SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF4893 FitnessBrowser__WCS417:GFF4893 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5u2kA Crystal structure of galactoside o-acetyltransferase complex with coa (h3 space group)
39% identity, 65% coverage: 58:180/188 of query aligns to 75:186/190 of 5u2kA

query
sites
5u2kA
V
 
V
T
 
K
F
 
L
G
 
G
Q
 
K
N
 
N
V
 
V
K
 
Y
I
 
V
N
 
N
D
 
T
Y
 
N
C
 
C
H
 
Y
I
 
F
G
x
M
A
 
D
M
 
G
S
 
G
R
 
Q
V
 
I
V
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
C
 
V
L
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
P
R
 
N
V
 
C
T
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
E
 
-
H
 
-
G
 
G
V
 
F
Y
|
Y
R
 
T
K
 
-
P
 
-
S
x
A
D
 
T
H
|
H
P
 
P
A
 
-
S
 
-
L
 
L
P
 
N
W
 
F
T
 
H
P
 
H
P
 
R
D
 
N
E
 
E
R
 
G
L
 
F
L
 
E
Q
 
K
G
 
A
K
 
G
P
 
P
I
 
I
I
 
H
I
 
I
E
 
G
K
 
S
N
 
N
V
 
T
W
 
W
I
 
F
G
 
G
S
 
G
G
 
H
A
 
V
I
 
A
I
 
V
V
x
L
G
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
E
G
 
G
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
I
 
I
S
 
P
R
 
P
Y
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
N
P
 
P
A
 
C
K
 
K
V
 
V
I
 
V
K
 
R
T
 
K
F
 
I
D
 
D
E
 
N

G3XD01 UDP-2-acetamido-3-amino-2,3-dideoxy-D-glucuronate N-acetyltransferase; UDP-D-GlcNAc3NA N-acetyltransferase; UDP-2-acetamido-3-amino-2,3-dideoxy-alpha-D-glucuronic acid 3-N-acetyltransferase; EC 2.3.1.201 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
34% identity, 84% coverage: 27:184/188 of query aligns to 21:161/191 of G3XD01

query
sites
G3XD01
A
 
S
R
 
R
V
 
V
I
 
W
N
 
H
K
 
F
G
 
V
H
 
H
L
 
I
Q
 
C
F
 
A
G
 
G
S
 
A
R
 
R
F
 
I
T
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
S
L
 
L
R
 
-
I
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
D
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
V
 
-
T
 
-
F
 
-
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
V
 
V
K
 
F
I
 
V
N
 
G
D
 
N
Y
 
-
C
 
-
H
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
M
 
-
S
 
-
R
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
R
C
 
C
L
 
K
I
 
I
G
 
Q
S
 
N
R
 
N
V
 
V
T
 
S
I
 
V
V
 
Y
D
 
D
H
 
N
-
 
V
-
 
T
-
 
L
E
 
E
H
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
R
 
C
K
 
G
P
 
P
S
 
S
-
 
M
-
 
V
-
 
F
-
 
T
-
 
N
-
 
V
D
 
Y
H
 
N
P
 
P
A
 
R
S
 
S
L
 
L
P
 
I
W
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
E
R
 
R
L
 
K
L
 
D
Q
 
Q
G
 
Y
K
 
R
P
 
N
I
 
T
I
 
L
I
 
V
E
 
K
K
 
K
N
 
G
V
 
A
W
 
T
I
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
N
A
 
C
I
 
T
I
 
I
V
 
V
G
 
C
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
E
G
 
Y
S
 
A
V
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
N
R
x
K
D
 
N
I
 
V
S
 
P
R
 
S
Y
 
Y
S
 
A
L
 
L
A
 
M
V
 
V
G
 
G
A
 
V
P
 
P
A
 
A
K
 
R
V
 
Q
I
 
I
K
 
G
T
 
W
F
 
M
D
 
S
E
 
E
G
 
F
G
 
G
K
 
E
Q
 
Q

3igjC Crystal structure of maltose o-acetyltransferase complexed with acetyl coenzyme a from bacillus anthracis
33% identity, 73% coverage: 43:180/188 of query aligns to 57:188/188 of 3igjC

query
sites
3igjC
A
 
S
G
 
S
V
 
A
D
 
D
L
 
G
R
 
K
I
 
A
E
 
Q
V
 
I
L
 
N
E
 
P
D
 
D
S
 
F
A
 
R
C
 
C
V
 
-
T
 
D
F
 
Y
G
 
G
Q
 
Y
N
 
N
V
 
I
K
 
H
I
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
S
-
 
F
-
x
F
-
 
A
N
 
N
D
 
F
Y
 
N
C
 
C
H
 
V
I
 
I
G
 
L
A
 
D
M
 
V
S
 
C
R
 
E
V
 
V
V
 
R
V
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
H
C
 
C
L
 
M
I
 
F
G
x
A
S
 
P
R
 
G
V
 
V
T
 
H
I
 
I
V
x
Y
D
 
T
H
x
A
E
 
T
H
|
H
G
 
P
V
 
L
Y
 
H
R
 
-
K
 
-
P
 
P
S
 
V
D
 
E
H
 
R
P
 
N
A
 
S
S
 
G
L
 
K
P
 
E
W
 
Y
T
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
K
I
 
I
E
 
G
K
 
N
N
 
N
V
 
V
W
 
W
I
 
V
G
|
G
S
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
I
V
x
N
G
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
S
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
N
S
 
A
V
 
V
I
 
I
G
x
A
A
x
S
N
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
|
T
R
 
K
D
 
D
I
 
V
S
 
P
R
 
N
Y
 
N
S
 
V
L
 
V
A
 
V
V
 
G
G
 
G
A
x
N
P
 
P
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
K
 
K
T
 
T
F
 
I
D
 
E
E
 
E

4isxA The crystal structure of maltose o-acetyltransferase from clostridium difficile 630 in complex with acetyl-coa
35% identity, 64% coverage: 61:180/188 of query aligns to 78:186/186 of 4isxA

query
sites
4isxA
G
 
G
Q
 
E
N
 
N
V
 
F
K
 
F
I
 
A
N
|
N
D
 
Y
Y
 
D
C
 
C
H
 
I
I
 
F
G
 
L
A
 
D
M
 
V
S
 
C
R
 
K
V
 
I
V
 
E
V
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
C
 
V
L
 
M
I
 
L
G
x
A
S
 
P
R
 
N
V
 
V
T
 
Q
I
 
I
V
 
Y
D
 
T
H
 
A
E
 
Y
H
 
H
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
R
 
-
K
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
P
 
-
W
 
-
T
 
-
P
 
P
P
 
I
D
 
D
E
 
A
R
 
Q
L
 
L
L
 
R
Q
 
N
-
 
S
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
Y
G
 
G
K
 
S
P
 
P
I
 
V
I
 
K
I
 
I
E
 
G
K
 
D
N
 
N
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
S
x
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
I
 
I
V
 
T
G
 
P
G
 
G
V
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
N
S
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
P
R
 
P
Y
 
N
S
 
T
L
 
V
A
 
A
V
|
V
G
 
G
A
 
N
P
 
P
A
 
C
K
 
R
V
 
V
I
 
I
K
|
K
T
 
K
F
 
I
D
 
E
E
 
E

P07464 Galactoside O-acetyltransferase; GAT; Acetyl-CoA:galactoside 6-O-acetyltransferase; Thiogalactoside acetyltransferase; Thiogalactoside transacetylase; EC 2.3.1.18 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
32% identity, 71% coverage: 52:185/188 of query aligns to 64:192/203 of P07464

query
sites
P07464
L
 
V
E
 
E
D
 
P
S
 
P
A
 
V
C
 
Y
V
 
F
T
x
S
F
 
Y
G
 
G
Q
 
S
N
 
N
V
 
I
K
 
H
I
 
I
-
 
G
-
 
R
N
 
N
D
 
F
Y
 
Y
C
 
A
H
x
N
I
 
F
G
 
N
A
 
L
M
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
D
-
x
D
S
 
Y
R
 
T
V
 
V
V
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
C
 
V
L
 
L
I
 
I
G
 
A
S
 
P
R
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
L
V
 
S
D
 
V
H
 
T
E
 
G
H
|
H
G
 
P
V
 
V
Y
 
H
R
 
H
K
 
E
P
 
L
S
 
R
D
 
K
H
 
N
P
 
G
A
 
E
S
 
-
L
 
-
P
 
-
W
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
M
Q
 
Y
G
 
S
K
 
F
P
 
P
I
 
I
I
 
T
I
 
I
E
 
G
K
 
N
N
 
N
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
S
|
S
G
 
H
A
 
V
I
 
V
I
 
I
V
 
N
G
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
N
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
I
 
I
S
 
P
R
 
P
Y
 
N
S
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
A
G
 
G
A
 
V
P
 
P
A
 
C
K
x
R
V
 
V
I
 
I
K
x
R
T
 
E
F
 
I
D
 
N
E
 
D
G
 
R
G
 
D
K
 
K
Q
 
H
W
 
Y

Sites not aligning to the query:

1krvA Galactoside acetyltransferase in complex with coa and pnp-beta-gal (see paper)
32% identity, 71% coverage: 52:185/188 of query aligns to 63:191/201 of 1krvA

query
sites
1krvA
L
 
V
E
 
E
D
 
P
S
 
P
A
 
V
C
 
Y
V
 
F
T
x
S
F
 
Y
G
 
G
Q
 
S
N
 
N
V
 
I
K
 
H
I
 
I
-
 
G
-
 
R
N
 
N
D
 
F
Y
|
Y
C
 
A
H
x
N
I
 
F
G
 
N
A
 
L
M
 
T
-
 
I
-
x
V
-
 
D
-
x
D
S
 
Y
R
 
T
V
 
V
V
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
C
 
V
L
 
L
I
 
I
G
x
A
S
 
P
R
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
L
V
x
S
D
 
V
H
x
T
E
 
G
H
 
H
G
 
P
V
 
V
Y
 
H
R
 
H
K
 
E
P
 
L
S
 
R
D
 
K
H
 
N
P
 
G
A
 
E
S
 
-
L
 
-
P
 
-
W
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
L
x
M
Q
 
Y
G
 
S
K
 
F
P
 
P
I
 
I
I
 
T
I
 
I
E
 
G
K
 
N
N
 
N
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
S
|
S
G
 
H
A
 
V
I
 
V
I
 
I
V
x
N
G
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
N
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
P
R
 
P
Y
 
N
S
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
A
G
 
G
A
 
V
P
|
P
A
 
C
K
x
R
V
 
V
I
 
I
K
x
R
T
 
E
F
 
I
D
 
N
E
 
D
G
 
R
G
 
D
K
 
K
Q
 
H
W
 
Y

Sites not aligning to the query:

1kruA Galactoside acetyltransferase in complex with iptg and coenzyme a (see paper)
32% identity, 71% coverage: 52:185/188 of query aligns to 63:191/201 of 1kruA

query
sites
1kruA
L
 
V
E
 
E
D
 
P
S
 
P
A
 
V
C
 
Y
V
 
F
T
x
S
F
 
Y
G
 
G
Q
 
S
N
 
N
V
 
I
K
 
H
I
 
I
-
 
G
-
 
R
N
 
N
D
 
F
Y
|
Y
C
 
A
H
x
N
I
 
F
G
 
N
A
 
L
M
 
T
-
 
I
-
x
V
-
 
D
-
x
D
S
 
Y
R
 
T
V
 
V
V
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
C
 
V
L
|
L
I
 
I
G
 
A
S
 
P
R
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
L
V
 
S
D
 
V
H
 
T
E
 
G
H
|
H
G
 
P
V
 
V
Y
 
H
R
 
H
K
 
E
P
 
L
S
 
R
D
 
K
H
 
N
P
 
G
A
 
E
S
 
-
L
 
-
P
 
-
W
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
L
x
M
Q
 
Y
G
 
S
K
 
F
P
 
P
I
 
I
I
 
T
I
 
I
E
 
G
K
 
N
N
 
N
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
S
|
S
G
 
H
A
 
V
I
 
V
I
 
I
V
 
N
G
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
N
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
|
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
P
R
 
P
Y
 
N
S
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
A
G
 
G
A
 
V
P
|
P
A
 
C
K
 
R
V
 
V
I
 
I
K
x
R
T
 
E
F
 
I
D
 
N
E
 
D
G
 
R
G
 
D
K
 
K
Q
 
H
W
 
Y

Sites not aligning to the query:

1krrA Galactoside acetyltransferase in complex with acetyl-coenzyme a (see paper)
32% identity, 71% coverage: 52:185/188 of query aligns to 63:191/200 of 1krrA

query
sites
1krrA
L
 
V
E
 
E
D
 
P
S
 
P
A
 
V
C
 
Y
V
 
F
T
 
S
F
 
Y
G
 
G
Q
 
S
N
 
N
V
 
I
K
 
H
I
 
I
-
 
G
-
 
R
N
 
N
D
 
F
Y
 
Y
C
 
A
H
x
N
I
 
F
G
 
N
A
 
L
M
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
D
-
 
D
S
 
Y
R
 
T
V
 
V
V
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
C
 
V
L
 
L
I
|
I
G
x
A
S
x
P
R
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
L
V
 
S
D
 
V
H
x
T
E
 
G
H
|
H
G
 
P
V
 
V
Y
 
H
R
 
H
K
 
E
P
 
L
S
 
R
D
 
K
H
 
N
P
 
G
A
 
E
S
 
-
L
 
-
P
 
-
W
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
M
Q
 
Y
G
 
S
K
 
F
P
 
P
I
 
I
I
 
T
I
 
I
E
 
G
K
 
N
N
 
N
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
|
G
S
|
S
G
 
H
A
 
V
I
 
V
I
 
I
V
x
N
G
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
N
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
|
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
P
R
 
P
Y
 
N
S
 
V
L
 
V
A
 
A
V
x
A
G
 
G
A
 
V
P
|
P
A
 
C
K
 
R
V
 
V
I
 
I
K
x
R
T
 
E
F
 
I
D
 
N
E
 
D
G
 
R
G
 
D
K
 
K
Q
 
H
W
 
Y

3nz2C Crystal structure of hexapeptide-repeat containing-acetyltransferase vca0836 complexed with acetyl co enzyme a from vibrio cholerae o1 biovar eltor
31% identity, 64% coverage: 60:180/188 of query aligns to 68:183/183 of 3nz2C

query
sites
3nz2C
F
 
F
G
 
G
Q
 
K
N
 
T
V
 
I
K
 
R
I
 
I
N
 
G
D
 
D
Y
 
H
C
 
T
H
 
F
I
 
I
G
 
N
A
 
M
M
 
N
-
 
V
-
 
V
-
 
M
-
 
L
-
 
D
-
 
G
S
 
A
R
 
P
V
 
I
V
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
H
C
 
V
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
P
R
 
S
V
 
T
T
 
Q
I
 
F
V
x
Y
D
 
T
H
 
A
E
 
S
H
|
H
G
 
S
V
 
L
Y
 
-
R
 
-
K
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
D
H
 
Y
P
 
R
A
 
R
S
 
R
L
 
Q
P
 
A
W
 
W
T
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
E
R
 
T
L
 
I
L
 
C
Q
 
-
G
 
-
K
 
K
P
 
P
I
 
I
I
 
V
I
 
I
E
 
E
K
 
D
N
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
|
G
S
 
G
G
 
N
A
 
V
I
 
V
I
 
I
V
 
N
G
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
A
G
 
R
S
 
S
V
 
V
I
 
V
G
x
A
A
|
A
N
|
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
N
R
 
Q
D
 
D
I
 
V
S
 
P
R
 
P
Y
 
D
S
 
T
L
 
L
A
 
V
V
x
G
G
 
G
A
x
T
P
|
P
A
 
A
K
 
R
V
 
I
I
x
L
K
x
R
T
 
S
F
 
L
D
 
K
E
 
D

3ectA Crystal structure of the hexapeptide-repeat containing- acetyltransferase vca0836 from vibrio cholerae
31% identity, 64% coverage: 60:180/188 of query aligns to 61:176/176 of 3ectA

query
sites
3ectA
F
 
F
G
 
G
Q
 
K
N
 
T
V
 
I
K
 
R
I
 
I
N
 
G
D
 
D
Y
 
H
C
 
T
H
 
F
I
 
I
G
 
N
A
 
M
M
 
N
-
 
V
-
 
V
-
 
M
-
 
L
-
 
D
-
 
G
S
 
A
R
 
P
V
 
I
V
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
H
C
 
V
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
P
R
 
S
V
 
T
T
 
Q
I
 
F
V
 
Y
D
 
T
H
 
A
E
 
S
H
 
H
G
 
S
V
 
L
Y
 
-
R
 
-
K
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
D
H
 
Y
P
 
R
A
 
R
S
 
R
L
 
Q
P
 
A
W
 
W
T
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
E
R
 
T
L
 
I
L
 
C
Q
 
-
G
 
-
K
 
K
P
 
P
I
 
I
I
 
V
I
 
I
E
 
E
K
 
D
N
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
S
 
G
G
 
N
A
 
V
I
 
V
I
 
I
V
 
N
G
 
Q
G
|
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
A
G
 
R
S
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
N
R
 
Q
D
|
D
I
 
V
S
 
P
R
 
P
Y
 
D
S
 
T
L
 
L
A
 
V
V
 
G
G
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
A
K
 
R
V
 
I
I
 
L
K
 
R
T
 
S
F
 
L
D
 
K
E
 
D

3nz2J Crystal structure of hexapeptide-repeat containing-acetyltransferase vca0836 complexed with acetyl co enzyme a from vibrio cholerae o1 biovar eltor
32% identity, 63% coverage: 60:178/188 of query aligns to 71:184/185 of 3nz2J

query
sites
3nz2J
F
 
F
G
 
G
Q
 
K
N
 
T
V
 
I
K
 
R
I
 
I
N
 
G
D
 
D
Y
 
H
C
 
T
H
 
F
I
 
I
G
 
N
A
 
M
M
 
N
-
 
V
-
 
V
-
 
M
-
 
L
-
 
D
-
 
G
S
 
A
R
 
P
V
 
I
V
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
H
C
 
V
L
 
L
I
 
I
G
|
G
S
 
P
R
 
S
V
 
T
T
 
Q
I
 
F
V
x
Y
D
 
T
H
 
A
E
 
S
H
|
H
G
 
S
V
 
L
Y
 
-
R
 
-
K
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
D
H
 
Y
P
 
R
A
 
R
S
 
R
L
 
Q
P
 
A
W
 
W
T
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
E
R
 
T
L
 
I
L
 
C
Q
 
-
G
 
-
K
 
K
P
 
P
I
 
I
I
 
V
I
 
I
E
 
E
K
 
D
N
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
S
 
G
G
 
N
A
 
V
I
 
V
I
 
I
V
 
N
G
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
A
G
 
R
S
 
S
V
 
V
I
 
V
G
x
A
A
|
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
N
R
 
Q
D
 
D
I
 
V
S
 
P
R
 
P
Y
 
D
S
 
T
L
 
L
A
 
V
V
x
G
G
 
G
A
x
T
P
|
P
A
 
A
K
 
R
V
 
I
I
 
L
K
x
R
T
 
S
F
 
L

A1ADJ6 Polysialic acid O-acetyltransferase; Capsule O-acetyl transferase; EC 2.3.1.136 from Escherichia coli O1:K1 / APEC (see paper)
34% identity, 59% coverage: 66:176/188 of query aligns to 184:278/307 of A1ADJ6

query
sites
A1ADJ6
I
 
V
N
 
T
D
 
D
Y
 
K
C
 
C
H
 
N
I
 
-
G
 
-
A
 
-
M
 
-
S
 
-
R
 
-
V
 
V
V
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
H
D
 
D
C
 
C
L
 
M
I
 
I
G
 
A
S
 
R
R
 
D
V
 
V
T
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
E
 
-
H
 
-
G
 
-
V
 
I
Y
 
L
R
 
R
K
 
A
P
 
S
S
 
D
D
 
G
H
|
H
P
 
P
A
 
-
S
 
-
L
 
I
P
 
F
W
 
D
T
 
I
P
 
H
P
 
S
D
 
K
E
 
K
R
 
R
L
 
I
L
 
N
Q
 
W
G
 
A
K
 
K
P
 
D
I
 
I
I
 
I
I
 
I
E
 
S
K
 
S
N
 
Y
V
 
V
W
|
W
I
 
V
G
 
G
S
 
R
G
 
N
A
 
V
I
 
S
I
 
I
V
 
M
G
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
S
I
 
V
G
 
G
E
 
S
G
 
G
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
Y
N
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
I
 
V
S
 
P
R
 
S
Y
 
M
S
 
C
L
 
A
A
 
A
V
 
A
G
 
G
A
 
N
P
 
P
A
 
A
K
 
K
V
 
I
I
 
I
K
 
K

8j40A Crystal structure of catb8 in complex with chloramphenicol (see paper)
33% identity, 54% coverage: 75:176/188 of query aligns to 53:161/209 of 8j40A

query
sites
8j40A
M
 
V
S
 
D
R
 
K
V
 
L
V
 
I
V
 
I
G
 
G
D
 
S
D
 
F
C
 
C
L
 
S
I
 
I
G
 
G
S
 
S
R
 
G
V
 
A
T
 
S
I
 
F
V
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
Q
D
 
G
H
 
H
E
 
Q
H
 
H
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
R
 
-
K
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
D
H
 
W
P
 
A
A
 
S
S
 
S
L
 
F
P
 
P
W
 
F
-
 
F
-
x
Y
-
 
M
-
 
Q
-
 
E
T
 
E
P
 
P
P
 
A
D
 
F
E
 
S
R
 
R
L
 
A
L
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
F
-
 
Q
Q
 
R
G
 
A
K
 
G
P
 
D
I
 
T
I
 
V
I
 
I
E
 
G
K
 
N
N
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
E
A
 
A
I
 
M
I
 
I
V
 
M
G
 
P
G
 
G
V
 
I
T
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
S
 
A
V
|
V
I
 
I
G
 
G
A
x
S
N
 
R
A
 
S
V
 
L
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
I
 
V
S
 
E
R
 
P
Y
 
Y
S
 
A
L
 
I
A
 
I
V
 
G
G
 
G
A
 
N
P
 
P
A
 
A
K
 
K
V
 
Q
I
 
I
K
 
K

Sites not aligning to the query:

3dhoA Structure of streptogramin acetyltransferase in complex with an inhibitor
37% identity, 56% coverage: 76:180/188 of query aligns to 59:170/203 of 3dhoA

query
sites
3dhoA
S
 
D
R
 
K
V
 
L
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
K
D
 
F
C
 
C
L
 
S
I
 
I
G
 
G
S
 
P
R
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
V
 
I
D
 
M
H
 
N
E
 
G
H
 
A
G
 
N
V
 
H
Y
 
R
R
x
M
K
 
D
P
 
G
S
 
S
D
 
T
H
 
Y
P
 
P
A
 
F
S
 
N
L
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
N
P
 
G
W
 
W
T
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
M
P
 
P
P
 
K
D
 
L
E
 
D
R
 
Q
L
 
L
L
 
P
Q
 
I
G
 
K
K
 
G
P
 
D
I
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
G
K
 
N
N
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
S
 
K
G
 
D
A
 
V
I
 
V
I
 
I
V
 
M
G
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
S
 
A
V
x
I
I
 
V
G
x
A
A
 
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
V
R
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
A
R
 
P
Y
 
Y
S
 
M
L
|
L
A
 
A
V
x
G
G
 
G
A
 
N
P
|
P
A
 
A
K
 
N
V
 
E
I
|
I
K
 
K
T
 
Q
-
 
R
F
 
F
D
 
D
E
 
Q

1kk4A Crystal structure of vat(d) in complex with acetyl-coa (see paper)
37% identity, 56% coverage: 76:180/188 of query aligns to 59:170/205 of 1kk4A

query
sites
1kk4A
S
 
D
R
 
K
V
 
L
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
K
D
 
F
C
 
C
L
 
S
I
|
I
G
|
G
S
 
P
R
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
V
 
I
D
 
M
H
 
N
E
 
G
H
 
A
G
 
N
V
 
H
Y
 
R
R
 
M
K
 
D
P
 
G
S
 
S
D
 
T
H
 
Y
P
 
P
A
 
F
S
 
N
L
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
N
P
 
G
W
 
W
T
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
M
P
 
P
P
 
K
D
 
L
E
 
D
R
 
Q
L
 
L
L
 
P
Q
 
I
G
x
K
K
 
G
P
 
D
I
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
G
K
 
N
N
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
S
x
K
G
 
D
A
 
V
I
 
V
I
 
I
V
 
M
G
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
S
 
A
V
 
I
I
 
V
G
x
A
A
|
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
V
R
x
K
D
 
D
I
 
I
S
 
A
R
 
P
Y
 
Y
S
 
M
L
|
L
A
 
A
V
x
G
G
|
G
A
 
N
P
|
P
A
 
A
K
 
N
V
 
E
I
|
I
K
 
K
T
 
Q
-
 
R
F
 
F
D
 
D
E
 
Q

P50870 Streptogramin A acetyltransferase; Virginiamycin acetyltransferase D; Vat(D); EC 2.3.1.- from Enterococcus faecium (Streptococcus faecium) (see paper)
37% identity, 56% coverage: 76:180/188 of query aligns to 59:170/209 of P50870

query
sites
P50870
S
 
D
R
 
K
V
 
L
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
K
D
 
F
C
 
C
L
 
S
I
 
I
G
 
G
S
 
P
R
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
V
 
I
D
 
M
H
 
N
E
 
G
H
 
A
G
 
N
V
x
H
Y
 
R
R
 
M
K
 
D
P
 
G
S
 
S
D
 
T
H
 
Y
P
 
P
A
 
F
S
 
N
L
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
N
P
 
G
W
 
W
T
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
M
P
 
P
P
 
K
D
 
L
E
 
D
R
 
Q
L
 
L
L
 
P
Q
 
I
G
 
K
K
 
G
P
 
D
I
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
G
K
 
N
N
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
S
 
K
G
 
D
A
 
V
I
 
V
I
 
I
V
 
M
G
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
S
 
A
V
 
I
I
 
V
G
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
V
R
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
A
R
 
P
Y
 
Y
S
 
M
L
 
L
A
 
A
V
 
G
G
 
G
A
 
N
P
 
P
A
 
A
K
 
N
V
 
E
I
 
I
K
 
K
T
 
Q
-
 
R
F
 
F
D
 
D
E
 
Q

1mrlA Crystal structure of streptogramin a acetyltransferase with dalfopristin (see paper)
37% identity, 56% coverage: 76:180/188 of query aligns to 59:170/204 of 1mrlA

query
sites
1mrlA
S
 
D
R
 
K
V
 
L
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
K
D
 
F
C
 
C
L
 
S
I
 
I
G
 
G
S
 
P
R
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
V
 
I
D
 
M
H
 
N
E
 
G
H
 
A
G
x
N
V
x
H
Y
 
R
R
 
M
K
 
D
P
 
G
S
 
S
D
 
T
H
 
Y
P
 
P
A
 
F
S
 
N
L
|
L
-
 
F
-
 
G
-
 
N
P
 
G
W
 
W
T
 
E
-
 
K
-
 
H
-
x
M
P
 
P
P
 
K
D
 
L
E
 
D
R
 
Q
L
|
L
L
 
P
Q
 
I
G
 
K
K
 
G
P
 
D
I
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
G
K
 
N
N
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
S
 
K
G
 
D
A
 
V
I
 
V
I
 
I
V
 
M
G
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
S
 
A
V
 
I
I
 
V
G
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
V
R
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
A
R
 
P
Y
 
Y
S
 
M
L
 
L
A
 
A
V
 
G
G
 
G
A
 
N
P
 
P
A
 
A
K
 
N
V
 
E
I
 
I
K
 
K
T
 
Q
-
 
R
F
 
F
D
 
D
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

1khrA Crystal structure of vat(d) in complex with virginiamycin and coenzyme a (see paper)
37% identity, 56% coverage: 76:180/188 of query aligns to 59:170/206 of 1khrA

query
sites
1khrA
S
 
D
R
 
K
V
 
L
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
K
D
 
F
C
 
C
L
 
S
I
 
I
G
 
G
S
 
P
R
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
V
 
I
D
 
M
H
 
N
E
 
G
H
x
A
G
x
N
V
x
H
Y
 
R
R
x
M
K
 
D
P
 
G
S
 
S
D
 
T
H
 
Y
P
 
P
A
 
F
S
 
N
L
|
L
-
 
F
-
 
G
-
 
N
P
 
G
W
 
W
T
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
M
P
 
P
P
 
K
D
 
L
E
 
D
R
 
Q
L
 
L
L
 
P
Q
 
I
G
 
K
K
 
G
P
 
D
I
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
G
K
 
N
N
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
 
G
S
 
K
G
 
D
A
 
V
I
 
V
I
 
I
V
 
M
G
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
S
 
A
V
 
I
I
 
V
G
x
A
A
|
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
V
R
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
A
R
 
P
Y
 
Y
S
 
M
L
|
L
A
 
A
V
x
G
G
 
G
A
 
N
P
|
P
A
 
A
K
 
N
V
 
E
I
|
I
K
 
K
T
 
Q
-
 
R
F
 
F
D
 
D
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

6pxaE The crystal structure of chloramphenicol acetyltransferase-like protein from vibrio fischeri es114 in complex with taurocholic acid
32% identity, 63% coverage: 71:188/188 of query aligns to 64:185/221 of 6pxaE

query
sites
6pxaE
H
 
Q
I
x
F
G
 
G
A
 
E
M
 
V
S
 
D
R
 
K
V
 
L
V
 
R
V
 
I
G
 
G
D
 
K
D
 
F
C
 
C
L
 
S
I
 
I
G
 
A
S
 
S
R
 
G
V
 
A
T
 
T
I
 
F
V
 
M
D
 
M
H
 
A
E
 
G
H
 
N
G
x
Q
V
 
G
Y
 
H
R
 
R
K
 
-
P
 
-
S
 
A
D
 
D
H
 
W
P
 
I
A
 
S
S
 
T
L
x
F
P
|
P
W
x
F
T
x
S
P
 
K
P
 
K
D
 
E
-
x
F
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
K
E
 
D
R
 
G
L
 
F
L
 
Q
Q
 
R
G
 
A
K
 
G
P
 
D
I
 
T
I
 
I
I
 
V
E
 
G
K
 
N
N
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
E
A
 
A
I
 
M
I
 
I
V
 
M
G
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
H
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
S
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
T
R
 
K
D
 
N
I
 
V
S
 
A
R
 
P
Y
 
Y
S
 
S
L
 
V
A
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
N
P
 
N
A
 
V
K
 
V
V
 
V
I
 
K
K
 
K
T
 
R
F
 
F
D
 
D
E
 
E
G
 
N
G
 
L
K
 
I
Q
 
Q
W
 
T
L
 
L
C
 
L
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5ux9A The crystal structure of chloramphenicol acetyltransferase from vibrio fischeri es114
32% identity, 63% coverage: 71:188/188 of query aligns to 59:180/215 of 5ux9A

query
sites
5ux9A
H
 
Q
I
 
F
G
 
G
A
 
E
M
 
V
S
 
D
R
 
K
V
 
L
V
 
R
V
 
I
G
 
G
D
 
K
D
 
F
C
 
C
L
 
S
I
 
I
G
 
A
S
 
S
R
 
G
V
 
A
T
 
T
I
 
F
V
 
M
D
 
M
H
 
A
E
 
G
H
 
N
G
 
Q
V
 
G
Y
 
H
R
 
R
K
 
-
P
 
-
S
 
A
D
 
D
H
 
W
P
 
I
A
 
S
S
 
T
L
 
F
P
 
P
W
 
F
T
 
S
P
 
K
P
 
K
D
 
E
-
 
F
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
K
E
 
D
R
 
G
L
 
F
L
 
Q
Q
 
R
G
 
A
K
 
G
P
 
D
I
 
T
I
 
I
I
 
V
E
 
G
K
 
N
N
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
E
A
 
A
I
 
M
I
 
I
V
 
M
G
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
H
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
S
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
T
R
 
K
D
 
N
I
 
V
S
 
A
R
 
P
Y
 
Y
S
 
S
L
 
V
A
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
N
P
 
N
A
 
V
K
 
V
V
 
V
I
 
K
K
 
K
T
 
R
F
 
F
D
 
D
E
 
E
G
 
N
G
 
L
K
 
I
Q
 
Q
W
 
T
L
 
L
C
 
L
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>GFF4893 FitnessBrowser__WCS417:GFF4893
MWIRLAFFSVLSKLLYGMNVRVIKGFARVINKGHLQFGSRFTAGVDLRIEVLEDSACVTF
GQNVKINDYCHIGAMSRVVVGDDCLIGSRVTIVDHEHGVYRKPSDHPASLPWTPPDERLL
QGKPIIIEKNVWIGSGAIIVGGVTIGEGSVIGANAVVTRDISRYSLAVGAPAKVIKTFDE
GGKQWLCV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory