SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_0740 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_0740 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5ez3B Crystal structure acyl-coa dehydrogenase from brucella melitensis in complex with fad
48% identity, 98% coverage: 12:540/540 of query aligns to 2:541/541 of 5ez3B

query
sites
5ez3B
T
 
T
H
 
H
E
 
E
V
 
V
L
 
T
N
 
N
Q
 
Q
P
 
T
P
 
P
P
 
P
F
 
I
E
 
T
E
 
G
V
 
T
N
 
N
L
 
A
F
 
Y
T
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
P
A
 
L
L
 
L
A
 
M
D
 
Q
A
 
I
V
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
F
G
 
P
G
 
K
A
 
E
R
 
L
H
 
H
R
 
T
E
 
E
R
 
-
L
 
L
T
 
E
S
 
Q
L
 
A
G
 
G
A
 
R
R
 
F
C
 
V
G
 
L
S
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
A
I
 
Q
D
 
D
W
 
L
G
 
A
V
 
R
E
 
L
A
 
A
N
 
N
R
 
T
N
 
E
I
 
L
P
 
P
V
 
K
L
 
L
E
 
R
S
 
T
Y
 
H
D
 
D
R
 
R
F
 
Q
G
 
G
Q
 
R
R
 
R
I
 
I
D
 
D
E
 
L
V
 
V
R
 
E
F
 
Y
H
 
H
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
A
L
 
L
M
 
M
R
 
R
L
 
R
G
 
S
L
 
V
D
 
A
S
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
H
S
 
S
V
 
S
A
 
I
W
 
W
D
 
E
G
 
D
T
 
N
P
 
P
A
 
L
G
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
R
-
 
R
H
 
H
V
 
Q
A
 
A
H
 
R
A
 
A
A
 
A
I
 
R
L
 
F
F
 
Y
L
 
L
T
 
T
G
 
A
Q
 
Q
A
 
L
D
 
E
S
 
A
G
 
G
T
 
H
S
 
L
C
 
C
P
 
P
M
 
L
T
 
T
M
 
M
T
 
T
Y
 
S
A
 
A
A
 
S
V
 
L
P
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
M
A
 
A
D
 
S
E
 
P
G
 
E
V
 
V
A
 
Y
G
 
K
E
 
Q
W
 
W
V
 
S
P
 
P
R
 
A
I
 
V
T
 
L
A
 
S
G
 
R
L
 
K
Y
 
Y
D
 
D
P
 
F
A
 
S
S
 
Q
R
 
K
P
 
P
A
 
A
A
 
F
E
 
R
K
 
K
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
M
 
M
A
 
G
M
|
M
T
|
T
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
G
|
G
G
|
G
S
x
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
A
N
 
N
T
 
A
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
E
P
 
P
A
 
A
G
 
I
E
 
G
A
 
G
G
 
A
W
 
W
Y
 
-
S
 
R
L
 
L
T
 
T
G
 
G
H
 
H
K
 
K
W
 
W
F
|
F
C
 
M
S
|
S
A
 
A
P
 
P
M
 
M
C
 
S
D
 
D
A
 
A
F
 
F
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
 
Q
A
 
T
Q
 
K
G
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
S
C
 
C
F
 
F
L
 
L
V
 
L
P
 
P
R
 
R
W
 
L
L
 
G
P
 
E
D
 
K
G
 
G
T
 
E
R
 
S
N
 
N
A
 
-
G
 
G
F
 
F
R
 
F
V
 
F
M
 
Q
R
 
R
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
G
D
 
N
R
 
R
S
 
S
N
 
N
A
 
A
S
 
S
S
 
S
E
 
E
I
 
V
E
 
E
Y
 
F
H
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
G
Q
 
Q
R
 
M
L
 
I
G
 
G
E
 
S
E
 
P
G
 
G
R
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
K
T
 
T
I
 
I
I
 
M
Q
 
D
M
 
M
V
 
V
Q
 
T
H
 
L
T
|
T
R
 
R
L
 
L
D
 
D
C
 
C
V
 
A
I
 
V
G
 
A
S
 
S
A
 
A
Q
 
G
Q
 
L
M
 
M
R
 
R
G
 
S
A
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
L
 
V
W
 
H
H
 
H
T
 
S
A
 
R
H
 
H
R
|
R
S
 
H
A
 
V
F
|
F
Q
 
G
R
 
K
R
 
P
L
|
L
I
 
V
D
 
E
Q
|
Q
P
 
P
A
 
L
M
|
M
A
 
Q
A
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
M
A
 
A
V
 
L
E
 
D
S
 
V
E
 
A
A
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
A
L
 
L
G
 
S
L
 
M
R
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
F
 
F
D
 
D
E
 
M
A
 
A
D
 
A
P
 
S
-
 
D
-
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
V
 
F
A
 
A
R
 
R
L
 
S
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
V
A
 
V
K
 
K
Y
 
Y
W
 
W
V
 
V
C
 
C
K
 
K
R
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
A
L
 
L
V
 
L
Y
 
Y
E
 
E
A
 
A
M
 
M
E
|
E
C
|
C
H
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
A
 
D
G
 
G
P
 
N
M
 
L
P
 
A
R
 
R
L
 
A
F
 
Y
R
 
R
Q
 
E
S
 
A
P
 
P
L
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
W
|
W
E
|
E
G
 
G
S
|
S
G
 
G
N
|
N
V
 
V
I
 
M
A
 
A
L
|
L
D
 
D
L
 
V
L
 
A
R
|
R
A
 
V
I
 
L
G
 
S
R
 
R
E
 
A
P
 
P
G
 
A
G
 
L
V
 
F
E
 
D
A
 
G
L
 
V
N
 
L
G
 
D
F
 
W
L
 
I
A
 
S
A
 
G
Q
 
Q
R
 
L
G
 
G
R
 
P
-
 
R
-
 
G
D
 
Q
A
 
G
A
 
T
Y
 
I
D
 
D
A
 
V
W
 
L
I
 
R
G
 
A
V
 
A
I
 
L
D
 
Q
L
 
L
K
 
T
S
 
E
A
 
T
H
 
D
E
 
Q
G
 
G
N
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
C
 
L
V
 
T
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
E
L
 
L
-
 
R
-
 
Q
L
 
L
G
 
G
W
 
A
D
 
D
S
 
D
P
 
I
G
 
-
A
 
A
D
 
D
A
 
A
F
 
F
C
 
I
R
 
E
L
 
T
R
 
R
L
 
L
S
 
G
P
 
G
R
 
L
-
 
W
G
 
R
S
 
T
A
 
T
Y
 
Y
G
 
G
A
 
M
F
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
R
V
 
H
D
 
N
T
 
A
R
 
M
A
 
R
L
 
I
I
 
I
E
 
D
R
 
Q
A
 
L
M
 
Y
P
 
P
V
 
A
A
 
S

3u33A Crystal structure of the e. Coli adaptive response protein aidb in the space group p3(2) (see paper)
44% identity, 94% coverage: 12:517/540 of query aligns to 5:519/540 of 3u33A

query
sites
3u33A
T
 
T
H
 
H
E
 
T
V
 
V
L
 
F
N
 
N
Q
 
Q
P
 
P
P
 
I
P
 
P
F
 
L
E
 
N
E
 
N
V
 
S
N
 
N
L
 
L
F
 
Y
T
 
L
G
 
S
D
 
D
R
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
C
D
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
T
R
 
R
A
 
E
G
 
G
G
 
A
A
 
G
R
 
W
H
 
D
R
 
S
E
 
D
R
 
F
L
 
L
T
 
A
S
 
S
L
 
I
G
 
G
A
 
Q
R
 
Q
C
 
L
G
 
G
S
 
T
A
 
A
E
 
E
V
 
S
I
 
L
D
 
E
W
 
L
G
 
G
V
 
R
E
 
L
A
 
A
N
 
N
R
 
V
N
 
N
I
 
P
P
 
P
V
 
E
L
 
L
E
 
L
S
 
R
Y
 
Y
D
 
D
R
 
A
F
 
Q
G
 
G
Q
 
R
R
 
R
I
 
L
D
 
D
E
 
D
V
 
V
R
 
R
F
 
F
H
 
H
P
 
P
A
 
A
Y
 
W
H
 
H
Q
 
L
L
 
L
M
 
M
R
 
Q
L
 
A
G
 
L
L
 
C
D
 
T
S
 
N
G
 
R
L
 
V
A
 
H
S
 
N
V
 
L
A
 
A
W
 
W
-
 
E
-
 
E
D
 
D
G
 
A
T
 
R
P
 
S
A
 
G
G
 
A
H
 
F
V
 
V
A
 
A
H
 
R
A
 
A
A
 
A
I
 
R
L
 
F
F
 
M
L
 
L
T
 
H
G
 
A
Q
 
Q
A
 
V
D
 
E
S
 
A
G
 
G
T
 
S
S
 
L
C
 
C
P
 
P
M
 
I
T
 
T
M
 
M
T
 
T
Y
 
F
A
 
A
A
 
A
V
 
T
P
 
P
A
 
L
L
 
L
-
 
L
R
 
Q
A
 
M
D
 
L
E
 
P
G
 
A
V
 
P
A
 
F
G
 
Q
E
 
D
W
 
W
V
 
T
P
 
T
R
 
P
I
 
L
T
 
L
A
 
S
G
 
D
L
 
R
Y
 
Y
D
 
D
P
 
S
A
 
H
S
 
L
R
 
L
P
 
P
A
 
G
A
 
G
E
 
Q
K
 
K
A
 
R
G
 
G
V
 
L
T
 
L
I
 
I
G
 
G
M
|
M
A
 
G
M
|
M
T
|
T
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
V
R
 
M
A
 
S
N
 
N
T
 
T
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
E
P
 
R
A
 
L
G
 
-
E
 
E
A
 
D
G
 
G
W
 
S
Y
 
Y
S
 
R
L
 
L
T
 
V
G
 
G
H
 
H
K
 
K
W
 
W
F
|
F
C
 
F
S
|
S
A
 
V
P
 
P
M
 
Q
C
 
S
D
 
D
A
 
A
F
 
H
L
 
L
T
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Q
A
 
T
Q
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
S
C
 
C
F
 
F
L
 
F
V
 
V
P
 
P
R
 
R
W
 
F
L
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
Q
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
-
F
 
I
R
 
R
V
 
L
M
 
E
R
 
R
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
G
D
 
N
R
 
R
S
 
S
N
 
N
A
 
A
S
 
S
S
 
C
E
 
E
I
 
V
E
 
E
Y
 
F
H
 
Q
G
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
G
Q
 
W
R
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
R
T
 
L
I
 
I
I
 
L
Q
 
K
M
 
M
V
 
G
Q
 
G
H
 
M
T
|
T
R
 
R
L
 
F
D
 
D
C
 
C
V
 
A
I
 
L
G
 
G
S
 
S
A
 
H
Q
 
A
Q
 
M
M
 
M
R
 
R
G
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
S
Q
 
L
A
 
A
L
 
I
W
 
Y
H
 
H
T
 
A
A
 
H
H
 
Q
R
|
R
S
 
H
A
 
V
F
|
F
Q
 
G
R
 
N
R
 
P
L
|
L
I
 
I
D
 
Q
Q
|
Q
P
 
P
A
 
L
M
|
M
A
 
R
A
 
H
V
 
V
L
 
L
A
 
S
D
 
R
L
 
M
A
 
A
V
 
L
E
 
Q
S
 
L
E
 
E
A
 
G
A
 
Q
T
 
T
V
 
A
L
 
L
G
 
L
L
 
F
R
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
F
 
W
D
 
D
-
 
R
E
 
R
A
 
A
D
 
D
P
 
A
V
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
W
A
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
F
T
 
T
P
 
P
I
 
A
A
 
A
K
 
K
Y
 
F
W
 
V
V
 
I
C
 
C
K
 
K
R
 
R
A
 
G
P
 
M
G
 
P
L
 
F
V
 
V
Y
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
M
E
|
E
C
x
V
H
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
 
C
E
 
E
A
 
E
G
 
S
P
 
E
M
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
L
F
 
Y
R
 
R
Q
 
E
S
 
M
P
 
P
L
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
I
W
|
W
E
|
E
G
|
G
S
|
S
G
 
G
N
|
N
V
 
I
I
 
M
A
 
C
L
|
L
D
 
D
L
 
V
L
 
L
R
|
R
A
 
V
I
 
L
G
 
N
R
 
K
E
 
Q
P
 
A
G
 
G
G
 
V
V
 
Y
E
 
D
A
 
L
L
 
L
N
 
S
G
 
E
F
 
A
L
 
F
A
 
V
A
 
E
Q
 
V
R
 
K
G
 
G
R
 
Q
D
 
D
A
 
R
A
 
Y
Y
 
F
D
 
D
A
 
R
W
 
A
I
 
V
G
 
R
V
 
R
I
 
L
-
 
Q
-
 
Q
D
 
Q
L
 
L
K
 
R
S
 
K
A
 
P
H
 
A
E
 
E
G
 
E
N
 
L
A
 
G
R
 
R
L
 
E
C
 
I
V
 
T
E
 
H
Q
 
Q
L
 
L
A
 
F
L
 
L
A
 
L
A
 
G
Q
 
C
A
 
G
A
 
A
V
 
Q
L
 
M
L
 
L
G
 
K
W
 
Y
D
 
A
S
 
S
-
 
P
P
 
P
G
 
M
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
F
 
W
C
 
C
R
 
Q
L
 
V
R
 
M
L
 
L
S
 
D
P
 
T
R
 
R
G
 
G

P33224 Putative acyl-CoA dehydrogenase AidB; EC 1.3.99.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
44% identity, 94% coverage: 12:517/540 of query aligns to 5:519/541 of P33224

query
sites
P33224
T
 
T
H
 
H
E
 
T
V
 
V
L
 
F
N
 
N
Q
 
Q
P
 
P
P
 
I
P
 
P
F
 
L
E
 
N
E
 
N
V
 
S
N
 
N
L
 
L
F
 
Y
T
 
L
G
 
S
D
 
D
R
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
C
D
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
T
R
 
R
A
 
E
G
 
G
G
 
A
A
 
G
R
 
W
H
 
D
R
 
S
E
 
D
R
 
F
L
 
L
T
 
A
S
 
S
L
 
I
G
 
G
A
 
Q
R
 
Q
C
 
L
G
 
G
S
 
T
A
 
A
E
 
E
V
 
S
I
 
L
D
 
E
W
 
L
G
 
G
V
 
R
E
 
L
A
 
A
N
 
N
R
 
V
N
 
N
I
 
P
P
 
P
V
 
E
L
 
L
E
 
L
S
 
R
Y
 
Y
D
 
D
R
 
A
F
 
Q
G
 
G
Q
 
R
R
 
R
I
 
L
D
 
D
E
 
D
V
 
V
R
 
R
F
 
F
H
 
H
P
 
P
A
 
A
Y
 
W
H
 
H
Q
 
L
L
 
L
M
 
M
R
 
Q
L
 
A
G
 
L
L
 
C
D
 
T
S
 
N
G
 
R
L
 
V
A
 
H
S
 
N
V
 
L
A
 
A
W
 
W
-
 
E
-
 
E
D
 
D
G
 
A
T
 
R
P
 
S
A
 
G
G
 
A
H
 
F
V
 
V
A
 
A
H
 
R
A
 
A
A
 
A
I
 
R
L
 
F
F
 
M
L
 
L
T
 
H
G
 
A
Q
 
Q
A
 
V
D
 
E
S
 
A
G
 
G
T
 
S
S
 
L
C
 
C
P
 
P
M
 
I
T
 
T
M
 
M
T
 
T
Y
 
F
A
 
A
A
 
A
V
 
T
P
 
P
A
 
L
L
 
L
-
 
L
R
 
Q
A
 
M
D
 
L
E
 
P
G
 
A
V
 
P
A
 
F
G
 
Q
E
 
D
W
 
W
V
 
T
P
 
T
R
 
P
I
 
L
T
 
L
A
 
S
G
 
D
L
 
R
Y
 
Y
D
 
D
P
 
S
A
 
H
S
 
L
R
 
L
P
 
P
A
 
G
A
 
G
E
 
Q
K
 
K
A
 
R
G
 
G
V
 
L
T
 
L
I
 
I
G
 
G
M
|
M
A
x
G
M
|
M
T
|
T
E
|
E
K
|
K
Q
|
Q
G
|
G
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
V
R
 
M
A
 
S
N
 
N
T
 
T
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
E
P
 
R
A
 
L
G
 
-
E
 
E
A
 
D
G
 
G
W
 
S
Y
 
Y
S
 
R
L
 
L
T
 
V
G
 
G
H
 
H
K
 
K
W
 
W
F
|
F
C
x
F
S
|
S
A
 
V
P
 
P
M
 
Q
C
 
S
D
 
D
A
 
A
F
 
H
L
 
L
T
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Q
A
 
T
Q
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
S
C
 
C
F
 
F
L
 
F
V
 
V
P
 
P
R
 
R
W
 
F
L
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
Q
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
-
F
 
I
R
 
R
V
 
L
M
 
E
R
 
R
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
G
D
 
N
R
 
R
S
 
S
N
 
N
A
 
A
S
 
S
S
 
C
E
 
E
I
 
V
E
 
E
Y
 
F
H
 
Q
G
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
G
Q
 
W
R
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
R
T
 
L
I
 
I
I
 
L
Q
 
K
M
 
M
V
 
G
Q
 
G
H
 
M
T
 
T
R
 
R
L
 
F
D
 
D
C
 
C
V
 
A
I
 
L
G
 
G
S
 
S
A
 
H
Q
 
A
Q
 
M
M
 
M
R
 
R
G
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
S
Q
 
L
A
 
A
L
 
I
W
 
Y
H
 
H
T
 
A
A
 
H
H
 
Q
R
 
R
S
 
H
A
 
V
F
 
F
Q
 
G
R
 
N
R
 
P
L
 
L
I
 
I
D
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
A
 
L
M
 
M
A
 
R
A
 
H
V
 
V
L
 
L
A
 
S
D
 
R
L
 
M
A
 
A
V
 
L
E
 
Q
S
 
L
E
 
E
A
 
G
A
 
Q
T
 
T
V
 
A
L
 
L
G
 
L
L
 
F
R
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
F
 
W
D
 
D
-
 
R
E
 
R
A
 
A
D
 
D
P
 
A
V
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
W
A
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
F
T
 
T
P
 
P
I
 
A
A
 
A
K
 
K
Y
 
F
W
 
V
V
 
I
C
 
C
K
 
K
R
 
R
A
 
G
P
 
M
G
 
P
L
 
F
V
 
V
Y
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
M
E
 
E
C
 
V
H
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
 
C
E
 
E
A
 
E
G
 
S
P
 
E
M
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
L
F
 
Y
R
 
R
Q
 
E
S
 
M
P
 
P
L
 
V
N
 
N
A
 
S
I
|
I
W
|
W
E
|
E
G
|
G
S
|
S
G
|
G
N
|
N
V
x
I
I
x
M
A
x
C
L
|
L
D
 
D
L
 
V
L
 
L
R
|
R
A
 
V
I
 
L
G
 
N
R
 
K
E
 
Q
P
 
A
G
 
G
G
 
V
V
 
Y
E
 
D
A
 
L
L
 
L
N
 
S
G
 
E
F
 
A
L
 
F
A
 
V
A
 
E
Q
 
V
R
 
K
G
 
G
R
 
Q
D
 
D
A
 
R
A
 
Y
Y
 
F
D
 
D
A
 
R
W
 
A
I
 
V
G
 
R
V
 
R
I
 
L
-
 
Q
-
 
Q
D
 
Q
L
 
L
K
 
R
S
 
K
A
 
P
H
 
A
E
 
E
G
 
E
N
 
L
A
 
G
R
 
R
L
 
E
C
 
I
V
 
T
E
 
H
Q
 
Q
L
 
L
A
 
F
L
 
L
A
 
L
A
 
G
Q
 
C
A
 
G
A
 
A
V
 
Q
L
 
M
L
 
L
G
 
K
W
 
Y
D
 
A
S
 
S
-
 
P
P
 
P
G
 
M
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
F
 
W
C
 
C
R
 
Q
L
 
V
R
 
M
L
 
L
S
 
D
P
 
T
R
|
R
G
 
G

4y9jB Crystal structure of caenorhabditis elegans acdh-11 in complex with c11-coa (see paper)
32% identity, 76% coverage: 31:443/540 of query aligns to 35:464/593 of 4y9jB

query
sites
4y9jB
D
 
D
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
R
D
 
R
A
 
L
V
 
L
A
 
P
R
 
E
A
 
S
G
 
E
G
 
Y
A
 
M
R
 
R
H
 
V
R
 
A
E
 
A
R
 
D
L
 
L
T
 
S
S
 
K
L
 
F
G
 
G
A
 
D
R
 
R
C
 
I
G
 
T
S
 
S
A
 
-
E
 
E
V
 
V
I
 
E
D
 
H
W
 
L
G
 
G
V
 
R
E
 
Q
A
 
A
N
 
E
R
 
L
N
 
E
I
 
Q
P
 
P
V
 
R
L
 
L
E
 
E
S
 
H
Y
 
Q
D
 
D
R
 
A
F
 
W
G
 
G
Q
 
K
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
K
V
 
L
R
 
I
F
 
V
H
 
C
P
 
N
A
 
E
Y
 
W
H
 
H
Q
 
K
L
 
L
M
 
K
R
 
Q
L
 
I
G
 
C
L
 
A
D
 
E
S
 
E
G
 
G
L
 
V
A
 
I
S
 
S
V
 
I
A
 
G
W
 
Y
D
 
E
G
 
D
T
 
S
P
 
V
-
 
D
-
 
P
-
 
F
A
 
V
G
 
R
H
 
R
V
 
I
A
 
H
H
 
Q
A
 
V
A
 
A
I
 
K
L
 
L
F
 
F
L
 
L
T
 
F
G
 
S
Q
 
P
A
 
S
D
 
A
S
 
G
G
 
L
T
 
V
S
|
S
C
 
C
P
 
P
M
 
M
T
x
A
M
 
M
T
 
T
Y
 
D
A
 
G
A
 
A
V
 
V
P
 
K
A
 
T
L
 
L
R
 
T
A
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
L
-
 
Y
-
 
G
D
 
K
E
 
H
G
 
K
V
 
L
A
 
A
G
 
T
E
 
E
W
 
A
V
 
V
P
 
D
R
 
R
I
 
L
T
 
R
A
 
S
G
 
-
L
 
-
Y
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
S
S
 
K
R
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
A
V
 
W
T
 
T
I
 
S
G
 
G
M
x
Q
A
 
W
M
|
M
T
|
T
E
 
E
K
 
K
Q
 
K
G
 
G
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
V
R
 
A
A
 
G
N
 
G
T
 
C
T
 
D
R
 
T
A
 
Y
E
 
A
P
 
V
A
 
Q
G
 
I
E
 
D
A
 
K
G
 
D
W
 
T
Y
 
Y
S
 
R
L
 
L
T
 
H
G
 
G
H
 
Y
K
 
K
W
 
W
F
|
F
C
x
S
S
|
S
A
 
A
P
 
V
M
 
D
C
 
A
D
 
D
A
 
V
F
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
 
R
-
 
I
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
D
-
 
G
-
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
E
A
 
G
Q
x
S
G
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
S
C
 
L
F
 
F
L
 
L
V
 
L
P
 
K
R
 
I
W
 
R
L
 
D
P
 
E
D
 
S
G
 
G
T
 
N
R
 
L
N
 
N
A
 
-
G
 
G
F
 
I
R
 
Q
V
 
M
M
 
V
R
 
R
L
 
L
K
 
K
D
 
N
K
 
K
L
 
L
G
 
G
D
 
T
R
 
K
S
 
Q
N
 
L
A
 
P
S
 
T
S
 
A
E
 
E
I
 
L
E
 
L
Y
 
L
H
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
L
 
I
G
 
G
E
 
D
E
 
Q
G
 
G
R
|
R
G
 
G
V
|
V
A
 
A
T
 
G
I
 
I
I
x
S
Q
 
N
M
 
M
V
x
L
Q
x
N
H
 
I
T
|
T
R
|
R
L
 
I
D
 
H
C
 
N
V
 
A
I
 
V
G
x
A
S
 
S
A
 
L
Q
 
G
Q
 
Y
M
 
M
R
 
R
G
 
R
A
 
I
L
 
I
A
 
S
Q
 
L
A
 
A
L
 
R
W
 
D
H
 
Y
T
 
S
A
 
T
H
 
K
R
|
R
S
 
V
A
x
V
F
|
F
Q
 
G
R
 
Q
R
 
T
L
x
Q
I
 
S
D
 
K
Q
 
W
P
 
P
A
 
L
M
 
H
A
 
T
A
 
T
V
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
K
L
 
M
A
 
E
V
 
V
E
 
D
S
 
T
-
 
R
-
 
G
-
 
S
-
 
M
-
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
R
V
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
S
L
 
E
A
 
A
-
 
G
Q
 
K
A
 
S
F
 
S
D
 
D
E
 
V
A
 
E
D
 
A
P
 
M
V
 
M
A
 
L
R
|
R
L
 
L
L
 
I
T
 
T
P
 
P
I
 
V
A
 
L
K
 
K
Y
 
L
W
 
Y
V
 
A
C
 
G
K
 
K
R
 
Q
A
 
A
P
 
V
G
 
P
L
 
M
V
 
V
Y
 
S
E
 
E
A
 
G
M
 
I
E
|
E
C
|
C
H
 
F
G
|
G
G
|
G
G
 
Q
G
 
G
Y
|
Y
I
 
M
E
 
E
A
 
D
G
 
T
P
 
G
M
 
L
P
 
P
R
 
T
L
 
L
F
 
L
R
 
R
Q
 
D
S
 
A
P
 
Q
L
 
V
N
 
T
A
 
P
I
 
I
W
|
W
E
|
E
G
 
G
S
x
T
G
 
T
N
 
N
V
|
V
I
 
L
A
 
S
L
|
L
D
 
D
L
 
V
L
 
L
R
|
R
A
 
V
I
 
F
-
 
S
G
 
G
R
 
K
E
 
E

Q9XWZ2 Acyl-CoA dehydrogenase family member 11; EC 1.3.99.- from Caenorhabditis elegans (see paper)
32% identity, 76% coverage: 31:443/540 of query aligns to 53:482/617 of Q9XWZ2

query
sites
Q9XWZ2
D
 
D
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
R
D
 
R
A
 
L
V
 
L
A
 
P
R
 
E
A
 
S
G
 
E
G
 
Y
A
 
M
R
 
R
H
 
V
R
 
A
E
 
A
R
 
D
L
 
L
T
 
S
S
 
K
L
 
F
G
 
G
A
 
D
R
 
R
C
 
I
G
 
T
S
 
S
A
 
-
E
 
E
V
 
V
I
 
E
D
 
H
W
 
L
G
 
G
V
 
R
E
 
Q
A
 
A
N
x
E
R
 
L
N
 
E
I
 
Q
P
 
P
V
 
R
L
 
L
E
 
E
S
 
H
Y
 
Q
D
 
D
R
 
A
F
 
W
G
 
G
Q
 
K
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
K
V
 
L
R
 
I
F
 
V
H
 
C
P
 
N
A
 
E
Y
 
W
H
 
H
Q
 
K
L
 
L
M
 
K
R
 
Q
L
 
I
G
 
C
L
 
A
D
 
E
S
 
E
G
 
G
L
 
V
A
 
I
S
 
S
V
 
I
A
 
G
W
 
Y
D
 
E
G
 
D
T
 
S
P
 
V
-
 
D
-
 
P
-
 
F
A
 
V
G
 
R
H
 
R
V
 
I
A
 
H
H
 
Q
A
 
V
A
 
A
I
 
K
L
 
L
F
 
F
L
 
L
T
 
F
G
 
S
Q
 
P
A
x
S
D
 
A
S
x
G
G
 
L
T
 
V
S
 
S
C
 
C
P
 
P
M
 
M
T
 
A
M
 
M
T
 
T
Y
 
D
A
 
G
A
 
A
V
 
V
P
 
K
A
 
T
L
 
L
R
 
T
A
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
L
-
 
Y
-
 
G
D
 
K
E
 
H
G
 
K
V
 
L
A
 
A
G
 
T
E
 
E
W
 
A
V
 
V
P
 
D
R
 
R
I
 
L
T
 
R
A
 
S
G
 
-
L
 
-
Y
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
S
S
 
K
R
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
A
V
 
W
T
 
T
I
 
S
G
 
G
M
 
Q
A
 
W
M
 
M
T
 
T
E
 
E
K
 
K
Q
 
K
G
 
G
G
|
G
S
 
S
D
 
D
V
 
V
R
 
A
A
 
G
N
 
G
T
 
C
T
 
D
R
 
T
A
 
Y
E
 
A
P
 
V
A
 
Q
G
 
I
E
 
D
A
 
K
G
 
D
W
 
T
Y
 
Y
S
 
R
L
 
L
T
 
H
G
 
G
H
 
Y
K
 
K
W
 
W
F
 
F
C
 
S
S
 
S
A
 
A
P
 
V
M
 
D
C
 
A
D
 
D
A
 
V
F
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
 
R
-
 
I
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
D
-
 
G
-
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
E
A
 
G
Q
 
S
G
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
S
C
 
L
F
 
F
L
 
L
V
 
L
P
 
K
R
 
I
W
 
R
L
 
D
P
 
E
D
 
S
G
 
G
T
 
N
R
 
L
N
 
N
A
 
-
G
 
G
F
 
I
R
 
Q
V
 
M
M
 
V
R
 
R
L
 
L
K
 
K
D
 
N
K
 
K
L
 
L
G
 
G
D
 
T
R
 
K
S
 
Q
N
 
L
A
 
P
S
 
T
S
 
A
E
 
E
I
 
L
E
 
L
Y
 
L
H
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
L
 
I
G
 
G
E
 
D
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
G
I
 
I
I
 
S
Q
 
N
M
 
M
V
 
L
Q
 
N
H
 
I
T
 
T
R
 
R
L
 
I
D
 
H
C
 
N
V
 
A
I
 
V
G
 
A
S
 
S
A
 
L
Q
 
G
Q
 
Y
M
 
M
R
 
R
G
 
R
A
 
I
L
 
I
A
 
S
Q
 
L
A
 
A
L
 
R
W
 
D
H
 
Y
T
 
S
A
 
T
H
 
K
R
 
R
S
 
V
A
 
V
F
 
F
Q
 
G
R
 
Q
R
 
T
L
 
Q
I
 
S
D
 
K
Q
 
W
P
 
P
A
 
L
M
 
H
A
 
T
A
 
T
V
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
K
L
 
M
A
 
E
V
 
V
E
 
D
S
 
T
-
 
R
-
 
G
-
 
S
-
 
M
-
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
R
V
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
S
L
 
E
A
 
A
-
 
G
Q
 
K
A
 
S
F
 
S
D
 
D
E
 
V
A
 
E
D
 
A
P
 
M
V
 
M
A
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
I
T
 
T
P
 
P
I
 
V
A
 
L
K
 
K
Y
 
L
W
 
Y
V
 
A
C
 
G
K
 
K
R
 
Q
A
 
A
P
 
V
G
 
P
L
 
M
V
 
V
Y
 
S
E
 
E
A
 
G
M
 
I
E
 
E
C
 
C
H
 
F
G
 
G
G
 
G
G
 
Q
G
|
G
Y
 
Y
I
 
M
E
 
E
A
 
D
G
 
T
P
 
G
M
 
L
P
 
P
R
 
T
L
 
L
F
 
L
R
|
R
Q
 
D
S
 
A
P
 
Q
L
 
V
N
 
T
A
 
P
I
 
I
W
 
W
E
 
E
G
 
G
S
 
T
G
 
T
N
 
N
V
 
V
I
 
L
A
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
V
I
 
F
-
 
S
G
 
G
R
 
K
E
 
E

6sdaB Bd2924 c10 acyl-coenzymea bound form (see paper)
31% identity, 79% coverage: 26:454/540 of query aligns to 11:454/503 of 6sdaB

query
sites
6sdaB
N
 
N
L
 
T
F
 
F
T
 
R
G
 
S
D
 
D
R
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
D
 
K
A
 
I
V
 
L
A
 
K
R
 
S
A
 
L
G
 
L
G
 
P
A
 
A
R
 
D
H
 
A
R
 
Q
E
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
P
R
 
H
L
 
L
T
 
E
S
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
E
R
 
R
C
 
A
G
 
V
S
 
T
A
 
-
E
 
D
V
 
M
I
 
L
D
 
T
W
 
W
G
 
A
V
 
Q
E
 
E
A
 
A
N
 
E
R
 
S
N
 
Q
I
 
P
P
 
P
V
 
V
L
 
H
E
 
V
S
 
P
Y
 
F
D
 
D
R
 
P
F
 
W
G
 
G
Q
 
R
R
 
R
I
 
I
D
 
D
E
 
D
V
 
I
R
 
K
F
 
T
H
 
S
P
 
H
A
 
G
Y
 
W
H
 
K
Q
 
A
L
 
L
M
 
E
R
 
K
L
 
V
G
 
A
L
 
A
D
 
E
S
 
E
G
 
G
L
 
I
A
 
V
S
 
A
V
 
T
A
 
A
W
 
Y
D
 
D
G
 
R
T
 
R
-
 
F
-
 
G
P
 
A
A
 
A
G
 
S
H
 
R
V
 
V
A
 
Y
H
 
Q
A
 
M
A
 
A
I
 
L
L
 
L
F
 
Y
L
 
L
T
 
Y
G
 
S
Q
 
P
A
 
S
D
 
S
S
 
A
G
 
I
T
 
F
S
 
S
C
|
C
P
 
P
M
 
L
T
 
A
M
 
M
T
 
T
Y
 
D
A
 
G
A
 
A
V
 
A
P
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
E
-
 
L
-
 
Y
A
 
A
D
 
D
E
 
A
G
 
D
V
 
L
A
 
K
G
 
A
E
 
R
W
 
V
V
 
L
P
 
P
R
 
H
I
 
L
T
 
L
A
 
S
G
 
-
L
 
-
Y
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
K
A
 
T
G
 
F
V
 
W
T
 
T
I
 
A
G
 
G
M
x
Q
A
 
W
M
|
M
T
|
T
E
 
E
K
 
R
Q
 
T
G
 
G
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
V
R
 
S
A
 
G
N
 
T
T
 
S
T
 
T
R
 
D
A
 
A
E
 
H
P
 
P
-
 
F
-
 
T
-
 
G
A
 
T
G
 
S
E
 
E
A
 
F
G
 
G
-
 
A
W
 
T
Y
 
H
S
 
S
L
 
L
T
 
H
G
 
G
H
 
T
K
 
K
W
 
W
F
|
F
C
x
T
S
 
S
A
 
A
P
 
T
M
 
T
C
 
S
D
 
Q
A
 
M
F
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
 
R
A
 
P
Q
 
D
G
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
x
S
-
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
S
C
 
L
F
 
F
L
 
F
V
 
L
P
 
E
R
 
L
W
 
R
L
 
N
P
 
D
D
 
K
G
 
G
T
 
E
R
 
L
N
 
N
A
 
H
G
 
-
F
 
I
R
 
Q
V
 
I
M
 
H
R
 
R
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
G
D
 
T
R
 
K
S
 
A
N
 
L
A
 
P
S
 
T
S
 
A
E
 
E
I
 
L
E
 
S
Y
 
L
H
 
Q
G
 
G
A
 
T
L
 
P
A
 
A
Q
 
R
R
 
M
L
 
I
G
 
G
E
 
G
E
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
G
V
|
V
A
 
K
T
 
R
I
 
I
I
x
A
Q
 
S
M
 
V
V
x
L
Q
x
N
H
 
I
T
|
T
R
|
R
L
 
I
D
 
Y
C
 
N
V
 
S
I
 
I
G
 
C
S
 
A
A
 
V
Q
 
G
Q
 
H
M
 
I
R
 
R
G
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
D
Q
 
L
A
 
A
L
 
Q
W
 
D
H
 
Y
T
 
S
A
 
G
H
 
K
R
|
R
S
 
Q
A
 
A
F
|
F
Q
 
G
R
 
K
R
 
L
L
|
L
I
 
K
D
 
D
Q
x
H
P
 
P
A
 
L
M
 
H
A
 
K
A
 
S
V
 
T
L
 
L
A
 
D
D
 
S
L
 
L
A
 
E
V
 
A
E
 
D
S
 
F
E
 
R
A
 
K
A
 
C
T
 
I
V
 
A
L
 
F
G
 
S
L
 
F
R
 
F
L
 
V
A
 
A
Q
 
N
A
 
L
F
 
L
D
 
G
E
 
Q
A
 
E
D
 
E
P
 
V
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
A
-
 
S
-
 
E
-
 
K
-
 
I
V
 
L
A
 
L
R
|
R
L
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
I
A
 
L
K
 
K
Y
 
L
W
 
Y
V
 
T
C
 
A
K
 
K
R
 
K
A
 
S
P
 
I
G
 
H
L
 
I
V
 
S
Y
 
S
E
 
E
A
 
V
M
 
V
E
|
E
C
x
M
H
 
F
G
 
G
G
|
G
G
 
A
G
 
G
Y
|
Y
I
 
V
E
 
E
A
 
D
G
 
T
P
 
G
M
 
I
P
 
P
R
 
R
L
 
L
F
 
L
R
 
R
Q
 
D
S
 
A
P
 
Q
L
 
V
N
 
F
A
 
S
I
 
I
W
|
W
E
|
E
G
 
G
S
x
T
G
 
T
N
|
N
V
 
V
I
 
L
A
 
S
L
|
L
D
 
D
L
 
M
L
 
L
R
|
R
A
 
A
I
 
F
G
 
E
R
 
K
E
 
D
P
 
Q
G
 
A
G
 
G
V
 
-
E
 
Q
A
 
I
L
 
L
N
 
E
G
 
Q
F
 
F
L
 
L

6sd8X Bd2924 apo-form (see paper)
31% identity, 79% coverage: 26:454/540 of query aligns to 11:454/503 of 6sd8X

query
sites
6sd8X
N
 
N
L
 
T
F
 
F
T
 
R
G
 
S
D
 
D
R
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
D
 
K
A
 
I
V
 
L
A
 
K
R
 
S
A
 
L
G
 
L
G
 
P
A
 
A
R
 
D
H
 
A
R
 
Q
E
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
P
R
 
H
L
 
L
T
 
E
S
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
E
R
 
R
C
 
A
G
 
V
S
 
T
A
 
-
E
 
D
V
 
M
I
 
L
D
 
T
W
 
W
G
 
A
V
 
Q
E
 
E
A
 
A
N
 
E
R
 
S
N
 
Q
I
 
P
P
 
P
V
 
V
L
 
H
E
 
V
S
 
P
Y
 
F
D
 
D
R
 
P
F
 
W
G
 
G
Q
 
R
R
 
R
I
 
I
D
 
D
E
 
D
V
 
I
R
 
K
F
 
T
H
 
S
P
 
H
A
 
G
Y
 
W
H
 
K
Q
 
A
L
 
L
M
 
E
R
 
K
L
 
V
G
 
A
L
 
A
D
 
E
S
 
E
G
 
G
L
 
I
A
 
V
S
 
A
V
 
T
A
 
A
W
 
Y
D
 
D
G
 
R
T
 
R
-
 
F
-
 
G
P
 
A
A
 
A
G
 
S
H
 
R
V
 
V
A
 
Y
H
 
Q
A
 
M
A
 
A
I
 
L
L
 
L
F
 
Y
L
 
L
T
 
Y
G
 
S
Q
 
P
A
 
S
D
 
S
S
 
A
G
 
I
T
 
F
S
 
S
C
 
C
P
 
P
M
 
L
T
 
A
M
 
M
T
 
T
Y
 
D
A
 
G
A
 
A
V
 
A
P
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
E
-
 
L
-
 
Y
A
 
A
D
 
D
E
 
A
G
 
D
V
 
L
A
 
K
G
 
A
E
 
R
W
 
V
V
 
L
P
 
P
R
 
H
I
 
L
T
 
L
A
 
S
G
 
-
L
 
-
Y
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
K
A
 
T
G
 
F
V
 
W
T
 
T
I
 
A
G
 
G
M
x
Q
A
 
W
M
|
M
T
|
T
E
 
E
K
 
R
Q
 
T
G
|
G
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
V
R
 
S
A
 
G
N
 
T
T
 
S
T
 
T
R
 
D
A
 
A
E
 
H
P
 
P
-
 
F
-
 
T
-
 
G
A
 
T
G
 
S
E
 
E
A
 
F
G
 
G
-
 
A
W
 
T
Y
 
H
S
 
S
L
 
L
T
 
H
G
 
G
H
 
T
K
 
K
W
 
W
F
|
F
C
x
T
S
 
S
A
 
A
P
 
T
M
 
T
C
 
S
D
 
Q
A
 
M
F
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
 
R
A
 
P
Q
 
D
G
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
S
C
 
L
F
 
F
L
 
F
V
 
L
P
 
E
R
 
L
W
 
R
L
 
N
P
 
D
D
 
K
G
 
G
T
 
E
R
 
L
N
 
N
A
 
H
G
 
-
F
 
I
R
 
Q
V
 
I
M
 
H
R
 
R
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
G
D
 
T
R
 
K
S
 
A
N
 
L
A
 
P
S
 
T
S
 
A
E
 
E
I
 
L
E
 
S
Y
 
L
H
 
Q
G
 
G
A
 
T
L
 
P
A
 
A
Q
 
R
R
 
M
L
 
I
G
 
G
E
 
G
E
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
K
T
 
R
I
 
I
I
 
A
Q
 
S
M
 
V
V
 
L
Q
 
N
H
 
I
T
|
T
R
 
R
L
 
I
D
 
Y
C
 
N
V
 
S
I
 
I
G
 
C
S
 
A
A
 
V
Q
 
G
Q
 
H
M
 
I
R
 
R
G
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
D
Q
 
L
A
 
A
L
 
Q
W
 
D
H
 
Y
T
 
S
A
 
G
H
 
K
R
|
R
S
 
Q
A
 
A
F
|
F
Q
 
G
R
 
K
R
 
L
L
|
L
I
 
K
D
 
D
Q
x
H
P
 
P
A
 
L
M
 
H
A
 
K
A
 
S
V
 
T
L
 
L
A
 
D
D
 
S
L
 
L
A
 
E
V
 
A
E
 
D
S
 
F
E
 
R
A
 
K
A
 
C
T
 
I
V
 
A
L
 
F
G
 
S
L
 
F
R
 
F
L
 
V
A
 
A
Q
 
N
A
 
L
F
 
L
D
 
G
E
 
Q
A
 
E
D
 
E
P
 
V
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
A
-
 
S
-
 
E
-
 
K
-
 
I
V
 
L
A
 
L
R
 
R
L
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
I
A
 
L
K
 
K
Y
 
L
W
 
Y
V
 
T
C
 
A
K
 
K
R
 
K
A
 
S
P
 
I
G
 
H
L
 
I
V
 
S
Y
 
S
E
 
E
A
 
V
M
 
V
E
 
E
C
x
M
H
 
F
G
 
G
G
|
G
G
 
A
G
 
G
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
A
 
D
G
 
T
P
 
G
M
 
I
P
 
P
R
 
R
L
 
L
F
 
L
R
 
R
Q
 
D
S
 
A
P
 
Q
L
 
V
N
 
F
A
 
S
I
 
I
W
|
W
E
 
E
G
 
G
S
x
T
G
 
T
N
 
N
V
|
V
I
 
L
A
 
S
L
|
L
D
 
D
L
 
M
L
 
L
R
|
R
A
 
A
I
 
F
G
 
E
R
 
K
E
 
D
P
 
Q
G
 
A
G
 
G
V
 
-
E
 
Q
A
 
I
L
 
L
N
 
E
G
 
Q
F
 
F
L
 
L

7p9xA Structure of cyclohex-1-ene-1-carboxyl-coa dehydrogenase complexed with cyclohex-1-ene-1-carboxyl-coa (see paper)
26% identity, 66% coverage: 86:440/540 of query aligns to 28:375/378 of 7p9xA

query
sites
7p9xA
I
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
K
R
 
S
F
 
L
H
 
F
P
 
P
A
 
E
Y
 
Y
H
 
A
Q
 
R
-
 
D
-
 
L
L
 
F
M
 
A
R
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
L
S
 
N
G
 
P
L
 
L
A
 
L
S
 
P
V
 
A
A
 
A
W
 
Y
D
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
E
A
 
M
G
 
G
H
 
V
V
 
L
A
 
T
H
 
L
A
 
A
A
 
L
I
 
I
L
 
L
F
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
E
D
 
E
S
 
L
G
 
G
T
 
R
S
 
V
C
 
C
P
 
A
M
 
S
T
 
T
M
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
A
V
x
L
P
 
L
A
 
L
L
 
I
R
 
A
A
 
Q
D
 
T
E
x
D
G
 
G
V
 
M
A
 
-
G
 
-
E
 
-
W
 
-
V
 
L
P
 
P
R
 
I
I
 
I
T
 
H
A
 
G
G
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
E
L
 
L
Y
 
K
D
 
E
P
 
R
A
 
Y
S
 
L
R
 
R
P
 
R
A
 
F
A
 
A
E
 
G
K
 
E
A
 
S
G
 
T
V
 
L
T
 
L
I
 
T
G
 
A
M
 
L
A
 
A
M
x
A
T
|
T
E
 
E
K
 
P
Q
 
A
G
 
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
x
L
R
 
L
A
 
A
N
 
M
T
 
K
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
V
P
 
R
A
 
Q
G
 
G
E
 
D
A
 
K
G
 
-
W
 
-
Y
 
Y
S
 
V
L
 
I
T
 
N
G
 
G
H
 
Q
K
 
K
W
 
C
F
|
F
C
x
I
S
x
T
-
 
N
A
 
G
P
 
S
M
 
V
C
 
A
D
 
D
A
 
V
F
 
I
L
 
V
T
 
V
L
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
G
Q
 
S
G
x
K
G
 
G
L
 
I
T
 
S
C
 
A
F
 
F
L
 
V
V
 
V
P
 
E
R
 
K
W
 
G
L
 
T
P
 
P
D
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
L
R
 
V
V
 
Y
M
 
G
R
 
R
L
 
N
K
 
E
D
 
S
K
 
K
L
 
M
G
 
G
D
 
M
R
 
R
S
 
G
N
 
S
A
 
I
S
x
N
S
 
S
E
 
E
I
 
L
E
 
F
Y
 
F
H
 
E
G
 
N
A
 
M
L
 
E
A
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
E
Q
 
N
R
 
I
L
 
I
G
 
G
E
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
T
G
 
G
V
x
F
A
 
A
T
 
N
I
 
L
I
x
M
Q
 
Q
M
 
T
V
x
L
Q
 
S
H
 
T
T
 
N
R
|
R
L
 
V
D
 
F
C
 
C
V
 
A
I
 
A
G
 
Q
S
 
A
A
 
V
Q
 
G
Q
 
I
M
 
A
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
D
Q
 
I
A
 
A
L
 
V
W
 
R
H
 
H
T
 
T
A
 
Q
H
 
D
R
 
R
S
 
V
A
 
Q
F
 
F
Q
 
G
R
 
K
R
 
P
L
 
I
I
 
A
D
 
H
Q
 
L
P
 
A
A
 
P
M
 
V
A
 
Q
A
 
F
V
 
M
L
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
M
A
 
A
V
 
T
E
 
A
S
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
R
V
 
L
L
 
L
G
 
T
L
 
R
R
 
K
L
 
A
A
 
A
Q
 
E
A
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
D
A
 
G
D
 
D
P
 
K
V
 
K
A
 
A
R
 
V
L
 
L
L
 
Y
T
 
G
P
 
S
I
 
M
A
 
A
K
 
K
Y
 
T
W
 
M
V
 
A
C
 
S
K
 
D
R
 
T
A
 
A
P
 
M
G
 
R
L
 
V
V
 
T
Y
 
T
E
 
D
A
 
A
M
 
V
E
 
Q
C
 
V
H
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
S
G
 
G
Y
 
Y
I
 
M
E
 
K
A
 
E
G
 
N
P
 
G
M
 
V
P
 
E
R
 
R
L
 
M
F
 
M
R
 
R
Q
 
D
S
 
A
P
 
K
L
|
L
N
 
T
A
 
Q
I
 
I
W
x
Y
E
x
T
G
|
G
S
x
T
G
 
N
N
x
Q
V
x
I
I
 
T
A
 
R
L
 
M
D
 
V
L
 
T
L
 
G
R
|
R
A
 
A
I
 
L

7p9aA Structure of cyclohex-1-ene-1-carboxyl-coa dehydrogenase complexed with cyclohex-1,5-diene-1-carboxyl-coa (see paper)
26% identity, 66% coverage: 86:440/540 of query aligns to 30:377/380 of 7p9aA

query
sites
7p9aA
I
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
K
R
 
S
F
 
L
H
 
F
P
 
P
A
 
E
Y
 
Y
H
 
A
Q
 
R
-
 
D
-
 
L
L
 
F
M
 
A
R
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
L
S
 
N
G
 
P
L
 
L
A
 
L
S
 
P
V
 
A
A
 
A
W
 
Y
D
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
E
A
 
M
G
 
G
H
 
V
V
 
L
A
 
T
H
 
L
A
 
A
A
 
L
I
 
I
L
 
L
F
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
E
D
 
E
S
 
L
G
 
G
T
 
R
S
 
V
C
 
C
P
 
A
M
 
S
T
 
T
M
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
A
V
 
L
P
 
L
A
 
L
L
 
I
R
 
A
A
 
Q
D
 
T
E
 
D
G
 
G
V
 
M
A
 
-
G
 
-
E
 
-
W
 
-
V
 
L
P
 
P
R
 
I
I
 
I
T
 
H
A
 
G
G
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
E
L
 
L
Y
 
K
D
 
E
P
 
R
A
 
Y
S
 
L
R
 
R
P
 
R
A
 
F
A
 
A
E
 
G
K
 
E
A
 
S
G
 
T
V
 
L
T
 
L
I
 
T
G
 
A
M
x
L
A
 
A
M
x
A
T
|
T
E
 
E
K
 
P
Q
 
A
G
 
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
x
L
R
 
L
A
 
A
N
 
M
T
 
K
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
V
P
 
R
A
 
Q
G
 
G
E
 
D
A
 
K
G
 
-
W
 
-
Y
 
Y
S
 
V
L
 
I
T
 
N
G
 
G
H
 
Q
K
 
K
W
 
C
F
|
F
C
x
I
S
x
T
-
 
N
A
 
G
P
 
S
M
 
V
C
 
A
D
 
D
A
 
V
F
 
I
L
 
V
T
 
V
L
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
G
Q
 
S
G
x
K
G
 
G
L
 
I
T
 
S
C
 
A
F
 
F
L
 
V
V
 
V
P
 
E
R
 
K
W
 
G
L
 
T
P
 
P
D
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
L
R
 
V
V
 
Y
M
 
G
R
 
R
L
 
N
K
 
E
D
 
S
K
|
K
L
 
M
G
 
G
D
 
M
R
 
R
S
 
G
N
 
S
A
 
I
S
x
N
S
 
S
E
 
E
I
 
L
E
 
F
Y
 
F
H
 
E
G
 
N
A
 
M
L
 
E
A
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
E
Q
 
N
R
 
I
L
 
I
G
 
G
E
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
T
G
 
G
V
x
F
A
 
A
T
 
N
I
 
L
I
x
M
Q
 
Q
M
 
T
V
x
L
Q
 
S
H
 
T
T
x
N
R
|
R
L
 
V
D
 
F
C
 
C
V
 
A
I
 
A
G
 
Q
S
 
A
A
 
V
Q
 
G
Q
 
I
M
 
A
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
D
Q
 
I
A
 
A
L
 
V
W
 
R
H
 
H
T
 
T
A
 
Q
H
 
D
R
 
R
S
 
V
A
 
Q
F
 
F
Q
 
G
R
 
K
R
 
P
L
 
I
I
 
A
D
 
H
Q
 
L
P
 
A
A
 
P
M
 
V
A
 
Q
A
 
F
V
 
M
L
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
M
A
 
A
V
 
T
E
 
A
S
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
R
V
 
L
L
 
L
G
 
T
L
 
R
R
 
K
L
 
A
A
 
A
Q
 
E
A
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
D
A
 
G
D
 
D
P
 
K
V
 
K
A
 
A
R
 
V
L
 
L
L
 
Y
T
 
G
P
 
S
I
 
M
A
 
A
K
 
K
Y
 
T
W
 
M
V
 
A
C
 
S
K
 
D
R
 
T
A
 
A
P
 
M
G
 
R
L
 
V
V
 
T
Y
 
T
E
 
D
A
 
A
M
 
V
E
 
Q
C
 
V
H
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
S
G
 
G
Y
 
Y
I
 
M
E
 
K
A
 
E
G
 
N
P
 
G
M
 
V
P
 
E
R
 
R
L
 
M
F
 
M
R
 
R
Q
 
D
S
 
A
P
 
K
L
|
L
N
 
T
A
 
Q
I
 
I
W
x
Y
E
x
T
G
|
G
S
x
T
G
 
N
N
x
Q
V
x
I
I
 
T
A
 
R
L
 
M
D
 
V
L
 
T
L
 
G
R
|
R
A
 
A
I
 
L

Q39QF5 Cyclohex-1-ene-1-carbonyl-CoA dehydrogenase; CHeneCoA dehydrogenase; EC 1.3.8.10 from Geobacter metallireducens (strain ATCC 53774 / DSM 7210 / GS-15) (see paper)
26% identity, 66% coverage: 86:440/540 of query aligns to 30:377/380 of Q39QF5

query
sites
Q39QF5
I
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
K
R
 
S
F
 
L
H
 
F
P
 
P
A
 
E
Y
 
Y
H
 
A
Q
 
R
-
 
D
-
 
L
L
 
F
M
 
A
R
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
L
S
 
N
G
 
P
L
 
L
A
 
L
S
 
P
V
 
A
A
 
A
W
 
Y
D
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
E
A
 
M
G
 
G
H
 
V
V
 
L
A
 
T
H
 
L
A
 
A
A
 
L
I
 
I
L
 
L
F
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
E
D
 
E
S
 
L
G
 
G
T
 
R
S
 
V
C
 
C
P
 
A
M
 
S
T
 
T
M
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
A
V
 
L
P
 
L
A
 
L
L
 
I
R
 
A
A
 
Q
D
 
T
E
x
D
G
 
G
V
 
M
A
 
-
G
 
-
E
 
-
W
 
-
V
 
L
P
 
P
R
 
I
I
 
I
T
 
H
A
 
G
G
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
E
L
 
L
Y
 
K
D
 
E
P
 
R
A
 
Y
S
 
L
R
 
R
P
 
R
A
 
F
A
 
A
E
 
G
K
 
E
A
 
S
G
 
T
V
 
L
T
 
L
I
 
T
G
 
A
M
x
L
A
 
A
M
x
A
T
|
T
E
 
E
K
 
P
Q
 
A
G
 
A
G
 
G
S
|
S
D
 
D
V
 
L
R
 
L
A
 
A
N
 
M
T
 
K
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
V
P
 
R
A
 
Q
G
 
G
E
 
D
A
 
K
G
 
-
W
 
-
Y
 
Y
S
 
V
L
 
I
T
 
N
G
 
G
H
 
Q
K
 
K
W
 
C
F
 
F
C
 
I
S
x
T
-
 
N
A
 
G
P
 
S
M
 
V
C
 
A
D
 
D
A
 
V
F
 
I
L
 
V
T
 
V
L
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
G
Q
 
S
G
x
K
G
 
G
L
 
I
T
 
S
C
 
A
F
 
F
L
 
V
V
 
V
P
 
E
R
 
K
W
 
G
L
 
T
P
 
P
D
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
L
R
 
V
V
 
Y
M
 
G
R
 
R
L
 
N
K
 
E
D
 
S
K
 
K
L
 
M
G
 
G
D
 
M
R
 
R
S
 
G
N
 
S
A
 
I
S
 
N
S
 
S
E
 
E
I
 
L
E
 
F
Y
 
F
H
 
E
G
 
N
A
 
M
L
 
E
A
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
E
Q
 
N
R
 
I
L
 
I
G
 
G
E
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
T
G
 
G
V
 
F
A
 
A
T
 
N
I
 
L
I
 
M
Q
 
Q
M
 
T
V
 
L
Q
 
S
H
 
T
T
x
N
R
|
R
L
 
V
D
 
F
C
 
C
V
 
A
I
 
A
G
 
Q
S
 
A
A
 
V
Q
 
G
Q
 
I
M
 
A
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
D
Q
 
I
A
 
A
L
 
V
W
 
R
H
 
H
T
 
T
A
 
Q
H
 
D
R
 
R
S
 
V
A
 
Q
F
 
F
Q
 
G
R
 
K
R
 
P
L
 
I
I
 
A
D
 
H
Q
 
L
P
 
A
A
 
P
M
 
V
A
 
Q
A
 
F
V
 
M
L
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
M
A
 
A
V
 
T
E
 
A
S
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
R
V
 
L
L
 
L
G
 
T
L
 
R
R
 
K
L
 
A
A
 
A
Q
 
E
A
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
D
A
 
G
D
 
D
P
 
K
V
 
K
A
 
A
R
 
V
L
 
L
L
 
Y
T
 
G
P
 
S
I
 
M
A
 
A
K
 
K
Y
 
T
W
 
M
V
 
A
C
 
S
K
 
D
R
 
T
A
 
A
P
 
M
G
 
R
L
 
V
V
 
T
Y
 
T
E
 
D
A
 
A
M
 
V
E
 
Q
C
 
V
H
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
S
G
 
G
Y
 
Y
I
 
M
E
 
K
A
 
E
G
 
N
P
 
G
M
 
V
P
 
E
R
 
R
L
 
M
F
 
M
R
 
R
Q
 
D
S
 
A
P
 
K
L
 
L
N
 
T
A
 
Q
I
 
I
W
 
Y
E
x
T
G
 
G
S
x
T
G
 
N
N
x
Q
V
 
I
I
 
T
A
 
R
L
 
M
D
 
V
L
 
T
L
 
G
R
|
R
A
 
A
I
 
L

1ukwB Crystal structure of medium-chain acyl-coa dehydrogenase from thermus thermophilus hb8
29% identity, 49% coverage: 174:440/540 of query aligns to 111:376/379 of 1ukwB

query
sites
1ukwB
R
 
R
P
 
P
A
 
L
A
 
T
E
 
E
K
 
K
A
 
P
G
 
A
V
 
L
T
 
A
I
 
-
G
 
A
M
x
F
A
 
A
M
x
L
T
x
S
E
 
E
K
 
P
Q
 
G
G
 
N
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
A
R
 
A
A
 
A
N
 
L
T
 
K
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
I
P
 
R
A
 
Q
G
 
G
E
x
D
A
 
-
G
 
-
W
x
H
Y
 
Y
S
 
V
L
 
L
T
 
N
G
 
G
H
 
T
K
 
K
-
 
M
W
|
W
F
 
I
C
x
S
S
 
N
A
 
G
P
 
G
M
 
E
C
 
A
D
 
E
A
 
W
F
 
V
L
 
V
T
 
V
L
 
F
A
 
A
Y
 
T
A
 
V
-
 
N
-
 
P
-
 
E
-
 
L
-
 
R
Q
 
H
G
 
K
G
 
G
L
 
V
T
 
V
C
 
A
F
 
L
L
 
V
V
 
V
P
 
E
R
 
R
W
 
G
L
 
T
P
 
P
D
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
F
R
 
K
V
 
A
M
 
I
R
 
K
L
 
I
K
 
H
D
 
G
K
|
K
L
 
M
G
 
G
D
 
Q
R
 
R
S
 
A
N
 
S
A
 
G
S
 
T
S
 
Y
E
 
E
I
 
L
E
 
V
Y
 
F
H
 
E
G
 
D
A
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
P
L
 
V
A
 
E
Q
 
N
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
E
G
 
G
V
 
F
A
 
K
T
 
I
I
 
A
I
 
M
Q
 
Q
M
 
T
V
 
L
Q
 
N
H
 
K
T
|
T
R
 
R
L
 
I
D
 
P
C
 
V
V
 
A
I
 
A
G
 
G
S
 
S
A
 
V
Q
 
G
Q
 
V
M
 
A
R
 
R
G
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
D
Q
 
E
A
 
A
L
 
R
W
 
K
H
 
Y
T
 
A
A
 
K
H
 
E
R
 
R
S
 
E
A
 
A
F
 
F
Q
 
G
R
 
E
R
 
P
L
 
I
I
 
A
D
 
N
Q
 
F
P
 
Q
A
 
A
M
 
I
A
 
Q
A
 
F
V
 
K
L
 
L
A
 
V
D
 
D
L
 
M
A
 
L
V
 
I
E
 
G
S
 
I
E
 
E
A
 
T
A
 
A
T
 
R
V
 
M
L
 
Y
G
 
T
L
 
Y
R
 
Y
L
 
A
A
 
A
Q
 
W
A
 
L
F
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
G
D
 
L
P
 
P
V
 
H
A
 
A
R
 
H
L
 
-
L
 
A
T
 
S
P
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
Y
 
A
W
 
Y
V
 
A
C
 
S
K
 
E
R
 
I
A
 
A
P
 
F
G
 
E
L
 
A
V
 
A
Y
 
N
E
 
Q
A
 
A
M
 
I
E
 
Q
C
 
I
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
I
 
V
E
 
R
A
 
E
G
 
F
P
 
P
M
 
V
P
 
E
R
 
K
L
 
L
F
 
L
R
 
R
Q
 
D
S
 
V
P
 
K
L
|
L
N
 
N
A
 
Q
I
 
I
W
x
Y
E
|
E
G
 
G
S
x
T
G
 
N
N
x
E
V
 
I
I
 
Q
A
 
R
L
|
L
D
 
I
L
 
I
L
 
A
R
|
R
A
 
H
I
 
I

1ukwA Crystal structure of medium-chain acyl-coa dehydrogenase from thermus thermophilus hb8
29% identity, 49% coverage: 174:440/540 of query aligns to 111:376/379 of 1ukwA

query
sites
1ukwA
R
 
R
P
 
P
A
 
L
A
 
T
E
 
E
K
 
K
A
 
P
G
 
A
V
 
L
T
 
A
I
 
-
G
 
A
M
x
F
A
 
A
M
x
L
T
x
S
E
 
E
K
 
P
Q
 
G
G
 
N
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
A
R
 
A
A
 
A
N
 
L
T
 
K
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
I
P
 
R
A
 
Q
G
 
G
E
 
D
A
 
-
G
 
-
W
 
H
Y
 
Y
S
 
V
L
 
L
T
 
N
G
 
G
H
 
T
K
 
K
-
 
M
W
|
W
F
 
I
C
x
S
S
 
N
A
 
G
P
 
G
M
 
E
C
 
A
D
 
E
A
 
W
F
 
V
L
 
V
T
 
V
L
 
F
A
 
A
Y
 
T
A
 
V
-
 
N
-
 
P
-
 
E
-
 
L
-
 
R
Q
 
H
G
 
K
G
 
G
L
 
V
T
 
V
C
 
A
F
 
L
L
 
V
V
 
V
P
 
E
R
 
R
W
 
G
L
 
T
P
 
P
D
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
F
R
 
K
V
 
A
M
 
I
R
 
K
L
 
I
K
 
H
D
 
G
K
 
K
L
 
M
G
 
G
D
 
Q
R
 
R
S
 
A
N
 
S
A
 
G
S
 
T
S
 
Y
E
 
E
I
 
L
E
 
V
Y
 
F
H
 
E
G
 
D
A
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
P
L
 
V
A
 
E
Q
 
N
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
E
G
 
G
V
 
F
A
 
K
T
 
I
I
 
A
I
 
M
Q
 
Q
M
 
T
V
 
L
Q
 
N
H
 
K
T
|
T
R
 
R
L
 
I
D
 
P
C
 
V
V
 
A
I
 
A
G
 
G
S
 
S
A
 
V
Q
 
G
Q
 
V
M
 
A
R
 
R
G
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
D
Q
 
E
A
 
A
L
 
R
W
 
K
H
 
Y
T
 
A
A
 
K
H
 
E
R
 
R
S
 
E
A
 
A
F
 
F
Q
 
G
R
 
E
R
 
P
L
 
I
I
 
A
D
 
N
Q
 
F
P
 
Q
A
 
A
M
 
I
A
 
Q
A
 
F
V
 
K
L
 
L
A
 
V
D
 
D
L
 
M
A
 
L
V
 
I
E
 
G
S
 
I
E
 
E
A
 
T
A
 
A
T
 
R
V
 
M
L
 
Y
G
 
T
L
 
Y
R
 
Y
L
 
A
A
 
A
Q
 
W
A
 
L
F
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
G
D
 
L
P
 
P
V
 
H
A
 
A
R
 
H
L
 
-
L
 
A
T
 
S
P
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
Y
 
A
W
 
Y
V
 
A
C
 
S
K
 
E
R
 
I
A
 
A
P
 
F
G
 
E
L
 
A
V
 
A
Y
 
N
E
 
Q
A
 
A
M
 
I
E
 
Q
C
 
I
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
I
 
V
E
 
R
A
 
E
G
 
F
P
 
P
M
 
V
P
 
E
R
 
K
L
 
L
F
 
L
R
 
R
Q
 
D
S
 
V
P
 
K
L
|
L
N
 
N
A
 
Q
I
 
I
W
x
Y
E
|
E
G
 
G
S
x
T
G
 
N
N
x
E
V
 
I
I
 
Q
A
 
R
L
|
L
D
 
I
L
 
I
L
 
A
R
|
R
A
 
H
I
 
I

1ivhA Structure of human isovaleryl-coa dehydrogenase at 2.6 angstroms resolution: structural basis for substrate specificity (see paper)
26% identity, 64% coverage: 95:440/540 of query aligns to 47:384/387 of 1ivhA

query
sites
1ivhA
Y
 
W
H
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
G
R
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
V
D
 
L
S
 
G
G
 
I
L
 
T
A
 
A
S
 
P
V
 
V
A
 
Q
W
 
Y
D
 
G
G
 
G
T
 
S
P
 
G
A
 
L
G
 
G
H
 
Y
V
 
L
A
 
E
H
 
H
A
 
V
A
 
L
I
 
V
L
 
M
F
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
Q
 
E
A
 
E
D
 
I
S
 
S
G
 
R
T
 
A
S
 
S
C
 
G
P
 
A
M
 
V
T
 
G
M
 
L
T
 
S
Y
 
Y
A
 
G
A
 
A
V
 
H
P
 
S
A
 
N
L
 
L
-
 
C
-
 
I
-
 
N
-
 
Q
-
 
L
-
 
V
-
 
R
R
 
N
A
 
G
D
 
N
E
 
E
G
 
A
V
 
Q
A
 
K
G
 
E
E
 
K
W
 
Y
V
 
L
P
 
P
R
 
K
I
 
L
T
 
I
A
 
S
G
 
G
L
 
E
Y
 
Y
D
 
I
P
 
G
A
 
A
S
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
M
x
L
A
 
A
M
|
M
T
x
S
E
 
E
K
 
P
Q
 
N
G
 
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
V
R
 
V
A
 
S
N
 
M
T
 
K
T
 
L
R
 
K
A
 
A
E
 
E
P
 
K
A
 
K
G
 
G
E
 
N
A
 
-
G
 
-
W
 
H
Y
 
Y
S
 
I
L
 
L
T
 
N
G
 
G
H
 
N
K
 
K
-
 
F
W
|
W
F
 
I
C
x
T
S
 
N
A
 
G
P
 
P
M
 
D
C
 
A
D
 
D
A
 
V
F
 
L
L
 
I
T
 
V
L
 
Y
A
 
A
Y
 
K
-
 
T
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
P
A
 
A
Q
x
S
G
x
R
G
 
G
L
 
I
T
 
T
C
 
A
F
 
F
L
 
I
V
 
V
P
 
E
R
 
K
W
 
G
L
 
M
P
 
P
D
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
F
R
 
S
V
 
T
M
 
S
R
 
K
L
 
K
K
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
G
D
 
M
R
 
R
S
 
G
N
 
S
A
 
N
S
 
T
S
 
C
E
 
E
I
 
L
E
 
I
Y
 
F
H
 
E
G
 
D
A
 
C
L
 
K
-
 
I
-
 
P
-
 
A
A
 
A
Q
 
N
R
 
I
L
 
L
G
 
G
E
 
H
E
 
E
G
 
N
R
 
K
G
 
G
V
|
V
A
x
Y
T
 
V
I
 
L
I
x
M
Q
 
S
M
 
G
V
 
L
Q
 
D
H
 
L
T
x
E
R
|
R
L
 
L
D
 
V
C
 
L
V
 
A
I
 
G
G
 
G
S
 
P
A
 
L
Q
 
G
Q
 
L
M
 
M
R
 
Q
G
 
A
A
 
V
L
 
L
A
 
D
Q
 
H
A
 
T
L
 
I
W
 
P
H
 
Y
T
 
L
A
 
H
H
 
V
R
|
R
S
 
E
A
 
A
F
|
F
Q
 
G
R
 
Q
R
 
K
L
 
I
I
 
G
D
 
H
Q
x
F
P
 
Q
A
 
L
M
|
M
A
 
Q
A
 
G
V
 
K
L
 
M
A
 
A
D
 
D
L
 
M
A
 
Y
V
 
T
E
 
R
S
 
L
E
 
M
A
 
A
A
 
C
T
 
R
V
 
Q
L
 
Y
G
 
V
L
 
Y
R
 
N
L
 
V
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
F
 
C
D
 
D
E
 
E
A
 
G
D
 
H
P
 
C
V
 
T
A
 
A
R
 
K
L
 
D
L
 
C
T
 
A
P
 
G
I
 
V
A
 
I
K
 
L
Y
 
Y
W
 
S
V
 
A
C
 
-
K
 
E
R
 
C
A
 
A
P
 
T
G
 
Q
L
 
V
V
 
A
Y
 
L
E
 
D
A
 
G
M
 
I
E
x
Q
C
|
C
H
 
F
G
 
G
G
|
G
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
E
 
N
A
 
D
G
 
F
P
 
P
M
 
M
P
 
G
R
 
R
L
 
F
F
 
L
R
 
R
Q
 
D
S
 
A
P
 
K
L
 
L
N
 
Y
A
 
E
I
 
I
W
x
G
E
x
A
G
|
G
S
x
T
G
 
S
N
x
E
V
|
V
I
 
R
A
 
R
L
 
L
D
 
V
L
 
I
L
 
G
R
|
R
A
 
A
I
 
F

8sgrA Human liver mitochondrial isovaleryl-coa dehydrogenase (see paper)
26% identity, 64% coverage: 95:440/540 of query aligns to 51:388/393 of 8sgrA

query
sites
8sgrA
Y
 
W
H
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
G
R
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
V
D
 
L
S
 
G
G
 
I
L
 
T
A
 
A
S
 
P
V
 
V
A
 
Q
W
 
Y
D
 
G
G
 
G
T
 
S
P
 
G
A
 
L
G
 
G
H
 
Y
V
 
L
A
 
E
H
 
H
A
 
V
A
 
L
I
 
V
L
 
M
F
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
Q
 
E
A
 
E
D
 
I
S
 
S
G
 
R
T
 
A
S
 
S
C
 
G
P
 
A
M
 
V
T
 
G
M
 
L
T
 
S
Y
 
Y
A
 
G
A
 
A
V
 
H
P
 
S
A
 
N
L
 
L
-
 
C
-
 
I
-
 
N
-
 
Q
-
 
L
-
 
V
-
 
R
R
 
N
A
 
G
D
 
N
E
 
E
G
 
A
V
 
Q
A
 
K
G
 
E
E
 
K
W
 
Y
V
 
L
P
 
P
R
 
K
I
 
L
T
 
I
A
 
S
G
 
G
L
 
E
Y
 
Y
D
 
I
P
 
G
A
 
A
S
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
L
A
 
A
M
 
M
T
x
S
E
 
E
K
 
P
Q
 
N
G
 
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
V
R
 
V
A
 
S
N
 
M
T
 
K
T
 
L
R
 
K
A
 
A
E
 
E
P
 
K
A
 
K
G
 
G
E
 
N
A
 
-
G
 
-
W
 
H
Y
 
Y
S
 
I
L
 
L
T
 
N
G
 
G
H
 
N
K
 
K
-
 
F
W
|
W
F
 
I
C
x
T
S
 
N
A
 
G
P
 
P
M
 
D
C
 
A
D
 
D
A
 
V
F
 
L
L
 
I
T
 
V
L
 
Y
A
 
A
Y
 
K
-
 
T
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
P
A
 
A
Q
 
S
G
 
R
G
 
G
L
 
I
T
 
T
C
 
A
F
 
F
L
 
I
V
 
V
P
 
E
R
 
K
W
 
G
L
 
M
P
 
P
D
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
F
R
 
S
V
 
T
M
 
S
R
 
K
L
 
K
K
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
G
D
 
M
R
 
R
S
 
G
N
 
S
A
 
N
S
 
T
S
 
C
E
 
E
I
 
L
E
 
I
Y
 
F
H
 
E
G
 
D
A
 
C
L
 
K
-
 
I
-
 
P
-
 
A
A
 
A
Q
 
N
R
 
I
L
 
L
G
 
G
E
 
H
E
 
E
G
 
N
R
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
Y
T
 
V
I
 
L
I
 
M
Q
 
S
M
 
G
V
 
L
Q
 
D
H
 
L
T
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
V
C
 
L
V
 
A
I
 
G
G
 
G
S
 
P
A
 
L
Q
 
G
Q
 
L
M
 
M
R
 
Q
G
 
A
A
 
V
L
 
L
A
 
D
Q
 
H
A
 
T
L
 
I
W
 
P
H
 
Y
T
 
L
A
 
H
H
 
V
R
|
R
S
 
E
A
 
A
F
|
F
Q
 
G
R
 
Q
R
 
K
L
x
I
I
 
G
D
 
H
Q
x
F
P
 
Q
A
 
L
M
 
M
A
 
Q
A
 
G
V
 
K
L
 
M
A
 
A
D
 
D
L
 
M
A
 
Y
V
 
T
E
 
R
S
 
L
E
 
M
A
 
A
A
 
C
T
 
R
V
 
Q
L
 
Y
G
 
V
L
 
Y
R
 
N
L
 
V
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
F
 
C
D
 
D
E
 
E
A
 
G
D
 
H
P
 
C
V
 
T
A
 
A
R
 
K
L
 
D
L
 
C
T
 
A
P
 
G
I
 
V
A
 
I
K
 
L
Y
 
Y
W
 
S
V
 
A
C
 
-
K
 
E
R
 
C
A
 
A
P
 
T
G
 
Q
L
 
V
V
 
A
Y
 
L
E
 
D
A
 
G
M
 
I
E
x
Q
C
|
C
H
 
F
G
 
G
G
|
G
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
E
 
N
A
 
D
G
 
F
P
 
P
M
 
M
P
 
G
R
 
R
L
 
F
F
 
L
R
 
R
Q
 
D
S
 
A
P
 
K
L
|
L
N
 
Y
A
 
E
I
 
I
W
 
G
E
 
A
G
|
G
S
x
T
G
 
S
N
 
E
V
 
V
I
 
R
A
 
R
L
|
L
D
 
V
L
 
I
L
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
F

P26440 Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial; IVD; Butyryl-CoA dehydrogenase; EC 1.3.8.4; EC 1.3.8.1 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
26% identity, 64% coverage: 95:440/540 of query aligns to 84:421/426 of P26440

query
sites
P26440
Y
 
W
H
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
G
R
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
V
D
 
L
S
 
G
G
 
I
L
 
T
A
 
A
S
 
P
V
 
V
A
 
Q
W
 
Y
D
 
G
G
 
G
T
 
S
P
 
G
A
 
L
G
 
G
H
 
Y
V
 
L
A
 
E
H
 
H
A
 
V
A
 
L
I
 
V
L
 
M
F
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
Q
 
E
A
 
E
D
 
I
S
 
S
G
 
R
T
 
A
S
 
S
C
 
G
P
 
A
M
 
V
T
 
G
M
 
L
T
 
S
Y
 
Y
A
 
G
A
 
A
V
 
H
P
 
S
A
 
N
L
 
L
-
 
C
-
 
I
-
 
N
-
 
Q
-
 
L
-
 
V
-
 
R
R
 
N
A
 
G
D
 
N
E
 
E
G
 
A
V
 
Q
A
 
K
G
 
E
E
 
K
W
 
Y
V
 
L
P
 
P
R
 
K
I
 
L
T
 
I
A
 
S
G
 
G
L
 
E
Y
 
Y
D
 
I
P
 
G
A
 
A
S
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
M
x
L
A
|
A
M
|
M
T
x
S
E
|
E
K
x
P
Q
x
N
G
x
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
V
R
 
V
A
 
S
N
 
M
T
 
K
T
 
L
R
 
K
A
 
A
E
 
E
P
 
K
A
 
K
G
 
G
E
 
N
A
 
-
G
 
-
W
 
H
Y
 
Y
S
 
I
L
 
L
T
 
N
G
 
G
H
 
N
K
 
K
-
 
F
W
|
W
F
x
I
C
x
T
S
 
N
A
 
G
P
 
P
M
 
D
C
 
A
D
 
D
A
 
V
F
 
L
L
 
I
T
 
V
L
 
Y
A
 
A
Y
 
K
-
 
T
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
P
A
 
A
Q
x
S
G
x
R
G
 
G
L
 
I
T
 
T
C
 
A
F
 
F
L
 
I
V
 
V
P
 
E
R
 
K
W
 
G
L
 
M
P
 
P
D
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
F
R
 
S
V
 
T
M
 
S
R
 
K
L
 
K
K
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
G
D
 
M
R
 
R
S
x
G
N
 
S
A
 
N
S
 
T
S
 
C
E
 
E
I
 
L
E
 
I
Y
 
F
H
 
E
G
 
D
A
 
C
L
 
K
-
 
I
-
 
P
-
 
A
A
 
A
Q
 
N
R
 
I
L
 
L
G
 
G
E
 
H
E
 
E
G
 
N
R
 
K
G
 
G
V
 
V
A
x
Y
T
 
V
I
 
L
I
 
M
Q
 
S
M
 
G
V
 
L
Q
x
D
H
x
L
T
x
E
R
|
R
L
 
L
D
 
V
C
 
L
V
x
A
I
 
G
G
 
G
S
 
P
A
 
L
Q
 
G
Q
 
L
M
 
M
R
 
Q
G
 
A
A
 
V
L
 
L
A
 
D
Q
 
H
A
 
T
L
 
I
W
 
P
H
 
Y
T
 
L
A
 
H
H
 
V
R
|
R
S
 
E
A
 
A
F
 
F
Q
 
G
R
 
Q
R
 
K
L
 
I
I
 
G
D
 
H
Q
 
F
P
x
Q
A
 
L
M
 
M
A
 
Q
A
 
G
V
 
K
L
 
M
A
 
A
D
 
D
L
 
M
A
 
Y
V
 
T
E
 
R
S
 
L
E
 
M
A
 
A
A
 
C
T
 
R
V
 
Q
L
 
Y
G
 
V
L
 
Y
R
 
N
L
 
V
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
F
 
C
D
 
D
E
 
E
A
 
G
D
 
H
P
 
C
V
 
T
A
 
A
R
 
K
L
 
D
L
 
C
T
 
A
P
 
G
I
 
V
A
 
I
K
 
L
Y
 
Y
W
 
-
V
 
S
C
 
A
K
 
E
R
 
C
A
 
A
P
 
T
G
 
Q
L
 
V
V
 
A
Y
 
L
E
 
D
A
 
G
M
x
I
E
x
Q
C
|
C
H
x
F
G
|
G
G
|
G
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
E
 
N
A
 
D
G
 
F
P
 
P
M
 
M
P
 
G
R
 
R
L
 
F
F
 
L
R
|
R
Q
 
D
S
 
A
P
 
K
L
 
L
N
x
Y
A
 
E
I
 
I
W
 
G
E
x
A
G
|
G
S
x
T
G
x
S
N
x
E
V
 
V
I
 
R
A
 
R
L
 
L
D
 
V
L
 
I
L
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
F

Sites not aligning to the query:

A3SI50 3-methylmercaptopropionyl-CoA dehydrogenase; MMPA-CoA dehydrogenase; EC 1.3.99.41 from Roseovarius nubinhibens (strain ATCC BAA-591 / DSM 15170 / ISM) (see paper)
27% identity, 48% coverage: 186:445/540 of query aligns to 161:455/591 of A3SI50

query
sites
A3SI50
M
|
M
A
 
N
M
 
L
T
 
T
E
 
E
K
 
P
Q
 
H
G
 
C
G
 
G
S
x
T
D
 
D
V
 
L
R
 
G
A
 
L
N
 
M
T
 
R
T
 
S
R
 
K
A
 
A
E
 
V
P
 
P
A
 
Q
G
 
D
E
 
D
A
 
-
G
 
G
W
 
S
Y
 
Y
S
 
A
L
 
I
T
 
S
G
 
G
H
 
Q
K
 
K
W
 
I
F
|
F
C
 
I
S
|
S
A
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
H
P
 
D
M
 
M
C
 
A
D
 
E
A
 
N
F
 
I
L
 
I
T
 
H
L
 
L
A
 
V
Y
 
L
A
 
A
Q
 
K
-
 
I
-
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
G
-
 
I
G
x
K
G
 
G
L
 
V
T
 
S
C
 
L
F
 
F
L
 
I
V
 
V
P
 
P
R
 
K
W
 
F
L
 
L
P
 
V
D
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
L
G
 
G
T
 
E
R
 
R
N
 
N
A
 
-
G
 
G
F
 
V
R
 
K
V
 
C
M
 
S
R
 
K
L
 
I
K
 
E
D
 
E
K
 
K
L
 
M
G
 
G
D
 
I
R
 
H
S
 
G
N
 
N
A
 
S
S
 
T
S
 
C
E
 
V
I
 
M
E
 
D
Y
 
Y
H
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
K
A
 
G
Q
 
W
R
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
E
E
 
E
G
x
H
R
x
K
G
 
G
V
 
M
A
x
R
T
 
A
I
 
M
I
x
F
Q
 
T
M
 
M
V
 
M
Q
 
N
H
 
E
T
 
A
R
 
R
L
 
I
D
 
G
C
 
V
V
 
G
I
 
M
G
 
Q
S
 
G
A
 
L
Q
 
A
Q
 
Q
M
 
A
R
 
E
G
 
V
A
 
A
L
 
Y
A
 
Q
Q
 
N
A
 
A
L
 
L
W
 
D
H
 
Y
T
 
A
A
 
-
H
 
-
R
 
R
S
 
D
A
 
R
F
 
L
Q
 
Q
R
 
G
R
 
R
-
 
S
-
 
V
-
 
T
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
G
-
 
P
-
 
A
-
 
D
-
 
P
L
 
L
I
 
I
D
 
V
Q
 
H
P
 
P
A
 
D
M
 
I
A
 
R
A
 
R
V
 
N
L
 
L
A
 
L
D
 
D
L
 
Q
A
 
K
V
 
S
E
 
F
S
 
I
E
 
E
A
 
G
A
 
A
T
 
R
V
 
A
L
 
F
G
 
L
L
 
L
R
 
W
L
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
M
F
 
I
D
 
D
E
 
R
A
 
A
D
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
H
P
 
G
V
 
M
A
 
V
R
 
S
L
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
A
 
I
K
 
K
Y
 
G
W
 
F
V
 
L
C
 
T
K
 
D
R
 
E
A
 
G
P
 
Y
G
 
D
L
 
M
V
 
T
Y
 
V
E
 
Q
A
 
A
M
 
Q
E
 
Q
C
 
V
H
 
Y
G
 
G
G
 
G
G
 
H
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
A
 
E
G
 
T
P
 
G
M
 
M
P
 
S
R
 
Q
L
 
F
F
 
T
R
 
R
Q
 
D
S
 
A
P
 
R
L
 
I
N
 
A
A
 
M
I
 
I
W
x
Y
E
|
E
G
 
G
S
 
A
G
 
N
N
 
G
V
 
V
I
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
V
-
 
G
R
|
R
A
 
K
I
 
L
G
 
A
R
 
Q
E
 
D
P
 
G
G
 
G

6fahD Molecular basis of the flavin-based electron-bifurcating caffeyl-coa reductase reaction (see paper)
27% identity, 46% coverage: 184:431/540 of query aligns to 120:367/379 of 6fahD

query
sites
6fahD
I
 
L
G
 
A
M
x
F
A
 
A
M
x
L
T
|
T
E
 
E
K
 
P
Q
 
G
G
 
A
G
 
G
S
 
S
D
 
D
V
 
A
R
 
G
A
 
G
N
 
M
T
 
S
T
 
T
R
 
T
A
 
A
E
 
V
P
 
D
A
 
M
G
 
G
E
 
D
A
 
-
G
 
-
W
 
Y
Y
 
Y
S
 
L
L
 
L
T
 
N
G
 
G
H
x
R
K
 
K
W
 
T
F
|
F
C
 
I
S
x
T
-
 
M
A
 
A
P
 
P
M
 
L
C
 
C
D
 
D
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
I
-
 
Y
A
 
A
F
 
K
L
 
T
T
 
D
L
 
M
A
 
S
Y
 
K
A
 
G
Q
 
T
G
 
R
G
 
G
L
 
I
T
 
S
C
 
A
F
 
F
L
 
I
V
 
V
P
 
D
R
 
-
W
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
L
R
 
K
N
 
S
A
 
E
G
 
G
F
 
V
R
 
S
V
 
M
M
 
G
R
 
K
L
 
N
K
x
E
D
 
H
K
 
K
L
 
M
G
 
G
D
 
L
R
 
I
S
 
G
N
 
C
A
 
A
S
 
T
S
 
S
E
 
D
I
 
I
E
 
I
Y
 
M
H
 
E
G
 
D
A
 
V
L
 
K
A
 
V
-
 
P
-
 
K
-
 
E
Q
 
N
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
E
E
 
V
G
 
N
R
 
K
G
 
G
V
 
F
A
 
S
T
 
N
I
 
A
I
 
M
Q
 
K
M
 
T
V
 
L
Q
 
D
H
 
V
T
x
G
R
 
R
L
 
L
D
 
G
C
 
V
V
 
A
I
 
S
G
 
Q
S
 
S
A
 
I
Q
 
G
Q
 
V
M
 
A
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
D
Q
 
E
A
 
A
L
 
I
W
 
K
H
 
Y
T
 
A
A
 
K
H
 
E
R
|
R
S
 
K
A
x
Q
F
|
F
Q
 
G
R
 
K
R
 
R
L
x
I
I
 
A
D
 
D
Q
x
F
P
 
Q
A
 
A
M
 
I
A
 
A
A
 
F
V
 
M
L
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
M
A
 
A
V
 
T
E
 
K
S
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
K
V
 
L
L
 
L
G
 
V
L
 
Y
R
 
N
L
 
A
A
 
A
Q
 
S
A
 
L
F
 
M
D
 
D
E
 
N
A
 
K
D
 
K
P
 
N
V
 
A
A
 
T
R
 
K
L
 
-
L
 
E
T
 
A
P
 
S
I
 
M
A
 
A
K
 
K
Y
 
F
W
 
Y
V
 
A
C
 
S
K
 
E
R
 
I
A
 
C
P
 
N
G
 
E
L
 
I
V
 
C
Y
 
A
E
 
K
A
 
A
M
 
V
E
x
Q
C
x
I
H
 
H
G
 
G
G
|
G
G
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
E
 
K
A
 
E
G
 
Y
P
 
K
M
 
V
P
 
E
R
 
R
L
 
M
F
 
Y
R
 
R
Q
 
D
S
 
C
P
 
R
L
 
V
N
 
F
A
 
T
I
 
I
W
x
Y
E
 
E
G
 
G
S
x
T
G
 
S
N
x
Q
V
 
V

Sites not aligning to the query:

4l1fA Electron transferring flavoprotein of acidaminococcus fermentans: towards a mechanism of flavin-based electron bifurcation (see paper)
27% identity, 50% coverage: 175:443/540 of query aligns to 113:380/380 of 4l1fA

query
sites
4l1fA
P
 
P
A
 
I
A
 
A
E
 
E
K
 
-
A
 
-
G
 
G
V
 
T
T
 
H
I
 
V
G
 
G
-
 
A
M
x
F
A
 
G
M
x
L
T
|
T
E
 
E
K
 
P
Q
 
S
G
 
A
G
|
G
S
x
T
D
 
D
V
 
A
R
 
S
A
 
A
N
 
Q
T
 
Q
T
 
T
R
 
T
A
 
A
E
 
V
P
 
L
A
 
K
G
 
G
E
 
D
A
 
K
G
 
-
W
 
-
Y
 
Y
S
 
I
L
 
L
T
 
N
G
 
G
H
 
S
K
 
K
W
 
I
F
|
F
C
x
I
S
x
T
-
 
N
A
 
G
P
 
K
M
 
E
C
 
A
D
 
D
A
 
T
F
 
Y
L
 
V
T
 
V
L
 
F
A
 
A
Y
 
M
-
 
T
-
 
D
-
 
K
A
 
S
Q
 
Q
G
 
G
-
 
V
-
x
H
G
 
G
L
 
I
T
 
S
C
 
A
F
 
F
L
 
I
V
 
L
P
 
E
R
 
K
W
 
G
L
 
M
P
 
P
D
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
F
R
 
R
V
 
F
M
 
G
R
 
K
L
 
I
K
 
E
D
 
D
K
 
K
L
 
M
G
 
G
D
 
G
R
 
H
S
 
T
N
 
S
A
 
I
S
 
T
S
 
A
E
 
E
I
 
L
E
 
I
Y
 
F
H
 
E
G
 
D
A
 
C
L
 
E
A
 
V
Q
 
P
R
 
K
-
 
E
-
 
N
-
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
E
G
 
G
V
x
F
A
 
K
T
 
I
I
 
A
I
x
M
Q
x
E
M
 
T
V
x
L
Q
x
D
H
 
G
T
x
G
R
|
R
L
 
I
D
 
G
C
 
V
V
 
A
I
 
A
G
 
Q
S
 
A
A
 
L
Q
 
G
Q
 
I
M
 
A
R
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
L
 
V
W
 
K
H
 
Y
T
 
S
A
 
K
H
 
E
R
|
R
S
 
E
A
x
Q
F
|
F
Q
 
G
R
 
R
R
 
S
L
x
I
I
 
S
D
 
K
Q
x
F
P
 
Q
A
 
A
M
x
L
A
 
Q
A
 
F
V
 
M
L
 
M
A
 
A
D
 
D
L
 
M
A
 
A
V
 
T
E
 
K
S
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
R
V
 
Y
L
 
L
G
 
V
L
 
Y
R
 
H
L
 
A
A
 
A
Q
 
M
A
 
L
F
 
K
D
 
N
E
 
E
A
 
G
D
 
K
P
 
P
V
 
Y
A
 
S
R
 
E
L
 
-
L
 
A
T
 
A
P
 
A
I
 
M
A
 
A
K
 
K
Y
 
C
W
 
F
V
 
A
C
 
S
K
 
D
R
 
V
A
 
A
P
 
M
G
 
E
L
 
V
V
 
T
Y
 
T
E
 
D
A
 
A
M
 
V
E
x
Q
C
x
I
H
 
F
G
 
G
G
|
G
G
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
I
 
T
E
 
V
A
 
D
G
 
Y
P
 
P
M
 
A
P
 
E
R
 
R
L
 
Y
F
 
M
R
 
R
Q
 
N
S
 
A
P
 
K
L
x
I
N
 
T
A
 
Q
I
 
I
W
x
Y
E
|
E
G
|
G
S
x
T
G
 
N
N
x
Q
V
 
V
I
 
M
A
 
R
L
 
I
D
 
V
L
 
T
L
 
S
R
|
R
A
 
A
I
 
L
G
 
L
R
 
R
E
 
D

Sites not aligning to the query:

2jifA Structure of human short-branched chain acyl-coa dehydrogenase (acadsb)
29% identity, 47% coverage: 176:431/540 of query aligns to 116:368/381 of 2jifA

query
sites
2jifA
A
 
T
A
 
T
E
 
E
K
 
K
A
 
V
G
 
G
V
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
S
M
x
F
A
 
C
M
x
L
T
x
S
E
 
E
K
 
A
Q
 
G
G
 
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
x
S
R
 
F
A
 
A
N
 
L
T
 
K
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
D
P
 
K
A
 
E
G
 
G
E
 
D
A
 
-
G
 
-
W
 
Y
Y
 
Y
S
 
V
L
 
L
T
 
N
G
 
G
H
 
S
K
 
K
-
 
M
W
|
W
F
x
I
C
x
S
S
 
S
A
 
A
P
 
E
M
 
H
C
 
A
D
 
G
A
 
L
F
 
F
L
 
L
T
 
V
L
 
M
A
 
A
Y
 
N
A
 
V
Q
 
D
-
 
P
-
 
T
-
 
I
-
 
G
-
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
 
I
T
 
T
C
 
S
F
 
F
L
 
L
V
 
V
P
 
D
R
 
R
W
 
D
L
 
T
P
 
P
D
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
L
R
 
H
V
 
I
M
 
G
R
 
K
L
 
P
K
 
E
D
 
N
K
|
K
L
 
L
G
 
G
D
 
L
R
 
R
S
 
A
N
 
S
A
 
S
S
x
T
S
 
C
E
 
P
I
 
L
E
 
T
Y
 
F
H
 
E
G
 
N
A
 
V
L
 
K
-
 
V
-
 
P
-
 
E
A
 
A
Q
 
N
R
 
I
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
E
 
I
G
 
G
R
 
H
G
 
G
V
x
Y
A
 
K
T
 
Y
I
 
A
I
|
I
Q
 
G
M
 
S
V
x
L
Q
x
N
H
 
E
T
x
G
R
|
R
L
 
-
D
 
-
C
 
-
V
 
-
I
 
I
G
 
G
S
 
I
A
 
A
Q
 
A
Q
 
Q
M
 
M
R
 
L
G
 
G
A
 
-
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
G
L
 
C
W
 
F
-
 
D
-
 
Y
-
 
T
-
 
I
-
 
P
H
 
Y
T
 
I
A
 
K
H
 
E
R
|
R
S
 
I
A
 
Q
F
|
F
Q
 
G
R
 
K
R
 
R
L
|
L
I
 
F
D
 
D
Q
x
F
P
 
Q
A
 
G
M
x
L
A
 
Q
A
 
H
V
 
Q
L
 
V
A
 
A
D
 
H
L
 
V
A
 
A
V
 
T
E
 
Q
S
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
R
V
 
L
L
 
L
G
 
T
L
 
Y
R
 
N
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
L
F
 
L
D
 
E
E
 
A
A
 
G
D
 
K
P
 
P
V
 
F
A
 
I
R
 
K
L
 
E
L
 
A
T
 
S
P
 
-
I
 
M
A
 
A
K
 
K
Y
 
Y
W
 
Y
V
 
A
C
 
S
K
 
E
R
 
I
A
 
A
P
 
G
G
 
Q
L
 
T
V
 
T
Y
 
S
E
 
K
A
 
C
M
 
I
E
|
E
C
x
W
H
 
M
G
 
G
G
|
G
G
 
V
G
 
G
Y
 
Y
I
 
T
E
 
K
A
 
D
G
 
Y
P
 
P
M
 
V
P
 
E
R
 
K
L
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
D
S
 
A
P
 
K
L
 
I
N
 
G
A
 
T
I
 
I
W
x
Y
E
|
E
G
|
G
S
 
A
G
 
S
N
|
N
V
x
I

Sites not aligning to the query:

7xp7B Crystal structure of the flavoprotein colb1 catalyzing assembly line- tethered cysteine dehydrogenation (see paper)
33% identity, 49% coverage: 186:448/540 of query aligns to 115:376/376 of 7xp7B

query
sites
7xp7B
M
x
F
A
 
A
M
x
L
T
x
S
E
 
E
K
 
E
Q
 
Q
G
 
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
A
R
 
F
A
 
A
N
 
L
T
 
T
T
 
T
R
 
V
A
 
A
E
 
R
P
 
Q
A
 
-
G
 
-
E
 
D
A
 
E
G
 
G
W
 
G
Y
 
Y
S
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
H
 
R
K
 
K
-
 
R
W
|
W
F
 
T
C
x
S
S
 
N
A
 
A
P
 
R
M
 
N
C
 
A
D
 
D
A
 
L
F
 
L
L
 
L
T
 
V
L
 
F
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
Q
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
P
T
 
T
C
 
A
F
 
F
L
 
V
V
 
V
P
 
P
R
 
A
W
 
D
L
 
A
P
 
P
D
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
V
R
 
S
V
 
L
M
 
D
R
 
D
L
 
R
K
 
V
D
 
E
K
 
Q
L
 
M
G
 
G
D
 
V
R
 
R
S
 
A
N
 
A
A
 
A
S
 
T
S
 
S
E
 
D
I
 
V
E
 
I
Y
 
F
H
 
D
G
 
G
A
 
T
-
 
P
-
 
V
-
 
R
L
 
T
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
G
 
G
E
 
P
E
 
P
G
 
G
R
 
G
G
 
G
V
 
Q
A
 
T
T
 
V
I
 
A
I
 
L
Q
 
S
M
 
G
V
 
L
Q
 
G
H
 
L
T
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
G
C
 
I
V
 
A
I
 
A
G
 
Q
S
 
M
A
 
T
Q
 
G
Q
 
L
M
 
A
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
D
Q
 
A
A
 
A
L
 
T
W
 
G
H
 
Y
T
 
S
A
 
R
H
 
V
R
|
R
S
 
E
A
 
Q
F
|
F
Q
 
G
R
 
G
R
 
R
L
x
I
I
 
A
D
 
D
Q
x
H
P
 
Q
A
 
G
M
x
V
A
 
A
A
 
F
V
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
V
A
 
A
V
 
S
E
 
R
S
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
R
V
 
A
L
 
L
G
 
L
L
 
Y
R
 
R
L
 
A
A
 
V
Q
 
D
A
 
L
F
 
H
D
 
G
E
 
R
-
 
G
A
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
E
R
 
L
L
 
M
-
 
R
L
 
L
T
 
A
P
 
A
I
 
M
A
 
A
K
 
K
Y
 
Y
W
 
V
V
 
A
C
 
S
K
 
E
R
 
V
A
 
A
P
 
E
G
 
R
L
 
A
V
 
A
Y
 
S
E
 
V
A
 
A
M
 
V
E
|
E
C
x
T
H
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
I
 
T
E
 
D
A
 
A
G
 
Y
P
 
P
M
 
V
P
 
E
R
 
R
L
 
F
F
 
Y
R
 
R
Q
 
D
S
 
A
P
 
K
L
 
A
N
 
G
A
 
K
I
|
I
W
x
Y
E
 
E
G
 
G
S
x
T
G
 
S
N
|
N
V
 
V
I
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
T
-
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
M
I
 
I
G
 
G
R
 
G
E
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
D
V
 
L
E
 
E

Query Sequence

>Ga0059261_0740 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_0740
MSSIRPIVQLDTHEVLNQPPPFEEVNLFTGDRALADAVARAGGARHRERLTSLGARCGSA
EVIDWGVEANRNIPVLESYDRFGQRIDEVRFHPAYHQLMRLGLDSGLASVAWDGTPAGHV
AHAAILFLTGQADSGTSCPMTMTYAAVPALRADEGVAGEWVPRITAGLYDPASRPAAEKA
GVTIGMAMTEKQGGSDVRANTTRAEPAGEAGWYSLTGHKWFCSAPMCDAFLTLAYAQGGL
TCFLVPRWLPDGTRNAGFRVMRLKDKLGDRSNASSEIEYHGALAQRLGEEGRGVATIIQM
VQHTRLDCVIGSAQQMRGALAQALWHTAHRSAFQRRLIDQPAMAAVLADLAVESEAATVL
GLRLAQAFDEADPVARLLTPIAKYWVCKRAPGLVYEAMECHGGGGYIEAGPMPRLFRQSP
LNAIWEGSGNVIALDLLRAIGREPGGVEALNGFLAAQRGRDAAYDAWIGVIDLKSAHEGN
ARLCVEQLALAAQAAVLLGWDSPGADAFCRLRLSPRGSAYGAFDAVVDTRALIERAMPVA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory