SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF4358 FitnessBrowser__Marino:GFF4358 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1sb8A Crystal structure of pseudomonas aeruginosa udp-n-acetylglucosamine 4- epimerase complexed with udp-n-acetylgalactosamine (see paper)
75% identity, 97% coverage: 8:341/343 of query aligns to 4:337/341 of 1sb8A

query
sites
1sb8A
R
 
R
Y
 
Y
P
 
E
Q
 
E
L
 
L
L
 
R
D
 
K
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
P
 
P
K
 
K
T
 
V
W
 
W
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
V
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
H
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
K
L
 
L
N
 
D
Q
 
Q
H
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
L
D
|
D
N
|
N
F
|
F
A
 
A
T
|
T
G
|
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
R
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
R
S
 
S
L
 
L
V
 
V
S
 
S
T
 
E
E
 
K
Q
 
Q
W
 
W
T
 
S
R
 
N
L
 
F
Q
 
K
S
 
F
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
D
|
D
I
|
I
R
 
R
N
 
N
P
 
L
E
 
D
D
 
D
C
 
C
A
 
N
R
 
N
A
 
A
C
 
C
E
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
H
 
H
Q
|
Q
A
 
A
A
|
A
L
 
L
G
 
G
S
|
S
V
 
V
P
 
P
R
 
R
S
 
S
L
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
P
I
 
I
T
 
T
T
 
S
N
 
N
A
 
A
A
x
T
N
 
N
I
 
I
T
 
D
G
 
G
F
 
F
L
 
L
N
 
N
M
 
M
L
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
K
V
 
V
K
 
Q
S
 
S
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
A
|
A
A
|
A
S
|
S
S
|
S
S
|
S
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
L
P
 
P
K
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
D
K
 
T
I
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
K
|
K
H
 
Y
V
 
V
N
 
N
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
S
R
 
R
S
 
C
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
K
 
S
A
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
L
R
 
R
Y
|
Y
F
 
F
N
|
N
V
|
V
F
 
F
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
|
A
V
|
V
I
 
I
P
 
P
K
 
K
W
|
W
T
 
T
A
 
S
A
 
S
M
 
M
V
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
 
D
D
 
D
V
 
V
F
x
Y
I
|
I
N
|
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
T
 
T
S
 
S
R
|
R
D
 
D
F
 
F
C
 
C
F
 
Y
I
 
I
E
 
E
N
 
N
A
 
T
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
E
 
G
D
 
L
S
 
D
A
 
A
R
 
R
N
 
N
E
 
Q
V
 
V
Y
 
Y
N
 
N
V
 
I
A
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
G
R
 
R
T
 
T
T
 
S
L
|
L
N
 
N
D
 
Q
L
 
L
F
 
F
A
 
F
A
 
A
L
 
L
K
 
R
S
 
D
A
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
N
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
S
Y
 
Y
D
 
H
K
 
R
A
 
E
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
F
 
F
R
|
R
P
 
E
G
 
G
D
|
D
V
 
V
R
 
R
H
 
H
S
|
S
Q
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
S
K
 
K
A
 
A
S
 
A
S
 
K
R
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
N
 
A
P
 
P
E
 
K
F
 
Y
R
 
D
I
 
V
V
 
S
E
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
A
K
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
W
 
W
Y
 
Y
L
 
I

1sb9A Crystal structure of pseudomonas aeruginosa udp-n-acetylglucosamine 4- epimerase complexed with udp-glucose (see paper)
75% identity, 97% coverage: 8:341/343 of query aligns to 3:336/340 of 1sb9A

query
sites
1sb9A
R
 
R
Y
 
Y
P
 
E
Q
 
E
L
 
L
L
 
R
D
 
K
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
P
 
P
K
 
K
T
 
V
W
 
W
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
V
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
H
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
K
L
 
L
N
 
D
Q
 
Q
H
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
L
D
|
D
N
|
N
F
|
F
A
 
A
T
|
T
G
|
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
R
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
R
S
 
S
L
 
L
V
 
V
S
 
S
T
 
E
E
 
K
Q
 
Q
W
 
W
T
 
S
R
 
N
L
 
F
Q
 
K
S
 
F
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
D
|
D
I
|
I
R
 
R
N
 
N
P
 
L
E
 
D
D
 
D
C
 
C
A
 
N
R
 
N
A
 
A
C
 
C
E
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
H
 
H
Q
|
Q
A
 
A
A
|
A
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
P
 
P
R
 
R
S
 
S
L
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
P
I
 
I
T
 
T
T
 
S
N
 
N
A
 
A
A
x
T
N
 
N
I
 
I
T
 
D
G
 
G
F
 
F
L
 
L
N
 
N
M
 
M
L
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
K
V
 
V
K
 
Q
S
 
S
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
A
|
A
A
|
A
S
|
S
S
|
S
S
|
S
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
L
P
 
P
K
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
D
K
 
T
I
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
K
|
K
H
 
Y
V
 
V
N
 
N
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
S
R
 
R
S
 
C
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
K
 
S
A
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
L
R
 
R
Y
|
Y
F
 
F
N
|
N
V
|
V
F
 
F
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
|
A
V
|
V
I
 
I
P
 
P
K
 
K
W
|
W
T
 
T
A
 
S
A
 
S
M
 
M
V
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
 
D
D
 
D
V
 
V
F
x
Y
I
|
I
N
|
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
T
 
T
S
 
S
R
 
R
D
 
D
F
 
F
C
 
C
F
 
Y
I
 
I
E
 
E
N
 
N
A
 
T
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
E
 
G
D
 
L
S
 
D
A
 
A
R
 
R
N
 
N
E
 
Q
V
 
V
Y
 
Y
N
 
N
V
 
I
A
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
G
R
 
R
T
 
T
T
 
S
L
|
L
N
 
N
D
 
Q
L
 
L
F
 
F
A
 
F
A
 
A
L
 
L
K
 
R
S
 
D
A
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
N
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
S
Y
 
Y
D
 
H
K
 
R
A
 
E
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
F
 
F
R
|
R
P
 
E
G
 
G
D
|
D
V
 
V
R
 
R
H
 
H
S
 
S
Q
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
S
K
 
K
A
 
A
S
 
A
S
 
K
R
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
N
 
A
P
 
P
E
 
K
F
 
Y
R
 
D
I
 
V
V
 
S
E
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
A
K
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
W
 
W
Y
 
Y
L
 
I

3ruhA Alternative analogs as viable substrates of udp-hexose 4-epimerases
69% identity, 98% coverage: 8:342/343 of query aligns to 4:333/336 of 3ruhA

query
sites
3ruhA
R
 
R
Y
 
Y
P
 
E
Q
 
E
L
 
I
L
 
T
D
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
P
 
I
S
 
F
Q
 
S
P
 
P
K
 
K
T
 
T
W
 
W
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
V
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
H
 
K
L
 
L
L
 
L
K
 
K
L
 
L
N
 
N
Q
 
Q
H
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
L
D
|
D
N
|
N
F
 
F
A
x
S
T
|
T
G
|
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
Y
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
K
S
 
T
L
 
L
V
 
V
S
 
S
T
 
T
E
 
E
Q
 
Q
W
 
W
T
 
S
R
 
R
L
 
F
Q
 
C
S
 
F
I
 
I
E
 
E
G
 
G
D
|
D
I
|
I
R
 
R
N
 
D
P
 
L
E
 
T
D
 
T
C
 
C
A
 
E
R
 
Q
A
 
V
C
 
M
E
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
H
V
 
V
L
 
L
H
 
H
Q
|
Q
A
|
A
A
|
A
L
 
L
G
|
G
S
|
S
V
 
V
P
 
P
R
 
R
S
 
S
L
 
I
N
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
T
 
T
T
 
T
N
 
N
A
 
A
A
x
T
N
 
N
I
 
I
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
N
 
N
M
 
I
L
 
L
V
 
H
A
 
A
A
 
A
R
 
K
D
 
N
A
 
A
G
 
Q
V
 
V
K
 
Q
S
 
S
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
A
|
A
A
|
A
S
|
S
S
|
S
S
|
S
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
N
I
 
I
G
 
G
K
 
N
P
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
K
|
K
H
 
Y
V
 
V
N
 
N
E
 
E
L
 
I
Y
 
Y
A
 
A
E
 
Q
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
R
 
R
S
 
T
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
K
 
K
A
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
L
R
 
R
Y
|
Y
F
 
F
N
|
N
V
|
V
F
 
F
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
|
A
V
|
V
I
 
I
P
 
P
K
|
K
W
|
W
T
 
T
A
 
A
A
 
A
M
 
M
V
 
L
R
 
K
G
 
G
E
 
D
D
 
D
V
 
V
F
x
Y
I
|
I
N
|
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
T
 
T
S
 
S
R
|
R
D
 
D
F
 
F
C
 
C
F
 
Y
I
 
I
E
 
D
N
 
N
A
 
V
V
 
I
Q
 
Q
A
 
M
N
 
N
L
 
I
L
 
L
A
 
S
A
 
A
T
 
L
A
 
A
E
 
K
D
 
D
S
 
S
A
 
A
R
 
K
N
 
D
E
 
N
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
L
|
L
N
 
N
D
 
E
L
 
L
F
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
N
 
S
G
 
G
V
 
Y
V
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
E
A
 
L
P
 
N
V
 
L
-
 
I
-
 
H
-
 
H
-
 
I
-
 
K
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
F
 
F
R
|
R
P
 
S
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
R
H
 
H
S
|
S
Q
 
Q
A
 
A
D
 
D
I
 
V
G
 
T
K
 
K
A
 
A
S
 
I
S
 
D
R
 
L
L
 
L
G
 
K
Y
 
Y
N
 
R
P
 
P
E
 
N
F
 
I
R
 
K
I
 
I
V
 
R
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
R
K
 
L
A
 
S
M
 
M
P
 
P
W
 
W
Y
 
Y
L
 
V
K
 
R

3rufA Alternative analogs as viable substrates of udp-hexose 4-epimerases
69% identity, 98% coverage: 8:342/343 of query aligns to 4:333/336 of 3rufA

query
sites
3rufA
R
 
R
Y
 
Y
P
 
E
Q
 
E
L
 
I
L
 
T
D
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
P
 
I
S
 
F
Q
 
S
P
 
P
K
 
K
T
 
T
W
 
W
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
V
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
H
 
K
L
 
L
L
 
L
K
 
K
L
 
L
N
 
N
Q
 
Q
H
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
L
D
|
D
N
|
N
F
 
F
A
x
S
T
|
T
G
|
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
Y
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
K
S
 
T
L
 
L
V
 
V
S
 
S
T
 
T
E
 
E
Q
 
Q
W
 
W
T
 
S
R
 
R
L
 
F
Q
 
C
S
 
F
I
 
I
E
 
E
G
 
G
D
|
D
I
|
I
R
 
R
N
 
D
P
 
L
E
 
T
D
 
T
C
 
C
A
 
E
R
 
Q
A
 
V
C
 
M
E
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
H
V
 
V
L
 
L
H
 
H
Q
|
Q
A
|
A
A
|
A
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
P
 
P
R
 
R
S
 
S
L
 
I
N
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
T
 
T
T
 
T
N
 
N
A
 
A
A
x
T
N
 
N
I
 
I
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
N
 
N
M
 
I
L
 
L
V
 
H
A
 
A
A
 
A
R
 
K
D
 
N
A
 
A
G
 
Q
V
 
V
K
 
Q
S
 
S
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
A
|
A
A
 
A
S
|
S
S
|
S
S
|
S
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
N
I
 
I
G
 
G
K
 
N
P
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
K
|
K
H
 
Y
V
 
V
N
 
N
E
 
E
L
 
I
Y
 
Y
A
 
A
E
 
Q
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
R
 
R
S
 
T
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
K
 
K
A
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
L
R
 
R
Y
|
Y
F
 
F
N
|
N
V
|
V
F
 
F
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
|
A
V
|
V
I
 
I
P
 
P
K
|
K
W
|
W
T
 
T
A
 
A
A
 
A
M
 
M
V
 
L
R
 
K
G
 
G
E
 
D
D
 
D
V
 
V
F
x
Y
I
|
I
N
|
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
T
 
T
S
 
S
R
|
R
D
 
D
F
 
F
C
 
C
F
 
Y
I
 
I
E
 
D
N
 
N
A
 
V
V
 
I
Q
 
Q
A
 
M
N
 
N
L
 
I
L
 
L
A
 
S
A
 
A
T
 
L
A
 
A
E
 
K
D
 
D
S
 
S
A
 
A
R
 
K
N
 
D
E
 
N
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
L
|
L
N
 
N
D
 
E
L
 
L
F
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
N
 
S
G
 
G
V
 
Y
V
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
E
A
 
L
P
 
N
V
 
L
-
 
I
-
 
H
-
 
H
-
 
I
-
 
K
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
F
 
F
R
|
R
P
 
S
G
 
G
D
|
D
V
 
V
R
 
R
H
 
H
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
D
 
D
I
 
V
G
 
T
K
 
K
A
 
A
S
 
I
S
 
D
R
 
L
L
 
L
G
 
K
Y
 
Y
N
 
R
P
 
P
E
 
N
F
 
I
R
 
K
I
 
I
V
 
R
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
R
K
 
L
A
 
S
M
 
M
P
 
P
W
 
W
Y
 
Y
L
 
V
K
 
R

3lu1A Crystal structure analysis of wbgu: a udp-galnac 4-epimerase (see paper)
69% identity, 98% coverage: 8:342/343 of query aligns to 4:333/336 of 3lu1A

query
sites
3lu1A
R
 
R
Y
 
Y
P
 
E
Q
 
E
L
 
I
L
 
T
D
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
P
 
I
S
 
F
Q
 
S
P
 
P
K
 
K
T
 
T
W
 
W
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
V
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
H
 
K
L
 
L
L
 
L
K
 
K
L
 
L
N
 
N
Q
 
Q
H
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
L
D
|
D
N
|
N
F
 
F
A
x
S
T
|
T
G
|
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
Y
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
K
S
 
T
L
 
L
V
 
V
S
 
S
T
 
T
E
 
E
Q
 
Q
W
 
W
T
 
S
R
 
R
L
 
F
Q
 
C
S
 
F
I
 
I
E
 
E
G
 
G
D
|
D
I
|
I
R
 
R
N
 
D
P
 
L
E
 
T
D
 
T
C
 
C
A
 
E
R
 
Q
A
 
V
C
 
M
E
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
H
V
 
V
L
 
L
H
 
H
Q
|
Q
A
|
A
A
|
A
L
 
L
G
 
G
S
|
S
V
 
V
P
 
P
R
 
R
S
 
S
L
 
I
N
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
T
 
T
T
 
T
N
 
N
A
 
A
A
 
T
N
 
N
I
 
I
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
N
 
N
M
 
I
L
 
L
V
 
H
A
 
A
A
 
A
R
 
K
D
 
N
A
 
A
G
 
Q
V
 
V
K
x
Q
S
 
S
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
A
|
A
A
|
A
S
|
S
S
|
S
S
|
S
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
N
I
 
I
G
 
G
K
 
N
P
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
K
|
K
H
 
Y
V
 
V
N
 
N
E
 
E
L
 
I
Y
 
Y
A
 
A
E
 
Q
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
R
 
R
S
 
T
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
K
|
K
A
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
L
R
 
R
Y
|
Y
F
 
F
N
|
N
V
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
V
|
V
I
 
I
P
 
P
K
 
K
W
|
W
T
 
T
A
 
A
A
 
A
M
 
M
V
 
L
R
 
K
G
 
G
E
 
D
D
 
D
V
 
V
F
x
Y
I
|
I
N
|
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
T
 
T
S
 
S
R
|
R
D
 
D
F
 
F
C
 
C
F
 
Y
I
 
I
E
 
D
N
 
N
A
 
V
V
 
I
Q
 
Q
A
 
M
N
 
N
L
 
I
L
 
L
A
 
S
A
 
A
T
 
L
A
 
A
E
 
K
D
 
D
S
 
S
A
 
A
R
 
K
N
 
D
E
 
N
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
L
|
L
N
 
N
D
 
E
L
 
L
F
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
N
 
S
G
 
G
V
 
Y
V
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
E
A
 
L
P
 
N
V
 
L
-
 
I
-
 
H
-
 
H
-
 
I
-
 
K
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
F
 
F
R
|
R
P
 
S
G
 
G
D
|
D
V
 
V
R
 
R
H
 
H
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
D
 
D
I
 
V
G
 
T
K
 
K
A
 
A
S
 
I
S
 
D
R
 
L
L
 
L
G
 
K
Y
 
Y
N
 
R
P
 
P
E
 
N
F
 
I
R
 
K
I
 
I
V
 
R
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
R
K
 
L
A
 
S
M
 
M
P
 
P
W
 
W
Y
 
Y
L
 
V
K
 
R

Q7BJX9 UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase; UDP-GalNAc 4-epimerase; EC 5.1.3.7 from Plesiomonas shigelloides (Aeromonas shigelloides) (see 2 papers)
69% identity, 98% coverage: 8:342/343 of query aligns to 7:341/345 of Q7BJX9

query
sites
Q7BJX9
R
 
R
Y
 
Y
P
 
E
Q
 
E
L
 
I
L
 
T
D
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
P
 
I
S
 
F
Q
 
S
P
 
P
K
 
K
T
 
T
W
 
W
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
x
V
A
|
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
H
 
K
L
 
L
L
 
L
K
 
K
L
 
L
N
 
N
Q
 
Q
H
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
L
D
|
D
N
|
N
F
|
F
A
x
S
T
|
T
G
|
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
Y
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
K
S
 
T
L
 
L
V
 
V
S
 
S
T
 
T
E
 
E
Q
 
Q
W
 
W
T
 
S
R
 
R
L
 
F
Q
 
C
S
 
F
I
 
I
E
 
E
G
 
G
D
|
D
I
|
I
R
 
R
N
 
D
P
 
L
E
 
T
D
 
T
C
 
C
A
 
E
R
 
Q
A
 
V
C
 
M
E
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
H
V
 
V
L
 
L
H
 
H
Q
|
Q
A
|
A
A
|
A
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
P
 
P
R
 
R
S
 
S
L
 
I
N
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
T
 
T
T
 
T
N
 
N
A
 
A
A
x
T
N
 
N
I
 
I
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
N
 
N
M
 
I
L
 
L
V
 
H
A
 
A
A
 
A
R
 
K
D
 
N
A
 
A
G
 
Q
V
 
V
K
 
Q
S
 
S
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
|
S
S
|
S
S
|
S
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
N
I
 
I
G
 
G
K
 
N
P
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
K
|
K
H
 
Y
V
 
V
N
 
N
E
 
E
L
 
I
Y
 
Y
A
 
A
E
 
Q
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
R
 
R
S
 
T
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
K
 
K
A
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
L
R
 
R
Y
|
Y
F
|
F
N
|
N
V
|
V
F
 
F
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
V
|
V
I
|
I
P
|
P
K
|
K
W
 
W
T
 
T
A
 
A
A
 
A
M
 
M
V
 
L
R
 
K
G
 
G
E
 
D
D
 
D
V
 
V
F
x
Y
I
|
I
N
|
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
T
 
T
S
|
S
R
|
R
D
 
D
F
 
F
C
 
C
F
 
Y
I
 
I
E
 
D
N
 
N
A
 
V
V
 
I
Q
 
Q
A
 
M
N
 
N
L
 
I
L
 
L
A
 
S
A
 
A
T
 
L
A
 
A
E
 
K
D
 
D
S
 
S
A
 
A
R
 
K
N
 
D
E
 
N
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
|
R
T
 
T
T
 
T
L
 
L
N
 
N
D
 
E
L
 
L
F
 
S
A
 
G
A
 
Y
L
 
I
K
 
Y
S
 
D
A
 
E
L
 
L
A
 
N
E
 
L
N
 
I
G
 
H
V
 
H
V
 
I
Y
 
D
D
 
K
K
 
L
A
 
S
P
 
I
V
 
K
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
F
 
F
R
|
R
P
x
S
G
|
G
D
|
D
V
 
V
R
|
R
H
|
H
S
|
S
Q
 
Q
A
 
A
D
 
D
I
 
V
G
 
T
K
 
K
A
 
A
S
 
I
S
 
D
R
 
L
L
 
L
G
 
K
Y
 
Y
N
 
R
P
 
P
E
 
N
F
 
I
R
 
K
I
 
I
V
 
R
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
R
K
 
L
A
 
S
M
 
M
P
 
P
W
 
W
Y
 
Y
L
 
V
K
 
R

6dntA Udp-n-acetylglucosamine 4-epimerase from methanobrevibacter ruminantium m1 in complex with udp-n-acetylmuramic acid (see paper)
37% identity, 95% coverage: 19:343/343 of query aligns to 2:309/310 of 6dntA

query
sites
6dntA
Q
 
K
P
 
D
K
 
K
T
 
N
W
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
L
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
H
L
 
I
L
 
V
E
 
D
H
 
A
L
 
L
L
 
I
K
 
D
L
 
D
N
 
N
Q
 
K
H
 
-
V
 
V
I
 
T
A
 
I
L
 
I
D
|
D
N
|
N
F
x
L
A
x
S
T
x
S
G
|
G
H
 
K
Q
 
M
S
 
E
N
 
N
L
 
L
D
 
N
E
 
-
V
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
-
T
 
N
E
 
P
Q
 
N
W
 
H
T
 
E
R
 
N
L
 
L
Q
 
T
S
 
I
I
 
I
E
 
K
G
 
E
D
|
D
I
x
L
R
 
M
N
 
D
P
 
A
E
 
-
D
 
D
C
 
L
A
 
E
R
 
K
A
 
I
C
 
L
E
 
K
G
 
D
V
 
K
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
L
 
F
H
 
H
Q
x
L
A
|
A
A
|
A
L
 
L
G
x
A
S
 
S
V
 
V
P
 
P
R
 
G
S
 
S
L
 
V
N
 
A
D
 
E
P
 
P
I
 
L
T
 
R
T
 
Y
N
 
N
A
 
Q
A
 
N
N
 
N
I
 
I
T
 
D
G
 
A
F
 
S
L
 
L
N
 
K
M
 
L
L
 
F
V
 
I
A
 
A
A
 
C
R
 
K
D
 
N
A
 
N
G
 
N
V
 
I
K
 
K
S
 
K
F
 
V
T
 
I
Y
 
F
A
x
S
A
x
S
S
|
S
S
|
S
S
x
A
T
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
E
H
 
N
P
 
P
A
 
N
L
 
M
P
 
P
K
 
L
V
 
K
E
 
E
E
 
S
K
 
E
I
 
N
G
 
F
K
 
L
P
 
P
L
 
C
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
V
 
A
T
 
Q
K
|
K
H
 
A
V
 
S
N
 
C
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
A
 
L
E
 
K
V
 
S
F
 
F
A
 
H
R
 
E
S
 
S
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
K
 
D
A
 
Y
I
 
V
G
 
A
L
 
L
R
 
R
Y
|
Y
F
|
F
N
|
N
V
|
V
F
 
F
G
 
G
K
 
P
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
E
N
 
N
G
 
S
A
 
P
Y
 
Y
A
 
A
A
|
A
V
|
V
I
 
I
P
 
P
K
|
K
W
 
F
T
 
I
A
 
S
A
 
A
M
 
I
V
 
L
R
 
N
G
 
G
E
 
E
D
 
S
V
 
P
F
x
V
I
|
I
N
x
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
|
E
T
x
Q
S
 
S
R
|
R
D
 
D
F
 
F
C
 
I
F
 
Y
I
 
V
E
 
K
N
 
E
A
 
I
V
 
A
Q
 
K
A
 
A
N
 
N
L
 
I
L
 
L
A
 
S
A
 
A
T
 
-
A
 
-
E
 
-
D
 
E
S
 
S
A
 
D
R
 
Y
N
 
N
E
 
G
V
 
V
Y
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
L
G
 
G
D
 
K
R
 
S
T
 
M
T
 
T
L
x
I
N
 
N
D
 
R
L
 
L
F
 
F
A
 
E
A
 
I
L
 
I
K
 
S
S
 
D
A
 
V
L
 
L
A
 
E
E
 
S
N
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
Y
 
-
D
 
D
K
 
I
A
 
D
P
 
V
V
 
K
Y
 
Y
R
 
L
D
 
D
F
 
E
R
|
R
P
 
P
G
 
G
D
|
D
V
 
I
R
 
K
H
|
H
S
 
S
Q
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
S
K
 
N
A
 
L
S
 
-
S
 
D
R
 
K
L
 
I
G
 
S
Y
 
F
N
 
K
P
 
P
-
 
D
E
 
E
F
 
D
R
 
K
I
 
F
V
 
E
E
 
E
G
 
Q
I
 
L
A
 
R
K
 
E
A
 
T
M
 
V
P
 
K
W
 
W
Y
 
F
L
 
I
K
 
S
H
 
Q

4zrnA Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (tm0509) with udp-glucose from hyperthermophilic eubacterium thermotoga maritima (see paper)
39% identity, 93% coverage: 24:342/343 of query aligns to 4:306/309 of 4zrnA

query
sites
4zrnA
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
H
L
 
V
L
 
V
E
 
D
H
 
K
L
 
L
L
 
I
K
 
E
L
 
N
N
 
G
Q
 
Y
H
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
V
L
 
V
D
|
D
N
|
N
F
 
L
A
x
S
T
x
S
G
|
G
H
 
K
Q
 
V
S
 
E
N
 
N
L
 
L
D
 
N
E
 
-
V
 
-
R
 
R
S
 
N
L
 
A
V
 
L
S
 
F
T
 
Y
E
 
E
Q
 
Q
W
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
Q
 
-
S
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
-
D
x
S
I
|
I
R
 
E
N
 
D
P
 
E
E
 
E
D
 
M
C
 
M
A
 
E
R
 
R
-
 
I
-
 
F
A
 
S
C
 
L
E
 
H
G
 
R
V
 
P
D
 
E
Y
 
Y
V
 
V
L
 
F
H
 
H
Q
x
L
A
|
A
A
|
A
L
 
Q
G
 
A
S
 
S
V
 
V
P
 
A
R
 
I
S
 
S
L
 
V
N
 
R
D
 
E
P
 
P
I
 
A
T
 
R
T
 
D
N
 
A
A
 
K
A
x
T
N
 
N
I
 
I
T
 
I
G
 
G
F
 
S
L
 
L
N
 
V
M
 
L
L
 
L
V
 
E
A
 
K
A
 
S
R
 
I
D
 
K
A
 
Y
G
 
G
V
 
V
K
 
K
S
 
K
F
 
F
T
 
I
Y
 
F
A
x
S
A
x
S
S
x
T
S
 
G
-
x
G
S
x
A
T
 
I
Y
 
Y
G
 
G
D
 
E
H
 
N
-
 
V
P
 
K
A
 
V
L
 
F
P
 
P
K
 
T
V
 
P
E
 
E
E
 
T
K
 
E
I
 
I
G
 
P
K
 
H
P
 
P
L
 
I
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
G
V
 
I
T
 
A
K
|
K
H
 
Y
V
 
S
N
 
T
E
 
E
L
 
M
Y
 
Y
A
 
L
E
 
E
V
 
F
F
 
F
A
 
A
R
 
R
S
 
E
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
K
 
K
A
 
Y
I
 
T
G
 
V
L
 
L
R
 
R
Y
|
Y
F
 
A
N
|
N
V
|
V
F
 
Y
G
 
G
K
 
P
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
N
x
Y
G
 
G
A
 
E
Y
 
-
A
 
A
A
x
G
V
|
V
I
 
V
P
 
A
K
 
I
W
 
F
T
 
T
A
 
E
A
 
R
M
 
M
V
 
L
R
 
R
G
 
G
E
 
E
D
 
E
V
 
V
F
x
H
I
 
I
N
x
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
T
x
Y
S
 
V
R
|
R
D
 
D
F
 
Y
C
 
V
F
 
Y
I
 
V
E
 
D
N
 
D
A
 
V
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
M
T
 
E
A
 
K
E
 
G
D
 
D
S
 
-
A
 
-
R
 
-
N
 
N
E
 
E
V
 
V
Y
 
F
N
 
N
V
 
I
A
 
G
V
 
T
G
 
G
D
 
R
R
 
G
T
 
T
T
 
T
L
x
V
N
 
N
D
 
Q
L
 
L
F
 
F
A
 
K
A
 
L
L
 
L
K
 
K
S
 
E
A
 
I
L
 
T
A
 
G
E
 
-
N
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
E
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
R
 
K
D
 
P
F
 
P
R
|
R
P
 
K
G
 
G
D
|
D
V
 
V
R
 
R
H
 
K
S
 
S
Q
 
I
A
 
L
D
 
D
I
 
Y
G
 
T
K
 
K
A
 
A
S
 
K
S
 
E
R
 
K
L
 
L
G
 
G
Y
 
W
N
 
E
P
 
P
E
 
K
F
 
V
R
 
S
I
 
L
V
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
K
K
 
L
A
 
T
M
 
V
P
 
E
W
 
Y
Y
 
F
L
 
R
K
 
K

6wj9B Udp-glcnac c4-epimerase mutant s121a/y146f from pseudomonas protegens in complex with udp-glcnac (see paper)
32% identity, 91% coverage: 24:335/343 of query aligns to 5:303/308 of 6wj9B

query
sites
6wj9B
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
H
L
 
L
L
 
V
E
 
D
H
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
A
L
 
K
N
 
G
Q
 
Y
H
 
A
V
 
V
I
 
R
A
 
V
L
 
L
D
|
D
N
x
D
F
 
L
A
x
S
T
|
T
G
|
G
H
 
K
Q
 
V
S
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
-
T
 
P
E
 
M
Q
 
G
W
 
D
T
 
A
R
 
G
L
 
L
Q
 
E
S
 
L
I
 
L
E
 
V
G
 
G
D
|
D
I
x
A
R
 
A
N
 
D
P
 
A
E
 
A
D
 
L
C
 
L
A
 
A
R
 
D
A
 
A
C
 
V
E
 
Q
G
 
G
V
 
C
D
 
D
Y
 
A
V
 
V
L
 
V
H
 
H
Q
x
L
A
|
A
A
|
A
L
 
V
G
 
A
S
 
S
V
|
V
P
 
Q
R
 
A
S
 
S
L
 
V
N
 
E
D
 
D
P
 
P
I
 
V
T
 
A
T
 
T
N
 
H
A
 
Q
A
x
S
N
 
N
I
 
F
T
 
I
G
 
A
F
 
T
L
 
L
N
 
R
M
 
L
L
 
C
V
 
E
A
 
A
A
 
M
R
 
T
D
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
K
 
R
S
 
R
F
 
V
T
 
V
Y
 
F
A
|
A
A
 
S
S
x
A
S
x
A
S
x
A
T
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
N
H
 
N
-
 
G
P
 
E
A
 
G
L
 
T
P
 
P
K
 
I
V
 
A
E
 
E
E
 
D
K
 
T
I
 
P
G
 
K
K
 
S
P
 
P
L
 
L
S
 
T
P
 
P
Y
x
F
A
 
A
V
 
A
T
 
D
K
|
K
H
 
L
V
 
A
N
 
S
E
 
E
L
 
Y
Y
 
Y
A
 
L
E
 
D
V
 
F
F
 
Y
A
 
R
R
 
R
S
 
Q
Y
 
H
G
 
G
F
 
L
K
 
E
A
 
P
I
 
V
G
 
I
L
 
L
R
 
R
Y
x
F
F
|
F
N
|
N
V
x
I
F
 
F
G
 
G
K
 
P
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
N
 
S
G
 
S
A
 
P
Y
 
Y
A
 
S
A
x
G
V
|
V
I
 
I
P
 
S
K
 
I
W
x
F
T
 
S
A
 
E
A
 
R
M
 
A
V
 
K
R
 
A
G
 
G
E
 
R
D
 
P
V
 
I
F
x
T
I
x
L
N
x
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
G
T
 
Q
S
 
T
R
|
R
D
 
D
F
 
F
C
 
V
F
 
Y
I
 
V
E
 
A
N
 
D
A
 
L
V
 
V
Q
 
K
A
 
I
N
 
-
L
 
L
L
 
V
A
 
Q
A
 
G
T
 
L
A
 
E
E
 
S
D
 
P
S
 
A
A
 
P
R
 
A
N
 
A
E
 
D
V
 
A
Y
 
T
N
 
N
V
 
V
A
 
G
V
 
L
G
 
G
D
 
G
R
 
V
T
 
T
T
 
T
L
|
L
N
 
N
D
 
D
L
 
L
F
 
I
A
 
G
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
S
 
Q
A
 
I
L
 
S
A
 
G
E
 
K
N
 
P
G
 
L
V
 
Q
V
 
V
Y
 
S
D
 
H
K
 
G
A
 
A
P
 
T
V
 
-
Y
 
-
R
 
-
D
 
-
F
 
-
R
|
R
P
 
S
G
 
G
D
|
D
V
 
I
R
 
R
H
 
H
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
D
 
D
I
 
N
G
 
R
K
 
R
A
 
L
S
 
R
S
 
E
R
 
R
L
 
F
G
 
D
Y
 
L
N
 
G
P
 
T
E
 
P
F
 
S
R
 
S
I
 
L
V
 
A
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
E
K
 
R

6wjaA Udp-glcnac c4-epimerase mutant s121a/y146f from pseudomonas protegens in complex with udp-galnac (see paper)
32% identity, 91% coverage: 24:335/343 of query aligns to 4:302/307 of 6wjaA

query
sites
6wjaA
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
H
L
 
L
L
 
V
E
 
D
H
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
A
L
 
K
N
 
G
Q
 
Y
H
 
A
V
 
V
I
 
R
A
 
V
L
 
L
D
|
D
N
x
D
F
 
L
A
x
S
T
|
T
G
|
G
H
 
K
Q
 
V
S
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
-
T
 
P
E
 
M
Q
 
G
W
 
D
T
 
A
R
 
G
L
 
L
Q
 
E
S
 
L
I
 
L
E
 
V
G
 
G
D
 
D
I
x
A
R
 
A
N
 
D
P
 
A
E
 
A
D
 
L
C
 
L
A
 
A
R
 
D
A
 
A
C
 
V
E
 
Q
G
 
G
V
 
C
D
 
D
Y
 
A
V
 
V
L
 
V
H
 
H
Q
x
L
A
|
A
A
|
A
L
 
V
G
 
A
S
 
S
V
|
V
P
 
Q
R
 
A
S
 
S
L
 
V
N
 
E
D
 
D
P
 
P
I
 
V
T
 
A
T
 
T
N
 
H
A
 
Q
A
x
S
N
 
N
I
 
F
T
 
I
G
 
A
F
 
T
L
 
L
N
 
R
M
 
L
L
 
C
V
 
E
A
 
A
A
 
M
R
 
T
D
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
K
 
R
S
 
R
F
 
V
T
 
V
Y
 
F
A
 
A
A
 
S
S
x
A
S
x
A
S
x
A
T
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
N
H
 
N
-
 
G
P
 
E
A
 
G
L
 
T
P
 
P
K
 
I
V
 
A
E
 
E
E
 
D
K
 
T
I
 
P
G
 
K
K
 
S
P
 
P
L
 
L
S
 
T
P
 
P
Y
x
F
A
 
A
V
 
A
T
 
D
K
|
K
H
 
L
V
 
A
N
 
S
E
 
E
L
 
Y
Y
 
Y
A
 
L
E
 
D
V
 
F
F
 
Y
A
 
R
R
 
R
S
 
Q
Y
 
H
G
 
G
F
 
L
K
 
E
A
 
P
I
 
V
G
 
I
L
 
L
R
 
R
Y
x
F
F
|
F
N
|
N
V
x
I
F
 
F
G
 
G
K
 
P
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
N
 
S
G
 
S
A
 
P
Y
 
Y
A
 
S
A
x
G
V
|
V
I
 
I
P
 
S
K
 
I
W
x
F
T
 
S
A
 
E
A
 
R
M
 
A
V
 
K
R
 
A
G
 
G
E
 
R
D
 
P
V
 
I
F
x
T
I
 
L
N
x
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
G
T
 
Q
S
 
T
R
|
R
D
 
D
F
 
F
C
 
V
F
 
Y
I
 
V
E
 
A
N
 
D
A
 
L
V
 
V
Q
 
K
A
 
I
N
 
-
L
 
L
L
 
V
A
 
Q
A
 
G
T
 
L
A
 
E
E
 
S
D
 
P
S
 
A
A
 
P
R
 
A
N
 
A
E
 
D
V
 
A
Y
 
T
N
 
N
V
 
V
A
 
G
V
 
L
G
 
G
D
 
G
R
 
V
T
 
T
T
 
T
L
|
L
N
 
N
D
 
D
L
 
L
F
 
I
A
 
G
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
S
 
Q
A
 
I
L
 
S
A
 
G
E
 
K
N
 
P
G
 
L
V
 
Q
V
 
V
Y
 
S
D
 
H
K
 
G
A
 
A
P
 
T
V
 
-
Y
 
-
R
 
-
D
 
-
F
 
-
R
|
R
P
 
S
G
 
G
D
|
D
V
 
I
R
 
R
H
 
H
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
D
 
D
I
 
N
G
 
R
K
 
R
A
 
L
S
 
R
S
 
E
R
 
R
L
 
F
G
 
D
Y
 
L
N
 
G
P
 
T
E
 
P
F
 
S
R
 
S
I
 
L
V
 
A
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
E
K
 
R

6zllA Crystal structure of udp-glucuronic acid 4-epimerase from bacillus cereus in complex with udp-galacturonic acid and NAD (see paper)
31% identity, 90% coverage: 24:333/343 of query aligns to 4:303/321 of 6zllA

query
sites
6zllA
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
H
L
 
L
L
 
C
E
 
Q
H
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
K
L
 
N
N
 
S
Q
 
A
-
 
Y
H
 
H
V
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
I
D
|
D
N
x
H
F
|
F
A
x
I
T
 
G
G
 
P
H
 
T
Q
 
P
S
 
A
N
 
T
L
 
L
D
 
-
E
x
K
V
 
T
R
 
G
S
 
N
L
 
I
V
 
Q
S
 
S
T
 
L
E
 
E
Q
 
L
W
 
N
T
 
S
R
 
R
L
 
F
Q
 
Q
S
 
F
I
 
I
E
 
R
G
 
E
D
|
D
I
|
I
R
 
L
N
 
N
P
 
-
E
 
T
D
 
D
C
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
L
C
 
L
E
 
Q
G
 
D
V
 
I
D
 
D
Y
 
V
V
 
V
L
 
Y
H
 
H
Q
x
L
A
|
A
A
|
A
L
 
I
G
x
P
S
 
G
V
|
V
P
x
R
R
 
T
S
 
S
L
 
W
N
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
F
D
 
Q
P
 
P
I
 
Y
T
 
V
T
 
T
N
 
N
A
 
-
A
 
-
N
 
N
I
 
I
T
 
M
G
 
V
F
 
T
L
 
Q
N
 
Q
M
 
L
L
 
L
V
 
E
A
 
A
A
 
C
R
 
K
D
 
H
A
 
I
G
 
K
V
 
L
K
 
D
S
 
K
F
 
F
T
 
I
Y
 
H
A
x
I
A
 
S
S
x
T
S
|
S
S
|
S
T
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
E
H
 
K
P
 
S
A
 
G
L
 
A
P
 
V
K
 
S
V
 
-
E
 
E
E
 
D
K
 
L
I
 
L
G
 
P
K
 
I
P
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
G
V
 
V
T
 
T
K
|
K
H
 
L
V
 
S
N
 
G
E
 
E
L
 
H
Y
 
L
A
 
C
E
 
H
V
 
V
F
 
Y
A
 
H
R
 
K
S
 
N
Y
 
F
G
 
H
F
 
I
K
 
P
A
 
I
I
 
V
G
 
I
L
 
L
R
 
R
Y
|
Y
F
 
F
N
x
T
V
|
V
F
 
Y
G
 
G
K
 
P
R
 
R
Q
 
Q
D
x
R
P
 
P
N
 
D
G
x
M
A
|
A
Y
 
F
A
 
H
A
x
R
V
 
L
I
 
I
P
 
K
K
 
Q
W
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
M
V
 
L
R
 
E
G
 
D
E
 
K
D
 
P
V
 
L
F
x
T
I
 
I
N
x
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
T
T
x
Q
S
 
T
R
|
R
D
 
D
F
 
F
C
 
T
F
 
Y
I
 
I
E
 
D
N
 
D
A
 
C
V
 
I
Q
 
R
A
 
G
N
 
T
L
 
V
L
 
A
A
 
A
A
 
L
T
 
E
A
 
T
E
 
K
D
 
K
S
 
N
A
 
I
R
 
I
N
 
G
E
 
E
V
 
V
Y
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
G
V
 
G
G
 
K
D
 
E
R
 
Q
T
 
A
T
 
S
L
x
I
N
 
L
D
 
D
L
 
I
F
 
I
A
 
S
A
 
M
L
 
L
K
 
E
S
 
K
A
 
I
L
 
S
A
 
G
E
 
K
N
 
S
G
 
A
V
 
T
V
 
-
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
Y
 
-
R
 
K
D
 
N
F
 
F
R
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
V
P
 
P
G
 
G
D
x
E
V
 
P
R
 
K
H
 
Q
S
 
T
Q
 
W
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
S
K
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
T
R
 
L
L
 
L
G
 
Q
Y
 
Y
N
 
S
P
 
P
E
 
T
F
 
V
R
 
S
I
 
L
V
 
S
E
 
D
G
 
G
I
 
L

6zldA Crystal structure of udp-glucuronic acid 4-epimerase from bacillus cereus in complex with udp-glucuronic acid and NAD (see paper)
31% identity, 90% coverage: 24:333/343 of query aligns to 4:303/314 of 6zldA

query
sites
6zldA
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
H
L
 
L
L
 
C
E
 
Q
H
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
K
L
 
N
N
 
S
Q
 
A
-
 
Y
H
 
H
V
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
I
D
|
D
N
x
H
F
|
F
A
x
I
T
 
G
G
 
P
H
 
T
Q
 
P
S
 
A
N
 
T
L
 
L
D
 
-
E
x
K
V
 
T
R
 
G
S
 
N
L
 
I
V
 
Q
S
 
S
T
 
L
E
 
E
Q
 
L
W
 
N
T
 
S
R
 
R
L
 
F
Q
 
Q
S
 
F
I
 
I
E
 
R
G
 
E
D
|
D
I
|
I
R
 
L
N
 
N
P
 
-
E
 
T
D
 
D
C
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
L
C
 
L
E
 
Q
G
 
D
V
 
I
D
 
D
Y
 
V
V
 
V
L
 
Y
H
 
H
Q
x
L
A
|
A
A
|
A
L
 
I
G
x
P
S
 
G
V
 
V
P
x
R
R
 
T
S
 
S
L
 
W
N
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
F
D
 
Q
P
 
P
I
 
Y
T
 
V
T
 
T
N
 
N
A
 
-
A
 
-
N
 
N
I
 
I
T
 
M
G
 
V
F
 
T
L
 
Q
N
 
Q
M
 
L
L
 
L
V
 
E
A
 
A
A
 
C
R
 
K
D
 
H
A
 
I
G
 
K
V
 
L
K
 
D
S
 
K