SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF443 PGA1_c04540 putative d-galactonate dehydratase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3rcyF Crystal structure of mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme- like protein from roseovarius sp. Tm1035
76% identity, 96% coverage: 1:395/410 of query aligns to 1:395/397 of 3rcyF

query
sites
3rcyF
M
 
V
K
 
K
L
 
L
Q
 
R
D
 
D
L
 
L
D
 
D
I
 
I
I
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
W
 
W
I
 
I
L
 
L
V
 
V
K
 
K
V
 
L
T
 
T
T
 
T
D
 
D
T
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
T
G
 
G
W
 
W
G
 
G
E
 
E
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
V
 
V
G
 
G
P
 
P
D
 
E
A
 
A
M
 
M
T
 
R
H
 
A
V
 
V
I
 
I
R
 
E
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
A
R
 
R
H
 
H
M
 
M
Q
 
E
G
 
G
M
 
E
N
 
N
P
 
P
E
 
E
N
 
N
I
 
I
E
 
E
W
 
L
M
 
M
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
G
 
G
F
 
F
T
 
T
Q
 
Q
R
|
R
P
|
P
D
 
D
L
 
L
S
 
T
V
 
A
M
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
F
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
I
 
I
A
 
A
C
 
C
W
 
W
D
 
D
I
 
I
L
 
L
G
 
G
K
 
K
D
 
A
R
 
R
D
 
G
R
 
R
P
 
P
V
 
V
H
 
W
A
 
A
L
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
K
M
 
M
N
 
N
D
 
P
R
 
R
L
 
I
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
P
 
P
H
 
H
H
 
H
D
 
P
I
 
I
D
 
T
A
 
P
F
 
F
W
 
W
N
 
T
T
 
S
P
 
A
E
 
D
L
 
M
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
A
A
 
D
A
 
C
V
 
V
E
 
A
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
V
 
V
K
|
K
F
 
F
D
|
D
P
 
P
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
T
 
T
M
 
L
R
|
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
M
 
M
P
 
P
A
 
A
Q
 
M
S
 
T
D
 
D
I
 
I
T
 
S
Q
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
E
F
 
F
C
 
C
R
 
R
A
 
K
I
 
I
R
 
R
E
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
K
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
F
 
F
G
|
G
T
 
T
H
|
H
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
T
 
T
P
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
I
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
P
Y
 
Y
E
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
F
 
Y
E
|
E
E
 
E
P
 
P
T
 
V
P
 
P
P
|
P
D
|
D
L
 
N
V
 
V
A
 
G
D
 
A
M
 
M
A
 
A
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
D
 
R
R
 
A
V
 
V
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
T
 
T
G
|
G
E
|
E
R
 
R
L
|
L
T
 
T
T
 
T
K
 
K
A
|
A
E
|
E
F
 
F
A
 
A
A
 
P
I
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
E
 
A
I
 
I
L
 
L
Q
|
Q
P
 
P
A
|
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
S
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
W
 
W
E
 
E
T
 
M
K
 
K
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
M
A
 
A
E
 
E
V
 
V
F
 
Y
G
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
M
A
 
A
P
 
P
H
|
H
L
 
L
Y
 
Y
A
|
A
G
 
G
P
 
P
V
 
V
E
 
E
W
 
W
A
 
A
A
 
A
N
 
N
I
 
V
Q
 
H
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
I
P
 
P
N
 
N
L
 
I
L
|
L
M
 
M
I
 
C
E
|
E
T
 
S
I
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
F
 
F
H
 
H
T
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
I
K
 
K
Q
 
G
G
 
S
I
 
I
T
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
G
G
 
G
F
 
Y
V
 
I
I
 
T
P
 
P
S
 
P
D
 
E
T
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
E
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
I
 
H
G
 
G
D
 
T
D
 
G
L
 
L
H
 
H
L
 
L
N
 
E
M
 
M
Q
 
Q
D
 
E
A
 
A
P
 
S
C
 
C
N
 
D
Y
 
Y

4e5tA Crystal structure of a putative mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme (target psi-200750) from labrenzia alexandrii dfl- 11
54% identity, 96% coverage: 1:392/410 of query aligns to 1:389/392 of 4e5tA

query
sites
4e5tA
M
 
M
K
 
R
L
 
L
Q
 
S
D
 
D
L
 
I
D
 
E
I
 
T
I
 
F
V
 
V
T
 
V
A
 
G
P
 
N
P
 
P
A
 
P
P
 
P
G
 
R
W
 
H
G
 
G
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
W
 
F
I
 
I
L
 
F
V
 
V
K
 
K
V
 
L
T
 
V
T
 
T
D
 
A
T
 
C
G
 
G
I
 
I
T
 
T
G
 
G
W
 
Y
G
 
G
E
 
E
C
 
I
Y
 
Y
A
 
N
A
 
A
S
 
T
V
 
F
G
 
G
P
 
P
D
 
D
A
 
L
M
 
V
T
 
A
H
 
K
V
 
M
I
 
A
R
 
E
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
A
R
 
R
H
 
Q
M
 
F
Q
 
A
G
 
G
M
 
E
N
 
D
P
 
P
E
 
H
N
 
H
I
 
I
E
 
E
W
 
K
M
 
L
F
 
W
R
 
H
R
 
K
A
 
T
Y
 
Y
S
 
G
S
 
A
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
D
 
D
L
 
V
S
 
T
V
 
V
M
 
M
G
 
G
A
 
V
F
 
L
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
I
 
M
A
 
A
C
 
C
W
 
W
D
 
D
I
 
I
L
 
I
G
 
G
K
 
K
D
 
A
R
 
A
D
 
G
R
 
K
P
 
P
V
 
A
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
K
M
 
V
N
 
H
D
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
R
A
 
S
Y
 
Y
T
 
T
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
L
 
K
P
 
P
H
 
N
H
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
V
W
 
Y
N
 
N
T
 
D
P
 
A
E
 
D
L
 
M
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
A
A
 
A
I
 
A
A
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
D
K
 
Q
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
A
 
A
V
 
V
K
 
K
F
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
A
G
 
G
P
 
A
Y
 
Y
T
 
T
M
 
I
R
 
Y
G
 
D
G
 
G
H
 
H
M
 
Q
P
 
P
A
 
S
Q
 
L
S
 
E
D
 
D
I
 
L
T
 
E
Q
 
R
S
 
S
V
 
E
A
 
A
F
 
F
C
 
C
R
 
K
A
 
Q
I
 
I
R
 
R
E
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
T
R
 
K
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
F
 
F
G
 
G
T
 
T
H
 
H
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
T
 
T
P
 
V
A
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
A
Q
 
R
A
 
R
L
 
L
E
 
E
S
 
A
Y
 
Y
E
 
D
P
 
P
L
 
L
W
 
W
F
 
F
E
|
E
E
 
E
P
 
P
T
 
I
P
 
P
P
 
P
D
 
E
L
 
K
V
 
P
A
 
E
D
 
D
M
 
M
A
 
A
R
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
R
R
 
Y
V
 
T
R
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
E
|
E
R
 
R
L
 
L
T
 
C
T
 
T
K
 
K
A
 
Y
E
 
E
F
 
F
A
 
S
A
 
R
I
 
V
L
 
L
R
 
E
A
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
E
 
S
I
 
I
L
 
L
Q
 
Q
P
 
M
A
 
N
L
 
L
G
 
G
R
 
R
S
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
L
W
 
L
E
 
E
T
 
A
K
 
K
K
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
M
A
 
A
E
 
E
V
 
C
F
 
H
G
 
S
A
 
A
Q
 
Q
M
 
I
A
 
A
P
 
P
H
 
H
L
 
L
Y
 
Y
A
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
L
E
 
V
W
 
A
A
 
L
A
 
A
N
 
N
I
 
I
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
T
S
 
C
I
 
S
P
 
P
N
 
N
L
 
F
L
 
L
M
 
V
I
 
L
E
 
E
T
 
S
I
 
I
E
 
R
T
 
T
-
 
F
-
 
D
P
 
G
F
 
F
H
 
F
T
 
A
A
 
E
L
 
L
I
 
L
K
 
T
Q
 
T
G
 
P
I
 
I
T
 
R
V
 
W
E
 
E
D
 
N
G
 
G
F
 
Y
V
 
I
I
 
I
P
 
P
S
 
S
D
 
Q
T
 
E
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
H
E
 
D
V
 
L
D
 
N
E
 
E
D
 
D
L
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
I
 
T
G
 
G
D
 
S
D
 
D
L
 
L
H
 
H
L
 
L
N
 
G
M
 
F
Q
 
Q
D
 
E
A
 
T
P
 
P

3sjnA Crystal structure of enolase spea_3858 (target efi-500646) from shewanella pealeana with magnesium bound
30% identity, 91% coverage: 1:373/410 of query aligns to 2:366/373 of 3sjnA

query
sites
3sjnA
M
 
L
K
 
K
L
 
I
Q
 
T
D
 
D
L
 
I
D
 
E
I
 
V
I
 
L
V
 
H
T
 
L
A
 
R
P
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
M
G
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
C
-
 
E
W
 
W
G
 
G
G
 
-
R
 
E
Y
 
D
W
 
A
I
 
V
L
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
V
T
 
H
T
 
T
D
 
D
T
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
V
G
 
G
W
 
V
G
 
G
E
 
E
C
 
A
Y
 
D
A
x
S
A
 
S
S
 
P
V
x
L
G
 
V
P
 
V
D
 
Q
A
 
A
-
 
C
-
 
I
-
 
E
-
 
A
-
 
P
M
 
Q
T
 
T
H
 
N
V
 
F
I
 
Y
R
 
C
D
 
N
V
 
G
F
 
L
E
 
K
R
 
R
H
 
L
M
 
L
Q
 
I
G
 
G
M
 
E
N
 
N
P
 
A
E
 
L
N
 
E
I
 
I
E
 
E
W
 
R
M
 
L
F
 
W
R
 
N
R
 
K
A
 
M
Y
 
Y
-
 
W
S
 
G
S
 
S
G
 
N
F
 
Y
T
 
M
Q
 
G
R
 
R
P
 
R
D
 
G
L
 
A
S
 
G
V
 
I
M
 
H
G
 
-
A
 
A
F
 
I
S
 
S
G
 
A
L
 
I
E
 
D
I
 
I
A
 
A
C
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
I
L
 
A
G
 
G
K
 
Q
D
 
F
R
 
Y
D
 
G
R
 
V
P
 
P
V
 
V
H
 
H
A
 
T
L
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
K
M
 
Y
N
 
R
D
 
D
R
 
K
L
 
I
R
 
R
A
 
C
Y
 
Y
T
 
G
Y
x
T
L
 
F
Y
 
I
P
 
P
L
 
A
P
 
-
H
 
-
H
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
-
W
 
-
N
 
D
T
 
K
P
 
P
E
 
E
L
 
D
A
 
N
A
 
V
E
 
A
S
 
I
A
 
V
I
 
Q
A
 
G
A
 
L
V
 
K
E
 
D
K
 
Q
G
 
G
Y
 
F
T
 
S
A
 
S
V
 
I
K
|
K
F
 
F
D
x
G
P
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
Y
 
-
T
 
-
M
 
-
R
 
-
G
 
G
G
 
G
H
 
V
M
|
M
P
 
G
A
 
D
Q
 
D
S
 
P
D
 
D
I
 
-
T
 
-
Q
 
T
S
 
D
V
 
Y
A
 
A
F
 
I
C
 
V
R
 
K
A
 
A
I
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
A
G
 
G
D
 
P
R
 
E
A
 
M
D
 
E
L
 
V
L
 
Q
F
 
I
G
x
D
T
 
L
H
x
A
G
 
S
Q
 
K
F
 
W
T
 
H
P
 
T
A
 
C
G
 
G
-
 
H
A
 
S
I
 
A
R
 
M
L
 
M
G
 
A
Q
 
K
A
 
R
L
 
L
E
 
E
S
 
E
Y
 
F
E
 
N
P
 
L
L
 
N
W
 
W
F
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
T
 
V
P
 
L
P
 
A
D
 
D
L
 
S
V
 
L
A
 
I
D
 
S
M
 
Y
A
 
E
R
 
K
V
 
L
A
 
S
D
 
R
R
 
Q
V
 
V
R
 
S
I
 
Q
P
 
K
V
x
I
A
 
A
T
 
G
G
|
G
E
|
E
R
x
S
L
 
L
T
 
T
T
 
T
K
 
R
A
 
Y
E
 
E
F
 
F
A
 
Q
A
 
E
I
 
F
L
 
I
R
 
T
A
 
K
G
 
S
A
 
N
A
 
A
E
 
D
I
 
I
L
 
V
Q
|
Q
P
 
P
A
x
D
L
 
I
G
 
T
R
 
R
S
 
C
G
 
G
G
 
G
I
 
I
W
 
T
E
 
E
T
 
M
K
 
K
K
 
K
I
 
I
A
 
Y
A
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
Q
V
 
M
F
 
N
G
 
G
A
 
T
Q
 
Q
M
 
L
A
 
I
P
 
P
H
|
H
L
x
G
Y
x
F
A
 
S
G
 
T
P
 
G
V
 
I
E
 
L
W
 
L
A
 
H
A
 
A
N
 
S
I
 
V
Q
 
H
L
 
F
A
 
L
A
 
A
S
 
A
I
 
C
P
 
E
N
 
Q
-
 
G
-
 
T
L
 
L
L
x
M
M
x
E
I
 
F
E
 
S
T
x
Q
I
 
S
E
x
S
T
 
S
P
 
P
F
 
L
H
 
F
T
 
T
A
 
S
L
 
L
I
 
V
K
 
K
Q
 
N
G
 
Q
I
 
L
T
 
Q
V
 
F
E
 
D
D
 
N
G
 
G
F
 
F
V
 
V
I
 
A
P
 
V
S
 
S
D
 
D
T
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
E
V
 
L
D
 
D
E
 
E
D
 
E
L
 
L

2o56A Crystal structure of a member of the enolase superfamily from salmonella typhimurium
30% identity, 93% coverage: 1:380/410 of query aligns to 2:389/392 of 2o56A

query
sites
2o56A
M
 
M
K
 
K
L
 
I
Q
 
T
D
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
I
I
 
I
V
 
D
T
 
V
A
 
A
P
 
N
P
 
D
A
 
F
P
 
K
G
 
-
W
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
W
 
W
-
 
R
-
 
P
I
 
V
L
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
I
T
 
N
T
 
T
D
 
D
T
 
E
G
 
G
I
 
I
T
 
S
G
 
G
W
 
F
G
 
G
E
 
E
C
 
V
-
 
G
Y
 
L
A
 
A
A
 
Y
S
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
A
D
 
S
A
 
A
M
 
G
T
 
I
H
 
G
V
 
M
I
 
A
R
 
K
D
 
D
V
 
-
F
 
L
E
 
S
R
 
A
H
 
I
M
 
I
Q
 
I
G
 
G
M
 
M
N
 
D
P
 
P
E
 
M
N
 
N
I
 
N
E
 
E
W
 
A
M
 
I
F
 
W
R
 
E
R
 
K
A
 
M
Y
 
L
S
 
K
S
 
K
G
 
T
F
 
F
T
 
W
Q
 
G
R
 
Q
P
 
G
D
 
G
L
 
G
S
 
G
V
 
I
M
 
F
G
 
S
A
 
A
-
 
A
F
 
M
S
 
S
G
 
G
L
 
I
E
 
D
I
 
I
A
 
A
C
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
I
L
 
K
G
 
G
K
 
K
D
 
A
R
 
W
D
 
G
R
 
V
P
 
P
V
 
L
H
 
Y
A
 
K
L
 
M
I
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
K
M
 
S
N
 
R
D
 
E
R
 
K
L
 
I
R
 
R
A
 
T
Y
 
Y
T
 
A
Y
 
S
L
 
Q
Y
 
L
P
 
Q
L
 
F
-
 
G
-
 
W
-
 
G
P
 
D
H
 
G
H
 
S
D
 
D
I
 
K
D
 
D
A
 
M
F
 
L
W
 
-
N
 
T
T
 
E
P
 
P
E
 
E
L
 
Q
A
 
Y
A
 
A
E
 
Q
S
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
T
A
 
A
V
 
V
E
 
S
K
 
E
G
 
G
Y
 
Y
T
 
D
A
 
A
V
 
I
K
|
K
F
 
V
D
|
D
P
 
T
A
 
V
-
 
A
-
x
M
-
 
D
-
 
R
-
 
H
G
 
G
P
 
N
Y
 
W
T
 
N
M
 
Q
R
 
Q
G
 
N
G
 
L
H
 
N
M
 
G
P
 
P
A
x
L
Q
 
T
S
 
D
D
 
K
I
 
I
T
 
L
Q
 
R
S
 
-
V
 
L
A
 
G
F
 
Y
C
 
D
R
 
R
-
 
M
-
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
E
 
D
A
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
P
R
 
D
A
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
I
F
 
A
G
x
E
T
 
M
H
|
H
G
 
A
Q
 
F
F
 
T
T
 
D
P
 
T
A
 
T
G
 
S
A
 
A
I
 
I
R
 
Q
L
 
F
G
 
G
Q
 
R
A
 
M
L
 
I
E
 
E
S
 
E
Y
 
L
E
 
G
P
 
I
L
 
F
W
 
Y
F
 
Y
E
|
E
E
 
E
P
 
P
T
 
V
P
 
M
P
 
P
D
 
L
L
 
N
V
 
P
A
 
A
D
 
Q
M
 
M
A
 
K
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
V
R
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
T
 
A
G
|
G
E
|
E
R
 
R
L
 
I
T
 
Y
T
 
W
K
 
R
A
 
W
E
 
G
F
 
Y
A
 
R
A
 
P
I
 
F
L
 
L
R
 
E
A
 
N
G
 
G
A
 
S
A
 
L
E
 
S
I
 
V
L
 
I
Q
|
Q
P
 
P
A
x
D
L
 
I
G
 
C
R
 
T
S
 
C
G
 
G
G
 
G
I
 
I
W
 
T
E
 
E
T
 
V
K
 
K
K
 
K
I
 
I
A
 
C
A
 
D
I
 
M
A
 
A
E
 
H
V
 
V
F
 
Y
G
 
D
A
 
K
Q
 
T
M
 
V
A
 
Q
P
 
I
H
|
H
L
 
V
Y
 
C
A
 
G
G
 
G
P
 
P
V
 
I
E
 
S
W
 
T
A
 
A
A
 
V
N
 
A
I
 
L
Q
 
H
L
 
M
A
 
E
A
 
T
S
 
A
I
 
I
P
 
P
N
 
N
L
 
F
L
 
V
M
 
I
I
 
H
E
|
E
T
 
L
I
 
H
E
 
R
T
 
Y
P
x
A
F
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
P
H
 
N
T
 
T
A
 
Q
L
 
T
I
 
C
K
 
K
Q
 
Y
G
 
N
I
 
Y
T
 
L
V
 
P
E
 
K
D
 
N
G
 
G
F
 
M
V
 
Y
I
 
E
P
 
V
S
 
P
D
 
E
T
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
I
G
 
G
I
 
Q
E
 
E
V
 
L
D
 
T
E
 
E
D
 
E
L
 
T
A
 
M
R
 
K
A
 
K
N
 
S
P
 
P
F
 
T
I
 
I

4e6mA Crystal structure of putative dehydratase protein from salmonella enterica subsp. Enterica serovar typhimurium (salmonella typhimurium)
31% identity, 86% coverage: 24:375/410 of query aligns to 27:393/401 of 4e6mA

query
sites
4e6mA
I
 
V
L
 
L
V
 
I
K
 
R
V
 
V
T
 
N
T
 
T
D
 
D
T
 
S
G
 
G
I
 
L
T
 
S
G
 
G
W
 
I
G
 
G
E
 
E
C
 
V
-
 
G
Y
x
L
A
 
A
A
 
Y
S
x
G
V
 
A
G
 
G
P
 
A
D
 
K
A
 
A
M
 
G
T
 
V
H
 
G
V
 
I
I
 
I
R
 
R
D
 
D
V
 
L
F
 
A
E
 
P
R
 
L
H
 
-
M
 
I
Q
 
V
G
 
G
M
 
E
N
 
D
P
 
P
E
 
L
N
 
N
I
 
I
E
 
E
W
 
K
M
 
I
F
 
W
R
 
E
R
 
F
A
 
F
Y
 
F
S
 
R
S
 
K
G
 
T
F
 
F
T
 
W
Q
 
G
R
 
M
P
 
G
D
 
G
L
 
G
S
 
N
V
 
V
M
 
F
G
 
Y
A
 
A
-
 
G
F
 
M
S
 
S
G
 
A
L
 
I
E
 
D
I
 
I
A
 
A
C
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
I
L
 
K
G
 
G
K
 
K
D
 
Y
R
 
L
D
 
G
R
 
V
P
 
P
V
 
V
H
 
Y
A
 
Q
L
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
K
M
 
T
N
 
N
D
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
T
Y
 
Y
T
 
A
Y
 
S
L
 
Q
Y
 
L
P
 
Q
L
 
F
P
 
G
H
 
W
H
 
G
D
 
D
I
 
K
D
 
R
A
 
H
F
 
I
W
 
L
N
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
L
 
E
A
 
Y
A
 
A
E
 
E
S
 
A
A
 
A
I
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
D
K
 
D
G
 
G
Y
 
Y
T
 
D
A
 
A
V
 
I
K
|
K
F
 
V
D
|
D
P
 
P
A
 
L
-
 
E
-
x
I
-
 
D
-
 
R
-
 
N
-
 
G
-
 
D
-
 
D
G
 
C
P
 
V
Y
 
F
T
 
Q
M
 
N
R
 
R
G
 
N
G
 
R
H
 
N
-
 
Y
-
 
S
-
 
G
M
 
L
P
 
L
A
 
L
Q
 
A
S
 
D
D
 
Q
I
 
L
T
 
K
Q
 
M
S
 
G
V
 
E
A
 
A
F
 
R
C
 
I
R
 
A
A
 
A
I
 
M
R
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
M
G
 
G
D
 
D
R
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
I
F
 
V
G
x
E
T
 
I
H
|
H
G
 
S
Q
 
L
F
 
L
T
 
G
P
 
T
A
 
N
G
 
S
A
 
A
I
 
I
R
 
Q
L
 
F
G
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
K
Y
 
Y
E
 
R
P
 
I
L
 
F
W
 
L
F
 
Y
E
|
E
E
 
E
P
 
P
T
 
I
P
 
H
P
 
P
D
 
L
L
 
N
V
 
S
A
 
D
D
 
N
M
 
M
A
 
Q
R
 
K
V
 
V
A
 
S
D
 
R
R
 
S
V
 
T
R
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
I
A
 
A
T
 
T
G
|
G
E
|
E
R
|
R
L
 
S
T
 
Y
T
 
T
K
 
R
A
 
W
E
 
G
F
 
Y
A
 
R
A
 
E
I
 
L
L
 
L
R
 
E
A
 
K
G
 
Q
A
 
S
A
 
I
E
 
A
I
 
V
L
 
A
Q
|
Q
P
 
P
A
x
D
L
 
L
G
 
C
R
 
L
S
 
C
G
 
G
G
 
G
I
 
I
W
 
T
E
 
E
T
 
G
K
 
K
K
 
K
I
 
I
A
 
C
A
 
D
I
 
Y
A
 
A
E
 
N
V
 
I
F
 
Y
G
 
D
A
 
T
Q
 
T
M
 
V
A
 
Q
P
 
V
H
|
H
L
 
V
Y
x
C
A
 
G
G
 
G
P
 
P
V
 
V
E
 
S
W
 
T
A
 
V
A
 
A
N
 
A
I
 
L
Q
 
H
L
 
M
A
 
E
A
 
T
S
 
A
I
 
I
P
 
P
N
 
N
L
 
F
L
 
I
M
 
I
I
 
H
E
|
E
T
 
-
I
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
-
F
 
H
H
 
H
T
 
T
A
 
N
L
x
A
I
 
M
K
 
K
Q
 
A
G
 
S
I
 
I
T
 
R
V
 
E
-
 
L
-
 
C
-
 
T
-
 
H
-
 
D
-
 
Y
-
 
Q
-
 
P
E
 
E
D
 
N
G
 
G
F
 
Y
V
 
Y
I
 
V
P
 
A
S
 
P
D
 
E
T
 
Q
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
Q
E
 
E
V
 
L
D
 
N
E
 
D
D
 
E
L
 
V
A
 
V
R
 
K

3rraB Crystal structure of enolase prk14017 (target efi-500653) from ralstonia pickettii 12j with magnesium bound
32% identity, 86% coverage: 23:373/410 of query aligns to 16:351/379 of 3rraB

query
sites
3rraB
W
 
W
I
 
M
L
 
F
V
 
L
K
 
K
V
 
V
T
 
E
T
 
T
D
 
D
T
 
E
G
 
G
I
 
V
T
 
T
G
 
G
W
 
W
G
 
G
E
 
E
-
 
P
-
 
V
C
x
I
Y
 
E
A
 
G
A
x
R
S
 
A
V
 
R
G
 
T
P
 
V
D
 
E
A
 
A
M
 
A
T
 
V
H
 
H
V
 
E
I
 
L
R
 
S
D
 
D
V
 
-
F
 
-
E
 
-
R
 
-
H
 
Y
M
 
L
Q
 
I
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
P
 
P
E
 
S
N
 
R
I
 
I
E
 
N
W
 
D
M
 
L
F
 
W
R
 
Q
R
 
T
A
 
M
Y
 
Y
S
 
R
S
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
-
Q
 
Y
R
 
R
P
 
G
D
 
G
L
 
P
S
 
I
V
 
L
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
I
E
 
D
I
 
Q
A
 
A
C
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
I
L
 
K
G
 
G
K
 
K
D
 
V
R
 
L
D
 
G
R
 
V
P
 
P
V
 
V
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
L
M
 
V
N
 
R
D
 
D
R
 
K
L
 
M
R
 
R
A
 
T
Y
|
Y
T
 
S
Y
 
W
L
 
V
Y
 
G
P
 
G
L
 
D
P
 
R
H
 
P
H
 
A
D
 
D
I
 
V
D
 
-
A
 
-
F
 
-
W
 
-
N
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
I
A
 
A
A
 
G
E
 
M
S
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
Q
A
 
A
V
 
-
E
 
-
K
 
G
G
 
G
Y
 
F
T
 
D
A
 
H
V
 
F
K
|
K
F
 
L
D
x
N
P
 
-
A
 
-
G
 
G
P
 
C
Y
 
E
T
x
E
M
 
M
R
 
-
G
 
-
G
 
G
H
 
I
M
 
I
P
 
D
A
 
T
Q
 
S
S
 
R
D
 
A
I
 
V
T
 
D
Q
 
A
S
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
R
C
 
V
R
 
A
A
 
E
I
 
I
R
 
R
E
 
S
A
 
A
V
 
F
G
 
G
D
 
N
R
 
T
A
 
V
D
 
E
L
 
F
L
 
G
F
 
L
G
x
D
T
 
F
H
|
H
G
 
G
Q
 
R
F
 
V
T
 
S
P
 
A
A
 
P
G
 
M
A
 
A
I
 
K
R
 
V
L
 
L
G
 
I
Q
 
K
A
 
E
L
 
L
E
 
E
S
 
P
Y
 
Y
E
 
R
P
 
P
L
 
L
W
 
F
F
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
T
 
V
P
 
L
P
 
A
D
 
E
L
 
Q
V
 
A
A
 
E
D
 
T
M
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
L
A
 
A
D
 
A
R
 
H
V
 
T
R
 
H
I
 
L
P
 
P
V
 
I
A
 
A
T
 
A
G
|
G
E
|
E
R
|
R
L
 
M
T
 
F
T
 
S
K
 
R
A
 
F
E
 
D
F
 
F
A
 
K
A
 
R
I
 
V
L
 
L
R
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
G
A
 
V
E
 
S
I
 
I
L
 
L
Q
|
Q
P
 
P
A
x
D
L
 
L
G
 
S
R
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
W
 
T
E
 
E
T
 
C
K
 
V
K
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
M
A
 
A
E
 
E
V
 
A
F
 
Y
G
 
D
A
 
V
Q
 
A
M
 
L
A
 
A
P
 
P
H
|
H
L
 
C
Y
x
P
A
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
I
E
 
A
W
 
L
A
 
A
A
 
A
N
 
C
I
 
L
Q
 
H
L
 
V
A
 
D
A
 
F
S
 
V
I
 
S
P
 
W
N
 
N
L
 
A
L
 
T
M
 
L
I
 
Q
E
|
E
T
 
Q
I
 
S
-
 
M
-
 
G
E
 
A
T
 
E
P
 
L
F
 
L
H
 
D
T
 
Y
A
 
V
L
 
R
I
 
N
K
 
K
Q
 
A
G
 
D
I
 
F
T
 
A
V
 
L
E
 
E
D
 
G
G
 
G
F
 
Y
V
 
I
I
 
R
P
 
P
S
 
P
D
 
R
T
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
D
V
 
I
D
 
D
E
 
E
D
 
A
L
 
L

2qq6B Crystal structure of mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme- like protein from rubrobacter xylanophilus dsm 9941
30% identity, 84% coverage: 36:381/410 of query aligns to 31:396/396 of 2qq6B

query
sites
2qq6B
G
 
G
W
 
L
G
 
G
E
 
E
C
 
C
Y
 
Y
A
x
P
A
 
S
S
 
A
V
 
-
G
 
-
P
 
P
D
 
A
A
 
A
M
 
G
T
 
I
H
 
H
V
 
H
I
 
I
R
 
V
D
 
M
V
 
N
F
 
M
E
 
E
R
 
E
H
 
Q
M
 
L
Q
 
L
G
 
G
M
 
E
N
 
D
P
 
P
E
 
R
N
 
D
I
 
V
E
 
E
W
 
R
M
 
L
F
 
Y
R
 
E
R
 
K
A
 
M
Y
 
R
S
 
R
-
 
W
S
 
N
G
 
I
F
 
F
T
 
T
Q
 
G
R
x
G
P
 
Q
D
 
A
L
 
G
S
 
A
V
 
V
M
 
I
G
 
T
A
 
A
F
 
L
S
 
S
G
 
G
L
 
I
E
 
E
I
 
T
A
 
A
C
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
L
L
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
L
R
 
Q
D
 
G
R
 
V
P
 
P
V
 
V
H
 
Y
A
 
R
L
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
A
M
 
F
N
 
R
D
 
R
R
 
R
L
 
V
R
 
R
A
 
L
Y
 
Y
T
 
A
-
x
D
-
 
C
-
 
N
-
 
A
-
 
G
Y
 
T
L
 
V
Y
 
D
P
 
A
L
 
A
P
 
A
H
 
H
H
 
H
D
 
I
I
 
E
D
 
G
A
 
G
F
 
L
W
 
F
N
 
E
T
 
E
P
 
G
E
 
S
L
 
N
A
 
E
A
 
E
E
 
Y
S
 
I
A
 
A
I
 
V
A
 
A
-
 
R
-
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
R
G
 
G
Y
 
F
T
 
D
A
 
A
V
 
I
K
|
K
F
 
L
D
|
D
P
 
V
-
 
D
-
 
D
-
 
I
A
 
T
G
 
G
P
 
P
Y
 
L
T
 
H
M
 
R
-
 
D
-
 
F
-
 
W
R
 
N
G
 
G
G
 
A
H
 
I
M
 
S
P
 
P
A
 
R
Q
 
E
S
 
H
D
 
E
I
 
A
T
 
M
Q
 
-
S
 
-
V
 
V
A
 
A
F
 
R
C
 
V
R
 
A
A
 
A
I
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
P
R
 
E
A
 
V
D
 
E
L
 
V
L
 
A
F
 
I
G
x
D
T
 
M
H
|
H
G
 
G
Q
 
R
F
 
F
T
 
D
P
 
I
A
 
P
G
 
S
A
 
S
I
 
I
R
 
R
L
 
F
G
 
A
Q
 
R
A
 
A
L
 
M
E
 
E
S
 
P
Y
 
F
E
 
G
P
 
L
L
 
L
W
 
W
F
 
L
E
|
E
E
 
E
P
 
P
T
 
T
P
 
P
P
 
P
D
 
E
L
 
N
V
 
L
A
 
D
D
 
A
M
 
L
A
 
A
R
 
E
V
 
V
A
 
R
D
 
R
R
 
S
V
 
T
R
 
S
I
 
T
P
 
P
V
 
I
A
 
C
T
 
A
G
|
G
E
|
E
R
 
N
L
 
V
T
 
Y
T
 
T
K
 
R
A
 
F
E
 
D
F
 
F
A
 
R
A
 
E
I
 
L
L
 
F
R
 
A
A
 
K
G
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
D
I
 
Y
L
 
V
Q
x
M
P
 
P
A
x
D
L
 
V
G
 
A
R
 
K
S
 
C
G
 
G
G
 
G
I
 
L
W
 
A
E
 
E
T
 
A
K
 
K
K
 
R
I
 
I
A
 
A
A
 
N
I
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
L
F
 
D
G
 
Y
A
 
I
Q
 
P
M
 
F
A
 
A
P
 
P
H
|
H
L
x
N
Y
 
V
A
 
S
G
 
S
P
 
P
V
 
V
E
 
G
W
 
T
A
 
V
A
 
A
N
 
A
I
 
A
Q
 
H
L
 
V
A
 
C
A
 
A
S
 
A
I
 
V
P
 
S
N
 
N
L
 
F
L
 
A
M
 
V
I
 
L
E
|
E
-
 
W
-
 
H
T
 
A
I
 
I
E
x
D
T
 
M
P
 
P
F
 
H
H
 
W
T
 
E
A
 
D
L
 
F
I
 
V
K
 
R
Q
 
Y
-
 
P
-
 
G
G
 
G
I
 
P
T
 
V
V
 
I
E
 
R
D
 
E
G
 
G
F
 
H
V
 
I
I
 
E
P
 
L
S
 
T
D
 
E
T
 
E
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
L
E
 
E
V
 
L
D
 
D
E
 
E
D
 
E
L
 
A
A
 
A
-
 
F
-
 
E
-
 
H
-
 
R
-
 
H
-
 
E
R
 
K
A
 
G
N
 
V
P
 
P
F
 
F
I
 
F
G
 
G

2ox4C Crystal structure of putative dehydratase from zymomonas mobilis zm4
29% identity, 88% coverage: 20:380/410 of query aligns to 19:389/397 of 2ox4C

query
sites
2ox4C
G
 
G
R
 
Q
Y
 
R
W
 
P
I
 
I
L
 
L
V
 
V
K
 
K
V
 
V
T
 
S
T
 
T
D
 
D
T
 
E
G
 
G
I
 
I
T
 
Y
G
 
G
W
 
L
G
 
G
E
 
E
C
 
A
-
 
G
Y
 
I
A
 
A
A
 
Y
S
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
G
D
 
S
A
 
A
M
 
A
T
 
A
H
 
G
V
 
I
I
 
L
R
 
K
D
 
D
V
 
-
F
 
Y
E
 
A
R
 
A
H
 
L
M
 
L
Q
 
I
G
 
G
M
 
E
N
 
D
P
 
P
E
 
F
N
 
N
I
 
T
E
 
E
W
 
A
M
 
I
F
 
W
R
 
E
R
 
K
A
 
L
Y
 
F
S
 
K
S
 
K
G
 
T
F
 
F
-
 
W
T
 
G
Q
 
Q
R
 
G
P
 
G
D
 
G
L
 
T
S
 
V
V
 
I
M
 
F
G
 
S
A
 
G
F
 
I
S
 
S
G
 
A
L
 
F
E
 
D
I
 
I
A
 
A
C
 
F
W
 
W
D
 
D
I
 
I
L
 
K
G
 
G
K
 
K
D
 
A
R
 
L
D
 
N
R
 
L
P
 
P
V
 
V
H
 
Y
A
 
K
L
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
K
M
 
N
N
 
R
D
 
E
R
 
D
L
 
L
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y
T
 
A
Y
 
S
L
 
Q
Y
 
L
P
 
Q
L
 
F
P
 
G
H
 
W
H
 
G
D
 
K
I
 
E
D
 
R
A
 
K
F
 
S
W
 
K
N
 
G
T
 
R
P
 
K
E
 
E
L
 
E
A
 
Y
A
 
A
E
 
E
S
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
A
K
 
E
G
 
G
Y
 
Y
T
 
D
A
 
A
V
 
V
K
|
K
F
 
V
D
|
D
P
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
D
-
 
R
-
 
N
-
 
G
A
 
S
G
 
R
P
 
E
Y
 
G
T
 
V
M
 
F
R
 
L
G
 
E
G
 
G
H
 
P
M
 
L
P
 
P
A
 
S
Q
 
E
S
 
T
D
 
-
I
 
I
T
 
K
Q
 
I
S
 
G
V
 
V
A
 
E
F
 
R
C
 
V
R
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
R
E
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
P
R
 
D
A
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
I
F
 
V
G
x
E
T
 
N
H
|
H
G
 
G
Q
 
H
F
 
T
T
 
D
P
 
L
A
 
V
G
 
S
A
 
A
I
 
I
R
 
Q
L
 
F
G
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
E
Y
 
F
E
 
N
P
 
I
L
 
F
W
 
F
F
 
Y
E
|
E
E
 
E
-
 
I
-
 
N
-
 
T
P
 
P
T
 
L
P
 
N
P
 
P
D
 
R
L
 
L
V
 
L
A
 
K
D
 
E
M
 
A
A
 
K
R
 
K
V
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
K
V
 
I
R
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
T
 
S
G
|
G
E
|
E
R
 
R
L
 
I
T
 
Y
T
 
S
K
 
R
A
 
W
E
 
G
F
 
F
A
 
L
A
 
P
I
 
F
L
 
L
R
 
E
A
 
D
G
 
R
A
 
S
A
 
I
E
 
D
I
 
V
L
 
I
Q
|
Q
P
 
P
A
x
D
L
 
L
G
 
G
R
 
T
S
 
C
G
 
G
G
 
G
I
 
F
W
 
T
E
 
E
T
 
F
K
 
K
K
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
D
I
 
M
A
 
A
E
 
H
V
 
I
F
 
F
G
 
E
A
 
V
Q
 
T
M
 
V
A
 
Q
P
 
A
H
|
H
L
 
V
Y
 
A
A
 
G
G
 
T
P
 
G
V
 
V
E
 
A
W
 
E
A
 
A
A
 
A
N
 
S
I
 
L
Q
 
H
L
 
A
A
 
E
A
 
I
S
 
A
I
 
I
P
 
P
N
 
N
L
 
F
L
 
C
M
 
I
I
 
H
E
|
E
-
 
H
-
 
H
-
 
Q
-
 
K
T
 
T
I
 
L
E
 
L
T
 
P
P
 
E
F
 
Y
H
 
E
T
 
E
A
 
L
L
 
C
I
 
V
K
 
H
Q
 
N
G
 
Y
I
 
Q
T
 
P
V
 
V
E
 
K
D
 
G
G
 
R
F
 
Y
V
 
K
I
 
V
P
 
P
S
 
-
D
 
E
T
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
I
G
 
G
I
 
Q
E
 
D
V
 
I
D
 
T
E
 
E
D
 
K
L
 
L
A
 
Y
R
 
Q
A
 
I
N
 
S
P
 
D
F
 
Y
I
 
V

4hpnA Crystal structure of a proposed galactarolactone cycloisomerase from agrobacterium tumefaciens, target efi-500704, with bound ca, ordered loops (see paper)
30% identity, 86% coverage: 21:372/410 of query aligns to 29:368/378 of 4hpnA

query
sites
4hpnA
R
 
R
Y
 
A
W
 
H
I
 
V
L
 
L
V
 
V
K
 
E
V
 
I
T
 
E
T
 
C
D
 
D
T
 
D
G
 
G
I
 
T
T
 
V
G
 
G
W
 
W
G
 
G
E
 
E
C
 
C
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
L
G
|
G
P
 
P
D
 
A
A
x
R
M
 
P
T
 
N
H
 
A
V
 
A
I
 
V
R
 
V
D
 
Q
V
 
A
F
 
Y
E
 
S
R
 
G
H
 
W
M
 
L
Q
 
I
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
P
 
P
E
 
R
N
 
Q
I
 
T
E
 
E
W
 
K
M
 
I
F
 
W
R
 
A
R
 
V
A
 
L
Y
 
Y
S
 
N
S
 
A
G
 
L
F
 
R
T
 
D
Q
 
Q
R
 
G
P
 
Q
D
 
R
L
 
G
S
 
L
V
 
S
M
 
L
G
 
T
A
 
A
F
 
L
S
 
S
G
 
G
L
 
I
E
 
D
I
 
I
A
 
A
C
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
I
L
 
K
G
 
G
K
 
K
D
 
H
R
 
Y
D
 
G
R
 
A
P
 
S
V
 
I
H
 
S
A
 
M
L
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
R
M
 
W
N
 
R
D
 
E
R
 
S
L
 
V
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
T
 
A
Y
 
-
L
x
T
Y
 
G
P
 
S
L
 
F
P
 
K
H
 
R
H
 
D
D
 
N
I
 
V
D
 
D
A
 
R
F
 
V
W
 
S
-
 
D
N
 
N
T
 
A
P
 
S
E
 
E
L
 
M
A
 
A
A
 
E
E
 
R
S
 
R
A
 
A
I
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
E
 
-
K
 
E
G
 
G
Y
 
F
T
 
H
A
 
A
V
 
C
K
|
K
F
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
Y
 
-
T
 
-
M
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
H
 
-
M
 
I
P
x
K
A
 
I
Q
 
G
S
 
F
D
 
G
I
 
V
T
 
E
Q
 
E
S
 
D
V
 
L
A
 
R
F
 
V
C
 
I
R
 
A
A
 
A
I
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
I
G
 
G
D
 
P
R
 
D
A
 
M
D
 
R
L
 
L
L
 
M
F
 
I
G
x
D
T
 
A
H
x
N
G
 
H
Q
 
G
F
 
Y
T
 
T
P
 
V
A
 
T
G
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
x
D
A
 
R
L
 
A
E
 
A
S
 
G
Y
 
F
E
 
G
P
 
I
L
 
D
W
 
W
F
 
F
E
|
E
E
 
E
P
 
P
T
 
V
P
 
V
P
 
P
D
 
E
L
 
Q
V
 
L
A
 
D
D
 
A
M
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
R
D
 
A
R
x
G
V
 
Q
R
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
T
 
G
G
|
G
E
|
E
R
x
T
L
 
W
T
 
H
T
 
G
K
 
R
A
 
Y
E
 
G
F
 
M
A
 
W
A
 
Q
I
 
A
L
 
L
R
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
V
E
 
D
I
 
I
L
 
L
Q
|
Q
P
 
P
A
x
D
L
 
L
G
 
C
R
 
G
S
 
C
G
 
G
G
 
G
I
 
F
W
 
S
E
 
E
T
 
I
K
 
Q
K
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
T
I
 
L
A
 
A
E
 
T
V
 
L
F
 
H
G
 
G
A
 
V
Q
 
R
M
 
I
A
 
V
P
 
P
H
|
H
L
x
V
Y
x
W
A
 
G
G
 
T
P
 
G
V
 
V
E
 
Q
W
 
I
A
 
A
A
 
A
N
 
A
I
 
L
Q
 
Q
-
 
F
L
 
M
A
 
A
A
 
A
S
 
M
I
 
T
P
 
P
N
 
D
L
 
P
L
 
V
M
x
R
I
 
V
E
 
N
T
 
P
I
 
I
E
 
E
-
 
P
-
 
I
-
 
M
-
x
E
-
x
F
-
 
D
-
 
R
-
 
T
-
x
H
T
 
N
P
 
P
F
 
F
H
 
R
T
 
Q
A
 
A
L
 
V
I
 
L
K
 
R
Q
 
E
G
 
P
I
 
L
T
 
E
V
 
A
E
 
V
D
 
N
G
 
G
F
 
V
V
 
V
I
 
T
P
 
I
S
 
P
D
 
D
T
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
E
V
 
I
D
 
N
E
 
R
D
 
D

Sites not aligning to the query:

3ozmA Crystal structure of enolase superfamily member from bordetella bronchiseptica complexed with mg, m-xylarate and l-lyxarate
30% identity, 88% coverage: 21:382/410 of query aligns to 32:377/386 of 3ozmA

query
sites
3ozmA
R
 
R
Y
 
Q
W
 
M
I
 
I
L
 
L
V
 
V
K
 
E
V
 
V
T
 
R
T
 
T
D
 
D
T
 
E
G
 
G
I
 
V
T
 
T
G
 
G
W
 
V
G
 
G
E
 
-
C
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
S
S
 
P
V
 
S
G
|
G
P
 
P
-
 
Y
-
x
D
-
 
L
D
 
A
A
 
V
M
 
L
T
 
K
H
 
R
V
 
A
I
 
I
R
 
E
D
 
D
V
 
V
F
 
I
E
 
G
R
 
P
H
 
Q
M
 
L
Q
 
I
G
 
G
M
 
E
N
 
D
P
 
P
E
 
A
N
 
N
I
 
I
E
 
N
W
 
Y
M
 
L
F
 
W
R
 
H
R
 
K
A
 
V
Y
 
F
S
 
H
S
 
G
G
 
E
F
 
V
T
 
S
Q
 
R
R
 
N
P
 
L
D
 
G
L
 
H
S
 
R
V
 
S
M
 
V
G
 
G
-
 
I
-
 
A
A
 
A
F
 
M
S
 
S
G
 
G
L
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
C
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
L
L
 
K
G
 
G
K
 
R
D
 
A
R
 
M
D
 
N
R
 
Q
P
 
P
V
 
I
H
 
Y
A
 
Q
L
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
K
M
 
F
N
 
H
D
 
T
R
 
R
-
 
G
L
 
V
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
T
 
A
Y
x
S
L
 
-
Y
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
H
 
-
H
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
S
A
 
I
F
x
Y
W
 
W
N
 
D
-
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
D
L
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
D
S
 
E
A
 
L
I
 
A
A
 
G
A
 
W
V
 
V
E
 
E
K
 
Q
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
A
 
A
V
 
A
K
|
K
F
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
Y
 
-
T
 
-
M
 
L
R
x
K
G
 
V
G
 
G
H
 
R
M
 
A
P
 
P
A
 
-
Q
 
-
S
 
-
D
 
-
I
 
-
T
 
R
Q
 
K
S
 
D
V
 
A
A
 
A
F
 
N
C
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
M
R
 
R
E
 
Q
A
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
A
R
 
D
A
 
V
D
 
E
L
 
I
L
 
L
F
 
V
G
x
D
T
 
A
H
x
N
G
 
Q
Q
 
S
F
 
L
T
 
G
P
 
R
A
 
H
G
 
D
A
 
A
I
 
L
R
 
A
L
 
M
G
 
L
Q
 
R
A
 
I
L
 
L
E
 
D
S
 
E
Y
 
A
E
 
G
P
 
C
L
 
Y
W
 
W
F
 
F
E
|
E
E
 
E
P
 
P
-
 
L
T
 
S
P
 
I
P
 
D
D
 
D
L
 
I
V
 
E
A
 
G
D
 
H
M
 
R
A
 
I
R
 
L
V
 
R
A
 
A
D
 
Q
R
 
G
V
 
T
R
 
P
I
 
V
P
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
G
|
G
E
|
E
R
x
N
L
 
L
T
 
Y
T
 
T
K
 
R
A
 
N
E
 
A
F
 
F
A
 
N
A
 
D
I
 
Y
L
 
I
R
 
R
A
 
N
G
 
D
A
 
A
A
 
I
E
 
D
I
 
V
L
 
L
Q
|
Q
P
 
A
A
x
D
L
 
A
G
 
S
R
 
R
S
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
W
 
T
E
 
E
T
 
A
K
 
L
K
 
A
I
 
I
A
 
S
A
 
A
I
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
S
F
 
A
G
 
H
A
 
L
Q
 
A
M
 
W
A
 
N
P
 
P
H
|
H
L
x
T
Y
x
F
A
 
N
G
 
D
P
 
I
V
 
I
E
 
T
W
 
V
A
 
A
A
 
A
N
 
N
I
 
L
Q
 
H
L
 
L
A
 
V
A
 
A
S
 
A
I
 
S
P
 
P
N
 
H
L
 
P
L
 
A
M
 
M
I
 
F
E
|
E
-
 
W
-
 
D
T
x
I
I
 
T
E
x
H
T
 
N
P
 
D
F
 
L
H
 
M
T
 
T
A
 
R
L
 
L
I
 
A
K
 
S
Q
 
Y
G
 
D
I
 
L
T
 
K
V
 
L
E
 
E
D
 
N
G
 
G
F
 
L
V
 
V
I
 
Q
P
 
P
S
 
P
D
 
Q
T
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
F
E
 
E
V
 
I
D
 
D
E
 
W
D
 
D
L
 
F
A
 
V
R
 
A
A
 
A
N
 
H
P
 
A
F
 
W
I
 
K
G
 
G
D
 
E

Sites not aligning to the query:

3op2A Crystal structure of putative mandelate racemase from bordetella bronchiseptica rb50 complexed with 2-oxoglutarate/phosphate
29% identity, 88% coverage: 21:382/410 of query aligns to 32:372/375 of 3op2A

query
sites
3op2A
R
 
R
Y
 
Q
W
 
M
I
 
I
L
 
L
V
 
V
K
 
E
V
 
V
T
 
R
T
 
T
D
 
D
T
 
E
G
 
G
I
 
V
T
 
T
G
 
G
W
 
V
G
 
G
E
 
-
C
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
S
S
 
P
V
 
S
G
|
G
P
 
P
-
 
Y
-
x
D
-
 
L
D
 
A
A
 
V
M
 
L
T
 
K
H
 
R
V
 
A
I
 
I
R
 
E
D
 
D
V
 
V
F
 
I
E
 
G
R
 
P
H
 
Q
M
 
L
Q
 
I
G
 
G
M
 
E
N
 
D
P
 
P
E
 
A
N
 
N
I
 
I
E
 
N
W
 
Y
M
 
L
F
 
W
R
 
H
R
 
K
A
 
V
Y
 
F
S
 
H
S
 
G
G
 
E
F
 
V
T
 
S
Q
 
R
R
 
S
P
 
V
D
 
G
L
 
I
S
 
A
V
 
A
M
 
M
G
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
S
G
 
G
L
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
C
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
L
L
 
K
G
 
G
K
 
R
D
 
A
R
 
M
D
 
N
R
 
Q
P
 
P
V
 
I
H
 
Y
A
 
Q
L
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
K
M
 
F
N
 
H
D
 
T
R
 
R
-
 
G
L
 
V
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
T
 
A
Y
x
S
L
 
-
Y
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
H
 
-
H
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
S
A
 
I
F
 
Y
W
 
W
N
 
D
-
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
D
L
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
D
S
 
E
A
 
L
I
 
A
A
 
G
A
 
W
V
 
V
E
 
E
K
 
Q
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
A
 
A
V
 
A
K
|
K
F
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
Y
 
-
T
 
-
M
 
L
R
x
K
G
 
V
G
 
G
H
 
R
M
 
A
P
 
P
A
 
-
Q
 
-
S
 
-
D
 
-
I
 
-
T
 
R
Q
 
K
S
 
D
V
 
A
A
 
A
F
 
N
C
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
M
R
 
R
E
 
Q
A
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
A
R
 
D
A
 
V
D
 
E
L
 
I
L
 
L
F
 
V
G
x
D
T
 
A
H
x
N
G
 
Q
Q
 
S
F
 
L
T
 
G
P
 
R
A
 
H
G
 
D
A
 
A
I
 
L
R
 
A
L
 
M
G
 
L
Q
 
R
A
 
I
L
 
L
E
 
D
S
 
E
Y
 
A
E
 
G
P
 
C
L
 
Y
W
 
W
F
 
F
E
|
E
E
 
E
P
 
P
-
 
L
T
 
S
P
 
I
P
 
D
D
 
D
L
 
I
V
 
E
A
 
G
D
 
H
M
 
R
A
 
I
R
 
L
V
 
R
A
 
A
D
 
Q
R
 
G
V
 
T
R
 
P
I
 
V
P
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
G
|
G
E
|
E
R
x
N
L
 
L
T
 
Y
T
 
T
K
 
R
A
 
N
E
 
A
F
 
F
A
 
N
A
 
D
I
 
Y
L
 
I
R
 
R
A
 
N
G
 
D
A
 
A
A
 
I
E
 
D
I
 
V
L
 
L
Q
|
Q
P
 
A
A
x
D
L
 
A
G
 
S
R
 
R
S
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
W
 
T
E
 
E
T
 
A
K
 
L
K
 
A
I
 
I
A
 
S
A
 
A
I
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
S
F
 
A
G
 
H
A
 
L
Q
 
A
M
 
W
A
 
N
P
 
P
H
|
H
L
x
T
Y
x
F
A
 
N
G
 
D
P
 
I
V
 
I
E
 
T
W
 
V
A
 
A
A
 
A
N
 
N
I
 
L
Q
 
H
L
 
L
A
 
V
A
 
A
S
 
A
I
 
S
P
 
P
N
 
H
L
 
P
L
 
A
M
 
M
I
 
F
E
|
E
-
 
W
-
 
D
T
x
I
I
 
T
E
x
H
T
 
N
P
 
D
F
 
L
H
 
M
T
 
T
A
 
R
L
 
L
I
 
A
K
 
S
Q
 
Y
G
 
D
I
 
L
T
 
K
V
 
L
E
 
E
D
 
N
G
 
G
F
 
L
V
 
V
I
 
Q
P
 
P
S
 
P
D
 
Q
T
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
F
E
 
E
V
 
I
D
 
D
E
 
W
D
 
D
L
 
F
A
 
V
R
 
A
A
 
A
N
 
H
P
 
A
F
 
W
I
 
K
G
 
G
D
 
E

Sites not aligning to the query:

3ozmD Crystal structure of enolase superfamily member from bordetella bronchiseptica complexed with mg, m-xylarate and l-lyxarate
30% identity, 88% coverage: 21:382/410 of query aligns to 32:377/381 of 3ozmD

query
sites
3ozmD
R
 
R
Y
 
Q
W
 
M
I
 
I
L
 
L
V
 
V
K
 
E
V
 
V
T
 
R
T
 
T
D
 
D
T
 
E
G
 
G
I
 
V
T
 
T
G
 
G
W
 
V
G
 
G
E
 
-
C
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
S
S
 
P
V
 
S
G
|
G
P
 
P
-
 
Y
-
x
D
-
 
L
D
 
A
A
 
V
M
 
L
T
 
K
H
 
R
V
 
A
I
 
I
R
 
E
D
 
D
V
 
V
F
 
I
E
 
G
R
 
P
H
 
Q
M
 
L
Q
 
I
G
 
G
M
 
E
N
 
D
P
 
P
E
 
A
N
 
N
I
 
I
E
 
N
W
 
Y
M
 
L
F
 
W
R
 
H
R
 
K
A
 
V
Y
 
F
S
 
H
S
 
G
G
 
E
F
 
V
T
 
S
Q
 
R
R
 
N
P
 
L
D
 
G
L
 
H
S
 
R
V
 
S
M
 
V
G
 
G
-
 
I
-
 
A
A
 
A
F
 
M
S
 
S
G
 
G
L
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
C
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
L
L
 
K
G
 
G
K
 
R
D
 
A
R
 
M
D
 
N
R
 
Q
P
 
P
V
 
I
H
 
Y
A
 
Q
L
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
K
M
 
F
N
 
H
D
 
T
R
 
R
-
 
G
L
 
V
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
T
 
A
Y
x
S
L
 
-
Y
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
H
 
-
H
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
S
A
 
I
F
 
Y
W
 
W
N
 
D
-
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
D
L
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
D
S
 
E
A
 
L
I
 
A
A
 
G
A
 
W
V
 
V
E
 
E
K
 
Q
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
A
 
A
V
 
A
K
|
K
F
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
Y
 
-
T
 
-
M
 
L
R
x
K
G
 
V
G
 
G
H
 
R
M
 
A
P
 
P
A
 
-
Q
 
-
S
 
-
D
 
-
I
 
-
T
 
R
Q
 
K
S
 
D
V
 
A
A
 
A
F
 
N
C
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
M
R
 
R
E
 
Q
A
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
A
R
 
D
A
 
V
D
 
E
L
 
I
L
 
L
F
 
V
G
x
D
T
 
A
H
x
N
G
 
Q
Q
 
S
F
 
L
T
 
G
P
 
R
A
 
H
G
 
D
A
 
A
I
 
L
R
 
A
L
 
M
G
 
L
Q
 
R
A
 
I
L
 
L
E
 
D
S
 
E
Y
 
A
E
 
G
P
 
C
L
 
Y
W
 
W
F
 
F
E
|
E
E
 
E
P
 
P
-
 
L
T
 
S
P
 
I
P
 
D
D