SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF749 FitnessBrowser__WCS417:GFF749 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7cyxA Crystal strcuture of glycine oxidase from bacillus cereus atcc 14579 (see paper)
33% identity, 93% coverage: 7:348/369 of query aligns to 4:344/363 of 7cyxA

query
sites
7cyxA
V
 
V
V
 
A
I
 
I
V
x
I
G
|
G
G
 
G
G
|
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
S
L
 
S
T
 
V
A
 
A
F
 
H
N
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
H
A
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
I
L
x
V
E
|
E
R
x
K
A
 
Q
G
 
S
L
 
I
G
 
A
Q
 
S
E
|
E
S
x
A
S
|
S
W
 
K
A
 
A
G
x
A
G
 
A
G
|
G
I
x
L
V
 
L
S
 
G
P
 
V
L
 
A
Y
 
Y
P
 
-
W
 
-
R
 
-
Y
 
-
S
 
N
P
 
P
A
 
-
V
 
L
T
 
F
A
 
E
L
 
L
A
 
A
H
 
R
W
 
E
S
 
S
Q
 
R
D
 
A
F
 
I
Y
 
F
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
R
 
V
L
 
L
F
 
R
A
 
E
Q
 
K
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
I
E
 
G
V
 
Y
H
 
E
T
 
E
T
 
K
G
 
G
L
 
I
Y
 
Y
W
 
R
L
 
I
-
 
A
D
 
Q
L
 
N
D
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
K
E
 
E
A
 
R
-
 
I
-
 
L
-
 
H
-
 
I
L
 
M
A
 
D
W
 
W
A
 
Q
A
 
Q
R
 
K
E
 
T
G
 
G
R
 
E
P
 
D
L
 
S
S
 
Y
K
 
F
V
 
L
D
 
T
V
 
G
S
 
D
A
 
H
A
 
V
H
 
R
D
 
E
A
 
K
V
 
E
P
 
P
V
 
Y
L
 
L
G
 
S
G
 
E
G
 
S
Y
 
I
A
 
I
N
 
G
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
M
 
Y
A
 
P
N
 
K
V
 
D
A
 
G
N
 
H
V
 
V
R
 
I
N
 
A
P
 
P
R
 
E
L
 
L
V
 
T
K
 
K
S
 
A
L
 
F
K
 
-
A
 
A
A
 
H
L
 
S
L
 
A
T
 
A
L
 
I
P
 
S
G
 
G
V
 
A
T
 
D
I
 
I
H
 
Y
E
 
E
Q
 
Q
C
 
T
E
 
E
V
|
V
T
 
F
G
 
D
F
 
I
L
 
R
L
 
I
D
 
E
A
 
N
G
 
N
N
 
K
V
 
V
V
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
I
T
 
T
A
 
S
D
 
E
G
 
G
A
 
I
I
 
V
F
 
T
G
 
C
D
 
E
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
A
x
G
G
|
G
A
 
S
W
|
W
S
 
S
G
 
T
E
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
S
T
 
Y
L
 
F
G
 
H
L
 
R
S
 
D
L
 
W
P
 
G
V
 
T
E
 
Y
P
 
P
V
 
V
K
 
K
G
 
G
Q
 
E
M
 
V
I
 
V
L
 
A
Y
 
V
K
 
R
C
 
S
A
 
R
S
 
K
D
 
Q
F
 
L
L
 
L
S
 
K
S
 
A
M
 
P
V
 
I
L
 
F
A
 
Q
K
 
E
G
 
R
R
 
F
Y
 
Y
A
 
I
I
 
T
P
 
P
R
 
K
R
 
R
D
 
G
G
 
G
H
 
R
I
 
Y
L
 
V
I
 
I
G
 
G
S
 
A
T
 
T
L
 
M
E
 
K
H
 
P
E
 
H
G
 
T
F
 
F
D
 
N
K
 
K
T
 
T
P
 
V
T
 
Q
E
 
P
T
 
E
A
 
S
L
 
I
E
 
T
S
 
S
L
 
I
K
 
L
A
 
E
S
 
R
A
 
A
V
 
Y
E
 
T
L
 
I
I
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
E
A
 
A
E
 
E
V
 
W
V
 
E
G
 
S
H
 
T
W
 
W
A
 
A
G
|
G
L
 
L
R
|
R
P
|
P
G
 
Q
S
 
S
P
 
N
E
 
H
G
 
E
I
 
A
P
 
P
Y
 
Y
I
 
M
G
 
G
Q
 
E
V
 
H
P
 
E
G
 
E
F
 
I
K
 
K
G
 
G
L
 
L
W
 
Y
L
 
A
N
 
C
C
 
T
G
 
G
H
 
H
Y
|
Y
R
|
R
N
|
N
G
|
G
L
x
I
V
 
L
L
 
L
A
 
S
P
 
P
A
 
I
S
 
S
C
 
G
Q
 
Q
L
 
Y
F
 
M
T
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I

3if9A Crystal structure of glycine oxidase g51s/a54r/h244a mutant in complex with inhibitor glycolate (see paper)
28% identity, 90% coverage: 21:351/369 of query aligns to 21:349/364 of 3if9A

query
sites
3if9A
F
 
Y
N
 
Y
L
 
L
A
 
A
T
 
K
Q
 
E
G
 
N
Q
 
K
A
 
N
V
 
T
V
 
A
L
 
L
L
 
F
E
|
E
R
x
S
A
 
G
G
 
T
L
 
M
G
 
G
Q
 
G
E
 
R
S
x
T
S
x
T
W
 
S
A
 
A
G
x
A
G
x
A
G
|
G
I
x
M
V
 
L
S
 
S
P
 
A
L
 
H
Y
 
R
P
 
E
W
 
C
R
 
E
Y
 
E
S
 
R
P
 
D
A
 
A
V
 
F
T
 
F
A
 
D
L
 
F
A
 
A
H
 
M
W
 
H
S
 
S
Q
 
Q
D
 
R
F
 
L
Y
 
Y
P
 
K
Q
 
G
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
R
 
E
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
Q
 
L
T
 
S
G
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
I
E
 
R
V
 
Q
H
 
H
T
 
N
T
 
G
G
 
G
L
 
M
Y
 
F
W
 
K
L
 
L
D
 
A
L
 
F
D
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
Q
-
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
M
D
 
D
E
 
D
A
 
L
E
 
D
A
 
S
L
 
V
A
 
S
W
 
W
A
 
Y
A
 
S
R
 
K
E
 
E
G
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
-
S
 
-
K
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
E
A
 
V
H
 
L
D
 
E
A
 
K
V
 
E
P
 
P
V
 
Y
L
 
A
G
 
S
G
 
G
G
 
D
Y
 
I
A
 
F
N
 
G
A
 
A
I
 
S
Y
 
F
M
 
I
A
 
Q
N
 
D
V
 
D
A
 
V
N
 
H
V
 
V
R
 
-
N
 
E
P
 
P
R
 
Y
L
 
F
V
 
V
K
 
C
S
 
K
L
 
A
K
 
Y
A
 
V
A
 
K
L
 
A
L
 
A
T
 
K
L
 
M
P
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
E
I
 
I
H
 
F
E
 
E
Q
 
H
C
 
T
E
x
P
V
|
V
T
 
L
G
 
H
F
 
V
L
 
E
L
 
R
D
 
D
A
 
-
G
 
G
N
 
E
V
 
A
V
 
L
G
 
F
V
 
I
S
 
K
T
 
T
A
 
P
D
 
S
G
 
G
A
 
D
I
 
V
F
 
W
G
 
A
D
 
N
Q
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
A
x
S
G
|
G
A
 
V
W
|
W
S
 
S
G
 
G
E
 
M
L
x
F
L
 
F
G
 
K
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
N
L
 
N
P
 
A
V
 
F
E
 
L
P
 
P
V
 
V
K
 
K
G
 
G
Q
 
E
M
 
C
I
 
L
L
 
S
Y
 
V
K
 
W
C
 
N
A
 
D
S
 
D
D
 
I
F
 
P
L
 
L
S
 
T
S
 
K
M
 
T
V
 
L
L
 
Y
A
 
H
K
 
D
G
 
A
R
 
C
Y
|
Y
A
 
I
I
 
V
P
 
P
R
 
R
R
 
K
D
 
S
G
 
G
H
 
R
I
 
L
L
 
V
I
 
V
G
 
G
S
 
A
T
 
T
L
 
M
E
 
K
H
 
P
E
 
G
G
 
D
F
 
W
D
 
S
K
 
E
T
 
T
P
 
P
T
 
D
E
 
L
T
 
G
A
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
V
K
 
M
A
 
K
S
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
T
L
 
M
I
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
I
A
 
Q
D
 
N
A
 
M
E
 
K
V
 
V
V
 
D
G
 
R
H
 
F
W
 
W
A
 
A
G
|
G
L
 
L
R
|
R
P
 
P
G
 
G
S
 
T
P
 
K
E
 
D
G
 
G
I
 
K
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
V
 
H
P
 
P
G
 
E
F
 
D
K
 
S
G
 
R
L
 
I
W
 
L
L
 
F
N
 
A
C
 
A
G
 
G
H
|
H
Y
x
F
R
|
R
N
|
N
G
|
G
L
x
I
V
 
L
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
A
S
 
T
C
 
G
Q
 
A
L
 
L
F
 
I
T
 
S
D
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
E
 
N
R
 
K

Sites not aligning to the query:

O31616 Glycine oxidase; GO; EC 1.4.3.19 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 3 papers)
27% identity, 90% coverage: 21:351/369 of query aligns to 21:349/369 of O31616

query
sites
O31616
F
 
Y
N
 
Y
L
 
L
A
 
A
T
 
K
Q
 
E
G
 
N
Q
 
K
A
 
N
V
 
T
V
 
A
L
 
L
L
 
F
E
|
E
R
x
S
A
 
G
G
 
T
L
 
M
G
 
G
Q
 
G
E
 
R
S
x
T
S
x
T
W
 
S
A
 
A
G
 
A
G
x
A
G
|
G
I
x
M
V
 
L
S
x
G
P
 
A
L
 
H
Y
x
A
P
 
E
W
 
C
R
 
E
Y
 
E
S
 
R
P
 
D
A
 
A
V
 
F
T
 
F
A
 
D
L
 
F
A
 
A
H
 
M
W
 
H
S
 
S
Q
 
Q
D
 
R
F
 
L
Y
 
Y
P
 
K
Q
 
G
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
R
 
E
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
Q
 
L
T
 
S
G
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
I
E
 
R
V
 
Q
H
 
H
T
 
N
T
 
G
G
 
G
L
 
M
Y
 
F
W
 
K
L
 
L
D
 
A
L
 
F
D
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
Q
-
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
M
D
 
D
E
 
D
A
 
L
E
 
D
A
 
S
L
 
V
A
 
S
W
 
W
A
 
Y
A
 
S
R
 
K
E
 
E
G
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
-
S
 
-
K
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
E
A
 
V
H
 
L
D
 
E
A
 
K
V
 
E
P
 
P
V
 
Y
L
 
A
G
 
S
G
 
G
G
 
D
Y
 
I
A
 
F
N
 
G
A
 
A
I
 
S
Y
 
F
M
 
I
A
 
Q
N
 
D
V
 
D
A
 
V
N
 
H
V
 
V
R
 
E
N
 
-
P
 
P
R
 
Y
L
 
F
V
 
V
K
 
C
S
 
K
L
 
A
K
 
Y
A
 
V
A
 
K
L
 
A
L
 
A
T
 
K
L
 
M
P
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
E
I
 
I
H
 
F
E
 
E
Q
 
H
C
 
T
E
 
P
V
|
V
T
 
L
G
 
H
F
 
V
L
 
E
L
 
R
D
 
D
A
 
-
G
 
G
N
 
E
V
 
A
V
 
L
G
 
F
V
 
I
S
 
K
T
 
T
A
 
P
D
 
S
G
 
G
A
 
D
I
 
V
F
 
W
G
 
A
D
 
N
Q
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
V
W
 
W
S
 
S
G
 
G
E
 
M
L
 
F
L
 
F
G
 
K
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
N
L
 
N
P
 
A
V
 
F
E
 
L
P
 
P
V
 
V
K
 
K
G
 
G
Q
 
E
M
 
C
I
 
L
L
 
S
Y
 
V
K
 
W
C
 
N
A
 
D
S
 
D
D
 
I
F
 
P
L
 
L
S
 
T
S
 
K
M
 
T
V
 
L
L
 
Y
A
 
H
K
 
D
G
x
H
R
 
C
Y
 
Y
A
 
I
I
 
V
P
 
P
R
 
R
R
 
K
D
 
S
G
 
G
H
 
R
I
 
L
L
 
V
I
 
V
G
 
G
S
 
A
T
 
T
L
 
M
E
 
K
H
 
P
E
 
G
G
 
D
F
 
W
D
 
S
K
 
E
T
 
T
P
 
P
T
 
D
E
 
L
T
 
G
A
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
V
K
 
M
A
 
K
S
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
T
L
 
M
I
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
I
A
 
Q
D
 
N
A
 
M
E
 
K
V
 
V
V
 
D
G
 
R
H
 
F
W
 
W
A
 
A
G
 
G
L
 
L
R
|
R
P
 
P
G
 
G
S
 
T
P
 
K
E
 
D
G
 
G
I
 
K
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
V
 
H
P
 
P
G
 
E
F
 
D
K
 
S
G
 
R
L
 
I
W
 
L
L
 
F
N
 
A
C
 
A
G
 
G
H
|
H
Y
x
F
R
|
R
N
|
N
G
|
G
L
x
I
V
x
L
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
A
S
 
T
C
 
G
Q
 
A
L
 
L
F
 
I
T
 
S
D
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
E
 
N
R
 
K

Sites not aligning to the query:

1ng3A Complex of thio (glycine oxidase) with acetyl-glycine (see paper)
27% identity, 90% coverage: 21:351/369 of query aligns to 21:349/364 of 1ng3A

query
sites
1ng3A
F
 
Y
N
 
Y
L
 
L
A
 
A
T
 
K
Q
 
E
G
 
N
Q
 
K
A
 
N
V
 
T
V
 
A
L
 
L
L
x
F
E
|
E
R
x
S
A
 
G
G
 
T
L
 
M
G
 
G
Q
 
G
E
x
R
S
x
T
S
x
T
W
 
S
A
 
A
G
x
A
G
x
A
G
|
G
I
x
M
V
 
L
S
 
G
P
 
A
L
 
H
Y
 
A
P
 
E
W
 
C
R
 
E
Y
 
E
S
 
R
P
 
D
A
 
A
V
 
F
T
 
F
A
 
D
L
 
F
A
 
A
H
 
M
W
 
H
S
 
S
Q
 
Q
D
 
R
F
 
L
Y
 
Y
P
 
K
Q
 
G
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
R
 
E
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
Q
 
L
T
 
S
G
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
I
E
x
R
V
 
Q
H
 
H
T
 
N
T
 
G
G
 
G
L
 
M
Y
 
F
W
 
K
L
 
L
D
 
A
L
 
F
D
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
Q
-
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
M
D
 
D
E
 
D
A
 
L
E
 
D
A
 
S
L
 
V
A
 
S
W
 
W
A
 
Y
A
 
S
R
 
K
E
 
E
G
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
-
S
 
-
K
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
E
A
 
V
H
 
L
D
 
E
A
 
K
V
 
E
P
 
P
V
 
Y
L
 
A
G
 
S
G
 
G
G
 
D
Y
 
I
A
 
F
N
 
G
A
 
A
I
 
S
Y
 
F
M
 
I
A
 
Q
N
 
D
V
 
D
A
 
V
N
 
H
V
 
V
R
 
E
N
 
-
P
 
P
R
 
Y
L
 
F
V
 
V
K
 
C
S
 
K
L
 
A
K
 
Y
A
 
V
A
 
K
L
 
A
L
 
A
T
 
K
L
 
M
P
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
E
I
 
I
H
 
F
E
 
E
Q
 
H
C
 
T
E
 
P
V
|
V
T
 
L
G
 
H
F
 
V
L
 
E
L
 
R
D
 
D
A
 
-
G
 
G
N
 
E
V
 
A
V
 
L
G
 
F
V
 
I
S
 
K
T
 
T
A
 
P
D
 
S
G
 
G
A
 
D
I
 
V
F
 
W
G
 
A
D
 
N
Q
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
A
x
S
G
|
G
A
 
V
W
|
W
S
 
S
G
 
G
E
 
M
L
x
F
L
 
F
G
 
K
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
N
L
 
N
P
 
A
V
 
F
E
 
L
P
 
P
V
 
V
K
 
K
G
 
G
Q
 
E
M
 
C
I
 
L
L
 
S
Y
 
V
K
 
W
C
 
N
A
 
D
S
 
D
D
 
I
F
 
P
L
 
L
S
 
T
S
 
K
M
 
T
V
 
L
L
 
Y
A
 
H
K
 
D
G
 
H
R
 
C
Y
|
Y
A
 
I
I
 
V
P
 
P
R
 
R
R
 
K
D
 
S
G
 
G
H
x
R
I
 
L
L
 
V
I
 
V
G
 
G
S
 
A
T
 
T
L
 
M
E
 
K
H
 
P
E
 
G
G
 
D
F
 
W
D
 
S
K
 
E
T
 
T
P
 
P
T
 
D
E
 
L
T
 
G
A
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
V
K
 
M
A
 
K
S
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
T
L
 
M
I
 
L
P
 
P
A
 
P
L
 
I
A
 
Q
D
 
N
A
 
M
E
 
K
V
 
V
V
 
D
G
 
R
H
 
F
W
 
W
A
 
A
G
|
G
L
 
L
R
|
R
P
 
P
G
 
G
S
 
T
P
 
K
E
 
D
G
 
G
I
 
K
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
V
 
H
P
 
P
G
 
E
F
 
D
K
 
S
G
 
R
L
 
I
W
 
L
L
 
F
N
 
A
C
 
A
G
 
G
H
|
H
Y
 
F
R
|
R
N
|
N
G
|
G
L
x
I
V
 
L
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
A
S
 
T
C
 
G
Q
 
A
L
 
L
F
 
I
T
 
S
D
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
E
 
N
R
 
K

Sites not aligning to the query:

4yshB Crystal structure of glycine oxidase from geobacillus kaustophilus
30% identity, 92% coverage: 21:361/369 of query aligns to 20:364/368 of 4yshB

query
sites
4yshB
F
 
F
N
 
E
L
 
L
A
 
A
T
 
K
Q
 
R
G
 
R
Q
 
H
A
 
R
V
 
V
V
 
A
L
 
I
L
x
F
E
|
E
R
x
K
A
 
G
G
 
T
L
 
M
G
 
G
Q
 
S
E
x
G
S
x
A
S
|
S
W
 
S
A
 
A
G
x
A
G
x
A
G
 
G
I
x
M
V
x
L
S
 
G
P
 
A
L
x
Q
Y
 
S
P
 
E
W
 
F
R
 
S
Y
 
T
S
 
S
P
 
S
A
 
P
V
 
L
T
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
A
H
 
L
W
 
Q
S
 
S
Q
 
R
D
 
A
F
 
L
Y
 
M
P
 
P
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
E
L
 
L
F
 
R
A
 
E
Q
 
R
T
 
T
G
 
G
V
 
I
D
 
D
P
 
I
E
 
G
V
 
L
H
 
V
T
 
E
T
 
K
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
W
 
K
L
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
T
-
 
E
-
 
E
D
 
E
L
 
A
D
 
D
D
 
D
E
 
L
A
 
Y
E
 
R
A
 
H
L
 
Y
A
 
T
W
 
F
A
 
W
A
 
R
R
 
G
E
 
I
G
 
G
R
 
E
P
 
P
L
 
V
S
 
Q
K
 
W
V
 
L
D
 
T
V
 
K
S
 
G
A
 
E
A
 
A
H
 
L
D
 
E
A
 
M
V
 
E
P
 
P
V
 
R
L
 
L
G
 
A
G
 
E
G
 
A
Y
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
I
 
M
Y
 
Y
M
 
I
A
 
P
N
 
G
V
 
D
A
 
G
N
 
Q
V
 
V
R
 
-
N
 
S
P
 
A
R
 
P
L
 
D
V
 
L
K
 
A
S
 
A
L
 
A
K
 
L
A
 
A
A
 
Y
L
 
A
L
 
A
T
 
A
L
 
S
P
 
A
G
 
G
V
 
A
T
 
C
I
 
L
H
 
Y
E
 
E
Q
 
Y
C
 
T
E
 
E
V
|
V
T
 
F
G
 
D
F
 
I
L
 
R
L
 
S
D
 
D
A
 
S
G
 
S
N
 
G
V
 
H
V
 
V
G
 
-
V
 
L
S
 
D
T
 
T
A
 
T
D
 
G
G
 
G
A
 
T
I
 
F
F
 
A
G
 
A
D
 
E
Q
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
A
x
S
G
 
G
A
 
A
W
|
W
S
 
A
G
 
A
E
 
R
L
 
L
L
 
G
G
 
A
T
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
L
P
 
S
V
 
V
E
 
Y
P
 
P
V
 
V
K
 
K
G
 
G
Q
 
E
M
 
C
I
 
V
L
 
M
Y
 
V
K
 
R
C
 
A
A
 
P
S
 
V
D
 
P
F
 
L
L
 
L
S
 
Q
S
 
T
M
 
T
V
 
V
L
 
F
A
 
A
K
 
K
-
 
N
G
|
G
R
 
C
Y
|
Y
A
 
I
I
 
V
P
 
P
R
 
K
R
 
S
D
 
G
G
 
N
H
 
R
I
 
L
L
 
L
I
|
I
G
 
G
S
x
A
T
 
T
L
 
S
E
 
T
H
 
P
E
 
G
G
 
T
F
 
F
D
 
D
K
 
R
T
 
R
P
 
V
T
 
S
E
 
A
T
 
G
A
 
G
L
 
V
E
 
M
S
 
N
L
|
L
K
 
L
A
 
H
S
 
R
A
 
A
V
 
A
E
 
H
L
 
L
I
 
V
P
 
P
A
 
D
L
 
I
A
 
E
D
 
Q
A
 
A
E
 
E
V
 
W
V
 
V
G
 
A
H
 
S
W
 
W
A
 
S
G
|
G
L
 
I
R
|
R
P
 
P
G
 
Q
S
 
T
P
 
E
E
 
D
G
 
G
I
 
L
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
Q
 
E
V
 
H
P
 
P
G
 
E
F
 
R
K
 
R
G
 
G
L
 
L
W
 
F
L
 
V
N
 
A
C
 
A
G
 
G
H
|
H
Y
 
Y
R
|
R
N
|
N
G
|
G
L
x
I
V
x
L
L
 
L
A
 
S
P
 
P
A
 
L
S
 
T
C
 
G
Q
 
L
L
 
L
F
 
V
T
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
L
 
E
E
 
R
R
 
K
A
 
E
P
 
T
I
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
L
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
A
 
S

Sites not aligning to the query:

4yshA Crystal structure of glycine oxidase from geobacillus kaustophilus
30% identity, 92% coverage: 21:361/369 of query aligns to 20:364/370 of 4yshA

query
sites
4yshA
F
 
F
N
 
E
L
 
L
A
 
A
T
 
K
Q
 
R
G
 
R
Q
 
H
A
 
R
V
 
V
V
 
A
L
 
I
L
x
F
E
|
E
R
x
K
A
 
G
G
 
T
L
 
M
G
 
G
Q
 
S
E
x
G
S
x
A
S
|
S
W
 
S
A
 
A
G
x
A
G
x
A
G
|
G
I
x
M
V
x
L
S
 
G
P
 
A
L
x
Q
Y
 
S
P
 
E
W
 
F
R
 
S
Y
 
T
S
 
S
P
 
S
A
 
P
V
 
L
T
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
A
H
 
L
W
 
Q
S
 
S
Q
 
R
D
 
A
F
 
L
Y
 
M
P
 
P
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
E
L
 
L
F
 
R
A
 
E
Q
 
R
T
 
T
G
 
G
V
 
I
D
 
D
P
 
I
E
 
G
V
 
L
H
 
V
T
 
E
T
 
K
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
W
 
K
L
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
T
-
 
E
-
 
E
D
 
E
L
 
A
D
 
D
D
 
D
E
 
L
A
 
Y
E
 
R
A
 
H
L
 
Y
A
 
T
W
 
F
A
 
W
A
 
R
R
 
G
E
 
I
G
 
G
R
 
E
P
 
P
L
 
V
S
 
Q
K
 
W
V
 
L
D
 
T
V
 
K
S
 
G
A
 
E
A
 
A
H
 
L
D
 
E
A
 
M
V
 
E
P
 
P
V
 
R
L
 
L
G
 
A
G
 
E
G
 
A
Y
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
I
 
M
Y
 
Y
M
 
I
A
 
P
N
 
G
V
 
D
A
 
G
N
 
Q
V
 
V
R
 
-
N
 
S
P
 
A
R
 
P
L
 
D
V
 
L
K
 
A
S
 
A
L
 
A
K
 
L
A
 
A
A
 
Y
L
 
A
L
 
A
T
 
A
L
 
S
P
 
A
G
 
G
V
 
A
T
 
C
I
 
L
H
 
Y
E
 
E
Q
 
Y
C
 
T
E
 
E
V
|
V
T
 
F
G
 
D
F
 
I
L
 
R
L
 
S
D
 
D
A
 
S
G
 
S
N
 
G
V
 
H
V
 
V
G
 
-
V
 
L
S
 
D
T
 
T
A
 
T
D
 
G
G
 
G
A
 
T
I
 
F
F
 
A
G
 
A
D
 
E
Q
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
A
x
S
G
|
G
A
 
A
W
|
W
S
 
A
G
 
A
E
 
R
L
 
L
L
 
G
G
 
A
T
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
L
P
 
S
V
 
V
E
 
Y
P
 
P
V
 
V
K
 
K
G
 
G
Q
 
E
M
 
C
I
 
V
L
 
M
Y
 
V
K
 
R
C
 
A
A
 
P
S
 
V
D
 
P
F
 
L
L
 
L
S
 
Q
S
 
T
M
 
T
V
 
V
L
 
F
A
 
A
K
 
K
-
 
N
G
 
G
R
 
C
Y
 
Y
A
 
I
I
 
V
P
 
P
R
 
K
R
 
S
D
 
G
G
 
N
H
 
R
I
 
L
L
 
L
I
|
I
G
 
G
S
 
A
T
 
T
L
 
S
E
 
T
H
 
P
E
 
G
G
 
T
F
 
F
D
 
D
K
 
R
T
 
R
P
 
V
T
 
S
E
 
A
T
 
G
A
 
G
L
 
V
E
 
M
S
 
N
L
|
L
K
 
L
A
 
H
S
 
R
A
 
A
V
 
A
E
 
H
L
 
L
I
 
V
P
 
P
A
 
D
L
 
I
A
 
E
D
 
Q
A
 
A
E
 
E
V
 
W
V
 
V
G
 
A
H
 
S
W
 
W
A
 
S
G
|
G
L
 
I
R
|
R
P
 
P
G
 
Q
S
 
T
P
 
E
E
 
D
G
 
G
I
 
L
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
Q
 
E
V
 
H
P
 
P
G
 
E
F
 
R
K
 
R
G
 
G
L
 
L
W
 
F
L
 
V
N
 
A
C
 
A
G
 
G
H
|
H
Y
 
Y
R
|
R
N
|
N
G
|
G
L
x
I
V
x
L
L
 
L
A
 
S
P
 
P
A
 
L
S
 
T
C
 
G
Q
 
L
L
 
L
F
 
V
T
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
L
 
E
E
 
R
R
 
K
A
 
E
P
 
T
I
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
L
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
A
 
S

Sites not aligning to the query:

Q5L2C2 Glycine oxidase; GO; GOX; GOXK; EC 1.4.3.19 from Geobacillus kaustophilus (strain HTA426)
30% identity, 92% coverage: 21:361/369 of query aligns to 21:366/377 of Q5L2C2

query
sites
Q5L2C2
F
 
F
N
 
E
L
 
L
A
 
A
T
 
K
Q
 
R
G
 
R
Q
 
H
A
 
R
V
 
V
V
 
A
L
 
I
L
 
F
E
|
E
R
x
K
A
 
G
G
 
T
L
 
M
G
 
G
Q
 
S
E
 
G
S
x
A
S
|
S
W
 
S
A
 
A
G
 
A
G
x
A
G
|
G
I
x
M
V
 
L
S
 
G
P
 
A
L
 
Q
Y
 
S
P
 
E
W
 
F
R
 
S
Y
 
T
S
 
S
P
 
S
A
 
P
V
 
L
T
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
A
H
 
L
W
 
Q
S
 
S
Q
 
R
D
 
A
F
 
L
Y
 
M
P
 
P
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
E
L
 
L
F
 
R
A
 
E
Q
 
R
T
 
T
G
 
G
V
 
I
D
 
D
P
 
I
E
 
G
V
 
L
H
 
V
T
 
E
T
 
K
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
W
 
K
L
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
T
-
 
E
-
 
E
D
 
E
L
 
A
D
 
D
D
 
D
E
 
L
A
 
Y
E
 
R
A
 
H
L
 
Y
A
 
T
W
 
F
A
 
W
A
 
R
R
 
G
E
 
I
G
 
G
R
 
E
P
 
P
L
 
V
S
 
Q
K
 
W
V
 
L
D
 
T
V
 
K
S
 
G
A
 
E
A
 
A
H
 
L
D
 
E
A
 
M
V
 
E
P
 
P
V
 
R
L
 
L
G
 
A
G
 
A
-
 
E
G
 
A
Y
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
I
 
M
Y
 
Y
M
 
I
A
 
P
N
 
G
V
 
D
A
 
G
N
 
Q
V
 
V
R
 
-
N
 
S
P
 
A
R
 
P
L
 
D
V
 
L
K
 
A
S
 
A
L
 
A
K
 
L
A
 
A
A
 
Y
L
 
A
L
 
A
T
 
A
L
 
S
P
 
A
G
 
G
V
 
A
T
 
C
I
 
L
H
 
Y
E
 
E
Q
 
Y
C
 
T
E
 
E
V
|
V
T
 
F
G
 
D
F
 
I
L
 
R
L
 
S
D
 
D
A
 
S
G
 
S
N
 
G
V
 
H
V
 
V
G
 
-
V
 
L
S
 
D
T
 
T
A
 
T
D
 
G
G
 
G
A
 
T
I
 
F
F
 
A
G
 
A
D
 
E
Q
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
A
G
 
A
E
 
R
L
 
L
L
 
G
G
 
A
T
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
L
P
 
S
V
 
V
E
 
Y
P
 
P
V
 
V
K
 
K
G
 
G
Q
 
E
M
 
C
I
 
V
L
 
M
Y
 
V
K
 
R
C
 
A
A
 
P
S
 
V
D
 
P
F
 
L
L
 
L
S
 
Q
S
 
T
M
 
T
V
 
V
L
 
F
A
 
A
K
 
K
-
 
N
G
 
G
R
 
C
Y
 
Y
A
 
I
I
 
V
P
 
P
R
 
K
R
 
S
D
 
G
G
 
N
H
 
R
I
 
L
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
A
T
 
T
L
 
S
E
 
T
H
 
P
E
 
G
G
 
T
F
 
F
D
 
D
K
 
R
T
 
R
P
 
V
T
 
S
E
 
A
T
 
G
A
 
G
L
 
V
E
 
M
S
 
N
L
 
L
K
 
L
A
 
H
S
 
R
A
 
A
V
 
A
E
 
H
L
 
L
I
 
V
P
 
P
A
 
D
L
 
I
A
 
E
D
 
Q
A
 
A
E
 
E
V
 
W
V
 
V
G
 
A
H
 
S
W
 
W
A
 
S
G
 
G
L
 
I
R
|
R
P
 
P
G
 
Q
S
 
T
P
 
E
E
 
D
G
 
G
I
 
L
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
Q
 
E
V
 
H
P
 
P
G
 
E
F
 
R
K
 
R
G
 
G
L
 
L
W
 
F
L
 
V
N
 
A
C
 
A
G
 
G
H
|
H
Y
|
Y
R
|
R
N
|
N
G
|
G
L
x
I
V
x
L
L
 
L
A
 
S
P
 
P
A
 
L
S
 
T
C
 
G
Q
 
L
L
 
L
F
 
V
T
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
L
 
E
E
 
R
R
 
K
A
 
E
P
 
T
I
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
L
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
A
 
S

Sites not aligning to the query:

S5FMM4 Glycine oxidase; GO; BliGO; EC 1.4.3.19 from Bacillus licheniformis (see paper)
25% identity, 89% coverage: 20:349/369 of query aligns to 20:347/369 of S5FMM4

query
sites
S5FMM4
A
 
A
F
 
Y
N
 
H
L
 
L
A
 
A
T
 
K
Q
 
A
G
 
G
Q
 
K
A
 
K
V
 
T
V
 
A
L
 
V
L
 
F
E
 
E
R
 
S
A
 
G
G
 
E
L
 
V
G
 
G
Q
 
K
E
 
K
S
 
A
S
 
T
W
 
S
A
 
A
G
 
A
G
 
A
G
 
G
I
 
M
V
 
L
S
x
G
P
 
A
L
 
H
Y
x
A
P
 
E
W
 
C
R
 
D
Y
 
K
S
 
P
P
 
G
A
 
T
V
 
F
T
 
F
A
 
E
L
 
F
A
 
A
H
 
R
W
 
A
S
 
S
Q
 
Q
D
 
K
F
 
A
Y
 
Y
P
 
K
Q
 
R
L
 
L
A
 
T
Q
 
G
R
 
E
L
 
L
F
x
K
A
 
D
Q
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
I
D
 
D
P
 
I
E
 
R
V
 
R
H
 
H
T
 
D
T
 
G
G
 
G
L
 
I
Y
 
L
W
 
K
L
 
L
D
 
A
L
 
F
D
 
S
D
 
E
E
 
S
A
 
D
E
 
R
A
 
E
L
 
H
A
 
L
W
 
M
A
 
Q
A
 
M
R
 
G
E
 
A
G
 
L
R
 
D
P
 
S
L
 
V
S
 
E
K
 
W
V
 
L
D
 
E
V
 
A
S
 
D
A
 
E
A
 
V
H
 
Y
D
 
K
A
 
L
V
 
E
P
 
P
V
 
N
L
 
A
G
 
G
G
 
K
G
 
G
Y
 
I
A
 
L
N
 
G
A
 
A
I
 
N
Y
 
F
M
 
I
A
 
R
N
 
D
V
 
D
A
 
V
N
 
H
V
 
V
R
 
E
N
 
P
P
 
A
R
 
A
L
 
V
V
 
C
K
 
R
S
 
A
L
 
F
K
 
A
A
 
R
A
 
G
L
 
A
L
 
R
T
 
M
L
 
L
P
 
-
G
 
G
V
 
A
T
 
D
I
 
V
H
 
F
E
 
E
Q
 
Y
C
 
T
E
 
P
V
 
V
T
 
L
G
 
S
F
 
I
L
 
E
L
 
S
D
 
E
A
 
A
G
 
G
N
 
-
V
 
A
V
 
V
G
 
R
V
 
V
S
 
T
T
 
S
A
 
A
D
 
S
G
 
G
A
 
T
I
 
A
F
 
E
G
 
A
D
 
E
Q
 
H
V
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
A
A
x
S
G
 
G
A
 
V
W
 
W
S
 
S
G
 
G
E
 
A
L
 
L
L
 
F
G
 
K
T
 
Q
L
 
I
G
 
G
L
 
L
S
 
D
L
 
K
P
 
R
V
 
F
E
 
Y
P
 
P
V
 
V
K
 
K
G
 
G
Q
 
E
M
 
C
I
 
L
L
 
S
Y
 
V
K
 
W
C
 
N
A
 
D
S
 
G
D
 
I
F
 
S
L
 
L
S
 
T
S
 
R
M
 
T
V
 
L
L
 
Y
A
 
H
K
 
D
G
 
H
R
 
C
Y
 
Y
A
 
I
I
 
V
P
 
P
R
 
R
R
 
H
D
 
S
G
 
G
H
 
R
I
 
L
L
 
V
I
 
V
G
 
G
S
 
A
T
 
T
L
 
M
E
 
K
H
 
P
E
 
G
G
 
D
F
 
W
D
 
N
K
 
E
T
 
Q
P
 
P
T
 
E
E
 
L
T
 
G
A
 
G
L
 
I
E
 
E
S
 
E
L
 
L
K
 
I
A
 
R
S
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
S
L
 
M
I
 
L
P
 
P
A
 
G
L
 
I
A
 
E
D
 
S
A
 
M
E
 
K
V
 
I
V
 
D
G
 
Q
H
 
C
W
 
W
A
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
R
P
 
P
G
 
E
S
 
T
P
 
G
E
 
D
G
 
G
I
 
N
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
V
 
H
P
 
P
G
 
E
F
 
N
K
 
D
G
 
R
L
 
I
W
 
L
L
 
F
N
 
A
C
 
A
G
 
G
H
 
H
Y
 
F
R
 
R
N
 
N
G
 
G
L
x
I
V
 
L
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
A
S
 
T
C
 
G
Q
 
E
L
 
M
F
x
M
T
 
A
D
 
D
L
 
M
L
 
I
L
 
L

6j39A Crystal structure of cmis2 with inhibitor (see paper)
30% identity, 76% coverage: 69:349/369 of query aligns to 65:352/368 of 6j39A

query
sites
6j39A
S
 
S
Q
 
R
D
 
E
F
 
R
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
S
L
 
F
A
 
V
Q
 
K
R
 
E
L
 
L
F
 
E
A
 
A
Q
 
V
T
 
S
G
 
G
V
 
T
D
 
S
P
 
A
E
 
G
V
 
Y
H
 
R
T
 
R
T
 
D
G
 
G
L
 
V
Y
 
L
W
 
D
L
 
A
D
 
A
L
 
F
D
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
S
E
 
L
A
 
A
L
 
A
A
 
L
W
 
D
A
 
G
A
 
L
R
 
R
E
 
N
-
 
F
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
L
G
 
G
R
 
V
P
 
A
L
 
V
S
 
A
K
 
P
V
 
L
D
 
N
V
 
A
S
 
R
A
 
R
A
 
C
H
 
R
D
 
E
A
 
H
V
 
E
P
 
P
V
 
M
L
 
L
G
 
A
G
 
E
G
 
S
Y
 
V
A
 
R
N
 
G
A
 
G
I
 
L
Y
 
L
M
 
G
A
 
P
N
 
D
V
 
D
A
 
G
N
 
A
V
 
V
R
 
-
N
 
N
P
 
P
R
 
R
-
 
E
L
 
L
V
 
T
K
 
A
S
 
A
L
 
L
K
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
D
T
 
V
L
 
R
P
 
G
G
 
G
V
 
T
T
 
L
I
 
I
H
 
R
E
 
R
Q
 
R
C
x
A
E
 
-
V
 
-
T
 
T
G
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
A
D
 
D
A
 
E
G
 
-
N
 
R
V
 
T
V
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
L
T
 
L
A
 
E
D
 
N
G
 
G
-
 
C
A
 
A
I
 
V
F
 
H
G
 
G
D
 
D
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
S
A
|
A
G
 
G
A
 
C
W
|
W
S
 
T
G
 
H
E
 
R
L
 
L
L
 
A
G
 
G
T
 
L
L
 
P
G
 
A
L
 
G
S
 
A
L
 
V
P
 
P
-
 
E
V
 
I
E
 
A
P
 
P
V
 
A
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
M
x
I
I
 
L
L
 
R
Y
 
L
K
 
R
C
 
S
A
 
A
S
 
A
D
 
P
F
 
F
L
 
L
S
 
R
S
 
R
M
 
A
V
 
T
L
x
R
A
 
A
-
 
V
-
 
T
-
 
R
-
 
G
K
 
S
G
 
G
R
 
V
Y
|
Y
A
 
L
I
 
V
P
 
P
R
 
R
R
 
T
D
 
D
G
 
G
H
 
E
I
 
L
L
 
V
I
 
V
G
 
G
S
 
A
T
 
T
L
x
Y
E
 
E
H
 
E
E
 
R
G
 
D
F
 
Y
D
 
D
K
 
T
T
 
T
P
 
V
T
 
T
E
 
A
T
 
G
A
 
G
L
 
V
E
 
A
S
 
E
L
 
L
K
 
L
A
 
G
S
 
K
A
 
V
V
 
L
E
 
A
L
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
G
L
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
L
E
 
E
V
 
L
V
 
A
G
 
E
H
 
T
W
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
R
|
R
P
 
P
G
 
G
S
 
S
P
 
P
E
 
D
G
 
G
I
 
L
P
 
P
Y
 
V
I
 
L
G
 
G
Q
 
W
V
 
T
P
 
-
G
 
A
F
 
V
K
 
P
G
 
N
L
 
L
W
 
L
L
 
V
N
 
A
C
 
T
G
 
G
H
 
H
Y
x
S
R
|
R
N
x
I
G
|
G
L
x
V
V
x
Q
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
I
S
 
T
C
 
A
Q
 
D
L
 
V
F
 
M
T
 
G
D
 
E
L
 
M
L
 
L
L
 
V

Sites not aligning to the query:

6j38A Crystal structure of cmis2 (see paper)
30% identity, 76% coverage: 69:349/369 of query aligns to 65:352/368 of 6j38A

query
sites
6j38A
S
 
S
Q
 
R
D
 
E
F
 
R
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
S
L
 
F
A
 
V
Q
 
K
R
 
E
L
 
L
F
 
E
A
 
A
Q
 
V
T
 
S
G
 
G
V
 
T
D
 
S
P
 
A
E
 
G
V
 
Y
H
 
R
T
 
R
T
 
D
G
 
G
L
 
V
Y
 
L
W
 
D
L
 
A
D
 
A
L
 
F
D
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
S
E
 
L
A
 
A
L
 
A
A
 
L
W
 
D
A
 
G
A
 
L
R
 
R
E
 
N
-
 
F
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
L
G
 
G
R
 
V
P
 
A
L
 
V
S
 
A
K
 
P
V
 
L
D
 
N
V
 
A
S
 
R
A
 
R
A
 
C
H
 
R
D
 
E
A
 
H
V
 
E
P
 
P
V
 
M
L
 
L
G
 
A
G
 
E
G
 
S
Y
 
V
A
 
R
N
 
G
A
 
G
I
 
L
Y
 
L
M
 
G
A
 
P
N
 
D
V
 
D
A
 
G
N
 
A
V
 
V
R
 
-
N
 
N
P
 
P
R
 
R
-
 
E
L
 
L
V
 
T
K
 
A
S
 
A
L
 
L
K
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
D
T
 
V
L
 
R
P
 
G
G
 
G
V
 
T
T
 
L
I
 
I
H
 
R
E
 
R
Q
 
R
C
x
A
E
 
-
V
 
-
T
 
T
G
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
A
D
 
D
A
 
E
G
 
-
N
 
R
V
 
T
V
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
L
T
 
L
A
 
E
D
 
N
G
 
G
-
 
C
A
 
A
I
 
V
F
 
H
G
 
G
D
 
D
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
S
A
|
A
G
 
G
A
 
C
W
|
W
S
 
T
G
 
H
E
 
R
L
 
L
L
 
A
G
 
G
T
 
L
L
 
P
G
 
A
L
 
G
S
 
A
L
 
V
P
 
P
-
 
E
V
 
I
E
 
A
P
 
P
V
 
A
K
 
K
G
|
G
Q
 
Q
M
 
I
I
 
L
L
 
R
Y
 
L
K
 
R
C
 
S
A
 
A
S
 
A
D
 
P
F
 
F
L
 
L
S
 
R
S
 
R
M
 
A
V
 
T
L
 
R
A
 
A
-
 
V
-
 
T
-
 
R
-
 
G
K
 
S
G
 
G
R
 
V
Y
 
Y
A
 
L
I
 
V
P
 
P
R
 
R
R
 
T
D
 
D
G
 
G
H
 
E
I
 
L
L
 
V
I
 
V
G
 
G
S
 
A
T
 
T
L
 
Y
E
 
E
H
 
E
E
 
R
G
 
D
F
 
Y
D
 
D
K
 
T
T
 
T
P
 
V
T
 
T
E
 
A
T
 
G
A
 
G
L
 
V
E
 
A
S
 
E
L
 
L
K
 
L
A
 
G
S
 
K
A
 
V
V
 
L
E
 
A
L
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
G
L
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
L
E
 
E
V
 
L
V
 
A
G
 
E
H
 
T
W
 
A
A
 
A
G
|
G
L
 
L
R
|
R
P
 
P
G
 
G
S
 
S
P
 
P
E
 
D
G
 
G
I
 
L
P
 
P
Y
 
V
I
 
L
G
 
G
Q
 
W
V
 
T
P
 
-
G
 
A
F
 
V
K
 
P
G
 
N
L
 
L
W
 
L
L
 
V
N
 
A
C
 
T
G
 
G
H
 
H
Y
x
S
R
|
R
N
x
I
G
|
G
L
x
V
V
x
Q
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
I
S
 
T
C
 
A
Q
 
D
L
 
V
F
 
M
T
 
G
D
 
E
L
 
M
L
 
L
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5i39A High resolution structure of l-amino acid deaminase from proteus vulgaris with the deletion of the specific insertion sequence (see paper)
25% identity, 98% coverage: 1:361/369 of query aligns to 21:379/383 of 5i39A

query
sites
5i39A
M
 
L
A
 
P
E
 
K
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
|
V
G
|
G
G
 
A
G
|
G
V
x
I
I
x
L
G
 
G
L
 
I
L
 
M
T
 
T
A
 
A
F
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
V
T
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
L
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
I
L
x
V
E
|
E
R
x
K
A
 
G
G
 
N
L
 
I
-
 
A
G
 
G
Q
 
E
E
x
Q
S
|
S
S
 
S
W
 
R
A
x
F
G
x
Y
G
 
G
G
x
Q
I
x
A
V
 
I
S
 
S
P
 
-
L
 
-
Y
 
-
P
 
-
W
 
Y
R
 
K
Y
 
M
S
 
P
P
 
D
A
 
E
V
 
T
T
 
F
A
 
L
L
 
L
A
 
H
H
 
H
W
 
L
S
 
G
Q
 
K
D
 
H
F
 
R
Y
 
W
P
 
-
Q
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
R
R
 
E
L
 
M
F
 
N
A
 
A
Q
 
K
T
 
V
G
 
G
V
 
I
D
 
D
P
 
T
E
 
T
V
 
Y
H
 
R
T
 
T
T
 
Q
G
 
G
L
 
R
Y
 
V
W
 
E
L
 
V
D
 
P
L
 
L
D
 
D
D
 
E
E
 
E
-
 
D
-
 
L
A
 
V
E
 
N
A
 
V
L
 
R
A
 
K
W
 
W
A
 
I
A
 
D
R
 
E
E
 
R
G
 
S
R
 
K
-
 
N
-
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
I
P
 
P
L
 
F
S
 
K
K
 
T
V
 
R
D
 
I
V
 
I
S
 
E
A
 
G
A
 
A
H
 
E
D
 
L
A
 
N
V
 
Q
P
 
R
V
 
L
L
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
T
Y
 
T
A
 
D
N
 
W
A
 
K
I
 
I
Y
 
A
-
 
G
M
 
F
A
 
E
N
 
E
V
 
D
A
 
S
N
 
G
V
 
S
R
 
F
N
 
D
P
 
P
R
 
E
L
 
V
V
 
A
K
 
T
S
 
F
L
 
V
K
 
M
A
 
A
A
 
E
L
 
Y
L
 
A
T
 
K
L
 
K
P
 
M
G
 
G
V
 
V
T
 
R
I
 
I
H
 
Y
E
 
T
Q
 
Q
C
 
C
E
x
A
V
x
A
T
 
R
G
 
G
F
 
L
L
 
E
L
 
T
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
V
V
 
I
V
 
S
G
 
D
V
 
V
S
 
V
T
 
T
A
 
E
D
 
K
G
 
G
A
 
A
I
 
I
F
 
K
G
 
T
D
 
S
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
A
x
G
G
|
G
A
 
V
W
|
W
S
 
S
G
 
R
E
 
L
L
 
F
L
 
M
G
 
Q
T
 
N
L
 
L
G
 
N
L
 
V
S
 
D
L
 
V
P
 
P
V
 
T
E
 
L
P
 
P
V
 
A
-
 
Y
K
x
Q
G
 
S
Q
|
Q
M
 
Q
I
 
L
L
 
I
Y
 
S
K
 
G
C
 
S
A
 
P
S
 
T
D
 
A
F
 
P
L
 
G
S
 
G
S
 
N
M
 
V
V
 
A
L
 
L
A
x
P
K
 
G
G
 
G
R
 
I
Y
 
F
A
 
F
I
 
R
P
 
E
R
 
Q
R
 
A
D
 
D
G
 
G
H
 
T
I
 
Y
L
 
A
I
 
T
G
 
S
S
 
P
T
 
R
L
 
V
E
 
I
H
 
V
E
 
A
G
 
L
F
 
P
D
 
D
K
 
L
T
 
P
P
 
E
T
 
L
E
 
N
T
 
A
A
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
A
S
 
E
A
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
-
I
 
F
P
 
P
A
 
A
L
 
F
A
 
K
D
 
E
A
 
S
E
 
K
V
 
L
V
 
I
G
 
D
H
 
Q
W
 
W
A
 
S
G
|
G
L
 
A
R
x
M
P
 
A
G
 
I
S
 
A
P
 
P
E
 
D
G
 
E
I
 
N
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
G
 
S
Q
 
E
V
 
V
P
 
K
G
 
E
F
 
Y
K
 
P
G
 
G
L
 
L
W
 
V
L
 
I
N
 
N
C
 
T
G
 
A
H
x
T
Y
x
G
R
x
W
N
 
-
G
|
G
L
x
M
V
x
T
L
 
E
A
 
S
P
 
P
A
 
V
S
 
S
C
 
A
Q
 
E
L
 
L
F
 
T
T
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
G
R
 
K
A
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
K
P
 
P
Y
 
F
A
 
S

5hxwA L-amino acid deaminase from proteus vulgaris (see paper)
24% identity, 98% coverage: 1:361/369 of query aligns to 13:429/433 of 5hxwA

query
sites
5hxwA
M
 
L
A
 
P
E
 
K
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
|
V
G
|
G
G
 
A
G
|
G
V
x
I
I
x
L
G
 
G
L
 
I
L
 
M
T
 
T
A
 
A
F
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
V
T
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
L
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
V
E
|
E
R
x
K
A
 
G
G
 
N
L
 
I
-
 
A
G
 
G
Q
x
E
E
x
Q
S
|
S
S
 
S
W
x
R
A
x
F
G
x
Y
G
|
G
G
x
Q
I
x
A
V
 
I
S
 
S
P
 
-
L
 
-
Y
 
-
P
 
-
W
 
Y
R
 
K
Y
 
M
S
 
P
P
 
D
A
 
E
V
 
T
T
 
F
A
 
L
L
 
L
A
 
H
H
 
H
W
 
L
S
 
G
Q
 
K
D
 
H
F
 
R
Y
 
W
P
 
-
Q
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
R
R
 
E
L
 
M
F
 
N
A
 
A
Q
 
K
T
 
V
G
 
G
V
 
I
D
 
D
P
 
T
E
 
T
V
 
Y
H
 
R
T
 
T
T
 
Q
G
 
G
L
 
R
Y
 
V
W
 
E
L
 
V
D
 
P
L
 
L
D
 
D
D
 
E
E
 
E
-
 
D
-
 
L
A
 
V
E
 
N
A
 
V
L
 
R
A
 
K
W
 
W
A
 
I
A
 
D
R
 
E
E
 
R
G
 
S
R
 
K
-
 
N
-
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
I
P
 
P
L
 
F
S
 
K
K
 
T
V
 
R
D
 
I
V
 
I
S
 
E
A
 
G
A
 
A
H
 
E
D
 
L
A
 
N
V
 
Q
P
 
R
V
 
L
L
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
T
Y
 
T
A
 
D
N
 
W
A
 
K
I
 
I
Y
 
A
-
 
G
M
 
F
A
 
E
N
 
E
V
 
D
A
 
S
N
 
G
V
 
S
R
 
F
N
 
D
P
 
P
R
 
E
L
 
V
V
 
A
K
 
T
S
 
F
L
 
V
K
 
M
A
 
A
A
 
E
L
 
Y
L
 
A
T
 
K
L
 
K
P
 
M
G
 
G
V
 
V
T
 
R
I
 
I
H
 
Y
E
 
T
Q
 
Q
C
 
C
E
x
A
V
x
A
T
 
R
G
 
G
F
 
L
L
 
E
L
 
T
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
V
V
 
I
V
 
S
G
 
D
V
 
V
S
 
V
T
 
T
A
 
E
D
 
K
G
 
G
A
 
A
I
 
I
F
 
K
G
 
T
D
 
S
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
A
x
G
G
|
G
A
 
V
W
|
W
S
 
S
G
 
R
E
 
L
L
 
F
L
 
M
G
 
Q
T
 
N
L
 
L
G
 
N
L
 
V
S
 
D
L
 
V
P
 
P
V
 
T
E
 
L
P
 
P
V
 
A
K
 
Y
G
x
Q
Q
 
S
M
x
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
I
-
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
G
I
 
I
L
 
F
Y
 
F
K
 
R
C
 
E
A
 
Q
S
 
A
D
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
Y
-
 
A
-
 
T
-
 
S
-
 
P
-
 
R
-
 
V
F
 
I
L
 
V
S
 
A
S
 
P
M
 
V
V
|
V
L
 
K
A
 
E
K
 
S
G
x
F
R
 
T
Y
 
Y
-
x
G
-
 
Y
-
 
K
-
x
Y
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
L
A
 
A
I
 
L
P
 
P
R
 
D
R
 
F
D
 
P
G
 
V
H
 
H
I
 
I
-
 
S
-
 
L
-
x
N
-
x
E
-
 
Q
L
 
L
I
 
I
G
 
N
S
 
S
T
x
F
L
x
M
E
 
Q
-
x
S
-
 
T
H
 
H
E
 
W
G
 
N
F
 
L
D
 
D
K
 
E
-
 
V
T
 
S
P
 
P
T
x
F
E
 
E
-
 
Q
-
 
F
-
 
R
-
 
N
-
 
M
-
 
T
-
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
L
-
 
N
T
 
A
A
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
A
S
 
E
A
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
-
I
 
F
P
 
P
A
 
A
L
 
F
A
 
K
D
 
E
A
 
S
E
 
K
V
 
L
V
 
I
G
 
D
H
 
Q
W
 
W
A
 
S
G
|
G
L
 
A
R
x
M
P
 
A
G
 
I
S
 
A
P
 
P
E
 
D
G
x
E
I
 
N
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
G
 
S
Q
 
E
V
 
V
P
 
K
G
 
E
F
 
Y
K
 
P
G
 
G
L
 
L
W
 
V
L
 
I
N
 
N
C
 
T
G
 
A
H
x
T
Y
x
G
R
x
W
N
 
-
G
|
G
L
x
M
V
x
T
L
 
E
A
 
S
P
 
P
A
 
V
S
 
S
C
 
A
Q
 
E
L
 
L
F
 
T
T
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
G
R
 
K
A
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
K
P
 
P
Y
 
F
A
 
S

2gagB Heteroteterameric sarcosine: structure of a diflavin metaloenzyme at 1.85 a resolution (see paper)
27% identity, 87% coverage: 8:328/369 of query aligns to 23:350/403 of 2gagB

query
sites
2gagB
V
 
I
I
 
I
V
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
V
x
G
I
x
H
G
 
G
L
 
L
L
 
A
T
 
T
A
 
A
F
 
Y
N
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
K
Q
 
N
G
 
H
-
 
G
-
 
I
Q
 
T
A
 
N
V
 
V
V
 
A
L
 
V
L
 
L
E
|
E
R
x
K
A
 
G
G
 
W
L
 
L
G
 
A
Q
 
G
E
x
G
S
x
N
S
x
M
W
x
A
A
x
R
G
x
N
G
x
T
G
x
T
I
|
I
V
 
I
S
x
R
P
 
S
L
 
N
Y
 
Y
P
 
L
W
 
W
R
 
D
Y
 
E
S
 
S
P
 
A
A
 
G
V
 
I
-
 
Y
-
 
E
T
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
K
H
 
L
W
 
W
S
 
E
Q
 
Q
D
 
L
F
 
P
Y
 
E
P
 
D
Q
 
L
L
 
E
A
 
Y
Q
 
D
R
 
F
L
 
L
F
 
F
A
 
S
Q
 
Q
T
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
L
P
 
N
E
 
L
V
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
L
G
 
G
L
 
-
Y
 
-
W
 
-
L
 
-
D
 
D
L
 
V
D
 
R
D
 
E
E
 
S
A
 
V
E
 
R
A
 
R
L
 
V
A
 
E
W
 
A
A
 
N
A
 
K
R
 
L
E
 
N
G
 
G
R
 
V
P
 
D
L
 
A
S
 
E
K
 
W
V
 
L
D
 
D
V
 
P
S
 
S
A
 
Q
A
 
V
H
 
K
D
 
E
A
 
A
V
 
C
P
 
P
V
 
I
L
 
I
G
 
N
G
 
-
G
 
-
Y
 
T
A
 
S
N
 
D
A
 
D
I
 
I
Y
 
R
M
 
Y
A
 
P
N
 
V
V
 
M
A
 
G
N
 
A
V
 
T
R
 
W
N
 
Q
P
 
P
R
 
R
L
 
A
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
x
K
-
x
H
-
 
D
-
 
H
V
 
V
K
 
A
S
 
W
L
 
A
K
 
F
A
 
A
A
 
R
L
 
K
L
 
A
T
 
N
L
 
E
P
 
M
G
 
G
V
 
V
T
 
D
I
 
I
H
 
I
E
 
Q
Q
 
N
C
 
C
E
 
E
V
|
V
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
I
L
 
K
D
 
D
A
 
G
G
 
E
N
 
K
V
 
V
V
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
K
T
 
T
A
 
T
D
 
R
G
 
G
A
 
T
I
 
I
F
 
H
G
 
A
D
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
A
A
x
G
G
x
A
A
 
G
W
x
H
S
 
S
G
 
S
E
 
V
L
|
L
L
 
A
G
 
E
T
 
M
L
 
A
G
 
G
L
 
F
S
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
I
E
 
Q
P
 
S
V
 
H
K
 
P
G
x
L
Q
 
Q
M
 
A
I
 
L
L
x
V
Y
 
S
K
 
E
C
 
L
A
 
F
S
 
E
D
 
P
F
 
V
L
 
H
S
 
P
S
 
T
M
 
V
V
 
V
L
x
M
A
 
S
K
 
N
-
 
H
-
 
I
G
 
H
R
 
V
Y
|
Y
A
 
V
I
 
S
P
 
Q
R
 
A
R
 
H
D
x
K
G
 
G
H
x
E
I
 
L
L
 
V
I
 
M
G
 
G
S
 
A
T
 
G
L
 
I
E
 
D
-
 
S
H
 
Y
E
 
N
G
 
G
F
 
Y
D
 
G
K
 
Q
T
 
R
P
 
G
T
 
A
E
 
F
T
 
H
A
 
V
L
 
I
E
 
Q
S
 
E
L
 
Q
K
 
M
A
 
A
S
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
L
I
 
F
P
 
P
A
 
I
L
 
F
A
 
A
D
 
R
A
 
A
E
 
H
V
 
V
V
 
L
G
x
R
H
 
T
W
|
W
A
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
G
 
T
S
 
T
P
 
M
E
 
D
G
 
A
I
 
S
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
G
 
S
Q
 
K
V
 
T
P
 
P
G
 
-
F
 
I
K
 
Q
G
 
N
L
 
L
W
 
Y
L
 
V
N
 
N
C
 
C
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6pxsA Crystal structure of iminodiacetate oxidase (idaa) from chelativorans sp. Bnc1 (see paper)
26% identity, 97% coverage: 6:364/369 of query aligns to 2:367/370 of 6pxsA

query
sites
6pxsA
Q
 
R
V
 
V
V
 
L
I
 
I
V
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
V
x
I
I
 
L
G
 
G
L
 
A
L
 
S
T
 
A
A
 
A
F
 
Y
N
 
H
L
 
L
A
 
A
T
 
R
Q
 
L
G
 
G
Q
 
A
A
 
Q
V
 
V
V
 
E
L
 
I
L
 
I
E
x
D
R
 
Q
A
x
N
G
x
H
L
 
P
G
 
G
Q
x
K
E
 
-
S
x
A
S
x
T
W
 
L
A
|
A
G
|
G
G
x
A
G
|
G
I
x
V
V
 
V
S
 
C
P
 
P
L
 
W
Y
 
A
P
 
T
W
 
E
R
 
A
Y
 
D
S
 
D
P
 
P
A
 
D
V
 
W
T
 
Y
A
 
L
L
 
L
A
 
Y
H
 
A
W
 
R
S
 
G
Q
 
A
D
 
R
F
 
Y
Y
 
Y
P
 
G
Q
 
T
L
 
L
A
 
I
Q
 
E
R
 
E
L
 
L
F
 
R
A
 
G
Q
 
Q
T
 
G
G
 
E
V
 
T
D
 
E
P
 
L
E
 
G
V
 
Y
H
 
S
T
 
R
T
 
V
G
 
G
L
 
A
Y
 
L
W
 
V
L
 
L
D
 
-
L
 
A
D
 
E
D
 
D
E
 
R
A
 
A
E
 
R
A
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
L
A
 
D
A
 
T
R
 
I
E
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
I
L
 
S
S
 
R
K
 
R
V
 
I
D
 
K
V
 
D
S
 
A
A
 
P
A
 
E
H
 
A
D
 
G
A
 
T
V
 
V
P
 
R
V
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
Y
 
E
A
 
A
N
 
K
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
P
-
 
P
-
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
D
-
 
L
-
 
E
A
 
A
I
 
I
Y
 
H
M
 
I
A
 
P
N
 
G
V
 
G
A
 
A
N
 
R
V
 
V
R
 
D
N
 
G
P
 
R
R
 
L
L
 
L
V
 
A
K
 
A
S
 
S
L
 
M
K
 
L
A
 
R
A
 
V
L
 
A
L
 
I
T
 
S
L
 
-
P
 
S
G
 
G
V
 
A
T
 
T
I
 
L
H
 
R
E
 
N
Q
 
-
C
 
-
E
 
D
V
x
Y
T
 
V
G
 
S
F
 
L
L
 
R
L
 
L
D
 
N
A
 
D
G
 
G
N
 
R
V
 
A
V
 
E
G
 
C
V
 
L
S
 
G
T
 
S
A
 
D
D
 
G
G
 
R
A
 
P
I
 
I
F
 
P
G
 
A
D
 
D
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
L
 
V
A
 
T
A
|
A
G
 
G
A
 
A
W
|
W
S
 
A
G
 
A
E
 
Q
L
x
I
L
 
L
G
 
A
T
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
R
L
 
H
P
 
P
V
 
V
E
 
V
P
 
P
V
 
Q
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
M
 
I
I
 
I
-
 
H
-
 
L
-
 
H
L
 
L
Y
 
P
K
 
G
C
 
V
A
 
A
S
 
T
D
 
S
F
 
G
L
 
W
S
 
P
S
 
V
M
 
V
V
 
L
L
 
P
A
 
M
K
 
N
G
 
S
R
 
Y
Y
|
Y
A
 
M
I
 
L
P
 
A
R
 
F
R
 
D
D
 
D
G
 
S
H
 
R
I
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
G
S
 
A
T
 
T
L
 
R
E
 
E
H
 
D
-
 
G
E
 
S
G
 
G
F
 
F
D
 
D
-
 
Y
K
 
R
T
 
V
P
 
T
T
 
A
E
 
R
T
 
G
A
 
Q
L
 
L
E
 
E
S
 
V
L
 
L
K
 
Q
A
 
A
S
 
-
A
 
G
V
 
L
E
 
G
L
 
I
I
 
A
P
 
P
A
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
T
V
 
H
V
 
I
G
 
E
H
 
T
W
 
R
A
 
V
G
|
G
L
 
F
R
|
R
P
 
P
G
 
A
S
 
G
P
 
S
E
 
A
G
 
M
I
 
R
P
 
P
Y
 
I
I
 
L
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
P
 
P
G
 
Q
F
 
I
K
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
T
L
 
I
N
 
G
C
 
N
G
 
G
H
 
L
Y
x
G
R
x
A
N
x
S
G
|
G
L
|
L
V
x
T
L
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
F
S
 
A
C
 
G
Q
 
H
L
 
L
F
 
L
T
 
A
D
 
G
L
 
V
L
 
V
L
 
M
E
 
G
R
 
E
A
 
P
P
 
A
I
 
E
I
 
V
D
 
P
P
 
L
A
 
E
P
 
R
Y
 
Y
A
 
S
P
 
P
E
 
T
G
 
G

Q50LF2 Sarcosine oxidase subunit beta; Sarcosine oxidase subunit B; Sarcosine oxidase (5,10-methylenetetrahydrofolate-forming) subunit beta; Tetrameric sarcosine oxidase subunit beta; TSOX subunit beta; EC 1.5.3.24 from Corynebacterium sp. (strain U-96) (see 4 papers)
28% identity, 54% coverage: 166:363/369 of query aligns to 188:387/405 of Q50LF2

query
sites
Q50LF2
G
 
G
V
 
V
T
 
D
I
 
I
H
 
I
E
 
Q
Q
 
N
C
 
C
E
 
E
V
|
V
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
L
 
K
D
 
D
A
 
G
G
 
E
N
 
K
V
 
V
V
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
K
T
 
T
A
 
T
D
 
R
G
 
G
A
 
T
I
 
I
F
 
L
G
 
A
D
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
G
G
 
A
A
 
G
W
 
H
S
 
S
G
 
S
E
 
V
L
 
L
L
 
A
G
 
E
T
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
F
S
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
I
E
 
Q
P
 
S
V
 
H
K
 
P
G
 
L
Q
 
Q
M
 
A
I
 
L
L
 
V
Y
 
S
K
 
E
C
 
L
A
 
F
S
 
E
D
 
P
F
 
V
L
 
H
S
 
P
S
 
T
M
 
V
V
 
V
L
 
M
A
 
S
K
 
N
-
 
H
-
 
I
G
x
H
R
 
V
Y
|
Y
A
 
V
I
 
S
P
 
Q
R
 
A
R
 
H
D
 
K
G
 
G
H
 
E
I
 
L
L
 
V
I
 
M
G
 
G
S
 
A
T
 
G
L
 
I
E
 
D
-
 
S
H
 
Y
E
 
N
G
 
G
F
 
Y
D
 
G
K
 
Q
T
 
R
P
 
G
T
 
A
E
 
F
T
 
H
A
 
V
L
 
I
E
 
E
S
 
E
L
 
Q
K
 
M
A
 
A
S
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
L
I
 
F
P
 
P
A
 
I
L
 
F
A
 
A
D
 
R
A
 
A
E
 
H
V
 
V
V
 
L
G
 
R
H
 
T
W
 
W
A
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
G
 
T
S
 
T
P
 
M
E
 
D
G
 
A
I
 
S
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
G
 
S
Q
 
K
V
 
T
P
 
P
G
 
-
F
 
I
K
 
Q
G
 
N
L
 
L
W
 
Y
L
 
V
N
 
N
C
 
C
G
 
G
H
 
W
Y
x
G
R
 
T
N
 
G
G
|
G
L
 
F
V
x
K
L
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
G
S
 
A
C
 
G
Q
 
Y
L
 
T
F
 
L
T
 
A
D
 
H
L
 
T
L
 
I
L
 
A
E
 
H
R
 
D
A
 
E
P
 
P
I
 
H
I
 
K
D
 
L
P
 
N
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
A
 
A
P
 
L
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3ad8B Heterotetrameric sarcosine oxidase from corynebacterium sp. U-96 in complex with pyrrole 2-carboxylate (see paper)
28% identity, 54% coverage: 166:363/369 of query aligns to 187:386/404 of 3ad8B

query
sites
3ad8B
G
 
G
V
 
V
T
 
D
I
 
I
H
 
I
E
 
Q
Q
 
N
C
 
C
E
 
E
V
|
V
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
L
 
K
D
 
D
A
 
G
G
 
E
N
 
K
V
 
V
V
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
K
T
 
T
A
 
T
D
 
R
G
 
G
A
 
T
I
 
I
F
 
L
G
 
A
D
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
A
A
x
G
G
x
A
A
 
G
W
x
H
S
 
S
G
 
S
E
 
V
L
 
L
L
 
A
G
 
E
T
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
F
S
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
I
E
 
Q
P
 
S
V
 
H
K
 
P
G
x
L
Q
 
Q
M
 
A
I
 
L
L
x
V
Y
 
S
K
 
E
C
 
L
A
 
F
S
 
E
D
 
P
F
 
V
L
 
H
S
 
P
S
 
T
M
 
V
V
 
V
L
x
M
A
 
S
K
 
N
-
 
H
-
 
I
G
 
H
R
 
V
Y
|
Y
A
 
V
I
 
S
P
 
Q
R
 
A
R
 
H
D
 
K
G
 
G
H
x
E
I
 
L
L
 
V
I
 
M
G
 
G
S
 
A
T
 
G
L
 
I
E
 
D
-
 
S
H
 
Y
E
 
N
G
 
G
F
 
Y
D
 
G
K
 
Q
T
 
R
P
 
G
T
 
A
E
 
F
T
 
H
A
 
V
L
 
I
E
 
E
S
 
E
L
 
Q
K
 
M
A
 
A
S
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
L
I
 
F
P
 
P
A
 
I
L
 
F
A
 
A
D
 
R
A
 
A
E
 
H
V
 
V
V
 
L
G
x
R
H
 
T
W
|
W
A
 
G
G
|
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
G
 
T
S
 
T
P
 
M
E
 
D
G
 
A
I
 
S
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
G
 
S
Q
 
K
V
 
T
P
 
P
G
 
-
F
 
I
K
 
Q
G
 
N
L
 
L
W
 
Y
L
 
V
N
 
N
C
 
C
G
 
G
H
 
W
Y
x
G
R
x
T
N
x
G
G
|
G
L
x
F
V
x
K
L
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
G
S
 
A
C
 
G
Q
 
Y
L
 
T
F
 
L
T
 
A
D
 
H
L
 
T
L
 
I
L
 
A
E
 
H
R
 
D
A
 
E
P
 
P
I
 
H
I
 
K
D
 
L
P
 
N
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
A
 
A
P
 
L
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3ad7B Heterotetrameric sarcosine oxidase from corynebacterium sp. U-96 in complex with methylthio acetate (see paper)
28% identity, 54% coverage: 166:363/369 of query aligns to 187:386/404 of 3ad7B

query
sites
3ad7B
G
 
G
V
 
V
T
 
D
I
 
I
H
 
I
E
 
Q
Q
 
N
C
 
C
E
 
E
V
|
V
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
L
 
K
D
 
D
A
 
G
G
 
E
N
 
K
V
 
V
V
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
K
T
 
T
A
 
T
D
 
R
G
 
G
A
 
T
I
 
I
F
 
L
G
 
A
D
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
A
A
x
G
G
x
A
A
 
G
W
x
H
S
 
S
G
 
S
E
 
V
L
 
L
L
 
A
G
 
E
T
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
F
S
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
I
E
 
Q
P
 
S
V
 
H
K
 
P
G
x
L
Q
 
Q
M
 
A
I
 
L
L
x
V
Y
 
S
K
 
E
C
 
L
A
 
F
S
 
E
D
 
P
F
 
V
L
 
H
S
 
P
S
 
T
M
 
V
V
 
V
L
x
M
A
 
S
K
 
N
-
 
H
-
 
I
G
 
H
R
 
V
Y
|
Y
A
 
V
I
 
S
P
 
Q
R
 
A
R
 
H
D
x
K
G
 
G
H
x
E
I
 
L
L
 
V
I
 
M
G
 
G
S
 
A
T
 
G
L
 
I
E
 
D
-
 
S
H
 
Y
E
 
N
G
 
G
F
 
Y
D
 
G
K
 
Q
T
 
R
P
 
G
T
 
A
E
 
F
T
 
H
A
 
V
L
 
I
E
 
E
S
 
E
L
 
Q
K
 
M
A
 
A
S
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
L
I
 
F
P
 
P
A
 
I
L
 
F
A
 
A
D
 
R
A
 
A
E
 
H
V
 
V
V
 
L
G
x
R
H
 
T
W
|
W
A
 
G
G
|
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
G
 
T
S
 
T
P
 
M
E
 
D
G
 
A
I
 
S
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
G
 
S
Q
 
K
V
 
T
P
 
P
G
 
-
F
 
I
K
 
Q
G
 
N
L
 
L
W
 
Y
L
 
V
N
 
N
C
 
C
G
 
G
H
 
W
Y
x
G
R
x
T
N
x
G
G
|
G
L
x
F
V
x
K
L
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
G
S
 
A
C
 
G
Q
 
Y
L
 
T
F
 
L
T
 
A
D
 
H
L
 
T
L
 
I
L
 
A
E
 
H
R
 
D
A
 
E
P
 
P
I
 
H
I
 
K
D
 
L
P
 
N
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
A
 
A
P
 
L
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1vrqB Crystal structure of heterotetrameric sarcosine oxidase from corynebacterium sp. U-96 in complex with folinic acid (see paper)
28% identity, 54% coverage: 166:363/369 of query aligns to 187:386/402 of 1vrqB

query
sites
1vrqB
G
 
G
V
 
V
T
 
D
I
 
I
H
 
I
E
 
Q
Q
 
N
C
 
C
E
 
E
V
|
V
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
L
 
K
D
 
D
A
 
G
G
 
E
N
 
K
V
 
V
V
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
K
T
 
T
A
 
T
D
 
R
G
 
G
A
 
T
I
 
I
F
 
L
G
 
A
D
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
A
|
A
A
x
G
G
 
A
A
 
G
W
x
H
S
 
S
G
 
S
E
 
V
L
 
L
L
 
A
G
 
E
T
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
F
S
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
I
E
 
Q
P
 
S
V
 
H
K
 
P
G
x
L
Q
 
Q
M
 
A
I
 
L
L
x
V
Y
 
S
K
 
E
C
 
L
A
 
F
S
 
E
D
 
P
F
 
V
L
 
H
S
 
P
S
 
T
M
 
V
V
 
V
L
 
M
A
 
S
K
 
N
-
 
H
-
 
I
G
 
H
R
 
V
Y
 
Y
A
 
V
I
 
S
P
 
Q
R
 
A
R
 
H
D
 
K
G
 
G
H
x
E
I
 
L
L
 
V
I
 
M
G
 
G
S
 
A
T
 
G
L
 
I
E
 
D
-
 
S
H
 
Y
E
 
N
G
 
G
F
 
Y
D
 
G
K
 
Q
T
 
R
P
 
G
T
 
A
E
 
F
T
 
H
A
 
V
L
 
I
E
 
E
S
 
E
L
 
Q
K
 
M
A
 
A
S
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
L
I
 
F
P
 
P
A
 
I
L
 
F
A
 
A
D
 
R
A
 
A
E
 
H
V
 
V
V
 
L
G
x
R
H
 
T
W
|
W
A
 
G
G
|
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
G
 
T
S
 
T
P
 
M
E
 
D
G
 
A
I
 
S
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
G
 
S
Q
 
K
V
 
T
P
 
P
G
 
-
F
 
I
K
 
Q
G
 
N
L
 
L
W
 
Y
L
 
V
N
 
N
C
 
C
G
 
G
H
 
W
Y
x
G
R
x
T
N
x
G
G
|
G
L
x
F
V
x
K
L
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
G
S
 
A
C
 
G
Q
 
Y
L
 
T
F
 
L
T
 
A
D
 
H
L
 
T
L
 
I
L
 
A
E
 
H
R
 
D
A
 
E
P
 
P
I
 
H
I
 
K
D
 
L
P
 
N
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
A
 
A
P
 
L
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1y56B Crystal structure of l-proline dehydrogenase from p.Horikoshii (see paper)
23% identity, 89% coverage: 20:348/369 of query aligns to 20:351/374 of 1y56B

query
sites
1y56B
A
 
A
F
 
H
N
 
E
L
 
L
A
 
A
T
 
K
Q
 
R
G
 
G
Q
 
E
A
 
E
V
 
V
V
 
T
L
 
V
L
x
I
E
|
E
R
x
K
A
 
R
G
 
F
L
 
I
G
 
G
Q
 
S
E
 
G
S
|
S
S
x
T
W
x
F
A
x
R
G
x
C
G
|
G
G
x
T
I
x
G
V
 
I
S
 
R
P
 
Q
L
 
Q
Y
 
F
P
 
N
W
 
-
R
 
-
Y
 
-
S
 
D
P
 
E
A
 
A
V
 
N
T
 
V
A
 
R
L
 
V
A
 
M
H
 
K
W
 
R
S
 
S
Q
 
V
D
 
E
F
 
L
Y
 
W
P
 
K
Q
 
K
L
 
Y
A
 
S
Q
 
E
R
 
E
L
 
Y
-
 
G
-
 
F
-
 
S
F
 
F
A
 
K
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
V
 
Y
D
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
-
H
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
L
Y
 
F
W
 
L
L
 
L
D
 
Y
L
 
D
D
 
D
D
 
E
E
 
E
A
 
V
E
 
K
A
 
T
L
 
F
A
 
K
W
 
R
-
 
N
-
 
I
-
 
E
-
 
I
A
 
Q
A
 
N
R
 
K
E
 
F
G
 
G
R
 
V
P
 
P
L
 
T
S
 
K
K
 
L
V
 
I
D
 
T
V
 
P
S
 
E
A
 
E
A
 
A
H
 
K
D
 
E
A
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
L
L
 
L
G
 
D
G
 
I
G
 
S
Y
 
E
A
 
V
N
 
I
A
 
A
I
 
A
Y
 
S
M
 
W
A
 
N
N
 
P
V
 
T
A
 
D
N
 
G
V
 
K
R
 
A
N
 
D
P
 
P
R
 
F
L
 
E
V
 
A
K
 
T
S
 
T
L
 
A
K
 
F
A
 
A
A
 
V
L
 
K
L
 
A
T
 
K
L
 
E
P
 
Y
G
 
G
V
 
A
T
 
K
I
 
L
H
 
L
E
 
E
Q
 
Y
C
 
T
E
|
E
V
|
V
T
 
K
G
 
G
F
 
F
L
 
L
L
 
I
D
 
E
A
 
N
G
 
N
N
 
E
V
 
I
V
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
K
T
 
T
A
 
N
D
 
K
G
 
G
A
 
I
I
 
I
F
 
K
G
 
T
D
 
G
Q
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
N
A
 
A
A
x
T
G
x
N
A
 
A
W
|
W
S
 
A
G
 
N
E
 
L
L
 
I
L
 
N
G
 
A
T
 
M
L
 
A
G
 
G
L
 
I
S
 
K
-
 
T
-
 
K
L
 
I
P
 
P
V
 
I
E
 
E
P
 
P
V
 
Y
K
 
K
G
x
H
Q
 
Q
M
 
A
I
 
V
L
 
I
Y
 
T
K
 
Q
-
 
P
C
 
I
A
 
K
S
 
R
D
 
G
F
 
T
L
 
I
S
 
N
S
x
P
M
 
M
V
 
V
L
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
A
 
-
I
 
I
P
 
S
R
 
F
R
 
K
D
 
Y
G
 
G
H
 
H
I
 
A
L
 
Y
I
 
L
G
 
T
S
 
Q
T
 
T
L
 
F
E
 
H
H
 
G
E
 
G
-
 
I
-
x
I
-
 
G
-
 
G
-
 
I
-
 
G
-
 
Y
-
 
E
-
 
I
-
 
G
-
 
P
G
 
T
F
 
Y
D
 
D
K
 
L
T
 
T
P
 
P
T
 
T
E
 
Y
T
 
E
A
 
F
L
 
L
E
 
R
S
 
E
L
 
V
K
 
S
A
 
Y
S
 
Y
A
 
F
V
 
T
E
 
K
L
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
N
A
 
L
E
 
L
V
 
I
V
 
L
G
x
R
H
 
T
W
|
W
A
 
A
G
|
G
L
x
Y
R
x
Y
P
 
A
G
 
K
S
 
T
P
 
P
E
 
D
G
 
S
I
 
N
P
 
P
Y
 
A
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
V
 
I
P
 
E
G
 
E
F
 
L
K
 
N
G
 
D
L
 
Y
W
 
Y
L
 
I
N
 
A
C
 
A
G
 
G
H
 
F
Y
 
S
R
x
G
N
x
H
G
|
G
L
x
F
V
x
M
L
 
M
A
 
A
P
 
P
A
 
A
S
 
V
C
 
G
Q
 
E
L
 
M
F
 
V
T
 
A
D
 
E
L
 
L
L
 
I

Sites not aligning to the query:

P40875 Sarcosine oxidase subunit beta; Sarcosine oxidase subunit B; Sarcosine oxidase (5,10-methylenetetrahydrofolate-forming) subunit beta; Tetrameric sarcosine oxidase subunit beta; TSOX subunit beta; EC 1.5.3.24 from Corynebacterium sp. (strain P-1) (see 3 papers)
30% identity, 44% coverage: 166:328/369 of query aligns to 188:352/405 of P40875

query
sites
P40875
G
 
G
V
 
V
T
 
D
I
 
I
H
 
I
E
 
Q
Q
 
N
C
|
C
E
 
E
V
 
V
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
L
 
K
D
 
D
A
 
G
G
 
E
N
 
K
V
 
V
V
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
K
T
 
T
A
 
T
D
 
R
G
 
G
A
 
T
I
 
I
F
 
H
G
 
A
D
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
G
G
 
A
A
 
G
W
 
H
S
 
S
G
 
S
E
 
V
L
 
L
L
 
A
G
 
E
T
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
F
S
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
I
E
 
Q
P
 
S
V
 
H
K
 
P
G
 
L
Q
 
Q
M
 
A
I
 
L
L
 
V
Y
 
S
K
 
E
C
 
L
A
 
F
S
 
E
D
 
P
F
 
V
L
 
H
S
 
P
S
 
T
M
 
V
V
 
V
L
 
M
A
 
S
K
 
N
-
 
H
-
 
I
G
 
H
R
 
V
Y
 
Y
A
 
V
I
 
S
P
 
Q
R
 
A
R
 
H
D
 
K
G
 
G
H
 
E
I
 
L
L
 
V
I
 
M
G
 
G
S
 
A
T
 
G
L
 
I
E
 
D
-
 
S
H
 
Y
E
 
N
G
 
G
F
 
Y
D
 
G
K
 
Q
T
 
R
P
 
G
T
 
A
E
 
F
T
 
H
A
 
V
L
 
I
E
 
E
S
 
E
L
 
Q
K
 
M
A
 
A
S
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
L
I
 
F
P
 
P
A
 
I
L
 
F
A
 
A
D
 
R
A
 
A
E
 
H
V
 
V
V
 
L
G
 
R
H
 
T
W
 
W
A
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
G
 
T
S
 
T
P
 
M
E
 
D
G
 
A
I
 
S
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
G
 
S
Q
 
K
V
 
T
P
 
P
G
 
-
F
 
I
K
 
Q
G
 
N
L
 
L
W
 
Y
L
 
V
N
 
N
C
|
C
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>GFF749 FitnessBrowser__WCS417:GFF749
MAEQQQVVIVGGGVIGLLTAFNLATQGQAVVLLERAGLGQESSWAGGGIVSPLYPWRYSP
AVTALAHWSQDFYPQLAQRLFAQTGVDPEVHTTGLYWLDLDDEAEALAWAAREGRPLSKV
DVSAAHDAVPVLGGGYANAIYMANVANVRNPRLVKSLKAALLTLPGVTIHEQCEVTGFLL
DAGNVVGVSTADGAIFGDQVVLAAGAWSGELLGTLGLSLPVEPVKGQMILYKCASDFLSS
MVLAKGRYAIPRRDGHILIGSTLEHEGFDKTPTETALESLKASAVELIPALADAEVVGHW
AGLRPGSPEGIPYIGQVPGFKGLWLNCGHYRNGLVLAPASCQLFTDLLLERAPIIDPAPY
APEGRINAG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory