SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF4590 FitnessBrowser__WCS417:GFF4590 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5bt9C Crystal structure of folm alternative dihydrofolate reductase 1 from brucella canis complexed with NADP (see paper)
27% identity, 98% coverage: 5:235/236 of query aligns to 7:242/250 of 5bt9C

query
sites
5bt9C
N
 
N
A
 
C
P
 
P
I
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
G
 
A
Q
 
R
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
K
H
 
A
C
 
I
A
 
V
Q
 
E
R
 
D
L
 
L
L
 
A
D
 
S
E
 
H
G
 
G
H
 
F
P
 
P
V
 
V
-
 
A
I
 
I
F
 
H
S
x
C
Y
x
N
R
|
R
S
|
S
E
 
L
R
 
D
P
 
E
G
 
G
V
 
-
Q
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
A
A
 
N
R
 
R
-
 
I
-
 
N
-
 
D
-
 
S
G
 
G
A
 
G
V
 
N
G
 
A
L
 
C
F
 
V
A
 
V
D
 
Q
F
 
A
S
 
D
S
x
L
E
|
E
A
 
G
G
 
D
I
 
V
L
 
R
A
 
G
F
 
L
I
 
V
A
 
K
E
 
Q
L
 
A
N
 
S
T
 
D
H
 
R
T
 
I
Q
 
G
S
 
P
L
 
I
R
 
R
A
 
L
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
A
 
L
W
 
F
I
 
Q
A
 
E
E
 
D
T
 
K
P
 
V
D
 
G
D
 
A
E
 
L
S
 
D
R
 
M
A
 
A
F
 
L
T
 
W
D
 
D
M
 
R
-
 
H
F
 
F
S
 
A
V
 
V
H
 
H
M
 
L
L
 
K
A
 
T
P
 
P
Y
 
V
L
 
I
I
 
L
N
 
A
L
 
E
H
 
D
C
 
M
S
 
R
P
 
K
L
 
A
L
 
L
Q
 
P
R
 
E
S
 
D
S
 
Q
P
 
D
A
 
G
D
 
L
I
 
V
V
 
V
H
 
N
I
|
I
S
 
I
D
 
D
D
 
Q
V
 
R
V
 
V
R
 
W
K
 
K
G
 
L
S
 
N
R
 
P
Q
 
Q
H
 
F
I
 
F
A
 
S
Y
|
Y
C
 
T
A
 
L
T
 
S
K
|
K
A
 
T
G
 
A
L
 
L
D
 
W
S
 
N
L
 
A
T
 
T
L
 
R
S
 
T
F
 
L
A
 
A
A
 
Q
Q
 
A
F
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
R
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
A
x
G
M
 
P
V
x
T
M
x
L
F
 
P
N
 
S
D
 
E
G
 
R
D
 
Q
D
 
R
-
 
P
A
 
E
D
 
D
Y
 
F
R
 
E
A
 
R
K
 
Q
V
 
V
L
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
S
A
 
K
L
 
L
G
 
P
I
 
L
E
 
Q
P
 
R
G
 
A
P
 
P
E
 
E
V
 
L
-
 
P
-
 
E
I
 
F
Y
 
G
Q
 
R
S
 
T
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
L
 
F
L
 
W
D
 
E
N
 
N
P
 
R
Y
 
S
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
M
L
 
I
T
 
A
V
 
L
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
H
 
H
I
 
L

6wprA Crystal structure of a putative 3-oxoacyl-acp reductase (fabg) with NADP(h) from acinetobacter baumannii (see paper)
26% identity, 100% coverage: 1:235/236 of query aligns to 1:243/244 of 6wprA

query
sites
6wprA
M
 
M
T
 
T
A
 
Q
T
 
E
N
 
R
A
 
K
P
 
V
I
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
Q
x
R
R
x
G
V
 
I
G
 
G
L
 
A
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
I
D
 
Q
E
 
D
G
 
G
H
 
Y
P
 
F
V
 
V
I
 
V
F
 
G
S
 
T
Y
 
A
R
x
T
S
 
S
E
 
E
R
 
-
P
 
S
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
A
 
K
L
 
L
R
 
T
-
 
D
-
 
S
-
 
F
A
 
G
R
 
E
G
 
Q
A
 
G
V
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
A
A
x
L
D
|
D
F
x
V
S
 
R
S
 
N
E
 
L
A
 
D
G
 
E
I
 
I
L
 
E
A
 
A
F
 
V
I
 
V
A
 
S
E
 
H
L
 
I
N
 
E
T
 
Q
H
 
N
T
 
Y
Q
 
G
S
 
P
L
 
V
R
 
L
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
-
x
G
-
x
I
-
 
T
-
 
K
-
 
D
S
 
N
A
 
L
W
 
L
I
 
L
A
 
R
E
 
M
T
 
S
P
 
E
D
 
D
D
 
D
E
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
F
 
W
T
 
D
D
 
D
M
 
I
F
 
L
S
 
N
V
 
I
H
 
H
M
 
L
L
 
K
A
 
A
P
 
V
Y
 
Y
L
 
R
I
 
L
N
 
S
L
 
K
H
 
R
C
 
V
S
 
L
P
 
K
L
 
G
L
 
M
Q
 
T
R
 
K
S
 
A
S
 
R
P
 
F
A
 
G
D
 
R
I
 
I
V
 
I
H
 
N
I
|
I
S
 
S
D
x
S
D
 
V
V
 
V
V
 
A
R
 
H
K
 
F
G
 
A
S
 
N
R
 
P
Q
 
G
H
 
Q
I
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
D
 
E
S
 
A
L
 
F
T
 
S
L
 
R
S
 
S
F
 
L
A
 
A
A
 
K
Q
 
E
F
 
M
A
 
G
P
 
S
-
 
R
L
 
Q
I
 
I
K
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
S
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
 
G
M
 
F
V
 
I
M
 
A
-
 
T
-
 
E
F
 
M
N
 
T
D
 
D
G
 
A
D
 
L
D
 
S
A
 
E
D
 
D
Y
 
I
R
 
R
A
 
K
K
 
K
V
 
M
L
 
S
A
 
D
K
 
Q
S
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
N
I
 
R
E
 
L
P
 
G
G
 
E
P
 
P
E
 
Q
V
 
D
I
 
I
Y
 
A
Q
 
N
S
 
A
V
 
V
R
 
S
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
D
 
S
N
 
D
P
 
K
-
 
A
-
 
G
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
V
L
 
L
T
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
Y
I
 
M

5t2uA Short chain dehydrogenase/reductase family protein (see paper)
29% identity, 96% coverage: 9:234/236 of query aligns to 10:239/241 of 5t2uA

query
sites
5t2uA
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
T
Q
 
S
R
x
G
V
 
I
G
 
G
L
 
L
H
 
E
C
 
S
A
 
A
Q
 
R
R
 
L
L
 
M
L
 
A
D
 
A
E
 
E
G
 
G
H
 
A
P
 
D
V
 
V
I
 
V
F
 
I
S
 
T
Y
 
G
R
|
R
S
x
D
E
 
A
R
 
Q
P
x
R
G
 
G
V
 
E
Q
 
Q
A
 
A
L
 
A
R
 
A
A
 
D
R
 
I
G
 
G
A
 
H
V
 
G
G
 
A
L
 
R
F
 
F
A
 
-
D
 
-
F
 
V
S
 
Q
S
 
A
E
x
D
A
x
L
G
 
G
I
 
D
L
 
L
A
 
D
F
 
S
I
 
V
A
 
A
E
 
D
L
 
L
N
 
A
T
 
A
H
 
Q
T
 
A
Q
 
P
S
 
D
L
 
V
R
 
D
A
 
I
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
 
G
A
 
I
W
x
Y
-
 
P
I
 
Q
A
 
A
E
 
S
T
 
T
P
 
F
D
 
D
D
 
Q
E
 
D
S
 
V
R
 
A
A
 
G
F
 
F
T
 
Q
D
 
Q
M
 
L
F
 
F
S
 
D
V
 
T
H
 
N
M
 
V
L
 
R
A
 
G
P
 
T
Y
 
Y
L
 
F
I
 
L
N
 
V
L
 
A
H
 
A
C
 
A
S
 
A
P
 
K
L
 
G
L
 
M
Q
 
V
R
 
A
S
 
R
S
 
G
P
 
H
A
 
G
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
|
I
S
 
T
D
x
T
D
 
L
V
 
A
V
 
A
R
 
H
K
 
K
G
 
G
S
 
F
R
 
P
Q
 
G
H
x
T
I
 
S
A
 
V
Y
|
Y
C
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
R
S
 
T
F
 
W
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
F
 
F
-
 
G
A
 
A
P
 
N
L
 
G
I
 
V
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
S
I
 
V
A
 
S
P
|
P
A
 
G
-
x
P
-
x
T
-
 
R
-
x
T
-
 
P
M
x
T
V
x
T
M
 
L
F
 
E
N
 
Q
D
 
L
G
 
G
D
 
D
D
 
F
A
 
I
D
 
D
Y
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
D
V
 
V
L
 
A
A
 
A
K
 
G
S
 
L
A
 
P
L
 
L
G
 
R
I
 
R
E
 
T
P
 
A
G
 
A
P
 
P
E
 
E
V
 
E
I
 
I
Y
 
A
Q
 
Q
S
 
A
V
 
V
R
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
D
 
S
-
 
P
-
 
R
N
 
A
P
 
S
Y
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
T
L
 
L
T
 
Y
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
G
H
 
Y

6t62A Crystal structure of acinetobacter baumannii fabg in complex with NADPH at 1.8 a resolution (see paper)
26% identity, 96% coverage: 9:235/236 of query aligns to 9:243/244 of 6t62A

query
sites
6t62A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
Q
x
R
R
x
G
V
 
I
G
 
G
L
 
A
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
I
D
 
Q
E
 
D
G
 
G
H
 
Y
P
 
F
V
 
V
I
 
V
F
 
G
S
 
T
Y
x
A
R
x
T
S
 
S
E
 
E
R
 
-
P
 
S
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
A
 
K
L
 
L
R
 
T
-
 
D
-
 
S
-
 
F
A
 
G
R
 
E
G
 
Q
A
 
G
V
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
A
A
x
L
D
|
D
F
x
V
S
 
R
S
 
N
E
 
L
A
 
D
G
 
E
I
 
I
L
 
E
A
 
A
F
 
V
I
 
V
A
 
S
E
 
H
L
 
I
N
 
E
T
 
Q
H
 
N
T
 
Y
Q
 
G
S
 
P
L
 
V
R
 
L
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
-
x
G
-
x
I
-
 
T
-
 
K
-
 
D
S
 
N
A
 
L
W
 
L
I
 
L
A
 
R
E
 
M
T
 
S
P
 
E
D
 
D
D
 
D
E
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
F
 
W
T
 
D
D
 
D
M
 
I
F
 
L
S
 
N
V
 
I
H
 
H
M
 
L
L
 
K
A
 
A
P
 
V
Y
 
Y
L
 
R
I
 
L
N
 
S
L
 
K
H
 
R
C
 
V
S
 
L
P
 
K
L
 
G
L
 
M
Q
 
T
R
 
K
S
 
A
S
 
R
P
 
F
A
 
G
D
 
R
I
 
I
V
 
I
H
 
N
I
|
I
S
|
S
D
x
S
D
 
V
V
 
V
V
 
A
R
 
H
K
 
F
G
 
A
S
 
N
R
 
P
Q
 
G
H
 
Q
I
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
D
 
E
S
 
A
L
 
F
T
 
S
L
 
R
S
 
S
F
 
L
A
 
A
A
 
K
Q
 
E
F
 
M
A
 
G
P
 
S
-
 
R
L
 
Q
I
 
I
K
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
S
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
M
 
F
V
x
I
M
 
A
-
 
T
-
 
E
F
x
M
N
 
T
D
 
D
G
 
A
D
 
L
D
 
S
A
 
E
D
 
D
Y
 
I
R
 
R
A
 
K
K
 
K
V
 
M
L
 
S
A
 
D
K
 
Q
S
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
N
I
 
R
E
 
L
P
 
G
G
 
E
P
 
P
E
 
Q
V
 
D
I
 
I
Y
 
A
Q
 
N
S
 
A
V
 
V
R
 
S
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
D
 
S
N
 
D
P
 
K
-
 
A
-
 
G
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
V
L
 
L
T
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
Y
I
 
M

8bcjB Crystal structure of short-chain dehydrogenase pa3128 from pseudomonas aeruginosa pao1 in complex with NADP+
25% identity, 96% coverage: 8:233/236 of query aligns to 7:250/250 of 8bcjB

query
sites
8bcjB
I
 
M
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
Q
x
R
R
x
G
V
x
I
G
 
G
L
 
A
H
 
A
C
 
T
A
 
A
Q
 
L
R
 
L
L
 
A
L
 
A
D
 
E
E
 
R
G
 
G
H
 
Y
P
 
A
V
 
V
I
 
V
F
 
L
S
 
N
Y
 
Y
R
x
L
S
x
R
E
x
N
R
 
R
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
R
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
R
-
 
Q
-
 
G
-
 
G
G
 
E
A
 
A
V
 
L
G
 
A
L
 
V
F
 
A
A
|
A
D
|
D
F
x
V
S
 
A
S
 
E
E
 
E
A
 
G
G
 
D
I
 
V
L
 
E
A
 
R
F
 
L
I
 
F
A
 
A
E
 
S
L
 
I
N
 
D
T
 
E
H
 
R
T
 
F
Q
 
G
S
 
R
L
 
L
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
x
G
A
 
M
W
 
L
I
 
E
A
 
A
E
 
Q
T
 
T
-
 
R
-
 
L
P
 
E
D
 
N
D
 
I
E
 
D
S
 
A
R
 
A
A
 
R
F
 
L
T
 
H
D
 
R
M
 
V
F
 
F
S
 
A
V
x
T
H
 
N
M
 
V
L
 
T
A
 
G
P
 
S
Y
 
F
L
 
L
I
 
C
N
 
A
L
 
R
H
 
E
C
 
A
S
 
V
P
 
K
L
 
R
L
 
L
Q
 
S
R
 
T
-
 
R
-
 
H
-
 
G
S
 
G
S
 
R
P
 
G
A
 
G
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
V
S
 
S
D
x
S
D
 
M
V
 
A
V
 
S
R
 
R
K
 
L
G
 
G
S
 
S
-
 
P
R
 
N
Q
 
E
H
 
Y
I
 
I
A
 
D
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
I
D
 
D
S
 
S
L
 
M
T
 
T
L
 
I
S
 
G
F
 
L
A
 
A
A
 
R
Q
 
E
F
 
V
A
 
A
P
 
A
L
 
E
-
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
R
P
|
P
A
x
G
M
 
L
V
x
I
-
 
D
-
x
T
-
 
E
M
x
I
F
x
H
N
 
A
D
 
S
G
 
G
D
 
G
D
 
E
A
 
P
D
 
G
Y
 
R
R
 
I
A
 
E
K
 
R
V
 
L
L
 
K
A
 
G
K
 
G
S
 
I
A
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
R
E
 
G
P
 
G
G
 
T
P
 
A
E
 
E
V
 
E
I
 
V
Y
 
A
Q
 
R
S
 
A
V
 
I
R
 
L
Y
 
W
L
 
L
L
 
A
D
 
S
N
 
D
P
 
E
-
 
A
-
 
S
Y
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
F
L
 
I
T
 
D
V
 
V
N
 
S
G
 
G
G
 
G
R
 
R

5ojiA Crystal structure of the dehydrogenase/reductase sdr family member 4 (dhrs4) from caenorhabditis elegans (see paper)
25% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 14:255/260 of 5ojiA

query
sites
5ojiA
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
x
A
A
 
A
G
x
T
Q
 
K
R
x
G
V
x
I
G
 
G
L
 
L
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
G
 
G
H
 
A
P
 
S
V
 
V
I
 
V
F
 
I
S
 
G
Y
x
S
R
|
R
S
x
N
E
 
Q
R
 
K
-
x
N
-
 
V
-
 
D
P
 
E
G
 
A
V
 
I
Q
 
E
A
 
Y
L
 
L
R
 
K
A
 
N
R
 
K
G
 
G
A
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
L
S
 
T
S
 
K
E
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
A
A
 
G
F
 
H
I
|
I
A
 
A
E
 
S
L
 
T
N
 
D
T
 
D
H
 
Q
T
 
K
Q
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
F
-
 
T
-
 
L
-
 
Q
-
 
K
-
 
F
-
 
G
S
 
K
L
 
I
R
 
N
A
 
I
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
-
x
H
-
x
G
-
 
I
-
 
N
-
 
P
A
 
A
S
 
F
A
 
G
W
 
H
I
 
I
A
 
L
E
 
E
T
 
V
P
 
S
D
 
D
D
 
-
E
 
-
S
 
-
R
 
Q
A
 
V
F
 
W
T
 
D
D
 
K
M
 
L
F
 
F
S
 
E
V
 
V
H
 
N
M
 
V
L
 
K
A
 
A
P
 
G
Y
 
F
L
 
Q
I
 
M
N
 
T
L
 
K
H
 
L
C
 
V
S
 
H
P
 
P
L
 
H
L
 
I
Q
 
A
R
 
K
S
 
E
S
 
G
P
 
G
A
 
G
D
 
A
I
 
I
V
 
I
H
 
F
I
x
N
S
 
A
D
x
S
D
 
Y
V
x
S
V
 
A
R
 
Y
K
 
K
G
 
S
S
 
P
R
 
P
Q
 
G
H
 
I
I
 
A
A
 
A
Y
|
Y
C
 
G
A
 
V
T
 
T
K
|
K
A
 
T
G
 
T
L
 
L
D
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
R
S
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
M
Q
 
G
F
 
L
A
 
A
P
 
K
-
 
D
L
 
N
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
x
G
M
x
V
-
x
I
-
 
K
-
x
T
-
 
K
-
x
M
-
x
S
-
 
Q
V
 
V
M
x
L
F
 
W
N
 
D
D
 
G
G
 
G
D
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
E
Y
 
K
R
 
E
A
 
L
K
 
T
V
 
D
L
 
I
A
 
Q
K
 
E
S
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
R
E
 
L
P
 
G
G
 
V
P
 
P
E
 
D
V
 
D
I
 
C
Y
 
A
Q
 
G
S
 
T
V
 
V
R
 
A
Y
 
Y
L
 
L
L
 
A
-
 
S
-
 
D
D
 
D
N
 
S
P
 
S
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
E
T
 
M
L
 
I
T
 
I
V
 
I
N
 
A
G
 
G
G
 
G

5ojgA Crystal structure of the dehydrogenase/reductase sdr family member 4 (dhrs4) from caenorhabditis elegans (see paper)
25% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 14:255/260 of 5ojgA

query
sites
5ojgA
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
x
A
A
 
A
G
x
T
Q
 
K
R
x
G
V
x
I
G
 
G
L
 
L
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
G
 
G
H
 
A
P
 
S
V
 
V
I
 
V
F
 
I
S
 
G
Y
x
S
R
|
R
S
x
N
E
 
Q
R
 
K
-
x
N
-
 
V
-
 
D
P
 
E
G
 
A
V
 
I
Q
 
E
A
 
Y
L
 
L
R
 
K
A
 
N
R
 
K
G
 
G
A
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
L
S
 
T
S
 
K
E
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
A
A
 
G
F
 
H
I
|
I
A
 
A
E
 
S
L
 
T
N
 
D
T
 
D
H
 
Q
T
 
K
Q
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
F
-
 
T
-
 
L
-
 
Q
-
 
K
-
 
F
-
 
G
S
 
K
L
 
I
R
 
N
A
 
I
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
-
x
H
-
x
G
-
 
I
-
 
N
-
 
P
A
 
A
S
 
F
A
 
G
W
 
H
I
 
I
A
 
L
E
 
E
T
 
V
P
 
S
D
 
D
D
 
-
E
 
-
S
 
-
R
 
Q
A
 
V
F
 
W
T
 
D
D
 
K
M
 
L
F
 
F
S
 
E
V
 
V
H
 
N
M
 
V
L
 
K
A
 
A
P
 
G
Y
 
F
L
 
Q
I
 
M
N
 
T
L
 
K
H
 
L
C
 
V
S
 
H
P
 
P
L
 
H
L
 
I
Q
 
A
R
 
K
S
 
E
S
 
G
P
 
G
A
 
G
D
 
A
I
 
I
V
 
I
H
 
F
I
x
N
S
 
A
D
x
S
D
 
Y
V
 
S
V
 
A
R
 
Y
K
 
K
G
 
S
S
 
P
R
 
P
Q
 
G
H
 
I
I
 
A
A
 
A
Y
|
Y
C
 
G
A
 
V
T
 
T
K
|
K
A
 
T
G
 
T
L
 
L
D
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
R
S
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
M
Q
 
G
F
 
L
A
 
A
P
 
K
-
 
D
L
 
N
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
A
P
|
P
A
 
G
M
 
V
-
x
I
-
 
K
-
x
T
-
 
K
-
x
M
-
 
S
-
 
Q
V
 
V
M
 
L
F
 
W
N
 
D
D
 
G
G
 
G
D
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
E
Y
 
K
R
 
E
A
 
L
K
 
T
V
 
D
L
 
I
A
 
Q
K
 
E
S
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
R
E
 
L
P
 
G
G
 
V
P
 
P
E
 
D
V
 
D
I
 
C
Y
 
A
Q
 
G
S
 
T
V
 
V
R
 
A
Y
 
Y
L
 
L
L
 
A
-
 
S
-
 
D
D
 
D
N
 
S
P
 
S
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
E
T
 
M
L
 
I
T
 
I
V
 
I
N
 
A
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
24% identity, 98% coverage: 1:232/236 of query aligns to 1:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
T
 
T
A
 
L
T
 
Q
N
 
G
A
 
K
P
 
V
I
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
S
Q
x
R
R
x
G
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
D
C
 
I
A
 
A
Q
 
I
R
 
N
L
 
L
L
 
A
D
 
K
E
 
E
G
 
G
H
 
A
P
 
N
V
 
I
I
 
F
F
 
F
S
x
N
Y
|
Y
R
x
N
S
x
G
E
x
S
R
 
P
P
 
E
G
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
H
-
 
G
-
 
V
-
 
E
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
L
 
M
R
 
K
A
 
A
R
x
N
G
x
V
A
 
A
V
 
I
G
 
A
L
 
E
F
 
D
A
 
V
D
 
D
F
 
-
S
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
A
F
 
F
I
 
F
A
 
K
E
 
Q
L
 
A
N
 
I
T
 
E
H
 
R
T
 
F
Q
 
G
S
 
R
L
 
V
R
 
D
A
 
I
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
 
G
-
x
I
-
 
T
-
 
R
-
 
D
A
 
N
W
 
L
I
 
L
A
 
M
E
 
R
T
 
M
P
 
K
D
 
E
D
 
D
E
 
E
S
 
-
R
 
-
A
 
-
F
 
W
T
 
D
D
 
D
M
 
V
F
 
I
S
 
N
V
x
I
H
 
N
M
 
L
L
 
K
A
 
G
P
 
T
Y
 
F
L
 
L
I
 
C
N
 
T
L
 
K
H
 
A
C
 
V
S
 
S
P
 
R
L
 
T
L
 
M
Q
 
M
R
 
K
S
 
Q
S
 
R
P
 
A
A
 
G
D
 
K
I
 
I
V
 
I
H
 
N
I
 
M
S
 
A
D
x
S
D
 
V
V
 
V
V
 
G
R
 
L
K
 
I
G
 
G
S
 
N
R
 
A
Q
 
G
H
x
Q
I
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
S
 
T
F
 
T
A
 
A
A
 
R
Q
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
R
-
 
G
I
 
I
K
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
 
G
M
 
F
V
x
I
M
 
T
F
x
T
N
 
D
D
 
M
G
 
T
D
 
D
D
 
K
A
 
L
D
 
D
Y
 
E
R
 
K
A
 
T
K
 
K
-
 
E
-
 
A
V
 
M
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
S
 
I
A
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
A
E
 
Y
P
 
G
G
 
T
P
 
T
E
 
E
V
 
D
I
 
I
Y
 
A
Q
 
N
S
 
A
V
 
V
R
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
D
 
S
N
 
D
-
 
A
-
 
S
P
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
S
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

3h4vA Selective screening and design to identify inhibitors of leishmania major pteridine reductase 1 (see paper)
27% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:267/273 of 3h4vA

query
sites
3h4vA
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
L
G
 
G
L
 
R
H
 
S
C
 
I
A
 
A
Q
 
E
R
 
G
L
 
L
L
 
H
D
 
A
E
 
E
G
 
G
H
 
Y
P
 
A
V
 
V
I
 
C
F
 
L
S
x
H
Y
|
Y
-
x
H
-
x
R
-
x
S
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
T
-
 
L
R
 
N
S
 
A
E
 
R
R
 
R
P
 
P
G
 
N
-
 
S
-
 
A
-
 
I
-
 
T
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
L
 
D
R
x
L
A
 
S
R
 
N
G
 
V
A
 
A
V
 
T
G
 
A
L
 
P
F
 
V
A
 
A
D
 
D
F
 
G
S
 
S
S
 
A
E
 
P
A
 
V
G
 
T
I
 
L
L
 
F
A
 
T
F
 
R
I
 
C
A
 
A
E
 
E
L
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
C
N
 
Y
T
 
T
H
 
H
T
 
W
Q
 
G
S
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
x
S
W
x
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
I
 
L
A
 
L
E
 
R
T
 
N
P
 
G
D
 
D
D
 
R
E
 
E
S
 
A
-
 
M
-
 
E
R
 
T
A
 
A
F
 
T
T
 
A
D
 
D
M
 
L
F
 
F
S
 
G
V
 
S
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
I
 
L
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
F
-
 
A
-
 
H
N
 
R
L
 
V
H
 
A
C
 
G
S
 
T
P
 
P
L
 
A
L
 
K
Q
 
H
R
 
R
S
 
G
S
 
T
P
 
N
A
 
Y
D
 
S
I
 
I
V
 
I
H
 
N
I
x
M
S
x
V
D
|
D
D
 
A
V
 
M
V
 
T
R
 
N
K
 
Q
G
 
P
S
x
L
R
 
L
Q
 
G
H
 
Y
I
 
T
A
 
I
Y
|
Y
C
 
T
A
 
M
T
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
L
D
 
E
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
R
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
Q
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
-
 
Q
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
G
P
|
P
A
 
G
M
x
L
-
x
S
V
 
V
M
 
L
F
 
V
N
 
D
D
 
D
G
 
M
D
 
P
D
 
P
A
 
A
D
 
V
Y
 
W
-
 
E
-
 
G
-
 
H
R
 
R
A
 
S
K
 
K
V
 
V
-
 
P
-
 
L
L
 
Y
A
 
Q
K
 
R
S
 
D
A
 
S
L
 
S
G
 
A
I
 
A
E
 
E
P
 
V
G
 
S
P
 
D
E
 
V
V
 
V
I
 
I
Y
 
F
Q
 
L
S
 
C
V
 
S
R
 
S
Y
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
K
N
 
A
P
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
C
L
 
V
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
26% identity, 96% coverage: 9:235/236 of query aligns to 9:239/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
A
Q
x
K
R
x
G
V
x
L
G
 
G
L
 
Q
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
A
L
 
Y
L
 
A
D
 
E
E
 
E
G
 
G
H
 
A
P
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
A
-
 
G
-
x
D
-
x
L
-
 
G
-
 
D
F
 
L
S
 
T
Y
 
Y
R
 
-
S
 
-
E
 
S
R
 
H
P
 
P
G
 
N
V
 
V
Q
 
E
A
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
G
L
 
M
F
 
Y
A
x
L
D
x
N
F
x
V
S
 
T
S
 
D
E
 
V
A
 
T
G
 
G
I
 
V
L
 
E
A
 
K
F
 
F
I
 
Y
A
 
Q
E
 
S
L
 
V
N
 
I
T
 
D
H
 
K
T
 
Y
Q
 
G
S
 
K
L
 
I
R
 
D
A
 
I
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
x
G
A
 
I
W
 
-
I
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
T
P
 
K
D
 
D
D
 
A
E
 
M
S
 
T
R
 
R
A
 
K
F
 
M
T
 
T
D
 
E
-
 
A
-
 
Q
-
 
W
-
 
D
-
 
A
M
 
V
F
 
I
S
 
D
V
 
V
H
 
N
M
 
L
L
 
K
A
 
G
P
 
V
Y
 
F
L
 
N
I
 
L
N
 
T
L
 
R
H
 
L
C
 
V
S
 
G
P
 
P
L
 
Q
L
 
M
Q
 
Q
R
 
T
S
 
N
S
 
G
P
 
Y
A
 
G
D
 
S
I
 
I
V
 
I
H
 
N
I
|
I
S
 
S
D
x
S
D
 
V
V
 
V
V
 
G
R
 
V
K
 
F
G
 
G
S
 
N
R
 
I
Q
 
G
H
 
Q
I
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
M
S
 
T
F
 
W
A
 
A
A
 
K
Q
 
E
F
 
F
A
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
G
P
 
A
L
 
N
I
 
V
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
A
x
G
M
 
Y
V
x
I
M
 
M
F
x
T
N
 
D
D
 
I
G
 
L
D
 
K
D
 
T
A
 
V
-
 
P
-
 
Q
D
 
D
Y
 
L
R
 
L
A
 
D
K
 
K
V
 
F
L
 
A
A
 
A
K
 
L
S
 
T
A
 
M
L
 
L
G
 
N
I
 
R
E
 
L
P
 
G
G
 
Q
P
 
P
E
 
E
V
 
E
I
 
I
Y
 
A
Q
 
K
S
 
V
V
 
A
R
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
-
 
S
-
 
D
D
 
D
N
 
A
P
 
S
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
L
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
M
H
 
R
I
 
L

3d3wA Structure of l-xylulose reductase with bound coenzyme, phosphate and hydroxide. (see paper)
26% identity, 95% coverage: 8:232/236 of query aligns to 10:240/244 of 3d3wA

query
sites
3d3wA
I
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
|
G
Q
x
K
R
x
G
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
G
C
 
T
A
 
V
Q
 
Q
R
 
A
L
 
L
L
 
H
D
 
A
E
 
T
G
 
G
H
 
A
P
 
R
V
 
V
I
 
V
F
 
A
S
 
V
Y
x
S
R
|
R
S
x
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
R
E
 
E
R
 
C
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Q
 
E
A
 
P
L
 
V
R
 
C
A
x
V
R
 
D
G
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
-
F
x
L
A
 
G
D
 
D
F
 
W
S
 
E
S
 
A
E
 
T
A
 
E
G
 
R
I
 
A
L
 
L
A
 
G
F
 
S
I
 
V
A
 
G
E
 
P
L
 
V
N
 
D
T
 
L
H
 
-
T
 
-
Q
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
x
A
-
 
V
A
 
A
W
 
L
I
 
L
A
 
Q
E
 
P
T
 
F
P
 
L
D
 
E
D
 
V
E
 
T
S
 
K
R
 
E
A
 
A
F
 
F
T
 
D
D
 
R
M
 
S
F
 
F
S
 
E
V
|
V
H
 
N
M
 
L
L
 
R
A
 
A
P
 
V
Y
 
I
L
 
Q
I
 
V
N
 
S
-
 
Q
L
 
I
H
 
V
C
 
A
S
 
R
P
 
G
L
 
L
L
 
I
Q
 
A
R
 
R
S
 
G
S
 
V
P
 
P
A
 
G
D
 
A
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
V
S
|
S
D
x
S
D
 
Q
V
 
C
V
 
S
R
 
Q
K
 
R
G
 
A
S
 
V
R
 
T
Q
 
N
H
|
H
I
 
S
A
 
V
Y
|
Y
C
 
C
A
 
S
T
 
T
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
M
L
 
L
T
 
T
L
 
K
S
 
V
F
 
M
A
 
A
A
 
L
Q
 
E
F
 
L
A
 
G
P
 
P
-
 
H
L
 
K
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
N
P
|
P
A
x
T
M
 
V
V
|
V
M
 
M
F
x
T
N
x
S
D
x
M
G
|
G
D
 
Q
-
 
A
-
 
T
-
 
W
-
 
S
D
 
D
A
 
P
D
 
H
Y
 
K
R
 
A
A
 
K
K
 
T
V
 
M
L
 
L
A
 
N
K
 
R
S
 
I
A
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
K
E
 
F
P
 
A
G
 
E
P
 
V
E
 
E
V
 
H
I
 
V
Y
 
V
Q
 
N
S
 
A
V
 
I
R
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
S
N
 
D
-
 
R
-
 
S
P
 
G
Y
 
M
V
 
T
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
T
L
 
L
T
 
P
V
 
V
N
 
E
G
 
G
G
 
G

1pr9A Human l-xylulose reductase holoenzyme (see paper)
26% identity, 95% coverage: 8:232/236 of query aligns to 10:240/244 of 1pr9A

query
sites
1pr9A
I
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
|
G
Q
x
K
R
x
G
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
G
C
 
T
A
 
V
Q
 
Q
R
 
A
L
 
L
L
 
H
D
 
A
E
 
T
G
 
G
H
 
A
P
 
R
V
 
V
I
 
V
F
 
A
S
 
V
Y
x
S
R
|
R
S
x
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
R
E
 
E
R
 
C
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Q
 
E
A
 
P
L
 
V
R
 
C
A
 
V
R
 
D
G
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
-
F
x
L
A
 
G
D
 
D
F
 
W
S
 
E
S
 
A
E
 
T
A
 
E
G
 
R
I
 
A
L
 
L
A
 
G
F
 
S
I
 
V
A
 
G
E
 
P
L
 
V
N
 
D
T
 
L
H
 
-
T
 
-
Q
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
x
A
-
 
V
A
 
A
W
 
L
I
 
L
A
 
Q
E
 
P
T
 
F
P
 
L
D
 
E
D
 
V
E
 
T
S
 
K
R
 
E
A
 
A
F
 
F
T
 
D
D
 
R
M
 
S
F
 
F
S
 
E
V
|
V
H
 
N
M
 
L
L
 
R
A
 
A
P
 
V
Y
 
I
L
 
Q
I
 
V
N
 
S
-
 
Q
L
 
I
H
 
V
C
 
A
S
 
R
P
 
G
L
 
L
L
 
I
Q
 
A
R
 
R
S
 
G
S
 
V
P
 
P
A
 
G
D
 
A
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
V
S
 
S
D
x
S
D
 
Q
V
x
C
V
 
S
R
 
Q
K
 
R
G
 
A
S
 
V
R
 
T
Q
 
N
H
|
H
I
 
S
A
 
V
Y
|
Y
C
 
C
A
 
S
T
 
T
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
M
L
 
L
T
 
T
L
 
K
S
 
V
F
 
M
A
 
A
A
 
L
Q
 
E
F
 
L
A
 
G
P
 
P
-
 
H
L
 
K
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
N
P
 
P
A
x
T
M
 
V
V
|
V
M
 
M
F
x
T
N
 
S
D
x
M
G
 
G
D
 
Q
-
 
A
-
 
T
-
 
W
-
 
S
D
 
D
A
 
P
D
 
H
Y
 
K
R
 
A
A
 
K
K
 
T
V
 
M
L
 
L
A
 
N
K
 
R
S
 
I
A
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
K
E
 
F
P
 
A
G
 
E
P
 
V
E
 
E
V
 
H
I
 
V
Y
 
V
Q
 
N
S
 
A
V
 
I
R
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
S
N
 
D
-
 
R
-
 
S
P
 
G
Y
 
M
V
 
T
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
T
L
 
L
T
 
P
V
 
V
N
 
E
G
 
G
G
 
G

Q7Z4W1 L-xylulose reductase; XR; Carbonyl reductase II; Dicarbonyl/L-xylulose reductase; Kidney dicarbonyl reductase; kiDCR; Short chain dehydrogenase/reductase family 20C member 1; Sperm surface protein P34H; EC 1.1.1.10 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
26% identity, 95% coverage: 8:232/236 of query aligns to 10:240/244 of Q7Z4W1

query
sites
Q7Z4W1
I
 
V
L
|
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
Q
x
K
R
x
G
V
x
I
G
|
G
L
x
R
H
x
G
C
x
T
A
x
V
Q
|
Q
R
x
A
L
|
L
L
x
H
D
x
A
E
x
T
G
|
G
H
x
A
P
x
R
V
|
V
I
x
V
F
x
A
S
x
V
Y
x
S
R
|
R
S
x
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
R
E
 
E
R
 
C
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Q
 
E
A
 
P
L
 
V
R
 
C
A
 
V
R
 
D
G
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
L
A
 
G
D
 
D
F
 
W
S
 
E
S
 
A
E
 
T
A
 
E
G
 
R
I
 
A
L
 
L
A
 
G
F
 
S
I
 
V
A
 
G
E
 
P
L
 
V
N
 
D
T
 
L
H
 
-
T
 
-
Q
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
 
N
A
 
A
S
 
A
-
 
V
A
 
A
W
 
L
I
 
L
A
 
Q
E
 
P
T
 
F
P
 
L
D
 
E
D
 
V
E
 
T
S
 
K
R
 
E
A
 
A
F
 
F
T
 
D
D
 
R
M
 
S
F
 
F
S
 
E
V
 
V
H
x
N
M
 
L
L
 
R
A
 
A
P
 
V
Y
 
I
L
 
Q
I
 
V
N
 
S
-
 
Q
L
 
I
H
 
V
C
 
A
S
 
R
P
 
G
L
 
L
L
 
I
Q
 
A
R
 
R
S
 
G
S
 
V
P
 
P
A
 
G
D
 
A
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
 
V
S
 
S
D
x
S
D
 
Q
V
 
C
V
 
S
R
 
Q
K
 
R
G
 
A
S
 
V
R
 
T
Q
 
N
H
 
H
I
 
S
A
 
V
Y
 
Y
C
 
C
A
 
S
T
 
T
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
M
L
 
L
T
 
T
L
 
K
S
 
V
F
 
M
A
 
A
A
 
L
Q
 
E
F
 
L
A
 
G
P
 
P
-
 
H
L
 
K
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
N
P
 
P
A
 
T
M
 
V
V
 
V
M
 
M
F
 
T
N
 
S
D
 
M
G
 
G
D
 
Q
-
 
A
-
 
T
-
 
W
-
 
S
D
 
D
A
 
P
D
 
H
Y
 
K
R
 
A
A
 
K
K
 
T
V
 
M
L
 
L
A
 
N
K
 
R
S
 
I
A
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
K
E
 
F
P
 
A
G
 
E
P
 
V
E
 
E
V
 
H
I
 
V
Y
 
V
Q
 
N
S
 
A
V
 
I
R
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
S
N
 
D
-
 
R
-
 
S
P
 
G
Y
 
M
V
 
T
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
T
L
 
L
T
 
P
V
 
V
N
 
E
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7opjA Trypanosoma brucei ptr1 (tbptr1) in complex with pyrimethamine (see paper)
27% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:244/250 of 7opjA

query
sites
7opjA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
D
 
Q
E
 
T
G
 
G
H
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
F
 
I
S
x
H
Y
|
Y
R
x
H
S
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
A
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
A
 
S
R
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
A
 
E
E
 
E
-
 
I
L
 
I
N
 
N
T
 
S
H
 
C
T
 
F
Q
 
R
S
 
A
L
 
F
-
 
G
-
 
R
-
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
I
 
Y
A
 
-
E
 
P
T
 
T
P
 
P
D
 
L
D
 
V
E
 
Q
S
 
G
R
 
K
A
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
Q
F
 
V
T
 
A
D
 
E
M
 
L
F
 
I
S
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
F
L
 
A
Q
 
Q
R
 
R
S
 
Q
S
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
V
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
R
 
M
Q
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
Q
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
-
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
M
x
V
V
x
S
M
x
L
F
 
L
N
x
P
D
 
V
G
 
A
D
 
M
D
 
G
A
 
E
D
 
E
Y
 
E
R
 
K
A
 
D
K
 
K
V
 
W
L
 
R
A
 
R
K
 
K
S
 
V
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
P
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
V
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

6gd4A Trypanosoma brucei ptr1 in complex with inhibitor 4c (f188) (see paper)
27% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:244/250 of 6gd4A

query
sites
6gd4A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
D
 
Q
E
 
T
G
 
G
H
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
F
 
I
S
 
H
Y
|
Y
R
x
H
S
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
A
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
A
 
S
R
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
A
 
E
E
 
E
-
 
I
L
 
I
N
 
N
T
 
S
H
 
C
T
 
F
Q
 
R
S
 
A
L
 
F
-
 
G
-
 
R
-
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
I
 
Y
A
 
-
E
 
P
T
 
T
P
 
P
D
 
L
D
 
V
E
 
Q
S
 
G
R
 
K
A
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
Q
F
 
V
T
 
A
D
 
E
M
 
L
F
 
I
S
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
F
L
 
A
Q
 
Q
R
 
R
S
 
Q
S
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
V
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
R
 
M
Q
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
Q
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
-
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
M
 
V
V
x
S
M
 
L
F
 
L
N
 
P
D
 
V
G
 
A
D
 
M
D
 
G
A
 
E
D
 
E
Y
 
E
R
 
K
A
 
D
K
 
K
V
 
W
L
 
R
A
 
R
K
 
K
S
 
V
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
P
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
V
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

6gclA Trypanosoma brucei ptr1 in complex with inhibitor 3a (f020) (see paper)
27% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:244/250 of 6gclA

query
sites
6gclA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
D
 
Q
E
 
T
G
 
G
H
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
F
 
I
S
 
H
Y
|
Y
R
x
H
S
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
A
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
A
 
S
R
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
A
 
E
E
 
E
-
 
I
L
 
I
N
 
N
T
 
S
H
 
C
T
 
F
Q
 
R
S
 
A
L
 
F
-
 
G
-
 
R
-
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
I
 
Y
A
 
-
E
 
P
T
 
T
P
 
P
D
 
L
D
 
V
E
 
Q
S
 
G
R
 
K
A
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
Q
F
 
V
T
 
A
D
 
E
M
 
L
F
 
I
S
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
F
L
 
A
Q
 
Q
R
 
R
S
 
Q
S
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
V
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
R
 
M
Q
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
Q
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
-
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
M
 
V
V
x
S
M
x
L
F
 
L
N
x
P
D
 
V
G
 
A
D
 
M
D
 
G
A
 
E
D
 
E
Y
 
E
R
 
K
A
 
D
K
 
K
V
 
W
L
 
R
A
 
R
K
 
K
S
 
V
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
P
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
V
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

4wcdA Trypanosoma brucei ptr1 in complex with inhibitor 10 (see paper)
27% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:244/250 of 4wcdA

query
sites
4wcdA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
D
 
Q
E
 
T
G
 
G
H
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
F
 
I
S
 
H
Y
|
Y
R
x
H
S
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
A
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
A
 
S
R
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
A
 
E
E
 
E
-
 
I
L
 
I
N
 
N
T
 
S
H
 
C
T
 
F
Q
 
R
S
 
A
L
 
F
-
 
G
-
 
R
-
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
I
 
Y
A
 
-
E
 
P
T
 
T
P
 
P
D
 
L
D
 
V
E
 
Q
S
 
G
R
 
K
A
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
Q
F
 
V
T
 
A
D
 
E
M
 
L
F
 
I
S
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
F
L
 
A
Q
 
Q
R
 
R
S
 
Q
S
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
V
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
R
 
M
Q
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
Q
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
-
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
M
x
V
V
x
S
M
x
L
F
 
L
N
x
P
D
 
V
G
 
A
D
 
M
D
 
G
A
 
E
D
 
E
Y
 
E
R
 
K
A
 
D
K
 
K
V
x
W
L
 
R
A
 
R
K
 
K
S
 
V
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
P
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
V
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

4cmkA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
27% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:244/250 of 4cmkA

query
sites
4cmkA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
D
 
Q
E
 
T
G
 
G
H
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
F
 
I
S
 
H
Y
|
Y
R
x
H
S
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
A
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
A
 
S
R
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
A
 
E
E
 
E
-
 
I
L
 
I
N
 
N
T
 
S
H
 
C
T
 
F
Q
 
R
S
 
A
L
 
F
-
 
G
-
 
R
-
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
I
 
Y
A
 
-
E
 
P
T
 
T
P
 
P
D
 
L
D
 
V
E
 
Q
S
 
G
R
 
K
A
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
Q
F
 
V
T
 
A
D
 
E
M
 
L
F
 
I
S
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
F
L
 
A
Q
 
Q
R
 
R
S
 
Q
S
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
x
M
V
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
R
 
M
Q
 
A
H
x
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
Q
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
-
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
M
x
V
V
x
S
M
 
L
F
 
L
N
x
P
D
 
V
G
 
A
D
 
M
D
 
G
A
 
E
D
 
E
Y
 
E
R
 
K
A
 
D
K
 
K
V
 
W
L
 
R
A
 
R
K
 
K
S
 
V
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
P
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
V
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

4cm8A Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
27% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:244/250 of 4cm8A

query
sites
4cm8A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
D
 
Q
E
 
T
G
 
G
H
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
F
 
I
S
 
H
Y
|
Y
R
x
H
S
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
A
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
A
 
S
R
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
A
 
E
E
 
E
-
 
I
L
 
I
N
 
N
T
 
S
H
 
C
T
 
F
Q
 
R
S
 
A
L
 
F
-
 
G
-
 
R
-
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
I
 
Y
A
 
-
E
 
P
T
 
T
P
 
P
D
 
L
D
 
V
E
 
Q
S
 
G
R
 
K
A
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
Q
F
 
V
T
 
A
D
 
E
M
 
L
F
 
I
S
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
F
L
 
A
Q
 
Q
R
 
R
S
 
Q
S
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
x
M
V
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
R
 
M
Q
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
Q
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
-
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
M
 
V
V
x
S
M
x
L
F
 
L
N
 
P
D
 
V
G
 
A
D
 
M
D
 
G
A
 
E
D
 
E
Y
 
E
R
 
K
A
 
D
K
 
K
V
x
W
L
 
R
A
 
R
K
 
K
S
 
V
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
P
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
V
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

4clrA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
27% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:244/250 of 4clrA

query
sites
4clrA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
D
 
Q
E
 
T
G
 
G
H
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
F
 
I
S
 
H
Y
 
Y
R
x
H
S
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
A
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
A
 
S
R
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
A
 
E
E
 
E
-
 
I
L
 
I
N
 
N
T
 
S
H
 
C
T
 
F
Q
 
R
S
 
A
L
 
F
-
 
G
-
 
R
-
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
I
 
Y
A
 
-
E
 
P
T
 
T
P
 
P
D
 
L
D
 
V
E
 
Q
S
 
G
R
 
K
A
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
Q
F
 
V
T
 
A
D
 
E
M
 
L
F
 
I
S
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
F
L
 
A
Q
 
Q
R
 
R
S
 
Q
S
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
V
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
R
 
M
Q
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
Q
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
-
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
M
x
V
V
x
S
M
x
L
F
 
L
N
x
P
D
 
V
G
 
A
D
 
M
D
 
G
A
 
E
D
 
E
Y
 
E
R
 
K
A
 
D
K
 
K
V
 
W
L
 
R
A
 
R
K
 
K
S
 
V
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
P
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
V
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>GFF4590 FitnessBrowser__WCS417:GFF4590
MTATNAPILITGAGQRVGLHCAQRLLDEGHPVIFSYRSERPGVQALRARGAVGLFADFSS
EAGILAFIAELNTHTQSLRAIIHNASAWIAETPDDESRAFTDMFSVHMLAPYLINLHCSP
LLQRSSPADIVHISDDVVRKGSRQHIAYCATKAGLDSLTLSFAAQFAPLIKVNGIAPAMV
MFNDGDDADYRAKVLAKSALGIEPGPEVIYQSVRYLLDNPYVTGTTLTVNGGRHIK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory