SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF836 Psest_0850 glucokinase, proteobacterial type to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 9 hits to proteins with known functional sites (download)

1sz2B Crystal structure of e. Coli glucokinase in complex with glucose (see paper)
39% identity, 99% coverage: 2:317/319 of query aligns to 2:316/320 of 1sz2B

query
sites
1sz2B
R
 
K
L
 
Y
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
N
A
 
A
R
 
R
F
 
L
A
 
A
L
 
L
W
 
C
R
 
D
-
 
I
-
 
A
D
 
S
S
 
G
R
 
E
L
 
I
E
 
S
S
 
Q
V
 
A
R
 
K
V
 
T
L
 
Y
A
 
S
A
 
G
A
 
L
D
 
D
F
 
Y
A
 
P
T
 
S
P
 
L
E
 
E
M
 
A
A
 
V
V
 
I
E
 
R
Y
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
E
S
 
E
L
 
H
G
 
K
L
 
V
A
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
E
V
 
V
E
 
K
A
 
D
A
 
G
C
 
C
L
 
I
A
 
A
C
 
I
A
 
A
G
x
C
P
|
P
V
 
I
K
 
T
G
 
G
E
 
D
Q
 
W
F
 
V
T
 
A
F
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
H
H
 
T
W
 
W
R
 
A
L
 
F
T
 
S
R
 
I
S
 
A
D
 
E
F
 
M
C
 
K
G
 
K
A
 
N
L
 
L
Q
 
G
M
 
F
G
 
S
E
 
H
L
 
L
L
 
E
L
 
I
I
 
I
N
|
N
D
|
D
F
 
F
A
 
T
A
 
A
M
 
V
A
 
S
L
 
M
G
 
A
M
 
I
T
 
P
R
 
M
V
 
L
G
 
K
E
 
K
A
 
-
G
 
-
R
 
E
R
 
H
M
 
L
I
 
I
C
 
Q
A
 
F
G
 
G
E
 
G
A
 
A
E
 
E
P
 
P
-
 
V
-
 
E
D
 
G
A
 
K
P
 
P
A
 
I
L
 
A
V
 
V
I
 
Y
G
 
G
P
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
|
L
G
|
G
V
 
V
A
 
A
G
 
H
L
 
L
L
 
V
P
 
H
L
 
V
G
 
D
G
 
K
G
 
-
S
 
R
W
 
W
R
 
V
A
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
G
H
|
H
V
 
V
D
 
D
L
 
F
P
 
A
V
 
P
A
 
N
D
 
S
A
 
E
H
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
I
L
 
I
W
 
L
Q
 
E
M
 
I
L
 
L
F
 
R
A
 
A
Q
 
E
L
 
I
G
 
G
H
 
H
V
 
V
R
 
S
A
 
A
E
|
E
D
 
R
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
P
G
 
G
L
 
L
L
 
V
L
 
N
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
T
 
A
V
 
I
C
 
V
T
 
K
V
 
A
A
 
D
G
 
N
L
 
R
A
 
L
P
 
P
R
 
E
L
 
N
A
 
L
S
 
K
P
 
P
A
 
K
E
 
D
V
 
I
T
 
T
A
 
E
A
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
D
D
 
S
H
 
C
V
 
T
A
 
D
V
 
C
A
 
R
-
 
R
T
 
A
L
 
L
E
 
S
Q
 
L
F
 
F
C
 
C
V
 
V
W
 
I
L
 
M
G
 
G
R
 
R
V
 
F
A
 
G
G
 
G
N
 
N
N
 
L
V
 
A
L
 
L
T
 
N
L
 
L
G
 
G
A
 
T
R
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
I
 
I
V
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
L
D
 
E
F
 
F
F
 
F
A
 
K
A
 
A
S
 
S
G
 
G
F
 
F
A
 
R
R
 
A
G
 
A
F
 
F
T
 
E
S
 
D
K
 
K
G
 
G
C
 
R
M
 
F
S
 
K
R
 
E
Y
 
Y
L
 
V
G
 
H
D
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
V
W
 
Y
L
 
L
V
 
I
T
 
V
A
 
H
E
 
D
F
 
N
P
 
P
G
 
G
L
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
V
 
A
A
 
H
L
 
L
E
 
R
Q
 
Q
A
 
T
L
 
L

6vzzA Crystal structure of glucokinase from balamuthia mandrillaris in complex with glucose (see paper)
31% identity, 78% coverage: 8:256/319 of query aligns to 30:314/374 of 6vzzA

query
sites
6vzzA
D
 
D
I
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
N
A
 
T
R
 
R
F
 
L
A
 
A
L
 
L
W
 
A
R
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
H
D
 
D
S
 
T
R
 
F
L
 
L
E
 
Q
S
 
V
V
 
L
R
 
K
V
 
V
L
 
-
A
 
-
A
 
K
A
 
A
D
 
D
F
 
D
A
 
T
T
 
R
P
 
K
E
 
L
M
 
I
A
 
A
V
 
F
E
 
F
Y
 
D
Y
 
S
L
 
V
A
 
S
S
 
D
L
 
S
G
 
I
L
 
R
A
 
D
P
 
L
G
 
L
S
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
-
 
S
-
 
G
A
 
A
C
 
C
L
 
L
A
 
A
C
 
G
A
|
A
G
|
G
P
 
R
V
 
I
-
 
S
-
 
P
K
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
V
F
 
L
T
 
D
F
 
V
T
|
T
N
 
N
-
 
F
-
 
H
-
 
G
-
 
D
-
 
A
N
 
T
H
 
H
W
 
R
R
 
R
L
 
L
T
 
K
R
 
R
S
 
S
D
 
E
F
 
L
C
 
P
G
 
S
A
 
F
L
 
L
-
 
F
Q
 
P
M
 
P
G
 
T
E
 
K
L
 
T
L
 
H
L
 
F
I
 
I
N
|
N
D
|
D
F
 
L
A
 
E
A
 
G
M
 
T
A
 
C
L
 
Y
G
 
G
M
 
V
T
 
S
R
 
S
V
 
M
G
 
N
E
 
A
A
 
S
G
 
D
R
 
A
R
 
L
M
 
D
I
 
Q
C
 
C
A
 
F
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
W
G
 
G
E
 
P
A
 
A
E
 
S
P
 
S
D
 
D
A
 
K
P
 
V
A
 
T
-
 
L
-
 
Q
-
x
P
-
x
D
-
 
H
-
 
Y
L
 
L
V
 
V
I
 
L
G
 
A
P
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
|
L
G
|
G
V
 
I
A
 
A
G
 
T
L
 
L
L
 
L
P
 
S
L
 
L
G
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
-
W
 
F
R
 
Q
A
 
V
L
 
M
P
 
P
G
 
M
E
|
E
G
 
F
G
 
G
H
|
H
V
 
V
D
 
A
L
 
I
-
 
S
P
 
P
V
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
A
-
 
N
-
 
A
A
 
A
D
 
Y
A
 
A
H
 
E
E
 
E
A
 
T
A
 
R
L
 
L
W
 
L
Q
 
E
M
 
Y
L
 
I
F
 
S
A
x
E
Q
 
K
L
 
L
G
 
Y
H
x
N
-
 
K
-
 
E
-
 
H
-
 
A
V
 
I
R
 
E
A
 
Y
E
|
E
D
 
D
V
 
I
L
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
V
L
 
I
L
 
T
Y
 
Y
R
 
K
T
 
W
V
 
V
C
 
L
T
 
D
V
 
E
A
 
A
G
 
N
L
 
V
A
 
Q
P
 
D
R
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
E
V
 
S
T
 
L
A
 
R
A
 
S
A
 
L
L
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
K
H
 
I
V
 
A
A
 
K
V
 
N
A
 
A
T
 
T
L
 
N
E
 
S
Q
 
E
F
 
A
C
 
C
V
 
P
W
 
Y
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
A
-
 
M
-
 
M
-
 
L
-
 
H
-
 
F
-
 
K
-
 
F
L
 
L
G
 
M
R
 
R
V
 
I
A
 
A
G
 
K
N
 
N
N
 
L
V
 
C
L
 
I
T
 
G
L
 
L
G
 
Q
A
 
V
R
 
R
G
 
G

8dtcA Crystal structure of glucokinase with bound glucose from acanthamoeba castellanii
29% identity, 78% coverage: 8:256/319 of query aligns to 30:313/374 of 8dtcA

query
sites
8dtcA
D
 
D
I
 
I
G
|
G
G
|
G
T
|
T
N
|
N
A
 
T
R
|
R
F
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
D
R
 
T
D
 
G
S
 
S
R
 
S
L
 
D
E
 
E
S
 
P
V
 
Y
R
 
V
V
 
Q
L
 
I
A
 
A
A
 
K
A
 
F
D
 
R
F
 
A
A
 
S
T
 
S
P
 
S
E
 
K
M
 
H
A
 
I
V
 
V
E
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
Q
-
 
Q
-
 
V
-
 
A
Y
 
R
Y
 
Q
L
 
V
A
 
A
S
 
D
L
 
I
G
 
L
L
 
G
A
 
V
P
 
P
G
 
A
S
 
S
V
 
-
E
 
-
A
 
G
A
 
A
C
 
C
L
 
L
A
 
A
C
 
G
A
 
A
G
|
G
P
 
R
V
 
I
K
 
G
G
 
D
E
 
D
Q
 
G
F
 
L
T
 
S
F
 
L
T
 
D
N
 
I
N
x
T
H
 
N
W
 
Y
R
 
P
L
 
G
T
 
T
R
 
P
S
 
A
D
 
D
F
 
R
C
 
T
-
 
L
G
 
T
A
 
S
L
 
D
Q
 
Q
M
 
L
G
 
P
E
 
T
L
 
Y
L
 
L
L
 
F
-
 
P
-
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
T
-
 
H
-
 
Y
I
 
I
N
|
N
D
|
D
F
 
L
A
 
E
A
 
S
M
 
T
A
 
C
L
 
Y
G
 
G
M
 
L
T
 
K
R
 
S
V
 
L
G
 
N
E
 
E
A
 
S
G
 
N
R
 
Q
R
 
-
M
 
-
I
 
-
C
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
F
A
 
F
E
 
K
P
 
P
-
 
L
-
 
W
-
 
S
-
 
T
-
 
S
-
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
T
-
 
M
-
 
K
D
 
R
A
 
A
P
 
N
A
 
Y
L
 
L
V
 
V
I
 
L
G
 
A
P
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
|
L
G
|
G
V
 
I
A
 
A
G
 
L
L
 
L
L
 
T
P
 
S
L
 
L
G
 
G
G
 
R
G
 
G
S
 
S
-
 
R
-
 
N
-
 
I
-
 
P
W
 
L
R
 
Q
A
 
V
L
 
M
P
 
P
G
 
M
E
|
E
G
 
F
G
 
G
H
|
H
-
 
A
V
 
L
D
 
Y
L
 
S
P
 
P
V
 
V
A
 
T
D
 
D
A
 
P
H
 
A
E
 
K
-
 
K
-
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
A
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
W
 
S
Q
 
K
M
 
T
L
 
L
F
 
Y
A
 
S
Q
 
G
L
 
K
G
 
N
H
 
A
V
 
I
R
 
E
A
 
Y
E
|
E
D
 
D
V
 
I
L
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
A
L
 
V
Y
 
Y
R
 
Q
T
 
W
V
 
I
C
 
T
T
 
A
V
 
E
A
 
H
G
 
K
L
 
E
A
 
A
P
 
A
R
 
K
L
 
Y
A
 
E
S
 
S
P
 
A
A
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
F
A
 
R
G
 
E
D
 
D
H
 
P
V
 
C
A
 
P
V
 
F
A
 
A
T
 
T
-
 
K
-
 
A
L
 
L
E
 
L
Q
 
I
F
 
H
C
 
Y
V
 
R
W
 
F
L
 
L
G
 
M
R
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
K
N
 
N
N
 
L
V
 
C
L
 
V
T
 
G
L
 
L
G
 
Q
A
 
A
R
 
K
G
 
G

2q2rA Trypanosoma cruzi glucokinase in complex with beta-d-glucose and adp (see paper)
29% identity, 76% coverage: 3:244/319 of query aligns to 30:292/370 of 2q2rA

query
sites
2q2rA
L
 
L
A
 
T
L
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
S
A
 
A
R
 
R
F
 
M
A
 
G
L
 
F
W
 
V
R
 
R
D
 
E
S
 
G
R
 
K
L
 
N
E
 
D
S
 
S
V
 
V
R
 
H
V
 
A
-
 
C
-
 
V
-
 
T
-
 
R
-
 
Y
-
 
S
L
 
M
A
 
K
A
 
R
A
 
K
D
 
D
F
 
I
A
 
T
T
 
E
P
 
-
E
 
-
M
 
-
A
 
I
V
 
I
E
 
E
Y
 
F
Y
 
F
L
 
N
A
 
E
S
 
I
L
 
I
G
 
E
L
 
L
A
 
M
P
 
P
G
 
A
S
 
S
-
 
V
-
 
M
-
 
K
-
 
R
V
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
G
C
 
V
L
 
I
A
 
N
C
 
V
A
 
P
G
|
G
P
 
P
V
 
V
K
 
T
G
 
G
E
 
G
Q
 
A
F
 
V
-
 
G
-
 
G
T
 
P
F
 
F
T
 
N
N
 
N
N
 
L
H
 
K
W
 
G
R
 
I
L
 
A
T
 
R
R
 
L
S
 
S
D
 
D
F
 
Y
C
 
P
G
 
K
A
 
A
L
 
L
-
 
F
Q
 
P
M
 
P
G
 
G
E
 
H
L
 
S
L
 
A
L
 
I
I
 
L
N
 
N
D
|
D
F
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
G
A
 
G
L
 
F
G
 
G
M
 
V
T
 
L
R
 
A
V
 
V
G
 
S
E
 
D
A
 
A
G
 
H
R
 
V
R
 
F
M
 
S
I
 
E
C
 
Y
A
 
F
G
 
G
-
 
V
-
 
M
-
 
W
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
Q
-
 
W
-
 
R
-
 
T
-
 
C
E
 
E
A
 
Q
E
 
E
P
 
P
D
 
A
A
 
G
P
 
S
A
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
C
L
 
L
V
 
V
I
 
L
G
 
A
P
 
P
G
|
G
T
|
T
G
 
G
L
|
L
G
|
G
V
 
S
A
 
S
G
 
-
L
 
-
L
 
L
P
 
I
L
 
Y
G
 
Y
G
 
N
G
 
P
S
 
Q
W
 
H
R
 
I
A
 
V
L
 
V
P
 
P
G
 
L
E
|
E
G
 
L
G
 
G
H
 
S
V
 
Q
D
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
M
A
 
R
D
 
K
A
 
-
H
 
-
E
 
D
A
 
I
A
 
D
L
 
Y
W
 
I
Q
 
Q
M
 
T
L
 
L
F
 
H
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
G
 
K
-
 
L
H
 
F
V
 
P
R
 
N
A
 
Y
E
|
E
D
 
N
V
 
M
L
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
E
L
 
F
L
 
H
Y
 
Y
R
 
R
T
 
Q
V
 
V
C
 
-
T
 
-
V
 
V
A
 
R
G
 
G
L
 
S
A
 
R
P
 
P
R
 
P
L
 
-
A
 
C
S
 
S
P
x
A
A
 
G
E
 
E
V
 
I
T
x
A
A
 
K
A
 
L
A
 
A
L
 
S
A
 
E
G
 
G
D
 
D
H
 
A
V
 
N
A
 
A
V
 
C
A
 
K
T
 
A
L
 
M
E
 
K
Q
 
K
F
 
Y
C
 
H
V
 
E
W
 
Y
L
 
L
G
 
M
R
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5brhA Crystal structure of trypanosoma cruzi glucokinase in complex with inhibitor dbt-glcn (see paper)
28% identity, 76% coverage: 3:244/319 of query aligns to 24:289/367 of 5brhA

query
sites
5brhA
L
 
L
A
 
T
L
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
S
A
 
A
R
 
R
F
 
M
A
 
G
L
 
F
W
 
V
R
 
R
D
 
E
S
 
G
R
 
K
L
 
N
E
 
D
S
 
S
V
 
V
R
 
H
-
 
A
V
 
C
L
 
V
A
 
T
A
 
R
A
 
Y
D
 
S
F
 
M
A
 
K
T
 
R
P
 
K
E
 
D
M
 
I
A
 
T
-
 
E
-
 
L
V
 
I
E
 
E
Y
 
F
Y
 
F
L
 
N
A
 
E
S
 
I
L
 
I
G
 
E
L
 
L
A
 
M
P
 
P
G
 
A
S
 
S
-
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
R
V
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
G
C
 
V
L
 
I
A
 
N
C
 
V
A
 
P
G
|
G
P
|
P
V
 
V
K
 
T
G
 
G
E
 
G
Q
 
A
F
 
V
-
 
G
-
 
G
T
 
P
F
 
F
T
x
N
N
 
N
N
 
L
H
 
K
W
 
G
R
 
I
L
 
A
T
 
R
R
 
L
S
 
S
D
 
D
F
 
Y
C
 
P
G
 
K
A
 
A
L
 
L
-
 
F
Q
 
P
M
 
P
G
 
G
E
 
R
L
 
S
L
 
A
L
 
I
I
 
L
N
|
N
D
|
D
F
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
G
A
 
G
L
 
F
G
 
G
M
 
V
T
 
L
R
 
A
V
 
V
G
 
S
E
 
D
A
 
A
G
 
H
R
 
V
R
 
F
M
 
S
I
 
E
C
 
Y
A
 
F
G
 
G
-
 
V
-
 
M
-
 
W
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
Q
-
 
W
-
 
R
-
 
T
-
 
C
E
 
E
A
 
Q
E
 
E
P
 
P
D
 
A
A
 
G
P
 
S
A
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
C
L
 
L
V
 
V
I
 
L
G
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
G
|
G
V
 
S
A
 
S
G
 
L
L
 
I
L
 
Y
-
 
Y
-
 
N
P
 
P
L
 
M
G
 
N
G
 
Q
G
 
Q
S
 
H
W
 
I
R
 
-
A
 
V
L
 
V
P
 
P
G
 
L
E
|
E
G
 
L
G
 
G
H
 
S
V
 
Q
D
 
T
L
 
I
P
 
P
V
 
M
A
 
R
D
 
K
A
 
-
H
 
-
E
 
D
A
 
I
A
 
D
L
 
Y
W
 
I
Q
 
Q
M
 
T
L
 
L
F
 
H
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
G
 
K
H
 
L
V
 
L
-
 
P
R
 
N
A
 
Y
E
|
E
D
 
N
V
 
M
L
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
E
L
 
F
L
 
H
Y
 
Y
R
 
R
T
 
Q
V
 
V
C
 
-
T
 
-
V
 
V
A
 
R
G
 
G
L
 
S
A
 
R
P
 
P
R
 
P
L
 
-
A
 
C
S
 
S
P
 
A
A
 
G
E
 
E
V
 
I
T
 
A
A
 
K
A
 
L
A
 
A
L
 
S
A
 
E
G
 
G
D
 
D
H
 
A
V
 
N
A
 
A
V
 
C
A
 
K
T
 
A
L
 
M
E
 
K
Q
 
K
F
 
Y
C
 
H
V
 
E
W
 
Y
L
 
L
G
 
M
R
 
R
V
 
V

5breA Crystal structure of trypanosoma cruzi glucokinase in complex with inhibitor cbz-glcn (see paper)
28% identity, 76% coverage: 3:244/319 of query aligns to 24:289/367 of 5breA

query
sites
5breA
L
 
L
A
 
T
L
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
S
A
 
A
R
 
R
F
 
M
A
 
G
L
 
F
W
 
V
R
 
R
D
 
E
S
 
G
R
 
K
L
 
N
E
 
D
S
 
S
V
 
V
R
 
H
-
 
A
V
 
C
L
 
V
A
 
T
A
 
R
A
 
Y
D
 
S
F
 
M
A
 
K
T
 
R
P
 
K
E
 
D
M
 
I
A
 
T
-
 
E
-
 
L
V
 
I
E
 
E
Y
 
F
Y
 
F
L
 
N
A
 
E
S
 
I
L
 
I
G
 
E
L
 
L
A
 
M
P
 
P
G
 
A
S
 
S
-
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
R
V
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
G
C
 
V
L
 
I
A
 
N
C
 
V
A
 
P
G
|
G
P
|
P
V
 
V
K
 
T
G
 
G
E
 
G
Q
 
A
F
 
V
-
 
G
-
 
G
T
x
P
F
 
F
T
x
N
N
 
N
N
 
L
H
 
K
W
 
G
R
 
I
L
 
A
T
 
R
R
 
L
S
 
S
D
 
D
F
 
Y
C
 
P
G
 
K
A
 
A
L
 
L
-
 
F
Q
 
P
M
 
P
G
 
G
E
 
R
L
 
S
L
 
A
L
 
I
I
 
L
N
|
N
D
|
D
F
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
G
A
 
G
L
 
F
G
 
G
M
 
V
T
 
L
R
 
A
V
 
V
G
 
S
E
 
D
A
 
A
G
 
H
R
 
V
R
 
F
M
 
S
I
 
E
C
 
Y
A
 
F
G
 
G
-
 
V
-
 
M
-
 
W
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
Q
-
 
W
-
 
R
-
 
T
-
 
C
E
 
E
A
 
Q
E
 
E
P
 
P
D
 
A
A
 
G
P
 
S
A
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
C
L
 
L
V
 
V
I
 
L
G
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
G
|
G
V
 
S
A
 
S
G
 
L
L
 
I
L
 
Y
-
 
Y
-
 
N
P
 
P
L
 
M
G
 
N
G
 
Q
G
 
Q
S
 
H
W
 
I
R
 
-
A
 
V
L
 
V
P
 
P
G
 
L
E
|
E
G
 
L
G
 
G
H
 
S
V
 
Q
D
 
T
L
 
I
P
 
P
V
 
M
A
 
R
D
 
K
A
 
-
H
 
-
E
 
D
A
 
I
A
 
D
L
 
Y
W
 
I
Q
 
Q
M
 
T
L
 
L
F
 
H
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
G
 
K
H
 
L
V
 
L
-
 
P
R
 
N
A
 
Y
E
|
E
D
 
N
V
 
M
L
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
E
L
 
F
L
 
H
Y
 
Y
R
 
R
T
 
Q
V
 
V
C
 
-
T
 
-
V
 
V
A
 
R
G
 
G
L
 
S
A
 
R
P
 
P
R
 
P
L
 
-
A
 
C
S
 
S
P
 
A
A
 
G
E
 
E
V
 
I
T
 
A
A
 
K
A
 
L
A
 
A
L
 
S
A
 
E
G
 
G
D
 
D
H
 
A
V
 
N
A
 
A
V
 
C
A
 
K
T
 
A
L
 
M
E
 
K
Q
 
K
F
 
Y
C
 
H
V
 
E
W
 
Y
L
 
L
G
 
M
R
 
R
V
 
V

5brdA Crystal structure of trypanosoma cruzi glucokinase in complex with inhibitor benz-glcn (see paper)
28% identity, 76% coverage: 3:244/319 of query aligns to 24:289/367 of 5brdA

query
sites
5brdA
L
 
L
A
 
T
L
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
S
A
 
A
R
 
R
F
 
M
A
 
G
L
 
F
W
 
V
R
 
R
D
 
E
S
 
G
R
 
K
L
 
N
E
 
D
S
 
S
V
 
V
R
 
H
-
 
A
V
 
C
L
 
V
A
 
T
A
 
R
A
 
Y
D
 
S
F
 
M
A
 
K
T
 
R
P
 
K
E
 
D
M
 
I
A
 
T
-
 
E
-
 
L
V
 
I
E
 
E
Y
 
F
Y
 
F
L
 
N
A
 
E
S
 
I
L
 
I
G
 
E
L
 
L
A
 
M
P
 
P
G
 
A
S
 
S
-
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
R
V
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
G
C
 
V
L
 
I
A
 
N
C
 
V
A
 
P
G
|
G
P
|
P
V
 
V
K
 
T
G
 
G
E
 
G
Q
 
A
F
 
V
-
 
G
-
 
G
T
x
P
F
 
F
T
x
N
N
 
N
N
 
L
H
 
K
W
 
G
R
 
I
L
 
A
T
 
R
R
 
L
S
 
S
D
 
D
F
 
Y
C
 
P
G
 
K
A
 
A
L
 
L
-
 
F
Q
 
P
M
 
P
G
 
G
E
 
R
L
 
S
L
 
A
L
 
I
I
 
L
N
|
N
D
|
D
F
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
G
A
 
G
L
 
F
G
 
G
M
 
V
T
 
L
R
 
A
V
 
V
G
 
S
E
 
D
A
 
A
G
 
H
R
 
V
R
 
F
M
 
S
I
 
E
C
 
Y
A
 
F
G
 
G
-
 
V
-
 
M
-
 
W
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
Q
-
 
W
-
 
R
-
 
T
-
 
C
E
 
E
A
 
Q
E
 
E
P
 
P
D
 
A
A
 
G
P
 
S
A
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
C
L
 
L
V
 
V
I
 
L
G
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
G
|
G
V
 
S
A
 
S
G
 
L
L
 
I
L
 
Y
-
 
Y
-
 
N
P
 
P
L
 
M
G
 
N
G
 
Q
G
 
Q
S
 
H
W
 
I
R
 
-
A
 
V
L
 
V
P
 
P
G
 
L
E
|
E
G
 
L
G
 
G
H
x
S
V
 
Q
D
 
T
L
 
I
P
 
P
V
 
M
A
 
R
D
 
K
A
 
-
H
 
-
E
 
D
A
 
I
A
 
D
L
 
Y
W
 
I
Q
 
Q
M
 
T
L
 
L
F
 
H
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
G
 
K
H
 
L
V
 
L
-
 
P
R
 
N
A
 
Y
E
|
E
D
 
N
V
 
M
L
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
E
L
 
F
L
 
H
Y
 
Y
R
 
R
T
 
Q
V
 
V
C
 
-
T
 
-
V
 
V
A
 
R
G
 
G
L
 
S
A
 
R
P
 
P
R
 
P
L
 
-
A
 
C
S
 
S
P
 
A
A
 
G
E
 
E
V
 
I
T
 
A
A
 
K
A
 
L
A
 
A
L
 
S
A
 
E
G
 
G
D
 
D
H
 
A
V
 
N
A
 
A
V
 
C
A
 
K
T
 
A
L
 
M
E
 
K
Q
 
K
F
 
Y
C
 
H
V
 
E
W
 
Y
L
 
L
G
 
M
R
 
R
V
 
V

5brfA Crystal structure of trypanosoma cruzi glucokinase in complex with inhibitor hpop-glcn (see paper)
28% identity, 76% coverage: 3:244/319 of query aligns to 24:286/364 of 5brfA

query
sites
5brfA
L
 
L
A
 
T
L
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
S
A
 
A
R
 
R
F
 
M
A
 
G
L
 
F
W
 
V
R
 
R
D
 
E
S
 
D
R
 
S
L
 
V
E
 
H
S
 
A
V
 
C
R
 
V
V
 
T
L
 
R
A
 
Y
A
 
S
A
 
M
D
 
K
F
 
R
A
 
K
T
 
D
P
 
I
E
 
T
M
 
E
A
 
L
V
 
I
E
 
E
Y
 
F
Y
 
F
L
 
N
A
 
E
S
 
I
L
 
I
G
 
E
L
 
L
A
 
M
P
 
P
G
 
A
S
 
S
-
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
R
V
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
G
C
 
V
L
 
I
A
 
N
C
 
V
A
 
P
G
|
G
P
 
P
V
 
V
K
 
T
G
 
G
E
 
G
Q
 
A
F
 
V
-
 
G
-
 
G
T
x
P
F
|
F
T
x
N
N
 
N
N
 
L
H
 
K
W
 
G
R
 
I
L
 
A
T
 
R
R
 
L
S
 
S
D
 
D
F
 
Y
C
 
P
G
 
K
A
 
A
L
 
L
-
 
F
Q
 
P
M
 
P
G
 
G
E
 
R
L
 
S
L
 
A
L
 
I
I
 
L
N
|
N
D
|
D
F
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
G
A
 
G
L
 
F
G
 
G
M
 
V
T
 
L
R
 
A
V
 
V
G
 
S
E
 
D
A
 
A
G
 
H
R
 
V
R
 
F
M
 
S
I
 
E
C
 
Y
A
 
F
G
 
G
-
 
V
-
 
M
-
 
W
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
Q
-
 
W
-
 
R
-
 
T
-
 
C
E
 
E
A
 
Q
E
 
E
P
 
P
D
 
A
A
 
G
P
 
S
A
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
C
L
 
L
V
 
V
I
 
L
G
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
|
G
L
 
L
G
|
G
V
 
S
A
 
S
G
 
L
L
 
I
L
 
Y
-
 
Y
-
 
N
P
 
P
L
 
M
G
 
N
G
 
Q
G
 
Q
S
 
H
W
 
I
R
 
-
A
 
V
L
 
V
P
 
P
G
 
L
E
|
E
G
 
L
G
 
G
H
 
S
V
 
Q
D
 
T
L
 
I
P
 
P
V
 
M
A
 
R
D
 
K
A
 
-
H
 
-
E
 
D
A
 
I
A
 
D
L
 
Y
W
 
I
Q
 
Q
M
 
T
L
 
L
F
 
H
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
G
 
K
H
 
L
V
 
L
-
 
P
R
 
N
A
 
Y
E
|
E
D
 
N
V
 
M
L
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
E
L
 
F
L
 
H
Y
 
Y
R
 
R
T
 
Q
V
 
V
C
 
-
T
 
-
V
 
V
A
 
R
G
 
G
L
 
S
A
 
R
P
 
P
R
 
P
L
 
-
A
 
C
S
 
S
P
 
A
A
 
G
E
 
E
V
 
I
T
 
A
A
 
K
A
 
L
A
 
A
L
 
S
A
 
E
G
 
G
D
 
D
H
 
A
V
 
N
A
 
A
V
 
C
A
 
K
T
 
A
L
 
M
E
 
K
Q
 
K
F
 
Y
C
 
H
V
 
E
W
 
Y
L
 
L
G
 
M
R
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

6da0A Crystal structure of glucokinase (nfhk) from naegleria fowleri (see paper)
24% identity, 83% coverage: 8:273/319 of query aligns to 32:329/378 of 6da0A

query
sites
6da0A
D
 
D
I
 
V
G
|
G
G
 
A
T
|
T
N
|
N
A
 
T
R
 
R
F
 
I
A
 
A
L
 
I
-
 
Q
W
 
F
R
 
I
D
 
I
S
 
N
R
 
E
L
 
D
E
 
Q
S
 
D
V
 
D
R
 
E
V
 
V
L
 
F
A
 
M
A
 
T
A
 
K
D
 
F
F
 
P
A
 
C
T
 
N
P
 
T
E
 
S
M
 
T
A
 
H
V
 
L
E
 
A
Y
 
N
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
A
L
 
Y
G
 
G
L
 
K
A
 
A
-
 
M
-
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
G
P
 
K
G
 
G
S
 
S
V
 
A
E
 
-
A
 
A
A
 
G
C
 
S
L
 
I
A
 
A
C
 
L
A
 
A
G
|
G
P
 
P
V
 
V
K
 
T
G
 
G
E
 
D
Q
 
K
F
 
V
T
 
R
F
 
I
T
|
T
N
 
N
N
 
-
H
 
-
W
 
Y
R
 
K
L
 
E
T
 
H
R
 
D
S
 
Q
D
 
E
F
 
F
C
 
F
G
 
Y
A
 
S
L
 
-
Q
 
Q
M
 
L
G
 
P
E
 
D
L
 
T
L
 
L
L
 
F
-
 
P
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
N
-
 
T
-
 
F
I
 
L
N
|
N
D
|
D
F
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
S
A
 
C
L
 
Y
G
 
G
M
 
I
T
 
I
R
 
N
V
 
V
G
 
G
E
 
T
A
 
N
G
 
N
R
 
R
-
 
L
-
 
H
R
 
E
M
 
F
I
 
F
C
 
C
A
 
P
G
 
I
E
 
D
A
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
N
-
 
Y
-
 
A
-
 
T
-
 
S
-
 
Q
-
 
T
-
 
V
-
 
R
-
 
L
E
 
S
P
 
D
D
 
T
A
 
S
P
 
E
A
 
Y
L
 
A
V
 
V
I
 
L
G
 
A
P
 
M
G
|
G
T
|
T
G
|
G
L
|
L
G
|
G
V
 
T
A
 
G
G
 
L
L
 
I
L
 
V
P
 
G
L
 
S
G
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
K
W
 
F
R
 
N
A
 
V
L
 
I
P
 
P
G
 
L
E
|
E
G
 
A
G
 
G
H
|
H
V
 
V
D
 
H
L
 
I
P
 
A
-
 
T
-
 
P
-
 
G
V
 
V
A
 
N
D
 
S
A
 
E
H
 
H
E
 
F
A
 
K
A
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
F
L
 
L
W
 
S
Q
 
Q
M
 
K
L
 
I
F
 
Y
A
 
G
Q
 
G
L
 
A
G
 
Y
H
 
P
V
 
I
R
 
E
A
 
Y
E
|
E
D
 
D
V
 
I
L
 
C
S
 
S
G
|
G
G
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
E
L
 
F
L
 
C
Y
 
Y
R
 
E
T
 
F
V
 
E
C
 
I
T
 
R
V
 
N
A
 
D
G
 
P
L
 
N
A
 
A
P
 
V
R
 
R
L
 
-
A
 
-
S
 
K
P
 
T
A
|
A
E
 
S
V
 
Q
T
 
I
A
|
A
A
 
E
A
 
S
L
 
Y
A
 
S
G
 
T
D
 
D
H
 
T
V
 
Y
A
 
A
V
 
R
A
 
Q
T
 
A
L
 
M
E
 
I
Q
 
T
F
 
H
C
 
Y
V
 
R
W
 
Y
L
 
L
G
 
M
R
 
K
V
 
A
A
 
A
G
 
Q
N
 
N
N
 
I
V
 
A
L
 
V
T
 
L
L
 
I
G
 
P
A
 
T
R
 
C
G
 
R
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
I
 
F
V
 
A
G
 
G
G
 
D
V
x
N
V
 
Q
P
 
V
R
 
F
F
x
N
A
 
E
D
 
D
F
 
F
F
 
F
A
 
K

Query Sequence

>GFF836 Psest_0850 glucokinase, proteobacterial type
MRLALVGDIGGTNARFALWRDSRLESVRVLAAADFATPEMAVEYYLASLGLAPGSVEAAC
LACAGPVKGEQFTFTNNHWRLTRSDFCGALQMGELLLINDFAAMALGMTRVGEAGRRMIC
AGEAEPDAPALVIGPGTGLGVAGLLPLGGGSWRALPGEGGHVDLPVADAHEAALWQMLFA
QLGHVRAEDVLSGGGLLLLYRTVCTVAGLAPRLASPAEVTAAALAGDHVAVATLEQFCVW
LGRVAGNNVLTLGARGGVYIVGGVVPRFADFFAASGFARGFTSKGCMSRYLGDVPVWLVT
AEFPGLEGAGVALEQALAR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory