SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF500 FitnessBrowser__Phaeo:GFF500 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 19 hits to proteins with known functional sites (download)

4j9xA Crystal structure of the complex of a hydroxyproline epimerase (target efi-506499, pseudomonas fluorescens pf-5) with trans-4-hydroxy-l- proline
53% identity, 98% coverage: 3:310/314 of query aligns to 6:310/310 of 4j9xA

query
sites
4j9xA
V
 
V
I
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
E
P
 
P
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
V
L
 
I
S
 
D
G
 
G
G
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
L
G
 
G
D
 
R
G
 
G
S
 
S
L
 
M
T
 
A
D
 
E
R
 
R
A
 
L
H
 
Q
R
 
I
L
 
L
F
 
E
R
 
R
D
 
E
H
 
H
R
 
D
D
 
Q
F
 
W
C
 
R
S
 
R
A
 
A
V
 
C
L
 
V
S
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
S
D
 
D
A
 
V
M
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
C
P
 
Q
P
 
P
T
 
Q
D
 
A
P
 
G
I
 
D
A
 
A
A
 
C
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
Y
 
F
F
 
F
N
 
N
P
 
N
I
 
S
G
 
G
P
 
Y
L
|
L
G
 
G
M
 
M
C
|
C
G
|
G
H
|
H
A
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
L
A
 
V
A
 
R
S
 
S
L
 
L
H
 
Y
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
L
 
Q
G
 
G
R
 
V
H
 
H
H
 
R
I
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
V
G
 
E
V
 
A
H
 
T
L
 
L
Q
 
H
T
 
E
A
 
D
N
 
L
R
 
S
A
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
R
N
 
N
V
 
V
E
 
P
S
 
A
D
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
A
 
T
G
 
Q
V
 
V
A
 
M
V
 
L
E
 
Q
V
 
L
P
 
P
G
 
G
Q
 
H
G
 
G
R
 
K
I
 
V
S
 
H
G
 
G
D
 
D
I
 
I
A
 
A
W
 
W
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
F
 
F
F
 
F
L
 
L
T
 
I
S
 
S
D
 
D
V
 
H
P
 
G
A
 
Q
P
 
R
L
 
I
T
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
E
R
 
A
L
 
L
T
 
T
T
 
H
S
 
Y
A
 
T
V
 
R
A
 
D
L
 
V
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
E
E
 
A
Q
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
A
D
 
E
G
 
G
A
 
G
M
 
V
I
 
I
D
 
D
H
|
H
I
 
I
E
 
E
-
 
L
F
 
F
V
 
A
G
 
D
P
 
D
P
 
P
L
 
Q
T
 
A
S
 
D
I
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
S
R
 
R
N
 
N
F
 
F
V
 
V
L
 
L
C
|
C
P
 
P
G
 
G
T
 
K
A
 
A
Y
 
Y
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
|
G
T
|
T
G
 
G
S
 
T
A
 
S
A
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
A
C
 
C
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
D
 
K
L
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
Q
T
 
A
W
 
W
I
 
R
Q
 
Q
E
 
A
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
G
S
 
S
T
 
Q
Y
 
F
A
 
S
L
 
A
H
 
H
Y
 
Y
R
 
E
P
 
K
G
 
-
P
 
V
T
 
G
G
 
E
G
 
Q
V
 
L
I
 
I
A
 
P
T
 
I
I
 
L
T
 
R
G
 
G
T
 
S
A
 
A
F
 
H
V
 
I
T
 
S
G
 
A
D
 
E
T
 
A
V
 
T
L
 
L
N
 
L
F
 
L
D
 
D
P
 
D
A
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
F
R
 
V
A
 
W
G
 
G
I
 
I
T
 
G
S
 
S

4j9wA Crystal structure of the complex of a hydroxyproline epimerase (target efi-506499, pseudomonas fluorescens pf-5) with the inhibitor pyrrole- 2-carboxylate
53% identity, 98% coverage: 3:310/314 of query aligns to 6:310/310 of 4j9wA

query
sites
4j9wA
V
 
V
I
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
E
P
 
P
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
V
L
 
I
S
 
D
G
 
G
G
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
L
G
 
G
D
 
R
G
 
G
S
 
S
L
 
M
T
 
A
D
 
E
R
 
R
A
 
L
H
 
Q
R
 
I
L
 
L
F
 
E
R
 
R
D
 
E
H
 
H
R
 
D
D
 
Q
F
 
W
C
 
R
S
 
R
A
 
A
V
 
C
L
 
V
S
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
S
D
 
D
A
 
V
M
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
C
P
 
Q
P
 
P
T
 
Q
D
 
A
P
 
G
I
 
D
A
 
A
A
 
C
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
Y
 
F
F
 
F
N
 
N
P
 
N
I
 
S
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
G
 
G
M
 
M
C
|
C
G
|
G
H
|
H
A
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
L
A
 
V
A
 
R
S
 
S
L
 
L
H
 
Y
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
L
 
Q
G
 
G
R
 
V
H
 
H
H
 
R
I
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
V
G
 
E
V
 
A
H
 
T
L
 
L
Q
 
H
T
 
E
A
 
D
N
 
L
R
 
S
A
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
R
N
 
N
V
 
V
E
 
P
S
 
A
D
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
A
 
T
G
 
Q
V
 
V
A
 
M
V
 
L
E
 
Q
V
 
L
P
 
P
G
 
G
Q
 
H
G
 
G
R
 
K
I
 
V
S
 
H
G
 
G
D
 
D
I
 
I
A
 
A
W
 
W
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
F
 
F
F
 
F
L
 
L
T
 
I
S
 
S
D
 
D
V
 
H
P
 
G
A
 
Q
P
 
R
L
 
I
T
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
E
R
 
A
L
 
L
T
 
T
T
 
H
S
 
Y
A
 
T
V
 
R
A
 
D
L
 
V
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
E
E
 
A
Q
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
A
D
 
E
G
 
G
A
 
G
M
 
V
I
 
I
D
 
D
H
|
H
I
 
I
E
 
E
-
 
L
F
 
F
V
 
A
G
 
D
P
 
D
P
 
P
L
 
Q
T
 
A
S
 
D
I
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
S
R
 
R
N
 
N
F
 
F
V
 
V
L
 
L
C
|
C
P
 
P
G
 
G
T
 
K
A
 
A
Y
 
Y
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
|
G
T
|
T
G
 
G
S
 
T
A
 
S
A
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
A
C
 
C
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
D
 
K
L
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
Q
T
 
A
W
 
W
I
 
R
Q
 
Q
E
 
A
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
G
S
 
S
T
 
Q
Y
 
F
A
 
S
L
 
A
H
 
H
Y
 
Y
R
 
E
P
 
K
G
 
-
P
 
V
T
 
G
G
 
E
G
 
Q
V
 
L
I
 
I
A
 
P
T
 
I
I
 
L
T
 
R
G
 
G
T
 
S
A
 
A
F
 
H
V
 
I
T
 
S
G
 
A
D
 
E
T
 
A
V
 
T
L
 
L
N
 
L
F
 
L
D
 
D
P
 
D
A
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
F
R
 
V
A
 
W
G
 
G
I
 
I
T
 
G
S
 
S

Q4KGU2 4-hydroxyproline 2-epimerase; 4Hyp 2-epimerase; 4HypE; EC 5.1.1.8 from Pseudomonas fluorescens (strain ATCC BAA-477 / NRRL B-23932 / Pf-5) (see paper)
53% identity, 98% coverage: 3:310/314 of query aligns to 6:310/310 of Q4KGU2

query
sites
Q4KGU2
V
 
V
I
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
E
P
 
P
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
V
L
 
I
S
 
D
G
 
G
G
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
L
G
 
G
D
 
R
G
 
G
S
 
S
L
 
M
T
 
A
D
 
E
R
 
R
A
 
L
H
 
Q
R
 
I
L
 
L
F
 
E
R
 
R
D
 
E
H
 
H
R
 
D
D
 
Q
F
 
W
C
 
R
S
 
R
A
 
A
V
 
C
L
 
V
S
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
S
D
 
D
A
 
V
M
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
C
P
 
Q
P
 
P
T
 
Q
D
 
A
P
 
G
I
 
D
A
 
A
A
 
C
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
Y
 
F
F
 
F
N
 
N
P
 
N
I
 
S
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
G
 
G
M
 
M
C
 
C
G
|
G
H
|
H
A
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
L
A
 
V
A
 
R
S
 
S
L
 
L
H
 
Y
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
L
 
Q
G
 
G
R
 
V
H
 
H
H
 
R
I
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
V
G
 
E
V
 
A
H
 
T
L
 
L
Q
 
H
T
 
E
A
 
D
N
 
L
R
 
S
A
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
R
N
 
N
V
 
V
E
 
P
S
 
A
D
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
A
 
T
G
 
Q
V
 
V
A
 
M
V
 
L
E
 
Q
V
 
L
P
 
P
G
 
G
Q
 
H
G
 
G
R
 
K
I
 
V
S
 
H
G
 
G
D
 
D
I
 
I
A
 
A
W
 
W
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
F
 
F
F
 
F
L
 
L
T
 
I
S
 
S
D
 
D
V
 
H
P
 
G
A
 
Q
P
 
R
L
 
I
T
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
E
R
 
A
L
 
L
T
 
T
T
 
H
S
 
Y
A
 
T
V
 
R
A
 
D
L
 
V
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
E
E
 
A
Q
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
A
D
 
E
G
 
G
A
 
G
M
 
V
I
 
I
D
 
D
H
|
H
I
 
I
E
 
E
-
 
L
F
 
F
V
 
A
G
 
D
P
 
D
P
 
P
L
 
Q
T
 
A
S
 
D
I
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
S
R
 
R
N
 
N
F
 
F
V
 
V
L
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
K
A
 
A
Y
 
Y
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
 
C
G
|
G
T
|
T
G
 
G
S
 
T
A
 
S
A
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
A
C
 
C
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
D
 
K
L
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
Q
T
 
A
W
 
W
I
 
R
Q
 
Q
E
 
A
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
G
S
 
S
T
 
Q
Y
 
F
A
 
S
L
 
A
H
 
H
Y
 
Y
R
 
E
P
 
K
G
 
-
P
 
V
T
 
G
G
 
E
G
 
Q
V
 
L
I
 
I
A
 
P
T
 
I
I
 
L
T
 
R
G
 
G
T
 
S
A
 
A
F
 
H
V
 
I
T
 
S
G
 
A
D
 
E
T
 
A
V
 
T
L
 
L
N
 
L
F
 
L
D
 
D
P
 
D
A
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
F
R
 
V
A
 
W
G
 
G
I
 
I
T
 
G
S
 
S

Q9I476 4-hydroxyproline 2-epimerase; 4Hyp 2-epimerase; 4HypE; Hydroxyproline-2-epimerase; PaHyPRE; EC 5.1.1.8 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
54% identity, 98% coverage: 1:308/314 of query aligns to 4:312/314 of Q9I476

query
sites
Q9I476
M
 
I
R
 
R
V
 
I
I
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
E
P
 
P
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
V
L
 
I
S
 
G
G
 
G
G
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
L
G
 
G
D
 
Q
G
 
G
S
 
D
L
 
M
T
 
A
D
 
E
R
 
R
A
 
R
H
 
R
R
 
L
L
 
L
F
 
G
R
 
E
D
 
R
H
 
H
R
 
D
D
 
A
F
 
W
C
 
R
S
 
A
A
 
A
V
 
C
L
 
I
S
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
S
D
 
D
A
 
V
M
 
L
V
|
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
C
P
 
A
P
 
P
T
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
E
A
 
A
A
 
C
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
Y
 
F
F
 
F
N
 
N
P
 
N
I
 
S
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
G
 
G
M
 
M
C
|
C
G
 
G
H
 
H
A
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
L
A
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
L
H
 
A
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
G
L
 
P
G
 
G
R
 
V
H
 
H
H
 
R
I
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
E
V
 
V
G
 
E
V
 
A
H
 
T
L
 
L
Q
 
H
T
 
E
A
 
D
N
 
G
R
 
S
A
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
R
N
 
N
V
 
V
E
 
P
S
 
A
D
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
A
 
R
G
 
Q
V
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
P
 
P
G
 
G
Q
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
V
S
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
I
A
 
A
W
 
W
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
F
 
F
F
 
F
L
 
L
T
 
V
S
 
A
D
 
G
V
 
H
P
 
G
A
 
Q
P
 
R
L
 
L
T
 
A
L
 
G
A
 
D
H
 
N
V
 
L
D
 
D
R
 
A
L
 
L
T
 
T
T
 
A
S
 
Y
A
 
T
V
 
V
A
 
A
L
 
V
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
D
Q
 
Q
G
 
D
I
 
I
T
 
R
G
 
G
R
 
E
D
 
D
G
 
G
A
 
G
M
 
A
I
 
I
D
 
D
H
 
H
I
 
I
E
 
E
-
 
L
F
 
F
V
 
A
G
 
D
P
 
D
P
 
P
L
 
H
T
 
A
S
 
D
I
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
S
R
 
R
N
 
N
F
 
F
V
 
V
L
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
K
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
T
A
 
S
A
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
A
C
 
C
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
D
 
K
L
 
L
A
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
Q
T
 
P
W
 
W
I
 
R
Q
 
Q
E
 
A
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
G
S
 
S
T
 
Q
Y
 
F
A
 
E
L
 
G
H
 
R
Y
 
Y
R
 
E
-
 
W
-
 
L
-
 
D
P
 
G
G
 
Q
P
 
P
T
 
G
G
 
G
G
 
P
V
 
I
I
 
V
A
 
P
T
 
T
I
 
I
T
 
R
G
 
G
T
 
R
A
 
A
F
 
H
V
 
V
T
 
S
G
 
A
D
 
E
T
 
A
V
 
T
L
 
L
N
 
L
F
 
L
D
 
A
P
 
D
A
 
D
D
 
D
P
 
P
Y
 
F
R
 
A
A
 
W
G
 
G
I
 
I

4q60A Crystal structure of a 4-hydroxyproline epimerase from burkholderia multivorans atcc 17616, target efi-506586, open form, with bound pyrrole-2-carboxylate
51% identity, 98% coverage: 1:309/314 of query aligns to 9:311/311 of 4q60A

query
sites
4q60A
M
 
I
R
 
Q
V
 
I
I
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
E
P
 
P
T
|
T
R
 
R
L
 
L
I
 
V
L
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
F
P
 
P
D
 
S
L
 
L
G
 
G
D
 
S
G
 
G
S
 
T
L
 
M
T
 
A
D
 
E
R
 
R
A
 
R
H
 
D
R
 
V
L
 
L
F
 
A
R
 
R
D
 
E
H
 
Y
R
 
D
D
 
R
F
 
Y
C
 
R
S
 
T
A
 
A
V
 
C
L
 
I
S
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
S
D
 
D
A
 
V
M
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
C
P
 
E
P
 
P
T
 
V
D
 
S
P
 
P
I
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
Y
 
F
F
 
F
N
 
N
P
 
N
I
 
S
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
G
 
G
M
 
M
C
 
C
G
|
G
H
|
H
A
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
V
A
 
V
A
 
R
S
 
T
L
 
L
H
 
H
H
 
H
L
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
G
L
 
P
G
 
G
R
 
V
H
 
H
H
 
R
I
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
V
G
 
E
V
 
A
H
 
T
L
 
L
Q
 
H
T
 
D
A
 
D
N
 
L
R
 
S
A
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
R
N
|
N
V
 
V
E
 
L
S
 
A
D
 
Y
R
 
R
Y
 
H
R
 
A
A
 
K
G
 
D
V
 
V
A
 
A
V
 
L
E
 
D
V
 
V
P
 
P
G
 
G
Q
 
Y
G
 
G
R
 
P
I
 
V
S
 
R
G
 
G
D
 
D
I
 
I
A
 
A
W
 
W
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
F
 
F
F
 
F
L
 
L
T
 
I
S
 
S
D
 
D
V
 
H
P
 
G
A
 
Q
P
 
R
L
 
V
T
 
A
L
 
G
A
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
A
R
 
A
L
 
L
T
 
T
T
 
A
S
 
Y
A
 
A
V
 
S
A
 
A
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
E
E
 
R
Q
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
A
D
 
N
G
 
G
A
 
G
M
 
E
I
 
I
D
 
D
H
 
H
I
 
I
E
 
E
-
 
L
F
 
F
V
 
A
G
 
D
P
 
D
P
 
P
L
 
E
T
 
H
S
 
D
I
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
S
R
 
R
N
 
S
F
 
F
V
 
V
L
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
L
A
 
-
Y
 
-
D
 
-
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
 
C
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
x
T
A
x
S
A
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
A
C
 
C
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
D
 
K
L
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
A
T
 
V
W
 
W
I
 
R
Q
 
Q
E
 
A
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
G
S
 
S
T
 
V
Y
 
F
A
 
H
L
 
A
H
 
S
Y
 
Y
R
 
V
P
 
Q
G
 
A
P
 
-
T
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
V
A
 
P
T
 
T
I
|
I
T
 
R
G
 
G
T
 
S
A
 
A
F
 
H
V
 
L
T
 
S
G
 
A
D
 
E
T
 
A
V
 
T
L
 
L
N
 
L
F
 
I
D
 
E
P
 
D
A
 
D
D
 
D
P
 
P
Y
 
F
R
 
R
A
 
W
G
 
G
I
 
I
T
 
V

Q2YLF3 4-hydroxyproline epimerase; Hydroxyproline-2-epimerase; HyPRE; EC 5.1.1.8 from Brucella abortus (strain 2308) (see paper)
33% identity, 97% coverage: 4:309/314 of query aligns to 9:331/333 of Q2YLF3

query
sites
Q2YLF3
I
 
V
D
 
D
S
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
C
G
 
G
E
 
N
P
 
P
T
 
V
R
 
R
L
 
L
I
 
V
L
 
A
S
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
N
L
 
L
G
 
N
D
 
G
G
 
S
S
 
T
L
 
M
T
 
M
D
 
E
R
 
K
A
 
R
H
 
A
R
 
H
L
 
F
F
 
L
R
 
A
D
 
E
H
 
Y
R
 
D
D
 
W
F
 
I
C
 
R
S
 
T
A
 
G
V
 
L
L
 
M
S
 
F
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
H
D
 
D
A
 
M
M
 
M
V
 
S
G
 
G
A
 
S
L
 
I
L
 
L
V
 
Y
P
 
P
P
 
P
T
 
T
D
 
R
P
 
P
I
 
D
A
 
C
A
 
D
A
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
L
Y
 
F
F
 
I
N
 
E
P
 
T
I
 
S
G
 
G
P
 
C
L
 
L
G
 
P
M
 
M
C
 
C
G
 
G
H
 
H
A
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
T
A
 
V
A
 
T
S
 
M
L
 
A
H
 
I
H
 
E
L
 
Q
G
 
G
R
 
L
L
 
V
-
 
T
-
 
P
-
 
K
D
 
T
L
 
P
G
 
G
R
 
K
H
 
L
H
 
N
I
 
L
E
 
D
T
 
T
P
 
P
V
 
A
G
 
G
T
 
L
V
 
V
G
 
A
V
 
I
H
 
E
L
 
Y
-
 
E
-
 
Q
-
 
D
-
 
G
Q
 
Q
T
 
Y
A
 
V
N
 
E
R
 
R
A
 
V
A
 
R
V
 
L
E
 
T
N
 
N
V
 
V
E
 
P
S
 
A
D
 
F
R
 
L
Y
 
Y
R
 
A
A
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
E
V
 
V
E
 
E
V
 
C
P
 
P
G
 
D
Q
 
L
G
 
G
R
 
P
I
 
I
S
 
K
G
 
V
D
 
D
I
 
V
A
 
A
W
 
Y
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
F
F
 
Y
F
 
A
L
 
I
T
 
V
S
 
E
D
 
P
V
 
Q
P
 
E
A
 
N
P
 
Y
L
 
T
T
 
D
L
 
M
A
 
D
H
 
D
V
 
Y
D
 
S
R
 
A
L
 
L
T
 
Q
T
 
L
S
 
I
A
 
A
V
 
W
A
 
S
-
 
P
-
 
V
L
 
L
R
 
R
Q
 
Q
A
 
R
L
 
L
A
 
N
E
 
E
Q
 
K
G
 
Y
I
 
K
T
 
F
G
 
Q
R
 
H
-
 
P
-
 
E
-
 
L
-
 
P
D
 
D
G
 
I
A
 
N
M
 
R
I
 
L
D
 
S
H
 
H
I
 
I
E
 
L
F
 
W
V
 
T
G
 
G
P
 
K
P
 
P
L
 
K
T
 
H
S
 
P
I
 
Q
G
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
R
N
 
N
F
 
A
V
 
V
L
 
F
C
 
Y
P
 
G
G
 
D
T
 
K
A
 
A
Y
 
I
D
 
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
T
A
 
S
A
 
A
K
 
R
L
 
M
A
 
A
C
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
K
G
 
G
D
 
K
L
 
L
A
 
K
P
 
P
G
 
C
V
 
D
T
 
E
W
 
F
I
 
I
Q
 
H
E
 
E
S
 
S
V
 
I
I
 
I
S
 
G
S
 
S
T
 
L
Y
 
F
-
 
H
A
 
G
L
 
R
H
 
V
Y
 
E
R
 
R
P
 
A
G
 
A
P
 
E
T
 
V
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
A
V
 
I
I
 
V
A
 
P
T
 
S
I
 
I
T
 
A
G
 
G
T
 
W
A
 
A
F
 
R
V
 
M
T
 
T
G
 
G
D
 
Y
T
 
N
V
 
T
L
 
I
N
 
F
F
 
I
D
 
D
P
 
D
A
 
R
D
 
D
P
 
P
Y
 
F
R
 
A
A
 
H
G
 
G
I
 
F
T
 
S

8a3fAAA Proline racemase A (AsProR)
30% identity, 97% coverage: 4:309/314 of query aligns to 10:334/335 of 8a3fAAA

query
sites
8a3fAAA
I
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
H
T
 
T
G
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
P
T
 
T
R
 
R
L
 
I
I
 
V
L
 
V
S
 
G
G
 
G
G
 
I
P
 
P
D
 
Q
L
 
I
G
 
N
D
 
G
G
 
E
S
 
T
L
 
M
T
 
A
D
 
D
R
 
K
A
 
K
H
 
K
R
 
Y
L
 
L
F
 
-
R
 
E
D
 
D
H
 
N
R
 
L
D
 
D
F
 
Y
C
 
V
-
 
R
S
 
T
A
 
A
V
 
L
L
 
M
S
 
H
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
H
D
 
N
A
 
D
M
 
M
V
x
F
G
 
G
A
 
S
L
 
I
L
 
I
V
 
T
P
 
S
P
 
S
T
 
N
D
 
N
P
 
K
I
 
E
A
 
A
A
 
D
A
 
F
A
 
G
V
 
I
I
 
I
Y
 
F
F
 
M
N
 
D
P
 
G
I
 
G
G
 
G
P
 
Y
L
|
L
G
 
N
M
 
M
C
|
C
G
|
G
H
|
H
A
 
G
T
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
T
S
 
V
L
 
A
H
 
V
H
 
E
L
 
T
G
 
G
R
 
M
L
 
V
D
 
E
L
 
M
-
 
V
-
 
E
-
 
P
-
 
V
G
 
T
R
 
N
H
 
I
H
 
N
I
 
M
E
 
E
T
 
A
P
 
P
V
 
A
G
 
G
T
 
L
V
 
I
G
 
K
V
 
A
H
 
K
L
 
V
Q
 
M
T
 
V
A
 
E
N
 
N
R
 
E
A
 
K
A
 
V
V
 
K
E
 
E
-
 
V
-
 
S
-
 
I
-
 
T
N
 
N
V
 
V
E
 
P
S
 
S
D
 
F
R
 
L
Y
 
Y
R
 
M
A
 
E
G
 
D
V
 
A
A
 
K
V
 
L
E
 
E
V
 
V
P
 
P
G
 
S
Q
 
L
G
 
N
R
 
K
-
 
T
I
 
I
S
 
T
G
 
F
D
 
D
I
 
I
A
 
S
W
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
S
W
 
F
F
 
F
F
 
A
L
 
I
T
 
I
-
 
H
-
 
A
S
 
K
D
 
E
V
 
L
P
 
G
A
 
V
P
 
K
L
 
V
T
 
E
L
 
T
A
 
S
H
 
Q
V
 
V
D
 
D
R
 
V
L
 
L
T
 
K
T
 
K
S
 
L
A
 
G
V
 
I
A
 
E
L
 
I
R
 
R
Q
 
D
A
 
L
L
 
I
A
 
N
E
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
K
-
 
V
Q
 
Q
G
 
H
I
 
P
T
 
E
G
 
L
R
 
E
D
 
H
G
 
I
A
 
K
M
 
T
I
 
V
D
 
D
H
 
L
I
 
V
E
 
E
F
 
I
V
 
Y
G
 
D
P
 
E
P
 
P
L
 
S
T
 
N
S
 
P
I
 
E
G
 
A
H
 
T
A
 
Y
R
 
K
N
 
N
F
 
V
V
 
V
L
 
I
C
x
F
P
 
G
G
 
Q
T
 
G
A
 
Q
Y
 
V
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
|
G
T
|
T
G
 
G
S
 
T
A
 
S
A
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
A
C
 
T
L
 
L
A
 
Y
A
 
K
D
 
K
G
 
G
D
 
H
L
 
L
A
 
K
P
 
I
G
 
D
V
 
E
T
 
K
W
 
F
I
 
V
Q
 
Y
E
 
E
S
 
S
V
 
I
I
 
T
S
 
G
S
 
T
T
 
M
Y
 
F
A
 
K
-
 
G
-
 
R
-
 
V
-
 
L
L
 
E
H
 
E
Y
 
T
R
 
K
P
 
V
G
 
G
P
 
E
T
 
F
G
 
D
G
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
P
T
 
E
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
G
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
D
 
F
T
 
N
V
 
H
L
 
F
N
 
V
F
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
E
D
 
D
P
 
P
Y
 
L
R
 
K
A
 
Y
G
 
G
I
 
F
T
 
T

6hjeA Trypanosoma cruzi proline racemase in complex with inhibitor ng-p27 (see paper)
31% identity, 98% coverage: 4:312/314 of query aligns to 12:356/357 of 6hjeA

query
sites
6hjeA
I
 
I
D
 
D
S
 
M
H
 
H
T
 
T
G
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
A
T
 
A
R
 
R
L
 
I
I
 
V
L
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
L
P
 
P
D
 
H
L
 
I
G
 
P
D
 
G
G
 
S
S
 
N
L
 
M
T
 
A
D
 
E
R
 
K
A
 
K
H
 
A
R
 
Y
L
 
L
F
 
Q
R
 
E
D
 
N
H
 
M
R
 
D
D
 
Y
F
 
L
C
 
R
S
 
R
A
 
G
V
 
I
L
 
M
S
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
H
D
 
D
A
 
D
M
 
M
V
x
F
G
 
G
A
 
A
L
 
F
L
 
L
V
 
F
P
 
D
P
 
P
T
 
I
D
 
E
P
 
E
I
 
G
A
 
A
A
 
D
A
 
L
A
 
G
V
 
I
I
 
V
Y
 
F
F
 
M
N
 
D
P
 
T
I
 
G
G
 
G
P
 
Y
L
|
L
G
 
N
M
|
M
C
|
C
G
|
G
H
|
H
A
 
N
T
 
S
I
 
I
G
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
T
S
 
A
L
 
A
H
 
V
H
 
E
L
 
T
G
 
G
R
 
I
L
 
V
D
 
S
L
 
V
G
 
P
R
 
A
H
 
K
H
 
A
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
V
I
 
L
E
 
D
T
 
T
P
 
P
V
 
A
G
 
G
T
 
L
V
 
V
-
 
R
-
 
G
G
 
T
V
 
A
H
 
H
L
 
L
Q
 
Q
T
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
E
-
 
S
-
 
E
A
 
V
N
 
S
R
 
N
A
 
A
A
 
S
V
 
I
E
 
I
N
 
N
V
 
V
E
 
P
S
 
S
D
 
F
R
 
L
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
Q
G
 
D
V
 
V
A
 
V
V
 
V
E
 
V
V
 
L
P
 
P
G
 
K
-
 
P
Q
 
Y
G
 
G
R
 
E
I
 
V
S
 
R
G
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
W
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
F
F
 
F
F
 
A
L
 
I
T
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
D
L
 
I
T
 
S
L
 
V
A
 
Q
H
 
N
V
 
L
D
 
S
R
 
R
L
 
L
T
 
Q
T
 
E
S
 
A
A
 
G
V
 
E
A
 
L
L
 
L
R
 
R
Q
 
T
A
 
E
L
 
I
A
 
-
E
 
N
Q
 
R
G
 
S
I
 
V
T
 
K
G
 
V
R
 
Q
D
 
H
G
 
P
A
 
Q
M
 
L
-
 
P
-
 
H
-
 
I
-
 
N
-
 
T
I
 
V
D
 
D
H
 
C
I
 
V
E
 
E
F
 
I
V
 
Y
G
 
G
P
 
P
P
 
P
L
 
T
T
 
N
S
 
P
I
 
E
G
 
A
H
 
N
A
 
Y
R
 
K
N
 
N
F
 
V
V
|
V
L
 
I
C
x
F
P
 
G
G
 
N
T
 
R
A
 
Q
Y
 
A
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
|
G
T
|
T
G
 
G
S
 
T
A
 
S
A
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
C
 
T
L
 
L
A
 
Y
A
 
A
D
 
K
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
A
 
R
P
 
I
G
 
G
V
 
E
T
 
T
W
 
F
I
 
V
Q
 
Y
E
 
E
S
 
S
V
 
I
I
 
L
S
 
G
S
 
S
T
 
L
Y
 
F
A
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
V
-
 
L
-
 
G
L
 
E
H
 
E
Y
 
R
R
 
I
P
 
P
G
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
V
P
 
P
T
 
V
G
 
T
G
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
M
-
 
L
-
 
V
V
 
V
I
 
T
A
 
A
T
 
E
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
K
A
 
A
F
 
F
V
 
I
T
 
M
G
 
G
D
 
F
T
 
N
V
 
T
L
 
M
N
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
T
D
 
D
P
 
P
Y
 
F
R
 
K
A
 
N
G
 
G
I
 
F
T
 
T
S
 
L
Q
 
K
E
 
Q

6hjgB Trypanosoma cruzi proline racemase in complex with inhibitor oxopa (see paper)
31% identity, 98% coverage: 4:312/314 of query aligns to 29:373/376 of 6hjgB

query
sites
6hjgB
I
 
I
D
 
D
S
 
M
H
 
H
T
 
T
G
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
A
T
 
A
R
 
R
L
 
I
I
 
V
L
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
L
P
 
P
D
 
H
L
 
I
G
 
P
D
 
G
G
 
S
S
 
N
L
 
M
T
 
A
D
 
E
R
 
K
A
 
K
H
 
A
R
 
Y
L
 
L
F
 
Q
R
 
E
D
 
N
H
 
M
R
 
D
D
 
Y
F
 
L
C
 
R
S
 
R
A
 
G
V
 
I
L
 
M
S
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
H
D
 
D
A
 
D
M
 
M
V
x
F
G
 
G
A
 
A
L
 
F
L
 
L
V
 
F
P
 
D
P
 
P
T
 
I
D
 
E
P
 
E
I
 
G
A
 
A
A
 
D
A
 
L
A
 
G
V
 
I
I
 
V
Y
 
F
F
 
M
N
 
D
P
 
T
I
 
G
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
G
 
N
M
 
M
C
|
C
G
|
G
H
|
H
A
 
N
T
 
S
I
 
I
G
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
T
S
 
A
L
 
A
H
 
V
H
 
E
L
 
T
G
 
G
R
 
I
L
 
V
D
 
S
L
 
V
G
 
P
R
 
A
H
 
K
H
 
A
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
V
I
 
L
E
 
D
T
 
T
P
 
P
V
 
A
G
 
G
T
 
L
V
 
V
-
 
R
-
 
G
G
 
T
V
 
A
H
 
H
L
 
L
Q
 
Q
T
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
E
-
 
S
-
 
E
A
 
V
N
 
S
R
 
N
A
 
A
A
 
S
V
 
I
E
 
I
N
 
N
V
 
V
E
 
P
S
 
S
D
 
F
R
 
L
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
Q
G
 
D
V
 
V
A
 
V
V
 
V
E
 
V
V
 
L
P
 
P
G
 
K
-
 
P
Q
 
Y
G
 
G
R
 
E
I
 
V
S
 
R
G
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
W
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
F
F
 
F
F
 
A
L
 
I
T
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
D
L
 
I
T
 
S
L
 
V
A
 
Q
H
 
N
V
 
L
D
 
S
R
 
R
L
 
L
T
 
Q
T
 
E
S
 
A
A
 
G
V
 
E
A
 
L
L
 
L
R
 
R
Q
 
T
A
 
E
L
 
I
A
 
-
E
 
N
Q
 
R
G
 
S
I
 
V
T
 
K
G
 
V
R
 
Q
D
 
H
G
 
P
A
 
Q
M
 
L
-
 
P
-
 
H
-
 
I
-
 
N
-
 
T
I
 
V
D
 
D
H
 
C
I
 
V
E
 
E
F
 
I
V
 
Y
G
 
G
P
 
P
P
 
P
L
 
T
T
 
N
S
 
P
I
 
E
G
 
A
H
 
N
A
 
Y
R
 
K
N
 
N
F
 
V
V
 
V
L
 
I
C
 
F
P
 
G
G
 
N
T
 
R
A
 
Q
Y
 
A
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
|
G
T
|
T
G
 
G
S
 
T
A
 
S
A
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
C
 
T
L
 
L
A
 
Y
A
 
A
D
 
K
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
A
 
R
P
 
I
G
 
G
V
 
E
T
 
T
W
 
F
I
 
V
Q
 
Y
E
 
E
S
 
S
V
 
I
I
 
L
S
 
G
S
 
S
T
 
L
Y
 
F
A
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
V
-
 
L
-
 
G
L
 
E
H
 
E
Y
 
R
R
 
I
P
 
P
G
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
V
P
 
P
T
 
V
G
 
T
G
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
M
-
 
L
-
 
V
V
 
V
I
 
T
A
 
A
T
 
E
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
K
A
 
A
F
 
F
V
 
I
T
 
M
G
 
G
D
 
F
T
 
N
V
 
T
L
 
M
N
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
T
D
 
D
P
 
P
Y
 
F
R
 
K
A
 
N
G
 
G
I
 
F
T
 
T
S
 
L
Q
 
K
E
 
Q

1w61A Proline racemase in complex with 2 molecules of pyrrole-2- carboxylic acid (holo form) (see paper)
31% identity, 98% coverage: 4:312/314 of query aligns to 8:352/353 of 1w61A

query
sites
1w61A
I
 
I
D
 
D
S
 
M
H
 
H
T
 
T
G
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
A
T
 
A
R
 
R
L
 
I
I
 
V
L
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
L
P
 
P
D
 
H
L
 
I
G
 
P
D
 
G
G
 
S
S
 
N
L
 
M
T
 
A
D
 
E
R
 
K
A
 
K
H
 
A
R
 
Y
L
 
L
F
 
Q
R
 
E
D
 
N
H
 
M
R
 
D
D
 
Y
F
 
L
C
 
R
S
 
R
A
 
G
V
 
I
L
 
M
S
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
H
D
 
D
A
 
D
M
 
M
V
x
F
G
 
G
A
 
A
L
 
F
L
 
L
V
 
F
P
 
D
P
 
P
T
 
I
D
 
E
P
 
E
I
 
G
A
 
A
A
 
D
A
 
L
A
 
G
V
 
I
I
 
V
Y
 
F
F
 
M
N
 
D
P
 
T
I
 
G
G
 
G
P
 
Y
L
|
L
G
 
N
M
 
M
C
|
C
G
|
G
H
|
H
A
 
N
T
 
S
I
 
I
G
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
T
S
 
A
L
 
A
H
 
V
H
 
E
L
 
T
G
 
G
R
 
I
L
 
V
D
 
S
L
 
V
G
 
P
R
 
A
H
 
K
H
 
A
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
V
I
 
L
E
 
D
T
 
T
P
 
P
V
 
A
G
 
G
T
 
L
V
 
V
-
 
R
-
 
G
G
 
T
V
 
A
H
 
H
L
 
L
Q
 
Q
T
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
E
-
 
S
-
 
E
A
 
V
N
 
S
R
 
N
A
 
A
A
 
S
V
 
I
E
 
I
N
 
N
V
 
V
E
 
P
S
 
S
D
 
F
R
 
L
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
Q
G
 
D
V
 
V
A
 
V
V
 
V
E
 
V
V
 
L
P
 
P
G
 
K
-
 
P
Q
 
Y
G
 
G
R
 
E
I
 
V
S
 
R
G
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
W
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
F
F
 
F
F
 
A
L
 
I
T
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
D
L
 
I
T
 
S
L
 
V
A
 
Q
H
 
N
V
 
L
D
 
S
R
 
R
L
 
L
T
 
Q
T
 
E
S
 
A
A
 
G
V
 
E
A
 
L
L
 
L
R
 
R
Q
 
T
A
 
E
L
 
I
A
 
-
E
 
N
Q
 
R
G
 
S
I
 
V
T
 
K
G
 
V
R
 
Q
D
 
H
G
 
P
A
 
Q
M
 
L
-
 
P
-
 
H
-
 
I
-
 
N
-
 
T
I
 
V
D
 
D
H
 
C
I
 
V
E
 
E
F
 
I
V
 
Y
G
 
G
P
 
P
P
 
P
L
 
T
T
 
N
S
 
P
I
 
E
G
 
A
H
 
N
A
 
Y
R
 
K
N
 
N
F
 
V
V
 
V
L
 
I
C
x
F
P
 
G
G
 
N
T
 
R
A
 
Q
Y
 
A
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
|
G
T
|
T
G
 
G
S
 
T
A
 
S
A
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
C
 
T
L
 
L
A
 
Y
A
 
A
D
 
K
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
A
 
R
P
 
I
G
 
G
V
 
E
T
 
T
W
 
F
I
 
V
Q
 
Y
E
 
E
S
 
S
V
 
I
I
 
L
S
 
G
S
 
S
T
 
L
Y
 
F
A
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
V
-
 
L
-
 
G
L
 
E
H
 
E
Y
 
R
R
 
I
P
 
P
G
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
V
P
 
P
T
 
V
G
 
T
G
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
M
-
 
L
-
 
V
V
 
V
I
 
T
A
 
A
T
 
E
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
K
A
 
A
F
 
F
V
 
I
T
 
M
G
 
G
D
 
F
T
 
N
V
 
T
L
 
M
N
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
T
D
 
D
P
 
P
Y
 
F
R
 
K
A
 
N
G
 
G
I
 
F
T
 
T
S
 
L
Q
 
K
E
 
Q

Q4DA80 Proline racemase A; TcPA45-A; TcPRACA; rTcPA45; EC 5.1.1.4 from Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (see 2 papers)
31% identity, 98% coverage: 4:312/314 of query aligns to 79:423/423 of Q4DA80

query
sites
Q4DA80
I
 
I
D
 
D
S
 
M
H
 
H
T
 
T
G
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
A
T
 
A
R
 
R
L
 
I
I
 
V
L
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
L
P
 
P
D
 
H
L
 
I
G
 
P
D
 
G
G
 
S
S
 
N
L
 
M
T
 
A
D
 
E
R
 
K
A
 
K
H
 
A
R
 
Y
L
 
L
F
 
Q
R
 
E
D
 
N
H
 
M
R
 
D
D
 
Y
F
 
L
C
 
R
S
 
R
A
 
G
V
 
I
L
 
M
S
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
H
D
 
D
A
 
D
M
 
M
V
 
F
G
 
G
A
 
A
L
 
F
L
 
L
V
 
F
P
 
D
P
 
P
T
 
I
D
 
E
P
 
E
I
 
G
A
 
A
A
 
D
A
 
L
A
 
G
V
 
M
I
 
V
Y
 
F
F
 
M
N
 
D
P
 
T
I
 
G
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
G
 
N
M
 
M
C
|
C
G
 
G
H
 
H
A
 
N
T
 
S
I
 
I
G
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
T
S
 
A
L
 
A
H
 
V
H
 
E
L
 
T
G
 
G
R
 
I
L
 
V
D
 
S
L
 
V
G
 
P
R
 
A
H
 
K
H
 
A
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
V
I
 
L
E
 
D
T
 
T
P
 
P
V
 
A
G
 
G
T
 
L
V
 
V
-
 
R
-
 
G
G
 
T
V
 
A
H
 
H
L
 
L
Q
 
Q
T
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
E
-
 
S
-
 
E
A
 
V
N
 
S
R
 
N
A
 
A
A
 
S
V
 
I
E
 
I
N
 
N
V
 
V
E
 
P
S
 
S
D
 
F
R
 
L
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
Q
G
 
D
V
 
V
A
 
V
V
 
V
E
 
V
V
 
L
P
 
P
G
 
K
-
 
P
Q
 
Y
G
 
G
R
 
E
I
 
V
S
 
R
G
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
W
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
F
F
 
F
F
 
A
L
 
I
T
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
D
L
 
I
T
 
S
L
 
V
A
 
Q
H
 
N
V
 
L
D
 
S
R
 
R
L
 
L
T
 
Q
T
 
E
S
 
A
A
 
G
V
 
E
A
 
L
L
 
L
R
 
R
Q
 
T
A
 
E
L
 
I
A
 
-
E
 
N
Q
 
R
G
 
S
I
 
V
T
 
K
G
 
V
R
 
Q
D
 
H
G
 
P
A
 
Q
M
 
L
-
 
P
-
 
H
-
 
I
-
 
N
-
 
T
I
 
V
D
 
D
H
 
C
I
 
V
E
 
E
F
 
I
V
 
Y
G
 
G
P
 
P
P
 
P
L
 
T
T
 
N
S
 
P
I
 
E
G
 
A
H
 
N
A
 
Y
R
 
K
N
 
N
F
 
V
V
 
V
L
 
I
C
 
F
P
 
G
G
 
N
T
 
R
A
 
Q
Y
 
A
D
 
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
T
A
 
S
A
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
C
 
T
L
 
L
A
 
Y
A
 
A
D
 
K
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
A
 
R
P
 
I
G
 
G
V
 
E
T
 
T
W
 
F
I
 
V
Q
 
Y
E
 
E
S
 
S
V
 
I
I
 
L
S
 
G
S
 
S
T
 
L
Y
 
F
A
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
V
-
 
L
-
 
G
L
 
E
H
 
E
Y
 
R
R
 
I
P
 
P
G
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
V
P
 
P
T
 
V
G
 
T
G
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
M
-
 
L
-
 
V
V
 
V
I
 
T
A
 
A
T
 
E
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
K
A
 
A
F
 
F
V
 
I
T
 
M
G
 
G
D
 
F
T
 
N
V
 
T
L
 
M
N
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
T
D
 
D
P
 
P
Y
 
F
R
 
K
A
 
N
G
 
G
I
 
F
T
 
T
S
 
L
Q
 
K
E
 
Q

6j7cA Crystal structure of proline racemase-like protein from thermococcus litoralis in complex with proline (see paper)
32% identity, 95% coverage: 3:300/314 of query aligns to 9:323/331 of 6j7cA

query
sites
6j7cA
V
 
V
I
 
V
D
 
D
S
 
T
H
 
H
T
 
T
G
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
P
T
 
T
R
 
R
L
 
I
I
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
V
P
 
N
D
 
V
L
 
K
G
 
G
D
 
E
G
 
D
S
 
I
L
 
I
T
 
E
D
 
K
R
 
R
A
 
E
H
 
Y
R
 
-
L
 
-
F
 
F
R
 
K
D
 
E
H
 
H
R
 
Y
D
 
D
F
 
W
C
 
I
-
 
R
S
 
T
A
 
A
V
 
L
L
 
L
S
 
H
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
H
D
 
S
A
 
D
M
 
Q
V
 
F
G
 
G
A
 
A
L
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
P
P
 
-
T
 
-
D
 
S
P
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
F
A
 
G
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
F
 
M
N
 
D
P
 
T
I
 
S
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
G
 
D
M
 
M
C
|
C
G
|
G
H
|
H
A
 
A
T
 
T
I
 
M
G
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
T
S
 
V
L
 
L
H
 
V
H
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
I
L
 
I
D
 
E
L
 
K
G
 
K
R
 
E
H
 
P
H
 
Y
-
 
T
-
 
T
-
 
V
-
 
K
I
 
L
E
 
E
T
 
T
P
 
P
V
 
A
G
 
G
T
 
L
V
 
V
G
 
E
V
 
A
H
 
K
L
 
A
Q
 
K
T
 
V
A
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
V
N
 
V
R
 
K
A
 
E
A
 
V
V
 
T
E
 
V
N
 
V
V
 
D
E
 
V
S
 
P
D
 
S
R
 
F
Y
 
Y
R
 
V
A
 
G
G
 
E
V
 
F
A
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
Y
P
 
P
G
 
G
Q
 
R
G
 
G
R
 
K
I
 
I
S
 
K
G
 
V
D
 
D
I
 
V
A
 
A
W
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
F
F
 
Y
F
 
V
L
 
I
T
 
A
S
 
D
-
 
A
-
 
R
D
 
D
V
 
L
P
 
G
A
 
L
P
 
R
L
 
V
T
 
R
L
 
R
A
 
E
H
 
Y
V
 
I
D
 
K
R
 
E
L
 
L
T
 
I
T
 
P
S
 
T
A
 
A
V
 
L
A
 
K
L
 
L
R
 
I
Q
 
K
A
 
V
L
 
A
A
 
N
E
 
E
Q
 
Q
-
 
I
-
 
K
-
 
V
-
 
Q
-
 
H
-
 
P
-
 
R
-
 
K
G
 
G
I
 
V
T
 
Q
G
 
N
R
 
R
D
 
-
G
 
-
A
 
-
M
 
-
I
 
I
D
 
N
H
 
L
I
 
A
E
 
M
F
 
L
V
 
T
G
 
D
P
 
E
P
 
P
L
 
E
T
 
R
S
 
E
I
 
D
G
 
S
H
 
D
A
 
G
R
 
K
N
 
N
F
 
V
V
 
V
L
 
I
C
x
W
P
 
G
G
 
E
T
 
G
A
 
S
Y
 
V
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
|
G
T
|
T
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
S
K
 
R
L
 
V
A
 
A
C
 
T
L
 
L
A
 
Y
A
 
S
D
 
K
G
 
G
D
 
I
L
 
L
A
 
K
P
 
E
G
 
G
V
 
D
T
 
I
W
 
F
I
 
V
Q
 
H
E
 
E
S
 
S
V
 
I
I
 
L
S
 
G
S
 
T
T
 
Q
Y
 
F
A
 
R
L
 
I
H
 
K
Y
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
T
-
 
T
R
 
K
P
 
I
G
 
G
P
 
E
T
 
Y
G
 
T
G
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
P
T
 
E
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
K
-
 
I
-
 
S
-
 
Q
D
 
D
T
 
I
V
 
I
L
 
S
N
 
K
F
 
N
D
 
D
P
 
P

6r77A Crystal structure of trans-3-hydroxy-l-proline dehydratase in complex with substrate - closed conformation (see paper)
26% identity, 98% coverage: 1:308/314 of query aligns to 20:345/348 of 6r77A

query
sites
6r77A
M
 
I
R
 
K
V
 
T
I
 
L
D
 
D
S
 
T
H
 
H
T
 
T
G
 
A
G
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
L
R
 
R
L
 
I
I
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
F
P
 
P
D
 
E
L
 
I
G
 
P
D
 
G
G
 
K
S
 
T
L
 
I
T
 
L
D
 
E
R
 
K
A
 
R
H
 
R
R
 
Y
L
 
L
F
 
M
R
 
E
D
 
N
H
 
L
R
 
D
D
 
H
F
 
L
C
 
R
S
 
K
A
 
A
V
 
L
L
 
M
S
 
W
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
H
D
 
A
A
 
D
M
 
M
V
x
Y
G
 
G
A
 
A
L
 
I
L
 
I
V
 
T
P
 
E
P
 
P
T
 
V
D
 
S
P
 
E
I
 
E
A
 
A
A
 
D
A
 
F
A
 
G
V
 
V
I
 
I
Y
 
F
F
 
M
N
 
H
P
 
N
I
 
E
G
 
G
P
 
Y
L
 
S
G
 
T
M
 
M
C
|
C
G
|
G
H
|
H
A
 
A
T
 
T
I
 
I
G
 
A
A
 
L
A
 
G
A
 
K
S
 
V
L
 
A
H
 
V
H
 
E
L
 
C
G
 
G
R
 
L
L
 
V
D
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
P
L
 
I
G
 
T
R
 
E
H
 
I
H
 
K
I
 
M
E
 
D
T
 
S
P
 
P
V
 
A
G
 
G
T
 
L
V
 
I
G
 
K
V
 
I
H
 
Y
L
 
V
Q
 
K
T
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
G
-
 
K
A
 
V
N
 
E
R
 
K
A
 
V
A
 
Y
V
 
F
E
 
H
N
 
N
V
 
V
E
 
P
S
 
S
D
 
F
R
 
V
Y
 
L
R
 
F
A
 
K
G
 
D
V
 
E
A
 
T
V
 
I
E
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
Q
 
I
G
 
G
R
 
E
I
 
V
S
 
K
G
 
Y
D
 
D
I
 
L
A
 
A
W
 
Y
G
 
G
G
 
G
N
 
A
W
 
F
F
x
Y
F
 
A
L
 
F
T
 
V
S
 
N
-
 
A
-
 
E
D
 
E
V
 
I
P
 
G
A
 
L
P
 
K
L
 
C
T
 
T
L
 
P
A
 
E
H
 
Y
V
 
Y
D
 
R
R
 
Q
L
 
L
T
 
I
T
 
D
S
 
V
A
 
G
V
 
M
A
 
K
L
 
I
R
 
K
Q
 
R
A
 
A
-
 
I
L
 
M
A
 
S
E
 
E
Q
 
K
G
 
E
I
 
I
T
 
R
-
 
H
-
 
P
-
 
F
G
 
E
R
 
E
D
 
D
G
 
L
A
 
S
M
 
F
I
 
L
D
x
Y
H
 
G
I
 
T
E
 
I
F
 
F
V
 
I
G
 
G
P
 
E
P
 
P
L
 
E
T
 
D
S
 
E
I
 
N
G
 
S
H
 
H
A
 
S
R
 
R
N
 
H
F
 
V
V
 
C
L
 
I
C
x
F
P
 
A
G
 
D
T
 
G
A
 
E
Y
 
V
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
x
T
G
|
G
T
|
T
G
 
G
S
 
V
A
 
S
A
 
A
K
 
R
L
 
L
A
 
A
C
 
I
L
 
L
A
 
Y
A
 
E
D
 
K
G
 
G
D
 
E
L
 
I
A
 
D
P
 
I
G
 
G
V
 
E
T
 
E
W
 
I
I
 
T
Q
 
I
E
 
E
S
 
S
V
 
I
I
 
I
S
 
G
S
 
T
T
 
K
Y
 
F
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
V
A
 
V
L
 
E
H
 
E
Y
 
T
R
 
R
P
 
Y
G
 
G
P
 
L
T
 
Y
G
 
R
G
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
P
T
 
E
I
 
V
T
 
G
G
 
G
T
 
N
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
V
G
 
A
D
 
K
T
 
N
V
 
T
L
 
F
N
 
L
F
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
Q
D
 
D
P
 
P
Y
 
L
R
 
K
A
 
Y
G
 
G
I
 
F

B9K4G4 Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase; T3LHyp dehydratase; t3HypD; Trans-L-3-hydroxyproline dehydratase; EC 4.2.1.77 from Allorhizobium ampelinum (strain ATCC BAA-846 / DSM 112012 / S4) (Agrobacterium vitis (strain S4)) (see paper)
30% identity, 100% coverage: 1:314/314 of query aligns to 7:339/342 of B9K4G4

query
sites
B9K4G4
M
 
I
R
 
H
V
 
V
I
 
I
D
 
G
S
 
V
H
 
H
T
 
A
G
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
V
T
 
G
R
 
D
L
 
V
I
 
I
L
 
V
S
 
G
G
 
G
-
 
V
G
 
S
P
 
P
D
 
P
L
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
-
S
 
T
L
 
L
T
 
W
D
 
E
R
 
Q
A
 
S
H
 
R
R
 
F
L
 
I
F
 
A
R
 
S
D
 
D
H
 
E
-
 
T
-
 
L
R
 
R
D
 
N
F
 
F
C
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
V
L
 
L
S
 
N
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
G
D
 
V
A
 
F
M
 
R
V
 
H
G
 
V
A
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
P
 
P
T
 
K
D
 
D
P
 
P
I
 
R
A
 
A
A
 
Q
A
 
M
A
 
G
V
 
F
I
 
I
Y
 
I
F
 
M
N
 
E
P
 
P
I
 
A
G
 
D
P
 
T
L
 
P
G
 
P
M
 
M
C
 
S
G
|
G
H
x
S
A
 
N
T
 
S
I
 
I
G
 
C
A
 
V
A
 
S
A
 
T
S
 
A
L
 
I
H
 
L
H
 
D
L
 
S
G
 
G
R
 
I
L
 
I
D
 
S
-
 
M
-
 
Q
-
 
E
-
 
P
L
 
L
G
 
T
R
 
H
H
 
M
H
 
V
I
 
L
E
 
E
T
 
A
P
 
P
V
 
G
G
 
G
T
 
V
V
 
I
G
 
E
V
 
V
H
 
T
L
 
A
Q
 
E
T
 
C
A
 
A
N
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
E
R
 
R
A
 
I
A
 
N
V
 
V
E
 
L
N
 
N
V
 
V
E
 
A
S
 
S
D
 
F
R
 
V
Y
 
T
R
 
R
A
 
L
G
 
A
V
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
E
V
 
V
P
 
E
G
 
G
Q
 
L
G
 
G
R
 
T
I
 
L
S
 
T
G
 
V
D
 
D
I
 
T
A
 
A
W
 
Y
G
 
G
G
 
G
N
 
D
W
 
S
F
 
F
F
 
V
L
 
I
T
 
V
S
 
D
D
 
A
V
 
I
P
 
G
A
 
L
P
 
G
L
 
F
T
 
S
L
 
L
A
 
K
-
 
P
-
 
D
H
 
E
V
 
A
D
 
R
R
 
E
L
 
L
T
 
A
T
 
E
S
 
L
A
 
G
V
 
M
A
 
K
L
 
I
R
 
T
Q
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
N
E
 
E
Q
 
Q
-
 
L
G
 
G
I
 
F
T
 
V
G
 
H
R
 
P
D
 
C
G
 
N
A
 
A
M
 
D
I
 
W
D
 
N
H
 
H
I
 
I
E
 
S
F
 
F
-
 
C
-
 
Q
V
 
M
G
 
T
P
 
T
P
 
P
L
 
I
T
 
T
S
 
R
-
 
E
-
 
N
-
 
G
I
 
I
G
 
L
H
 
T
A
 
G
R
 
K
N
 
S
F
 
A
V
 
V
L
 
A
C
 
I
P
 
R
G
 
P
T
 
G
A
 
K
Y
 
I
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
 
T
G
|
G
T
|
T
G
 
G
S
 
C
A
 
S
A
 
A
K
 
R
L
 
L
A
 
A
C
 
V
L
 
M
A
 
H
A
 
A
D
 
R
G
 
G
D
 
E
L
 
I
A
 
G
P
 
I
G
 
G
V
 
E
T
 
T
W
 
Y
I
 
I
Q
 
G
E
 
R
S
 
S
V
 
I
I
 
I
S
 
D
S
 
S
T
 
E
Y
 
F
A
 
K
L
 
C
H
 
H
Y
 
I
-
 
D
-
 
S
-
 
L
-
 
T
R
 
E
P
 
I
G
 
G
P
 
G
T
 
L
G
 
S
G
 
A
V
 
I
I
 
R
A
 
P
T
 
V
I
 
I
T
 
S
G
 
G
T
 
R
A
 
A
F
 
W
V
 
I
T
 
T
G
 
G
D
 
V
T
 
S
V
 
Q
L
 
L
N
 
M
F
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
T
D
 
D
P
 
P
Y
 
W
R
 
P
A
 
S
G
 
G
I
 
Y
T
 
Q
S
 
L
Q
 
S
E
 
D
V
 
T
Y
 
W

4k7gD Crystal structure of a 3-hydroxyproline dehydratse from agrobacterium vitis, target efi-506470, with bound pyrrole 2-carboxylate, ordered active site
30% identity, 100% coverage: 1:314/314 of query aligns to 17:349/352 of 4k7gD

query
sites
4k7gD
M
 
I
R
 
H
V
 
V
I
 
I
D
 
G
S
 
V
H
 
H
T
 
A
G
 
E
G
 
G
E
|
E
P
 
V
T
 
G
R
 
D
L
 
V
I
 
I
L
 
V
S
 
G
G
 
G
-
 
V
G
 
S
P
 
P
D
 
P
L
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
-
S
 
T
L
 
L
T
 
W
D
 
E
R
 
Q
A
 
S
H
 
R
R
 
F
L
 
I
F
 
A
R
 
S
D
 
D
H
 
E
-
 
T
-
 
L
R
 
R
D
 
N
F
 
F
C
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
V
L
 
L
S
 
N
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
G
D
 
V
A
 
F
M
 
R
V
x
H
G
 
V
A
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P