
T
 
E
D
 
S
T
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
K
I
 
I
E
 
R
S
 
A
D
 
E
L
 
F
G
 
G
V
 
E
P
 
V
T
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
F
x
I
D
 
T
R
 
R
F
 
D
M
 
N
P
 
L
F
 
L
L
 
M
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
D
K
 
E
L
 
E
W
 
W
D
 
N
Q
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
N
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
V
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
I
 
M
A
 
K
A
 
K
G
 
R
G
 
H
G
 
G
K
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
T
V
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
G
G
 
G
E
x
Q
S
 
A
V
 
N
Y
x
F
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
F
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
V
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
T
 
S
K
 
R
N
 
G
V
 
I
C
 
T
L
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
E
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
T
K
 
R
G
 
A
V
 
L
A
 
S
E
 
D
T
 
D
A
 
Q
P
 
R
N
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
A
A
 
G
F
 
I
R
 
L
N
 
A
A
 
Q
V
 
V
P
 
P
M
 
A
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
Y
 
I
P
 
A
G
 
N
L
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
N
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

Query Sequence

>GFF4203 FitnessBrowser__Marino:GFF4203
MISQQQEQVIMRGLEGKTVIVTGGGGGIGRAVCLRFAEEGSLVAVLDRDESTARATADLI
TEAGGRAKAYAADITDYAMITDTVAAIESDLGVPTVLVNNAGFDRFMPFLKTEPKLWDQL
IAVNLTGALNMHHVVLPGMIAAGGGKVINVASDAARVGSSGESVYAACKAGLVGFSKTVA
RELATKNVCLNVVCPGPTDTALLKGVAETAPNPEKLLEAFRNAVPMKRLAQPEDYPGLIA
LLASDDANFITGQVISVSGGLTMAG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory