SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_0494 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_0494 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5xu1B Structure of a non-canonical abc transporter from streptococcus pneumoniae r6 (see paper)
37% identity, 89% coverage: 11:204/218 of query aligns to 12:208/226 of 5xu1B

query
sites
5xu1B
T
 
S
F
 
Y
R
 
R
Y
 
N
G
 
G
G
 
D
Q
 
Q
A
 
E
-
 
L
-
 
Q
V
 
V
V
 
L
D
 
K
G
 
N
F
 
I
D
 
N
L
 
L
V
 
E
Q
 
V
E
 
N
P
 
E
G
 
G
D
 
E
H
 
F
R
 
V
V
 
A
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
 
T
L
 
L
I
 
M
N
 
N
L
 
T
I
 
I
A
 
G
G
 
M
L
 
L
L
 
D
T
 
T
P
 
P
Q
 
T
S
 
S
G
 
G
R
 
E
I
 
Y
M
 
Y
I
 
L
D
 
E
G
 
G
E
 
Q
S
 
E
I
 
V
G
 
A
D
 
G
L
 
L
P
 
G
A
 
E
A
 
K
K
 
Q
R
 
L
D
 
A
D
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
N
R
 
Q
K
 
Q
I
 
I
G
 
G
V
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
Q
L
 
F
R
 
F
L
 
L
V
 
L
A
 
S
A
 
K
L
 
L
D
 
N
V
 
A
T
 
L
A
 
Q
N
 
N
L
 
V
M
 
E
L
 
L
A
 
P
Q
 
L
R
 
I
L
 
Y
A
 
A
G
 
G
-
 
V
-
 
S
Q
 
S
R
 
S
P
 
K
D
 
R
R
 
R
G
 
K
E
 
L
I
 
A
Q
 
E
A
 
E
L
 
Y
L
 
L
A
 
D
A
 
K
L
 
V
D
 
E
L
 
L
T
 
T
H
 
E
R
 
R
A
 
S
H
 
H
A
 
H
R
 
L
P
 
P
R
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
Q
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
N
H
 
N
P
 
P
K
 
S
L
 
I
L
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
T
C
 
K
N
 
T
A
 
G
E
 
N
R
 
Q
V
 
I
A
 
M
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
D
T
 
L
A
 
-
N
 
N
T
 
K
H
 
E
G
 
G
S
 
K
T
 
T
L
 
I
L
 
I
V
 
M
A
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
A
 
P
R
 
E
I
 
I
K
 
A
A
 
A
F
 
Y

P75957 Lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD; EC 7.6.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
41% identity, 79% coverage: 30:201/218 of query aligns to 35:208/233 of P75957

query
sites
P75957
G
 
G
D
 
E
H
 
M
R
 
M
V
 
A
L
 
I
L
 
V
G
|
G
P
 
S
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
L
I
 
L
N
 
H
L
 
L
I
 
L
A
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
D
T
 
T
P
 
P
Q
 
T
S
 
S
G
 
G
R
 
D
I
 
V
M
 
I
I
 
F
D
 
N
G
 
G
E
 
Q
S
 
P
I
 
M
G
 
S
D
 
K
L
 
L
P
 
S
A
 
S
A
 
A
K
 
A
R
 
K
D
 
A
D
 
E
L
 
L
R
 
R
R
 
N
R
 
Q
K
 
K
I
 
L
G
 
G
V
 
F
V
 
I
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
F
L
 
H
R
 
H
L
 
L
V
 
L
A
 
P
A
 
D
L
 
F
D
 
T
V
 
A
T
 
L
A
 
E
N
 
N
L
 
V
M
 
A
L
 
M
A
 
P
Q
 
L
R
 
L
L
 
I
A
 
G
G
 
K
Q
 
K
R
 
K
P
 
P
D
 
A
R
 
E
G
 
I
E
 
N
I
 
S
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
-
 
E
-
 
M
L
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
V
D
 
G
L
 
L
T
 
D
H
 
H
R
 
R
A
 
A
H
 
N
A
 
H
R
 
R
P
 
P
R
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
Q
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
N
H
 
N
P
 
P
K
 
R
L
 
L
L
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
D
 
A
C
 
R
N
 
N
A
 
A
E
 
D
R
 
S
V
 
I
A
 
F
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
I
 
G
E
 
E
T
 
L
A
 
N
N
 
R
T
 
L
H
 
Q
G
 
G
S
 
T
T
 
A
L
 
F
L
 
L
V
 
V
A
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
A
 
L
R
 
Q
I
 
L

P9WQK5 Uncharacterized ABC transporter ATP-binding protein Rv0073 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
40% identity, 96% coverage: 5:213/218 of query aligns to 4:217/330 of P9WQK5

query
sites
P9WQK5
L
 
L
E
 
S
I
 
I
S
 
Q
S
 
N
L
 
L
T
 
V
F
 
V
R
 
E
Y
 
Y
-
 
Y
-
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Y
A
 
A
V
 
L
-
 
R
-
 
P
V
 
I
D
 
N
G
 
G
F
 
L
D
 
N
L
 
L
V
 
D
Q
 
V
E
 
A
P
 
A
G
 
G
D
 
S
H
 
L
R
 
V
V
 
M
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
C
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
L
I
 
L
N
 
S
L
 
C
I
 
L
A
 
G
G
 
G
L
 
I
L
 
L
T
 
R
P
 
P
Q
 
K
S
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
M
x
K
I
 
F
D
 
D
G
 
E
E
 
V
S
 
D
I
 
I
G
 
T
D
 
T
L
 
L
P
 
Q
A
 
G
A
 
A
K
 
E
R
 
L
D
 
A
D
 
N
L
 
Y
R
 
R
R
 
R
R
 
N
K
 
K
I
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
A
L
 
F
R
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
P
A
 
S
L
 
L
D
 
T
V
 
A
T
 
V
A
 
E
N
 
N
L
 
V
M
 
M
L
 
V
A
 
P
Q
 
L
R
 
R
L
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
M
-
 
S
-
 
R
R
 
R
P
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
R
E
 
R
I
 
A
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
V
D
 
N
L
 
L
T
 
A
H
 
E
R
 
R
A
 
M
H
 
N
A
 
H
R
 
R
P
 
P
R
 
G
E
 
D
L
 
L
S
 
S
Q
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
I
V
 
A
A
 
L
H
 
D
P
 
P
K
 
P
L
 
L
L
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
A
A
 
H
L
 
L
D
 
D
D
 
F
C
 
I
N
 
Q
A
 
V
E
 
E
R
 
E
V
 
V
A
 
L
Q
 
R
L
 
L
L
 
I
I
 
R
E
 
E
T
 
L
A
 
A
N
 
D
T
 
G
H
 
E
G
 
-
S
 
R
T
 
V
L
 
V
L
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
D
A
 
S
R
 
R
I
 
M
K
 
L
A
 
P
F
 
M
I
 
A
P
 
D
D
 
R
A
 
V
V
 
V
T
 
E
L
 
L
A
 
T
P
 
P

7arlD Lolcde in complex with lipoprotein and adp (see paper)
41% identity, 79% coverage: 30:201/218 of query aligns to 32:205/222 of 7arlD

query
sites
7arlD
G
 
G
D
 
E
H
 
M
R
 
M
V
 
A
L
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
S
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
 
T
L
 
L
I
 
L
N
 
H
L
 
L
I
 
L
A
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
D
T
 
T
P
 
P
Q
 
T
S
 
S
G
 
G
R
 
D
I
 
V
M
 
I
I
 
F
D
 
N
G
 
G
E
 
Q
S
 
P
I
 
M
G
 
S
D
 
K
L
 
L
P
 
S
A
 
S
A
 
A
K
 
A
R
 
K
D
 
A
D
 
E
L
 
L
R
 
R
R
 
N
R
 
Q
K
 
K
I
 
L
G
 
G
V
 
F
V
 
I
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
F
L
 
H
R
 
H
L
 
L
V
 
L
A
 
P
A
 
D
L
 
F
D
 
T
V
 
A
T
 
L
A
 
E
N
 
N
L
 
V
M
 
A
L
 
M
A
 
P
Q
 
L
R
 
L
L
 
I
A
 
G
G
 
K
Q
 
K
R
 
K
P
 
P
D
 
A
R
 
E
G
 
I
E
 
N
I
 
S
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
-
 
E
-
 
M
L
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
V
D
 
G
L
 
L
T
 
D
H
 
H
R
 
R
A
 
A
H
 
N
A
 
H
R
 
R
P
 
P
R
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
Q
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
N
H
 
N
P
 
P
K
 
R
L
 
L
L
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
D
 
A
C
 
R
N
 
N
A
 
A
E
 
D
R
 
S
V
 
I
A
 
F
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
I
 
G
E
 
E
T
 
L
A
 
N
N
 
R
T
 
L
H
 
Q
G
 
G
S
 
T
T
 
A
L
 
F
L
 
L
V
 
V
A
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
A
 
L
R
 
Q
I
 
L

7mdyC Lolcde nucleotide-bound
41% identity, 79% coverage: 30:201/218 of query aligns to 32:205/226 of 7mdyC

query
sites
7mdyC
G
 
G
D
 
E
H
 
M
R
 
M
V
 
A
L
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
S
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
I
 
L
N
 
H
L
 
L
I
 
L
A
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
D
T
 
T
P
 
P
Q
 
T
S
 
S
G
 
G
R
 
D
I
 
V
M
 
I
I
 
F
D
 
N
G
 
G
E
 
Q
S
 
P
I
 
M
G
 
S
D
 
K
L
 
L
P
 
S
A
 
S
A
 
A
K
 
A
R
 
K
D
 
A
D
 
E
L
 
L
R
 
R
R
 
N
R
 
Q
K
 
K
I
 
L
G
 
G
V
 
F
V
 
I
F
 
Y
Q
|
Q
T
 
F
L
 
H
R
 
H
L
 
L
V
 
L
A
 
P
A
 
D
L
 
F
D
 
T
V
 
A
T
 
L
A
 
E
N
 
N
L
 
V
M
 
A
L
 
M
A
 
P
Q
 
L
R
 
L
L
 
I
A
 
G
G
 
K
Q
 
K
R
 
K
P
 
P
D
 
A
R
 
E
G
 
I
E
 
N
I
 
S
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
-
 
E
-
 
M
L
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
V
D
 
G
L
 
L
T
 
D
H
 
H
R
 
R
A
 
A
H
 
N
A
x
H
R
 
R
P
 
P
R
 
S
E
|
E
L
 
L
S
|
S
Q
x
G
G
|
G
E
 
E
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
N
H
 
N
P
 
P
K
 
R
L
 
L
L
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
x
N
L
 
L
D
 
D
D
 
A
C
 
R
N
 
N
A
 
A
E
 
D
R
 
S
V
 
I
A
 
F
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
I
 
G
E
 
E
T
 
L
A
 
N
N
 
R
T
 
L
H
 
Q
G
 
G
S
 
T
T
 
A
L
 
F
L
 
L
V
 
V
A
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
A
 
L
R
 
Q
I
 
L

Sites not aligning to the query:

7v8iD Lolcd(e171q)e with bound amppnp in nanodiscs (see paper)
40% identity, 79% coverage: 30:201/218 of query aligns to 34:207/229 of 7v8iD

query
sites
7v8iD
G
 
G
D
 
E
H
 
M
R
 
M
V
 
A
L
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
S
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
I
 
L
N
 
H
L
 
L
I
 
L
A
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
D
T
 
T
P
 
P
Q
 
T
S
 
S
G
 
G
R
 
D
I
 
V
M
 
I
I
 
F
D
 
N
G
 
G
E
 
Q
S
 
P
I
 
M
G
 
S
D
 
K
L
 
L
P
 
S
A
 
S
A
 
A
K
 
A
R
 
K
D
 
A
D
 
E
L
 
L
R
 
R
R
 
N
R
 
Q
K
 
K
I
 
L
G
 
G
V
 
F
V
 
I
F
 
Y
Q
|
Q
T
 
F
L
 
H
R
 
H
L
 
L
V
 
L
A
 
P
A
 
D
L
 
F
D
 
T
V
 
A
T
 
L
A
 
E
N
 
N
L
 
V
M
 
A
L
 
M
A
 
P
Q
 
L
R
 
L
L
 
I
A
 
G
G
 
K
Q
 
K
R
 
K
P
 
P
D
 
A
R
 
E
G
 
I
E
 
N
I
 
S
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
-
 
E
-
 
M
L
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
V
D
 
G
L
 
L
T
 
D
H
 
H
R
|
R
A
 
A
H
 
N
A
x
H
R
 
R
P
 
P
R
 
S
E
|
E
L
 
L
S
|
S
Q
 
G
G
|
G
E
|
E
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
N
H
 
N
P
 
P
K
 
R
L
 
L
L
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
D
 
A
C
 
R
N
 
N
A
 
A
E
 
D
R
 
S
V
 
I
A
 
F
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
I
 
G
E
 
E
T
 
L
A
 
N
N
 
R
T
 
L
H
 
Q
G
 
G
S
 
T
T
 
A
L
 
F
L
 
L
V
 
V
A
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
A
 
L
R
 
Q
I
 
L

Sites not aligning to the query:

1f3oA Crystal structure of mj0796 atp-binding cassette (see paper)
35% identity, 89% coverage: 11:204/218 of query aligns to 10:211/232 of 1f3oA

query
sites
1f3oA
T
 
T
F
x
Y
R
 
K
Y
 
M
G
 
G
G
 
E
Q
 
E
A
 
I
V
 
I
-
 
Y
-
 
A
V
 
L
D
 
K
G
 
N
F
 
V
D
 
N
L
 
L
V
 
N
Q
 
I
E
 
K
P
 
E
G
 
G
D
 
E
H
 
F
R
 
V
V
 
S
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
M
I
 
L
N
 
N
L
 
I
I
 
I
A
 
G
G
 
C
L
 
L
L
 
D
T
 
K
P
 
P
Q
 
T
S
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
V
M
 
Y
I
 
I
D
 
D
G
 
N
E
 
I
S
 
K
I
 
T
G
 
N
D
 
D
L
 
L
P
 
D
A
 
D
A
 
D
K
 
E
R
 
L
D
 
T
D
 
K
L
 
I
R
 
R
R
 
R
R
 
D
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
Q
L
 
F
R
 
N
L
 
L
V
 
I
A
 
P
A
 
L
L
 
L
D
 
T
V
 
A
T
 
L
A
 
E
N
 
N
-
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
P
L
 
L
M
 
I
L
 
F
A
 
K
Q
 
Y
R
 
R
-
 
G
-
 
A
L
 
M
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
R
 
E
P
 
R
D
 
R
R
 
K
G
 
R
E
 
A
I
 
L
Q
 
E
A
 
C
L
 
L
L
 
K
A
 
M
A
 
A
L
 
-
D
 
E
L
 
L
T
 
E
H
 
E
R
 
R
-
 
F
A
 
A
H
 
N
A
 
H
R
 
K
P
 
P
R
 
N
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
Q
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
N
H
 
N
P
 
P
K
 
P
L
 
I
L
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
S
C
 
K
N
 
T
A
 
G
E
 
E
R
 
K
V
 
I
A
 
M
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
I
 
K
E
 
K
T
 
L
A
 
N
N
 
E
T
 
E
H
 
D
G
 
G
S
 
K
T
 
T
L
 
V
L
 
V
V
 
V
A
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
A
 
I
R
 
N
I
 
V
K
 
A
A
 
R
F
 
F

6z67B Ftse structure of streptococcus pneumoniae in complex with amppnp at 2.4 a resolution (see paper)
35% identity, 91% coverage: 4:201/218 of query aligns to 3:201/229 of 6z67B

query
sites
6z67B
V
 
I
L
 
I
E
 
E
I
 
M
S
 
R
S
 
D
L
 
V
T
 
V
F
 
K
R
 
K
Y
|
Y
-
 
D
G
 
N
G
|
G
Q
 
T
A
 
T
V
x
A
V
 
L
D
 
R
G
 
G
F
 
V
D
 
S
L
 
V
V
 
S
Q
 
V
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
D
 
E
H
 
F
R
 
A
V
 
Y
L
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
F
I
 
I
N
 
R
L
 
S
I
 
L
A
 
Y
G
 
R
L
 
E
L
 
V
T
 
K
P
 
I
Q
 
D
S
 
K
G
 
G
R
 
S
I
 
L
M
 
S
I
 
V
D
 
A
G
 
G
E
 
-
S
 
-
I
 
-
G
 
F
D
 
N
L
 
L
P
 
V
A
 
K
A
 
I
K
 
K
R
 
K
D
 
K
D
 
D
-
 
V
-
 
P
L
 
L
R
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
S
I
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
D
L
 
Y
R
 
K
L
 
L
V
 
L
A
 
P
A
 
K
L
 
K
D
 
T
V
 
V
T
 
Y
A
 
E
N
 
N
L
 
I
M
 
A
L
 
Y
A
 
A
Q
 
M
R
 
E
L
 
V
A
 
I
G
 
G
Q
 
E
-
 
N
-
 
R
R
 
R
P
 
N
D
 
I
R
 
K
G
 
R
E
 
R
I
 
V
Q
 
M
A
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
D
A
 
L
L
 
V
D
 
G
L
 
L
T
 
K
H
 
H
R
 
K
A
 
V
H
 
R
A
 
S
R
 
F
P
 
P
R
 
N
E
 
E
L
 
L
S
 
S
Q
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
N
H
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
V
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
D
 
P
C
 
D
N
 
N
A
 
S
E
 
W
R
 
E
V
 
I
A
 
M
Q
 
N
L
 
L
L
 
L
I
 
-
E
 
E
T
 
R
A
 
I
N
 
N
T
 
L
H
 
Q
G
 
G
S
 
T
T
 
T
L
 
I
L
 
L
V
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
N
A
 
S
R
 
Q
I
 
I

6z4wA Ftse structure from streptococcus pneumoniae in complex with adp (space group p 1) (see paper)
35% identity, 91% coverage: 4:201/218 of query aligns to 3:201/230 of 6z4wA

query
sites
6z4wA
V
 
I
L
 
I
E
 
E
I
 
M
S
 
R
S
 
D
L
 
V
T
 
V
F
 
K
R
 
K
Y
|
Y
-
 
D
G
 
N
G
 
G
Q
x
T
A
 
T
V
x
A
V
 
L
D
 
R
G
 
G
F
 
V
D
 
S
L
 
V
V
 
S
Q
 
V
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
D
 
E
H
 
F
R
 
A
V
 
Y
L
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
F
I
 
I
N
 
R
L
 
S
I
 
L
A
 
Y
G
 
R
L
 
E
L
 
V
T
 
K
P
 
I
Q
 
D
S
 
K
G
 
G
R
 
S
I
 
L
M
 
S
I
 
V
D
 
A
G
 
G
E
 
-
S
 
-
I
 
-
G
 
F
D
 
N
L
 
L
P
 
V
A
 
K
A
 
I
K
 
K
R
 
K
D
 
K
D
 
D
-
 
V
-
 
P
L
 
L
R
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
S
I
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
D
L
 
Y
R
 
K
L
 
L
V
 
L
A
 
P
A
 
K
L
 
K
D
 
T
V
 
V
T
 
Y
A
 
E
N
 
N
L
 
I
M
 
A
L
 
Y
A
 
A
Q
 
M
R
 
E
L
 
V
A
 
I
G
 
G
Q
 
E
-
 
N
-
 
R
R
 
R
P
 
N
D
 
I
R
 
K
G
 
R
E
 
R
I
 
V
Q
 
M
A
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
D
A
 
L
L
 
V
D
 
G
L
 
L
T
 
K
H
 
H
R
 
K
A
 
V
H
 
R
A
 
S
R
 
F
P
 
P
R
 
N
E
 
E
L
 
L
S
 
S
Q
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
N
H
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
V
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
D
 
P
C
 
D
N
 
N
A
 
S
E
 
W
R
 
E
V
 
I
A
 
M
Q
 
N
L
 
L
L
 
L
I
 
-
E
 
E
T
 
R
A
 
I
N
 
N
T
 
L
H
 
Q
G
 
G
S
 
T
T
 
T
L
 
I
L
 
L
V
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
N
A
 
S
R
 
Q
I
 
I

1l2tA Dimeric structure of mj0796, a bacterial abc transporter cassette (see paper)
34% identity, 89% coverage: 11:204/218 of query aligns to 10:211/230 of 1l2tA

query
sites
1l2tA
T
 
T
F
x
Y
R
 
K
Y
 
M
G
 
G
G
 
E
Q
 
E
A
 
I
V
 
I
-
 
Y
-
 
A
V
 
L
D
 
K
G
 
N
F
 
V
D
 
N
L
 
L
V
 
N
Q
 
I
E
 
K
P
 
E
G
 
G
D
 
E
H
 
F
R
 
V
V
 
S
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
M
I
 
L
N
 
N
L
 
I
I
 
I
A
 
G
G
 
C
L
 
L
L
 
D
T
 
K
P
 
P
Q
 
T
S
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
V
M
 
Y
I
 
I
D
 
D
G
 
N
E
 
I
S
 
K
I
 
T
G
 
N
D
 
D
L
 
L
P
 
D
A
 
D
A
 
D
K
 
E
R
 
L
D
 
T
D
 
K
L
 
I
R
 
R
R
 
R
R
 
D
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
Q
L
 
F
R
 
N
L
 
L
V
 
I
A
 
P
A
 
L
L
 
L
D
 
T
V
 
A
T
 
L
A
 
E
N
 
N
-
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
P
L
 
L
M
 
I
L
 
F
A
 
K
Q
 
Y
R
 
R
-
 
G
-
 
A
L
 
M
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
R
 
E
P
 
R
D
 
R
R
 
K
G
 
R
E
 
A
I
 
L
Q
 
E
A
 
C
L
 
L
L
 
K
A
 
M
A
 
A
L
 
-
D
 
E
L
 
L
T
 
E
H
 
E
R
 
R
-
x
F
A
 
A
H
 
N
A
 
H
R
 
K
P
 
P
R
 
N
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
Q
 
G
G
|
G
E
x
Q
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
N
H
 
N
P
 
P
K
 
P
L
 
I
L
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
S
C
 
K
N
 
T
A
 
G
E
 
E
R
 
K
V
 
I
A
 
M
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
I
 
K
E
 
K
T
 
L
A
 
N
N
 
E
T
 
E
H
 
D
G
 
G
S
 
K
T
 
T
L
 
V
L
 
V
V
 
V
A
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
A
 
I
R
 
N
I
 
V
K
 
A
A
 
R
F
 
F

3d31A Modbc from methanosarcina acetivorans (see paper)
37% identity, 92% coverage: 4:203/218 of query aligns to 1:195/348 of 3d31A

query
sites
3d31A
V
 
M
L
 
I
E
 
E
I
 
I
S
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
S
F
 
R
R
 
K
Y
 
W
G
 
K
G
 
N
Q
 
F
A
 
S
V
 
L
V
 
-
D
 
D
G
 
N
F
 
L
D
 
S
L
 
L
V
 
K
Q
 
V
E
 
E
P
 
S
G
 
G
D
 
E
H
 
Y
R
 
F
V
 
V
L
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
T
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
L
L
 
F
I
 
L
N
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
F
L
 
H
T
 
V
P
 
P
Q
 
D
S
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
M
 
L
I
 
L
D
 
D
G
 
G
E
 
K
S
 
D
I
 
V
G
 
T
D
 
D
L
 
L
P
 
S
A
 
P
A
 
E
K
 
K
R
 
H
D
 
D
D
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
-
K
 
-
I
 
I
G
 
A
V
 
F
V
 
V
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
N
L
 
Y
R
 
S
L
 
L
V
 
F
A
 
P
A
 
H
L
 
M
D
 
N
V
 
V
T
 
K
A
 
K
N
 
N
L
 
L
M
 
E
L
 
F
A
 
G
Q
 
M
R
 
R
L
 
M
A
 
K
G
 
K
Q
 
I
R
 
K
P
 
-
D
 
D
R
 
P
G
 
K
E
 
R
I
 
V
Q
 
L
A
 
D
L
 
T
L
 
A
A
 
R
A
 
D
L
 
L
D
 
K
L
 
I
T
 
E
H
 
H
R
 
L
A
 
L
H
 
D
A
 
R
R
 
N
P
 
P
R
 
L
E
 
T
L
 
L
S
 
S
Q
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
T
H
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
I
L
 
L
I
 
L
A
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
P
C
 
R
N
 
T
A
 
Q
E
 
E
R
 
N
V
 
A
A
 
R
Q
 
E
L
 
M
L
 
L
I
 
S
E
 
V
T
 
L
A
 
H
N
 
K
T
 
K
H
 
N
G
 
K
S
 
L
T
 
T
L
 
V
L
 
L
V
 
H
A
 
I
T
 
T
H
 
H
D
 
D
-
 
Q
-
 
T
-
 
E
A
 
A
R
 
R
I
 
I
K
 
M
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5lilA Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atpys (p21) (see paper)
36% identity, 92% coverage: 3:203/218 of query aligns to 2:207/615 of 5lilA

query
sites
5lilA
R
 
N
V
 
I
L
 
I
E
 
E
I
 
I
S
 
K
S
 
Q
L
 
L
T
 
N
F
 
-
R
 
R
Y
 
Y
G
x
F
G
 
G
Q
 
E
A
 
G
-
 
E
-
 
N
-
 
R
-
 
V
-
 
H
V
|
V
V
 
L
D
 
K
G
 
D
F
 
I
D
 
S
L
 
L
V
 
S
Q
 
I
E
 
E
P
 
R
G
 
G
D
 
D
H
 
F
R
 
V
V
 
A
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
Q
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
I
 
M
N
 
N
L
 
I
I
 
I
A
 
G
G
 
C
L
 
L
L
 
D
T
 
T
P
 
A
Q
 
T
S
 
G
G
 
G
R
 
S
I
 
S
M
 
K
I
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
K
S
 
E
I
 
T
G
 
I
D
 
E
L
 
L
P
 
T
A
 
N
A
 
D
K
 
Q
R
 
L
D
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
R
R
 
S
R
 
Q
K
 
K
I
 
F
G
 
G
V
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
|
Q
T
 
R
L
 
Y
R
 
N
L
 
L
V
 
L
A
 
S
A
 
S
L
 
L
D
 
T
V
 
A
T
 
A
A
 
E
N
 
N
L
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
P
Q
 
A
R
 
I
L
 
Y
A
 
A
G
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
Q
-
 
S
Q
 
Q
R
 
R
P
 
L
D
 
E
R
 
R
G
 
A
E
 
-
I
 
-
Q
 
K
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
K
L
 
L
D
 
G
L
 
L
T
 
G
H
 
D
R
x
K
A
 
W
H
 
Q
A
 
N
R
 
K
P
 
P
R
 
N
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
Q
 
G
G
|
G
E
x
Q
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
M
A
 
N
H
 
G
P
 
G
K
 
E
L
 
I
L
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
S
C
 
H
N
 
S
A
 
G
E
 
E
R
 
N
V
 
V
A
 
M
Q
 
E
L
 
I
L
 
L
I
 
-
E
 
R
T
 
Q
A
 
L
N
 
H
T
 
E
H
 
E
G
 
G
S
 
H
T
 
T
L
 
I
L
 
I
V
 
M
A
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
A
 
K
R
 
H
I
 
I
K
 
A
A
 
A

5lj7A Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atp (p21) (see paper)
36% identity, 92% coverage: 3:203/218 of query aligns to 2:207/592 of 5lj7A

query
sites
5lj7A
R
 
N
V
 
I
L
 
I
E
 
E
I
 
I
S
 
K
S
 
Q
L
 
L
T
 
N
F
 
-
R
 
R
Y
 
Y
G
 
F
G
 
G
Q
 
E
A
 
G
-
 
E
-
 
N
-
 
R
-
 
V
-
 
H
V
|
V
V
 
L
D
 
K
G
 
D
F
 
I
D
 
S
L
 
L
V
 
S
Q
 
I
E
 
E
P
 
R
G
 
G
D
 
D
H
 
F
R
 
V
V
 
A
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
Q
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
I
 
M
N
 
N
L
 
I
I
 
I
A
 
G
G
 
C
L
 
L
L
 
D
T
 
T
P
 
A
Q
 
T
S
 
G
G
 
G
R
 
S
I
 
S
M
 
K
I
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
K
S
 
E
I
 
T
G
 
I
D
 
E
L
 
L
P
 
T
A
 
N
A
 
D
K
 
Q
R
 
L
D
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
R
R
 
S
R
 
Q
K
 
K
I
 
F
G
 
G
V
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
|
Q
T
 
R
L
 
Y
R
 
N
L
 
L
V
 
L
A
 
S
A
 
S
L
 
L
D
 
T
V
 
A
T
 
A
A
 
E
N
 
N
L
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
P
Q
 
A
R
 
I
L
 
Y
A
 
A
G
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
Q
-
 
S
Q
 
Q
R
 
R
P
 
L
D
 
E
R
 
R
G
 
A
E
 
-
I
 
-
Q
 
K
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
K
L
 
L
D
 
G
L
 
L
T
 
G
H
 
D
R
x
K
A
 
W
H
 
Q
A
 
N
R
 
K
P
 
P
R
 
N
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
Q
 
G
G
|
G
E
x
Q
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
M
A
 
N
H
 
G
P
 
G
K
 
E
L
 
I
L
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
S
C
 
H
N
 
S
A
 
G
E
 
E
R
 
N
V
 
V
A
 
M
Q
 
E
L
 
I
L
 
L
I
 
-
E
 
R
T
 
Q
A
 
L
N
 
H
T
 
E
H
 
E
G
 
G
S
 
H
T
 
T
L
 
I
L
 
I
V
 
M
A
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
A
 
K
R
 
H
I
 
I
K
 
A
A
 
A

2pclA Crystal structure of abc transporter with complex (aq_297) from aquifex aeolicus vf5
35% identity, 84% coverage: 16:198/218 of query aligns to 15:198/223 of 2pclA

query
sites
2pclA
G
 
G
Q
 
Y
A
 
E
V
 
I
V
 
L
D
 
K
G
 
G
F
 
I
D
 
S
L
 
L
V
 
S
Q
 
V
E
 
K
P
 
K
G
 
G
D
 
E
H
 
F
R
 
V
V
 
S
L
 
I
L
 
I
G
 
G
P
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
L
I
 
L
N
 
Y
L
 
I
I
 
L
A
 
G
G
 
L
L
 
L
L
 
D
T
 
A
P
 
P
Q
 
T
S
 
E
G
 
G
R
 
K
I
 
V
M
 
F
I
 
L
D
 
E
G
 
G
E
 
K
S
 
E
I
 
V
G
 
D
D
 
Y
L
 
T
P
 
N
A
 
E
A
 
K
K
 
E
R
 
L
D
 
S
D
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
N
R
 
R
K
 
K
I
 
L
G
 
G
V
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
F
L
 
H
R
 
Y
L
 
L
V
 
I
A
 
P
A
 
E
L
 
L
D
 
T
V
 
A
T
 
L
A
 
E
N
 
N
L
 
V
M
 
I
L
 
V
A
 
P
Q
 
M
R
 
L
L
 
K
A
 
M
G
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
K
-
 
K
Q
 
E
R
 
A
P
 
K
D
 
E
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
Y
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
E
L
 
L
D
 
G
L
 
L
T
 
G
H
 
D
R
 
K
A
 
L
H
 
S
A
 
R
R
 
K
P
 
P
R
 
Y
E
 
E
L
 
L
S
 
S
Q
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
N
H
 
E
P
 
P
K
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
F
A
 
A
D
 
D
E
|
E
P
|
P
T
|
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
D
 
S
C
 
A
N
 
N
A
 
T
E
 
K
R
 
R
V
 
V
A
 
M
Q
 
D
L
 
I
L
 
F
I
 
L
E
 
K
T
 
I
A
 
-
N
 
N
T
 
E
H
 
G
G
 
G
S
 
T
T
 
S
L
 
I
L
 
V
V
 
M
A
 
V
T
|
T
H
 
H
D
 
E

5ws4A Crystal structure of tripartite-type abc transporter macb from acinetobacter baumannii (see paper)
35% identity, 91% coverage: 4:201/218 of query aligns to 4:206/650 of 5ws4A

query
sites
5ws4A
V
 
L
L
 
L
E
 
E
I
 
V
S
 
S
S
 
N
L
 
L
T
 
V
F
 
R
R
 
E
Y
 
F
-
 
P
G
 
A
G
 
G
Q
 
E
A
 
S
-
 
T
-
 
I
-
 
Q
V
 
I
V
 
L
D
 
K
G
 
G
F
 
I
D
 
D
L
 
L
V
 
T
Q
 
I
E
 
Y
P
 
E
G
 
G
D
 
E
H
 
L
R
 
V
V
 
A
L
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
Q
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
x
S
T
 
T
L
 
L
I
 
M
N
 
N
L
 
I
I
 
L
A
 
G
G
 
C
L
 
L
L
 
D
T
 
R
P
 
P
Q
 
T
S
 
S
G
 
G
R
 
S
I
 
Y
M
 
K
I
 
V
D
 
N
G
 
G
E
 
Q
S
 
E
I
 
T
G
 
G
D
 
K
L
 
L
P
 
E
A
 
P
A
 
D
K
 
Q
R
 
L
D
 
A
D
 
Q
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
E
K
 
Y
I
 
F
G
 
G
V
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
T
 
R
L
 
Y
R
 
H
L
 
L
V
 
L
A
 
G
A
 
D
L
 
L
D
 
S
V
 
A
T
 
E
A
 
G
N
 
N
L
 
V
M
 
E
L
 
V
A
 
P
Q
 
A
R
 
V
L
 
Y
A
 
A
G
 
G
Q
 
V
R
 
T
P
 
P
-
 
A
D
 
D
R
 
R
G
 
K
E
 
Q
-
 
R
I
 
A
Q
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
T
A
 
E
L
 
L
D
 
G
L
 
L
T
 
G
H
 
T
R
 
K
A
 
T
H
 
Q
A
 
N
R
 
R
P
 
P
R
 
S
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
Q
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
M
A
 
N
H
 
G
P
 
G
K
 
D
L
 
V
L
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
S
C
 
H
N
 
S
A
 
G
E
 
V
R
 
E
V
 
V
A
 
M
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
I
 
R
E
 
E
T
 
-
A
 
L
N
 
N
T
 
A
H
 
A
G
 
G
S
 
H
T
 
T
L
 
I
L
 
I
V
 
L
A
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
A
 
M
R
 
Q
I
 
V

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
37% identity, 87% coverage: 9:198/218 of query aligns to 10:200/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
S
 
S
L
 
K
T
 
V
F
|
F
R
 
K
Y
 
K
G
 
G
G
 
K
Q
 
V
A
 
V
V
 
A
V
 
L
D
 
D
G
 
N
F
 
V
D
 
N
L
 
I
V
 
N
Q
 
I
E
 
E
P
 
N
G
 
G
D
 
E
H
 
R
R
 
F
V
 
G
L
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
F
I
 
M
N
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
D
T
 
V
P
 
P
Q
 
S
S
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
L
M
 
Y
I
 
F
D
 
D
G
 
D
E
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
A
S
 
S
I
 
N
G
 
G
D
 
K
L
 
L
P
 
I
A
 
V
A
 
P
K
 
P
R
 
E
D
 
D
D
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
T
 
T
L
 
W
R
 
A
L
 
L
V
 
Y
A
 
P
A
 
N
L
 
L
D
 
T
V
 
A
T
 
F
A
 
E
N
 
N
L
 
I
M
 
A
-
 
F
-
 
P
L
 
L
A
 
T
Q
 
N
R
 
M
L
 
K
A
 
M
G
 
S
Q
 
K
R
 
E
P
 
E
D
 
I
R
 
R
G
 
K
E
 
R
I
 
V
Q
 
E
A
 
E
L
 
V
L
 
A
A
 
K
A
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
I
T
 
H
H
 
H
R
 
V
A
 
L
H
 
N
A
 
H
R
 
F
P
 
P
R
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
S
Q
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
H
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
L
A
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
D
 
A
C
 
R
N
 
M
A
 
R
E
 
D
R
 
S
V
 
A
A
 
R
Q
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
K
E
 
E
T
 
V
A
 
Q
N
 
S
T
 
R
H
 
L
G
 
G
S
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
37% identity, 87% coverage: 9:198/218 of query aligns to 10:200/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
S
 
S
L
 
K
T
 
V
F
|
F
R
 
K
Y
 
K
G
 
G
G
 
K
Q
 
V
A
 
V
V
 
A
V
 
L
D
 
D
G
 
N
F
 
V
D
 
N
L
 
I
V
 
N
Q
 
I
E
 
E
P
 
N
G
 
G
D
 
E
H
 
R
R
 
F
V
 
G
L
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
F
I
 
M
N
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
D
T
 
V
P
 
P
Q
 
S
S
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
L
M
 
Y
I
 
F
D
 
D
G
 
D
E
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
A
S
 
S
I
 
N
G
 
G
D
 
K
L
 
L
P
 
I
A
 
V
A
 
P
K
 
P
R
 
E
D
 
D
D
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
L
 
W
R
 
A
L
 
L
V
 
Y
A
 
P
A
 
N
L
 
L
D
 
T
V
 
A
T
 
F
A
 
E
N
 
N
L
 
I
M
 
A
-
 
F
-
 
P
L
 
L
A
 
T
Q
 
N
R
 
M
L
 
K
A
 
M
G
 
S
Q
 
K
R
 
E
P
 
E
D
 
I
R
 
R
G
 
K
E
 
R
I
 
V
Q
 
E
A
 
E
L
 
V
L
 
A
A
 
K
A
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
I
T
 
H
H
 
H
R
 
V
A
 
L
H
 
N
A
 
H
R
 
F
P
 
P
R
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
S
Q
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
H
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
L
A
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
D
 
A
C
 
R
N
 
M
A
 
R
E
 
D
R
 
S
V
 
A
A
 
R
Q
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
K
E
 
E
T
 
V
A
 
Q
N
 
S
T
 
R
H
 
L
G
 
G
S
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D

1oxuA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
37% identity, 87% coverage: 9:198/218 of query aligns to 10:200/353 of 1oxuA

query
sites
1oxuA
S
 
S
L
 
K
T
 
V
F
|
F
R
 
K
Y
 
K
G
 
G
G
 
K
Q
 
V
A
 
V
V
x
A
V
 
L
D
 
D
G
 
N
F
 
V
D
 
N
L
 
I
V
 
N
Q
 
I
E
 
E
P
 
N
G
 
G
D
 
E
H
 
R
R
 
F
V
 
G
L
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
F
I
 
M
N
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
D
T
 
V
P
 
P
Q
 
S
S
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
L
M
 
Y
I
 
F
D
 
D
G
 
D
E
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
A
S
 
S
I
 
N
G
 
G
D
 
K
L
 
L
P
 
I
A
 
V
A
 
P
K
 
P
R
 
E
D
 
D
D
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
L
 
W
R
 
A
L
 
L
V
 
Y
A
 
P
A
 
N
L
 
L
D
 
T
V
 
A
T
 
F
A
 
E
N
 
N
L
 
I
M
 
A
-
 
F
-
 
P
L
 
L
A
 
T
Q
 
N
R
 
M
L
 
K
A
 
M
G
 
S
Q
 
K
R
 
E
P
 
E
D
 
I
R
 
R
G
 
K
E
 
R
I
 
V
Q
 
E
A
 
E
L
 
V
L
 
A
A
 
K
A
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
I
T
 
H
H
 
H
R
 
V
A
 
L
H
 
N
A
 
H
R
 
F
P
 
P
R
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
S
Q
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
H
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
L
A
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
D
 
A
C
 
R
N
 
M
A
 
R
E
 
D
R
 
S
V
 
A
A
 
R
Q
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
K
E
 
E
T
 
V
A
 
Q
N
 
S
T
 
R
H
 
L
G
 
G
S
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D

Q97UY8 Glucose import ATP-binding protein GlcV; EC 7.5.2.- from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
37% identity, 87% coverage: 9:198/218 of query aligns to 10:200/353 of Q97UY8

query
sites
Q97UY8
S
 
S
L
 
K
T
 
V
F
 
F
R
 
K
Y
 
K
G
 
G
G
 
K
Q
 
V
A
 
V
V
 
A
V
 
L
D
 
D
G
 
N
F
 
V
D
 
N
L
 
I
V
 
N
Q
 
I
E
 
E
P
 
N
G
 
G
D
 
E
H
 
R
R
 
F
V
 
G
L
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
F
I
 
M
N
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
D
T
 
V
P
 
P
Q
 
S
S
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
L
M
 
Y
I
 
F
D
 
D
G
 
D
E
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
A
S
 
S
I
 
N
G
 
G
D
 
K
L
 
L
P
 
I
A
 
V
A
 
P
K
 
P
R
 
E
D
 
D
D
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
L
 
W
R
 
A
L
 
L
V
 
Y
A
 
P
A
 
N
L
 
L
D
 
T
V
 
A
T
 
F
A
 
E
N
 
N
L
 
I
M
 
A
-
 
F
-
 
P
L
 
L
A
 
T
Q
 
N
R
 
M
L
 
K
A
 
M
G
 
S
Q
 
K
R
 
E
P
 
E
D
 
I
R
 
R
G
 
K
E
 
R
I
 
V
Q
 
E
A
 
E
L
 
V
L
 
A
A
 
K
A
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
I
T
 
H
H
 
H
R
 
V
A
 
L
H
 
N
A
 
H
R
 
F
P
 
P
R
 
R
E
 
E
L
 
L
S
|
S
Q
 
G
G
|
G
E
 
Q
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
H
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
L
A
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
D
 
A
C
 
R
N
 
M
A
 
R
E
 
D
R
 
S
V
 
A
A
 
R
Q
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
K
E
 
E
T
 
V
A
 
Q
N
 
S
T
 
R
H
 
L
G
 
G
S
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
36% identity, 95% coverage: 4:211/218 of query aligns to 2:208/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
V
 
I
L
 
I
E
 
R
I
 
I
S
 
R
S
 
N
L
 
L
T
 
H
F
 
K
R
 
W
Y
x
F
G
 
G
G
 
P
Q
 
L
A
 
H
V
|
V
V
 
L
D
 
K
G
 
G
F
 
I
D
 
H
L
 
L
V
 
E
Q
 
V
E
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
E
H
 
K
R
 
L
V
 
V
L
 
I
L
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
I
 
I
N
 
R
L
 
T
I
 
I
A
 
N
G
 
R
L
 
L
L
 
E
T
 
D
P
 
F
Q
 
Q
S
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
V
M
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
L
S
 
S
I
 
V
G
 
K
D
 
D
L
 
D
P
 
R
A
 
A
A
 
L
K
 
R
R
 
E
D
 
I
D
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
R
R
 
R
K
 
E
I
 
V
G
 
G
V
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
Q
L
 
F
R
 
N
L
 
L
V
 
F
A
 
P
A
 
H
L
 
M
D
 
T
V
 
V
T
 
L
A
 
E
N
 
N
L
 
V
M
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
P
R
 
M
L
 
R
A
 
V
G
 
R
Q
 
R
R
 
W
P
 
P
-
 
R
D
 
E
R
 
K
G
 
A
E
 
E
I
 
K
Q
 
K
A
 
A
-
 
L
-
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
R
L
 
V
D
 
G
L
 
I
T
 
L
H
 
D
R
 
Q
A
 
A
H
 
R
A
 
K
R
 
Y
P
 
P
R
 
A
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
Q
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
M
H
 
E
P
 
P
K
 
K
L
 
I
L
 
M
I
 
L
A
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
P
C
 
E
N
 
M
A
 
V
E
 
G
R
 
E
V
 
V
A
 
L
Q
 
D
L
 
V
L
 
M
I
 
R
E
 
D
T
 
L
A
 
A
N
 
Q
T
 
G
H
 
-
G
 
G
S
 
M
T
 
T
L
 
M
L
 
V
V
 
V
A
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
A
 
M
R
 
G
I
 
F
K
 
A
A
 
R
F
 
E
I
 
V
P
 
A
D
 
D
A
 
R
V
 
V
T
 
V
L
 
F

Query Sequence

>Ga0059261_0494 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_0494
MPRVLEISSLTFRYGGQAVVDGFDLVQEPGDHRVLLGPSGSGKTTLINLIAGLLTPQSGR
IMIDGESIGDLPAAKRDDLRRRKIGVVFQTLRLVAALDVTANLMLAQRLAGQRPDRGEIQ
ALLAALDLTHRAHARPRELSQGEAQRAAIARGLVAHPKLLIADEPTSALDDCNAERVAQL
LIETANTHGSTLLVATHDARIKAFIPDAVTLAPVREAD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory