SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF900 FitnessBrowser__Marino:GFF900 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1xg5C Structure of human putative dehydrogenase mgc4172 in complex with nadp
35% identity, 98% coverage: 2:220/224 of query aligns to 14:255/257 of 1xg5C

query
sites
1xg5C
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
E
 
A
T
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
L
A
 
V
K
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
L
R
 
K
L
 
V
V
 
V
L
 
G
A
 
C
A
|
A
R
|
R
S
x
T
E
 
V
D
 
G
K
 
N
L
 
I
K
 
E
G
 
E
L
 
L
Q
 
A
Q
 
A
E
 
E
L
 
C
-
 
K
-
 
S
-
 
A
G
 
G
G
 
Y
E
 
P
E
 
G
K
 
T
V
 
L
L
 
I
T
 
P
V
 
Y
Q
 
R
C
 
C
D
|
D
V
x
L
Q
 
S
S
 
N
G
 
E
D
 
E
D
 
D
Q
 
I
K
 
L
N
 
S
M
 
M
V
 
F
D
 
S
Q
 
A
A
 
I
L
 
R
K
 
S
T
 
Q
F
 
H
G
 
S
R
 
G
I
 
V
D
 
D
A
 
I
V
 
C
F
 
I
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
R
 
L
G
 
A
G
 
R
E
 
P
P
 
D
G
 
T
G
 
L
F
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
S
D
 
T
P
 
S
D
 
G
V
 
-
W
 
W
K
 
K
D
 
D
M
 
M
I
 
F
L
 
N
T
 
V
N
 
N
I
 
V
Y
 
L
G
 
A
V
 
L
G
 
S
L
 
I
T
 
C
L
 
T
Q
 
R
H
 
E
C
 
A
M
 
Y
P
 
Q
A
 
S
L
 
M
K
 
K
E
 
E
S
 
R
K
 
N
-
 
V
-
 
D
-
 
D
G
 
G
H
 
H
L
 
I
L
 
I
L
 
N
T
x
I
G
 
N
S
|
S
A
 
M
A
 
S
G
 
G
R
 
H
A
 
R
T
 
V
I
 
L
P
 
P
G
 
L
S
 
S
M
 
V
-
 
T
-
 
H
-
 
F
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
|
K
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
A
I
 
L
G
 
T
Y
 
E
G
 
G
V
 
L
R
 
R
E
 
Q
E
 
E
L
 
L
R
 
R
-
 
E
-
 
A
G
 
Q
S
 
T
G
 
H
I
 
I
R
 
R
V
 
A
T
 
T
L
 
C
I
 
I
E
 
S
P
 
P
G
|
G
M
 
V
V
|
V
D
 
E
T
|
T
P
 
Q
F
|
F
-
 
A
-
 
F
-
x
K
-
 
L
F
 
H
D
 
D
E
 
K
R
 
D
P
 
P
G
 
E
H
 
K
A
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
Y
-
 
E
-
 
Q
-
 
M
-
 
K
-
 
C
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
A
N
 
E
A
 
A
V
 
V
M
 
I
Y
 
Y
A
 
V
V
 
L
A
 
S
Q
 
T
P
 
P
A
 
A
H
 
H
V
 
I
D
 
Q
V
 
I
N
 
G
E
 
D
I
 
I
L
 
Q
V
 
M
R
 
R
P
 
P
T
 
T

A0A1U8QWA2 Glycine betaine reductase ATRR; Nonribosomal peptide synthetase-like protein ATRR; EC 1.2.1.-; EC 1.1.1.- from Emericella nidulans (strain FGSC A4 / ATCC 38163 / CBS 112.46 / NRRL 194 / M139) (Aspergillus nidulans) (see paper)
35% identity, 97% coverage: 2:219/224 of query aligns to 1033:1265/1270 of A0A1U8QWA2

query
sites
A0A1U8QWA2
L
x
V
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
S
|
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
|
G
A
|
A
E
x
A
T
x
V
A
|
A
R
x
T
A
|
A
A
x
L
A
|
A
K
x
R
Q
x
E
G
|
G
Y
x
A
R
x
H
L
x
V
V
x
A
L
|
L
A
x
G
A
|
A
R
|
R
S
x
R
E
x
L
D
|
D
K
x
A
L
|
L
K
x
E
G
x
S
L
|
L
Q
x
K
Q
x
E
E
x
K
L
|
L
G
x
S
G
x
A
E
x
S
-
x
G
E
x
V
K
|
K
V
|
V
L
x
V
T
|
T
V
x
C
Q
x
K
C
x
T
D
|
D
V
|
V
Q
x
T
S
x
D
G
x
R
D
x
K
D
x
Q
Q
x
V
K
x
E
N
x
G
M
x
L
V
|
V
D
x
K
Q
x
A
A
|
A
L
x
T
K
x
E
T
x
E
F
x
L
G
|
G
R
x
P
I
x
V
D
|
D
A
x
I
V
x
L
F
x
V
A
|
A
N
x
C
A
|
A
G
|
G
R
x
V
G
x
M
G
x
Y
E
x
F
P
 
-
G
x
T
G
x
M
F
x
M
S
x
A
G
x
N
A
x
T
D
x
Q
P
x
M
D
|
D
V
x
E
W
|
W
K
x
E
D
x
R
M
x
T
I
x
V
L
x
D
T
x
V
N
|
N
I
x
C
Y
x
K
G
|
G
V
x
I
G
x
L
L
x
N
T
x
S
L
|
L
Q
x
A
H
x
S
C
x
T
M
x
V
P
|
P
A
x
G
-
x
M
L
|
L
K
x
A
E
x
R
S
x
G
K
|
K
G
|
G
H
|
H
L
x
V
L
x
V
L
x
A
T
x
I
G
x
S
S
|
S
A
x
D
A
|
A
G
|
G
R
|
R
A
x
K
T
x
V
I
x
F
P
|
P
G
|
G
-
x
L
S
x
G
M
x
V
Y
|
Y
S
|
S
A
|
A
T
x
S
K
|
K
W
x
F
A
x
F
V
|
V
T
x
E
A
|
A
I
x
T
G
x
L
Y
x
Q
G
x
A
V
x
L
R
|
R
E
x
L
E
|
E
L
x
T
R
x
A
G
|
G
S
x
Q
G
|
G
I
x
L
R
|
R
V
|
V
T
|
T
L
x
A
I
x
V
E
x
Q
P
|
P
G
|
G
M
x
N
V
x
T
D
x
A
T
|
T
P
x
D
F
x
L
-
x
L
-
x
G
-
x
M
-
x
S
-
x
T
-
x
D
-
x
A
-
x
E
-
x
A
-
x
I
-
x
K
-
x
K
F
x
Y
D
x
G
E
|
E
R
x
P
P
x
S
G
|
G
-
x
A
H
x
Q
A
x
I
L
|
L
K
x
D
P
|
P
E
|
E
D
|
D
I
x
V
A
|
A
N
|
N
A
x
S
V
x
I
M
x
I
Y
|
Y
A
|
A
V
x
L
A
x
R
Q
|
Q
P
|
P
A
x
E
H
|
H
V
|
V
D
 
A
V
 
M
N
 
N
E
 
E
I
 
I
L
 
L
V
 
I
R
 
E
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3rkrA Crystal structure of a metagenomic short-chain oxidoreductase (sdr) in complex with NADP (see paper)
34% identity, 99% coverage: 2:222/224 of query aligns to 9:221/221 of 3rkrA

query
sites
3rkrA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
K
A
 
L
A
 
G
K
 
S
Q
 
L
G
 
G
Y
 
A
R
 
R
L
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
T
A
|
A
R
|
R
S
x
D
E
 
V
D
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
R
G
 
A
L
 
V
Q
 
E
Q
 
R
E
 
E
L
 
I
-
 
V
-
 
A
-
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
E
 
A
K
 
E
V
 
-
L
 
-
T
 
S
V
 
H
Q
 
A
C
|
C
D
|
D
V
x
L
Q
 
S
S
 
H
G
 
S
D
 
D
D
 
A
Q
 
I
K
 
A
N
 
A
M
 
F
V
 
A
D
 
T
Q
 
G
A
 
V
L
 
L
K
 
A
T
 
A
F
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
C
D
 
D
A
 
V
V
 
L
F
 
V
A
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
R
x
V
G
|
G
G
 
W
E
 
F
P
 
G
G
 
G
G
 
P
F
 
L
S
 
H
G
 
T
A
 
M
D
 
K
P
 
P
D
 
A
V
 
E
W
 
W
K
 
D
D
 
A
M
 
L
I
 
I
L
 
A
T
 
V
N
 
N
I
 
L
Y
 
K
G
 
A
V
 
P
G
 
Y
L
 
L
T
 
L
L
 
L
Q
 
R
H
 
A
C
 
F
M
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
M
K
 
I
E
 
A
S
 
A
K
 
K
-
 
R
G
 
G
H
 
H
L
 
I
L
 
I
L
 
N
T
 
I
G
 
S
S
|
S
A
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
K
A
 
N
T
 
P
I
 
V
P
 
A
-
 
D
G
 
G
S
 
A
M
 
A
Y
|
Y
S
 
T
A
 
A
T
 
S
K
|
K
W
 
W
A
 
G
V
 
L
T
 
N
A
 
G
I
 
L
G
 
M
Y
 
T
G
 
S
V
 
A
R
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
L
R
 
R
G
 
Q
S
 
H
G
 
Q
I
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
S
L
 
L
I
 
V
E
 
A
P
 
P
G
 
G
M
 
S
V
 
V
D
 
-
T
 
-
P
 
-
F
 
-
F
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
A
L
 
I
K
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
D
A
 
V
V
 
V
M
 
A
Y
 
L
A
 
L
V
 
A
A
 
T
Q
 
Q
P
 
A
A
 
D
H
 
Q
V
 
S
D
 
F
V
 
I
N
 
S
E
 
E
I
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
R
P
 
P
T
 
T
P
 
L
K
 
K

2japA Clavulanic acid dehydrogenase: structural and biochemical analysis of the final step in the biosynthesis of the beta- lactamase inhibitor clavulanic acid (see paper)
37% identity, 99% coverage: 2:223/224 of query aligns to 9:245/245 of 2japA

query
sites
2japA
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
E
E
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
L
A
 
A
K
 
A
Q
 
E
G
 
G
Y
 
A
R
 
A
L
 
V
V
 
A
L
 
I
A
 
A
A
|
A
R
|
R
S
x
R
E
 
V
D
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
R
G
 
A
L
 
L
Q
 
G
Q
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
T
G
 
A
E
 
A
-
 
G
E
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
H
T
 
V
V
 
L
Q
 
E
C
x
L
D
|
D
V
|
V
Q
 
A
S
 
D
G
 
R
D
 
Q
D
 
G
Q
 
V
K
 
D
N
 
A
M
 
A
V
 
V
D
 
A
Q
 
S
A
 
T
L
 
V
K
 
E
T
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
A
 
I
V
 
L
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
R
 
I
G
 
-
G
x
M
E
 
L
P
 
L
G
 
G
G
 
P
F
 
V
S
 
E
G
 
D
A
 
A
D
 
D
P
 
T
D
 
T
V
 
D
W
 
W
K
 
T
D
 
R
M
 
M
I
 
I
L
 
D
T
|
T
N
 
N
I
 
L
Y
 
L
G
 
G
V
 
L
G
 
M
L
 
Y
T
 
M
L
 
T
Q
 
R
H
 
A
C
 
A
M
 
L
P
 
P
A
 
H
L
 
L
K
 
L
E
 
R
S
 
S
K
 
K
G
 
G
H
 
T
L
 
V
L
 
V
L
 
Q
T
x
M
G
x
S
S
|
S
A
 
I
A
|
A
G
 
G
R
 
R
A
 
V
T
 
N
I
 
V
-
 
R
P
 
N
G
 
A
S
 
A
M
 
V
Y
|
Y
S
 
Q
A
 
A
T
 
T
K
|
K
W
 
F
A
 
G
V
 
V
T
 
N
A
 
A
I
 
F
G
 
S
Y
 
E
G
 
T
V
 
L
R
 
R
E
 
Q
E
 
E
L
 
V
R
 
T
G
 
E
S
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
V
L
 
V
I
 
I
E
 
E
P
|
P
G
 
G
M
x
T
V
x
T
D
 
D
T
|
T
P
x
E
F
x
L
-
 
R
-
 
G
-
 
H
-
 
I
-
 
T
-
 
H
-
 
T
-
x
A
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
M
F
x
Y
D
 
E
E
 
Q
R
|
R
P
 
I
G
 
S
H
 
Q
-
 
I
-
 
R
A
 
K
L
 
L
K
 
Q
P
 
A
E
 
Q
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
E
A
 
A
V
 
V
M
 
R
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
A
 
T
Q
 
A
P
 
P
A
 
H
H
 
H
V
 
A
D
 
T
V
 
V
N
 
H
E
 
E
I
 
I
L
 
F
V
 
I
R
 
R
P
 
P
T
 
T
P
 
D
K
 
Q
V
 
V

2jahC Biochemical and structural analysis of the clavulanic acid dehydeogenase (cad) from streptomyces clavuligerus (see paper)
37% identity, 99% coverage: 2:223/224 of query aligns to 10:246/246 of 2jahC

query
sites
2jahC
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
E
E
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
L
A
 
A
K
 
A
Q
 
E
G
 
G
Y
 
A
R
 
A
L
 
V
V
 
A
L
 
I
A
 
A
A
|
A
R
|
R
S
x
R
E
 
V
D
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
R
G
 
A
L
 
L
Q
 
G
Q
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
T
G
 
A
E
 
A
-
 
G
E
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
H
T
 
V
V
 
L
Q
 
E
C
 
L
D
|
D
V
|
V
Q
 
A
S
 
D
G
 
R
D
 
Q
D
 
G
Q
 
V
K
 
D
N
 
A
M
 
A
V
 
V
D
 
A
Q
 
S
A
 
T
L
 
V
K
 
E
T
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
A
 
I
V
 
L
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
R
 
I
G
 
-
G
 
M
E
 
L
P
 
L
G
 
G
G
 
P
F
 
V
S
 
E
G
 
D
A
 
A
D
 
D
P
 
T
D
 
T
V
 
D
W
 
W
K
 
T
D
 
R
M
 
M
I
 
I
L
 
D
T
|
T
N
 
N
I
 
L
Y
 
L
G
 
G
V
 
L
G
 
M
L
 
Y
T
 
M
L
 
T
Q
 
R
H
 
A
C
 
A
M
 
L
P
 
P
A
 
H
L
 
L
K
 
L
E
 
R
S
 
S
K
 
K
G
 
G
H
 
T
L
 
V
L
 
V
L
 
Q
T
x
M
G
 
S
S
|
S
A
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
V
T
 
N
I
 
V
-
 
R
P
 
N
G
 
A
S
 
A
M
 
V
Y
|
Y
S
 
Q
A
 
A
T
 
T
K
|
K
W
 
F
A
 
G
V
 
V
T
 
N
A
 
A
I
 
F
G
 
S
Y
 
E
G
 
T
V
 
L
R
 
R
E
 
Q
E
 
E
L
 
V
R
 
T
G
 
E
S
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
V
L
 
V
I
 
I
E
 
E
P
|
P
G
|
G
M
x
T
V
x
T
D
 
D
T
|
T
P
x
E
F
x
L
-
 
R
-
 
G
-
 
H
-
 
I
-
 
T
-
 
H
-
 
T
-
x
A
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
M
F
 
Y
D
 
E
E
 
Q
R
 
R
P
 
I
G
 
S
H
 
Q
-
 
I
-
 
R
A
 
K
L
 
L
K
 
Q
P
 
A
E
 
Q
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
E
A
 
A
V
 
V
M
 
R
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
A
 
T
Q
 
A
P
 
P
A
 
H
H
 
H
V
 
A
D
 
T
V
 
V
N
 
H
E
 
E
I
 
I
L
 
F
V
 
I
R
 
R
P
 
P
T
 
T
P
 
D
K
 
Q
V
 
V

2ehdB Crystal structure analysis of oxidoreductase
35% identity, 98% coverage: 1:220/224 of query aligns to 7:213/213 of 2ehdB

query
sites
2ehdB
M
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
E
E
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
L
A
 
L
A
 
H
K
 
A
Q
 
K
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
L
 
V
V
 
G
L
 
L
A
 
M
A
 
A
R
|
R
S
x
D
E
 
E
D
 
K
K
 
R
L
 
L
K
 
Q
G
 
A
L
 
L
Q
 
A
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
E
K
 
G
V
 
A
L
 
L
T
 
P
V
 
L
Q
 
P
C
 
G
D
 
D
V
 
V
Q
 
R
S
 
E
G
 
E
D
 
G
D
 
D
Q
 
W
K
 
A
N
 
R
M
 
A
V
 
V
D
 
A
Q
 
A
A
 
M
L
 
E
K
 
E
T
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
L
D
 
S
A
 
A
V
 
L
F
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
V
G
 
G
-
 
V
G
 
M
E
 
K
P
 
P
G
 
-
G
 
-
F
 
V
S
 
H
G
 
E
A
 
L
D
 
T
P
 
L
D
 
E
V
 
E
W
 
W
K
 
R
D
 
L
M
 
V
I
 
L
L
 
D
T
 
T
N
 
N
I
 
L
Y
 
T
G
 
G
V
 
A
G
 
F
L
 
L
T
 
G
L
 
I
Q
 
R
H
 
H
C
 
A
M
 
V
P
 
P
A
 
A
-
 
L
L
 
L
K
 
R
E
 
R
S
 
G
K
 
G
G
 
G
H
 
T
L
 
I
L
 
V
L
 
N
T
 
V
G
|
G
S
 
S
A
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
K
A
 
N
T
 
P
I
 
F
P
 
K
-
 
G
G
 
G
S
 
A
M
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
W
 
F
A
 
G
V
 
L
T
 
L
A
 
G
I
 
L
G
 
A
Y
 
G
G
 
A
V
 
A
R
 
M
E
 
L
E
 
D
L
 
L
R
 
R
G
 
E
S
 
A
G
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
V
L
 
N
I
 
V
E
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
S
V
 
V
D
 
K
T
 
-
P
 
-
F
 
-
F
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
A
N
 
Q
A
 
A
V
 
V
M
 
L
Y
 
F
A
 
A
V
 
L
A
 
E
Q
 
M
P
 
P
A
 
G
H
 
H
V
 
A
D
 
M
V
 
V
N
 
S
E
 
E
I
 
I
L
 
E
V
 
L
R
 
R
P
 
P
T
 
T

3l77A X-ray structure alcohol dehydrogenase from archaeon thermococcus sibiricus complexed with 5-hydroxy-NADP
36% identity, 97% coverage: 2:218/224 of query aligns to 6:227/235 of 3l77A

query
sites
3l77A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
E
E
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
L
A
 
A
K
 
R
Q
 
D
G
 
G
Y
 
Y
R
 
A
L
 
L
V
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
A
R
|
R
S
|
S
E
 
V
D
 
D
K
 
R
L
 
L
K
 
E
G
 
K
L
 
I
Q
 
A
Q
 
H
E
 
E
L
 
L
G
 
M
G
 
Q
E
 
E
E
 
Q
-
 
G
-
 
V
K
 
E
V
 
V
L
 
F
T
 
Y
V
 
H
Q
 
H
C
x
L
D
|
D
V
|
V
Q
 
S
S
 
K
G
 
A
D
 
E
D
 
S
Q
 
V
K
 
E
N
 
E
M
 
F
V
 
S
D
 
K
Q
 
K
A
 
V
L
 
L
K
 
E
T
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
V
V
 
V
F
 
V
A
 
A
N
|
N
A
|
A
G
|
G
R
 
L
G
 
-
G
 
G
E
 
Y
P
 
F
G
 
K
G
 
R
F
 
L
S
 
E
G
 
E
A
 
L
D
 
S
P
 
E
D
 
E
V
 
E
W
 
F
K
 
H
D
 
E
M
 
M
I
 
I
L
 
E
T
 
V
N
 
N
I
 
L
Y
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
W
L
 
R
T
 
T
L
 
L
Q
 
K
H
 
A
C
 
F
M
 
L
P
 
D
A
 
S
L
 
L
K
 
K
E
 
R
S
 
T
K
 
G
G
 
G
H
 
L
L
 
A
L
 
L
L
 
V
T
|
T
G
x
T
S
|
S
A
x
D
A
 
V
G
 
S
R
 
A
A
 
R
T
 
L
I
 
I
P
 
P
-
 
Y
G
 
G
S
 
G
M
 
G
Y
|
Y
S
 
V
A
 
S
T
 
T
K
|
K
W
 
W
A
 
A
V
 
A
T
 
R
A
 
A
I
 
L
G
 
-
Y
 
-
G
 
-
V
 
V
R
 
R
E
 
T
-
 
F
E
 
Q
L
 
I
R
 
E
G
 
N
S
 
P
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
F
T
 
F
L
 
E
I
 
L
E
 
R
P
|
P
G
|
G
M
x
A
V
|
V
D
 
D
T
|
T
P
x
Y
F
|
F
F
 
G
D
 
G
E
 
S
R
 
K
P
 
P
G
 
G
H
 
K
-
x
P
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
G
A
 
Y
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
D
D
 
E
I
 
I
A
 
A
N
 
E
A
 
A
V
 
V
M
 
R
Y
 
C
A
 
L
V
 
L
A
 
K
Q
 
L
P
 
P
A
 
K
H
 
D
V
 
V
D
 
R
V
 
V
N
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
M
V
 
L
R
 
R

6ixjA The crystal structure of sulfoacetaldehyde reductase from klebsiella oxytoca (see paper)
32% identity, 98% coverage: 1:219/224 of query aligns to 4:238/251 of 6ixjA

query
sites
6ixjA
M
 
V
L
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
T
S
|
S
G
|
G
I
x
F
G
 
G
A
 
E
E
 
A
T
 
A
A
 
A
R
 
Q
A
 
V
A
 
F
A
 
A
K
 
D
Q
 
A
G
 
G
Y
 
W
R
 
S
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
G
R
|
R
S
x
R
E
 
F
D
 
E
K
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
T
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
D
E
 
K
L
 
L
G
 
A
G
 
S
E
 
Q
E
 
V
K
 
P
V
 
V
L
 
H
T
 
I
V
 
I
Q
 
E
C
 
L
D
|
D
V
|
V
Q
 
R
S
 
D
G
 
S
D
 
D
D
 
S
Q
 
V
K
 
A
N
 
A
M
 
A
V
 
V
D
 
A
Q
 
A
A
 
L
L
 
P
K
 
A
T
 
D
F
 
F
G
 
A
R
 
D
I
 
I
D
 
T
A
 
T
V
 
L
F
 
I
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
R
 
L
G
 
A
G
 
L
E
 
S
P
 
P
G
 
Q
G
 
P
F
 
A
S
 
Q
G
 
K
A
 
V
D
 
D
P
 
L
D
 
D
V
 
D
W
 
W
K
 
K
D
 
T
M
 
M
I
 
I
L
 
D
T
|
T
N
 
N
I
 
V
Y
 
T
G
 
G
V
 
L
G
 
V
L
 
N
T
 
V
L
 
T
Q
 
H
H
 
A
C
 
L
M
 
L
P
 
P
A
 
T
L
 
L
K
 
I
E
 
N
-
 
H
-
 
G
S
 
A
K
 
G
G
 
A
H
 
S
L
 
I
L
 
I
L
 
N
T
x
I
G
 
G
S
|
S
A
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
A
 
W
T
 
P
I
x
Y
P
 
P
G
 
G
S
 
S
-
 
H
M
 
V
Y
|
Y
S
 
G
A
 
A
T
 
S
K
|
K
W
 
A
A
 
F
V
 
V
T
 
K
A
 
Q
I
 
F
G
 
S
Y
 
Y
G
 
N
V
 
L
R
 
R
E
 
C
E
 
D
L
 
L
R
 
L
G
 
G
S
 
T
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
T
L
 
D
I
 
L
E
 
A
P
|
P
G
|
G
M
 
I
V
x
A
D
 
E
T
|
T
P
x
E
F
|
F
F
 
T
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
T
-
 
K
-
 
G
D
 
D
E
 
Q
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
D
-
 
N
-
 
L
-
 
Y
R
 
R
P
 
G
G
 
T
H
 
T
A
 
P
L
 
L
K
 
S
P
 
A
E
 
R
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
E
A
 
Q
V
 
M
M
 
F
Y
 
Y
A
 
I
V
 
A
A
 
T
Q
 
L
P
 
P
A
 
D
H
 
H
V
 
M
D
 
N
V
 
I
N
 
N
E
 
R
I
 
V
L
 
E
V
 
V
R
 
M
P
 
P

3asvA The closed form of serine dehydrogenase complexed with NADP+ (see paper)
31% identity, 99% coverage: 1:222/224 of query aligns to 3:238/248 of 3asvA

query
sites
3asvA
M
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
T
S
 
A
G
|
G
I
x
F
G
 
G
A
 
E
E
 
C
T
 
I
A
 
T
R
 
R
A
 
R
A
 
F
A
 
I
K
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
H
R
 
K
L
 
V
V
 
I
L
 
A
A
 
T
A
 
G
R
|
R
S
x
R
E
 
Q
D
 
E
K
 
R
L
 
L
K
 
Q
G
 
E
L
 
L
Q
 
K
Q
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
-
E
 
-
E
 
D
K
 
N
V
 
L
L
 
Y
T
 
I
V
 
A
Q
 
Q
C
 
L
D
|
D
V
|
V
Q
 
R
S
 
N
G
 
R
D
 
A
D
 
A
Q
 
I
K
 
E
N
 
E
M
 
M
V
 
L
D
 
A
Q
 
S
A
 
L
L
 
P
K
 
A
T
 
E
F
 
W
G
 
C
R
 
N
I
 
I
D
 
D
A
 
I
V
 
L
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
-
 
L
-
 
A
R
 
L
G
 
G
G
 
M
E
 
E
P
 
P
G
 
A
G
 
-
F
 
-
S
 
H
G
 
K
A
 
A
D
 
S
P
 
V
D
 
E
V
 
D
W
 
W
K
 
E
D
 
T
M
 
M
I
 
I
L
 
D
T
 
T
N
 
N
I
 
N
Y
 
K
G
 
G
V
 
L
G
 
V
L
 
Y
T
 
M
L
 
T
Q
 
R
H
 
A
C
 
V
M
 
L
P
 
P
A
 
G
L
 
M
K
 
V
E
 
E
-
 
R
S
 
N
K
 
H
G
 
G
H
 
H
L
 
I
L
 
I
L
 
N
T
x
I
G
 
G
S
|
S
A
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
S
A
 
W
T
 
P
I
 
Y
P
 
A
-
 
G
G
 
G
S
 
N
M
 
V
Y
|
Y
S
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
W
 
A
A
 
F
V
 
V
T
 
R
A
 
Q
I
 
F
G
 
S
Y
 
L
G
 
N
V
 
L
R
 
R
E
 
T
E
 
D
L
 
L
R
 
H
G
 
G
S
 
T
G
 
A
I
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
T
L
 
D
I
 
I
E
 
E
P
 
P
G
|
G
M
 
L
V
|
V
-
 
G
D
 
G
T
|
T
P
x
E
F
|
F
F
 
S
D
 
N
E
 
V
R
 
R
-
 
F
-
 
K
-
 
G
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
T
-
 
Y
-
 
Q
P
 
N
G
 
T
H
 
V
A
 
A
L
 
L
K
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
S
N
 
E
A
 
A
V
 
V
M
 
W
Y
 
W
A
 
V
V
 
S
A
 
T
Q
 
L
P
 
P
A
 
A
H
 
H
V
 
V
D
 
N
V
 
I
N
 
N
E
 
T
I
 
L
L
 
E
V
 
M
R
 
M
P
 
P
T
 
V
P
 
T
K
 
Q

3p19A Improved NADPH-dependent blue fluorescent protein (see paper)
31% identity, 99% coverage: 1:222/224 of query aligns to 5:237/239 of 3p19A

query
sites
3p19A
M
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
E
E
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
R
A
 
F
A
 
S
K
 
E
Q
 
E
G
 
G
Y
 
H
R
 
P
L
 
L
V
 
L
L
 
L
A
 
L
A
|
A
R
|
R
S
x
R
E
 
V
D
 
E
K
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
A
L
 
L
Q
 
N
Q
 
L
E
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
P
K
 
N
V
 
T
L
 
L
T
 
C
V
 
A
Q
 
Q
C
 
V
D
|
D
V
|
V
Q
 
T
S
 
D
G
 
K
D
 
Y
D
 
T
Q
 
F
K
 
D
N
 
T
M
 
A
V
 
I
D
 
T
Q
 
R
A
 
A
L
 
E
K
 
K
T
 
I
F
 
Y
G
 
G
R
 
P
I
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
I
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
R
 
M
G
 
-
G
 
M
E
 
L
P
 
L
G
 
G
G
 
Q
F
 
I
S
 
D
G
 
T
A
 
Q
D
 
E
P
 
A
D
 
N
V
 
E
W
 
W
K
 
Q
D
 
R
M
 
M
I
 
F
L
 
D
T
 
V
N
 
N
I
 
V
Y
 
L
G
 
G
V
 
L
G
 
L
L
 
N
T
 
G
L
 
M
Q
 
Q
H
 
A
C
 
V
M
 
L
P
 
A
A
 
P
L
 
M
K
 
K
-
 
A
E
 
R
S
 
N
K
 
C
G
 
G
H
 
T
L
 
I
L
 
I
L
 
N
T
x
I
G
 
S
S
|
S
A
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
K
A
 
K
T
 
T
I
 
F
P
 
P
G
 
D
-
 
H
S
 
A
M
 
A
Y
|
Y
S
 
C
A
 
G
T
 
T
K
|
K
W
 
F
A
 
A
V
 
V
T
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
S
Y
 
E
G
 
N
V
 
V
R
 
R
E
 
E
E
 
E
L
 
V
R
 
A
G
 
A
S
 
S
G
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
M
L
 
T
I
 
I
E
 
A
P
|
P
G
 
S
M
x
A
V
|
V
D
 
K
T
|
T
P
x
E
F
x
L
F
 
L
D
 
S
E
 
H
R
 
T
P
 
T
G
 
S
H
 
Q
A
 
Q
L
 
I
K
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
Y
-
 
D
-
 
A
-
 
W
-
 
R
-
 
V
-
 
D
-
 
M
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
A
P
 
A
E
 
D
D
 
D
I
 
V
A
 
A
N
 
R
A
 
A
V
 
V
M
 
L
Y
 
F
A
 
A
V
 
Y
A
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
A
 
Q
H
 
N
V
 
V
D
 
C
V
 
I
N
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
A
V
 
L
R
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
K
K
 
Q

Q9P7B4 NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase; L-allo-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.381 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
32% identity, 98% coverage: 1:220/224 of query aligns to 9:246/259 of Q9P7B4

query
sites
Q9P7B4
M
 
I
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
K
E
 
S
T
 
T
A
 
A
R
 
F
A
 
E
A
 
I
A
 
A
K
 
K
Q
 
V
G
 
A
-
 
K
Y
 
V
R
 
K
L
 
L
V
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
R
S
 
R
E
 
F
D
x
S
K
x
T
L
 
V
K
 
E
G
 
E
L
 
I
Q
 
A
Q
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
E
G
 
S
-
 
K
-
 
Y
E
 
E
E
 
V
K
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
P
V
 
L
Q
 
K
C
 
L
D
 
D
V
 
V
Q
 
S
S
 
D
G
 
L
D
 
K
D
 
S
Q
 
I
K
 
P
N
 
G
M
 
V
V
 
I
D
 
E
Q
 
S
A
 
L
L
 
P
K
 
K
T
 
E
F
 
F
G
 
A
R
 
D
I
 
I
D
 
D
A
 
V
V
 
L
F
 
I
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
L
G
 
A
G
 
L
E
 
G
P
 
T
G
 
D
G
 
K
F
 
V
S
 
I
G
 
D
A
 
L
D
 
N
P
 
I
D
 
D
V
 
D
W
 
A
K
 
V
D
 
T
M
 
M
I
 
I
L
 
T
T
 
T
N
 
N
I
 
V
Y
 
L
G
 
G
V
 
M
G
 
M
L
 
A
T
 
M
L
 
T
Q
 
R
H
 
A
C
 
V
M
 
L
P
 
P
A
 
I
L
 
F
-
 
Y
K
 
S
E
 
K
S
 
N
K
 
K
G
 
G
H
 
D
L
 
I
L
 
L
L
 
N
T
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
E
T
 
S
-
 
Y
I
 
V
P
 
G
G
 
G
S
 
S
M
 
V
Y
 
Y
S
 
C
A
 
S
T
 
T
K
 
K
W
 
S
A
 
A
V
 
L
T
 
A
A
 
Q
I
 
F
G
 
T
Y
 
S
G
 
A
V
 
L
R
 
R
E
 
K
E
 
E
L
 
T
R
 
I
G
 
D
S
 
T
G
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
I
T
 
M
L
 
E
I
 
V
E
 
D
P
 
P
G
 
G
M
 
L
V
 
V
D
 
E
T
 
T
P
 
E
F
 
F
F
 
S
D
 
V
E
 
V
R
 
R
-
 
F
-
 
H
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
Q
-
 
K
-
 
A
-
 
D
-
 
N
-
 
V
-
 
Y
-
 
K
P
 
N
G
 
S
H
 
E
A
 
P
L
 
L
K
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
E
A
 
V
V
 
I
M
 
L
Y
 
F
A
 
A
V
 
L
A
 
T
Q
 
R
P
 
R
A
 
E
H
 
N
V
 
V
D
 
V
V
 
I
N
 
A
E
 
D
I
 
T
L
 
L
V
 
V
R
 
F
P
 
P
T
 
S

3rkuA Substrate fingerprint and the structure of NADP+ dependent serine dehydrogenase from saccharomyces cerevisiae complexed with NADP+
31% identity, 98% coverage: 1:220/224 of query aligns to 17:257/268 of 3rkuA

query
sites
3rkuA
M
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
 
A
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
E
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
L
A
 
E
-
 
Y
-
 
L
-
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
N
Q
 
G
G
 
D
Y
 
M
R
 
K
L
 
L
V
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
|
R
S
x
R
E
 
L
D
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
E
G
 
E
L
 
L
Q
 
K
Q
 
K
E
 
T
L
 
I
G
 
D
G
 
Q
E
 
E
-
 
F
-
 
P
-
 
N
E
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
H
T
 
V
V
 
A
Q
 
Q
C
 
L
D
|
D
V
x
I
Q
 
T
S
 
Q
G
 
A
D
 
E
D
 
K
Q
 
I
K
 
K
N
 
P
M
 
F
V
 
I
D
 
E
Q
 
N
A
 
L
L
 
P
K
 
Q
T
 
E
F
 
F
G
 
K
R
 
D
I
 
I
D
 
D
A
 
I
V
 
L
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
R
x
K
G
x
A
G
 
L
E
 
G
P
 
S
G
 
D
G
 
R
F
 
V
S
 
G
G
 
Q
A
 
I
D
 
A
P
 
T
D
 
E
V
 
D
W
 
I
K
 
Q
D
 
D
M
 
V
I
 
F
L
 
D
T
 
T
N
|
N
I
 
V
Y
 
T
G
 
A
V
 
L
G
 
I
L
 
N
T
 
I
L
 
T
Q
 
Q
H
 
A
C
 
V
M
 
L
P
 
P
A
 
I
L
 
F
K
 
Q
-
 
A
E
 
K
S
 
N
K
 
S
G
 
G
H
 
D
L
 
I
L
 
V
L
 
N
T
 
L
G
 
G
S
|
S
A
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
D
T
 
A
I
 
Y
P
 
P
-
 
T
G
 
G
S
 
S
M
 
I
Y
|
Y
S
 
C
A
 
A
T
 
S
K
|
K
W
 
F
A
 
A
V
 
V
T
 
G
A
 
A
I
 
F
G
 
T
Y
 
D
G
 
S
V
 
L
R
 
R
E
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
I
G
 
N
S
 
T
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
T
 
I
L
 
L
I
 
I
E
 
A
P
|
P
G
|
G
M
 
L
V
|
V
D
 
E
T
|
T
P
x
E
F
|
F
F
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
Y
-
 
R
-
 
G
-
x
N
D
 
E
E
 
E
R
 
Q
P
 
A
G
 
K
H
 
N
A
 
V
L
 
Y
K
 
K
-
 
D
-
 
T
-
 
T
-
 
P
-
 
L
-
 
M
P
 
A
E
 
D
D
 
D
I
 
V
A
 
A
N
 
D
A
 
L
V
 
I
M
 
V
Y
 
Y
A
 
A
V
 
T
A
 
S
Q
 
R
P
 
K
A
 
Q
H
 
N
V
 
T
D
 
V
V
 
I
N
 
A
E
 
D
I
 
T
L
 
L
V
 
I
R
 
F
P
 
P
T
 
T

Q05016 NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase; L-allo-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.381 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast)
31% identity, 98% coverage: 1:220/224 of query aligns to 16:256/267 of Q05016

query
sites
Q05016
M
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
K
E
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
L
A
 
E
-
 
Y
-
 
L
-
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
N
Q
 
G
G
 
D
Y
 
M
R
 
K
L
 
L
V
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
R
S
 
R
E
 
L
D
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
E
G
 
E
L
 
L
Q
 
K
Q
 
K
E
 
T
L
 
I
G
 
D
G
 
Q
E
 
E
-
 
F
-
 
P
-
 
N
E
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
H
T
 
V
V
 
A
Q
 
Q
C
 
L
D
 
D
V
 
I
Q
 
T
S
 
Q
G
 
A
D
 
E
D
 
K
Q
 
I
K
 
K
N
 
P
M
 
F
V
 
I
D
 
E
Q
 
N
A
 
L
L
 
P
K
 
Q
T
 
E
F
 
F
G
 
K
R
 
D
I
 
I
D
 
D
A
 
I
V
 
L
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
R
 
K
G
 
A
G
 
L
E
 
G
P
 
S
G
 
D
G
 
R
F
 
V
S
 
G
G
 
Q
A
 
I
D
 
A
P
 
T
D
 
E
V
 
D
W
 
I
K
 
Q
D
 
D
M
 
V
I
 
F
L
 
D
T
 
T
N
 
N
I
 
V
Y
 
T
G
 
A
V
 
L
G
 
I
L
 
N
T
 
I
L
 
T
Q
 
Q
H
 
A
C
 
V
M
 
L
P
 
P
A
 
I
L
 
F
K
 
Q
-
 
A
E
 
K
S
 
N
K
 
S
G
 
G
H
 
D
L
 
I
L
 
V
L
 
N
T
 
L
G
 
G
S
 
S
A
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
D
T
 
A
I
 
Y
P
 
P
-
 
T
G
 
G
S
 
S
M
 
I
Y
|
Y
S
 
C
A
 
A
T
 
S
K
|
K
W
 
F
A
 
A
V
 
V
T
 
G
A
 
A
I
 
F
G
 
T
Y
 
D
G
 
S
V
 
L
R
 
R
E
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
I
G
 
N
S
 
T
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
T
 
I
L
 
L
I
 
I
E
 
A
P
 
P
G
 
G
M
 
L
V
 
V
D
 
E
T
 
T
P
 
E
F
 
F
F
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
Y
-
 
R
-
 
G
-
 
N
D
 
E
E
 
E
R
 
Q
P
 
A
G
 
K
H
 
N
A
 
V
L
 
Y
K
 
K
-
 
D
-
 
T
-
 
T
-
 
P
-
 
L
-
 
M
P
 
A
E
 
D
D
 
D
I
 
V
A
 
A
N
 
D
A
 
L
V
 
I
M
 
V
Y
 
Y
A
 
A
V
 
T
A
 
S
Q
 
R
P
 
K
A
 
Q
H
 
N
V
 
T
D
 
V
V
 
I
N
 
A
E
 
D
I
 
T
L
 
L
V
 
I
R
 
F
P
 
P
T
 
T

3iahA Crystal structure of short chain dehydrogenase (ycik) from salmonella enterica subsp. Enterica serovar typhimurium str. Lt2 in complex with NADP and acetate.
30% identity, 88% coverage: 1:196/224 of query aligns to 15:221/253 of 3iahA

query
sites
3iahA
M
 
I
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
 
D
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
E
 
E
T
 
A
A
 
A
R
 
L
A
 
T
A
 
Y
A
 
A
K
 
R
Q
 
Y
G
 
G
Y
 
A
R
 
T
L
 
V
V
 
I
L
 
L
A
 
L
A
 
G
R
|
R
S
 
N
E
 
E
D
 
E
K
|
K
L
 
L
K
 
R
G
 
R
L
 
V
Q
 
A
Q
 
Q
E
 
H
L
 
I
G
 
A
G
 
D
E
 
E
E
 
Q
K
 
H
V
 
V
-
 
Q
-
 
P
-
 
Q
-
 
W
L
 
F
T
 
T
V
 
L
Q
x
D
C
x
L
D
 
L
V
 
T
Q
 
C
S
 
T
G
 
A
D
 
E
D
 
E
Q
 
C
K
 
R
N
 
Q
M
 
V
V
 
A
D
 
D
Q
 
R
A
 
I
L
 
A
K
 
A
T
 
H
F
 
Y
G
 
P
R
 
R
I
 
L
D
 
D
A
 
G
V
 
V
F
 
L
A
 
H
N
|
N
A
 
A
G
|
G
R
 
L
G
 
L
G
 
G
E
 
E
P
 
I
G
 
G
G
 
P
F
 
M
S
 
S
G
 
E
A
 
Q
D
 
D
P
 
P
D
 
Q
V
 
I
W
 
W
K
 
Q
D
 
D
M
 
V
I
 
M
L
 
Q
T
 
V
N
 
N
I
 
V
Y
 
N
G
 
A
V
 
T
G
 
F
-
 
M
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
Q
 
A
H
 
L
C
 
L
M
 
P
P
 
L
A
 
L
L
 
L
K
 
K
E
 
S
S
 
D
K
 
A
G
 
G
H
 
S
L
 
L
L
 
V
L
 
F
T
|
T
G
 
S
S
|
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
R
 
R
-
 
Q
A
 
G
T
 
R
I
 
A
P
 
N
G
 
W
S
 
G
M
 
A
Y
|
Y
S
 
A
A
 
T
T
 
S
K
|
K
W
 
F
A
 
A
V
 
T
T
 
E
A
 
G
I
 
M
G
 
M
Y
 
Q
G
 
V
V
 
L
R
 
A
E
 
D
E
 
E
L
 
Y
R
 
Q
G
 
N
S
 
R
G
 
S
I
 
L
R
 
R
V
 
V
T
 
N
L
 
C
I
 
I
E
 
N
P
|
P
G
|
G
-
x
G
-
x
T
-
 
R
-
x
T
-
 
S
M
|
M
V
x
R
D
 
A
T
 
S
P
 
A
F
 
F
F
 
P
D
 
T
E
 
E
R
 
D
P
 
P
G
 
Q
H
 
K
A
 
L
L
 
K
K
 
T
P
 
P
E
 
A
D
 
D
I
 
I

2rh4B Actinorhodin ketoreductase, actkr, with NADPH and inhibitor emodin (see paper)
34% identity, 81% coverage: 2:182/224 of query aligns to 17:201/268 of 2rh4B

query
sites
2rh4B
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
E
 
E
T
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
R
A
 
L
A
 
G
K
 
K
Q
 
E
G
 
G
Y
 
L
R
 
R
L
 
V
V
 
F
L
 
V
A
 
C
A
|
A
R
|
R
S
x
G
E
 
E
D
 
E
K
 
G
L
 
L
K
 
R
G
 
T
L
 
T
Q
 
L
Q
 
K
E
 
E
L
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
A
G
 
G
G
 
V
E
 
E
E
 
A
K
 
D
V
 
G
L
 
R
T
 
T
V
 
-
Q
 
-
C
|
C
D
|
D
V
|
V
Q
 
R
S
 
S
G
 
V
D
 
P
D
 
E
Q
 
I
K
 
E
N
 
A
M
 
L
V
 
V
D
 
A
Q
 
A
A
 
V
L
 
V
K
 
E
T
 
R
F
 
Y
G
 
G
R
 
P
I
 
V
D
 
D
A
 
V
V
 
L
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
P
G
 
G
G
 
G
F
 
G
S
 
A
G
 
T
A
 
A
D
 
E
-
 
L
-
 
A
P
 
D
D
 
E
V
 
L
W
 
W
K
 
L
D
 
D
M
 
V
I
 
V
L
 
E
T
 
T
N
|
N
I
 
L
Y
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
F
L
 
R
T
 
V
L
 
T
Q
 
K
H
 
Q
C
 
V
M
 
L
P
 
K
A
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
M
L
 
L
K
 
E
E
 
R
S
 
G
K
 
T
G
 
G
H
 
R
L
 
I
L
 
V
L
 
N
T
 
I
G
 
A
S
|
S
A
 
T
A
 
G
G
 
G
R
 
K
-
 
Q
A
 
G
T
 
V
I
 
V
P
 
H
G
 
A
S
 
A
M
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
W
 
H
A
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
G
I
 
F
G
 
T
Y
 
K
G
 
A
V
 
L
R
 
G
E
 
L
E
 
E
L
 
L
R
 
A
G
 
R
S
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
T
 
N
L
 
A
I
 
V
E
 
C
P
 
P
G
|
G
M
 
F
V
|
V
D
 
E
T
|
T
P
 
P
F
x
M

Sites not aligning to the query:

1w4zA Structure of actinorhodin polyketide (actiii) reductase (see paper)
34% identity, 81% coverage: 2:182/224 of query aligns to 8:192/259 of 1w4zA

query
sites
1w4zA
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
E
 
E
T
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
R
A
 
L
A
 
G
K
 
K
Q
 
E
G
 
G
Y
 
L
R
 
R
L
 
V
V
 
F
L
 
V
A
 
C
A
 
A
R
|
R
S
x
G
E
 
E
D
 
E
K
 
G
L
 
L
K
 
R
G
 
T
L
 
T
Q
 
L
Q
 
K
E
 
E
L
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
A
G
 
G
G
 
V
E
 
E
E
 
A
K
 
D
V
 
G
L
 
R
T
 
T
V
 
-
Q
 
-
C
 
C
D
|
D
V
|
V
Q
 
R
S
 
S
G
 
V
D
 
P
D
 
E
Q
 
I
K
 
E
N
 
A
M
 
L
V
 
V
D
 
A
Q
 
A
A
 
V
L
 
V
K
 
E
T
 
R
F
 
Y
G
 
G
R
 
P
I
 
V
D
 
D
A
 
V
V
 
L
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
R
 
R
G
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
P
G
 
G
G
 
G
F
 
G
S
 
A
G
 
T
A
 
A
D
 
E
-
 
L
-
 
A
P
 
D
D
 
E
V
 
L
W
 
W
K
 
L
D
 
D
M
 
V
I
 
V
L
 
E
T
 
T
N
|
N
I
 
L
Y
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
F
L
 
R
T
 
V
L
 
T
Q
 
K
H
 
Q
C
 
V
M
 
L
P
 
K
A
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
M
L
 
L
K
 
E
E
 
R
S
 
G
K
 
T
G
 
G
H
 
R
L
 
I
L
 
V
L
 
N
T
 
I
G
 
A
S
|
S
A
 
T
A
 
G
G
 
G
R
 
K
-
 
Q
A
 
G
T
 
V
I
 
V
P
 
H
G
 
A
S
 
A
M
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
W
 
H
A
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
G
I
 
F
G
 
T
Y
 
K
G
 
A
V
 
L
R
 
G
E
 
L
E
 
E
L
 
L
R
 
A
G
 
R
S
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
T
 
N
L
 
A
I
 
V
E
 
C
P
|
P
G
|
G
M
 
F
V
|
V
D
 
E
T
|
T
P
 
P
F
 
M

Sites not aligning to the query:

1xr3A Actinorhodin polyketide ketoreductase with NADP and the inhibitor isoniazid bound (see paper)
34% identity, 81% coverage: 2:182/224 of query aligns to 5:189/256 of 1xr3A

query
sites
1xr3A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
E
 
E
T
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
R
A
 
L
A
 
G
K
 
K
Q
 
E
G
 
G
Y
 
L
R
 
R
L
 
V
V
 
F
L
 
V
A
 
C
A
|
A
R
|
R
S
x
G
E
 
E
D
 
E
K
 
G
L
 
L
K
 
R
G
 
T
L
 
T
Q
 
L
Q
 
K
E
 
E
L
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
A
G
 
G
G
 
V
E
 
E
E
 
A
K
 
D
V
 
G
L
 
R
T
 
T
V
 
-
Q
 
-
C
|
C
D
|
D
V
|
V
Q
 
R
S
 
S
G
 
V
D
 
P
D
 
E
Q
 
I
K
 
E
N
 
A
M
 
L
V
 
V
D
 
A
Q
 
A
A
 
V
L
 
V
K
 
E
T
 
R
F
 
Y
G
 
G
R
 
P
I
 
V
D
 
D
A
 
V
V
 
L
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
R
 
R
G
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
P
G
 
G
G
 
G
F
 
G
S
 
A
G
 
T
A
 
A
D
 
E
-
 
L
-
 
A
P
 
D
D
 
E
V
 
L
W
 
W
K
 
L
D
 
D
M
 
V
I
 
V
L
 
E
T
 
T
N
|
N
I
 
L
Y
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
F
L
 
R
T
 
V
L
 
T
Q
 
K
H
 
Q
C
 
V
M
 
L
P
 
K
A
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
M
L
 
L
K
 
E
E
 
R
S
 
G
K
 
T
G
 
G
H
 
R
L
 
I
L
 
V
L
 
N
T
 
I
G
 
A
S
|
S
A
x
T
A
x
G
G
 
G
R
 
K
-
 
Q
A
 
G
T
x
V
I
 
V
P
 
H
G
 
A
S
 
A
M
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
W
 
H
A
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
G
I
 
F
G
 
T
Y
 
K
G
 
A
V
 
L
R
 
G
E
 
L
E
 
E
L
 
L
R
 
A
G
 
R
S
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
T
 
N
L
 
A
I
 
V
E
 
C
P
 
P
G
|
G
M
 
F
V
|
V
D
 
E
T
|
T
P
|
P
F
 
M

Sites not aligning to the query:

2rh4A Actinorhodin ketoreductase, actkr, with NADPH and inhibitor emodin (see paper)
34% identity, 81% coverage: 2:182/224 of query aligns to 6:190/257 of 2rh4A

query
sites
2rh4A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
E
 
E
T
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
R
A
 
L
A
 
G
K
 
K
Q
 
E
G
 
G
Y
 
L
R
 
R
L
 
V
V
 
F
L
 
V
A
 
C
A
|
A
R
|
R
S
x
G
E
 
E
D
 
E
K
 
G
L
 
L
K
 
R
G
 
T
L
 
T
Q
 
L
Q
 
K
E
 
E
L
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
A
G
 
G
G
 
V
E
 
E
E
 
A
K
 
D
V
 
G
L
 
R
T
 
T
V
 
-
Q
 
-
C
|
C
D
|
D
V
|
V
Q
 
R
S
 
S
G
 
V
D
 
P
D
 
E
Q
 
I
K
 
E
N
 
A
M
 
L
V
 
V
D
 
A
Q
 
A
A
 
V
L
 
V
K
 
E
T
 
R
F
 
Y
G
 
G
R
 
P
I
 
V
D
 
D
A
 
V
V
 
L
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
R
 
R
G
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
P
G
 
G
G
 
G
F
 
G
S
 
A
G
 
T
A
 
A
D
 
E
-
 
L
-
 
A
P
 
D
D
 
E
V
 
L
W
 
W
K
 
L
D
 
D
M
 
V
I
 
V
L
 
E
T
 
T
N
|
N
I
 
L
Y
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
F
L
 
R
T
 
V
L
 
T
Q
 
K
H
 
Q
C
 
V
M
 
L
P
 
K
A
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
M
L
 
L
K
 
E
E
 
R
S
 
G
K
 
T
G
 
G
H
 
R
L
 
I
L
 
V
L
 
N
T
 
I
G
 
A
S
|
S
A
x
T
A
 
G
G
 
G
R
 
K
-
x
Q
A
 
G
T
x
V
I
 
V
P
 
H
G
 
A
S
 
A
M
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
W
 
H
A
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
G
I
 
F
G
 
T
Y
 
K
G
 
A
V
 
L
R
 
G
E
 
L
E
 
E
L
 
L
R
 
A
G
 
R
S
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
T
 
N
L
 
A
I
 
V
E
 
C
P
|
P
G
|
G
M
x
F
V
|
V
D
 
E
T
|
T
P
 
P
F
x
M

Sites not aligning to the query:

P16544 Putative ketoacyl reductase; EC 1.3.1.- from Streptomyces coelicolor (strain ATCC BAA-471 / A3(2) / M145) (see 2 papers)
34% identity, 81% coverage: 2:182/224 of query aligns to 10:194/261 of P16544

query
sites
P16544
L
 
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
S
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
|
G
A
x
L
E
|
E
T
x
I
A
|
A
R
|
R
A
x
R
A
x
L
A
x
G
K
|
K
Q
x
E
G
|
G
Y
x
L
R
|
R
L
x
V
V
x
F
L
x
V
A
x
C
A
|
A
R
|
R
S
x
G
E
 
E
D
 
E
K
 
G
L
 
L
K
 
R
G
 
T
L
 
T
Q
 
L
Q
 
K
E
 
E
L
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
A
G
 
G
G
 
V
E
 
E
E
 
A
K
 
D
V
 
G
L
 
R
T
 
T
V
 
-
Q
 
-
C
 
C
D
|
D
V
 
V
Q
 
R
S
 
S
G
 
V
D
 
P
D
 
E
Q
 
I
K
 
E
N
 
A
M
 
L
V
 
V
D
 
A
Q
 
A
A
 
V
L
 
V
K
 
E
T
 
R
F
 
Y
G
 
G
R
 
P
I
 
V
D
 
D
A
 
V
V
 
L
F
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
P
G
 
G
G
 
G
F
 
G
S
 
A
G
 
T
A
 
A
D
 
E
-
 
L
-
 
A
P
 
D
D
 
E
V
 
L
W
 
W
K
 
L
D
 
D
M
 
V
I
 
V
L
 
E
T
 
T
N
 
N
I
 
L
Y
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
F
L
 
R
T
 
V
L
 
T
Q
 
K
H
 
Q
C
 
V
M
 
L
P
 
K
A
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
M
L
 
L
K
 
E
E
 
R
S
 
G
K
 
T
G
 
G
H
 
R
L
 
I
L
 
V
L
 
N
T
 
I
G
 
A
S
 
S
A
 
T
A
 
G
G
 
G
R
 
K
-
 
Q
A
 
G
T
 
V
I
 
V
P
 
H
G
 
A
S
 
A
M
 
P
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
W
 
H
A
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
G
I
 
F
G
 
T
Y
 
K
G
 
A
V
 
L
R
 
G
E
 
L
E
 
E
L
 
L
R
 
A
G
 
R
S
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
T
 
N
L
 
A
I
 
V
E
 
C
P
 
P
G
 
G
M
 
F
V
 
V
D
 
E
T
 
T
P
 
P
F
 
M

6gtuA 17beta-hydroxysteroid dehydrogenase 14 variant t205 in complex with fragment j6
31% identity, 86% coverage: 16:207/224 of query aligns to 24:211/268 of 6gtuA

query
sites
6gtuA
R
 
R
A
 
A
A
 
F
A
 
V
K
 
N
Q
 
S
G
 
G
Y
 
A
R
 
R
L
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
C
A
x
D
R
x
K
S
 
D
E
 
E
D
 
S
K
 
G
L
 
G
K
 
R
G
 
A
L
 
L
Q
 
E
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
G
 
P
G
 
G
E
 
A
E
 
V
K
 
F
V
 
I
L
 
L
T
 
-
V
 
-
Q
 
-
C
 
C
D
|
D
V
 
V
Q
 
T
S
 
Q
G
 
E
D
 
D
D
 
D
Q
 
V
K
 
K
N
 
T
M
 
L
V
 
V
D
 
S
Q
 
E
A
 
T
L
 
I
K
 
R
T
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
A
 
C
V
 
V
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
R
 
H
G
 
H
G
 
P
E
 
P
P
 
P
G
 
Q
G
 
R
F
 
P
S
 
E
G
 
E
A
 
T
D
 
S
P
 
A
D
 
Q
V
 
G
W
 
F
K
 
R
D
 
Q
M
 
L
I
 
L
L
 
E
T
x
L
N
 
N
I
 
L
Y
 
L
G
 
G
V
 
T
G
 
Y
L
 
T
T
 
L
L
 
T
Q
 
K
H
 
L
C
 
A
M
 
L
P
 
P
A
 
Y
L
 
L
K
 
R
E
 
K
S
 
S
K
 
Q
G
 
G
H
 
N
L
 
V
L
 
I
-
 
N
-
 
I
-
 
S
-
x
S
L
 
L
T
 
V
G
 
G
S
 
A
A
 
I
A
 
G
G
 
Q
R
 
A
A
 
Q
T
 
A
I
 
V
P
 
P
G
 
-
S
 
-
M
 
-
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
T
 
T
K
|
K
W
 
G
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
A
I
 
M
G
 
T
Y
 
K
G
 
A
V
 
L
R
 
A
E
 
L
E
 
D
L
 
E
R
 
S
G
 
P
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
N
L
 
C
I
 
I
E
 
S
P
 
P
G
|
G
M
x
N
V
x
I
D
 
W
T
|
T
P
 
P
F
x
L
F
 
W
D
 
E
E
 
E
R
 
L
P
 
-
G
 
-
H
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
M
P
 
P
E
 
D
D
 
P
I
 
R
A
 
A
N
 
T
A
 
I
V
 
R
M
 
E
Y
 
G
A
 
M
V
 
L
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>GFF900 FitnessBrowser__Marino:GFF900
MLITGASSGIGAETARAAAKQGYRLVLAARSEDKLKGLQQELGGEEKVLTVQCDVQSGDD
QKNMVDQALKTFGRIDAVFANAGRGGEPGGFSGADPDVWKDMILTNIYGVGLTLQHCMPA
LKESKGHLLLTGSAAGRATIPGSMYSATKWAVTAIGYGVREELRGSGIRVTLIEPGMVDT
PFFDERPGHALKPEDIANAVMYAVAQPAHVDVNEILVRPTPKVE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory