SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF990 FitnessBrowser__WCS417:GFF990 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 8 hits to proteins with known functional sites (download)

5ti1H Crystal structure of fumarylacetoacetate hydrolase from burkholderia xenovorans lb400
51% identity, 98% coverage: 8:427/428 of query aligns to 14:428/430 of 5ti1H

query
sites
5ti1H
R
 
K
S
 
S
W
 
W
V
 
V
A
 
E
S
 
S
A
 
A
N
 
N
G
 
N
H
 
P
T
 
T
-
 
G
D
 
D
F
 
F
P
 
S
L
 
I
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
P
 
P
L
 
F
G
 
G
V
 
I
F
 
F
S
 
S
I
 
D
N
 
G
G
 
L
S
 
N
A
 
A
P
 
T
R
 
R
-
 
R
A
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
G
D
 
D
S
 
S
I
 
I
L
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
-
A
 
A
A
 
A
I
 
L
D
 
E
E
 
S
F
 
A
D
 
G
G
 
L
E
 
L
A
 
S
R
 
V
R
 
P
A
 
S
I
 
D
E
 
S
A
 
V
T
 
F
A
 
V
G
 
R
G
 
D
Q
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
D
F
 
F
F
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
D
P
 
A
R
 
W
V
 
R
A
 
S
L
 
V
R
 
R
E
 
V
R
 
Q
L
 
L
L
 
S
E
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
S
E
 
R
G
 
D
S
 
D
T
 
A
L
 
T
H
 
L
T
 
R
R
 
D
E
 
D
A
 
A
Q
 
E
V
 
L
-
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
A
L
 
L
H
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
A
D
 
D
C
 
A
Q
 
Q
M
 
L
H
 
H
V
 
L
P
 
P
A
 
V
Q
 
Q
I
 
I
N
 
P
D
 
G
Y
 
Y
T
 
T
D
|
D
F
 
F
Y
 
Y
V
 
S
G
 
S
I
 
K
E
 
E
H
|
H
A
 
A
Q
 
T
N
 
N
V
 
V
G
 
G
K
 
S
L
 
M
F
 
F
R
 
R
-
 
D
P
 
P
D
 
K
N
 
N
P
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
N
Y
 
W
K
 
S
Y
 
E
V
 
M
P
 
P
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
H
 
N
G
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
S
T
 
S
I
 
V
R
 
V
T
 
V
S
 
S
G
 
G
T
 
T
D
 
P
V
 
V
R
 
R
R
 
R
P
 
P
K
 
N
G
 
G
Q
 
Q
T
 
L
L
 
K
P
 
L
A
 
P
G
 
D
Q
 
Q
S
 
E
E
 
R
P
 
P
T
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
A
C
 
C
A
 
R
R
 
K
L
 
L
D
 
D
Y
 
I
E
|
E
L
 
L
E
|
E
L
 
T
G
 
G
I
 
F
W
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
G
 
G
N
 
N
E
 
A
M
 
L
G
 
G
D
 
E
S
 
P
I
 
V
A
 
T
I
 
C
G
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
E
D
 
A
H
 
H
I
 
I
A
 
F
G
 
G
F
 
M
C
 
V
L
 
L
L
 
L
N
 
N
D
|
D
W
 
W
S
 
S
A
 
A
R
|
R
D
 
D
I
 
I
Q
|
Q
A
 
Q
W
 
W
E
 
E
Y
 
Y
Q
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
F
L
 
N
S
 
A
K
|
K
S
 
T
F
 
F
I
 
A
T
|
T
T
 
T
I
 
I
S
 
S
P
 
P
W
 
W
V
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
P
 
P
F
 
F
R
 
R
K
 
V
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
R
 
Q
P
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
S
 
A
Y
 
Y
L
 
L
L
 
-
D
 
-
K
 
-
R
 
R
D
 
H
Q
 
D
A
 
G
A
 
E
G
 
H
A
 
A
L
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
T
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
T
L
 
L
T
 
R
T
 
P
A
 
Q
A
 
Q
M
 
A
R
 
K
E
 
E
Q
 
-
N
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
A
H
 
S
R
 
T
L
 
I
A
 
T
L
 
R
S
 
T
N
 
N
S
 
F
L
 
K
H
 
H
M
 
M
Y
 
Y
W
 
W
T
 
T
V
 
M
A
 
A
Q
 
Q
L
 
Q
V
 
L
A
 
A
H
 
H
H
 
H
S
 
T
V
 
V
N
 
S
G
 
G
C
 
C
Q
 
N
L
 
T
Q
 
R
A
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
F
 
M
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
L
 
I
S
 
S
G
 
G
P
 
P
Q
 
T
A
 
E
G
 
D
Q
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
|
E
M
 
L
T
 
T
E
 
W
G
 
N
G
 
G
K
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
L
E
 
E
L
 
L
P
 
R
S
 
E
G
 
G
E
 
G
V
 
T
R
 
R
K
 
S
F
 
F
L
 
I
E
 
E
D
 
D
G
 
G
D
 
D
E
 
E
I
 
L
I
 
T
L
 
L
R
 
A
A
 
G
R
 
W
C
 
C
N
 
Q
R
 
G
E
 
E
G
 
G
F
 
Y
A
 
-
S
 
R
I
 
V
G
 
G
F
 
F
G
 
G
E
 
V
C
 
C
R
 
A
G
 
G
T
 
E
V
 
I
I
 
L
A
 
P
A
 
A

P16930 Fumarylacetoacetase; FAA; Beta-diketonase; Fumarylacetoacetate hydrolase; EC 3.7.1.2 from Homo sapiens (Human) (see 14 papers)
47% identity, 96% coverage: 18:427/428 of query aligns to 10:415/419 of P16930

query
sites
P16930
T
 
S
D
 
D
F
 
F
P
 
P
L
 
I
Q
 
H
N
|
N
L
 
L
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
S
I
 
T
N
 
R
G
 
G
S
 
D
A
 
P
-
 
R
P
 
P
R
 
R
A
 
I
G
 
G
V
 
V
A
|
A
I
 
I
G
 
G
D
 
D
S
 
Q
I
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
S
A
 
I
A
 
I
I
 
K
D
 
H
E
 
L
F
 
F
D
 
T
G
 
G
E
 
P
A
 
V
-
 
L
R
 
S
R
 
K
A
 
H
I
 
Q
E
 
D
A
 
V
T
x
F
A
 
N
G
 
Q
G
 
P
Q
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
S
F
 
F
F
 
M
A
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
Q
G
 
A
P
 
A
R
 
W
V
 
K
A
 
E
L
 
A
R
 
R
E
 
V
R
 
F
L
 
L
L
 
Q
E
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
S
E
 
V
G
 
-
S
 
S
T
 
Q
L
 
A
H
 
R
T
 
L
R
 
R
E
 
D
A
 
D
Q
 
T
V
 
E
L
 
L
H
 
R
R
 
K
A
 
C
A
 
A
-
 
F
-
 
I
-
 
S
-
 
Q
-
 
A
D
 
S
C
 
A
Q
 
T
M
 
M
H
 
H
V
 
L
P
 
P
A
 
A
Q
 
T
I
 
I
N
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
V
 
S
G
 
S
I
 
R
E
 
Q
H
 
H
A
|
A
Q
 
T
N
 
N
V
 
V
G
 
G
K
 
I
L
 
M
F
 
F
R
 
R
-
 
D
P
 
K
D
 
E
N
 
N
P
 
A
L
 
L
L
 
M
P
 
P
N
 
N
Y
 
W
K
 
L
Y
 
H
V
 
L
P
 
P
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
S
T
 
S
I
 
V
R
 
V
T
 
V
S
 
S
G
 
G
T
 
T
D
 
P
V
 
I
R
 
R
R
 
R
P
 
P
K
 
M
G
 
G
Q
 
Q
T
 
M
L
 
K
P
 
P
A
 
D
G
 
D
Q
 
S
S
 
K
E
 
P
P
 
P
T
 
V
F
 
Y
G
 
G
P
 
A
C
|
C
A
 
K
R
 
L
L
 
L
D
 
D
Y
 
M
E
 
E
L
 
L
E
 
E
L
 
M
G
 
A
I
 
F
W
 
F
I
 
V
G
 
G
Q
 
P
G
 
G
N
 
N
E
 
R
M
 
L
G
 
G
D
 
E
S
 
P
I
 
I
A
 
P
I
 
I
G
 
S
D
 
K
A
 
A
A
 
H
D
 
E
H
 
H
I
 
I
A
 
F
G
 
G
F
 
M
C
 
V
L
 
L
L
 
M
N
 
N
D
|
D
W
|
W
S
 
S
A
 
A
R
 
R
D
 
D
I
 
I
Q
 
Q
A
 
K
W
 
W
E
 
E
Y
 
Y
Q
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
F
L
 
L
S
 
G
K
 
K
S
 
S
F
 
F
I
 
G
T
 
T
T
 
T
I
 
V
S
 
S
P
 
P
W
 
W
V
 
V
V
 
V
T
 
P
A
 
M
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
M
P
 
P
F
 
F
R
 
A
K
 
V
A
 
P
Q
 
N
P
 
P
A
 
K
R
x
Q
P
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
D
P
 
P
Q
 
R
P
 
P
L
 
L
S
 
P
Y
 
Y
L
 
L
L
 
C
D
 
H
K
 
D
R
 
E
D
 
P
Q
 
Y
A
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
T
L
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
N
L
 
L
E
 
S
V
 
V
L
 
N
L
 
L
T
 
K
T
 
G
A
 
E
A
 
G
M
 
M
R
 
S
E
 
Q
Q
 
-
N
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
A
H
 
A
R
 
T
L
 
I
A
 
C
L
 
K
S
 
S
N
 
N
S
 
F
L
 
K
H
 
Y
M
 
M
Y
 
Y
W
 
W
T
 
T
V
 
M
A
 
L
Q
 
Q
L
 
Q
V
 
L
A
 
T
H
 
H
H
 
H
S
 
S
V
 
V
N
 
N
G
 
G
C
 
C
Q
 
N
L
 
L
Q
x
R
A
x
P
G
 
G
D
 
D
L
 
L
F
 
L
G
 
A
S
 
S
G
 
G
T
 
T
L
 
I
S
 
S
G
 
G
P
 
P
Q
 
E
A
 
P
G
 
E
Q
 
N
F
 
F
G
 
G
S
 
S
L
 
M
L
 
L
E
 
E
M
 
L
T
 
S
E
 
W
G
 
K
G
 
G
K
 
T
K
 
K
P
 
P
V
 
I
E
 
D
L
 
L
P
 
G
S
 
N
G
 
G
E
 
Q
V
 
T
R
|
R
K
 
K
F
 
F
L
 
L
E
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
E
 
E
I
 
V
I
 
I
L
 
I
R
 
T
A
 
G
R
 
Y
C
 
C
N
 
Q
R
 
G
E
 
D
G
 
G
F
 
Y
A
 
-
S
 
R
I
 
I
G
 
G
F
|
F
G
 
G
E
 
Q
C
 
C
R
 
A
G
 
G
T
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P35505 Fumarylacetoacetase; FAA; Beta-diketonase; Fumarylacetoacetate hydrolase; EC 3.7.1.2 from Mus musculus (Mouse) (see 3 papers)
46% identity, 96% coverage: 18:427/428 of query aligns to 10:415/419 of P35505

query
sites
P35505
T
 
S
D
 
D
F
 
F
P
 
P
L
 
I
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
S
I
 
T
N
 
Q
G
 
S
S
 
N
-
 
P
A
 
K
P
 
P
R
 
R
A
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
G
D
 
D
S
 
Q
I
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
S
A
 
V
A
 
I
I
 
K
D
 
H
E
 
L
F
 
F
D
 
T
G
 
G
E
 
P
A
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
K
-
 
H
R
 
Q
R
 
H
A
 
V
I
 
F
E
 
D
A
 
E
T
 
T
A
 
T
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
L
N
 
N
A
 
N
F
 
F
F
 
M
A
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
Q
G
 
A
P
 
A
R
 
W
V
 
K
A
 
E
L
 
A
R
 
R
E
 
A
R
 
S
L
 
L
L
 
Q
E
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
S
E
 
A
G
 
S
S
 
Q
T
 
A
L
 
R
H
 
L
T
 
R
R
 
D
E
 
D
A
 
K
Q
 
E
V
 
L
L
 
R
H
 
Q
R
 
R
A
 
A
-
 
F
-
 
T
-
 
S
-
 
Q
A
 
A
D
 
S
C
 
A
Q
 
T
M
 
M
H
 
H
V
 
L
P
 
P
A
 
A
Q
 
T
I
 
I
N
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
D
|
D
F
 
F
Y
 
Y
V
 
S
G
 
S
I
 
R
E
 
Q
H
 
H
A
 
A
Q
 
T
N
 
N
V
 
V
G
 
G
K
 
I
L
 
M
F
 
F
R
 
R
-
 
G
P
 
K
D
 
E
N
 
N
P
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
N
Y
 
W
K
 
L
Y
 
H
V
 
L
P
 
P
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
S
T
 
S
I
 
I
R
 
V
T
 
V
S
 
S
G
 
G
T
 
T
D
 
P
V
 
I
R
 
R
R
 
R
P
 
P
K
 
M
G
 
G
Q
 
Q
T
 
M
L
 
R
P
 
P
A
 
D
G
 
N
Q
 
S
S
 
K
E
 
P
P
 
P
T
 
V
F
 
Y
G
 
G
P
 
A
C
 
C
A
 
R
R
 
L
L
 
L
D
 
D
Y
 
M
E
|
E
L
 
L
E
|
E
L
 
M
G
 
A
I
 
F
W
 
F
I
 
V
G
 
G
Q
 
P
G
 
G
N
 
N
E
 
R
M
 
F
G
 
G
D
 
E
S
 
P
I
 
I
A
 
P
I
 
I
G
 
S
D
 
K
A
 
A
A
 
H
D
 
E
H
 
H
I
 
I
A
 
F
G
 
G
F
 
M
C
 
V
L
 
L
L
 
M
N
 
N
D
|
D
W
 
W
S
 
S
A
 
A
R
 
R
D
 
D
I
 
I
Q
 
Q
A
 
Q
W
 
W
E
 
E
Y
 
Y
Q
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
F
L
 
L
S
 
G
K
|
K
S
 
S
F
 
F
I
 
G
T
|
T
T
 
T
I
 
I
S
 
S
P
 
P
W
 
W
V
 
V
V
 
V
T
 
P
A
 
M
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
M
P
 
P
F
 
F
R
 
V
K
 
V
A
 
P
Q
 
N
P
 
P
A
 
K
R
 
Q
P
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
D
P
 
P
Q
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
P
Y
 
Y
L
 
L
L
 
C
D
 
H
K
 
S
R
 
Q
D
 
P
Q
 
Y
A
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
T
L
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
N
L
 
L
E
 
S
V
 
V
L
 
S
L
 
L
T
 
K
T
 
G
A
 
E
A
 
G
M
 
M
R
 
S
E
 
Q
Q
 
-
N
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
A
H
 
A
R
 
T
L
 
I
A
 
C
L
 
R
S
 
S
N
 
N
S
 
F
L
 
K
H
 
H
M
 
M
Y
 
Y
W
 
W
T
 
T
V
 
M
A
 
L
Q
 
Q
L
 
Q
V
 
L
A
 
T
H
 
H
H
 
H
S
 
S
V
 
V
N
 
N
G
 
G
C
 
C
Q
 
N
L
 
L
Q
 
R
A
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
L
F
 
L
G
 
A
S
 
S
G
 
G
T
 
T
L
 
I
S
 
S
G
 
G
P
 
S
Q
 
D
A
 
P
G
 
E
Q
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
S
L
 
M
L
 
L
E
 
E
M
 
L
T
 
S
E
 
W
G
 
K
G
 
G
K
 
T
K
 
K
P
 
A
V
 
I
E
 
D
L
 
V
P
 
E
S
 
Q
G
 
G
E
 
Q
V
 
T
R
 
R
K
 
T
F
 
F
L
 
L
E
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
E
 
E
I
 
V
I
 
I
L
 
I
R
 
T
A
 
G
R
 
H
C
 
C
N
 
Q
R
 
G
E
 
D
G
 
G
F
 
Y
A
 
-
S
 
R
I
 
V
G
 
G
F
 
F
G
 
G
E
 
Q
C
 
C
R
 
A
G
 
G
T
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
P
A
 
A

1hyoB Crystal structure of fumarylacetoacetate hydrolase complexed with 4- (hydroxymethylphosphinoyl)-3-oxo-butanoic acid (see paper)
46% identity, 96% coverage: 18:427/428 of query aligns to 12:417/419 of 1hyoB

query
sites
1hyoB
T
 
S
D
 
D
F
 
F
P
 
P
L
 
I
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
S
I
 
T
N
 
Q
G
 
S
S
 
N
-
 
P
A
 
K
P
 
P
R
 
R
A
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
G
D
 
D
S
 
Q
I
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
S
A
 
V
A
 
I
I
 
K
D
 
H
E
 
L
F
 
F
D
 
T
G
 
G
E
 
P
A
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
K
-
 
H
R
 
Q
R
 
H
A
 
V
I
 
F
E
 
D
A
 
E
T
 
T
A
 
T
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
L
N
 
N
A
 
N
F
 
F
F
 
M
A
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
Q
G
 
A
P
 
A
R
 
W
V
 
K
A
 
E
L
 
A
R
 
R
E
 
A
R
 
S
L
 
L
L
 
Q
E
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
S
E
 
A
G
 
S
S
 
Q
T
 
A
L
 
R
H
 
L
T
 
R
R
 
D
E
 
D
A
 
K
Q
 
E
V
 
L
L
 
R
H
 
Q
R
 
R
A
 
A
-
 
F
-
 
T
-
 
S
-
 
Q
A
 
A
D
 
S
C
 
A
Q
 
T
M
 
M
H
 
H
V
 
L
P
 
P
A
 
A
Q
 
T
I
 
I
N
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
D
|
D
F
|
F
Y
|
Y
V
 
S
G
 
S
I
 
R
E
 
Q
H
|
H
A
 
A
Q
 
T
N
 
N
V
|
V
G
 
G
K
 
I
L
 
M
F
 
F
R
|
R
-
 
G
P
 
K
D
 
E
N
 
N
P
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
N
Y
 
W
K
 
L
Y
 
H
V
 
L
P
 
P
I
 
V
G
 
G
Y
|
Y
H
 
H
G
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
S
T
 
S
I
 
I
R
 
V
T
 
V
S
 
S
G
 
G
T
 
T
D
 
P
V
 
I
R
 
R
R
 
R
P
 
P
K
 
M
G
 
G
Q
 
Q
T
 
M
L
 
R
P
 
P
A
 
D
G
 
N
Q
 
S
S
 
K
E
 
P
P
 
P
T
 
V
F
 
Y
G
 
G
P
 
A
C
 
C
A
 
R
R
 
L
L
 
L
D
 
D
Y
 
M
E
|
E
L
 
L
E
|
E
L
 
M
G
 
A
I
 
F
W
 
F
I
 
V
G
 
G
Q
 
P
G
 
G
N
 
N
E
 
R
M
 
F
G
 
G
D
 
E
S
 
P
I
 
I
A
 
P
I
 
I
G
 
S
D
 
K
A
 
A
A
 
H
D
 
E
H
 
H
I
 
I
A
 
F
G
 
G
F
 
M
C
 
V
L
 
L
L
 
M
N
 
N
D
|
D
W
|
W
S
 
S
A
 
A
R
|
R
D
 
D
I
 
I
Q
|
Q
A
 
Q
W
 
W
E
 
E
Y
 
Y
Q
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
F
L
 
L
S
 
G
K
|
K
S
 
S
F
 
F
I
x
G
T
|
T
T
 
T
I
 
I
S
 
S
P
 
P
W
 
W
V
 
V
V
 
V
T
 
P
A
 
M
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
M
P
 
P
F
 
F
R
 
V
K
 
V
A
 
P
Q
 
N
P
 
P
A
 
K
R
 
Q
P
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
D
P
 
P
Q
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
P
Y
 
Y
L
 
L
L
 
C
D
 
H
K
 
S
R
 
Q
D
 
P
Q
 
Y
A
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
T
L
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
N
L
 
L
E
 
S
V
 
V
L
 
S
L
 
L
T
 
K
T
 
G
A
 
E
A
 
G
M
 
M
R
 
S
E
 
Q
Q
 
-
N
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
A
H
 
A
R
 
T
L
 
I
A
 
C
L
 
R
S
 
S
N
 
N
S
 
F
L
 
K
H
 
H
M
 
M
Y
 
Y
W
 
W
T
 
T
V
 
M
A
 
L
Q
 
Q
L
 
Q
V
 
L
A
 
T
H
 
H
H
 
H
S
 
S
V
 
V
N
 
N
G
 
G
C
 
C
Q
 
N
L
 
L
Q
 
R
A
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
L
F
 
L
G
 
A
S
 
S
G
|
G
T
|
T
L
 
I
S
 
S
G
 
G
P
 
S
Q
 
D
A
 
P
G
 
E
Q
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
S
L
 
M
L
 
L
E
|
E
M
 
L
T
 
S
E
 
W
G
 
K
G
 
G
K
 
T
K
 
K
P
 
A
V
 
I
E
 
D
L
 
V
P
 
G
S
 
Q
G
 
G
E
 
Q
V
 
T
R
 
R
K
 
T
F
 
F
L
 
L
E
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
E
 
E
I
 
V
I
 
I
L
 
I
R
 
T
A
 
G
R
 
H
C
 
C
N
 
Q
R
 
G
E
 
D
G
 
G
F
 
Y
A
 
-
S
 
R
I
 
V
G
 
G
F
 
F
G
 
G
E
 
Q
C
 
C
R
 
A
G
 
G
T
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
P
A
 
A

2hzyA Mouse fumarylacetoacetate hydrolase complexes with a transition-state mimic of the complete substrate (see paper)
46% identity, 96% coverage: 18:427/428 of query aligns to 10:415/416 of 2hzyA

query
sites
2hzyA
T
 
S
D
 
D
F
 
F
P
 
P
L
 
I
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
S
I
 
T
N
 
Q
G
 
S
S
 
N
-
 
P
A
 
K
P
 
P
R
 
R
A
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
G
D
 
D
S
 
Q
I
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
S
A
 
V
A
 
I
I
 
K
D
 
H
E
 
L
F
 
F
D
 
T
G
 
G
E
 
P
A
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
K
-
 
H
R
 
Q
R
 
H
A
 
V
I
 
F
E
 
D
A
 
E
T
 
T
A
 
T
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
L
N
 
N
A
 
N
F
 
F
F
 
M
A
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
Q
G
 
A
P
 
A
R
 
W
V
 
K
A
 
E
L
 
A
R
 
R
E
 
A
R
 
S
L
 
L
L
 
Q
E
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
S
E
 
A
G
 
S
S
 
Q
T
 
A
L
 
R
H
 
L
T
 
R
R
 
D
E
 
D
A
 
K
Q
 
E
V
 
L
L
 
R
H
 
Q
R
 
R
A
 
A
-
 
F
-
 
T
-
 
S
-
 
Q
A
 
A
D
 
S
C
 
A
Q
 
T
M
 
M
H
 
H
V
 
L
P
 
P
A
 
A
Q
 
T
I
 
I
N
x
G
D
|
D
Y
 
Y
T
 
T
D
|
D
F
 
F
Y
 
Y
V
 
S
G
 
S
I
 
R
E
 
Q
H
|
H
A
 
A
Q
 
T
N
 
N
V
 
V
G
 
G
K
 
I
L
 
M
F
 
F
R
 
R
-
 
G
P
 
K
D
 
E
N
 
N
P
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
N
Y
 
W
K
 
L
Y
 
H
V
 
L
P
 
P
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
S
T
 
S
I
 
I
R
 
V
T
 
V
S
 
S
G
 
G
T
 
T
D
 
P
V
 
I
R
 
R
R
 
R
P
 
P
K
 
M
G
 
G
Q
 
Q
T
 
M
L
 
R
P
 
P
A
 
D
G
 
N
Q
 
S
S
 
K
E
 
P
P
 
P
T
 
V
F
 
Y
G
 
G
P
 
A
C
 
C
A
 
R
R
 
L
L
 
L
D
 
D
Y
 
M
E
|
E
L
 
L
E
|
E
L
 
M
G
 
A
I
 
F
W
 
F
I
 
V
G
 
G
Q
 
P
G
 
G
N
 
N
E
 
R
M
 
F
G
 
G
D
 
E
S
 
P
I
 
I
A
 
P
I
 
I
G
 
S
D
 
K
A
 
A
A
 
H
D
 
E
H
 
H
I
 
I
A
 
F
G
 
G
F
 
M
C
 
V
L
 
L
L
 
M
N
 
N
D
|
D
W
 
W
S
 
S
A
 
A
R
|
R
D
 
D
I
 
I
Q
|
Q
A
 
Q
W
 
W
E
 
E
Y
 
Y
Q
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
F
L
 
L
S
 
G
K
|
K
S
 
S
F
 
F
I
 
G
T
|
T
T
 
T
I
 
I
S
 
S
P
 
P
W
 
W
V
 
V
V
 
V
T
 
P
A
 
M
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
M
P
 
P
F
 
F
R
 
V
K
 
V
A
 
P
Q
 
N
P
 
P
A
 
K
R
 
Q
P
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
D
P
 
P
Q
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
P
Y
 
Y
L
 
L
L
 
C
D
 
H
K
 
S
R
 
Q
D
 
P
Q
 
Y
A
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
T
L
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
N
L
 
L
E
 
S
V
 
V
L
 
S
L
 
L
T
 
K
T
 
G
A
 
E
A
 
G
M
 
M
R
 
S
E
 
Q
Q
 
-
N
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
A
H
 
A
R
 
T
L
 
I
A
 
C
L
 
R
S
 
S
N
 
N
S
 
F
L
 
K
H
 
H
M
 
M
Y
 
Y
W
 
W
T
 
T
V
 
M
A
 
L
Q
 
Q
L
 
Q
V
 
L
A
 
T
H
 
H
H
 
H
S
 
S
V
 
V
N
 
N
G
 
G
C
 
C
Q
 
N
L
 
L
Q
 
R
A
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
L
F
 
L
G
 
A
S
 
S
G
 
G
T
 
T
L
 
I
S
 
S
G
 
G
P
 
S
Q
 
D
A
 
P
G
 
E
Q
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
S
L
 
M
L
 
L
E
|
E
M
 
L
T
 
S
E
 
W
G
 
K
G
 
G
K
 
T
K
 
K
P
 
A
V
 
I
E
 
D
L
 
V
P
 
G
S
 
Q
G
 
G
E
 
Q
V
 
T
R
 
R
K
 
T
F
 
F
L
 
L
E
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
E
 
E
I
 
V
I
 
I
L
 
I
R
 
T
A
 
G
R
 
H
C
 
C
N
 
Q
R
 
G
E
 
D
G
 
G
F
 
Y
A
 
-
S
 
R
I
 
V
G
 
G
F
 
F
G
 
G
E
 
Q
C
 
C
R
 
A
G
 
G
T
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
P
A
 
A

1qcoA Crystal structure of fumarylacetoacetate hydrolase complexed with fumarate and acetoacetate (see paper)
46% identity, 96% coverage: 18:427/428 of query aligns to 10:415/416 of 1qcoA

query
sites
1qcoA
T
 
S
D
 
D
F
 
F
P
 
P
L
 
I
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
S
I
 
T
N
 
Q
G
 
S
S
 
N
-
 
P
A
 
K
P
 
P
R
 
R
A
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
G
D
 
D
S
 
Q
I
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
S
A
 
V
A
 
I
I
 
K
D
 
H
E
 
L
F
 
F
D
 
T
G
 
G
E
 
P
A
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
K
-
 
H
R
 
Q
R
 
H
A
 
V
I
 
F
E
 
D
A
 
E
T
 
T
A
 
T
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
L
N
 
N
A
 
N
F
 
F
F
 
M
A
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
Q
G
 
A
P
 
A
R
 
W
V
 
K
A
 
E
L
 
A
R
 
R
E
 
A
R
 
S
L
 
L
L
 
Q
E
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
S
E
 
A
G
 
S
S
 
Q
T
 
A
L
 
R
H
 
L
T
 
R
R
 
D
E
 
D
A
 
K
Q
 
E
V
 
L
L
 
R
H
 
Q
R
 
R
A
 
A
-
 
F
-
 
T
-
 
S
-
 
Q
A
 
A
D
 
S
C
 
A
Q
 
T
M
 
M
H
 
H
V
 
L
P
 
P
A
 
A
Q
 
T
I
 
I
N
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
D
|
D
F
|
F
Y
|
Y
V
 
S
G
 
S
I
 
R
E
 
Q
H
|
H
A
 
A
Q
 
T
N
 
N
V
|
V
G
 
G
K
 
I
L
 
M
F
 
F
R
|
R
-
 
G
P
 
K
D
 
E
N
 
N
P
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
N
Y
 
W
K
 
L
Y
 
H
V
 
L
P
 
P
I
 
V
G
 
G
Y
|
Y
H
 
H
G
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
S
T
 
S
I
 
I
R
 
V
T
 
V
S
 
S
G
 
G
T
 
T
D
 
P
V
 
I
R
 
R
R
 
R
P
 
P
K
 
M
G
 
G
Q
 
Q
T
 
M
L
 
R
P
 
P
A
 
D
G
 
N
Q
 
S
S
 
K
E
 
P
P
 
P
T
 
V
F
 
Y
G
 
G
P
 
A
C
 
C
A
 
R
R
 
L
L
 
L
D
 
D
Y
 
M
E
|
E
L
 
L
E
|
E
L
 
M
G
 
A
I
 
F
W
 
F
I
 
V
G
 
G
Q
 
P
G
 
G
N
 
N
E
 
R
M
 
F
G
 
G
D
 
E
S
 
P
I
 
I
A
 
P
I
 
I
G
 
S
D
 
K
A
 
A
A
 
H
D
 
E
H
 
H
I
 
I
A
 
F
G
 
G
F
 
M
C
 
V
L
 
L
L
 
M
N
 
N
D
|
D
W
 
W
S
 
S
A
 
A
R
 
R
D
 
D
I
 
I
Q
|
Q
A
 
Q
W
 
W
E
 
E
Y
|
Y
Q
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
F
L
 
L
S
 
G
K
|
K
S
 
S
F
 
F
I
 
G
T
 
T
T
 
T
I
 
I
S
 
S
P
 
P
W
 
W
V
 
V
V
 
V
T
 
P
A
 
M
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
M
P
 
P
F
 
F
R
 
V
K
 
V
A
 
P
Q
 
N
P
 
P
A
 
K
R
 
Q
P
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
D
P
 
P
Q
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
P
Y
 
Y
L
 
L
L
 
C
D
 
H
K
 
S
R
 
Q
D
 
P
Q
 
Y
A
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
T
L
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
N
L
 
L
E
 
S
V
 
V
L
 
S
L
 
L
T
 
K
T
 
G
A
 
E
A
 
G
M
 
M
R
 
S
E
 
Q
Q
 
-
N
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
A
H
 
A
R
 
T
L
 
I
A
 
C
L
 
R
S
 
S
N
 
N
S
 
F
L
 
K
H
 
H
M
 
M
Y
 
Y
W
 
W
T
 
T
V
 
M
A
 
L
Q
 
Q
L
 
Q
V
 
L
A
 
T
H
 
H
H
 
H
S
 
S
V
 
V
N
 
N
G
 
G
C
 
C
Q
 
N
L
 
L
Q
 
R
A
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
L
F
 
L
G
 
A
S
 
S
G
|
G
T
|
T
L
 
I
S
 
S
G
 
G
P
 
S
Q
 
D
A
 
P
G
 
E
Q
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
S
L
 
M
L
 
L
E
 
E
M
 
L
T
 
S
E
 
W
G
 
K
G
 
G
K
 
T
K
 
K
P
 
A
V
 
I
E
 
D
L
 
V
P
 
G
S
 
Q
G
 
G
E
 
Q
V
 
T
R
 
R
K
 
T
F
 
F
L
 
L
E
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
E
 
E
I
 
V
I
 
I
L
 
I
R
 
T
A
 
G
R
 
H
C
 
C
N
 
Q
R
 
G
E
 
D
G
 
G
F
 
Y
A
 
-
S
 
R
I
 
V
G
 
G
F
 
F
G
 
G
E
 
Q
C
 
C
R
 
A
G
 
G
T
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
P
A
 
A

8skyB Crystal structure of yisk from bacillus subtilis in complex with oxalate
28% identity, 41% coverage: 194:368/428 of query aligns to 142:273/303 of 8skyB

query
sites
8skyB
C
 
T
A
 
S
R
 
Q
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
E
|
E
L
 
G
E
|
E
L
 
L
G
 
A
I
 
V
W
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
K
G
 
S
N
 
-
E
 
-
M
 
-
G
 
G
D
 
T
S
 
R
I
 
I
A
 
S
I
 
K
G
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
Y
D
 
D
H
 
H
I
 
V
A
 
F
G
 
G
F
 
Y
C
 
T
L
 
I
L
 
V
N
 
N
D
|
D
W
 
I
S
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
A
 
K
W
 
R
E
 
H
Y
 
K
Q
 
Q
P
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
F
F
 
F
L
 
I
S
 
G
K
|
K
S
 
S
F
 
L
I
 
D
T
 
T
T
 
T
-
 
C
-
 
P
I
 
M
S
 
G
P
 
P
W
 
V
V
 
L
V
 
V
T
 
H
A
 
K
E
 
S
A
 
S
L
 
I
-
 
Q
E
 
E
P
 
P
F
 
E
R
 
R
K
 
L
A
 
K
Q
 
V
P
 
E
A
 
T
R
 
R
P
 
V
E
 
N
G
 
G
D
 
E
P
 
L
Q
 
R
P
 
-
L
 
-
S
 
-
Y
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
R
 
-
D
 
-
Q
 
Q
A
 
S
A
 
G
G
 
S
A
 
A
L
 
S
D
 
D
I
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
-
R
 
-
E
 
-
Q
 
-
N
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
-
H
 
-
M
 
M
Y
 
I
W
 
F
T
 
S
V
 
I
A
 
P
Q
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
E
H
 
T
H
 
L
S
 
S
V
 
-
N
 
K
G
 
G
C
 
M
Q
 
T
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
D
L
 
I
F
 
I
G
 
A
S
 
T
G
|
G
T
|
T
L
 
P
S
 
S
G
 
G
P
 
V
Q
 
G
A
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8sutA Crystal structure of yisk from bacillus subtilis in complex with reaction product 4-hydroxy-2-oxoglutaric acid
28% identity, 41% coverage: 194:368/428 of query aligns to 143:274/303 of 8sutA

query
sites
8sutA
C
 
T
A
 
S
R
 
Q
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
E
|
E
L
 
G
E
|
E
L
 
L
G
 
A
I
 
V
W
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
K
G
 
S
N
 
-
E
 
-
M
 
-
G
 
G
D
 
T
S
 
R
I
 
I
A
 
S
I
 
K
G
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
Y
D
 
D
H
 
H
I
 
V
A
 
F
G
 
G
F
 
Y
C
 
T
L
 
I
L
 
V
N
 
N
D
|
D
W
 
I
S
 
T
A
 
A
R
|
R
D
 
D
I
 
L
Q
|
Q
A
 
K
W
 
R
E
 
H
Y
 
K
Q
 
Q
P
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
F
F
 
F
L
 
I
S
 
G
K
|
K
S
 
S
F
 
L
I
 
D
T
 
T
T
 
T
-
 
C
-
 
P
I
 
M
S
 
G
P
 
P
W
 
V
V
 
L
V
 
V
T
 
H
A
 
K
E
 
S
A
 
S
L
 
I
-
 
Q
E
 
E
P
 
P
F
 
E
R
 
R
K
 
L
A
 
K
Q
 
V
P
 
E
A
 
T
R
 
R
P
 
V
E
 
N
G
 
G
D
 
E
P
 
L
Q
 
R
P
 
-
L
 
-
S
 
-
Y
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
R
 
-
D
 
-
Q
 
Q
A
 
S
A
 
G
G
 
S
A
 
A
L
 
S
D
 
D
I
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
-
R
 
-
E
 
-
Q
 
-
N
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
-
H
 
-
M
 
M
Y
 
I
W
 
F
T
 
S
V
 
I
A
 
P
Q
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
E
H
 
T
H
 
L
S
 
S
V
 
-
N
 
K
G
 
G
C
 
M
Q
 
T
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
D
L
 
I
F
 
I
G
 
A
S
 
T
G
|
G
T
|
T
L
 
P
S
 
S
G
 
G
P
 
V
Q
 
G
A
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>GFF990 FitnessBrowser__WCS417:GFF990
MTQPTLTRSWVASANGHTDFPLQNLPLGVFSINGSAPRAGVAIGDSILDLQAAIDEFDGE
ARRAIEATAGGQLNAFFALGRGPRVALRERLLELLAEGSTLHTREAQVLHRAADCQMHVP
AQINDYTDFYVGIEHAQNVGKLFRPDNPLLPNYKYVPIGYHGRASTIRTSGTDVRRPKGQ
TLPAGQSEPTFGPCARLDYELELGIWIGQGNEMGDSIAIGDAADHIAGFCLLNDWSARDI
QAWEYQPLGPFLSKSFITTISPWVVTAEALEPFRKAQPARPEGDPQPLSYLLDKRDQAAG
ALDIELEVLLTTAAMREQNLPAHRLALSNSLHMYWTVAQLVAHHSVNGCQLQAGDLFGSG
TLSGPQAGQFGSLLEMTEGGKKPVELPSGEVRKFLEDGDEIILRARCNREGFASIGFGEC
RGTVIAAR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory