SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF5352 FitnessBrowser__WCS417:GFF5352 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
57% identity, 97% coverage: 2:238/245 of query aligns to 1:236/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
P
 
P
L
 
I
L
 
I
R
 
R
I
 
I
S
 
R
A
 
N
L
 
L
H
 
H
K
 
K
Y
 
W
Y
x
F
G
 
G
D
 
P
H
 
L
H
 
H
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
H
L
 
L
T
 
E
V
 
V
E
 
A
E
 
P
G
 
G
Q
 
E
V
 
K
V
 
L
A
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
T
 
T
L
 
I
N
 
N
G
 
R
L
 
L
E
 
E
S
 
D
I
 
F
N
 
Q
D
 
E
G
 
G
V
 
E
I
 
V
E
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
L
Y
 
S
L
 
V
D
 
K
A
 
D
A
 
D
R
 
R
A
 
A
D
 
-
L
 
L
R
 
R
S
 
E
L
 
I
R
 
R
Q
 
R
K
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
Q
 
M
V
 
R
V
 
V
Q
 
R
K
 
R
V
 
W
P
 
P
K
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
E
Q
 
K
L
 
K
A
 
A
K
 
L
Q
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
I
G
 
L
E
 
D
K
 
Q
F
 
A
D
 
R
A
 
K
F
 
Y
P
 
P
D
 
A
R
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
I
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
D
V
 
V
V
 
M
R
 
R
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
D
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
T
L
 
M
I
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
V
V
 
V
F
 
F
M
 
M
H
 
D
Q
 
G
G
 
G
K
 
Q
V
 
I
H
 
V
E
 
E
V
 
E
G
 
G
D
 
R
P
 
P
K
 
E
V
 
E
L
 
I
F
 
F
A
 
T
S
 
R
P
 
P
Q
 
K
T
 
E
A
 
E
E
 
R
L
 
T
A
 
R
N
 
S
F
 
F
I
 
L

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
55% identity, 96% coverage: 3:238/245 of query aligns to 3:238/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
L
 
M
L
 
I
R
 
D
I
 
V
S
 
H
A
 
Q
L
 
L
H
 
K
K
 
K
Y
 
S
Y
x
F
G
 
G
D
 
S
H
 
L
H
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
V
T
 
H
V
 
I
E
 
R
E
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
T
 
C
L
 
L
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
D
I
 
F
N
 
D
D
 
E
G
 
G
V
 
E
I
 
I
E
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
I
Y
 
N
L
 
L
D
 
K
A
 
A
A
 
K
R
 
D
A
 
T
D
 
N
L
 
L
R
 
N
S
 
K
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
K
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
Q
 
M
V
 
K
V
 
V
Q
 
R
K
 
K
V
 
W
P
 
P
K
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
L
 
K
A
 
A
K
 
M
Q
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
K
E
 
D
K
 
K
F
 
A
D
 
H
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
D
 
D
R
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
I
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
S
V
 
V
V
 
M
R
 
K
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
K
 
N
D
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
L
 
M
I
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
D
K
 
R
L
 
V
V
 
L
F
 
F
M
 
M
H
 
D
Q
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
H
 
I
E
 
E
V
 
E
G
 
G
D
 
K
P
 
P
K
 
E
V
 
D
L
 
L
F
 
F
A
 
D
S
 
R
P
 
P
Q
 
Q
T
 
H
A
 
E
E
 
R
L
 
T
A
 
K
N
 
A
F
 
F
I
 
L

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
55% identity, 96% coverage: 3:238/245 of query aligns to 3:238/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
L
 
M
L
 
I
R
 
D
I
 
V
S
 
H
A
 
Q
L
 
L
H
 
K
K
 
K
Y
 
S
Y
x
F
G
 
G
D
 
S
H
 
L
H
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
V
T
 
H
V
 
I
E
 
R
E
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
T
 
C
L
 
L
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
D
I
 
F
N
 
D
D
 
E
G
 
G
V
 
E
I
 
I
E
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
I
Y
 
N
L
 
L
D
 
K
A
 
A
A
 
K
R
 
D
A
 
T
D
 
N
L
 
L
R
 
N
S
 
K
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
K
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
Q
 
M
V
 
K
V
 
V
Q
 
R
K
 
K
V
 
W
P
 
P
K
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
L
 
K
A
 
A
K
 
M
Q
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
K
E
 
D
K
 
K
F
 
A
D
 
H
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
D
 
D
R
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
|
D
E
 
E
I
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
S
V
 
V
V
 
M
R
 
K
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
K
 
N
D
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
L
 
M
I
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
D
K
 
R
L
 
V
V
 
L
F
 
F
M
 
M
H
 
D
Q
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
H
 
I
E
 
E
V
 
E
G
 
G
D
 
K
P
 
P
K
 
E
V
 
D
L
 
L
F
 
F
A
 
D
S
 
R
P
 
P
Q
 
Q
T
 
H
A
 
E
E
 
R
L
 
T
A
 
K
N
 
A
F
 
F
I
 
L

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
55% identity, 96% coverage: 3:238/245 of query aligns to 3:238/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
L
 
M
L
 
I
R
 
D
I
 
V
S
 
H
A
 
Q
L
 
L
H
 
K
K
 
K
Y
 
S
Y
x
F
G
 
G
D
 
S
H
 
L
H
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
V
T
 
H
V
 
I
E
 
R
E
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
T
 
C
L
 
L
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
D
I
 
F
N
 
D
D
 
E
G
 
G
V
 
E
I
 
I
E
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
I
Y
 
N
L
 
L
D
 
K
A
 
A
A
 
K
R
 
D
A
 
T
D
 
N
L
 
L
R
 
N
S
 
K
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
K
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
Q
 
M
V
 
K
V
 
V
Q
 
R
K
 
K
V
 
W
P
 
P
K
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
L
 
K
A
 
A
K
 
M
Q
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
K
E
 
D
K
 
K
F
 
A
D
 
H
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
D
 
D
R
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
I
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
S
V
 
V
V
 
M
R
 
K
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
K
 
N
D
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
L
 
M
I
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
D
K
 
R
L
 
V
V
 
L
F
 
F
M
 
M
H
 
D
Q
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
H
 
I
E
 
E
V
 
E
G
 
G
D
 
K
P
 
P
K
 
E
V
 
D
L
 
L
F
 
F
A
 
D
S
 
R
P
 
P
Q
 
Q
T
 
H
A
 
E
E
 
R
L
 
T
A
 
K
N
 
A
F
 
F
I
 
L

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
55% identity, 96% coverage: 3:238/245 of query aligns to 3:238/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
L
 
M
L
 
I
R
 
D
I
 
V
S
 
H
A
 
Q
L
 
L
H
 
K
K
 
K
Y
 
S
Y
x
F
G
 
G
D
 
S
H
 
L
H
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
V
T
 
H
V
 
I
E
 
R
E
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
T
 
C
L
 
L
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
D
I
 
F
N
 
D
D
 
E
G
 
G
V
 
E
I
 
I
E
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
I
Y
 
N
L
 
L
D
 
K
A
 
A
A
 
K
R
 
D
A
 
T
D
 
N
L
 
L
R
 
N
S
 
K
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
K
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
Q
 
M
V
 
K
V
 
V
Q
 
R
K
 
K
V
 
W
P
 
P
K
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
L
 
K
A
 
A
K
 
M
Q
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
K
E
 
D
K
 
K
F
 
A
D
 
H
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
D
 
D
R
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
I
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
S
V
 
V
V
 
M
R
 
K
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
K
 
N
D
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
L
 
M
I
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
D
K
 
R
L
 
V
V
 
L
F
 
F
M
 
M
H
 
D
Q
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
H
 
I
E
 
E
V
 
E
G
 
G
D
 
K
P
 
P
K
 
E
V
 
D
L
 
L
F
 
F
A
 
D
S
 
R
P
 
P
Q
 
Q
T
 
H
A
 
E
E
 
R
L
 
T
A
 
K
N
 
A
F
 
F
I
 
L

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
52% identity, 96% coverage: 3:238/245 of query aligns to 1:236/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
L
 
M
L
 
I
R
 
F
I
 
V
S
 
N
A
 
D
L
 
V
H
 
Y
K
 
K
Y
 
N
Y
x
F
G
 
G
D
 
S
H
 
L
H
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
V
D
 
T
L
 
L
T
 
K
V
 
V
E
 
N
E
 
K
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
C
L
 
I
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
E
I
 
P
N
 
T
D
 
K
G
 
G
V
 
E
I
 
V
E
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
V
Y
 
K
L
 
I
D
 
N
A
 
N
A
 
G
R
 
K
A
 
V
D
 
N
L
 
I
R
 
N
S
 
K
L
 
V
R
 
R
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
I
E
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
Q
 
V
V
 
K
V
 
V
Q
 
K
K
 
K
V
 
M
P
 
N
K
 
K
A
 
K
K
 
E
A
 
A
A
 
E
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
V
Q
 
D
M
 
L
L
 
L
E
 
A
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
L
E
 
D
K
 
K
F
 
K
D
 
D
A
 
Q
F
 
Y
P
 
P
D
 
I
R
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
Q
P
 
P
K
 
E
V
 
V
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
|
E
I
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
N
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
N
V
 
V
V
 
M
R
 
K
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
K
 
N
D
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
L
 
M
I
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
|
H
E
 
E
M
 
M
R
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
D
K
 
R
L
 
V
V
 
I
F
 
F
M
 
M
H
 
D
Q
 
D
G
 
G
K
 
V
V
 
I
H
 
V
E
 
E
V
 
E
G
 
G
D
 
T
P
 
P
K
 
E
V
 
E
L
 
I
F
 
F
A
 
Y
S
 
R
P
 
A
Q
 
K
T
 
N
A
 
E
E
 
R
L
 
T
A
 
R
N
 
E
F
 
F
I
 
L

P02915 Histidine/lysine/arginine/ornithine transport ATP-binding protein HisP; EC 7.4.2.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
51% identity, 96% coverage: 4:238/245 of query aligns to 7:253/258 of P02915

query
sites
P02915
L
 
L
R
 
H
I
 
V
S
 
I
A
 
D
L
 
L
H
 
H
K
 
K
Y
 
R
Y
 
Y
G
 
G
D
 
G
H
 
H
H
 
E
V
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
V
D
 
S
L
 
L
T
 
Q
V
 
A
E
 
R
E
 
A
G
 
G
Q
 
D
V
 
V
V
 
I
A
 
S
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
S
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
T
 
C
L
 
I
N
 
N
G
 
F
L
 
L
E
 
E
S
 
K
I
 
P
N
 
S
D
 
E
G
 
G
V
 
A
I
 
I
E
 
I
V
 
V
D
 
N
G
 
G
E
 
Q
Y
 
N
L
 
I
D
 
N
A
 
L
A
 
V
R
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
-
 
V
A
 
A
D
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
Q
L
 
L
R
 
R
S
 
L
L
 
L
R
 
R
Q
 
T
K
 
R
V
 
L
G
 
T
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
W
P
 
S
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
M
L
 
E
A
 
A
P
 
P
Q
 
I
V
 
Q
V
 
V
Q
 
L
K
 
G
V
 
L
P
 
S
K
 
K
A
 
H
K
 
D
A
 
A
A
 
R
Q
 
E
L
 
R
A
 
A
K
 
L
Q
 
K
M
 
Y
L
 
L
E
 
A
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
I
G
 
D
E
 
E
K
 
R
F
 
A
D
 
Q
A
 
G
-
 
K
F
 
Y
P
 
P
D
 
V
R
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
E
P
 
P
K
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
I
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
L
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
R
V
 
I
V
 
M
R
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
K
 
E
D
 
E
G
 
G
M
 
K
T
 
T
L
 
M
I
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
H
V
 
V
G
 
S
D
 
S
K
 
H
L
 
V
V
 
I
F
 
F
M
 
L
H
 
H
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
I
H
 
E
E
 
E
V
 
E
G
 
G
D
 
D
P
 
P
K
 
E
V
 
Q
L
 
V
F
 
F
A
 
G
S
 
N
P
 
P
Q
 
Q
T
 
S
A
 
P
E
 
R
L
 
L
A
 
Q
N
 
Q
F
 
F
I
 
L

1b0uA Atp-binding subunit of the histidine permease from salmonella typhimurium (see paper)
51% identity, 96% coverage: 4:238/245 of query aligns to 3:249/258 of 1b0uA

query
sites
1b0uA
L
 
L
R
 
H
I
 
V
S
 
I
A
 
D
L
 
L
H
 
H
K
 
K
Y
 
R
Y
|
Y
G
 
G
D
 
G
H
|
H
H
 
E
V
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
V
D
 
S
L
 
L
T
 
Q
V
 
A
E
 
R
E
 
A
G
 
G
Q
 
D
V
 
V
V
 
I
A
 
S
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
S
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
T
 
C
L
 
I
N
 
N
G
 
F
L
 
L
E
 
E
S
 
K
I
 
P
N
 
S
D
 
E
G
 
G
V
 
A
I
 
I
E
 
I
V
 
V
D
 
N
G
 
G
E
 
Q
Y
 
N
L
 
I
D
 
N
A
 
L
A
 
V
R
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
-
 
V
A
 
A
D
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
Q
L
 
L
R
 
R
S
 
L
L
 
L
R
 
R
Q
 
T
K
 
R
V
 
L
G
 
T
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
W
P
 
S
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
M
L
 
E
A
 
A
P
 
P
Q
 
I
V
 
Q
V
 
V
Q
 
L
K
 
G
V
 
L
P
 
S
K
 
K
A
 
H
K
 
D
A
 
A
A
 
R
Q
 
E
L
 
R
A
 
A
K
 
L
Q
 
K
M
 
Y
L
 
L
E
 
A
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
I
G
 
D
E
 
E
K
 
R
F
 
A
D
 
Q
A
 
G
-
 
K
F
 
Y
P
 
P
D
 
V
R
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
E
P
 
P
K
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
I
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
L
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
R
V
 
I
V
 
M
R
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
K
 
E
D
 
E
G
 
G
M
 
K
T
 
T
L
 
M
I
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
H
V
 
V
G
 
S
D
 
S
K
 
H
L
 
V
V
 
I
F
 
F
M
 
L
H
 
H
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
I
H
 
E
E
 
E
V
 
E
G
 
G
D
 
D
P
 
P
K
 
E
V
 
Q
L
 
V
F
 
F
A
 
G
S
 
N
P
 
P
Q
 
Q
T
 
S
A
 
P
E
 
R
L
 
L
A
 
Q
N
 
Q
F
 
F
I
 
L

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
42% identity, 91% coverage: 19:241/245 of query aligns to 21:244/343 of P30750

query
sites
P30750
L
 
L
K
 
N
G
 
N
I
 
V
D
 
S
L
 
L
T
 
H
V
 
V
E
 
P
E
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
V
 
Y
A
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
A
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
T
 
C
L
 
V
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
R
I
 
P
N
 
T
D
 
E
G
 
G
V
 
S
I
 
V
E
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
Y
 
E
L
 
L
D
 
T
A
 
T
-
 
L
A
 
S
R
 
E
A
 
S
D
 
E
L
 
L
R
 
T
S
 
K
L
 
A
R
 
R
Q
 
R
K
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
-
P
 
P
Q
 
L
V
 
E
V
 
L
Q
 
D
K
 
N
V
 
T
P
 
P
K
 
K
A
 
D
K
 
E
A
 
V
A
 
K
Q
 
R
L
 
R
A
 
V
K
 
T
Q
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
D
K
 
K
F
 
H
D
 
D
A
 
S
F
 
Y
P
 
P
D
 
S
R
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
S
S
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
C
D
 
D
E
|
E
I
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
T
V
 
T
N
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
S
 
E
V
 
L
V
 
L
R
 
K
Q
 
D
L
 
I
A
 
N
K
 
R
D
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
L
 
I
I
 
L
M
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
E
 
R
V
 
I
G
 
C
D
 
D
K
 
C
L
 
V
V
 
A
F
 
V
M
 
I
H
 
S
Q
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
L
H
 
I
E
 
E
V
 
Q
G
 
D
D
 
T
P
 
V
K
 
S
V
 
E
L
 
V
F
 
F
A
 
S
S
 
H
P
 
P
Q
 
K
T
 
T
A
 
P
E
 
L
L
 
A
A
 
Q
N
 
K
F
 
F
I
 
I
G
 
Q
S
 
S
T
 
T

Sites not aligning to the query:

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
41% identity, 91% coverage: 19:241/245 of query aligns to 22:245/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
L
 
L
K
 
N
G
 
N
I
 
V
D
 
S
L
 
L
T
 
H
V
 
V
E
 
P
E
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
V
 
Y
A
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
A
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
T
 
C
L
 
V
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
R
I
 
P
N
 
T
D
 
E
G
 
G
V
 
S
I
 
V
E
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
Y
 
E
L
 
L
D
 
T
A
 
T
-
 
L
A
 
S
R
 
E
A
 
S
D
 
E
L
 
L
R
 
T
S
 
K
L
 
A
R
 
R
Q
 
R
K
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
-
P
 
P
Q
 
L
V
 
E
V
 
L
Q
 
D
K
 
N
V
 
T
P
 
P
K
 
K
A
 
D
K
 
E
A
 
V
A
 
K
Q
 
R
L
 
R
A
 
V
K
 
T
Q
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
D
K
 
K
F
 
H
D
 
D
A
 
S
F
 
Y
P
 
P
D
 
S
R
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
|
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
S
S
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
Q
I
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
T
V
 
T
N
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
S
 
E
V
 
L
V
 
L
R
 
K
Q
 
D
L
 
I
A
 
N
K
 
R
D
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
L
 
I
I
 
L
M
 
L
V
 
I
T
 
T
H
|
H
E
 
E
M
 
M
R
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
E
 
R
V
 
I
G
 
C
D
 
D
K
 
C
L
 
V
V
 
A
F
 
V
M
 
I
H
 
S
Q
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
L
H
 
I
E
 
E
V
 
Q
G
 
D
D
 
T
P
 
V
K
 
S
V
 
E
L
 
V
F
 
F
A
 
S
S
 
H
P
 
P
Q
 
K
T
 
T
A
 
P
E
 
L
L
 
A
A
 
Q
N
 
K
F
 
F
I
 
I
G
 
Q
S
 
S
T
 
T

Sites not aligning to the query:

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
41% identity, 91% coverage: 19:241/245 of query aligns to 22:245/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
L
 
L
K
 
N
G
 
N
I
 
V
D
 
S
L
 
L
T
 
H
V
 
V
E
 
P
E
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
V
 
Y
A
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
A
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
T
 
C
L
 
V
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
R
I
 
P
N
 
T
D
 
E
G
 
G
V
 
S
I
 
V
E
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
Y
 
E
L
 
L
D
 
T
A
 
T
-
 
L
A
 
S
R
 
E
A
 
S
D
 
E
L
 
L
R
 
T
S
 
K
L
 
A
R
 
R
Q
 
R
K
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
-
P
 
P
Q
 
L
V
 
E
V
 
L
Q
 
D
K
 
N
V
 
T
P
 
P
K
 
K
A
 
D
K
 
E
A
 
V
A
 
K
Q
 
R
L
 
R
A
 
V
K
 
T
Q
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
D
K
 
K
F
 
H
D
 
D
A
 
S
F
 
Y
P
 
P
D
 
S
R
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
S
S
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
Q
I
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
T
V
 
T
N
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
S
 
E
V
 
L
V
 
L
R
 
K
Q
 
D
L
 
I
A
 
N
K
 
R
D
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
L
 
I
I
 
L
M
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
E
 
R
V
 
I
G
 
C
D
 
D
K
 
C
L
 
V
V
 
A
F
 
V
M
 
I
H
 
S
Q
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
L
H
 
I
E
 
E
V
 
Q
G
 
D
D
 
T
P
 
V
K
 
S
V
 
E
L
 
V
F
 
F
A
 
S
S
 
H
P
 
P
Q
 
K
T
 
T
A
 
P
E
 
L
L
 
A
A
 
Q
N
 
K
F
 
F
I
 
I
G
 
Q
S
 
S
T
 
T

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
41% identity, 91% coverage: 19:241/245 of query aligns to 22:245/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
L
 
L
K
 
N
G
 
N
I
 
V
D
 
S
L
 
L
T
 
H
V
 
V
E
 
P
E
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
V
 
Y
A
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
A
S
 
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
T
 
C
L
 
V
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
R
I
 
P
N
 
T
D
 
E
G
 
G
V
 
S
I
 
V
E
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
Y
 
E
L
 
L
D
 
T
A
 
T
-
 
L
A
 
S
R
 
E
A
 
S
D
 
E
L
 
L
R
 
T
S
 
K
L
 
A
R
 
R
Q
 
R
K
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
-
P
 
P
Q
 
L
V
 
E
V
 
L
Q
 
D
K
 
N
V
 
T
P
 
P
K
 
K
A
 
D
K
 
E
A
 
V
A
 
K
Q
 
R
L
 
R
A
 
V
K
 
T
Q
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
D
K
 
K
F
 
H
D
 
D
A
 
S
F
 
Y
P
 
P
D
 
S
R
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
S
S
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
Q
I
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
T
V
 
T
N
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
S
 
E
V
 
L
V
 
L
R
 
K
Q
 
D
L
 
I
A
 
N
K
 
R
D
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
L
 
I
I
 
L
M
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
E
 
R
V
 
I
G
 
C
D
 
D
K
 
C
L
 
V
V
 
A
F
 
V
M
 
I
H
 
S
Q
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
L
H
 
I
E
 
E
V
 
Q
G
 
D
D
 
T
P
 
V
K
 
S
V
 
E
L
 
V
F
 
F
A
 
S
S
 
H
P
 
P
Q
 
K
T
 
T
A
 
P
E
 
L
L
 
A
A
 
Q
N
 
K
F
 
F
I
 
I
G
 
Q
S
 
S
T
 
T

Sites not aligning to the query:

5lilA Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atpys (p21) (see paper)
41% identity, 88% coverage: 1:216/245 of query aligns to 1:220/615 of 5lilA

query
sites
5lilA
M
 
M
P
 
N
L
 
I
L
 
I
R
 
E
I
 
I
S
 
K
A
 
Q
L
 
L
H
 
N
K
 
R
Y
 
Y
Y
x
F
G
 
G
D
 
E
H
 
G
-
 
E
-
 
N
-
 
R
-
 
V
H
 
H
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
D
I
 
I
D
 
S
L
 
L
T
 
S
V
 
I
E
 
E
E
 
R
G
 
G
Q
 
D
V
 
F
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
R
 
Q
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
M
R
 
N
T
 
I
L
 
I
N
 
G
G
 
C
L
 
L
E
 
D
S
 
T
I
 
A
N
 
T
D
 
G
G
 
G
V
 
S
I
 
S
E
 
K
V
 
I
D
 
D
G
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
T
-
 
I
E
 
E
Y
 
L
L
 
T
D
 
N
A
 
D
A
 
Q
R
 
L
A
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
 
S
L
 
-
R
 
-
Q
 
Q
K
 
K
V
 
F
G
 
G
M
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
|
Q
Q
 
R
F
 
Y
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
-
P
 
P
Q
 
A
V
 
I
V
 
Y
Q
 
A
K
 
G
V
 
M
P
 
P
K
 
Q
A
 
S
K
 
Q
A
 
R
A
 
L
Q
 
E
L
 
R
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
K
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
D
K
|
K
F
 
W
D
 
Q
A
 
N
F
 
K
P
 
P
D
 
N
R
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
M
 
N
S
 
G
P
 
G
K
 
E
V
 
I
L
 
I
L
 
L
C
 
A
D
 
D
E
 
Q
I
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
H
L
 
S
V
 
G
N
 
E
E
 
N
V
 
V
L
 
M
S
 
E
V
 
I
V
 
L
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
A
 
H
K
 
E
D
 
E
G
 
G
M
 
H
T
 
T
L
 
I
I
 
I
M
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
K
R
 
H
F
 
I
A
 
A
R
 
A
E
 
S
V
 
-
G
 
A
D
 
N
K
 
R
L
 
I
V
 
I
F
 
E
M
 
I
H
 
K
Q
 
D
G
 
G
K
 
E
V
 
I

5lj7A Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atp (p21) (see paper)
41% identity, 88% coverage: 1:216/245 of query aligns to 1:220/592 of 5lj7A

query
sites
5lj7A
M
 
M
P
 
N
L
 
I
L
 
I
R
 
E
I
 
I
S
 
K
A
 
Q
L
 
L
H
 
N
K
 
R
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
G
D
 
E
H
 
G
-
 
E
-
 
N
-
 
R
-
 
V
H
 
H
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
D
I
 
I
D
 
S
L
 
L
T
 
S
V
 
I
E
 
E
E
 
R
G
 
G
Q
 
D
V
 
F
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
R
 
Q
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
M
R
 
N
T
 
I
L
 
I
N
 
G
G
 
C
L
 
L
E
 
D
S
 
T
I
 
A
N
 
T
D
 
G
G
 
G
V
 
S
I
 
S
E
 
K
V
 
I
D
 
D
G
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
T
-
 
I
E
 
E
Y
 
L
L
 
T
D
 
N
A
 
D
A
 
Q
R
 
L
A
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
 
S
L
 
-
R
 
-
Q
 
Q
K
 
K
V
 
F
G
 
G
M
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
|
Q
Q
 
R
F
 
Y
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
-
P
 
P
Q
 
A
V
 
I
V
 
Y
Q
 
A
K
 
G
V
 
M
P
 
P
K
 
Q
A
 
S
K
 
Q
A
 
R
A
 
L
Q
 
E
L
 
R
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
K
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
D
K
|
K
F
 
W
D
 
Q
A
 
N
F
 
K
P
 
P
D
 
N
R
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
M
 
N
S
 
G
P
 
G
K
 
E
V
 
I
L
 
I
L
 
L
C
 
A
D
 
D
E
 
Q
I
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
H
L
 
S
V
 
G
N
 
E
E
 
N
V
 
V
L
 
M
S
 
E
V
 
I
V
 
L
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
A
 
H
K
 
E
D
 
E
G
 
G
M
 
H
T
 
T
L
 
I
I
 
I
M
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
K
R
 
H
F
 
I
A
 
A
R
 
A
E
 
S
V
 
-
G
 
A
D
 
N
K
 
R
L
 
I
V
 
I
F
 
E
M
 
I
H
 
K
Q
 
D
G
 
G
K
 
E
V
 
I

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
37% identity, 97% coverage: 2:239/245 of query aligns to 16:249/378 of P69874

query
sites
P69874
P
 
P
L
 
L
L
 
V
R
 
Q
I
 
L
S
 
A
A
 
G
L
 
I
H
 
R
K
 
K
Y
x
C
Y
x
F
G
 
D
D
 
G
H
 
K
H
 
E
V
 
V
L
 
I
K
 
P
G
 
Q
I
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
T
V
 
I
E
 
N
E
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
x
F
V
 
L
A
 
T
I
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
P
S
 
S
G
 
G
S
x
C
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
V
L
|
L
R
 
R
T
 
L
L
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
T
I
 
V
N
 
D
D
 
S
G
 
G
V
 
R
I
 
I
E
 
M
V
x
L
D
 
D
G
 
N
E
 
E
Y
 
D
L
 
I
D
 
T
A
 
H
A
 
V
R
 
P
A
 
A
D
 
E
L
 
N
R
 
R
S
 
Y
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
K
 
-
V
 
V
G
 
N
M
 
T
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
S
F
 
Y
N
 
A
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
F
A
 
G
P
 
L
Q
 
R
V
 
M
V
 
-
Q
 
Q
K
 
K
V
 
T
P
 
P
K
 
A
A
 
A
K
 
E
A
 
I
A
 
T
Q
 
P
L
 
R
A
 
V
K
 
M
Q
 
E
M
 
A
L
 
L
E
 
R
R
 
M
V
|
V
G
 
Q
L
 
L
G
 
E
E
 
T
K
 
F
F
 
A
D
 
Q
A
 
R
F
 
K
P
 
P
D
 
H
R
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
M
 
N
S
 
K
P
 
P
K
 
R
V
 
L
L
 
L
L
 
L
C
 
L
D
|
D
E
 
E
I
 
S
T
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
Y
E
 
K
L
 
L
V
 
R
N
 
K
E
 
Q
V
 
M
L
 
Q
S
 
N
V
 
E
V
 
L
R
 
K
Q
 
A
L
 
L
A
 
Q
K
 
R
D
 
K
-
 
L
G
 
G
M
 
I
T
 
T
L
 
F
I
 
V
M
 
F
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
Q
R
 
E
F
 
E
A
 
A
R
 
L
E
 
T
V
 
M
G
 
S
D
 
D
K
 
R
L
 
I
V
 
V
F
 
V
M
 
M
H
 
R
Q
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
I
H
 
E
E
 
Q
V
 
D
G
 
G
D
 
T
P
 
P
K
 
R
V
 
E
L
 
I
F
 
Y
A
 
E
S
 
E
P
 
P
Q
 
K
T
 
N
A
 
L
E
 
F
L
 
V
A
 
A
N
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P0AAH0 Phosphate import ATP-binding protein PstB; ABC phosphate transporter; Phosphate-transporting ATPase; EC 7.3.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
36% identity, 96% coverage: 4:238/245 of query aligns to 11:252/257 of P0AAH0

query
sites
P0AAH0
L
 
I
R
 
Q
I
 
V
S
 
R
A
 
N
L
 
L
H
 
N
K
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
D
 
K
H
 
F
H
 
H
V
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
N
I
 
I
D
 
N
L
 
L
T
 
D
V
 
I
E
 
A
E
 
K
G
 
N
Q
 
Q
V
 
V
V
 
T
A
 
A
I
 
F
I
 
I
G
 
G
R
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
C
G
|
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
T
L
 
F
N
 
N
G
 
K
L
 
M
-
 
F
-
 
E
-
 
L
-
 
Y
-
 
P
E
 
E
S
 
Q
I
 
R
N
 
A
D
 
E
G
 
G
V
 
E
I
 
I
E
 
L
V
 
L
D
 
D
G
 
G
E
 
D
Y
 
N
L
 
I
D
 
L
A
 
T
A
 
N
R
 
S
A
 
Q
D
 
D
L
 
I
R
 
A
S
 
L
L
 
L
R
 
R
Q
 
A
K
 
K
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
K
F
 
P
N
 
T
L
 
P
F
 
F
P
 
P
H
 
-
L
 
M
T
 
S
V
 
I
G
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
I
M
 
A
L
 
F
A
 
G
P
 
V
Q
 
R
V
 
L
V
 
F
Q
 
E
K
 
K
V
 
L
P
 
S
K
 
R
A
 
A
K
 
D
A
 
M
A
 
D
Q
 
E
L
 
R
A
 
V
K
 
Q
Q
 
W
M
 
A
L
 
L
E
 
T
R
 
K
V
 
A
G
 
A
L
 
L
G
 
W
-
 
N
-
 
E
-
 
T
-
 
K
E
 
D
K
 
K
F
 
L
D
 
H
A
 
Q
F
 
S
P
 
G
D
 
Y
R
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
C
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
G
L
 
I
A
 
A
M
 
I
S
 
R
P
 
P
K
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
P
T
 
C
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
I
L
 
S
V
 
T
N
 
G
E
 
R
V
 
I
L
 
E
S
 
E
V
 
L
V
 
I
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
A
 
K
K
 
Q
D
 
D
G
 
-
M
 
Y
T
 
T
L
 
V
I
 
V
M
 
I
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
N
M
 
M
R
 
Q
F
 
Q
A
 
A
R
 
A
E
 
R
V
 
C
G
 
S
D
 
D
K
 
H
L
 
T
V
 
A
F
 
F
M
 
M
H
 
Y
Q
 
L
G
 
G
K
 
E
V
 
L
H
 
I
E
 
E
V
 
F
G
 
S
D
 
N
P
 
T
K
 
D
V
 
D
L
 
L
F
 
F
A
 
T
S
 
K
P
 
P
Q
 
A
T
 
K
A
 
K
E
 
Q
L
 
T
A
 
E
N
 
D
F
 
Y
I
 
I

Sites not aligning to the query:

8hprD Lpqy-sugabc in state 4 (see paper)
37% identity, 94% coverage: 11:240/245 of query aligns to 10:236/362 of 8hprD

query
sites
8hprD
K
 
K
Y
 
S
Y
|
Y
G
 
P
D
 
D
-
 
V
H
 
R
H
 
A
V
 
A
L
 
V
K
 
K
G
 
E
I
 
F
D
 
S
L
 
M
T
 
T
V
 
I
E
 
A
E
 
D
G
 
G
Q
 
E
V
 
F
V
 
I
A
 
I
I
 
L
I
 
V
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
 
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
T
L
 
L
R
 
N
T
 
M
L
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
E
I
 
I
N
 
T
D
 
S
G
 
G
V
 
E
I
 
L
E
 
R
V
 
I
D
 
G
G
 
G
E
 
E
Y
 
R
L
 
V
D
 
N
A
 
E
A
 
K
R
 
A
A
 
P
D
 
K
L
 
D
R
 
R
S
 
D
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
K
 
-
V
 
I
G
 
A
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
Q
 
S
F
 
Y
N
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
R
E
 
Q
N
 
N
V
 
I
M
 
A
L
 
F
A
 
-
P
 
P
Q
 
L
V
 
T
V
 
L
Q
 
A
K
 
K
V
 
V
P
 
P
K
 
K
A
 
A
K
 
E
A
 
I
A
 
A
Q
 
A
L
 
K
A
 
V
K
 
E
Q
 
E
M
 
T
L
 
A
E
 
K
R
 
I
V
 
L
G
 
D
L
 
L
G
 
S
E
 
E
K
 
L
F
 
L
D
 
D
A
x
R
F
 
K
P
 
P
D
 
G
R
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
M
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
M
 
R
S
 
S
P
 
P
K
 
K
V
 
A
L
 
F
L
 
L
C
 
M
D
 
D
E
x
Q
I
 
P
T
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
K
L
 
L
V
 
R
N
 
V
E
 
Q
V
 
M
L
 
R
S
 
A
V
 
E
V
 
I
R
 
S
Q
 
R
L
 
L
A
 
Q
-
 
D
K
 
R
D
 
L
G
 
G
M
 
T
T
 
T
L
 
T
I
 
V
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
|
H
E
 
D
M
 
Q
R
 
T
F
 
E
A
 
A
R
 
M
E
 
T
V
 
L
G
 
G
D
 
D
K
 
R
L
 
V
V
 
V
F
 
V
M
 
M
H
 
L
Q
 
A
G
 
G
K
 
E
V
 
V
H
 
Q
E
 
Q
V
 
I
G
 
G
D
 
T
P
 
P
K
 
D
V
 
E
L
 
L
F
 
Y
A
 
S
S
 
S
P
 
P
Q
 
A
T
 
N
A
 
L
E
 
F
L
 
V
A
 
A
N
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
S

8hprC Lpqy-sugabc in state 4 (see paper)
37% identity, 94% coverage: 11:240/245 of query aligns to 10:236/363 of 8hprC

query
sites
8hprC
K
 
K
Y
 
S
Y
|
Y
G
 
P
D
 
D
-
 
V
H
 
R
H
 
A
V
 
A
L
 
V
K
 
K
G
 
E
I
 
F
D
 
S
L
 
M
T
 
T
V
 
I
E
 
A
E
 
D
G
 
G
Q
 
E
V
 
F
V
 
I
A
 
I
I
 
L
I
 
V
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
|
G
S
 
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
T
L
 
L
R
 
N
T
 
M
L
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
E
I
 
I
N
 
T
D
 
S
G
 
G
V
 
E
I
 
L
E
 
R
V
 
I
D
 
G
G
 
G
E
 
E
Y
 
R
L
 
V
D
 
N
A
 
E
A
 
K
R
 
A
A
 
P
D
 
K
L
 
D
R
 
R
S
 
D
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
K
 
-
V
 
I
G
 
A
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
Q
 
S
F
 
Y
N
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
R
E
 
Q
N
 
N
V
 
I
M
 
A
L
 
F
A
 
-
P
 
P
Q
 
L
V
 
T
V
 
L
Q
 
A
K
 
K
V
 
V
P
 
P
K
 
K
A
 
A
K
 
E
A
 
I
A
 
A
Q
 
A
L
 
K
A
 
V
K
 
E
Q
 
E
M
 
T
L
 
A
E
 
K
R
 
I
V
 
L
G
 
D
L
 
L
G
 
S
E
 
E
K
 
L
F
 
L
D
 
D
A
 
R
F
 
K
P
 
P
D
 
G
R
x
Q
L
 
L
S
 
S
G
|
G
G
|
G
Q
|
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
M
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
M
 
R
S
 
S
P
 
P
K
 
K
V
 
A
L
 
F
L
 
L
C
 
M
D
 
D
E
 
Q
I
 
P
T
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
K
L
 
L
V
 
R
N
 
V
E
 
Q
V
 
M
L
 
R
S
 
A
V
 
E
V
 
I
R
 
S
Q
 
R
L
 
L
A
 
Q
-
 
D
K
 
R
D
 
L
G
 
G
M
 
T
T
 
T
L
 
T
I
 
V
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
|
H
E
 
D
M
 
Q
R
 
T
F
 
E
A
 
A
R
 
M
E
 
T
V
 
L
G
 
G
D
 
D
K
 
R
L
 
V
V
 
V
F
 
V
M
 
M
H
 
L
Q
 
A
G
 
G
K
 
E
V
 
V
H
 
Q
E
 
Q
V
 
I
G
 
G
D
 
T
P
 
P
K
 
D
V
 
E
L
 
L
F
 
Y
A
 
S
S
 
S
P
 
P
Q
 
A
T
 
N
A
 
L
E
 
F
L
 
V
A
 
A
N
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
S

8hplC Lpqy-sugabc in state 1 (see paper)
37% identity, 91% coverage: 19:240/245 of query aligns to 17:234/384 of 8hplC

query
sites
8hplC
L
 
V
K
 
K
G
 
E
I
 
F
D
 
S
L
 
M
T
 
T
V
 
I
E
 
A
E
 
D
G
 
G
Q
 
E
V
 
F
V
 
I
A
 
I
I
 
L
I
 
V
G
 
G
R
 
P
S
 
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
T
L
 
L
R
 
N
T
 
M
L
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
E
I
 
I
N
 
T
D
 
S
G
 
G
V
 
E
I
 
L
E
 
R
V
 
I
D
 
G
G
 
G
E
 
E
Y
 
R
L
 
V
D
 
N
A
 
E
A
 
K
R
 
A
A
 
P
D
 
K
L
 
D
R
 
R
S
 
D
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
K
 
-
V
 
I
G
 
A
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
S
F
 
Y
N
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
R
E
 
Q
N
 
N
V
 
I
M
 
A
L
 
F
A
 
-
P
 
P
Q
 
L
V
 
T
V
 
L
Q
 
A
K
 
K
V
 
V
P
 
P
K
 
K
A
 
A
K
 
E
A
 
I
A
 
A
Q
 
A
L
 
K
A
 
V
K
 
E
Q
 
E
M
 
T
L
 
A
E
 
K
R
 
I
V
 
L
G
 
D
L
 
L
G
 
S
E
 
E
K
 
L
F
 
L
D
 
D
A
 
R
F
 
K
P
 
P
D
 
G
R
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
M
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
M
 
R
S
 
S
P
 
P
K
 
K
V
 
A
L
 
F
L
 
L
C
 
M
D
 
D
E
 
Q
I
 
P
T
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
K
L
 
L
V
 
R
N
 
V
E
 
Q
V
 
M
L
 
R
S
 
A
V
 
E
V
 
I
R
 
S
Q
 
R
L
 
L
A
 
Q
-
 
D
K
 
R
D
 
L
G
 
G
M
 
T
T
 
T
L
 
T
I
 
V
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
Q
R
 
T
F
 
E
A
 
A
R
 
M
E
 
T
V
 
L
G
 
G
D
 
D
K
 
R
L
 
V
V
 
V
F
 
V
M
 
M
H
 
L
Q
 
A
G
 
G
K
 
E
V
 
V
H
 
Q
E
 
Q
V
 
I
G
 
G
D
 
T
P
 
P
K
 
D
V
 
E
L
 
L