SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF856 FitnessBrowser__psRCH2:GFF856 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3wy2A Crystal structure of alpha-glucosidase in complex with glucose (see paper)
58% identity, 99% coverage: 8:541/542 of query aligns to 4:535/535 of 3wy2A

query
sites
3wy2A
W
 
W
W
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
S
 
S
F
 
F
F
 
L
D
|
D
S
 
S
N
x
R
G
 
G
D
|
D
G
 
G
V
|
V
G
 
G
D
|
D
L
 
L
P
 
N
G
 
G
V
 
I
L
 
T
H
 
E
K
 
K
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
G
I
 
I
W
 
W
L
 
L
S
 
S
P
 
P
F
 
F
F
 
F
T
 
T
S
 
S
P
 
P
M
 
M
K
 
L
D
|
D
F
 
F
G
 
G
Y
|
Y
D
 
D
V
 
V
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
R
 
R
G
 
D
V
 
V
D
 
D
P
 
P
L
 
M
F
 
F
G
 
G
T
 
T
L
 
L
D
 
E
D
 
D
F
 
F
V
 
K
R
 
A
L
 
L
V
 
L
E
 
E
A
 
K
C
 
A
H
 
H
E
 
S
R
 
L
G
 
G
M
 
L
R
 
K
V
 
V
L
 
M
I
 
I
D
|
D
Q
 
Q
V
 
V
L
 
I
N
x
S
H
|
H
S
 
T
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
W
 
W
F
 
F
A
 
Q
E
 
E
S
 
S
R
 
R
S
 
Q
S
 
N
R
 
R
D
 
T
N
 
N
D
 
P
K
 
K
A
 
A
D
 
D
W
 
W
Y
 
F
V
 
V
W
 
W
A
 
A
D
 
D
P
 
P
K
 
K
P
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
P
P
 
P
N
 
N
N
 
N
W
 
W
L
 
L
S
 
S
V
 
I
F
|
F
G
 
G
G
 
G
P
 
S
A
 
A
W
 
W
S
 
T
W
 
F
D
 
D
S
 
S
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
Q
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
L
|
L
H
 
H
N
|
N
F
|
F
L
 
L
S
 
T
S
 
S
Q
|
Q
P
 
P
D
|
D
L
x
V
N
 
N
F
|
F
H
 
H
C
 
H
P
|
P
A
 
E
V
 
A
Q
x
R
D
x
Q
Q
 
A
L
 
Q
L
|
L
D
 
D
D
 
N
M
 
M
E
 
R
F
 
F
W
 
W
L
 
L
K
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
F
R
|
R
L
 
L
D
|
D
A
x
T
A
 
V
N
 
N
F
|
F
Y
|
Y
F
|
F
H
|
H
D
 
D
A
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
D
N
 
N
P
 
P
P
 
P
N
 
V
T
 
P
E
 
K
I
 
G
R
 
E
E
 
A
G
 
K
S
 
T
I
 
L
G
 
G
V
 
A
R
 
P
I
 
E
D
 
A
N
 
N
P
 
P
Y
 
Y
A
 
T
Y
 
W
Q
 
Q
R
 
R
H
 
H
I
 
V
Y
 
Y
D
|
D
K
 
L
T
x
S
R
|
R
P
|
P
E
 
E
N
 
N
M
 
L
D
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
K
R
x
D
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
M
Q
 
D
R
 
E
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
A
 
T
S
 
T
S
 
T
V
 
V
A
 
G
E
|
E
I
 
I
G
 
G
C
 
D
D
 
D
E
 
N
S
 
P
L
 
L
R
 
E
T
x
R
M
 
M
A
 
A
A
x
E
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
G
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
K
L
 
L
H
 
H
M
 
M
A
 
A
Y
 
Y
S
 
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
N
E
 
M
Q
 
P
C
 
H
S
 
S
P
 
A
G
 
S
Y
 
Y
I
 
L
R
 
R
H
 
E
T
 
V
V
 
I
E
 
E
G
 
R
I
 
F
E
 
Q
R
 
R
E
 
L
L
 
A
A
 
G
D
 
D
G
 
A
W
 
W
S
 
P
C
 
C
W
 
W
S
 
A
M
 
T
G
 
S
N
 
N
H
|
H
D
|
D
V
 
V
V
 
V
R
 
R
V
 
S
M
 
A
T
 
T
R
 
R
W
 
W
A
 
G
L
 
A
N
 
D
G
 
E
R
 
D
P
 
P
D
 
H
P
 
-
E
 
A
R
 
Y
G
 
P
R
 
K
L
 
V
L
 
M
M
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
L
L
 
F
S
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
C
 
C
M
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
A
E
 
D
L
 
V
R
 
P
Y
 
F
E
 
E
D
 
R
L
 
I
V
 
Q
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
I
 
K
T
 
V
F
 
L
W
 
W
P
 
P
E
 
E
F
 
F
K
 
K
G
 
G
R
|
R
D
 
D
G
 
G
C
 
C
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
M
P
 
P
W
 
W
E
 
-
S
x
T
E
 
D
A
x
G
H
 
E
H
 
Q
A
 
G
G
|
G
F
 
F
T
 
S
G
 
P
S
 
V
Q
 
E
P
 
P
W
 
W
L
 
L
P
 
P
V
 
M
D
 
E
D
 
A
S
 
R
H
 
H
R
 
L
S
 
E
L
 
L
S
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
R
Q
 
Q
D
 
Q
A
 
D
D
 
D
P
 
P
H
 
N
S
 
A
M
 
T
L
 
L
N
 
N
C
 
T
Y
 
V
R
 
R
R
 
A
F
 
L
L
 
L
G
 
A
W
 
F
R
 
R
R
 
R
E
 
S
Q
 
H
R
 
P
L
 
A
L
 
L
I
 
F
E
 
D
G
 
G
D
 
D
I
 
L
H
 
S
M
 
L
V
 
V
Y
 
D
H
 
V
D
 
G
D
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
G
F
 
F
E
 
T
R
 
R
R
 
Q
L
 
K
G
 
G
D
 
D
E
 
E
A
 
T
W
 
L
L
 
L
C
 
C
L
 
V
F
 
F
N
 
N
L
 
L
G
 
T
D
 
G
L
 
Q
S
 
E
R
 
Q
S
 
Q
Y
 
T
E
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
V
Q
 
E
A
 
V
V
 
A
P
 
S
L
 
D
V
 
L
D
 
P
V
 
V
P
 
A
A
 
H
S
 
F
F
 
T
A
 
A
E
 
T
Y
 
R
D
 
D
G
 
G
H
 
S
W
 
T
A
 
L
R
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
A
H
 
Y
G
 
Q
F
 
A
G
 
A
Y
 
F
V
 
M
R
 
Q
L
 
V
A
 
A

3wy1A Crystal structure of alpha-glucosidase (see paper)
58% identity, 99% coverage: 8:541/542 of query aligns to 4:535/535 of 3wy1A

query
sites
3wy1A
W
 
W
W
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
S
 
S
F
 
F
F
 
L
D
|
D
S
 
S
N
 
R
G
 
G
D
|
D
G
 
G
V
|
V
G
 
G
D
|
D
L
 
L
P
 
N
G
 
G
V
 
I
L
 
T
H
 
E
K
 
K
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
G
I
 
I
W
 
W
L
 
L
S
 
S
P
 
P
F
 
F
F
 
F
T
 
T
S
 
S
P
 
P
M
 
M
K
 
L
D
|
D
F
 
F
G
 
G
Y
|
Y
D
 
D
V
 
V
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
R
 
R
G
 
D
V
 
V
D
 
D
P
 
P
L
 
M
F
 
F
G
 
G
T
 
T
L
 
L
D
 
E
D
 
D
F
 
F
V
 
K
R
 
A
L
 
L
V
 
L
E
 
E
A
 
K
C
 
A
H
 
H
E
 
S
R
 
L
G
 
G
M
 
L
R
 
K
V
 
V
L
 
M
I
 
I
D
|
D
Q
 
Q
V
 
V
L
 
I
N
x
S
H
|
H
S
 
T
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
W
 
W
F
 
F
A
 
Q
E
 
E
S
 
S
R
 
R
S
 
Q
S
 
N
R
 
R
D
 
T
N
 
N
D
 
P
K
 
K
A
 
A
D
 
D
W
 
W
Y
 
F
V
 
V
W
 
W
A
 
A
D
 
D
P
 
P
K
 
K
P
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
P
P
 
P
N
 
N
N
 
N
W
 
W
L
 
L
S
 
S
V
x
I
F
|
F
G
 
G
G
 
G
P
 
S
A
 
A
W
 
W
S
 
T
W
 
F
D
 
D
S
 
S
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
Q
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
L
|
L
H
 
H
N
|
N
F
|
F
L
 
L
S
 
T
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
D
|
D
L
x
V
N
 
N
F
|
F
H
 
H
C
 
H
P
 
P
A
 
E
V
 
A
Q
 
R
D
 
Q
Q
 
A
L
 
Q
L
 
L
D
 
D
D
 
N
M
 
M
E
 
R
F
 
F
W
 
W
L
 
L
K
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
F
R
|
R
L
 
L
D
|
D
A
x
T
A
 
V
N
 
N
F
|
F
Y
|
Y
F
|
F
H
|
H
D
 
D
A
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
D
N
 
N
P
 
P
P
 
P
N
 
V
T
 
P
E
 
K
I
 
G
R
 
E
E
 
A
G
 
K
S
 
T
I
 
L
G
|
G
V
 
A
R
 
P
I
 
E
D
 
A
N
 
N
P
 
P
Y
 
Y
A
 
T
Y
 
W
Q
 
Q
R
 
R
H
 
H
I
 
V
Y
 
Y
D
|
D
K
 
L
T
 
S
R
 
R
P
 
P
E
 
E
N
 
N
M
 
L
D
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
K
R
 
D
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
M
Q
 
D
R
 
E
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
A
 
T
S
 
T
S
 
T
V
 
V
A
 
G
E
|
E
I
 
I
G
 
G
C
 
D
D
 
D
E
 
N
S
 
P
L
 
L
R
 
E
T
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
E
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
G
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
K
L
 
L
H
 
H
M
 
M
A
 
A
Y
 
Y
S
 
T
F
|
F
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
N
E
 
M
Q
 
P
C
 
H
S
 
S
P
 
A
G
 
S
Y
 
Y
I
 
L
R
 
R
H
 
E
T
 
V
V
 
I
E
 
E
G
 
R
I
 
F
E
 
Q
R
 
R
E
 
L
L
 
A
A
 
G
D
 
D
G
 
A
W
 
W
S
 
P
C
 
C
W
 
W
S
 
A
M
 
T
G
 
S
N
 
N
H
|
H
D
|
D
V
 
V
V
 
V
R
 
R
V
 
S
M
 
A
T
 
T
R
 
R
W
 
W
A
 
G
L
 
A
N
 
D
G
 
E
R
 
D
P
 
P
D
 
H
P
 
-
E
 
A
R
 
Y
G
 
P
R
 
K
L
 
V
L
 
M
M
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
L
L
 
F
S
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
C
 
C
M
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
A
E
 
D
L
 
V
R
 
P
Y
 
F
E
 
E
D
 
R
L
 
I
V
 
Q
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
I
 
K
T
 
V
F
 
L
W
 
W
P
 
P
E
 
E
F
 
F
K
 
K
G
 
G
R
|
R
D
 
D
G
 
G
C
 
C
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
M
P
 
P
W
 
W
E
 
-
S
 
T
E
 
D
A
 
G
H
 
E
H
 
Q
A
 
G
G
 
G
F
 
F
T
 
S
G
 
P
S
 
V
Q
 
E
P
 
P
W
 
W
L
 
L
P
 
P
V
 
M
D
 
E
D
 
A
S
 
R
H
 
H
R
 
L
S
 
E
L
 
L
S
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
R
Q
 
Q
D
 
Q
A
 
D
D
 
D
P
 
P
H
 
N
S
 
A
M
 
T
L
 
L
N
 
N
C
 
T
Y
 
V
R
 
R
R
 
A
F
 
L
L
 
L
G
 
A
W
 
F
R
 
R
R
 
R
E
 
S
Q
 
H
R
 
P
L
 
A
L
 
L
I
 
F
E
 
D
G
 
G
D
 
D
I
 
L
H
 
S
M
 
L
V
 
V
Y
 
D
H
 
V
D
 
G
D
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
G
F
 
F
E
 
T
R
 
R
R
 
Q
L
 
K
G
 
G
D
 
D
E
 
E
A
 
T
W
 
L
L
 
L
C
 
C
L
 
V
F
 
F
N
 
N
L
 
L
G
 
T
D
 
G
L
 
Q
S
 
E
R
 
Q
S
 
Q
Y
 
T
E
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
V
Q
 
E
A
 
V
V
 
A
P
 
S
L
 
D
V
 
L
D
 
P
V
 
V
P
 
A
A
 
H
S
 
F
F
 
T
A
 
A
E
 
T
Y
 
R
D
 
D
G
 
G
H
 
S
W
 
T
A
 
L
R
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
A
H
 
Y
G
 
Q
F
 
A
G
 
A
Y
 
F
V
 
M
R
 
Q
L
 
V
A
 
A

3wy4A Crystal structure of alpha-glucosidase mutant e271q in complex with maltose (see paper)
58% identity, 99% coverage: 8:541/542 of query aligns to 4:535/535 of 3wy4A

query
sites
3wy4A
W
 
W
W
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
S
 
S
F
 
F
F
 
L
D
|
D
S
 
S
N
 
R
G
 
G
D
|
D
G
 
G
V
|
V
G
 
G
D
|
D
L
 
L
P
 
N
G
 
G
V
 
I
L
 
T
H
 
E
K
 
K
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
G
I
 
I
W
 
W
L
 
L
S
 
S
P
 
P
F
 
F
F
 
F
T
 
T
S
 
S
P
 
P
M
 
M
K
 
L
D
|
D
F
 
F
G
 
G
Y
|
Y
D
 
D
V
 
V
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
R
 
R
G
 
D
V
 
V
D
 
D
P
 
P
L
 
M
F
 
F
G
 
G
T
 
T
L
 
L
D
 
E
D
 
D
F
 
F
V
 
K
R
 
A
L
 
L
V
 
L
E
 
E
A
 
K
C
 
A
H
 
H
E
 
S
R
 
L
G
 
G
M
 
L
R
 
K
V
 
V
L
 
M
I
 
I
D
|
D
Q
 
Q
V
 
V
L
 
I
N
x
S
H
|
H
S
 
T
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
W
 
W
F
 
F
A
 
Q
E
 
E
S
 
S
R
 
R
S
 
Q
S
 
N
R
 
R
D
 
T
N
 
N
D
 
P
K
 
K
A
 
A
D
 
D
W
 
W
Y
 
F
V
 
V
W
 
W
A
 
A
D
 
D
P
 
P
K
 
K
P
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
P
P
 
P
N
 
N
N
 
N
W
 
W
L
 
L
S
 
S
V
x
I
F
|
F
G
 
G
G
 
G
P
 
S
A
 
A
W
 
W
S
 
T
W
 
F
D
 
D
S
 
S
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
Q
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
L
|
L
H
 
H
N
|
N
F
|
F
L
 
L
S
 
T
S
 
S
Q
|
Q
P
 
P
D
|
D
L
x
V
N
 
N
F
|
F
H
 
H
C
 
H
P
 
P
A
 
E
V
 
A
Q
 
R
D
 
Q
Q
 
A
L
 
Q
L
 
L
D
 
D
D
 
N
M
 
M
E
 
R
F
 
F
W
 
W
L
 
L
K
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
F
R
|
R
L
 
L
D
|
D
A
x
T
A
 
V
N
 
N
F
|
F
Y
|
Y
F
|
F
H
|
H
D
 
D
A
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
D
N
 
N
P
 
P
P
 
P
N
 
V
T
 
P
E
 
K
I
 
G
R
 
E
E
 
A
G
 
K
S
 
T
I
x
L
G
|
G
V
x
A
R
x
P
I
 
E
D
 
A
N
 
N
P
 
P
Y
 
Y
A
 
T
Y
 
W
Q
 
Q
R
 
R
H
 
H
I
 
V
Y
 
Y
D
|
D
K
 
L
T
 
S
R
 
R
P
 
P
E
 
E
N
 
N
M
 
L
D
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
K
R
 
D
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
M
Q
 
D
R
 
E
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
A
 
T
S
 
T
S
 
T
V
 
V
A
 
G
E
x
Q
I
 
I
G
|
G
C
 
D
D
 
D
E
 
N
S
 
P
L
 
L
R
 
E
T
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
E
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
G
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
K
L
 
L
H
 
H
M
 
M
A
 
A
Y
 
Y
S
 
T
F
|
F
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
N
E
 
M
Q
 
P
C
 
H
S
 
S
P
 
A
G
 
S
Y
 
Y
I
 
L
R
 
R
H
 
E
T
 
V
V
 
I
E
 
E
G
 
R
I
 
F
E
 
Q
R
 
R
E
 
L
L
 
A
A
 
G
D
 
D
G
 
A
W
 
W
S
 
P
C
 
C
W
 
W
S
 
A
M
 
T
G
 
S
N
 
N
H
|
H
D
|
D
V
|
V
V
 
V
R
 
R
V
 
S
M
 
A
T
 
T
R
 
R
W
 
W
A
 
G
L
 
A
N
 
D
G
 
E
R
 
D
P
 
P
D
 
H
P
 
-
E
 
A
R
 
Y
G
 
P
R
 
K
L
 
V
L
 
M
M
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
L
L
 
F
S
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
C
 
C
M
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
|
E
A
|
A
E
x
D
L
x
V
R
 
P
Y
 
F
E
 
E
D
 
R
L
 
I
V
 
Q
D
 
D
P
 
P
Y
|
Y
G
 
G
I
 
K
T
 
V
F
 
L
W
 
W
P
 
P
E
 
E
F
|
F
K
|
K
G
|
G
R
|
R
D
 
D
G
|
G
C
 
C
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
M
P
 
P
W
 
W
E
 
-
S
 
T
E
 
D
A
 
G
H
 
E
H
 
Q
A
 
G
G
 
G
F
 
F
T
 
S
G
 
P
S
 
V
Q
 
E
P
 
P
W
 
W
L
 
L
P
 
P
V
 
M
D
 
E
D
 
A
S
 
R
H
 
H
R
 
L
S
 
E
L
 
L
S
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
R
Q
 
Q
D
 
Q
A
 
D
D
 
D
P
 
P
H
 
N
S
 
A
M
 
T
L
 
L
N
 
N
C
 
T
Y
 
V
R
 
R
R
 
A
F
 
L
L
 
L
G
 
A
W
 
F
R
 
R
R
 
R
E
 
S
Q
 
H
R
 
P
L
 
A
L
 
L
I
 
F
E
 
D
G
 
G
D
 
D
I
 
L
H
 
S
M
 
L
V
 
V
Y
 
D
H
 
V
D
 
G
D
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
G
F
 
F
E
 
T
R
 
R
R
 
Q
L
 
K
G
 
G
D
 
D
E
 
E
A
 
T
W
 
L
L
 
L
C
 
C
L
 
V
F
 
F
N
 
N
L
 
L
G
 
T
D
 
G
L
 
Q
S
 
E
R
 
Q
S
 
Q
Y
 
T
E
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
V
Q
 
E
A
 
V
V
 
A
P
 
S
L
 
D
V
 
L
D
 
P
V
 
V
P
 
A
A
 
H
S
 
F
F
 
T
A
 
A
E
 
T
Y
 
R
D
 
D
G
 
G
H
 
S
W
 
T
A
 
L
R
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
A
H
 
Y
G
 
Q
F
 
A
G
 
A
Y
 
F
V
 
M
R
 
Q
L
 
V
A
 
A

3wy4B Crystal structure of alpha-glucosidase mutant e271q in complex with maltose (see paper)
57% identity, 68% coverage: 8:374/542 of query aligns to 4:323/421 of 3wy4B

query
sites
3wy4B
W
 
W
W
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
S
 
S
F
 
F
F
 
-
D
 
-
S
 
-
N
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
N
G
 
G
V
 
I
L
 
T
H
 
E
K
 
K
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
G
I
 
I
W
 
W
L
 
L
S
 
S
P
 
P
F
 
F
F
 
F
T
 
T
S
 
S
P
 
P
M
 
M
K
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
T
 
T
L
 
L
D
 
E
D
 
D
F
 
F
V
 
K
R
 
A
L
 
L
V
 
L
E
 
E
A
 
K
C
 
A
H
 
H
E
 
S
R
 
L
G
 
G
M
 
L
R
 
K
V
 
V
L
 
M
I
 
I
D
|
D
Q
 
Q
V
 
V
L
 
I
N
x
S
H
 
H
S
 
T
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
W
 
W
F
 
F
A
 
Q
E
 
E
S
 
S
R
 
R
S
 
Q
S
 
N
R
 
R
D
 
T
N
 
N
D
 
P
K
 
K
A
 
A
D
 
D
W
 
W
Y
 
F
V
 
V
W
 
W
A
 
A
D
 
D
P
 
P
K
 
K
P
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
P
P
 
P
N
 
N
N
 
N
W
 
W
L
 
L
S
 
S
V
 
I
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
S
A
 
A
W
 
W
S
 
T
W
 
F
D
 
D
S
 
S
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
Q
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
L
|
L
H
 
H
N
|
N
F
 
F
L
 
L
S
 
T
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
D
|
D
L
x
V
N
 
N
F
|
F
H
 
H
C
 
H
P
 
P
A
 
E
V
 
A
Q
 
R
D
 
Q
Q
 
A
L
 
Q
L
 
L
D
 
D
D
 
N
M
 
M
E
 
R
F
 
F
W
 
W
L
 
L
K
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
F
R
|
R
L
 
L
D
|
D
A
 
T
A
 
V
N
 
N
F
|
F
Y
|
Y
F
|
F
H
|
H
D
 
D
A
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
D
N
 
N
P
 
P
P
 
P
N
 
V
T
 
P
E
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
K
I
 
E
D
 
A
N
 
N
P
 
P
Y
 
Y
A
 
T
Y
 
W
Q
 
Q
R
 
R
H
 
H
I
 
V
Y
 
Y
D
|
D
K
 
L
T
 
S
R
 
R
P
 
P
E
 
E
N
 
N
M
 
L
D
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
K
R
 
D
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
M
Q
 
D
R
 
E
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
A
 
T
S
 
T
S
 
T
V
 
V
A
 
G
E
x
Q
I
 
I
G
 
G
C
 
D
D
 
D
E
 
N
S
 
P
L
 
L
R
 
E
T
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
E
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
G
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
K
L
 
L
H
 
H
M
 
M
A
 
A
Y
 
Y
S
 
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
N
E
 
M
Q
 
P
C
 
H
S
 
S
P
 
A
G
 
S
Y
 
Y
I
 
L
R
 
R
H
 
E
T
 
V
V
 
I
E
 
E
G
 
R
I
 
F
E
 
Q
R
 
R
E
 
L
L
 
A
A
 
G
D
 
D
G
 
A
W
 
W
S
 
P
C
 
C
W
 
W
S
 
A
M
 
T
G
 
S
N
 
D
-
 
P
H
 
H
D
 
A
V
 
Y
V
 
P
R
 
K
V
 
V
M
 
M
T
 
-
R
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
M
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
L
L
 
F
S
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
C
 
C
M
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
E
 
E

4m56A The structure of wild-type mall from bacillus subtilis (see paper)
35% identity, 93% coverage: 8:511/542 of query aligns to 2:522/555 of 4m56A

query
sites
4m56A
W
 
W
W
 
W
R
 
K
G
 
E
G
 
A
V
 
V
I
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
D
 
D
S
 
A
N
 
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
F
G
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
L
 
I
H
 
Q
K
 
K
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
A
 
K
S
 
N
L
 
L
N
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
V
I
 
I
W
 
W
L
 
L
S
 
S
P
 
P
F
 
V
F
 
F
T
 
D
S
 
S
P
 
P
M
 
Q
K
 
D
D
|
D
F
 
N
G
 
G
Y
|
Y
D
 
D
V
 
I
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
R
 
K
G
 
N
V
 
M
D
 
Y
P
 
E
L
 
K
F
 
F
G
 
G
T
 
T
L
 
N
D
 
E
D
 
D
F
 
M
V
 
F
R
 
Q
L
 
L
V
 
I
E
 
D
A
 
E
C
 
V
H
 
H
E
 
K
R
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
I
L
 
V
I
 
M
D
|
D
Q
 
L
V
 
V
L
 
V
N
 
N
H
|
H
S
 
T
S
 
S
D
 
D
Q
 
E
H
 
H
P
 
A
W
 
W
F
 
F
A
 
A
E
 
E
S
 
S
R
 
R
S
 
K
S
 
S
R
 
K
D
 
D
N
 
N
D
 
P
K
 
Y
A
 
R
D
 
D
W
 
Y
Y
 
Y
V
 
L
W
 
W
A
 
K
D
 
D
P
 
P
K
 
K
P
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
E
P
 
P
N
 
N
N
 
N
W
 
W
L
 
G
S
 
S
V
 
I
F
|
F
G
 
S
G
 
G
P
 
S
A
 
A
W
 
W
S
 
T
W
 
Y
D
 
D
S
 
E
R
 
G
R
 
T
R
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
N
 
Y
F
|
F
L
 
S
S
 
K
S
 
K
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
L
 
L
N
 
N
F
 
W
H
 
E
C
 
N
P
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
D
 
R
Q
 
E
L
 
V
L
 
Y
D
 
D
D
 
V
M
 
M
E
 
R
F
 
F
W
 
W
L
 
M
K
 
D
L
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
W
R
|
R
L
 
M
D
|
D
A
x
V
A
 
I
N
 
-
F
 
-
Y
 
-
F
 
-
H
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
R
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
-
P
 
-
N
 
-
T
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
G
S
 
S
I
 
I
G
 
S
V
 
K
R
 
Y
I
 
T
D
 
D
N
 
F
P
 
P
-
 
D
Y
 
Y
A
 
E
Y
 
T
Q
 
R
R
 
S
H
 
Y
I
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
R
Y
 
Y
D
 
H
K
 
S
T
 
N
R
 
G
P
 
P
E
 
R
N
 
L
M
 
H
D
 
E
F
 
F
L
 
I
R
 
Q
R
 
E
L
 
M
-
 
N
R
 
R
A
 
E
L
 
V
L
 
L
Q
 
S
R
 
H
Y
 
Y
P
 
D
G
 
C
A
 
M
S
 
T
S
 
V
V
 
G
A
x
E
E
 
A
I
 
N
G
 
G
C
 
S
D
 
D
E
 
-
S
 
-
L
 
I
R
 
E
T
 
E
M
 
A
A
 
K
A
 
K
Y
 
Y
T
 
T
S
 
D
G
 
A
G
 
S
-
 
R
D
 
Q
T
 
E
L
 
L
H
 
N
M
 
M
A
 
I
Y
 
F
S
 
T
F
 
F
-
 
E
-
 
H
-
 
M
D
 
D
L
 
I
L
 
D
T
 
K
E
 
E
Q
 
Q
C
 
N
S
 
S
P
 
P
G
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
W
-
 
Q
-
 
I
-
 
K
-
 
P
-
 
F
-
 
D
-
 
L
-
 
I
Y
 
A
I
 
L
R
 
K
H
 
K
T
 
T
V
 
M
E
 
T
G
 
R
I
 
W
E
 
Q
R
 
T
E
 
G
L
 
L
A
 
M
D
 
N
-
 
V
G
 
G
W
 
W
S
 
N
C
 
T
W
 
L
S
 
Y
M
 
F
G
 
E
N
 
N
H
|
H
D
|
D
V
 
Q
V
 
P
R
 
R
V
 
V
M
 
I
T
 
S
R
 
R
W
 
W
A
 
G
L
 
N
N
 
D
G
 
R
R
 
K
P
 
L
D
 
R
P
 
K
E
 
E
R
 
C
G
 
A
R
 
K
L
 
A
L
 
F
M
 
A
A
 
T
L
 
V
L
 
L
L
 
H
S
 
G
L
 
M
R
 
K
G
 
G
S
 
T
V
 
P
C
 
F
M
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
E
 
E
L
 
I
G
 
G
L
 
M
P
 
V
E
 
N
A
 
S
E
 
D
L
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
M
-
 
Y
-
 
D
-
 
D
-
 
L
-
x
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
R
 
A
Y
 
Y
E
 
R
D
 
E
L
 
L
V
 
V
D
 
V
P
 
E
Y
 
N
G
 
K
I
 
T
T
 
M
F
 
S
W
 
E
P
 
K
E
 
E
F
 
F
-
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
M
-
 
I
K
 
K
G
 
G
R
|
R
D
 
D
G
 
H
C
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
M
P
 
Q
W
 
W
E
 
D
S
 
A
E
 
-
A
 
G
H
 
K
H
 
H
A
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
T
G
 
A
S
 
G
Q
 
D
P
 
P
W
 
W
L
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
N
D
 
S
S
 
R
H
 
Y
R
 
Q
S
 
D
L
 
I
S
 
N
V
 
V
A
 
K
A
 
E
Q
 
S
D
 
L
A
 
E
D
 
D
P
 
Q
H
 
D
S
 
S
M
 
I
L
 
F
N
 
F
C
 
Y
Y
 
Y
R
 
Q
R
 
K
F
 
L
L
 
I
G
 
Q
W
 
L
R
 
R
R
 
K
E
 
Q
Q
 
Y
R
 
K
L
 
I
L
 
M
I
 
I
E
 
Y
G
 
G
D
 
D
I
 
Y
H
 
Q
M
 
L
V
 
L
Y
 
Q
H
 
E
D
 
N
D
 
D
-
 
P
A
 
Q
L
 
V
L
 
F
V
 
S
F
 
Y
E
 
L
R
 
R
R
 
E
L
 
Y
G
 
R
D
 
G
E
 
E
A
 
K
W
 
L
L
 
L
C
 
V
L
 
V
F
 
V
N
 
N
L
 
L
G
 
S
D
 
E
L
 
E
S
 
K
R
 
A
S
 
L
Y
 
F
E
 
E
L
 
A
P
 
P
A
 
P
Q
 
E
A
 
L
V
 
I

5wczA Crystal structure of wild-type mall from bacillus subtilis with ts analogue 1-deoxynojirimycin (see paper)
35% identity, 93% coverage: 8:511/542 of query aligns to 2:522/556 of 5wczA

query
sites
5wczA
W
 
W
W
 
W
R
 
K
G
 
E
G
 
A
V
 
V
I
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
D
 
D
S
 
A
N
 
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
F
G
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
L
 
I
H
 
Q
K
 
K
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
A
 
K
S
 
N
L
 
L
N
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
V
I
 
I
W
 
W
L
 
L
S
 
S
P
 
P
F
 
V
F
 
F
T
 
D
S
 
S
P
 
P
M
 
Q
K
 
D
D
|
D
F
 
N
G
 
G
Y
|
Y
D
 
D
V
 
I
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
R
 
K
G
 
N
V
 
M
D
 
Y
P
 
E
L
 
K
F
 
F
G
 
G
T
 
T
L
 
N
D
 
E
D
 
D
F
 
M
V
 
F
R
 
Q
L
 
L
V
 
I
E
 
D
A
 
E
C
 
V
H
 
H
E
 
K
R
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
I
L
 
V
I
 
M
D
|
D
Q
 
L
V
 
V
L
 
V
N
 
N
H
|
H
S
 
T
S
 
S
D
 
D
Q
 
E
H
 
H
P
 
A
W
 
W
F
 
F
A
 
A
E
 
E
S
 
S
R
 
R
S
 
K
S
 
S
R
 
K
D
 
D
N
 
N
D
 
P
K
 
Y
A
 
R
D
 
D
W
 
Y
Y
 
Y
V
 
L
W
 
W
A
 
K
D
 
D
P
 
P
K
 
K
P
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
E
P
 
P
N
 
N
N
 
N
W
 
W
L
 
G
S
 
S
V
 
I
F
|
F
G
 
S
G
 
G
P
 
S
A
 
A
W
 
W
S
 
T
W
 
Y
D
 
D
S
 
E
R
 
G
R
 
T
R
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
N
 
Y
F
|
F
L
 
S
S
 
K
S
 
K
Q
|
Q
P
 
P
D
 
D
L
 
L
N
 
N
F
 
W
H
 
E
C
 
N
P
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
D
 
R
Q
 
E
L
 
V
L
 
Y
D
 
D
D
 
V
M
 
M
E
 
R
F
 
F
W
 
W
L
 
M
K
 
D
L
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
W
R
|
R
L
 
M
D
|
D
A
x
V
A
 
I
N
 
-
F
 
-
Y
 
-
F
 
-
H
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
R
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
-
P
 
-
N
 
-
T
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
G
S
 
S
I
 
I
G
 
S
V
 
K
R
 
Y
I
 
T
D
 
D
N
 
F
P
 
P
-
 
D
Y
 
Y
A
 
E
Y
 
T
Q
 
R
R
 
S
H
 
Y
I
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
R
Y
 
Y
D
 
H
K
 
S
T
 
N
R
 
G
P
 
P
E
 
R
N
 
L
M
 
H
D
 
E
F
 
F
L
 
I
R
 
Q
R
 
E
L
 
M
-
 
N
R
 
R
A
 
E
L
 
V
L
 
L
Q
 
S
R
 
H
Y
 
Y
P
 
D
G
 
C
A
 
M
S
 
T
S
 
V
V
 
G
A
x
E
E
 
A
I
 
N
G
 
G
C
 
S
D
 
D
E
 
-
S
 
-
L
 
I
R
 
E
T
 
E
M
 
A
A
 
K
A
 
K
Y
 
Y
T
 
T
S
 
D
G
 
A
G
 
S
-
 
R
D
 
Q
T
 
E
L
 
L
H
 
N
M
 
M
A
 
I
Y
 
F
S
 
T
F
 
F
-
 
E
-
 
H
-
 
M
D
 
D
L
 
I
L
 
D
T
 
K
E
 
E
Q
 
Q
C
 
N
S
 
S
P
 
P
G
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
W
-
 
Q
-
 
I
-
 
K
-
 
P
-
 
F
-
 
D
-
 
L
-
 
I
Y
 
A
I
 
L
R
 
K
H
 
K
T
 
T
V
 
M
E
 
T
G
 
R
I
 
W
E
 
Q
R
 
T
E
 
G
L
 
L
A
 
M
D
 
N
-
 
V
G
 
G
W
 
W
S
 
N
C
 
T
W
 
L
S
 
Y
M
 
F
G
 
E
N
 
N
H
|
H
D
|
D
V
 
Q
V
 
P
R
 
R
V
 
V
M
 
I
T
 
S
R
 
R
W
 
W
A
 
G
L
 
N
N
 
D
G
 
R
R
 
K
P
 
L
D
 
R
P
 
K
E
 
E
R
 
C
G
 
A
R
 
K
L
 
A
L
 
F
M
 
A
A
 
T
L
 
V
L
 
L
L
 
H
S
 
G
L
 
M
R
 
K
G
 
G
S
 
T
V
 
P
C
 
F
M
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
E
 
E
L
 
I
G
 
G
L
 
M
P
 
V
E
 
N
A
 
S
E
 
D
L
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
M
-
 
Y
-
 
D
-
 
D
-
 
L
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
R
 
A
Y
 
Y
E
 
R
D
 
E
L
 
L
V
 
V
D
 
V
P
 
E
Y
 
N
G
 
K
I
 
T
T
 
M
F
 
S
W
 
E
P
 
K
E
 
E
F
 
F
-
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
M
-
 
I
K
 
K
G
 
G
R
|
R
D
 
D
G
 
H
C
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
M
P
 
Q
W
 
W
E
 
D
S
 
A
E
 
-
A
 
G
H
 
K
H
 
H
A
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
T
G
 
A
S
 
G
Q
 
D
P
 
P
W
 
W
L
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
N
D
 
S
S
 
R
H
 
Y
R
 
Q
S
 
D
L
 
I
S
 
N
V
 
V
A
 
K
A
 
E
Q
 
S
D
 
L
A
 
E
D
 
D
P
 
Q
H
 
D
S
 
S
M
 
I
L
 
F
N
 
F
C
 
Y
Y
 
Y
R
 
Q
R
 
K
F
 
L
L
 
I
G
 
Q
W
 
L
R
 
R
R
 
K
E
 
Q
Q
 
Y
R
 
K
L
 
I
L
 
M
I
 
I
E
 
Y
G
 
G
D
 
D
I
 
Y
H
 
Q
M
 
L
V
 
L
Y
 
Q
H
 
E
D
 
N
D
 
D
-
 
P
A
 
Q
L
 
V
L
 
F
V
 
S
F
 
Y
E
 
L
R
 
R
R
 
E
L
 
Y
G
 
R
D
 
G
E
 
E
A
 
K
W
 
L
L
 
L
C
 
V
L
 
V
F
 
V
N
 
N
L
 
L
G
 
S
D
 
E
L
 
E
S
 
K
R
 
A
S
 
L
Y
 
F
E
 
E
L
 
A
P
 
P
A
 
P
Q
 
E
A
 
L
V
 
I

O06994 Oligo-1,6-glucosidase 1; Dextrin 6-alpha-D-glucanohydrolase; Oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase 1; Sucrase-isomaltase 1; Isomaltase 1; EC 3.2.1.10 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
35% identity, 94% coverage: 5:511/542 of query aligns to 1:527/561 of O06994

query
sites
O06994
L
 
M
Q
 
S
N
 
E
W
 
W
W
 
W
R
 
K
G
 
E
G
 
A
V
 
V
I
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
D
|
D
S
 
A
N
|
N
G
 
G
D
|
D
G
 
G
V
x
F
G
 
G
D
|
D
L
 
L
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
L
 
I
H
 
Q
K
 
K
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
A
 
K
S
 
N
L
 
L
N
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
V
I
 
I
W
 
W
L
 
L
S
 
S
P
 
P
F
 
V
F
 
F
T
 
D
S
 
S
P
 
P
M
 
Q
K
 
D
D
 
D
F
 
N
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
R
 
K
G
 
N
V
 
M
D
 
Y
P
 
E
L
 
K
F
 
F
G
 
G
T
 
T
L
 
N
D
 
E
D
 
D
F
 
M
V
 
F
R
 
Q
L
 
L
V
 
I
E
 
D
A
 
E
C
 
V
H
 
H
E
 
K
R
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
I
L
 
V
I
 
M
D
 
D
Q
 
L
V
 
V
L
 
V
N
 
N
H
 
H
S
 
T
S
 
S
D
 
D
Q
 
E
H
 
H
P
 
A
W
 
W
F
 
F
A
 
A
E
 
E
S
 
S
R
 
R
S
 
K
S
 
S
R
 
K
D
 
D
N
 
N
D
 
P
K
 
Y
A
 
R
D
 
D
W
 
Y
Y
 
Y
V
 
L
W
 
W
A
 
K
D
 
D
P
 
P
K
 
K
P
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
E
P
 
P
N
 
N
N
 
N
W
 
W
L
 
G
S
 
S
V
 
I
F
 
F
G
 
S
G
 
G
P
 
S
A
 
A
W
 
W
S
 
T
W
 
Y
D
 
D
S
 
E
R
 
G
R
 
T
R
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
N
 
Y
F
 
F
L
 
S
S
 
K
S
 
K
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
L
 
L
N
 
N
F
 
W
H
 
E
C
 
N
P
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
D
 
R
Q
 
E
L
 
V
L
 
Y
D
 
D
D
 
V
M
 
M
E
 
R
F
 
F
W
 
W
L
 
M
K
 
D
L
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
W
R
 
R
L
 
M
D
 
D
A
 
V
A
 
I
N
 
G
F
 
S
Y
 
I
F
 
S
H
 
K
D
 
Y
A
 
T
E
 
D
L
 
F
R
 
P
D
 
D
N
 
-
P
 
-
P
 
-
N
 
-
T
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
Y
R
 
E
I
 
T
D
 
D
N
 
H
P
 
S
Y
 
R
A
 
S
Y
 
Y
Q
 
I
R
 
V
H
 
G
I
 
R
Y
 
Y
D
 
H
K
 
S
T
 
N
R
 
G
P
 
P
E
 
R
N
 
L
M
 
H
D
 
E
F
 
F
L
 
I
R
 
Q
R
 
E
L
 
M
-
 
N
R
 
R
A
 
E
L
 
V
L
 
L
Q
 
S
R
 
H
Y
 
Y
P
 
D
G
 
C
A
 
M
S
 
T
S
 
V
V
 
G
A
 
E
E
 
A
I
 
N
G
 
G
C
 
S
D
 
D
E
 
-
S
 
-
L
 
I
R
 
E
T
 
E
M
 
A
A
 
K
A
 
K
Y
 
Y
T
 
T
S
 
D
G
 
A
G
 
S
-
 
R
D
 
Q
T
 
E
L
 
L
H
 
N
M
 
M
A
 
I
Y
 
F
S
 
T
F
 
F
-
 
E
-
 
H
-
 
M
D
 
D
L
 
I
L
 
D
T
 
K
E
 
E
Q
 
Q
C
 
N
S
 
S
P
 
P
G
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
W
-
 
Q
-
 
I
-
 
K
-
 
P
-
 
F
-
 
D
-
 
L
-
 
I
Y
 
A
I
 
L
R
 
K
H
 
K
T
 
T
V
 
M
E
 
T
G
 
R
I
 
W
E
 
Q
R
 
T
E
 
G
L
 
L
A
 
M
D
 
N
-
 
V
G
 
G
W
 
W
S
 
N
C
 
T
W
 
L
S
 
Y
M
 
F
G
 
E
N
 
N
H
 
H
D
 
D
V
 
Q
V
 
P
R
 
R
V
 
V
M
 
I
T
 
S
R
 
R
W
 
W
A
 
G
L
 
N
N
 
D
G
 
R
R
 
K
P
 
L
D
 
R
P
 
K
E
 
E
R
 
C
G
 
A
R
 
K
L
 
A
L
 
F
M
 
A
A
 
T
L
 
V
L
 
L
L
 
H
S
 
G
L
 
M
R
 
K
G
 
G
S
 
T
V
 
P
C
 
F
M
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
E
 
E
L
 
I
G
 
G
L
 
M
P
 
V
E
 
N
A
 
S
E
 
D
L
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
M
-
 
Y
-
 
D
-
 
D
-
 
L
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
R
 
A
Y
 
Y
E
 
R
D
 
E
L
 
L
V
 
V
D
 
V
P
 
E
Y
 
N
G
 
K
I
 
T
T
 
M
F
 
S
W
 
E
P
 
K
E
 
E
F
 
F
-
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
M
-
 
I
K
 
K
G
 
G
R
 
R
D
 
D
G
 
H
C
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
M
P
 
Q
W
 
W
E
 
D
S
 
A
E
 
-
A
 
G
H
 
K
H
 
H
A
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
T
G
 
A
S
 
G
Q
 
D
P
 
P
W
 
W
L
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
N
D
 
S
S
 
R
H
 
Y
R
 
Q
S
 
D
L
 
I
S
 
N
V
 
V
A
 
K
A
 
E
Q
 
S
D
 
L
A
 
E
D
 
D
P
 
Q
H
 
D
S
 
S
M
 
I
L
 
F
N
 
F
C
 
Y
Y
 
Y
R
 
Q
R
 
K
F
 
L
L
 
I
G
 
Q
W
 
L
R
 
R
R
 
K
E
 
Q
Q
 
Y
R
 
K
L
 
I
L
 
M
I
 
I
E
 
Y
G
 
G
D
 
D
I
 
Y
H
 
Q
M
 
L
V
 
L
Y
 
Q
H
 
E
D
 
N
D
 
D
-
 
P
A
 
Q
L
 
V
L
 
F
V
 
S
F
 
Y
E
 
L
R
 
R
R
 
E
L
 
Y
G
 
R
D
 
G
E
 
E
A
 
K
W
 
L
L
 
L
C
 
V
L
 
V
F
 
V
N
 
N
L
 
L
G
 
S
D
 
E
L
 
E
S
 
K
R
 
A
S
 
L
Y
 
F
E
 
E
L
 
A
P
 
P
A
 
P
Q
 
E
A
 
L
V
 
I

4mazA The structure of mall mutant enzyme v200s from bacillus subtilus (see paper)
35% identity, 93% coverage: 8:511/542 of query aligns to 2:525/559 of 4mazA

query
sites
4mazA
W
 
W
W
 
W
R
 
K
G
 
E
G
 
A
V
 
V
I
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
D
|
D
S
 
A
N
|
N
G
 
G
D
|
D
G
 
G
V
x
F
G
 
G
D
|
D
L
 
L
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
L
 
I
H
 
Q
K
 
K
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
A
 
K
S
 
N
L
 
L
N
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
V
I
 
I
W
 
W
L
 
L
S
 
S
P
 
P
F
 
V
F
 
F
T
 
D
S
 
S
P
 
P
M
 
Q
K
 
D
D
 
D
F
 
N
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
R
 
K
G
 
N
V
 
M
D
 
Y
P
 
E
L
 
K
F
 
F
G
 
G
T
 
T
L
 
N
D
 
E
D
 
D
F
 
M
V
 
F
R
 
Q
L
 
L
V
 
I
E
 
D
A
 
E
C
 
V
H
 
H
E
 
K
R
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
I
L
 
V
I
 
M
D
|
D
Q
 
L
V
 
V
L
 
V
N
 
N
H
 
H
S
 
T
S
 
S
D
 
D
Q
 
E
H
 
H
P
 
A
W
 
W
F
 
F
A
 
A
E
 
E
S
 
S
R
 
R
S
 
K
S
 
S
R
 
K
D
 
D
N
 
N
D
 
P
K
 
Y
A
 
R
D
 
D
W
 
Y
Y
 
Y
V
 
L
W
 
W
A
 
K
D
 
D
P
 
P
K
 
K
P
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
E
P
 
P
N
 
N
N
 
N
W
 
W
L
 
G
S
 
S
V
 
I
F
 
F
G
 
S
G
 
G
P
 
S
A
 
A
W
 
W
S
 
T
W
 
Y
D
 
D
S
 
E
R
 
G
R
 
T
R
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
N
 
Y
F
 
F
L
 
S
S
 
K
S
 
K
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
L
 
L
N
 
N
F
 
W
H
 
E
C
 
N
P
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
D
 
R
Q
 
E
L
 
V
L
 
Y
D
 
D
D
 
V
M
 
M
E
 
R
F
 
F
W
 
W
L
 
M
K
 
D
L
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
W
R
|
R
L
 
M
D
|
D
A
 
S
A
 
I
N
 
G
F
 
S
Y
 
I
F
 
S
H
 
K
D
 
Y
A
 
T
E
 
D
L
 
F
R
 
P
D
 
D
N
 
-
P
 
-
P
 
-
N
 
-
T
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
Y
R
 
E
I
 
T
D
 
D
N
 
H
P
 
S
Y
 
R
A
 
S
Y
 
Y
Q
 
I
R
 
V
H
 
G
I
 
R
Y
 
Y
D
 
H
K
 
S
T
 
N
R
 
G
P
 
P
E
 
R
N
 
L
M
 
H
D
 
E
F
 
F
L
 
I
R
 
Q
R
 
E
L
 
M
-
 
N
R
 
R
A
 
E
L
 
V
L
 
L
Q
 
S
R
 
H
Y
 
Y
P
 
D
G
 
C
A
 
M
S
 
T
S
 
V
V
 
G
A
x
E
E
 
A
I
 
N
G
 
G
C
 
S
D
 
D
E
 
-
S
 
-
L
 
I
R
 
E
T
 
E
M
 
A
A
 
K
A
 
K
Y
 
Y
T
 
T
S
 
D
G
 
A
G
 
S
-
 
R
D
 
Q
T
 
E
L
 
L
H
 
N
M
 
M
A
 
I
Y
 
F
S
 
T
F
 
F
-
 
E
-
 
H
-
 
M
D
 
D
L
 
I
L
 
D
T
 
K
E
 
E
Q
 
Q
C
 
N
S
 
S
P
 
P
G
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
W
-
 
Q
-
 
I
-
 
K
-
 
P
-
 
F
-
 
D
-
 
L
-
 
I
Y
 
A
I
 
L
R
 
K
H
 
K
T
 
T
V
 
M
E
 
T
G
 
R
I
 
W
E
 
Q
R
 
T
E
 
G
L
 
L
A
 
M
D
 
N
-
 
V
G
 
G
W
 
W
S
 
N
C
 
T
W
 
L
S
 
Y
M
 
F
G
 
E
N
 
N
H
|
H
D
|
D
V
 
Q
V
 
P
R
 
R
V
 
V
M
 
I
T
 
S
R
 
R
W
 
W
A
 
G
L
 
N
N
 
D
G
 
R
R
 
K
P
 
L
D
 
R
P
 
K
E
 
E
R
 
C
G
 
A
R
 
K
L
 
A
L
 
F
M
 
A
A
 
T
L
 
V
L
 
L
L
 
H
S
 
G
L
 
M
R
 
K
G
 
G
S
 
T
V
 
P
C
 
F
M
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
E
 
E
L
 
I
G
 
G
L
 
M
P
 
V
E
 
N
A
 
S
E
 
D
L
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
M
-
 
Y
-
 
D
-
 
D
-
 
L
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
R
 
A
Y
 
Y
E
 
R
D
 
E
L
 
L
V
 
V
D
 
V
P
 
E
Y
 
N
G
 
K
I
 
T
T
 
M
F
 
S
W
 
E
P
 
K
E
 
E
F
 
F
-
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
M
-
 
I
K
 
K
G
 
G
R
 
R
D
 
D
G
 
H
C
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
M
P
 
Q
W
 
W
E
 
D
S
 
A
E
 
-
A
 
G
H
 
K
H
 
H
A
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
T
G
 
A
S
 
G
Q
 
D
P
 
P
W
 
W
L
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
N
D
 
S
S
 
R
H
 
Y
R
 
Q
S
 
D
L
 
I
S
 
N
V
 
V
A
 
K
A
 
E
Q
 
S
D
 
L
A
 
E
D
 
D
P
 
Q
H
 
D
S
 
S
M
 
I
L
 
F
N
 
F
C
 
Y
Y
 
Y
R
 
Q
R
 
K
F
 
L
L
 
I
G
 
Q
W
 
L
R
 
R
R
 
K
E
 
Q
Q
 
Y
R
 
K
L
 
I
L
 
M
I
 
I
E
 
Y
G
 
G
D
 
D
I
 
Y
H
 
Q
M
 
L
V
 
L
Y
 
Q
H
 
E
D
 
N
D
 
D
-
 
P
A
 
Q
L
 
V
L
 
F
V
 
S
F
 
Y
E
 
L
R
 
R
R
 
E
L
 
Y
G
 
R
D
 
G
E
 
E
A
 
K
W
 
L
L
 
L
C
 
V
L
 
V
F
 
V
N
 
N
L
 
L
G
 
S
D
 
E
L
 
E
S
 
K
R
 
A
S
 
L
Y
 
F
E
 
E
L
 
A
P
 
P
A
 
P
Q
 
E
A
 
L
V
 
I

7lv6B The structure of mall mutant enzyme s536r from bacillus subtilis
35% identity, 93% coverage: 8:511/542 of query aligns to 2:525/559 of 7lv6B

query
sites
7lv6B
W
 
W
W
 
W
R
 
K
G
 
E
G
 
A
V
 
V
I
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
D
|
D
S
 
A
N
|
N
G
 
G
D
|
D
G
 
G
V
x
F
G
 
G
D
|
D
L
 
L
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
L
 
I
H
 
Q
K
 
K
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
A
 
K
S
 
N
L
 
L
N
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
V
I
 
I
W
 
W
L
 
L
S
 
S
P
 
P
F
 
V
F
 
F
T
 
D
S
 
S
P
 
P
M
 
Q
K
 
D
D
 
D
F
 
N
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
R
 
K
G
 
N
V
 
M
D
 
Y
P
 
E
L
 
K
F
 
F
G
 
G
T
 
T
L
 
N
D
 
E
D
 
D
F
 
M
V
 
F
R
 
Q
L
 
L
V
 
I
E
 
D
A
 
E
C
 
V
H
 
H
E
 
K
R
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
I
L
 
V
I
 
M
D
 
D
Q
 
L
V
 
V
L
 
V
N
 
N
H
 
H
S
 
T
S
 
S
D
 
D
Q
 
E
H
 
H
P
 
A
W
 
W
F
 
F
A
 
A
E
 
E
S
 
S
R
 
R
S
 
K
S
 
S
R
 
K
D
 
D
N
 
N
D
 
P
K
 
Y
A
 
R
D
 
D
W
 
Y
Y
 
Y
V
 
L
W
 
W
A
 
K
D
 
D
P
 
P
K
 
K
P
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
E
P
 
P
N
 
N
N
 
N
W
 
W
L
 
G
S
 
S
V
 
I
F
 
F
G
 
S
G
 
G
P
 
S
A
 
A
W
 
W
S
 
T
W
 
Y
D
 
D
S
 
E
R
 
G
R
 
T
R
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
N
 
Y
F
 
F
L
 
S
S
 
K
S
 
K
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
L
 
L
N
 
N
F
 
W
H
 
E
C
 
N
P
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
D
 
R
Q
 
E
L
 
V
L
 
Y
D
 
D
D
 
V
M
 
M
E
 
R
F
 
F
W
 
W
L
 
M
K
 
D
L
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
W
R
 
R
L
 
M
D
 
D
A
 
V
A
 
I
N
 
G
F
 
S
Y
 
I
F
 
S
H
 
K
D
 
Y
A
 
T
E
 
D
L
 
F
R
 
P
D
 
D
N
 
-
P
 
-
P
 
-
N
 
-
T
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
Y
R
 
E
I
 
T
D
 
D
N
 
H
P
 
S
Y
 
R
A
 
S
Y
 
Y
Q
 
I
R
 
V
H
 
G
I
 
R
Y
 
Y
D
 
H
K
 
S
T
 
N
R
 
G
P
 
P
E
 
R
N
 
L
M
 
H
D
 
E
F
 
F
L
 
I
R
 
Q
R
 
E
L
 
M
-
 
N
R
 
R
A
 
E
L
 
V
L
 
L
Q
 
S
R
 
H
Y
 
Y
P
 
D
G
 
C
A
 
M
S
 
T
S
 
V
V
 
G
A
 
E
E
 
A
I
 
N
G
 
G
C
 
S
D
 
D
E
 
-
S
 
-
L
 
I
R
 
E
T
 
E
M
 
A
A
 
K
A
 
K
Y
 
Y
T
 
T
S
 
D
G
 
A
G
 
S
-
 
R
D