SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF4363 FitnessBrowser__WCS417:GFF4363 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 12 hits to proteins with known functional sites (download)

8crvA Crystal structure of the carbamate kinase from pseudomonas aeruginosa
82% identity, 100% coverage: 1:308/309 of query aligns to 3:311/312 of 8crvA

query
sites
8crvA
M
 
M
R
 
R
I
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
N
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
E
P
 
P
M
 
M
T
 
T
A
 
A
D
 
D
N
 
N
Q
 
Q
R
 
R
A
 
E
N
 
N
I
 
V
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
V
H
 
A
A
 
P
G
 
G
N
 
N
E
 
E
L
 
L
V
 
V
I
 
I
A
 
A
H
 
H
G
|
G
N
|
N
G
|
G
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
A
L
 
L
Q
 
Q
A
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
T
 
D
Q
 
K
V
 
V
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
E
T
 
T
E
 
E
G
 
G
M
 
M
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
 
M
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
L
 
M
G
 
G
N
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
P
F
 
F
E
 
E
V
 
V
P
 
P
F
 
F
A
 
A
T
 
T
L
 
I
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
G
K
 
K
D
 
D
P
 
P
A
 
A
F
 
F
Q
 
Q
N
 
N
P
 
P
T
 
T
K
 
K
P
 
P
I
 
I
G
 
G
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
K
 
R
A
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
E
K
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
K
 
K
G
 
G
W
 
W
A
 
S
I
 
I
A
 
T
P
 
P
D
 
D
G
 
G
D
 
D
K
 
K
Y
 
F
R
 
R
R
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
P
 
P
K
 
K
R
 
R
I
 
I
F
 
F
E
 
E
I
 
I
R
 
R
P
 
P
I
 
V
T
 
K
W
 
W
L
 
L
L
 
L
D
 
E
K
 
K
G
 
G
S
 
T
I
 
I
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
G
 
G
G
|
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
P
 
P
T
 
T
M
 
M
Y
 
Y
G
 
D
E
 
E
D
 
A
G
 
G
-
 
K
K
 
K
L
 
L
R
 
S
G
 
G
I
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
K
|
K
D
 
D
L
 
L
C
 
C
S
 
S
S
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
Q
Q
 
E
L
 
L
K
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
L
V
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
D
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
V
D
 
D
F
 
W
G
 
G
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
I
 
I
G
 
A
Q
 
Q
A
 
A
H
 
H
P
 
P
D
 
D
E
 
E
M
 
L
E
 
E
K
 
R
L
 
L
G
 
G
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
S
M
 
M
G
 
G
P
 
P
K
 
K
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
C
 
I
E
 
E
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
S
 
S
L
 
L
S
 
A
D
 
D
I
 
I
E
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
T
Q
 
E
G
 
G
S
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
V
S
 
S
T
 
T
A
 
R
K
 
K
P
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
E
Y
 
Y

1e19A Structure of the carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase from the hyperthermophilic archaeon pyrococcus furiosus bound to adp (see paper)
45% identity, 96% coverage: 2:299/309 of query aligns to 3:311/313 of 1e19A

query
sites
1e19A
R
 
R
I
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
N
|
N
A
 
A
L
 
L
L
 
Q
R
 
Q
R
 
R
G
 
G
E
 
Q
P
 
K
M
 
G
T
 
S
A
 
Y
D
 
E
N
 
E
Q
 
M
R
 
M
A
 
D
N
 
N
I
 
V
R
 
R
I
 
K
A
 
T
T
 
A
E
 
R
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
K
 
E
I
 
I
H
 
I
A
 
A
-
 
R
G
 
G
N
 
Y
E
 
E
L
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
T
H
 
H
G
 
G
N
 
N
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
-
 
S
-
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
H
L
 
M
Q
 
D
A
 
A
A
 
G
A
 
Q
Y
 
A
T
 
T
Q
 
Y
V
 
G
S
 
I
P
 
P
-
 
A
Y
 
Q
P
 
P
L
 
M
D
 
D
V
 
V
L
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
M
T
 
S
E
 
Q
G
 
G
M
 
W
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
 
M
I
 
I
E
 
Q
Q
 
Q
E
 
A
L
 
L
G
 
K
N
 
N
L
 
E
L
 
L
D
 
R
-
 
K
-
 
R
-
 
G
F
 
M
E
 
E
V
 
K
P
 
K
F
 
V
A
 
V
T
 
T
L
 
I
L
 
I
T
 
T
Q
 
Q
V
 
T
E
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
K
K
 
N
D
 
D
P
 
P
A
 
A
F
 
F
Q
 
Q
N
 
N
P
 
P
T
 
T
K
|
K
P
 
P
I
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
F
Y
 
Y
S
 
D
K
 
E
A
 
E
E
 
T
A
 
A
E
 
K
K
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
K
 
K
G
 
G
W
 
W
A
 
I
I
 
V
A
 
K
P
 
E
D
 
D
-
 
S
G
 
G
D
 
R
K
 
G
Y
 
W
R
 
R
R
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
D
P
 
P
K
 
K
R
 
G
I
 
H
F
 
V
E
 
E
I
 
A
R
 
E
P
 
T
I
 
I
T
 
K
W
 
K
L
 
L
L
 
V
D
 
E
K
 
R
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
I
 
I
C
 
A
A
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
V
P
 
P
T
 
V
M
 
I
Y
 
L
G
 
-
E
 
E
D
 
D
G
 
G
K
 
E
L
 
I
R
 
K
G
 
G
I
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
K
|
K
D
 
D
L
 
L
C
 
A
S
 
G
S
 
E
L
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
E
Q
 
E
L
 
V
K
 
N
A
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
F
V
 
M
I
 
I
A
 
L
T
|
T
D
|
D
V
|
V
N
 
N
A
 
G
A
|
A
F
x
A
I
 
L
D
 
Y
F
x
Y
G
 
G
K
 
T
P
 
E
T
 
K
Q
 
E
K
 
Q
A
x
W
I
 
L
G
 
R
Q
 
E
A
 
V
H
 
K
P
 
V
D
 
E
E
 
E
M
 
L
E
 
R
K
 
K
L
 
Y
-
 
Y
-
 
E
-
 
E
-
 
G
G
x
H
F
|
F
A
x
K
A
 
A
G
 
G
S
|
S
M
|
M
G
 
G
P
 
P
K
|
K
V
 
V
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
I
E
 
R
F
 
F
A
 
I
R
 
E
Q
 
W
T
 
G
G
 
G
K
 
E
T
 
R
A
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
A
S
 
H
L
 
L
S
 
E
D
 
K
I
 
A
E
 
V
A
 
E
I
 
A
V
 
L
Q
 
E
G
 
G
S
 
K
A
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
Q
I
 
V

4jz8A Carbamate kinase from giardia lamblia bound to citric acid (see paper)
47% identity, 96% coverage: 3:299/309 of query aligns to 7:313/316 of 4jz8A

query
sites
4jz8A
I
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
N
|
N
A
 
A
L
 
M
L
 
L
R
 
Q
R
 
A
G
 
K
E
 
E
P
 
K
M
 
G
T
 
D
A
 
Y
D
 
D
N
 
T
Q
 
Q
R
 
R
A
 
K
N
 
N
I
 
V
R
 
E
I
 
I
A
 
A
T
 
A
E
 
S
Q
 
E
I
 
I
A
 
Y
K
 
K
I
 
I
H
 
H
-
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
Y
E
 
K
L
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
T
H
 
S
G
|
G
N
|
N
G
|
G
P
|
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
L
 
A
L
 
I
S
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
N
A
 
Q
A
 
A
Y
 
A
T
 
A
Q
 
G
V
 
V
S
 
S
P
 
P
-
 
E
Y
 
M
P
 
P
L
 
L
D
 
H
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
E
 
M
T
 
S
E
 
Q
G
 
G
M
 
F
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
 
M
I
 
M
E
 
S
Q
 
Q
E
 
A
L
 
M
G
 
D
N
 
N
L
 
V
L
 
F
-
 
C
-
 
A
-
 
N
D
 
N
F
 
E
E
 
P
V
 
A
P
 
N
F
 
C
A
 
V
T
 
T
L
 
C
L
 
V
T
 
T
Q
 
Q
V
 
T
E
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
P
K
 
K
D
 
D
P
 
Q
A
 
A
F
 
F
Q
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
K
|
K
P
 
P
I
 
V
G
 
G
P
 
R
V
 
F
Y
 
Y
S
 
T
K
 
E
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
E
 
K
K
 
D
L
 
L
-
 
M
A
 
A
A
 
A
E
 
N
K
 
P
G
 
G
W
 
K
A
 
I
I
 
L
A
 
R
P
 
E
D
 
D
-
 
A
G
 
G
D
 
R
K
 
G
Y
 
W
R
|
R
R
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
P
 
P
K
 
L
R
 
E
I
 
I
F
 
V
E
 
E
I
 
Y
R
 
G
P
 
V
I
 
I
T
 
K
W
 
T
L
 
L
L
 
I
D
 
D
K
 
N
G
 
N
S
 
V
I
 
L
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
T
G
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
P
 
P
T
 
C
M
 
K
Y
 
R
G
 
-
E
 
E
D
 
N
G
 
K
K
 
V
L
 
I
R
 
S
G
 
G
I
 
V
E
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
K
|
K
D
 
D
L
 
L
C
 
A
S
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
K
Q
 
T
L
 
L
K
 
N
A
 
S
D
 
D
L
 
Y
L
 
L
V
 
M
I
 
I
A
 
L
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
L
A
 
N
A
 
A
F
 
C
I
 
I
D
 
N
F
 
Y
G
 
K
K
 
K
P
 
P
T
 
D
Q
 
E
K
 
R
A
 
K
I
 
L
G
 
E
Q
 
E
A
 
I
H
 
K
P
 
L
D
 
S
E
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
A
M
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
D
G
 
G
-
 
H
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
S
M
 
M
G
 
G
P
 
P
K
|
K
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
I
E
 
E
F
 
F
A
 
T
R
 
Q
Q
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
M
A
 
S
V
 
I
I
 
I
G
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
S
D
 
T
I
 
A
E
 
V
A
 
D
I
 
A
V
 
L
Q
 
N
G
 
G
S
 
K
A
 
C
G
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I

4jz7C Carbamate kinase from giardia lamblia bound to amp-pnp (see paper)
47% identity, 96% coverage: 3:299/309 of query aligns to 7:313/316 of 4jz7C

query
sites
4jz7C
I
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
N
|
N
A
 
A
L
 
M
L
 
L
R
 
Q
R
 
A
G
 
K
E
 
E
P
 
K
M
 
G
T
 
D
A
 
Y
D
 
D
N
 
T
Q
 
Q
R
 
R
A
 
K
N
 
N
I
 
V
R
 
E
I
 
I
A
 
A
T
 
A
E
 
S
Q
 
E
I
 
I
A
 
Y
K
 
K
I
 
I
H
 
H
-
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
Y
E
 
K
L
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
T
H
 
S
G
|
G
N
 
N
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
L
 
A
L
 
I
S
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
N
A
 
Q
A
 
A
Y
 
A
T
 
A
Q
 
G
V
 
V
S
 
S
P
 
P
-
 
E
Y
 
M
P
 
P
L
 
L
D
 
H
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
E
 
M
T
 
S
E
 
Q
G
 
G
M
 
F
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
 
M
I
 
M
E
 
S
Q
 
Q
E
 
A
L
 
M
G
 
D
N
 
N
L
 
V
L
 
F
-
 
C
-
 
A
-
 
N
D
 
N
F
 
E
E
 
P
V
 
A
P
 
N
F
 
C
A
 
V
T
 
T
L
 
C
L
 
V
T
 
T
Q
 
Q
V
 
T
E
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
P
K
 
K
D
 
D
P
 
Q
A
 
A
F
 
F
Q
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
K
|
K
P
 
P
I
 
V
G
 
G
P
 
R
V
 
F
Y
 
Y
S
 
T
K
 
E
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
E
 
K
K
 
D
L
 
L
-
 
M
A
 
A
A
 
A
E
 
N
K
 
P
G
 
G
W
 
K
A
 
I
I
 
L
A
 
R
P
 
E
D
 
D
-
 
A
G
 
G
D
 
R
K
 
G
Y
 
W
R
 
R
R
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
P
 
P
K
 
L
R
 
E
I
 
I
F
 
V
E
 
E
I
 
Y
R
 
G
P
 
V
I
 
I
T
 
K
W
 
T
L
 
L
L
 
I
D
 
D
K
 
N
G
 
N
S
 
V
I
 
L
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
T
G
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
P
 
P
T
 
C
M
 
K
Y
 
R
G
 
-
E
 
E
D
 
N
G
 
K
K
 
V
L
 
I
R
 
S
G
 
G
I
 
V
E
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
K
|
K
D
 
D
L
 
L
C
 
A
S
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
K
Q
 
T
L
 
L
K
 
N
A
 
S
D
 
D
L
 
Y
L
 
L
V
 
M
I
 
I
A
 
L
T
|
T
D
|
D
V
|
V
N
 
L
A
x
N
A
|
A
F
x
C
I
 
I
D
 
N
F
x
Y
G
 
K
K
 
K
P
 
P
T
 
D
Q
 
E
K
 
R
A
 
K
I
 
L
G
 
E
Q
 
E
A
 
I
H
 
K
P
 
L
D
 
S
E
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
A
M
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
D
G
 
G
-
x
H
F
 
F
A
|
A
A
 
A
G
 
G
S
|
S
M
|
M
G
 
G
P
 
P
K
|
K
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
I
E
 
E
F
 
F
A
 
T
R
 
Q
Q
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
M
A
 
S
V
 
I
I
 
I
G
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
S
D
 
T
I
 
A
E
 
V
A
 
D
I
 
A
V
 
L
Q
 
N
G
 
G
S
 
K
A
 
C
G
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I

4olcA Carbamate kinase from giardia lamblia thiocarbamoylated by disulfiram on cys242 (see paper)
47% identity, 96% coverage: 3:299/309 of query aligns to 6:305/308 of 4olcA

query
sites
4olcA
I
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
N
|
N
A
 
A
L
 
M
L
 
L
R
 
Q
R
 
A
G
 
K
E
 
E
P
 
K
M
 
G
T
 
D
A
 
Y
D
 
D
N
 
T
Q
 
Q
R
 
R
A
 
K
N
 
N
I
 
V
R
 
E
I
 
I
A
 
A
T
 
A
E
 
S
Q
 
E
I
 
I
A
 
Y
K
 
K
I
 
I
H
 
H
-
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
Y
E
 
K
L
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
T
H
 
S
G
 
G
N
 
N
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
L
 
A
L
 
I
S
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
N
A
 
Q
A
 
A
Y
 
A
T
 
A
Q
 
G
V
 
V
S
 
S
P
 
P
-
 
E
Y
 
M
P
 
P
L
 
L
D
 
H
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
E
 
M
T
 
S
E
 
Q
G
 
G
M
 
F
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
 
M
I
 
M
E
 
S
Q
 
Q
E
 
A
L
 
M
G
 
D
N
 
N
L
 
V
L
 
F
-
 
C
-
 
A
-
 
N
D
 
N
F
 
E
E
 
P
V
 
A
P
 
N
F
 
C
A
 
V
T
 
T
L
 
C
L
 
V
T
 
T
Q
 
Q
V
 
T
E
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
P
K
 
K
D
 
D
P
 
Q
A
 
A
F
 
F
Q
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
K
|
K
P
 
P
I
 
V
G
 
G
P
 
R
V
 
F
Y
 
Y
S
 
T
K
 
E
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
E
 
K
K
 
D
L
 
L
-
 
M
A
 
A
A
 
A
E
 
N
K
 
P
G
 
G
W
 
K
A
 
I
I
 
L
A
 
R
P
 
E
D
 
D
-
 
A
G
 
G
D
 
R
K
 
G
Y
 
W
R
 
R
R
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
P
 
P
K
 
L
R
 
E
I
 
I
F
 
V
E
 
E
I
 
Y
R
 
G
P
 
V
I
 
I
T
 
K
W
 
T
L
 
L
L
 
I
D
 
D
K
 
N
G
 
N
S
 
V
I
 
L
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
T
G
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
P
 
P
T
 
C
M
 
K
Y
 
R
G
 
-
E
 
E
D
 
N
G
 
K
K
 
V
L
 
I
R
 
S
G
 
G
I
 
V
E
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
K
|
K
D
 
D
L
 
L
C
 
A
S
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
K
Q
 
T
L
 
L
K
 
N
A
 
S
D
 
D
L
 
Y
L
 
L
V
 
M
I
 
I
A
 
L
T
 
T
D
|
D
V
 
V
N
x
L
A
 
N
A
 
A
F
 
C
I
 
I
D
 
R
F
 
-
G
 
-
K
 
-
P
 
-
T
 
K
Q
 
L
K
 
E
A
 
E
I
 
I
G
 
K
Q
 
L
A
 
S
H
 
E
P
 
I
D
 
L
E
 
A
M
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
D
G
 
G
-
 
H
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
S
M
 
M
G
 
G
P
 
P
K
|
K
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
I
E
 
E
F
 
F
A
 
T
R
 
Q
Q
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
M
A
 
S
V
 
I
I
 
I
G
 
T
S
 
S
L
 
L
S
|
S
D
 
T
I
 
A
E
 
V
A
 
D
I
 
A
V
 
L
Q
 
N
G
 
G
S
 
K
A
 
C
G
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I

3kzfB Structure of giardia carbamate kinase (see paper)
45% identity, 96% coverage: 3:299/309 of query aligns to 6:295/298 of 3kzfB

query
sites
3kzfB
I
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
N
|
N
A
 
A
L
 
M
L
 
L
R
 
Q
R
 
A
G
 
K
E
 
E
P
 
K
M
 
G
T
 
D
A
 
Y
D
 
D
N
 
T
Q
 
Q
R
 
R
A
 
K
N
 
N
I
 
V
R
 
E
I
 
I
A
 
A
T
 
A
E
 
S
Q
 
E
I
 
I
A
 
Y
K
 
K
I
 
I
H
 
H
-
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
Y
E
 
K
L
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
T
H
 
S
G
 
G
N
 
N
G
|
G
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
L
 
A
L
 
I
S
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
N
A
 
Q
A
 
A
Y
 
A
T
 
A
Q
 
G
V
 
V
S
 
S
P
 
P
-
 
E
Y
 
M
P
 
P
L
 
L
D
 
H
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
E
 
M
T
 
S
E
 
Q
G
 
G
M
 
F
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
 
M
I
 
M
E
 
S
Q
 
Q
E
 
A
L
 
M
G
 
D
N
 
N
L
 
V
L
 
F
-
 
C
-
 
A
-
 
N
D
 
N
F
 
E
E
 
P
V
 
A
P
 
N
F
 
C
A
 
V
T
 
T
L
 
C
L
 
V
T
 
T
Q
 
Q
V
 
T
E
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
P
K
 
K
D
 
D
P
 
Q
A
 
A
F
 
F
Q
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
K
|
K
P
 
P
I
 
V
G
 
G
P
 
R
V
 
F
Y
 
Y
S
 
T
K
 
E
A
 
I
E
 
L
A
 
R
E
 
E
K
 
D
L
 
-
A
 
-
A
 
A
E
 
G
K
 
R
G
 
G
W
 
W
A
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
Y
 
-
R
 
R
R
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
P
 
P
K
 
L
R
 
E
I
 
I
F
 
V
E
 
E
I
 
Y
R
 
G
P
 
V
I
 
I
T
 
K
W
 
T
L
 
L
L
 
I
D
 
D
K
 
N
G
 
N
S
 
V
I
 
L
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
T
G
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
P
 
P
T
 
C
M
 
K
Y
 
R
G
 
-
E
 
E
D
 
N
G
 
K
K
 
V
L
 
I
R
 
S
G
 
G
I
 
V
E
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
K
|
K
D
 
D
L
 
L
C
 
A
S
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
K
Q
 
T
L
 
L
K
 
N
A
 
S
D
 
D
L
 
Y
L
 
L
V
 
M
I
 
I
A
 
L
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
L
A
 
N
A
 
A
F
 
C
I
 
I
D
 
K
F
 
-
G
 
-
K
 
K
P
 
P
T
 
D
Q
 
E
K
 
R
A
 
K
I
 
L
G
 
E
Q
 
E
A
 
I
H
 
K
P
 
L
D
 
S
E
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
A
M
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
D
G
 
G
F
 
H
A
 
F
A
 
-
G
 
G
S
 
S
M
 
M
G
 
G
P
 
P
K
|
K
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
I
E
 
E
F
 
F
A
 
T
R
 
Q
Q
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
M
A
 
S
V
 
I
I
 
I
G
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
S
D
 
T
I
 
A
E
 
V
A
 
D
I
 
A
V
 
L
Q
 
N
G
 
G
S
 
K
A
 
C
G
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I

4jz7A Carbamate kinase from giardia lamblia bound to amp-pnp (see paper)
43% identity, 96% coverage: 3:299/309 of query aligns to 7:282/285 of 4jz7A

query
sites
4jz7A
I
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
N
|
N
A
 
A
L
 
M
L
 
L
R
 
Q
R
 
A
G
 
K
E
 
E
P
 
K
M
 
G
T
 
D
A
 
Y
D
 
D
N
 
T
Q
 
Q
R
 
R
A
 
K
N
 
N
I
 
V
R
 
E
I
 
I
A
 
A
T
 
A
E
 
S
Q
 
E
I
 
I
A
 
Y
K
 
K
I
 
I
H
 
H
-
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
Y
E
 
K
L
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
T
H
 
S
G
 
G
N
 
N
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
L
 
A
L
 
I
S
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
N
A
 
Q
A
 
A
Y
 
A
T
 
A
Q
 
G
V
 
V
S
 
S
P
 
P
-
 
E
Y
 
M
P
 
P
L
 
L
D
 
H
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
E
 
M
T
 
S
E
 
Q
G
 
G
M
 
F
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
 
M
I
 
M
E
 
S
Q
 
Q
E
 
A
L
 
M
G
 
D
N
 
N
L
 
V
L
 
F
-
 
C
-
 
A
-
 
N
D
 
N
F
 
E
E
 
P
V
 
A
P
 
N
F
 
C
A
 
V
T
 
T
L
 
C
L
 
V
T
 
T
Q
 
Q
V
 
T
E
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
P
K
 
K
D
 
D
P
 
Q
A
 
A
F
 
F
Q
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
K
|
K
P
 
P
I
 
V
G
 
-
P
 
-
V
 
-
Y
 
-
S
 
-
K
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
W
 
-
A
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
Y
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
V
V
 
V
A
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
P
 
P
K
 
L
R
 
E
I
 
I
F
 
V
E
 
E
I
 
Y
R
 
G
P
 
V
I
 
I
T
 
K
W
 
T
L
 
L
L
 
I
D
 
D
K
 
N
G
 
N
S
 
V
I
 
L
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
T
G
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
P
 
P
T
 
C
M
 
K
Y
 
R
G
 
-
E
 
E
D
 
N
G
 
K
K
 
V
L
 
I
R
 
S
G
 
G
I
 
V
E
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
K
|
K
D
 
D
L
 
L
C
 
A
S
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
K
Q
 
T
L
 
L
K
 
N
A
 
S
D
 
D
L
 
Y
L
 
L
V
 
M
I
 
I
A
 
L
T
|
T
D
|
D
V
|
V
N
 
L
A
 
N
A
|
A
F
x
C
I
 
I
D
 
N
F
x
Y
G
 
K
K
 
K
P
 
P
T
 
D
Q
 
E
K
 
R
A
 
K
I
 
L
G
 
E
Q
 
E
A
 
I
H
 
K
P
 
L
D
 
S
E
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
A
M
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
D
G
 
G
-
x
H
F
|
F
A
|
A
A
 
A
G
 
G
S
|
S
M
|
M
G
 
G
P
 
P
K
|
K
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
I
E
 
E
F
 
F
A
 
T
R
 
Q
Q
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
M
A
 
S
V
 
I
I
 
I
G
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
S
D
 
T
I
 
A
E
 
V
A
 
D
I
 
A
V
 
L
Q
 
N
G
 
G
S
 
K
A
 
C
G
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I

3kzfD Structure of giardia carbamate kinase (see paper)
44% identity, 96% coverage: 3:299/309 of query aligns to 6:290/293 of 3kzfD

query
sites
3kzfD
I
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
N
|
N
A
 
A
L
 
M
L
 
L
R
 
Q
R
 
A
G
 
K
E
 
E
P
 
K
M
 
G
T
 
D
A
 
Y
D
 
D
N
 
T
Q
 
Q
R
 
R
A
 
K
N
 
N
I
 
V
R
 
E
I
 
I
A
 
A
T
 
A
E
 
S
Q
 
E
I
 
I
A
 
Y
K
 
K
I
 
I
H
 
H
-
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
Y
E
 
K
L
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
T
H
 
S
G
 
G
N
 
N
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
L
 
A
L
 
I
S
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
N
A
 
Q
A
 
A
Y
 
A
T
 
A
Q
 
G
V
 
V
S
 
S
P
 
P
-
 
E
Y
 
M
P
 
P
L
 
L
D
 
H
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
E
 
M
T
 
S
E
 
Q
G
 
G
M
 
F
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
 
M
I
 
M
E
 
S
Q
 
Q
E
 
A
L
 
M
G
 
D
N
 
N
L
 
V
L
 
F
-
 
C
-
 
A
-
 
N
D
 
N
F
 
E
E
 
P
V
 
A
P
 
N
F
 
C
A
 
V
T
 
T
L
 
C
L
 
V
T
 
T
Q
 
Q
V
 
T
E
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
P
K
 
K
D
 
D
P
 
Q
A
 
A
F
 
F
Q
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
K
|
K
P
 
P
I
 
V
G
 
G
P
 
R
V
 
F
Y
 
Y
S
 
T
K
 
E
A
 
I
E
 
L
A
 
R
E
 
E
K
 
D
L
 
-
A
 
-
A
 
A
E
 
G
K
 
R
G
 
G
W
 
W
A
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
Y
 
-
R
 
R
R
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
P
 
P
K
 
L
R
 
E
I
 
I
F
 
V
E
 
E
I
 
Y
R
 
G
P
 
V
I
 
I
T
 
K
W
 
T
L
 
L
L
 
I
D
 
D
K
 
N
G
 
N
S
 
V
I
 
L
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
T
G
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
P
 
P
T
 
C
M
 
K
Y
 
R
G
 
-
E
 
E
D
 
N
G
 
K
K
 
V
L
 
I
R
 
S
G
 
G
I
 
V
E
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
K
|
K
D
 
D
L
 
L
C
 
A
S
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
K
Q
 
T
L
 
L
K
 
N
A
 
S
D
 
D
L
 
Y
L
 
L
V
 
M
I
 
I
A
 
L
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
I
 
L
D
 
N
F
 
A
G
 
C
K
 
E
P
 
R
T
 
K
Q
 
L
K
 
E
A
 
E
I
 
I
G
 
K
Q
 
L
A
 
S
H
 
E
P
 
I
D
 
L
E
 
A
M
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
D
G
 
G
F
 
H
A
 
F
A
 
-
G
 
G
S
 
S
M
 
M
G
 
G
P
 
P
K
|
K
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
I
E
 
E
F
 
F
A
 
T
R
 
Q
Q
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
M
A
 
S
V
 
I
I
 
I
G
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
S
D
 
T
I
 
A
E
 
V
A
 
D
I
 
A
V
 
L
Q
 
N
G
 
G
S
 
K
A
 
C
G
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I

P0A2X8 Carbamate kinase 1; EC 2.7.2.2 from Enterococcus faecium (Streptococcus faecium) (see 2 papers)
43% identity, 93% coverage: 2:287/309 of query aligns to 4:295/310 of P0A2X8

query
sites
P0A2X8
R
 
K
I
 
M
V
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
I
L
 
L
R
 
S
R
 
N
G
 
D
E
 
A
P
 
S
M
 
A
T
 
H
A
 
A
D
 
-
N
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
A
N
 
L
I
 
V
R
 
Q
I
 
T
A
 
S
T
 
A
E
 
Y
Q
 
L
I
 
V
A
 
H
K
 
L
I
 
I
H
 
K
A
 
Q
G
 
G
N
 
H
E
 
R
L
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
S
H
 
H
G
 
G
N
 
N
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
-
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
L
L
 
Q
Q
 
Q
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
Y
 
D
T
 
S
Q
 
E
V
 
K
S
 
N
P
 
P
-
 
A
Y
 
M
P
 
P
L
 
L
D
 
D
V
 
T
L
 
C
G
 
V
A
 
A
E
 
M
T
 
T
E
 
Q
G
 
G
M
 
S
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
 
W
I
 
L
E
 
S
Q
 
N
E
 
A
L
 
L
G
 
N
N
 
Q
L
 
E
L
 
L
D
 
N
-
 
K
-
 
A
-
 
G
F
 
I
E
 
K
V
 
K
P
 
Q
F
 
V
A
 
A
T
 
T
L
 
V
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
E
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
P
K
 
A
D
 
D
P
 
E
A
 
A
F
 
F
Q
 
K
N
 
N
P
 
P
T
 
T
K
 
K
P
 
P
I
 
I
G
 
G
P
 
P
V
 
F
Y
 
L
S
 
T
K
x
E
A
 
A
E
|
E
A
 
A
E
 
-
K
|
K
L
x
E
A
 
A
A
 
M
E
 
Q
K
 
A
G
 
G
W
 
A
A
 
I
I
 
F
A
 
K
P
 
E
D
 
D
-
 
A
G
 
G
D
 
R
K
 
G
Y
 
W
R
 
R
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
K
P
 
P
K
 
I
R
 
D
I
 
I
F
 
H
E
 
E
I
 
A
R
 
E
P
 
T
I
 
I
T
 
N
W
 
T
L
 
L
L
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
D
S
 
I
I
 
I
V
 
T
I
 
I
C
 
S
A
 
C
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
P
 
P
T
 
V
M
 
V
Y
 
G
G
 
Q
E
 
E
D
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
L
R
 
K
G
 
G
I
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
|
D
K
 
K
D
|
D
L
 
F
C
 
A
S
 
S
S
 
E
L
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
E
Q
 
L
L
 
V
K
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
A
L
 
L
V
 
V
I
 
I
A
 
L
T
 
T
D
 
G
V
 
V
N
 
D
A
 
Y
A
 
V
F
 
C
I
 
I
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
K
 
K
P
 
P
T
 
D
Q
 
E
K
 
K
A
 
Q
I
 
L
G
 
T
Q
 
N
A
 
V
H
 
T
P
 
V
D
 
A
E
 
E
M
 
L
E
 
E
K
 
E
L
 
Y
-
 
K
-
 
Q
-
 
A
-
 
G
G
 
H
F
 
F
A
 
A
A
 
P
G
 
G
S
 
S
M
 
M
G
 
L
P
 
P
K
 
K
V
 
I
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
C
 
I
E
 
Q
F
 
F
A
 
V
R
 
E
-
 
S
Q
 
Q
T
 
P
G
 
N
K
 
K
T
 
Q
A
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
E
D
 
N
I
 
L

Sites not aligning to the query:

2we5A Carbamate kinase from enterococcus faecalis bound to mgadp (see paper)
43% identity, 93% coverage: 2:287/309 of query aligns to 3:294/309 of 2we5A

query
sites
2we5A
R
 
K
I
 
M
V
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
N
|
N
A
 
A
L
 
I
L
 
L
R
 
S
R
 
N
G
 
D
E
 
A
P
 
S
M
 
A
T
 
H
A
 
A
D
 
-
N
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
A
N
 
L
I
 
V
R
 
Q
I
 
T
A
 
S
T
 
A
E
 
Y
Q
 
L
I
 
V
A
 
H
K
 
L
I
 
I
H
 
K
A
 
Q
G
 
G
N
 
H
E
 
R
L
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
S
H
 
H
G
 
G
N
 
N
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
-
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
L
L
 
Q
Q
 
Q
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
Y
 
D
T
 
S
Q
 
E
V
 
K
S
 
N
P
 
P
-
 
A
Y
 
M
P
 
P
L
 
L
D
 
D
V
 
T
L
 
C
G
 
V
A
 
A
E
 
M
T
 
T
E
 
Q
G
 
G
M
 
S
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
 
W
I
 
L
E
 
S
Q
 
N
E
 
A
L
 
L
G
 
N
N
 
Q
L
 
E
L
 
L
D
 
N
-
 
K
-
 
A
-
 
G
F
 
I
E
 
K
V
 
K
P
 
Q
F
 
V
A
 
A
T
 
T
L
 
V
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
E
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
P
K
 
A
D
 
D
P
 
E
A
 
A
F
 
F
Q
 
K
N
 
N
P
 
P
T
 
T
K
|
K
P
 
P
I
 
I
G
 
G
P
 
P
V
 
F
Y
 
L
S
 
T
K
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
-
K
 
K
L
 
E
A
 
A
A
 
M
E
 
Q
K
 
A
G
 
G
W
 
A
A
 
I
I
 
F
A
 
K
P
 
E
D
 
D
-
 
A
G
 
G
D
 
R
K
 
G
Y
 
W
R
 
R
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
K
P
 
P
K
 
I
R
 
D
I
 
I
F
 
H
E
 
E
I
 
A
R
 
E
P
 
T
I
 
I
T
 
N
W
 
T
L
 
L
L
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
D
S
 
I
I
 
I
V
 
T
I
 
I
C
 
S
A
 
C
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
P
 
P
T
 
V
M
 
V
Y
 
G
G
 
Q
E
 
E
D
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
L
R
 
K
G
 
G
I
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
K
|
K
D
 
D
L
 
F
C
 
A
S
 
S
S
 
E
L
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
E
Q
 
L
L
 
V
K
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
A
L
 
L
V
 
V
I
 
I
A
 
L
T
|
T
D
x
G
V
|
V
N
 
D
A
 
Y
A
x
V
F
x
C
I
 
I
D
 
N
F
x
Y
G
 
G
K
 
K
P
 
P
T
 
D
Q
 
E
K
 
K
A
 
Q
I
 
L
G
 
T
Q
 
N
A
 
V
H
 
T
P
 
V
D
 
A
E
 
E
M
 
L
E
 
E
K
 
E
L
 
Y
-
 
K
-
 
Q
-
 
A
-
 
G
G
x
H
F
|
F
A
|
A
A
 
P
G
 
G
S
|
S
M
|
M
G
 
L
P
 
P
K
|
K
V
 
I
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
C
 
I
E
 
Q
F
 
F
A
 
V
R
 
E
-
 
S
Q
 
Q
T
 
P
G
 
N
K
 
K
T
 
Q
A
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
E
D
 
N
I
 
L

2we4A Carbamate kinase from enterococcus faecalis bound to a sulfate ion and two water molecules, which mimic the substrate carbamyl phosphate (see paper)
43% identity, 93% coverage: 2:287/309 of query aligns to 3:294/309 of 2we4A

query
sites
2we4A
R
x
K
I
 
M
V
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
N
|
N
A
 
A
L
 
I
L
 
L
R
 
S
R
 
N
G
 
D
E
 
A
P
 
S
M
 
A
T
 
H
A
 
A
D
 
-
N
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
A
N
 
L
I
 
V
R
 
Q
I
 
T
A
 
S
T
 
A
E
 
Y
Q
 
L
I
 
V
A
 
H
K
 
L
I
 
I
H
 
K
A
 
Q
G
 
G
N
 
H
E
x
R
L
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
S
H
 
H
G
|
G
N
|
N
G
|
G
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
-
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
L
L
 
Q
Q
 
Q
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
Y
 
D
T
 
S
Q
 
E
V
 
K
S
 
N
P
 
P
-
 
A
Y
 
M
P
 
P
L
 
L
D
 
D
V
 
T
L
 
C
G
 
V
A
 
A
E
 
M
T
 
T
E
 
Q
G
 
G
M
 
S
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
 
W
I
 
L
E
 
S
Q
 
N
E
 
A
L
 
L
G
 
N
N
 
Q
L
 
E
L
 
L
D
 
N
-
 
K
-
 
A
-
 
G
F
 
I
E
 
K
V
 
K
P
 
Q
F
 
V
A
 
A
T
 
T
L
 
V
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
E
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
P
K
 
A
D
 
D
P
 
E
A
 
A
F
 
F
Q
 
K
N
 
N
P
 
P
T
 
T
K
|
K
P
 
P
I
 
I
G
 
G
P
 
P
V
 
F
Y
 
L
S
 
T
K
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
-
K
 
K
L
 
E
A
 
A
A
 
M
E
 
Q
K
 
A
G
 
G
W
 
A
A
 
I
I
 
F
A
 
K
P
 
E
D
 
D
-
 
A
G
 
G
D
x
R
K
 
G
Y
 
W
R
|
R
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
K
P
 
P
K
 
I
R
 
D
I
 
I
F
 
H
E
 
E
I
 
A
R
 
E
P
 
T
I
 
I
T
 
N
W
 
T
L
 
L
L
x
I
D
x
K
K
 
N
G
 
D
S
 
I
I
 
I
V
 
T
I
 
I
C
 
S
A
 
C
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
P
 
P
T
 
V
M
 
V
Y
 
G
G
 
Q
E
 
E
D
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
L
R
 
K
G
 
G
I
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
K
|
K
D
 
D
L
 
F
C
 
A
S
 
S
S
 
E
L
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
E
Q
 
L
L
 
V
K
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
A
L
 
L
V
 
V
I
 
I
A
 
L
T
 
T
D
 
G
V
 
V
N
 
D
A
 
Y
A
 
V
F
 
C
I
|
I
D
x
N
F
 
Y
G
 
G
K
 
K
P
 
P
T
 
D
Q
 
E
K
 
K
A
 
Q
I
 
L
G
 
T
Q
 
N
A
 
V
H
 
T
P
 
V
D
 
A
E
 
E
M
 
L
E
 
E
K
 
E
L
 
Y
-
 
K
-
 
Q
-
 
A
-
 
G
G
x
H
F
|
F
A
 
A
A
 
P
G
 
G
S
 
S
M
 
M
G
 
L
P
 
P
K
|
K
V
 
I
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
C
 
I
E
 
Q
F
 
F
A
 
V
R
 
E
-
 
S
Q
 
Q
T
 
P
G
 
N
K
 
K
T
 
Q
A
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
E
D
 
N
I
 
L

4axsA Structure of carbamate kinase from mycoplasma penetrans (see paper)
36% identity, 96% coverage: 2:299/309 of query aligns to 1:289/291 of 4axsA

query
sites
4axsA
R
 
R
I
 
I
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
N
|
N
A
 
A
L
 
L
L
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
M
 
-
T
 
-
A
 
G
D
 
D
N
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
A
 
E
N
 
L
I
 
V
R
 
K
I
 
I
A
 
P
T
 
A
E
 
A
Q
 
K
I
 
I
A
 
A
K
 
A
-
 
L
I
 
I
H
 
Q
A
 
E
G
 
G
N
 
H
E
 
E
L
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
G
H
 
H
G
|
G
N
|
N
G
|
G
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
L
 
M
L
 
I
S
 
F
L
 
N
Q
 
A
A
 
F
A
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
K
-
 
K
A
 
A
Y
 
N
T
 
E
Q
 
K
V
 
T
S
 
A
P
 
L
Y
 
V
P
 
P
L
 
F
D
 
A
V
 
E
L
 
A
G
 
G
A
 
G
E
 
M
T
 
S
E
 
Q
G
 
G
M
 
Y
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
 
H
I
 
M
E
 
L
Q
 
T
E
 
A
L
 
I
G
 
S
N
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
K
L
 
K
L
 
L
D
 
N
F
 
I
E
 
Q
V
 
K
P
 
D
F
 
V
A
 
L
T
 
Y
L
 
F
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
V
 
T
E
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
A
K
 
N
D
 
D
P
 
P
A
 
A
F
 
F
Q
 
K
N
 
N
P
 
P
T
 
T
K
|
K
P
 
P
I
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
F
Y
 
Y
S
 
S
K
 
N
A
 
P
E
 
N
A
 
S
E
 
V
K
 
I
L
 
V
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
W
 
-
A
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
Y
 
-
R
 
-
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
S
P
 
P
R
 
I
P
 
P
K
 
V
R
 
D
I
 
F
F
 
I
E
 
G
I
 
I
R
 
D
P
 
A
I
 
I
T
 
K
W
 
Q
L
 
N
L
 
V
D
 
N
K
 
N
G
 
G
S
 
C
I
 
V
V
 
C
I
 
I
C
 
V
A
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
P
 
P
T
 
T
M
 
I
Y
 
I
G
 
-
E
 
Q
D
 
D
G
 
N
K
 
Q
L
 
Y
R
 
I
G
 
G
I
 
V
E
 
D
A
 
G
V
 
V
I
 
I
D
 
D
K
|
K
D
 
D
L
 
F
C
 
A
S
 
L
S
 
A
L
 
K
L
 
I
A
 
A
S
 
D
Q
 
A
L
 
V
K
 
N
A
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
F
V
 
V
I
 
V
A
x
L
T
|
T
D
 
A
V
 
V
N
 
D
A
 
Y
A
 
V
F
 
Y
I
 
V
D
 
D
F
 
F
G
 
N
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
I
 
L
G
 
K
-
 
T
-
 
V
-
 
D
-
 
V
Q
 
K
A
 
A
H
 
L
P
 
N
D
 
N
E
 
F
M
 
I
E
 
N
K
 
Q
L
 
D
G
 
Q
F
 
F
A
 
A
A
 
K
G
 
G
S
 
S
M
 
M
G
 
L
P
 
P
K
|
K
V
 
I
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
C
 
M
E
 
G
F
 
F
A
 
V
R
 
N
-
 
G
Q
 
H
T
 
P
G
 
N
K
 
R
T
 
S
A
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
A
S
 
D
L
 
L
S
 
S
D
 
K
I
 
V
E
 
E
A
 
D
I
 
A
V
 
L
Q
 
K
G
 
G
S
 
L
A
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
K
I
 
I

Query Sequence

>GFF4363 FitnessBrowser__WCS417:GFF4363
MRIVVALGGNALLRRGEPMTADNQRANIRIATEQIAKIHAGNELVIAHGNGPQVGLLSLQ
AAAYTQVSPYPLDVLGAETEGMIGYIIEQELGNLLDFEVPFATLLTQVEVDAKDPAFQNP
TKPIGPVYSKAEAEKLAAEKGWAIAPDGDKYRRVVASPRPKRIFEIRPITWLLDKGSIVI
CAGGGGIPTMYGEDGKLRGIEAVIDKDLCSSLLASQLKADLLVIATDVNAAFIDFGKPTQ
KAIGQAHPDEMEKLGFAAGSMGPKVQAACEFARQTGKTAVIGSLSDIEAIVQGSAGTRIS
TAKPGITYL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory