SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF843 FitnessBrowser__WCS417:GFF843 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q94JV5 Deaminated glutathione amidase, chloroplastic/cytosolic; dGSH amidase; Nitrilase-like protein 2; Protein nitrilase 1 homolog; AtNit1; Protein Nit1 homolog; EC 3.5.1.128 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
43% identity, 93% coverage: 7:268/282 of query aligns to 43:302/307 of Q94JV5

query
sites
Q94JV5
Q
 
Q
M
 
M
V
 
T
S
 
S
Q
 
V
S
 
N
D
 
D
V
 
L
L
 
M
A
 
T
N
 
N
L
 
F
A
 
A
Q
 
T
A
 
C
R
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
V
E
 
Q
H
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
I
V
 
C
L
 
F
P
 
P
E
 
E
N
 
N
F
 
F
A
 
S
A
 
F
M
 
V
G
 
G
R
 
D
R
 
K
D
 
E
V
 
G
A
 
E
D
 
S
I
 
V
G
 
K
R
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
P
L
 
L
G
 
-
E
 
D
G
 
G
P
 
P
I
 
V
L
 
M
P
 
E
W
 
R
L
 
Y
K
 
C
Q
 
S
T
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
S
T
 
N
L
 
I
W
 
W
I
 
L
V
 
S
A
 
L
G
 
G
T
 
G
L
 
F
P
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
K
 
Q
D
 
E
R
 
R
P
 
F
N
 
D
A
 
-
K
 
D
S
 
T
N
 
H
A
 
L
C
 
C
S
 
N
-
 
T
-
 
H
L
 
V
L
 
V
V
 
I
D
 
D
D
 
D
Q
 
A
G
 
G
E
 
M
I
 
I
V
 
R
A
 
D
R
 
T
Y
 
Y
D
 
Q
K
 
K
L
 
M
H
 
H
L
 
L
F
 
F
D
 
D
V
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
P
D
 
G
A
 
G
R
 
S
G
 
S
R
 
-
Y
 
Y
R
 
K
E
 
E
S
 
S
D
 
S
D
 
F
Y
 
T
A
 
V
F
 
P
G
 
G
D
 
T
H
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
S
A
 
V
D
 
D
T
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
V
C
 
C
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
R
 
R
F
 
F
P
 
P
E
 
K
L
 
I
Y
 
Y
S
 
Q
E
 
Q
L
 
L
R
 
R
-
 
F
A
 
E
A
 
Q
G
 
K
A
 
A
E
 
Q
L
 
V
I
 
L
T
 
L
A
 
V
P
 
P
S
 
S
A
 
A
F
 
F
T
 
T
A
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
E
A
 
A
H
 
H
W
 
W
D
 
E
V
 
I
L
 
L
I
 
L
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
C
 
C
Y
 
Y
L
 
V
L
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
G
 
A
G
 
G
V
 
K
H
 
H
P
 
N
G
 
E
P
 
K
R
 
R
E
 
E
T
 
S
Y
 
Y
G
 
G
H
 
D
A
 
T
A
 
L
I
 
I
V
 
I
D
 
D
P
 
P
W
 
W
G
 
G
R
 
T
V
 
V
L
 
V
A
 
G
Q
 
R
-
 
L
-
 
P
Q
 
D
D
 
R
K
 
V
G
 
S
E
 
T
A
 
G
V
 
I
L
 
V
L
 
V
A
 
A
E
 
D
R
 
I
D
 
D
S
 
F
S
 
S
E
 
L
Q
 
I
A
 
D
S
 
S
I
 
V
R
 
R
A
 
T
R
 
K
M
 
M
P
 
P
V
 
I
V
 
D
N
 
K
H
 
Q
R
 
R

Sites not aligning to the query:

P47016 Deaminated glutathione amidase; dGSH amidase; Nitrilase homolog 1; EC 3.5.1.128 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
33% identity, 94% coverage: 4:269/282 of query aligns to 9:302/307 of P47016

query
sites
P47016
A
 
A
V
 
V
I
 
A
Q
 
Q
M
 
L
V
 
C
S
 
S
Q
 
S
S
 
A
D
 
D
V
 
L
L
 
T
A
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
K
Q
 
V
A
 
V
R
 
K
R
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
S
H
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
Q
G
 
K
G
 
K
A
 
A
K
 
D
L
 
V
A
 
V
V
 
F
L
 
L
P
 
P
E
 
E
N
 
A
F
 
S
A
 
D
A
 
Y
M
 
L
G
 
S
R
 
Q
R
 
N
D
 
P
V
 
L
A
 
H
D
 
S
I
 
R
G
 
Y
R
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
K
L
 
S
G
 
P
-
 
K
-
 
F
-
 
I
-
 
R
-
 
Q
-
 
L
E
 
Q
G
 
S
P
 
S
I
 
I
L
 
T
P
 
D
W
 
L
L
 
V
K
 
R
Q
 
D
T
 
N
A
 
S
R
 
R
D
 
N
L
 
I
T
 
D
L
 
-
W
 
-
I
 
-
V
 
V
A
 
S
G
 
I
T
 
G
L
 
V
P
 
H
L
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
S
D
 
E
R
 
Q
P
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
G
N
 
N
A
 
D
K
 
R
S
 
V
N
 
R
A
 
N
C
 
V
S
 
L
L
 
L
L
 
Y
V
 
I
D
 
D
D
 
H
Q
 
E
G
 
G
E
 
K
I
 
I
V
 
L
A
 
Q
R
 
E
Y
 
Y
D
 
Q
K
 
K
L
 
L
H
 
H
L
 
L
F
 
F
D
 
D
V
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
P
D
 
N
A
 
G
R
 
-
G
 
P
R
 
I
Y
 
L
R
 
K
E
 
E
S
 
S
D
 
K
D
 
S
Y
 
V
A
 
Q
F
 
P
G
 
G
D
 
K
H
 
A
V
 
I
V
 
P
-
 
D
V
 
I
A
 
I
D
 
E
T
 
S
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
S
T
 
A
V
 
I
C
|
C
Y
 
Y
D
 
D
L
 
I
R
|
R
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
F
Y
 
S
S
 
L
E
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
S
A
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
I
 
L
T
 
C
A
 
F
P
 
P
S
 
S
A
 
A
F
 
F
T
 
T
A
 
I
V
 
K
T
|
T
G
 
G
A
 
E
A
 
A
H
 
H
W
 
W
D
 
E
V
 
L
L
 
L
I
 
G
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
D
T
 
T
Q
 
Q
C
 
C
Y
 
Y
L
 
V
L
 
L
A
 
M
A
 
P
A
 
G
Q
 
Q
G
 
V
G
 
G
V
 
M
H
 
H
-
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
W
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
S
-
 
H
-
 
M
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
K
P
 
S
G
 
S
P
 
R
R
 
R
E
 
E
T
 
S
Y
 
W
G
 
G
H
 
H
A
 
S
A
 
M
I
 
V
V
 
I
D
 
D
P
 
P
W
 
W
G
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
I
A
 
A
Q
 
H
Q
 
A
D
 
D
K
 
P
-
 
S
-
 
T
-
 
V
G
 
G
E
 
P
A
 
Q
V
 
L
L
 
I
L
 
L
A
 
A
E
 
D
R
 
L
D
 
D
S
 
R
S
 
E
E
 
L
Q
 
L
A
 
Q
S
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
N
R
 
K
M
 
M
P
 
P
V
 
L
V
 
W
N
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
R

4hg5A Structural insights into yeast nit2: wild-type yeast nit2 in complex with oxaloacetate (see paper)
33% identity, 94% coverage: 4:269/282 of query aligns to 6:299/304 of 4hg5A

query
sites
4hg5A
A
 
A
V
 
V
I
 
A
Q
 
Q
M
 
L
V
 
C
S
 
S
Q
 
S
S
 
A
D
 
D
V
 
L
L
 
T
A
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
K
Q
 
V
A
 
V
R
 
K
R
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
S
H
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
Q
G
 
K
G
 
K
A
 
A
K
 
D
L
 
V
A
 
V
V
 
F
L
 
L
P
 
P
E
 
E
N
 
A
F
 
S
A
 
D
A
 
Y
M
 
L
G
 
S
R
 
Q
R
 
N
D
 
P
V
 
L
A
 
H
D
 
S
I
 
R
G
 
Y
R
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
K
L
 
S
G
 
P
-
 
K
-
 
F
-
 
I
-
 
R
-
 
Q
-
 
L
E
 
Q
G
 
S
P
 
S
I
 
I
L
 
T
P
 
D
W
 
L
L
 
V
K
 
R
Q
 
D
T
 
N
A
 
S
R
 
R
D
 
N
L
 
I
T
 
D
L
 
-
W
 
-
I
 
-
V
 
V
A
 
S
G
 
I
T
 
G
L
 
V
P
 
H
L
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
S
D
 
E
R
 
Q
P
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
G
N
 
N
A
 
D
K
 
R
S
 
V
N
 
R
A
x
N
C
 
V
S
 
L
L
 
L
L
 
Y
V
 
I
D
 
D
D
 
H
Q
 
E
G
 
G
E
 
K
I
 
I
V
 
L
A
 
Q
R
 
E
Y
 
Y
D
 
Q
K
|
K
L
 
L
H
 
H
L
 
L
F
|
F
D
 
D
V
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
P
D
 
N
A
 
G
R
 
-
G
 
P
R
 
I
Y
 
L
R
 
K
E
|
E
S
 
S
D
 
K
D
 
S
Y
 
V
A
 
Q
F
 
P
G
 
G
D
 
K
H
 
A
V
 
I
V
 
P
-
 
D
V
 
I
A
 
I
D
 
E
T
 
S
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
S
T
 
A
V
 
I
C
|
C
Y
|
Y
D
 
D
L
 
I
R
|
R
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
F
Y
 
S
S
 
L
E
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
S
A
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
I
 
L
T
 
C
A
 
F
P
 
P
S
 
S
A
|
A
F
|
F
T
|
T
A
 
I
V
 
K
T
|
T
G
 
G
A
 
E
A
 
A
H
 
H
W
 
W
D
 
E
V
 
L
L
 
L
I
 
G
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
D
T
 
T
Q
 
Q
C
 
C
Y
 
Y
L
 
V
L
 
L
A
 
M
A
 
P
A
 
G
Q
 
Q
G
 
V
G
 
G
V
 
M
H
 
H
-
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
W
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
S
-
 
H
-
 
M
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
K
P
 
S
G
 
S
P
 
R
R
 
R
E
 
E
T
 
S
Y
 
W
G
 
G
H
 
H
A
 
S
A
 
M
I
 
V
V
 
I
D
 
D
P
 
P
W
 
W
G
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
I
A
 
A
Q
 
H
Q
 
A
D
 
D
K
 
P
-
 
S
-
 
T
-
 
V
G
 
G
E
 
P
A
 
Q
V
 
L
L
 
I
L
 
L
A
 
A
E
 
D
R
 
L
D
 
D
S
 
R
S
 
E
E
 
L
Q
 
L
A
 
Q
S
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
N
R
 
K
M
 
M
P
 
P
V
 
L
V
 
W
N
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
R

4hg3A Structural insights into yeast nit2: wild-type yeast nit2 in complex with alpha-ketoglutarate (see paper)
33% identity, 94% coverage: 4:269/282 of query aligns to 6:299/304 of 4hg3A

query
sites
4hg3A
A
 
A
V
 
V
I
 
A
Q
 
Q
M
 
L
V
 
C
S
 
S
Q
 
S
S
 
A
D
 
D
V
 
L
L
 
T
A
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
K
Q
 
V
A
 
V
R
 
K
R
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
S
H
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
Q
G
 
K
G
 
K
A
 
A
K
 
D
L
 
V
A
 
V
V
 
F
L
 
L
P
 
P
E
|
E
N
 
A
F
 
S
A
 
D
A
 
Y
M
 
L
G
 
S
R
 
Q
R
 
N
D
 
P
V
 
L
A
 
H
D
 
S
I
 
R
G
 
Y
R
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
K
L
 
S
G
 
P
-
 
K
-
 
F
-
 
I
-
 
R
-
 
Q
-
 
L
E
 
Q
G
 
S
P
 
S
I
 
I
L
 
T
P
 
D
W
 
L
L
 
V
K
 
R
Q
 
D
T
 
N
A
 
S
R
 
R
D
 
N
L
 
I
T
 
D
L
 
-
W
 
-
I
 
-
V
 
V
A
 
S
G
 
I
T
 
G
L
 
V
P
 
H
L
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
S
D
 
E
R
 
Q
P
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
G
N
 
N
A
 
D
K
 
R
S
 
V
N
 
R
A
x
N
C
 
V
S
 
L
L
 
L
L
 
Y
V
 
I
D
 
D
D
 
H
Q
 
E
G
 
G
E
 
K
I
 
I
V
 
L
A
 
Q
R
 
E
Y
 
Y
D
 
Q
K
|
K
L
 
L
H
 
H
L
 
L
F
|
F
D
 
D
V
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
P
D
 
N
A
 
G
R
 
-
G
 
P
R
 
I
Y
 
L
R
 
K
E
|
E
S
 
S
D
 
K
D
 
S
Y
 
V
A
 
Q
F
 
P
G
 
G
D
 
K
H
 
A
V
 
I
V
 
P
-
 
D
V
 
I
A
 
I
D
 
E
T
 
S
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
S
T
 
A
V
 
I
C
|
C
Y
|
Y
D
 
D
L
 
I
R
|
R
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
F
Y
 
S
S
 
L
E
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
S
A
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
I
 
L
T
 
C
A
 
F
P
 
P
S
 
S
A
|
A
F
|
F
T
|
T
A
 
I
V
 
K
T
|
T
G
 
G
A
 
E
A
 
A
H
 
H
W
 
W
D
 
E
V
 
L
L
 
L
I
 
G
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
D
T
 
T
Q
 
Q
C
 
C
Y
 
Y
L
 
V
L
 
L
A
 
M
A
 
P
A
 
G
Q
 
Q
G
 
V
G
 
G
V
 
M
H
 
H
-
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
W
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
S
-
 
H
-
 
M
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
K
P
 
S
G
 
S
P
 
R
R
 
R
E
 
E
T
 
S
Y
 
W
G
 
G
H
 
H
A
 
S
A
 
M
I
 
V
V
 
I
D
 
D
P
 
P
W
 
W
G
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
I
A
 
A
Q
 
H
Q
 
A
D
 
D
K
 
P
-
 
S
-
 
T
-
 
V
G
 
G
E
 
P
A
 
Q
V
 
L
L
 
I
L
 
L
A
 
A
E
 
D
R
 
L
D
 
D
S
 
R
S
 
E
E
 
L
Q
 
L
A
 
Q
S
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
N
R
 
K
M
 
M
P
 
P
V
 
L
V
 
W
N
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
R

4hgdA Structural insights into yeast nit2: c169s mutant of yeast nit2 in complex with an endogenous peptide-like ligand (see paper)
33% identity, 94% coverage: 4:269/282 of query aligns to 5:295/299 of 4hgdA

query
sites
4hgdA
A
 
A
V
 
V
I
 
A
Q
 
Q
M
 
L
V
 
C
S
 
S
Q
 
S
S
 
A
D
 
D
V
 
L
L
 
T
A
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
K
Q
 
V
A
 
V
R
 
K
R
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
S
H
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
Q
G
 
K
G
 
K
A
 
A
K
 
D
L
 
V
A
 
V
V
 
F
L
 
L
P
 
P
E
|
E
N
 
A
F
 
S
A
 
D
A
 
Y
M
x
L
G
 
S
R
 
Q
R
 
N
D
 
P
V
 
L
A
 
H
D
 
S
I
 
R
G
 
Y
R
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
K
L
 
S
G
 
P
-
 
K
-
 
F
-
 
I
-
 
R
-
 
Q
-
 
L
E
 
Q
G
 
S
P
 
S
I
 
I
L
 
T
P
 
D
W
 
L
L
 
V
K
 
R
Q
 
D
T
 
N
A
 
S
R
 
R
D
 
N
L
 
I
T
 
D
L
 
-
W
 
-
I
 
-
V
 
V
A
 
S
G
 
I
T
 
G
L
 
V
P
x
H
L
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
S
D
 
E
R
 
Q
P
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
G
N
 
N
A
 
D
K
 
R
S
 
V
N
 
R
A
 
N
C
 
V
S
 
L
L
 
L
L
 
Y
V
 
I
D
 
D
D
 
H
Q
 
E
G
 
G
E
 
K
I
 
I
V
 
L
A
 
Q
R
 
E
Y
 
Y
D
 
Q
K
|
K
L
 
L
H
 
H
L
 
L
F
|
F
D
 
D
V
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
P
D
 
N
A
 
P
R
 
I
G
 
-
R
 
-
Y
 
L
R
 
K
E
|
E
S
 
S
D
 
K
D
 
S
Y
 
V
A
 
Q
F
 
P
G
 
G
D
 
K
H
 
A
V
 
I
V
 
P
-
 
D
V
 
I
A
 
I
D
 
E
T
 
S
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
S
T
 
A
V
 
I
C
x
S
Y
|
Y
D
 
D
L
 
I
R
|
R
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
F
Y
 
S
S
 
L
E
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
S
A
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
I
 
L
T
 
C
A
 
F
P
 
P
S
 
S
A
|
A
F
|
F
T
|
T
A
 
I
V
 
K
T
|
T
G
 
G
A
 
E
A
 
A
H
 
H
W
 
W
D
 
E
V
 
L
L
 
L
I
 
G
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
D
T
 
T
Q
 
Q
C
 
C
Y
 
Y
L
 
V
L
 
L
A
 
M
A
 
P
A
 
G
Q
 
Q
G
 
V
G
 
G
V
 
M
H
 
H
-
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
W
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
S
-
 
H
-
 
M
-
 
S
-
 
A
-
 
L
P
 
E
G
 
K
P
 
R
R
|
R
E
 
E
T
 
S
Y
 
W
G
 
G
H
 
H
A
 
S
A
 
M
I
 
V
V
 
I
D
 
D
P
 
P
W
 
W
G
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
I
A
 
A
Q
 
H
Q
 
A
D
 
D
K
 
P
-
 
S
-
 
T
-
 
V
G
 
G
E
 
P
A
 
Q
V
 
L
L
 
I
L
 
L
A
 
A
E
 
D
R
 
L
D
 
D
S
 
R
S
 
E
E
 
L
Q
 
L
A
 
Q
S
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
N
R
 
K
M
 
M
P
 
P
V
 
L
V
 
W
N
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
R

Q9NQR4 Omega-amidase NIT2; Nitrilase homolog 2; EC 3.5.1.3 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
33% identity, 95% coverage: 3:269/282 of query aligns to 6:265/276 of Q9NQR4

query
sites
Q9NQR4
F
 
L
A
 
A
V
 
L
I
 
I
Q
 
Q
M
 
L
V
 
Q
S
 
I
Q
 
S
S
 
S
D
 
I
V
 
K
L
 
S
A
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
T
Q
 
R
A
 
A
R
 
C
R
 
S
L
 
F
L
 
I
E
 
R
H
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
G
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
I
A
 
V
V
 
S
L
 
L
P
 
P
E
|
E
N
 
C
F
 
F
-
 
N
A
 
S
A
 
P
M
 
Y
G
 
G
R
 
A
R
 
K
D
 
Y
V
 
F
A
 
P
D
 
E
I
 
Y
G
 
-
R
 
-
A
 
A
E
 
E
A
 
K
L
 
I
G
 
-
E
 
P
G
 
G
P
 
E
I
 
S
L
 
T
P
 
Q
W
 
K
L
 
L
K
 
S
Q
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
K
D
 
E
L
 
C
T
 
S
L
 
I
W
 
Y
I
 
L
V
 
I
A
 
G
G
 
G
T
 
S
L
 
I
P
 
P
L
 
-
P
 
-
P
 
-
K
 
E
D
 
E
R
 
D
P
 
A
N
 
G
A
 
K
K
 
L
S
 
Y
N
 
N
A
 
T
C
 
C
S
 
A
L
 
V
L
 
F
V
 
G
D
 
P
D
 
D
Q
 
-
G
 
G
E
 
T
I
 
L
V
 
L
A
 
A
R
 
K
Y
 
Y
D
 
R
K
|
K
L
 
I
H
 
H
L
 
L
F
|
F
D
|
D
V
x
I
D
|
D
V
|
V
A
x
P
D
 
-
A
x
G
R
x
K
G
x
I
R
x
T
Y
x
F
R
x
Q
E
|
E
S
 
S
D
 
K
D
 
T
Y
 
L
A
 
S
F
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
S
V
 
F
V
 
S
V
 
T
A
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
V
 
Y
G
 
C
R
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
G
V
 
I
C
|
C
Y
 
Y
D
 
D
L
 
M
R
 
R
F
 
F
P
 
A
E
 
E
L
 
L
Y
 
A
S
 
Q
E
 
I
L
 
Y
R
 
A
A
 
Q
A
 
R
G
 
G
A
 
C
E
 
Q
L
 
L
I
 
L
T
 
V
A
 
Y
P
 
P
S
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
N
A
 
L
V
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
P
A
 
A
H
 
H
W
 
W
D
 
E
V
 
L
L
 
L
I
 
Q
R
 
R
A
 
S
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
D
T
 
N
Q
 
Q
C
 
V
Y
 
Y
L
 
V
L
 
A
A
 
T
A
 
A
A
 
S
Q
 
P
G
 
A
G
 
R
V
 
D
H
 
D
P
 
K
G
 
A
P
 
S
R
 
Y
E
 
V
T
 
A
Y
 
W
G
 
G
H
 
H
A
 
S
A
 
T
I
 
V
V
 
V
D
 
N
P
 
P
W
 
W
G
 
G
R
 
E
V
|
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
Q
 
A
D
 
G
K
 
T
G
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
I
L
 
V
L
 
Y
A
 
S
E
 
D
R
 
I
D
 
D
S
 
L
S
 
K
E
 
K
Q
 
L
A
 
A
S
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
R
 
Q
M
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
F
N
 
R
H
 
Q
R
 
K
R
 
R

P46011 Bifunctional nitrilase/nitrile hydratase NIT4; Cyanoalanine nitrilase; Nitrilase 4; EC 3.5.5.1; EC 3.5.5.4; EC 4.2.1.65 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
27% identity, 90% coverage: 13:267/282 of query aligns to 49:323/355 of P46011

query
sites
P46011
D
 
D
V
 
T
L
 
P
A
 
A
N
 
T
L
 
L
A
 
D
Q
 
K
A
 
A
R
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
S
H
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
N
G
 
G
A
 
S
K
 
Q
L
 
L
A
 
V
V
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
E
N
 
A
F
 
F
-
 
I
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
S
-
 
T
-
 
F
-
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
I
-
 
G
-
 
S
-
 
R
A
 
T
A
 
A
M
 
K
G
 
G
R
 
R
R
 
D
D
 
D
V
 
F
A
 
R
D
 
K
I
 
Y
G
 
H
R
 
A
A
 
S
E
 
A
A
 
I
L
 
D
G
 
V
E
 
P
G
 
G
P
 
P
I
 
E
L
 
V
P
 
E
W
 
R
L
 
L
K
 
A
Q
 
L
T
 
M
A
 
A
R
 
K
D
 
K
L
 
Y
T
 
K
L
 
V
W
 
Y
I
 
L
V
 
V
A
 
M
G
 
G
T
 
V
L
 
I
P
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
K
 
-
D
 
E
R
 
R
P
 
E
N
 
G
A
 
Y
K
 
T
S
 
L
N
 
Y
A
 
C
C
 
T
S
 
V
L
 
L
L
 
F
V
 
F
D
 
D
D
 
S
Q
 
Q
G
 
G
E
 
L
I
 
F
V
 
L
A
 
G
R
 
K
Y
 
H
D
 
R
K
 
K
L
 
L
H
 
-
L
 
-
F
 
-
D
 
-
V
 
M
D
 
P
V
 
T
A
 
A
D
 
L
A
 
E
R
 
R
G
 
C
R
 
I
Y
 
W
R
 
G
E
 
F
S
 
G
D
 
D
D
 
-
Y
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
G
D
 
S
H
 
T
V
 
I
V
 
P
V
 
V
A
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
V
 
I
G
 
G
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
A
T
 
A
V
 
I
C
|
C
Y
 
W
D
 
E
L
 
N
R
 
R
F
 
M
P
 
P
E
 
S
L
 
L
Y
 
R
S
 
T
E
 
A
L
 
M
R
 
Y
A
 
A
A
 
K
G
 
G
A
 
I
E
 
E
L
 
I
I
 
Y
T
 
C
A
 
A
P
 
P
S
 
T
A
 
A
F
 
D
T
 
S
A
 
R
V
 
E
T
 
T
G
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
W
 
W
D
 
L
V
 
A
L
 
S
I
 
M
R
 
T
A
 
H
R
 
I
A
 
A
I
 
L
E
 
E
T
 
G
Q
 
G
C
 
C
Y
 
F
L
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
N
Q
 
Q
G
 
F
G
 
C
V
 
R
-
 
R
-
 
K
-
 
D
H
 
Y
P
 
P
G
 
S
P
 
P
R
 
P
E
 
E
T
 
Y
Y
 
M
-
 
F
-
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
S
-
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
D
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
C
-
 
A
G
 
G
H
 
G
A
 
S
A
 
S
I
 
I
V
 
I
D
 
S
P
 
P
W
 
L
G
 
G
R
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
G
Q
 
P
D
 
N
-
 
Y
K
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
L
L
 
I
L
 
T
A
 
A
E
 
D
R
 
L
D
 
D
S
 
L
S
 
G
E
 
D
Q
 
I
A
 
A
S
 
R
I
 
A
R
 
K
A
 
F
R
 
D
M
 
F
P
 
D
V
 
V
V
 
V
N
 
G
H
 
H

6ypaB The c146a variant of an amidase from pyrococcus horikoshii with bound glutaramide
30% identity, 78% coverage: 17:237/282 of query aligns to 26:228/269 of 6ypaB

query
sites
6ypaB
N
 
N
L
 
Y
A
 
S
Q
 
K
A
 
A
R
 
E
R
 
K
L
 
L
L
 
I
E
 
K
H
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
K
G
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
E
|
E
-
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
T
-
 
G
-
x
Y
N
 
N
F
 
F
A
 
E
A
 
S
M
 
-
G
 
-
R
 
R
R
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
F
D
 
D
I
 
V
G
 
-
R
 
-
A
 
A
E
 
Q
A
 
Q
L
 
I
G
 
P
E
 
E
G
 
G
P
 
E
I
 
T
L
 
T
P
 
T
W
 
F
L
 
L
K
 
M
Q
 
E
T
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
E
L
 
L
T
 
G
L
 
L
W
 
Y
I
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
K
 
A
D
 
E
R
 
K
P
 
S
N
 
G
A
 
N
K
 
Y
S
 
L
N
 
Y
A
 
N
C
 
S
S
 
A
L
 
V
L
 
V
V
 
V
D
 
G
D
 
P
Q
 
R
G
 
G
E
 
Y
I
 
I
V
 
-
A
 
G
R
 
K
Y
 
Y
D
 
R
K
|
K
L
 
I
H
 
H
L
 
L
F
|
F
D
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
Y
R
 
R
E
|
E
S
 
K
D
 
V
D
 
F
Y
 
F
A
 
E
F
 
P
G
 
G
D
 
D
-
 
L
H
 
G
V
 
F
V
 
K
V
 
V
A
 
F
D
 
D
T
 
I
P
 
G
V
 
F
G
 
A
R
 
K
L
 
V
G
 
G
L
 
V
T
 
M
V
 
I
C
x
A
Y
x
F
D
 
D
L
x
W
R
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
S
Y
 
A
S
 
R
E
 
T
L
 
L
R
 
A
A
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
I
 
I
T
 
A
A
 
H
P
 
P
S
 
A
A
x
N
F
x
L
T
x
V
A
x
M
V
 
P
T
 
Y
G
 
A
A
 
P
A
 
R
H
 
A
W
 
M
D
 
P
V
 
I
L
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
A
I
 
L
E
 
E
T
 
N
Q
 
R
C
 
V
Y
 
Y
L
 
T
L
 
I
A
 
T
A
 
A
A
 
D
Q
 
R
G
 
V
G
 
G
V
 
E
H
 
E
P
 
R
G
 
G
P
 
L
R
 
K
E
 
-
T
 
F
Y
 
I
G
 
G
H
 
K
A
 
S
A
 
L
I
 
I
V
 
A
D
 
S
P
 
P
W
 
K
G
 
A
R
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
S

7ovgA The c146a variant of an amidase from pyrococcus horikoshii with bound acetamide (see paper)
31% identity, 78% coverage: 17:237/282 of query aligns to 20:222/263 of 7ovgA

query
sites
7ovgA
N
 
N
L
 
Y
A
 
S
Q
 
K
A
 
A
R
 
E
R
 
K
L
 
L
L
 
I
E
 
K
H
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
K
G
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
E
|
E
-
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
T
-
 
G
-
x
Y
N
 
N
F
 
F
A
 
E
A
 
S
M
 
-
G
 
-
R
 
R
R
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
F
D
 
D
I
 
V
G
 
-
R
 
-
A
 
A
E
 
Q
A
 
Q
L
 
I
G
 
P
E
 
E
G
 
G
P
 
E
I
 
T
L
 
T
P
 
T
W
 
F
L
 
L
K
 
M
Q
 
E
T
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
E
L
 
L
T
 
G
L
 
L
W
 
Y
I
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
A
K
 
E
D
 
K
R
 
S
P
 
G
N
 
N
A
 
Y
K
 
L
S
 
Y
N
 
N
A
 
S
C
 
-
S
 
A
L
 
V
L
 
V
V
 
V
D
 
G
D
 
P
Q
 
R
G
 
G
E
 
Y
I
 
I
V
 
-
A
 
G
R
 
K
Y
 
Y
D
 
R
K
|
K
L
 
I
H
 
H
L
 
L
F
|
F
D
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
Y
R
 
R
E
|
E
S
 
K
D
 
V
D
 
F
Y
 
F
A
 
E
F
 
P
G
 
G
D
 
D
-
 
L
H
 
G
V
 
F
V
 
K
V
 
V
A
 
F
D
 
D
T
 
I
P
 
G
V
 
F
G
 
A
R
 
K
L
 
V
G
 
G
L
 
V
T
 
M
V
 
I
C
x
A
Y
x
F
D
 
D
L
 
W
R
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
S
Y
 
A
S
 
R
E
 
T
L
 
L
R
 
A
A
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
I
 
I
T
 
A
A
 
H
P
 
P
S
 
A
A
x
N
F
 
L
T
 
V
A
 
M
V
 
P
T
 
Y
G
 
A
A
 
P
A
 
R
H
 
A
W
 
M
D
 
P
V
 
I
L
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
A
I
 
L
E
 
E
T
 
N
Q
 
R
C
 
V
Y
 
Y
L
 
T
L
 
I
A
 
T
A
 
A
A
 
D
Q
 
R
G
 
V
G
 
G
V
 
E
H
 
E
P
 
R
G
 
G
P
 
L
R
 
K
E
 
-
T
 
F
Y
 
I
G
 
G
H
 
K
A
 
S
A
 
L
I
 
I
V
 
A
D
 
S
P
 
P
W
 
K
G
 
A
R
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
S

3klcB Crystal structure of hyperthermophilic nitrilase (see paper)
30% identity, 84% coverage: 17:253/282 of query aligns to 18:237/261 of 3klcB

query
sites
3klcB
N
 
N
L
 
Y
A
 
S
Q
 
K
A
 
A
R
 
E
R
 
K
L
 
L
L
 
I
E
 
K
H
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
K
G
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
A
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
E
|
E
N
 
L
F
 
F
A
 
D
A
 
T
-
 
G
-
 
Y
-
 
N
-
 
F
M
 
E
G
 
T
R
 
R
R
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
F
D
 
E
I
 
I
G
 
-
R
 
-
A
 
A
E
 
Q
A
 
K
L
 
I
G
 
P
E
 
E
G
 
G
P
 
E
I
 
T
L
 
T
P
 
T
W
 
F
L
 
L
K
 
M
Q
 
D
T
 
V
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
T
T
 
G
L
 
V
W
 
Y
I
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
A
P
 
E
K
 
K
D
 
D
R
 
G
P
 
D
N
 
V
A
 
L
K
 
Y
S
x
N
N
 
S
A
 
A
C
 
-
S
 
-
L
 
V
L
 
V
V
 
V
D
 
G
D
 
P
Q
 
R
G
 
G
E
 
-
I
x
F
V
 
I
A
 
G
R
x
K
Y
 
Y
D
 
R
K
|
K
L
 
I
H
 
H
L
 
L
F
 
F
D
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
Y
R
 
R
E
|
E
S
 
K
D
 
F
D
 
F
Y
 
F
A
 
E
F
 
P
G
 
G
D
 
D
-
 
L
H
 
G
V
 
F
V
 
R
V
 
V
A
 
F
D
 
D
T
 
L
P
 
G
V
 
F
G
 
M
R
 
K
L
 
V
G
 
G
L
 
V
T
 
M
V
 
I
C
|
C
Y
 
F
D
 
D
L
 
W
R
 
F
F
 
F
P
 
P
E
|
E
L
 
S
Y
 
A
S
 
R
E
 
T
L
 
L
R
 
A
A
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
V
I
 
I
T
 
A
A
 
H
P
 
P
S
 
A
A
x
N
F
x
L
T
 
V
A
x
M
V
 
P
T
 
Y
G
 
A
A
 
P
A
 
R
H
 
A
W
 
M
D
 
P
V
 
I
L
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
A
I
 
L
E
 
E
T
 
N
Q
 
K
C
 
V
Y
 
Y
L
 
T
L
 
V
A
 
T
A
 
A
A
 
D
Q
 
R
G
 
V
G
 
G
V
 
E
H
 
E
P
 
R
G
 
G
P
 
L
R
 
K
E
 
-
T
 
F
Y
 
I
G
 
G
H
 
K
A
 
S
A
 
L
I
 
I
V
 
A
D
 
S
P
 
P
W
 
K
G
 
A
R
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
S
Q
 
M
-
 
A
Q
 
S
D
 
E
K
 
T
G
 
E
E
 
E
A
 
E
V
 
V
L
 
G
L
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
I
D
 
D
S
 
L
S
 
S

Sites not aligning to the query:

3klcA Crystal structure of hyperthermophilic nitrilase (see paper)
30% identity, 84% coverage: 17:253/282 of query aligns to 18:237/261 of 3klcA

query
sites
3klcA
N
 
N
L
 
Y
A
 
S
Q
 
K
A
 
A
R
 
E
R
 
K
L
 
L
L
 
I
E
 
K
H
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
K
G
 
Q
G
|
G
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
A
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
E
|
E
N
 
L
F
 
F
A
 
D
A
 
T
-
 
G
-
 
Y
-
 
N
-
 
F
M
 
E
G
 
T
R
 
R
R
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
F
D
 
E
I
 
I
G
 
-
R
 
-
A
 
A
E
 
Q
A
 
K
L
 
I
G
 
P
E
 
E
G
 
G
P
 
E
I
 
T
L
 
T
P
 
T
W
 
F
L
 
L
K
 
M
Q
 
D
T
 
V
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
T
T
 
G
L
 
V
W
 
Y
I
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
A
P
 
E
K
 
K
D
 
D
R
 
G
P
 
D
N
 
V
A
 
L
K
 
Y
S
x
N
N
 
S
A
 
A
C
 
-
S
 
-
L
 
V
L
 
V
V
 
V
D
x
G
D
x
P
Q
x
R
G
 
G
E
 
-
I
x
F
V
x
I
A
x
G
R
x
K
Y
 
Y
D
 
R
K
|
K
L
 
I
H
 
H
L
 
L
F
 
F
D
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
Y
R
 
R
E
|
E
S
 
K
D
 
F
D
 
F
Y
 
F
A
 
E
F
 
P
G
 
G
D
 
D
-
 
L
H
 
G
V
 
F
V
x
R
V
|
V
A
 
F
D
 
D
T
 
L
P
 
G
V
 
F
G
 
M
R
 
K
L
 
V
G
 
G
L
 
V
T
 
M
V
 
I
C
|
C
Y
 
F
D
 
D
L
 
W
R
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
S
Y
 
A
S
 
R
E
 
T
L
 
L
R
 
A
A
 
L
A
x
K
G
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
V
I
 
I
T
 
A
A
 
H
P
 
P
S
 
A
A
x
N
F
x
L
T
 
V
A
x
M
V
 
P
T
 
Y
G
 
A
A
 
P
A
 
R
H
 
A
W
 
M
D
 
P
V
 
I
L
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
A
I
 
L
E
 
E
T
 
N
Q
 
K
C
 
V
Y
 
Y
L
 
T
L
 
V
A
 
T
A
 
A
A
 
D
Q
 
R
G
 
V
G
 
G
V
 
E
H
 
E
P
 
R
G
 
G
P
 
L
R
 
K
E
 
-
T
 
F
Y
 
I
G
 
G
H
 
K
A
 
S
A
 
L
I
 
I
V
 
A
D
 
S
P
 
P
W
 
K
G
 
A
R
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
S
Q
 
M
-
 
A
Q
 
S
D
 
E
K
 
T
G
 
E
E
 
E
A
 
E
V
 
V
L
 
G
L
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
I
D
 
D
S
 
L
S
 
S

Sites not aligning to the query:

Q9UYV8 Nitrilase; PaNit; EC 3.5.5.1 from Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) (see paper)
30% identity, 83% coverage: 17:251/282 of query aligns to 19:236/262 of Q9UYV8

query
sites
Q9UYV8
N
 
N
L
 
Y
A
 
S
Q
 
K
A
 
A
R
 
E
R
 
K
L
 
L
L
 
I
E
 
K
H
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
K
G
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
A
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
N
 
L
F
 
F
A
 
D
A
 
T
-
 
G
-
 
Y
-
 
N
-
 
F
M
 
E
G
 
T
R
 
R
R
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
F
D
 
E
I
 
I
G
 
-
R
 
-
A
 
A
E
 
Q
A
 
K
L
 
I
G
 
P
E
 
E
G
 
G
P
 
E
I
 
T
L
 
T
P
 
T
W
 
F
L
 
L
K
 
M
Q
 
D
T
 
V
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
T
T
 
G
L
 
V
W
 
Y
I
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
A
P
 
E
K
 
K
D
 
D
R
 
G
P
 
D
N
 
V
A
 
L
K
 
Y
S
 
N
N
 
S
A
 
A
C
 
-
S
 
-
L
 
V
L
 
V
V
 
V
D
 
G
D
 
P
Q
 
R
G
 
G
E
 
-
I
 
F
V
 
I
A
 
G
R
 
K
Y
 
Y
D
 
R
K
 
K
L
 
I
H
 
H
L
 
L
F
 
F
D
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
S
 
K
D
 
F
D
 
F
Y
 
F
A
 
E
F
 
P
G
 
G
D
 
D
-
 
L
H
 
G
V
 
F
V
 
R
V
 
V
A
 
F
D
 
D
T
 
L
P
 
G
V
 
F
G
 
M
R
 
K
L
 
V
G
 
G
L
 
V
T
 
M
V
 
I
C
|
C
Y
 
F
D
 
D
L
 
W
R
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
S
Y
 
A
S
 
R
E
 
T
L
 
L
R
 
A
A
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
V
I
 
I
T
 
A
A
 
H
P
 
P
S
 
A
A
 
N
F
 
L
T
 
V
A
 
M
V
 
P
T
 
Y
G
 
A
A
 
P
A
 
R
H
 
A
W
 
M
D
 
P
V
 
I
L
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
A
I
 
L
E
 
E
T
 
N
Q
 
K
C
 
V
Y
 
Y
L
 
T
L
 
V
A
 
T
A
 
A
A
 
D
Q
 
R
G
 
V
G
 
G
V
 
E
H
 
E
P
 
R
G
 
G
P
 
L
R
 
K
E
 
-
T
 
F
Y
 
I
G
 
G
H
 
K
A
 
S
A
 
L
I
 
I
V
 
A
D
 
S
P
 
P
W
 
K
G
 
A
R
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
S
Q
 
M
-
 
A
Q
 
S
D
 
E
K
 
T
G
 
E
E
 
E
A
 
E
V
 
V
L
 
G
L
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
I
D
 
D

5h8iC Crystal structure of medicago truncatula n-carbamoylputrescine amidohydrolase (mtcpa) in complex with n-(dihydroxymethyl)putrescine (see paper)
26% identity, 94% coverage: 4:269/282 of query aligns to 12:284/301 of 5h8iC

query
sites
5h8iC
A
 
S
V
 
A
I
 
L
Q
 
Q
M
 
F
V
 
A
S
 
C
Q
 
T
S
 
D
D
 
D
V
 
V
L
 
S
A
 
T
N
 
N
L
 
V
A
 
T
Q
 
T
A
 
A
R
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
V
E
 
R
H
 
A
A
 
A
A
 
H
A
 
K
G
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
N
L
 
I
A
 
V
V
 
L
L
 
I
P
 
Q
E
|
E
-
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
N
x
Y
F
 
F
A
 
C
A
 
Q
M
 
A
G
 
Q
R
 
R
R
 
E
D
 
D
V
 
F
A
 
-
D
 
-
I
 
I
G
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
P
L
 
Y
G
 
K
E
 
D
G
 
H
P
 
P
I
 
T
L
 
I
P
 
M
W
 
R
L
 
L
K
 
Q
Q
 
K
T
 
L
A
 
A
R
 
K
D
 
E
L
 
L
T
 
G
L
 
V
W
 
V
I
 
I
V
 
P
A
 
V
G
 
S
T
 
F
L
 
F
P
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
K
 
E
D
 
E
R
 
A
P
 
N
N
 
N
A
 
A
K
 
H
S
 
Y
N
|
N
A
 
S
C
 
I
S
 
A
L
 
I
L
 
-
V
 
I
D
 
D
D
 
A
Q
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
D
V
 
L
A
 
G
R
 
I
Y
 
Y
D
 
R
K
|
K
L
 
S
H
 
H
L
 
-
F
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
I
A
x
P
D
 
D
A
 
G
R
 
P
G
 
G
R
 
-
Y
|
Y
R
 
E
E
|
E
S
 
K
D
 
F
D
 
Y
Y
 
F
A
 
N
F
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
T
-
 
G
V
 
F
V
 
K
V
 
V
A
 
F
D
 
Q
T
 
T
P
 
K
V
 
Y
G
 
A
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
V
T
 
A
V
 
I
C
|
C
Y
x
W
D
 
D
L
 
Q
R
 
W
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
A
Y
 
A
S
 
R
E
 
A
L
 
M
R
 
A
A
 
L
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
I
 
L
T
 
F
A
 
Y
P
 
P
S
 
T
A
|
A
F
x
I
-
 
G
-
 
S
-
x
E
-
 
P
-
 
H
-
 
D
T
 
Q
A
 
S
V
 
I
T
 
D
G
 
S
A
 
R
A
 
D
H
 
H
W
 
W
D
 
K
V
 
R
L
 
V
I
 
M
R
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
A
I
 
G
E
 
A
T
 
N
Q
 
L
C
 
V
Y
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
S
A
 
N
Q
 
R
G
 
I
G
 
G
-
 
N
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
E
V
 
T
H
 
E
P
 
H
G
 
G
P
 
K
R
 
S
E
 
E
T
 
I
-
 
K
-
 
F
Y
 
Y
G
 
G
H
 
N
A
 
S
A
 
F
I
 
I
V
 
A
D
 
G
P
 
P
W
 
T
G
 
G
R
 
E
V
 
I
L
 
V
A
 
S
-
 
I
Q
 
A
Q
 
D
D
 
D
K
 
K
G
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
E
R
 
F
D
 
N
S
 
L
S
 
D
E
 
K
Q
 
I
A
 
K
S
 
S
I
 
M
R
 
R
A
 
H
R
 
C
M
 
W
P
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
R
H
 
D
R
 
R
R
 
R

5h8jB Crystal structure of medicago truncatula n-carbamoylputrescine amidohydrolase (mtcpa) in complex with cadaverine (see paper)
26% identity, 94% coverage: 4:269/282 of query aligns to 8:280/297 of 5h8jB

query
sites
5h8jB
A
 
S
V
 
A
I
 
L
Q
 
Q
M
 
F
V
 
A
S
 
C
Q
 
T
S
 
D
D
 
D
V
 
V
L
 
S
A
 
T
N
 
N
L
 
V
A
 
T
Q
 
T
A
 
A
R
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
V
E
 
R
H
 
A
A
 
A
A
 
H
A
 
K
G
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
N
L
 
I
A
 
V
V
 
L
L
 
I
P
 
Q
E
|
E
-
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
N
 
Y
F
 
F
A
 
C
A
 
Q
M
 
A
G
 
Q
R
 
R
R
 
E
D
 
D
V
 
F
A
 
-
D
 
-
I
 
I
G
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
P
L
 
Y
G
 
K
E
 
D
G
 
H
P
 
P
I
 
T
L
 
I
P
 
M
W
 
R
L
 
L
K
 
Q
Q
 
K
T
 
L
A
 
A
R
 
K
D
 
E
L
 
L
T
 
G
L
 
V
W
 
V
I
 
I
V
 
P
A
 
V
G
 
S
T
 
F
L
 
F
P
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
K
 
E
D
 
E
R
 
A
P
 
N
N
 
N
A
 
A
K
 
H
S
 
Y
N
|
N
A
 
S
C
 
I
S
 
A
L
 
I
L
 
-
V
 
I
D
 
D
D
 
A
Q
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
D
V
 
L
A
 
G
R
 
I
Y
 
Y
D
 
R
K
|
K
L
 
S
H
 
H
L
 
-
F
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
I
A
x
P
D
 
D
A
 
G
R
 
P
G
 
G
R
 
-
Y
|
Y
R
 
E
E
|
E
S
 
K
D
 
F
D
 
Y
Y
 
F
A
 
N
F
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
T
-
 
G
V
 
F
V
 
K
V
 
V
A
 
F
D
 
Q
T
 
T
P
 
K
V
 
Y
G
 
A
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
V
T
 
A
V
 
I
C
|
C
Y
x
W
D
 
D
L
 
Q
R
 
W
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
A
Y
 
A
S
 
R
E
 
A
L
 
M
R
 
A
A
 
L
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
I
 
L
T
 
F
A
 
Y
P
 
P
S
 
T
A
|
A
F
x
I
-
 
G
-
 
S
-
x
E
-
 
P
-
 
H
-
 
D
T
 
Q
A
 
S
V
 
I
T
 
D
G
 
S
A
 
R
A
 
D
H
 
H
W
 
W
D
 
K
V
 
R
L
 
V
I
 
M
R
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
A
I
 
G
E
 
A
T
 
N
Q
 
L
C
 
V
Y
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
S
A
 
N
Q
 
R
G
 
I
G
 
G
-
 
N
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
E
V
 
T
H
 
E
P
 
H
G
 
G
P
 
K
R
 
S
E
 
E
T
 
I
-
 
K
-
 
F
Y
 
Y
G
 
G
H
 
N
A
 
S
A
 
F
I
 
I
V
 
A
D
 
G
P
 
P
W
 
T
G
 
G
R
 
E
V
 
I
L
 
V
A
 
S
-
 
I
Q
 
A
Q
 
D
D
 
D
K
 
K
G
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
E
R
 
F
D
 
N
S
 
L
S
 
D
E
 
K
Q
 
I
A
 
K
S
 
S
I
 
M
R
 
R
A
 
H
R
 
C
M
 
W
P
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
R
H
 
D
R
 
R
R
 
R

5h8lB Crystal structure of medicago truncatula n-carbamoylputrescine amidohydrolase (mtcpa) c158s mutant in complex with putrescine (see paper)
26% identity, 94% coverage: 4:269/282 of query aligns to 9:281/298 of 5h8lB

query
sites
5h8lB
A
 
S
V
 
A
I
 
L
Q
 
Q
M
 
F
V
 
A
S
 
C
Q
 
T
S
 
D
D
 
D
V
 
V
L
 
S
A
 
T
N
 
N
L
 
V
A
 
T
Q
 
T
A
 
A
R
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
V
E
 
R
H
 
A
A
 
A
A
 
H
A
 
K
G
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
N
L
 
I
A
 
V
V
 
L
L
 
I
P
 
Q
E
|
E
-
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
N
 
Y
F
 
F
A
 
C
A
 
Q
M
 
A
G
 
Q
R
 
R
R
 
E
D
 
D
V
 
F
A
 
-
D
 
-
I
 
I
G
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
P
L
 
Y
G
 
K
E
 
D
G
 
H
P
 
P
I
 
T
L
 
I
P
 
M
W
 
R
L
 
L
K
 
Q
Q
 
K
T
 
L
A
 
A
R
 
K
D
 
E
L
 
L
T
 
G
L
 
V
W
 
V
I
 
I
V
 
P
A
 
V
G
 
S
T
 
F
L
 
F
P
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
K
 
E
D
 
E
R
 
A
P
 
N
N
 
N
A
 
A
K
 
H
S
 
Y
N
|
N
A
 
S
C
 
I
S
 
A
L
 
I
L
 
-
V
 
I
D
 
D
D
 
A
Q
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
D
V
 
L
A
 
G
R
 
I
Y
 
Y
D
 
R
K
|
K
L
 
S
H
 
H
L
 
-
F
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
I
A
x
P
D
 
D
A
 
G
R
 
P
G
 
G
R
 
-
Y
|
Y
R
 
E
E
|
E
S
 
K
D
 
F
D
 
Y
Y
 
F
A
 
N
F
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
T
-
 
G
V
 
F
V
 
K
V
 
V
A
 
F
D
 
Q
T
 
T
P
 
K
V
 
Y
G
 
A
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
V
T
 
A
V
 
I
C
x
S
Y
x
W
D
 
D
L
 
Q
R
 
W
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
A
Y
 
A
S
 
R
E
 
A
L
 
M
R
 
A
A
 
L
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
I
 
L
T
 
F
A
 
Y
P
 
P
S
 
T
A
|
A
F
x
I
-
 
G
-
 
S
-
x
E
-
 
P
-
 
H
-
 
D
T
 
Q
A
 
S
V
 
I
T
 
D
G
 
S
A
 
R
A
 
D
H
 
H
W
 
W
D
 
K
V
 
R
L
 
V
I
 
M
R
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
A
I
 
G
E
 
A
T
 
N
Q
 
L
C
 
V
Y
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
S
A
 
N
Q
 
R
G
 
I
G
 
G
-
 
N
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
E
V
 
T
H
 
E
P
 
H
G
 
G
P
 
K
R
 
S
E
 
E
T
 
I
-
 
K
-
 
F
Y
 
Y
G
 
G
H
 
N
A
 
S
A
 
F
I
 
I
V
 
A
D
 
G
P
 
P
W
 
T
G
 
G
R
 
E
V
 
I
L
 
V
A
 
S
-
 
I
Q
 
A
Q
 
D
D
 
D
K
 
K
G
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
E
R
 
F
D
 
N
S
 
L
S
 
D
E
 
K
Q
 
I
A
 
K
S
 
S
I
 
M
R
 
R
A
 
H
R
 
C
M
 
W
P
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
R
H
 
D
R
 
R
R
 
R

O25067 Aliphatic amidase; Acylamide amidohydrolase; EC 3.5.1.4 from Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) (Campylobacter pylori) (see paper)
23% identity, 90% coverage: 1:255/282 of query aligns to 18:261/339 of O25067

query
sites
O25067
M
 
V
S
 
N
F
 
Y
A
 
K
V
 
M
I
 
P
Q
 
R
M
 
L
V
 
H
S
 
T
Q
 
K
S
 
N
D
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
E
N
 
N
L
 
C
A
 
R
Q
 
N
A
 
I
R
 
A
R
 
K
L
 
V
L
 
I
E
 
G
H
 
G
A
 
V
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
-
 
L
-
 
P
G
 
G
A
 
L
K
 
D
L
 
L
A
 
I
V
 
I
L
 
F
P
 
P
E
 
E
N
 
-
F
 
Y
A
 
S
A
 
T
M
 
H
G
 
G
-
 
I
-
 
M
-
 
Y
-
 
D
R
 
R
R
 
Q
D
 
E
V
 
M
A
 
F
D
 
D
I
 
T
G
 
A
R
 
-
A
 
A
E
 
S
A
 
V
L
 
P
G
 
G
E
 
E
G
 
E
P
 
T
I
 
A
L
 
I
P
 
-
W
 
-
L
 
F
K
 
A
Q
 
E
T
 
A
A
 
C
R
 
K
D
 
K
L
 
N
T
 
K
L
 
V
W
 
W
I
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
G
T
 
V
L
 
F
P
 
S
L
 
L
P
 
T
P
 
G
K
 
E
D
 
K
R
 
H
P
 
E
N
 
Q
A
 
A
K
 
K
S
 
K
N
 
N
A
 
P
C
 
Y
S
 
N
-
 
T
-
 
L
L
 
I
L
 
L
V
 
V
D
 
N
D
 
D
Q
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
Q
R
 
K
Y
 
Y
D
 
R
K
 
K
L
 
I
H
 
L
L
 
-
F
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
P
Y
 
W
R
 
C
E
 
P
S
 
I
D
 
E
D
 
C
Y
 
W
A
 
Y
F
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
K
V
 
T
V
 
Y
V
 
V
A
 
V
D
 
D
T
 
G
P
 
P
V
 
K
G
 
G
-
 
L
R
 
K
L
 
V
G
 
S
L
 
L
T
 
I
V
 
I
C
|
C
Y
 
D
D
|
D
L
 
G
R
 
N
F
 
Y
P
 
P
E
 
E
L
 
I
Y
 
W
S
 
R
E
 
D
L
 
C
R
 
A
A
 
M
A
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
L
I
 
I
T
 
V
A
 
R
P
 
C
S
 
Q
A
 
G
F
 
Y
T
 
M
A
 
-
V
 
Y
T
 
P
G
 
A
A
 
K
A
 
E
H
 
Q
W
 
Q
D
 
I
V
 
A
L
 
I
I
 
V
R
 
K
A
 
A
R
 
M
A
 
A
I
 
W
E
 
A
T
 
N
Q
 
Q
C
 
C
Y
 
Y
L
 
V
L
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
N
Q
 
A
G
 
T
G
 
G
V
 
F
H
 
D
P
 
-
G
 
G
P
 
V
R
 
Y
E
 
S
T
 
Y
Y
 
F
G
 
G
H
 
H
A
 
S
A
 
S
I
 
I
V
 
I
D
 
G
P
 
F
W
 
D
G
 
G
R
 
H
V
 
T
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
Q
 
C
D
 
G
K
 
E
G
 
E
E
 
E
A
 
N
V
 
G
L
 
L
L
 
Q
A
 
Y
E
 
A
R
 
Q
D
 
L
S
 
S
S
 
V
E
 
Q
Q
 
Q

Q44185 N-carbamoyl-D-amino acid hydrolase; D-N-alpha-carbamilase; EC 3.5.1.77 from Rhizobium radiobacter (Agrobacterium tumefaciens) (Agrobacterium radiobacter) (see paper)
27% identity, 76% coverage: 24:237/282 of query aligns to 31:260/304 of Q44185

query
sites
Q44185
L
 
M
L
 
L
E
 
T
H
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
S
G
 
R
G
 
G
A
 
V
K
 
N
L
 
F
A
 
I
V
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
T
N
 
F
F
 
F
A
 
P
A
 
R
M
 
W
G
 
H
R
 
F
R
 
T
D
 
D
V
 
E
A
 
A
D
 
E
I
 
L
-
 
D
G
 
S
R
 
F
A
 
Y
E
 
E
A
 
T
L
 
E
G
 
M
E
 
P
G
 
G
P
 
P
I
 
V
L
 
V
P
 
R
W
 
P
L
 
L
K
 
F
Q
 
E
T
 
T
A
 
A
R
 
A
D
 
E
L
 
L
T
 
G
L
 
I
W
 
G
I
 
F
V
 
N
A
 
L
G
 
G
T
 
Y
L
 
A
P
 
E
L
 
L
P
 
V
P
 
V
K
 
E
D
 
G
R
 
G
P
 
V
N
 
K
A
 
R
K
 
R
S
 
F
N
 
N
A
 
T
C
 
-
S
 
S
L
 
I
L
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
K
Q
 
S
G
 
G
E
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
G
R
 
K
Y
 
Y
D
 
R
K
 
K
L
 
I
H
|
H
L
 
L
F
 
P
D
 
G
V
 
H
D
 
K
V
 
E
A
 
Y
D
 
E
A
 
A
-
 
Y
-
 
R
-
 
P
-
 
F
-
 
Q
-
x
H
-
 
L
R
 
E
G
 
K
R
 
R
Y
 
Y
R
 
F
E
 
E
S
 
P
D
 
G
D
 
D
Y
 
L
A
 
G
F
 
F
G
 
-
D
 
-
H
 
-
V
 
-
V
 
P
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
T
 
V
P
 
D
V
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
M
T
 
F
V
 
I
C
 
C
Y
 
N
D
 
D
L
 
R
R
 
R
F
 
W
P
 
P
E
 
E
L
 
T
Y
 
W
S
 
R
E
 
V
L
 
M
R
 
G
A
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
I
 
I
-
 
C
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
T
 
N
A
 
T
P
 
P
S
 
T
A
 
H
F
 
N
T
 
P
A
 
P
V
 
V
T
 
P
G
 
Q
A
 
H
A
 
D
H
 
H
W
 
L
D
 
T
V
 
S
L
 
F
-
x
H
-
 
H
-
 
L
-
 
L
-
 
S
I
 
M
R
 
Q
A
 
A
R
 
G
A
 
S
I
 
Y
E
 
Q
T
 
N
Q
 
G
C
 
A
Y
 
W
L
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
G
Q
 
K
G
 
V
G
 
G
V
 
M
H
 
E
P
 
E
G
 
G
P
 
C
R
 
M
E
 
-
T
 
L
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
A
 
S
A
 
C
I
 
I
V
 
V
D
 
A
P
 
P
W
 
T
G
 
G
R
 
E
V
 
I
L
 
V
A
 
A

Q9RQ17 Aliphatic amidase; Acylamide amidohydrolase; Wide spectrum amidase; EC 3.5.1.4 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see paper)
22% identity, 95% coverage: 1:267/282 of query aligns to 18:275/348 of Q9RQ17

query
sites
Q9RQ17
M
 
V
S
 
N
F
 
Y
A
 
K
V
 
M
I
 
P
Q