SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF427 Psest_0431 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4e5kA Thermostable phosphite dehydrogenase in complex with NAD and sulfite (see paper)
96% identity, 98% coverage: 1:329/336 of query aligns to 1:329/329 of 4e5kA

query
sites
4e5kA
M
 
M
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
H
R
 
R
V
 
V
H
 
H
D
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
H
C
 
C
E
 
E
L
 
L
M
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
T
 
T
D
 
D
S
 
S
T
 
T
L
 
L
P
 
T
R
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
R
R
 
R
C
 
C
R
 
R
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
M
 
M
M
 
M
A
 
A
F
 
F
M
|
M
P
 
P
D
 
D
R
 
R
V
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
D
F
 
F
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
I
G
 
G
C
 
C
A
 
A
L
|
L
K
|
K
G
|
G
F
 
F
D
 
D
N
 
N
F
 
F
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
C
 
C
T
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
L
 
L
T
 
T
F
 
F
V
 
V
P
 
P
D
 
D
L
 
L
L
|
L
T
 
T
V
 
V
P
 
P
T
|
T
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
K
F
 
F
Q
 
R
G
 
G
W
 
W
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
D
 
D
N
 
N
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
F
L
 
L
G
|
G
M
 
M
G
|
G
A
|
A
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
W
 
W
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
H
|
H
E
|
E
A
|
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
Q
 
Q
T
 
T
E
 
E
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
C
 
C
S
 
S
E
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
A
S
 
S
S
 
S
D
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
A
|
A
L
|
L
P
|
P
L
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
T
 
T
Q
 
L
H
 
H
L
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
R
P
 
P
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
P
|
P
C
|
C
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
M
 
M
E
|
E
D
 
D
W
 
W
A
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
D
R
 
R
P
 
P
R
 
Q
L
 
Q
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
H
P
 
P
N
 
N
T
 
T
L
 
L
F
 
F
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
E
 
E
I
 
I
E
 
E
R
 
R
C
 
C
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
I
I
 
L
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
E
R
 
R
P
 
P
I
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
L
P
 
P

4e5pA Thermostable phosphite dehydrogenase a176r variant in complex with nad (see paper)
95% identity, 99% coverage: 1:332/336 of query aligns to 1:332/332 of 4e5pA

query
sites
4e5pA
M
 
M
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
H
R
 
R
V
 
V
H
 
H
D
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
H
C
 
C
E
 
E
L
 
L
M
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
T
 
T
D
 
D
S
 
S
T
 
T
L
 
L
P
 
T
R
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
R
R
 
R
C
 
C
R
 
R
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
M
 
M
M
 
M
A
 
A
F
 
F
M
 
M
P
 
P
D
 
D
R
 
R
V
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
D
F
 
F
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
I
G
 
G
C
 
C
A
 
A
L
 
L
K
|
K
G
 
G
F
 
F
D
 
D
N
 
N
F
 
F
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
C
 
C
T
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
L
 
L
T
 
T
F
 
F
V
 
V
P
 
P
D
 
D
L
 
L
L
|
L
T
 
T
V
 
V
P
 
P
T
|
T
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
Q
F
 
F
Q
 
R
G
 
G
W
 
W
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
D
 
D
N
 
N
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
F
L
 
L
G
 
G
M
 
M
G
|
G
A
|
A
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
W
 
W
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
H
 
H
E
x
A
A
x
R
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
Q
 
Q
T
 
T
E
 
E
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
C
 
C
S
 
S
E
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
A
S
 
S
S
 
S
D
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
|
L
P
|
P
L
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
T
|
T
Q
 
L
H
 
H
L
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
R
P
 
P
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
P
|
P
C
|
C
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
M
 
M
E
|
E
D
 
D
W
 
W
A
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
D
R
 
R
P
 
P
R
 
Q
L
 
Q
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
H
P
 
P
N
 
N
T
 
T
L
 
L
F
 
F
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
 
G
S
 
S
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
E
 
E
I
 
I
E
 
E
R
 
R
C
 
C
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
I
I
 
L
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
E
R
 
R
P
 
P
I
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
A
E
 
N

4e5mA Thermostable phosphite dehydrogenase e175a/a176r in complex with NADP (see paper)
95% identity, 98% coverage: 1:329/336 of query aligns to 1:329/329 of 4e5mA

query
sites
4e5mA
M
 
M
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
H
R
 
R
V
 
V
H
 
H
D
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
H
C
 
C
E
 
E
L
 
L
M
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
T
 
T
D
 
D
S
 
S
T
 
T
L
 
L
P
 
T
R
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
R
R
 
R
C
 
C
R
 
R
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
M
 
M
M
 
M
A
 
A
F
 
F
M
 
M
P
 
P
D
 
D
R
 
R
V
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
D
F
 
F
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
I
G
 
G
C
 
C
A
 
A
L
 
L
K
|
K
G
 
G
F
 
F
D
 
D
N
 
N
F
 
F
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
C
 
C
T
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
L
 
L
T
 
T
F
 
F
V
 
V
P
 
P
D
 
D
L
 
L
L
|
L
T
 
T
V
 
V
P
 
P
T
|
T
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
Q
F
 
F
Q
 
R
G
 
G
W
 
W
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
D
 
D
N
 
N
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
F
L
 
L
G
 
G
M
 
M
G
|
G
A
|
A
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
W
 
W
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
H
 
H
E
 
A
A
x
R
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
Q
 
Q
T
 
T
E
 
E
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
C
 
C
S
 
S
E
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
A
S
 
S
S
 
S
D
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
|
L
P
|
P
L
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
T
|
T
Q
 
L
H
 
H
L
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
R
P
 
P
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
P
|
P
C
|
C
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
M
 
M
E
|
E
D
 
D
W
 
W
A
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
D
R
 
R
P
 
P
R
 
Q
L
 
Q
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
H
P
 
P
N
 
N
T
 
T
L
 
L
F
 
F
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
E
 
E
I
 
I
E
 
E
R
 
R
C
 
C
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
I
I
 
L
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
E
R
 
R
P
 
P
I
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
L
P
 
P

6ih6A Phosphite dehydrogenase mutant i151r/p176r/m207a from ralstonia sp. 4506 in complex with non-natural cofactor nicotinamide cytosine dinucleotide
56% identity, 97% coverage: 1:327/336 of query aligns to 1:328/330 of 6ih6A

query
sites
6ih6A
M
 
M
L
 
K
P
 
P
K
 
K
L
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
T
H
 
H
R
 
W
V
 
V
H
 
H
D
 
P
E
 
E
I
 
I
L
 
I
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
S
P
 
A
H
 
S
C
 
A
E
 
D
L
 
V
M
 
I
T
 
P
N
 
N
Q
 
T
T
 
T
D
 
R
S
 
E
T
 
T
L
 
L
P
 
P
R
 
R
E
 
S
E
 
E
I
 
V
L
 
I
R
 
A
R
 
R
C
 
A
R
 
K
D
 
D
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
M
 
L
M
 
M
A
 
A
F
 
F
M
 
M
P
 
P
D
 
D
R
 
S
V
 
I
D
 
D
A
 
S
D
 
A
F
 
F
L
 
L
Q
 
E
A
 
E
C
 
C
P
 
P
E
 
K
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
I
G
 
G
C
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
F
 
F
D
 
D
V
 
V
D
 
N
A
 
A
C
 
C
T
 
T
A
 
R
R
 
H
G
 
G
V
 
V
W
 
W
L
 
L
T
 
T
F
 
I
V
 
V
P
 
P
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
I
P
 
P
T
|
T
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
L
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
T
R
 
R
H
 
H
L
 
M
R
 
L
A
 
E
A
 
G
D
 
D
A
 
R
F
 
Q
V
 
I
R
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
H
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
W
 
W
Q
 
R
P
 
P
Q
 
T
F
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
T
N
 
G
A
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
L
x
R
G
 
G
M
 
M
G
|
G
A
|
A
I
x
V
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
I
A
 
A
D
 
Q
R
 
R
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
W
 
F
G
 
E
A
 
M
T
 
N
L
 
L
Q
 
L
Y
 
Y
H
 
C
E
x
D
A
 
R
K
 
I
A
 
P
L
 
L
D
 
N
T
 
A
Q
 
E
T
 
Q
E
 
E
Q
 
K
R
 
A
L
 
W
G
 
H
L
 
V
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
T
C
 
L
S
 
D
E
 
E
L
 
L
F
 
L
A
 
E
S
 
K
S
 
C
D
 
D
F
 
Y
I
 
V
L
 
V
L
 
P
A
|
A
L
x
V
P
|
P
L
 
M
N
 
A
A
 
A
D
 
E
T
|
T
Q
 
L
H
 
H
L
 
L
V
 
I
N
 
D
A
 
A
E
 
T
L
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
K
V
 
M
R
 
K
P
 
T
G
 
G
A
 
S
L
 
Y
L
 
L
V
 
I
N
 
N
P
x
A
C
|
C
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
A
R
 
S
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
G
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
M
 
M
E
 
E
D
 
E
W
 
W
A
 
I
R
 
R
A
 
A
D
 
D
R
 
R
P
 
P
R
 
Q
L
 
A
I
 
I
D
 
P
P
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
D
H
 
N
P
 
T
-
 
A
N
 
Q
T
 
T
L
 
F
F
 
F
T
 
T
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
S
 
S
A
 
A
V
 
V
R
 
K
A
 
E
V
 
V
R
 
R
L
 
L
E
 
E
I
 
I
E
 
E
R
 
R
C
 
Q
A
 
A
A
 
A
Q
 
M
N
 
N
I
 
I
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
E
R
 
K
P
 
P
I
 
M
N
 
G
A
 
A
A
 
I
N
 
N
R
 
Q

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
34% identity, 97% coverage: 1:327/336 of query aligns to 1:323/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
M
 
M
L
 
K
P
 
P
K
 
K
L
 
V
V
 
F
I
 
I
T
 
T
H
 
R
R
 
A
V
 
I
H
 
P
D
 
E
E
 
N
I
 
G
L
 
I
Q
 
N
L
 
M
L
 
L
A
 
E
P
 
E
H
 
E
C
 
F
E
 
E
L
 
V
M
 
E
T
 
V
N
 
W
Q
 
E
T
 
E
D
 
E
S
 
R
T
 
E
L
 
I
P
 
P
R
 
R
E
 
E
E
 
K
I
 
L
L
 
L
R
 
E
R
 
K
C
 
V
R
 
K
D
 
D
A
 
V
Q
 
D
A
 
A
M
 
L
M
 
V
A
 
T
F
x
M
M
x
L
P
 
S
D
 
E
R
 
R
V
 
I
D
 
D
A
 
Q
D
 
E
F
 
V
L
 
F
Q
 
E
A
 
N
C
 
A
P
 
P
E
 
R
L
 
L
R
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
A
C
 
N
A
x
Y
L
x
A
K
x
V
G
|
G
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
F
 
I
D
 
D
V
 
V
D
 
E
A
 
E
C
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
I
W
 
Y
L
 
V
T
 
T
F
 
N
V
 
T
P
 
P
D
 
D
L
 
V
L
|
L
T
 
T
V
 
N
P
 
A
T
|
T
A
 
A
E
 
D
L
 
H
A
 
A
I
 
F
G
 
A
L
 
L
A
 
L
V
 
L
G
 
A
L
 
T
G
 
A
R
 
R
H
 
H
L
 
V
R
 
V
A
 
K
A
 
G
D
 
D
A
 
K
F
 
F
V
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
E
F
 
W
Q
 
K
-
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
I
G
 
A
W
 
W
Q
 
H
P
 
P
Q
 
K
-
 
W
F
 
F
Y
 
L
G
 
G
T
 
Y
G
 
E
L
 
L
D
 
Y
N
 
G
A
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
 
G
M
x
F
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
M
 
I
A
 
A
D
 
R
R
 
R
L
 
A
Q
 
K
G
 
G
W
 
F
G
 
N
A
 
M
T
 
R
L
 
I
Q
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
E
 
-
A
x
S
K
x
R
A
 
T
L
 
R
D
 
K
T
 
S
Q
 
Q
T
 
A
E
 
E
Q
 
K
R
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
A
R
 
E
R
 
Y
V
 
R
A
 
P
C
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
V
F
 
L
A
 
K
S
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
F
I
 
V
L
 
I
L
 
L
A
|
A
L
x
V
P
|
P
L
 
L
N
 
T
A
 
K
D
 
E
T
|
T
Q
 
M
H
 
Y
L
 
M
V
 
I
N
 
N
A
 
E
E
 
E
L
 
R
L
 
L
A
 
K
L
 
L
V
 
M
R
 
K
P
 
P
G
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
P
x
I
C
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
K
A
 
A
V
 
L
L
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
K
R
 
E
G
 
G
Q
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
Y
 
A
A
 
G
A
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
M
 
E
E
|
E
D
 
P
W
 
Y
A
 
Y
R
 
N
A
 
E
D
 
E
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
F
A
 
S
H
 
L
P
 
D
N
 
N
T
 
V
L
 
V
F
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
V
 
T
R
 
F
A
 
E
V
 
A
R
 
R
L
 
E
E
 
A
I
 
M
E
 
A
R
 
E
C
 
L
A
 
V
A
 
A
Q
 
R
N
 
N
I
 
L
I
 
I
Q
 
A
A
 
F
L
 
K
A
 
R
G
 
G
A
 
E
R
 
I
P
 
P
I
 
P
N
 
T
A
 
L
A
 
V
N
 
N
R
 
K

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
36% identity, 97% coverage: 3:327/336 of query aligns to 2:322/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
P
 
P
K
 
K
L
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
H
 
R
R
 
A
V
 
I
H
 
P
D
 
E
E
 
N
I
 
G
L
 
I
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
R
P
 
E
H
 
H
C
 
F
E
 
E
L
 
V
M
 
E
T
 
V
N
 
W
Q
 
E
T
 
H
D
 
E
S
 
H
T
 
E
L
 
I
P
 
P
R
 
R
E
 
E
E
 
V
I
 
L
L
 
L
R
 
E
R
 
K
C
 
V
R
 
K
D
 
D
A
 
V
Q
 
D
A
 
A
M
 
L
M
 
V
A
 
T
F
 
M
M
 
L
P
 
S
D
 
E
R
 
K
V
 
I
D
 
D
A
 
R
D
 
E
F
 
V
L
 
F
Q
 
D
A
 
A
C
 
A
P
 
P
E
 
R
L
 
L
R
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
A
C
 
N
A
 
Y
L
 
A
K
x
V
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
F
 
I
D
 
D
V
 
I
D
 
E
A
 
E
C
 
A
T
 
T
A
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
I
W
 
Y
L
 
V
T
 
T
F
 
N
V
 
T
P
 
P
D
 
D
L
 
V
L
|
L
T
 
T
V
 
D
P
 
A
T
|
T
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
I
 
W
G
 
A
L
 
L
A
 
L
V
 
L
G
 
A
L
 
A
G
 
A
R
 
R
H
 
H
L
 
V
R
 
V
A
 
K
A
 
G
D
 
D
A
 
K
F
 
F
V
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
E
F
 
W
Q
 
K
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
I
G
 
A
W
 
W
Q
 
H
P
 
P
Q
 
K
-
 
M
F
 
F
Y
 
L
G
 
G
T
 
Y
G
 
D
L
 
V
D
 
Y
N
 
G
A
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
|
G
M
x
F
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
M
 
I
A
 
A
D
 
K
R
 
R
L
 
A
Q
 
K
G
 
G
W
 
F
G
 
G
A
 
M
T
 
R
L
 
I
Q
 
L
Y
 
Y
H
 
-
E
 
T
A
|
A
K
x
R
A
x
S
L
 
R
D
x
K
T
 
P
Q
 
E
T
 
A
E
 
E
Q
 
K
R
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
A
R
 
E
R
 
F
V
 
K
A
 
P
C
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
L
F
 
L
A
 
R
S
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
F
I
 
V
L
 
V
L
 
L
A
 
A
L
x
V
P
|
P
L
 
L
N
 
T
A
 
K
D
x
E
T
|
T
Q
 
Y
H
 
H
L
 
M
V
 
I
N
 
N
A
 
E
E
 
E
L
 
R
L
 
L
A
 
R
L
 
L
V
 
M
R
 
K
P
 
P
G
 
T
A
 
A
L
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
P
x
V
C
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
K
A
 
A
V
 
L
L
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
K
R
 
E
G
 
G
Q
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
A
Y
 
A
A
 
G
A
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
M
 
E
E
|
E
D
 
P
W
 
Y
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
Y
D
 
D
P
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
F
A
 
A
H
 
L
P
 
D
N
 
N
T
 
V
L
 
V
F
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
V
 
T
R
 
F
A
 
G
V
 
A
R
 
R
L
 
E
E
 
G
I
 
M
E
 
A
R
 
E
C
 
L
A
 
V
A
 
A
Q
 
K
N
 
N
I
 
L
I
 
I
Q
 
A
A
 
F
L
 
K
A
 
N
G
 
G
A
 
E
R
 
V
P
 
P
I
 
P
N
 
T
A
 
L
A
 
V
N
 
N
R
 
R

O58320 Glyoxylate reductase; EC 1.1.1.26 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3)
33% identity, 97% coverage: 1:327/336 of query aligns to 1:323/334 of O58320

query
sites
O58320
M
 
M
L
 
K
P
 
P
K
 
K
L
 
V
V
 
F
I
 
I
T
 
T
H
 
R
R
 
E
V
 
I
H
 
P
D
 
E
E
 
V
I
 
G
L
 
I
Q
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
E
P
 
D
H
 
E
C
 
F
E
 
E
L
 
V
M
 
E
T
 
V
N
 
W
Q
 
G
T
 
D
D
 
E
S
 
K
T
 
E
L
 
I
P
 
P
R
 
R
E
 
E
E
 
I
I
 
L
L
 
L
R
 
K
R
 
K
C
 
V
R
 
K
D
 
E
A
 
V
Q
 
D
A
 
A
M
 
L
M
 
V
A
 
T
F
 
M
M
 
L
P
 
S
D
 
E
R
 
R
V
 
I
D
 
D
A
 
K
D
 
E
F
 
V
L
 
F
Q
 
E
A
 
N
C
 
A
P
 
P
E
 
K
L
 
L
R
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
A
C
 
N
A
 
Y
L
 
A
K
 
V
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
F
 
I
D
 
D
V
 
I
D
 
E
A
 
E
C
 
A
T
 
T
A
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
I
W
 
Y
L
 
V
T
 
T
F
 
N
V
 
T
P
 
P
D
 
D
L
 
V
L
 
L
T
 
T
V
 
D
P
 
A
T
 
T
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
I
 
F
G
 
A
L
 
L
A
 
L
V
 
L
G
 
A
L
 
T
G
 
A
R
 
R
H
 
H
L
 
V
R
 
V
A
 
K
A
 
G
D
 
D
A
 
R
F
 
F
V
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
E
F
 
W
Q
 
K
-
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
V
G
 
A
W
 
W
Q
 
H
P
 
P
Q
 
K
-
 
W
F
 
F
Y
 
L
G
 
G
T
 
Y
G
 
D
L
 
V
D
 
Y
N
 
G
A
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
M
x
L
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
M
 
I
A
 
A
D
 
K
R
 
R
L
 
A
Q
 
K
G
 
G
W
 
F
G
 
N
A
 
M
T
 
R
L
 
I
Q
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
E
 
-
A
x
S
K
x
R
A
x
T
L
 
R
D
 
K
T
 
E
Q
 
E
T
 
V
E
 
E
Q
 
R
R
 
E
L
 
L
G
 
N
L
 
A
R
 
E
R
 
F
V
 
K
A
 
P
C
 
L
S
 
E
E
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
R
S
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
F
I
 
V
L
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
L
N
 
T
A
 
R
D
 
E
T
 
T
Q
 
Y
H
 
H
L
 
L
V
 
I
N
 
N
A
 
E
E
 
E
L
 
R
L
 
L
A
 
K
L
 
L
V
 
M
R
 
K
P
 
K
G
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
P
x
I
C
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
N
A
 
A
V
 
L
L
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
K
R
 
E
G
 
G
Q
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
Y
 
A
A
 
G
A
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
M
 
E
E
 
E
D
 
P
W
 
Y
A
 
Y
R
 
N
A
 
E
D
 
E
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
F
A
 
K
H
 
L
P
 
D
N
 
N
T
 
V
L
 
V
F
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
|
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
V
 
S
R
 
F
A
 
G
V
 
A
R
 
R
L
 
E
E
 
G
I
 
M
E
 
A
R
 
E
C
 
L
A
 
V
A
 
A
Q
 
K
N
 
N
I
 
L
I
 
I
Q
 
A
A
 
F
L
 
K
A
 
R
G
 
G
A
 
E
R
 
I
P
 
P
I
 
P
N
 
T
A
 
L
A
 
V
N
 
N
R
 
R

2dbqA Crystal structure of glyoxylate reductase (ph0597) from pyrococcus horikoshii ot3, complexed with NADP (i41) (see paper)
33% identity, 97% coverage: 1:327/336 of query aligns to 1:323/333 of 2dbqA

query
sites
2dbqA
M
 
M
L
 
K
P
 
P
K
 
K
L
 
V
V
 
F
I
 
I
T
 
T
H
 
R
R
 
E
V
 
I
H
 
P
D
 
E
E
 
V
I
 
G
L
 
I
Q
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
E
P
 
D
H
 
E
C
 
F
E
 
E
L
 
V
M
 
E
T
 
V
N
 
W
Q
 
G
T
 
D
D
 
E
S
 
K
T
 
E
L
 
I
P
 
P
R
 
R
E
 
E
E
 
I
I
 
L
L
 
L
R
 
K
R
 
K
C
 
V
R
 
K
D
 
E
A
 
V
Q
 
D
A
 
A
M
 
L
M
 
V
A
 
T
F
 
M
M
 
L
P
 
S
D
 
E
R
 
R
V
 
I
D
 
D
A
 
K
D
 
E
F
 
V
L
 
F
Q
 
E
A
 
N
C
 
A
P
 
P
E
 
K
L
 
L
R
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
A
C
 
N
A
 
Y
L
 
A
K
x
V
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
F
 
I
D
 
D
V
 
I
D
 
E
A
 
E
C
 
A
T
 
T
A
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
I
W
 
Y
L
 
V
T
 
T
F
 
N
V
 
T
P
 
P
D
 
D
L
 
V
L
|
L
T
 
T
V
 
D
P
 
A
T
|
T
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
I
 
F
G
 
A
L
 
L
A
 
L
V
 
L
G
 
A
L
 
T
G
 
A
R
 
R
H
 
H
L
 
V
R
 
V
A
 
K
A
 
G
D
 
D
A
 
R
F
 
F
V
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
E
F
 
W
Q
 
K
-
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
V
G
 
A
W
 
W
Q
 
H
P
 
P
Q
 
K
-
 
W
F
 
F
Y
 
L
G
 
G
T
 
Y
G
 
D
L
 
V
D
 
Y
N
 
G
A
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
M
x
L
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
M
 
I
A
 
A
D
 
K
R
 
R
L
 
A
Q
 
K
G
 
G
W
 
F
G
 
N
A
 
M
T
 
R
L
 
I
Q
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
E
 
-
A
x
S
K
x
R
A
x
T
L
 
R
D
 
K
T
 
E
Q
 
E
T
 
V
E
 
E
Q
 
R
R
 
E
L
 
L
G
 
N
L
 
A
R
 
E
R
 
F
V
 
K
A
 
P
C
 
L
S
 
E
E
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
R
S
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
F
I
 
V
L
 
V
L
 
L
A
|
A
L
x
V
P
|
P
L
 
L
N
 
T
A
 
R
D
 
E
T
|
T
Q
 
Y
H
 
H
L
 
L
V
 
I
N
 
N
A
 
E
E
 
E
L
 
R
L
 
L
A
 
K
L
 
L
V
 
M
R
 
K
P
 
K
G
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
P
x
I
C
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
N
A
 
A
V
 
L
L
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
K
R
 
E
G
 
G
Q
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
Y
 
A
A
 
G
A
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
M
 
E
E
|
E
D
 
P
W
 
Y
A
 
Y
R
 
N
A
 
E
D
 
E
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
F
A
 
K
H
 
L
P
 
D
N
 
N
T
 
V
L
 
V
F
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
V
 
S
R
 
F
A
 
G
V
 
A
R
 
R
L
 
E
E
 
G
I
 
M
E
 
A
R
 
E
C
 
L
A
 
V
A
 
A
Q
 
K
N
 
N
I
 
L
I
 
I
Q
 
A
A
 
F
L
 
K
A
 
R
G
 
G
A
 
E
R
 
I
P
 
P
I
 
P
N
 
T
A
 
L
A
 
V
N
 
N
R
 
R

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
33% identity, 84% coverage: 33:314/336 of query aligns to 30:297/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
T
 
N
L
 
L
P
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
I
R
 
A
R
 
E
C
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
Q
 
E
A
 
G
M
 
L
M
 
I
A
 
V
F
 
R
M
 
S
P
 
A
D
 
T
R
 
K
V
 
V
D
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
L
 
I
Q
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
E
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
C
 
R
A
 
A
L
 
G
K
 
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
N
 
N
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
W
 
L
L
 
V
T
 
M
F
 
N
V
 
T
P
 
P
D
 
N
L
 
G
L
 
N
T
 
S
V
 
L
P
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
I
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
V
 
M
G
 
C
L
 
L
G
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
R
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
V
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
F
 
W
Q
 
E
G
 
-
W
 
-
Q
 
R
P
 
K
Q
 
K
F
 
F
Y
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
D
 
N
N
 
G
A
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
|
G
M
x
L
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
|
G
L
 
R
A
 
E
M
 
V
A
 
A
D
 
T
R
 
R
L
 
M
Q
 
Q
G
 
S
W
 
F
G
 
G
-
 
M
A
 
K
T
 
T
L
 
I
Q
 
G
Y
 
Y
H
x
D
E
 
-
A
 
-
K
 
P
A
 
I
L
 
I
D
 
S
T
 
P
Q
 
E
T
 
V
E
 
S
Q
 
A
R
 
S
L
 
F
G
 
G
L
 
V
R
 
Q
R
 
Q
V
 
L
A
 
P
C
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
S
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
T
L
 
V
A
x
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
A
 
P
D
 
S
T
 
T
Q
 
T
H
 
G
L
 
L
V
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
L
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
V
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
P
 
C
C
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
G
 
A
G
 
G
Y
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
M
 
E
E
 
E
D
 
P
W
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
P
R
 
R
L
 
-
I
 
-
D
 
D
P
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
T
 
V
L
 
I
F
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
V
 
T
R
 
K
A
 
E
V
 
A
R
 
Q
L
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
S
R
 
R
C
 
C
A
 
G
A
 
E
Q
 
E
N
 
I
I
 
A
I
 
V
Q
 
Q

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
33% identity, 84% coverage: 33:314/336 of query aligns to 30:297/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
T
 
N
L
 
L
P
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
I
R
 
A
R
 
E
C
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
Q
 
E
A
 
G
M
 
L
M
 
I
A
 
V
F
 
R
M
 
S
P
 
A
D
 
T
R
 
K
V
 
V
D
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
L
 
I
Q
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
E
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
C
 
R
A
 
A
L
 
G
K
 
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
N
 
N
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
W
 
L
L
 
V
T
 
M
F
 
N
V
 
T
P
 
P
D
 
N
L
 
G
L
 
N
T
 
S
V
 
L
P
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
I
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
V
 
M
G
 
C
L
 
L
G
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
R
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
V
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
F
 
W
Q
 
E
G
 
-
W
 
-
Q
 
R
P
 
K
Q
 
K
F
 
F
Y
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
D
 
N
N
 
G
A
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
L
G
|
G
A
 
R
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
E
M
 
V
A
 
A
D
 
T
R
 
R
L
 
M
Q
 
Q
G
 
S
W
 
F
G
 
G
-
 
M
A
 
K
T
 
T
L
 
I
Q
 
G
Y
|
Y
H
x
D
E
 
-
A
 
-
K
x
P
A
x
I
L
x
I
D
 
S
T
 
P
Q
 
E
T
 
V
E
 
S
Q
 
A
R
 
S
L
 
F
G
 
G
L
 
V
R
 
Q
R
 
Q
V
 
L
A
 
P
C
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
S
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
T
L
 
V
A
 
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
A
 
P
D
 
S
T
 
T
Q
 
T
H
 
G
L
|
L
V
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
L
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
V
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
P
 
C
C
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
G
 
A
G
 
G
Y
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
M
 
E
E
 
E
D
 
P
W
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
P
R
 
R
L
 
-
I
 
-
D
 
D
P
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
T
 
V
L
 
I
F
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
V
 
T
R
 
K
A
 
E
V
 
A
R
 
Q
L
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
S
R
 
R
C
 
C
A
 
G
A
 
E
Q
 
E
N
 
I
I
 
A
I
 
V
Q
 
Q

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
33% identity, 84% coverage: 33:314/336 of query aligns to 30:297/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
T
 
N
L
 
L
P
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
I
R
 
A
R
 
E
C
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
Q
 
E
A
 
G
M
 
L
M
 
I
A
 
V
F
 
R
M
 
S
P
 
A
D
 
T
R
 
K
V
 
V
D
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
L
 
I
Q
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
E
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
C
 
R
A
 
A
L
 
G
K
 
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
N
 
N
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
W
 
L
L
 
V
T
 
M
F
 
N
V
 
T
P
 
P
D
 
N
L
 
G
L
 
N
T
 
S
V
 
L
P
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
I
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
V
 
M
G
 
C
L
 
L
G
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
R
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
V
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
F
 
W
Q
 
E
G
 
-
W
 
-
Q
 
R
P
 
K
Q
 
K
F
 
F
Y
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
D
 
N
N
 
G
A
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
E
M
 
V
A
 
A
D
 
T
R
 
R
L
 
M
Q
 
Q
G
 
S
W
 
F
G
 
G
-
 
M
A
 
K
T
 
T
L
 
I
Q
 
G
Y
|
Y
H
x
D
E
 
-
A
 
-
K
x
P
A
 
I
L
x
I
D
 
S
T
 
P
Q
 
E
T
 
V
E
 
S
Q
 
A
R
 
S
L
 
F
G
 
G
L
 
V
R
 
Q
R
 
Q
V
 
L
A
 
P
C
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
S
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
T
L
 
V
A
x
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
A
 
P
D
 
S
T
 
T
Q
 
T
H
 
G
L
|
L
V
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
L
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
V
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
P
 
C
C
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
G
 
A
G
 
G
Y
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
M
 
E
E
 
E
D
 
P
W
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
P
R
 
R
L
 
-
I
 
-
D
 
D
P
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
T
 
V
L
 
I
F
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
V
 
T
R
 
K
A
 
E
V
 
A
R
 
Q
L
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
S
R
 
R
C
 
C
A
 
G
A
 
E
Q
 
E
N
 
I
I
 
A
I
 
V
Q
 
Q

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
33% identity, 84% coverage: 33:314/336 of query aligns to 30:297/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
T
 
N
L
 
L
P
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
I
R
 
A
R
 
E
C
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
Q
 
E
A
 
G
M
 
L
M
 
I
A
 
V
F
 
R
M
 
S
P
 
A
D
 
T
R
 
K
V
 
V
D
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
L
 
I
Q
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
E
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
C
 
R
A
 
A
L
 
G
K
 
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
N
 
N
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
W
 
L
L
 
V
T
 
M
F
 
N
V
 
T
P
 
P
D
 
N
L
 
G
L
 
N
T
 
S
V
 
L
P
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
I
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
V
 
M
G
 
C
L
 
L
G
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
R
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
V
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
F
 
W
Q
 
E
G
 
-
W
 
-
Q
 
R
P
 
K
Q
 
K
F
 
F
Y
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
D
 
N
N
 
G
A
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
L
G
|
G
A
x
R
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
E
M
 
V
A
 
A
D
 
T
R
 
R
L
 
M
Q
 
Q
G
 
S
W
 
F
G
 
G
-
 
M
A
 
K
T
 
T
L
 
I
Q
 
G
Y
 
Y
H
x
D
E
 
-
A
 
-
K
x
P
A
x
I
L
x
I
D
 
S
T
 
P
Q
 
E
T
 
V
E
 
S
Q
 
A
R
 
S
L
 
F
G
 
G
L
 
V
R
 
Q
R
 
Q
V
 
L
A
 
P
C
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
S
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
T
L
 
V
A
x
H
L
x
T
P
 
P
L
 
L
N
x
L
A
 
P
D
 
S
T
 
T
Q
 
T
H
 
G
L
 
L
V
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
L
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
V
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
P
 
C
C
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
G
 
A
G
 
G
Y
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
M
 
E
E
 
E
D
 
P
W
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
P
R
 
R
L
 
-
I
 
-
D
 
D
P
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
T
 
V
L
 
I
F
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
V
 
T
R
 
K
A
 
E
V
 
A
R
 
Q
L
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
S
R
 
R
C
 
C
A
 
G
A
 
E
Q
 
E
N
 
I
I
 
A
I
 
V
Q
 
Q

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
33% identity, 84% coverage: 33:314/336 of query aligns to 29:296/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
T
 
N
L
 
L
P
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
I
R
 
A
R
 
E
C
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
Q
 
E
A
 
G
M
 
L
M
 
I
A
 
V
F
 
R
M
 
S
P
 
A
D
 
T
R
 
K
V
 
V
D
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
L
 
I
Q
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
E
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
C
 
R
A
 
A
L
 
G
K
 
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
N
 
N
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
W
 
L
L
 
V
T
 
M
F
 
N
V
 
T
P
 
P
D
 
N
L
 
G
L
x
N
T
 
S
V
 
L
P
 
S
T
x
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
I
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
V
 
M
G
 
C
L
 
L
G
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
R
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
V
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
F
 
W
Q
 
E
G
 
-
W
 
-
Q
 
R
P
 
K
Q
 
K
F
 
F
Y
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
D
 
N
N
 
G
A
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
E
M
 
V
A
 
A
D
 
T
R
 
R
L
 
M
Q
 
Q
G
 
S
W
 
F
G
 
G
-
 
M
A
 
K
T
 
T
L
 
I
Q
 
G
Y
|
Y
H
x
D
E
 
-
A
 
-
K
x
P
A
x
I
L
 
I
D
 
S
T
 
P
Q
 
E
T
 
V
E
 
S
Q
 
A
R
 
S
L
 
F
G
 
G
L
 
V
R
 
Q
R
 
Q
V
 
L
A
 
P
C
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
S
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
T
L
 
V
A
x
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
A
 
P
D
 
S
T
|
T
Q
 
T
H
 
G
L
 
L
V
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
L
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
V
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
P
x
C
C
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
G
 
A
G
 
G
Y
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
M
 
E
E
 
E
D
 
P
W
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
P
R
 
R
L
 
-
I
 
-
D
 
D
P
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
T
 
V
L
 
I
F
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
|
G
S
 
A
A
 
S
V
 
T
R
 
K
A
 
E
V
 
A
R
 
Q
L
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
S
R
 
R
C
 
C
A
 
G
A
 
E
Q
 
E
N
 
I
I
 
A
I
 
V
Q
 
Q

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
33% identity, 84% coverage: 33:314/336 of query aligns to 31:298/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
T
 
N
L
 
L
P
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
I
R
 
A
R
 
E
C
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
Q
 
E
A
 
G
M
 
L
M
 
I
A
 
V
F
 
R
M
 
S
P
 
A
D
 
T
R
 
K
V
 
V
D
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
L
 
I
Q
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
E
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
C
 
R
A
 
A
L
 
G
K
 
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
N
 
N
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
W
 
L
L
 
V
T
 
M
F
 
N
V
 
T
P
 
P
D
 
N
L
 
G
L
 
N
T
 
S
V
 
L
P
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
I
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
V
 
M
G
 
C
L
 
L
G
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
R
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
V
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
F
 
W
Q
 
E
G
 
-
W
 
-
Q
 
R
P
 
K
Q
 
K
F
 
F
Y
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
D
 
N
N
 
G
A
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
E
M
 
V
A
 
A
D
 
T
R
 
R
L
 
M
Q
 
Q
G
 
S
W
 
F
G
 
G
-
 
M
A
 
K
T
 
T
L
 
I
Q
 
G
Y
|
Y
H
x
D
E
 
-
A
 
-
K
x
P
A
 
I
L
 
I
D
 
S
T
 
P
Q
 
E
T
 
V
E
 
S
Q
 
A
R
 
S
L
 
F
G
 
G
L
 
V
R
 
Q
R
 
Q
V
 
L
A
 
P
C
x
L
S
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
S
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
T
L
 
V
A
x
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
A
 
P
D
 
S
T
 
T
Q
 
T
H
 
G
L
|
L
V
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
L
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
V
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
P
 
C
C
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
G
 
A
G
 
G
Y
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
M
 
E
E
 
E
D
 
P
W
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
P
R
 
R
L
 
-
I
 
-
D
 
D
P
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
T
 
V
L
 
I
F
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
V
 
T
R
 
K
A
 
E
V
 
A
R
 
Q
L
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
S
R
 
R
C
 
C
A
 
G
A
 
E
Q
 
E
N
 
I
I
 
A
I
 
V
Q
 
Q

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
33% identity, 84% coverage: 33:314/336 of query aligns to 29:296/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
T
 
N
L
 
L
P
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
I
R
 
A
R
 
E
C
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
Q
 
E
A
 
G
M
 
L
M
 
I
A
 
V
F
 
R
M
 
S
P
 
A
D
 
T
R
 
K
V
 
V
D
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
L
 
I
Q
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
E
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
C
 
R
A
 
A
L
 
G
K
 
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
N
 
N
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
W
 
L
L
 
V
T
 
M
F
 
N
V
 
T
P
 
P
D
 
N
L
 
G
L
 
N
T
 
S
V
 
L
P
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
I
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
V
 
M
G
 
C
L
 
L
G
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
R
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
V
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
F
 
W
Q
 
E
G
 
-
W
 
-
Q
 
R
P
 
K
Q
 
K
F
 
F
Y
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
D
 
N
N
 
G
A
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
E
M
 
V
A
 
A
D
 
T
R
 
R
L
 
M
Q
 
Q
G
 
S
W
 
F
G
 
G
-
 
M
A
 
K
T
 
T
L
 
I
Q
 
G
Y
|
Y
H
x
D
E
 
-
A
 
-
K
x
P
A
x
I
L
x
I
D
 
S
T
 
P
Q
 
E
T
 
V
E
 
S
Q
 
A
R
 
S
L
 
F
G
 
G
L
 
V
R
 
Q
R
 
Q
V
 
L
A
 
P
C
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
S
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
T
L
 
V
A
x
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
A
 
P
D
 
S
T
 
T
Q
 
T
H
 
G
L
|
L
V
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
L
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
V
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
P
 
C
C
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
G
 
A
G
 
G
Y
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
M
 
E
E
 
E
D
 
P
W
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
P
R
 
R
L
 
-
I
 
-
D
 
D
P
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
T
 
V
L
 
I
F
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
V
 
T
R
 
K
A
 
E
V
 
A
R
 
Q
L
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
S
R
 
R
C
 
C
A
 
G
A
 
E
Q
 
E
N
 
I
I
 
A
I
 
V
Q
 
Q

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
33% identity, 84% coverage: 33:314/336 of query aligns to 31:298/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
T
 
N
L
 
L
P
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
I
R
 
A
R
 
E
C
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
Q
 
E
A
 
G
M
 
L
M
 
I
A
 
V
F
 
R
M
 
S
P
 
A
D
 
T
R
 
K
V
 
V
D
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
L
 
I
Q
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
E
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
C
 
R
A
 
A
L
 
G
K
x
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
N
 
N
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
W
 
L
L
 
V
T
 
M
F
 
N
V
 
T
P
 
P
D
 
N
L
 
G
L
 
N
T
 
S
V
 
L
P
 
S
T
x
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
I
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
V
 
M
G
 
C
L
 
L
G
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
R
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
V
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
F
 
W
Q
 
E
G
 
-
W
 
-
Q
 
R
P
 
K
Q
 
K
F
 
F
Y
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
D
 
N
N
 
G
A
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
|
G
M
 
L
G
 
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
E
M
 
V
A
 
A
D
 
T
R
 
R
L
 
M
Q
 
Q
G
 
S
W
 
F
G
 
G
-
 
M
A
 
K
T
 
T
L
 
I
Q
 
G
Y
|
Y
H
x
D
E
 
-
A
 
-
K
x
P
A
x
I
L
 
I
D
 
S
T
 
P
Q
 
E
T
 
V
E
 
S
Q
 
A
R
 
S
L
 
F
G
 
G
L
 
V
R
 
Q
R
 
Q
V
 
L
A
 
P
C
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
S
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
T
L
 
V
A
x
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
A
 
P
D
 
S
T
|
T
Q
 
T
H
 
G
L
 
L
V
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
L
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
V
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
P
x
C
C
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
G
 
A
G
 
G
Y
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
M
 
E
E
 
E
D
 
P
W
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
P
R
 
R
L
 
-
I
 
-
D
 
D
P
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
T
 
V
L
 
I
F
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
|
G
S
 
A
A
 
S
V
 
T
R
 
K
A
 
E
V
 
A
R
 
Q
L
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
S
R
 
R
C
 
C
A
 
G
A
x
E
Q
 
E
N
 
I
I
 
A
I
 
V
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
33% identity, 84% coverage: 33:314/336 of query aligns to 27:294/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
T
 
N
L
 
L
P
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
I
R
 
A
R
 
E
C
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
Q
 
E
A
 
G
M
 
L
M
 
I
A
 
V
F
 
R
M
 
S
P
 
A
D
 
T
R
 
K
V
 
V
D
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
L
 
I
Q
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
E
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
C
 
R
A
 
A
L
 
G
K
 
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
N
 
N
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
W
 
L
L
 
V
T
 
M
F
 
N
V
 
T
P
 
P
D
 
N
L
 
G
L
 
N
T
 
S
V
 
L
P
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
I
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
V
 
M
G
 
C
L
 
L
G
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
R
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
V
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
F
 
W
Q
 
E
G
 
-
W
 
-
Q
 
R
P
 
K
Q
 
K
F
 
F
Y
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
D
 
N
N
 
G
A
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
L
G
|
G
A
 
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
E
M
 
V
A
 
A
D
 
T
R
 
R
L
 
M
Q
 
Q
G
 
S
W
 
F
G
 
G
-
 
M
A
 
K
T
 
T
L
 
I
Q
 
G
Y
|
Y
H
x
D
E
 
-
A
 
-
K
x
P
A
x
I
L
x
I
D
 
S
T
 
P
Q
 
E
T
 
V
E
 
S
Q
 
A
R
 
S
L
 
F
G
 
G
L
 
V
R
 
Q
R
 
Q
V
 
L
A
 
P
C
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
S
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
T
L
 
V
A
x
H
L
x
T
P
 
P
L
 
L
N
 
L
A
 
P
D
 
S
T
 
T
Q
 
T
H
 
G
L
|
L
V
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
L
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
V
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
P
 
C
C
 
A
R
|
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
G
 
A
G
 
G
Y
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
M
 
E
E
 
E
D
 
P
W
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
P
R
 
R
L
 
-
I
 
-
D
 
D
P
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
T
 
V
L
 
I
F
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
V
 
T
R
 
K
A
 
E
V
 
A
R
 
Q
L
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
S
R
 
R
C
 
C
A
 
G
A
 
E
Q
 
E
N
 
I
I
 
A
I
 
V
Q
 
Q

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
33% identity, 84% coverage: 33:314/336 of query aligns to 35:302/533 of O43175

query
sites
O43175
T
 
N
L
 
L
P
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
I
R
 
A
R
 
E
C
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
Q
 
E
A
 
G
M
 
L
M
 
I
A
 
V
F
 
R
M
 
S
P
 
A
D
 
T
R
 
K
V
 
V
D
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
L
 
I
Q
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
E
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
C
 
R
A
 
A
L
 
G
K
x
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
N
 
N
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
W
 
L
L
 
V
T
 
M
F
 
N
V
 
T
P
 
P
D
 
N
L
 
G
L
 
N
T
 
S
V
 
L
P
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
I
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
V
 
M
G
 
C
L
 
L
G
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
R
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
V
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
F
 
W
Q
 
E
G
 
-
W
 
-
Q
x
R
P
 
K
Q
 
K
F
 
F
Y
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
D
 
N
N
 
G
A
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
E
M
 
V
A
 
A
D
 
T
R
 
R
L
 
M
Q
 
Q
G
 
S
W
 
F
G
 
G
-
 
M
A
 
K
T
 
T
L
 
I
Q
 
G
Y
 
Y
H
x
D
E
 
-
A
 
-
K
 
P
A
 
I
L
 
I
D
 
S
T
 
P
Q
 
E
T
 
V
E
 
S
Q
 
A
R
 
S
L
 
F
G
 
G
L
 
V
R
 
Q
R
 
Q
V
 
L
A
 
P
C
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
S
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
T
L
 
V
A
 
H
L
x
T
P
 
P
L
 
L
N
 
L
A
 
P
D
 
S
T
 
T
Q
 
T
H
 
G
L
 
L
V
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
L
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
V
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
P
x
C
C
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
G
 
A
G
 
G
Y
 
A
A
 
A
A
 
L
D
|
D
V
|
V
F
 
F
E
 
T
M
 
E
E
 
E
D
 
P
W
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
P
R
 
R
L
 
-
I
 
-
D
 
D
P
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
T
 
V
L
 
I
F
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
I
x
L
G
|
G
S
x
A
A
 
S
V
 
T
R
 
K
A
 
E
V
 
A
R
 
Q
L
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
S
R
 
R
C
 
C
A
 
G
A
 
E
Q
 
E
N
 
I
I
 
A
I
 
V
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

2gcgA Ternary crystal structure of human glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase (see paper)
31% identity, 94% coverage: 2:318/336 of query aligns to 2:315/324 of 2gcgA

query
sites
2gcgA
L
 
L
P
 
M
K
 
K
L
 
V
V
 
F
I
 
V
T
 
T
H
 
R
R
 
R
V
 
I
H
 
P
D
 
A
E
 
E
-
 
G
-
 
R
I
 
V
L
 
A
Q
 
L
L
 
A
L
 
R
A
 
A
P
 
A
H
 
D
C
 
C
E
 
E
L
 
V
M
 
E
T
 
Q
N
 
W
Q
 
D
T
 
S
D
 
D
S
 
E
T
 
P
L
 
I
P
 
P
R
 
A
E
 
K
E
 
E
I
 
L
L
 
E
R
 
R
R
 
G
C
 
V
R
 
A
D
 
G
A
 
A
Q
 
H
A
 
G
M
 
L
M
 
L
A
 
C
F
 
L
M
x
L
P
 
S
D
 
D
R
 
H
V
 
V
D
 
D
A
 
K
D
 
R
F
 
I
L
 
L
Q
 
D
A
 
A
C
 
A
-
 
G
P
 
A
E
 
N
L
 
L
R
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
S
C
 
T
A
 
M
L
x
S
K
x
V
G
|
G
F
 
I
D
 
D
N
 
H
F
 
L
D
 
A
V
 
L
D
 
D
A
 
E
C
 
I
T
 
K
A
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
I
W
 
R
L
 
V
T
 
G
F
 
Y
V
 
T
P
 
P
D
 
D
L
 
V
L
|
L
T
 
T
V
 
D
P
 
T
T
|
T
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
V
G
 
S
L
 
L
A
 
L
V
 
L
G
 
T
L
 
T
G
 
C
R
 
R
H
 
R
L
 
L
R
 
P
A
 
E
A
 
A
D
 
I
A
 
E
F
 
E
V
 
V
R
 
K
S
 
N
G
 
G
K
 
G
F
 
W
Q
 
T
G
 
S
W
 
W
Q
 
K
P
 
P
Q
 
L
F
 
W
Y
 
L
-
 
C
G
 
G
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
T
N
 
Q
A
 
S
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
M
 
L
G
|
G
A
 
R
I
|
I
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
M
 
I
A
 
A
D
 
R
R
 
R
L
 
L
Q
 
K
G
 
P
W
 
F
G
 
G
A
 
V
T
 
Q
L
 
R
Q
 
F
Y
 
L
H
 
Y
E
 
T
A
x
G
K
x
R
A
 
Q
L
 
P
D
x
R
T
 
P
Q
 
E
T
 
E
E
 
A
Q
 
A
R
 
E
L
 
F
G
 
Q
L
 
A
R
 
E
R
 
F
V
 
V
A
 
S
C
 
T
S
 
P
E
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
A
S
 
Q
S
 
S
D
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
V
L
 
V
A
 
A
L
x
C
P
x
S
L
 
L
N
 
T
A
 
P
D
 
A
T
|
T
Q
 
E
H
 
G
L
 
L
V
 
C
N
 
N
A
 
K
E
 
D
L
 
F
L
 
F
A
 
Q
L
 
K
V
 
M
R
 
K
P
 
E
G
 
T
A
 
A
L
 
V
L
 
F
V
 
I
N
 
N
P
x
I
C
 
S
R
|
R
G
 
G
S
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
A
 
D
A
 
D
V
 
L
L
 
Y
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
A
R
 
S
G
 
G
Q
 
K
L
 
I
G
 
A
G
 
A
Y
 
A
A
 
G
A
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
T
E
 
S
M
 
P
E
|
E
D
 
-
W
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
P
R
 
L
L
 
P
I
 
T
D
 
N
P
 
H
A
 
P
L
 
L
L
 
L
A
 
T
H
 
L
P
 
K
N
 
N
T
 
C
L
 
V
F
 
I
T
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
V
 
T
R
 
H
A
 
R
V
 
T
R
 
R
L
 
N
E
 
T
I
 
M
E
 
S
R
 
L
C
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
N
N
 
N
I
 
L
I
 
L
Q
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
R
G
 
G

Q9UBQ7 Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase; EC 1.1.1.79; EC 1.1.1.81 from Homo sapiens (Human) (see paper)
31% identity, 94% coverage: 2:318/336 of query aligns to 6:319/328 of Q9UBQ7

query
sites
Q9UBQ7
L
 
L
P
 
M
K
 
K
L
 
V
V
 
F
I
 
V
T
 
T
H
 
R
R
 
R
V
 
I
H
 
P
D
 
A
E
 
E
-
 
G
-
 
R
I
 
V
L
 
A
Q
 
L
L
 
A
L
 
R
A
 
A
P
 
A
H
 
D
C
 
C
E
 
E
L
 
V
M
 
E
T
 
Q
N
 
W
Q
 
D
T
 
S
D
 
D
S
 
E
T
 
P
L
 
I
P
 
P
R
 
A
E
 
K
E
 
E
I
 
L
L
 
E
R
 
R
R
 
G
C
 
V
R
 
A
D
 
G
A
 
A
Q
 
H
A
 
G
M
 
L
M
 
L
A
 
C
F
 
L
M
 
L
P
 
S
D
 
D
R
 
H
V
 
V
D
 
D
A
 
K
D
 
R
F
 
I
L
 
L
Q
 
D
A
 
A
C
 
A
-
 
G
P
 
A
E
 
N
L
 
L
R
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
S
C
 
T
A
 
M
L
 
S
K
x
V
G
|
G
F
 
I
D
 
D
N
 
H
F
 
L
D
 
A
V
 
L
D
 
D
A
 
E
C
 
I
T
 
K
A
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
I
W
 
R
L
 
V
T
 
G
F
 
Y
V
 
T
P
 
P
D
 
D
L
 
V
L
 
L
T
 
T
V
 
D
P
 
T
T
 
T
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
V
G
 
S
L
 
L
A
 
L
V
 
L
G
 
T
L
 
T
G
 
C
R
 
R
H
 
R
L
 
L
R
 
P
A
 
E
A
 
A
D
 
I
A
 
E
F
 
E
V
 
V
R
 
K
S
 
N
G
 
G
K
 
G
F
 
W
Q
 
T
G
 
S
W
 
W
Q
 
K
P
 
P
Q
 
L
F
 
W
Y
 
L
-
 
C
G
 
G
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
T
N
 
Q
A
 
S
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
M
 
L
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
M
 
I
A
 
A
D
 
R
R
 
R
L
 
L
Q
 
K
G
 
P
W
 
F
G
 
G
A
 
V
T
 
Q
L
 
R
Q
 
F
Y
 
L
H
 
Y
E
 
T
A
 
G
K
x
R
A
x
Q
L
x
P
D
x
R
T
 
P
Q
 
E
T
 
E
E
 
A
Q
 
A
R
 
E
L
 
F
G
 
Q
L
 
A
R
 
E
R
 
F
V
 
V
A
 
S
C
 
T
S
 
P
E
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
A
S
 
Q
S
 
S
D
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
V
L
 
V
A
 
A
L
 
C
P
x
S
L
 
L
N
 
T
A
 
P
D
 
A
T
 
T
Q
 
E
H
 
G
L
 
L
V
 
C
N
 
N
A
 
K
E
 
D
L
 
F
L
 
F
A
 
Q
L
 
K
V
 
M
R
 
K
P
 
E
G
 
T
A
 
A
L
 
V
L
 
F
V
 
I
N
 
N
P
x
I
C
 
S
R
|
R
G
 
G
S
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
A
 
D
A
 
D
V
 
L
L
 
Y
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
A
R
 
S
G
 
G
Q
 
K
L
 
I
G
 
A
G
 
A
Y
 
A
A
 
G
A
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
T
E
 
S
M
 
P
E
 
E
D
 
-
W
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
P
R
 
L
L
 
P
I
 
T
D
 
N
P
 
H
A
 
P
L
 
L
L
 
L
A
 
T
H
 
L
P
 
K
N
 
N
T
 
C
L
 
V
F
 
I
T
 
L
P
 
P
H
|
H
I
|
I
G
|
G
S
|
S
A
 
A
V
 
T
R
 
H
A
 
R
V
 
T
R
 
R
L
 
N
E
 
T
I
 
M
E
 
S
R
 
L
C
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
N
N
 
N
I
 
L
I
 
L
Q
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
R
G
 
G

Query Sequence

>GFF427 Psest_0431 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases
MLPKLVITHRVHDEILQLLAPHCELMTNQTDSTLPREEILRRCRDAQAMMAFMPDRVDAD
FLQACPELRVVGCALKGFDNFDVDACTARGVWLTFVPDLLTVPTAELAIGLAVGLGRHLR
AADAFVRSGKFQGWQPQFYGTGLDNATVGILGMGAIGLAMADRLQGWGATLQYHEAKALD
TQTEQRLGLRRVACSELFASSDFILLALPLNADTQHLVNAELLALVRPGALLVNPCRGSV
VDEAAVLAALERGQLGGYAADVFEMEDWARADRPRLIDPALLAHPNTLFTPHIGSAVRAV
RLEIERCAAQNIIQALAGARPINAANRLPKAEPAAC

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory