SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF4747 FitnessBrowser__WCS417:GFF4747 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1dfoB Crystal structure at 2.4 angstrom resolution of e. Coli serine hydroxymethyltransferase in complex with glycine and 5-formyl tetrahydrofolate (see paper)
74% identity, 100% coverage: 1:415/417 of query aligns to 1:416/417 of 1dfoB

query
sites
1dfoB
M
 
M
F
 
L
S
 
K
R
 
R
D
 
E
L
 
M
T
 
N
I
 
I
A
 
A
K
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
E
L
 
L
F
 
W
A
 
Q
A
 
A
M
 
M
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
A
 
K
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
E
 
E
E
 
E
H
 
H
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
P
 
P
A
 
R
V
 
V
M
 
M
E
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
Q
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
K
R
 
R
Y
|
Y
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
A
x
S
G
|
G
S
|
S
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
S
 
F
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
L
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
G
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
N
L
|
L
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
|
G
H
|
H
L
|
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
P
V
 
V
S
 
N
S
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y
N
 
N
A
 
I
V
 
V
Q
 
P
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
A
N
 
T
G
 
G
L
 
H
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
A
E
 
D
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
Q
A
 
A
V
 
K
E
 
E
H
 
H
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
I
 
I
V
 
I
A
 
G
G
 
G
F
|
F
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
Q
 
G
I
 
V
L
 
V
D
 
D
F
 
W
P
 
A
R
 
K
F
 
M
R
 
R
A
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
S
V
 
I
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
V
 
V
D
|
D
M
 
M
A
|
A
H
|
H
V
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
F
 
H
A
 
A
D
 
H
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
A
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
N
 
G
A
x
S
-
 
E
D
x
E
I
 
L
E
 
Y
K
 
K
K
 
K
L
 
L
N
 
N
S
 
S
A
 
A
V
 
V
F
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
G
Q
 
Q
G
|
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
M
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
V
C
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
M
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
F
 
F
K
 
K
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
A
K
 
K
N
 
N
A
 
A
Q
 
K
T
 
A
M
 
M
A
 
V
S
 
E
V
 
V
F
 
F
I
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
D
 
K
V
 
V
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
E
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
V
S
 
D
L
 
L
I
 
V
K
 
D
Q
 
K
D
 
N
I
 
L
S
 
T
G
 
G
K
 
K
D
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
R
A
 
A
F
 
N
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
|
N
S
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
N
D
 
D
P
 
P
R
 
K
S
|
S
P
|
P
F
|
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
I
R
|
R
F
 
V
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
I
T
 
T
T
 
R
R
 
R
G
 
G
F
 
F
K
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
E
C
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
W
 
W
I
 
M
C
 
C
D
 
D
I
 
V
L
 
L
A
 
D
D
 
S
L
 
I
N
 
N
N
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
E
A
 
R
V
 
I
R
 
K
E
 
G
K
 
K
V
 
V
K
 
L
A
 
D
I
 
I
C
 
C
K
 
A
K
 
R
L
 
Y
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y

P0A825 Serine hydroxymethyltransferase; SHMT; Serine methylase; EC 2.1.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 8 papers)
74% identity, 100% coverage: 1:415/417 of query aligns to 1:416/417 of P0A825

query
sites
P0A825
M
 
M
F
 
L
S
 
K
R
 
R
D
 
E
L
 
M
T
 
N
I
 
I
A
 
A
K
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
E
L
 
L
F
 
W
A
 
Q
A
 
A
M
 
M
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
A
 
K
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
E
 
E
E
 
E
H
 
H
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
P
 
P
A
 
R
V
 
V
M
 
M
E
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
Q
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
|
K
Y
|
Y
A
 
A
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
|
K
R
 
R
Y
 
Y
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
|
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
A
 
S
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
S
 
F
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
L
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
G
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
N
L
 
L
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
P
V
 
V
S
 
N
S
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y
N
 
N
A
 
I
V
 
V
Q
 
P
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
A
N
 
T
G
 
G
L
 
H
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
A
E
 
D
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
Q
A
 
A
V
 
K
E
 
E
H
 
H
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
I
 
I
V
 
I
A
 
G
G
 
G
F
 
F
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
Q
 
G
I
 
V
L
 
V
D
 
D
F
 
W
P
 
A
R
 
K
F
 
M
R
 
R
A
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
S
V
 
I
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
H
 
H
V
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
P
|
P
N
 
N
P
|
P
V
 
V
P
|
P
F
 
H
A
 
A
D
 
H
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
 
T
T
 
T
H
|
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
A
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
A
R
x
K
A
 
G
N
 
G
A
 
S
-
 
E
D
 
E
I
 
L
E
 
Y
K
|
K
K
 
K
L
 
L
N
 
N
S
 
S
A
 
A
V
 
V
F
 
F
P
|
P
G
 
G
A
 
G
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
|
P
L
 
L
E
 
M
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
V
C
 
A
F
x
L
K
|
K
E
 
E
A
 
A
L
 
M
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
F
 
F
K
|
K
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
A
K
|
K
N
 
N
A
 
A
Q
 
K
T
 
A
M
 
M
A
 
V
S
 
E
V
 
V
F
 
F
I
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
D
 
K
V
 
V
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
E
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
V
S
 
D
L
 
L
I
 
V
K
 
D
Q
 
K
D
 
N
I
 
L
S
 
T
G
 
G
K
|
K
D
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
R
A
 
A
F
 
N
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
|
K
N
 
N
S
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
N
D
 
D
P
 
P
R
x
K
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
I
R
|
R
F
 
V
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
I
T
 
T
T
 
R
R
|
R
G
 
G
F
 
F
K
|
K
E
 
E
A
 
A
E
 
E
C
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
W
 
W
I
 
M
C
 
C
D
 
D
I
 
V
L
 
L
A
 
D
D
 
S
L
 
I
N
 
N
N
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
E
A
 
R
V
 
I
R
 
K
E
 
G
K
 
K
V
 
V
K
 
L
A
 
D
I
 
I
C
 
C
K
 
A
K
 
R
L
 
Y
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y

1eqbA X-ray crystal structure at 2.7 angstroms resolution of ternary complex between the y65f mutant of e-coli serine hydroxymethyltransferase, glycine and 5-formyl tetrahydrofolate (see paper)
74% identity, 99% coverage: 2:415/417 of query aligns to 1:415/416 of 1eqbA

query
sites
1eqbA
F
 
L
S
 
K
R
 
R
D
 
E
L
 
M
T
 
N
I
 
I
A
 
A
K
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
E
L
 
L
F
 
W
A
 
Q
A
 
A
M
 
M
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
A
 
K
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
E
 
E
E
 
E
H
 
H
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
P
 
P
A
 
R
V
 
V
M
 
M
E
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
Q
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
K
R
 
R
Y
|
Y
Y
x
F
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
A
x
S
G
|
G
S
|
S
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
S
 
F
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
L
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
G
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
N
L
|
L
A
 
A
H
 
H
G
|
G
G
|
G
H
|
H
L
|
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
P
V
 
V
S
 
N
S
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y
N
 
N
A
 
I
V
 
V
Q
 
P
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
A
N
 
T
G
 
G
L
 
H
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
A
E
 
D
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
Q
A
 
A
V
 
K
E
 
E
H
 
H
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
I
 
I
V
 
I
A
 
G
G
 
G
F
|
F
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
Q
 
G
I
 
V
L
 
V
D
 
D
F
 
W
P
 
A
R
 
K
F
 
M
R
 
R
A
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
S
V
 
I
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
V
 
V
D
|
D
M
 
M
A
 
A
H
|
H
V
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
F
 
H
A
 
A
D
 
H
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
|
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
A
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
N
 
G
A
 
S
-
 
E
D
 
E
I
 
L
E
 
Y
K
 
K
K
 
K
L
 
L
N
 
N
S
 
S
A
 
A
V
 
V
F
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
G
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
M
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
V
C
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
M
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
F
 
F
K
 
K
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
A
K
 
K
N
 
N
A
 
A
Q
 
K
T
 
A
M
 
M
A
 
V
S
 
E
V
 
V
F
 
F
I
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
D
 
K
V
 
V
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
E
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
V
S
 
D
L
 
L
I
 
V
K
 
D
Q
 
K
D
 
N
I
 
L
S
 
T
G
 
G
K
 
K
D
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
R
A
 
A
F
 
N
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
|
N
S
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
N
D
 
D
P
 
P
R
 
K
S
|
S
P
|
P
F
|
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
I
R
|
R
F
 
V
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
I
T
 
T
T
 
R
R
 
R
G
 
G
F
 
F
K
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
E
C
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
W
 
W
I
 
M
C
 
C
D
 
D
I
 
V
L
 
L
A
 
D
D
 
S
L
 
I
N
 
N
N
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
E
A
 
R
V
 
I
R
 
K
E
 
G
K
 
K
V
 
V
K
 
L
A
 
D
I
 
I
C
 
C
K
 
A
K
 
R
L
 
Y
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y

4n0wA X-ray crystal structure of a serine hydroxymethyltransferase from burkholderia cenocepacia with covalently attached pyridoxal phosphate
65% identity, 100% coverage: 1:415/417 of query aligns to 2:415/416 of 4n0wA

query
sites
4n0wA
M
 
M
F
 
F
S
 
D
R
 
R
-
 
A
D
 
Q
L
 
S
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
N
Y
 
V
D
 
D
A
 
P
D
 
E
L
 
I
F
 
F
A
 
A
A
 
A
M
 
I
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
A
 
N
V
 
R
R
 
R
Q
 
Q
E
 
E
E
 
D
H
 
H
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
P
 
P
A
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
A
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
Q
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
V
K
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
E
Y
 
A
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
N
A
x
S
G
|
G
S
|
S
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
S
 
Q
A
 
G
V
 
V
Y
 
F
L
 
F
A
 
A
L
 
M
L
 
L
Q
 
K
G
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
I
L
 
M
G
 
G
M
 
M
S
 
S
L
 
L
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
P
V
 
V
S
 
N
S
 
M
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
W
Y
 
F
N
 
N
A
 
V
V
 
V
Q
 
S
Y
 
Y
G
 
G
I
 
L
D
 
N
A
 
E
N
 
N
G
 
E
L
 
D
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
E
 
A
V
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
N
E
 
E
H
 
H
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
A
S
 
S
A
 
A
Y
 
F
S
 
A
Q
 
L
I
 
K
L
 
I
D
 
D
F
 
F
P
 
E
R
 
R
F
 
L
R
 
A
A
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
K
K
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
F
 
M
V
 
V
D
|
D
M
 
M
A
|
A
H
|
H
V
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
F
 
H
A
 
A
D
 
D
V
 
F
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
T
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
V
I
 
I
L
 
L
A
 
M
R
 
K
A
 
-
N
 
-
A
 
A
D
 
E
I
 
Y
E
 
E
K
 
K
K
 
P
L
 
I
N
 
N
S
 
S
A
 
A
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
M
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
V
C
 
A
F
 
F
K
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
S
P
 
P
E
 
E
F
 
F
K
 
K
T
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
K
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
R
T
 
V
M
 
L
A
 
A
S
 
E
V
 
T
F
 
L
I
 
V
E
 
K
R
 
R
G
 
G
F
 
L
D
 
R
V
 
I
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
R
T
 
T
E
 
E
N
 
S
H
 
H
L
 
V
F
 
M
L
 
L
L
 
V
S
 
D
L
 
L
I
 
R
K
 
A
Q
 
K
D
 
H
I
 
I
S
 
T
G
 
G
K
 
K
D
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
A
A
 
A
F
 
H
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
 
N
S
 
A
V
 
I
P
 
P
N
 
N
D
 
D
P
 
P
R
 
E
S
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
I
R
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
S
P
 
P
A
 
A
V
 
M
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
F
 
F
K
 
G
E
 
P
A
 
A
E
 
E
C
 
A
K
 
E
E
 
Q
L
 
V
A
 
G
G
 
N
W
 
L
I
 
I
C
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
L
A
 
E
D
 
N
L
 
P
N
 
E
N
 
D
E
 
A
A
 
A
V
 
T
I
 
I
D
 
E
A
 
R
V
 
V
R
 
R
E
 
A
K
 
Q
V
 
V
K
 
A
A
 
E
I
 
L
C
 
T
K
 
K
K
 
R
L
 
F
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y

4otlA X-ray crystal structure of serine hydroxymethyl transferase from burkholderia cenocepacia bound to plp and glycine
66% identity, 98% coverage: 7:415/417 of query aligns to 2:408/409 of 4otlA

query
sites
4otlA
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
N
Y
 
V
D
 
D
A
 
P
D
 
E
L
 
I
F
 
F
A
 
A
A
 
A
M
 
I
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
A
 
N
V
 
R
R
 
R
Q
 
Q
E
 
E
E
 
D
H
 
H
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
P
 
P
A
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
A
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
Q
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
V
K
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
E
Y
 
A
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
N
A
x
S
G
|
G
S
|
S
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
S
 
Q
A
 
G
V
 
V
Y
 
F
L
 
F
A
 
A
L
 
M
L
 
L
Q
 
K
G
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
I
L
 
M
G
 
G
M
 
M
S
 
S
L
 
L
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
P
V
 
V
S
 
N
S
 
M
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
W
Y
 
F
N
 
N
A
 
V
V
 
V
Q
 
S
Y
 
Y
G
 
G
I
 
L
D
 
N
A
 
E
N
 
N
G
 
E
L
 
D
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
E
 
A
V
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
N
E
 
E
H
 
H
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
F
S
 
A
Q
 
L
I
 
K
L
 
I
D
 
D
F
 
F
P
 
E
R
 
R
F
 
L
R
 
A
A
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
K
K
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
F
 
M
V
 
V
D
|
D
M
 
M
A
|
A
H
|
H
V
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
F
 
H
A
 
A
D
 
D
V
 
F
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
T
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
V
I
 
I
L
 
L
A
 
M
R
 
K
A
 
-
N
 
-
A
 
A
D
 
E
I
 
Y
E
 
E
K
 
K
K
 
P
L
 
I
N
 
N
S
 
S
A
 
A
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
M
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
V
C
 
A
F
 
F
K
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
S
P
 
P
E
 
E
F
 
F
K
 
K
T
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
K
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
R
T
 
V
M
 
L
A
 
A
S
 
E
V
 
T
F
 
L
I
 
V
E
 
K
R
 
R
G
 
G
F
 
L
D
 
R
V
 
I
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
R
T
 
T
E
 
E
N
 
S
H
 
H
L
 
V
F
 
M
L
 
L
L
 
V
S
 
D
L
 
L
I
 
R
K
 
A
Q
 
K
D
 
H
I
 
I
S
 
T
G
 
G
K
 
K
D
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
A
A
 
A
F
 
H
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
 
N
S
 
A
V
 
I
P
 
P
N
 
N
D
 
D
P
 
P
R
 
E
S
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
I
R
|
R
F
 
L
G
 
G
T
 
S
P
 
P
A
 
A
V
 
M
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
F
 
F
K
 
G
E
 
P
A
 
A
E
 
E
C
 
A
K
 
E
E
 
Q
L
 
V
A
 
G
G
 
N
W
 
L
I
 
I
C
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
L
A
 
E
D
 
N
L
 
P
N
 
E
N
 
D
E
 
A
A
 
A
V
 
T
I
 
I
D
 
E
A
 
R
V
 
V
R
 
R
E
 
A
K
 
Q
V
 
V
K
 
A
A
 
E
I
 
L
C
 
T
K
 
K
K
 
R
L
 
F
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y

4ot8A X-ray crystal structure of serine hydroxymethyl transferase from burkholderia cenocepacia bound to plp and serine
66% identity, 98% coverage: 7:415/417 of query aligns to 7:413/414 of 4ot8A

query
sites
4ot8A
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
N
Y
 
V
D
 
D
A
 
P
D
 
E
L
 
I
F
 
F
A
 
A
A
 
A
M
 
I
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
A
 
N
V
 
R
R
 
R
Q
 
Q
E
 
E
E
 
D
H
 
H
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
P
 
P
A
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
A
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
Q
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
V
K
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
E
Y
 
A
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
N
A
x
S
G
|
G
S
|
S
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
S
 
Q
A
 
G
V
 
V
Y
 
F
L
 
F
A
 
A
L
 
M
L
 
L
Q
 
K
G
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
I
L
 
M
G
 
G
M
 
M
S
 
S
L
 
L
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
P
V
 
V
S
 
N
S
 
M
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
W
Y
 
F
N
 
N
A
 
V
V
 
V
Q
 
S
Y
 
Y
G
 
G
I
 
L
D
 
N
A
 
E
N
 
N
G
 
E
L
 
D
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
E
 
A
V
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
N
E
 
E
H
 
H
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
A
S
 
S
A
 
A
Y
 
F
S
 
A
Q
 
L
I
 
K
L
 
I
D
 
D
F
 
F
P
 
E
R
 
R
F
 
L
R
 
A
A
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
K
K
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
F
 
M
V
 
V
D
|
D
M
 
M
A
|
A
H
|
H
V
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
F
 
H
A
 
A
D
 
D
V
 
F
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
T
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
V
I
 
I
L
 
L
A
 
M
R
 
K
A
 
-
N
 
-
A
 
A
D
 
E
I
 
Y
E
 
E
K
 
K
K
 
P
L
 
I
N
 
N
S
 
S
A
 
A
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
M
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
V
C
 
A
F
 
F
K
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
S
P
 
P
E
 
E
F
 
F
K
 
K
T
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
K
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
R
T
 
V
M
 
L
A
 
A
S
 
E
V
 
T
F
 
L
I
 
V
E
 
K
R
 
R
G
 
G
F
 
L
D
 
R
V
 
I
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
R
T
 
T
E
 
E
N
 
S
H
 
H
L
 
V
F
 
M
L
 
L
L
 
V
S
 
D
L
 
L
I
 
R
K
 
A
Q
 
K
D
 
H
I
 
I
S
 
T
G
 
G
K
 
K
D
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
A
A
 
A
F
 
H
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
 
N
S
 
A
V
 
I
P
 
P
N
 
N
D
 
D
P
 
P
R
 
E
S
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
I
R
|
R
F
 
L
G
 
G
T
 
S
P
 
P
A
 
A
V
 
M
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
F
 
F
K
 
G
E
 
P
A
 
A
E
 
E
C
 
A
K
 
E
E
 
Q
L
 
V
A
 
G
G
 
N
W
 
L
I
 
I
C
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
L
A
 
E
D
 
N
L
 
P
N
 
E
N
 
D
E
 
A
A
 
A
V
 
T
I
 
I
D
 
E
A
 
R
V
 
V
R
 
R
E
 
A
K
 
Q
V
 
V
K
 
A
A
 
E
I
 
L
C
 
T
K
 
K
K
 
R
L
 
F
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y

6ymfA Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase from aphanothece halophytica in the plp-serine external aldimine state (see paper)
59% identity, 98% coverage: 8:415/417 of query aligns to 7:414/418 of 6ymfA

query
sites
6ymfA
I
 
L
A
 
L
K
 
Q
Y
 
T
D
 
D
A
 
P
D
 
T
L
 
I
F
 
S
A
 
G
A
 
M
M
 
M
E
 
Q
Q
 
K
E
 
E
A
 
L
V
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
E
 
R
E
 
E
H
 
H
I
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
F
T
 
T
S
 
S
P
 
P
A
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
A
A
 
T
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
Y
 
L
P
 
P
G
 
K
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
V
 
E
V
 
I
E
 
E
Q
 
Q
L
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
A
Y
 
S
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
A
x
S
G
|
G
S
x
A
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
S
 
F
A
 
A
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
T
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
G
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
K
I
 
I
L
 
M
G
 
G
M
 
M
S
 
D
L
 
L
A
 
S
H
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
P
V
 
A
S
 
N
S
 
V
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
W
Y
 
F
N
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
H
Y
 
Y
G
 
G
I
 
V
D
 
S
A
 
Q
N
 
E
G
 
T
-
 
E
L
 
Q
I
 
L
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
E
 
H
V
 
I
E
 
L
R
 
E
L
 
V
A
 
A
V
 
R
E
 
Q
H
 
E
K
 
R
P
 
P
K
 
K
M
 
L
I
 
I
V
 
I
A
 
C
G
 
G
F
 
Y
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
Q
 
R
I
 
I
L
 
I
D
 
N
F
 
F
P
 
E
R
 
K
F
 
F
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
F
 
L
V
 
A
D
|
D
M
 
I
A
|
A
H
|
H
V
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
S
G
 
G
V
 
H
Y
 
H
P
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
F
 
H
A
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
T
R
 
R
A
 
-
N
 
D
A
 
P
D
 
E
I
 
L
E
 
G
K
 
K
K
 
K
L
 
F
N
 
N
S
 
K
A
 
S
V
 
V
F
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
T
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
E
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
V
C
 
A
F
 
F
K
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
F
 
F
K
 
K
T
 
A
Y
 
Y
Q
 
S
Q
 
G
Q
 
Q
V
 
V
V
 
I
K
 
A
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
M
 
M
A
 
A
S
 
Q
V
 
Q
F
 
L
I
 
Q
E
 
N
R
 
R
G
 
G
F
 
F
D
 
K
V
 
I
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
E
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
F
 
M
L
 
L
L
 
V
S
 
D
L
 
L
I
 
R
K
 
S
Q
 
V
D
 
N
I
 
L
S
 
T
G
 
G
K
 
K
D
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
Q
A
 
L
L
 
V
G
 
S
K
 
D
A
 
V
F
 
N
I
 
I
T
 
T
V
 
A
N
 
N
K
 
K
N
 
N
S
 
T
V
 
V
P
 
P
N
 
F
D
 
D
P
 
P
R
 
E
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
|
R
F
 
L
G
 
G
T
 
S
P
 
P
A
 
A
V
 
M
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
F
 
L
K
 
G
E
 
T
A
 
E
E
 
D
C
 
F
K
 
A
E
 
E
L
 
I
A
 
A
G
 
N
W
 
I
I
 
I
C
 
A
D
 
D
I
 
R
L
 
L
A
 
Q
D
 
N
L
 
P
N
 
E
N
 
D
E
 
E
A
 
Q
V
 
V
I
 
K
D
 
Q
A
 
A
V
 
C
R
 
V
E
 
Q
K
 
R
V
 
V
K
 
A
A
 
A
I
 
L
C
 
C
K
 
E
K
 
R
L
 
F
P
 
P
V
 
L
Y
 
Y

6ymdA Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase from aphanothece halophytica in the covalent complex with malonate (see paper)
59% identity, 98% coverage: 8:415/417 of query aligns to 7:414/420 of 6ymdA

query
sites
6ymdA
I
 
L
A
 
L
K
 
Q
Y
 
T
D
 
D
A
 
P
D
 
T
L
 
I
F
 
S
A
 
G
A
 
M
M
 
M
E
 
Q
Q
 
K
E
 
E
A
 
L
V
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
E
 
R
E
 
E
H
 
H
I
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
F
T
 
T
S
 
S
P
 
P
A
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
A
A
 
T
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
Y
 
L
P
 
P
G
 
K
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
V
 
E
V
 
I
E
 
E
Q
 
Q
L
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
A
Y
 
S
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
A
x
S
G
|
G
S
x
A
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
S
 
F
A
 
A
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
T
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
G
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
K
I
 
I
L
 
M
G
 
G
M
 
M
S
 
D
L
 
L
A
 
S
H
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
P
V
 
A
S
 
N
S
 
V
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
W
Y
 
F
N
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
H
Y
 
Y
G
 
G
I
 
V
D
 
S
A
 
Q
N
 
E
G
 
T
-
 
E
L
 
Q
I
 
L
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
E
 
H
V
 
I
E
 
L
R
 
E
L
 
V
A
 
A
V
 
R
E
 
Q
H
 
E
K
 
R
P
 
P
K
 
K
M
 
L
I
 
I
V
 
I
A
 
C
G
 
G
F
x
Y
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
Q
 
R
I
 
I
L
 
I
D
 
N
F
 
F
P
 
E
R
 
K
F
 
F
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
F
 
L
V
 
A
D
|
D
M
 
I
A
|
A
H
|
H
V
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
S
G
 
G
V
 
H
Y
 
H
P
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
F
 
H
A
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
T
R
 
R
A
 
-
N
 
D
A
 
P
D
 
E
I
 
L
E
 
G
K
 
K
K
 
K
L
 
F
N
 
N
S
 
K
A
 
S
V
 
V
F
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
T
Q
 
Q
G
 
G
G
|
G
P
 
P
L
 
L
E
 
E
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
V
C
 
A
F
 
F
K
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
F
 
F
K
 
K
T
 
A
Y
 
Y
Q
 
S
Q
 
G
Q
 
Q
V
 
V
V
 
I
K
 
A
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
M
 
M
A
 
A
S
 
Q
V
 
Q
F
 
L
I
 
Q
E
 
N
R
 
R
G
 
G
F
 
F
D
 
K
V
 
I
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
E
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
F
 
M
L
 
L
L
 
V
S
 
D
L
 
L
I
 
R
K
 
S
Q
 
V
D
 
N
I
 
L
S
 
T
G
 
G
K
 
K
D
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
Q
A
 
L
L
 
V
G
 
S
K
 
D
A
 
V
F
 
N
I
 
I
T
 
T
V
 
A
N
 
N
K
 
K
N
 
N
S
 
T
V
 
V
P
 
P
N
 
F
D
 
D
P
 
P
R
 
E
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
|
R
F
 
L
G
 
G
T
 
S
P
 
P
A
 
A
V
 
M
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
F
 
L
K
 
G
E
 
T
A
 
E
E
 
D
C
 
F
K
 
A
E
 
E
L
 
I
A
 
A
G
 
N
W
 
I
I
 
I
C
 
A
D
 
D
I
 
R
L
 
L
A
 
Q
D
 
N
L
 
P
N
 
E
N
 
D
E
 
E
A
 
Q
V
 
V
I
 
K
D
 
Q
A
 
A
V
 
C
R
 
V
E
 
Q
K
 
R
V
 
V
K
 
A
A
 
A
I
 
L
C
 
C
K
 
E
K
 
R
L
 
F
P
 
P
V
 
L
Y
 
Y

1kl2A Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase complexed with glycine and 5-formyl tetrahydrofolate (see paper)
60% identity, 96% coverage: 8:409/417 of query aligns to 4:404/405 of 1kl2A

query
sites
1kl2A
I
 
L
A
 
P
K
 
Q
Y
 
Q
D
 
D
A
 
P
D
 
Q
L
 
V
F
 
F
A
 
A
A
 
A
M
 
I
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
A
 
R
V
 
K
R
 
R
Q
 
Q
E
 
H
E
 
A
H
 
K
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
F
T
 
V
S
 
S
P
 
R
A
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
|
Y
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
R
D
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
E
Y
 
H
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
A
x
S
G
|
G
S
x
A
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
S
 
M
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
L
 
F
A
 
T
L
 
V
L
 
L
Q
 
E
G
 
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
N
L
 
L
A
 
S
H
 
H
G
 
G
G
|
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
P
V
 
V
S
 
N
S
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
V
L
 
Q
Y
 
Y
N
 
N
A
 
F
V
 
V
Q
 
A
Y
 
Y
G
 
G
I
 
V
D
 
D
A
 
P
-
 
E
N
 
T
G
 
H
L
 
V
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
E
 
D
V
 
V
E
 
R
R
 
E
L
 
K
A
 
A
V
 
R
E
 
L
H
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
M
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
A
F
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
Q
 
R
I
 
I
L
 
I
D
 
D
F
 
F
P
 
A
R
 
K
F
 
F
R
 
R
A
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
F
 
M
V
 
V
D
|
D
M
 
M
A
|
A
H
|
H
V
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
H
P
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
A
 
A
D
 
H
V
 
F
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
|
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
L
A
 
C
R
 
Q
A
 
E
N
 
Q
A
 
-
D
 
-
I
 
F
E
 
A
K
 
K
K
 
Q
L
 
I
N
 
D
S
 
K
A
 
A
V
 
I
F
|
F
P
 
P
G
 
G
A
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
M
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
V
C
 
A
F
 
F
K
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
P
 
D
E
 
D
F
 
F
K
 
K
T
 
A
Y
 
Y
Q
 
A
Q
 
K
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
K
 
D
N
 
N
A
 
A
Q
 
K
T
 
R
M
 
L
A
 
A
S
 
S
V
 
A
F
 
L
I
 
Q
E
 
N
R
 
E
G
 
G
F
 
F
D
 
T
V
 
L
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
E
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
F
 
L
L
 
L
L
 
V
S
 
D
L
 
L
I
 
R
K
 
P
Q
 
Q
D
 
Q
I
 
L
S
 
T
G
 
G
K
 
K
D
 
T
A
 
A
D
 
E
A
 
K
A
 
V
L
 
L
G
 
D
K
 
E
A
 
V
F
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
|
N
S
 
T
V
 
I
P
 
P
N
 
Y
D
 
D
P
 
P
R
 
E
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
I
R
|
R
F
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
A
A
 
A
V
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
F
 
F
K
 
G
E
 
L
A
 
E
E
 
E
C
 
M
K
 
D
E
 
E
L
 
I
A
 
A
G
 
A
W
 
I
I
 
I
C
 
G
D
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
K
D
 
N
L
 
V
N
 
G
N
 
S
E
 
E
A
 
Q
V
 
A
I
 
L
D
 
E
A
 
E
V
 
A
R
 
R
E
 
Q
K
 
R
V
 
V
K
 
A
A
 
A
I
 
L
C
 
T

1kl1A Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase complexed with glycine (see paper)
60% identity, 96% coverage: 8:409/417 of query aligns to 4:404/405 of 1kl1A

query
sites
1kl1A
I
 
L
A
 
P
K
 
Q
Y
 
Q
D
 
D
A
 
P
D
 
Q
L
 
V
F
 
F
A
 
A
A
 
A
M
 
I
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
A
 
R
V
 
K
R
 
R
Q
 
Q
E
 
H
E
 
A
H
 
K
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
F
T
 
V
S
 
S
P
 
R
A
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
R
D
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
E
Y
 
H
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
A
x
S
G
|
G
S
x
A
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
S
 
M
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
L
 
F
A
 
T
L
 
V
L
 
L
Q
 
E
G
 
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
N
L
 
L
A
 
S
H
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
P
V
 
V
S
 
N
S
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
V
L
 
Q
Y
 
Y
N
 
N
A
 
F
V
 
V
Q
 
A
Y
 
Y
G
 
G
I
 
V
D
 
D
A
 
P
-
 
E
N
 
T
G
 
H
L
 
V
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
E
 
D
V
 
V
E
 
R
R
 
E
L
 
K
A
 
A
V
 
R
E
 
L
H
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
M
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
A
F
x
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
Q
 
R
I
 
I
L
 
I
D
 
D
F
 
F
P
 
A
R
 
K
F
 
F
R
 
R
A
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
F
 
M
V
 
V
D
|
D
M
 
M
A
|
A
H
|
H
V
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
H
P
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
A
 
A
D
 
H
V
 
F
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
|
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
L
A
 
C
R
 
Q
A
 
E
N
 
Q
A
 
-
D
 
-
I
 
F
E
 
A
K
 
K
K
 
Q
L
 
I
N
 
D
S
 
K
A
 
A
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
M
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
V
C
 
A
F
 
F
K
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
P
 
D
E
 
D
F
 
F
K
 
K
T
 
A
Y
 
Y
Q
 
A
Q
 
K
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
K
 
D
N
 
N
A
 
A
Q
 
K
T
 
R
M
 
L
A
 
A
S
 
S
V
 
A
F
 
L
I
 
Q
E
 
N
R
 
E
G
 
G
F
 
F
D
 
T
V
 
L
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
E
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
F
 
L
L
 
L
L
 
V
S
 
D
L
 
L
I
 
R
K
 
P
Q
 
Q
D
 
Q
I
 
L
S
 
T
G
 
G
K
 
K
D
 
T
A
 
A
D
 
E
A
 
K
A
 
V
L
 
L
G
 
D
K
 
E
A
 
V
F
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
 
N
S
 
T
V
 
I
P
 
P
N
 
Y
D
 
D
P
 
P
R
 
E
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
I
R
|
R
F
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
A
A
 
A
V
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
F
 
F
K
 
G
E
 
L
A
 
E
E
 
E
C
 
M
K
 
D
E
 
E
L
 
I
A
 
A
G
 
A
W
 
I
I
 
I
C
 
G
D
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
K
D
 
N
L
 
V
N
 
G
N
 
S
E
 
E
A
 
Q
V
 
A
I
 
L
D
 
E
A
 
E
V
 
A
R
 
R
E
 
Q
K
 
R
V
 
V
K
 
A
A
 
A
I
 
L
C
 
T

1kkpA Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase complexed with serine (see paper)
60% identity, 96% coverage: 8:409/417 of query aligns to 4:404/405 of 1kkpA

query
sites
1kkpA
I
 
L
A
 
P
K
 
Q
Y
 
Q
D
 
D
A
 
P
D
 
Q
L
 
V
F
 
F
A
 
A
A
 
A
M
 
I
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
A
 
R
V
 
K
R
 
R
Q
 
Q
E
 
H
E
 
A
H
 
K
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
F
T
 
V
S
 
S
P
 
R
A
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
R
D
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
E
Y
 
H
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
A
x
S
G
|
G
S
x
A
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
S
 
M
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
L
 
F
A
 
T
L
 
V
L
 
L
Q
 
E
G
 
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
N
L
 
L
A
 
S
H
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
A
 
S