SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF855 FitnessBrowser__psRCH2:GFF855 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3igjC Crystal structure of maltose o-acetyltransferase complexed with acetyl coenzyme a from bacillus anthracis
55% identity, 98% coverage: 4:181/182 of query aligns to 4:182/188 of 3igjC

query
sites
3igjC
S
 
T
E
 
E
K
 
K
Q
 
D
K
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
M
Y
 
Y
Y
 
I
P
 
A
G
 
D
D
 
D
P
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
V
A
 
A
D
 
D
Q
 
R
A
 
V
A
 
E
A
 
A
K
 
K
A
 
R
W
 
L
M
 
T
V
 
R
R
 
L
Y
 
Y
N
 
N
A
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
E
A
 
T
S
 
G
P
 
D
D
 
E
E
 
R
R
 
R
R
 
F
A
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
N
E
 
Q
R
 
L
L
 
L
A
 
G
S
 
S
V
 
S
G
 
A
A
 
D
G
 
G
-
 
K
A
 
A
V
 
Q
I
 
I
R
 
N
P
 
P
P
 
D
F
 
F
H
 
R
C
 
C
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
H
 
H
L
 
V
G
 
G
E
 
K
G
 
S
A
 
F
F
|
F
L
 
A
N
 
N
F
 
F
N
 
N
C
 
C
V
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
C
E
 
E
V
 
V
H
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
D
G
 
H
A
 
C
Q
 
M
I
 
F
G
x
A
P
 
P
A
 
G
V
 
V
Q
 
H
L
 
I
Y
|
Y
T
 
T
A
|
A
D
 
T
H
|
H
P
 
P
R
 
L
D
 
H
P
 
P
E
 
V
A
 
E
R
 
R
R
 
N
S
 
S
G
 
G
V
 
K
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
R
 
K
P
 
P
I
 
V
N
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
N
N
 
N
V
 
V
W
 
W
V
 
V
G
|
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
I
L
x
N
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
S
I
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
x
A
A
x
S
G
 
G
S
 
A
V
 
V
V
 
V
T
|
T
R
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
N
G
 
N
A
 
V
T
 
V
V
 
V
V
 
G
G
 
G
N
|
N
P
 
P
A
 
A
R
 
K
I
 
V

4isxA The crystal structure of maltose o-acetyltransferase from clostridium difficile 630 in complex with acetyl-coa
47% identity, 99% coverage: 2:181/182 of query aligns to 1:180/186 of 4isxA

query
sites
4isxA
A
 
A
M
 
M
S
 
T
E
 
E
K
 
K
Q
 
E
K
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
S
G
 
G
E
 
K
L
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
A
G
 
N
D
 
D
P
 
E
E
 
L
I
 
L
L
 
V
A
 
K
D
 
E
Q
 
R
A
 
E
A
 
Y
A
 
C
K
 
K
A
 
K
W
 
L
M
 
T
V
 
R
R
 
L
Y
 
F
N
 
N
A
 
N
A
 
T
L
 
L
A
 
E
A
 
D
S
 
E
P
 
Y
D
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
E
A
 
D
L
 
I
L
 
L
A
 
R
E
 
Q
R
 
L
L
 
F
A
 
G
S
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
K
G
 
Q
A
 
I
V
 
N
I
 
V
R
 
E
P
 
Q
P
 
N
F
 
I
H
 
R
C
 
C
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
H
 
H
L
 
V
G
 
G
E
 
E
G
 
N
A
 
F
F
 
F
L
 
A
N
|
N
F
 
Y
N
 
D
C
 
C
V
 
I
I
 
F
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
C
E
 
K
V
 
I
H
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
D
G
 
N
A
 
V
Q
 
M
I
 
L
G
x
A
P
 
P
A
 
N
V
 
V
Q
 
Q
L
 
I
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
D
 
Y
H
 
H
P
 
P
R
 
I
D
 
D
P
 
A
E
 
Q
A
 
L
R
 
R
R
 
N
S
 
S
G
 
G
V
 
I
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
R
 
S
P
 
P
I
 
V
N
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
N
V
 
V
W
|
W
V
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
I
 
I
L
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
P
G
 
N
A
 
T
T
 
V
V
 
A
V
|
V
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
C
R
 
R
I
 
V

Sites not aligning to the query:

5u2kA Crystal structure of galactoside o-acetyltransferase complex with coa (h3 space group)
39% identity, 98% coverage: 3:181/182 of query aligns to 1:180/190 of 5u2kA

query
sites
5u2kA
M
 
M
S
 
T
E
 
E
K
 
K
Q
 
E
K
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
E
E
 
K
L
 
W
Y
 
Y
Y
 
D
P
 
A
G
 
N
-
 
F
D
 
D
P
 
Q
E
 
Y
I
 
L
L
 
I
A
 
N
D
 
E
Q
 
R
A
 
A
A
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
D
W
 
I
M
 
C
V
 
F
R
 
E
Y
 
L
N
 
N
A
 
H
A
 
T
L
 
R
A
 
P
A
 
S
S
 
A
P
 
T
D
 
N
E
 
K
R
 
R
R
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
I
A
 
D
E
 
Q
R
 
L
L
 
F
A
 
Q
S
 
T
V
 
T
G
 
T
A
 
D
G
 
N
A
 
V
V
 
S
I
 
I
R
 
S
P
 
I
P
 
P
F
 
F
H
 
D
C
 
T
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
W
N
 
N
I
 
V
H
 
K
L
 
L
G
 
G
E
 
K
G
 
N
A
 
V
F
 
Y
L
 
V
N
 
N
F
 
T
N
 
N
C
 
C
V
 
Y
I
 
F
L
x
M
D
 
D
V
 
G
V
 
G
E
 
Q
V
 
I
H
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
D
G
 
N
A
 
V
Q
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
N
V
 
C
Q
 
G
L
 
F
Y
|
Y
T
 
T
A
|
A
D
 
T
H
|
H
P
 
P
R
 
L
D
 
N
P
 
F
E
 
H
A
 
H
R
 
R
R
 
N
S
 
E
G
 
G
V
 
F
E
 
E
F
 
K
G
 
A
R
 
G
P
 
P
I
 
I
N
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
S
N
 
N
V
 
T
W
 
W
V
 
F
G
 
G
G
 
G
G
 
H
A
 
V
I
 
A
I
 
V
L
|
L
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
E
D
 
G
A
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
P
G
 
H
A
 
S
T
 
L
V
 
A
V
 
V
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
C
R
 
K
I
 
V

P07464 Galactoside O-acetyltransferase; GAT; Acetyl-CoA:galactoside 6-O-acetyltransferase; Thiogalactoside acetyltransferase; Thiogalactoside transacetylase; EC 2.3.1.18 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
38% identity, 99% coverage: 1:181/182 of query aligns to 1:181/203 of P07464

query
sites
P07464
M
|
M
A
 
N
M
 
M
S
 
P
E
 
M
K
 
T
Q
 
E
K
 
R
M
 
I
L
 
R
A
 
A
G
 
G
E
 
K
L
 
L
Y
 
F
Y
 
T
P
x
D
G
 
M
D
 
C
P
 
E
E
 
G
I
 
L
L
 
P
A
 
E
D
 
K
Q
 
R
A
 
L
A
 
R
A
 
G
K
 
K
A
 
T
W
 
L
M
 
M
V
 
Y
R
 
E
Y
 
F
N
 
N
A
 
H
A
 
S
L
 
H
A
 
P
A
 
S
S
 
E
P
 
V
D
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
E
A
 
S
L
 
L
L
 
I
A
 
K
E
 
E
R
 
M
L
 
F
A
 
A
S
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
E
G
 
N
A
 
A
V
 
W
I
 
V
R
 
E
P
 
P
P
 
P
F
 
V
H
 
Y
C
 
F
D
x
S
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
S
N
 
N
I
 
I
H
 
H
L
 
I
G
 
G
E
 
R
G
 
N
A
 
F
F
 
Y
L
 
A
N
|
N
F
 
F
N
 
N
C
 
L
V
 
T
I
 
I
L
 
V
D
 
D
V
x
D
V
 
Y
E
 
T
V
 
V
H
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
D
G
 
N
A
 
V
Q
 
L
I
 
I
G
 
A
P
 
P
A
 
N
V
 
V
Q
 
T
L
 
L
Y
 
S
T
 
V
A
 
T
D
 
G
H
|
H
P
 
P
R
 
V
D
 
H
P
 
H
E
 
E
A
 
L
R
 
R
R
 
K
S
 
N
G
 
G
V
 
E
E
 
M
F
 
Y
G
 
S
R
 
F
P
 
P
I
 
I
N
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
N
N
 
N
V
 
V
W
 
W
V
 
I
G
 
G
G
x
S
G
 
H
A
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
N
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
A
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
V
 
I
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
P
G
 
N
A
 
V
T
 
V
V
 
A
V
 
A
G
 
G
N
 
V
P
 
P
A
 
C
R
|
R
I
 
V

Sites not aligning to the query:

1krvA Galactoside acetyltransferase in complex with coa and pnp-beta-gal (see paper)
39% identity, 99% coverage: 1:181/182 of query aligns to 2:180/201 of 1krvA

query
sites
1krvA
M
 
M
A
 
P
M
 
M
S
 
T
E
 
E
K
 
R
Q
 
I
K
 
R
M
 
-
L
 
-
A
 
A
G
 
G
E
 
K
L
 
L
Y
 
F
Y
 
T
P
x
D
G
 
M
D
 
C
P
 
E
E
 
G
I
 
L
L
 
P
A
 
E
D
 
K
Q
x
R
A
 
L
A
 
R
A
 
G
K
 
K
A
 
T
W
 
L
M
 
M
V
 
Y
R
 
E
Y
 
F
N
 
N
A
 
H
A
 
S
L
 
H
A
 
P
A
 
S
S
 
E
P
 
V
D
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
E
A
 
S
L
 
L
L
 
I
A
 
K
E
 
E
R
 
M
L
 
F
A
 
A
S
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
E
G
 
N
A
 
A
V
 
W
I
 
V
R
 
E
P
 
P
P
 
P
F
 
V
H
 
Y
C
 
F
D
x
S
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
S
N
 
N
I
 
I
H
 
H
L
 
I
G
 
G
E
 
R
G
 
N
A
 
F
F
x
Y
L
 
A
N
|
N
F
 
F
N
 
N
C
 
L
V
 
T
I
 
I
L
x
V
D
 
D
V
x
D
V
 
Y
E
 
T
V
 
V
H
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
D
G
 
N
A
 
V
Q
 
L
I
 
I
G
x
A
P
 
P
A
 
N
V
 
V
Q
 
T
L
 
L
Y
x
S
T
 
V
A
x
T
D
 
G
H
 
H
P
 
P
R
 
V
D
 
H
P
 
H
E
 
E
A
 
L
R
 
R
R
 
K
S
 
N
G
 
G
V
 
E
E
x
M
F
 
Y
G
 
S
R
 
F
P
 
P
I
 
I
N
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
N
N
 
N
V
 
V
W
|
W
V
 
I
G
|
G
G
x
S
G
 
H
A
 
V
I
 
V
I
 
I
L
x
N
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
A
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
V
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
P
G
 
N
A
 
V
T
 
V
V
 
A
V
 
A
G
 
G
N
 
V
P
|
P
A
 
C
R
|
R
I
 
V

Sites not aligning to the query:

1kruA Galactoside acetyltransferase in complex with iptg and coenzyme a (see paper)
39% identity, 99% coverage: 1:181/182 of query aligns to 2:180/201 of 1kruA

query
sites
1kruA
M
 
M
A
 
P
M
 
M
S
 
T
E
 
E
K
 
R
Q
 
I
K
 
R
M
 
-
L
 
-
A
 
A
G
 
G
E
 
K
L
 
L
Y
 
F
Y
 
T
P
x
D
G
 
M
D
 
C
P
 
E
E
 
G
I
 
L
L
x
P
A
 
E
D
 
K
Q
x
R
A
 
L
A
 
R
A
 
G
K
 
K
A
 
T
W
 
L
M
 
M
V
 
Y
R
 
E
Y
 
F
N
 
N
A
 
H
A
 
S
L
 
H
A
 
P
A
 
S
S
 
E
P
 
V
D
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
E
A
 
S
L
 
L
L
 
I
A
 
K
E
 
E
R
 
M
L
 
F
A
 
A
S
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
E
G
 
N
A
 
A
V
x
W
I
 
V
R
 
E
P
 
P
P
 
P
F
 
V
H
 
Y
C
 
F
D
x
S
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
S
N
 
N
I
 
I
H
 
H
L
 
I
G
 
G
E
 
R
G
 
N
A
 
F
F
x
Y
L
 
A
N
|
N
F
 
F
N
 
N
C
 
L
V
 
T
I
 
I
L
x
V
D
 
D
V
x
D
V
 
Y
E
 
T
V
 
V
H
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
D
G
 
N
A
 
V
Q
x
L
I
 
I
G
 
A
P
 
P
A
 
N
V
 
V
Q
 
T
L
 
L
Y
 
S
T
 
V
A
 
T
D
 
G
H
|
H
P
 
P
R
 
V
D
 
H
P
 
H
E
 
E
A
 
L
R
 
R
R
 
K
S
 
N
G
 
G
V
 
E
E
x
M
F
 
Y
G
 
S
R
 
F
P
 
P
I
 
I
N
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
N
N
 
N
V
 
V
W
|
W
V
 
I
G
|
G
G
x
S
G
 
H
A
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
N
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
A
 
S
V
 
V
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
V
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
P
G
 
N
A
 
V
T
 
V
V
 
A
V
 
A
G
 
G
N
 
V
P
|
P
A
 
C
R
 
R
I
 
V

Sites not aligning to the query:

1krrA Galactoside acetyltransferase in complex with acetyl-coenzyme a (see paper)
39% identity, 99% coverage: 1:181/182 of query aligns to 2:180/200 of 1krrA

query
sites
1krrA
M
 
M
A
 
P
M
 
M
S
 
T
E
 
E
K
 
R
Q
 
I
K
 
R
M
 
-
L
 
-
A
 
A
G
 
G
E
 
K
L
 
L
Y
 
F
Y
 
T
P
 
D
G
 
M
D
 
C
P
 
E
E
 
G
I
 
L
L
 
P
A
 
E
D
 
K
Q
 
R
A
 
L
A
 
R
A
 
G
K
 
K
A
 
T
W
 
L
M
 
M
V
 
Y
R
 
E
Y
 
F
N
 
N
A
 
H
A
 
S
L
 
H
A
 
P
A
 
S
S
 
E
P
 
V
D
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
E
A
 
S
L
 
L
L
 
I
A
 
K
E
 
E
R
 
M
L
 
F
A
 
A
S
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
E
G
 
N
A
 
A
V
 
W
I
 
V
R
 
E
P
 
P
P
 
P
F
 
V
H
 
Y
C
 
F
D
 
S
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
S
N
 
N
I
 
I
H
 
H
L
 
I
G
 
G
E
 
R
G
 
N
A
 
F
F
 
Y
L
 
A
N
|
N
F
 
F
N
 
N
C
 
L
V
 
T
I
 
I
L
 
V
D
 
D
V
 
D
V
 
Y
E
 
T
V
 
V
H
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
D
G
 
N
A
 
V
Q
 
L
I
|
I
G
x
A
P
|
P
A
 
N
V
 
V
Q
 
T
L
 
L
Y
 
S
T
 
V
A
x
T
D
 
G
H
|
H
P
 
P
R
 
V
D
 
H
P
 
H
E
 
E
A
 
L
R
 
R
R
 
K
S
 
N
G
 
G
V
 
E
E
 
M
F
 
Y
G
 
S
R
 
F
P
 
P
I
 
I
N
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
N
N
 
N
V
 
V
W
 
W
V
 
I
G
|
G
G
x
S
G
 
H
A
 
V
I
 
V
I
 
I
L
x
N
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
A
 
S
V
 
V
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
V
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
P
G
 
N
A
 
V
T
 
V
V
 
A
V
x
A
G
 
G
N
 
V
P
|
P
A
 
C
R
 
R
I
 
V

Sites not aligning to the query:

3nz2J Crystal structure of hexapeptide-repeat containing-acetyltransferase vca0836 complexed with acetyl co enzyme a from vibrio cholerae o1 biovar eltor
41% identity, 99% coverage: 1:181/182 of query aligns to 2:180/185 of 3nz2J

query
sites
3nz2J
M
 
M
A
 
K
M
 
M
S
 
S
E
 
E
K
 
L
Q
 
E
K
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
H
Y
 
F
Y
 
D
P
 
G
G
 
A
D
 
S
P
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
E
A
 
A
D
 
L
Q
 
R
A
 
S
A
 
Q
A
 
A
K
 
G
A
 
R
W
 
L
M
 
K
V
 
L
R
 
E
Y
 
I
N
 
N
A
 
Q
A
 
S
L
 
L
A
 
D
A
 
E
S
 
A
P
 
-
D
 
-
E
 
E
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
L
 
L
L
 
Q
A
 
R
E
 
E
R
 
L
L
 
F
A
 
G
S
 
H
V
 
L
G
 
G
A
 
H
G
 
K
A
 
S
V
 
C
I
 
V
R
 
Q
P
 
P
P
 
P
F
 
F
H
 
H
C
 
C
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
Y
 
K
N
 
T
I
 
I
H
 
R
L
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
H
A
 
T
F
 
F
L
 
I
N
 
N
F
 
M
N
 
N
C
 
V
V
 
V
I
 
M
L
 
L
D
 
D
V
 
G
V
 
A
E
 
P
V
 
I
H
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
D
G
 
H
A
 
V
Q
 
L
I
 
I
G
|
G
P
 
P
A
 
S
V
 
T
Q
 
Q
L
 
F
Y
|
Y
T
 
T
A
 
A
D
 
S
H
|
H
P
 
S
R
 
L
D
 
D
P
 
Y
E
 
R
A
 
R
R
 
R
R
 
Q
S
 
A
G
 
W
V
 
E
E
 
T
F
 
I
G
 
C
R
 
K
P
 
P
I
 
I
N
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
D
N
 
D
V
 
V
W
|
W
V
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
N
A
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
N
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
A
D
 
R
A
 
S
V
 
V
I
 
V
G
x
A
A
|
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
N
R
 
Q
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
P
G
 
D
A
 
T
T
 
L
V
 
V
V
x
G
G
 
G
N
x
T
P
|
P
A
 
A
R
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

3nz2C Crystal structure of hexapeptide-repeat containing-acetyltransferase vca0836 complexed with acetyl co enzyme a from vibrio cholerae o1 biovar eltor
41% identity, 98% coverage: 3:181/182 of query aligns to 1:177/183 of 3nz2C

query
sites
3nz2C
M
 
M
S
 
S
E
 
E
K
 
L
Q
 
E
K
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
H
Y
 
F
Y
 
D
P
 
G
G
 
A
D
 
S
P
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
E
A
 
A
D
 
L
Q
 
R
A
 
S
A
 
Q
A
 
A
K
 
G
A
 
R
W
 
L
M
 
K
V
 
L
R
 
E
Y
 
I
N
 
N
A
 
Q
A
 
S
L
 
L
A
 
D
A
 
E
S
 
A
P
 
-
D
 
-
E
 
E
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
L
 
L
L
 
Q
A
 
R
E
 
E
R
 
L
L
 
F
A
 
G
S
 
H
V
 
L
G
 
G
A
 
H
G
 
K
A
 
S
V
 
C
I
 
V
R
 
Q
P
 
P
P
 
P
F
 
F
H
 
H
C
 
C
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
Y
 
K
N
 
T
I
 
I
H
 
R
L
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
H
A
 
T
F
 
F
L
 
I
N
 
N
F
 
M
N
 
N
C
 
V
V
 
V
I
 
M
L
 
L
D
 
D
V
 
G
V
 
A
E
 
P
V
 
I
H
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
D
G
 
H
A
 
V
Q
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
S
V
 
T
Q
 
Q
L
 
F
Y
|
Y
T
 
T
A
 
A
D
 
S
H
|
H
P
 
S
R
 
L
D
 
D
P
 
Y
E
 
R
A
 
R
R
 
R
R
 
Q
S
 
A
G
 
W
V
 
E
E
 
T
F
 
I
G
 
C
R
 
K
P
 
P
I
 
I
N
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
D
N
 
D
V
 
V
W
 
W
V
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
N
A
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
N
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
A
D
 
R
A
 
S
V
 
V
I
 
V
G
x
A
A
|
A
G
x
N
S
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
N
R
 
Q
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
P
G
 
D
A
 
T
T
 
L
V
 
V
V
x
G
G
 
G
N
x
T
P
|
P
A
 
A
R
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

3ectA Crystal structure of the hexapeptide-repeat containing- acetyltransferase vca0836 from vibrio cholerae
39% identity, 96% coverage: 7:181/182 of query aligns to 2:170/176 of 3ectA

query
sites
3ectA
Q
 
E
K
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
K
G
 
G
E
 
H
L
 
-
Y
 
-
Y
 
-
P
 
-
G
 
A
D
 
S
P
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
E
A
 
A
D
 
L
Q
 
R
A
 
S
A
 
Q
A
 
A
K
 
G
A
 
R
W
 
L
M
 
K
V
 
L
R
 
E
Y
 
I
N
 
N
A
 
Q
A
 
S
L
 
L
A
 
D
A
 
E
S
 
A
P
 
-
D
 
-
E
 
E
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
L
 
L
L
 
Q
A
 
R
E
 
E
R
 
L
L
 
F
A
 
G
S
 
H
V
 
L
G
 
G
A
 
H
G
 
K
A
 
S
V
 
C
I
 
V
R
 
Q
P
 
P
P
 
P
F
 
F
H
 
H
C
 
C
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
Y
 
K
N
 
T
I
 
I
H
 
R
L
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
H
A
 
T
F
 
F
L
 
I
N
 
N
F
 
M
N
 
N
C
 
V
V
 
V
I
 
M
L
 
L
D
 
D
V
 
G
V
 
A
E
 
P
V
 
I
H
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
D
G
 
H
A
 
V
Q
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
S
V
 
T
Q
 
Q
L
 
F
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
D
 
S
H
 
H
P
 
S
R
 
L
D
 
D
P
 
Y
E
 
R
A
 
R
R
 
R
R
 
Q
S
 
A
G
 
W
V
 
E
E
 
T
F
 
I
G
 
C
R
 
K
P
 
P
I
 
I
N
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
D
N
 
D
V
 
V
W
 
W
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
N
A
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
N
P
 
Q
G
|
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
A
D
 
R
A
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
N
R
 
Q
D
|
D
V
 
V
P
 
P
A
 
P
G
 
D
A
 
T
T
 
L
V
 
V
V
 
G
G
 
G
N
 
T
P
 
P
A
 
A
R
 
R
I
 
I

A1ADJ6 Polysialic acid O-acetyltransferase; Capsule O-acetyl transferase; EC 2.3.1.136 from Escherichia coli O1:K1 / APEC (see paper)
38% identity, 51% coverage: 89:181/182 of query aligns to 183:276/307 of A1ADJ6

query
sites
A1ADJ6
V
 
V
I
 
V
L
 
T
D
 
D
V
 
K
V
 
C
E
 
N
V
 
V
H
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
H
G
 
D
A
 
C
Q
 
M
I
 
I
G
 
A
P
 
R
A
 
D
V
 
V
Q
 
I
L
 
L
Y
 
R
T
 
A
A
 
S
D
 
D
-
 
G
H
|
H
P
 
P
R
 
I
D
 
F
P
 
D
E
 
I
A
 
H
R
 
S
R
 
K
S
 
K
G
 
R
V
 
I
E
 
N
F
 
W
G
 
A
R
 
K
P
 
D
I
 
I
N
 
I
I
 
I
G
 
S
R
 
S
N
 
Y
V
 
V
W
|
W
V
 
V
G
 
G
G
 
R
G
 
N
A
 
V
I
 
S
I
 
I
L
 
M
P
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
S
I
 
V
G
 
G
D
 
S
D
 
G
A
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
S
 
S
V
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
S
G
 
M
A
 
C
T
 
A
V
 
A
V
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
K
I
 
I

4mzuB Crystal structure of fdtd, a bifunctional ketoisomerase/n- acetyltransferase from shewanella denitrificans (see paper)
38% identity, 47% coverage: 96:181/182 of query aligns to 65:139/290 of 4mzuB

query
sites
4mzuB
V
 
I
H
 
H
I
 
I
G
 
Q
A
 
D
G
 
D
A
 
V
Q
x
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
x
N
V
 
V
Q
 
-
L
 
-
Y
 
-
T
 
T
A
 
F
D
x
T
H
x
N
P
x
D
R
x
K
D
 
Q
P
|
P
E
 
R
A
 
S
R
 
L
R
 
K
S
 
T
G
 
I
V
 
V
E
 
K
F
 
K
G
 
G
R
 
A
P
 
S
I
 
I
N
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
V
 
-
W
 
-
V
 
-
G
|
G
G
x
A
G
 
N
A
 
S
I
 
T
I
 
I
L
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
I
T
 
L
I
 
I
G
 
G
D
 
E
D
 
N
A
 
A
V
 
M
I
 
V
G
|
G
A
|
A
G
 
G
S
 
A
V
 
V
V
 
I
T
|
T
R
x
K
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
D
G
 
N
A
 
A
T
 
I
V
 
V
V
x
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
G
R
|
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

4mzuF Crystal structure of fdtd, a bifunctional ketoisomerase/n- acetyltransferase from shewanella denitrificans (see paper)
38% identity, 47% coverage: 96:181/182 of query aligns to 65:140/294 of 4mzuF

query
sites
4mzuF
V
 
I
H
 
H
I
 
I
G
 
Q
A
 
D
G
 
D
A
 
V
Q
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
N
V
 
V
Q
 
T
L
 
F
Y
 
T
T
x
N
A
x
D
D
x
K
H
 
Q
P
 
P
R
 
R
D
 
-
P
 
-
E
 
S
A
 
K
R
 
I
R
 
K
S
 
T
G
 
I
V
 
V
E
 
K
F
 
K
G
 
G
R
 
A
P
 
S
I
 
I
N
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
V
 
-
W
 
-
V
 
-
G
|
G
G
x
A
G
 
N
A
 
S
I
 
T
I
 
I
L
|
L
P
 
P
G
 
G
V
 
I
T
 
L
I
 
I
G
 
G
D
 
E
D
 
N
A
 
A
V
 
M
I
 
V
G
|
G
A
|
A
G
 
G
S
 
A
V
 
V
V
 
I
T
|
T
R
x
K
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
D
G
 
N
A
 
A
T
 
I
V
 
V
V
x
I
G
 
G
N
|
N
P
 
P
A
 
G
R
|
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

7s42A Crystal structure of an n-acetyltransferase from helicobacter pullorum in the presence of coenzyme a and dtdp-3-acetamido-3,6-dideoxy-d- galactose (see paper)
34% identity, 55% coverage: 69:168/182 of query aligns to 42:135/145 of 7s42A

query
sites
7s42A
H
 
H
C
 
C
D
x
F
Y
 
I
G
x
E
Y
 
N
N
 
D
I
 
V
H
 
K
L
 
I
G
 
G
E
 
N
G
 
N
A
 
V
F
 
T
L
 
I
N
 
K
F
 
C
N
 
G
C
 
V
V
 
Q
I
 
I
L
x
W
D
 
D
V
 
G
V
 
I
E
 
E
V
 
I
H
 
E
I
 
-
G
 
-
A
 
D
G
 
D
A
 
V
Q
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
N
V
 
V
Q
 
T
L
 
F
Y
x
C
T
x
N
A
x
D
D
x
K
H
x
Y
P
|
P
R
 
R
D
 
S
P
 
K
E
 
Q
A
x
Y
R
 
P
R
 
K
S
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
E
F
 
F
G
 
S
R
 
K
P
 
T
I
 
I
N
 
-
I
 
I
G
 
K
R
 
K
N
 
G
V
 
A
W
 
S
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
N
A
 
A
I
 
T
I
 
I
L
|
L
P
 
P
G
 
G
V
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
E
D
 
N
A
 
A
V
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
A
V
 
I
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
V
 
V

7s41A Crystal structure of an n-acetyltransferase from helicobacter pullorum in the presence of coenzyme a and dtdp-3-acetamido-3,6-dideoxy-d- glucose (see paper)
34% identity, 55% coverage: 69:168/182 of query aligns to 42:135/145 of 7s41A

query
sites
7s41A
H
 
H
C
 
C
D
x
F
Y
 
I
G
x
E
Y
 
N
N
 
D
I
 
V
H
 
K
L
 
I
G
 
G
E
 
N
G
 
N
A
 
V
F
 
T
L
 
I
N
 
K
F
 
C
N
 
G
C
 
V
V
 
Q
I
 
I
L
x
W
D
 
D
V
 
G
V
 
I
E
 
E
V
 
I
H
 
E
I
 
-
G
 
-
A
 
D
G
 
D
A
 
V
Q
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
N
V
 
V
Q
 
T
L
 
F
Y
x
C
T
x
N
A
x
D
D
x
K
H
x
Y
P
|
P
R
 
R
D
 
S
P
 
K
E
 
Q
A
x
Y
R
 
P
R
 
K
S
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
E
F
 
F
G
 
S
R
 
K
P
 
T
I
 
I
N
 
-
I
 
I
G
 
K
R
 
K
N
 
G
V
 
A
W
 
S
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
N
A
 
A
I
 
T
I
 
I
L
|
L
P
 
P
G
 
G
V
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
E
D
 
N
A
 
A
V
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
A
V
 
I
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
V
 
V

7s3wA Crystal structure of an n-acetyltransferase from helicobacter pullorum in the presence of coenzyme a and dtdp-3-amino-3,6-dideoxy-d- galactose (see paper)
34% identity, 55% coverage: 69:168/182 of query aligns to 42:135/145 of 7s3wA

query
sites
7s3wA
H
 
H
C
 
C
D
x
F
Y
 
I
G
x
E
Y
 
N
N
 
D
I
 
V
H
 
K
L
 
I
G
 
G
E
 
N
G
 
N
A
 
V
F
 
T
L
 
I
N
 
K
F
 
C
N
 
G
C
 
V
V
 
Q
I
 
I
L
 
W
D
 
D
V
 
G
V
 
I
E
 
E
V
 
I
H
 
E
I
 
-
G
 
-
A
 
D
G
 
D
A
 
V
Q
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
N
V
 
V
Q
 
T
L
 
F
Y
x
C
T
 
N
A
x
D
D
x
K
H
x
Y
P
|
P
R
 
R
D
 
S
P
 
K
E
 
Q
A
x
Y
R
 
P
R
 
K
S
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
E
F
 
F
G
 
S
R
 
K
P
 
T
I
 
I
N
 
-
I
 
I
G
 
K
R
 
K
N
 
G
V
 
A
W
 
S
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
N
A
 
A
I
 
T
I
 
I
L
|
L
P
 
P
G
 
G
V
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
E
D
 
N
A
 
A
V
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
A
V
 
I
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
V
 
V

7s3uA Crystal structure of an n-acetyltransferase from helicobacter pullorum in the presence of coenzyme a and dtdp-3-amino-3,6-dideoxy-d-glucose (see paper)
34% identity, 55% coverage: 69:168/182 of query aligns to 42:135/145 of 7s3uA

query
sites
7s3uA
H
 
H
C
 
C
D
x
F
Y
 
I
G
x
E
Y
 
N
N
 
D
I
 
V
H
 
K
L
 
I
G
 
G
E
 
N
G
 
N
A
 
V
F
 
T
L
 
I
N
 
K
F
 
C
N
 
G
C
 
V
V
 
Q
I
 
I
L
 
W
D
 
D
V
 
G
V
 
I
E
 
E
V
 
I
H
 
E
I
 
-
G
 
-
A
 
D
G
 
D
A
 
V
Q
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
N
V
 
V
Q
 
T
L
 
F
Y
x
C
T
x
N
A
x
D
D
x
K
H
x
Y
P
|
P
R
 
R
D
 
S
P
 
K
E
 
Q
A
x
Y
R
 
P
R
 
K
S
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
E
F
 
F
G
 
S
R
 
K
P
 
T
I
 
I
N
 
-
I
 
I
G
 
K
R
 
K
N
 
G
V
 
A
W
 
S
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
N
A
 
A
I
 
T
I
 
I
L
|
L
P
 
P
G
 
G
V
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
E
D
 
N
A
 
A
V
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
A
V
 
I
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
V
 
V

7s45A Crystal structure of an n-acetyltransferase, c80t mutant, from helicobacter pullorum in the presence of acetyl coenzyme a and dtdp (see paper)
32% identity, 55% coverage: 69:168/182 of query aligns to 42:131/141 of 7s45A

query
sites
7s45A
H
 
H
C
 
C
D
x
F
Y
 
I
G
x
E
Y
 
N
N
 
D
I
 
V
H
 
K
L
 
I
G
 
G
E
 
N
G
 
N
A
 
V
F
 
T
L
 
I
N
 
K
F
 
C
N
 
G
C
 
V
V
 
Q
I
 
I
L
x
W
D
 
D
V
 
G
V
 
I
E
 
E
V
 
I
H
 
E
I
 
-
G
 
-
A
 
D
G
 
D
A
 
V
Q
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
N
V
 
V
Q
 
T
L
 
F
Y
x
T
T
x
N
A
x
D
D
x
K
H
x
Y
P
|
P
R
 
R
D
 
S
P
 
K
E
 
Q
A
 
F
R
 
S
R
 
K
S
 
T
G
 
I
V
 
I
E
 
K
F
 
K
G
 
G
R
 
A
P
 
S
I
 
I
N
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
V
 
-
W
 
-
V
 
-
G
 
G
G
 
A
G
 
N
A
 
A
I
 
T
I
 
I
L
|
L
P
 
P
G
 
G
V
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
E
D
 
N
A
 
A
V
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
A
V
 
I
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
V
 
V

4eaaA X-ray crystal structure of the h141n mutant of perosamine n- acetyltransferase from caulobacter crescentus in complex with coa and gdp-perosamine (see paper)
31% identity, 58% coverage: 78:182/182 of query aligns to 124:208/210 of 4eaaA

query
sites
4eaaA
L
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
L
A
 
A
F
 
I
L
 
I
N
 
N
F
 
T
N
 
G
C
 
A
V
 
V
I
 
V
L
 
D
D
 
N
V
 
-
V
 
-
E
 
D
V
 
C
H
 
R
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
C
Q
 
H
I
 
L
G
 
G
P
|
P
A
 
A
V
 
S
Q
 
A
L
 
L
Y
 
A
T
 
G
A
 
G
D
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
I
 
V
N
 
S
I
 
V
G
 
G
R
 
E
N
 
R
V
 
A
W
x
F
V
 
L
G
 
G
G
x
V
G
 
G
A
 
A
I
 
R
I
 
V
L
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
A
D
 
D
A
 
T
V
 
I
I
 
V
G
 
G
A
|
A
G
 
G
S
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
V
R
 
R
D
 
D
V
 
L
P
 
P
A
 
D
G
 
S
A
 
V
T
 
L
V
 
A
V
x
I
G
 
G
N
 
V
P
 
P
A
 
A
R
 
K
I
 
I
R
x
K

Sites not aligning to the query:

3fscA Crystal structure of qdtc, the dtdp-3-amino-3,6-dideoxy-d-glucose n- acetyl transferase from thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum in complex with coa and dtdp-3-amino-fucose (see paper)
32% identity, 59% coverage: 73:180/182 of query aligns to 108:217/259 of 3fscA

query
sites
3fscA
G
 
G
Y
 
N
N
 
N
I
 
V
H
x
K
L
 
I
G
|
G
E
x
T
G
 
L
A
 
S
F
 
D
L
 
I
N
 
Q
F
 
H
N
 
H
C
 
V
V
 
Y
I
 
I
L
 
G
D
 
N
V
 
Y
V
 
V
E
 
N
V
 
I
H
|
H
-
x
S
-
 
N
-
 
V
-
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
E
G
 
K
A
 
S
Q
 
I
I
 
I
G
 
K
P
 
D
A
 
F
V
 
V
Q
 
W
L
 
L
Y
x
F
-
 
P
-
 
H
-
 
V
-
 
V
T
 
L
A
 
T
D
 
N
H
 
D
P
 
P
R
 
T
D
 
P
P
 
P
E
 
S
A
 
N
R
 
E
R
 
L
S
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
I
 
-
N
 
T
I
 
I
G
 
E
R
 
L
N
 
F
V
 
A
W
 
V
V
 
I
G
x
A
G
x
A
G
 
R
A
 
S
I
 
V
I
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
I
T
 
H
I
 
I
G
 
N
D
 
E
D
 
D
A
 
A
V
 
L
I
 
V
G
|
G
A
|
A
G
 
G
S
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
K
G
 
E
A
 
T
T
 
V
V
 
V
V
|
V
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>GFF855 FitnessBrowser__psRCH2:GFF855
MAMSEKQKMLAGELYYPGDPEILADQAAAKAWMVRYNAALAASPDERRALLAERLASVGA
GAVIRPPFHCDYGYNIHLGEGAFLNFNCVILDVVEVHIGAGAQIGPAVQLYTADHPRDPE
ARRSGVEFGRPINIGRNVWVGGGAIILPGVTIGDDAVIGAGSVVTRDVPAGATVVGNPAR
IR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory