SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF860 FitnessBrowser__Phaeo:GFF860 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P00367 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial; GDH 1; EC 1.4.1.3 from Homo sapiens (Human) (see 9 papers)
44% identity, 99% coverage: 6:476/476 of query aligns to 63:555/558 of P00367

query
sites
P00367
E
 
D
P
 
P
S
 
N
F
 
F
R
 
F
Q
 
K
S
 
M
V
 
V
D
 
E
L
 
G
M
 
F
F
 
F
N
 
D
R
 
R
A
 
G
V
 
A
S
 
S
L
 
I
M
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
E
D
 
D
L
 
L
P
 
R
P
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
 
K
-
 
R
-
 
N
-
 
R
-
 
V
-
 
R
G
 
G
L
 
I
E
 
L
E
 
R
K
 
I
I
 
I
R
 
K
V
 
P
C
 
C
N
 
N
A
 
H
T
 
V
Y
 
L
T
 
S
V
 
L
R
 
S
F
 
F
G
 
P
V
 
I
R
 
R
L
 
R
R
 
D
-
 
D
G
 
G
G
 
S
I
 
W
Q
 
E
T
 
V
F
 
I
T
 
E
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
S
 
A
V
 
Q
H
 
H
S
 
S
E
 
Q
H
 
H
M
 
R
E
 
T
P
 
P
V
 
C
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
M
 
T
G
 
D
V
 
V
N
 
S
Q
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
L
M
 
M
T
 
T
Y
 
Y
K
 
K
C
|
C
A
 
A
L
 
V
V
 
V
E
 
D
A
 
V
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
C
 
K
I
 
I
D
 
N
P
 
P
R
 
K
Q
 
N
Y
 
Y
E
 
T
E
 
D
H
 
N
E
 
E
L
 
L
E
 
E
L
 
K
I
 
I
T
 
T
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
T
Y
 
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
R
 
K
D
 
G
L
 
F
I
 
I
N
 
G
P
 
P
S
 
G
Q
 
I
N
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
 
D
M
 
M
G
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
E
 
E
M
 
M
A
 
S
W
 
W
I
 
I
A
 
A
D
 
D
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
A
R
 
S
-
 
T
M
 
I
N
 
G
T
 
H
T
 
Y
D
 
D
I
 
I
N
 
N
A
 
A
K
 
H
A
 
A
C
 
C
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
I
N
 
S
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
H
G
 
G
R
 
R
V
 
I
E
x
S
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
|
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
F
Y
 
H
A
 
G
L
 
I
R
 
E
E
 
N
F
 
F
F
 
I
R
 
N
N
 
E
P
 
A
E
 
S
D
 
Y
V
 
M
A
 
S
A
 
I
A
 
L
N
 
G
M
 
M
D
 
T
G
 
P
K
 
G
L
 
F
D
 
G
G
 
D
K
 
K
R
 
T
V
 
F
I
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
L
 
F
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
H
 
H
A
 
S
A
 
M
K
x
R
F
 
Y
L
 
L
M
 
-
S
 
H
E
x
R
D
 
F
G
 
G
A
 
A
K
 
K
I
 
C
T
 
I
A
 
A
V
 
V
I
 
G
E
 
E
R
 
S
D
 
D
G
 
G
G
 
S
L
 
I
I
 
W
D
 
N
E
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
P
E
 
K
A
 
E
V
 
L
F
 
E
Q
 
D
W
 
F
I
 
K
A
 
L
N
 
Q
N
 
H
G
 
G
G
 
S
V
 
I
T
 
L
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
D
 
K
A
 
A
R
 
K
Y
 
P
V
 
Y
E
 
E
N
 
G
G
 
S
A
 
-
L
 
-
L
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
A
D
 
D
C
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
S
E
 
E
G
 
K
V
 
Q
I
 
L
N
 
T
L
 
K
T
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
P
N
 
R
I
 
V
K
 
K
A
 
A
R
 
K
L
 
I
I
 
I
I
 
A
E
 
E
A
 
G
A
 
A
N
 
N
G
 
G
P
 
P
V
 
T
T
 
T
A
 
P
G
 
E
A
 
A
D
 
D
E
 
K
I
 
I
L
 
F
R
 
L
D
 
E
K
 
R
G
 
N
T
 
I
V
 
M
I
 
V
I
 
I
P
 
P
D
 
D
M
 
L
Y
 
Y
A
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
L
S
 
N
H
 
H
I
 
V
R
 
S
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
M
 
L
Q
 
T
R
 
F
R
 
K
Q
 
Y
E
 
E
-
 
R
E
 
D
A
 
S
R
 
N
H
 
Y
Q
 
H
L
 
L
V
 
L
V
 
M
D
 
S
E
 
V
L
 
Q
E
 
E
A
 
S
L
 
L
S
 
E
E
 
R
S
 
K
L
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
H
W
 
G
T
 
G
L
 
T
N
 
I
P
 
P
-
 
I
-
 
V
-
 
P
-
 
T
-
 
A
K
 
E
F
 
F
T
 
Q
E
 
D
R
 
R
Y
 
-
L
 
I
R
 
S
G
 
G
A
 
A
D
x
S
E
 
E
L
 
K
E
 
D
L
 
I
V
 
V
R
x
H
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
A
D
 
Y
T
 
T
M
 
M
-
 
E
R
|
R
T
 
S
A
 
A
Y
 
R
Q
 
Q
S
 
I
M
 
M
R
 
R
E
 
T
V
 
A
W
 
M
H
 
K
G
 
-
R
 
Y
N
 
N
D
 
L
V
 
G
T
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
V
V
 
N
S
 
A
I
 
I
D
 
E
K
 
K
V
 
V
A
 
F
K
 
K
S
 
V
Y
 
Y
R
 
N
A
 
E
K
 
A
G
 
G
L
 
V

Sites not aligning to the query:

6dhdA Bovine glutamate dehydrogenase complexed with nadh, gtp, glutamate (see paper)
44% identity, 99% coverage: 6:476/476 of query aligns to 6:498/501 of 6dhdA

query
sites
6dhdA
E
 
D
P
 
P
S
 
N
F
 
F
R
 
F
Q
 
K
S
 
M
V
 
V
D
 
E
L
 
G
M
 
F
F
 
F
N
 
D
R
 
R
A
 
G
V
 
A
S
 
S
L
 
I
M
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
E
D
 
D
L
 
L
P
 
K
P
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
 
K
-
 
R
-
 
N
-
 
R
-
 
V
-
 
R
G
 
G
L
 
I
E
 
L
E
 
R
K
 
I
I
 
I
R
 
K
V
 
P
C
 
C
N
 
N
A
 
H
T
 
V
Y
 
L
T
 
S
V
 
L
R
 
S
F
 
F
G
 
P
V
 
I
R
 
R
L
 
R
R
 
D
-
 
D
G
 
G
G
 
S
I
 
W
Q
 
E
T
 
V
F
 
I
T
 
E
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
S
 
A
V
 
Q
H
 
H
S
 
S
E
 
Q
H
|
H
M
x
R
E
 
T
P
 
P
V
 
C
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
|
R
Y
 
Y
A
 
S
M
 
T
G
 
D
V
 
V
N
 
S
Q
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
L
M
|
M
T
 
T
Y
 
Y
K
|
K
C
 
C
A
|
A
L
 
V
V
 
V
E
x
D
A
x
V
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
C
 
K
I
 
I
D
 
N
P
 
P
R
 
K
Q
 
N
Y
 
Y
E
 
T
E
 
D
H
 
N
E
 
E
L
 
L
E
 
E
L
 
K
I
 
I
T
 
T
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
T
Y
 
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
R
 
K
D
 
G
L
 
F
I
 
I
N
 
G
P
 
P
S
 
G
Q
 
V
N
 
D
V
 
V
P
 
P
A
|
A
P
 
P
D
|
D
M
|
M
G
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
E
 
E
M
 
M
A
 
S
W
 
W
I
 
I
A
 
A
D
 
D
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
A
R
 
S
-
 
T
M
 
I
N
 
G
T
 
H
T
 
Y
D
 
D
I
 
I
N
 
N
A
 
A
K
x
H
A
 
A
C
 
C
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
I
N
 
S
A
x
Q
G
|
G
G
 
G
I
 
I
A
x
H
G
 
G
R
 
R
V
 
I
E
x
S
A
 
A
T
|
T
G
 
G
R
|
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
F
Y
 
H
A
 
G
L
 
I
R
 
E
E
 
N
F
 
F
F
 
I
R
 
N
N
 
E
P
 
A
E
 
S
D
 
Y
V
 
M
A
 
S
A
 
I
A
 
L
N
 
G
M
 
M
D
 
T
G
 
P
K
 
G
L
 
F
D
 
G
G
 
D
K
 
K
R
 
T
V
 
F
I
 
A
V
 
V
Q
|
Q
G
 
G
L
x
F
G
|
G
N
|
N
V
|
V
G
 
G
Y
 
L
H
|
H
A
 
S
A
 
M
K
x
R
F
x
Y
L
 
L
M
 
-
S
 
H
E
x
R
D
 
F
G
 
G
A
 
A
K
 
K
I
 
C
T
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
G
E
|
E
R
x
S
D
 
D
G
 
G
G
 
S
L
 
I
I
 
W
D
 
N
E
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
P
E
 
K
A
 
E
V
 
L
F
x
E
Q
 
D
W
 
F
I
 
K
A
 
L
N
 
Q
N
 
H
G
 
G
G
 
T
V
 
I
T
 
L
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
D
 
K
A
 
A
R
 
K
Y
 
I
V
 
Y
E
 
E
N
 
G
G
 
S
A
 
-
L
 
-
L
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
V
D
 
D
C
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
A
A
|
A
L
 
S
E
 
E
G
 
K
V
 
Q
I
 
L
N
 
T
L
 
K
T
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
P
N
 
R
I
 
V
K
 
K
A
 
A
R
 
K
L
 
I
I
 
I
I
 
A
E
 
E
A
 
G
A
|
A
N
|
N
G
 
G
P
 
P
V
 
T
T
 
T
A
 
P
G
 
E
A
 
A
D
 
D
E
 
K
I
 
I
L
 
F
R
 
L
D
 
E
K
 
R
G
 
N
T
 
I
V
 
M
I
 
V
I
 
I
P
 
P
D
 
D
M
 
L
Y
 
Y
A
 
L
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
|
V
T
 
T
V
 
V
S
|
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
L
K
|
K
N
|
N
L
 
L
S
 
N
H
|
H
I
 
V
R
x
S
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
M
 
L
Q
 
T
R
 
F
R
 
K
Q
 
Y
E
 
E
-
 
R
E
 
D
A
 
S
R
 
N
H
 
Y
Q
 
H
L
 
L
V
 
L
V
 
M
D
 
S
E
 
V
L
 
Q
E
 
E
A
 
S
L
 
L
S
 
E
E
 
R
S
 
K
L
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
H
W
 
G
T
 
G
L
 
T
N
 
I
P
 
P
-
 
I
-
 
V
-
 
P
-
 
T
-
 
A
K
 
E
F
 
F
T
 
Q
E
 
D
R
 
R
Y
 
-
L
 
I
R
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
S
E
 
E
L
 
K
E
 
D
L
 
I
V
 
V
R
x
H
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
A
D
 
Y
T
 
T
M
 
M
-
 
E
R
 
R
T
 
S
A
 
A
Y
 
R
Q
 
Q
S
 
I
M
 
M
R
 
R
E
 
T
V
 
A
W
 
M
H
 
K
G
 
-
R
 
Y
N
 
N
D
 
L
V
 
G
T
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
V
V
 
N
S
 
A
I
 
I
D
 
E
K
|
K
V
 
V
A
 
F
K
x
R
S
 
V
Y
 
Y
R
 
N
A
 
E
K
 
A
G
 
G
L
 
V

3etgA Glutamate dehydrogenase complexed with gw5074 (see paper)
44% identity, 99% coverage: 6:476/476 of query aligns to 6:498/501 of 3etgA

query
sites
3etgA
E
 
D
P
 
P
S
 
N
F
 
F
R
 
F
Q
 
K
S
 
M
V
 
V
D
 
E
L
 
G
M
 
F
F
 
F
N
 
D
R
 
R
A
 
G
V
 
A
S
 
S
L
 
I
M
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
E
D
 
D
L
 
L
P
 
K
P
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
 
K
-
 
R
-
 
N
-
 
R
-
 
V
-
 
R
G
 
G
L
 
I
E
 
L
E
 
R
K
 
I
I
 
I
R
 
K
V
 
P
C
 
C
N
 
N
A
 
H
T
 
V
Y
 
L
T
 
S
V
 
L
R
 
S
F
 
F
G
 
P
V
 
I
R
 
R
L
 
R
R
 
D
-
 
D
G
 
G
G
 
S
I
 
W
Q
 
E
T
 
V
F
 
I
T
 
E
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
S
 
A
V
 
Q
H
 
H
S
 
S
E
 
Q
H
 
H
M
 
R
E
 
T
P
 
P
V
 
C
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
M
 
T
G
 
D
V
 
V
N
 
S
Q
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
L
M
|
M
T
 
T
Y
 
Y
K
|
K
C
 
C
A
 
A
L
 
V
V
 
V
E
 
D
A
 
V
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
C
 
K
I
 
I
D
 
N
P
 
P
R
 
K
Q
 
N
Y
 
Y
E
 
T
E
 
D
H
 
N
E
 
E
L
 
L
E
 
E
L
 
K
I
 
I
T
 
T
R
|
R
R
|
R
F
 
F
A
 
T
Y
x
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
R
 
K
D
 
G
L
 
F
I
 
I
N
 
G
P
 
P
S
 
G
Q
 
V
N
 
D
V
 
V
P
 
P
A
|
A
P
 
P
D
|
D
M
|
M
G
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
E
 
E
M
 
M
A
 
S
W
 
W
I
 
I
A
 
A
D
 
D
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
A
R
 
S
-
 
T
M
 
I
N
 
G
T
 
H
T
 
Y
D
 
D
I
 
I
N
 
N
A
 
A
K
 
H
A
 
A
C
 
C
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
I
N
 
S
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
x
H
G
|
G
R
|
R
V
 
I
E
x
S
A
 
A
T
|
T
G
 
G
R
|
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
F
Y
 
H
A
 
G
L
 
I
R
 
E
E
 
N
F
 
F
F
 
I
R
 
N
N
 
E
P
 
A
E
 
S
D
 
Y
V
 
M
A
 
S
A
 
I
A
 
L
N
 
G
M
 
M
D
 
T
G
 
P
K
 
G
L
 
F
D
 
G
G
 
D
K
 
K
R
 
T
V
 
F
I
 
A
V
 
V
Q
|
Q
G
 
G
L
 
F
G
|
G
N
 
N
V
|
V
G
 
G
Y
 
L
H
 
H
A
 
S
A
 
M
K
x
R
F
 
Y
L
 
L
M
 
-
S
 
H
E
x
R
D
 
F
G
 
G
A
 
A
K
 
K
I
 
C
T
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
G
E
|
E
R
x
S
D
 
D
G
 
G
G
 
S
L
 
I
I
 
W
D
 
N
E
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
P
E
 
K
A
 
E
V
 
L
F
x
E
Q
 
D
W
 
F
I
 
K
A
 
L
N
 
Q
N
 
H
G
 
G
G
 
T
V
 
I
T
 
L
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
D
 
K
A
 
A
R
 
K
Y
 
I
V
 
Y
E
 
E
N
 
G
G
 
S
A
 
-
L
 
-
L
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
V
D
 
D
C
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
A
A
|
A
L
 
S
E
 
E
G
 
K
V
 
Q
I
 
L
N
 
T
L
 
K
T
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
P
N
 
R
I
 
V
K
 
K
A
 
A
R
 
K
L
 
I
I
 
I
I
 
A
E
 
E
A
x
G
A
|
A
N
|
N
G
 
G
P
 
P
V
 
T
T
 
T
A
 
P
G
 
E
A
 
A
D
 
D
E
 
K
I
 
I
L
 
F
R
 
L
D
 
E
K
 
R
G
 
N
T
 
I
V
 
M
I
 
V
I
 
I
P
 
P
D
 
D
M
 
L
Y
 
Y
A
 
L
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
|
V
T
 
T
V
 
V
S
|
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
L
S
 
N
H
 
H
I
 
V
R
 
S
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
M
 
L
Q
 
T
R
 
F
R
 
K
Q
 
Y
E
 
E
-
 
R
E
 
D
A
 
S
R
 
N
H
 
Y
Q
 
H
L
 
L
V
 
L
V
 
M
D
 
S
E
 
V
L
 
Q
E
 
E
A
 
S
L
 
L
S
 
E
E
 
R
S
 
K
L
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
H
W
 
G
T
 
G
L
 
T
N
 
I
P
 
P
-
 
I
-
 
V
-
 
P
-
 
T
-
 
A
K
 
E
F
 
F
T
 
Q
E
 
D
R
 
R
Y
 
-
L
 
I
R
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
S
E
 
E
L
 
K
E
 
D
L
 
I
V
 
V
R
 
H
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
A
D
 
Y
T
 
T
M
 
M
-
 
E
R
 
R
T
 
S
A
 
A
Y
 
R
Q
 
Q
S
 
I
M
 
M
R
 
R
E
 
T
V
 
A
W
 
M
H
 
K
G
 
-
R
 
Y
N
 
N
D
 
L
V
 
G
T
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
V
V
 
N
S
 
A
I
 
I
D
 
E
K
 
K
V
 
V
A
 
F
K
 
R
S
 
V
Y
 
Y
R
 
N
A
 
E
K
 
A
G
 
G
L
 
V

3etdA Structure of glutamate dehydrogenase complexed with bithionol (see paper)
44% identity, 99% coverage: 6:476/476 of query aligns to 6:498/501 of 3etdA

query
sites
3etdA
E
 
D
P
 
P
S
 
N
F
 
F
R
 
F
Q
 
K
S
 
M
V
 
V
D
 
E
L
 
G
M
 
F
F
 
F
N
 
D
R
 
R
A
 
G
V
 
A
S
 
S
L
 
I
M
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
E
D
 
D
L
 
L
P
 
K
P
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
 
K
-
 
R
-
 
N
-
 
R
-
 
V
-
 
R
G
 
G
L
 
I
E
 
L
E
 
R
K
 
I
I
 
I
R
 
K
V
 
P
C
 
C
N
 
N
A
 
H
T
 
V
Y
 
L
T
 
S
V
 
L
R
 
S
F
 
F
G
 
P
V
 
I
R
 
R
L
 
R
R
 
D
-
 
D
G
 
G
G
 
S
I
 
W
Q
 
E
T
 
V
F
 
I
T
 
E
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
S
 
A
V
 
Q
H
 
H
S
 
S
E
 
Q
H
 
H
M
 
R
E
 
T
P
 
P
V
 
C
K
|
K
G
 
G
G
|
G
I
 
I
R
|
R
Y
 
Y
A
 
S
M
 
T
G
 
D
V
 
V
N
 
S
Q
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
L
M
|
M
T
 
T
Y
 
Y
K
|
K
C
 
C
A
 
A
L
 
V
V
 
V
E
 
D
A
 
V
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
C
 
K
I
 
I
D
 
N
P
 
P
R
 
K
Q
 
N
Y
 
Y
E
 
T
E
 
D
H
 
N
E
 
E
L
 
L
E
 
E
L
 
K
I
 
I
T
 
T
R
|
R
R
|
R
F
 
F
A
 
T
Y
 
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
R
 
K
D
 
G
L
 
F
I
 
I
N
 
G
P
 
P
S
 
G
Q
 
V
N
 
D
V
 
V
P
 
P
A
|
A
P
 
P
D
|
D
M
|
M
G
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
E
 
E
M
 
M
A
 
S
W
 
W
I
 
I
A
 
A
D
|
D
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
A
R
x
S
-
 
T
M
 
I
N
 
G
T
 
H
T
 
Y
D
 
D
I
 
I
N
 
N
A
 
A
K
 
H
A
 
A
C
 
C
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
I
N
 
S
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
x
H
G
|
G
R
|
R
V
x
I
E
 
S
A
 
A
T
|
T
G
 
G
R
|
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
F
Y
 
H
A
 
G
L
 
I
R
 
E
E
 
N
F
 
F
F
 
I
R
 
N
N
 
E
P
 
A
E
 
S
D
 
Y
V
 
M
A
 
S
A
 
I
A
 
L
N
 
G
M
 
M
D
 
T
G
 
P
K
 
G
L
 
F
D
 
G
G
 
D
K
 
K
R
 
T
V
 
F
I
 
A
V
 
V
Q
|
Q
G
 
G
L
x
F
G
|
G
N
 
N
V
|
V
G
 
G
Y
 
L
H
 
H
A
 
S
A
 
M
K
x
R
F
 
Y
L
 
L
M
 
-
S
 
H
E
x
R
D
 
F
G
 
G
A
 
A
K
 
K
I
 
C
T
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
G
E
|
E
R
x
S
D
 
D
G
 
G
G
 
S
L
 
I
I
 
W
D
 
N
E
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
P
E
 
K
A
 
E
V
 
L
F
x
E
Q
 
D
W
 
F
I
 
K
A
 
L
N
 
Q
N
 
H
G
 
G
G
 
T
V
 
I
T
 
L
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
D
 
K
A
 
A
R
 
K
Y
 
I
V
 
Y
E
 
E
N
 
G
G
 
S
A
 
-
L
 
-
L
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
V
D
 
D
C
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
A
A
|
A
L
 
S
E
 
E
G
 
K
V
 
Q
I
 
L
N
 
T
L
 
K
T
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
P
N
 
R
I
 
V
K
 
K
A
 
A
R
 
K
L
 
I
I
 
I
I
 
A
E
 
E
A
 
G
A
|
A
N
|
N
G
 
G
P
 
P
V
 
T
T
 
T
A
 
P
G
 
E
A
 
A
D
 
D
E
 
K
I
 
I
L
 
F
R
 
L
D
 
E
K
 
R
G
 
N
T
 
I
V
 
M
I
 
V
I
 
I
P
 
P
D
 
D
M
 
L
Y
 
Y
A
 
L
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
|
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
L
S
 
N
H
 
H
I
 
V
R
 
S
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
M
 
L
Q
 
T
R
 
F
R
 
K
Q
 
Y
E
 
E
-
 
R
E
 
D
A
 
S
R
 
N
H
 
Y
Q
 
H
L
 
L
V
 
L
V
 
M
D
 
S
E
 
V
L
 
Q
E
 
E
A
 
S
L
 
L
S
 
E
E
 
R
S
 
K
L
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
H
W
 
G
T
 
G
L
 
T
N
 
I
P
 
P
-
 
I
-
 
V
-
 
P
-
 
T
-
 
A
K
 
E
F
 
F
T
 
Q
E
 
D
R
 
R
Y
 
-
L
 
I
R
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
S
E
 
E
L
 
K
E
 
D
L
 
I
V
 
V
R
x
H
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
A
D
 
Y
T
 
T
M
 
M
-
 
E
R
 
R
T
 
S
A
 
A
Y
 
R
Q
 
Q
S
 
I
M
 
M
R
 
R
E
 
T
V
 
A
W
 
M
H
 
K
G
 
-
R
 
Y
N
 
N
D
 
L
V
 
G
T
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
V
V
 
N
S
 
A
I
 
I
D
 
E
K
 
K
V
 
V
A
 
F
K
 
R
S
 
V
Y
 
Y
R
 
N
A
 
E
K
 
A
G
 
G
L
 
V

6dhlA Bovine glutamate dehydrogenase complexed with epicatechin-3-gallate (ecg) (see paper)
44% identity, 99% coverage: 6:476/476 of query aligns to 1:493/496 of 6dhlA

query
sites
6dhlA
E
 
D
P
 
P
S
 
N
F
 
F
R
 
F
Q
 
K
S
 
M
V
 
V
D
 
E
L
 
G
M
 
F
F
 
F
N
 
D
R
 
R
A
 
G
V
 
A
S
 
S
L
 
I
M
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
E
D
 
D
L
 
L
P
 
K
P
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
 
K
-
 
R
-
 
N
-
 
R
-
 
V
-
 
R
G
 
G
L
 
I
E
 
L
E
 
R
K
 
I
I
 
I
R
 
K
V
 
P
C
 
C
N
 
N
A
 
H
T
 
V
Y
 
L
T
 
S
V
 
L
R
 
S
F
 
F
G
 
P
V
 
I
R
 
R
L
 
R
R
 
D
-
 
D
G
 
G
G
 
S
I
 
W
Q
 
E
T
 
V
F
 
I
T
 
E
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
S
 
A
V
 
Q
H
 
H
S
 
S
E
 
Q
H
|
H
M
x
R
E
 
T
P
 
P
V
 
C
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
M
 
T
G
 
D
V
 
V
N
 
S
Q
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
L
M
 
M
T
 
T
Y
 
Y
K
 
K
C
|
C
A
 
A
L
 
V
V
 
V
E
x
D
A
x
V
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
C
 
K
I
 
I
D
 
N
P
 
P
R
 
K
Q
 
N
Y
 
Y
E
 
T
E
 
D
H
 
N
E
 
E
L
 
L
E
 
E
L
 
K
I
 
I
T
 
T
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
T
Y
 
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
R
 
K
D
 
G
L
 
F
I
 
I
N
 
G
P
 
P
S
 
G
Q
 
V
N
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
 
D
M
 
M
G
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
E
 
E
M
 
M
A
 
S
W
 
W
I
 
I
A
 
A
D
 
D
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
A
R
 
S
-
 
T
M
 
I
N
 
G
T
 
H
T
 
Y
D
 
D
I
 
I
N
 
N
A
 
A
K
 
H
A
 
A
C
 
C
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
I
N
 
S
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
H
G
 
G
R
 
R
V
 
I
E
 
S
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
F
Y
 
H
A
 
G
L
 
I
R
 
E
E
 
N
F
 
F
F
 
I
R
 
N
N
 
E
P
 
A
E
 
S
D
 
Y
V
 
M
A
 
S
A
 
I
A
 
L
N
 
G
M
 
M
D
 
T
G
 
P
K
 
G
L
 
F
D
 
G
G
 
D
K
 
K
R
 
T
V
 
F
I
 
A
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
L
 
F
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
H
 
H
A
 
S
A
 
M
K
 
R
F
 
Y
L
 
L
M
 
-
S
 
H
E
 
R
D
 
F
G
 
G
A
 
A
K
 
K
I
 
C
T
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
G
E
 
E
R
 
S
D
 
D
G
 
G
G
 
S
L
 
I
I
 
W
D
 
N
E
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
P
E
 
K
A
 
E
V
 
L
F
 
E
Q
 
D
W
 
F
I
 
K
A
 
L
N
 
Q
N
 
H
G
 
G
G
 
T
V
 
I
T
 
L
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
D
 
K
A
 
A
R
 
K
Y
 
I
V
 
Y
E
 
E
N
 
G
G
 
S
A
 
-
L
 
-
L
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
V
D
 
D
C
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
S
E
 
E
G
 
K
V
 
Q
I
 
L
N
 
T
L
 
K
T
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
P
N
 
R
I
 
V
K
 
K
A
 
A
R
 
K
L
 
I
I
 
I
I
 
A
E
 
E
A
 
G
A
 
A
N
 
N
G
 
G
P
 
P
V
 
T
T
 
T
A
 
P
G
 
E
A
 
A
D
 
D
E
 
K
I
 
I
L
 
F
R
 
L
D
 
E
K
 
R
G
 
N
T
 
I
V
 
M
I
 
V
I
 
I
P
 
P
D
 
D
M
 
L
Y
 
Y
A
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
L
K
|
K
N
 
N
L
 
L
S
 
N
H
 
H
I
 
V
R
x
S
F
 
Y
G
 
G
R
|
R
M
 
L
Q
 
T
R
 
F
R
 
K
Q
 
Y
E
 
E
-
 
R
E
 
D
A
 
S
R
 
N
H
 
Y
Q
 
H
L
 
L
V
 
L
V
 
M
D
 
S
E
 
V
L
 
Q
E
 
E
A
 
S
L
 
L
S
 
E
E
 
R
S
 
K
L
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
H
W
 
G
T
 
G
L
 
T
N
 
I
P
 
P
-
 
I
-
 
V
-
 
P
-
 
T
-
 
A
K
 
E
F
 
F
T
 
Q
E
 
D
R
 
R
Y
 
-
L
 
I
R
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
S
E
 
E
L
 
K
E
 
D
L
 
I
V
 
V
R
 
H
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
A
D
 
Y
T
 
T
M
 
M
-
 
E
R
|
R
T
 
S
A
 
A
Y
 
R
Q
 
Q
S
 
I
M
 
M
R
 
R
E
 
T
V
 
A
W
 
M
H
 
K
G
 
-
R
 
Y
N
 
N
D
 
L
V
 
G
T
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
V
V
 
N
S
 
A
I
 
I
D
 
E
K
|
K
V
 
V
A
 
F
K
 
R
S
 
V
Y
 
Y
R
 
N
A
 
E
K
 
A
G
 
G
L
 
V

3eteA Crystal structure of bovine glutamate dehydrogenase complexed with hexachlorophene (see paper)
44% identity, 99% coverage: 6:476/476 of query aligns to 3:495/495 of 3eteA

query
sites
3eteA
E
 
D
P
 
P
S
 
N
F
 
F
R
 
F
Q
 
K
S
 
M
V
 
V
D
 
E
L
 
G
M
 
F
F
 
F
N
 
D
R
 
R
A
 
G
V
 
A
S
 
S
L
 
I
M
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
E
D
 
D
L
 
L
P
 
K
P
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
 
K
-
 
R
-
 
N
-
 
R
-
 
V
-
 
R
G
 
G
L
 
I
E
 
L
E
 
R
K
 
I
I
 
I
R
 
K
V
 
P
C
 
C
N
 
N
A
 
H
T
 
V
Y
 
L
T
 
S
V
 
L
R
 
S
F
 
F
G
 
P
V
 
I
R
 
R
L
 
R
R
 
D
-
 
D
G
 
G
G
 
S
I
 
W
Q
 
E
T
 
V
F
 
I
T
 
E
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
S
 
A
V
 
Q
H
 
H
S
 
S
E
 
Q
H
 
H
M
 
R
E
 
T
P
 
P
V
 
C
K
|
K
G
 
G
G
|
G
I
 
I
R
|
R
Y
 
Y
A
 
S
M
 
T
G
 
D
V
 
V
N
 
S
Q
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
L
M
|
M
T
 
T
Y
 
Y
K
|
K
C
 
C
A
 
A
L
 
V
V
 
V
E
 
D
A
 
V
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
C
 
K
I
 
I
D
 
N
P
 
P
R
x
K
Q
 
N
Y
 
Y
E
 
T
E
 
D
H
 
N
E
 
E
L
 
L
E
 
E
L
 
K
I
 
I
T
 
T
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
T
Y
 
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
R
 
K
D
 
G
L
 
F
I
 
I
N
 
G
P
 
P
S
 
G
Q
 
V
N
 
D
V
 
V
P
 
P
A
|
A
P
 
P
D
|
D
M
|
M
G
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
E
 
E
M
 
M
A
 
S
W
 
W
I
 
I
A
 
A
D
 
D
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
A
R
 
S
-
x
T
M
x
I
N
 
G
T
 
H
T
x
Y
D
 
D
I
 
I
N
 
N
A
 
A
K
 
H
A
 
A
C
 
C
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
I
N
 
S
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
H
G
 
G
R
|
R
V
x
I
E
x
S
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
|
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
F
Y
 
H
A
 
G
L
 
I
R
 
E
E
 
N
F
 
F
F
 
I
R
 
N
N
 
E
P
 
A
E
 
S
D
 
Y
V
 
M
A
 
S
A
 
I
A
 
L
N
 
G
M
 
M
D
 
T
G
 
P
K
 
G
L
 
F
D
 
G
G
 
D
K
 
K
R
 
T
V
 
F
I
 
A
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
L
x
F
G
|
G
N
 
N
V
|
V
G
 
G
Y
 
L
H
|
H
A
 
S
A
 
M
K
x
R
F
x
Y
L
 
L
M
 
-
S
 
H
E
 
R
D
 
F
G
 
G
A
 
A
K
 
K
I
 
C
T
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
G
E
|
E
R
x
S
D
 
D
G
 
G
G
 
S
L
 
I
I
 
W
D
 
N
E
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
P
E
 
K
A
 
E
V
 
L
F
 
E
Q
 
D
W
 
F
I
 
K
A
 
L
N
 
Q
N
 
H
G
 
G
G
 
T
V
 
I
T
 
L
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
D
 
K
A
 
A
R
 
K
Y
 
I
V
 
Y
E
 
E
N
 
G
G
 
S
A
 
-
L
 
-
L
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
V
D
 
D
C
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
A
A
|
A
L
 
S
E
 
E
G
 
K
V
 
Q
I
 
L
N
 
T
L
 
K
T
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
P
N
 
R
I
 
V
K
 
K
A
 
A
R
 
K
L
 
I
I
 
I
I
 
A
E
 
E
A
 
G
A
|
A
N
|
N
G
 
G
P
 
P
V
 
T
T
 
T
A
 
P
G
 
E
A
 
A
D
 
D
E
 
K
I
 
I
L
 
F
R
 
L
D
 
E
K
 
R
G
 
N
T
 
I
V
 
M
I
 
V
I
 
I
P
 
P
D
 
D
M
 
L
Y
 
Y
A
 
L
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
|
V
T
 
T
V
 
V
S
|
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
L
S
 
N
H
 
H
I
 
V
R
 
S
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
M
 
L
Q
 
T
R
 
F
R
 
K
Q
 
Y
E
 
E
-
 
R
E
 
D
A
 
S
R
 
N
H
 
Y
Q
 
H
L
 
L
V
 
L
V
 
M
D
 
S
E
 
V
L
 
Q
E
 
E
A
 
S
L
 
L
S
 
E
E
 
R
S
 
K
L
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
H
W
 
G
T
 
G
L
 
T
N
 
I
P
 
P
-
 
I
-
 
V
-
 
P
-
 
T
-
 
A
K
 
E
F
 
F
T
 
Q
E
 
D
R
 
R
Y
 
-
L
 
I
R
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
S
E
 
E
L
x
K
E
 
D
L
 
I
V
 
V
R
x
H
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
A
D
 
Y
T
 
T
M
 
M
-
 
E
R
 
R
T
 
S
A
 
A
Y
 
R
Q
 
Q
S
 
I
M
 
M
R
 
R
E
 
T
V
 
A
W
 
M
H
 
K
G
 
-
R
 
Y
N
 
N
D
 
L
V
 
G
T
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
V
V
 
N
S
 
A
I
 
I
D
 
E
K
 
K
V
 
V
A
 
F
K
 
R
S
 
V
Y
 
Y
R
 
N
A
 
E
K
 
A
G
 
G
L
 
V

8ar7A Bovine glutamate dehydrogenase in ternary complex with the allosteric activators adp and leucine (see paper)
44% identity, 99% coverage: 6:476/476 of query aligns to 2:494/496 of 8ar7A

query
sites
8ar7A
E
 
D
P
 
P
S
 
N
F
 
F
R
 
F
Q
 
K
S
 
M
V
 
V
D
 
E
L
 
G
M
 
F
F
 
F
N
 
D
R
 
R
A
 
G
V
 
A
S
 
S
L
 
I
M
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
E
D
 
D
L
 
L
P
 
K
P
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
 
K
-
 
R
-
 
N
-
 
R
-
 
V
-
 
R
G
 
G
L
 
I
E
 
L
E
 
R
K
x
I
I
|
I
R
x
K
V
x
P
C
|
C
N
|
N
A
 
H
T
 
V
Y
 
L
T
 
S
V
 
L
R
 
S
F
 
F
G
 
P
V
 
I
R
 
R
L
 
R
R
 
D
-
 
D
G
 
G
G
 
S
I
 
W
Q
 
E
T
 
V
F
 
I
T
 
E
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
S
 
A
V
 
Q
H
|
H
S
|
S
E
 
Q
H
|
H
M
 
R
E
 
T
P
 
P
V
 
C
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
M
 
T
G
 
D
V
 
V
N
 
S
Q
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
L
M
 
M
T
 
T
Y
 
Y
K
 
K
C
 
C
A
|
A
L
 
V
V
 
V
E
x
D
A
x
V
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
C
 
K
I
 
I
D
 
N
P
 
P
R
 
K
Q
 
N
Y
 
Y
E
 
T
E
 
D
H
 
N
E
 
E
L
 
L
E
 
E
L
 
K
I
 
I
T
 
T
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
T
Y
 
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
R
 
K
D
 
G
L
 
F
I
 
I
N
 
G
P
 
P
S
 
G
Q
 
V
N
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
 
D
M
 
M
G
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
E
 
E
M
 
M
A
 
S
W
 
W
I
 
I
A
 
A
D
 
D
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
A
R
 
S
-
 
T
M
 
I
N
 
G
T
 
H
T
 
Y
D
 
D
I
 
I
N
 
N
A
 
A
K
 
H
A
 
A
C
 
C
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
I
N
 
S
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
x
H
G
 
G
R
 
R
V
 
I
E
 
S
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
F
Y
 
H
A
 
G
L
 
I
R
 
E
E
 
N
F
 
F
F
 
I
R
 
N
N
 
E
P
 
A
E
 
S
D
 
Y
V
 
M
A
 
S
A
 
I
A
 
L
N
 
G
M
 
M
D
 
T
G
 
P
K
 
G
L
 
F
D
 
G
G
 
D
K
 
K
R
 
T
V
 
F
I
 
A
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
L
 
F
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
H
 
H
A
 
S
A
 
M
K
 
R
F
 
Y
L
 
L
M
 
-
S
 
H
E
 
R
D
 
F
G
 
G
A
 
A
K
 
K
I
 
C
T
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
G
E
 
E
R
 
S
D
 
D
G
 
G
G
 
S
L
 
I
I
 
W
D
 
N
E
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
P
E
 
K
A
 
E
V
 
L
F
 
E
Q
 
D
W
 
F
I
 
K
A
 
L
N
 
Q
N
 
H
G
 
G
G
 
T
V
 
I
T
 
L
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
D
 
K
A
 
A
R
 
K
Y
 
I
V
 
Y
E
 
E
N
 
G
G
 
S
A
 
-
L
 
-
L
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
V
D
 
D
C
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
S
E
 
E
G
 
K
V
 
Q
I
 
L
N
 
T
L
 
K
T
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
P
N
 
R
I
 
V
K
 
K
A
 
A
R
 
K
L
 
I
I
 
I
I
 
A
E
 
E
A
 
G
A
 
A
N
 
N
G
 
G
P
 
P
V
 
T
T
 
T
A
 
P
G
 
E
A
 
A
D
 
D
E
 
K
I
 
I
L
 
F
R
 
L
D
 
E
K
 
R
G
 
N
T
 
I
V
 
M
I
 
V
I
 
I
P
 
P
D
 
D
M
 
L
Y
 
Y
A
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
L
K
|
K
N
 
N
L
 
L
S
 
N
H
 
H
I
 
V
R
x
S
F
 
Y
G
 
G
R
|
R
M
 
L
Q
 
T
R
 
F
R
 
K
Q
 
Y
E
 
E
-
 
R
E
 
D
A
 
S
R
 
N
H
 
Y
Q
 
H
L
 
L
V
 
L
V
 
M
D
 
S
E
 
V
L
 
Q
E
 
E
A
 
S
L
 
L
S
 
E
E
 
R
S
 
K
L
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
H
W
 
G
T
 
G
L
 
T
N
 
I
P
 
P
-
 
I
-
 
V
-
 
P
-
 
T
-
 
A
K
 
E
F
 
F
T
 
Q
E
 
D
R
 
R
Y
 
-
L
 
I
R
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
S
E
 
E
L
 
K
E
 
D
L
 
I
V
 
V
R
 
H
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
A
D
 
Y
T
 
T
M
 
M
-
 
E
R
|
R
T
 
S
A
 
A
Y
 
R
Q
 
Q
S
 
I
M
 
M
R
 
R
E
 
T
V
 
A
W
 
M
H
 
K
G
 
-
R
 
Y
N
 
N
D
 
L
V
 
G
T
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
V
V
 
N
S
 
A
I
 
I
D
 
E
K
|
K
V
 
V
A
 
F
K
 
R
S
x
V
Y
 
Y
R
 
N
A
 
E
K
 
A
G
|
G
L
x
V

Sites not aligning to the query:

1nqtA Crystal structure of bovine glutamate dehydrogenase-adp complex (see paper)
44% identity, 99% coverage: 6:476/476 of query aligns to 1:493/496 of 1nqtA

query
sites
1nqtA
E
 
D
P
 
P
S
 
N
F
 
F
R
 
F
Q
 
K
S
 
M
V
 
V
D
 
E
L
 
G
M
 
F
F
 
F
N
 
D
R
 
R
A
 
G
V
 
A
S
 
S
L
 
I
M
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
E
D
 
D
L
 
L
P
 
R
P
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
 
K
-
 
R
-
 
N
-
 
R
-
 
V
-
 
R
G
 
G
L
 
I
E
 
L
E
 
R
K
 
I
I
 
I
R
 
K
V
 
P
C
 
C
N
 
N
A
 
H
T
 
V
Y
 
L
T
 
S
V
 
L
R
 
S
F
 
F
G
 
P
V
 
I
R
 
R
L
 
R
R
 
D
-
 
D
G
 
G
G
 
S
I
 
W
Q
 
E
T
 
V
F
 
I
T
 
E
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
S
 
A
V
 
Q
H
 
H
S
 
S
E
 
H
H
x
Q
M
x
R
E
 
T
P
 
P
V
 
C
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
M
 
T
G
 
D
V
 
V
N
 
S
Q
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
L
M
 
M
T
 
T
Y
 
Y
K
 
K
C
 
C
A
|
A
L
 
V
V
 
V
E
x
D
A
 
V
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
C
 
K
I
 
I
D
 
N
P
 
P
R
 
K
Q
 
N
Y
 
Y
E
 
T
E
 
D
H
 
N
E
 
E
L
 
L
E
 
E
L
 
K
I
 
I
T
 
T
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
T
Y
 
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
R
 
K
D
 
G
L
 
F
I
 
I
N
 
G
P
 
P
S
 
G
Q
 
I
N
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
|
D
M
 
M
G
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
E
 
E
M
 
M
A
 
S
W
 
W
I
 
I
A
 
A
D
 
D
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
A
R
 
S
-
 
T
M
 
I
N
 
G
T
 
H
T
 
Y
D
 
D
I
 
I
N
 
N
A
 
A
K
 
H
A
 
A
C
 
C
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
x
I
N
 
S
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
H
G
 
G
R
 
R
V
 
I
E
 
S
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
F
Y
 
H
A
 
G
L
 
I
R
 
E
E
 
N
F
 
F
F
 
I
R
 
N
N
 
E
P
 
A
E
 
S
D
 
Y
V
 
M
A
 
S
A
 
I
A
 
L
N
 
G
M
 
M
D
 
T
G
 
P
K
 
G
L
 
F
D
 
G
G
 
D
K
 
K
R
 
T
V
 
F
I
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
L
 
F
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
H
 
H
A
 
S
A
 
M
K
 
R
F
 
Y
L
 
L
M
 
-
S
 
H
E
 
R
D
 
F
G
 
G
A
 
A
K
 
K
I
 
C
T
 
I
A
 
A
V
 
V
I
 
G
E
 
E
R
 
S
D
 
D
G
 
G
G
 
S
L
 
I
I
 
W
D
 
N
E
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
P
E
 
K
A
 
E
V
 
L
F
 
E
Q
 
D
W
 
F
I
 
K
A
 
L
N
 
Q
N
 
H
G
 
G
G
 
S
V
 
I
T
 
L
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
D
 
K
A
 
A
R
 
K
Y
 
P
V
 
Y
E
 
E
N
 
G
G
 
S
A
 
-
L
 
-
L
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
A
D
 
D
C
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
S
E
 
E
G
 
K
V
 
Q
I
 
L
N
 
T
L
 
K
T
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
P
N
 
R
I
 
V
K
 
K
A
 
A
R
 
K
L
 
I
I
 
I
I
 
A
E
 
E
A
 
G
A
 
A
N
 
N
G
 
G
P
 
P
V
 
T
T
 
T
A
 
P
G
 
E
A
 
A
D
 
D
E
 
K
I
 
I
L
 
F
R
 
L
D
 
E
K
 
R
G
 
N
T
 
I
V
 
M
I
 
V
I
 
I
P
 
P
D
 
D
M
 
L
Y
 
Y
A
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
L
S
 
N
H
 
H
I
 
V
R
x
S
F
 
Y
G
 
G
R
|
R
M
 
L
Q
 
T
R
 
F
R
 
K
Q
 
Y
E
 
E
-
 
R
E
 
D
A
 
S
R
 
N
H
 
Y
Q
 
H
L
 
L
V
 
L
V
 
M
D
 
S
E
 
V
L
 
Q
E
 
E
A
 
S
L
 
L
S
 
E
E
 
R
S
 
K
L
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
H
W
 
G
T
 
G
L
 
T
N
 
I
P
 
P
-
 
I
-
 
V
-
 
P
-
 
T
-
 
A
K
 
E
F
 
F
T
 
Q
E
 
D
R
 
R
Y
 
-
L
 
I
R
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
S
E
 
E
L
 
K
E
 
D
L
 
I
V
 
V
R
 
H
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
A
D
 
Y
T
 
T
M
 
M
-
 
E
R
|
R
T
 
S
A
 
A
Y
 
R
Q
 
Q
S
 
I
M
 
M
R
 
R
E
 
T
V
 
A
W
 
M
H
 
K
G
 
-
R
 
Y
N
 
N
D
 
L
V
 
G
T
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
V
V
 
N
S
 
A
I
 
I
D
 
E
K
|
K
V
 
V
A
 
F
K
 
K
S
 
V
Y
 
Y
R
 
N
A
 
E
K
 
A
G
 
G
L
 
V

6dhmA Bovine glutamate dehydrogenase complexed with zinc (see paper)
44% identity, 98% coverage: 6:471/476 of query aligns to 6:493/495 of 6dhmA

query
sites
6dhmA
E
 
D
P
 
P
S
 
N
F
 
F
R
 
F
Q
 
K
S
 
M
V
 
V
D
 
E
L
 
G
M
 
F
F
 
F
N
 
D
R
 
R
A
 
G
V
 
A
S
 
S
L
 
I
M
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
E
D
 
D
L
 
L
P
 
K
P
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
 
K
-
 
R
-
 
N
-
 
R
-
 
V
-
 
R
G
 
G
L
 
I
E
 
L
E
 
R
K
 
I
I
 
I
R
 
K
V
 
P
C
 
C
N
 
N
A
 
H
T
 
V
Y
 
L
T
 
S
V
 
L
R
 
S
F
 
F
G
 
P
V
 
I
R
 
R
L
 
R
R
 
D
-
 
D
G
 
G
G
 
S
I
 
W
Q
 
E
T
 
V
F
 
I
T
 
E
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
S
 
A
V
 
Q
H
 
H
S
 
S
E
 
Q
H
 
H
M
 
R
E
 
T
P
 
P
V
 
C
K
|
K
G
 
G
G
|
G
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
M
 
T
G
 
D
V
 
V
N
 
S
Q
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
L
M
|
M
T
 
T
Y
 
Y
K
|
K
C
 
C
A
 
A
L
 
V
V
 
V
E
 
D
A
 
V
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
C
 
K
I
 
I
D
 
N
P
 
P
R
 
K
Q
 
N
Y
 
Y
E
 
T
E
 
D
H
 
N
E
 
E
L
 
L
E
 
E
L
 
K
I
 
I
T
 
T
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
T
Y
 
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
R
 
K
D
 
G
L
 
F
I
 
I
N
 
G
P
 
P
S
 
G
Q
 
V
N
 
D
V
 
V
P
 
P
A
|
A
P
 
P
D
|
D
M
|
M
G
x
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
E
 
E
M
 
M
A
 
S
W
 
W
I
 
I
A
 
A
D
 
D
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
A
R
 
S
-
 
T
M
 
I
N
 
G
T
 
H
T
 
Y
D
 
D
I
 
I
N
 
N
A
 
A
K
 
H
A
 
A
C
 
C
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
I
N
 
S
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
x
H
G
 
G
R
|
R
V
 
I
E
x
S
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
F
Y
 
H
A
 
G
L
 
I
R
 
E
E
 
N
F
 
F
F
 
I
R
 
N
N
 
E
P
 
A
E
 
S
D
 
Y
V
 
M
A
 
S
A
 
I
A
 
L
N
 
G
M
 
M
D
 
T
G
 
P
K
 
G
L
 
F
D
 
G
G
 
D
K
 
K
R
 
T
V
 
F
I
 
A
V
 
V
Q
|
Q
G
|
G
L
x
F
G
|
G
N
|
N
V
|
V
G
 
G
Y
 
L
H
|
H
A
 
S
A
 
M
K
x
R
F
x
Y
L
 
L
M
 
-
S
 
H
E
x
R
D
 
F
G
 
G
A
 
A
K
 
K
I
 
C
T
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
G
E
|
E
R
x
S
D
 
D
G
 
G
G
 
S
L
 
I
I
 
W
D
 
N
E
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
P
E
x
K
A
 
E
V
 
L
F
x
E
Q
 
D
W
 
F
I
 
K
A
 
L
N
 
Q
N
 
H
G
 
G
G
 
T
V
 
I
T
 
L
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
D
 
K
A
 
A
R
 
K
Y
 
I
V
 
Y
E
 
E
N
 
G
G
 
S
A
 
-
L
 
-
L
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
V
D
 
D
C
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
A
A
|
A
L
 
S
E
 
E
G
 
K
V
 
Q
I
 
L
N
 
T
L
 
K
T
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
P
N
 
R
I
 
V
K
 
K
A
 
A
R
 
K
L
 
I
I
 
I
I
 
A
E
 
E
A
x
G
A
|
A
N
|
N
G
 
G
P
 
P
V
 
T
T
 
T
A
 
P
G
 
E
A
 
A
D
 
D
E
 
K
I
 
I
L
 
F
R
 
L
D
 
E
K
 
R
G
 
N
T
 
I
V
 
M
I
 
V
I
 
I
P
 
P
D
 
D
M
 
L
Y
 
Y
A
 
L
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G