SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF932 FitnessBrowser__WCS417:GFF932 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
50% identity, 83% coverage: 55:323/324 of query aligns to 56:327/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
K
 
R
L
 
I
G
 
D
R
 
Q
E
 
E
Q
 
V
L
 
F
Q
 
E
G
 
N
A
 
A
S
 
P
K
 
R
L
 
L
E
 
R
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
 
N
V
x
Y
S
x
A
V
|
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
Y
 
I
D
 
D
V
 
V
A
 
E
Y
 
E
F
 
A
N
 
T
E
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
Y
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
N
S
 
A
T
|
T
A
 
A
D
 
D
L
 
H
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
A
S
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
H
V
 
V
A
 
V
E
 
K
L
 
G
D
 
D
A
 
K
W
 
F
T
 
V
K
 
R
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
K
 
K
-
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
I
A
 
A
S
 
W
V
 
H
G
 
P
A
 
K
P
 
W
L
 
F
F
 
L
G
 
G
C
 
Y
D
 
E
V
 
L
H
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
M
x
F
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
A
R
 
K
L
 
-
G
 
G
F
 
F
N
 
N
M
 
M
P
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
S
 
Y
G
x
S
N
x
R
S
 
T
R
 
R
K
 
K
P
 
S
A
 
Q
L
 
A
E
 
E
Q
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
E
F
 
Y
R
 
R
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
K
E
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
V
C
 
I
L
 
L
V
x
A
V
|
V
P
|
P
L
 
L
S
 
T
D
 
K
K
 
E
T
|
T
R
 
M
H
 
Y
L
 
M
I
 
I
S
 
N
T
 
E
R
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
S
 
P
S
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
I
|
I
S
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
N
 
E
Q
 
G
T
 
W
I
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
Q
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
A
 
Y
E
 
N
S
 
E
P
 
E
L
 
L
F
 
F
Q
 
S
L
 
L
S
 
D
N
 
N
A
 
V
V
 
V
T
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
H
 
F
E
 
E
T
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
M
A
 
A
N
 
E
R
 
L
A
 
V
L
 
A
D
 
R
N
 
N
L
 
L
R
 
I
S
 
A
A
 
F
L
 
K
L
 
R
G
 
G
Q
 
E
R
 
I
P
 
P
Q
 
P
D
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
P
 
K
Q
 
E
V
 
V
W
 
I
K
 
K

Sites not aligning to the query:

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
50% identity, 83% coverage: 55:323/324 of query aligns to 55:326/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
K
 
K
L
 
I
G
 
D
R
 
R
E
 
E
Q
 
V
L
 
F
Q
 
D
G
 
A
A
 
A
S
 
P
K
 
R
L
 
L
E
 
R
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
 
N
V
 
Y
S
 
A
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
Y
 
I
D
 
D
V
 
I
A
 
E
Y
 
E
F
 
A
N
 
T
E
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
Y
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
D
S
 
A
T
|
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
F
 
W
A
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
A
S
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
H
V
 
V
A
 
V
E
 
K
L
 
G
D
 
D
A
 
K
W
 
F
T
 
V
K
 
R
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
K
 
K
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
I
A
 
A
S
 
W
V
 
H
G
 
P
A
 
K
P
 
M
L
 
F
F
 
L
G
 
G
C
 
Y
D
 
D
V
 
V
H
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
|
G
M
x
F
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
A
R
 
K
L
 
-
G
 
G
F
 
F
N
 
G
M
 
M
P
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
S
 
T
G
x
A
N
x
R
S
|
S
R
 
R
K
|
K
P
 
P
A
 
E
L
 
A
E
 
E
Q
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
E
F
 
F
R
 
K
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
R
E
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
V
C
 
V
L
 
L
V
 
A
V
|
V
P
|
P
L
 
L
S
 
T
D
 
K
K
x
E
T
|
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
M
I
 
I
S
 
N
T
 
E
R
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
R
L
 
L
M
 
M
K
 
K
S
 
P
S
 
T
A
 
A
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
I
x
V
S
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
N
 
E
Q
 
G
T
 
W
I
 
I
R
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
Q
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
A
 
Y
E
 
D
S
 
E
P
 
E
L
 
L
F
 
F
Q
 
A
L
 
L
S
 
D
N
 
N
A
 
V
V
 
V
T
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
H
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
G
M
 
M
A
 
A
N
 
E
R
 
L
A
 
V
L
 
A
D
 
K
N
 
N
L
 
L
R
 
I
S
 
A
A
 
F
L
 
K
L
 
N
G
 
G
Q
 
E
R
 
V
P
 
P
Q
 
P
D
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
P
 
R
Q
 
E
V
 
V
W
 
L
K
 
K

O58320 Glyoxylate reductase; EC 1.1.1.26 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3)
50% identity, 83% coverage: 55:323/324 of query aligns to 56:327/334 of O58320

query
sites
O58320
K
 
R
L
 
I
G
 
D
R
 
K
E
 
E
Q
 
V
L
 
F
Q
 
E
G
 
N
A
 
A
S
 
P
K
 
K
L
 
L
E
 
R
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
 
N
V
 
Y
S
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
Y
 
I
D
 
D
V
 
I
A
 
E
Y
 
E
F
 
A
N
 
T
E
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
Y
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
D
S
 
A
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
A
S
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
H
V
 
V
A
 
V
E
 
K
L
 
G
D
 
D
A
 
R
W
 
F
T
 
V
K
 
R
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
K
 
K
-
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
V
A
 
A
S
 
W
V
 
H
G
 
P
A
 
K
P
 
W
L
 
F
F
 
L
G
 
G
C
 
Y
D
 
D
V
 
V
H
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
M
x
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
A
R
 
K
L
 
-
G
 
G
F
 
F
N
 
N
M
 
M
P
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
S
 
Y
G
x
S
N
x
R
S
x
T
R
 
R
K
 
K
P
 
E
A
 
E
L
 
V
E
 
E
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
N
A
 
A
Q
 
E
F
 
F
R
 
K
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
R
E
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
V
C
 
V
L
 
L
V
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
L
S
 
T
D
 
R
K
 
E
T
 
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
L
I
 
I
S
 
N
T
 
E
R
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
S
 
K
S
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
N
 
E
Q
 
G
T
 
W
I
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
Q
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
Y
A
 
Y
E
 
N
S
 
E
P
 
E
L
 
L
F
 
F
Q
 
K
L
 
L
S
 
D
N
 
N
A
 
V
V
 
V
T
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
|
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
G
M
 
M
A
 
A
N
 
E
R
 
L
A
 
V
L
 
A
D
 
K
N
 
N
L
 
L
R
 
I
S
 
A
A
 
F
L
 
K
L
 
R
G
 
G
Q
 
E
R
 
I
P
 
P
Q
 
P
D
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
P
 
R
Q
 
E
V
 
V
W
 
I
K
 
K

2dbqA Crystal structure of glyoxylate reductase (ph0597) from pyrococcus horikoshii ot3, complexed with NADP (i41) (see paper)
50% identity, 83% coverage: 55:323/324 of query aligns to 56:327/333 of 2dbqA

query
sites
2dbqA
K
 
R
L
 
I
G
 
D
R
 
K
E
 
E
Q
 
V
L
 
F
Q
 
E
G
 
N
A
 
A
S
 
P
K
 
K
L
 
L
E
 
R
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
 
N
V
 
Y
S
 
A
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
Y
 
I
D
 
D
V
 
I
A
 
E
Y
 
E
F
 
A
N
 
T
E
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
Y
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
D
S
 
A
T
|
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
A
S
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
H
V
 
V
A
 
V
E
 
K
L
 
G
D
 
D
A
 
R
W
 
F
T
 
V
K
 
R
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
K
 
K
-
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
V
A
 
A
S
 
W
V
 
H
G
 
P
A
 
K
P
 
W
L
 
F
F
 
L
G
 
G
C
 
Y
D
 
D
V
 
V
H
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
M
x
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
A
R
 
K
L
 
-
G
 
G
F
 
F
N
 
N
M
 
M
P
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
S
 
Y
G
x
S
N
x
R
S
x
T
R
 
R
K
 
K
P
 
E
A
 
E
L
 
V
E
 
E
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
N
A
 
A
Q
 
E
F
 
F
R
 
K
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
R
E
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
V
C
 
V
L
 
L
V
x
A
V
|
V
P
|
P
L
 
L
S
 
T
D
 
R
K
 
E
T
|
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
L
I
 
I
S
 
N
T
 
E
R
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
S
 
K
S
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
N
 
E
Q
 
G
T
 
W
I
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
Q
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
A
 
Y
E
 
N
S
 
E
P
 
E
L
 
L
F
 
F
Q
 
K
L
 
L
S
 
D
N
 
N
A
 
V
V
 
V
T
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
G
M
 
M
A
 
A
N
 
E
R
 
L
A
 
V
L
 
A
D
 
K
N
 
N
L
 
L
R
 
I
S
 
A
A
 
F
L
 
K
L
 
R
G
 
G
Q
 
E
R
 
I
P
 
P
Q
 
P
D
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
P
 
R
Q
 
E
V
 
V
W
 
I
K
 
K

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
42% identity, 78% coverage: 59:311/324 of query aligns to 60:306/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
E
 
E
Q
 
L
L
 
I
Q
 
D
G
 
A
A
 
L
S
 
P
K
 
K
L
 
L
E
 
E
V
 
I
V
 
V
S
 
S
S
 
S
V
 
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
N
 
K
Y
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
I
Y
 
K
F
 
C
N
 
E
E
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
M
 
R
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
D
S
 
D
T
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
I
M
 
L
S
 
A
S
 
V
A
 
L
R
 
R
R
 
R
V
 
I
A
 
C
E
 
E
L
 
C
D
 
D
A
 
K
W
 
Y
T
 
V
K
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
A
 
-
S
 
-
V
 
F
G
 
G
A
 
D
P
 
F
L
 
K
F
 
L
G
 
T
C
 
T
D
 
K
V
 
F
H
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
M
x
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
E
R
 
R
G
 
A
R
 
E
L
 
-
G
 
A
F
 
F
N
 
D
M
 
C
P
 
P
I
 
I
L
 
S
Y
 
Y
S
 
F
G
x
S
N
x
R
S
|
S
R
 
K
K
 
K
P
 
P
A
 
N
L
 
T
E
 
N
Q
 
Y
E
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
T
Q
 
Y
F
 
Y
R
 
G
S
 
S
L
 
V
D
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
A
A
 
S
E
 
N
A
 
S
D
 
D
F
 
I
V
 
L
C
 
V
L
 
V
V
 
A
V
 
C
P
 
P
L
 
L
S
 
T
D
 
P
K
 
E
T
 
T
R
 
T
H
 
H
L
 
I
I
 
I
S
 
N
T
 
R
R
 
E
E
 
V
L
 
I
G
 
D
L
 
A
M
 
L
K
 
G
S
 
P
S
 
K
A
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
G
R
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
E
L
 
L
I
 
V
D
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
V
N
 
E
Q
 
G
T
 
R
I
 
L
R
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
Q
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
E
A
 
V
E
 
P
S
 
E
P
 
K
L
 
L
F
 
F
Q
 
G
L
 
L
S
 
E
N
 
N
A
 
V
V
 
V
T
 
L
L
 
L
P
 
P
H
 
H
I
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
G
T
 
T
H
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
E
 
K
A
 
V
M
 
M
A
 
A
N
 
D
R
 
L
A
 
V
L
 
V
D
 
G
N
 
N
L
 
L
R
 
E
S
 
A
A
 
H
L
 
F
L
 
S
G
 
G
Q
 
K

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
42% identity, 78% coverage: 59:311/324 of query aligns to 58:304/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
E
 
E
Q
 
L
L
 
I
Q
 
D
G
 
A
A
 
L
S
 
P
K
 
K
L
 
L
E
 
E
V
 
I
V
 
V
S
 
S
S
 
S
V
 
F
S
 
S
V
|
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
N
 
K
Y
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
I
Y
 
K
F
 
C
N
 
E
E
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
M
 
R
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
D
S
 
D
T
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
I
M
 
L
S
 
A
S
 
V
A
 
L
R
 
R
R
 
R
V
 
I
A
 
C
E
 
E
L
 
C
D
 
D
A
 
K
W
 
Y
T
 
V
K
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
A
 
-
S
 
-
V
 
F
G
 
G
A
 
D
P
 
F
L
 
K
F
 
L
G
 
T
C
 
T
D
 
K
V
 
F
H
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
M
x
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
E
R
 
R
G
 
A
R
 
E
L
 
-
G
 
A
F
 
F
N
 
D
M
 
C
P
 
P
I
 
I
L
 
S
Y
 
Y
S
 
F
G
x
S
N
x
R
S
|
S
R
 
K
K
 
K
P
 
P
A
 
N
L
 
T
E
 
N
Q
 
Y
E
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
T
Q
 
Y
F
 
Y
R
 
G
S
 
S
L
 
V
D
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
A
A
 
S
E
 
N
A
 
S
D
 
D
F
 
I
V
 
L
C
 
V
L
 
V
V
 
A
V
x
C
P
|
P
L
 
L
S
 
T
D
 
P
K
 
E
T
|
T
R
 
T
H
 
H
L
 
I
I
 
I
S
 
N
T
 
R
R
 
E
E
 
V
L
 
I
G
 
D
L
 
A
M
 
L
K
 
G
S
 
P
S
 
K
A
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
x
G
R
|
R
G
 
G
P
 
P
V
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
E
L
 
L
I
 
V
D
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
V
N
 
E
Q
 
G
T
 
R
I
 
L
R
 
G
G
 
G
A
|
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
Q
 
R
E
|
E
P
 
P
L
 
E
A
 
V
E
 
P
S
 
E
P
 
K
L
 
L
F
 
F
Q
 
G
L
 
L
S
 
E
N
 
N
A
 
V
V
 
V
T
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
V
G
|
G
S
 
S
A
 
G
T
 
T
H
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
E
 
K
A
 
V
M
 
M
A
 
A
N
 
D
R
 
L
A
 
V
L
 
V
D
 
G
N
 
N
L
 
L
R
 
E
S
 
A
A
 
H
L
 
F
L
 
S
G
 
G
Q
 
K

Q9UBQ7 Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase; EC 1.1.1.79; EC 1.1.1.81 from Homo sapiens (Human) (see paper)
40% identity, 82% coverage: 46:311/324 of query aligns to 52:320/328 of Q9UBQ7

query
sites
Q9UBQ7
A
 
A
H
 
H
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
C
V
 
L
-
 
L
G
 
S
R
 
D
K
 
H
L
 
V
G
 
D
R
 
K
E
 
R
Q
 
I
L
 
L
Q
 
D
G
 
A
A
 
A
-
 
G
S
 
A
K
 
N
L
 
L
E
 
K
V
 
V
V
 
I
S
 
S
S
 
T
V
 
M
S
 
S
V
|
V
G
|
G
Y
 
I
D
 
D
N
 
H
Y
 
L
D
 
A
V
 
L
A
 
D
Y
 
E
F
 
I
N
 
K
E
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
R
L
 
V
T
 
G
N
 
Y
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
D
S
 
T
T
 
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
V
A
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
T
S
 
T
A
 
C
R
 
R
R
 
R
V
 
L
A
 
P
E
 
E
L
 
A
D
 
I
A
 
E
W
 
E
T
 
V
K
 
K
A
 
N
G
 
G
Q
 
G
W
 
W
K
 
T
A
 
S
S
 
W
V
 
K
G
 
P
A
 
L
P
 
W
L
 
L
F
 
C
G
 
G
C
 
Y
D
 
G
V
 
L
H
 
T
G
 
Q
K
 
S
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
M
 
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
R
 
K
L
 
P
G
 
F
F
 
G
N
 
V
M
 
Q
P
 
R
I
 
F
L
 
L
Y
 
Y
S
 
T
G
 
G
N
x
R
S
x
Q
R
x
P
K
x
R
P
 
P
A
 
E
L
 
E
E
 
A
Q
 
A
E
 
E
L
 
F
G
 
Q
A
 
A
Q
 
E
F
 
F
R
 
V
S
 
S
L
 
T
D
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
Q
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
I
C
 
V
L
 
V
V
 
A
V
 
C
P
x
S
L
 
L
S
 
T
D
 
P
K
 
A
T
 
T
R
 
E
H
 
G
L
 
L
I
 
C
S
 
N
T
 
K
R
 
D
E
 
F
L
 
F
G
 
Q
L
 
K
M
 
M
K
 
K
S
 
E
S
 
T
A
 
A
I
 
V
L
 
F
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
R
|
R
G
 
G
P
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
P
 
D
A
 
D
L
 
L
I
 
Y
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
N
 
S
Q
 
G
T
 
K
I
 
I
R
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
T
E
 
S
Q
 
P
E
 
E
P
 
P
L
 
L
-
 
P
A
 
T
E
 
N
S
 
H
P
 
P
L
 
L
F
 
L
Q
 
T
L
 
L
S
 
K
N
 
N
A
 
C
V
 
V
T
 
I
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
|
I
G
|
G
S
|
S
A
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
R
T
 
T
R
 
R
E
 
N
A
 
T
M
 
M
A
 
S
N
 
L
R
 
L
A
 
A
L
 
A
D
 
N
N
 
N
L
 
L
R
 
L
S
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
R
G
 
G
Q
 
E

2gcgA Ternary crystal structure of human glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase (see paper)
40% identity, 82% coverage: 46:311/324 of query aligns to 48:316/324 of 2gcgA

query
sites
2gcgA
A
 
A
H
 
H
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
C
V
 
L
-
x
L
G
 
S
R
 
D
K
 
H
L
 
V
G
 
D
R
 
K
E
 
R
Q
 
I
L
 
L
Q
 
D
G
 
A
A
 
A
-
 
G
S
 
A
K
 
N
L
 
L
E
 
K
V
 
V
V
 
I
S
 
S
S
 
T
V
 
M
S
|
S
V
|
V
G
|
G
Y
 
I
D
 
D
N
 
H
Y
 
L
D
 
A
V
 
L
A
 
D
Y
 
E
F
 
I
N
 
K
E
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
R
L
 
V
T
 
G
N
 
Y
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
D
S
 
T
T
|
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
V
A
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
T
S
 
T
A
 
C
R
 
R
R
 
R
V
 
L
A
 
P
E
 
E
L
 
A
D
 
I
A
 
E
W
 
E
T
 
V
K
 
K
A
 
N
G
 
G
Q
 
G
W
 
W
K
 
T
A
 
S
S
 
W
V
 
K
G
 
P
A
 
L
P
 
W
L
 
L
F
 
C
G
 
G
C
 
Y
D
 
G
V
 
L
H
 
T
G
 
Q
K
 
S
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
M
 
L
G
|
G
N
 
R
I
|
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
R
 
K
L
 
P
G
 
F
F
 
G
N
 
V
M
 
Q
P
 
R
I
 
F
L
 
L
Y
 
Y
S
 
T
G
|
G
N
x
R
S
 
Q
R
 
P
K
x
R
P
 
P
A
 
E
L
 
E
E
 
A
Q
 
A
E
 
E
L
 
F
G
 
Q
A
 
A
Q
 
E
F
 
F
R
 
V
S
 
S
L
 
T
D
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
Q
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
I
C
 
V
L
 
V
V
 
A
V
x
C
P
x
S
L
 
L
S
 
T
D
 
P
K
 
A
T
|
T
R
 
E
H
 
G
L
 
L
I
 
C
S
 
N
T
 
K
R
 
D
E
 
F
L
 
F
G
 
Q
L
 
K
M
 
M
K
 
K
S
 
E
S
 
T
A
 
A
I
 
V
L
 
F
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
R
|
R
G
 
G
P
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
P
 
D
A
 
D
L
 
L
I
 
Y
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
N
 
S
Q
 
G
T
 
K
I
 
I
R
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
T
E
 
S
Q
 
P
E
|
E
P
 
P
L
 
L
-
 
P
A
 
T
E
 
N
S
 
H
P
 
P
L
 
L
F
 
L
Q
 
T
L
 
L
S
 
K
N
 
N
A
 
C
V
 
V
T
 
I
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
R
T
 
T
R
 
R
E
 
N
A
 
T
M
 
M
A
 
S
N
 
L
R
 
L
A
 
A
L
 
A
D
 
N
N
 
N
L
 
L
R
 
L
S
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
R
G
 
G
Q
 
E

5v6qB Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and malonate (see paper)
36% identity, 94% coverage: 2:306/324 of query aligns to 3:299/319 of 5v6qB

query
sites
5v6qB
K
 
R
K
 
P
T
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
V
F
 
P
S
 
G
R
 
K
V
 
I
T
 
N
P
 
P
E
 
R
M
 
V
I
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
Q
 
P
Q
 
E
D
 
M
F
 
F
E
 
E
V
 
T
I
 
V
A
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
-
K
 
R
L
 
I
G
 
E
D
 
R
I
 
A
S
 
D
A
 
A
Q
 
A
F
 
L
N
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
D
P
 
M
H
 
R
A
 
D
H
 
V
G
 
S
L
 
G
I
 
I
G
 
A
V
 
V
G
 
S
R
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
P
R
 
V
E
 
P
Q
 
L
L
 
M
Q
 
D
G
 
A
A
 
F
S
 
P
K
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
 
N
V
 
F
S
 
G
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
N
 
G
Y
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
S
Y
 
R
F
 
A
N
 
A
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
V
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
E
S
 
E
T
x
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
N
S
 
T
A
 
L
R
 
R
R
 
L
V
 
L
A
 
P
E
 
Q
L
 
A
D
 
E
A
 
Q
W
 
W
T
 
L
K
 
R
A
 
Q
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
K
 
V
A
 
R
S
 
E
V
 
G
G
 
A
A
 
F
P
 
P
L
 
L
F
 
S
G
 
P
C
 
L
D
 
S
V
 
L
H
 
R
G
 
G
K
 
R
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
V
x
F
G
 
G
M
x
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
R
 
E
L
 
-
G
 
A
F
 
F
N
 
G
M
 
V
P
 
S
I
 
I
L
 
A
Y
 
Y
S
 
-
G
 
-
N
 
H
S
x
T
R
|
R
K
 
T
P
 
P
A
 
-
L
 
-
E
 
R
Q
 
E
E
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
F
Q
 
T
F
 
Y
R
 
H
S
 
P
L
 
T
D
 
L
E
 
V
L
 
G
L
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
A
-
 
V
D
 
D
F
 
T
V
 
L
C
 
I
L
 
V
V
 
I
V
|
V
P
|
P
L
 
G
S
 
T
D
 
A
K
x
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
S
 
N
T
 
A
R
 
D
E
 
V
L
 
L
G
 
S
L
 
A
M
 
L
K
 
G
S
 
P
S
 
K
A
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
x
V
S
x
G
R
|
R
G
 
G
P
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
Q
 
G
T
 
T
I
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
Q
 
N
E
|
E
P
 
P
L
 
N
A
 
V
E
 
P
S
 
E
P
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
S
L
 
F
S
 
P
N
 
N
A
 
V
V
 
S
T
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
V
G
x
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
N
 
D
R
 
L
A
 
V
L
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
K
S
 
A

5v7gA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
36% identity, 94% coverage: 2:306/324 of query aligns to 1:297/317 of 5v7gA

query
sites
5v7gA
K
 
R
K
 
P
T
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
V
F
 
P
S
 
G
R
 
K
V
 
I
T
 
N
P
 
P
E
 
R
M
 
V
I
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
Q
 
P
Q
 
E
D
 
M
F
 
F
E
 
E
V
 
T
I
 
V
A
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
-
K
 
R
L
 
I
G
 
E
D
 
R
I
 
A
S
 
D
A
 
A
Q
 
A
F
 
L
N
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
D
P
 
M
H
 
R
A
 
D
H
 
V
G
 
S
L
 
G
I
 
I
G
 
A
V
 
V
G
 
S
R
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
P
R
 
V
E
 
P
Q
 
L
L
 
M
Q
 
D
G
 
A
A
 
F
S
 
P
K
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
 
N
V
 
F
S
x
G
V
|
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
N
 
G
Y
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
S
Y
 
R
F
 
A
N
 
A
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
V
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
E
S
 
E
T
x
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
N
S
 
T
A
 
L
R
 
R
R
 
L
V
 
L
A
 
P
E
 
Q
L
 
A
D
 
E
A
 
Q
W
 
W
T
 
L
K
 
R
A
 
Q
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
K
 
V
A
 
R
S
 
E
V
 
G
G
 
A
A
 
F
P
 
P
L
 
L
F
 
S
G
 
P
C
 
L
D
 
S
V
 
L
H
 
R
G
 
G
K
 
R
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
V
x
F
G
 
G
M
x
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
R
 
E
L
 
-
G
 
A
F
 
F
N
 
G
M
 
V
P
 
S
I
 
I
L
 
A
Y
 
Y
S
 
-
G
 
-
N
 
H
S
x
T
R
|
R
K
 
T
P
 
P
A
 
-
L
 
-
E
 
R
Q
 
E
E
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
F
Q
 
T
F
 
Y
R
 
H
S
 
P
L
 
T
D
 
L
E
 
V
L
 
G
L
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
A
-
 
V
D
 
D
F
 
T
V
 
L
C
 
I
L
 
V
V
 
I
V
|
V
P
|
P
L
 
G
S
 
T
D
 
A
K
x
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
S
 
N
T
 
A
R
 
D
E
 
V
L
 
L
G
 
S
L
 
A
M
 
L
K
 
G
S
 
P
S
 
K
A
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
x
V
S
x
G
R
|
R
G
 
G
P
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
Q
 
G
T
 
T
I
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
Q
 
N
E
|
E
P
 
P
L
 
N
A
 
V
E
 
P
S
 
E
P
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
S
L
 
F
S
 
P
N
 
N
A
 
V
V
 
S
T
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
V
G
x
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
N
 
D
R
 
L
A
 
V
L
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
K
S
 
A

5v7nA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and 2-keto-d-gluconic acid (see paper)
36% identity, 94% coverage: 2:306/324 of query aligns to 2:298/319 of 5v7nA

query
sites
5v7nA
K
 
R
K
 
P
T
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
V
F
 
P
S
 
G
R
 
K
V
 
I
T
 
N
P
 
P
E
 
R
M
 
V
I
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
Q
 
P
Q
 
E
D
 
M
F
 
F
E
 
E
V
 
T
I
 
V
A
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
-
K
 
R
L
 
I
G
 
E
D
 
R
I
 
A
S
 
D
A
 
A
Q
 
A
F
 
L
N
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
D
P
 
M
H
 
R
A
 
D
H
 
V
G
 
S
L
 
G
I
 
I
G
 
A
V
 
V
G
 
S
R
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
P
R
 
V
E
 
P
Q
 
L
L
 
M
Q
 
D
G
 
A
A
 
F
S
 
P
K
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
 
N
V
 
F
S
x
G
V
|
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
N
 
G
Y
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
S
Y
 
R
F
 
A
N
 
A
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
V
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
E
S
 
E
T
x
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
N
S
 
T
A
 
L
R
 
R
R
 
L
V
 
L
A
 
P
E
 
Q
L
 
A
D
 
E
A
 
Q
W
 
W
T
 
L
K
 
R
A
 
Q
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
K
 
V
A
 
R
S
 
E
V
 
G
G
 
A
A
 
F
P
 
P
L
 
L
F
 
S
G
 
P
C
 
L
D
 
S
V
 
L
H
 
R
G
 
G
K
 
R
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
V
 
F
G
 
G
M
x
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
R
 
E
L
 
-
G
 
A
F
 
F
N
 
G
M
 
V
P
 
S
I
 
I
L
 
A
Y
 
Y
S
 
-
G
 
-
N
 
H
S
x
T
R
|
R
K
 
T
P
 
P
A
 
-
L
 
-
E
 
R
Q
 
E
E
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
F
Q
 
T
F
 
Y
R
 
H
S
 
P
L
 
T
D
 
L
E
 
V
L
 
G
L
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
A
-
 
V
D
 
D
F
 
T
V
 
L
C
 
I
L
 
V
V
 
I
V
|
V
P
|
P
L
 
G
S
 
T
D
 
A
K
x
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
S
 
N
T
 
A
R
 
D
E
 
V
L
 
L
G
 
S
L
 
A
M
 
L
K
 
G
S
 
P
S
 
K
A
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
x
V
S
x
G
R
|
R
G
 
G
P
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
Q
 
G
T
 
T
I
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
Q
 
N
E
|
E
P
 
P
L
 
N
A
 
V
E
 
P
S
 
E
P
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
S
L
 
F
S
 
P
N
 
N
A
 
V
V
 
S
T
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
V
G
x
A
S
|
S
A
 
A
T
 
S
H
 
V
E
 
V
T
 
T
R
|
R
E
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
N
 
D
R
 
L
A
 
V
L
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
K
S
 
A

5j23A Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with 2'-phospho-adp-ribose (see paper)
36% identity, 94% coverage: 2:306/324 of query aligns to 1:297/318 of 5j23A

query
sites
5j23A
K
 
R
K
 
P
T
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
V
F
 
P
S
 
G
R
 
K
V
 
I
T
 
N
P
 
P
E
 
R
M
 
V
I
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
Q
 
P
Q
 
E
D
 
M
F
 
F
E
 
E
V
 
T
I
 
V
A
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
-
K
 
R
L
 
I
G
 
E
D
 
R
I
 
A
S
 
D
A
 
A
Q
 
A
F
 
L
N
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
D
P
 
M
H
 
R
A
 
D
H
 
V
G
 
S
L
 
G
I
 
I
G
 
A
V
 
V
G
 
S
R
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
P
R
 
V
E
 
P
Q
 
L
L
 
M
Q
 
D
G
 
A
A
 
F
S
 
P
K
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
 
N
V
 
F
S
 
G
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
N
 
G
Y
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
S
Y
 
R
F
 
A
N
 
A
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
V
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
E
S
 
E
T
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
N
S
 
T
A
 
L
R
 
R
R
 
L
V
 
L
A
 
P
E
 
Q
L
 
A
D
 
E
A
 
Q
W
 
W
T
 
L
K
 
R
A
 
Q
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
K
 
V
A
 
R
S
 
E
V
 
G
G
 
A
A
 
F
P
 
P
L
 
L
F
 
S
G
 
P
C
 
L
D
 
S
V
 
L
H
 
R
G
 
G
K
 
R
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
V
 
F
G
 
G
M
x
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
R
 
E
L
 
-
G
 
A
F
 
F
N
 
G
M
 
V
P
 
S
I
 
I
L
 
A
Y
 
Y
S
 
-
G
 
-
N
 
H
S
x
T
R
|
R
K
 
T
P
 
P
A
 
-
L
 
-
E
 
R
Q
 
E
E
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
F
Q
 
T
F
 
Y
R
 
H
S
 
P
L
 
T
D
 
L
E
 
V
L
 
G
L
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
A
-
 
V
D
 
D
F
 
T
V
 
L
C
 
I
L
 
V
V
 
I
V
 
V
P
|
P
L
 
G
S
 
T
D
 
A
K
x
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
S
 
N
T
 
A
R
 
D
E
 
V
L
 
L
G
 
S
L
 
A
M
 
L
K
 
G
S
 
P
S
 
K
A
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
 
V
S
 
G
R
|
R
G
 
G
P
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
Q
 
G
T
 
T
I
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
Q
 
N
E
|
E
P
 
P
L
 
N
A
 
V
E
 
P
S
 
E
P
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
S
L
 
F
S
 
P
N
 
N
A
 
V
V
 
S
T
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
V
G
 
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
N
 
D
R
 
L
A
 
V
L
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
K
S
 
A

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
37% identity, 85% coverage: 42:318/324 of query aligns to 38:311/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
A
 
A
L
 
V
P
 
P
H
 
E
A
 
A
H
 
D
G
 
A
L
 
L
-
 
L
I
 
V
G
 
R
V
 
S
G
 
A
R
 
T
K
 
T
L
 
V
G
 
D
R
 
A
E
 
E
Q
 
V
L
 
L
Q
 
A
G
 
A
A
 
A
S
 
P
K
 
K
L
 
L
E
 
K
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
 
R
V
 
A
S
 
G
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
D
Y
 
A
F
 
A
N
 
T
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
M
 
L
L
 
V
T
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
D
 
T
V
 
S
L
x
N
T
 
I
E
 
H
S
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
L
 
H
A
 
A
F
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
A
S
 
A
A
 
S
R
 
R
R
 
Q
V
 
I
A
 
P
E
 
A
L
 
A
D
 
D
A
 
A
W
 
S
T
 
L
K
 
R
A
 
E
G
 
H
Q
 
T
W
 
W
K
 
K
A
 
R
S
 
S
V
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
S
L
 
F
F
 
S
G
 
G
C
 
T
D
 
E
V
 
I
H
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
L
V
 
V
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
G
 
-
R
 
I
L
 
A
G
 
A
F
 
F
N
 
G
M
 
A
P
 
Y
I
 
V
L
 
V
Y
 
A
S
 
Y
G
 
D
N
 
P
S
 
Y
R
 
V
K
 
S
P
 
P
A
 
A
L
 
R
E
 
A
Q
 
A
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
I
Q
 
E
F
 
L
R
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
C
 
S
L
 
V
V
 
H
V
 
L
P
 
P
L
 
K
S
 
T
D
 
P
K
 
E
T
 
T
R
 
A
H
 
G
L
 
L
I
 
I
S
 
D
T
 
K
R
 
E
E
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
K
M
 
T
K
 
K
S
 
P
S
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
A
S
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
Q
 
T
N
 
G
Q
 
G
T
 
H
I
 
V
R
 
R
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
A
Q
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
C
A
 
T
E
 
D
S
 
S
P
 
P
L
 
L
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
S
 
A
N
 
Q
A
 
V
V
 
V
T
 
V
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
A
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
E
 
D
A
 
R
M
 
A
A
 
G
N
 
T
R
 
D
A
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
S
L
 
V
R
 
R
S
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
G
Q
 
E
R
 
F
P
 
V
Q
 
P
D
 
D
L
 
A
V
 
V
N
 
N

Sites not aligning to the query:

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
37% identity, 85% coverage: 42:318/324 of query aligns to 39:312/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
A
 
A
L
 
V
P
 
P
H
 
E
A
 
A
H
 
D
G
 
A
L
 
L
-
 
L
I
 
V
G
 
R
V
 
S
G
 
A
R
 
T
K
 
T
L
 
V
G
 
D
R
 
A
E
 
E
Q
 
V
L
 
L
Q
 
A
G
 
A
A
 
A
S
 
P
K
 
K
L
 
L
E
 
K
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
x
R
V
 
A
S
 
G
V
|
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
D
Y
 
A
F
 
A
N
 
T
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
M
 
L
L
 
V
T
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
D
 
T
V
 
S
L
x
N
T
 
I
E
 
H
S
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
L
 
H
A
 
A
F
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
A
S
 
A
A
 
S
R
 
R
R
 
Q
V
 
I
A
 
P
E
 
A
L
 
A
D
 
D
A
 
A
W
 
S
T
 
L
K
 
R
A
 
E
G
 
H
Q
 
T
W
 
W
K
 
K
A
 
R
S
 
S
V
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
S
L
 
F
F
 
S
G
 
G
C
 
T
D
 
E
V
 
I
H
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
L
V
 
V
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
G
 
-
R
 
I
L
 
A
G
 
A
F
 
F
N
 
G
M
 
A
P
 
Y
I
 
V
L
 
V
Y
 
A
S
 
Y
G
 
D
N
 
P
S
 
Y
R
 
V
K
 
S
P
 
P
A
 
A
L
 
R
E
 
A
Q
 
A
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
I
Q
 
E
F
 
L
R
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
C
 
S
L
 
V
V
 
H
V
 
L
P
 
P
L
 
K
S
 
T
D
 
P
K
 
E
T
 
T
R
 
A
H
 
G
L
 
L
I
 
I
S
 
D
T
 
K
R
 
E
E
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
K
M
 
T
K
 
K
S
 
P
S
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
A
S
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
Q
 
T
N
 
G
Q
 
G
T
 
H
I
 
V
R
 
R
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
A
Q
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
C
A
 
T
E
 
D
S
 
S
P
 
P
L
 
L
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
S
 
A
N
 
Q
A
 
V
V
 
V
T
 
V
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
 
G
S
x
A
A
 
S
T
 
T
H
 
A
E
 
E
T
 
A
R
x
Q
E
 
D
A
 
R
M
 
A
A
 
G
N
 
T
R
 
D
A
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
S
L
 
V
R
 
R
S
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
G
Q
 
E
R
 
F
P
 
V
Q
 
P
D
 
D
L
 
A
V
 
V
N
 
N

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
42% identity, 74% coverage: 55:294/324 of query aligns to 52:288/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
K
 
K
L
 
V
G
 
T
R
 
R
E
 
R
Q
 
V
L
 
I
Q
 
E
G
 
S
A
 
A
S
 
P
K
 
K
L
 
L
E
 
K
V
 
V
V
 
I
S
 
A
S
 
R
V
 
A
S
 
G
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
N
 
N
Y
 
I
D
 
D
V
 
V
A
 
E
Y
 
A
F
 
A
N
 
K
E
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
M
 
E
L
 
V
T
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
D
 
A
V
 
A
L
x
S
T
 
S
E
 
R
S
 
S
T
x
V
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
M
M
 
F
S
 
S
S
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
K
V
 
I
A
 
A
E
 
F
L
 
A
D
 
D
A
 
R
W
 
K
T
 
M
K
 
R
A
 
E
G
 
G
Q
 
V
W
 
W
K
 
A
A
 
K
S
 
K
V
 
E
G
 
A
A
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
M
G
 
G
C
 
I
D
 
E
V
 
L
H
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
M
x
F
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
Y
A
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
K
R
 
I
G
 
A
R
 
N
-
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
M
N
 
N
M
 
I
P
 
L
I
 
L
L
x
Y
-
x
D
-
x
P
Y
 
Y
S
 
P
G
 
N
N
 
E
S
 
E
R
 
R
K
 
A
P
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
Q
 
K
E
 
E
L
 
V
G
 
N
A
 
G
Q
 
K
F
 
F
R
 
V
S
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
K
E
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
V
V
 
V
C
 
T
L
 
I
V
 
H
V
|
V
P
|
P
L
 
L
S
 
V
D
 
E
K
 
S
T
|
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
L
I
 
I
S
 
N
T
 
E
R
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
S
 
K
S
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
x
T
S
|
S
R
|
R
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
N
 
E
Q
 
G
T
 
W
I
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
Q
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
L
-
 
P
A
 
K
E
 
D
S
 
H
P
 
P
L
 
L
F
 
T
Q
 
K
L
 
F
S
 
D
N
 
N
A
 
V
V
 
V
T
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
A
A