SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF5312 FitnessBrowser__WCS417:GFF5312 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P0A6C5 Amino-acid acetyltransferase; N-acetylglutamate synthase; AGS; NAGS; EC 2.3.1.1 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
51% identity, 99% coverage: 3:429/433 of query aligns to 8:438/443 of P0A6C5

query
sites
P0A6C5
D
 
E
Y
 
L
V
 
V
N
 
E
W
 
G
L
 
F
R
 
R
H
|
H
A
 
S
S
 
V
P
 
P
Y
|
Y
I
 
I
N
 
N
A
 
T
H
 
H
R
 
R
D
 
G
C
 
K
T
 
T
F
 
F
V
 
V
V
 
I
M
 
M
L
 
L
P
 
G
G
 
G
D
 
E
G
 
A
V
 
I
E
 
E
H
 
H
P
 
E
N
 
N
F
 
F
G
 
S
N
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
D
 
D
L
 
I
V
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
H
S
|
S
L
 
L
G
 
G
V
 
I
R
|
R
L
 
L
V
 
V
L
 
V
V
 
V
H
 
Y
G
 
G
S
 
A
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
E
 
D
A
 
A
R
 
N
L
 
L
E
 
A
A
 
A
R
 
H
G
 
H
L
 
H
T
 
E
P
 
P
A
 
L
Y
 
Y
H
 
H
E
 
K
G
 
N
L
 
I
R
 
R
I
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
A
A
 
K
T
 
T
L
 
L
E
 
E
C
 
L
V
 
V
I
 
K
D
 
Q
A
 
A
V
 
A
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
R
 
Q
I
 
L
A
 
D
I
 
I
E
 
T
A
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
S
M
 
M
D
 
S
M
 
L
A
 
N
S
 
N
S
 
T
P
 
P
M
 
L
Q
 
Q
G
 
G
S
 
A
R
 
H
L
 
I
R
 
N
V
 
V
A
 
V
S
 
S
G
 
G
N
 
N
L
 
F
V
 
I
T
 
I
A
 
A
R
 
Q
P
 
P
I
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
D
E
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
H
 
C
H
 
H
T
 
S
G
 
G
E
 
R
V
 
I
R
 
R
R
 
R
V
 
I
D
 
D
R
 
E
K
 
D
G
 
A
I
 
I
N
 
H
R
 
R
L
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
S
R
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
L
 
M
S
 
G
P
 
P
L
 
V
G
 
A
Y
 
V
S
 
S
P
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
S
F
 
F
N
 
N
L
 
L
A
 
T
C
 
S
E
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
T
 
T
R
 
Q
A
 
L
A
 
A
I
 
I
D
 
K
L
 
L
G
 
K
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
G
F
 
F
G
 
C
A
 
S
D
 
S
M
 
Q
G
 
G
L
 
V
I
 
T
D
 
N
E
 
D
N
 
D
G
 
G
R
 
D
L
 
I
V
 
V
R
 
S
E
 
E
L
 
L
R
 
F
P
 
P
Q
 
N
Q
 
E
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
R
V
 
V
P
 
E
A
 
A
H
 
Q
L
 
E
Q
 
E
R
 
K
L
 
G
G
 
D
S
 
Y
S
 
N
N
 
S
Y
 
G
Q
 
T
A
 
V
E
 
R
L
 
F
L
 
L
D
 
R
A
 
G
A
 
A
A
 
V
E
 
K
A
 
A
C
 
C
R
 
R
G
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
R
R
 
R
S
 
C
H
 
H
I
 
L
V
 
I
S
 
S
Y
 
Y
A
 
Q
E
 
E
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
Q
E
 
E
L
 
L
F
 
F
T
 
S
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
I
G
|
G
T
 
T
L
 
Q
V
 
I
A
 
V
Q
 
M
E
 
E
Q
 
S
F
 
A
E
 
E
L
 
Q
V
 
I
R
 
R
E
 
R
A
 
A
A
 
T
I
 
I
E
 
N
D
 
D
V
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
I
L
 
L
D
 
E
L
 
L
I
 
I
S
 
R
P
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
R
S
 
S
R
 
R
E
 
E
V
 
Q
L
 
L
E
 
E
R
 
M
E
 
E
I
 
I
E
 
D
Q
 
K
F
 
F
S
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
Q
R
 
R
E
 
D
G
 
N
M
 
T
I
 
T
I
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
P
I
 
F
A
 
P
D
 
E
S
 
E
N
 
K
A
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
M
A
 
A
C
 
C
L
 
V
A
 
A
V
 
V
N
 
H
P
 
P
E
 
D
Y
 
Y
R
 
R
H
 
S
G
 
S
A
 
S
R
 
R
G
 
G
D
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
A
S
 
A
R
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
K
 
S
T
 
K
L
 
L
F
 
F
V
 
V
L
 
L
T
 
T
T
 
T
R
 
R
T
 
S
A
 
I
H
 
H
W
 
W
F
 
F
R
 
Q
E
 
E
R
 
R
G
 
G
F
 
F
E
 
T
P
 
P
S
 
V
S
 
D
V
 
I
D
 
D
R
 
L
L
 
L
P
 
P
S
 
E
A
 
S
R
 
K
A
 
K
S
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
Y
Q
|
Q
R
 
R
N
 
K
S
 
S
K
 
K
I
 
V
F
 
L

4i49A Structure of ngnags bound with bisubstrate analog coa-NAG (see paper)
39% identity, 99% coverage: 4:433/433 of query aligns to 3:422/424 of 4i49A

query
sites
4i49A
Y
 
F
V
 
V
N
 
A
W
 
H
L
 
F
R
 
R
H
 
E
A
 
A
S
 
A
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
N
 
R
A
 
Q
H
 
M
R
 
R
D
 
G
C
 
T
T
 
T
F
 
L
V
 
V
V
 
A
M
 
G
L
 
I
P
 
D
G
 
G
D
 
R
G
 
L
V
 
L
E
 
E
H
 
G
P
 
G
N
 
T
F
 
L
G
 
N
N
 
K
I
 
L
V
 
A
H
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
S
S
 
Q
L
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
I
H
 
H
G
 
G
S
 
A
R
 
Y
P
 
H
Q
 
F
I
 
L
E
 
D
A
 
R
R
 
L
L
 
A
E
 
A
A
 
A
R
 
Q
G
 
G
L
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
H
Y
 
Y
H
 
C
E
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
I
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
T
T
 
S
L
 
L
E
 
G
C
 
Q
V
 
A
I
 
Q
D
 
Q
A
 
F
V
 
A
G
 
G
Q
 
T
L
 
V
R
 
R
I
 
S
A
 
R
I
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
A
L
 
L
S
 
C
M
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
S
 
-
S
 
-
P
 
-
M
 
-
Q
 
-
G
 
G
S
 
S
R
 
S
L
 
V
R
 
P
V
 
L
A
 
V
S
 
S
G
 
G
N
 
N
L
 
F
V
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
R
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
I
E
 
D
G
 
G
V
 
T
D
 
D
Y
 
M
H
 
E
H
 
Y
T
 
A
G
 
G
E
 
V
V
 
I
R
 
R
R
 
K
V
 
T
D
 
D
R
 
T
K
 
A
G
 
A
I
 
L
N
 
R
R
 
F
L
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
A
R
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
V
L
 
W
L
 
M
S
 
P
P
 
P
L
 
L
G
 
G
Y
 
H
S
 
S
P
 
Y
T
 
G
G
 
G
E
 
K
I
 
T
F
 
F
N
 
N
L
 
L
A
 
D
C
 
M
E
 
V
D
 
Q
V
 
A
A
 
A
T
 
A
R
 
S
A
 
V
A
 
A
I
 
V
D
 
S
L
 
L
G
 
Q
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
V
L
 
Y
F
 
L
G
 
T
A
 
L
D
 
S
M
 
D
G
 
G
L
 
I
I
 
S
D
 
R
E
 
P
N
 
D
G
 
G
R
 
T
L
 
L
V
 
A
R
 
E
E
 
T
L
 
L
R
 
S
P
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
A
P
 
Q
A
 
S
H
 
L
L
 
A
Q
 
E
R
 
H
L
 
A
G
 
A
S
 
S
S
 
E
N
 
T
Y
 
R
Q
 
R
A
 
-
E
 
-
L
 
L
L
 
I
D
 
S
A
 
S
A
 
A
A
 
V
E
 
A
A
 
A
C
 
L
R
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
H
R
 
R
S
 
V
H
 
Q
I
 
I
V
 
L
S
 
N
Y
 
G
A
 
A
E
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
S
L
 
L
L
 
L
T
 
Q
E
 
E
L
 
L
F
 
F
T
 
T
R
 
R
D
 
N
G
 
G
G
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
S
V
 
I
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
Q
 
A
F
 
F
E
 
V
L
 
S
V
 
I
R
 
R
E
 
Q
A
 
A
A
 
H
I
 
S
E
 
G
D
 
D
V
 
I
G
 
P
G
 
H
L
 
I
L
 
A
D
 
A
L
 
L
I
 
I
S
 
R
P
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
|
I
L
|
L
V
x
L
R
 
H
R
|
R
S
 
S
R
 
R
E
 
E
V
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
N
E
 
H
I
 
I
E
 
S
Q
 
E
F
 
F
S
 
S
V
 
I
V
 
L
E
 
E
R
 
H
E
 
D
G
 
G
M
 
N
I
 
L
I
 
Y
A
 
G
C
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
K
Q
 
T
I
 
F
A
 
A
D
 
E
S
 
A
N
 
D
A
 
C
G
 
G
E
 
E
L
 
I
A
|
A
C
|
C
L
|
L
A
|
A
V
|
V
N
 
S
P
 
P
E
 
Q
Y
 
A
R
x
Q
H
x
D
G
 
G
A
x
G
R
 
Y
G
|
G
D
x
E
V
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
A
R
 
H
I
 
I
E
 
I
S
 
D
R
 
K
A
 
A
R
 
R
A
 
G
Q
 
I
G
 
G
L
 
I
K
 
S
T
 
R
L
 
L
F
 
F
V
 
A
L
|
L
T
x
S
T
 
T
R
 
N
T
|
T
A
 
G
H
 
E
W
|
W
F
|
F
R
 
A
E
 
E
R
 
R
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
P
 
T
S
 
A
S
 
S
V
 
E
D
 
D
R
 
E
L
 
L
P
 
P
S
 
E
A
 
T
R
 
R
A
 
R
S
 
K
L
 
D
Y
 
Y
N
 
R
Y
 
S
Q
 
N
-
 
G
R
|
R
N
 
N
S
|
S
K
 
H
I
 
I
F
 
L
E
 
V
K
 
R
A
 
R
L
 
L

3d2mA Crystal structure of n-acetylglutamate synthase from neisseria gonorrhoeae complexed with coenzyme a and l-glutamate (see paper)
39% identity, 99% coverage: 4:433/433 of query aligns to 3:422/424 of 3d2mA

query
sites
3d2mA
Y
 
F
V
 
V
N
 
A
W
 
H
L
 
F
R
 
R
H
 
E
A
 
A
S
 
A
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
N
 
R
A
 
Q
H
 
M
R
 
R
D
 
G
C
 
T
T
 
T
F
 
L
V
 
V
V
 
A
M
 
G
L
x
I
P
 
D
G
 
G
D
 
R
G
 
L
V
 
L
E
 
E
H
 
G
P
 
G
N
 
T
F
 
L
G
 
N
N
 
K
I
 
L
V
 
A
H
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
S
S
 
Q
L
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
I
H
 
H
G
 
G
S
 
A
R
 
Y
P
 
H
Q
 
F
I
 
L
E
 
D
A
 
R
R
 
L
L
 
A
E
 
A
A
 
A
R
 
Q
G
 
G
L
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
H
Y
 
Y
H
 
C
E
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
I
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
T
T
 
S
L
 
L
E
 
G
C
 
Q
V
 
A
I
 
Q
D
 
Q
A
 
F
V
 
A
G
 
G
Q
 
T
L
 
V
R
 
R
I
 
S
A
 
R
I
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
A
L
 
L
S
 
C
M
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
S
 
-
S
 
-
P
 
-
M
 
-
Q
 
-
G
 
G
S
 
S
R
 
S
L
 
V
R
 
P
V
 
L
A
 
V
S
 
S
G
 
G
N
 
N
L
 
F
V
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
R
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
I
E
 
D
G
 
G
V
 
T
D
 
D
Y
 
M
H
 
E
H
 
Y
T
 
A
G
 
G
E
 
V
V
 
I
R
 
R
R
 
K
V
 
T
D
 
D
R
 
T
K
 
A
G
 
A
I
 
L
N
 
R
R
 
F
L
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
A
R
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
V
L
 
W
L
 
M
S
 
P
P
 
P
L
 
L
G
 
G
Y
 
H
S
 
S
P
 
Y
T
 
G
G
 
G
E
 
K
I
 
T
F
 
F
N
 
N
L
 
L
A
 
D
C
 
M
E
 
V
D
 
Q
V
 
A
A
 
A
T
 
A
R
 
S
A
 
V
A
 
A
I
 
V
D
 
S
L
 
L
G
 
Q
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
V
L
 
Y
F
 
L
G
 
T
A
 
L
D
 
S
M
 
D
G
 
G
L
 
I
I
 
S
D
 
R
E
 
P
N
 
D
G
 
G
R
 
T
L
 
L
V
 
A
R
 
E
E
 
T
L
 
L
R
 
S
P
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
A
P
 
Q
A
 
S
H
 
L
L
 
A
Q
 
E
R
 
H
L
 
A
G
 
A
S
 
S
S
 
E
N
 
T
Y
 
R
Q
 
R
A
 
-
E
 
-
L
 
L
L
 
I
D
 
S
A
 
S
A
 
A
A
 
V
E
 
A
A
 
A
C
 
L
R
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
H
R
 
R
S
 
V
H
 
Q
I
 
I
V
 
L
S
 
N
Y
 
G
A
 
A
E
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
S
L
 
L
L
 
L
T
 
Q
E
 
E
L
 
L
F
 
F
T
 
T
R
 
R
D
 
N
G
 
G
G
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
S
V
 
I
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
Q
 
A
F
 
F
E
 
V
L
 
S
V
 
I
R
 
R
E
 
Q
A
 
A
A
 
H
I
 
S
E
 
G
D
 
D
V
 
I
G
 
P
G
 
H
L
 
I
L
 
A
D
 
A
L
 
L
I
 
I
S
 
R
P
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
L
 
L
V
x
L
R
 
H
R
|
R
S
 
S
R
 
R
E
 
E
V
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
N
E
 
H
I
 
I
E
 
S
Q
 
E
F
 
F
S
 
S
V
 
I
V
 
L
E
 
E
R
 
H
E
 
D
G
 
G
M
 
N
I
 
L
I
 
Y
A
 
G
C
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
K
Q
 
T
I
 
F
A
 
A
D
 
E
S
 
A
N
 
D
A
 
C
G
 
G
E
 
E
L
 
I
A
|
A
C
|
C
L
|
L
A
 
A
V
|
V
N
 
S
P
 
P
E
 
Q
Y
 
A
R
x
Q
H
x
D
G
 
G
A
x
G
R
 
Y
G
|
G
D
x
E
V
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
A
R
 
H
I
 
I
E
 
I
S
 
D
R
 
K
A
 
A
R
 
R
A
 
G
Q
 
I
G
 
G
L
 
I
K
 
S
T
 
R
L
 
L
F
 
F
V
 
A
L
|
L
T
x
S
T
 
T
R
 
N
T
|
T
A
 
G
H
 
E
W
|
W
F
 
F
R
 
A
E
 
E
R
 
R
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
P
 
T
S
 
A
S
 
S
V
 
E
D
 
D
R
 
E
L
 
L
P
 
P
S
 
E
A
 
T
R
 
R
A
 
R
S
 
K
L
 
D
Y
 
Y
N
 
R
Y
 
S
Q
 
N
-
 
G
R
|
R
N
 
N
S
|
S
K
 
H
I
 
I
F
 
L
E
 
V
K
 
R
A
 
R
L
 
L

3b8gA Crysta structure of n-acetylglutamate synthase from neisseria gonorrhoeae complexed with coenzyme a and n-acetyl-glutamate (see paper)
39% identity, 99% coverage: 4:433/433 of query aligns to 3:422/424 of 3b8gA

query
sites
3b8gA
Y
 
F
V
 
V
N
 
A
W
 
H
L
 
F
R
 
R
H
 
E
A
 
A
S
 
A
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
N
 
R
A
 
Q
H
 
M
R
 
R
D
 
G
C
 
T
T
 
T
F
 
L
V
 
V
V
 
A
M
 
G
L
x
I
P
 
D
G
 
G
D
 
R
G
 
L
V
 
L
E
 
E
H
 
G
P
 
G
N
 
T
F
 
L
G
 
N
N
 
K
I
 
L
V
 
A
H
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
S
S
 
Q
L
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
I
H
 
H
G
 
G
S
 
A
R
 
Y
P
 
H
Q
 
F
I
 
L
E
 
D
A
 
R
R
 
L
L
 
A
E
 
A
A
 
A
R
 
Q
G
 
G
L
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
H
Y
 
Y
H
 
C
E
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
I
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
T
T
 
S
L
 
L
E
 
G
C
 
Q
V
 
A
I
 
Q
D
 
Q
A
 
F
V
 
A
G
 
G
Q
 
T
L
 
V
R
 
R
I
 
S
A
 
R
I
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
A
L
 
L
S
 
C
M
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
S
 
-
S
 
-
P
 
-
M
 
-
Q
 
-
G
 
G
S
 
S
R
 
S
L
 
V
R
 
P
V
 
L
A
 
V
S
 
S
G
 
G
N
 
N
L
 
F
V
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
R
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
I
E
 
D
G
 
G
V
 
T
D
 
D
Y
 
M
H
 
E
H
 
Y
T
 
A
G
 
G
E
 
V
V
 
I
R
 
R
R
 
K
V
 
T
D
 
D
R
 
T
K
 
A
G
 
A
I
 
L
N
 
R
R
 
F
L
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
A
R
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
V
L
 
W
L
 
M
S
 
P
P
 
P
L
 
L
G
 
G
Y
 
H
S
 
S
P
 
Y
T
 
G
G
 
G
E
 
K
I
 
T
F
 
F
N
 
N
L
 
L
A
 
D
C
 
M
E
 
V
D
 
Q
V
 
A
A
 
A
T
 
A
R
 
S
A
 
V
A
 
A
I
 
V
D
 
S
L
 
L
G
 
Q
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
V
L
 
Y
F
 
L
G
 
T
A
 
L
D
 
S
M
 
D
G
 
G
L
 
I
I
 
S
D
 
R
E
 
P
N
 
D
G
 
G
R
 
T
L
 
L
V
 
A
R
 
E
E
 
T
L
 
L
R
 
S
P
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
A
P
 
Q
A
 
S
H
 
L
L
 
A
Q
 
E
R
 
H
L
 
A
G
 
A
S
 
S
S
 
E
N
 
T
Y
 
R
Q
 
R
A
 
-
E
 
-
L
 
L
L
 
I
D
 
S
A
 
S
A
 
A
A
 
V
E
 
A
A
 
A
C
 
L
R
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
H
R
 
R
S
 
V
H
 
Q
I
 
I
V
 
L
S
 
N
Y
 
G
A
 
A
E
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
S
L
 
L
L
 
L
T
 
Q
E
 
E
L
 
L
F
 
F
T
 
T
R
 
R
D
 
N
G
 
G
G
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
S
V
 
I
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
Q
 
A
F
 
F
E
 
V
L
 
S
V
 
I
R
 
R
E
 
Q
A
 
A
A
 
H
I
 
S
E
 
G
D
 
D
V
 
I
G
 
P
G
 
H
L
 
I
L
 
A
D
 
A
L
 
L
I
 
I
S
 
R
P
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
|
I
L
 
L
V
x
L
R
 
H
R
|
R
S
 
S
R
 
R
E
 
E
V
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
N
E
 
H
I
 
I
E
 
S
Q
 
E
F
 
F
S
 
S
V
 
I
V
 
L
E
 
E
R
 
H
E
 
D
G
 
G
M
 
N
I
 
L
I
 
Y
A
 
G
C
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
K
Q
 
T
I
 
F
A
 
A
D
 
E
S
 
A
N
 
D
A
 
C
G
 
G
E
 
E
L
 
I
A
|
A
C
|
C
L
|
L
A
 
A
V
|
V
N
 
S
P
 
P
E
 
Q
Y
 
A
R
x
Q
H
x
D
G
 
G
A
x
G
R
x
Y
G
|
G
D
x
E
V
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
A
R
 
H
I
 
I
E
 
I
S
 
D
R
 
K
A
 
A
R
 
R
A
 
G
Q
 
I
G
 
G
L
 
I
K
 
S
T
 
R
L
 
L
F
 
F
V
 
A
L
|
L
T
x
S
T
 
T
R
 
N
T
|
T
A
 
G
H
x
E
W
|
W
F
 
F
R
 
A
E
 
E
R
 
R
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
P
 
T
S
 
A
S
 
S
V
 
E
D
 
D
R
 
E
L
 
L
P
 
P
S
 
E
A
 
T
R
 
R
A
 
R
S
 
K
L
 
D
Y
 
Y
N
 
R
Y
 
S
Q
 
N
-
 
G
R
|
R
N
 
N
S
|
S
K
 
H
I
 
I
F
 
L
E
 
V
K
 
R
A
 
R
L
 
L

2r8vA Native structure of n-acetylglutamate synthase from neisseria gonorrhoeae (see paper)
39% identity, 99% coverage: 4:433/433 of query aligns to 3:422/424 of 2r8vA

query
sites
2r8vA
Y
 
F
V
 
V
N
 
A
W
 
H
L
 
F
R
 
R
H
 
E
A
 
A
S
 
A
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
N
 
R
A
 
Q
H
 
M
R
 
R
D
 
G
C
 
T
T
 
T
F
 
L
V
 
V
V
 
A
M
 
G
L
x
I
P
 
D
G
 
G
D
 
R
G
 
L
V
 
L
E
 
E
H
 
G
P
 
G
N
 
T
F
 
L
G
 
N
N
 
K
I
 
L
V
 
A
H
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
S
S
 
Q
L
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
I
H
 
H
G
 
G
S
 
A
R
 
Y
P
 
H
Q
 
F
I
 
L
E
 
D
A
 
R
R
 
L
L
 
A
E
 
A
A
 
A
R
 
Q
G
 
G
L
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
H
Y
 
Y
H
 
C
E
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
I
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
T
T
 
S
L
 
L
E
 
G
C
 
Q
V
 
A
I
 
Q
D
 
Q
A
 
F
V
 
A
G
 
G
Q
 
T
L
 
V
R
 
R
I
 
S
A
 
R
I
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
A
L
 
L
S
 
C
M
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
S
 
-
S
 
-
P
 
-
M
 
-
Q
 
-
G
 
G
S
 
S
R
 
S
L
 
V
R
 
P
V
 
L
A
 
V
S
 
S
G
 
G
N
 
N
L
 
F
V
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
R
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
I
E
 
D
G
 
G
V
 
T
D
 
D
Y
 
M
H
 
E
H
 
Y
T
 
A
G
 
G
E
 
V
V
 
I
R
 
R
R
 
K
V
 
T
D
 
D
R
 
T
K
 
A
G
 
A
I
 
L
N
 
R
R
 
F
L
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
A
R
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
V
L
 
W
L
 
M
S
 
P
P
 
P
L
 
L
G
 
G
Y
 
H
S
 
S
P
 
Y
T
 
G
G
 
G
E
 
K
I
 
T
F
 
F
N
 
N
L
 
L
A
 
D
C
 
M
E
 
V
D
 
Q
V
 
A
A
 
A
T
 
A
R
 
S
A
 
V
A
 
A
I
 
V
D
 
S
L
 
L
G
 
Q
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
V
L
 
Y
F
 
L
G
 
T
A
 
L
D
 
S
M
 
D
G
 
G
L
 
I
I
 
S
D
 
R
E
 
P
N
 
D
G
 
G
R
 
T
L
 
L
V
 
A
R
 
E
E
 
T
L
 
L
R
 
S
P
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
A
P
 
Q
A
 
S
H
 
L
L
 
A
Q
 
E
R
 
H
L
 
A
G
 
A
S
 
S
S
 
E
N
 
T
Y
 
R
Q
 
R
A
 
-
E
 
-
L
 
L
L
 
I
D
 
S
A
 
S
A
 
A
A
 
V
E
 
A
A
 
A
C
 
L
R
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
H
R
 
R
S
 
V
H
 
Q
I
 
I
V
 
L
S
 
N
Y
 
G
A
 
A
E
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
S
L
 
L
L
 
L
T
 
Q
E
 
E
L
 
L
F
 
F
T
 
T
R
 
R
D
 
N
G
 
G
G
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
S
V
 
I
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
Q
 
A
F
 
F
E
 
V
L
 
S
V
 
I
R
 
R
E
 
Q
A
 
A
A
 
H
I
 
S
E
 
G
D
 
D
V
 
I
G
 
P
G
 
H
L
 
I
L
 
A
D
 
A
L
 
L
I
 
I
S
 
R
P
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
|
I
L
|
L
V
 
L
R
 
H
R
 
R
S
 
S
R
 
R
E
 
E
V
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
N
E
 
H
I
 
I
E
 
S
Q
 
E
F
 
F
S
 
S
V
 
I
V
 
L
E
 
E
R
 
H
E
 
D
G
 
G
M
 
N
I
 
L
I
 
Y
A
 
G
C
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
K
Q
 
T
I
 
F
A
 
A
D
 
E
S
 
A
N
 
D
A
 
C
G
 
G
E
 
E
L
 
I
A
 
A
C
 
C
L
|
L
A
 
A
V
|
V
N
 
S
P
 
P
E
 
Q
Y
 
A
R
x
Q
H
x
D
G
 
G
A
x
G
R
 
Y
G
|
G
D
x
E
V
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
A
R
 
H
I
 
I
E
 
I
S
 
D
R
 
K
A
 
A
R
 
R
A
 
G
Q
 
I
G
 
G
L
 
I
K
 
S
T
 
R
L
 
L
F
 
F
V
 
A
L
 
L
T
 
S
T
 
T
R
 
N
T
|
T
A
 
G
H
x
E
W
|
W
F
|
F
R
 
A
E
 
E
R
 
R
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
P
 
T
S
 
A
S
 
S
V
 
E
D
 
D
R
 
E
L
 
L
P
 
P
S
 
E
A
 
T
R
 
R
A
 
R
S
 
K
L
 
D
Y
 
Y
N
 
R
Y
 
S
Q
 
N
-
 
G
R
 
R
N
 
N
S
 
S
K
 
H
I
 
I
F
 
L
E
 
V
K
 
R
A
 
R
L
 
L

3d2pA Crystal structure of n-acetylglutamate synthase from neisseria gonorrhoeae complexed with coenzyme a and l-arginine (see paper)
38% identity, 99% coverage: 4:433/433 of query aligns to 3:422/424 of 3d2pA

query
sites
3d2pA
Y
 
F
V
 
V
N
 
A
W
 
H
L
 
F
R
 
R
H
 
E
A
 
A
S
 
A
P
 
P
Y
|
Y
I
 
I
N
 
R
A
 
Q
H
 
M
R
 
R
D
 
G
C
 
T
T
 
T
F
 
L
V
 
V
V
 
A
M
 
G
L
x
I
P
 
D
G
 
G
D
 
R
G
 
L
V
 
L
E
 
E
H
 
G
P
 
G
N
 
T
F
 
L
G
 
N
N
 
K
I
 
L
V
 
A
H
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
S
S
 
Q
L
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
I
H
 
H
G
 
G
S
 
A
R
 
Y
P
 
H
Q
 
F
I
 
L
E
 
D
A
 
R
R
 
L
L
 
A
E
 
A
A
 
A
R
 
Q
G
 
G
L
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
H
Y
 
Y
H
 
C
E
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
I
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
T
T
 
S
L
 
L
E
 
G
C
 
Q
V
 
A
I
 
Q
D
 
Q
A
 
F
V
 
A
G
 
G
Q
 
T
L
 
V
R
 
R
I
 
S
A
 
R
I
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
A
L
 
L
S
 
C
M
 
G
D
 
S
M
 
V
A
 
-
S
 
S
S
 
G
P
 
F
M
 
A
Q
 
R
G
 
A
S
 
P
R
 
S
L
 
V
R
 
P
V
 
L
A
 
V
S
 
S
G
 
G
N
 
N
L
 
F
V
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
R
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
I
E
 
D
G
 
G
V
 
T
D
 
D
Y
 
M
H
 
E
H
 
Y
T
 
A
G
 
G
E
 
V
V
 
I
R
 
R
R
 
K
V
 
T
D
 
D
R
 
T
K
 
A
G
 
A
I
 
L
N
 
R
R
 
F
L
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
A
R
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
V
L
 
W
L
 
M
S
 
P
P
 
P
L
 
L
G
 
G
Y
 
H
S
 
S
P
 
Y
T
 
G
G
 
G
E
 
K
I
 
T
F
 
F
N
 
N
L
 
L
A
 
D
C
 
M
E
 
V
D
 
Q
V
 
A
A
 
A
T
 
A
R
 
S
A
 
V
A
 
A
I
 
V
D
 
S
L
 
L
G
 
Q
A
 
A
D
 
E
K
|
K
L
 
L
L
 
V
L
 
Y
F
 
L
G
 
T
A
 
L
D
 
S
M
 
D
G
 
G
L
 
I
I
 
S
D
 
R
E
 
P
N
 
D
G
 
G
R
 
T
L
 
L
V
 
A
R
x
E
E
 
T
L
 
L
R
 
S
P
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
A
P
 
Q
A
 
S
H
 
L
L
 
A
Q
 
E
R
 
H
L
 
A
G
 
A
S
 
S
S
 
E
N
 
T
Y
 
R
Q
 
R
A
 
-
E
 
-
L
 
L
L
 
I
D
 
S
A
 
S
A
 
A
A
 
V
E
 
A
A
 
A
C
 
L
R
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
H
R
 
R
S
 
V
H
x
Q
I
 
I
V
 
L
S
 
N
Y
 
G
A
 
A
E
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
S
L
 
L
L
 
L
T
 
Q
E
|
E
L
|
L
F
 
F
T
|
T
R
|
R
D
x
N
G
 
G
G
 
I
G
|
G
T
 
T
L
x
S
V
 
I
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
Q
 
A
F
 
F
E
 
V
L
 
S
V
 
I
R
 
R
E
 
Q
A
 
A
A
 
H
I
 
S
E
 
G
D
 
D
V
 
I
G
 
P
G
 
H
L
 
I
L
 
A
D
 
A
L
 
L
I
 
I
S
 
R
P
 
P
L
|
L
E
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
I
 
I
L
 
L
V
 
L
R
 
H
R
 
R
S
 
S
R
 
R
E
 
E
V
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
N
E
 
H
I
 
I
E
 
S
Q
 
E
F
 
F
S
 
S
V
 
I
V
 
L
E
 
E
R
 
H
E
 
D
G
 
G
M
 
N
I
 
L
I
 
Y
A
 
G
C
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
K
Q
 
T
I
 
F
A
 
A
D
 
E
S
 
A
N
 
D
A
 
C
G
 
G
E
 
E
L
 
I
A
 
A
C
 
C
L
|
L
A
 
A
V
|
V
N
 
S
P
 
P
E
 
Q
Y
 
A
R
x
Q
H
x
D
G
 
G
A
x
G
R
 
Y
G
|
G
D
x
E
V
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
A
R
 
H
I
 
I
E
 
I
S
 
D
R
 
K
A
 
A
R
 
R
A
 
G
Q
 
I
G
 
G
L
 
I
K
 
S
T
 
R
L
 
L
F
 
F
V
 
A
L
 
L
T
 
S
T
 
T
R
 
N
T
 
T
A
 
G
H
x
E
W
|
W
F
 
F
R
 
A
E
 
E
R
 
R
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
P
 
T
S
 
A
S
 
S
V
 
E
D
 
D
R
 
E
L
 
L
P
 
P
S
 
E
A
 
T
R
 
R
A
 
R
S
 
K
L
 
D
Y
 
Y
N
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
R
N
 
N
S
 
S
K
 
H
I
 
I
F
 
L
E
 
V
K
 
R
A
 
R
L
 
L

2btyA Acetylglutamate kinase from thermotoga maritima complexed with its inhibitor arginine (see paper)
27% identity, 65% coverage: 3:283/433 of query aligns to 4:279/282 of 2btyA

query
sites
2btyA
D
 
D
Y
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
V
L
 
L
R
 
L
H
 
E
A
 
A
S
 
L
P
 
P
Y
|
Y
I
 
I
N
 
K
A
 
E
H
x
F
R
 
Y
D
 
G
C
 
K
T
 
T
F
 
F
V
 
V
V
 
I
M
x
K
L
 
F
P
x
G
G
|
G
D
 
S
G
 
A
V
 
M
E
 
K
H
 
Q
P
 
E
N
 
N
F
 
A
G
 
K
N
 
K
-
 
A
I
 
F
V
 
I
H
 
Q
D
 
D
L
 
I
V
 
I
L
 
L
L
 
L
H
 
K
S
 
Y
L
 
T
G
 
G
V
 
I
R
 
K
L
 
P
V
 
I
L
 
I
V
 
V
H
 
H
G
|
G
S
x
G
R
x
G
P
 
P
Q
 
A
I
 
I
E
 
S
A
 
Q
R
 
M
L
 
M
E
 
K
A
 
D
R
 
L
G
 
G
L
 
I
T
 
E
P
 
P
A
 
V
Y
 
F
H
 
K
E
 
N
G
 
G
L
 
H
R
 
R
I
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
K
T
 
T
L
 
M
E
 
E
C
 
-
V
 
I
I
 
V
D
 
E
A
 
M
V
 
V
G
 
L
Q
 
V
L
 
G
R
 
K
I
 
I
A
 
N
I
 
K
E
 
E
A
 
I
R
 
V
L
 
M
S
 
N
M
 
L
D
 
N
M
 
L
A
 
H
S
 
G
S
 
G
P
 
R
M
 
A
Q
 
V
G
 
G
-
 
I
-
 
C
-
 
G
-
 
K
-
 
D
S
 
S
R
 
K
L
 
L
R
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
E
G
 
K
N
 
E
L
 
T
V
 
K
T
 
H
A
 
G
R
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
D
Y
 
I
H
 
G
H
 
Y
T
 
V
G
 
G
E
 
K
V
 
V
R
 
K
R
 
K
V
 
V
D
 
N
R
 
P
K
 
E
G
 
I
I
 
L
N
 
H
R
 
A
L
 
L
L
 
I
D
 
E
E
 
N
R
 
D
S
 
Y
I
 
I
V
 
P
L
 
V
L
 
I
S
 
A
P
 
P
L
 
V
G
 
G
Y
 
I
S
 
G
P
 
E
T
 
D
G
 
G
E
 
H
I
 
S
F
 
Y
N
 
N
L
 
I
A
x
N
C
 
A
E
x
D
D
 
T
V
 
A
A
 
A
T
 
A
R
 
E
A
 
I
A
 
A
I
 
K
D
 
S
L
 
L
G
 
M
A
 
A
D
 
E
K
|
K
L
 
L
L
 
I
L
 
L
F
 
L
G
 
-
A
 
T
D
 
D
M
 
V
G
 
D
L
 
G
I
 
V
D
 
L
E
 
K
N
 
D
G
 
G
R
 
K
L
 
L
V
 
I
R
x
S
E
 
T
L
 
L
R
 
T
P
 
P
Q
 
D
Q
 
E
V
 
A
P
 
E
A
 
E
H
 
L
L
 
I
Q
 
R
R
 
D
L
 
G
G
 
T
S
 
V
S
 
T
N
 
G
Y
 
G
Q
 
M
A
 
I
E
 
P
L
x
K
L
 
V
D
 
E
A
 
C
A
 
A
A
 
V
E
 
S
A
 
A
C
 
V
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
A
S
 
V
H
 
H
I
 
I
V
 
I
S
 
N
Y
 
G
A
 
G
E
 
L
D
 
E
G
 
H
A
 
A
L
 
I
L
 
L
T
 
L
E
|
E
L
x
I
F
 
F
T
 
S
R
|
R
D
x
K
G
 
G
G
 
I
G
|
G
T
 
T
L
x
M
V
 
I
A
 
K
Q
 
E

Q9X2A4 Acetylglutamate kinase; N-acetyl-L-glutamate 5-phosphotransferase; NAG kinase; NAGK; EC 2.7.2.8 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
27% identity, 65% coverage: 3:283/433 of query aligns to 4:279/282 of Q9X2A4

query
sites
Q9X2A4
D
 
D
Y
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
V
L
 
L
R
 
L
H
 
E
A
 
A
S
 
L
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
N
 
K
A
 
E
H
 
F
R
 
Y
D
 
G
C
 
K
T
 
T
F
 
F
V
 
V
V
 
I
M
 
K
L
 
F
P
 
G
G
 
G
D
 
S
G
 
A
V
 
M
E
 
K
H
 
Q
P
 
E
N
 
N
F
 
A
G
 
K
N
 
K
-
 
A
I
 
F
V
 
I
H
 
Q
D
 
D
L
 
I
V
 
I
L
 
L
L
 
L
H
 
K
S
 
Y
L
 
T
G
 
G
V
 
I
R
 
K
L
 
P
V
 
I
L
 
I
V
 
V
H
 
H
G
 
G
S
 
G
R
 
G
P
 
P
Q
 
A
I
 
I
E
 
S
A
 
Q
R
 
M
L
 
M
E
 
K
A
 
D
R
 
L
G
 
G
L
 
I
T
 
E
P
 
P
A
 
V
Y
 
F
H
 
K
E
 
N
G
 
G
L
 
H
R
 
R
I
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
K
T
 
T
L
 
M
E
 
E
C
 
-
V
 
I
I
 
V
D
 
E
A
 
M
V
 
V
G
 
L
Q
 
V
L
 
G
R
 
K
I
 
I
A
 
N
I
 
K
E
 
E
A
 
I
R
 
V
L
 
M
S
 
N
M
 
L
D
 
N
M
 
L
A
 
H
S
 
G
S
 
G
P
 
R
M
 
A
Q
 
V
G
 
G
-
 
I
-
 
C
-
 
G
-
 
K
-
 
D
S
 
S
R
 
K
L
 
L
R
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
E
G
 
K
N
 
E
L
 
T
V
 
K
T
 
H
A
 
G
R
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
D
Y
 
I
H
 
G
H
 
Y
T
 
V
G
 
G
E
 
K
V
 
V
R
 
K
R
 
K
V
 
V
D
 
N
R
 
P
K
 
E
G
 
I
I
 
L
N
 
H
R
 
A
L
 
L
L
 
I
D
 
E
E
 
N
R
 
D
S
 
Y
I
 
I
V
 
P
L
 
V
L
 
I
S
 
A
P
 
P
L
 
V
G
 
G
Y
 
I
S
 
G
P
 
E
T
 
D
G
 
G
E
 
H
I
 
S
F
 
Y
N
|
N
L
 
I
A
 
N
C
 
A
E
 
D
D
 
T
V
 
A
A
 
A
T
 
A
R
 
E
A
 
I
A
 
A
I
 
K
D
 
S
L
 
L
G
 
M
A
 
A
D
 
E
K
|
K
L
 
L
L
 
I
L
 
L
F
 
L
G
 
-
A
 
T
D
 
D
M
 
V
G
 
D
L
 
G
I
 
V
D
 
L
E
 
K
N
 
D
G
 
G
R
 
K
L
 
L
V
 
I
R
x
S
E
 
T
L
 
L
R
 
T
P
 
P
Q
 
D
Q
 
E
V
 
A
P
 
E
A
 
E
H
 
L
L
 
I
Q
 
R
R
 
D
L
 
G
G
 
T
S
 
V
S
 
T
N
 
G
Y
 
G
Q
 
M
A
 
I
E
 
P
L
 
K
L
 
V
D
 
E
A
 
C
A
 
A
A
 
V
E
 
S
A
 
A
C
 
V
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
A
S
 
V
H
 
H
I
 
I
V
 
I
S
 
N
Y
 
G
A
 
G
E
 
L
D
 
E
G
 
H
A
 
A
L
 
I
L
 
L
T
 
L
E
|
E
L
x
I
F
|
F
T
x
S
R
 
R
D
 
K
G
 
G
G
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
M
V
 
I
A
 
K
Q
 
E

2bufA Arginine feed-back inhibitable acetylglutamate kinase (see paper)
29% identity, 64% coverage: 8:285/433 of query aligns to 14:290/292 of 2bufA

query
sites
2bufA
L
 
L
R
 
S
H
 
E
A
 
A
S
 
L
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
N
 
R
A
 
R
H
 
F
R
 
V
D
 
G
C
 
K
T
 
T
F
 
L
V
 
V
V
 
I
M
x
K
L
 
Y
P
 
G
G
|
G
D
 
N
G
 
A
V
 
M
E
 
E
H
 
S
P
 
E
N
 
E
F
 
L
-
 
K
G
 
A
N
 
G
I
 
F
V
 
A
H
 
R
D
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
M
H
 
K
S
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
I
R
 
N
L
 
P
V
 
V
L
 
V
V
 
V
H
 
H
G
|
G
S
x
G
R
x
G
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
E
 
G
A
 
D
R
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
R
R
 
L
G
 
S
L
 
I
T
 
E
P
 
S
A
 
H
Y
 
F
H
 
I
E
 
D
G
 
G
L
 
M
R
|
R
I
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
M
E
 
D
C
 
V
V
 
V
I
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
R
 
E
I
 
M
A
 
V
I
 
L
E
 
G
A
 
G
R
 
Q
L
 
V
S
 
N
M
 
K
D
 
D
M
 
I
A
 
V
S
 
N
-
 
L
-
 
I
S
 
N
P
 
R
M
 
H
Q
 
G
G
 
G
S
 
S
R
 
A
L
 
I
R
 
G
V
 
L
A
 
T
S
 
G
G
 
K
N
 
D
-
 
A
-
 
E
L
 
L
V
 
I
T
 
R
A
 
A
R
 
K
P
 
K
I
 
L
G
 
T
V
 
V
L
 
T
-
 
R
E
 
Q
G
 
I
V
 
I
D
 
D
Y
 
I
H
 
G
H
 
H
T
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
V
R
 
T
R
 
G
V
 
V
D
 
N
R
 
V
K
 
G
G
 
L
I
 
L
N
 
N
R
 
M
L
 
L
L
 
V
D
 
K
E
 
G
R
 
D
S
 
F
I
 
I
V
 
P
L
 
V
L
 
I
S
 
A
P
 
P
L
 
I
G
 
G
Y
 
V
S
 
G
P
 
S
T
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
S
F
 
Y
N
|
N
L
 
I
A
 
N
C
x
A
E
x
D
D
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
G
R
 
K
A
 
V
A
 
A
I
 
E
D
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
M
L
 
L
F
 
L
G
 
T
A
 
N
D
 
I
M
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
M
D
 
D
E
 
K
N
 
Q
G
 
G
R
 
Q
L
 
V
V
 
L
R
 
T
E
 
G
L
 
L
R
 
S
P
 
T
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
V
P
 
N
A
 
E
H
 
L
L
 
I
Q
 
A
R
 
D
L
 
-
G
 
-
S
 
G
S
 
T
N
 
I
Y
 
Y
Q
 
G
A
 
G
E
 
M
L
 
L
-
 
P
-
x
K
L
 
I
D
 
R
A
 
C
A
 
A
A
 
L
E
 
E
A
 
A
C
 
V
R
 
Q
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
T
R
 
S
S
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
I
S
 
D
Y
 
G
A
 
R
E
 
V
D
 
P
G
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
L
T
 
L
E
 
E
L
 
I
F
 
F
T
 
T
R
 
D
D
 
S
G
 
G
G
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
I
A
 
S
Q
 
N
E
 
R
Q
 
K

Q9HTN2 Acetylglutamate kinase; N-acetyl-L-glutamate 5-phosphotransferase; NAG kinase; NAGK; EC 2.7.2.8 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see 2 papers)
29% identity, 64% coverage: 8:285/433 of query aligns to 15:299/301 of Q9HTN2

query
sites
Q9HTN2
L
 
L
R
 
S
H
 
E
A
 
A
S
 
L
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
N
 
R
A
 
R
H
 
F
R
 
V
D
 
G
C
 
K
T
 
T
F
 
L
V
 
V
V
 
I
M
 
K
L
 
Y
P
 
G
G
 
G
D
 
N
G
 
A
V
 
M
E
 
E
H
 
S
P
 
E
N
 
E
F
 
L
-
 
K
G
 
A
N
 
G
I
 
F
V
 
A
H
 
R
D
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
M
H
 
K
S
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
I
R
 
N
L
 
P
V
 
V
L
 
V
V
 
V
H
 
H
G
 
G
S
 
G
R
 
G
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
E
 
G
A
 
D
R
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
R
R
 
L
G
 
S
L
 
I
T
 
E
P
 
S
A
 
H
Y
 
F
H
 
I
E
 
D
G
 
G
L
 
M
R
|
R
I
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
M
E
 
D
C
 
-
V
 
V
I
 
V
D
 
E
A
 
M
V
 
V
-
 
L
-
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
R
 
N
I
 
K
A
 
D
I
 
I
E
 
V
A
 
N
R
 
L
L
 
I
S
 
N
M
 
R
D
 
H
M
 
G
A
 
G
S
 
S
S
 
A
P
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
L
M
 
I
Q
 
R
G
 
A
S
 
K
R
 
K
L
 
L
R
 
T
V
 
V
A
 
T
S
 
R
G
 
Q
N
 
T
L
 
P
V
 
E
T
 
M
A
 
T
R
 
K
P
 
P
I
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
E
G
 
I
V
 
I
D
 
D
Y
 
I
H
 
G
H
 
H
T
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
V
R
 
T
R
 
G
V
 
V
D
 
N
R
 
V
K
 
G
G
 
L
I
 
L
N
 
N
R
 
M
L
 
L
L
 
V
D
 
K
E
 
G
R
 
D
S
 
F
I
 
I
V
 
P
L
 
V
L
 
I
S
 
A
P
 
P
L
 
I
G
 
G
Y
 
V
S
 
G
P
 
S
T
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
S
F
 
Y
N
|
N
L
 
I
A
 
N
C
 
A
E
 
D
D
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
G
R
 
K
A
 
V
A
 
A
I
 
E
D
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
M
L
 
L
F
 
L
G
 
T
A
 
N
D
 
I
M
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
M
D
 
D
E
 
K
N
 
Q
G
 
G
R
 
Q
L
 
V
V
 
L
R
 
T
E
 
G
L
 
L
R
 
S
P
 
T
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
V
P
 
N
A
 
E
H
 
L
L
 
I
Q
 
A
R
 
D
L
 
-
G
 
-
S
 
G
S
 
T
N
 
I
Y
 
Y
Q
 
G
A
 
G
E
 
M
L
 
L
-
 
P
-
 
K
L
 
I
D
 
R
A
 
C
A
 
A
A
 
L
E
 
E
A
 
A
C
 
V
R
 
Q
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
T
R
 
S
S
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
I
S
 
D
Y
 
G
A
 
R
E
 
V
D
 
P
G
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
L
T
 
L
E
 
E
L
 
I
F
 
F
T
 
T
R
 
D
D
 
S
G
 
G
G
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
I
A
 
S
Q
 
N
E
 
R
Q
 
K

Sites not aligning to the query:

2bufC Arginine feed-back inhibitable acetylglutamate kinase (see paper)
29% identity, 64% coverage: 8:285/433 of query aligns to 14:298/298 of 2bufC

query
sites
2bufC
L
 
L
R
 
S
H
 
E
A
 
A
S
 
L
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
N
 
R
A
 
R
H
 
F
R
 
V
D
 
G
C
 
K
T
 
T
F
 
L
V
 
V
V
 
I
M
x
K
L
 
Y
P
 
G
G
|
G
D
x
N
G
 
A
V
 
M
E
 
E
H
 
S
P
 
E
N
 
E
F
 
L
-
 
K
G
 
A
N
 
G
I
 
F
V
 
A
H
 
R
D
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
M
H
 
K
S
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
I
R
 
N
L
 
P
V
 
V
L
 
V
V
 
V
H
 
H
G
 
G
S
 
G
R
x
G
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
E
 
G
A
 
D
R
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
R
R
 
L
G
 
S
L
 
I
T
 
E
P
 
S
A
 
H
Y
 
F
H
 
I
E
 
D
G
 
G
L
 
M
R
 
R
I
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
M
E
 
D
C
 
-
V
 
V
I
 
V
D
 
E
A
 
M
V
 
V
-
 
L
-
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
R
 
N
I
 
K
A
 
D
I
 
I
E
 
V
A
 
N
R
 
L
L
 
I
S
 
N
M
 
R
D
 
H
M
 
G
A
 
G
S
 
S
S
 
A
P
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
L
M
 
I
Q
 
R
G
 
A
S
 
K
R
 
K
L
 
L
R
 
T
V
 
V
A
 
T
S
 
R
G
 
Q
N
 
T
L
 
P
V
 
E
T
 
M
A
 
T
R
 
K
P
 
P
I
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
E
G
 
I
V
 
I
D
 
D
Y
 
I
H
 
G
H
 
H
T
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
V
R
 
T
R
 
G
V
 
V
D
 
N
R
 
V
K
 
G
G
 
L
I
 
L
N
 
N
R
 
M
L
 
L
L
 
V
D
 
K
E
 
G
R
 
D
S
 
F
I
 
I
V
 
P
L
 
V
L
 
I
S
 
A
P
 
P
L
 
I
G
 
G
Y
 
V
S
 
G
P
 
S
T
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
S
F
 
Y
N
 
N
L
 
I
A
 
N
C
 
A
E
x
D
D
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
G
R
 
K
A
 
V
A
 
A
I
 
E
D
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
M
L
 
L
F
 
L
G
 
T
A
x
N
D
 
I
M
 
A
G
 
G
L
|
L
I
x
M
D
 
D
E
 
K
N
 
Q
G
 
G
R
 
Q
L
 
V
V
 
L
R
 
T
E
 
G
L
 
L
R
 
S
P
 
T
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
V
P
 
N
A
 
E
H
 
L
L
 
I
Q
 
A
R
 
D
L
 
-
G
 
-
S
 
G
S
x
T
N
x
I
Y
|
Y
Q
 
G
A
x
G
E
x
M
L
 
L
-
 
P
-
x
K
L
 
I
D
 
R
A
 
C
A
 
A
A
 
L
E
 
E
A
 
A
C
 
V
R
 
Q
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
T
R
 
S
S
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
I
S
 
D
Y
 
G
A
 
R
E
 
V
D
 
P
G
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
L
T
 
L
E
 
E
L
 
I
F
 
F
T
 
T
R
 
D
D
 
S
G
 
G
G
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
I
A
 
S
Q
 
N
E
 
R
Q
 
K

2v5hB Controlling the storage of nitrogen as arginine: the complex of pii and acetylglutamate kinase from synechococcus elongatus pcc 7942 (see paper)
29% identity, 66% coverage: 3:286/433 of query aligns to 5:286/289 of 2v5hB

query
sites
2v5hB
D
 
D
Y
 
R
V
 
V
N
 
R
W
 
I
L
 
L
R
 
S
H
 
E
A
 
A
S
 
L
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
N
 
Q
A
 
Q
H
 
F
R
 
A
D
 
G
C
 
R
T
 
T
F
 
V
V
 
V
V
 
V
M
x
K
L
 
Y
P
 
G
G
|
G
D
 
A
G
 
A
V
 
M
E
 
K
H
 
Q
P
 
E
N
 
E
F
 
L
G
 
K
N
 
E
-
 
A
I
 
V
V
 
M
H
 
R
D
 
D
L
 
I
V
 
V
L
 
F
L
 
L
H
 
A
S
 
C
L
 
V
G
 
G
V
 
M
R
 
R
L
 
P
V
 
V
L
 
V
V
 
V
H
 
H
G
|
G
S
 
G
R
x
G
P
 
P
Q
 
E
I
 
I
E
 
N
A
 
A
R
 
W
L
 
L
E
 
G
A
 
R
R
 
V
G
 
G
L
 
I
T
 
E
P
 
P
A
 
Q
Y
 
F
H
 
H
E
 
N
G
 
G
L
 
L
R
|
R
I
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
A
A
 
D
T
 
T
L
 
M
E
 
E
C
 
V
V
 
V
-
 
E
I
 
M
D
 
V
A
 
L
V
 
V
G
 
G
Q
 
R
L
 
V
R
 
N
I
 
K
A
 
D
I
 
I
E
 
V
A
 
S
R
 
R
L
 
I
S
 
N
M
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
S
 
T
S
 
T
P
 
G
M
 
G
Q
 
R
G
 
A
S
 
V
R
 
G
L
 
F
R
 
C
V
 
G
A
 
T
S
 
D
G
 
G
N
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
L
A
 
A
R
 
R
P
 
P
I
 
H
G
 
D
V
 
-
L
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
I
D
 
G
Y
 
F
H
 
-
H
 
-
T
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
V
R
 
N
R
 
S
V
 
V
D
 
N
R
 
S
K
 
E
G
 
V
I
 
I
N
 
E
R
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
E
E
 
R
R
 
G
S
 
Y
I
 
I
V
 
P
L
 
V
L
 
I
S
 
S
P
 
S
L
 
V
G
 
A
Y
 
A
S
 
D
P
 
E
T
 
N
G
 
G
E
 
Q
I
 
S
F
 
F
N
|
N
L
 
I
A
 
N
C
x
A
E
x
D
D
 
T
V
 
V
A
 
A
T
 
G
R
 
E
A
 
I
A
 
A
I
 
A
D
 
A
L
 
L
G
 
N
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
I
L
 
L
F
 
L
G
 
T
A
 
D
D
 
T
M
 
R
G
 
G
L
 
I
I
 
L
D
 
E
E
 
D
N
 
P
G
 
K
R
 
R
L
 
P
V
 
E
R
 
S
E
 
L
L
 
I
R
 
P
P
 
R
Q
 
L
Q
 
N
V
 
I
P
 
P
A
 
Q
H
 
S
L
 
R
Q
 
E
R
 
L
L
 
I
G
 
A
S
 
Q
S
 
G
N
 
I
Y
 
V
Q
 
G
A
 
G
E
 
G
L
 
M
L
 
I
-
 
P
-
x
K
-
 
V
D
 
D
A
 
C
A
 
C
A
 
I
E
 
R
A
 
S
C
 
L
R
 
A
G
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
R
R
 
A
S
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
I
S
 
D
Y
 
G
A
 
R
E
 
I
D
 
P
G
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
L
E
 
E
L
 
I
F
 
F
T
 
T
R
 
D
D
 
A
G
 
G
G
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
M
V
 
I
A
 
V
Q
 
G
E
 
S
Q
 
G
F
 
Y

2bufK Arginine feed-back inhibitable acetylglutamate kinase (see paper)
29% identity, 64% coverage: 8:283/433 of query aligns to 14:273/273 of 2bufK

query
sites
2bufK
L
 
L
R
 
S
H
 
E
A
 
A
S
 
L
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
N
 
R
A
 
R
H
 
F
R
 
V
D
 
G
C
 
K
T
 
T
F
 
L
V
 
V
V
 
I
M
x
K
L
 
Y
P
 
G
G
|
G
D
 
N
G
 
A
V
 
M
E
 
E
H
 
S
P
 
E
N
 
E
F
 
L
-
 
K
G
 
A
N
 
G
I
 
F
V
 
A
H
 
R
D
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
M
H
 
K
S
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
I
R
 
N
L
 
P
V
 
V
L
 
V
V
 
V
H
 
H
G
 
G
S
 
G
R
x
G
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
E
 
G
A
 
D
R
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
R
R
 
L
G
 
S
L
 
I
T
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
H
 
-
E
 
E
G
 
S
L
 
H
R
|
R
I
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
M
E
 
D
C
 
V
V
 
V
I
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
R
 
E
I
 
M
A
 
V
I
 
L
E
 
G
A
 
G
R
 
Q
L
 
V
S
 
N
M
 
K
D
 
D
M
 
I
A
 
V
S
 
N
-
 
L
-
 
I
S
 
N
P
 
R
M
 
H
Q
 
G
G
 
G
S
 
S
R
 
A
L
 
I
R
 
G
V
 
L
A
 
T
S
 
G
G
 
K
N
 
D
-
 
A
-
 
E
L
 
L
V
 
I
T
 
R
A
 
A
R
 
K
P
 
K
I