SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF900 FitnessBrowser__Phaeo:GFF900 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6ed7A Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase bound to inhibitor mac13772
52% identity, 98% coverage: 9:431/432 of query aligns to 6:423/429 of 6ed7A

query
sites
6ed7A
L
 
L
E
 
A
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
R
Y
 
H
L
 
I
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
T
N
 
S
V
 
M
A
 
T
K
 
S
P
 
P
G
 
L
P
 
P
T
 
V
F
 
Y
V
 
P
V
 
V
K
 
V
E
 
S
S
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
C
H
 
E
I
 
L
T
 
I
L
 
L
D
 
S
D
 
D
G
 
G
T
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
G
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
C
 
A
M
 
A
M
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
Y
R
 
N
N
 
H
P
 
P
A
 
Q
I
 
L
T
 
N
S
 
A
A
 
A
I
 
M
H
 
K
A
 
S
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
T
 
A
L
 
M
P
 
S
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
H
 
H
D
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
I
D
 
E
L
 
L
G
 
C
R
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
A
I
 
M
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
S
 
P
L
 
L
T
 
E
R
 
C
I
 
V
F
 
F
Y
 
L
C
 
A
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
M
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
W
H
 
Q
A
 
A
I
 
K
G
 
G
Q
 
E
P
 
-
E
 
A
R
 
R
K
 
Q
E
 
R
F
 
F
A
 
L
T
 
T
I
 
F
R
 
R
S
 
N
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
|
D
T
 
T
W
 
F
K
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
N
G
 
S
M
 
M
H
 
H
H
 
S
L
 
L
F
 
W
Q
 
K
G
 
G
A
 
Y
L
 
L
S
 
P
V
 
E
Q
 
N
H
 
L
F
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
A
P
 
P
P
 
Q
V
 
S
R
 
R
I
 
M
H
 
D
E
 
G
D
 
E
W
 
W
S
 
-
D
 
D
D
 
E
P
 
R
A
 
D
Q
 
M
N
 
V
G
 
G
L
 
F
G
 
A
E
 
R
L
 
L
R
 
M
A
 
A
V
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
A
G
 
H
Q
 
R
D
 
H
K
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
V
I
 
I
L
 
I
E
 
E
P
 
P
V
 
I
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
x
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
M
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
W
L
 
L
N
 
K
Q
 
R
A
 
I
R
 
R
A
 
K
L
 
I
C
 
C
D
 
D
E
 
R
L
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
A
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
C
N
 
E
F
 
H
C
 
A
D
 
E
A
 
I
E
 
A
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
L
C
 
C
L
 
L
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
T
I
 
M
S
 
T
F
 
L
A
 
S
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
T
N
 
T
D
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
N
G
 
G
N
 
E
P
 
A
G
 
G
I
 
C
F
 
F
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
A
L
 
I
L
 
L
T
 
E
G
 
S
Q
 
G
D
 
D
W
 
W
R
 
Q
G
 
Q
T
 
Q
V
 
V
S
 
A
G
 
D
I
 
I
A
 
E
E
 
V
Q
 
Q
M
 
L
Q
 
R
S
 
E
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
P
A
 
A
R
 
R
E
 
D
L
 
A
P
 
E
N
 
M
V
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
V
E
 
E
M
 
T
K
 
T
H
 
H
A
 
P
V
 
V
S
 
N
A
 
M
D
 
A
E
 
A
A
 
L
H
 
Q
A
 
K
R
 
F
A
 
F
H
 
V
D
 
E
M
 
Q
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
I
R
|
R
P
 
P
F
|
F
G
 
G
K
 
K
N
 
L
I
 
I
Y
 
Y
T
 
L
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
T
 
I
T
 
L
P
 
P
D
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
S
 
Q
Q
 
R
I
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
A
M
 
V
L
 
N
R
 
R
L
 
A
A
 
V
R
 
Q
E
 
D

P12995 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase; 7,8-diamino-pelargonic acid aminotransferase; DAPA AT; DAPA aminotransferase; 7,8-diaminononanoate synthase; DANS; Diaminopelargonic acid synthase; EC 2.6.1.62 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
52% identity, 98% coverage: 9:431/432 of query aligns to 6:423/429 of P12995

query
sites
P12995
L
 
L
E
 
A
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
R
Y
 
H
L
 
I
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
T
N
 
S
V
 
M
A
 
T
K
 
S
P
 
P
G
 
L
P
 
P
T
 
V
F
 
Y
V
 
P
V
 
V
K
 
V
E
 
S
S
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
C
H
 
E
I
 
L
T
 
I
L
 
L
D
 
S
D
 
D
G
 
G
T
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
G
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
C
 
A
M
 
A
M
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
Y
R
 
N
N
 
H
P
 
P
A
 
Q
I
 
L
T
 
N
S
 
A
A
 
A
I
 
M
H
 
K
A
 
S
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
T
 
A
L
 
M
P
 
S
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
H
 
H
D
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
I
D
 
E
L
 
L
G
 
C
R
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
A
I
 
M
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
S
 
P
L
 
L
T
 
E
R
 
C
I
 
V
F
 
F
Y
 
L
C
 
A
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
M
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
W
H
 
Q
A
 
A
I
 
K
G
 
G
Q
 
E
P
 
-
E
 
A
R
 
R
K
 
Q
E
 
R
F
 
F
A
 
L
T
 
T
I
 
F
R
 
R
S
 
N
G
 
G
Y
|
Y
H
 
H
G
 
G
D
|
D
T
 
T
W
 
F
K
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
N
G
 
S
M
 
M
H
 
H
H
 
S
L
 
L
F
 
W
Q
 
K
G
 
G
A
 
Y
L
 
L
S
 
P
V
 
E
Q
 
N
H
 
L
F
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
A
P
 
P
P
 
Q
V
 
S
R
 
R
I
 
M
H
 
D
E
 
G
D
 
E
W
 
W
S
 
-
D
 
D
D
 
E
P
 
R
A
 
D
Q
 
M
N
 
V
G
 
G
L
 
F
G
 
A
E
 
R
L
 
L
R
 
M
A
 
A
V
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
A
G
 
H
Q
 
R
D
 
H
K
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
V
I
 
I
L
 
I
E
 
E
P
 
P
V
 
I
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
M
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
W
L
 
L
N
 
K
Q
 
R
A
 
I
R
 
R
A
 
K
L
 
I
C
 
C
D
 
D
E
 
R
L
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
A
D
|
D
E
 
E
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
A
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
C
N
 
E
F
 
H
C
 
A
D
 
E
A
 
I
E
 
A
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
L
C
 
C
L
 
L
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
T
I
 
M
S
 
T
F
 
L
A
 
S
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
T
N
 
T
D
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
N
G
 
G
N
 
E
P
 
A
G
 
G
I
 
C
F
 
F
M
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
A
L
 
I
L
 
L
T
 
E
G
 
S
Q
 
G
D
 
D
W
 
W
R
 
Q
G
 
Q
T
 
Q
V
 
V
S
 
A
G
 
D
I
 
I
A
 
E
E
 
V
Q
 
Q
M
 
L
Q
 
R
S
 
E
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
P
A
 
A
R
 
R
E
 
D
L
 
A
P
 
E
N
 
M
V
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
V
E
 
E
M
 
T
K
 
T
H
 
H
A
 
P
V
 
V
S
 
N
A
 
M
D
 
A
E
 
A
A
 
L
H
 
Q
A
 
K
R
 
F
A
 
F
H
 
V
D
 
E
M
 
Q
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
I
R
|
R
P
 
P
F
 
F
G
 
G
K
 
K
N
 
L
I
 
I
Y
 
Y
T
 
L
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
T
 
I
T
 
L
P
 
P
D
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
S
 
Q
Q
 
R
I
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
A
M
 
V
L
 
N
R
 
R
L
 
A
A
 
V
R
 
Q
E
 
D

1dtyA Crystal structure of adenosylmethionine-8-amino-7-oxonanoate aminotransferase with pyridoxal phosphate cofactor.
51% identity, 98% coverage: 9:431/432 of query aligns to 6:423/429 of 1dtyA

query
sites
1dtyA
L
 
L
E
 
A
F
 
F
D
 
D
Q
 
E
Q
 
R
Y
 
H
L
 
I
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
T
N
 
S
V
 
M
A
 
T
K
 
S
P
 
P
G
 
L
P
 
P
T
 
V
F
 
Y
V
 
P
V
 
V
K
 
V
E
 
S
S
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
C
H
 
E
I
 
L
T
 
I
L
 
L
D
 
S
D
 
D
G
 
G
T
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
G
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
 
W
W
 
W
C
 
A
M
 
A
M
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
Y
R
 
N
N
 
H
P
 
P
A
 
Q
I
 
L
T
 
N
S
 
A
A
 
A
I
 
M
H
 
K
A
 
S
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
T
 
A
L
 
M
P
 
S
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
D
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
I
D
 
E
L
 
L
G
 
C
R
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
A
I
 
M
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
S
 
P
L
 
L
T
 
E
R
 
C
I
 
V
F
 
F
Y
 
L
C
 
A
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
M
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
W
H
 
D
A
 
A
I
 
K
G
 
G
Q
 
E
P
 
-
E
 
A
R
 
R
K
 
D
E
 
R
F
 
F
A
 
L
T
 
T
I
 
F
R
 
R
S
 
N
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
W
 
F
K
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
N
G
 
S
M
 
M
H
 
H
H
 
S
L
 
L
F
 
W
Q
 
K
G
 
G
A
 
Y
L
 
L
S
 
P
V
 
E
Q
 
N
H
 
L
F
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
A
P
 
P
P
 
Q
V
 
S
R
 
R
I
 
M
H
 
D
E
 
G
D
 
E
W
 
W
S
 
-
D
 
D
D
 
E
P
 
R
A
 
D
Q
 
M
N
 
V
G
 
G
L
 
F
G
 
A
E
 
R
L
 
L
R
 
M
A
 
A
V
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
A
G
 
H
Q
 
R
D
 
H
K
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
V
I
 
I
L
 
I
E
|
E
P
 
P
V
 
I
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
M
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
W
L
 
L
N
 
K
Q
 
R
A
 
I
R
 
R
A
 
K
L
 
I
C
 
C
D
 
D
E
 
R
L
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
A
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
C
N
 
E
F
 
H
C
 
A
D
 
E
A
 
I
E
 
A
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
L
C
 
C
L
 
L
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
T
I
 
M
S
 
T
F
 
L
A
 
S
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
T
N
 
T
D
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
D
G
 
G
N
 
E
P
 
A
G
 
G
I
 
C
F
 
F
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
A
L
 
I
L
 
L
T
 
E
G
 
S
Q
 
G
D
 
D
W
 
W
R
 
Q
G
 
Q
T
 
Q
V
 
V
S
 
A
G
 
D
I
 
I
A
 
E
E
 
V
Q
 
Q
M
 
L
Q
 
R
S
 
E
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
P
A
 
A
R
 
R
E
 
D
L
 
A
P
 
E
N
 
M
V
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
V
E
 
E
M
 
T
K
 
T
H
 
H
A
 
P
V
 
V
S
 
N
A
 
M
D
 
A
E
 
A
A
 
L
H
 
Q
A
 
K
R
 
F
A
 
F
H
 
V
D
 
E
M
 
Q
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
I
R
 
R
P
 
P
F
 
F
G
 
G
K
 
K
N
 
L
I
 
I
Y
|
Y
T
 
L
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
T
 
I
T
 
L
P
 
P
D
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
S
 
Q
Q
 
R
I
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
A
M
 
V
L
 
N
R
 
R
L
 
A
A
 
V
R
 
Q
E
 
D

1mlzA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase in complex with the trans-isomer of amiclenomycin. (see paper)
52% identity, 98% coverage: 9:431/432 of query aligns to 6:422/427 of 1mlzA

query
sites
1mlzA
L
 
L
E
 
A
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
R
Y
 
H
L
 
I
W
 
L
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
T
N
 
S
V
 
M
A
 
T
K
 
S
P
 
P
G
 
L
P
 
P
T
 
V
F
 
Y
V
 
P
V
 
V
K
 
V
E
 
S
S
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
C
H
 
E
I
 
L
T
 
I
L
 
L
D
 
S
D
 
D
G
 
G
T
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
G
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
C
 
A
M
 
A
M
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
Y
R
 
N
N
 
H
P
 
P
A
 
Q
I
 
L
T
 
N
S
 
A
A
 
A
I
 
M
H
 
K
A
 
S
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
T
 
A
L
 
M
P
 
S
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
H
 
H
D
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
I
D
 
E
L
 
L
G
 
C
R
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
A
I
 
M
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
S
 
P
L
 
L
T
 
E
R
 
C
I
 
V
F
 
F
Y
 
L
C
 
A
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
M
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
W
H
 
Q
A
 
A
I
 
K
G
 
G
Q
 
E
P
 
-
E
 
A
R
 
R
K
 
Q
E
 
R
F
 
F
A
 
L
T
 
T
I
 
F
R
 
R
S
 
N
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
W
 
F
K
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
N
G
 
S
M
 
M
H
 
H
H
 
S
L
 
L
F
 
W
Q
 
K
G
 
G
A
 
Y
L
 
L
S
 
P
V
 
E
Q
 
N
H
 
L
F
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
A
P
 
P
P
 
Q
V
 
S
R
 
R
I
 
M
H
 
G
E
 
E
D
 
-
W
 
W
S
 
-
D
 
D
D
 
E
P
 
R
A
 
D
Q
 
M
N
 
V
G
 
G
L
 
F
G
 
A
E
 
R
L
 
L
R
 
M
A
 
A
V
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
A
G
 
H
Q
 
R
D
 
H
K
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
V
I
 
I
L
 
I
E
|
E
P
 
P
V
 
I
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
M
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
W
L
 
L
N
 
K
Q
 
R
A
 
I
R
 
R
A
 
K
L
 
I
C
 
C
D
 
D
E
 
R
L
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
A
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
C
N
 
E
F
 
H
C
 
A
D
 
E
A
 
I
E
 
A
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
L
C
 
C
L
 
L
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
T
I
 
M
S
 
T
F
 
L
A
 
S
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
T
N
 
T
D
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
N
G
 
G
N
 
E
P
 
A
G
 
G
I
 
C
F
 
F
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
A
L
 
I
L
 
L
T
 
E
G
 
S
Q
 
G
D
 
D
W
 
W
R
 
Q
G
 
Q
T
 
Q
V
 
V
S
 
A
G
 
D
I
 
I
A
 
E
E
 
V
Q
 
Q
M
 
L
Q
 
R
S
 
E
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
P
A
 
A
R
 
R
E
 
D
L
 
A
P
 
E
N
 
M
V
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
V
E
 
E
M
 
T
K
 
T
H
 
H
A
 
P
V
 
V
S
 
N
A
 
M
D
 
A
E
 
A
A
 
L
H
 
Q
A
 
K
R
 
F
A
 
F
H
 
V
D
 
E
M
 
Q
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
I
R
|
R
P
 
P
F
|
F
G
 
G
K
 
K
N
 
L
I
 
I
Y
|
Y
T
 
L
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
T
 
I
T
 
L
P
 
P
D
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
S
 
Q
Q
 
R
I
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
A
M
 
V
L
 
N
R
 
R
L
 
A
A
 
V
R
 
Q
E
 
D

1mlyA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase in complex with the cis isomer of amiclenomycin (see paper)
52% identity, 98% coverage: 9:431/432 of query aligns to 6:422/427 of 1mlyA

query
sites
1mlyA
L
 
L
E
 
A
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
R
Y
 
H
L
 
I
W
 
L
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
T
N
 
S
V
 
M
A
 
T
K
 
S
P
 
P
G
 
L
P
 
P
T
 
V
F
 
Y
V
 
P
V
 
V
K
 
V
E
 
S
S
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
C
H
 
E
I
 
L
T
 
I
L
 
L
D
 
S
D
 
D
G
 
G
T
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
G
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
C
 
A
M
 
A
M
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
Y
R
 
N
N
 
H
P
 
P
A
 
Q
I
 
L
T
 
N
S
 
A
A
 
A
I
 
M
H
 
K
A
 
S
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
T
 
A
L
 
M
P
 
S
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
H
 
H
D
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
I
D
 
E
L
 
L
G
 
C
R
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
A
I
 
M
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
S
 
P
L
 
L
T
 
E
R
 
C
I
 
V
F
 
F
Y
 
L
C
 
A
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
M
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
W
H
 
Q
A
 
A
I
 
K
G
 
G
Q
 
E
P
 
-
E
 
A
R
 
R
K
 
Q
E
 
R
F
 
F
A
 
L
T
 
T
I
 
F
R
 
R
S
 
N
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
W
 
F
K
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
N
G
 
S
M
 
M
H
 
H
H
 
S
L
 
L
F
 
W
Q
 
K
G
 
G
A
 
Y
L
 
L
S
 
P
V
 
E
Q
 
N
H
 
L
F
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
A
P
 
P
P
 
Q
V
 
S
R
 
R
I
 
M
H
 
G
E
 
E
D
 
-
W
 
W
S
 
-
D
 
D
D
 
E
P
 
R
A
 
D
Q
 
M
N
 
V
G
 
G
L
 
F
G
 
A
E
 
R
L
 
L
R
 
M
A
 
A
V
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
A
G
 
H
Q
 
R
D
 
H
K
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
V
I
 
I
L
 
I
E
|
E
P
 
P
V
 
I
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
M
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
W
L
 
L
N
 
K
Q
 
R
A
 
I
R
 
R
A
 
K
L
 
I
C
 
C
D
 
D
E
 
R
L
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
A
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
C
N
 
E
F
 
H
C
 
A
D
 
E
A
 
I
E
 
A
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
L
C
 
C
L
 
L
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
T
I
 
M
S
 
T
F
 
L
A
 
S
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
T
N
 
T
D
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
N
G
 
G
N
 
E
P
 
A
G
 
G
I
 
C
F
 
F
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
A
L
 
I
L
 
L
T
 
E
G
 
S
Q
 
G
D
 
D
W
 
W
R
 
Q
G
 
Q
T
 
Q
V
 
V
S
 
A
G
 
D
I
 
I
A
 
E
E
 
V
Q
 
Q
M
 
L
Q
 
R
S
 
E
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
P
A
 
A
R
 
R
E
 
D
L
 
A
P
 
E
N
 
M
V
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
V
E
 
E
M
 
T
K
 
T
H
 
H
A
 
P
V
 
V
S
 
N
A
 
M
D
 
A
E
 
A
A
 
L
H
 
Q
A
 
K
R
 
F
A
 
F
H
 
V
D
 
E
M
 
Q
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
I
R
|
R
P
 
P
F
|
F
G
 
G
K
 
K
N
 
L
I
 
I
Y
|
Y
T
 
L
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
T
 
I
T
 
L
P
 
P
D
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
S
 
Q
Q
 
R
I
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
A
M
 
V
L
 
N
R
 
R
L
 
A
A
 
V
R
 
Q
E
 
D

6erkA Crystal structure of diaminopelargonic acid aminotransferase from psychrobacter cryohalolentis (see paper)
47% identity, 97% coverage: 10:428/432 of query aligns to 8:412/420 of 6erkA

query
sites
6erkA
E
 
D
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
Q
Y
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
A
N
 
S
V
 
L
A
 
P
K
 
P
P
 
T
G
 
Y
P
 
P
T
 
N
F
 
I
V
 
V
V
 
I
K
 
D
E
 
R
S
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
I
H
 
Y
I
 
I
T
 
V
L
 
T
D
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
G
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
 
W
W
 
W
C
 
A
M
 
S
M
 
V
H
 
H
G
 
G
H
 
Y
R
 
N
N
 
H
P
 
P
A
 
K
I
 
L
T
 
N
S
 
A
A
 
A
I
 
M
H
 
I
A
 
E
Q
 
Q
L
 
L
D
 
G
T
 
K
L
 
M
P
 
A
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
D
 
Q
P
 
P
A
 
A
I
 
I
D
 
D
L
 
L
G
 
G
R
 
K
K
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
S
I
 
I
T
 
V
P
 
P
E
 
A
S
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
A
I
 
I
F
 
F
Y
 
Y
C
 
A
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
I
S
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
L
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
I
A
 
A
I
 
A
G
 
K
Q
 
R
P
 
P
E
 
S
R
 
K
K
 
C
E
 
Q
F
 
F
A
 
A
T
 
S
I
 
T
R
 
H
S
 
S
G
 
G
Y
|
Y
H
x
Y
G
 
G
D
 
D
T
 
T
W
 
W
K
 
H
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
C
 
C
D
 
D
P
 
K
D
 
Q
T
 
-
G
 
-
M
 
-
H
 
-
H
 
-
L
 
-
F
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
L
S
 
P
V
 
M
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
V
 
V
S
 
A
R
 
A
P
 
P
P
 
P
V
 
M
R
 
G
I
 
F
H
 
E
E
 
R
D
 
D
W
 
L
S
 
T
D
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
Q
N
 
S
G
 
E
L
 
R
G
 
E
E
 
A
L
 
L
R
 
T
A
 
E
V
 
F
L
 
F
E
 
V
A
 
K
G
 
N
Q
 
S
D
 
D
K
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
G
F
 
F
I
 
I
L
 
I
E
|
E
P
 
P
V
 
I
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
F
Y
 
Y
H
 
S
P
 
P
E
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
N
 
Q
Q
 
L
A
 
L
R
 
R
A
 
K
L
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
E
L
 
Y
G
 
D
I
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
A
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
S
G
 
G
A
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
C
N
 
E
F
 
H
C
 
A
D
 
A
A
 
I
E
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
M
C
 
T
L
 
I
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
M
S
 
T
F
 
F
A
 
A
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
S
N
 
T
D
 
R
R
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
D
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
Q
G
 
S
N
 
D
P
 
Y
G
 
P
I
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
C
A
 
A
S
 
S
L
 
I
D
 
D
L
 
L
L
 
I
T
 
V
G
 
S
Q
 
Y
D
 
D
W
 
I
R
 
E
G
 
A
T
 
R
V
 
T
S
 
E
G
 
N
I
 
M
A
 
Q
E
 
A
Q
 
I
M
 
M
Q
 
N
S
 
E
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
P
A
 
A
R
 
V
E
 
S
L
 
L
P
 
E
N
 
G
V
 
V
A
 
K
D
 
E
V
 
V
R
 
R
V
 
C
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
V
G
 
A
V
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
L
K
 
N
H
 
E
A
 
A
V
 
V
S
 
D
A
 
M
D
 
P
E
 
I
A
 
F
H
 
Q
A
 
T
R
 
L
A
 
L
H
 
I
D
 
N
M
 
N
G
 
G
V
 
I
F
 
W
L
 
V
R
 
R
P
 
P
F
 
F
G
 
G
K
 
K
N
 
L
I
 
V
Y
 
Y
T
 
I
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
V
T
 
I
T
 
T
P
 
D
D
 
D
Q
 
E
L
 
L
S
 
T
Q
 
T
I
 
L
T
 
C
A
 
Q
G
 
A
M
 
L
L
 
L
R
 
K
L
 
V

4cxqA Mycobaterium tuberculosis transaminase bioa complexed with substrate kapa (see paper)
49% identity, 98% coverage: 9:430/432 of query aligns to 7:423/427 of 4cxqA

query
sites
4cxqA
L
 
I
E
 
A
F
 
V
D
 
D
Q
 
G
Q
 
A
Y
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
S
N
 
S
V
 
I
A
 
G
K
 
R
P
 
E
G
 
V
P
 
S
T
 
P
F
 
V
V
 
V
V
 
A
K
 
V
E
 
A
S
 
A
E
 
H
G
 
G
V
 
A
H
 
W
I
 
L
T
 
T
L
 
L
-
 
I
D
 
R
D
 
D
G
 
G
-
 
Q
-
 
P
T
 
I
R
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
C
 
T
M
 
A
M
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
A
 
A
I
 
L
T
 
D
S
 
Q
A
 
A
I
 
L
H
 
T
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
T
 
V
L
 
M
P
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
D
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
A
D
 
R
L
 
L
G
 
A
R
 
K
K
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
S
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
I
 
V
F
 
F
Y
 
F
C
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
W
H
 
R
A
 
G
I
 
R
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
G
R
 
K
K
 
R
E
 
R
F
 
L
A
 
M
T
 
T
I
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
W
 
F
K
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
H
 
S
L
 
L
F
 
W
Q
 
T
G
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
A
V
 
A
Q
 
Q
H
 
V
F
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
V
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
-
E
 
R
D
 
D
W
 
Y
S
 
-
D
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
Y
N
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
F
E
 
E
L
 
A
R
 
Q
A
 
L
V
 
A
L
 
Q
E
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
D
 
-
K
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
V
I
 
V
L
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
E
 
R
Y
 
Y
L
 
L
N
 
H
Q
 
D
A
 
L
R
 
R
A
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
L
 
Y
G
 
E
I
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
A
N
 
D
F
 
H
C
 
A
D
 
G
A
 
V
E
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
L
S
 
S
F
 
L
A
 
A
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
C
N
 
T
D
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
G
 
G
I
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
K
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
W
 
W
R
 
R
G
 
T
T
 
R
V
 
I
S
 
T
G
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
G
M
 
L
Q
 
T
S
 
A
E
 
G
L
 
L
A
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
P
 
P
N
 
A
V
 
V
A
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
K
 
D
H
 
R
A
 
P
V
 
V
S
 
D
A
 
L
D
 
A
E
 
V
A
 
A
H
 
T
A
 
P
R
 
A
A
 
A
H
 
L
D
 
D
M
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
L
R
|
R
P
 
P
F
 
F
G
 
R
K
 
N
N
 
L
I
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
T
 
C
T
 
T
P
 
P
D
 
A
Q
 
E
L
 
I
S
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M
L
 
V
R
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R

1qj3A Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase in complex with 7-keto-8-aminopelargonic acid (see paper)
51% identity, 98% coverage: 9:431/432 of query aligns to 6:411/416 of 1qj3A

query
sites
1qj3A
L
 
L
E
 
A
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
R
Y
 
H
L
 
I
W
 
L
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
T
N
 
S
V
 
M
A
 
T
K
 
S
P
 
P
G
 
L
P
 
P
T
 
V
F
 
Y
V
 
P
V
 
V
K
 
V
E
 
S
S
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
C
H
 
E
I
 
L
T
 
I
L
 
L
D
 
S
D
 
D
G
 
G
T
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
G
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
C
 
A
M
 
A
M
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
Y
R
 
N
N
 
H
P
 
P
A
 
Q
I
 
L
T
 
N
S
 
A
A
 
A
I
 
M
H
 
K
A
 
S
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
T
 
A
L
 
M
P
 
S
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
H
 
H
D
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
I
D
 
E
L
 
L
G
 
C
R
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
A
I
 
M
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
S
 
P
L
 
L
T
 
E
R
 
C
I
 
V
F
 
F
Y
 
L
C
 
A
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
M
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
W
H
 
Q
A
 
A
I
 
K
G
 
G
Q
 
E
P
 
-
E
 
A
R
 
R
K
 
Q
E
 
R
F
 
F
A
 
L
T
 
T
I
 
F
R
 
R
S
 
N
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
W
 
F
K
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
N
G
 
L
M
 
P
H
 
E
H
 
N
L
 
L
F
 
F
Q
 
A
G
 
P
A
 
A
L
 
-
S
 
-
V
 
-
Q
 
-
H
 
-
F
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
P
P
 
Q
V
 
S
R
 
R
I
 
M
H
 
G
E
 
E
D
 
-
W
 
W
S
 
-
D
 
D
D
 
E
P
 
R
A
 
D
Q
 
M
N
 
V
G
 
G
L
 
F
G
 
A
E
 
R
L
 
L
R
 
M
A
 
A
V
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
A
G
 
H
Q
 
R
D
 
H
K
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
V
I
 
I
L
 
I
E
|
E
P
 
P
V
 
I
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
M
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
W
L
 
L
N
 
K
Q
 
R
A
 
I
R
 
R
A
 
K
L
 
I
C
 
C
D
 
D
E
 
R
L
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
A
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
C
N
 
E
F
 
H
C
 
A
D
 
E
A
 
I
E
 
A
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
L
C
 
C
L
 
L
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
T
I
 
M
S
 
T
F
 
L
A
 
S
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
T
N
 
T
D
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
N
G
 
G
N
 
-
P
 
-
G
 
G
I
 
C
F
 
F
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
A
L
 
I
L
 
L
T
 
E
G
 
S
Q
 
G
D
 
D
W
 
W
R
 
Q
G
 
Q
T
 
Q
V
 
V
S
 
A
G
 
D
I
 
I
A
 
E
E
 
V
Q
 
Q
M
 
L
Q
 
R
S
 
E
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
P
A
 
A
R
 
R
E
 
D
L
 
A
P
 
E
N
 
M
V
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
V
E
 
E
M
 
T
K
 
T
H
 
H
A
 
P
V
 
V
S
 
N
A
 
M
D
 
A
E
 
A
A
 
L
H
 
Q
A
 
K
R
 
F
A
 
F
H
 
V
D
 
E
M
 
Q
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
I
R
|
R
P
 
P
F
|
F
G
 
G
K
 
K
N
 
L
I
 
I
Y
|
Y
T
 
L
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
T
 
I
T
 
L
P
 
P
D
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
S
 
Q
Q
 
R
I
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
A
M
 
V
L
 
N
R
 
R
L
 
A
A
 
V
R
 
Q
E
 
D

4w1vA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a thiazole inhibitor (see paper)
49% identity, 98% coverage: 9:430/432 of query aligns to 7:421/425 of 4w1vA

query
sites
4w1vA
L
 
I
E
 
A
F
 
V
D
 
D
Q
 
G
Q
 
A
Y
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
T
 
S
N
 
S
V
 
I
A
 
G
K
 
R
P
 
-
G
 
S
P
 
P
T
 
V
F
 
V
V
 
A
V
 
V
K
 
A
E
 
A
S
 
H
E
 
G
G
 
A
V
 
W
H
 
L
I
 
T
T
 
L
L
 
I
D
 
R
D
 
D
G
 
G
-
 
Q
-
 
P
T
 
I
R
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
C
 
T
M
 
A
M
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
A
 
A
I
 
L
T
 
D
S
 
Q
A
 
A
I
 
L
H
 
T
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
T
 
V
L
 
M
P
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
D
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
A
D
 
R
L
 
L
G
 
A
R
 
K
K
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
S
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
I
 
V
F
 
F
Y
 
F
C
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
W
H
 
R
A
 
G
I
 
R
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
G
R
 
K
K
 
R
E
 
R
F
 
L
A
 
M
T
 
T
I
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
W
 
F
K
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
H
 
S
L
 
L
F
 
W
Q
 
T
G
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
A
V
 
A
Q
 
Q
H
 
V
F
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
V
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
-
E
 
R
D
 
D
W
 
Y
S
 
-
D
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
Y
N
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
F
E
 
E
L
 
A
R
 
Q
A
 
L
V
 
A
L
 
Q
E
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
D
 
-
K
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
V
I
 
V
L
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
E
 
R
Y
 
Y
L
 
L
N
 
H
Q
 
D
A
 
L
R
 
R
A
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
L
 
Y
G
 
E
I
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
A
N
 
D
F
 
H
C
 
A
D
 
G
A
 
V
E
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
L
S
 
S
F
 
L
A
 
A
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
C
N
 
T
D
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
G
 
G
I
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
K
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
W
 
W
R
 
R
G
 
T
T
 
R
V
 
I
S
 
T
G
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
G
M
 
L
Q
 
T
S
 
A
E
 
G
L
 
L
A
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
P
 
P
N
 
A
V
 
V
A
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
K
 
D
H
 
R
A
 
P
V
 
V
S
 
D
A
 
L
D
 
A
E
 
V
A
 
A
H
 
T
A
 
P
R
 
A
A
 
A
H
 
L
D
 
D
M
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
F
|
F
G
 
R
K
 
N
N
 
L
I
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
T
 
C
T
 
T
P
 
P
D
 
A
Q
 
E
L
 
I
S
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M
L
 
V
R
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R

4cxrA Mycobaterium tuberculosis transaminase bioa complexed with 1-(1,3- benzothiazol-2-yl)methanamine (see paper)
49% identity, 98% coverage: 9:430/432 of query aligns to 7:421/425 of 4cxrA

query
sites
4cxrA
L
 
I
E
 
A
F
 
V
D
 
D
Q
 
G
Q
 
A
Y
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
S
N
 
S
V
 
I
A
 
G
K
 
R
P
 
-
G
 
S
P
 
P
T
 
V
F
 
V
V
 
A
V
 
V
K
 
A
E
 
A
S
 
H
E
 
G
G
 
A
V
 
W
H
 
L
I
 
T
T
 
L
L
 
I
D
 
R
D
 
D
G
 
G
-
 
Q
-
 
P
T
 
I
R
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
C
 
T
M
 
A
M
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
A
 
A
I
 
L
T
 
D
S
 
Q
A
 
A
I
 
L
H
 
T
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
T
 
V
L
 
M
P
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
D
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
A
D
 
R
L
 
L
G
 
A
R
 
K
K
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
S
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
I
 
V
F
 
F
Y
 
F
C
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
W
H
 
R
A
 
G
I
 
R
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
G
R
 
K
K
 
R
E
 
R
F
 
L
A
 
M
T
 
T
I
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
W
 
F
K
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
H
 
S
L
 
L
F
 
W
Q
 
T
G
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
A
V
 
A
Q
 
Q
H
 
V
F
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
V
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
-
E
 
R
D
 
D
W
 
Y
S
 
-
D
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
Y
N
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
F
E
 
E
L
 
A
R
 
Q
A
 
L
V
 
A
L
 
Q
E
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
D
 
-
K
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
V
I
 
V
L
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
x
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
E
 
R
Y
 
Y
L
 
L
N
 
H
Q
 
D
A
 
L
R
 
R
A
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
L
 
Y
G
 
E
I
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
A
N
 
D
F
 
H
C
 
A
D
 
G
A
 
V
E
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
L
S
 
S
F
 
L
A
 
A
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
C
N
 
T
D
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
G
 
G
I
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
K
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
W
 
W
R
 
R
G
 
T
T
 
R
V
 
I
S
 
T
G
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
G
M
 
L
Q
 
T
S
 
A
E
 
G
L
 
L
A
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
P
 
P
N
 
A
V
 
V
A
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
K
 
D
H
 
R
A
 
P
V
 
V
S
 
D
A
 
L
D
 
A
E
 
V
A
 
A
H
 
T
A
 
P
R
 
A
A
 
A
H
 
L
D
 
D
M
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
G
 
R
K
 
N
N
 
L
I
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
T
 
C
T
 
T
P
 
P
D
 
A
Q
 
E
L
 
I
S
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M
L
 
V
R
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R

5te2A Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a mechanism-based inhibitor (see paper)
49% identity, 98% coverage: 9:430/432 of query aligns to 7:424/428 of 5te2A

query
sites
5te2A
L
 
I
E
 
A
F
 
V
D
 
D
Q
 
G
Q
 
A
Y
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
S
N
 
S
V
 
I
A
 
G
K
 
R
P
 
E
G
 
A
P
 
V
T
 
S
F
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
A
E
 
V
S
 
A
-
 
A
E
 
H
G
 
G
V
 
A
H
 
W
I
 
L
T
 
T
L
 
L
-
 
I
D
 
R
D
 
D
G
 
G
-
 
Q
-
 
P
T
 
I
R
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
C
 
T
M
 
A
M
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
A
 
A
I
 
L
T
 
D
S
 
Q
A
 
A
I
 
L
H
 
T
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
T
 
V
L
 
M
P
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
D
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
A
D
 
R
L
 
L
G
 
A
R
 
K
K
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
S
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
I
 
V
F
 
F
Y
 
F
C
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
W
H
 
R
A
 
G
I
 
R
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
G
R
 
K
K
 
R
E
 
R
F
 
L
A
 
M
T
 
T
I
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
W
 
F
K
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
H
 
S
L
 
L
F
 
W
Q
 
T
G
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
A
V
 
A
Q
 
Q
H
 
V
F
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
V
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
-
E
 
R
D
 
D
W
 
Y
S
 
-
D
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
Y
N
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
F
E
 
E
L
 
A
R
 
Q
A
 
L
V
 
A
L
 
Q
E
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
D
 
-
K
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
V
I
 
V
L
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
E
 
R
Y
 
Y
L
 
L
N
 
H
Q
 
D
A
 
L
R
 
R
A
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
L
 
Y
G
 
E
I
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
A
N
 
D
F
 
H
C
 
A
D
 
G
A
 
V
E
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
L
S
 
S
F
 
L
A
 
A
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
C
N
 
T
D
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
G
 
G
I
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
K
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
W
 
W
R
 
R
G
 
T
T
 
R
V
 
I
S
 
T
G
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
G
M
 
L
Q
 
T
S
 
A
E
 
G
L
 
L
A
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
P
 
P
N
 
A
V
 
V
A
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
K
 
D
H
 
R
A
 
P
V
 
V
S
 
D
A
 
L
D
 
A
E
 
V
A
 
A
H
 
T
A
 
P
R
 
A
A
 
A
H
 
L
D
 
D
M
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
G
 
R
K
 
N
N
 
L
I
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
T
 
C
T
 
T
P
 
P
D
 
A
Q
 
E
L
 
I
S
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M
L
 
V
R
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R

4xjoA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with an inhibitor optimized from hts lead (see paper)
49% identity, 98% coverage: 9:430/432 of query aligns to 7:424/428 of 4xjoA

query
sites
4xjoA
L
 
I
E
 
A
F
 
V
D
 
D
Q
 
G
Q
 
A
Y
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
T
 
S
N
 
S
V
 
I
A
 
G
K
 
R
P
 
E
G
 
A
P
 
V
T
 
S
F
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
A
E
 
V
S
 
A
-
 
A
E
 
H
G
 
G
V
 
A
H
 
W
I
 
L
T
 
T
L
 
L
-
 
I
D
 
R
D
 
D
G
 
G
-
 
Q
-
 
P
T
 
I
R
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
C
 
T
M
 
A
M
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
A
 
A
I
 
L
T
 
D
S
 
Q
A
 
A
I
 
L
H
 
T
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
T
 
V
L
 
M
P
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
D
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
A
D
 
R
L
 
L
G
 
A
R
 
K
K
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
S
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
I
 
V
F
 
F
Y
 
F
C
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
W
H
 
R
A
 
G
I
 
R
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
G
R
 
K
K
 
R
E
 
R
F
 
L
A
 
M
T
 
T
I
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
W
 
F
K
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
x
G
G
|
G
M
 
M
H
 
H
H
 
S
L
 
L
F
 
W
Q
 
T
G
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
A
V
 
A
Q
 
Q
H
 
V
F
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
V
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
-
E
 
R
D
 
D
W
 
Y
S
 
-
D
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
Y
N
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
F
E
 
E
L
 
A
R
 
Q
A
 
L
V
 
A
L
 
Q
E
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
D
 
-
K
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
V
I
 
V
L
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
x
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
E
 
R
Y
 
Y
L
 
L
N
 
H
Q
 
D
A
 
L
R
 
R
A
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
L
 
Y
G
 
E
I
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
A
N
 
D
F
 
H
C
 
A
D
 
G
A
 
V
E
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
L
S
 
S
F
 
L
A
 
A
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
C
N
 
T
D
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
G
 
G
I
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
K
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
W
 
W
R
 
R
G
 
T
T
 
R
V
 
I
S
 
T
G
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
G
M
 
L
Q
 
T
S
 
A
E
 
G
L
 
L
A
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
P
 
P
N
 
A
V
 
V
A
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
K
 
D
H
 
R
A
 
P
V
 
V
S
 
D
A
 
L
D
 
A
E
 
V
A
 
A
H
 
T
A
 
P
R
 
A
A
 
A
H
 
L
D
 
D
M
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
G
 
R
K
 
N
N
 
L
I
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
T
 
C
T
 
T
P
 
P
D
 
A
Q
 
E
L
 
I
S
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M
L
 
V
R
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R

4xewA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a hts lead compound (see paper)
49% identity, 98% coverage: 9:430/432 of query aligns to 7:424/428 of 4xewA

query
sites
4xewA
L
 
I
E
 
A
F
 
V
D
 
D
Q
 
G
Q
 
A
Y
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
T
 
S
N
 
S
V
 
I
A
 
G
K
 
R
P
 
E
G
 
A
P
 
V
T
 
S
F
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
A
E
 
V
S
 
A
-
 
A
E
 
H
G
 
G
V
 
A
H
 
W
I
 
L
T
 
T
L
 
L
-
 
I
D
 
R
D
 
D
G
 
G
-
 
Q
-
 
P
T
 
I
R
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
C
 
T
M
 
A
M
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
A
 
A
I
 
L
T
 
D
S
 
Q
A
 
A
I
 
L
H
 
T
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
T
 
V
L
 
M
P
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
D
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
A
D
 
R
L
 
L
G
 
A
R
 
K
K
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
S
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
I
 
V
F
 
F
Y
 
F
C
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
W
H
 
R
A
 
G
I
 
R
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
G
R
 
K
K
 
R
E
 
R
F
 
L
A
 
M
T
 
T
I
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
W
 
F
K
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
H
 
S
L
 
L
F
 
W
Q
 
T
G
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
A
V
 
A
Q
 
Q
H
 
V
F
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
V
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
-
E
 
R
D
 
D
W
 
Y
S
 
-
D
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
Y
N
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
F
E
 
E
L
 
A
R
 
Q
A
 
L
V
 
A
L
 
Q
E
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
D
 
-
K
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
V
I
 
V
L
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
E
 
R
Y
 
Y
L
 
L
N
 
H
Q
 
D
A
 
L
R
 
R
A
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
L
 
Y
G
 
E
I
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
A
N
 
D
F
 
H
C
 
A
D
 
G
A
 
V
E
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
L
S
 
S
F
 
L
A
 
A
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
C
N
 
T
D
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
G
 
G
I
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
K
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
W
 
W
R
 
R
G
 
T
T
 
R
V
 
I
S
 
T
G
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
G
M
 
L
Q
 
T
S
 
A
E
 
G
L
 
L
A
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
P
 
P
N
 
A
V
 
V
A
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
K
 
D
H
 
R
A
 
P
V
 
V
S
 
D
A
 
L
D
 
A
E
 
V
A
 
A
H
 
T
A
 
P
R
 
A
A
 
A
H
 
L
D
 
D
M
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
L
R
|
R
P
 
P
F
|
F
G
 
R
K
 
N
N
 
L
I
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
T
 
C
T
 
T
P
 
P
D
 
A
Q
 
E
L
 
I
S
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M
L
 
V
R
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R

4wyfA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a dsf fragment hit (see paper)
49% identity, 98% coverage: 9:430/432 of query aligns to 7:424/428 of 4wyfA

query
sites
4wyfA
L
 
I
E
 
A
F
 
V
D
 
D
Q
 
G
Q
 
A
Y
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
S
N
 
S
V
 
I
A
 
G
K
 
R
P
 
E
G
 
A
P
 
V
T
 
S
F
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
A
E
 
V
S
 
A
-
 
A
E
 
H
G
 
G
V
 
A
H
 
W
I
 
L
T
 
T
L
 
L
-
 
I
D
 
R
D
 
D
G
 
G
-
 
Q
-
 
P
T
 
I
R
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
 
W
W
 
W
C
 
T
M
 
A
M
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
A
 
A
I
 
L
T
 
D
S
 
Q
A
 
A
I
 
L
H
 
T
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
T
 
V
L
 
M
P
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
D
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
A
D
 
R
L
 
L
G
 
A
R
 
K
K
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
S
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
I
 
V
F
 
F
Y
 
F
C
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
W
H
 
R
A
 
G
I
 
R
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
G
R
 
K
K
 
R
E
 
R
F
 
L
A
 
M
T
 
T
I
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
W
 
F
K
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
H
 
S
L
 
L
F
 
W
Q
 
T
G
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
A
V
 
A
Q
 
Q
H
 
V
F
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
V
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
-
E
 
R
D
 
D
W
 
Y
S
 
-
D
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
Y
N
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
F
E
 
E
L
 
A
R
 
Q
A
 
L
V
 
A
L
 
Q
E
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
D
 
-
K
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
V
I
 
V
L
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
E
 
R
Y
 
Y
L
 
L
N
 
H
Q
 
D
A
 
L
R
 
R
A
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
L
 
Y
G
 
E
I
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
A
N
 
D
F
 
H
C
 
A
D
 
G
A
 
V
E
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
L
S
 
S
F
 
L
A
 
A
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
C
N
 
T
D
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
G
 
G
I
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
K
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
W
 
W
R
 
R
G
 
T
T
 
R
V
 
I
S
 
T
G
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
G
M
 
L
Q
 
T
S
 
A
E
 
G
L
 
L
A
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
P
 
P
N
 
A
V
 
V
A
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
K
 
D
H
 
R
A
 
P
V
 
V
S
 
D
A
 
L
D
 
A
E
 
V
A
 
A
H
 
T
A
 
P
R
 
A
A
 
A
H
 
L
D
 
D
M
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
G
 
R
K
 
N
N
 
L
I
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
T
 
C
T
 
T
P
 
P
D
 
A
Q
 
E
L
 
I
S
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M
L
 
V
R
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R

4wycA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a thiazole benzamide inhibitor (see paper)
49% identity, 98% coverage: 9:430/432 of query aligns to 7:424/428 of 4wycA

query
sites
4wycA
L
 
I
E
 
A
F
 
V
D
 
D
Q
 
G
Q
 
A
Y
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
T
 
S
N
 
S
V
 
I
A
 
G
K
 
R
P
 
E
G
 
A
P
 
V
T
 
S
F
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
A
E
 
V
S
 
A
-
 
A
E
 
H
G
 
G
V
 
A
H
 
W
I
 
L
T
 
T
L
 
L
-
 
I
D
 
R
D
 
D
G
 
G
-
 
Q
-
 
P
T
 
I
R
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
C
 
T
M
 
A
M
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
A
 
A
I
 
L
T
 
D
S
 
Q
A
 
A
I
 
L
H
 
T
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
T
 
V
L
 
M
P
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
D
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
A
D
 
R
L
 
L
G
 
A
R
 
K
K
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
S
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
I
 
V
F
 
F
Y
 
F
C
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
W
H
 
R
A
 
G
I
 
R
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
G
R
 
K
K
 
R
E
 
R
F
 
L
A
 
M
T
 
T
I
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
W
 
F
K
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
H
 
S
L
 
L
F
 
W
Q
 
T
G
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
A
V
 
A
Q
 
Q
H
 
V
F
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
V
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
-
E
 
R
D
 
D
W
 
Y
S
 
-
D
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
Y
N
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
F
E
 
E
L
 
A
R
 
Q
A
 
L
V
 
A
L
 
Q
E
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
D
 
-
K
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
V
I
 
V
L
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
E
 
R
Y
 
Y
L
 
L
N
 
H
Q
 
D
A
 
L
R
 
R
A
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
L
 
Y
G
 
E
I
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
A
N
 
D
F
 
H
C
 
A
D
 
G
A
 
V
E
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
L
S
 
S
F
 
L
A
 
A
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
C
N
 
T
D
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
G
 
G
I
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
K
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
W
 
W
R
 
R
G
 
T
T
 
R
V
 
I
S
 
T
G
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
G
M
 
L
Q
 
T
S
 
A
E
 
G
L
 
L
A
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
P
 
P
N
 
A
V
 
V
A
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
K
 
D
H
 
R
A
 
P
V
 
V
S
 
D
A
 
L
D
 
A
E
 
V
A
 
A
H
 
T
A
 
P
R
 
A
A
 
A
H
 
L
D
 
D
M
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
G
 
R
K
 
N
N
 
L
I
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
T
 
C
T
 
T
P
 
P
D
 
A
Q
 
E
L
 
I
S
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M
L
 
V
R
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R

4mqrA Mycobaterium tuberculosis transaminase bioa complexed with e)-5- hydroxy-4-(((z)-isonicotinoyldiazenyl)methylene)-6-methyl-1,4- dihydropyridin-3-yl)methyl phosphate (see paper)
49% identity, 98% coverage: 9:430/432 of query aligns to 7:424/428 of 4mqrA

query
sites
4mqrA
L
 
I
E
 
A
F
 
V
D
 
D
Q
 
G
Q
 
A
Y
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
S
N
 
S
V
 
I
A
 
G
K
 
R
P
 
E
G
 
A
P
 
V
T
 
S
F
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
A
E
 
V
S
 
A
-
 
A
E
 
H
G
 
G
V
 
A
H
 
W
I
 
L
T
 
T
L
 
L
-
 
I
D
 
R
D
 
D
G
 
G
-
 
Q
-
 
P
T
 
I
R
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
C
 
T
M
 
A
M
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
A
 
A
I
 
L
T
 
D
S
 
Q
A
 
A
I
 
L
H
 
T
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
T
 
V
L
 
M
P
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
D
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
A
D
 
R
L
 
L
G
 
A
R
 
K
K
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
S
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
I
 
V
F
 
F
Y
 
F
C
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
W
H
 
R
A
 
G
I
 
R
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
G
R
 
K
K
 
R
E
 
R
F
 
L
A
 
M
T
 
T
I
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
W
 
F
K
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
H
 
S
L
 
L
F
 
W
Q
 
T
G
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
A
V
 
A
Q
 
Q
H
 
V
F
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
V
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
-
E
 
R
D
 
D
W
 
Y
S
 
-
D
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
Y
N
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
F
E
 
E
L
 
A
R
 
Q
A
 
L
V
 
A
L
 
Q
E
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
D
 
-
K
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
V
I
 
V
L
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
E
 
R
Y
 
Y
L
 
L
N
 
H
Q
 
D
A
 
L
R
 
R
A
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
L
 
Y
G
 
E
I
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
A
N
 
D
F
 
H
C
 
A
D
 
G
A
 
V
E
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
L
S
 
S
F
 
L
A
 
A
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
C
N
 
T
D
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
G
 
G
I
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
K
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
W
 
W
R
 
R
G
 
T
T
 
R
V
 
I
S
 
T
G
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
G
M
 
L
Q
 
T
S
 
A
E
 
G
L
 
L
A
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
P
 
P
N
 
A
V
 
V
A
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
K
 
D
H
 
R
A
 
P
V
 
V
S
 
D
A
 
L
D
 
A
E
 
V
A
 
A
H
 
T
A
 
P
R
 
A
A
 
A
H
 
L
D
 
D
M
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
G
 
R
K
 
N
N
 
L
I
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
T
 
C
T
 
T
P
 
P
D
 
A
Q
 
E
L
 
I
S
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M
L
 
V
R
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R

4mqqA Mycobaterium tuberculosis transaminase bioa complexed with benzo[d]thiazole-2-carbohydrazide (see paper)
49% identity, 98% coverage: 9:430/432 of query aligns to 7:424/428 of 4mqqA

query
sites
4mqqA
L
 
I
E
 
A
F
 
V
D
 
D
Q
 
G
Q
 
A
Y
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
S
N
 
S
V
 
I
A
 
G
K
 
R
P
 
E
G
 
A
P
 
V
T
 
S
F
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
A
E
 
V
S
 
A
-
 
A
E
 
H
G
 
G
V
 
A
H
 
W
I
 
L
T
 
T
L
 
L
-
 
I
D
 
R
D
 
D
G
 
G
-
 
Q
-
 
P
T
 
I
R
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
C
 
T
M
 
A
M
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
A
 
A
I
 
L
T
 
D
S
 
Q
A
 
A
I
 
L
H
 
T
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
T
 
V
L
 
M
P
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
D
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
A
D
 
R
L
 
L
G
 
A
R
 
K
K
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
S
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
I
 
V
F
 
F
Y
 
F
C
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
W
H
 
R
A
 
G
I
 
R
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
G
R
 
K
K
 
R
E
 
R
F
 
L
A
 
M
T
 
T
I
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
W
 
F
K
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
H
 
S
L
 
L
F
 
W
Q
 
T
G
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
A
V
 
A
Q
 
Q
H
 
V
F
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
V
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
-
E
 
R
D
 
D
W
 
Y
S
 
-
D
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
Y
N
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
F
E
 
E
L
 
A
R
 
Q
A
 
L
V
 
A
L
 
Q
E
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
D
 
-
K
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
V
I
 
V
L
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
E
 
R
Y
 
Y
L
 
L
N
 
H
Q
 
D
A
 
L
R
 
R
A
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
L
 
Y
G
 
E
I
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
A
N
 
D
F
 
H
C
 
A
D
 
G
A
 
V
E
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
L
S
 
S
F
 
L
A
 
A
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
C
N
 
T
D
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
G
 
G
I
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
K
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
W
 
W
R
 
R
G
 
T
T
 
R
V
 
I
S
 
T
G
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
G
M
 
L
Q
 
T
S
 
A
E
 
G
L
 
L
A
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
P
 
P
N
 
A
V
 
V
A
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
K
 
D
H
 
R
A
 
P
V
 
V
S
 
D
A
 
L
D
 
A
E
 
V
A
 
A
H
 
T
A
 
P
R
 
A
A
 
A
H
 
L
D
 
D
M
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
G
 
R
K
 
N
N
 
L
I
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
T
 
C
T
 
T
P
 
P
D
 
A
Q
 
E
L
 
I
S
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M
L
 
V
R
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R

4mqpA Mycobaterium tuberculosis transaminase bioa complexed with 2- hydrazinylbenzo[d]thiazole (see paper)
49% identity, 98% coverage: 9:430/432 of query aligns to 7:424/428 of 4mqpA

query
sites
4mqpA
L
 
I
E
 
A
F
 
V
D
 
D
Q
 
G
Q
 
A
Y
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
S
N
 
S
V
 
I
A
 
G
K
 
R
P
 
E
G
 
A
P
 
V
T
 
S
F
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
A
E
 
V
S
 
A
-
 
A
E
 
H
G
 
G
V
 
A
H
 
W
I
 
L
T
 
T
L
 
L
-
 
I
D
 
R
D
 
D
G
 
G
-
 
Q
-
 
P
T
 
I
R
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
C
 
T
M
 
A
M
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
A
 
A
I
 
L
T
 
D
S
 
Q
A
 
A
I
 
L
H
 
T
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
T
 
V
L
 
M
P
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
D
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
A
D
 
R
L
 
L
G
 
A
R
 
K
K
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
S
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
I
 
V
F
 
F
Y
 
F
C
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
W
H
 
R
A
 
G
I
 
R
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
G
R
 
K
K
 
R
E
 
R
F
 
L
A
 
M
T
 
T
I
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
W
 
F
K
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
H
 
S
L
 
L
F
 
W
Q
 
T
G
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
A
V
 
A
Q
 
Q
H
 
V
F
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
V
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
-
E
 
R
D
 
D
W
 
Y
S
 
-
D
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
Y
N
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
F
E
 
E
L
 
A
R
 
Q
A
 
L
V
 
A
L
 
Q
E
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
D
 
-
K
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
V
I
 
V
L
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
x
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
E
 
R
Y
 
Y
L
 
L
N
 
H
Q
 
D
A
 
L
R
 
R
A
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
L
 
Y
G
 
E
I
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
A
N
 
D
F
 
H
C
 
A
D
 
G
A
 
V
E
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
L
S
 
S
F
 
L
A
 
A
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
C
N
 
T
D
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
G
 
G
I
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
K
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
W
 
W
R
 
R
G
 
T
T
 
R
V
 
I
S
 
T
G
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
G
M
 
L
Q
 
T
S
 
A
E
 
G
L
 
L
A
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
P
 
P
N
 
A
V
 
V
A
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
K
 
D
H
 
R
A
 
P
V
 
V
S
 
D
A
 
L
D
 
A
E
 
V
A
 
A
H
 
T
A
 
P
R
 
A
A
 
A
H
 
L
D
 
D
M
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
G
 
R
K
 
N
N
 
L
I
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
T
 
C
T
 
T
P
 
P
D
 
A
Q
 
E
L
 
I
S
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M
L
 
V
R
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R

5kgtA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with an inhibitor optimized from hts lead: 1-[4-[4-(3-chlorophenyl)carbonylpiperidin-1- yl]phenyl]ethanone (see paper)
49% identity, 98% coverage: 9:430/432 of query aligns to 7:424/429 of 5kgtA

query
sites
5kgtA
L
 
I
E
 
A
F
 
V
D
 
D
Q
 
G
Q
 
A
Y
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
S
N
 
S
V
 
I
A
 
G
K
 
R
P
 
E
G
 
A
P
 
V
T
 
S
F
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
A
E
 
V
S
 
A
-
 
A
E
 
H
G
 
G
V
 
A
H
 
W
I
 
L
T
 
T
L
 
L
-
 
I
D
 
R
D
 
D
G
 
G
-
 
Q
-
 
P
T
 
I
R
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
 
W
W
 
W
C
 
T
M
 
A
M
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
A
 
A
I
 
L
T
 
D
S
 
Q
A
 
A
I
 
L
H
 
T
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
T
 
V
L
 
M
P
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
D
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
A
D
 
R
L
 
L
G
 
A
R
 
K
K
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
S
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
I
 
V
F
 
F
Y
 
F
C
 
S
D
 
D
S
|
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
W
H
 
R
A
 
G
I
 
R
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
G
R
 
K
K
 
R
E
 
R
F
 
L
A
 
M
T
 
T
I
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
W
 
F
K
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
H
 
S
L
 
L
F
 
W
Q
 
T
G
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
A
V
 
A
Q
 
Q
H
 
V
F
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
V
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
-
E
 
R
D
 
D
W
 
Y
S
 
-
D
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
Y
N
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
F
E
 
E
L
 
A
R
 
Q
A
 
L
V
 
A
L
 
Q
E
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
D
 
-
K
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
V
I
 
V
L
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
E
 
R
Y
 
Y
L
 
L
N
 
H
Q
 
D
A
 
L
R
 
R
A
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
L
 
Y
G
 
E
I
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
A
N
 
D
F
 
H
C
 
A
D
 
G
A
 
V
E
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
L
S
 
S
F
 
L
A
 
A
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
C
N
 
T
D
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
G
 
G
I
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
|
G
P
 
P
T
|
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
K
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
W
 
W
R
 
R
G
 
T
T
 
R
V
 
I
S
 
T
G
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
G
M
 
L
Q
 
T
S
 
A
E
 
G
L
 
L
A
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
P
 
P
N
 
A
V
 
V
A
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
K
 
D
H
 
R
A
 
P
V
 
V
S
 
D
A
 
L
D
 
A
E
 
V
A
 
A
H
 
T
A
 
P
R
 
A
A
 
A
H
 
L
D
 
D
M
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
G
 
R
K
 
N
N
 
L
I
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
T
 
C
T
 
T
P
 
P
D
 
A
Q
 
E
L
 
I
S
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M
L
 
V
R
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R

5kgsA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with an inhibitor optimized from hts lead: 5-[4-(1,3-benzodioxol-5-ylcarbonyl)piperazin-1-yl]-2, 3-dihydroinden-1-one (see paper)
49% identity, 98% coverage: 9:430/432 of query aligns to 7:424/429 of 5kgsA

query
sites
5kgsA
L
 
I
E
 
A
F
 
V
D
 
D
Q
 
G
Q
 
A
Y
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
T
 
S
N
 
S
V
 
I
A
 
G
K
 
R
P
 
E
G
 
A
P
 
V
T
 
S
F
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
A
E
 
V
S
 
A
-
 
A
E
 
H
G
 
G
V
 
A
H
 
W
I
 
L
T
 
T
L
 
L
-
 
I
D
 
R
D
 
D
G
 
G
-
 
Q
-
 
P
T
 
I
R
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
C
 
T
M
 
A
M
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
A
 
A
I
 
L
T
 
D
S
 
Q
A
 
A
I
 
L
H
 
T
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
T
 
V
L
 
M
P
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
D
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
A
D
 
R
L
 
L
G
 
A
R
 
K
K
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
S
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
I
 
V
F
 
F
Y
 
F
C
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
W
H
 
R
A
 
G
I
 
R
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
G
R
 
K
K
 
R
E
 
R
F
 
L
A
 
M
T
 
T
I
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
W
 
F
K
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
|
D
P
 
P
D
 
H
T
x
G
G
|
G
M
 
M
H
 
H
H
 
S
L
 
L
F
 
W
Q
 
T
G
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
A
V
 
A
Q
 
Q
H
 
V
F
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
V
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
-
E
 
R
D
 
D
W
 
Y
S
 
-
D
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
Y
N
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
F
E
 
E
L
 
A
R
 
Q
A
 
L
V
 
A
L
 
Q
E
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
D
 
-
K
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
V
I
 
V
L
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
R
F
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
E
 
R
Y
 
Y
L
 
L
N
 
H
Q
 
D
A
 
L
R
 
R
A
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
L
 
Y
G
 
E
I
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
A
N
 
D
F
 
H
C
 
A
D
 
G
A
 
V
E
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
G
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
L
S
 
S
F
 
L
A
 
A
C
 
A
T
 
T
M
 
L
T
 
C
N
 
T
D
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
G
 
T
V
 
I
G
 
S
G
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
G
 
G
I
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
Y
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
K
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
W
 
W
R
 
R
G
 
T
T
 
R
V
 
I
S
 
T
G
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
G
M
 
L
Q
 
T
S
 
A
E
 
G
L
 
L
A
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
P
 
P
N
 
A
V
 
V
A
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
K
 
D
H
 
R
A
 
P
V
 
V
S
 
D
A
 
L
D
 
A
E
 
V
A
 
A
H
 
T
A
 
P
R
 
A
A
 
A
H
 
L
D
 
D
M
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
F
|
F
G
 
R
K
 
N
N
 
L
I
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
T
 
C
T
 
T
P
 
P
D
 
A
Q
 
E
L
 
I
S
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M
L
 
V
R
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R

Query Sequence

>GFF900 FitnessBrowser__Phaeo:GFF900
MSAADLTQLEFDQQYLWHPYTNVAKPGPTFVVKESEGVHITLDDGTRLIDAMSSWWCMMH
GHRNPAITSAIHAQLDTLPHVMFGGLTHDPAIDLGRKLLEITPESLTRIFYCDSGSVSVE
VAMKMAVQYQHAIGQPERKEFATIRSGYHGDTWKAMSVCDPDTGMHHLFQGALSVQHFVS
RPPVRIHEDWSDDPAQNGLGELRAVLEAGQDKIAAFILEPVVQGTGGMYFYHPEYLNQAR
ALCDELGILLIFDEIATGFGRTGALFATNFCDAEPDIICLGKGLTGGHISFACTMTNDRV
AEGVGGGNPGIFMHGPTYMANPLACAAAKASLDLLTGQDWRGTVSGIAEQMQSELATARE
LPNVADVRVLGAIGVIEMKHAVSADEAHARAHDMGVFLRPFGKNIYTMPPFITTPDQLSQ
ITAGMLRLAREL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory