SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF4633 FitnessBrowser__WCS417:GFF4633 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q1LK00 Tryptophan 2,3-dioxygenase; TDO; Tryptamin 2,3-dioxygenase; Tryptophan oxygenase; TO; TRPO; Tryptophan pyrrolase; Tryptophanase; EC 1.13.11.11 from Cupriavidus metallidurans (strain ATCC 43123 / DSM 2839 / NBRC 102507 / CH34) (Ralstonia metallidurans) (see paper)
71% identity, 95% coverage: 16:285/285 of query aligns to 30:299/299 of Q1LK00

query
sites
Q1LK00
W
 
W
H
 
H
N
 
G
A
 
A
E
 
Q
L
 
M
N
 
D
F
 
F
S
 
A
E
 
R
S
 
D
M
 
M
S
 
S
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
D
 
G
L
 
L
G
 
D
K
 
Q
V
 
I
L
 
L
S
 
S
A
 
A
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
D
H
 
H
N
 
N
E
 
E
M
 
M
L
 
L
F
|
F
I
 
I
I
 
V
Q
 
Q
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
S
 
T
E
 
E
L
 
L
W
 
W
M
 
M
K
 
K
L
 
L
M
 
M
L
 
L
H
 
H
E
 
E
L
 
L
K
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
D
H
 
G
V
 
V
R
 
K
L
 
S
G
 
D
E
 
Q
L
 
L
P
 
Q
P
 
P
A
 
A
F
 
F
K
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
V
S
 
S
R
 
R
I
 
I
F
 
M
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
H
 
Q
A
 
A
W
 
W
A
 
N
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
M
 
M
T
 
T
P
 
P
S
 
P
E
 
E
Y
|
Y
K
 
S
S
 
A
I
 
M
R
|
R
P
 
P
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
G
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
Y
Q
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
I
 
I
E
 
E
F
 
F
I
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
N
K
 
K
S
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
M
L
 
L
R
 
R
P
 
P
H
 
H
A
 
A
H
 
H
R
 
R
P
 
P
E
 
E
L
 
H
L
 
L
N
 
E
E
 
L
L
 
V
K
 
E
V
 
T
A
 
A
I
 
L
A
 
H
T
 
T
P
 
P
S
 
S
L
 
M
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
I
N
 
R
L
 
L
M
 
M
I
 
A
Q
 
R
A
 
R
G
 
G
L
 
F
A
 
Q
I
 
I
D
 
D
P
 
P
K
 
E
R
 
V
A
 
V
E
 
E
R
 
R
D
 
D
P
 
W
T
 
T
A
 
Q
A
 
P
T
 
T
V
 
Q
H
 
Y
D
 
N
E
 
A
S
 
S
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
W
 
W
R
 
L
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
R
 
R
D
 
N
P
 
P
S
 
S
R
 
A
Y
 
H
W
 
W
D
 
E
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
L
A
 
G
E
 
E
K
 
K
F
 
F
I
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
E
D
 
D
S
 
A
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
W
 
W
R
 
R
F
 
F
R
 
R
H
 
H
V
 
V
T
 
T
T
 
T
V
 
V
E
 
E
R
 
R
I
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
F
Q
 
K
P
 
R
G
 
G
T
|
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
E
 
E
G
 
G
V
 
V
G
 
S
Y
 
Y
L
 
L
R
 
R
K
 
R
M
 
M
L
 
L
D
 
D
T
 
V
V
 
V
L
 
L
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
L
W
 
W
R
 
K
V
 
L
R
 
R
S
 
T
T
 
D
L
 
L

2noxB Crystal structure of tryptophan 2,3-dioxygenase from ralstonia metallidurans (see paper)
70% identity, 95% coverage: 16:285/285 of query aligns to 1:266/266 of 2noxB

query
sites
2noxB
W
 
W
H
 
H
N
 
G
A
 
A
E
 
Q
L
 
M
N
 
D
F
 
F
S
 
A
E
 
R
S
 
D
M
 
M
S
 
S
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
D
 
G
L
 
L
G
 
D
K
 
Q
V
 
I
L
 
L
S
 
S
A
 
A
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
D
H
 
H
N
 
N
E
 
E
M
 
M
L
 
L
F
|
F
I
 
I
I
 
V
Q
 
Q
H
|
H
Q
 
Q
T
 
T
S
x
T
E
 
E
L
 
L
W
 
W
M
 
M
K
 
K
L
 
L
M
 
M
L
 
L
H
 
H
E
 
E
L
 
L
K
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
D
H
 
G
V
 
V
R
 
K
L
 
S
G
 
D
E
 
Q
L
 
L
P
 
Q
P
 
P
A
 
A
F
 
F
K
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
V
S
 
S
R
 
R
I
 
I
F
 
M
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
H
 
Q
A
 
A
W
|
W
A
 
N
V
 
V
L
|
L
A
 
A
T
 
T
M
 
M
T
 
T
P
 
P
S
 
P
E
 
E
Y
 
Y
K
 
S
S
 
A
I
 
M
R
 
R
P
 
P
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
A
S
 
S
S
|
S
G
|
G
F
|
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
Y
Q
 
Q
Y
|
Y
R
|
R
E
 
E
I
 
I
E
 
E
F
 
F
I
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
N
K
 
K
S
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
M
L
 
L
R
 
R
P
 
P
H
 
H
A
 
A
H
 
H
R
 
R
P
 
P
E
 
E
L
 
H
L
 
L
N
 
E
E
 
L
L
 
V
K
 
E
V
 
T
A
 
A
I
 
L
A
 
H
T
 
T
P
 
P
S
 
S
L
 
M
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
I
N
 
R
L
 
L
M
 
M
I
 
A
Q
 
R
A
 
R
G
 
G
L
 
F
A
 
Q
I
 
I
D
 
D
P
 
P
K
 
E
R
 
V
A
 
V
E
 
E
R
 
R
D
 
D
P
 
W
T
 
T
A
 
Q
A
 
P
T
 
T
V
 
Q
H
 
Y
D
 
N
E
 
A
S
 
S
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
W
 
W
R
 
L
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
R
 
R
D
 
N
P
 
P
S
 
S
R
 
A
Y
 
H
W
 
W
D
 
E
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
L
A
 
G
E
 
E
K
 
K
F
 
F
I
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
E
D
 
D
S
 
A
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
W
 
W
R
 
R
F
 
F
R
 
R
H
|
H
V
 
V
T
 
T
T
 
T
V
|
V
E
 
E
R
 
R
I
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
F
Q
 
K
P
 
R
G
 
G
T
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
-
E
|
E
G
 
G
V
 
V
G
 
S
Y
|
Y
L
|
L
R
 
R
K
 
R
M
 
M
L
 
L
D
 
D
T
 
V
V
 
V
L
 
L
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
L
W
 
W
R
 
K
V
 
L
R
 
R
S
 
T
T
 
D
L
 
L

2nw9A Crystal structure of tryptophan 2,3-dioxygenase (tdo) from xanthomonas campestris in complex with ferrous heme and 6-fluoro-tryptophan. Northeast structural genomics target xcr13 (see paper)
48% identity, 91% coverage: 27:285/285 of query aligns to 3:263/265 of 2nw9A

query
sites
2nw9A
M
 
L
S
 
T
Y
 
Y
G
 
G
D
 
G
Y
 
Y
L
 
L
D
 
R
L
 
L
G
 
D
K
 
Q
V
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
A
Q
 
Q
H
 
Q
P
 
P
L
 
L
S
 
S
-
 
E
-
 
P
P
 
A
D
 
H
H
 
H
N
 
D
E
 
E
M
 
M
L
 
L
F
|
F
I
 
I
I
 
I
Q
 
Q
H
|
H
Q
 
Q
T
 
T
S
|
S
E
 
E
L
 
L
W
 
W
M
 
L
K
 
K
L
 
L
M
 
L
L
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
L
K
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
I
E
 
V
H
 
H
V
 
L
R
 
Q
L
 
R
G
 
D
E
 
E
L
 
V
P
 
W
P
 
Q
A
 
C
F
 
R
K
 
K
M
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
S
S
 
K
R
 
Q
I
 
V
F
 
L
D
 
R
Q
 
Q
L
 
L
V
 
T
H
 
E
A
 
Q
W
|
W
A
 
S
V
 
V
L
|
L
A
 
E
T
 
T
M
 
L
T
 
T
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Y
|
Y
K
 
M
S
 
G
I
 
F
R
|
R
P
 
D
F
 
V
L
|
L
G
 
G
Q
 
P
S
|
S
S
 
S
G
|
G
F
|
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
L
Q
 
Q
Y
|
Y
R
|
R
E
 
Y
I
 
I
E
 
E
F
 
F
I
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
N
K
 
K
S
 
N
A
 
P
A
 
Q
L
 
M
L
 
L
R
 
Q
P
 
V
H
 
F
A
 
A
H
 
Y
R
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
G
L
 
Q
N
 
A
E
 
R
L
 
L
K
 
R
V
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
E
T
 
A
P
 
P
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
E
 
E
A
 
F
I
 
L
N
 
R
L
 
Y
M
 
L
I
 
A
Q
 
R
A
 
F
G
 
G
L
 
H
A
 
A
I
 
I
D
 
P
P
 
Q
K
 
Q
R
 
Y
A
 
Q
E
 
A
R
 
R
D
 
D
P
 
W
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
H
V
 
V
H
 
A
D
 
D
E
 
D
S
 
T
V
 
L
E
 
R
A
 
P
A
 
V
W
 
F
R
 
E
E
 
R
V
 
I
Y
 
Y
R
 
E
D
 
N
P
 
T
S
 
D
R
 
R
Y
 
Y
W
 
W
D
 
R
L
 
E
Y
 
Y
Q
 
S
L
 
L
A
 
C
E
 
E
K
 
D
F
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
V
E
 
E
D
 
T
S
 
Q
F
 
F
R
 
Q
Q
 
L
W
 
W
R
 
R
F
 
F
R
 
R
H
|
H
V
 
M
T
 
R
T
 
T
V
|
V
E
 
M
R
 
R
I
 
V
I
|
I
G
 
G
F
 
F
Q
 
K
P
 
R
G
|
G
T
|
T
G
|
G
G
 
G
T
x
S
E
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
L
 
L
R
 
Q
K
 
Q
M
 
A
L
 
L
D
 
A
T
 
L
V
 
T
L
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
L
W
 
F
R
 
D
V
 
V
R
 
R
S
 
T
T
 
S
L
 
V

Q8PDA8 Tryptophan 2,3-dioxygenase; TDO; Tryptamin 2,3-dioxygenase; Tryptophan oxygenase; TO; TRPO; Tryptophan pyrrolase; Tryptophanase; EC 1.13.11.11 from Xanthomonas campestris pv. campestris (strain ATCC 33913 / DSM 3586 / NCPPB 528 / LMG 568 / P 25) (see 2 papers)
48% identity, 91% coverage: 27:285/285 of query aligns to 22:282/298 of Q8PDA8

query
sites
Q8PDA8
M
 
L
S
 
T
Y
 
Y
G
 
G
D
 
G
Y
 
Y
L
 
L
D
 
R
L
 
L
G
 
D
K
 
Q
V
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
A
Q
 
Q
H
 
Q
P
 
P
L
 
L
S
 
S
-
 
E
-
 
P
P
 
A
D
 
H
H
 
H
N
 
D
E
 
E
M
 
M
L
 
L
F
|
F
I
|
I
I
|
I
Q
|
Q
H
|
H
Q
 
Q
T
 
T
S
 
S
E
 
E
L
 
L
W
 
W
M
 
L
K
 
K
L
 
L
M
 
L
L
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
L
K
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
I
E
 
V
H
 
H
V
 
L
R
 
Q
L
 
R
G
 
D
E
 
E
L
 
V
P
 
W
P
 
Q
A
 
C
F
 
R
K
 
K
M
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
S
S
 
K
R
 
Q
I
 
V
F
 
L
D
 
R
Q
 
Q
L
 
L
V
 
T
H
 
E
A
 
Q
W
 
W
A
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
E
T
 
T
M
 
L
T
 
T
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Y
|
Y
K
 
M
S
 
G
I
 
F
R
|
R
P
 
D
F
 
V
L
 
L
G
 
G
Q
 
P
S
 
S
S
 
S
G
 
G
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
E
 
Y
I
 
I
E
 
E
F
 
F
I
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
N
K
 
K
S
 
N
A
 
P
A
 
Q
L
 
M
L
 
L
R
 
Q
P
 
V
H
 
F
A
 
A
H
 
Y
R
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
G
L
 
Q
N
 
A
E
 
R
L
 
L
K
 
R
V
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
E
T
 
A
P
 
P
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
E
 
E
A
 
F
I
 
L
N
 
R
L
 
Y
M
 
L
I
 
A
Q
 
R
A
 
F
G
 
G
L
 
H
A
 
A
I
 
I
D
 
P
P
 
Q
K
 
Q
R
 
Y
A
 
Q
E
 
A
R
 
R
D
 
D
P
 
W
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
H
V
 
V
H
 
A
D
 
D
E
 
D
S
 
T
V
 
L
E
 
R
A
 
P
A
 
V
W
 
F
R
 
E
E
 
R
V
 
I
Y
 
Y
R
 
E
D
 
N
P
 
T
S
 
D
R
 
R
Y
 
Y
W
 
W
D
 
R
L
 
E
Y
 
Y
Q
 
S
L
 
L
A
 
C
E
 
E
K
 
D
F
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
V
E
 
E
D
 
T
S
 
Q
F
 
F
R
 
Q
Q
 
L
W
 
W
R
 
R
F
 
F
R
 
R
H
|
H
V
 
M
T
 
R
T
 
T
V
 
V
E
 
M
R
 
R
I
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
F
Q
 
K
P
 
R
G
 
G
T
|
T
G
 
G
G
 
G
T
 
S
E
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
L
 
L
R
 
Q
K
 
Q
M
 
A
L
 
L
D
 
A
T
 
L
V
 
T
L
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
L
W
 
F
R
 
D
V
 
V
R
 
R
S
 
T
T
 
S
L
 
V

7p46A Crystal structure of xanthomonas campestris tryptophan 2,3-dioxygenase (tdo) (see paper)
48% identity, 91% coverage: 27:285/285 of query aligns to 18:278/281 of 7p46A

query
sites
7p46A
M
 
L
S
 
T
Y
 
Y
G
 
G
D
 
G
Y
 
Y
L
 
L
D
 
R
L
 
L
G
 
D
K
 
Q
V
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
A
Q
 
Q
H
 
Q
P
 
P
L
 
L
S
 
S
-
 
E
-
 
P
P
 
A
D
 
H
H
 
H
N
 
D
E
 
E
M
 
M
L
 
L
F
|
F
I
 
I
I
 
I
Q
 
Q
H
x
S
Q
 
Q
T
 
T
S
|
S
E
 
E
L
 
L
W
 
W
M
 
L
K
 
K
L
 
L
M
 
L
L
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
L
K
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
I
E
 
V
H
 
H
V
 
L
R
 
Q
L
 
R
G
 
D
E
 
E
L
 
V
P
 
W
P
 
Q
A
 
C
F
 
R
K
|
K
M
 
V
L
 
L
A
|
A
R
 
R
V
 
S
S
 
K
R
 
Q
I
 
V
F
 
L
D
 
R
Q
 
Q
L
 
L
V
 
T
H
 
E
A
 
Q
W
|
W
A
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
E
T
 
T
M
 
L
T
 
T
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Y
|
Y
K
 
M
S
 
G
I
 
F
R
|
R
P
 
D
F
 
V
L
 
L
G
 
G
Q
 
P
S
|
S
S
|
S
G
|
G
F
|
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
L
Q
 
Q
Y
|
Y
R
|
R
E
 
Y
I
 
I
E
 
E
F
 
F
I
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
N
K
 
K
S
 
N
A
 
P
A
 
Q
L
 
M
L
 
L
R
 
Q
P
 
V
H
 
F
A
 
A
H
 
Y
R
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
G
L
 
Q
N
 
A
E
 
R
L
 
L
K
 
R
V
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
E
T
 
A
P
 
P
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
E
 
E
A
 
F
I
 
L
N
 
R
L
 
Y
M
 
L
I
 
A
Q
 
R
A
 
F
G
 
G
L
 
H
A
 
A
I
 
I
D
 
P
P
 
Q
K
 
Q
R
 
Y
A
 
Q
E
 
A
R
 
R
D
 
D
P
 
W
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
H
V
 
V
H
 
A
D
 
D
E
 
D
S
 
T
V
 
L
E
 
R
A
 
P
A
 
V
W
 
F
R
 
E
E
 
R
V
 
I
Y
 
Y
R
 
E
D
 
N
P
 
T
S
 
D
R
 
R
Y
 
Y
W
 
W
D
 
R
L
 
E
Y
|
Y
Q
x
S
L
 
L
A
 
C
E
|
E
K
 
D
F
 
L
I
 
V
D
|
D
L
 
V
E
 
E
D
 
T
S
 
Q
F
 
F
R
 
Q
Q
 
L
W
 
W
R
 
R
F
 
F
R
 
R
H
|
H
V
 
M
T
 
R
T
 
T
V
|
V
E
 
M
R
 
R
I
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
F
Q
 
K
P
 
R
G
|
G
T
|
T
G
|
G
G
 
G
T
x
S
E
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
L
 
L
R
 
Q
K
 
Q
M
 
A
L
 
L
D
 
A
T
 
L
V
 
T
L
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
L
W
 
F
R
 
D
V
 
V
R
 
R
S
 
T
T
 
S
L
 
V

1yw0A Crystal structure of the tryptophan 2,3-dioxygenase from xanthomonas campestris. Northeast structural genomics target xcr13.
44% identity, 91% coverage: 28:285/285 of query aligns to 1:241/243 of 1yw0A

query
sites
1yw0A
S
 
T
Y
 
Y
G
 
G
D
 
G
Y
 
Y
L
 
L
D
 
R
L
 
L
G
 
D
K
 
Q
V
 
L
L
 
L
S
 
S
A
|
A
Q
|
Q
H
x
Q
P
 
P
L
 
L
S
 
S
-
 
E
-
 
P
P
 
A
D
 
H
H
 
H
N
 
D
E
 
E
M
 
M
L
 
L
F
 
F
I
 
I
I
 
I
Q
 
Q
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
S
 
S
E
 
E
L
 
L
W
 
W
M
 
L
K
 
K
L
 
L
M
 
L
L
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
L
K
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
I
E
 
V
H
 
H
V
 
L
R
 
Q
L
 
R
G
 
D
E
 
E
L
 
V
P
 
W
P
 
Q
A
 
C
F
 
R
K
 
K
M
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
S
S
 
K
R
 
Q
I
 
V
F
 
L
D
 
R
Q
 
Q
L
 
L
V
 
T
H
 
E
A
 
Q
W
 
W
A
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
E
T
 
T
M
 
L
T
 
T
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
K
 
M
S
 
G
I
 
F
R
 
R
P
 
D
F
 
V
L
 
L
G
 
G
Q
 
-
S
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
E
 
Y
I
 
I
E
 
E
F
 
F
I
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
N
K
 
K
S
 
N
A
 
P
A
 
Q
L
 
M
L
 
L
R
 
Q
P
 
V
H
 
F
A
 
A
H
 
Y
R
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
G
L
 
Q
N
 
A
E
 
R
L
 
L
K
 
R
V
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
E
T
 
A
P
 
P
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
E
 
E
A
 
F
I
 
L
N
 
R
L
 
Y
M
 
L
I
 
A
Q
 
R
A
 
F
G
 
G
L
 
H
A
 
A
I
 
I
D
 
P
P
 
Q
K
 
Q
R
 
Y
A
 
Q
E
 
A
R
 
R
D
 
D
P
 
W
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
H
V
 
V
H
 
A
D
 
D
E
 
D
S
 
T
V
 
L
E
 
R
A
 
P
A
 
V
W
 
F
R
 
E
E
 
R
V
 
I
Y
 
Y
R
 
E
D
 
N
P
 
T
S
 
D
R
 
R
Y
 
Y
W
 
W
D
 
R
L
 
E
Y
 
Y
Q
 
S
L
 
L
A
 
C
E
 
E
K
 
D
F
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
V
E
 
E
D
 
T
S
 
Q
F
 
F
R
 
Q
Q
 
L
W
 
W
R
 
R
F
 
F
R
 
R
H
 
H
V
 
M
T
 
R
T
 
T
V
 
V
E
 
M
R
 
R
I
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
F
Q
 
-
P
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
M
 
A
L
 
L
D
 
A
T
 
L
V
 
T
L
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
L
W
 
F
R
 
D
V
 
V
R
 
R
S
 
T
T
 
S
L
 
V

5ti9C Crystal structure of human tdo in complex with trp and dioxygen, northeast structural genomics consortium target hr6161 (see paper)
30% identity, 85% coverage: 27:267/285 of query aligns to 1:287/326 of 5ti9C

query
sites
5ti9C
M
 
L
S
 
I
Y
 
Y
G
 
G
D
 
N
Y
 
Y
L
 
L
D
 
H
L
 
L
G
 
E
K
 
K
V
 
V
L
 
L
S
 
N
A
 
A
Q
 
Q
H
 
E
P
 
L
L
 
Q
S
 
S
P
 
E
D
 
T
-
 
K
-
 
G
-
 
N
-
 
K
-
 
I
H
 
H
N
 
D
E
 
E
M
 
H
L
 
L
F
|
F
I
 
I
I
 
I
Q
 
T
H
|
H
Q
 
Q
T
 
A
S
x
Y
E
 
E
L
 
L
W
 
W
M
 
F
K
 
K
L
 
Q
M
 
I
L
 
L
H
 
W
E
 
E
L
 
L
K
 
D
A
 
S
A
 
V
R
 
R
E
 
E
H
 
I
V
 
F
R
 
Q
L
 
N
G
 
G
E
 
H
L
 
V
P
x
R
P
 
D
A
x
E
F
 
R
K
 
N
M
 
M
L
 
L
A
 
K
-
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
R
-
 
M
-
 
H
R
 
R
V
 
V
S
 
S
R
 
V
I
 
I
F
 
L
D
 
K
Q
 
L
L
 
L
V
 
V
H
 
Q
A
 
Q
W
 
F
A
 
S
V
 
I
L
|
L
A
 
E
T
 
T
M
 
M
T
 
T
P
 
A
S
 
L
E
 
D
Y
 
F
K
 
N
S
 
D
I
 
F
R
|
R
P
 
E
F
 
Y
L
|
L
G
 
S
Q
 
P
S
x
A
S
|
S
G
|
G
F
|
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
L
Q
 
Q
Y
x
F
R
|
R
E
 
L
I
 
L
E
 
E
F
 
N
I
 
K
L
 
I
G
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
Q
-
 
N
-
 
R
-
 
D
-
 
N
-
 
F
-
 
K
N
 
G
K
 
E
S
 
E
A
 
N
A
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
L
P
 
K
H
 
S
A
 
E
H
 
Q
R
 
E
P
 
K
E
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
E
E
 
L
L
 
V
K
 
E
V
 
A
A
x
W
I
 
L
A
 
E
-
x
R
T
|
T
P
|
P
S
 
G
L
 
L
Y
 
E
D
 
P
E
 
H
A
 
G
I
 
F
N
 
N
L
 
F
-
 
W
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
E
-
 
K
M
 
N
I
 
I
Q
 
T
A
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
E
I
 
E
D
 
E
P
 
F
K
 
I
R
 
R
A
 
F
E
 
Q
R
 
K
D
 
Q
P
 
K
T
 
E
A
 
V
A
 
L
T
 
L
V
 
S
-
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
E
-
 
K
-
 
R
H
 
H
D
 
E
E
 
H
S
 
L
V
 
L
E
 
S
A
 
K
A
 
G
W
 
E
R
 
R
E
 
R
V
 
L
-
 
S
-
 
Y
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
M
-
x
I
-
 
Y
-
 
F
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
P
 
E
S
 
P
R
 
R
Y
x
F
W
 
Q
D
 
V
L
x
P
Y
 
F
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
E
 
T
K
 
S
F
 
L
I
 
M
D
 
D
L
 
I
E
 
D
D
 
S
S
 
L
F
 
M
R
 
T
Q
 
K
W
|
W
R
 
R
F
 
Y
R
 
N
H
|
H
V
 
V
T
 
C
T
 
M
V
|
V
E
 
H
R
 
R
I
x
M
I
x
L
G
 
G
F
 
S
Q
 
K
P
 
A
G
|
G
T
|
T
G
|
G
G
 
G
T
x
S
E
 
S
G
 
G
V
 
Y
G
 
H
Y
 
Y
L
|
L
R
 
R

6pyzC Crystal structure of human tryptophan 2,3-dioxygenase in complex with pf-06840003 in active site (see paper)
30% identity, 85% coverage: 26:267/285 of query aligns to 1:294/333 of 6pyzC

query
sites
6pyzC
S
 
G
M
 
L
S
 
I
Y
|
Y
G
 
G
D
 
N
Y
|
Y
L
 
L
D
 
H
L
 
L
G
 
E
K
 
K
V
 
V
L
 
L
S
 
N
A
 
A
Q
 
Q
H
 
E
P
 
L
L
 
Q
S
 
S
P
 
E
D
 
T
-
 
K
-
 
G
-
 
N
-
 
K
-
 
I
H
 
H
N
 
D
E
 
E
M
 
H
L
 
L
F
|
F
I
 
I
I
 
I
Q
 
T
H
|
H
Q
 
Q
T
 
A
S
x
Y
E
 
E
L
 
L
W
 
W
M
 
F
K
 
K
L
 
Q
M
 
I
L
 
L
H
 
W
E
 
E
L
 
L
K
 
D
A
 
S
A
 
V
R
 
R
E
 
E
H
 
I
V
 
F
R
 
Q
L
 
N
G
 
G
E
 
H
L
 
V
P
x
R
P
 
D
A
x
E
F
 
R
K
 
N
M
 
M
L
 
L
A
 
K
-
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
R
-
 
M
-
 
H
R
 
R
V
 
V
S
 
S
R
 
V
I
 
I
F
 
L
D
 
K
Q
 
L
L
 
L
V
 
V
H
 
Q
A
 
Q
W
 
F
A
 
S
V
 
I
L
|
L
A
 
E
T
 
T
M
 
M
T
 
T
P
 
A
S
 
L
E
 
D
Y
 
F
K
 
N
S
 
D
I
 
F
R
 
R
P
 
E
F
 
Y
L
 
L
G
 
S
Q
 
P
S
x
A
S
|
S
G
|
G
F
|
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
L
Q
 
Q
Y
x
F
R
|
R
E
 
L
I
 
L
E
 
E
F
 
N
I
 
K
L
 
I
G
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
Q
-
 
N
-
 
M
-
 
R
-
 
V
-
 
P
-
 
Y
-
 
H
-
 
Y
-
 
R
-
 
D
-
 
N
-
 
F
-
 
K
N
 
G
K
 
E
S
 
E
A
 
N
A
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
L
P
 
K
H
 
S
A
 
E
H
 
Q
R
 
E
P
 
K
E
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
E
E
 
L
L
 
V
K
 
E
V
 
A
A
x
W
I
 
L
A
 
E
-
x
R
T
|
T
P
|
P
S
 
G
L
 
L
Y
 
E
D
 
P
E
 
H
A
 
G
I
 
F
N
 
N
L
 
F
-
 
W
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
E
-
 
K
M
 
N
I
 
I
Q
 
T
A
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
E
I
 
E
D
 
E
P
 
A
K
 
E
R
 
F
A
 
Q
E
 
K
R
 
Q
D
 
K
P
 
E
T
 
V
A
 
L
A
 
L
T
 
S
V
 
L
H
 
F
D
 
D
E
 
E
S
 
K
V
 
R
E
 
H
A
 
E
-
 
H
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
K
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
L
A
 
S
W
 
Y
R
 
R
E
 
A
V
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
M
-
 
I
-
 
Y
-
 
F
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
P
 
E
S
 
P
R
 
R
Y
x
F
W
 
Q
D
 
V
L
 
P
Y
 
F
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
E
 
T
K
 
S
F
 
L
I
 
M
D
 
D
L
 
I
E
 
D
D
 
S
S
 
L
F
 
M
R
 
T
Q
 
K
W
 
W
R
 
R
F
 
Y
R
 
N
H
|
H
V
 
V
T
 
C
T
x
M
V
|
V
E
 
H
R
 
R
I
x
M
I
 
L
G
 
G
F
 
S
Q
 
K
P
 
A
G
|
G
T
|
T
G
|
G
G
 
G
T
x
S
E
 
S
G
 
G
V
 
Y
G
 
H
Y
|
Y
L
|
L
R
 
R

P20351 Tryptophan 2,3-dioxygenase; TDO; Protein vermilion; Tryptamin 2,3-dioxygenase; Tryptophan oxygenase; TO; TRPO; Tryptophan pyrrolase; Tryptophanase; EC 1.13.11.11 from Drosophila melanogaster (Fruit fly) (see paper)
28% identity, 94% coverage: 4:270/285 of query aligns to 3:340/379 of P20351

query
sites
P20351
C
 
C
P
 
P
F
 
Y
S
 
A
A
 
G
D
 
N
Y
 
G
Q
 
N
P
 
D
P
 
H
E
 
D
E
 
D
W
 
-
H
 
S
N
 
A
A
 
V
E
 
P
L
 
L
N
 
T
F
 
T
S
 
E
E
 
V
S
 
G
M
 
K
S
 
I
Y
 
Y
G
 
G
D
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
M
L
 
L
G
 
D
K
 
K
V
 
L
L
 
L
S
 
D
A
 
A
Q
 
Q
H
 
C
P
 
M
L
 
L
S
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
D
-
 
K
-
 
R
P
 
P
D
 
V
H
 
H
N
 
D
E
 
E
M
 
H
L
 
L
F
 
F
I
 
I
I
 
I
Q
 
T
H
 
H
Q
 
Q
T
 
A
S
 
Y
E
 
E
L
 
L
W
 
W
M
 
F
K
 
K
L
 
Q
M
 
I
L
 
I
H
 
F
E
 
E
L
 
F
K
 
D
A
 
S
A
 
I
R
 
R
-
 
D
-
 
M
-
 
L
-
 
D
-
 
A
E
 
E
H
 
V
V
 
I
R
 
D
L
 
E
G
 
T
E
 
K
L
 
T
P
 
L
P
 
E
A
 
I
F
 
V
K
 
K
M
 
R
L
 
L
A
 
N
R
 
R
V
 
V
S
 
V
R
 
L
I
 
I
F
 
L
D
 
K
Q
 
L
L
 
L
V
 
V
H
 
D
A
 
Q
W
 
V
A
 
P
V
 
I
L
 
L
A
 
E
T
 
T
M
 
M
T
 
T
P
 
P
S
 
L
E
x
D
Y
 
F
K
 
M
S
 
D
I
 
F
R
 
R
P
 
K
F
 
Y
L
 
L
G
 
A
Q
 
P
S
 
A
S
 
S
G
 
G
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
L
Q
 
Q
Y
 
F
R
 
R
E
 
L
I
 
I
E
 
E
F
 
N
I
 
K
L
 
L
G
 
G
N
 
V
K
 
L
S
 
T
A
 
E
A
 
Q
L
 
R
L
 
V
R
 
R
P
 
Y
H
 
N
A
 
Q
H
 
K
R
 
Y
P
 
S
E
 
D
L
 
V
L
 
F
-
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
R
N
 
N
E
 
S
L
 
I
K
 
R
V
 
N
A
 
S
I
 
E
A
 
K
T
 
D
P
 
P
S
 
S
L
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
-
 
R
-
 
W
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
T
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
F
-
 
N
-
 
F
-
 
W
-
 
A
-
 
K
Y
 
F
D
 
Q
E
 
E
A
 
S
I
 
V
N
 
D
L
 
R
M
 
F
I
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
Q
-
 
V
-
 
Q
-
 
S
-
 
A
-
 
M
-
 
E
-
 
E
-
 
P
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
N
-
x
Y
-
 
R
-
 
L
L
 
M
A
 
D
I
 
I
D
 
E
P
 
K
K
 
R
R
 
R
-
 
E
A
 
V
E
 
Y
R
 
R
D
 
S
P
 
I
T
 
F
A
 
D
A
 
P
T
 
A
V
 
V
H
 
H
D
 
D
E
 
A
S
 
L
V
 
V
E
 
R
A
 
R
A
 
G
W
 
D
R
 
R
E
 
R
-
 
F
-
 
S
-
 
H
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
M
-
 
I
-
 
T
V
 
F
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
P
 
E
S
 
P
R
 
R
Y
 
F
W
 
S
D
 
Q
L
 
P
Y
 
H
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
E
 
T
K
 
L
F
 
L
I
 
M
D
 
D
L
 
I
E
 
D
D
 
S
S
 
L
F
 
I
R
 
T
Q
 
K
W
 
W
R
|
R
F
 
Y
R
 
N
H
|
H
V
 
V
T
 
I
T
 
M
V
 
V
E
 
Q
R
 
R
I
 
M
I
 
I
G
 
G
F
 
S
Q
 
Q
P
 
Q
-
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
S
E
 
S
G
 
G
V
 
Y
G
 
Q
Y
|
Y
L
 
L
R
 
R
K
 
S
M
 
T
L
 
L

4hkaA Crystal structure of drosophila melanogaster tryptophan 2,3- dioxygenase in complex with heme (see paper)
29% identity, 85% coverage: 29:270/285 of query aligns to 4:317/345 of 4hkaA

query
sites
4hkaA
Y
 
Y
G
 
G
D
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
M
L
 
L
G
 
D
K
 
K
V
 
L
L
 
L
S
 
D
A
 
A
Q
 
Q
H
 
C
P
 
M
L
 
L
S
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
D
-
 
K
-
 
R
P
 
P
D
 
V
H
 
H
N
 
D
E
 
E
M
 
H
L
 
L
F
 
F
I
 
I
I
 
I
Q
 
T
H
|
H
Q
 
Q
T
 
A
S
x
Y
E
 
E
L
 
L
W
 
W
M
x
F
K
 
K
L
 
Q
M
 
I
L
 
I
H
 
F
E
 
E
L
 
F
K
 
D
A
 
S
A
 
I
R
 
R
-
 
D
-
 
M
-
 
L
-
 
D
-
 
A
E
 
E
H
 
V
V
 
I
R
 
D
L
 
E
G
 
T
E
 
K
L
 
T
P
 
L
P
 
E
A
 
I
F
 
V
K
 
K
M
 
R
L
 
L
A
 
N
R
 
R
V
 
V
S
 
V
R
 
L
I
 
I
F
 
L
D
 
K
Q
 
L
L
 
L
V
 
V
H
 
D
A
 
Q
W
 
V
A
 
P
V
 
I
L
|
L
A
 
E
T
 
T
M
 
M
T
 
T
P
 
P
S
 
L
E
 
D
Y
x
F
K
 
M
S
 
D
I
 
F
R
 
R
P
 
K
F
 
Y
L
 
L
G
 
A
Q
 
P
S
 
A
S
 
S
G
 
G
F
|
F
Q
|
Q
S
 
S
F
 
L
Q
 
Q
Y
x
F
R
 
R
E
 
L
I
 
I
E
 
E
F
 
N
I
 
K
L
 
L
G
 
G
N
 
V
K
 
L
S
 
T
A
 
E
A
 
Q
L
 
R
L
 
V
R
 
R
P
x
Y
H
 
N
A
 
Q
H
 
K
R
 
Y
P
 
S
E
 
D
L
 
V
L
 
F
-
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
R
N
 
N
E
 
S
L
 
I
K
 
R
V
 
N
A
 
S
I
 
E
A
 
K
T
 
D
P
 
P
S
 
S
L
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
-
 
R
-
 
W
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
T
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
F
-
 
N
-
 
F
-
 
W
-
 
A
-
 
K
Y
 
F
D
 
Q
E
 
E
A
 
S
I
 
V
N
 
D
L
 
R
M
 
F
I
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
Q
-
 
V
-
 
Q
-
 
S
-
 
A
-
 
M
-
 
E
-
 
E
-
 
P
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
N
-
 
Y
-
 
R
-
 
L
L
 
M
A
 
D
I
 
I
D
 
E
P
 
K
K
 
R
R
 
R
-
 
E
A
 
V
E
 
Y
R
 
R
D
 
S
P
 
I
T
 
F
A
 
D
A
 
P
T
 
A
V
 
V
H
 
H
D
 
D
E
 
A
S
 
L
V
 
V
E
 
R
A
 
R
A
 
G
W
 
D
R
 
R
E
 
R
-
 
F
-
 
S
-
 
H
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
M
-
 
I
-
 
T
V
 
F
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
P
 
E
S
 
P
R
 
R
Y
 
F
W
 
S
D
 
Q
L
 
P
Y
 
H
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
E
 
T
K
 
L
F
 
L
I
 
M
D
 
D
L
 
I
E
 
D
D
 
S
S
 
L
F
 
I
R
 
T
Q
 
K
W
|
W
R
 
R
F
 
Y
R
 
N
H
|
H
V
 
V
T
 
I
T
 
M
V
|
V
E
 
Q
R
 
R
I
 
M
I
 
I
G
 
G
F
 
S
Q
 
Q
P
 
Q
-
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
S
E
 
S
G
 
G
V
 
Y
G
 
Q
Y
|
Y
L
|
L
R
 
R
K
 
S
M
 
T
L
 
L

Q09474 Tryptophan 2,3-dioxygenase; TDO; Tryptamin 2,3-dioxygenase; Tryptophan oxygenase; TO; TRPO; Tryptophan pyrrolase; Tryptophanase; EC 1.13.11.11 from Caenorhabditis elegans (see paper)
26% identity, 88% coverage: 17:267/285 of query aligns to 29:351/403 of Q09474

query
sites
Q09474
H
 
N
N
 
K
A
 
V
E
 
E
L
 
M
N
 
G
F
 
F
S
 
G
E
 
Q
S
 
T
M
 
-
S
 
-
Y
 
Y
G
 
S
D
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
Q
L
 
L
G
 
D
K
 
K
V
 
I
L
 
L
S
 
T
A
 
A
Q
 
Q
H
 
R
P
 
L
L
 
K
S
 
S
P
 
E
D
 
A
H
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
D
N
 
D
E
 
E
M
 
H
L
 
L
F
 
F
I
 
I
I
 
V
Q
 
I
H
 
H
Q
 
Q
T
 
A
S
 
H
E
 
E
L
 
L
W
 
W
M
 
F
K
 
K
L
 
Q
M
 
I
L
 
I
H
 
F
E
 
D
L
 
L
K
 
D
A
 
N
A
 
V
R
 
R
E
 
K
H
 
L
V
 
L
R
 
N
-
 
N
-
 
T
L
 
I
G
 
V
E
 
D
L
 
E
P
 
T
P
 
K
A
 
T
F
 
L
K
 
K
M
 
I
-
 
V
-
 
S
-
 
G
L
 
L
A
 
D
R
 
R
V
 
M
S
 
T
R
 
K
I
 
I
F
 
L
D
 
S
Q
 
L
L
 
L
V
 
T
H
 
E
A
 
Q
W
 
I
A
 
T
V
 
L
L
 
L
A
 
D
T
 
T
M
 
M
T
 
S
P
|
P
S
x
L
E
x
D
Y
 
F
K
 
V
S
 
D
I
 
F
R
 
R
P
 
K
F
 
Y
L
 
L
G
 
T
Q
 
P
S
 
A
S
 
S
G
 
G
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
L
Q
 
Q
Y
 
F
R
 
R
E
 
V
I
 
L
E
 
E
F
 
N
I
 
K
L
 
L
G
 
G
N
 
V
K
 
R
S
 
Q
A
 
E
A
 
R
L
 
R
L
 
I
R
 
K
P
 
Y
H
 
N
A
 
A
-
 
Q
H
 
H
R
 
Y
P
 
K
E
 
N
L
 
V
L
 
F
N
 
N
E
 
D
L
 
T
K
 
D
V
 
L
A
 
K
I
 
T
A
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
T
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
S
-
 
L
-
 
L
-
 
T
-
 
L
-
 
I
-
 
E
-
 
S
-
 
W
-
 
L
-
 
E
-
 
R
T
 
T
P
 
P
S
 
G
L
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
T
-
 
S
-
 
E
-
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
F
-
 
W
-
 
I
-
 
K
Y
 
Y
D
 
E
E
 
K
A
 
S
I
 
V
N
 
N
-
 
K
-
 
Y
L
 
L
M
 
A
I
 
D
Q
 
L
A
 
A
G
 
K
L
 
Q
A
 
A
I
 
A
D
 
D
P
 
P
K
 
S
R
 
N
A
 
T
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
K
-
 
Q
-
 
L
-
 
T
-
 
A
-
 
E
-
 
Y
-
 
H
-
 
K
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
F
-
 
Q
-
 
S
-
 
I
-
 
L
-
 
D
-
 
P
-
 
R
-
 
Q
-
 
H
-
 
E
-
 
Q
-
 
H
-
 
I
R
 
R
D
 
N
P
 
G
T
 
N
A
 
R
A
 
L
T
 
L
V
 
S
H
 
H
D
 
D
E
 
A
S
 
T
V
 
K
E
 
G
A
 
A
A
 
M
W
 
M
R
 
I
E
 
Y
V
 
F
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
P
 
M
S
 
P
R
 
R
Y
 
F
W
 
S
D
 
Q
L
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
I
A
 
L
E
 
T
K
 
F
F
 
L
I
 
M
D
 
D
L
 
I
E
 
D
D
 
S
S
 
L
F
 
F
R
 
T
Q
 
K
W
 
W
R
 
R
F
 
Y
R
 
N
H
 
H
V
 
V
T
 
L
T
 
L
V
 
V
E
 
Q
R
 
R
I
 
M
I
 
L
G
 
G
F
 
A
Q
 
K
P
 
Q
G
 
G
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
S
E
 
S
G
 
G
V
 
Y
G
 
M
Y
 
Y
L
 
L
R
 
R

6a4iD Crystal structure of human tdo inhibitor complex
32% identity, 79% coverage: 27:252/285 of query aligns to 1:248/290 of 6a4iD

query
sites
6a4iD
M
 
L
S
 
I
Y
|
Y
G
 
G
D
 
N
Y
|
Y
L
 
L
D
 
H
L
 
L
G
 
E
K
 
K
V
 
V
L
 
L
S
 
N
A
 
A
Q
 
Q
H
 
E
P
 
L
L
 
Q
S
 
S
P
 
E
D
 
T
-
 
K
-
 
G
-
 
N
-
 
K
-
 
I
H
 
H
N
 
D
E
 
E
M
 
H
L
 
L
F
|
F
I
 
I
I
 
I
Q
 
T
H
|
H
Q
 
Q
T
 
A
S
x
Y
E
 
E
L
 
L
W
 
W
M
 
F
K
 
K
L
 
Q
M
 
I
L
 
L
H
 
W
E
 
E
L
 
L
K
 
D
A
 
S
A
 
V
R
 
R
E
 
E
H
 
I
V
 
F
R
 
Q
L
 
N
G
 
G
E
 
H
L
 
V
P
x
R
P
 
D
A
 
E
F
 
R
K
 
N
M
 
M
L
 
L
A
 
K
-
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
R
-
 
M
-
 
H
R
 
R
V
 
V
S
 
S
R
 
V
I
 
I
F
 
L
D
 
K
Q
 
L
L
 
L
V
 
V
H
 
Q
A
 
Q
W
 
F
A
 
S
V
 
I
L
 
L
A
 
E
T
 
T
M
 
M
T
 
T
P
 
A
S
 
L
E
 
D
Y
x
F
K
 
N
S
 
D
I
 
F
R
 
R
P
 
E
F
 
Y
L
 
L
G
 
S
Q
 
P
S
x
A
S
|
S
G
|
G
F
|
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
L
Q
 
Q
Y
x
F
R
 
R
E
 
L
I
 
L
E
 
E
F
 
N
-
 
K
-
 
I
-
 
G
I
 
V
L
 
L
G
 
K
N
 
G
K
 
E
S
 
E
A
 
N
A
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
L
P
 
K
H
 
S
A
 
E
H
 
Q
R
 
E
P
 
K
E
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
E
E
 
L
L
 
V
K
 
E
V
 
A
A
x
W
I
 
L
A
 
E
-
x
R
T
|
T
P
|
P
S
 
G
L
 
L
Y
 
E
D
 
P
E
 
H
A
 
G
I
 
F
N
 
N
L
 
F
-
 
W
-
 
G
-
 
K
M
 
L
I
 
E
Q
 
E
A
 
V
G
 
L
L
 
L
A
 
S
I
 
L
-
 
F
D
 
D
P
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
H
E
 
E
R
 
H
D
 
L
P
 
L
T
 
S
A
 
K
A
 
G
T
 
E
-
 
R
-
 
R
V
 
L
H
 
S
D
 
Y
E
 
R
S
 
A
V
 
L
E
 
Q
A
 
G
A
 
A
W
 
L
R
 
M
-
x
I
E
 
Y
V
 
F
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
P
 
E
S
 
P
R
 
R
Y
x
F
W
 
Q
D
 
V
L
 
P
Y
 
F
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
E
 
T
K
 
S
F
 
L
I
 
M
D
 
D
L
 
I
E
 
D
D
 
S
S
 
L
F
 
M
R
 
T
Q
 
K
W
 
W
R
 
R
F
 
Y
R
 
N
H
|
H
V
 
V
T
 
C
T
 
M
V
|
V
E
 
H
R
 
R
I
x
M
I
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6a4iB Crystal structure of human tdo inhibitor complex
30% identity, 85% coverage: 27:267/285 of query aligns to 1:275/309 of 6a4iB

query
sites
6a4iB
M
 
L
S
 
I
Y
|
Y
G
 
G
D
 
N
Y
|
Y
L
 
L
D
 
H
L
 
L
G
 
E
K
 
K
V
 
V
L
 
L
S
 
N
A
 
A
Q
 
Q
H
 
E
P
 
L
L
 
Q
S
 
S
P
 
E
D
 
T
-
 
K
-
 
G
-
 
N
-
 
K
-
 
I
H
 
H
N
 
D
E
 
E
M
 
H
L
 
L
F
|
F
I
 
I
I
 
I
Q
 
T
H
|
H
Q
 
Q
T
 
A
S
x
Y
E
 
E
L
 
L
W
 
W
M
 
F
K
 
K
L
 
Q
M
 
I
L
 
L
H
 
W
E
 
E
L
 
L
K
 
D
A
 
S
A
 
V
R
 
R
E
 
E
H
 
I
V
 
F
R
 
Q
L
 
N
G
 
G
E
 
H
L
 
V
P
x
R
P
 
D
A
x
E
F
 
R
K
 
N
M
 
M
L
 
L
A
 
K
-
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
R
-
 
M
-
 
H
R
 
R
V
 
V
S
 
S
R
 
V
I
 
I
F
 
L
D
 
K
Q
 
L
L
 
L
V
 
V
H
 
Q
A
 
Q
W
 
F
A
 
S
V
 
I
L
|
L
A
 
E
T
 
T
M
 
M
T
 
T
P
 
A
S
 
L
E
 
D
Y
 
F
K
 
N
S
 
D
I
 
F
R
 
R
P
 
E
F
 
Y
L
|
L
G
 
S
Q
 
P
S
x
A
S
|
S
G
|
G
F
|
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
L
Q
 
Q
Y
x
F
R
|
R
E
 
L
I
 
L
E
 
E
F
 
N
-
 
K
-
 
I
-
 
G
I
 
V
L
 
L
G
 
K
N
 
G
K
 
E
S
 
E
A
 
N
A
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
L
P
 
K
H
 
S
A
 
E
H
 
Q
R
 
E
P
 
K
E
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
E
E
 
L
L
 
V
K
 
E
V
 
A
A
x
W
I
 
L
A
 
E
-
x
R
T
|
T
P
|
P
S
 
G
L
 
L
Y
 
E
D
 
P
E
 
H
A
 
G
I
 
F
N
 
N
L
 
F
-
 
W
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
E
-
 
K
M
 
N
I
 
I
Q
 
T
A
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
E
I
 
E
D
 
E
P
 
F
K
 
Q
R
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
F
D
 
Q
P
 
K
T
 
Q
A
 
K
A
 
E
T
 
V
V
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
E
-
 
K
-
 
R
H
 
H
D
 
E
E
 
H
S
 
L
V
 
L
E
 
S
A
 
K
A
 
G
W
 
E
R
 
R
E
 
R
V
 
L
-
 
S
-
 
Y
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
M
-
 
I
-
 
Y
-
 
F
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
P
 
E
S
 
P
R
 
R
Y
 
F
W
 
Q
D
 
V
L
x
P
Y
 
F
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
E
 
T
K
 
S
F
 
L
I
 
M
D
 
D
L
 
I
E
 
D
D
 
S
S
 
L
F
 
M
R
 
T
Q
 
K
W
|
W
R
 
R
F
 
Y
R
 
N
H
|
H
V
 
V
T
 
C
T
 
M
V
|
V
E
 
H
R
 
R
I
 
M
I
 
L
G
 
G
F
 
-
Q
 
-
P
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
-
E
 
S
G
 
G
V
 
Y
G
 
H
Y
 
Y
L
|
L
R
 
R

6a4iA Crystal structure of human tdo inhibitor complex
29% identity, 84% coverage: 29:267/285 of query aligns to 3:293/322 of 6a4iA

query
sites
6a4iA
Y
|
Y
G
 
G
D
 
N
Y
|
Y
L
 
L
D
 
H
L
 
L
G
 
E
K
 
K
V
 
V
L
 
L
S
 
N
A
 
A
Q
 
Q
H
 
E
P
 
L
L
 
Q
S
 
S
P
 
E
D
 
T
-
 
K
-
 
G
-
 
N
-
 
K
-
 
I
H
 
H
N
 
D
E
 
E
M
 
H
L
 
L
F
|
F
I
 
I
I
 
I
Q
 
T
H
|
H
Q
 
Q
T
 
A
S
x
Y
E
 
E
L
 
L
W
 
W
M
 
F
K
 
K
L
 
Q
M
 
I
L
 
L
H
 
W
E
 
E
L
 
L
K
 
D
A
 
S
A
 
V
R
 
R
E
 
E
H
 
I
V
 
F
R
 
Q
L
 
N
G
 
G
E
 
H
L
 
V
P
x
R
P
 
D
A
 
E
F
 
R
K
 
N
M
 
M
L
 
L
A
 
K
-
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
R
-
 
M
-
 
H
R
 
R
V
 
V
S
 
S
R
 
V
I
 
I
F
 
L
D
 
K
Q
 
L
L
 
L
V
 
V
H
 
Q
A
 
Q
W
 
F
A
 
S
V
 
I
L
|
L
A
 
E
T
 
T
M
 
M
T
 
T
P
 
A
S
 
L
E
 
D
Y
x
F
K
 
N
S
 
D
I
 
F
R
 
R
P
 
E
F
 
Y
L
 
L
G
 
S
Q
 
P
S
x
A
S
|
S
G
|
G
F
|
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
L
Q
 
Q
Y
x
F
R
 
R
E
 
L
I
 
L
E
 
E
F
 
N
I
 
K
L
 
I
G
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
Q
-
 
N
-
 
M
-
 
N
-
 
F
-
 
K
N
 
G
K
 
E
S
 
E
A
 
N
A
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
L
P
 
K
H
 
S
A
 
E
H
 
Q
R
 
E
P
 
K
E
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
E
E
 
L
L
 
V
K
 
E
V
 
A
A
x
W
I
 
L
A
 
E
-
x
R
T
|
T
P
|
P
S
 
G
L
 
L
Y
 
E
D
 
P
E
 
H
A
 
G
I
 
F
N
 
N
L
 
F
-
 
W
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
E
-
 
K
M
 
N
I
 
I
Q
 
T
A
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
E
I
 
E
D
 
E
P
 
F
K
 
I
R
 
R
A
 
I
E
 
Q
R
 
A
D
 
E
P
 
E
T
 
K
A
 
E
A
 
E
T
 
Q
V
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
F
-
 
Q
-
 
K
-
 
Q
-
 
K
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
E
-
 
K
-
 
R
H
 
H
D
 
E
E
 
H
S
 
L
V
 
L
E
 
S
A
 
K
A
 
G
W
 
E
R
 
R
E
 
R
V
 
L
-
 
S
-
 
Y
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
M
-
x
I
-
 
Y
-
 
F
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
P
 
E
S
 
P
R
 
R
Y
x
F
W
 
Q
D
 
V
L
x
P
Y
 
F
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
E
 
T
K
 
S
F
 
L
I
 
M
D
 
D
L
 
I
E
 
D
D
 
S
S
 
L
F
 
M
R
 
T
Q
 
K
W
|
W
R
 
R
F
 
Y
R
 
N
H
|
H
V
 
V
T
 
C
T
x
M
V
|
V
E
 
H
R
 
R
I
x
M
I
 
L
G
 
G
F
 
-
Q
 
-
P
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
S
G
 
G
T
 
S
E
 
S
G
 
G
V
 
Y
G
 
H
Y
 
Y
L
|
L
R
 
R

8qv7B Crystal structure of human tdo with alpha-methyl-l-tryptophan
30% identity, 79% coverage: 27:252/285 of query aligns to 1:272/310 of 8qv7B

query
sites
8qv7B
M
 
L
S
 
I
Y
 
Y
G
 
G
D
 
N
Y
 
Y
L
 
L
D
 
H
L
 
L
G
 
E
K
 
K
V
 
V
L
 
L
S
 
N
A
 
A
Q
 
Q
H
 
E
P
 
L
L
 
Q
S
 
S
P
 
E
D
 
T
-
 
K
-
 
G
-
 
N
-
 
K
-
 
I
H
 
H
N
 
D
E
 
E
M
 
H
L
 
L
F
 
F
I
 
I
I
 
I
Q
 
T
H
 
H
Q
 
Q
T
 
A
S
 
Y
E
 
E
L
 
L
W
 
W
M
 
F
K
 
K
L
 
Q
M
 
I
L
 
L
H
 
W
E
 
E
L
 
L
K
 
D
A
 
S
A
 
V
R
 
R
E
 
E
H
 
I
V
 
F
R
 
Q
L
 
N
G
 
G
E
 
H
L
 
V
P
x
R
P
 
D
A
x
E
F
 
R
K
 
N
M
 
M
L
 
L
A
 
K
-
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
R
-
 
M
-
 
H
R
 
R
V
 
V
S
 
S
R
 
V
I
 
I
F
 
L
D
 
K
Q
 
L
L
 
L
V
 
V
H
 
Q
A
 
Q
W
 
F
A
 
S
V
 
I
L
 
L
A
 
E
T
 
T
M
 
M
T
 
T
P
 
A
S
 
L
E
 
D
Y
 
F
K
 
N
S
 
D
I
 
F
R
 
R
P
 
E
F
 
Y
L
 
L
G
 
S
Q
 
P
S
 
A
S
 
S
G
 
G
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
L
Q
 
Q
Y
 
F
R
 
R
E
 
L
I
 
L
E
 
E
F
 
N
I
 
K
L
 
I
G
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
Q
-
 
F
-
 
K
N
 
G
K
 
E
S
 
E
A
 
N
A
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
L
P
 
K
H
 
S
A
 
E
H
 
Q
R
 
E
P
 
K
E
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
E
E
 
L
L
 
V
K
 
E
V
 
A
A
x
W
I
 
L
A
 
E
-
x
R
T
|
T
P
|
P
S
 
G
L
 
L
Y
 
E
D
 
P
E
 
H
A
 
G
I
 
F
N
 
N
L
 
F
-
 
W
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
E
-
 
K
M
 
N
I
 
I
Q
 
T
A
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
E
I
 
E
D
 
E
P
 
F
K
 
I
R
 
R
-
 
Q
-
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
F
D
 
Q
P
 
K
T
 
Q
A
 
K
A
 
E
T
 
V
V
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
E
-
 
K
-
 
R
H
 
H
D
 
E
E
 
H
S
 
L
V
 
L
E
 
S
A
 
K
A
 
G
W
 
E
R
 
R
E
 
R
V
 
L
-
 
S
-
 
Y
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
M
-
 
I
-
 
Y
-
 
F
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
P
 
E
S
 
P
R
 
R
Y
x
F
W
 
Q
D
 
V
L
 
P
Y
 
F
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
E
 
T
K
 
S
F
 
L
I
 
M
D
 
D
L
 
I
E
 
D
D
 
S
S
 
L
F
 
M
R
 
T
Q
 
K
W
 
W
R
 
R
F
 
Y
R
 
N
H
 
H
V
 
V
T
 
C
T
 
M
V
 
V
E
 
H
R
 
R
I
 
M
I
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7lu7CCC Tryptophan 2,3-dioxygenase
28% identity, 80% coverage: 26:252/285 of query aligns to 1:279/323 of 7lu7CCC

query
sites
7lu7CCC
S
 
G
M
 
L
S
 
I
Y
|
Y
G
 
G
D
 
N
Y
|
Y
L
 
L
D
 
H
L
 
L
G
 
E
K
 
K
V
 
V
L
 
L
S
 
N
A
 
A
Q
 
Q
H
 
E
P
 
L
L
 
Q
S
 
S
P
 
E
D
 
T
-
 
K
-
 
G
-
 
N
-
 
K
-
 
I
H
 
H
N
 
D
E
 
E
M
 
H
L
 
L
F
|
F
I
 
I
I
 
I
Q
 
T
H
|
H
Q
 
Q
T
 
A
S
x
Y
E
 
E
L
 
L
W
 
W
M
 
F
K
 
K
L
 
Q
M
 
I
L
 
L
H
 
W
E
 
E
L
 
L
K
 
D
A
 
S
A
 
V
R
 
R
E
 
E
H
 
I
V
 
F
R
 
Q
L
 
N
G
 
G
E
 
H
L
 
V
P
x
R
P
 
D
A
x
E
F
 
R
K
 
N
M
 
M
L
 
L
A
 
K
-
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
R
-
 
M
-
 
H
R
 
R
V
 
V
S
 
S
R
 
V
I
 
I
F
 
L
D
 
K
Q
 
L
L
 
L
V
 
V
H
 
Q
A
 
Q
W
 
F
A
 
S
V
 
I
L
 
L
A
 
E
T
 
T
M
 
M
T
 
T
P
 
A
S
 
L
E
 
D