SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF722 PGA1_c07370 putative short chain dehydrogenase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5wjsA Crystal structure of oxidoreductase (short chain dehydrogenase/reductase family) from burkholderia thailandensis complexed with nadh
50% identity, 96% coverage: 5:251/256 of query aligns to 9:256/258 of 5wjsA

query
sites
5wjsA
A
 
A
I
 
R
F
 
Y
P
 
P
D
 
S
L
 
L
K
 
A
G
 
G
A
 
R
S
 
A
V
 
V
F
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
S
x
T
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
F
S
 
V
E
 
E
G
 
H
F
 
F
L
 
A
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
R
V
 
V
A
 
A
F
 
F
V
 
V
G
x
D
R
x
L
S
 
D
D
 
E
-
 
Q
A
 
A
T
 
A
D
 
R
F
 
A
V
 
L
E
 
A
R
 
A
M
 
R
E
 
L
A
 
A
E
 
D
T
 
A
G
 
A
N
 
H
R
 
E
P
 
P
L
 
V
F
 
F
I
 
V
Q
 
A
C
 
C
D
|
D
I
x
L
T
 
T
D
 
D
I
 
I
P
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
G
A
 
A
I
 
I
K
 
E
Q
 
A
A
 
I
A
 
R
E
 
A
A
 
R
H
 
I
G
 
G
P
 
P
I
 
I
T
 
A
T
 
A
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
|
A
N
 
N
D
 
D
Q
 
V
R
 
R
H
 
H
A
 
A
T
 
I
L
 
A
D
 
D
V
 
V
D
 
T
E
 
P
E
 
D
F
 
S
W
 
F
D
 
D
W
 
A
A
 
C
Q
 
I
A
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
R
A
 
H
Y
 
Q
F
 
F
F
 
F
A
 
A
C
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
D
G
 
D
M
 
M
Q
 
K
A
 
R
A
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
F
x
L
T
x
G
S
|
S
I
 
I
S
 
S
Y
 
W
M
 
M
M
 
L
G
 
K
N
 
N
N
 
A
G
 
G
Y
|
Y
P
 
P
A
 
V
Y
|
Y
T
 
A
T
 
S
A
 
A
N
x
K
A
 
A
G
 
A
I
 
V
N
 
Q
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
F
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
F
R
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
T
L
 
L
A
 
V
P
|
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
L
 
M
T
 
T
D
 
D
K
|
K
Q
 
Q
L
 
R
D
 
R
Q
 
L
W
 
W
A
 
L
T
 
D
P
 
D
E
 
A
A
 
G
L
 
R
A
 
A
A
 
A
H
 
I
L
 
K
E
 
A
R
 
G
Q
 
Q
C
 
C
L
 
I
K
 
D
D
 
A
H
 
E
L
 
L
A
 
L
P
 
P
Q
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
A
G
 
R
S
 
M
T
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
A
A
 
D
T
 
D
S
 
S
R
 
R
M
 
M
V
 
I
T
 
T
G
 
A
Q
 
Q
T
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7wwxA Crystal structure of herbaspirillum huttiense l-arabinose 1- dehydrogenase (NAD bound form) (see paper)
48% identity, 97% coverage: 5:253/256 of query aligns to 4:254/254 of 7wwxA

query
sites
7wwxA
A
 
A
I
 
N
F
 
F
P
 
P
D
 
S
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
K
S
 
R
V
 
V
F
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
I
S
 
V
E
 
E
G
 
A
F
 
F
L
 
A
R
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
H
V
 
V
A
 
A
F
 
F
V
 
V
G
x
D
-
x
I
R
 
A
S
 
T
D
 
E
A
 
A
T
 
S
D
 
E
F
 
A
V
 
L
E
 
C
R
 
N
M
 
D
E
 
I
A
 
A
E
 
A
T
 
A
G
 
G
N
 
H
-
 
P
R
 
K
P
 
P
L
 
L
F
 
F
I
 
R
Q
 
H
C
|
C
D
|
D
I
x
L
T
 
R
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
F
K
 
Q
A
 
A
A
 
T
I
 
I
K
 
A
Q
 
E
A
 
L
A
 
Q
E
 
G
A
 
Q
H
 
L
G
 
G
P
 
D
I
 
F
T
 
D
T
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
|
A
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
R
 
R
H
 
H
A
 
K
T
 
L
L
 
E
D
 
E
V
 
V
D
 
T
E
 
L
E
 
E
F
 
Y
W
 
W
D
 
N
W
 
D
A
 
R
Q
 
I
A
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
Q
K
 
R
A
 
P
Y
 
S
F
 
F
F
 
F
A
 
A
C
 
V
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
L
 
V
P
 
E
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
A
 
R
A
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
|
F
T
x
S
S
|
S
I
 
I
S
 
S
Y
 
W
M
 
H
M
 
Q
G
 
S
N
 
G
N
 
G
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
A
 
V
Y
|
Y
T
 
T
T
 
T
A
 
A
N
x
K
A
 
A
G
 
S
I
 
T
N
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
D
F
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
H
R
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
T
L
 
V
A
 
T
P
|
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
L
 
M
T
 
T
D
 
E
K
x
R
Q
 
Q
L
 
I
D
 
K
Q
 
L
W
 
W
A
 
L
T
 
D
P
 
E
E
 
E
A
 
G
L
 
K
A
 
K
A
 
A
H
 
I
L
 
A
E
 
R
R
 
N
Q
 
Q
C
 
C
L
 
L
K
 
Q
D
 
G
H
 
D
L
 
L
A
 
L
P
 
P
Q
 
W
D
 
H
I
 
L
V
 
A
G
 
R
S
 
M
T
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
A
A
 
D
T
 
D
S
 
S
R
 
A
M
 
M
V
 
C
T
 
T
G
 
A
Q
 
Q
T
 
E
L
 
F
V
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G
V
 
W
V
 
V

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
35% identity, 96% coverage: 10:254/256 of query aligns to 3:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
A
 
K
S
 
V
V
 
A
F
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
D
L
 
I
S
 
A
E
 
I
G
 
N
F
 
L
L
 
A
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
V
 
I
A
 
F
F
 
F
V
x
N
-
x
Y
-
x
N
G
|
G
R
x
S
S
 
P
D
 
E
A
 
A
T
 
A
D
 
E
F
 
E
V
 
T
E
 
A
R
 
K
M
 
L
E
 
V
A
 
A
E
 
E
T
 
H
G
 
G
N
 
V
R
 
E
P
 
V
L
 
E
F
 
A
I
 
M
Q
 
K
C
 
A
D
x
N
I
x
V
T
 
A
D
 
I
I
 
A
P
 
E
A
 
D
L
 
V
K
 
D
A
 
A
A
 
F
I
 
F
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
E
 
E
A
 
R
H
 
F
G
 
G
P
 
R
I
 
V
T
 
D
T
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
N
x
I
D
 
T
Q
 
R
R
 
D
H
 
N
A
 
L
T
 
L
L
 
M
D
 
R
V
 
M
D
 
K
E
 
E
E
 
D
F
 
E
W
 
W
D
 
D
W
 
D
A
 
V
Q
 
I
A
 
N
I
|
I
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
G
Y
 
T
F
 
F
F
 
L
A
 
C
C
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
S
P
 
R
G
 
T
M
 
M
Q
 
M
A
 
K
A
 
Q
G
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
 
M
T
 
A
S
|
S
I
 
V
S
 
V
Y
 
G
M
 
L
M
 
I
G
 
G
N
 
N
N
 
A
G
 
G
Y
x
Q
P
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
V
T
 
A
A
 
S
N
x
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
F
 
L
G
 
A
P
 
P
D
 
R
R
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
W
 
F
V
x
I
L
 
T
T
|
T
D
 
D
-
 
M
-
 
T
K
 
D
Q
 
K
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
W
 
-
A
 
K
T
 
T
P
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
M
A
 
L
A
 
A
H
 
Q
L
 
I
E
 
P
R
 
-
Q
 
-
C
 
-
L
 
L
K
 
G
D
 
A
H
 
Y
L
 
G
A
 
T
P
 
T
Q
 
E
D
 
D
I
 
I
V
 
A
G
 
N
S
 
A
T
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
T
 
A
S
 
S
R
 
K
M
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
V
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
M
V
 
V
V
 
M

7krmC Putative fabg bound to nadh from acinetobacter baumannii
37% identity, 96% coverage: 10:254/256 of query aligns to 3:243/244 of 7krmC

query
sites
7krmC
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
A
 
K
S
 
V
V
 
A
F
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
|
S
-
 
E
-
 
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
L
 
T
S
 
A
E
 
E
G
 
I
F
 
F
L
 
A
R
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
F
 
I
V
 
V
G
x
D
R
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
-
T
x
L
D
 
D
F
 
L
V
 
A
E
 
Q
R
 
S
M
 
Q
E
 
N
A
 
A
E
 
A
T
 
K
-
 
A
-
 
L
G
 
G
N
 
E
R
 
G
P
 
H
L
 
M
F
 
G
I
 
L
Q
 
A
C
x
A
D
x
N
I
x
V
T
 
A
D
 
N
I
 
E
P
 
E
A
 
Q
L
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
V
K
 
E
Q
 
Q
A
 
A
A
 
L
E
 
Q
A
 
H
H
 
Y
G
 
G
P
 
K
I
 
I
T
 
D
T
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
N
 
I
D
 
T
Q
 
Q
R
 
P
H
 
I
A
 
K
T
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
I
D
 
Q
E
 
R
E
 
S
F
 
D
W
 
Y
D
 
D
W
 
R
A
 
V
Q
 
L
A
 
D
I
x
V
N
 
S
L
 
L
K
 
R
A
 
G
Y
 
T
F
 
L
F
 
I
A
 
M
C
 
S
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
P
G
 
S
M
 
M
Q
 
K
A
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
C
F
 
L
T
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
S
Y
 
A
M
 
Q
M
 
R
G
 
G
N
 
G
N
 
G
-
 
I
-
 
F
G
 
G
Y
 
G
P
 
P
A
 
H
Y
|
Y
T
 
S
T
 
A
A
 
A
N
x
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
A
R
 
K
S
 
A
L
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
F
 
F
G
 
G
P
 
G
D
 
D
R
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
L
 
L
A
 
T
P
 
P
G
 
G
W
 
L
V
x
I
L
 
Q
T
|
T
D
 
D
K
 
M
Q
 
N
L
 
D
D
 
D
Q
 
R
W
 
R
A
 
-
T
 
-
P
 
H
E
 
D
A
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
G
H
 
I
L
 
P
E
 
L
R
 
G
Q
 
R
C
 
L
L
 
G
K
 
K
D
 
-
H
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
A
Q
 
Q
D
 
D
I
 
V
V
 
A
G
 
N
S
 
A
T
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
T
 
L
S
 
S
R
 
A
M
 
Y
V
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
V
T
 
T
L
 
L
V
 
D
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
V
 
M
V
 
L
V
 
I

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
35% identity, 96% coverage: 10:254/256 of query aligns to 5:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
K
 
Q
G
 
D
A
 
K
S
 
V
V
 
A
F
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
E
L
 
A
S
 
A
E
 
R
G
 
V
F
 
F
L
 
M
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
V
F
 
I
V
 
A
G
x
D
R
x
F
S
 
N
D
 
E
A
 
A
T
 
A
D
 
G
F
 
K
V
 
-
E
 
E
R
 
A
M
 
V
E
 
E
A
 
A
E
 
N
T
 
P
G
 
G
N
 
-
R
 
-
P
 
V
L
 
V
F
 
F
I
 
I
Q
 
R
C
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
I
 
R
P
 
E
A
 
S
L
 
V
K
 
H
A
 
R
A
 
L
I
 
V
K
 
E
Q
 
N
A
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
R
H
 
F
G
 
G
P
 
K
I
 
I
T
 
D
T
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
-
x
G
-
x
I
A
 
T
N
 
R
D
|
D
Q
 
S
R
 
M
H
 
L
A
 
S
T
x
K
L
 
M
D
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
Q
E
 
-
F
 
-
W
 
F
D
 
Q
W
 
Q
A
 
V
Q
 
I
A
 
N
I
 
V
N
|
N
L
 
L
K
 
T
A
 
G
Y
 
V
F
 
F
F
 
H
A
 
C
C
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
Y
M
 
M
Q
 
A
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
G
 
K
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
x
T
T
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
T
Y
 
G
M
 
T
M
 
Y
G
 
G
N
|
N
N
x
V
G
 
G
Y
x
Q
P
 
T
A
 
N
Y
|
Y
T
 
A
T
 
A
A
 
A
N
x
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
I
G
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
F
 
L
G
 
A
P
 
R
D
 
K
R
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
W
x
F
V
x
T
L
 
E
T
|
T
D
 
A
K
x
M
Q
 
V
L
 
A
D
 
E
Q
 
-
W
 
-
A
 
-
T
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
K
L
 
V
A
 
I
A
 
E
H
x
K
L
 
M
E
 
K
R
 
A
Q
 
Q
C
 
V
L
 
P
K
 
M
D
 
G
H
 
R
L
 
L
A
 
G
-
 
K
P
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
I
V
 
A
G
 
N
S
 
A
T
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
H
T
 
E
S
 
S
R
 
D
M
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
T
 
V
L
 
L
V
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
M
V
 
M

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
29% identity, 95% coverage: 9:251/256 of query aligns to 3:248/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
D
 
D
L
 
L
K
 
R
G
 
G
A
 
R
S
 
V
V
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
S
S
x
R
G
|
G
I
x
L
G
 
G
A
 
F
A
 
G
L
 
I
S
 
A
E
 
Q
G
 
G
F
 
L
L
 
A
R
 
E
Q
 
A
G
 
G
A
 
C
K
 
S
V
 
V
A
 
V
F
 
V
V
 
A
G
x
S
R
|
R
S
 
N
-
 
L
-
 
E
D
 
E
A
 
A
T
 
S
D
 
E
F
 
A
V
 
A
E
 
Q
R
 
K
M
 
L
E
 
T
A
 
E
E
 
K
T
 
Y
G
 
G
N
 
V
R
 
E
P
 
T
L
 
M
F
 
A
I
 
F
Q
 
R
C
|
C
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
N
I
 
Y
P
 
E
A
 
E
L
 
V
K
 
K
A
 
K
A
 
L
I
 
L
K
 
E
Q
 
A
A
 
V
A
 
K
E
 
E
A
 
K
H
 
F
G
 
G
P
 
K
I
 
L
T
 
D
T
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
A
x
G
N
x
I
D
 
N
Q
 
R
R
 
R
H
 
H
A
 
P
T
 
A
L
 
E
D
 
E
V
 
F
D
 
P
E
 
L
E
 
D
F
 
E
W
 
F
D
 
R
W
 
Q
A
 
V
Q
 
I
A
 
E
I
x
V
N
 
N
L
 
L
K
 
F
A
 
G
Y
 
T
F
 
Y
F
 
Y
A
 
V
C
 
C
Q
 
R
A
 
E
V
 
A
L
 
F
P
 
S
G
 
L
M
 
L
Q
 
R
A
 
E
A
 
S
G
 
D
G
 
N
G
 
P
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
x
I
T
 
G
S
|
S
I
 
L
S
 
T
Y
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
V
M
 
T
M
 
M
G
 
P
N
 
N
N
 
-
G
 
-
Y
x
I
P
 
S
A
 
A
Y
|
Y
T
 
A
T
 
A
A
 
S
N
x
K
A
 
G
G
 
G
I
 
V
N
 
A
G
 
S
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
F
 
W
G
 
G
P
 
R
D
 
Y
R
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
V
L
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
W
V
x
Y
L
 
R
T
|
T
D
 
K
K
x
M
Q
x
T
L
 
E
D
 
A
Q
 
V
W
 
F
A
 
S
T
 
D
P
 
P
E
 
E
A
 
K
L
 
L
A
 
D
A
 
Y
H
 
M
L
 
L
E
 
K
R
 
R
Q
 
I
C
 
P
L
 
L
K
 
G
D
 
R
H
 
T
L
 
G
A
 
V
P
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
L
V
 
K
G
 
G
S
 
V
T
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
E
T
 
E
S
 
A
R
 
K
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
L
 
I
V
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q5P5I4 (S)-1-Phenylethanol dehydrogenase; EC 1.1.1.311 from Aromatoleum aromaticum (strain EbN1) (Azoarcus sp. (strain EbN1)) (see 2 papers)
36% identity, 95% coverage: 10:253/256 of query aligns to 5:247/249 of Q5P5I4

query
sites
Q5P5I4
L
 
L
K
 
K
G
 
D
A
 
K
S
 
L
V
 
A
F
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
L
 
I
S
 
A
E
 
E
G
 
R
F
 
F
L
 
A
R
 
V
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
I
A
 
A
F
 
I
V
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
A
D
|
D
F
 
L
V
 
V
E
 
P
R
 
A
M
 
P
E
 
E
A
 
A
E
 
E
T
 
A
-
 
A
-
 
I
-
 
R
-
 
N
-
 
L
G
 
G
N
 
R
R
 
R
P
 
V
L
 
L
F
 
T
I
 
V
Q
 
K
C
|
C
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
Q
I
 
P
P
 
G
A
 
D
L
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
F
I
 
G
K
 
K
Q
 
Q
A
 
V
A
 
I
E
 
S
A
 
T
H
 
F
G
 
G
P
 
R
I
 
C
T
 
D
T
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
N
 
-
D
 
-
Q
 
-
R
 
I
H
x
Y
A
 
P
T
 
L
L
 
I
D
 
P
V
 
F
D
 
D
E
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
F
E
 
E
F
 
Q
W
 
W
D
 
K
W
 
K
A
 
T
Q
 
F
A
 
E
I
 
I
N
 
N
L
 
V
K
 
D
A
 
S
Y
 
G
F
 
F
F
 
L
A
 
M
C
 
A
Q
 
K
A
 
A
V
 
F
L
 
V
P
 
P
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
A
 
R
A
 
N
G
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
 
L
T
 
T
S
 
S
I
 
T
S
 
T
Y
 
Y
M
 
W
M
 
L
G
 
K
N
 
I
N
 
E
G
 
A
Y
 
Y
P
 
T
A
 
H
Y
 
Y
T
 
I
T
 
S
A
 
T
N
x
K
A
 
A
G
 
A
I
 
N
N
 
I
G
 
G
M
 
F
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
S
E
 
D
F
 
L
G
 
G
P
 
K
D
 
D
R
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
P
|
P
G
x
S
W
x
L
V
|
V
L
 
R
T
 
T
D
 
-
K
 
-
Q
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
A
T
|
T
P
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
S
A
 
A
A
 
L
H
 
S
L
 
A
E
 
M
R
 
F
Q
 
D
C
 
V
L
 
L
K
 
P
D
 
N
H
 
M
L
 
L
-
 
Q
-
 
A
-
 
I
-
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
Q
A
 
V
P
 
P
Q
 
L
D
 
D
I
 
L
V
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
A
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
T
 
D
S
 
A
R
 
S
M
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
M
V
 
V

Sites not aligning to the query:

2ewmB Crystal structure of the (s)-specific 1-phenylethanol dehydrogenase of the denitrifying bacterium strain ebn1 (see paper)
36% identity, 95% coverage: 10:253/256 of query aligns to 3:245/247 of 2ewmB

query
sites
2ewmB
L
 
L
K
 
K
G
 
D
A
 
K
S
 
L
V
 
A
F
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
L
 
I
S
 
A
E
 
E
G
 
R
F
 
F
L
 
A
R
 
V
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
I
A
 
A
F
 
I
V
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
A
D
|
D
F
x
L
V
 
V
E
 
P
R
 
A
M
 
P
E
 
E
A
 
A
E
 
E
T
 
A
-
 
A
-
 
I
-
 
R
-
 
N
-
 
L
G
 
G
N
 
R
R
 
R
P
 
V
L
 
L
F
 
T
I
 
V
Q
 
K
C
|
C
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
Q
I
 
P
P
 
G
A
 
D
L
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
F
I
 
G
K
 
K
Q
 
Q
A
 
V
A
 
I
E
 
S
A
 
T
H
 
F
G
 
G
P
 
R
I
 
C
T
 
D
T
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
N
 
-
D
 
-
Q
 
-
R
 
I
H
 
Y
A
 
P
T
 
L
L
 
I
D
 
P
V
 
F
D
 
D
E
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
F
E
 
E
F
 
Q
W
 
W
D
 
K
W
 
K
A
 
T
Q
 
F
A
 
E
I
 
I
N
 
N
L
 
V
K
 
D
A
 
S
Y
 
G
F
 
F
F
 
L
A
 
M
C
 
A
Q
 
K
A
 
A
V
 
F
L
 
V
P
 
P
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
A
 
R
A
 
N
G
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
 
L
T
 
T
S
|
S
I
 
T
S
 
T
Y
 
Y
M
 
W
M
 
L
G
 
K
N
 
I
N
 
E
G
 
A
Y
|
Y
P
 
T
A
 
H
Y
|
Y
T
 
I
T
 
S
A
 
T
N
x
K
A
 
A
G
 
A
I
 
N
N
 
I
G
 
G
M
 
F
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
S
E
 
D
F
 
L
G
 
G
P
 
K
D
 
D
R
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
P
|
P
G
x
S
W
x
L
V
|
V
L
 
R
T
 
T
D
 
-
K
 
-
Q
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
A
T
|
T
P
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
S
A
 
A
A
 
L
H
 
S
L
 
A
E
 
M
R
 
F
Q
 
D
C
 
V
L
 
L
K
 
P
D
 
N
H
 
M
L
 
L
-
 
Q
-
 
A
-
 
I
-
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
Q
A
 
V
P
 
P
Q
 
L
D
 
D
I
 
L
V
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
A
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
T
 
D
S
 
A
R
 
S
M
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
M
V
 
V

6t62A Crystal structure of acinetobacter baumannii fabg in complex with NADPH at 1.8 a resolution (see paper)
32% identity, 93% coverage: 16:252/256 of query aligns to 9:241/244 of 6t62A

query
sites
6t62A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
I
S
 
A
E
 
Q
G
 
Q
F
 
L
L
 
I
R
 
Q
Q
 
D
G
 
G
A
 
Y
K
 
F
V
 
V
A
 
-
F
 
-
V
 
V
G
 
G
R
 
T
S
x
A
D
x
T
A
 
S
T
 
E
D
 
S
F
 
G
V
 
A
E
 
Q
R
 
K
M
 
L
E
 
T
A
 
D
E
 
S
T
 
F
G
 
G
N
 
E
R
 
Q
P
 
G
L
 
A
F
 
G
I
 
L
Q
 
A
C
x
L
D
|
D
I
x
V
T
 
R
D
 
N
I
 
L
P
 
D
A
 
E
L
 
I
K
 
E
A
 
A
A
 
V
I
 
V
K
 
S
Q
 
H
A
 
I
A
 
E
E
 
Q
A
 
N
H
 
Y
G
 
G
P
 
P
I
 
V
T
 
L
T
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
N
x
I
D
 
T
Q
 
K
R
 
D
H
 
N
A
 
L
T
 
L
L
 
L
D
 
R
V
 
M
D
 
S
E
 
E
E
 
D
F
 
D
W
 
W
D
 
D
W
 
D
A
 
I
Q
 
L
A
 
N
I
 
I
N
 
H
L
 
L
K
 
K
A
 
A
Y
 
V
F
 
Y
F
 
R
A
 
L
C
 
S
Q
 
K
A
 
R
V
 
V
L
 
L
P
 
K
G
 
G
M
 
M
Q
 
T
A
 
K
A
 
A
G
 
R
G
 
F
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
x
I
T
x
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
Y
 
A
M
 
H
M
 
F
G
 
A
N
 
N
N
 
P
G
 
G
Y
 
Q
P
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
S
T
 
A
A
 
A
N
x
K
A
 
A
G
 
G
I
 
I
N
 
E
G
 
A
M
 
F
T
 
S
R
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
F
 
M
G
 
G
P
 
S
D
 
R
R
 
Q
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
S
L
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
F
V
x
I
L
 
A
T
 
T
D
 
E
K
 
-
Q
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
-
T
x
M
P
 
T
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
E
H
 
D
L
 
I
E
 
-
R
 
R
Q
 
K
C
 
K
L
 
M
K
 
S
D
 
D
H
 
Q
L
 
V
A
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
E
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
I
 
I
V
 
A
G
 
N
S
 
A
T
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
T
 
K
S
 
A
R
 
G
M
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
T
 
V
L
 
L
V
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
V
 
L

6wprA Crystal structure of a putative 3-oxoacyl-acp reductase (fabg) with NADP(h) from acinetobacter baumannii (see paper)
32% identity, 93% coverage: 16:252/256 of query aligns to 9:241/244 of 6wprA

query
sites
6wprA
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
I
S
 
A
E
 
Q
G
 
Q
F
 
L
L
 
I
R
 
Q
Q
 
D
G
 
G
A
 
Y
K
 
F
V
 
V
A
 
-
F
 
-
V
 
V
G
 
G
R
 
T
S
 
A
D
x
T
A
 
S
T
 
E
D
 
S
F
 
G
V
 
A
E
 
Q
R
 
K
M
 
L
E
 
T
A
 
D
E
 
S
T
 
F
G
 
G
N
 
E
R
 
Q
P
 
G
L
 
A
F
 
G
I
 
L
Q
 
A
C
x
L
D
|
D
I
x
V
T
 
R
D
 
N
I
 
L
P
 
D
A
 
E
L
 
I
K
 
E
A
 
A
A
 
V
I
 
V
K
 
S
Q
 
H
A
 
I
A
 
E
E
 
Q
A
 
N
H
 
Y
G
 
G
P
 
P
I
 
V
T
 
L
T
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
N
x
I
D
 
T
Q
 
K
R
 
D
H
 
N
A
 
L
T
 
L
L
 
L
D
 
R
V
 
M
D
 
S
E
 
E
E
 
D
F
 
D
W
 
W
D
 
D
W
 
D
A
 
I
Q
 
L
A
 
N
I
 
I
N
 
H
L
 
L
K
 
K
A
 
A
Y
 
V
F
 
Y
F
 
R
A
 
L
C
 
S
Q
 
K
A
 
R
V
 
V
L
 
L
P
 
K
G
 
G
M
 
M
Q
 
T
A
 
K
A
 
A
G
 
R
G
 
F
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
x
I
T
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
Y
 
A
M
 
H
M
 
F
G
 
A
N
 
N
N
 
P
G
 
G
Y
 
Q
P
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
S
T
 
A
A
 
A
N
x
K
A
 
A
G
 
G
I
 
I
N
 
E
G
 
A
M
 
F
T
 
S
R
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
F
 
M
G
 
G
P
 
S
D
 
R
R
 
Q
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
S
L
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
W
 
F
V
 
I
L
 
A
T
 
T
D
 
E
K
 
-
Q
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
-
T
 
M
P
 
T
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
E
H
 
D
L
 
I
E
 
-
R
 
R
Q
 
K
C
 
K
L
 
M
K
 
S
D
 
D
H
 
Q
L
 
V
A
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
E
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
I
 
I
V
 
A
G
 
N
S
 
A
T
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
T
 
K
S
 
A
R
 
G
M
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
T
 
V
L
 
L
V
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
V
 
L

4za2D Crystal structure of pectobacterium carotovorum 2-keto-3-deoxy-d- gluconate dehydrogenase complexed with NAD+ (see paper)
32% identity, 95% coverage: 9:251/256 of query aligns to 7:243/247 of 4za2D

query
sites
4za2D
D
 
D
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
A
 
K
S
 
V
V
 
A
F
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
C
G
x
D
S
 
T
G
 
G
I
x
L
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
L
 
M
S
 
A
E
 
I
G
 
G
F
 
L
L
 
A
R
 
Q
Q
 
A
G
 
G
A
 
C
K
 
D
V
 
I
A
 
V
F
 
G
V
 
V
G
 
N
R
x
I
S
 
V
D
 
E
A
 
P
T
 
K
D
 
D
F
 
T
V
 
I
E
 
E
R
 
K
M
 
V
E
 
T
A
 
A
E
 
-
T
 
L
G
 
G
N
 
R
R
 
R
P
 
F
L
 
L
F
 
S
I
 
L
Q
 
T
C
 
A
D
|
D
I
x
M
T
 
S
D
 
N
I
 
V
P
 
S
A
 
G
L
 
H
K
 
A
A
 
E
A
 
L
I
 
V
K
 
E
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
E
 
A
A
 
E
H
 
F
G
 
G
P
 
H
I
 
V
T
 
D
T
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
N
 
I
D
 
I
Q
 
R
R
 
R
H
 
E
A
 
D
T
 
A
L
 
I
D
 
E
V
 
F
D
 
S
E
 
E
E
 
K
F
 
N
W
 
W
D
 
D
W
 
D
A
 
V
Q
 
M
A
 
N
I
x
L
N
 
N
L
 
I
K
 
K
A
 
S
Y
 
V
F
 
F
F
 
F
A
 
M
C
 
S
Q
 
Q
A
 
T
V
 
V
L
 
A
P
 
R
G
 
Q
M
 
F
Q
 
I
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
-
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
x
I
T
 
A
S
|
S
I
 
M
S
 
L
Y
 
S
M
 
F
M
 
Q
G
 
G
N
 
G
N
 
I
G
 
R
Y
 
V
P
 
P
A
 
S
Y
|
Y
T
 
T
T
 
A
A
 
S
N
x
K
A
 
S
G
 
A
I
 
V
N
 
M
G
 
G
M
 
V
T
 
T
R
 
R
S
 
L
L
 
M
A
 
A
R
 
N
E
 
E
F
 
W
G
 
A
P
 
K
D
 
H
R
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
G
|
G
W
 
Y
V
x
M
L
 
A
T
|
T
D
 
N
K
x
N
Q
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
-
T
 
T
P
 
Q
E
 
E
A
 
R
L
 
S
A
 
K
A
 
E
H
 
I
L
 
L
E
 
D
R
 
R
Q
 
I
C
 
P
L
 
A
K
 
G
D
 
R
H
 
W
L
 
G
A
 
L
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
I
 
L
V
 
M
G
 
G
S
 
P
T
 
S
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
S
T
 
A
S
 
S
R
 
D
M
 
Y
V
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
Y
T
 
T
L
 
I
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5b4tA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and a substrate d-3- hydroxybutyrate (see paper)
34% identity, 95% coverage: 10:251/256 of query aligns to 2:256/260 of 5b4tA

query
sites
5b4tA
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
K
S
 
K
V
 
A
F
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
x
T
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
L
 
M
S
 
A
E
 
T
G
 
E
F
 
L
L
 
A
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
A
 
V
F
 
I
V
 
N
G
 
G
R
x
F
S
 
G
D
 
Q
A
 
P
T
 
E
D
 
D
F
 
-
V
 
I
E
 
E
R
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
T
M
 
L
E
 
E
A
 
S
E
 
K
T
 
F
G
 
G
N
 
V
R
 
K
P
 
A
L
 
Y
F
 
Y
I
 
L
Q
 
N
C
 
A
D
|
D
I
x
L
T
 
S
D
 
D
I
 
A
P
 
Q
A
 
A
L
 
T
K
 
R
A
 
D
A
 
F
I
 
I
K
 
A
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
H
 
L
G
 
G
P
 
G
I
 
L
T
 
D
T
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
x
G
N
 
I
D
x
Q
Q
 
H
R
 
T
H
 
A
A
 
P
T
 
I
L
 
E
D
 
E
V
 
F
D
 
P
E
 
V
E
 
D
F
 
K
W
 
W
D
 
N
W
 
A
A
 
I
Q
 
I
A
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
K
 
S
A
 
A
Y
 
V
F
 
F
F
 
H
A
 
G
C
 
T
Q
 
A
A
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
I
M
 
M
Q
 
Q
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
x
I
T
 
A
S
|
S
I
 
A
S
x
H
Y
 
G
M
 
L
M
 
V
G
 
A
N
 
S
N
 
V
G
 
N
Y
x
K
P
 
S
A
 
A
Y
|
Y
T
 
V
T
 
A
A
 
A
N
x
K
A
 
H
G
 
G
I
 
V
N
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
V
L
 
T
A
 
A
R
 
L
E
 
E
F
 
N
G
 
A
P
 
G
D
 
K
R
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
C
P
|
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
-
 
R
-
x
T
-
 
P
L
|
L
T
x
V
D
 
E
K
 
K
Q
|
Q
L
 
I
D
 
E
Q
 
A
W
x
I
A
 
S
T
 
Q
P
 
Q
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
R
H
 
E
L
 
L
-
 
L
-
 
A
E
 
E
R
 
K
Q
 
Q
C
 
P
L
 
S
K
 
L
D
 
Q
H
 
F
L
 
V
A
 
T
P
 
P
Q
 
E
D
 
Q
I
 
L
V
 
G
G
 
G
S
 
A
T
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
A
 
A
T
 
A
S
 
A
R
 
D
M
 
Q
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
T
 
T
L
 
L
V
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3w8dA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and an inhibitor methylmalonate
34% identity, 95% coverage: 10:251/256 of query aligns to 2:256/260 of 3w8dA

query
sites
3w8dA
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
K
S
 
K
V
 
A
F
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
L
 
M
S
 
A
E
 
T
G
 
E
F
 
L
L
 
A
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
A
 
V
F
 
I
V
 
N
G
 
G
R
x
F
S
 
G
D
 
Q
A
 
P
T
 
E
D
 
D
F
 
-
V
 
I
E
 
E
R
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
T
M
 
L
E
 
E
A
 
S
E
 
K
T
 
F
G
 
G
N
 
V
R
 
K
P
 
A
L
 
Y
F
 
Y
I
 
L
Q
 
N
C
x
A
D
|
D
I
x
L
T
 
S
D
 
D
I
 
A
P
 
Q
A
 
A
L
 
T
K
 
R
A
 
D
A
 
F
I
 
I
K
 
A
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
H
 
L
G
 
G
P
 
G
I
 
L
T
 
D
T
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
N
 
I
D
x
Q
Q
 
H
R
 
T
H
 
A
A
 
P
T
 
I
L
 
E
D
 
E
V
 
F
D
 
P
E
 
V
E
 
D
F
 
K
W
 
W
D
 
N
W
 
A
A
 
I
Q
 
I
A
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
K
 
S
A
 
A
Y
 
V
F
 
F
F
 
H
A
 
G
C
 
T
Q
 
A
A
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
I
M
 
M
Q
 
Q
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
 
I
T
 
A
S
|
S
I
 
A
S
x
H
Y
 
G
M
 
L
M
 
V
G
 
A
N
 
S
N
 
V
G
 
N
Y
x
K
P
 
S
A
 
A
Y
|
Y
T
 
V
T
 
A
A
 
A
N
x
K
A
 
H
G
 
G
I
 
V
N
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
V
L
 
T
A
 
A
R
 
L
E
 
E
F
 
N
G
 
A
P
 
G
D
 
K
R
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
C
P
|
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
-
 
R
-
x
T
-
 
P
L
|
L
T
x
V
D
 
E
K
 
K
Q
|
Q
L
 
I
D
 
E
Q
 
A
W
x
I
A
 
S
T
 
Q
P
 
Q
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
R
H
 
E
L
 
L
-
 
L
-
 
A
E
 
E
R
 
K
Q
 
Q
C
 
P
L
 
S
K
 
L
D
 
Q
H
 
F
L
 
V
A
 
T
P
 
P
Q
 
E
D
 
Q
I
 
L
V
 
G
G
 
G
S
 
A
T
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
A
 
A
T
 
A
S
 
A
R
 
D
M
 
Q
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
T
 
T
L
 
L
V
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3vdrA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase, prepared in the presence of the substrate d-3-hydroxybutyrate and NAD(+) (see paper)
34% identity, 95% coverage: 10:251/256 of query aligns to 2:256/260 of 3vdrA

query
sites
3vdrA
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
K
S
 
K
V
 
A
F
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
x
T
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
L
 
M
S
 
A
E
 
T
G
 
E
F
 
L
L
 
A
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
A
 
V
F
 
I
V
 
N
G
 
G
R
x
F
S
 
G
D
 
Q
A
 
P
T
 
E
D
 
D
F
 
-
V
 
I
E
 
E
R
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
T
M
 
L
E
 
E
A
 
S
E
 
K
T
 
F
G
 
G
N
 
V
R
 
K
P
 
A
L
 
Y
F
 
Y
I
 
L
Q
 
N
C
 
A
D
|
D
I
x
L
T
 
S
D
 
D
I
 
A
P
 
Q
A
 
A
L
 
T
K
 
R
A
 
D
A
 
F
I
 
I
K
 
A
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
H
 
L
G
 
G
P
 
G
I
 
L
T
 
D
T
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
N
 
I
D
x
Q
Q
 
H
R
 
T
H
 
A
A
 
P
T
 
I
L
 
E
D
 
E
V
 
F
D
 
P
E
 
V
E
 
D
F
 
K
W
 
W
D
 
N
W
 
A
A
 
I
Q
 
I
A
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
K
 
S
A
 
A
Y
 
V
F
 
F
F
 
H
A
 
G
C
 
T
Q
 
A
A
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
I
M
 
M
Q
 
Q
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
 
I
T
 
A
S
|
S
I
 
A
S
x
H
Y
 
G
M
 
L
M
 
V
G
 
A
N
 
S
N
 
V
G
 
N
Y
x
K
P
 
S
A
 
A
Y
|
Y
T
 
V
T
 
A
A
 
A
N
x
K
A
 
H
G
 
G
I
 
V
N
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
V
L
 
T
A
 
A
R
 
L
E
 
E
F
 
N
G
 
A
P
 
G
D
 
K
R
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
C
P
 
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
-
 
R
-
x
T
-
 
P
L
|
L
T
x
V
D
 
E
K
 
K
Q
|
Q
L
 
I
D
 
E
Q
 
A
W
x
I
A
 
S
T
 
Q
P
 
Q
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
R
H
 
E
L
 
L
-
 
L
-
 
A
E
 
E
R
 
K
Q
 
Q
C
 
P
L
 
S
K
 
L
D
 
Q
H
 
F
L
 
V
A
 
T
P
 
P
Q
 
E
D
 
Q
I
 
L
V
 
G
G
 
G
S
 
A
T
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
A
 
A
T
 
A
S
 
A
R
 
D
M
 
Q
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
T
 
T
L
 
L
V
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3vdqA Crystal structure of alcaligenes faecalis d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase in complex with NAD(+) and acetate (see paper)
34% identity, 95% coverage: 10:251/256 of query aligns to 2:256/260 of 3vdqA

query
sites
3vdqA
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
K
S
 
K
V
 
A
F
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
L
 
M
S
 
A
E
 
T
G
 
E
F
 
L
L
 
A
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
A
 
V
F
 
I
V
 
N
G
 
G
R
x
F
S
 
G
D
 
Q
A
 
P
T
 
E
D
 
D
F
 
-
V
 
I
E
 
E
R
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
T
M
 
L
E
 
E
A
 
S
E
 
K
T
 
F
G
 
G
N
 
V
R
 
K
P
 
A
L
 
Y
F
 
Y
I
 
L
Q
 
N
C
 
A
D
|
D
I
x
L
T
 
S
D
 
D
I
 
A
P
 
Q
A
 
A
L
 
T
K
 
R
A
 
D
A
 
F
I
 
I
K
 
A
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
H
 
L
G
 
G
P
 
G
I
 
L
T
 
D
T
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
N
 
I
D
x
Q
Q
 
H
R
 
T
H
 
A
A
 
P
T
 
I
L
 
E
D
 
E
V
 
F
D
 
P
E
 
V
E
 
D
F
 
K
W
 
W
D
 
N
W
 
A
A
 
I
Q
 
I
A
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
K
 
S
A
 
A
Y
 
V
F
 
F
F
 
H
A
 
G
C
 
T
Q
 
A
A
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
I
M
 
M
Q
 
Q
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
x
I
T
 
A
S
|
S
I
 
A
S
x
H
Y
 
G
M
 
L
M
 
V
G
 
A
N
 
S
N
 
V
G
 
N
Y
x
K
P
 
S
A
 
A
Y
|
Y
T
 
V
T
 
A
A
 
A
N
x
K
A
 
H
G
 
G
I
 
V
N
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
V
L
 
T
A
 
A
R
 
L
E
 
E
F
 
N
G
 
A
P
 
G
D
 
K
R
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
C
P
|
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
-
 
R
-
x
T
-
 
P
L
|
L
T
x
V
D
 
E
K
 
K
Q
|
Q
L
 
I
D
 
E
Q
 
A
W
x
I
A
 
S
T
 
Q
P
 
Q
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
R
H
 
E
L
 
L
-
 
L
-
 
A
E
 
E
R
 
K
Q
 
Q
C
 
P
L
 
S
K
 
L
D
 
Q
H
 
F
L
 
V
A
 
T
P
 
P
Q
 
E
D
 
Q
I
 
L
V
 
G
G
 
G
S
 
A
T
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
A
 
A
T
 
A
S
 
A
R
 
D
M
 
Q
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
T
 
T
L
 
L
V
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
33% identity, 95% coverage: 10:252/256 of query aligns to 3:237/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
L
 
L
K
 
E
G
 
G
A
 
K
S
 
V
V
 
A
F
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
S
x
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
S
 
A
E
 
L
G
 
A
F
 
Y
L
 
A
R
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
F
 
A
V
 
G
G
x
D
R
x
L
S
 
G
D
 
D
A
 
L
T
 
T
D
 
Y
F
 
S
V
 
H
E
 
P
R
 
N
M
 
V
E
 
E
A
 
G
E
 
-
T
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
I
 
M
Q
 
Y
C
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
I
 
V
P
 
T
A
 
G
L
 
V
K
 
E
A
 
K
A
 
F
I
 
Y
K
 
Q
Q
 
S
A
 
V
A
 
I
E
 
D
A
 
K
H
 
Y
G
 
G
P
 
K
I
 
I
T
 
D
T
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
N
 
I
D
 
T
Q
 
K
R
 
D
H
 
A
A
 
M
T
 
T
L
 
R
D
 
K
V
 
M
D
 
T
E
 
E
E
 
A
F
 
Q
W
 
W
D
 
D
W
 
A
A
 
V
Q
 
I
A
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
G
Y
 
V
F
 
F
F
 
N
A
 
L
C
 
T
Q
 
R
A
 
L
V
 
V
L
 
G
P
 
P
G
 
Q
M
 
M
Q
 
Q
A
 
T
A
 
N
G
 
G
G
 
Y
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
x
I
T
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
Y
 
G
M
 
V
M
 
F
G
 
G
N
 
N
N
 
I
G
 
G
Y
 
Q
P
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
A
T
 
A
A
 
T
N
x
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
M
S
 
T
L
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
F
 
F
G
 
A
P
 
L
D
 
K
-
 
G
-
 
A
R
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
Y
V
x
I
L
 
M
T
|
T
D
 
D
K
 
I
Q
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
L
W
 
K
A
 
T
T
 
V
P
 
P
E
 
Q
A
 
D
L
 
L
A
 
L
A
 
D
H
 
K
L
 
F
E
 
A
R
 
A
Q
 
L
C
 
T
L
 
M
K
 
L
D
 
N
H
 
R
L
 
L
A
 
G
-
 
Q
P
 
P
Q
 
E
D
 
E
I
 
I
V
 
A
G
 
K
S
 
V
T
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
T
 
D
S
 
A
R
 
S
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
L
 
I
V
 
N
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
V
 
M

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
32% identity, 96% coverage: 7:252/256 of query aligns to 3:240/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
F
 
F
P
 
M
D
 
N
L
 
L
K
 
E
G
 
G
A
 
K
S
 
V
V
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
A
E
 
E
G
 
L
F
 
L
L
 
A
R
 
E
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
-
F
 
-
V
 
I
G
 
G
R
 
T
S
 
A
D
x
T
A
 
S
T
 
E
D
 
S
F
 
G
V
 
A
E
 
Q
R
 
A
M
 
I
E
 
S
A
 
D
E
 
Y
T
 
L
G
 
G
N
 
D
R
 
N
P
 
G
L
 
K
F
 
G
I
 
M
Q
 
A
C
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
N
I
 
P
P
 
E
A
 
S
L
 
I
K
 
E
A
 
A
A
 
V
I
 
L
K
 
K
Q
 
A
A
 
I
A
 
T
E
 
D
A
 
E
H
 
F
G
 
G
P
 
G
I
 
V
T
 
D
T
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
N
 
I
D
 
T
Q
 
R
R
 
D
H
 
N
A
 
L
T
 
L
L
 
M
D
 
R
V
 
M
D
 
K
E
 
E
E
 
E
F
 
E
W
 
W
D
 
S
W
 
D
A
 
I
Q
 
M
A
 
E
I
 
T
N
|
N
L
 
L
K
 
T
A
 
S
Y
 
I
F
 
F
F
 
R
A
 
L
C
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
R
G
 
G
M
 
M
Q
 
M
A
 
K
A
 
K
G
 
R
G
 
Q
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
 
V
T
x
G
S
|
S
I
 
V
S
 
V
Y
 
G
M
 
T
M
 
M
G
 
G
N
 
N
N
 
A
G
 
G
Y
x
Q
P
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
A
T
 
A
A
 
A
N
x
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
I
G
 
G
M
 
F
T
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
F
 
V
G
 
A
P
 
S
D
 
R
R
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
L
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
F
V
 
I
L
 
E
T
|
T
D
 
D
K
 
M
Q
 
N
L
 
D
D
 
E
Q
 
Q
W
 
R
A
 
T
T
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
A
L
 
T
A
 
L
A
 
A
H
 
Q
L
 
V
E
 
P
R
 
A
Q
 
G
C
 
R
L
 
L
K
 
G
D
 
D
H
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
P
Q
 
R
D
 
E
I
 
I
V
 
A
G
 
S
S
 
A
T
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
P
T
 
E
S
 
A
R
 
A
M
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
V
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
V
 
M

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
31% identity, 96% coverage: 10:254/256 of query aligns to 6:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
L
 
L
K
 
A
G
 
S
A
 
K
S
 
T
V
 
A
F
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
F
A
 
G
L
 
I
S
 
A
E
 
Q
G
 
V
F
 
L
L
 
A
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
R
V
 
V
A
 
I
F
 
I
V
 
A
G
x
D
R
|
R
S
 
D
D
 
A
A
 
H
T
 
G
D
 
E
F
 
A
V
 
A
E
 
A
R
 
A
M
 
S
E
 
L
A
 
R
E
 
E
T
 
S
G
 
G
N
 
A
R
 
Q
P
 
A
L
 
L
F
 
F
I
 
I
Q
 
S
C
|
C
D
 
N
I
|
I
T
 
A
D
 
E
I
 
K
P
 
T
A
 
Q
L
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
L
I
 
F
K
 
S
Q
 
Q
A
 
A
A
 
E
E
 
E
A
 
A
H
 
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
T
 
D
T
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
x
G
N
x
I
D
 
N
Q
 
R
R
 
D
H
 
A
A
 
M
T
 
L
L
 
H
D
 
K
V
 
L
D
 
T
E
 
E
E
 
A
F
 
D
W
 
W
D
 
D
W
 
T
A
 
V
Q
 
I
A
 
D
I
x
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
G
Y
 
T
F
 
F
F
 
L
A
 
C
C
 
M
Q
 
Q
A
 
Q
V
 
A
L
 
A
P
 
I
G
 
R
M
 
M
Q
 
R
A
 
E
A
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
 
I
T
 
A
S
 
S
I
 
A
S
 
S
Y
 
W
M
 
-
M
 
L
G
 
G
N
 
N
N
 
V
G
 
G
Y
 
Q
P
 
T
A
 
N
Y
|
Y
T
 
S
T
 
A
A
 
S
N
x
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
V
G
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
A
A
 
C
R
 
R
E
 
E
F
 
L
G
 
A
P
 
K
D
 
K
R
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
W
 
F
V
x
I
L
 
D
T
|
T
D
 
D
K
 
M
Q
x
T
L
 
R
D
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
G
T
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
N
L
 
V
A
 
W
A
 
Q
H
 
I
L
 
M
E
 
V
R
 
S
Q
 
K
C
 
I
L
 
P
K
 
A
D
 
G
H
 
Y
L
 
A
A
 
G
P
 
E
Q
 
A
D
 
K
I
 
D
V
 
V
G
 
G
S
 
E
T
 
C
L
 
V
-
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
T
 
G
S
 
A
R
 
R
M
 
Y
V
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
T
 
V
L
 
I
V
 
N
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
M
V
 
V
V
 
L

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
33% identity, 93% coverage: 14:252/256 of query aligns to 6:244/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
S
 
S
V
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
S
L
 
I
S
 
A
E
 
L
G
 
Q
F
 
L
L
 
A
R
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
Y
K
 
N
V
 
V
A
 
A
-
 
V
-
 
N
F
 
Y
V
 
A
G
 
G
-
 
S
R
 
K
S
 
E
D
 
K
A
 
A
T
 
E
D
 
A
F
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
E
M
 
I
E
 
K
A
 
A
E
 
K
T
 
-
G
 
G
N
 
V
R
 
D
P
 
S
L
 
F
F
 
A
I
 
I
Q
 
Q
C
 
A
D
 
N
I
 
V
T
 
A
D
 
D
I
 
A
P
 
D
A
 
E
L
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
M
I
 
I
K
 
K
Q
 
E
A
 
V
A
 
V
E
 
S
A
 
Q
H
 
F
G
 
G
P
 
S
I
 
L
T
 
D
T
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
N
 
I
D
 
T
Q
 
R
R
 
D
H
 
N
A
 
L
T
 
L
L
 
M
D
 
R
V
 
M
D
 
K
E
 
E
E
 
Q
F
 
E
W
 
W
D
 
D
W
 
D
A
 
V
Q
 
I
A
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
G
Y
 
V
F
 
F
F
 
N
A
 
C
C
 
I
Q
 
Q
A
 
K
V
 
A
L
 
T
P
 
P
G
 
Q
M
 
M
Q
 
L
A
 
R
A
 
Q
G
 
R
G
 
S
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
 
L
T
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
Y
 
G
M
 
A
M
 
V
G
 
G
N
 
N
N
 
P
G
 
G
Y
x
Q
P
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
V
T
 
A
A
 
T
N
x
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
F
 
L
G
 
A
P
 
S
D
 
R
R
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
F
V
 
I
L
 
V
T
 
S
D
 
D
K
 
-
Q
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
-
T
 
M
P
 
T
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
D
H
 
E
L
 
L
E
 
K
R
 
E
Q
 
Q
C
 
M
L
 
L
K
 
T
D
 
Q
-
 
I
H
 
P
L
 
L
A
 
A
-
 
R
-
 
F
-
 
G
-
 
Q
P
 
D
Q
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
A
G
 
N
S
 
T
T
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
T
 
K
S
 
A
R
 
K
M
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
L
 
I
V
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
V
 
M

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
33% identity, 95% coverage: 12:255/256 of query aligns to 5:239/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
G
 
G
A
 
K
S
 
G
V
 
V
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
L
 
I
S
 
A
E
 
Q
G
 
A
F
 
F
L
 
A
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
L
V
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
C
G
x
D
-
x
L
R
|
R
S
 
P
D
 
E
A
 
G
T
 
K
D
 
E
F
 
V
V
 
A
E
 
E
R
 
A
M
 
I
E
 
G
A
 
G
E
 
A
T
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
F
I
 
F
Q
 
Q
C
x
V
D
|
D
I
x
L
T
 
E
D
 
D
I
 
E
P
 
R
A
 
E
L
 
R
K
 
V
A
 
R
A
 
F
I
 
V
K
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
Y
A
 
A
H
 
L
G
 
G
P
 
R
I
 
V
T
 
D
T
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
|
A
N
x
I
D
 
A
Q
 
A
R
 
P
H
 
G
A
 
S
T
 
A
L
 
L
D
 
T
V
 
V
D
 
R
E
 
L
E
 
P
F
 
E
W
 
W
D
 
R
W
 
R
A
 
V
Q
 
L
A
 
E
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
T
A
 
A
Y
 
P
F
 
M
F
 
H
A
 
L
C
 
S
Q
 
A
A
 
L
V
 
A
L
 
A
P
 
R
G
 
E
M
 
M
Q
 
R
A
 
K
A
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
F
x
V
T
 
A
S
|
S
I
 
V
S
 
Q
Y
 
G
M
 
L
M
 
F
G
 
A
N
 
E
N
 
Q
G
 
E
Y
x
N
P
 
A
A
 
A
Y
|
Y
T
 
N
T
 
A
A
 
S
N
x
K
A
 
G
G
 
G
I
 
L
N
 
V
G
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
L
E
 
D
F
 
L
G
 
A
P
 
P
D
 
L
R
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
A
V
x
I
L
 
A
T
|
T
D
 
E
K
x
A
Q
x
V
L
 
L
D
 
E
Q
 
A
W
 
I
A
 
A
T
 
R
P
 
R
E
 
D
A
 
W
L
 
E
A
 
D
A
 
L
H
 
H
L
 
A
E
 
L
R
 
R
Q
 
R
C
 
L
L
 
G
K
 
K
D
 
-
H
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
P
Q
 
E
D
 
E
I
 
V
V
 
A
G
 
E
S
 
A
T
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
E
T
 
K
S
 
A
R
 
S
M
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
T
 
I
L
 
L
V
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
M
V
 
T
V
 
A
T
 
S

Query Sequence

>GFF722 PGA1_c07370 putative short chain dehydrogenase
MSDTAIFPDLKGASVFITGGGSGIGAALSEGFLRQGAKVAFVGRSDATDFVERMEAETGN
RPLFIQCDITDIPALKAAIKQAAEAHGPITTLVNNAANDQRHATLDVDEEFWDWAQAINL
KAYFFACQAVLPGMQAAGGGSIVNFTSISYMMGNNGYPAYTTANAGINGMTRSLAREFGP
DRIRVNALAPGWVLTDKQLDQWATPEALAAHLERQCLKDHLAPQDIVGSTLFLASATSRM
VTGQTLVVDGGVVVTG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory