SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_0771 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_0771 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q4WR83 Acyl-CoA ligase sidI; Siderophore biosynthesis protein I; EC 6.2.1.- from Aspergillus fumigatus (strain ATCC MYA-4609 / CBS 101355 / FGSC A1100 / Af293) (Neosartorya fumigata) (see paper)
41% identity, 99% coverage: 8:553/554 of query aligns to 23:590/590 of Q4WR83

query
sites
Q4WR83
L
 
L
S
 
S
H
 
I
V
 
V
R
 
E
G
 
G
T
 
P
D
 
T
T
 
Q
P
 
P
P
 
E
L
 
L
I
 
L
E
 
D
H
 
I
T
 
T
I
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
L
L
 
L
V
 
T
R
 
L
A
 
Q
A
 
S
E
 
L
Q
 
Q
W
 
Y
G
 
G
E
 
D
R
 
Y
D
 
E
A
 
C
L
 
L
V
 
V
S
 
F
V
 
P
A
 
W
Q
 
T
G
 
G
I
 
A
R
 
R
W
 
W
S
 
T
F
 
Y
A
 
T
E
 
D
L
 
L
L
 
K
A
 
D
R
 
E
T
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
V
A
 
A
S
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
M
G
 
G
L
 
I
K
 
Q
P
 
K
G
 
G
E
 
D
R
 
R
I
 
I
G
 
G
I
 
I
W
 
M
S
 
A
P
 
G
N
 
N
C
 
C
A
 
E
E
 
Q
W
 
Y
T
 
I
L
 
S
T
 
V
Q
 
F
F
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
V
G
 
G
L
 
A
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
V
I
 
L
N
 
N
P
 
N
A
 
T
Y
 
Y
R
 
T
L
 
P
S
 
S
E
 
E
V
 
L
E
 
Y
Y
 
Y
T
 
A
I
 
L
N
 
G
K
 
H
V
 
T
G
 
D
L
 
C
A
 
R
A
 
L
L
 
L
V
 
F
A
 
L
A
 
T
E
 
P
S
 
R
F
 
I
K
 
G
T
 
R
S
 
H
A
 
S
Y
 
L
A
 
E
E
 
E
M
 
V
V
 
L
E
 
A
T
 
K
L
 
L
G
 
G
P
 
P
-
 
R
-
 
P
-
 
K
-
 
E
E
 
Q
R
 
G
L
 
T
P
 
S
T
 
S
L
 
A
R
 
L
A
 
E
R
 
E
I
 
I
L
 
I
I
 
I
G
 
L
E
 
R
N
 
G
E
 
Q
R
 
Y
P
 
S
G
 
G
W
 
F
L
 
S
S
 
T
F
 
Y
A
 
E
D
 
H
V
 
V
-
 
I
-
 
Q
-
 
R
-
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
L
A
 
P
A
 
S
H
 
H
L
 
A
A
 
L
G
 
Q
A
 
D
L
 
R
P
 
E
E
 
A
D
 
E
L
 
L
H
 
H
P
 
S
S
 
T
D
 
D
P
 
V
I
 
C
N
 
N
I
 
L
Q
 
Q
F
 
F
T
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
S
T
 
T
G
 
G
L
 
N
P
 
P
K
 
K
G
 
A
A
 
A
T
 
M
L
 
L
S
 
T
H
 
H
R
 
H
N
 
N
I
 
L
L
 
V
N
 
N
N
 
N
G
 
S
Y
 
R
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
R
M
 
M
G
 
N
L
 
L
S
 
T
A
 
S
Q
 
F
D
 
D
R
 
I
I
 
L
C
 
C
I
 
C
P
 
P
V
 
P
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
H
 
H
C
 
C
F
 
F
G
 
G
M
 
L
V
 
V
M
 
L
G
 
G
N
 
M
L
 
L
A
 
A
S
 
V
L
 
V
T
 
T
H
 
H
G
 
G
A
 
S
A
 
K
M
 
I
V
 
I
Y
 
F
P
 
P
A
 
S
P
 
E
G
 
T
F
 
F
D
 
D
P
 
P
E
 
T
A
 
A
A
 
V
L
 
L
R
 
H
A
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
D
E
 
E
R
 
K
C
 
C
T
 
T
A
 
A
L
 
L
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
T
M
 
M
F
 
F
I
 
E
A
 
A
M
 
I
L
 
L
A
 
S
H
 
L
P
 
P
V
 
K
L
 
P
D
 
P
S
 
N
L
 
F
D
 
D
V
 
C
T
 
S
S
 
N
L
 
L
R
 
R
T
 
T
G
 
G
C
 
I
M
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
P
C
 
V
P
 
P
E
 
R
P
 
P
L
 
L
M
 
M
R
 
K
E
 
R
V
 
L
I
 
L
D
 
E
R
 
E
L
 
L
H
 
N
M
 
M
R
 
T
D
 
E
V
 
Y
T
 
T
I
 
S
G
 
S
Y
 
Y
G
 
G
M
 
L
T
 
T
E
 
E
T
 
A
S
 
S
P
 
P
V
 
T
S
 
C
F
 
F
Q
 
N
T
 
A
A
 
L
L
 
T
D
 
T
D
 
D
P
 
S
I
 
I
H
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
L
G
 
T
S
 
T
I
 
V
G
 
G
R
 
K
V
 
V
Q
 
M
P
 
P
H
 
H
L
 
A
E
 
K
S
 
A
K
 
K
L
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
T
D
 
Q
G
 
G
N
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
P
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
C
 
C
T
 
I
R
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
Q
V
 
L
M
 
T
H
 
K
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
D
 
N
E
 
N
Q
 
P
E
 
E
R
 
K
T
 
T
A
 
A
E
 
E
S
 
A
I
 
L
-
 
I
-
 
T
D
 
D
A
 
S
E
 
D
G
 
G
-
 
V
-
 
T
W
 
W
M
 
L
H
 
K
S
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
E
A
 
A
V
 
I
I
 
F
D
 
D
D
 
E
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
A
 
C
N
 
S
I
 
I
V
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
F
K
 
K
D
 
D
M
 
I
V
 
I
I
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
E
 
E
N
 
N
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
R
 
L
E
 
E
I
 
I
E
 
E
G
 
E
F
 
R
L
 
L
Y
 
A
S
 
A
H
 
H
P
 
P
A
 
A
I
 
I
E
 
E
D
 
V
V
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
I
G
 
G
V
 
I
P
 
P
D
 
D
D
 
Q
R
 
K
M
 
Y
G
 
G
E
 
E
E
 
V
L
 
V
C
 
G
A
 
A
W
 
F
V
 
L
R
 
A
L
 
L
R
 
A
A
 
A
-
 
D
-
 
V
G
 
S
A
 
A
Q
 
R
A
 
P
D
 
S
A
 
D
E
 
E
S
 
E
I
 
L
R
 
R
D
 
A
F
 
W
C
 
T
R
 
R
G
 
E
Q
 
T
I
 
L
A
 
G
H
 
R
F
 
H
K
 
K
V
 
A
P
 
P
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
F
R
 
F
I
 
V
V
 
F
A
 
G
E
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
R
-
 
T
F
 
I
P
 
P
T
 
V
T
 
T
V
 
G
T
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
V
Q
 
R
K
 
K
F
 
V
L
 
D
I
 
L
R
 
R
E
 
K
A
 
-
M
 
I
I
 
A
A
 
A
E
 
S
L
 
V
G
 
L
S
 
E
Q
 
R
S
 
R
G
 
L
A
 
A
Q
 
K
S
 
T
A
 
A
E
 
A
T
 
I
K
 
K
E
 
E
N
 
K

Sites not aligning to the query:

P69451 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase; Long-chain acyl-CoA synthetase; Acyl-CoA synthetase; EC 6.2.1.3 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
33% identity, 94% coverage: 15:533/554 of query aligns to 12:551/561 of P69451

query
sites
P69451
D
 
D
T
 
V
P
 
P
P
 
T
L
 
E
I
 
I
E
 
N
H
 
P
T
 
D
I
 
R
G
 
Y
E
 
Q
A
 
S
L
 
L
V
 
V
R
 
D
A
 
M
A
 
F
E
 
E
Q
 
Q
W
 
S
G
 
V
E
 
A
R
 
R
-
 
Y
-
 
A
D
 
D
A
 
Q
L
 
P
V
 
A
S
 
F
V
 
V
A
 
N
Q
 
M
G
 
G
I
 
E
R
 
V
W
 
M
S
 
T
F
 
F
A
 
R
E
 
K
L
 
L
L
 
E
A
 
E
R
 
R
T
 
S
D
 
R
R
 
A
L
 
F
A
 
A
S
 
A
G
 
Y
L
 
L
L
 
Q
-
 
Q
A
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
K
P
 
K
G
 
G
E
 
D
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
L
W
 
M
S
 
M
P
 
P
N
 
N
C
 
L
A
 
L
E
 
Q
W
 
Y
T
 
P
L
 
V
T
 
A
Q
 
L
F
 
F
A
 
G
A
 
I
A
 
L
R
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
V
V
 
V
T
 
N
I
 
V
N
 
N
P
 
P
A
 
L
Y
 
Y
R
 
T
L
 
P
S
 
R
E
 
E
V
 
L
E
 
E
Y
 
H
T
 
Q
I
 
L
N
 
N
K
 
D
V
 
S
G
 
G
L
 
A
A
 
S
A
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
I
A
 
V
E
 
S
S
 
N
F
 
F
-
 
A
-
 
H
-
 
T
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
V
-
 
D
K
 
K
T
 
T
S
 
A
A
 
V
Y
 
Q
A
 
H
E
 
V
M
 
I
V
 
L
E
 
T
T
 
R
L
 
M
G
 
G
P
 
-
E
 
D
R
 
Q
L
 
L
P
 
S
T
 
T
L
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
T
I
 
V
-
 
V
-
 
N
-
 
F
-
 
V
-
 
V
-
 
K
-
 
Y
-
 
I
-
 
K
-
 
R
L
 
L
I
 
V
G
 
P
E
 
K
N
 
Y
E
 
H
R
 
L
P
 
P
G
 
D
W
 
A
L
 
I
S
 
S
F
 
F
A
 
R
D
 
S
V
 
A
-
 
L
-
 
H
A
 
N
A
 
G
H
 
Y
L
 
R
A
 
M
G
 
Q
A
 
Y
L
 
V
P
 
K
E
 
P
D
 
E
L
 
L
H
 
V
P
 
P
S
 
E
D
 
D
P
 
L
I
 
A
N
 
F
I
 
L
Q
 
Q
F
x
Y
T
|
T
S
 
G
G
|
G
T
|
T
T
 
T
G
|
G
L
 
V
P
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
T
 
M
L
 
L
S
 
T
H
 
H
R
 
R
N
 
N
I
 
M
L
 
L
N
 
A
N
 
N
G
 
L
Y
 
E
F
 
Q
V
 
V
G
 
N
R
 
A
G
 
T
M
 
Y
G
 
G
-
 
P
-
 
L
-
 
L
L
 
H
S
 
P
A
 
G
Q
 
K
D
 
E
R
 
L
I
 
V
C
 
V
I
 
T
P
 
A
V
 
L
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
H
 
H
C
 
I
F
 
F
G
 
A
M
 
L
V
 
T
M
 
I
G
 
N
N
 
C
L
 
L
A
 
L
S
 
F
L
 
I
T
 
E
H
 
L
G
 
G
A
 
G
A
 
Q
M
 
N
V
 
L
Y
 
L
P
 
I
A
 
T
P
 
N
G
 
P
F
 
R
D
 
D
P
 
I
E
 
P
A
 
G
A
 
L
L
 
V
R
 
K
A
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
Y
R
 
P
C
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
I
Y
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
N
T
 
T
M
 
L
F
 
F
I
 
N
A
 
A
M
 
L
L
 
L
A
 
N
H
 
N
P
 
K
V
 
E
L
 
F
D
 
Q
S
 
Q
L
 
L
D
 
D
V
 
F
T
 
S
S
 
S
L
 
L
R
 
H
T
 
L
G
 
S
C
 
A
M
 
-
A
 
G
G
 
G
A
 
G
I
 
M
C
 
P
P
 
V
E
 
Q
P
 
Q
L
 
V
M
 
V
R
 
A
E
 
E
V
 
R
I
 
W
D
 
V
R
 
K
L
 
L
H
 
T
M
 
G
R
 
Q
D
 
Y
V
 
L
T
 
L
I
 
E
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
M
 
L
T
 
T
E
|
E
T
 
C
S
 
A
P
 
P
V
 
L
S
 
V
F
 
S
Q
 
V
T
 
N
A
 
P
L
 
Y
D
 
D
D
 
I
P
 
D
I
 
Y
H
 
H
R
 
-
R
 
-
T
 
S
G
 
G
S
 
S
I
 
I
G
 
G
R
 
L
V
 
P
Q
 
V
P
 
P
H
 
S
L
 
T
E
 
E
S
 
A
K
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
D
D
 
D
G
 
D
N
 
N
I
 
E
V
 
V
P
 
P
V
 
P
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
L
C
 
C
T
 
V
R
 
K
G
 
G
Y
 
P
S
 
Q
V
 
V
M
 
M
H
 
L
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
D
 
Q
E
 
R
Q
 
P
E
 
D
R
 
A
T
 
T
A
 
D
E
 
E
S
 
I
I
 
I
D
 
-
A
 
K
E
 
N
G
 
G
W
 
W
M
 
L
H
 
H
S
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
I
A
 
A
V
 
V
I
 
M
D
 
D
D
 
E
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
A
 
L
N
 
R
I
 
I
V
 
V
G
 
D
R
 
R
L
 
K
K
 
K
D
 
D
M
 
M
V
 
I
I
 
L
R
 
V
G
 
S
G
 
G
E
 
F
N
 
N
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
R
 
N
E
 
E
I
 
I
E
 
E
G
 
D
F
 
V
L
 
V
Y
 
M
S
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
I
 
V
E
 
Q
D
 
E
V
 
V
A
 
A
V
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
D
 
S
D
 
G
R
 
S
M
 
S
G
 
G
E
 
E
E
 
A
L
 
V
C
 
K
A
 
I
W
 
F
V
 
V
R
 
-
L
 
V
R
 
K
A
 
K
G
 
D
A
 
P
Q
 
S
A
 
L
D
 
T
A
 
E
E
 
E
S
 
S
I
 
L
R
 
V
D
 
T
F
 
F
C
 
C
R
 
R
G
 
R
Q
 
Q
I
 
L
A
 
T
H
 
G
F
 
Y
K
 
K
V
 
V
P
 
P
R
 
K
Y
 
L
V
 
V
R
 
E
I
 
F
V
 
R
A
 
D
E
 
E
F
 
L
P
 
P
T
 
K
T
 
S
V
 
N
T
 
V
G
 
G
K
 
K
V
 
I
Q
 
L
K
 
R
F
 
R
L
 
E
I
 
L
R
 
R
E
 
D

4gxqA Crystal structure of atp bound rpmatb-bxbclm chimera b1 (see paper)
33% identity, 89% coverage: 42:533/554 of query aligns to 21:499/506 of 4gxqA

query
sites
4gxqA
V
 
I
S
 
E
V
 
T
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
I
 
D
R
 
K
W
 
I
S
 
S
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
A
D
 
G
R
 
R
L
 
V
A
 
A
S
 
N
G
 
V
L
 
L
L
 
V
A
 
A
L
 
R
G
 
G
L
 
L
K
 
Q
P
 
V
G
 
G
E
 
D
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
A
W
 
Q
S
 
T
P
 
E
N
 
K
C
 
S
A
 
V
E
 
E
W
 
A
T
 
L
L
 
V
T
 
L
Q
 
Y
F
 
L
A
 
A
A
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
G
I
 
V
L
 
Y
V
 
L
T
 
P
I
 
L
N
 
N
P
 
T
A
 
A
Y
 
Y
R
 
T
L
 
L
S
 
H
E
 
E
V
 
L
E
 
D
Y
 
Y
T
 
F
I
 
I
N
 
T
K
 
D
V
 
A
G
 
E
L
 
P
A
 
K
A
 
I
L
 
V
V
 
V
A
 
C
A
 
D
E
 
P
S
 
S
F
 
K
K
 
R
T
 
D
S
 
G
A
 
I
Y
 
A
A
 
A
-
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
V
-
 
G
E
 
A
M
 
T
V
 
V
E
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
D
R
 
-
L
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
G
W
 
R
L
 
G
S
 
S
F
 
L
A
 
T
D
 
D
V
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
G
L
 
A
A
 
S
G
 
E
A
 
A
L
 
F
P
 
A
E
 
T
-
 
I
D
 
D
L
 
R
H
 
G
P
 
A
S
 
D
D
 
D
P
 
L
I
 
A
N
 
A
I
 
I
Q
 
L
F
 
Y
T
|
T
S
|
S
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
L
 
R
P
 
S
K
 
K
G
 
G
A
 
A
T
 
M
L
 
L
S
 
S
H
 
H
R
 
D
N
 
N
I
 
L
L
 
A
N
 
S
N
|
N
G
 
S
Y
 
L
F
 
T
V
 
L
G
 
V
R
 
D
G
 
Y
M
 
W
G
 
R
L
 
F
S
 
T
A
 
P
Q
 
D
D
 
D
R
 
V
I
 
L
C
 
I
I
 
H
P
 
A
V
 
L
P
 
P
L
 
I
Y
 
Y
H
|
H
C
 
T
F
 
H
G
 
G
M
 
L
V
 
F
M
 
V
G
 
A
N
 
S
L
 
N
A
 
V
S
 
T
L
 
L
T
 
F
H
 
A
G
 
R
A
 
G
A
 
S
M
 
M
V
 
I
Y
 
F
P
 
-
A
 
L
P
 
P
G
 
K
F
 
F
D
 
D
P
 
P
E
 
D
A
 
K
A
 
I
L
 
L
R
 
D
A
 
L
V
 
M
A
 
A
A
 
-
E
 
-
R
 
R
C
 
A
T
 
T
A
 
V
L
 
L
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
T
M
 
F
F
 
Y
I
 
T
A
 
R
M
 
L
L
 
L
A
 
Q
H
 
S
P
 
P
V
 
R
L
 
L
D
 
-
S
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
T
 
T
S
 
K
L
 
E
R
 
T
T
 
T
G
 
G
C
 
H
M
 
M
A
 
R
G
 
L
A
 
F
I
 
I
C
 
S
-
 
G
P
x
S
E
x
A
P
|
P
L
 
L
M
 
L
R
 
A
E
 
D
V
 
T
I
 
H
D
 
R
R
 
E
L
 
W
H
 
S
M
 
A
R
 
K
D
 
T
-
 
G
-
 
H
-
 
A
V
 
V
T
 
L
I
x
E
G
x
R
Y
 
Y
G
|
G
M
|
M
T
|
T
E
|
E
T
 
T
S
 
N
P
 
-
V
 
-
S
 
-
F
 
M
Q
 
N
T
 
T
A
 
S
L
 
N
D
 
P
D
 
Y
P
 
D
I
 
G
H
 
D
R
 
R
R
 
V
T
 
P
G
 
G
S
 
A
I
 
V
G
 
G
R
 
P
V
 
A
Q
 
L
P
 
P
H
 
G
L
 
V
E
 
S
S
 
A
K
 
R
L
 
V
I
 
T
D
 
D
L
 
P
D
 
E
-
 
T
G
 
G
N
 
K
I
 
E
V
 
L
P
 
P
V
 
R
G
 
G
Q
 
D
P
 
I
G
 
G
E
 
M
L
 
I
C
 
E
T
 
V
R
 
K
G
 
G
Y
 
P
S
 
N
V
 
V
M
 
F
H
 
K
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
D
 
R
E
 
M
Q
 
P
E
 
E
R
 
K
T
 
T
A
 
K
E
 
S
S
 
E
I
 
F
D
 
R
A
 
D
E
 
D
G
 
G
W
 
F
M
 
F
H
 
I
S
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
L
A
 
G
V
 
K
I
 
I
D
 
D
D
 
E
E
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
V
N
 
H
I
 
I
V
 
L
G
 
G
R
|
R
L
 
G
K
 
K
D
 
D
M
 
L
V
 
V
I
|
I
R
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
F
N
|
N
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
R
 
K
E
 
E
I
 
I
E
 
E
G
 
S
F
 
E
L
 
I
Y
 
D
S
 
A
H
 
M
P
 
P
A
 
G
I
 
V
E
 
V
D
 
E
V
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
V
 
V
P
 
P
D
 
H
D
 
A
R
 
D
M
 
F
G
 
G
E
 
E
E
 
G
L
 
V
C
 
T
A
 
A
W
 
F
V
 
V
R
 
V
L
 
L
R
 
K
-
 
R
-
 
E
-
 
F
A
 
A
G
 
P
A
 
S
Q
 
E
A
 
I
D
 
L
A
 
A
E
 
E
S
 
E
I
 
L
R
 
K
D
 
A
F
 
F
C
 
V
R
 
K
G
 
D
Q
 
R
I
 
L
A
 
A
H
 
K
F
 
F
K
 
K
V
 
M
P
 
P
R
 
K
Y
 
K
V
 
V
R
 
I
I
 
F
V
 
V
A
 
D
E
 
D
F
 
L
P
 
P
T
 
R
T
 
N
V
 
T
T
 
M
G
 
G
K
x
A
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
F
 
N
L
 
V
I
 
L
R
 
R
E
 
E

6k4cA Ancestral luciferase anclamp in complex with dlsa (see paper)
29% identity, 94% coverage: 18:535/554 of query aligns to 14:537/538 of 6k4cA

query
sites
6k4cA
P
 
P
L
 
L
I
 
E
E
 
D
H
 
G
T
 
T
I
 
A
G
 
G
E
 
E
A
 
Q
L
 
L
V
 
Y
R
 
K
A
 
A
A
 
L
E
 
K
Q
 
K
W
 
Y
G
 
A
E
 
Q
R
 
L
D
 
P
A
 
G
L
 
T
V
 
I
S
 
A
V
 
L
A
 
T
Q
 
D
G
 
A
I
 
H
-
 
T
-
 
E
-
 
E
R
 
N
W
 
I
S
 
S
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
L
T
 
T
D
 
C
R
 
R
L
 
L
A
 
A
S
 
E
G
 
S
L
 
L
L
 
K
A
 
N
L
 
Y
G
 
G
L
 
L
K
 
K
P
 
Q
G
 
N
E
 
N
R
 
T
I
 
I
G
 
A
I
 
V
W
 
C
S
 
S
P
 
E
N
 
N
C
 
N
A
 
L
E
 
Q
W
 
F
T
 
F
L
 
I
T
 
P
Q
 
V
F
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
Y
A
 
I
G
 
G
L
 
V
I
 
A
L
 
V
V
 
A
T
 
P
I
 
V
N
 
N
P
 
D
A
 
K
Y
 
Y
R
 
T
L
 
E
S
 
R
E
 
E
V
 
L
E
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
I
N
 
N
K
 
S
V
 
L
G
 
N
L
 
I
A
 
S
A
 
K
-
 
P
L
 
T
V
 
I
A
 
I
A
 
F
E
 
C
S
 
S
F
 
K
K
 
K
T
 
T
S
 
L
A
 
Q
Y
 
K
A
 
I
E
 
L
M
 
Q
V
 
V
E
 
K
T
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
S
T
 
Y
L
 
I
R
 
K
A
 
K
R
 
I
I
 
I
L
 
I
I
 
L
G
 
D
E
 
S
N
 
K
E
 
E
R
 
D
P
 
I
G
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
 
Q
-
 
C
-
 
L
-
 
N
-
 
N
W
 
F
L
 
I
S
 
S
-
 
Q
F
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
A
A
 
N
A
 
F
H
 
N
L
 
V
A
 
S
G
 
N
A
 
F
L
 
K
P
 
P
E
 
N
D
 
S
L
 
F
H
 
D
P
 
R
S
 
D
D
 
E
P
 
Q
I
 
V
N
 
A
-
 
L
I
 
I
Q
 
M
F
 
N
T
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
A
 
V
T
 
M
L
 
L
S
 
T
H
 
H
R
 
K
N
 
N
I
 
L
L
 
V
-
 
V
-
 
R
-
 
F
-
 
S
-
 
H
-
 
C
N
 
R
N
 
D
G
 
P
Y
 
I
F
 
F
V
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
G
M
 
N
G
 
Q
L
 
I
S
 
I
A
 
P
Q
 
G
D
 
T
R
 
A
I
 
I
C
 
L
I
 
T
P
 
V
V
 
I
P
 
P
L
 
F
Y
 
H
H
|
H
C
 
G
F
|
F
G
 
G
M
 
M
V
 
-
M
 
F
G
x
T
N
 
T
L
 
L
A
 
G
S
 
Y
L
 
F
T
 
T
H
 
C
G
 
G
A
 
F
A
 
R
M
 
I
V
 
V
Y
 
L
P
 
-
A
 
M
P
 
H
G
 
R
F
 
F
D
 
E
P
 
E
E
 
E
A
 
L
A
 
F
L
 
L
R
 
K
A
 
S
V
 
L
A
 
Q
A
 
D
E
 
Y
R
 
K
C
 
V
T
 
Q
A
 
S
L
 
T
Y
 
L
G
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
T
M
 
L
F
 
M
I
 
A
A
 
F
M
 
F
L
 
A
A
 
K
H
 
S
P
 
P
V
 
L
L
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
Y
D
 
D
V
 
L
T
 
S
S
 
N
L
 
L
R
 
K
T
 
E
G
 
I
C
 
A
M
 
S
A
 
G
G
|
G
A
|
A
I
x
P
C
 
L
P
 
S
E
 
K
P
 
E
L
 
V
M
 
G
R
 
E
E
 
A
V
 
V
I
 
A
D
 
K
R
 
R
L
 
F
H
 
K
M
 
L
R
 
P
D
 
G
V
 
I
T
 
R
I
 
Q
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
M
x
L
T
|
T
E
 
E
T
 
T
S
 
T
P
 
S
V
x
A
S
 
I
F
 
I
Q
 
I
T
 
T
A
 
P
L
 
E
D
 
G
D
 
D
P
 
-
I
 
-
H
 
-
R
 
V
R
 
K
T
 
P
G
 
G
S
 
S
I
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
V
Q
 
V
P
 
P
H
 
F
L
 
F
E
 
S
S
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
D
-
 
T
G
 
G
N
 
K
I
 
T
V
 
L
P
 
G
V
 
P
G
 
N
Q
 
Q
P
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
C
 
C
T
 
F
R
 
K
G
 
G
Y
 
D
S
 
M
V
 
I
M
 
M
H
 
K
G
 
G
Y
 
Y
W
 
V
D
 
N
E
 
N
Q
 
P
E
 
E
R
 
A
T
 
T
A
 
K
E
 
E
S
 
I
I
 
I
D
 
D
A
 
K
E
 
D
G
 
G
W
 
W
M
 
L
H
 
H
S
 
S
G
 
G
D
|
D
L
 
I
A
 
G
V
 
Y
I
 
Y
D
 
D
D
 
E
E
 
D
G
 
G
Y
 
H
A
 
F
N
 
F
I
|
I
V
 
V
G
 
D
R
 
R
L
 
L
K
 
K
D
 
S
M
 
L
V
 
I
I
 
K
R
 
Y
G
 
K
G
 
G
E
 
Y
N
 
Q
I
 
V
Y
 
A
P
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
L
E
 
E
G
 
S
F
 
I
L
 
L
Y
 
L
S
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
S
I
 
I
E
 
I
D
 
D
V
 
A
A
 
G
V
 
V
V
 
T
G
 
G
V
 
I
P
 
P
D
 
D
D
 
E
R
 
D
M
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
L
L
 
P
C
 
A
A
 
A
W
 
C
V
 
V
R
 
V
L
 
L
R
 
Q
A
 
P
G
 
G
A
 
K
Q
 
H
A
 
L
D
 
T
A
 
E
E
 
K
S
 
E
I
 
V
R
 
I
D
 
D
F
 
Y
C
 
V
R
 
A
G
 
S
Q
 
Q
I
 
V
A
 
S
H
 
S
F
 
A
K
 
K
V
 
R
P
 
L
R
 
R
-
 
G
Y
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
F
V
 
V
A
 
D
E
 
E
F
 
I
P
 
P
T
 
K
T
 
G
V
 
S
T
 
T
G
 
G
K
|
K
V
 
I
Q
 
D
K
 
R
F
 
K
L
 
A
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
A
 
I
M
 
L

6k4dA Ancestral luciferase anclamp in complex with atp and d-luciferin (see paper)
29% identity, 94% coverage: 18:535/554 of query aligns to 14:537/539 of 6k4dA

query
sites
6k4dA
P
 
P
L
 
L
I
 
E
E
 
D
H
 
G
T
 
T
I
 
A
G
 
G
E
 
E
A
 
Q
L
 
L
V
 
Y
R
 
K
A
 
A
A
 
L
E
 
K
Q
 
K
W
 
Y
G
 
A
E
 
Q
R
 
L
D
 
P
A
 
G
L
 
T
V
 
I
S
 
A
V
 
L
A
 
T
Q
 
D
G
 
A
I
 
H
-
 
T
-
 
E
-
 
E
R
 
N
W
 
I
S
 
S
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
L
T
 
T
D
 
C
R
 
R
L
 
L
A
 
A
S
 
E
G
 
S
L
 
L
L
 
K
A
 
N
L
 
Y
G
 
G
L
 
L
K
 
K
P
 
Q
G
 
N
E
 
N
R
 
T
I
 
I
G
 
A
I
 
V
W
 
C
S
 
S
P
 
E
N
 
N
C
 
N
A
 
L
E
 
Q
W
 
F
T
 
F
L
 
I
T
 
P
Q
 
V
F
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
Y
A
 
I
G
 
G
L
 
V
I
 
A
L
 
V
V
 
A
T
 
P
I
 
V
N
 
N
P
 
D
A
 
K
Y
 
Y
R
 
T
L
 
E
S
 
R
E
 
E
V
 
L
E
 
I
Y
 
N
T
 
S
I
 
L
N
 
N
K
 
I
V
 
S
G
 
K
L
 
P
A
 
T
A
 
I
L
 
I
V
 
F
A
 
C
A
 
S
E
 
K
S
 
-
F
 
-
K
 
K
T
 
T
S
 
L
A
 
Q
Y
 
K
A
 
I
E
 
L
M
 
Q
V
 
V
E
 
K
T
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
S
T
 
Y
L
 
I
R
 
K
A
 
K
R
 
I
I
 
I
L
 
I
I
 
L
G
 
D
E
 
S
N
 
K
E
 
E
R
 
D
P
 
I
G
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
 
Q
-
 
C
-
 
L
-
 
N
-
 
N
W
 
F
L
 
I
S
 
S
-
 
Q
F
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
A
A
 
N
A
 
F
H
 
N
L
 
V
A
 
S
G
 
N
A
 
F
L
 
K
P
 
P
E
 
N
D
 
S
L
 
F
H
 
D
P
 
R
S
 
D
D
 
E
P
 
Q
I
 
V
N
 
A
-
 
L
I
 
I
Q
 
M
F
 
N
T
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
A
 
V
T
 
M
L
 
L
S
 
T
H
 
H
R
 
K
N
 
N
I
 
L
L
 
V
-
 
V
-
 
R
-
 
F
-
 
S
-
 
H
-
 
C
N
 
R
N
 
D
G
 
P
Y
 
I
F
 
F
V
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
G
M
 
N
G
 
Q
L
 
I
S
 
I
A
 
P
Q
 
G
D
 
T
R
 
A
I
 
I
C
 
L
I
 
T
P
 
V
V
 
I
P
 
P
L
 
F
Y
 
H
H
|
H
C
 
G
F
|
F
G
 
G
M
 
M
V
 
-
M
 
F
G
x
T
N
 
T
L
 
L
A
 
G
S
 
Y
L
 
F
T
 
T
H
 
C
G
 
G
A
 
F
A
 
R
M
 
I
V
 
V
Y
 
L
P
 
-
A
 
M
P
 
H
G
 
R
F
 
F
D
 
E
P
 
E
E
 
E
A
 
L
A
 
F
L
 
L
R
 
K
A
 
S
V
 
L
A
 
Q
A
 
D
E
 
Y
R
 
K
C
 
V
T
 
Q
A
 
S
L
 
T
Y
 
L
G
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
T
M
 
L
F
 
M
I
 
A
A
 
F
M
 
F
L
 
A
A
 
K
H
 
S
P
 
P
V
 
L
L
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
Y
D
 
D
V
 
L
T
 
S
S
 
N
L
 
L
R
 
K
T
 
E
G
 
I
C
 
A
M
 
S
A
 
G
G
|
G
A
|
A
I
x
P
C
 
L
P
 
S
E
 
K
P
 
E
L
 
V
M
 
G
R
 
E
E
 
A
V
 
V
I
 
A
D
 
K
R
 
R
L
 
F
H
 
K
M
 
L
R
 
P
D
 
G
V
 
I
T
x
R
I
 
Q
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
M
x
L
T
|
T
E
 
E
T
 
T
S
 
T
P
x
S
V
x
A
S
 
I
F
 
I
Q
 
I
T
 
T
A
 
P
L
 
E
D
 
G
D
 
D
P
 
-
I
 
-
H
 
-
R
 
V
R
 
K
T
 
P
G
 
G
S
 
S
I
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
V
Q
 
V
P
 
P
H
 
F
L
 
F
E
 
S
S
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
D
-
 
T
G
 
G
N
 
K
I
 
T
V
 
L
P
 
G
V
 
P
G
 
N
Q
 
Q
P
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
C
 
C
T
 
F
R
 
K
G
 
G
Y
 
D
S
 
M
V
 
I
M
 
M
H
 
K
G
 
G
Y
 
Y
W
 
V
D
 
N
E
 
N
Q
 
P
E
 
E
R
 
A
T
 
T
A
 
K
E
 
E
S
 
I
I
 
I
D
 
D
A
 
K
E
 
D
G
 
G
W
 
W
M
 
L
H
 
H
S
 
S
G
 
G
D
|
D
L
 
I
A
 
G
V
 
Y
I
 
Y
D
 
D
D
 
E
E
 
D
G
 
G
Y
 
H
A
 
F
N
 
F
I
|
I
V
 
V
G
 
D
R
 
R
L
 
L
K
 
K
D
 
S
M
 
L
V
 
I
I
 
K
R
 
Y
G
 
K
G
 
G
E
 
Y
N
 
Q
I
 
V
Y
 
A
P
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
L
E
 
E
G
 
S
F
 
I
L
 
L
Y
 
L
S
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
S
I
 
I
E
 
I
D
 
D
V
 
A
A
 
G
V
 
V
V
 
T
G
 
G
V
 
I
P
 
P
D
 
D
D
 
E
R
 
D
M
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
L
L
 
P
C
 
A
A
 
A
W
 
C
V
 
V
R
 
V
L
 
L
R
 
Q
A
 
P
G
 
G
A
 
K
Q
 
H
A
 
L
D
 
T
A
 
E
E
 
K
S
 
E
I
 
V
R
 
I
D
 
D
F
 
Y
C
 
V
R
 
A
G
 
S
Q
 
Q
I
 
V
A
 
S
H
 
S
F
 
A
K
 
K
V
 
R
P
 
L
R
 
R
-
 
G
Y
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
F
V
 
V
A
 
D
E
 
E
F
 
I
P
 
P
T
 
K
T
 
G
V
 
S
T
 
T
G
 
G
K
|
K
V
 
I
Q
 
D
K
 
R
F
 
K
L
 
A
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
A
 
I
M
 
L

Q9S725 4-coumarate--CoA ligase 2; 4CL 2; 4-coumarate--CoA ligase isoform 2; At4CL2; 4-coumaroyl-CoA synthase 2; Caffeate--CoA ligase; EC 6.2.1.12; EC 6.2.1.- from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 3 papers)
29% identity, 90% coverage: 34:532/554 of query aligns to 48:547/556 of Q9S725

query
sites
Q9S725
Q
 
E
W
 
F
G
 
A
E
 
A
R
 
K
D
 
P
A
 
C
L
 
L
V
 
I
S
 
N
V
 
G
A
 
P
Q
 
T
G
 
G
I
 
E
R
 
V
W
 
Y
S
 
T
F
 
Y
A
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
H
A
 
V
R
 
T
T
 
S
D
 
R
R
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
A
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
V
K
 
K
P
 
Q
G
 
H
E
 
D
R
 
V
I
 
V
G
 
M
I
 
I
W
 
L
S
 
L
P
 
P
N
 
N
C
 
S
A
 
P
E
 
E
W
 
V
T
 
V
L
 
L
T
 
T
Q
 
F
F
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
S
R
 
F
A
 
I
G
 
G
L
 
A
I
 
I
L
 
T
V
 
T
T
 
S
I
 
A
N
 
N
P
 
P
A
 
F
Y
 
F
R
 
T
L
 
P
S
 
A
E
 
E
V
 
I
E
 
S
Y
 
K
T
 
Q
I
 
A
N
 
-
K
 
K
V
 
A
G
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
L
V
 
I
A
 
V
A
 
T
E
 
Q
S
 
S
F
 
-
K
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
R
Y
 
Y
A
 
V
E
 
D
M
 
K
V
 
I
E
 
K
T
 
N
L
 
L
G
 
Q
P
 
N
E
 
D
-
 
G
R
 
V
L
 
L
P
 
I
T
 
V
L
 
T
R
 
T
A
 
D
R
 
S
I
 
D
L
 
A
I
 
I
G
 
P
E
 
E
N
 
N
E
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
C
L
 
L
S
 
R
F
 
F
A
 
S
D
 
E
V
 
L
A
 
T
A
 
Q
H
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
P
L
 
R
A
 
V
G
 
D
A
 
S
L
 
I
P
 
P
E
 
E
D
 
K
L
 
I
H
 
S
P
 
P
S
 
E
D
 
D
P
 
V
I
 
V
N
 
A
I
 
L
Q
 
P
F
 
F
T
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
K
|
K
G
 
G
A
 
V
T
 
M
L
 
L
S
 
T
H
 
H
R
 
K
N
 
G
I
 
L
L
 
V
N
 
T
-
 
S
-
 
V
-
 
A
-
 
Q
-
 
Q
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
N
-
 
P
N
 
N
G
 
L
Y
 
Y
F
 
F
V
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
N
A
 
R
Q
 
D
D
 
D
R
 
V
I
 
I
C
 
L
I
 
C
P
 
V
V
 
L
P
 
P
L
 
M
Y
 
F
H
 
H
C
 
I
F
 
Y
G
 
A
M
 
L
V
 
N
M
 
S
G
 
I
N
 
M
L
 
L
A
 
C
S
 
S
L
 
L
T
 
R
H
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
T
M
 
I
V
 
L
Y
 
I
P
 
-
A
 
M
P
 
P
G
 
K
F
 
F
D
 
E
P
 
I
E
 
T
A
 
L
A
 
L
L
 
L
R
 
E
A
 
Q
V
 
I
A
 
Q
A
 
R
E
 
C
R
 
K
C
 
V
T
 
T
A
 
V
L
 
A
Y
x
M
G
 
V
V
 
V
P
 
P
T
 
P
M
 
I
F
 
V
I
 
L
A
 
A
M
 
I
L
 
A
A
 
K
H
 
S
P
 
P
V
 
E
L
 
T
D
 
E
S
 
K
L
 
Y
D
 
D
V
 
L
T
 
S
S
 
S
L
 
V
R
 
R
T
 
M
G
 
-
C
 
V
M
x
K
A
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
-
C
 
-
P
 
-
E
 
A
P
 
P
L
 
L
M
 
G
R
 
K
E
 
E
V
 
L
I
 
E
D
 
D
R
 
A
L
 
I
H
 
S
M
 
A
R
 
K
-
 
F
-
 
P
-
 
N
-
 
A
D
 
K
V
 
L
T
 
G
I
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
M
 
M
T
 
T
E
 
E
T
 
A
S
 
G
P
 
P
V
 
V
S
 
L
F
 
A
Q
 
M
T
 
S
A
 
L
-
 
G
-
 
F
L
 
A
D
 
K
D
 
E
P
 
P
I
 
F
H
 
P
R
 
V
R
 
K
T
 
S
G
 
G
S
 
A
I
 
C
G
 
G
R
 
T
V
 
V
Q
 
V
P
 
R
H
 
N
L
 
A
E
 
E
S
 
M
K
 
K
L
 
I
I
 
L
D
 
D
L
 
P
D
 
D
-
 
T
G
 
G
N
 
D
I
 
S
V
 
L
P
 
P
V
 
R
G
 
N
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
E
|
E
L
 
I
C
|
C
T
 
I
R
 
R
G
 
G
Y
 
N
S
 
Q
V
 
I
M
 
M
H
 
K
G
 
G
Y
 
Y
W
 
L
D
 
N
E
 
D
Q
 
P
E
 
L
R
 
A
T
 
T
A
 
A
E
 
S
S
 
T
I
 
I
D
 
D
A
 
K
E
 
D
G
 
G
W
 
W
M
 
L
H
 
H
S
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
V
A
 
G
V
 
F
I
 
I
D
 
D
D
 
D
E
 
D
G
 
D
Y
 
E
A
 
L
N
 
F
I
 
I
V
 
V
G
 
D
R
|
R
L
 
L
K
 
K
D
 
E
M
 
L
V
 
I
I
 
K
R
 
Y
G
x
K
G
 
G
E
 
F
N
 
Q
I
 
V
Y
 
A
P
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
L
E
 
E
G
 
S
F
 
L
L
 
L
Y
 
I
S
 
G
H
 
H
P
 
P
A
 
E
I
 
I
E
 
N
D
 
D
V
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
A
V
 
M
P
 
K
D
 
E
D
 
E
R
 
D
M
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
V
L
 
P
C
 
V
A
 
A
W
 
F
V
 
V
R
 
V
L
 
R
R
 
S
A
 
K
G
 
D
A
 
S
Q
 
N
A
 
I
D
 
S
A
 
E
E
 
D
S
 
E
I
 
I
R
 
K
D
 
Q
F
 
F
C
 
V
R
 
S
G
 
K
Q
 
Q
I
 
V
A
 
V
H
 
F
F
 
Y
K
 
K
V
 
R
P
 
I
R
 
N
Y
 
K
V
 
V
R
 
F
I
 
F
V
 
T
A
 
D
E
 
S
F
 
I
P
 
P
T
 
K
T
 
A
V
 
P
T
 
S
G
 
G
K
|
K
V
 
I
Q
 
L
K
 
R
F
 
K
L
 
D
I
 
L
R
 
R

2d1sA Crystal structure of the thermostable japanese firefly luciferase complexed with high-energy intermediate analogue (see paper)
30% identity, 94% coverage: 18:535/554 of query aligns to 13:535/539 of 2d1sA

query
sites
2d1sA
P
 
P
L
 
I
I
 
E
E
 
E
H
 
G
T
 
S
I
 
A
G
 
G
E
 
T
A
 
Q
L
 
L
V
 
R
R
 
K
A
 
Y
A
 
M
E
 
E
Q
 
R
W
 
Y
G
 
A
E
 
K
R
 
L
D
 
G
A
 
A
L
 
I
-
 
A
-
 
F
V
 
T
S
 
N
V
 
A
A
 
V
Q
 
T
G
 
G
I
 
V
R
 
D
W
 
Y
S
 
S
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
L
 
Y
L
 
L
A
 
E
R
 
K
T
 
S
D
 
C
R
 
C
L
 
L
A
 
G
S
 
K
G
 
A
L
 
L
L
 
Q
A
 
N
L
 
Y
G
 
G
L
 
L
K
 
V
P
 
V
G
 
D
E
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
A
I
 
L
W
 
C
S
 
S
P
 
E
N
 
N
C
 
C
A
 
E
E
 
E
W
 
F
T
 
F
L
 
I
T
 
P
Q
 
V
F
 
I
A
 
A
A
 
G
A
 
L
R
 
F
A
 
I
G
 
G
L
 
V
I
 
G
L
 
V
V
 
A
T
 
P
I
 
T
N
 
N
P
 
E
A
 
I
Y
 
Y
R
 
T
L
 
L
S
 
R
E
 
E
V
 
L
E
 
V
Y
 
H
T
 
S
I
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
F
-
 
S
N
 
S
K
 
K
V
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
D
A
 
K
L
 
V
V
 
I
A
 
T
A
 
V
E
 
Q
S
 
K
F
 
T
K
 
V
T
 
T
S
 
T
A
 
I
Y
 
K
A
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
I
-
 
L
-
 
D
E
 
S
M
 
K
V
 
V
E
 
D
T
 
Y
L
 
R
G
 
G
P
 
Y
E
 
Q
R
 
C
L
 
L
P
 
D
T
 
T
L
 
F
R
 
I
A
 
K
R
 
R
I
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
N
E
 
T
R
 
P
P
 
P
G
 
G
W
 
F
L
 
Q
-
 
A
-
 
S
S
 
S
F
 
F
A
 
K
D
 
T
V
 
V
A
 
E
A
 
V
H
 
D
L
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
-
H
 
R
P
 
K
S
 
E
D
 
Q
P
 
V
I
 
A
N
 
L
I
 
I
Q
 
M
F
 
N
T
x
S
S
|
S
G
 
G
T
 
S
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
A
 
V
T
 
Q
L
 
L
S
 
T
H
 
H
R
 
E
N
 
N
I
 
I
L
 
V
N
 
T
N
x
R
G
 
-
Y
 
F
F
 
S
V
 
H
G
 
A
R
 
R
-
 
D
-
 
P
-
 
I
-
 
Y
G
 
G
M
 
N
G
 
Q
L
 
V
S
 
S
A
 
P
Q
 
G
D
 
T
R
 
A
I
 
V
C
 
L
I
 
T
P
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
F
Y
 
H
H
|
H
C
 
G
F
|
F
G
 
G
M
 
M
V
 
-
M
 
F
G
x
T
N
 
T
L
 
L
A
 
G
S
 
Y
L
 
L
T
 
I
H
 
C
G
 
G
A
 
F
A
 
R
M
 
V
V
 
V
Y
 
M
P
 
L
A
 
T
P
 
K
G
 
-
F
 
F
D
 
D
P
 
E
E
 
E
A
 
T
A
 
F
L
 
L
R
 
K
A
 
T
V
 
L
A
 
Q
A
 
D
E
 
Y
R
 
K
C
 
C
T
 
T
A
 
S
L
 
V
Y
x
I
G
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
T
M
 
L
F
 
F
I
 
A
A
 
I
M
 
L
L
 
N
A
 
K
H
 
S
P
 
E
V
 
L
L
 
L
D
 
N
S
 
K
L
 
Y
D
 
D
V
 
L
T
 
S
S
 
N
L
 
L
R
 
V
T
 
E
G
 
I
C
 
A
M
 
S
A
 
G
G
|
G
A
|
A
I
x
P
C
 
L
P
 
S
E
 
K
P
 
E
L
 
V
M
 
G
R
 
E
E
 
A
V
 
V
I
 
A
D
 
R
R
 
R
L
 
F
H
 
N
M
 
L
R
 
P
D
 
G
V
 
V
T
 
R
I
x
Q
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
M
x
L
T
|
T
E
|
E
T
 
T
S
 
T
P
x
S
V
x
A
S
 
I
F
 
I
Q
 
I
T
 
T
A
 
P
L
 
E
D
 
G
D
 
D
P
 
-
I
 
-
H
 
-
R
 
D
R
 
K
T
 
P
G
 
G
S
 
A
I
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
V
Q
 
V
P
 
P
H
 
L
L
 
F
E
 
K
S
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
L
D
 
D
-
 
T
-
 
K
G
 
K
N
 
S
I
 
L
V
 
G
P
 
P
V
 
-
G
 
N
Q
 
R
P
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
V
C
 
C
T
 
V
R
 
K
G
 
G
Y
 
P
S
 
M
V
 
L
M
 
M
H
 
K
G
 
G
Y
 
Y
W
 
V
D
 
N
E
 
N
Q
 
P
E
 
E
R
 
A
T
 
T
A
 
K
E
 
E
S
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
E
E
 
E
G
 
G
W
 
W
M
 
L
H
 
H
S
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
I
A
 
G
V
 
Y
I
 
Y
D
 
D
D
 
E
E
 
E
G
 
K
Y
 
H
A
 
F
N
 
F
I
 
I
V
 
V
G
 
D
R
|
R
L
 
L
K
 
K
D
 
S
M
 
L
V
 
I
I
x
K
R
 
Y
G
 
K
G
 
G
E
 
Y
N
x
Q
I
 
V
Y
 
P
P
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
L
E
 
E
G
 
S
F
 
V
L
 
L
Y
 
L
S
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
S
I
 
I
E
 
F
D
 
D
V
 
A
A
 
G
V
 
V
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
D
 
D
D
 
P
R
 
V
M
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
L
L
 
P
C
 
G
A
 
A
W
 
V
V
 
V
R
 
V
L
 
L
R
 
E
A
 
S
G
 
G
A
 
K
Q
 
N
A
 
M
D
 
T
A
 
E
E
 
K
S
 
E
I
 
V
R
 
M
D
 
D
F
 
Y
C
 
V
R
 
A
G
 
S
Q
 
Q
I
 
V
A
 
S
H
 
N
F
 
A
K
 
K
V
 
R
P
 
L
R
 
R
-
 
G
Y
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
F
V
 
V
A
 
D
E
 
E
F
 
V
P
 
P
T
 
K
T
 
G
V
 
L
T
 
T
G
 
G
K
|
K
V
 
I
Q
 
D
K
 
G
F
 
R
L
 
A
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
I
M
 
L

2d1rA Crystal structure of the thermostable japanese firefly luciferase complexed with oxyluciferin and amp (see paper)
30% identity, 94% coverage: 18:535/554 of query aligns to 13:535/539 of 2d1rA

query
sites
2d1rA
P
 
P
L
 
I
I
 
E
E
 
E
H
 
G
T
 
S
I
 
A
G
 
G
E
 
T
A
 
Q
L
 
L
V
 
R
R
 
K
A
 
Y
A
 
M
E
 
E
Q
 
R
W
 
Y
G
 
A
E
 
K
R
 
L
D
 
G
A
 
A
L
 
I
-
 
A
-
 
F
V
 
T
S
 
N
V
 
A
A
 
V
Q
 
T
G
 
G
I
 
V
R
 
D
W
 
Y
S
 
S
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
L
 
Y
L
 
L
A
 
E
R
 
K
T
 
S
D
 
C
R
 
C
L
 
L
A
 
G
S
 
K
G
 
A
L
 
L
L
 
Q
A
 
N
L
 
Y
G
 
G
L
 
L
K
 
V
P
 
V
G
 
D
E
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
A
I
 
L
W
 
C
S
 
S
P
 
E
N
 
N
C
 
C
A
 
E
E
 
E
W
 
F
T
 
F
L
 
I
T
 
P
Q
 
V
F
 
I
A
 
A
A
 
G
A
 
L
R
 
F
A
 
I
G
 
G
L
 
V
I
 
G
L
 
V
V
 
A
T
 
P
I
 
T
N
 
N
P
 
E
A
 
I
Y
 
Y
R
 
T
L
 
L
S
 
R
E
 
E
V
 
L
E
 
V
Y
 
H
T
 
S
I
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
F
-
 
S
N
 
S
K
 
K
V
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
D
A
 
K
L
 
V
V
 
I
A
 
T
A
 
V
E
 
Q
S
 
K
F
 
T
K
 
V
T
 
T
S
 
T
A
 
I
Y
 
K
A
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
I
-
 
L
-
 
D
E
 
S
M
 
K
V
 
V
E
 
D
T
 
Y
L
 
R
G
 
G
P
 
Y
E
 
Q
R
 
C
L
 
L
P
 
D
T
 
T
L
 
F
R
 
I
A
 
K
R
 
R
I
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
N
E
 
T
R
 
P
P
 
P
G
 
G
W
 
F
L
 
Q
-
 
A
-
 
S
S
 
S
F
 
F
A
 
K
D
 
T
V
 
V
A
 
E
A
 
V
H
 
D
L
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
-
H
 
R
P
 
K
S
 
E
D
 
Q
P
 
V
I
 
A
N
 
L
I
 
I
Q
 
M
F
 
N
T
x
S
S
|
S
G
 
G
T
 
S
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
A
 
V
T
 
Q
L
 
L
S
 
T
H
 
H
R
 
E
N
 
N
I
 
I
L
 
V
N
 
T
N
x
R
G
 
-
Y
 
F
F
 
S
V
 
H
G
 
A
R
 
R
-
 
D
-
 
P
-
 
I
-
 
Y
G
 
G
M
 
N
G
 
Q
L
 
V
S
 
S
A
 
P
Q
 
G
D
 
T
R
 
A
I
 
V
C
 
L
I
 
T
P
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
F
Y
 
H
H
|
H
C
 
G
F
|
F
G
 
G
M
 
M
V
 
-
M
 
F
G
x
T
N
 
T
L
 
L
A
 
G
S
 
Y
L
 
L
T
 
I
H
 
C
G
 
G
A
 
F
A
 
R
M
 
V
V
 
V
Y
 
M
P
 
L
A
 
T
P
 
K
G
 
-
F
 
F
D
 
D
P
 
E
E
 
E
A
 
T
A
 
F
L
 
L
R
 
K
A
 
T
V
 
L
A
 
Q
A
 
D
E
 
Y
R
 
K
C
 
C
T
 
T
A
 
S
L
 
V
Y
 
I
G
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
T
M
 
L
F
 
F
I
 
A
A
 
I
M
 
L
L
 
N
A
 
K
H
 
S
P
 
E
V
 
L
L
 
L
D
 
N
S
 
K
L
 
Y
D
 
D
V
 
L
T
 
S
S
 
N
L
 
L
R
 
V
T
 
E
G
 
I
C
 
A
M
 
S
A
 
G
G
|
G
A
|
A
I
x
P
C
 
L
P
 
S
E
 
K
P
 
E
L
 
V
M
 
G
R
 
E
E
 
A
V
 
V
I
 
A
D
 
R
R
 
R
L
 
F
H
 
N
M
 
L
R
 
P
D
 
G
V
 
V
T
 
R
I
 
Q
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
M
x
L
T
|
T
E
|
E
T
 
T
S
 
T
P
 
S
V
x
A
S
 
I
F
 
I
Q
 
I
T
 
T
A
 
P
L
 
E
D
 
G
D
 
D
P
 
-
I
 
-
H
 
-
R
 
D
R
 
K
T
 
P
G
 
G
S
 
A
I
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
V
Q
 
V
P
 
P
H
 
L
L
 
F
E
 
K
S
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
L
D
 
D
-
 
T
-
 
K
G
 
K
N
 
S
I
 
L
V
 
G
P
 
P
V
 
-
G
 
N
Q
 
R
P
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
V
C
 
C
T
 
V
R
 
K
G
 
G
Y
 
P
S
 
M
V
 
L
M
 
M
H
 
K
G
 
G
Y
 
Y
W
 
V
D
 
N
E
 
N
Q
 
P
E
 
E
R
 
A
T
 
T
A
 
K
E
 
E
S
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
E
E
 
E
G
 
G
W
 
W
M
 
L
H
 
H
S
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
I
A
 
G
V
 
Y
I
 
Y
D
 
D
D
 
E
E
 
E
G
 
K
Y
 
H
A
 
F
N
 
F
I
 
I
V
 
V
G
 
D
R
 
R
L
 
L
K
 
K
D
 
S
M
 
L
V
 
I
I
x
K
R
 
Y
G
 
K
G
 
G
E
 
Y
N
x
Q
I
 
V
Y
 
P
P
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
L
E
 
E
G
 
S
F
 
V
L
 
L
Y
 
L
S
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
S
I
 
I
E
 
F
D
 
D
V
 
A
A
 
G
V
 
V
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
D
 
D
D
 
P
R
 
V
M
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
L
L
 
P
C
 
G
A
 
A
W
 
V
V
 
V
R
 
V
L
 
L
R
 
E
A
 
S
G
 
G
A
 
K
Q
 
N
A
 
M
D
 
T
A
 
E
E
 
K
S
 
E
I
 
V
R
 
M
D
 
D
F
 
Y
C
 
V
R
 
A
G
 
S
Q
 
Q
I
 
V
A
 
S
H
 
N
F
 
A
K
 
K
V
 
R
P
 
L
R
 
R
-
 
G
Y
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
F
V
 
V
A
 
D
E
 
E
F
 
V
P
 
P
T
 
K
T
 
G
V
 
L
T
 
T
G
 
G
K
|
K
V
 
I
Q
 
D
K
 
G
F
 
R
L
 
A
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
I
M
 
L

Q84P21 Peroxisomal OPC-8:0-CoA ligase 1; 4-coumarate--CoA ligase isoform 9; At4CL9; 4-coumarate--CoA ligase-like 5; EC 6.2.1.- from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
28% identity, 90% coverage: 38:534/554 of query aligns to 46:540/546 of Q84P21

query
sites
Q84P21
R
 
R
D
 
I
A
 
A
L
 
F
V
 
I
S
 
D
V
 
A
A
 
S
Q
 
T
G
 
G
I
 
Q
R
 
N
W
 
L
S
 
T
F
 
F
A
 
T
E
 
E
L
 
L
L
 
W
A
 
R
R
 
A
T
 
V
D
 
E
R
 
S
L
 
V
A
 
A
S
 
D
G
 
C
L
 
L
L
 
S
A
 
E
L
 
I
G
 
G
L
 
I
K
 
R
P
 
K
G
 
G
E
 
H
R
 
V
I
 
V
G
 
L
I
 
L
W
 
L
S
 
S
P
 
P
N
 
N
C
 
S
A
 
I
E
 
L
W
 
F
T
 
P
L
 
V
T
 
V
Q
 
C
F
 
L
A
 
S
A
 
V
A
 
M
R
 
S
A
 
L
G
 
G
L
 
A
I
 
I
L
 
I
V
 
T
T
 
T
I
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
L
Y
 
N
R
 
T
L
 
S
S
 
N
E
 
E
V
 
I
E
 
A
Y
 
K
T
 
Q
I
 
I
N
 
K
K
 
D
V
 
S
G
 
N
L
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
P
A
 
V
E
 
L
S
 
A
F
 
F
K
 
T
T
 
T
S
 
S
A
 
Q
Y
 
L
A
 
L
E
 
P
M
 
K
V
 
I
E
 
-
T
 
S
L
 
A
G
 
A
P
 
A
E
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
P
T
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
I
L
 
V
I
 
L
G
 
M
E
 
D
N
 
E
E
 
E
R
 
R
P
 
V
G
 
D
W
 
S
L
 
V
S
 
G
F
 
D
A
 
V
D
 
R
V
 
R
A
 
L
A
 
V
H
 
E
L
 
M
A
 
M
G
 
K
A
 
K
L
 
E
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
N
-
 
R
-
 
V
-
 
K
E
 
E
D
 
R
L
 
V
H
 
D
P
 
Q
S
 
D
D
 
D
P
 
T
I
 
A
N
 
T
I
 
L
Q
 
L
F
 
Y
T
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
M
P
 
S
K
 
K
G
 
G
A
 
V
T
 
I
L
 
S
S
 
S
H
 
H
R
 
R
N
 
N
I
 
L
L
 
I
N
 
A
N
 
M
-
 
V
G
 
Q
Y
 
T
F
 
I
V
 
V
G
 
N
R
 
R
G
 
F
M
 
G
G
 
S
L
 
D
S
 
D
A
 
G
Q
 
E
D
 
Q
R
 
R
I
 
F
C
 
I
I
 
C
P
 
T
V
 
V
P
 
P
L
 
M
Y
 
F
H
 
H
C
 
I
F
 
Y
G
 
G
M
 
L
V
 
A
M
 
A
G
 
F
N
 
A
L
 
T
A
 
G
S
 
L
L
 
L
T
 
A
H
 
Y
G
 
G
A
 
S
A
 
T
M
 
I
V
 
I
Y
 
V
P
 
L
A
 
S
P
 
K
G
 
-
F
 
F
D
 
E
P
 
M
E
 
H
A
 
E
A
 
M
L
 
M
R
 
S
A
 
A
V
 
I
A
 
G
A
 
K
E
 
Y
R
 
Q
C
 
A
T
 
T
A
 
S
L
 
L
Y
 
P
G
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
P
M
 
I
F
 
L
I
 
V
A