SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF635 FitnessBrowser__psRCH2:GFF635 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5o5cB The crystal structure of dfoj, the desferrioxamine biosynthetic pathway lysine decarboxylase from the fire blight disease pathogen erwinia amylovora (see paper)
58% identity, 91% coverage: 33:494/507 of query aligns to 19:461/468 of 5o5cB

query
sites
5o5cB
Q
 
E
Q
 
Q
G
 
V
L
 
L
N
 
A
L
 
L
V
 
M
Q
 
T
Q
 
E
C
 
T
L
 
V
Q
 
K
R
 
G
Q
 
V
Q
 
E
Q
 
K
P
 
P
F
 
F
S
 
S
G
 
G
I
 
I
L
 
L
P
 
P
Q
 
H
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
R
D
 
E
F
 
F
E
 
S
R
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
D
R
 
Q
P
 
-
L
 
-
G
 
G
D
 
S
A
 
N
G
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
L
D
 
K
Q
 
K
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
A
V
 
V
Y
 
W
F
 
F
H
 
H
H
 
H
P
 
P
R
 
K
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
N
 
N
C
 
C
P
 
P
V
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
L
 
I
V
 
M
S
 
A
S
 
A
L
 
V
N
 
N
S
 
S
S
 
S
L
 
V
D
 
D
T
 
T
W
 
W
D
 
D
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
R
 
K
L
 
V
I
 
I
D
 
D
W
 
W
T
 
T
C
 
L
A
 
S
R
 
R
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
P
S
 
A
Q
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
V
 
I
F
 
F
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
|
G
T
|
T
Q
 
Q
S
 
S
N
 
N
L
 
L
M
 
M
G
 
A
L
 
M
L
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
D
H
 
S
V
 
W
C
 
C
N
 
A
R
 
-
L
 
-
P
 
A
D
 
H
H
 
H
G
 
P
G
 
G
N
 
H
L
 
L
-
 
I
R
 
K
H
 
H
-
 
R
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
H
E
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
K
L
 
W
R
 
R
I
 
V
F
 
F
A
 
T
S
 
S
R
 
K
A
 
L
S
 
S
H
|
H
F
 
F
S
 
S
V
 
I
Q
 
Q
K
 
K
S
 
S
A
 
M
A
 
A
L
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
V
 
V
R
 
I
S
 
P
I
 
V
E
 
D
T
 
Y
D
 
D
S
 
E
A
 
R
Q
 
Y
C
 
R
M
 
M
S
 
D
V
 
V
P
 
D
A
 
C
L
 
L
A
 
K
Q
 
Q
A
 
E
L
 
V
A
 
Q
D
 
R
C
 
C
Q
 
L
R
 
Q
L
 
Q
G
 
G
E
 
L
L
 
I
P
 
P
M
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
T
T
|
T
D
 
D
F
 
F
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
G
E
 
A
I
 
I
A
 
S
A
 
E
L
 
L
C
 
C
Q
 
K
H
 
H
Y
 
H
G
 
G
V
 
M
W
 
W
L
 
M
H
 
H
V
 
V
D
|
D
A
 
A
A
|
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
C
G
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
S
P
 
E
R
 
S
Y
 
H
R
 
R
D
 
P
W
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
K
A
 
A
D
 
D
S
 
S
V
 
V
T
 
T
V
 
V
D
|
D
Y
 
Y
H
|
H
K
|
K
S
 
S
F
 
F
F
 
F
Q
 
Q
P
 
T
V
 
V
S
 
S
C
 
C
S
 
G
G
 
A
F
 
F
F
 
F
V
 
V
R
 
R
Q
 
D
R
 
K
Q
 
H
H
 
H
L
 
L
S
 
S
Y
 
H
I
 
V
T
 
T
H
 
-
H
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
N
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
Q
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
G
T
 
T
P
 
P
N
 
N
L
 
L
V
 
V
N
 
N
K
 
K
S
 
S
I
 
I
Q
 
Q
T
|
T
T
|
T
R
 
R
R
 
R
F
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
M
W
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
V
L
 
S
G
 
G
A
 
P
E
 
M
H
 
A
I
 
L
G
 
G
A
 
N
M
 
A
F
 
F
E
 
D
E
 
D
V
 
I
I
 
L
D
 
A
R
 
L
A
 
T
A
 
Q
D
 
I
T
 
A
H
 
H
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
N
N
 
A
D
 
H
P
 
P
A
 
A
F
 
I
E
 
E
V
 
V
F
 
L
-
 
H
T
 
V
P
 
P
R
 
E
L
 
L
S
 
T
T
 
T
L
 
Q
V
 
I
F
 
F
R
 
R
F
 
Y
V
 
V
A
 
P
P
 
D
G
 
A
V
 
L
A
 
T
N
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
D
E
 
E
I
 
I
N
 
N
R
 
T
E
 
N
I
 
I
R
 
R
K
 
K
A
 
A
I
 
V
F
 
F
R
 
R
S
 
S
G
 
G
A
 
N
A
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
G
T
 
T
V
 
K
V
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
F
 
F
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
N
T
 
T
T
 
T
L
 
A
N
 
A
D
 
D
L
 
I
R
 
E
A
 
D
I
 
V
V
 
I
E
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
V
D
 
H
H
 
Y
G
 
G

4obvC Ruminococcus gnavus tryptophan decarboxylase rumgna_01526 (alpha-fmt) (see paper)
31% identity, 85% coverage: 69:501/507 of query aligns to 55:469/471 of 4obvC

query
sites
4obvC
R
 
R
P
 
P
L
 
V
G
 
N
D
 
E
A
 
V
G
 
V
A
 
S
A
 
E
L
 
M
R
 
M
E
 
N
L
 
E
D
 
V
Q
 
Y
L
 
R
Y
 
Y
L
 
R
R
 
G
D
 
D
A
 
A
V
 
-
Y
 
-
F
 
-
H
 
N
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
F
V
 
F
A
 
S
H
x
F
L
x
V
N
 
P
C
 
G
P
|
P
V
x
A
V
 
S
L
x
S
P
 
V
A
 
S
L
 
W
L
 
L
A
 
G
E
 
D
V
 
I
L
 
M
V
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
Y
N
 
N
S
 
I
S
x
H
L
 
-
D
 
-
T
 
-
W
 
-
D
 
-
Q
 
-
S
 
-
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
M
-
 
V
-
 
N
L
 
C
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
R
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
K
W
 
W
T
 
L
C
 
A
A
 
K
R
 
Q
I
 
V
G
 
G
L
 
F
G
 
T
S
 
E
Q
 
N
A
 
P
D
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
T
 
V
S
 
S
G
 
G
G
|
G
T
x
S
Q
 
M
S
 
A
N
 
N
L
 
I
M
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
T
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
D
H
 
-
V
 
-
C
 
-
N
 
N
R
 
K
L
 
L
P
 
T
D
 
D
H
 
-
G
 
-
G
 
I
N
 
N
L
 
L
R
 
H
H
 
L
G
 
G
L
 
T
P
 
A
A
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
F
 
Y
A
 
I
S
 
S
R
 
D
A
 
Q
S
 
T
H
|
H
F
 
S
S
 
S
V
 
V
Q
 
A
K
 
K
S
 
G
A
 
L
A
 
R
L
 
I
L
 
I
G
 
G
L
 
I
G
 
T
Y
 
D
D
 
S
A
 
R
V
 
I
R
 
R
S
 
R
I
 
I
E
 
P
T
 
T
D
 
N
S
 
S
A
 
H
Q
 
F
C
 
Q
M
 
M
S
 
D
V
 
T
P
 
T
A
 
K
L
 
L
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
E
D
 
T
C
 
D
Q
 
K
R
 
K
L
 
S
G
 
G
E
 
Y
L
 
I
P
 
P
M
 
F
A
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
G
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
|
T
D
 
N
F
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
T
E
 
E
I
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
L
C
 
C
Q
 
K
H
 
K
Y
 
H
G
 
D
V
 
M
W
 
W
L
 
F
H
 
H
V
 
I
D
|
D
A
 
G
A
|
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
G
 
S
L
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
S
P
 
P
R
 
K
Y
 
Y
R
 
K
D
 
S
W
 
L
L
 
L
A
 
T
G
 
G
I
 
T
E
 
G
H
 
L
A
 
A
D
 
D
S
 
S
V
 
I
T
 
S
V
 
W
D
|
D
Y
 
A
H
 
H
K
|
K
S
 
W
F
 
L
F
|
F
Q
 
Q
P
 
T
V
 
Y
S
 
G
C
 
C
S
 
A
G
 
M
F
 
V
F
 
L
V
 
V
R
 
K
Q
 
D
R
 
I
Q
 
R
H
 
N
L
 
L
S
 
-
Y
 
-
I
 
-
T
 
-
H
 
F
H
 
H
A
 
S
D
 
F
Y
 
H
L
 
V
N
 
N
P
 
P
R
 
E
S
 
Y
-
x
L
Q
 
K
T
 
D
R
 
L
E
 
E
G
 
D
T
 
N
P
 
V
N
 
N
L
 
T
V
x
W
N
 
D
K
 
I
S
 
G
I
 
M
Q
 
E
T
 
L
T
|
T
R
 
R
R
 
P
F
 
A
D
 
R
A
 
G
L
 
L
K
 
K
L
 
L
W
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
R
 
Q
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
S
E
 
D
H
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
S
M
 
A
F
 
I
E
 
E
E
 
H
V
 
G
I
 
F
D
 
Q
R
 
L
A
 
A
A
 
V
D
 
W
T
 
A
H
 
E
R
 
E
L
 
A
L
 
L
A
 
N
N
 
P
D
 
K
P
 
K
A
 
D
F
 
W
E
 
E
V
 
I
F
 
V
T
 
S
P
 
P
-
 
A
R
 
Q
L
 
M
S
 
A
T
 
M
L
 
I
V
 
N
F
 
F
R
 
R
F
 
Y
V
 
A
A
 
P
P
 
K
G
 
D
V
 
L
A
 
T
N
 
K
E
 
E
R
 
E
L
 
Q
D
 
D
E
 
I
I
 
L
N
 
N
R
 
E
E
 
K
I
 
I
R
 
S
K
 
H
A
 
R
I
 
I
F
 
L
R
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
A
I
 
I
A
 
F
A
 
T
T
 
T
V
 
V
V
 
L
E
 
N
G
 
G
R
 
K
Q
 
T
Y
 
V
L
 
L
K
 
R
F
 
I
T
 
C
L
 
A
L
 
I
N
 
H
P
|
P
E
|
E
T
 
A
T
 
T
L
 
Q
N
 
E
D
 
D
L
 
M
R
 
Q
A
 
H
I
 
T
V
 
I
E
 
D
L
 
L
I
 
L
R
 
D
D
 
Q
H
 
Y
G
 
G
A
 
R
R
 
E
L
 
I
L
 
Y
D
 
T
E
 
E
L
 
M

A7B1V0 Tryptophan decarboxylase; Trp decarboxylase; EC 4.1.1.105 from Ruminococcus gnavus (strain ATCC 29149 / VPI C7-9) (see paper)
30% identity, 86% coverage: 69:504/507 of query aligns to 70:490/490 of A7B1V0

query
sites
A7B1V0
R
 
R
P
 
P
L
 
V
G
 
N
D
 
E
A
 
V
G
 
V
A
 
S
A
 
E
L
 
M
R
 
M
E
 
N
L
 
E
D
 
V
Q
 
Y
L
 
R
Y
 
Y
L
 
R
R
 
G
D
 
D
A
 
A
V
 
-
Y
 
-
F
 
-
H
 
N
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
F
V
 
F
A
 
S
H
 
F
L
 
V
N
 
P
C
 
G
P
 
P
V
 
A
V
 
S
L
 
S
P
 
V
A
 
S
L
 
W
L
 
L
A
 
G
E
 
D
V
 
I
L
 
M
V
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
Y
N
 
N
S
 
I
S
 
H
L
 
-
D
 
-
T
 
-
W
 
-
D
 
-
Q
 
-
S
 
-
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
M
-
 
V
-
 
N
L
 
C
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
R
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
K
W
 
W
T
 
L
C
 
A
A
 
K
R
 
Q
I
 
V
G
 
G
L
 
F
G
 
T
S
 
E
Q
 
N
A
 
P
D
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
T
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
M
S
 
A
N
 
N
L
 
I
M
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
T
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
D
H
 
-
V
 
-
C
 
-
N
 
N
R
 
K
L
 
L
P
 
T
D
 
D
H
 
I
G
 
-
G
 
-
N
 
N
L
 
L
R
 
H
H
 
L
G
 
G
L
 
T
P
 
A
A
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
F
 
Y
A
 
I
S
 
S
R
 
D
A
 
Q
S
 
T
H
 
H
F
 
S
S
 
S
V
 
V
Q
 
A
K
 
K
S
 
G
A
 
L
A
 
R
L
 
I
L
 
I
G
 
G
L
 
I
G
 
T
Y
 
D
D
 
S
A
 
R
V
 
I
R
 
R
S
 
R
I
 
I
E
 
P
T
 
T
D
 
N
S
 
S
A
 
H
Q
 
F
C
 
Q
M
 
M
S
 
D
V
 
T
P
 
T
A
 
K
L
 
L
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
E
D
 
T
C
 
D
Q
 
K
R
 
K
L
 
S
G
 
G
E
 
Y
L
 
I
P
 
P
M
 
F
A
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
G
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
N
F
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
T
E
 
E
I
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
L
C
 
C
Q
 
K
H
 
K
Y
 
H
G
 
D
V
 
M
W
 
W
L
 
F
H
 
H
V
 
I
D
 
D
A
 
G
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
G
 
S
L
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
S
P
 
P
R
 
K
Y
 
Y
R
 
K
D
 
S
W
 
L
L
 
L
A
 
T
G
 
G
I
 
T
E
 
G
H
 
L
A
 
A
D
 
D
S
 
S
V
 
I
T
 
S
V
 
W
D
 
D
Y
 
A
H
 
H
K
|
K
S
 
W
F
 
L
F
 
F
Q
 
Q
P
 
T
V
 
Y
S
 
G
C
 
C
S
 
A
G
 
M
F
 
V
F
 
L
V
 
V
R
 
K
Q
 
D
R
 
I
Q
 
R
H
 
N
L
 
L
S
 
F
Y
 
H
I
 
S
T
 
F
H
 
H
-
 
V
H
 
N
A
 
P
D
 
E
Y
 
Y
L
 
L
N
 
K
P
 
D
R
 
L
S
 
E
Q
 
N
T
 
D
R
 
I
E
 
D
G
 
N
T
 
V
P
 
-
N
 
N
L
 
T
V
 
W
N
 
D
K
 
I
S
 
G
I
 
M
Q
 
E
T
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
P
F
 
A
D
 
R
A
 
G
L
 
L
K
 
K
L
 
L
W
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
R
 
Q
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
S
E
 
D
H
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
S
M
 
A
F
 
I
E
 
E
E
 
H
V
 
G
I
 
F
D
 
Q
R
 
L
A
 
A
A
 
V
D
 
W
T
 
A
H
 
E
R
 
E
L
 
A
L
 
L
A
 
N
N
 
P
D
 
K
P
 
K
A
 
D
F
 
W
E
 
E
V
 
I
F
 
V
T
 
S
P
 
P
-
 
A
R
 
Q
L
 
M
S
 
A
T
 
M
L
 
I
V
 
N
F
 
F
R
 
R
F
 
Y
V
 
A
A
 
P
P
 
K
G
 
D
V
 
L
A
 
T
N
 
K
E
 
E
R
 
E
L
 
Q
D
 
D
E
 
I
I
 
L
N
 
N
R
 
E
E
 
K
I
 
I
R
 
S
K
 
H
A
 
R
I
 
I
F
 
L
R
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
A
I
 
I
A
 
F
A
 
T
T
 
T
V
 
V
V
 
L
E
 
N
G
 
G
R
 
K
Q
 
T
Y
 
V
L
 
L
K
 
R
F
 
I
T
 
C
L
 
A
L
 
I
N
 
H
P
 
P
E
 
E
T
 
A
T
 
T
L
 
Q
N
 
E
D
 
D
L
 
M
R
 
Q
A
 
H
I
 
T
V
 
I
E
 
D
L
 
L
I
 
L
R
 
D
D
 
Q
H
 
Y
G
 
G
A
 
R
R
 
E
L
 
I
L
 
Y
D
 
T
E
 
E
L
 
M
P
 
K
T
 
K
A
 
A

4obuA Ruminococcus gnavus tryptophan decarboxylase rumgna_01526 (apo) (see paper)
30% identity, 86% coverage: 69:504/507 of query aligns to 55:462/462 of 4obuA

query
sites
4obuA
R
 
R
P
 
P
L
 
V
G
 
N
D
 
E
A
 
V
G
 
V
A
 
S
A
 
E
L
 
M
R
 
M
E
 
N
L
 
E
D
 
V
Q
 
Y
L
 
R
Y
 
Y
L
 
R
R
 
G
D
 
D
A
 
A
V
 
-
Y
 
-
F
 
-
H
 
N
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
F
V
 
F
A
 
S
H
x
F
L
 
V
N
 
P
C
 
G
P
 
P
V
 
A
V
 
S
L
 
S
P
 
V
A
 
S
L
 
W
L
 
L
A
 
G
E
 
D
V
 
I
L
 
M
V
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
Y
N
 
N
S
 
I
S
 
H
L
 
A
D
 
G
T
 
G
W
 
S
D
 
K
Q
 
L
S
 
A
A
 
P
G
 
M
G
 
V
T
 
N
L
 
C
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
R
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
K
W
 
W
T
 
L
C
 
A
A
 
K
R
 
Q
I
 
V
G
 
G
L
 
F
G
 
T
S
 
E
Q
 
N
A
 
P
D
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
T
 
V
S
 
S
G
 
G
G
|
G
T
x
S
Q
 
M
S
 
A
N
 
N
L
 
I
M
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
T
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
D
H
 
-
V
 
-
C
 
-
N
 
N
R
 
K
L
 
L
P
 
T
D
 
D
H
 
I
G
 
-
G
 
-
N
 
N
L
 
L
R
 
H
H
 
L
G
 
G
L
 
T
P
 
A
A
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
F
 
Y
A
 
I
S
 
S
R
 
D
A
 
Q
S
 
T
H
|
H
F
 
S
S
 
S
V
 
V
Q
 
A
K
 
K
S
 
G
A
 
L
A
 
R
L
 
I
L
 
I
G
 
G
L
 
I
G
 
T
Y
 
D
D
 
S
A
 
R
V
 
I
R
 
R
S
 
R
I
 
I
E
 
P
T
 
T
D
 
N
S
 
S
A
 
H
Q
 
F
C
 
Q
M
 
M
S
 
D
V
 
T
P
 
T
A
 
K
L
 
L
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
E
D
 
T
C
 
D
Q
 
K
R
 
K
L
 
S
G
 
G
E
 
Y
L
 
I
P
 
P
M
 
F
A
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
G
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
|
T
D
 
N
F
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
T
E
 
E
I
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
L
C
 
C
Q
 
K
H
 
K
Y
 
H
G
 
D
V
 
M
W
 
W
L
 
F
H
 
H
V
 
I
D
|
D
A
 
G
A
|
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
G
 
S
L
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
S
P
 
P
R
 
K
Y
 
Y
R
 
K
D
 
S
W
 
L
L
 
L
A
 
T
G
 
G
I
 
T
E
 
G
H
 
L
A
 
A
D
 
D
S
 
S
V
 
I
T
 
S
V
 
W
D
 
D
Y
 
A
H
 
H
K
|
K
S
 
W
F
 
L
F
 
F
Q
 
Q
P
 
T
V
x
Y
S
 
G
C
 
C
S
 
A
G
 
M
F
 
V
F
 
L
V
 
V
R
 
K
Q
 
D
R
 
I
Q
 
R
H
 
N
L
 
L
S
 
-
Y
 
-
I
 
-
T
 
-
H
 
F
H
 
H
A
 
S
D
 
F
Y
 
H
L
 
V
N
 
N
P
 
P
R
 
E
S
 
-
Q
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
N
 
-
L
 
Y
V
 
L
N
 
D
K
 
I
S
 
G
I
 
M
Q
 
E
T
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
P
F
 
A
D
 
R
A
 
G
L
 
L
K
 
K
L
 
L
W
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
R
 
Q
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
S
E
 
D
H
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
S
M
 
A
F
 
I
E
 
E
E
 
H
V
 
G
I
 
F
D
 
Q
R
 
L
A
 
A
A
 
V
D
 
W
T
 
A
H
 
E
R
 
E
L
 
A
L
 
L
A
 
N
N
 
P
D
 
K
P
 
K
A
 
D
F
 
W
E
 
E
V
 
I
F
 
V
T
 
S
P
 
P
-
 
A
R
 
Q
L
 
M
S
 
A
T
 
M
L
 
I
V
 
N
F
 
F
R
 
R
F
 
Y
V
 
A
A
 
P
P
 
K
G
 
D
V
 
L
A
 
T
N
 
K
E
 
E
R
 
E
L
 
Q
D
 
D
E
 
I
I
 
L
N
 
N
R
 
E
E
 
K
I
 
I
R
 
S
K
 
H
A
 
R
I
 
I
F
 
L
R
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
A
I
 
I
A
 
F
A
 
T
T
 
T
V
 
V
V
 
L
E
 
N
G
 
G
R
 
K
Q
 
T
Y
 
V
L
 
L
K
 
R
F
 
I
T
 
C
L
 
A
L
 
I
N
 
H
P
 
P
E
 
E
T
 
A
T
 
T
L
 
Q
N
 
E
D
 
D
L
 
M
R
 
Q
A
 
H
I
 
T
V
 
I
E
 
D
L
 
L
I
 
L
R
 
D
D
 
Q
H
 
Y
G
 
G
A
 
R
R
 
E
L
 
I
L
 
Y
D
 
T
E
 
E
L
 
M
P
 
K
T
 
K
A
 
A

Q05683 Glutamate decarboxylase 2; 65 kDa glutamic acid decarboxylase; GAD-65; Glutamate decarboxylase 65 kDa isoform; EC 4.1.1.15 from Rattus norvegicus (Rat) (see 2 papers)
29% identity, 89% coverage: 48:497/507 of query aligns to 112:585/585 of Q05683

query
sites
Q05683
Q
 
Q
P
 
D
F
 
V
S
 
M
G
 
N
I
 
I
L
 
L
P
 
L
Q
 
Q
E
 
Y
L
 
V
A
 
V
A
 
K
D
 
S
F
 
F
E
 
D
R
 
R
-
 
S
-
 
T
-
 
K
-
 
V
V
 
I
D
 
D
L
 
F
E
 
H
R
 
Y
P
 
P
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
Y
-
 
N
-
 
W
-
 
E
L
 
L
G
 
A
D
 
D
A
 
Q
G
 
P
A
 
Q
A
 
N
L
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
I
-
 
L
-
 
T
-
 
H
D
 
C
Q
 
Q
L
 
T
Y
 
T
L
 
L
R
 
K
D
 
Y
A
 
A
V
 
I
Y
 
K
F
 
T
H
 
G
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
V
 
F
A
 
N
H
 
Q
L
 
L
N
 
S
C
 
T
P
 
G
V
 
L
V
 
D
L
 
M
P
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
D
V
 
W
L
 
L
V
 
T
S
 
S
S
 
T
L
 
A
N
 
N
S
 
T
S
 
N
L
 
M
D
 
F
T
 
T
W
 
Y
D
 
E
Q
 
I
S
 
A
A
 
P
G
 
V
G
 
F
T
 
V
L
 
L
I
 
L
E
 
E
Q
 
Y
R
 
V
L
 
T
I
 
L
D
 
K
W
 
K
T
 
M
C
 
R
A
 
E
R
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
W
-
 
P
G
 
G
S
 
G
Q
 
S
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
I
F
 
F
T
 
S
S
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
Q
 
I
S
 
S
N
 
N
L
 
M
M
 
Y
G
 
A
L
 
M
L
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
R
E
 
Y
H
 
K
V
 
M
C
 
F
N
 
P
R
 
E
L
 
V
P
 
K
D
 
E
H
 
K
G
 
G
G
 
-
N
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
M
A
 
A
E
 
A
A
 
V
A
 
P
G
 
R
L
 
L
R
 
I
I
 
A
F
 
F
A
 
T
S
 
S
R
 
E
A
 
H
S
 
S
H
 
H
F
 
F
S
 
S
V
 
L
Q
 
K
K
 
K
S
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
G
Y
 
T
D
 
D
A
 
S
V
 
V
R
 
I
S
 
L
I
 
I
E
 
K
T
 
C
D
 
D
S
 
E
A
 
R
Q
 
G
C
 
K
M
 
M
S
 
I
V
 
P
P
 
S
A
 
D
L
 
L
A
 
E
Q
 
R
A
 
R
L
 
I
A
 
L
D
 
E
C
 
V
Q
 
K
R
 
Q
L
 
K
G
 
G
E
 
F
L
 
V
P
 
P
M
 
F
A
 
L
V
 
V
V
 
S
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
V
F
 
Y
G
 
G
S
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
L
E
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
I
C
 
C
Q
 
K
H
 
K
Y
 
Y
G
 
K
V
 
I
W
 
W
L
 
M
H
 
H
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Y
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
M
A
 
S
P
 
R
R
 
K
Y
 
H
R
 
K
D
 
W
W
 
K
L
 
L
A
 
N
G
 
G
I
 
V
E
 
E
H
 
R
A
 
A
D
 
N
S
 
S
V
 
V
T
 
T
V
 
W
D
 
N
Y
 
P
H
 
H
K
 
K
S
 
M
F
 
M
F
 
G
Q
 
V
P
 
P
V
 
L
S
 
Q
C
 
C
S
 
S
G
 
A
F
 
L
F
 
L
V
 
V
R
 
R
Q
 
E
R
 
E
Q
 
G
H
 
L
L
 
M
S
 
Q
Y
 
S
I
 
C
T
 
N
H
 
Q
-
 
M
H
 
H
A
 
A
D
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
F
P
 
Q
R
 
Q
S
 
D
Q
 
K
T
 
H
R
 
Y
E
 
D
G
 
L
T
 
S
P
 
Y
N
 
D
L
 
T
V
 
G
N
 
D
K
 
K
S
 
A
I
 
L
Q
 
Q
T
 
C
T
 
G
R
 
R
R
 
H
F
 
V
D
 
D
A
 
V
L
 
F
K
 
K
L
 
L
W
 
W
L
 
L
T
 
M
L
 
W
R
 
R
I
 
A
L
 
K
G
 
G
A
 
T
E
 
T
H
 
G
I
 
F
G
 
E
A
 
A
M
 
H
F
 
I
E
 
D
E
 
K
V
 
C
I
 
L
D
 
E
R
 
L
A
 
A
A
 
E
D
 
Y
T
 
L
H
 
Y
R
 
N
L
 
I
L
 
I
A
 
K
N
 
N
D
 
R
P
 
E
A
 
G
F
 
Y
E
 
E
V
 
M
F
 
V
-
 
F
-
 
D
-
 
G
T
 
K
P
 
P
R
 
Q
L
 
H
S
 
T
T
 
N
L
 
V
V
 
C
F
 
F
R
 
W
F
 
F
V
 
V
A
 
P
P
 
P
G
 
S
V
 
L
A
 
R
-
 
V
-
 
L
-
 
E
-
 
D
N
 
N
E
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
M
-
 
S
R
 
R
L
 
L
D
 
S
E
 
K
I
 
V
N
 
A
R
 
P
E
 
V
I
 
I
R
 
K
K
 
A
A
 
R
I
 
M
F
 
M
R
 
E
S
 
Y
G
 
G
A
 
T
A
 
T
V
 
M
I
 
V
A
 
S
A
 
Y
T
 
Q
V
 
P
V
 
L
E
 
G
G
 
D
R
 
K
-
 
V
Q
 
N
Y
 
F
L
 
F
K
 
R
F
 
M
T
 
V
L
 
I
L
 
S
N
 
N
P
 
P
E
 
A
T
 
A
T
 
T
L
 
H
N
 
Q
D
 
D
L
 
I
R
 
D
A
 
F
I
 
L
V
 
I
E
 
E
L
 
E
I
 
I
R
 
E
D
 
R
H
 
L
G
 
G
A
 
Q
R
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q80WP8 Acidic amino acid decarboxylase GADL1; Aspartate 1-decarboxylase; ADC; Cysteine sulfinic acid decarboxylase; CSADC; Glutamate decarboxylase-like protein 1; EC 4.1.1.11; EC 4.1.1.29 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
27% identity, 97% coverage: 1:494/507 of query aligns to 49:547/550 of Q80WP8

query
sites
Q80WP8
M
 
M
T
 
T
P
 
P
S
 
G
S
 
K
T
 
K
V
 
I
V
 
P
P
 
I
F
 
F
A
 
V
P
 
D
G
 
G
P
 
V
V
 
V
S
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
-
F
 
-
T
 
P
R
 
Q
S
 
T
N
 
D
H
 
V
D
 
K
D
 
A
Y
 
G
R
 
E
Q
 
K
L
 
F
L
 
V
Q
 
E
Q
 
E
G
 
A
L
 
C
N
 
R
L
 
L
V
 
I
Q
 
M
Q
 
E
C
 
E
L
 
V
Q
 
V
R
 
L
Q
 
K
Q
 
A
Q
 
T
P
 
D
F
 
V
S
 
N
G
 
E
I
 
K
L
 
V
-
 
C
-
 
E
-
 
W
-
 
Q
-
 
P
P
 
P
Q
 
E
E
 
Q
L
 
L
A
 
R
A
 
-
D
 
-
F
 
-
E
 
Q
R
 
L
V
 
L
D
 
D
L
 
L
E
 
E
-
 
M
R
 
R
P
 
D
L
 
T
G
 
G
D
 
E
A
 
S
G
 
Q
A
 
D
A
 
K
L
 
L
R
 
L
E
 
K
L
 
L
D
 
C
Q
 
Q
L
 
D
Y
 
V
L
 
I
R
 
H
D
 
F
A
 
S
V
 
V
Y
 
K
F
 
T
H
 
N
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
F
V
 
F
A
 
N
H
 
Q
L
 
L
N
 
Y
C
 
A
P
 
G
V
 
L
V
 
D
L
 
Y
P
 
Y
A
 
S
L
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
R
V
 
I
L
 
I
V
 
T
S
 
E
S
 
A
L
 
L
N
 
N
S
 
P
S
 
S
L
 
I
D
 
Y
T
 
T
W
 
Y
D
 
E
Q
 
V
S
 
S
A
 
P
G
 
V
G
 
F
T
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
E
Q
 
E
R
 
A
L
 
V
I
 
L
D
 
K
W
 
K
T
 
M
C
 
I
A
 
E
R
 
C
I
 
V
G
 
G
L
 
W
G
 
-
S
 
K
Q
 
E
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
I
F
 
F
T
 
N
S
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
V
S
 
S
N
 
N
L
 
M
M
 
C
G
 
A
L
 
M
L
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
Y
H
 
R
V
 
H
C
 
C
N
 
P
R
 
D
L
 
I
P
 
K
D
 
E
H
 
K
G
 
G
G
 
L
N
 
S
L
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
R
E
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
I
I
 
L
F
 
F
A
 
T
S
 
S
R
 
A
A
 
E
S
 
C
H
 
H
F
 
Y
S
 
S
V
 
M
Q
 
K
K
 
K
S
 
A
A
 
A
A
 
S
L
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
G
Y
 
T
D
 
Q
A
 
N
V
 
V
R
 
Y
S
 
F
I
 
V
E
 
E
T
 
T
D
 
D
S
 
G
A
 
R
Q
 
G
C
 
K
M
 
M
S
 
I
V
 
P
P
 
E
A
 
D
L
 
L
A
 
E
Q
 
K
A
 
Q
L
 
I
A
 
W
D
 
Q
C
 
A
Q
 
R
R
 
Q
L
 
E
G
 
G
E
 
A
L
 
V
P
 
P
M
 
F
A
 
L
V
 
V
V
 
C
A
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
V
F
 
L
G
 
G
S
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
V
C
 
C
Q
 
E
H
 
R
Y
 
H
G
 
G
V
 
L
W
 
W
L
 
L
H
 
H
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
S
Y
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
S
L
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
S
P
 
R
R
 
K
Y
 
H
R
 
R
D
 
R
W
 
L
L
 
L
A
 
H
G
 
G
I
 
I
E
 
H
H
 
R
A
 
A
D
 
D
S
 
S
V
 
V
T
 
A
V
 
W
D
 
N
Y
 
P
H
 
H
K
|
K
S
 
M
F
 
L
F
 
M
Q
 
A
P
 
G
V
 
I
S
 
Q
C
 
C
S
 
S
G
 
A
F
 
L
F
 
L
V
 
V
R
 
K
Q
 
D
R
 
K
Q
 
S
H
 
D
L
 
L
-
 
L
-
 
K
S
 
K
Y
 
C
I
 
Y
T
 
S
H
 
A
H
 
K
A
 
A
D
 
T
Y
 
Y
L
 
L
N
 
F
P
 
Q
R
 
Q
S
 
D
Q
 
K
T
 
F
R
 
Y
E
 
D
G
 
V
T
 
S
P
 
Y
N
 
D
L
 
T
V
 
G
N
 
D
K
 
K
S
 
S
I
 
I
Q
 
Q
T
 
C
T
 
S
R
 
R
R
 
R
F
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
F
K
 
K
L
 
F
W
 
W
L
 
M
T
 
T
L
 
W
R
 
K
I
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
T
E
 
S
H
 
G
I
 
L
G
 
-
A
 
-
M
 
-
F
 
-
E
 
E
E
 
E
V
 
R
I
 
V
D
 
N
R
 
R
A
 
A
A
 
F
D
 
A
T
 
L
H
 
S
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
 
V
N
 
D
D
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
K
-
 
R
P
 
E
A
 
G
F
 
F
E
 
K
V
 
L
F
 
L
T
 
M
-
 
E
P
 
P
R
 
E
L
 
Y
S
 
T
T
 
N
L
 
V
V
 
C
F
 
F
R
 
W
F
 
Y
V
 
I
A
 
P
P
 
P
G
 
S
V
 
L
A
 
R
N
 
E
-
 
M
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
F
-
 
W
E
 
R
R
 
K
L
 
L
D
 
S
E
 
L
I
 
V
N
 
A
R
 
P
E
 
A
I
 
I
R
 
K
K
 
E
A
 
K
I
 
M
F
 
M
R
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
S
A
 
L
V
 
M
I
 
L
A
 
G
A
 
Y
T
 
Q
V
 
P
V
 
H
E
 
R
G
 
G
R
 
K
-
 
V
Q
 
N
Y
 
F
L
 
F
K
 
R
F
 
Q
T
 
V
L
 
V
L
 
I
N
 
S
P
 
P
E
 
Q
T
 
V
T
 
S
L
 
R
N
 
E
D
 
D
L
 
M
R
 
D
A
 
F
I
 
L
V
 
L
E
 
D
L
 
E
I
 
I
R
 
D
D
 
S
H
 
L
G
 
G

Q05329 Glutamate decarboxylase 2; 65 kDa glutamic acid decarboxylase; GAD-65; Glutamate decarboxylase 65 kDa isoform; EC 4.1.1.15 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
29% identity, 89% coverage: 48:497/507 of query aligns to 112:585/585 of Q05329

query
sites
Q05329
Q
 
Q
P
 
D
F
 
V
S
 
M
G
 
N
I
 
I
L
 
L
P
 
L
Q
 
Q
E
 
Y
L
 
V
A
 
V
A
x
K
D
 
S
F
 
F
E
 
D
R
 
R
-
 
S
-
 
T
-
 
K
-
 
V
V
 
I
D
 
D
L
 
F
E
 
H
R
 
Y
P
 
P
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
Y
-
 
N
-
 
W
-
 
E
L
 
L
G
 
A
D
 
D
A
 
Q
G
 
P
A
 
Q
A
 
N
L
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
I
-
 
L
-
 
M
-
 
H
D
 
C
Q
 
Q
L
 
T
Y
 
T
L
 
L
R
 
K
D
 
Y
A
 
A
V
 
I
Y
 
K
F
 
T
H
 
G
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
V
 
F
A
 
N
H
 
Q
L
 
L
N
 
S
C
 
T
P
 
G
V
 
L
V
 
D
L
 
M
P
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
D
V
 
W
L
 
L
V
 
T
S
 
S
S
 
T
L
 
A
N
 
N
S
 
T
S
 
N
L
 
M
D
 
F
T
 
T
W
 
Y
D
 
E
Q
 
I
S
 
A
A
 
P
G
 
V
G
 
F
T
 
V
L
 
L
I
 
L
E
 
E
Q
 
Y
R
 
V
L
 
T
I
 
L
D
 
K
W
 
K
T
 
M
C
 
R
A
 
E
R
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
W
-
 
P
G
 
G
S
 
G
Q
 
S
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
I
F
 
F
T
 
S
S
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
Q
 
I
S
 
S
N
 
N
L
 
M
M
 
Y
G
 
A
L
 
M
L
 
M
L
 
I
A
 
A
R
 
R
E
 
F
H
 
K
V
 
M
C
 
F
N
 
P
R
 
E
L
 
V
P
 
K
D
 
E
H
 
K
G
 
G
G
 
-
N
 
-
L
 
-
R
 
M
H
 
A
G
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
R
E
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
I
I
 
A
F
 
F
A
 
T
S
 
S
R
 
E
A
 
H
S
 
S
H
 
H
F
 
F
S
 
S
V
 
L
Q
x
K
K
 
K
S
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
G
Y
 
T
D
 
D
A
 
S
V
 
V
R
 
I
S
 
L
I
 
I
E
 
K
T
 
C
D
 
D
S
 
E
A
 
R
Q
 
G
C
 
K
M
 
M
S
 
I
V
 
P
P
 
S
A
 
D
L
 
L
A
 
E
Q
 
R
A
 
R
L
 
I
A
 
L
D
 
E
C
 
A
Q
 
K
R
 
Q
L
 
K
G
 
G
E
 
F
L
 
V
P
 
P
M
 
F
A
 
L
V
 
V
V
 
S
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
V
F
 
Y
G
 
G
S
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
L
E
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
I
C
 
C
Q
 
K
H
 
K
Y
 
Y
G
 
K
V
 
I
W
 
W
L
 
M
H
 
H
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Y
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
M
A
 
S
P
x
R
R
 
K
Y
 
H
R
 
K
D
 
W
W
 
K
L
 
L
A
 
S
G
 
G
I
 
V
E
 
E
H
 
R
A
 
A
D
 
N
S
 
S
V
 
V
T
 
T
V
 
W
D
 
N
Y
 
P
H
 
H
K
 
K
S
 
M
F
 
M
F
 
G
Q
 
V
P
 
P
V
 
L
S
 
Q
C
 
C
S
 
S
G
 
A
F
 
L
F
 
L
V
 
V
R
 
R
Q
 
E
R
 
E
Q
 
G
H
 
L
L
 
M
S
 
Q
Y
 
N
I
 
C
T
 
N
H
 
Q
-
 
M
H
 
H
A
 
A
D
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
F
P
 
Q
R
 
Q
S
 
D
Q
 
K
T
 
H
R
 
Y
E
 
D
G
 
L
T
 
S
P
 
Y
N
 
D
L
 
T
V
 
G
N
 
D
K
 
K
S
 
A
I
 
L
Q
 
Q
T
 
C
T
 
G
R
 
R
R
 
H
F
 
V
D
 
D
A
 
V
L
 
F
K
 
K
L
 
L
W
 
W
L
 
L
T
 
M
L
 
W
R
 
R
I
 
A
L
 
K
G
 
G
A
 
T
E
 
T
H
 
G
I
 
F
G
 
E
A
 
A
M
 
H
F
 
V
E
 
D
E
 
K
V
 
C
I
 
L
D
 
E
R
 
L
A
 
A
A
 
E
D
 
Y
T
 
L
H
 
Y
R
 
N
L
 
I
L
 
I
A
 
K
N
 
N
D
 
R
P
 
E
A
 
G
F
 
Y
E
 
E
V
 
M
F
 
V
-
 
F
-
 
D
-
 
G
T
 
K
P
 
P
R
 
Q
L
 
H
S
 
T
T
 
N
L
 
V
V
 
C
F
 
F
R
 
W
F
 
Y
V
 
I
A
 
P
P
 
P
G
 
S
V
 
L
A
 
R
-
 
T
-
 
L
-
 
E
-
 
D
N
 
N
E
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
M
-
 
S
R
 
R
L
 
L
D
 
S
E
 
K
I
 
V
N
 
A
R
 
P
E
 
V
I
 
I
R
 
K
K
 
A
A
 
R
I
 
M
F
 
M
R
 
E
S
 
Y
G
 
G
A
 
T
A
 
T
V
 
M
I
 
V
A
 
S
A
 
Y
T
 
Q
V
 
P
V
 
L
E
 
G
G
 
D
R
 
K
-
 
V
Q
 
N
Y
 
F
L
 
F
K
x
R
F
 
M
T
 
V
L
 
I
L
 
S
N
 
N
P
 
P
E
 
A
T
 
A
T
 
T
L
 
H
N
 
Q
D
 
D
L
 
I
R
 
D
A
 
F
I
 
L
V
 
I
E
 
E
L
 
E
I
 
I
R
 
E
D
 
R
H
 
L
G
 
G
A
 
Q
R
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6enzA Crystal structure of mouse gadl1 (see paper)
29% identity, 85% coverage: 65:494/507 of query aligns to 55:484/487 of 6enzA

query
sites
6enzA
V
 
L
D
 
D
L
 
L
E
 
E
-
 
M
R
 
R
P
 
D
L
 
T
G
 
G
D
 
E
A
 
S
G
 
Q
A
 
D
A
 
K
L
 
L
R
 
L
E
 
K
L
 
L
D
 
C
Q
 
Q
L
 
D
Y
 
V
L
 
I
R
 
H
D
 
F
A
 
S
V
 
V
Y
 
K
F
 
T
H
 
N
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
F
V
 
F
A
 
N
H
 
Q
L
 
L
N
 
Y
C
 
A
P
 
G
V
 
L
V
 
D
L
 
Y
P
 
Y
A
 
S
L
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
R
V
 
I
L
 
I
V
 
T
S
 
E
S
 
A
L
 
L
N
 
N
S
 
P
S
 
S
L
 
I
D
 
Y
T
 
T
W
 
Y
D
 
E
Q
 
V
S
 
S
A
 
P
G
 
V
G
 
F
T
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
E
Q
 
E
R
 
A
L
 
V
I
 
L
D
 
K
W
 
K
T
 
M
C
 
I
A
 
E
R
 
C
I
 
V
G
 
G
L
 
W
G
 
-
S
 
K
Q
 
E
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
I
F
 
F
T
 
N
S
 
P
G
|
G
G
|
G
T
x
S
Q
 
V
S
 
S
N
 
N
L
 
M
M
 
C
G
 
A
L
 
M
L
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
Y
H
 
R
V
 
H
C
 
C
N
 
P
R
 
D
L
 
I
P
 
K
D
 
E
H
 
K
G
 
G
G
 
L
N
 
S
L
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
R
E
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
I
I
 
L
F
 
F
A
 
T
S
 
S
R
 
A
A
 
E
S
 
C
H
|
H
F
 
Y
S
 
S
V
 
M
Q
 
K
K
 
K
S
 
A
A
 
A
A
 
S
L
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
G
Y
 
T
D
 
Q
A
 
N
V
 
V
R
 
Y
S
 
F
I
 
V
E
 
E
T
 
T
D
 
D
S
 
G
A
 
R
Q
 
G
C
 
K
M
 
M
S
 
I
V
 
P
P
 
E
A
 
D
L
 
L
A
 
E
Q
 
K
A
 
Q
L
 
I
A
 
W
D
 
Q
C
 
A
Q
 
R
R
 
Q
L
 
E
G
 
G
E
 
A
L
 
V
P
 
P
M
 
F
A
 
L
V
 
V
V
 
C
A
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
T
T
|
T
D
 
V
F
 
L
G
 
G
S
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
V
C
 
C
Q
 
E
H
 
R
Y
 
H
G
 
G
V
 
L
W
 
W
L
 
L
H
 
H
V
 
V
D
|
D
A
 
A
A
x
S
Y
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
S
L
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
S
P
 
R
R
 
K
Y
 
H
R
 
R
D
 
R
W
 
L
L
 
L
A
 
H
G
 
G
I
 
I
E
 
H
H
 
R
A
 
A
D
 
D
S
 
S
V
 
V
T
 
A
V
 
W
D
 
N
Y
 
P
H
 
H
K
|
K
S
 
M
F
 
L
F
 
M
Q
 
A
P
 
G
V
 
I
S
 
Q
C
 
C
S
 
S
G
 
A
F
 
L
F
 
L
V
 
V
R
 
K
Q
 
D
R
 
K
Q
 
S
H
 
D
L
 
L
S
 
L
Y
 
K
I
 
K
T
 
C
H
 
Y
H
 
S
A
 
A
D
 
K
Y
 
A
L
 
T
N
 
D
P
 
K
R
 
F
S
 
Y
Q
 
D
T
 
V
R
 
S
E
 
Y
G
 
D
T
 
T
P
 
G
N
 
-
L
 
-
V
 
-
N
 
D
K
 
K
S
 
S
I
 
I
Q
 
Q
T
 
C
T
 
S
R
 
R
R
 
R
F
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
F
K
 
K
L
 
F
W
 
W
L
 
M
T
 
T
L
 
W
R
 
K
I
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
T
E
 
S
H
 
G
I
 
L
G
 
-
A
 
-
M
 
-
F
 
-
E
 
E
E
 
E
V
 
R
I
 
V
D
 
N
R
 
R
A
 
A
A
 
F
D
 
A
T
 
L
H
 
S
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
 
V
N
 
D
D
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
K
-
 
R
P
 
E
A
 
G
F
 
F
E
 
K
V
 
L
F
 
L
T
 
M
-
 
E
P
 
P
R
 
E
L
 
Y
S
 
T
T
 
N
L
 
V
V
 
C
F
 
F
R
 
W
F
 
Y
V
 
I
A
 
P
P
 
P
G
 
S
V
 
L
A
 
R
N
 
E
-
 
M
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
F
-
 
W
E
 
R
R
 
K
L
 
L
D
 
S
E
 
L
I
 
V
N
 
A
R
 
P
E
 
A
I
 
I
R
 
K
K
 
E
A
 
K
I
 
M
F
 
M
R
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
S
A
 
L
V
 
M
I
 
L
A
 
G
A
 
Y
T
 
Q
V
 
P
V
 
H
E
 
R
G
 
G
R
 
K
-
 
V
Q
 
N
Y
 
F
L
 
F
K
 
R
F
 
Q
T
 
V
L
 
V
L
 
I
N
 
S
P
 
P
E
 
Q
T
 
V
T
 
S
L
 
R
N
 
E
D
 
D
L
 
M
R
 
D
A
 
F
I
 
L
V
 
L
E
 
D
L
 
E
I
 
I
R
 
D
D
 
S
H
 
L
G
 
G

2jisB Human cysteine sulfinic acid decarboxylase (csad) in complex with plp.
31% identity, 84% coverage: 32:459/507 of query aligns to 27:448/487 of 2jisB

query
sites
2jisB
L
 
I
Q
 
Q
Q
 
K
G
 
G
L
 
T
N
 
S
L
 
V
V
 
S
Q
 
Q
Q
 
K
C
 
V
L
 
C
Q
 
E
R
 
W
Q
 
K
Q
 
E
Q
 
-
P
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
-
L
 
-
P
 
P
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
-
D
 
-
F
 
-
E
 
Q
R
 
L
V
 
L
D
 
D
L
 
L
E
 
E
-
 
L
R
 
R
P
 
S
L
 
Q
G
 
G
D
 
E
A
 
S
G
 
Q
A
 
K
A
 
Q
L
 
I
R
 
L
E
 
E
L
 
R
D
 
C
Q
 
R
L
 
A
Y
 
V
L
 
I
R
 
R
D
 
Y
A
 
S
V
 
V
Y
 
K
F
 
T
H
 
G
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
F
V
 
F
A
 
N
H
 
Q
L
 
L
N
 
F
C
 
S
P
 
G
V
 
L
V
 
D
L
 
P
P
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
G
E
 
R
V
 
I
L
 
I
V
 
T
S
 
E
S
 
S
L
 
L
N
 
N
S
 
T
S
 
S
L
 
Q
D
 
Y
T
 
T
W
 
Y
D
 
E
Q
 
I
S
 
A
A
 
P
G
 
V
G
 
F
T
 
V
L
 
L
I
 
M
E
 
E
Q
 
E
R
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
R
W
 
K
T
 
L
C
 
R
A
 
A
R
 
L
I
 
V
G
 
G
L
 
W
G
 
S
S
 
S
Q
 
-
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
I
F
 
F
T
 
C
S
 
P
G
|
G
G
|
G
T
x
S
Q
 
I
S
 
S
N
 
N
L
 
M
M
 
Y
G
 
A
L
 
V
L
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
Y
H
 
Q
V
 
-
C
 
-
N
 
-
R
 
R
L
 
Y
P
 
P
D
 
D
H
 
C
G
 
K
G
 
Q
N
 
R
L
 
G
R
 
L
H
 
R
G
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
P
E
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
A
I
 
L
F
 
F
A
 
T
S
 
S
R
 
K
A
 
E
S
 
C
H
 
H
F
 
Y
S
 
S
V
 
I
Q
 
Q
K
 
K
S
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
Y
 
T
D
 
D
A
 
S
V
 
V
R
 
R
S
 
V
I
 
V
E
 
K
T
 
A
D
 
D
S
 
E
A
 
R
Q
 
G
C
 
K
M
 
M
S
 
V
V
 
P
P
 
E
A
 
D
L
 
L
A
 
E
Q
 
R
A
 
Q
L
 
I
A
 
G
D
 
M
C
 
A
Q
 
E
R
 
A
L
 
E
G
 
G
E
 
A
L
 
V
P
 
P
M
 
F
A
 
L
V
 
V
V
 
S
A
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
T
T
|
T
D
 
V
F
 
L
G
 
G
S
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
E
E
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
D
L
 
V
C
 
C
Q
 
Q
H
 
R
Y
 
H
G
 
G
V
 
L
W
 
W
L
 
L
H
 
H
V
 
V
D
|
D
A
 
A
A
|
A
Y
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
S
L
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
S
P
 
Q
R
 
T
Y
 
H
R
 
R
D
 
H
W
 
L
L
 
L
A
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
Q
H
 
R
A
 
A
D
 
D
S
 
S
V
 
V
T
 
A
V
 
W
D
x
N
Y
 
P
H
 
H
K
|
K
S
 
L
F
 
L
F
 
A
Q
 
A
P
 
G
V
 
L
S
 
Q
C
 
C
S
 
S
G
 
A
F
 
L
F
 
L
V
 
L
R
 
Q
Q
 
D
R
 
T
Q
 
S
H
 
N
L
 
L
S
 
L
Y
 
K
I
 
R
T
 
C
H
 
H
-
 
G
-
 
S
H
 
Q
A
 
A
D
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
F
P
 
Q
R
 
Q
S
 
D
Q
 
K
T
 
F
R
 
Y
E
 
D
G
 
V
T
 
A
P
 
L
N
 
D
L
 
T
V
 
G
N
 
D
K
 
K
S
 
V
I
 
V
Q
 
Q
T
x
C
T
x
G
R
 
R
R
 
R
F
 
V
D
 
D
A
 
C
L
 
L
K
 
K
L
 
L
W
 
W
L
 
L
T
 
M
L
 
W
R
 
K
I
 
A
L
 
Q
G
 
G
A
 
D
E
 
Q
H
 
G
I
 
L
G
 
-
A
 
-
M
 
-
F
 
-
E
 
E
E
 
R
V
 
R
I
 
I
D
 
D
R
 
Q
A
 
A
A
 
F
D
 
V
T
 
L
H
 
A
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
 
V
N
 
E
D
 
E
-
 
M
-
 
K
-
 
K
-
 
R
P
 
E
A
 
G
F
 
F
E
 
E
-
 
L
V
 
V
F
 
M
T
 
E
P
 
P
R
 
E
L
 
F
S
 
V
T
 
N
L
 
V
V
 
C
F
 
F
R
 
W
F
 
F
V
 
V
A
 
P
P
 
P
G
 
S
V
 
L
-
 
R
-
 
G
-
 
K
-
 
Q
-
 
E
-
 
S
-
 
P
-
 
D
A
 
Y
N
 
H
E
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
S
E
 
K
I
 
V
N
 
A
R
 
P
E
 
V
I
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
R
I
 
M
F
 
V
R
 
K
S
 
E
G
 
G
A
 
S
A
 
M
V
 
M
I
 
I
A
 
G

2okkA The x-ray crystal structure of the 65kda isoform of glutamic acid decarboxylase (gad65) (see paper)
28% identity, 88% coverage: 48:494/507 of query aligns to 25:481/483 of 2okkA

query
sites
2okkA
Q
 
Q
P
 
D
F
 
V
S
 
M
G
 
N
I
 
I
L
 
L
P
 
L
Q
 
Q
E
 
Y
L
 
V
A
 
V
A
 
K
D
 
S
F
 
F
E
 
D
R
 
R
-
 
S
-
 
T
-
 
K
-
 
V
V
 
I
D
 
D
L
 
F
E
 
H
R
 
Y
P
 
P
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
Y
-
 
N
-
 
W
-
 
E
L
 
L
G
 
A
D
 
D
A
 
Q
G
 
P
A
 
Q
A
 
N
L
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
I
-
 
L
-
 
M
-
 
H
D
 
C
Q
 
Q
L
 
T
Y
 
T
L
 
L
R
 
K
D
 
Y
A
 
A
V
 
I
Y
 
K
F
 
T
H
 
G
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
V
 
F
A
 
N
H
x
Q
L
|
L
N
x
S
C
 
T
P
 
G
V
 
L
V
 
D
L
 
M
P
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
D
V
 
W
L
 
L
V
 
T
S
 
S
S
 
T
L
 
A
N
 
N
S
 
T
S
 
N
L
 
M
D
 
F
T
 
T
W
 
Y
D
 
E
Q
 
I
S
 
A
A
 
P
G
 
V
G
 
F
T
 
V
L
 
L
I
 
L
E
 
E
Q
 
Y
R
 
V
L
 
T
I
 
L
D
 
K
W
 
K
T
 
M
C
 
R
A
 
E
R
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
W
-
 
P
G
 
G
S
 
G
Q
 
S
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
I
F
 
F
T
 
S
S
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
Q
 
I
S
 
S
N
 
N
L
 
M
M
 
Y
G
 
A
L
 
M
L
 
M
L
 
I
A
 
A
R
 
R
E
 
F
H
 
K
V
 
M
C
 
F
N
 
P
R
 
E
L
 
V
P
 
K
D
 
E
H
 
K
G
 
G
G
 
-
N
 
-
L
 
-
R
 
M
H
 
A
G
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
R
E
 
L
A
 
I
A
 
A
G
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
F
 
F
A
 
T
S
 
S
R
 
E
A
 
H
S
 
S
H
|
H
F
 
F
S
 
S
V
 
L
Q
 
K
K
 
K
S
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
G
Y
 
T
D
 
D
A
 
S
V
 
V
R
 
I
S
 
L
I
 
I
E
 
K
T
 
C
D
 
D
S
 
E
A
 
R
Q
 
G
C
 
K
M
 
M
S
 
I
V
 
P
P
 
S
A
 
D
L
 
L
A
 
E
Q
 
R
A
 
R
L
 
I
A
 
L
D
 
E
C
 
A
Q
 
K
R
 
Q
L
 
K
G
 
G
E
 
F
L
 
V
P
 
P
M
 
F
A
 
L
V
 
V
V
 
S
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
V
F
 
Y
G
 
G
S
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
L
E
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
I
C
 
C
Q
 
K
H
 
K
Y
 
Y
G
 
K
V
 
I
W
 
W
L
 
M
H
 
H
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Y
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
M
A
 
S
P
 
R
R
 
K
Y
 
H
R
 
K
D
 
W
W
 
K
L
 
L
A
 
S
G
 
G
I
 
V
E
 
E
H
 
R
A
 
A
D
 
N
S
 
S
V
 
V
T
 
T
V
 
W
D
 
N
Y
 
P
H
 
H
K
|
K
S
 
M
F
 
M
F
 
G
Q
 
V
P
 
P
V
 
L
S
 
Q
C
 
C
S
 
S
G
 
A
F
 
L
F
 
L
V
 
V
R
 
R
Q
 
E
R
 
E
Q
 
-
H
 
-
L
 
-
S
 
-
Y
 
-
I
 
-
T
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
-
D
 
G
Y
 
L
L
 
M
N
 
Q
P
 
N
R
 
C
S
 
N
Q
 
Q
T
 
M
R
 
H
E
 
D
G
 
L
T
 
S
P
 
Y
N
 
D
L
 
T
V
 
G
N
 
D
K
 
K
S
 
A
I
 
L
Q
 
Q
T
 
C
T
 
G
R
 
R
R
 
H
F
 
V
D
 
D
A
 
V
L
 
F
K
 
K
L
 
L
W
 
W
L
 
L
T
 
M
L
 
W
R
 
R
I
 
A
L
 
K
G
 
G
A
 
T
E
 
T
H
 
G
I
 
F
G
 
E
A
 
A
M
 
H
F
 
V
E
 
D
E
 
K
V
 
C
I
 
L
D
 
E
R
 
L
A
 
A
A
 
E
D
 
Y
T
 
L
H
 
Y
R
 
N
L
 
I
L
 
I
A
 
K
N
 
N
D
 
R
P
 
E
A
 
G
F
 
Y
E
 
E
V
 
M
F
 
V
-
 
F
-
 
D
-
 
G
T
 
K
P
 
P
R
 
Q
L
 
H
S
 
T
T
 
N
L
 
V
V
 
C
F
 
F
R
 
W
F
 
Y
V
 
I
A
 
P
P
 
P
G
 
S
V
 
L
A
 
R
N
 
T
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
M
E
 
S
R
 
R
L
 
L
D
 
S
E
 
K
I
 
V
N
 
A
R
 
P
E
 
V
I
 
I
R
 
K
K
 
A
A
 
R
I
 
M
F
 
M
R
 
E
S
 
Y
G
 
G
A
 
T
A
 
T
V
 
M
I
 
V
A
 
S
A
 
Y
T
 
Q
V
 
P
V
 
L
E
 
G
G
 
D
R
 
K
-
 
V
Q
 
N
Y
 
F
L
 
F
K
x
R
F
 
M
T
 
V
L
 
I
L
 
S
N
 
N
P
 
P
E
 
A
T
 
A
T
 
T
L
 
H
N
 
Q
D
 
D
L
 
I
R
 
D
A
 
F
I
 
L
V
 
I
E
 
E
L
 
E
I
 
I
R
 
E
D
 
R
H
 
L
G
 
G

3vp6A Structural characterization of glutamic acid decarboxylase; insights into the mechanism of autoinactivation (see paper)
29% identity, 91% coverage: 36:494/507 of query aligns to 33:499/500 of 3vp6A

query
sites
3vp6A
L
 
L
N
 
N
L
 
Y
V
 
V
Q
 
R
Q
 
K
C
 
T
L
 
F
Q
 
D
R
 
R
Q
 
S
Q
 
T
Q
 
K
P
 
V
F
 
L
S
 
D
G
 
F
I
 
H
L
 
H
P
 
P
Q
 
H
E
 
Q
L
 
L
A
 
L
A
 
E
D
 
G
F
 
M
E
 
E
R
 
G
V
 
F
D
 
N
L
 
L
E
 
E
R
 
-
P
 
-
L
 
L
G
 
S
D
 
D
A
 
H
G
 
P
A
 
E
A
 
S
L
 
L
R
 
E
E
 
Q
L
 
I
-
 
L
-
 
V
-
 
D
D
 
C
Q
 
R
L
 
D
Y
 
T
L
 
L
R
 
K
D
 
Y
A
 
G
V
 
V
Y
 
R
F
 
T
H
 
G
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
F
V
 
F
A
 
N
H
x
Q
L
|
L
N
x
S
C
 
T
P
 
G
V
 
L
V
 
D
L
 
I
P
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
A
A
 
G
E
 
E
V
 
W
L
 
L
V
 
T
S
 
S
S
 
T
L
 
A
N
 
N
S
 
T
S
 
N
L
 
M
D
x
F
T
 
T
W
 
Y
D
 
E
Q
 
I
S
 
A
A
 
P
G
 
V
G
 
F
T
 
V
L
 
L
I
 
M
E
 
E
Q
 
Q
R
 
I
L
 
T
I
 
L
D
 
K
W
 
K
T
 
M
C
 
R
A
 
E
R
 
I
I
 
V
G
 
G
L
 
W
G
 
S
S
 
S
Q
 
K
-
 
D
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
I
F
 
F
T
 
S
S
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
Q
 
I
S
 
S
N
 
N
L
 
M
M
 
Y
G
 
S
L
 
I
L
 
M
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
Y
H
 
K
V
 
Y
C
 
F
N
 
P
R
 
E
L
 
V
P
 
K
D
 
T
H
 
K
G
 
G
G
 
-
N
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
M
A
 
A
E
 
A
A
 
V
A
 
P
G
 
K
L
 
L
R
 
V
I
 
L
F
 
F
A
 
T
S
 
S
R
 
E
A
 
Q
S
 
S
H
|
H
F
 
Y
S
 
S
V
 
I
Q
 
K
K
 
K
S
 
A
A
 
G
A
 
A
L
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
F
G
 
G
Y
 
T
D
 
D
A
 
N
V
 
V
R
 
I
S
 
L
I
 
I
E
 
K
T
 
C
D
 
N
S
 
E
A
 
R
Q
 
G
C
 
K
M
 
I
S
 
-
V
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
D
A
 
F
Q
 
E
A
 
A
-
 
K
L
 
I
A
 
L
D
 
E
C
 
A
Q
 
K
R
 
Q
L
 
K
G
 
G
E
 
Y
L
 
V
P
 
P
M
 
F
A
 
Y
V
 
V
V
 
N
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
V
F
 
Y
G
 
G
S
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
P
L
 
I
P
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
D
L
 
I
C
 
C
Q
 
E
H
 
K
Y
 
Y
G
 
N
V
 
L
W
 
W
L
 
L
H
 
H
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Y
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
M
A
 
S
P
 
R
R
 
K
Y
 
H
R
 
R
D
 
H
W
 
K
L
 
L
A
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
R
A
 
A
D
 
N
S
 
S
V
 
V
T
 
T
V
 
W
D
 
N
Y
 
P
H
 
H
K
|
K
S
 
M
F
 
M
F
 
G
Q
 
V
P
 
L
V
 
L
S
 
Q
C
 
C
S
 
S
G
 
A
F
 
I
F
 
L
V
 
V
R
 
K
Q
 
E
R
 
K
Q
 
G
H
 
I
L
 
L
S
 
Q
Y
 
G
I
 
C
T
 
N
H
 
Q
-
 
M
H
 
H
A
 
A
D
 
S
Y
 
Y
L
|
L
N
 
F
P
 
Q
R
 
Q
S
 
D
Q
 
K
T
 
H
R
 
Y
E
 
D
G
 
V
T
 
S
P
 
Y
N
 
D
L
 
T
V
 
G
N
 
D
K
 
K
S
 
A
I
 
I
Q
 
Q
T
 
C
T
 
G
R
 
R
R
 
H
F
 
V
D
 
D
A
 
I
L
 
F
K
 
K
L
 
F
W
 
W
L
 
L
T
 
M
L
 
W
R
 
K
I
 
A
L
 
K
G
 
G
A
 
T
E
 
V
H
 
G
I
 
F
G
 
E
A
 
N
M
 
Q
F
 
I
E
 
N
E
 
K
V
 
C
I
 
L
D
 
E
R
 
L
A
 
A
A
 
E
D
 
Y
T
 
L
H
 
Y
R
 
A
L
 
K
L
 
I
A
 
K
N
 
N
D
 
R
P
 
E
A
 
E
F
 
F
E
 
E
-
 
M
V
 
V
F
 
F
T
 
N
-
 
G
-
 
E
P
 
P
R
 
E
L
 
H
S
 
T
T
 
N
L
 
V
V
 
C
F
 
F
R
 
W
F
 
Y
V
 
I
A
 
P
P
 
Q
-
 
S
-
 
L
-
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
P
N
 
D
-
 
S
-
 
P
-
 
Q
-
 
R
-
 
R
E
 
E
R
 
K
L
 
L
D
 
H
E
 
K
I
 
V
N
 
A
R
 
P
E
 
K
I
 
I
R
 
K
K
 
A
A
 
L
I
 
M
F
 
M
R
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
T
A
 
T
V
 
M
I
 
V
A
 
G
A
 
Y
T
 
Q
V
 
P
V
 
Q
E
 
G
G
 
D
R
 
K
-
 
A
Q
 
N
Y
 
F
L
 
F
K
x
R
F
 
M
T
 
V
L
 
I
L
 
S
N
 
N
P
 
P
E
 
A
T
 
A
T
 
T
L
 
Q
N
 
S
D
 
D
L
 
I
R
 
D
A
 
F
I
 
L
V
 
I
E
 
E
L
 
E
I
 
I
R
 
E
D
 
R
H
 
L
G
 
G

2okjB The x-ray crystal structure of the 67kda isoform of glutamic acid decarboxylase (gad67) (see paper)
28% identity, 91% coverage: 36:497/507 of query aligns to 33:502/504 of 2okjB

query
sites
2okjB
L
 
L
N
 
N
L
 
Y
V
 
V
Q
 
R
Q
 
K
C
 
T
L
 
F
Q
 
D
R
 
R
Q
 
S
Q
 
T
Q
 
K
P
 
V
F
 
L
S
 
D
G
 
F
I
 
H
L
 
H
P
 
P
Q
 
H
E
 
Q
L
 
L
A
 
L
A
 
E
D
 
G
F
 
M
E
 
E
R
 
G
V
 
F
D
 
N
L
 
L
E
 
E
R
 
-
P
 
-
L
 
L
G
 
S
D
 
D
A
 
H
G
 
P
A
 
E
A
 
S
L
 
L
R
 
E
E
 
Q
L
 
I
D
 
-
Q
 
L
L
 
V
Y
 
D
L
 
C
R
 
R
D
 
D
A
 
T
V
 
L
Y
 
K
F
 
Y
H
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
T
-
 
G
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
F
V
 
F
A
 
N
H
x
Q
L
|
L
N
x
S
C
 
T
P
 
G
V
 
L
V
 
D
L
 
I
P
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
A
A
 
G
E
 
E
V
 
W
L
 
L
V
 
T
S
 
S
S
 
T
L
 
A
N
 
N
S
 
T
S
 
N
L
 
M
D
 
F
T
 
T
W
 
Y
D
 
E
Q
 
I
S
 
A
A
 
P
G
 
V
G
 
F
T
 
V
L
 
L
I
 
M
E
 
E
Q
 
Q
R
 
I
L
 
T
I
 
L
D
 
K
W
 
K
T
 
M
C
 
R
A
 
E
R
 
I
I
 
V
G
 
G
L
 
W
G
 
S
S
 
S
Q
 
K
-
 
D
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
I
F
 
F
T
 
S
S
 
P
G
|
G
G
|
G
T
x
A
Q
 
I
S
 
S
N
 
N
L
 
M
M
 
Y
G
 
S
L
 
I
L
 
M
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
Y
H
 
K
V
 
Y
C
 
F
N
 
P
R
 
E
L
 
V
P
 
K
D
 
T
H
 
K
G
 
G
G
 
-
N
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
M
A
 
A
E
 
A
A
 
V
A
 
P
G
 
K
L
 
L
R
 
V
I
 
L
F
 
F
A
 
T
S
 
S
R
 
E
A
 
Q
S
 
S
H
|
H
F
 
Y
S
 
S
V
 
I
Q
 
K
K
 
K
S
 
A
A
 
G
A
 
A
L
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
F
G
 
G
Y
 
T
D
 
D
A
 
N
V
 
V
R
 
I
S
 
L
I
 
I
E
 
K
T
 
C
D
 
N
S
 
E
A
 
R
Q
 
G
C
 
K
M
 
I
S
 
I
V
 
P
P
 
A
A
 
D
L
 
F
A
 
E
Q
 
A
A
 
K
L
 
I
A
 
L
D
 
E
C
 
A
Q
 
K
R
 
Q
L
 
K
G
 
G
E
 
Y
L
 
V
P
 
P
M
 
F
A
 
Y
V
 
V
V
 
N
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
|
T
D
 
V
F
 
Y
G
 
G
S
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
P
L
 
I
P
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
D
L
 
I
C
 
C
Q
 
E
H
 
K
Y
 
Y
G
 
N
V
 
L
W
 
W
L
 
L
H
 
H
V
 
V
D
|
D
A
 
A
A
|
A
Y
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
M
A
 
S
P
 
R
R
 
K
Y
 
H
R
 
R
D
 
H
W
 
K
L
 
L
A
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
R
A
 
A
D
 
N
S
 
S
V
 
V
T
 
T
V
 
W
D
x
N
Y
 
P
H
|
H
K
|
K
S
 
M
F
 
M
F
 
G
Q
 
V
P
 
L
V
 
L
S
 
Q
C
 
C
S
 
S
G
 
A
F
 
I
F
 
L
V
 
V
R
 
K
Q
 
E
R
 
K
Q
 
G
H
 
I
L
 
L
S
 
Q
Y
 
G
I
 
C
T
 
N
H
 
Q
H
 
M
-
 
C
A
 
A
D
 
G
Y
 
Y
L
 
L
N
 
F
P
 
Q
R
 
P
S
 
D
Q
 
K
T
 
Q
R
 
Y
E
 
D
G
 
V
T
 
S
P
 
Y
N
 
D
L
 
T
V
 
G
N
 
D
K
 
K
S
 
A
I
 
I
Q
 
Q
T
 
C
T
 
G
R
 
R
R
 
H
F
 
V
D
 
D
A
 
I
L
 
F
K
 
K
L
 
F
W
 
W
L
 
L
T
 
M
L
 
W
R
 
K
I
 
A
L
 
K
G
 
G
A
 
T
E
 
V
H
 
G
I
 
F
G
 
E
A
 
N
M
 
Q
F
 
I
E
 
N
E
 
K
V
 
C
I
 
L
D
 
E
R
 
L
A
 
A
A
 
E
D
 
Y
T
 
L
H
 
Y
R
 
A
L
 
K
L
 
I
A
 
K
N
 
N
D
 
R
P
 
E
A
 
E
F
 
F
E
 
E
-
 
M
V
 
V
F
 
F
T
 
N
-
 
G
-
 
E
P
 
P
R
 
E
L
 
H
S
 
T
T
 
N
L
 
V
V
 
C
F
 
F
R
 
W
F
 
Y
V
 
I
A
 
P
P
 
Q
-
 
S
-
 
L
-
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
P
N
 
D
-
 
S
-
 
P
-
 
Q
-
 
R
-
 
R
E
 
E
R
 
K
L
 
L
D
 
H
E
 
K
I
 
V
N
 
A
R
 
P
E
 
K
I
 
I
R
 
K
K
 
A
A
 
L
I
 
M
F
 
M
R
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
T
A
 
T
V
 
M
I
 
V
A
 
G
A
 
Y
T
 
Q
V
 
P
V
 
Q
E
 
G
G
 
D
R
 
K
-
 
A
Q
 
N
Y
 
F
L
 
F
K
x
R
F
 
M
T
 
V
L
 
I
L
 
S
N
 
N
P
 
P
E
 
A
T
 
A
T
 
T
L
 
Q
N
 
S
D
 
D
L
 
I
R
 
D
A
 
F
I
 
L
V
 
I
E
 
E
L
 
E
I
 
I
R
 
E
D
 
R
H
 
L
G
 
G
A
 
Q
R
 
D
L
 
L

Q99259 Glutamate decarboxylase 1; 67 kDa glutamic acid decarboxylase; GAD-67; Glutamate decarboxylase 67 kDa isoform; EC 4.1.1.15 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
28% identity, 91% coverage: 36:497/507 of query aligns to 125:594/594 of Q99259

query
sites
Q99259
L
 
L
N
 
N
L
 
Y
V
 
V
Q
 
R
Q
 
K
C
 
T
L
 
F
Q
 
D
R
 
R
Q
 
S
Q
 
T
Q
 
K
P
 
V
F
 
L
S
 
D
G
 
F
I
 
H
L
 
H
P
 
P
Q
 
H
E
 
Q
L
 
L
A
 
L
A
 
E
D
 
G
F
 
M
E
 
E
R
 
G
V
 
F
D
 
N
L
 
L
E
 
E
R
 
-
P
 
-
L
 
L
G
 
S
D
 
D
A
 
H
G
 
P
A
 
E
A
 
S
L
 
L
R
 
E
E
 
Q
L
 
I
-
 
L
-
 
V
-
 
D
D
 
C
Q
 
R
L
 
D
Y
 
T
L
 
L
R
 
K
D
 
Y
A
 
G
V
 
V
Y
 
R
F
 
T
H
 
G
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
F
V
 
F
A
 
N
H
x
Q
L
|
L
N
x
S
C
 
T
P
 
G
V
 
L
V
 
D
L
 
I
P
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
A
A
 
G
E
 
E
V
 
W
L
 
L
V
 
T
S
 
S
S
 
T
L
 
A
N
 
N
S
 
T
S
 
N
L
 
M
D
 
F
T
 
T
W
 
Y
D
 
E
Q
 
I
S
 
A
A
 
P
G
 
V
G
 
F
T
 
V
L
 
L
I
 
M
E
 
E
Q
 
Q
R
x
I
L
 
T
I
 
L
D
 
K
W
x
K
T
 
M
C
 
R
A
 
E
R
 
I
I
 
V
G
 
G
L
 
W
G
 
S
S
 
S
Q
 
K
-
 
D
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
I
F
 
F
T
 
S
S
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
Q
 
I
S
 
S
N
 
N
L
 
M
M
 
Y
G
 
S
L
 
I
L
 
M
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
Y
H
 
K
V
 
Y
C
 
F
N
 
P
R
 
E
L
 
V
P
 
K
D
 
T
H
 
K
G
 
G
G
 
-
N
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
M
A
 
A
E
 
A
A
 
V
A
 
P
G
 
K
L
 
L
R
 
V
I
 
L
F
 
F
A
 
T
S
 
S
R
 
E
A
 
Q
S
 
S
H
 
H
F
 
Y
S
 
S
V
 
I
Q
 
K
K
 
K
S
 
A
A
 
G
A
 
A
L
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
F
G
 
G
Y
 
T
D
 
D
A
 
N
V
 
V
R
 
I
S
 
L
I
 
I
E
 
K
T
 
C
D
 
N
S
 
E
A
 
R
Q
 
G
C
 
K
M
 
I
S
 
-
V
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
D
A
 
F
Q
 
E
A
 
A
-
 
K
L
 
I
A
 
L
D
 
E
C
 
A
Q
 
K
R
 
Q
L
 
K
G
 
G
E
 
Y
L
 
V
P
 
P
M
 
F
A
 
Y
V
 
V
V
 
N
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
V
F
 
Y
G
 
G
S
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
P
L
 
I
P
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
D
L
 
I
C
 
C
Q
 
E
H
 
K
Y
 
Y
G
 
N
V
 
L
W
 
W
L
 
L
H
 
H
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Y
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
M
A
 
S
P
 
R
R
 
K
Y
 
H
R
 
R
D
 
H
W
 
K
L
 
L
A
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
R
A
 
A
D
 
N
S
 
S
V
 
V
T
 
T
V
 
W
D
 
N
Y
 
P
H
 
H
K
|
K
S
 
M
F
 
M
F
 
G
Q
 
V
P
 
L
V
 
L
S
 
Q
C
 
C
S
 
S
G
 
A
F
 
I
F
 
L
V
 
V
R
 
K
Q
 
E
R
 
K
Q
 
G
H
 
I
L
 
L
S
 
Q
Y
 
G
I
 
C
T
 
N
H
 
Q
H
 
M
-
 
C
A
 
A
D
 
G
Y
 
Y
L
 
L
N
 
F
P
 
Q
R
 
P
S
 
D
Q
 
K
T
 
Q
R
 
Y
E
 
D
G
 
V
T
 
S
P
 
Y
N
 
D
L
 
T
V
 
G
N
 
D
K
 
K
S
 
A
I
 
I
Q
 
Q
T
 
C
T
 
G
R
 
R
R
 
H
F
 
V
D
 
D
A
 
I
L
 
F
K
 
K
L
 
F
W
 
W
L
 
L
T
 
M
L
 
W
R
 
K
I
 
A
L
 
K
G
 
G
A
 
T
E
 
V
H
 
G
I
 
F
G
 
E
A
 
N
M
 
Q
F
 
I
E
 
N
E
 
K
V
 
C
I
 
L
D
 
E
R
 
L
A
 
A
A
 
E
D
 
Y
T
 
L
H
 
Y
R
 
A
L
 
K
L
 
I
A
 
K
N
 
N
D
 
R
P
 
E
A
 
E
F
 
F
E
 
E
-
 
M
V
 
V
F
 
F
T
 
N
-
 
G
-
 
E
P
 
P
R
 
E
L
 
H
S
 
T
T
 
N
L
 
V
V
 
C
F
 
F
R
 
W
F
 
Y
V
 
I
A
 
P
P
 
Q
-
 
S
-
 
L
-
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
P
N
 
D
-
 
S
-
 
P
-
 
Q
-
x
R
-
x
R
E
|
E
R
x
K
L
|
L
D
x
H
E
x
K
I
x
V
N
x
A
R
x
P
E
x
K
I
|
I
R
x
K
K
x
A
A
x
L
I
x
M
F
x
M
R
x
E
S
|
S
G
|
G
A
x
T
A
x
T
V
x
M
I
x
V
A
x
G
A
x
Y
T
x
Q
V
x
P
V
x
Q
E
x
G
G
x
D
R
x
K
-
x
A
Q
x
N
Y
x
F
L
x
F
K
x
R
F
x
M
T
x
V
L
x
I
L
x
S
N
|
N
P
|
P
E
x
A
T
x
A
T
|
T
L
x
Q
N
x
S
D
|
D
L
x
I
R
x
D
A
x
F
I
x
L
V
x
I
E
|
E
L
x
E
I
|
I
R
x
E
D
x
R
H
x
L
G
|
G
A
x
Q
R
x
D
L
|
L

Sites not aligning to the query:

6zekA Crystal structure of mouse csad (see paper)
31% identity, 80% coverage: 55:459/507 of query aligns to 37:439/476 of 6zekA

query
sites
6zekA
P
 
P
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
-
D
 
-
F
 
-
E
 
Q
R
 
L
V
 
L
D
 
D
L
 
L
E
 
E
-
 
L
R
 
Q
P
 
S
L
 
Q
G
 
G
D
 
E
A
 
S
G
 
R
A
 
E
A
 
Q
L
 
I
R
 
L
E
 
E
L
 
R
D
 
C
Q
 
R
L
 
T
Y
 
V
L
 
I
R
 
H
D
 
Y
A
 
S
V
 
V
Y
 
K
F
 
T
H
 
G
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
F
V
 
F
A
 
N
H
 
Q
L
 
L
N
 
F
C
 
S
P
 
G
V
 
L
V
 
D
L
 
P
P
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
G
E
 
R
V
 
I
L
 
I
V
 
T
S
 
E
S
 
S
L
 
L
N
 
N
S
 
T
S
 
S
L
 
Q
D
 
Y
T
 
T
W
 
Y
D
 
E
Q
 
I
S
 
A
A
 
P
G
 
V
G
 
F
T
 
V
L
 
L
I
 
M
E
 
E
Q
 
E
R
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
K
W
 
K
T
 
L
C
 
R
A
 
A
R
 
L
I
 
V
G
 
G
L
 
W
G
 
N
S
 
S
Q
 
-
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
T
 
C
S
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
I
S
 
S
N
 
N
L
 
M
M
 
Y
G
 
A
L
 
M
L
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
-
H
 
-
V
 
-
C
 
F
N
 
Q
R
 
R
L
 
Y
P
 
P
D
 
D
H
 
C
G
 
K
G
 
Q
N
 
R
L
 
G
R
 
L
H
 
R
G
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
P
E
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
A
I
 
L
F
 
F
A
 
T
S
 
S
R
 
K
A
 
E
S
 
C
H
 
H
F
 
Y
S
 
S
V
 
I
Q
 
T
K
 
K
S
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
Y
 
T
D
 
D
A
 
S
V
 
V
R
 
R
S
 
V
I
 
V
E
 
K
T
 
A
D
 
D
S
 
E
A
 
R
Q
 
G
C
 
R
M
 
M
S
 
I
V
 
P
P
 
E
A
 
D
L
 
L
A
 
E
Q
 
R
A
 
Q
L
 
I
A
 
I
D
 
L
C
 
A
Q
 
E
R
 
A
L
 
E
G
 
G
E
 
S
L
 
V
P
 
P
M
 
F
A
 
L
V
 
V
V
 
S
A
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
V
F
 
L
G
 
G
S
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
D
E
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
D
L
 
V
C
 
C
Q
 
Q
H
 
R
Y
 
H
G
 
G
V
 
L
W
 
W
L
 
F
H
 
H
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Y
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
S
L
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
S
P
 
R
R
 
T
Y
 
H
R
 
R
D
 
H
W
 
L
L
 
L
A
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
Q
H
 
R
A
 
A
D
 
D
S
 
S
V
 
V
T
 
A
V
 
W
D
 
N
Y
 
P
H
 
H
K
 
K
S
 
L
F
 
L
F
 
A
Q
 
A
P
 
G
V
 
L
S
 
Q
C
 
C
S
 
S
G
 
A
F
 
L
F
 
L
V
 
L
R
 
R
Q
 
D
R
 
T
Q
 
S
H
 
N
L
 
L
S
 
-
Y
 
L
I
 
K
T
 
R
H
 
C
H
 
H
A
 
G
D
 
S
Y
 
Q
L
 
L
N
 
F
P
 
Q
R
 
Q
S
 
D
Q
 
K
T
 
F
R
 
Y
E
 
D
G
 
V
T
 
A
P
 
L
N
 
D
L
 
T
V
 
G
N
 
D
K
 
K
S
 
V
I
 
V
Q
 
Q
T
 
C
T
 
G
R
 
R
R
 
R
F
 
V
D
 
D
A
 
C
L
 
L
K
 
K
L
 
L
W
 
W
L
 
L
T
 
M
L
 
W
R
 
K
I
 
A
L
 
Q
G
 
G
A
 
-
E
 
-
H
 
-
I
 
-
G
 
G
A
 
Q
M
 
G
F
 
L
E
 
E
E
 
R
V
 
R
I
 
I
D
 
D
R
 
Q
A
 
A
A
 
F
D
 
A
T
 
L
H
 
T
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
 
V
N
 
E
D
 
E
-
x
I
-
x
K
-
 
K
-
x
R
P
 
E
A
 
G
F
|
F
E
 
E
-
 
L
V
 
V
F
 
M
T
 
E
P
 
P
R
 
E
L
 
F
S
 
V
T
 
N
L
 
V
V
 
C
F
 
F
R
 
W
F
 
F
V
 
V
A
 
P
P
 
P
G
 
S
V
 
L
-
 
R
-
 
G
-
 
K
-
 
K
-
 
E
-
 
S
-
 
P
-
 
D
A
 
Y
N
 
S
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
D
 
S
E
 
Q
I
 
V
N
 
A
R
 
P
E
 
V
I
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
R
I
 
M
F
 
V
R
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
T
A
 
M
V
 
M
I
 
I
A
 
G

Q8RY79 Phenylacetaldehyde synthase; AtPAAS; 3,4-dihydroxyphenylacetaldehyde synthase; DHPAA synthase; Aromatic L-amino acid decarboxylase; Aromatic aldehyde synthase; AtAAS; EC 4.1.1.109; EC 4.1.1.107 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
26% identity, 80% coverage: 91:498/507 of query aligns to 81:488/490 of Q8RY79

query
sites
Q8RY79
Y
 
H
F
 
W
H
 
Q
H
 
S
P
 
P
R
 
S
Y
 
F
V
 
F
A
 
A
H
 
Y
L
 
Y
N
x
P
C
 
S
P
 
N
V
 
S
V
 
S
L
 
V
P
 
A
A
 
G
L
 
F
L
 
L
A
 
G
E
 
E
V
 
M
L
 
L
V
 
S
S
 
A
S
 
G
L
 
L
N
 
G
S
 
I
S
 
V
L
 
G
D
 
F
T
 
S
W
 
W
D
 
V
Q
 
T
S
 
S
A
 
P
G
 
A
G
 
A
T
 
T
L
 
E
I
 
L
E
 
E
Q
 
M
R
 
I
L
 
V
I
 
L
D
 
D
W
 
W
T
 
V
C
 
A
A
 
K
R
 
L
I
 
L
G
 
N
L
 
L
G
 
P
S
 
E
Q
 
Q
-
 
F
-
 
M
-
 
S
-
 
K
-
 
G
-
 
N
A
 
G
D
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
I
T
 
Q
S
 
G
G
 
S
G
 
A
T
 
S
Q
 
E
S
 
A
N
 
V
L
 
L
M
 
V
G
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
D
H
 
K
V
 
V
C
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
H
 
-
G
 
-
G
 
-
N
 
-
L
 
L
R
 
R
H
 
S
G
 
V
L
 
G
P
 
K
A
 
N
E
 
A
A
 
L
A
 
E
G
 
K
L
 
L
R
 
V
I
 
V
F
 
Y
A
 
S
S
 
S
R
 
D
A
 
Q
S
 
T
H
|
H
F
 
S
S
 
A
V
 
L
Q
 
Q
K
 
K
S
 
A
A
 
C
A
 
Q
L
 
I
L
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
H
Y
 
P
D
 
E
A
 
N
V
 
C
R
 
R
S
 
V
I
 
L
E
 
T
T
 
T
D
 
D
S
 
S
A
 
S
Q
 
T
C
 
N
M
 
Y
S
 
A
V
 
L
-
 
R
-
 
P
P
 
E
A
 
S
L
 
L
A
 
Q
Q
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
S
D
 
R
C
 
D
Q
 
L
R
 
E
L
 
A
G
 
G
E
 
L
L
 
I
P
 
P
M
 
F
A
 
F
V
 
L
V
 
C
A
 
A
T
 
N
A
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
S
F
 
S
G
 
T
S
 
A
I
 
V
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
A
E
 
A
I
 
L
A
 
G
A
 
K
L
 
I
C
 
A
Q
 
N
H
 
S
Y
 
N
G
 
G
V
 
I
W
 
W
L
 
F
H
 
H
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
G
 
S
L
 
A
L
 
C
V
 
I
A
 
C
P
 
P
R
 
E
Y
 
Y
R
 
R
D
 
Q
W
 
Y
L
 
I
A
 
D
G
 
G
I
 
V
E
 
E
H
 
T
A
 
A
D
 
D
S
 
S
V
 
F
T
 
N
V
 
M
D
 
N
Y
 
A
H
|
H
K
|
K
S
 
W
F
 
F
F
 
L
Q
 
T
P
 
N
V
 
F
S
 
D
C
 
C
S
 
S
G
 
L
F
 
L
F
 
W
V
 
V
R
 
K
Q
 
D
R
 
Q
Q
 
D
H
 
S
L
 
L
S
 
T
Y
 
L
-
 
A
I
 
L
T
 
S
H
 
T
H
 
N
A
 
P
D
 
E
Y
x
F
L
 
L
N
 
K
P
 
N
R
 
K
S
 
A
Q
 
S
T
 
Q
R
 
A
E
 
N
G
 
L
T
 
V
P
 
V
N
 
D
L
 
Y
V
 
K
N
 
D
K
 
W
S
 
Q
I
 
I
Q
 
P
T
 
L
T
 
G
R
 
R
R
 
R
F
 
F
D
 
R
A
 
S
L
 
L
K
 
K
L
 
L
W
 
W
L
 
M
T
 
V
L
 
L
R
 
R
I
 
L
L
 
Y
G
 
G
A
 
S
E
 
E
H
 
T
I
 
L
G
 
K
A
 
S
M
 
Y
F
 
I
E
 
R
E
 
N
V
 
H
I
 
I
D
 
K
R
 
L
A
 
A
A
 
K
D
 
E
T
 
F
H
 
E
R
 
Q
L
 
L
L
 
V
A
 
S
N
 
Q
D
 
D
P
 
P
A
 
N
F
 
F
E
 
E
V
 
I
F
 
V
T
 
T
P
 
P
R
 
R
L
 
I
S
 
F
T
 
A
L
 
L
V
 
V
-
 
C
F
 
F
R
 
R
F
 
L
V
 
V
A
 
P
P
 
V
G
 
K
V
 
D
A
 
E
N
 
E
E
 
K
R
 
K
L
 
C
D
 
N
E
 
N
I
 
R
N
 
N
R
 
R
E
 
E
I
 
L
R
 
L
K
 
D
A
 
A
I
 
V
F
 
N
R
 
S
S
 
S
G
 
G
A
 
K
A
 
L
V
 
F
I
 
M
A
 
S
A
 
H
T
 
T
V
 
A
V
 
L
E
 
S
G
 
G
R
 
K
Q
 
I
Y
 
V
L
 
L
K
 
R
F
 
C
T
 
A
L
 
I
L
 
G
N
 
A
P
 
P
E
 
L
T
 
T
T
 
E
L
 
E
N
 
K
D
 
H
L
 
V
R
 
K
A
 
E
I
 
A
V
 
W
E
 
K
L
 
I
I
 
I
R
 
Q
D
 
E
H
 
E
G
 
A
A
 
S
R
 
Y
L
 
L
L
 
L

P19113 Histidine decarboxylase; HDC; EC 4.1.1.22 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
27% identity, 94% coverage: 26:500/507 of query aligns to 5:477/662 of P19113

query
sites
P19113
D
 
E
D
 
E
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
E
L
 
R
L
 
G
Q
 
R
Q
 
E
G
 
M
L
 
V
N
 
D
L
 
Y
V
 
I
Q
 
C
Q
 
Q
C
 
Y
L
 
L
Q
 
S
-
 
T
-
 
V
R
 
R
Q
 
E
Q
 
R
Q
 
R
P
 
V
F
x
T
S
 
P
G
 
D
I
 
V
L
 
Q
P
 
P
Q
 
G
E
 
Y
L
 
L
A
 
R
A
 
A
D
 
Q
F
 
L
E
 
P
R
 
E
V
 
S
D
 
A
L
 
P
E
|
E
R
 
D
P
 
P
L
 
-
G
 
D
D
 
S
A
 
W
G
 
D
A
 
S
A
 
I
L
 
F
R
 
G
E
 
D
L
 
I
D
 
E
Q
 
R
L
 
I
Y
 
I
L
 
M
R
 
P
D
 
G
A
 
V
V
 
V
Y
 
H
F
 
W
H
 
Q
H
 
S
P
 
P
R
 
H
Y
 
M
V
 
H
A
 
A
H
 
Y
L
 
Y
N
 
P
C
 
A
P
 
L
V
 
T
V
 
S
L
 
W
P
 
P
A
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
G
E
 
D
V
 
M
L
 
L
V
 
A
S
 
D
S
 
A
L
 
I
N
 
N
S
 
C
S
 
L
L
 
G
D
 
F
T
 
T
W
 
W
D
 
A
Q
 
S
S
 
S
A
 
P
G
 
A
G
 
C
T
 
T
L
 
E
I
 
L
E
 
E
Q
 
M
R
 
N
L
 
V
I
 
M
D
 
D
W
 
W
T
 
L
C
 
A
A
 
K
R
 
M
I
 
L
G
 
G
L
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
F
-
 
L
-
 
H
-
 
H
-
 
H
-
 
P
G
 
S
S
 
S
Q
 
Q
A
 
G
D
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
L
T
 
Q
S
 
S
G
 
T
G
 
V
T
 
S
Q
 
E
S
 
S
N
 
T
L
 
L
M
 
I
G
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
K
H
 
N
V
 
K
C
 
I
N
 
L
R
 
E
L
 
M
-
 
K
-
 
T
-
 
S
-
 
E
P
 
P
D
 
D
H
 
A
G
 
D
G
 
E
N
 
S
L
 
C
R
 
L
H
 
N
G
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
A
G
 
R
L
 
L
R
 
V
I
 
A
F
 
Y
A
 
A
S
 
S
R
 
D
A
 
Q
S
 
A
H
 
H
F
 
S
S
 
S
V
 
V
Q
 
E
K
 
K
S
 
-
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
S
L
 
L
G
 
V
Y
 
-
D
 
-
A
 
K
V
 
M
R
 
K
S
 
F
I
 
L
E
 
P
T
 
V
D
 
D
S
 
D
A
 
N
Q
 
F
C
 
S
M
 
L
S
 
R
V
 
G
P
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
L
 
I
A
 
E
D
 
E
C
 
D
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
G
 
G
E
 
L
L
 
V
P
 
P
M
 
V
A
 
F
V
 
V
V
 
C
A
 
A
T
 
T
A
 
L
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
G
F
 
V
G
 
C
S
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
C
L
 
L
P
 
S
E
 
E
I
 
L
A
 
G
A
 
P
L
 
I
C
 
C
Q
 
A
H
 
R
Y
 
E
G
 
G
V
 
L
W
 
W
L
 
L
H
 
H
V
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
G
 
T
L
 
A
L
 
F
V
 
L
A
 
C
P
 
P
R
x
E
Y
 
F
R
 
R
D
 
G
W
 
F
L
 
L
A
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
Y
A
 
A
D
 
D
S
 
S
V
 
F
T
 
T
V
 
F
D
 
N
Y
 
P
H
 
S
K
|
K
S
 
W
F
 
M
F
 
M
Q
 
V
P
 
H
V
 
F
S
 
D
C
 
C
S
 
T
G
 
G
F
 
F
F
 
W
V
 
V
R
 
K
Q
 
D
R
 
K
Q
 
Y
H
 
K
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Q
I
 
-
T
 
T
H
 
F
H
 
S
A
 
V
D
 
N
Y
 
P
L
 
I
N
x
Y
P
 
L
R
 
R
S
 
H
Q
 
A
T
 
N
R
 
S
E
 
G
G
 
V
T
 
A
P
 
T
N
 
D
L
 
F
V
 
M
N
 
H
K
 
W
S
 
Q
I
 
I
Q
 
P
T
 
L
T
x
S
R
 
R
R
 
R
F
 
F
D
 
R
A
 
S
L
 
V
K
 
K
L
 
L
W
 
W
L
 
F
T
 
V
L
 
I
R
 
R
I
 
S
L
 
F
G
 
G
A
 
V
E
 
K
H
 
N
I
 
L
G
 
Q
A
 
A
M
 
H
F
 
V
E
 
R
E
 
H
V
 
G
I
 
T
D
 
E
R
 
M
A
 
A
A
 
K
D
 
Y
T
 
F
H
 
E
R
 
S
L
 
L
L
 
V
A
 
R
N
 
N
D
 
D
P
 
P
A
 
S
F
 
F
E
 
E
V
 
I
F
 
P
T
 
A
P
 
K
R
 
R
-
 
H
L
 
L
S
 
G
T
 
L
L
 
V
V
 
V
F
 
F
R
 
R
F
 
L
V
 
K
A
 
G
P
 
P
G
 
N
V
 
C
A
 
L
N
 
T
E
 
E
R
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
N
I
 
V
R
 
L
K
 
K
A
 
E
I
 
I
F
 
A
R
 
K
S
 
A
G
 
G
A
 
R
A
 
L
V
 
F
I
 
L
A
 
I
A
 
P
T
 
A
V
 
T
V
 
I
E
 
Q
G
 
D
R
 
K
Q
 
L
Y
 
I
L
 
I
K
 
R
F
 
F
T
 
T
L
 
V
L
 
T
N
 
S
P
 
Q
E
 
F
T
 
T
T
 
T
L
 
R
N
 
D
D
 
D
L
 
I
R
 
L
A
 
R
I
 
D
V
 
W
E
 
N
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
H
 
A
G
 
A
A
 
T
R
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
S
E
 
Q

4e1oC Human histidine decarboxylase complex with histidine methyl ester (hme) (see paper)
26% identity, 94% coverage: 26:500/507 of query aligns to 9:481/481 of 4e1oC

query
sites
4e1oC
D
 
E
D
 
E
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
E
L
 
R
L
 
G
Q
 
R
Q
 
E
G
 
M
L
 
V
N
 
D
L
 
Y
V
 
I
Q
 
C
Q
 
Q
C
 
Y
L
 
L
Q
 
S
-
 
T
-
 
V
R
 
R
Q
 
E
Q
 
R
Q
 
R
P
 
V
F
 
T
S
 
P
G
 
D
I
 
V
L
 
Q
P
 
P
Q
 
G
E
 
Y
L
 
L
A
 
R
A
 
A
D
 
Q
F
 
L
E
 
P
R
 
E
V
 
S
D
 
A
L
 
P
E
 
E
R
 
D
P
 
P
L
 
-
G
 
D
D
 
S
A
 
W
G
 
D
A
 
S
A
 
I
L
 
F
R
 
G
E
 
D
L
 
I
D
 
E
Q
 
R
L
 
I
Y
 
I
L
 
M
R
 
P
D
 
G
A
 
V
V
 
V
Y
 
H
F
 
W
H
 
Q
H
 
S
P
 
P
R
 
H
Y
 
M
V
 
H
A
 
A
H
x
Y
L
x
Y
N
 
P
C
 
A
P
 
L
V
 
T
V
 
S
L
 
W
P
 
P
A
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
G
E
 
D
V
 
M
L
 
L
V
 
A
S
 
D
S
 
A
L
 
I
N
 
N
S
 
C
S
x
L
L
 
G
D
 
F
T
 
T
W
 
W
D
 
A
Q
 
S
S
 
S
A
 
P
G
 
A
G
 
C
T
 
T
L
 
E
I
 
L
E
 
E
Q
 
M
R
 
N
L
 
V
I
 
M
D
 
D
W
 
W
T
 
L
C
 
A
A
 
K
R
 
M
I
 
L
G
 
G
L
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
F
-
 
L
-
 
H
-
 
H
-
 
H
-
 
P
G
 
S
S
 
S
Q
 
Q
A
 
G
D
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
L
T
 
Q
S
 
S
G
x
T
G
x
V
T
x
S
Q
 
E
S
 
S
N
 
T
L
 
L
M
 
I
G
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
K
H
 
N
V
 
K
C
 
I
N
 
L
R
 
E
L
 
M
P
 
K
D
 
T
H
 
S
G
 
E
G
 
P
N
 
D
L
 
A
R
 
D
H
 
E
G
 
S
L
 
-
P
 
-
A
 
S
E
 
L
A
 
N
A
 
A
G
 
R
L
 
L
R
 
V
I
 
A
F
 
Y
A
 
A
S
 
S
R
 
D
A
 
Q
S
 
A
H
|
H
F
 
S
S
 
S
V
 
V
Q
 
E
K
 
K
S
 
-
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
S
L
 
L
G
 
V
Y
 
-
D
 
-
A
 
K
V
 
M
R
 
K
S
 
F
I
 
L
E
 
P
T
 
V
D
 
D
S
 
D
A
 
N
Q
 
F
C
 
S
M
 
L
S
 
R
V
 
G
P
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
L
 
I
A
 
E
D
 
E
C
 
D
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
G
 
G
E
 
L
L
 
V
P
 
P
M
 
V
A
 
F
V
 
V
V
 
C
A
 
A
T
 
T
A
 
L
G
 
G
T
 
T
T
|
T
D
 
G
F
 
V
G
 
C
S
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
C
L
 
L
P
 
S
E
 
E
I
 
L
A
 
G
A
 
P
L
 
I
C
 
C
Q
 
A
H
 
R
Y
 
E
G
 
G
V
 
L
W
 
W
L
 
L
H
 
H
V
 
I
D
|
D
A
 
A
A
|
A
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
G
 
T
L
 
A
L
 
F
V
 
L
A
 
C
P
 
P
R
 
E
Y
 
F
R
 
R
D
 
G
W
 
F
L
 
L
A
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
Y
A
 
A
D
 
D
S
 
S
V
 
F
T
 
T
V
 
F
D
 
N
Y
 
P
H
 
S
K
|
K
S
 
W
F
 
M
F
 
M
Q
 
V
P
 
H
V
 
F
S
 
D
C
 
C
S
 
T
G
 
G
F
 
F
F
 
W
V
 
V
R
 
K
Q
 
D
R
 
K
Q
 
Y
H
 
K
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Q
I
 
-
T
 
T
H
 
F
H
 
S
A
 
V
D
 
N
Y
 
P
L
 
I
N
x
Y
P
 
L
R
 
R
S
 
H
Q
 
A
T
 
N
R
 
S
E
 
G
G
 
V
T
 
A
P
 
T
N
 
D
L
 
F
V
 
M
N
 
H
K
 
W
S
 
Q
I
 
I
Q
 
P
T
 
L
T
 
S
R
 
R
R
 
R
F
 
F
D
 
R
A
 
S
L
 
V
K
 
K
L
 
L
W
 
W
L
 
F
T
 
V
L
 
I
R
 
R
I
 
S
L
 
F
G
 
G
A
 
V
E
 
K
H
 
N
I
 
L
G
 
Q
A
 
A
M
 
H
F
 
V
E
 
R
E
 
H
V
 
G
I
 
T
D
 
E
R
 
M
A
 
A
A
 
K
D
 
Y
T
 
F
H
 
E
R
 
S
L
 
L
L
 
V
A
 
R
N
 
N
D
 
D
P
 
P
A
 
S
F
 
F
E
 
E
V
 
I
F
 
P
T
 
A
P
 
K
R
 
R
-
 
H
L
 
L
S
 
G
T
 
L
L
 
V
V
 
V
F
 
F
R
 
R
F
 
L
V
 
K
A
 
G
P
 
P
G
 
-
V
 
-
A
 
-
N
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
N
E
 
S
I
 
L
N
 
T
R
 
E
E
 
N
I
 
V
R
 
L
K
 
K
A
 
E
I
 
I
F
 
A
R
 
K
S
 
A
G
 
G
A
 
R
A
 
L
V
 
F
I
 
L
A
 
I
A
 
P
T
 
A
V
 
T
V
 
I
E
 
Q
G
 
D
R
 
K
Q
 
L
Y
 
I
L
 
I
K
 
R
F
 
F
T
 
T
L
 
V
L
 
T
N
 
S
P
 
Q
E
 
F
T
 
T
T
 
T
L
 
R
N
 
D
D
 
D
L
 
I
R
 
L
A
 
R
I
 
D
V
 
W
E
 
N
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
H
 
A
G
 
A
A
 
T
R
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
S
E
 
Q

7eiyA Human histidine decarboxylase mutant y334f soaking with histidine
27% identity, 93% coverage: 26:498/507 of query aligns to 4:466/467 of 7eiyA

query
sites
7eiyA
D
 
E
D
 
E
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
E
L
 
R
L
 
G
Q
 
R
Q
 
E
G
 
M
L
 
V
N
 
D
L
 
Y
V
 
I
Q
 
C
Q
 
Q
C
 
Y
L
 
L
Q
 
S
-
 
T
-
 
V
R
 
R
Q
 
E
Q
 
R
Q
 
R
P
 
V
F
 
T
S
 
P
G
 
D
I
 
V
L
 
Q
P
 
P
Q
 
G
E
 
Y
L
 
L
A
 
R
A
 
A
D
 
Q
F
 
L
E
 
P
R
 
E
V
 
S
D
 
A
L
 
P
E
 
E
R
 
D
P
 
P
L
 
-
G
 
D
D
 
S
A
 
W
G
 
D
A
 
S
A
 
I
L
 
F
R
 
G
E
 
D
L
 
I
D
 
E
Q
 
R
L
 
I
Y
 
I
L
 
M
R
 
P
D
 
G
A
 
V
V
 
V
Y
 
H
F
 
W
H
 
Q
H
 
S
P
 
P
R
 
H
Y
 
M
V
 
H
A
 
A
H
 
Y
L
x
Y
N
 
P
C
 
A
P
 
L
V
 
T
V
 
S
L
 
W
P
 
P
A
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
G
E
 
D
V
 
M
L
 
L
V
 
A
S
 
D
S
 
A
L
 
I
N
 
N
S
 
C
S
 
L
L
 
G
D
 
F
T
 
T
W
 
W
D
 
A
Q
 
S
S
 
S
A
 
P
G
 
A
G
 
C
T
 
T
L
 
E
I
 
L
E
 
E
Q
 
M
R
 
N
L
 
V
I
 
M
D
 
D
W
 
W
T
 
L
C
 
A
A
 
K
R
 
M
I
 
L
G
 
G
L
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
F
-
 
L
-
 
H
-
 
H
-
 
H
-
 
P
G
 
S
S
 
S
Q
 
Q
A
 
G
D
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
L
T
 
Q
S
 
S
G
x
T
G
x
V
T
x
S
Q
 
E
S
 
S
N
 
T
L
 
L
M
 
I
G
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
K
H
 
N
V
 
K
C
 
I
N
 
L
R
 
E
L
 
M
P
 
K
D
 
T
H
 
S
G
 
E
G
 
P
N
 
D
L
 
A
R
 
D
H
 
E
G
 
S
L
 
-
P
 
-
A
 
S
E
 
L
A
 
N
A
 
A
G
 
R
L
 
L
R
 
V
I
 
A
F
 
Y
A
 
A
S
 
S
R
 
D
A
 
Q
S
 
A
H
|
H
F
 
S
S
 
S
V
 
V
Q
 
E
K
 
K
S
 
-
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
S
L
 
L
G
 
V
Y
 
-
D
 
-
A
 
K
V
 
M
R
 
K
S
 
F
I
 
L
E
 
P
T
 
V
D
 
D
S
 
D
A
 
N
Q
 
F
C
 
S
M
 
L
S
 
R
V
 
G
P
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
L
 
I
A
 
E
D
 
E
C
 
D
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
G
 
G
E
 
L
L
 
V
P
 
P
M
 
V
A
 
F
V
 
V
V
 
C
A
 
A
T
 
T
A
 
L
G
 
G
T
 
T
T
|
T
D
 
G
F
 
V
G
 
C
S
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
C
L
 
L
P
 
S
E
 
E
I
 
L
A
 
G
A
 
P
L
 
I
C
 
C
Q
 
A
H
 
R
Y
 
E
G
 
G
V
 
L
W
 
W
L
 
L
H
 
H
V
 
I
D
|
D
A
 
A
A
|
A
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
G
 
T
L
 
A
L
 
F
V
 
L
A
 
C
P
 
P
R
 
E
Y
 
F
R
 
R
D
 
G
W
 
F
L
 
L
A
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
Y
A
 
A
D
 
D
S
 
S
V
 
F
T
 
T
V
 
F
D
 
N
Y
 
P
H
 
S
K
|
K
S
 
W
F
 
M
F
 
M
Q
 
V
P
 
H
V
 
F
S
 
D
C
 
C
S
 
T
G
 
G
F
 
F
F
 
W
V
 
V
R
 
K
Q
 
D
R
 
K
Q
 
-
H
 
-
L
 
-
S
 
-
Y
 
Y
I
 
K
T
 
L
H
 
Q
H
 
Q
A
 
T
D
 
F
Y
 
S
L
 
V
N
 
N
P
 
P
R
 
G
S
 
V
Q
 
A
T
 
T
R
 
-
E
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
N
 
D
L
 
F
V
 
M
N
 
H
K
 
W
S
 
Q
I
 
I
Q
 
P
T
 
L
T
 
S
R
 
R
R
 
R
F
 
F
D
 
R
A
 
S
L
 
V
K
 
K
L
 
L
W
 
W
L
 
F
T
 
V
L
 
I
R
 
R
I
 
S
L
 
F
G
 
G
A
 
V
E
 
K
H
 
N
I
 
L
G
 
Q
A
 
A
M
 
H
F
 
V
E
 
R
E
 
H
V
 
G
I
 
T
D
 
E
R
 
M
A
 
A
A
 
K
D
 
Y
T
 
F
H
 
E
R
 
S
L
 
L
L
 
V
A
 
R
N
 
N
D
 
D
P
 
P
A
 
S
F
 
F
E
 
E
V
 
I
F
 
P
T
 
A
P
 
K
R
 
R
-
 
H
L
 
L
S
 
G
T
 
L
L
 
V
V
 
V
F
 
F
R
 
R
F
 
L
V
 
K
A
 
G
P
 
P
G
 
-
V
 
-
A
 
-
N
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
N
E
 
S
I
 
L
N
 
T
R
 
E
E
 
N
I
 
V
R
 
L
K
 
K
A
 
E
I
 
I
F
 
A
R
 
K
S
 
A
G
 
G
A
 
R
A
 
L
V
 
F
I
 
L
A
 
I
A
 
P
T
 
A
V
 
T
V
 
I
E
 
Q
G
 
D
R
 
K
Q
 
L
Y
 
I
L
 
I
K
 
R
F
 
F
T
 
T
L
 
V
L
 
T
N
 
S
P
 
Q
E
 
F
T
 
T
T
 
T
L
 
R
N
 
D
D
 
D
L
 
I
R
 
L
A
 
R
I
 
D
V
 
W
E
 
N
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
H
 
A
G
 
A
A
 
T
R
 
L
L
 
I
L
 
L

7xinA Crystal structure of dodc from pseudomonas
31% identity, 82% coverage: 76:492/507 of query aligns to 55:461/470 of 7xinA

query
sites
7xinA
A
 
A
A
 
I
L
 
L
R
 
D
E
 
D
L
 
V
D
 
N
Q
 
N
L
 
L
Y
 
V
L
 
M
R
 
P
D
 
G
A
 
L
V
 
S
Y
 
H
F
 
W
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
R
 
D
Y
 
F
V
 
Y
A
 
G
H
 
Y
L
x
F
N
 
P
C
 
S
P
 
N
V
 
G
V
 
T
L
 
L
P
 
S
A
 
S
L
 
V
L
 
L
A
 
G
E
 
D
V
 
F
L
 
L
V
 
S
S
 
T
S
 
G
L
 
L
N
 
G
S
 
V
S
 
L
L
 
G
D
 
L
T
 
S
W
 
W
D
 
Q
Q
 
S
S
 
S
A
 
P
G
 
A
G
 
L
T
 
S
L
 
E
I
 
L
E
 
E
Q
 
E
R
 
T
L
 
T
I
 
L
D
 
D
W
 
W
T
 
L
C
 
R
A
 
Q
R
 
L
I
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
S
S
 
G
Q
 
Q
A
 
W
D
 
S
G
 
G
V
 
V
F
 
I
T
 
Q
S
 
D
G
x
T
G
x
A
T
x
S
Q
 
T
S
 
S
N
 
T
L
 
L
M
 
V
G
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
S
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
R
V
 
A
C
 
T
N
 
D
R
 
Y
L
 
-
P
 
-
D
 
-
H
 
-
G
 
-
G
 
A
N
 
L
L
 
V
R
 
R
H
 
G
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
A
 
A
E
 
E
A
 
P
A
 
K
G
 
P
L
 
L
R
 
I
I
 
V
F
 
Y
A
 
V
S
 
S
R
 
A
A
 
H
S
 
A
H
|
H
F
 
S
S
 
S
V
 
V
Q
 
D
K
 
K
S
 
A
A
 
A
A
 
L
L
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
F
G
 
G
Y
 
R
D
 
D
A
 
N
V
 
I
R
 
R
S
 
L
I
 
I
E
 
P
T
 
T
D
 
D
S
 
E
A
 
R
Q
 
Y
C
 
A
M
 
L
S
 
R
V
 
P
P
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
Q
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
E
D
 
Q
C
 
D
Q
 
L
R
 
A
L
 
A
G
 
G
E
 
N
L
 
Q
P
 
P
M
 
C
A
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
T
G
 
G
T
 
T
T
|
T
D
 
T
F
 
T
G
 
T
S
 
A
I
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
R
E
 
P
I
 
V
A
 
G
A
 
E
L
 
I
C
 
A
Q
 
Q
H
 
A
Y
 
N
G
 
G
V
 
L
W
 
W
L
 
L
H
 
H
V
 
V
D
|
D
A
 
S
A
|
A
Y
 
M
G
 
A
G
 
G
G
 
S
L
 
A
L
 
M
V
 
I
A
 
L
P
 
P
R
 
E
Y
 
C
R
 
R
D
 
W
W
 
M
L
 
W
A
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
L
A
 
A
D
 
D
S
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
D
x
N
Y
 
A
H
|
H
K
|
K
S
 
W
F
 
L
F
 
G
Q
 
V
P
 
A
V
 
F
S
 
D
C
 
C
S
 
S
G
 
I
F
 
Y
F
 
Y
V
 
V
R
 
R
Q
 
D
R
 
P
Q
 
Q
H
 
H
L
 
L
-
 
I
S
 
R
Y
 
V
I
 
M
T
 
S
H
 
T
H
 
N
A
 
P
D
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
Q
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
Q
G
 
S
T
 
A
P
 
K
N
 
N
L
 
L
V
 
R
N
 
D
K
 
W
S
 
G
I
 
I
Q
 
P
T
 
L
T
 
G
R
 
R
R
 
R
F
 
F
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
L
W
 
W
L
 
F
T
 
M
L
 
L
R
 
R
I
 
S
L
 
E
G
 
G
A
 
V
E
 
D
H
 
A
I
 
L
G
 
Q
A
 
A
M
 
R
F
 
L
E
 
R
E
 
R
V
 
D
I
 
L
D
 
D
R
 
N
A
 
A
A
 
Q
D
 
W
T
 
L
H
 
A
R
 
G
L
 
Q
L
 
V
A
 
E
N
 
A
D
 
A
P
 
A
A
 
E
F
 
W
E
 
E
V
 
V
F
 
L
T
 
A
P
 
P
-
 
V
R
 
Q
L
 
L
S
 
Q
T
 
T
L
 
L
V
 
C
F
 
I
R
 
R
F
 
H
V
 
R
A
 
P
P
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
E
N
 
G
E
 
E
R
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
A
I
 
H
N
 
T
R
 
K
E
 
G
I
 
W
R
 
A
K
 
E
A
 
R
I
 
L
F
 
N
R
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
Y
I
 
V
A
 
T
A
 
P
T
 
A
V
 
T
V
 
L
E
 
D
G
 
G
R
 
R
Q
 
W
Y
 
M
L
 
V
K
 
R
F
 
V
T
 
S
L
 
I
L
 
G
N
 
A
P
 
L
E
 
P
T
 
T
T
 
E
L
 
R
N
 
G
D
 
D
L
 
V
R
 
Q
A
 
R
I
 
L
V
 
W
E
 
A
L
 
R
I
 
L
R
 
Q
D
 
D

4rlgD The clear crystal structure of pyridoxal-dependent decarboxylase from sphaerobacter thermophilus dsm 20745
33% identity, 76% coverage: 94:479/507 of query aligns to 79:454/470 of 4rlgD

query
sites
4rlgD
H
 
N
P
 
P
R
 
G
Y
 
Y
V
 
I
A
 
G
H
 
H
L
 
M
N
 
D
C
 
P
P
 
M
V
 
P
V
 
A
L
 
T
P
 
M
A
 
A
L
 
I
L
 
L
A
 
G
E
 
D
V
 
L
L
 
V
V
 
A
S
 
A
S
 
A
L
 
V
N
 
N
S
 
N
S
 
N
L
 
M
D
 
L
T
 
S
W
 
L
D
 
E
Q
 
M
S
 
S
A
 
P
G
 
S
G
 
F
T
 
S
L
 
R
I
 
L
E
 
E
Q
 
T
R
 
L
L
 
L
I
 
L
D
 
R
W
 
A
T
 
I
C
 
A
A
 
G
R
 
L
I
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
E
Q
 
Q
A
 
A
D
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
L
T
 
T
S
 
S
G
|
G
G
|
G
T
x
S
Q
 
L
S
 
A
N
 
N
L
 
L
M
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
N
H
 
V
V
 
A
C
 
F
N
 
D
R
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
H
 
-
G
 
-
G
 
-
N
 
S
L
 
V
R
 
E
H
 
P
G
 
G
L
 
I
P
 
T
A
 
G
E
 
L
A
 
A
A
 
Q
G
 
R
L
 
P
R
 
V
I
 
I
F
 
F
A
 
A
S
|
S
R
 
E
A
 
A
S
x
A
H
|
H
F
x
T
S
 
S
V
 
L
Q
|
Q
K
 
K
S
 
A
A
 
A
A
 
M
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
Y
 
T
D
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
I
S
 
P
I
 
V
E
 
R
T
 
A
D
 
T
S
 
A
A
 
D
Q
 
S
C
 
R
M
 
M
S
 
D
V
 
P
P
 
E
A
 
D
L
 
L
A
 
R
Q
 
A
A
 
R
L
 
I
A
 
D
D
 
Q
C
 
A
Q
 
R
R
 
G
L
 
A
G
 
G
E
 
Q
L
 
H
P
 
P
M
 
F
A
 
C
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
|
T
D
 
T
F
 
T
G
 
G
S
 
N
I
 
I
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
G
A
 
A
L
 
I
C
 
A
Q
 
R
H
 
E
Y
 
H
G
 
G
V
 
L
W
 
W
L
 
F
H
 
H
V
 
V
D
|
D
A
 
A
A
|
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
V
V
 
F
A
 
S
P
 
E
R
 
R
Y
 
H
R
 
R
D
 
W
W
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
Q
A
 
A
D
 
D
S
 
S
V
 
I
T
 
T
V
 
F
D
x
N
Y
 
P
H
 
Q
K
|
K
S
 
W
F
 
L
F
 
Y
Q
 
V
P
 
A
V
 
K
S
 
T
C
 
C
S
 
A
G
 
M
F
 
V
F
 
L
V
 
F
R
 
R
Q
 
D
R
 
-
Q
 
-
H
 
-
L
 
-
S
 
A
Y
 
G
I
 
V
T
 
L
H
 
E
H
 
R
A
 
A
D
 
F
Y
 
R
L
 
I
N
 
P
P
 
P
R
 
Y
S
 
M
Q
 
R
T
 
A
R
 
T
E
 
D
G
 
G
T
 
F
P
 
I
N
 
N
L
 
L
V
 
G
N
 
E
K
 
I
S
 
G
I
 
V
Q
 
Q
T
 
G
T
 
T
R
 
R
R
 
H
F
 
A
D
 
D
A
 
V
L
 
V
K
 
K
L
 
L
W
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
R
 
Q
I
 
H
L
 
I
G
 
G
A
 
Q
E
 
Q
H
 
G
I
 
Y
G
 
A
A
 
R
M
 
L
F
 
I
E
 
D
E
 
D
V
 
G
I
 
Y
D
 
R
R
 
L
A
 
A
A
 
E
D
 
R
T
 
V
H
 
V
R
 
E
L
 
G
L
 
V
A
 
R
N
 
Q
D
 
R
P
 
P
-
 
F
-
 
L
-
 
R
-
 
L
A
 
A
F
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
D
T
 
T
P
 
-
R
 
-
L
 
-
S
 
N
T
 
I
L
 
V
V
 
C
F
 
F
R
 
R
F
 
G
V
 
E
A
 
P
P
 
D
G
 
W
V
 
L
A
 
P
N
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
W
D
 
D
E
 
D
I
 
W
N
 
N
R
 
A
E
 
A
I
 
L
R
 
Q
K
 
A
A
 
L
I
 
L
F
 
L
R
 
R
S
 
E
G
 
G
A
 
K
A
 
I
V
 
F
I
 
L
A
 
S
A
 
L
T
 
P
V
 
V
V
 
Y
E
 
R
G
 
G
R
 
G
Q
 
R
Y
 
W
L
 
L
K
 
R
F
 
A
T
 
V
L
 
L
L
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
Y
T
 
T
T
 
T

Query Sequence

>GFF635 FitnessBrowser__psRCH2:GFF635
MTPSSTVVPFAPGPVSNGLFTRSNHDDYRQLLQQGLNLVQQCLQRQQQPFSGILPQELAA
DFERVDLERPLGDAGAALRELDQLYLRDAVYFHHPRYVAHLNCPVVLPALLAEVLVSSLN
SSLDTWDQSAGGTLIEQRLIDWTCARIGLGSQADGVFTSGGTQSNLMGLLLAREHVCNRL
PDHGGNLRHGLPAEAAGLRIFASRASHFSVQKSAALLGLGYDAVRSIETDSAQCMSVPAL
AQALADCQRLGELPMAVVATAGTTDFGSIDPLPEIAALCQHYGVWLHVDAAYGGGLLVAP
RYRDWLAGIEHADSVTVDYHKSFFQPVSCSGFFVRQRQHLSYITHHADYLNPRSQTREGT
PNLVNKSIQTTRRFDALKLWLTLRILGAEHIGAMFEEVIDRAADTHRLLANDPAFEVFTP
RLSTLVFRFVAPGVANERLDEINREIRKAIFRSGAAVIAATVVEGRQYLKFTLLNPETTL
NDLRAIVELIRDHGARLLDELPTAANQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory