SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF4227 FitnessBrowser__WCS417:GFF4227 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5yeiC Mechanistic insight into the regulation of pseudomonas aeruginosa aspartate kinase (see paper)
88% identity, 98% coverage: 2:407/413 of query aligns to 1:397/397 of 5yeiC

query
sites
5yeiC
A
 
A
L
 
L
I
 
I
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
F
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
S
V
 
V
G
 
G
S
 
T
V
 
V
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
D
 
E
K
 
K
V
 
V
K
 
K
K
 
K
F
 
F
R
 
R
D
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
D
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
V
S
 
S
A
 
A
M
 
M
S
 
S
G
 
G
E
 
E
T
 
T
N
 
N
R
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
G
L
 
L
A
 
A
K
 
N
A
 
Q
I
 
I
S
 
M
G
 
-
D
 
-
Q
 
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
V
P
 
P
R
 
R
E
 
E
L
 
L
D
 
D
V
 
V
I
 
M
V
 
V
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
S
M
 
M
A
 
A
L
 
L
N
 
I
K
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
S
 
N
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T
D
 
D
S
 
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
K
 
K
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Q
 
H
I
 
I
D
 
D
D
 
D
Q
 
T
K
 
H
I
 
I
R
 
R
T
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
A
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
G
Q
 
N
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
E
C
 
C
Q
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
V
V
 
V
S
 
P
V
 
Q
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
L
 
L
D
 
D
K
 
K
I
 
I
T
 
T
F
 
F
E
 
E
E
 
E
M
 
M
L
 
L
E
 
E
M
 
M
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
S
K
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
E
F
 
F
A
 
A
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
L
H
 
H
S
 
S
F
 
F
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
I
 
I
D
 
D
E
 
-
E
 
-
E
 
-
S
 
-
M
 
-
E
 
-
Q
 
-
P
 
P
I
 
I
I
 
I
S
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
R
 
R
D
 
D
E
 
E
A
 
A
K
 
K
L
 
L
T
 
T
I
 
I
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
D
 
D
T
|
T
P
|
P
G
 
G
V
 
V
A
|
A
F
 
F
K
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
S
 
S
G
 
A
A
 
A
N
 
N
I
 
V
E
 
E
V
 
V
D
 
D
M
 
M
I
 
I
V
 
V
Q
|
Q
N
 
N
V
 
V
S
 
A
H
 
H
D
 
D
N
 
N
T
 
T
T
 
T
D
 
D
F
 
F
T
 
T
F
 
F
T
 
T
V
 
V
H
 
H
R
 
R
N
 
N
E
 
D
Y
 
Y
D
 
L
A
 
N
A
 
A
E
 
L
R
 
E
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
N
 
Q
T
 
T
A
 
A
K
 
A
E
 
N
I
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
A
V
 
I
G
 
G
D
 
D
T
 
T
K
 
N
I
 
I
A
 
A
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
I
V
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
|
M
R
 
R
S
 
S
H
|
H
A
|
A
G
|
G
V
|
V
A
|
A
S
|
S
R
 
R
M
 
M
F
 
F
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
S
 
S
I
 
I
N
|
N
I
|
I
Q
 
Q
M
 
M
I
 
I
S
 
S
T
 
T
S
 
S
E
 
E
I
 
I
K
 
K
V
 
V
S
 
S
V
 
V
V
 
V
I
 
I
E
 
E
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
T
A
 
A
F
 
F
E
 
E
L
 
L
D
 
D
A
 
A

P26512 Aspartokinase; Aspartate kinase; EC 2.7.2.4 from Corynebacterium glutamicum (strain ATCC 13032 / DSM 20300 / BCRC 11384 / JCM 1318 / LMG 3730 / NCIMB 10025) (see 2 papers)
48% identity, 98% coverage: 1:405/413 of query aligns to 1:407/421 of P26512

query
sites
P26512
M
 
M
A
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
S
S
 
S
V
 
L
G
 
E
S
 
S
V
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
R
Q
 
N
V
 
V
A
 
A
D
 
E
K
 
R
V
 
I
K
 
V
K
 
A
F
 
T
R
 
K
D
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
N
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
C
S
 
S
A
 
A
M
 
M
S
 
G
G
 
D
E
 
T
T
 
T
N
 
D
R
 
E
L
 
L
I
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
A
I
 
V
S
 
N
G
 
-
D
 
-
Q
 
-
Q
 
-
P
 
P
L
 
V
P
 
P
-
 
P
-
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
M
D
 
D
V
 
M
I
 
L
V
 
L
S
 
T
T
 
A
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
V
 
I
T
 
S
I
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
I
N
 
E
K
 
S
R
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
E
A
 
A
V
 
Q
S
 
S
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
V
 
A
R
 
G
I
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
T
S
 
E
A
 
R
H
 
H
T
 
G
K
 
N
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
V
Q
 
D
I
 
V
D
 
T
D
 
P
Q
 
G
K
 
R
I
 
V
R
 
R
T
 
E
D
 
A
L
 
L
K
 
D
A
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
I
V
 
C
V
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
N
-
 
K
E
 
E
Q
 
T
G
 
R
N
 
D
I
 
V
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
N
A
 
A
D
 
D
E
 
V
C
 
C
Q
 
E
I
 
I
Y
 
Y
T
 
S
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
T
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
I
V
 
V
S
 
P
V
 
N
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
L
 
L
D
 
E
K
 
K
I
 
L
T
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
E
M
 
M
L
 
L
E
 
E
M
 
L
A
 
A
S
 
A
L
 
V
G
 
G
S
 
S
K
 
K
V
 
I
L
 
L
Q
 
V
I
 
L
R
 
R
A
 
S
V
 
V
E
 
E
F
 
Y
A
 
A
G
 
R
K
 
A
Y
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
R
H
 
S
S
 
S
F
 
Y
K
 
S
E
 
N
G
 
D
P
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
A
I
 
G
D
 
S
E
 
M
E
 
E
E
 
D
-
 
I
S
 
P
M
 
V
E
 
E
Q
 
E
P
 
A
I
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
A
F
 
T
N
 
D
R
 
K
D
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
L
 
V
T
 
T
I
 
V
R
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
S
D
 
D
T
 
K
P
 
P
G
|
G
V
 
E
A
|
A
F
 
A
K
 
K
I
 
V
L
 
F
G
 
R
P
 
A
I
 
L
S
 
A
G
 
D
A
 
A
N
 
E
I
 
I
E
 
N
V
 
I
D
 
D
M
 
M
I
 
V
V
 
L
Q
|
Q
N
 
N
V
 
V
S
|
S
-
 
S
-
 
V
H
 
E
D
 
D
N
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
F
 
I
T
 
T
F
 
F
T
 
T
V
 
C
H
 
P
R
 
R
N
 
S
E
 
D
Y
 
G
D
 
R
A
 
R
A
 
A
E
 
M
R
 
E
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
N
 
K
T
 
L
A
 
Q
K
 
V
E
 
Q
I
 
G
G
 
N
A
 
W
R
 
T
E
 
N
V
 
V
V
 
L
G
 
Y
D
 
D
T
 
D
K
 
Q
I
 
V
A
 
G
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
M
 
M
R
 
K
S
 
S
H
 
H
A
 
P
G
 
G
V
|
V
A
x
T
S
 
A
R
x
E
M
x
F
F
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
R
K
 
D
E
 
V
S
 
N
I
 
V
N
 
N
I
 
I
Q
 
E
M
 
L
I
 
I
S
 
S
T
 
T
S
 
S
E
 
E
I
 
I
K
 
R
V
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
L
I
 
I
E
 
R
E
 
E
K
 
D
Y
 
D
L
 
L
E
 
D
L
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
E
A
 
Q
F
 
F
E
 
Q
L
 
L

P41398 Aspartokinase; Aspartate kinase; EC 2.7.2.4 from Corynebacterium flavescens (see paper)
48% identity, 98% coverage: 1:405/413 of query aligns to 1:407/421 of P41398

query
sites
P41398
M
 
M
A
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
S
S
 
S
V
 
L
G
 
E
S
 
S
V
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
R
Q
 
N
V
 
V
A
 
A
D
 
E
K
 
R
V
 
I
K
 
V
K
 
A
F
 
T
R
 
K
D
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
N
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
C
S
 
S
A
 
A
M
 
M
S
 
G
G
 
D
E
 
T
T
 
T
N
 
D
R
 
E
L
 
L
I
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
A
I
 
V
S
 
N
G
 
-
D
 
-
Q
 
-
Q
 
-
P
 
P
L
 
V
P
 
P
-
 
P
-
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
M
D
 
D
V
 
M
I
 
L
V
 
L
S
 
T
T
 
A
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
V
 
I
T
 
S
I
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
I
N
 
E
K
 
S
R
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
E
A
 
A
V
 
Q
S
 
S
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
V
 
A
R
 
G
I
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
T
S
 
E
A
 
R
H
 
H
T
 
G
K
 
N
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
V
Q
 
D
I
 
V
D
 
T
D
 
P
Q
 
G
K
 
R
I
 
V
R
 
R
T
 
E
D
 
A
L
 
L
K
 
D
A
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
I
V
 
C
V
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
N
-
 
K
E
 
E
Q
 
T
G
 
R
N
 
D
I
 
V
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
N
A
 
A
D
 
D
E
 
V
C
 
C
Q
 
E
I
 
I
Y
 
Y
T
 
S
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
T
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
I
V
 
V
S
 
P
V
 
N
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
L
 
L
D
 
E
K
 
K
I
 
L
T
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
E
M
 
M
L
 
L
E
 
E
M
 
L
A
 
A
S
 
A
L
 
V
G
 
G
S
 
S
K
 
K
V
 
I
L
 
L
Q
 
V
I
 
L
R
 
R
A
 
S
V
 
V
E
 
E
F
 
Y
A
 
A
G
 
R
K
 
A
Y
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
R
H
 
S
S
 
S
F
 
Y
K
 
S
E
 
N
G
 
D
P
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
A
I
 
G
D
 
S
E
 
M
E
 
E
E
 
D
-
 
I
S
 
P
M
 
V
E
 
E
Q
 
E
P
 
A
I
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
A
F
 
T
N
 
D
R
 
K
D
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
L
 
V
T
 
T
I
 
V
R
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
S
D
 
D
T
 
K
P
 
P
G
 
G
V
 
E
A
 
A
F
 
A
K
 
K
I
 
V
L
 
F
G
 
R
P
 
A
I
 
L
S
 
A
G
 
D
A
 
A
N
 
E
I
 
I
E
 
N
V
 
I
D
 
D
M
 
M
I
 
V
V
 
L
Q
 
Q
N
 
N
V
 
V
S
 
S
-
 
S
-
 
V
H
 
E
D
 
D
N
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
F
 
I
T
 
T
F
 
F
T
 
T
V
 
C
H
 
P
R
 
R
N
 
A
E
 
D
Y
 
G
D
 
R
A
 
R
A
 
A
E
 
M
R
 
E
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
N
 
K
T
 
L
A
 
Q
K
 
V
E
 
Q
I
 
G
G
 
N
A
 
W
R
 
T
E
 
N
V
 
V
V
 
L
G
 
Y
D
 
D
T
 
D
K
 
Q
I
 
V
A
x
D
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
M
 
M
R
 
K
S
 
S
H
 
H
A
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
T
S
 
A
R
 
E
M
 
F
F
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
R
K
 
D
E
 
V
S
 
N
I
 
V
N
 
N
I
 
I
Q
 
E
M
 
L
I
 
I
S
 
S
T
 
T
S
 
S
E
 
E
I
 
I
K
 
R
V
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
L
I
 
I
E
 
R
E
 
E
K
 
D
Y
 
D
L
 
L
E
 
D
L
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
E
A
 
Q
F
 
F
E
 
Q
L
 
L

P61489 Aspartokinase; Aspartate kinase; AK; ASK; Threonine-sensitive AK; ThrA; EC 2.7.2.4 from Thermus thermophilus (see paper)
48% identity, 98% coverage: 1:406/413 of query aligns to 1:403/405 of P61489

query
sites
P61489
M
 
M
A
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
V
Q
 
Q
K
|
K
F
 
Y
G
|
G
G
|
G
T
 
T
S
 
S
V
 
V
G
 
G
S
 
D
V
 
L
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
H
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
D
 
Q
K
 
R
V
 
I
K
 
A
K
 
H
F
 
Y
R
 
R
D
 
E
A
 
K
G
 
G
D
 
H
D
 
R
L
 
L
V
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
V
S
|
S
A
|
A
M
 
M
S
 
G
G
 
H
E
 
T
T
|
T
N
 
D
R
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
R
I
 
V
S
 
-
G
 
-
D
 
N
Q
 
P
Q
 
R
P
 
P
L
 
P
P
 
F
R
 
R
E
 
E
L
 
L
D
 
D
V
 
L
I
 
L
V
 
T
S
 
T
T
 
T
G
 
G
E
|
E
Q
 
Q
V
 
V
T
 
S
I
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
S
M
 
M
A
 
Q
L
 
L
N
 
W
K
 
A
R
 
M
G
 
G
V
 
I
P
 
P
A
 
A
V
 
K
S
 
G
Y
 
F
T
 
V
G
 
Q
S
 
H
Q
 
Q
V
 
I
R
 
G
I
 
I
L
 
T
T
 
T
D
 
D
S
 
G
A
 
R
H
 
Y
T
 
G
K
 
D
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Q
 
E
I
 
V
D
 
N
D
 
P
Q
 
A
K
 
R
I
 
I
R
 
R
T
 
E
D
 
A
L
 
L
K
 
D
A
 
Q
G
 
G
R
 
F
V
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
|
G
F
 
F
Q
 
M
G
 
G
V
 
T
D
 
T
E
 
P
Q
 
E
G
 
G
N
 
E
I
 
I
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
|
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
|
D
T
 
T
T
 
T
G
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
G
A
 
A
D
 
K
E
 
E
C
 
C
Q
 
E
I
 
I
Y
 
Y
T
 
T
D
|
D
V
 
T
D
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
T
 
T
D
|
D
P
 
P
R
 
H
V
 
L
V
 
I
S
 
P
V
 
E
A
 
A
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
D
 
S
K
 
V
I
 
I
T
 
G
F
 
Y
E
 
D
E
 
Q
M
 
M
L
 
L
E
 
E
M
 
M
A
 
A
S
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
A
K
 
R
V
 
V
L
 
L
Q
 
H
I
 
P
R
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
Y
F
 
Y
A
 
A
G
 
K
K
 
R
Y
 
Y
N
 
G
V
 
V
P
 
V
L
 
L
R
 
H
V
 
V
L
 
R
H
 
S
S
 
S
F
 
F
K
 
S
E
 
Y
G
 
N
P
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
-
I
 
-
D
 
-
E
 
K
E
 
E
E
 
V
S
 
A
M
 
M
E
 
E
Q
 
M
-
 
D
P
 
K
I
 
A
I
 
V
S
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
A
F
 
L
N
 
D
R
 
L
D
 
D
E
 
H
A
 
A
K
 
Q
L
 
I
T
 
G
I
 
L
R
 
I
G
 
G
V
 
I
P
 
P
D
 
D
T
 
Q
P
 
P
G
 
G
V
 
I
A
 
A
F
 
A
K
 
K
I
 
V
L
 
F
G
 
Q
P
 
A
I
 
L
S
 
A
G
 
E
A
 
R
N
 
G
I
 
I
E
 
A
V
 
V
D
 
D
M
 
M
I
 
I
V
 
I
Q
 
Q
N
 
G
V
 
V
S
 
P
-
 
G
H
 
H
D
 
D
N
 
P
T
 
S
-
 
R
T
 
Q
D
 
Q
F
 
M
T
 
A
F
 
F
T
 
T
V
 
V
H
 
K
R
 
K
N
 
D
E
 
F
Y
 
A
D
 
Q
A
 
E
A
 
A
E
 
L
R
 
E
I
 
A
L
 
L
Q
 
E
N
 
P
T
 
V
A
 
L
K
 
A
E
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
G
R
 
-
E
 
E
V
 
A
V
 
I
G
 
L
D
 
R
T
 
P
K
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
I
V
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
 
L
R
 
A
S
 
S
H
 
T
A
 
P
G
 
E
V
 
V
A
 
P
S
 
A
R
 
K
M
 
M
F
 
F
E
 
Q
A
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
S
E
 
T
S
 
G
I
 
A
N
 
N
I
 
I
Q
 
E
M
 
M
I
 
I
S
 
A
T
 
T
S
 
S
E
 
E
I
 
V
K
 
R
V
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
I
I
 
I
E
 
P
E
 
A
K
 
E
Y
 
Y
L
 
A
E
 
E
L
 
A
A
 
A
V
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
V
H
 
H
T
 
Q
A
 
A
F
 
F
E
 
E
L
 
L
D
 
D

3aawC Crystal structure of aspartate kinase from corynebacterium glutamicum in complex with lysine and threonine (see paper)
47% identity, 98% coverage: 1:405/413 of query aligns to 1:390/392 of 3aawC

query
sites
3aawC
M
 
M
A
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
V
Q
 
Q
K
|
K
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
S
S
 
S
V
 
L
G
 
E
S
 
S
V
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
R
Q
 
N
V
 
V
A
 
A
D
 
E
K
 
R
V
 
I
K
 
V
K
 
A
F
 
T
R
 
K
D
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
N
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
C
S
|
S
A
 
A
M
 
M
S
 
G
G
 
D
E
 
T
T
 
T
N
 
D
R
 
E
L
 
L
I
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
A
I
 
V
S
 
N
G
 
-
D
 
-
Q
 
-
Q
 
-
P
 
P
L
 
V
P
 
P
-
 
P
-
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
M
D
 
D
V
 
M
I
 
L
V
 
L
S
 
T
T
 
A
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
V
 
I
T
 
S
I
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
I
N
 
E
K
 
S
R
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
E
A
 
A
V
 
Q
S
 
S
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
V
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
-
S
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
-
Q
 
D
I
 
V
D
 
T
D
 
P
Q
 
G
K
 
R
I
 
V
R
 
R
T
 
E
D
 
A
L
 
L
K
 
D
A
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
I
V
 
C
V
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
N
E
 
K
Q
 
R
G
 
-
N
 
D
I
 
V
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
|
G
S
|
S
D
|
D
T
 
T
T
 
T
G
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
N
A
 
A
D
 
D
E
 
V
C
 
C
Q
 
E
I
 
I
Y
 
Y
T
 
S
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
T
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
I
V
 
V
S
 
P
V
 
N
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
L
 
L
D
 
E
K
 
K
I
 
L
T
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
E
M
 
M
L
 
L
E
 
E
M
 
L
A
 
A
S
 
A
L
 
V
G
 
G
S
 
S
K
 
K
V
 
I
L
 
L
Q
 
V
I
 
L
R
 
R
A
 
S
V
 
V
E
 
E
F
 
Y
A
 
A
G
 
R
K
 
A
Y
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
R
H
 
S
S
 
S
F
 
Y
K
 
S
E
 
N
G
 
D
P
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
A
I
 
G
D
 
S
E
 
M
E
 
E
E
 
D
-
 
I
S
 
P
M
 
V
E
 
E
Q
 
E
P
 
A
I
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
A
F
 
T
N
 
D
R
 
K
D
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
L
 
V
T
 
T
I
 
V
R
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
S
D
 
D
T
x
K
P
 
P
G
|
G
V
x
E
A
|
A
F
 
A
K
 
K
I
 
V
L
 
F
G
 
R
P
 
A
I
 
L
S
 
A
G
 
D
A
 
A
N
 
E
I
 
I
E
 
N
V
 
I
D
 
D
M
 
M
I
 
V
V
 
L
Q
|
Q
N
 
N
V
 
V
S
 
S
-
 
S
-
 
V
H
 
E
D
 
D
N
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
F
 
I
T
 
T
F
 
F
T
 
T
V
 
C
H
 
P
R
 
R
N
 
S
E
 
D
Y
 
G
D
 
R
A
 
R
A
 
A
E
 
M
R
 
E
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
N
 
K
T
 
L
A
 
Q
K
 
V
E
 
Q
I
 
G
G
 
N
A
 
W
R
 
T
E
 
N
V
 
V
V
 
L
G
 
Y
D
 
D
T
 
D
K
 
Q
I
 
V
A
 
G
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
M
|
M
R
 
K
S
 
S
H
|
H
A
 
P
G
 
G
V
 
V
A
x
T
S
 
A
R
 
E
M
 
F
F
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
R
K
 
D
E
 
V
S
 
N
I
 
V
N
|
N
I
|
I
Q
 
E
M
 
L
I
 
I
S
 
S
T
 
T
S
|
S
E
 
E
I
 
I
K
 
R
V
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
L
I
 
I
E
 
R
E
 
E
K
 
D
Y
 
D
L
 
L
E
 
D
L
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
E
A
 
Q
F
 
F
E
 
Q
L
 
L

3l76A Crystal structure of aspartate kinase from synechocystis (see paper)
46% identity, 99% coverage: 2:411/413 of query aligns to 1:414/585 of 3l76A

query
sites
3l76A
A
 
A
L
 
L
I
 
I
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
F
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
S
V
 
V
G
 
G
S
 
T
V
 
V
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
Q
Q
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
Q
K
 
R
V
 
I
K
 
K
K
 
R
F
 
T
R
 
V
D
 
Q
A
 
G
G
 
G
D
 
N
D
 
S
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
V
S
 
S
A
 
A
M
 
M
S
 
G
G
 
K
E
 
S
T
 
T
N
 
D
R
 
V
L
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
A
 
Q
I
 
I
S
 
S
G
 
P
D
 
N
Q
 
-
Q
 
-
P
 
P
L
 
C
P
 
R
R
 
R
E
 
E
L
 
M
D
 
D
V
 
M
I
 
L
V
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
T
 
S
I
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
S
M
 
L
A
 
A
L
 
L
N
 
Q
K
 
E
R
 
I
G
 
D
V
 
Q
P
 
P
A
 
A
V
 
I
S
 
S
Y
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
V
 
V
R
 
G
I
 
I
L
 
V
T
 
T
D
 
E
S
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
I
L
 
L
Q
 
E
I
 
I
D
 
R
D
 
P
Q
 
D
K
 
R
I
 
L
R
 
E
T
 
H
D
 
H
L
 
L
K
 
R
A
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
V
 
I
D
 
H
E
 
L
Q
 
E
G
 
-
N
 
-
I
 
I
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
T
 
T
T
 
S
G
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
F
C
 
C
Q
 
E
I
 
I
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
P
G
 
G
V
 
I
Y
 
L
T
 
T
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
L
V
 
V
S
 
P
V
 
E
A
 
A
Q
 
Q
R
 
L
L
 
M
D
 
A
K
 
E
I
 
I
T
 
T
F
 
C
E
 
D
E
 
E
M
 
M
L
 
L
E
 
E
M
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
H
I
 
P
R
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
E
F
 
I
A
 
A
G
 
R
K
 
N
Y
 
Y
N
 
G
V
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
V
V
 
V
L
 
R
H
 
S
S
 
S
F
 
W
K
 
S
E
 
D
G
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
K
I
 
V
T
 
V
I
 
A
D
 
P
E
 
P
E
 
V
E
 
Q
S
 
N
M
 
R
E
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
I
Q
 
A
P
 
K
I
 
A
I
 
V
S
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
E
F
 
Y
N
 
D
R
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
K
 
K
L
 
V
T
 
A
I
 
L
R
 
L
G
 
R
V
 
V
P
 
P
D
 
D
T
x
R
P
 
P
G
 
G
V
|
V
A
|
A
F
 
S
K
 
K
I
 
L
L
 
F
G
 
R
P
 
D
I
 
I
S
 
A
G
 
Q
A
 
Q
N
 
Q
I
 
V
E
x
D
V
x
I
D
|
D
M
 
L
I
 
I
V
 
I
Q
|
Q
N
 
S
V
 
I
S
 
H
H
 
D
D
 
G
N
 
N
T
 
S
T
 
N
D
 
D
F
 
I
T
 
A
F
 
F
T
 
T
V
 
V
H
 
V
R
 
K
N
 
D
E
 
L
Y
 
L
D
 
N
A
 
T
A
 
A
E
 
E
R
 
A
I
 
V
L
 
T
Q
 
S
N
 
A
T
 
I
A
 
A
K
 
P
E
 
A
I
 
L
G
 
R
A
 
S
R
 
Y
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
Q
-
 
E
-
 
A
E
 
E
V
 
I
V
 
I
G
 
V
D
 
E
T
 
K
K
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
K
V
 
I
S
 
A
I
 
I
V
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
M
|
M
R
 
I
S
 
G
H
x
R
A
 
P
G
 
G
V
x
I
A
 
A
S
 
A
R
 
K
M
 
M
F
 
F
E
 
K
A
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
D
E
 
V
S
 
G
I
 
V
N
|
N
I
|
I
Q
 
E
M
 
M
I
 
I
S
 
S
T
 
T
S
|
S
E
|
E
I
 
V
K
 
K
V
 
V
S
 
S
V
 
C
V
 
V
I
 
I
E
 
D
E
 
Q
K
 
R
Y
 
D
L
 
A
E
 
D
L
 
R
A
 
A
V
 
I
R
 
A
A
 
A
L
 
L
H
 
S
T
 
N
A
 
A
F
 
F
-
 
G
-
 
V
E
 
T
L
 
L
D
 
S
A
 
P
P
 
P
A
 
K
R
 
N
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

3ab4A Crystal structure of feedback inhibition resistant mutant of aspartate kinase from corynebacterium glutamicum in complex with lysine and threonine (see paper)
44% identity, 98% coverage: 2:405/413 of query aligns to 1:369/370 of 3ab4A

query
sites
3ab4A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
S
S
 
S
V
 
L
G
 
E
S
 
S
V
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
R
Q
 
N
V
 
V
A
 
A
D
 
E
K
 
R
V
 
I
K
 
V
K
 
A
F
 
T
R
 
K
D
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
N
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
C
S
 
S
A
 
A
M
 
M
S
 
G
G
 
D
E
 
T
T
 
T
N
 
D
R
 
E
L
 
L
I
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
A
I
 
V
S
 
N
G
 
-
D
 
-
Q
 
-
Q
 
-
P
 
P
L
 
V
P
 
P
-
 
P
-
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
M
D
 
D
V
 
M
I
 
L
V
 
L
S
 
T
T
 
A
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
V
 
I
T
 
S
I
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
I
N
 
E
K
 
S
R
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
E
A
 
A
V
 
Q
S
 
S
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
Q
 
-
V
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
-
S
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
-
Q
 
-
I
 
V
D
 
T
D
 
P
Q
 
G
K
 
R
I
 
V
R
 
R
T
 
E
D
 
A
L
 
L
K
 
D
A
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
I
V
 
C
V
 
I
V
 
V
A
 
-
G
 
-
F
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
N
A
 
A
D
 
D
E
 
V
C
 
C
Q
 
E
I
 
I
Y
 
Y
T
 
S
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
T
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
I
V
 
V
S
 
P
V
 
N
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
L
 
L
D
 
E
K
 
K
I
 
L
T
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
E
M
 
M
L
 
L
E
 
E
M
 
L
A
 
A
S
 
A
L
 
V
G
 
G
S
 
S
K
 
K
V
 
I
L
 
L
Q
 
V
I
 
L
R
 
R
A
 
S
V
 
V
E
 
E
F
 
Y
A
 
A
G
 
R
K
 
A
Y
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
R
H
 
S
S
 
S
F
 
Y
K
 
S
E
 
N
G
 
D
P
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
A
I
 
G
D
 
S
E
 
M
E
 
E
E
 
D
-
 
I
S
 
P
M
 
V
E
 
E
Q
 
E
P
 
A
I
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
A
F
 
T
N
 
D
R
 
K
D
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
L
 
V
T
 
T
I
 
V
R
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
S
D
 
D
T
x
K
P
 
P
G
|
G
V
x
E
A
|
A
F
 
A
K
 
K
I
 
V
L
 
F
G
 
R
P
 
A
I
 
L
S
 
A
G
 
D
A
 
A
N
 
E
I
 
I
E
 
N
V
 
I
D
 
D
M
 
M
I
 
V
V
 
L
Q
|
Q
N
 
N
V
 
V
S
 
F
H
 
S
D
 
D
N
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
F
 
I
T
 
T
F
 
F
T
 
T
V
 
C
H
 
P
R
 
R
N
 
S
E
 
D
Y
 
G
D
 
R
A
 
R
A
 
A
E
 
M
R
 
E
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
N
 
K
T
 
L
A
 
Q
K
 
V
E
 
Q
I
 
G
G
 
N
A
 
W
R
 
T
E
 
N
V
 
V
V
 
L
G
 
Y
D
 
D
T
 
D
K
 
Q
I
 
V
A
 
G
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
M
|
M
R
 
K
S
 
S
H
|
H
A
x
P
G
 
G
V
|
V
A
x
T
S
 
A
R
 
E
M
 
F
F
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
R
K
 
D
E
 
V
S
 
N
I
 
V
N
|
N
I
|
I
Q
 
E
M
 
L
I
 
I
S
 
S
T
 
T
S
|
S
E
|
E
I
 
I
K
 
R
V
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
L
I
 
I
E
 
R
E
 
E
K
 
D
Y
 
D
L
 
L
E
 
D
L
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
E
A
 
Q
F
 
F
E
 
Q
L
 
L

2hmfA Structure of a threonine sensitive aspartokinase from methanococcus jannaschii complexed with mg-adp and aspartate (see paper)
34% identity, 97% coverage: 5:403/413 of query aligns to 3:461/464 of 2hmfA

query
sites
2hmfA
V
 
V
Q
 
M
K
 
K
F
 
F
G
|
G
G
 
G
T
 
T
S
 
S
V
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
R
Q
 
H
V
 
V
A
 
A
D
 
K
K
 
I
V
 
V
K
 
T
K
 
K
F
 
R
R
 
K
D
 
K
A
 
E
G
 
D
D
 
D
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
V
S
|
S
A
 
A
M
 
M
S
 
S
G
 
E
E
 
V
T
|
T
N
 
N
R
 
A
L
 
L
I
 
V
-
 
E
-
 
I
-
 
S
-
 
Q
-
 
Q
-
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
R
D
 
D
L
 
I
A
 
A
K
 
K
-
 
V
-
 
G
-
 
D
-
 
F
-
 
I
-
 
K
-
 
F
-
 
I
-
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
Y
-
 
K
-
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
E
A
 
A
I
 
I
S
 
K
G
 
S
D
 
E
Q
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
K
-
 
K
-
 
I
-
 
I
-
 
D
-
 
S
-
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
Q
 
E
P
 
L
L
 
T
P
 
P
R
 
K
E
 
S
L
 
R
D
 
D
V
 
Y
I
 
I
V
 
L
S
 
S
T
 
F
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
V
 
L
T
 
S
I
 
S
A
 
P
L
 
I
L
 
L
A
 
S
M
 
G
A
 
A
L
 
I
N
 
R
K
 
D
R
 
L
G
 
G
V
 
E
P
 
K
A
 
S
V
 
I
S
 
A
Y
 
L
T
 
E
G
 
G
S
 
G
Q
 
E
V
 
A
R
 
G
I
 
I
L
 
I
T
 
T
D
 
D
S
 
N
A
 
N
H
 
F
T
 
G
K
 
S
A
 
A
R
 
R
I
 
V
L
 
K
Q
 
R
I
 
L
D
 
E
-
 
V
D
 
K
Q
 
E
K
 
R
I
 
L
R
 
L
T
 
P
D
 
L
L
 
L
K
 
K
A
 
E
G
 
G
R
 
I
V
 
I
V
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
T
G
 
G
F
|
F
Q
 
I
G
 
G
V
 
T
D
 
T
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
N
 
Y
I
 
I
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
|
R
G
|
G
G
 
G
S
|
S
D
 
D
T
 
Y
T
 
S
G
 
A
V
 
A
A
 
L
L
 
I
A
 
G
A
 
Y
A
 
G
L
 
L
K
 
D
A
 
A
D
 
D
E
 
I
C
 
I
Q
 
E
I
 
I
Y
 
W
T
|
T
D
|
D
V
|
V
D
 
S
G
 
G
V
 
V
Y
|
Y
T
 
T
T
|
T
D
|
D
P
|
P
R
|
R
V
 
L
V
 
V
S
 
P
V
 
T
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
L
 
I
D
 
P
K
 
K
I
 
L
T
 
S
F
 
Y
E
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
E
 
E
M
 
L
A
 
A
S
 
Y
L
 
F
G
 
G
S
 
A
K
|
K
V
|
V
L
 
L
Q
 
H
I
 
P
R
 
R
A
 
T
V
 
I
E
 
E
F
 
P
A
 
A
G
 
M
K
 
E
Y
 
K
N
 
G
V
 
I
P
 
P
L
 
I
R
 
L
V
 
V
L
 
K
H
 
N
S
 
T
F
 
F
K
 
E
-
 
P
E
 
E
G
 
S
P
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
I
 
N
D
 
D
E
 
M
E
 
E
E
 
-
S
 
-
M
 
M
E
 
S
Q
 
D
P
 
S
I
 
I
I
 
V
S
 
K
G
 
A
I
 
I
A
 
S
F
 
T
N
 
I
R
 
K
D
 
N
E
 
V
A
 
A
K
 
L
L
 
I
T
 
N
I
 
I
-
 
F
-
 
G
R
 
A
G
 
G
V
 
M
P
 
V
D
 
G
T
 
V
P
 
S
G
 
G
V
 
T
A
 
A
F
 
A
K
 
R
I
 
I
L
 
F
G
 
K
P
 
A
I
 
L
S
 
G
G
 
E
A
 
E
N
 
E
I
 
V
E
 
N
V
 
V
D
 
I
M
 
L
I
 
I
V
 
S
Q
 
Q
N
 
G
V
 
S
S
 
S
H
 
E
D
 
-
N
 
-
T
 
-
T
 
T
D
 
N
F
 
I
T
 
S
F
 
L
T
 
V
V
 
V
H
 
S
R
 
E
N
 
E
E
 
D
Y
 
V
D
 
D
A
 
K
A
 
A
E
 
L
R
 
K
I
 
A
L
 
L
Q
 
K
N
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
R
E
 
E
I
 
F
G
 
G
-
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
N
-
 
N
-
 
N
-
 
L
A
 
I
R
 
R
E
 
D
V
 
V
V
 
S
G
 
V
D
 
D
T
 
K
K
 
D
I
 
V
A
 
C
K
 
V
V
 
I
S
 
S
I
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
M
 
M
R
 
R
S
 
G
H
 
A
A
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
S
 
G
R
 
K
M
 
I
F
 
F
E
 
T
A
 
A
L
 
V
A
 
S
K
 
E
E
 
S
S
 
G
I
 
A
N
 
N
I
 
I
Q
 
K
M
 
M
I
 
I
S
 
A
-
 
Q
-
 
G
T
 
S
S
 
S
E
 
E
I
 
V
K
 
N
V
 
I
S
 
S
V
 
F
V
 
V
I
 
I
E
 
D
E
 
E
K
 
K
Y
 
D
L
 
L
E
 
L
L
 
N
A
 
C
V
 
V
R
 
R
A
 
K
L
 
L
H
 
H
T
 
E
A
 
K
F
 
F

3c1mC Cyrstal structure of threonine-sensitive aspartokinase from methanococcus jannaschii with mgamp-pnp and l-aspartate (see paper)
34% identity, 97% coverage: 5:403/413 of query aligns to 3:465/468 of 3c1mC

query
sites
3c1mC
V
 
V
Q
 
M
K
|
K
F
 
F
G
|
G
G
|
G
T
 
T
S
 
S
V
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
R
Q
 
H
V
 
V
A
 
A
D
 
K
K
 
I
V
 
V
K
 
T
K
 
K
F
 
R
R
 
K
D
 
K
A
 
E
G
 
D
D
 
D
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
V
S
|
S
A
 
A
M
 
M
S
 
S
G
 
E
E
 
V
T
|
T
N
 
N
R
 
A
L
 
L
I
 
V
-
 
E
-
 
I
-
 
S
-
 
Q
-
 
Q
-
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
R
D
 
D
L
 
I
A
 
A
K
 
K
-
 
V
-
 
G
-
 
D
-
 
F
-
 
I
-
 
K
-
 
F
-
 
I
-
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
Y
-
 
K
-
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
E
A
 
A
I
 
I
S
 
K
G
 
S
D
 
E
Q
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
K
-
 
K
-
 
I
-
 
I
-
 
D
-
 
S
-
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
Q
 
E
P
 
L
L
 
T
P
 
P
R
 
K
E
 
S
L
 
R
D
 
D
V
 
Y
I
 
I
V
 
L
S
 
S
T
 
F
G
 
G
E
|
E
Q
 
R
V
 
L
T
 
S
I
 
S
A
 
P
L
 
I
L
 
L
A
 
S
M
 
G
A
 
A
L
 
I
N
 
R
K
 
D
R
 
L
G
 
G
V
 
E
P
 
K
A
 
S
V
 
I
S
 
A
Y
 
L
T
 
E
G
 
G
S
 
G
Q
 
E
V
 
A
R
 
G
I
 
I
L
 
I
T
 
T
D
 
D
S
 
N
A
 
N
H
 
F
T
 
G
K
 
S
A
 
A
R
 
R
I
 
V
L
 
K
Q
 
R
I
 
L
D
 
E
-
 
V
D
 
K
Q
 
E
K
 
R
I
 
L
R
 
L
T
 
P
D
 
L
L
 
L
K
 
K
A
 
E
G
 
G
R
 
I
V
 
I
V
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
T
G
 
G
F
|
F
Q
 
I
G
 
G
V
 
T
D
 
T
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
N
 
Y
I
 
I
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
|
R
G
|
G
G
 
G
S
|
S
D
 
D
T
 
Y
T
 
S
G
 
A
V
 
A
A
 
L
L
 
I
A
 
G
A
 
Y
A
 
G
L
 
L
K
 
D
A
 
A
D
 
D
E
 
I
C
 
I
Q
 
E
I
 
I
Y
 
W
T
|
T
D
|
D
V
 
V
D
 
S
G
 
G
V
 
V
Y
|
Y
T
 
T
T
 
T
D
|
D
P
|
P
R
|
R
V
 
L
V
 
V
S
 
P
V
 
T
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
L
 
I
D
 
P
K
 
K
I
 
L
T
 
S
F
 
Y
E
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
E
 
E
M
 
L
A
 
A
S
 
Y
L
 
F
G
 
G
S
 
A
K
|
K
V
|
V
L
 
L
Q
 
H
I
 
P
R
 
R
A
 
T
V
 
I
E
 
E
F
 
P
A
 
A
G
 
M
K
 
E
Y
 
K
N
 
G
V
 
I
P
 
P
L
 
I
R
 
L
V
 
V
L
 
K
H
 
N
S
 
T
F
 
F
K
 
E
-
 
P
E
 
E
G
 
S
P
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
I
 
N
D
 
D
E
 
M
E
 
E
E
 
-
S
 
-
M
 
M
E
 
S
Q
 
D
P
 
S
I
 
I
I
 
V
S
 
K
G
 
A
I
 
I
A
 
S
F
 
T
N
 
I
R
 
K
D
 
N
E
 
V
A
 
A
K
 
L
L
 
I
T
 
N
I
 
I
-
 
F
-
 
G
R
 
A
G
 
G
V
 
M
P
 
V
D
 
G
T
 
V
P
 
S
G
 
G
V
 
T
A
 
A
F
 
A
K
 
R
I
 
I
L
 
F
G
 
K
P
 
A
I
 
L
S
 
G
G
 
E
A
 
E
N
 
E
I
 
V
E
 
N
V
 
V
D
 
I
M
 
L
I
 
I
V
 
S
Q
 
Q
N
 
G
V
 
S
S
 
S
H
 
E
D
 
T
N
 
N
T
 
I
T
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
D
-
 
V
D
 
D
F
 
K
T
 
A
F
 
L
T
 
K
V
 
A
H
 
L
R
 
K
N
 
R
E
 
E
Y
 
F
-
 
G
D
 
D
A
 
G
A
 
K
E
 
K
R
 
S
I
 
F
L
 
L
Q
 
N
N
 
N
T
 
N
A
 
L
K
 
-
E
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
I
R
 
R
E
 
D
V
 
V
V
 
S
G
 
V
D
 
D
T
 
K
K
 
D
I
 
V
A
 
C
K
 
V
V
 
I
S
 
S
I
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
M
 
M
R
 
R
S
 
G
H
 
A
A
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
S
 
G
R
 
K
M
 
I
F
 
F
E
 
T
A
 
A
L
 
V
A
 
S
K
 
E
E
 
S
S
 
G
I
 
A
N
 
N
I
 
I
Q
 
K
M
 
M
I
 
I
S
 
A
-
 
Q
-
 
G
T
 
S
S
 
S
E
 
E
I
 
V
K
 
N
V
 
I
S
 
S
V
 
F
V
 
V
I
 
I
E
 
D
E
 
E
K
 
K
Y
 
D
L
 
L
E
 
L
L
 
N
A
 
C
V
 
V
R
 
R
A
 
K
L
 
L
H
 
H
T
 
E
A
 
K
F
 
F

3c1nA Crystal structure of allosteric inhibition threonine-sensitive aspartokinase from methanococcus jannaschii with l-threonine (see paper)
34% identity, 97% coverage: 5:403/413 of query aligns to 3:456/458 of 3c1nA

query
sites
3c1nA
V
 
V
Q
 
M
K
 
K
F
 
F
G
|
G
G
|
G
T
|
T
S
|
S
V
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
R
Q
 
H
V
 
V
A
 
A
D
 
K
K
 
I
V
 
V
K
 
T
K
 
K
F
 
R
R
 
K
D
 
K
A
 
E
G
 
D
D
 
D
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
V
S
 
S
A
 
A
M
 
M
S
 
S
G
 
E
E
 
V
T
 
T
N
 
N
R
 
A
L
 
L
I
 
V
-
 
E
-
 
I
-
 
S
-
 
Q
-
 
Q
-
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
R
D
 
D
L
 
I
A
 
A
K
 
K
-
 
V
-
 
G
-
 
D
-
 
F
-
 
I
-
 
K
-
 
F
-
 
I
-
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
Y
-
 
K
-
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
E
A
 
A
I
 
I
S
 
S
G
 
E
D
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
K
-
 
K
-
 
I
-
 
I
-
 
D
-
 
S
-
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
Q
 
G
Q
 
E
P
 
L
L
 
T
P
 
P
R
 
K
E
 
S
L
 
R
D
 
D
V
 
Y
I
 
I
V
 
L
S
 
S
T
 
F
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
V
 
L
T
 
S
I
 
S
A
 
P
L
 
I
L
 
L
A
 
S
M
 
G
A
 
A
L
 
I
N
 
R
K
 
D
R
 
L
G
 
G
V
 
E
P
 
K
A
 
S
V
 
I
S
 
A
Y
 
L
T
 
E
G
 
G
S
 
G
Q
 
E
V
 
A
R
 
G
I
 
I
L
 
I
T
 
T
D
 
D
S
 
N
A
 
N
H
 
F
T
 
G
K
 
S
A
 
A
R
 
R
I
 
V
L
 
K
Q
 
R
I
 
L
D
 
E
-
 
V
D
 
K
Q
 
E
K
 
R
I
 
L
R
 
L
T
 
P
D
 
L
L
 
L
K
 
K
A
 
E
G
 
G
R
 
I
V
 
I
V
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
T
G
 
G
F
 
F
Q
 
I
G
 
G
V
 
T
D
 
T
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
N
 
Y
I
 
I
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
T
 
Y
T
 
S
G
 
A
V
 
A
A
 
L
L
 
I
A
 
G
A
 
Y
A
 
G
L
 
L
K
 
D
A
 
A
D
 
D
E
 
I
C
 
I
Q
 
E
I
 
I
Y
x
W
T
|
T
D
|
D
V
 
V
D
 
S
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
L
V
 
V
S
 
P
V
 
T
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
L
 
I
D
 
P
K
 
K
I
 
L
T
 
S
F
 
Y
E
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
E
 
E
M
 
L
A
 
A
S
 
Y
L
 
F
G
 
G
S
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
H
I
 
P
R
 
R
A
 
T
V
 
I
E
 
E
F
 
P
A
 
A
G
 
M
K
 
E
Y
 
K
N
 
G
V
 
I
P
 
P
L
 
I
R
 
L
V
 
V
L
 
K
H
 
N
S
 
T
F
 
F
K
 
E
-
 
P
E
 
E
G
 
S
P
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
I
 
N
D
 
D
E
 
M
E
 
D
E
 
-
S
 
-
M
 
-
E
 
-
Q
 
-
P
 
S
I
 
I
I
 
V
S
 
K
G
 
A
I
 
I
A
 
S
F
 
T
N
 
I
R
 
K
D
 
N
E
 
V
A
 
A
K
 
L
L
 
I
T
 
N
I
 
I
-
 
F
-
 
G
R
 
A
G
 
G
V
 
M
P
 
V
D
 
G
T
 
V
P
 
S
G
 
G
V
 
T
A
 
A
F
 
A
K
 
R
I
 
I
L
 
F
G
 
K
P
 
A
I
 
L
S
 
G
G
 
E
A
 
E
N
 
E
I
 
V
E
 
N
V
 
V
D
 
I
M
 
L
I
 
I
V
 
S
Q
 
Q
N
 
G
V
 
S
S
 
S
H
 
E
D
 
-
N
 
-
T
 
-
T
 
T
D
 
N
F
 
I
T
 
S
F
 
L
T
 
V
V
 
V
H
 
S
R
 
E
N
 
E
E
 
D
Y
 
V
D
 
D
A
 
K
A
 
A
E
 
L
R
 
K
I
 
A
L
 
L
Q
 
K
N
 
R
T
 
E
A
 
F
K
 
G
E
 
D
I
 
L
G
 
N
A
 
N
-
 
N
-
 
L
-
 
I
R
 
R
E
 
D
V
 
V
V
 
S
G
 
V
D
 
D
T
 
K
K
 
D
I
 
V
A
 
C
K
 
V
V
 
I
S
 
S
I
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
M
 
M
R
 
R
S
 
G
H
x
A
A
 
K
G
 
G
V
x
I
A
|
A
S
 
G
R
 
K
M
 
I
F
 
F
E
 
T
A
 
A
L
 
V
A
 
S
K
 
E
E
 
S
S
 
G
I
 
A
N
|
N
I
|
I
Q
 
K
M
 
M
I
 
I
S
 
A
-
x
Q
-
 
G
T
 
S
S
 
S
E
|
E
I
 
V
K
 
N
V
 
I
S
 
S
V
 
F
V
 
V
I
 
I
E
 
D
E
 
E
K
 
K
Y
 
D
L
 
L
E
 
L
L
 
N
A
 
C
V
 
V
R
 
R
A
 
K
L
 
L
H
 
H
T
 
E
A
 
K
F
 
F

2re1A Crystal structure of aspartokinase alpha and beta subunits
58% identity, 37% coverage: 255:405/413 of query aligns to 2:148/148 of 2re1A

query
sites
2re1A
I
 
V
S
 
T
G
 
G
I
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
D
R
 
K
D
 
N
E
 
Q
A
 
A
K
 
R
L
 
I
T
 
N
I
 
V
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
K
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
F
 
Y
K
 
Q
I
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
A
I
 
V
S
 
A
G
 
D
A
 
A
N
 
N
I
 
I
E
 
E
V
 
V
D
 
D
M
 
M
I
 
I
V
 
I
Q
 
Q
N
 
N
V
 
-
S
 
-
H
 
-
D
 
-
N
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
F
 
F
T
 
S
F
 
F
T
 
T
V
 
V
H
 
P
R
 
R
N
 
G
E
 
D
Y
 
Y
D
 
K
A
 
Q
A
 
T
E
 
L
R
 
E
I
 
I
L
 
L
Q
 
S
N
 
E
T
 
R
A
 
Q
K
 
D
E
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
A
E
 
S
V
 
I
V
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
D
K
x
T
I
 
V
A
 
C
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
L
G
 
G
M
 
M
R
 
R
S
 
S
H
 
H
A
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
A
S
 
A
R
 
K
M
 
I
F
 
F
E
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
E
E
 
E
S
 
G
I
 
I
N
 
N
I
 
I
Q
 
Q
M
 
M
I
 
I
S
 
S
T
 
T
S
 
S
E
 
E
I
 
I
K
 
K
V
 
V
S
 
S
V
 
V
V
 
L
I
 
I
E
x
D
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
L
 
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
T
R
 
R
A
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
N
L
 
L

4go7X The regulatory subunit of aspartate kinase in complex with threonine from mycobacterium tuberculosis (see paper)
48% identity, 38% coverage: 250:407/413 of query aligns to 4:161/165 of 4go7X

query
sites
4go7X
M
 
M
E
 
E
Q
 
D
P
 
P
I
 
I
I
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
A
F
 
H
N
 
D
R
 
R
D
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
L
 
V
T
 
T
I
 
I
R
 
V
G
 
G
V
 
L
P
 
P
D
 
D
T
x
I
P
 
P
G
|
G
V
x
Y
A
|
A
F
 
A
K
 
K
I
 
V
L
 
F
G
 
R
P
 
A
I
 
V
S
 
A
G
 
D
A
 
A
N
 
D
I
 
V
E
 
N
V
 
I
D
 
D
M
 
M
I
 
V
V
 
L
Q
|
Q
N
 
N
V
 
V
S
 
S
H
 
K
D
 
D
N
 
G
T
 
K
T
 
T
D
 
D
F
 
I
T
 
T
F
 
F
T
 
T
V
 
C
H
 
S
R
 
R
N
 
D
E
 
V
Y
 
G
D
 
P
A
 
A
A
 
A
E
 
V
R
 
E
I
 
K
L
 
L
Q
 
D
N
 
S
T
 
L
A
 
R
K
 
N
E
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
F
R
 
S
E
 
Q
V
 
L
V
 
L
G
 
Y
D
 
D
T
 
D
K
 
H
I
 
I
A
 
G
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
A
G
 
G
M
 
M
R
 
R
S
 
S
H
 
H
A
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
T
S
 
A
R
 
T
M
 
F
F
 
C
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
A
E
 
V
S
 
G
I
 
V
N
 
N
I
 
I
Q
 
E
M
 
L
I
 
I
S
 
S
T
 
T
S
 
S
E
 
E
I
 
I
K
 
R
V
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
L
I
 
C
E
 
R
E
 
D
K
 
T
Y
 
E
L
 
L
E
 
D
L
 
K
A
 
A
V
 
V
R
 
V
A
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
E
A
 
A
F
 
F
E
 
G
L
 
L
D
 
E