SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_0925 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_0925 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5mh6A D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with 2-ketohexanoic acid and NAD+ (1.35 a resolution)
38% identity, 78% coverage: 64:305/311 of query aligns to 59:305/306 of 5mh6A

query
sites
5mh6A
W
 
W
L
 
V
S
 
H
T
 
C
I
 
I
Y
x
R
A
|
A
G
|
G
I
 
Y
D
 
D
A
 
E
F
 
F
D
 
P
V
 
V
D
 
G
L
 
V
L
 
Y
K
 
E
T
 
E
R
 
A
G
 
G
T
 
T
I
 
Y
L
 
L
T
 
T
N
 
N
G
 
S
V
x
T
G
 
G
I
 
I
N
x
H
A
 
G
I
 
T
A
 
T
V
 
V
A
 
G
E
 
E
Y
 
T
A
 
V
V
 
A
M
 
G
G
 
Y
M
 
M
L
 
L
A
 
T
A
 
F
A
 
A
K
 
R
R
 
R
F
 
L
D
 
H
Q
 
A
V
 
Y
V
 
R
R
 
D
M
 
A
A
 
Q
D
 
H
R
 
D
R
 
H
E
 
A
W
 
W
P
 
-
A
 
-
D
 
D
A
 
L
P
 
P
G
 
R
K
 
Y
V
 
E
E
 
E
L
 
P
F
 
F
E
x
T
-
 
L
-
x
A
-
 
G
T
 
E
R
 
R
A
 
V
L
 
C
I
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
G
|
G
T
|
T
I
x
L
G
 
G
R
 
R
M
 
G
I
 
V
G
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
L
G
 
G
V
 
M
D
 
E
V
 
V
T
 
V
G
 
G
V
 
V
T
 
R
R
|
R
S
 
S
G
 
G
R
 
D
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
N
-
 
V
D
 
S
G
 
T
T
 
V
L
 
Y
T
 
T
P
 
P
G
 
D
Q
 
R
W
 
L
R
 
H
E
 
E
R
 
A
L
 
I
G
 
A
D
 
D
Y
 
A
D
 
R
W
 
F
L
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
T
P
|
P
S
 
L
T
 
T
G
 
D
D
 
E
T
|
T
H
 
E
A
 
G
L
 
M
I
 
V
G
 
A
T
 
A
A
 
P
E
 
E
L
x
F
A
x
E
A
 
T
M
|
M
K
 
R
P
 
E
G
 
D
A
 
A
W
 
S
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
A
|
A
R
|
R
G
|
G
D
x
P
M
 
V
V
|
V
D
 
V
Q
x
E
P
 
S
A
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
K
 
S
R
 
G
R
x
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
F
D
x
S
P
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
E
D
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
T
 
D
T
 
F
P
 
E
N
 
D
V
 
V
I
 
L
H
 
I
S
 
T
M
 
P
H
|
H
L
 
V
S
|
S
G
 
A
R
 
-
S
 
A
Q
 
T
A
 
S
K
 
K
M
x
Y
F
 
H
M
 
E
R
 
D
A
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
I
L
 
R
E
 
E
N
 
N
A
 
I
R
 
E
A
 
K
F
 
I
A
 
A
E
 
T
G
 
G
R
 
D
P
 
E
M
 
L
K
 
T
N
 
N
V
 
R
V
 
V

5mhaB D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with a mixture of 2-ketohexanoic acid and 2-hydroxyhexanoic acid, and NADPH (1.57 a resolution)
38% identity, 78% coverage: 64:305/311 of query aligns to 61:307/308 of 5mhaB

query
sites
5mhaB
W
 
W
L
 
V
S
 
H
T
 
C
I
 
I
Y
x
R
A
|
A
G
|
G
I
 
Y
D
 
D
A
 
E
F
 
F
D
 
P
V
 
V
D
 
G
L
 
V
L
 
Y
K
 
E
T
 
E
R
 
A
G
 
G
T
 
T
I
 
Y
L
 
L
T
 
T
N
 
N
G
 
S
V
x
T
G
 
G
I
 
I
N
x
H
A
 
G
I
 
T
A
 
T
V
 
V
A
 
G
E
 
E
Y
 
T
A
 
V
V
 
A
M
 
G
G
 
Y
M
 
M
L
 
L
A
 
T
A
 
F
A
 
A
K
 
R
R
 
R
F
 
L
D
 
H
Q
 
A
V
 
Y
V
 
R
R
 
D
M
 
A
A
 
Q
D
 
H
R
 
D
R
 
H
E
 
A
W
 
W
P
 
-
A
 
-
D
 
D
A
 
L
P
 
P
G
 
R
K
 
Y
V
 
E
E
 
E
L
 
P
F
 
F
E
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
G
T
 
E
R
 
R
A
 
V
L
 
C
I
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
x
L
G
|
G
T
|
T
I
x
L
G
 
G
R
 
R
M
 
G
I
 
V
G
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
L
G
 
G
V
 
M
D
 
E
V
 
V
T
 
V
G
 
G
V
 
V
T
x
R
R
|
R
S
|
S
G
 
G
R
 
D
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
N
-
 
V
D
 
S
G
 
T
T
 
V
L
 
Y
T
 
T
P
|
P
G
 
D
Q
 
R
W
 
L
R
 
H
E
 
E
R
 
A
L
 
I
G
 
A
D
 
D
Y
 
A
D
 
R
W
 
F
L
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
A
x
T
P
|
P
S
 
L
T
 
T
G
 
D
D
 
E
T
|
T
H
 
E
A
 
G
L
 
M
I
 
V
G
 
A
T
 
A
A
 
P
E
 
E
L
x
F
A
x
E
A
 
T
M
|
M
K
 
R
P
 
E
G
 
D
A
 
A
W
 
S
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
D
 
P
M
 
V
V
 
V
D
 
V
Q
 
E
P
 
S
A
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
K
 
S
R
 
G
R
x
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
F
D
 
S
P
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
E
D
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
T
 
D
T
 
F
P
 
E
N
 
D
V
 
V
I
 
L
H
 
I
S
 
T
M
 
P
H
|
H
L
 
V
S
|
S
G
 
A
R
 
-
S
 
A
Q
 
T
A
 
S
K
 
K
M
x
Y
F
 
H
M
 
E
R
 
D
A
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
I
L
 
R
E
 
E
N
 
N
A
 
I
R
 
E
A
 
K
F
 
I
A
 
A
E
 
T
G
 
G
R
 
D
P
 
E
M
 
L
K
 
T
N
 
N
V
 
R
V
 
V

5mhaA D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with a mixture of 2-ketohexanoic acid and 2-hydroxyhexanoic acid, and NADPH (1.57 a resolution)
38% identity, 78% coverage: 64:305/311 of query aligns to 61:307/308 of 5mhaA

query
sites
5mhaA
W
 
W
L
 
V
S
 
H
T
 
C
I
 
I
Y
x
R
A
|
A
G
|
G
I
 
Y
D
 
D
A
 
E
F
 
F
D
 
P
V
 
V
D
 
G
L
 
V
L
 
Y
K
 
E
T
 
E
R
 
A
G
 
G
T
 
T
I
 
Y
L
 
L
T
 
T
N
 
N
G
 
S
V
x
T
G
 
G
I
 
I
N
x
H
A
 
G
I
 
T
A
 
T
V
 
V
A
 
G
E
 
E
Y
 
T
A
 
V
V
 
A
M
 
G
G
 
Y
M
 
M
L
 
L
A
 
T
A
 
F
A
 
A
K
 
R
R
 
R
F
 
L
D
 
H
Q
 
A
V
 
Y
V
 
R
R
 
D
M
 
A
A
 
Q
D
 
H
R
 
D
R
 
H
E
 
A
W
 
W
P
 
-
A
 
-
D
 
D
A
 
L
P
 
P
G
 
R
K
 
Y
V
 
E
E
 
E
L
 
P
F
 
F
E
x
T
-
 
L
-
x
A
-
 
G
T
 
E
R
 
R
A
 
V
L
 
C
I
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
x
L
G
|
G
T
|
T
I
x
L
G
 
G
R
 
R
M
 
G
I
 
V
G
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
L
G
 
G
V
 
M
D
 
E
V
 
V
T
 
V
G
 
G
V
 
V
T
x
R
R
|
R
S
|
S
G
 
G
R
 
D
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
N
-
 
V
D
 
S
G
 
T
T
 
V
L
 
Y
T
 
T
P
|
P
G
 
D
Q
 
R
W
 
L
R
 
H
E
 
E
R
 
A
L
 
I
G
 
A
D
 
D
Y
 
A
D
 
R
W
 
F
L
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
A
x
T
P
|
P
S
 
L
T
 
T
G
 
D
D
 
E
T
|
T
H
 
E
A
 
G
L
 
M
I
 
V
G
 
A
T
 
A
A
 
P
E
 
E
L
 
F
A
 
E
A
 
T
M
 
M
K
 
R
P
 
E
G
 
D
A
 
A
W
 
S
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
D
 
P
M
 
V
V
 
V
D
 
V
Q
 
E
P
 
S
A
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
K
 
S
R
 
G
R
 
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
F
D
 
S
P
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
E
D
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
T
 
D
T
 
F
P
 
E
N
 
D
V
 
V
I
 
L
H
 
I
S
 
T
M
 
P
H
|
H
L
 
V
S
|
S
G
 
A
R
 
-
S
 
A
Q
 
T
A
 
S
K
 
K
M
x
Y
F
 
H
M
 
E
R
 
D
A
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
I
L
 
R
E
 
E
N
 
N
A
 
I
R
 
E
A
 
K
F
 
I
A
 
A
E
 
T
G
 
G
R
 
D
P
 
E
M
 
L
K
 
T
N
 
N
V
 
R
V
 
V

5mh5A D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with 2-keto-hexanoic acid and NADP+ (1.4 a resolution)
38% identity, 78% coverage: 64:305/311 of query aligns to 61:307/308 of 5mh5A

query
sites
5mh5A
W
 
W
L
 
V
S
 
H
T
 
C
I
 
I
Y
x
R
A
|
A
G
|
G
I
 
Y
D
 
D
A
 
E
F
 
F
D
 
P
V
 
V
D
 
G
L
 
V
L
 
Y
K
 
E
T
 
E
R
 
A
G
 
G
T
 
T
I
 
Y
L
 
L
T
 
T
N
 
N
G
 
S
V
x
T
G
 
G
I
 
I
N
x
H
A
 
G
I
 
T
A
 
T
V
 
V
A
 
G
E
 
E
Y
 
T
A
 
V
V
 
A
M
 
G
G
 
Y
M
 
M
L
 
L
A
 
T
A
 
F
A
 
A
K
 
R
R
 
R
F
 
L
D
 
H
Q
 
A
V
 
Y
V
 
R
R
 
D
M
 
A
A
 
Q
D
 
H
R
 
D
R
 
H
E
 
A
W
 
W
P
 
-
A
 
-
D
 
D
A
 
L
P
 
P
G
 
R
K
 
Y
V
 
E
E
 
E
L
 
P
F
 
F
E
x
T
-
 
L
-
x
A
-
 
G
T
 
E
R
 
R
A
 
V
L
 
C
I
 
V
V
 
V
G
|
G
Y
x
L
G
|
G
T
|
T
I
x
L
G
 
G
R
 
R
M
 
G
I
 
V
G
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
L
G
 
G
V
 
M
D
 
E
V
 
V
T
 
V
G
 
G
V
 
V
T
x
R
R
|
R
S
|
S
G
 
G
R
 
D
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
N
-
 
V
D
 
S
G
 
T
T
 
V
L
 
Y
T
 
T
P
 
P
G
 
D
Q
 
R
W
 
L
R
 
H
E
 
E
R
 
A
L
 
I
G
 
A
D
 
D
Y
 
A
D
 
R
W
 
F
L
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
A
x
T
P
|
P
S
 
L
T
 
T
G
 
D
D
 
E
T
|
T
H
 
E
A
 
G
L
 
M
I
 
V
G
 
A
T
 
A
A
 
P
E
 
E
L
x
F
A
x
E
A
 
T
M
|
M
K
 
R
P
 
E
G
 
D
A
 
A
W
 
S
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
D
 
P
M
 
V
V
 
V
D
 
V
Q
 
E
P
 
S
A
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
K
 
S
R
 
G
R
x
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
F
D
 
S
P
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
E
D
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
T
 
D
T
 
F
P
 
E
N
 
D
V
 
V
I
 
L
H
 
I
S
 
T
M
 
P
H
|
H
L
 
V
S
|
S
G
 
A
R
 
-
S
 
A
Q
 
T
A
 
S
K
 
K
M
x
Y
F
 
H
M
 
E
R
 
D
A
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
I
L
 
R
E
 
E
N
 
N
A
 
I
R
 
E
A
 
K
F
 
I
A
 
A
E
 
T
G
 
G
R
 
D
P
 
E
M
 
L
K
 
T
N
 
N
V
 
R
V
 
V

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
33% identity, 87% coverage: 29:298/311 of query aligns to 36:314/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
R
 
R
E
 
E
E
 
K
A
 
L
I
 
L
A
 
E
M
 
K
V
 
V
A
 
K
D
 
D
A
 
V
D
 
D
I
 
-
A
 
A
W
 
L
V
 
V
D
 
T
M
|
M
M
x
L
R
 
S
P
 
E
D
 
R
W
 
I
T
 
D
G
 
Q
E
 
E
A
 
V
A
 
F
A
 
E
A
 
N
G
 
A
V
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
R
W
 
I
L
 
V
S
 
A
T
 
N
I
x
Y
Y
x
A
A
x
V
G
|
G
I
 
Y
D
 
D
A
 
N
F
 
I
D
 
D
V
 
V
D
 
E
L
 
E
L
 
A
K
 
T
T
 
R
R
 
R
G
 
G
T
 
I
I
 
Y
L
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
V
 
P
G
 
D
I
 
V
N
x
L
A
 
T
I
 
N
A
 
A
V
x
T
A
 
A
E
 
D
Y
 
H
A
 
A
V
 
F
M
 
A
G
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
T
A
 
A
K
 
R
R
 
H
F
 
V
-
 
V
-
 
K
-
 
G
D
 
D
Q
 
K
V
 
F
V
 
V
R
 
R
M
 
S
A
 
G
D
 
E
-
 
W
R
 
K
R
 
R
E
 
K
W
 
G
P
 
I
A
 
A
D
 
W
A
 
H
P
 
P
G
 
K
-
 
W
-
 
F
-
 
L
K
 
G
V
 
Y
E
 
E
L
 
L
F
 
Y
E
 
G
T
 
K
R
 
T
A
 
I
L
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
x
F
G
|
G
T
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
Q
M
 
A
I
 
I
G
 
A
D
 
R
R
 
R
L
 
A
A
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
N
V
 
M
D
 
R
V
 
I
T
 
L
G
 
Y
V
 
Y
T
x
S
R
|
R
S
 
T
G
 
R
R
 
K
D
 
S
G
 
Q
T
 
A
L
 
E
T
 
K
P
 
E
-
 
L
-
 
G
G
 
A
Q
 
E
W
 
Y
R
 
R
-
 
P
-
 
L
-
 
E
E
 
E
R
 
V
L
 
L
G
 
K
D
 
E
Y
 
S
D
 
D
W
 
F
L
 
V
V
 
I
L
 
L
A
|
A
A
x
V
P
|
P
S
 
L
T
 
T
G
 
K
D
 
E
T
|
T
H
 
M
A
 
Y
L
 
M
I
 
I
G
 
N
T
 
E
A
 
E
E
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
G
 
T
A
 
A
W
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
D
 
K
M
 
V
V
 
V
D
 
D
Q
 
T
P
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
K
K
 
E
R
 
G
R
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
F
D
 
E
P
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
P
 
Y
D
 
N
D
 
E
H
 
E
P
 
-
L
 
L
W
 
F
T
 
S
T
 
L
P
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
V
H
 
L
S
 
T
M
 
P
H
|
H
L
 
I
-
x
G
S
 
S
G
 
A
R
 
T
S
 
F
Q
 
E
A
 
A
K
 
R
M
 
E
F
 
A
M
 
M
R
 
-
A
 
-
A
 
A
A
 
E
L
 
L
F
 
V
L
 
A
E
 
R
N
 
N
A
 
L
R
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
K
E
 
R
G
 
G

Q9UBQ7 Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase; EC 1.1.1.79; EC 1.1.1.81 from Homo sapiens (Human) (see paper)
32% identity, 81% coverage: 57:307/311 of query aligns to 70:328/328 of Q9UBQ7

query
sites
Q9UBQ7
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
N
L
 
L
K
 
K
W
 
V
L
 
I
S
 
S
T
 
T
I
 
M
Y
 
S
A
x
V
G
|
G
I
 
I
D
 
D
A
 
H
F
 
L
D
 
A
V
 
L
D
 
D
L
 
E
L
 
I
K
 
K
T
 
K
R
 
R
G
 
G
T
 
I
I
 
R
L
 
V
T
 
G
N
 
Y
G
 
T
V
 
P
G
 
D
I
 
V
N
 
L
A
 
T
I
 
D
A
 
T
V
 
T
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
V
 
V
M
 
S
G
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
T
A
 
T
A
 
C
K
 
R
R
 
R
F
 
L
D
 
P
Q
 
E
V
 
A
V
 
I
R
 
E
M
 
E
A
 
V
D
 
K
R
 
N
R
 
G
E
 
G
W
 
W
P
 
T
A
 
S
D
 
W
A
 
K
P
 
P
-
 
L
-
 
W
-
 
L
G
 
C
K
 
G
V
 
Y
E
 
G
L
 
L
F
 
T
E
 
Q
T
 
S
R
 
T
A
 
V
L
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
L
G
|
G
T
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
Q
M
 
A
I
 
I
G
 
A
D
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
P
F
 
F
G
 
G
V
 
V
D
 
Q
V
 
R
T
 
F
G
 
L
V
 
Y
T
 
T
-
 
G
R
|
R
S
x
Q
G
x
P
R
|
R
D
 
P
G
 
E
T
 
E
L
 
A
T
 
A
P
 
E
G
 
F
Q
 
Q
W
 
A
R
 
E
-
 
F
-
 
V
-
 
S
-
 
T
-
 
P
E
 
E
R
 
L
L
 
A
G
 
A
D
 
Q
Y
 
S
D
 
D
W
 
F
L
 
I
V
 
V
L
 
V
A
 
A
A
 
C
P
x
S
S
 
L
T
 
T
G
 
P
D
 
A
T
 
T
H
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
C
G
 
N
T
 
K
A
 
D
E
 
F
L
 
F
A
 
Q
A
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
E
G
 
T
A
 
A
W
 
V
L
 
F
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
S
R
|
R
G
 
G
D
 
D
M
 
V
V
 
V
D
 
N
Q
 
Q
P
 
D
A
 
D
L
 
L
I
 
Y
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
S
R
 
G
R
 
K
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
A
F
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
T
D
 
N
H
 
H
P
 
P
L
 
L
W
 
L
T
 
T
T
 
L
P
 
K
N
 
N
V
 
C
I
 
V
H
 
I
S
 
L
M
 
P
H
|
H
L
x
I
-
x
G
-
x
S
-
 
A
S
 
T
G
 
H
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
A
 
N
K
 
T
M
 
M
F
 
S
M
 
L
R
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
N
L
 
N
F
 
L
L
 
L
E
 
A
N
 
G
A
 
L
R
 
R
A
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
E
P
 
P
M
 
M
K
 
P
N
 
S
V
 
E
V
 
L
D
 
K
L
 
L

2gcgA Ternary crystal structure of human glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase (see paper)
32% identity, 81% coverage: 57:307/311 of query aligns to 66:324/324 of 2gcgA

query
sites
2gcgA
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
N
L
 
L
K
 
K
W
 
V
L
 
I
S
 
S
T
 
T
I
 
M
Y
x
S
A
x
V
G
|
G
I
 
I
D
 
D
A
 
H
F
 
L
D
 
A
V
 
L
D
 
D
L
 
E
L
 
I
K
 
K
T
 
K
R
 
R
G
 
G
T
 
I
I
 
R
L
 
V
T
 
G
N
 
Y
G
 
T
V
 
P
G
 
D
I
 
V
N
x
L
A
 
T
I
 
D
A
 
T
V
x
T
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
V
 
V
M
 
S
G
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
T
A
 
T
A
 
C
K
 
R
R
 
R
F
 
L
D
 
P
Q
 
E
V
 
A
V
 
I
R
 
E
M
 
E
A
 
V
D
 
K
R
 
N
R
 
G
E
 
G
W
 
W
P
 
T
A
 
S
D
 
W
A
 
K
P
 
P
-
 
L
-
 
W
-
 
L
G
 
C
K
 
G
V
 
Y
E
 
G
L
 
L
F
 
T
E
 
Q
T
 
S
R
 
T
A
 
V
L
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
Y
 
L
G
|
G
T
 
R
I
|
I
G
 
G
R
 
Q
M
 
A
I
 
I
G
 
A
D
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
P
F
 
F
G
 
G
V
 
V
D
 
Q
V
 
R
T
 
F
G
 
L
V
 
Y
T
 
T
-
x
G
R
|
R
S
 
Q
G
 
P
R
|
R
D
 
P
G
 
E
T
 
E
L
 
A
T
 
A
P
 
E
G
 
F
Q
 
Q
W
 
A
R
 
E
-
 
F
-
 
V
-
 
S
-
 
T
-
 
P
E
 
E
R
 
L
L
 
A
G
 
A
D
 
Q
Y
 
S
D
 
D
W
 
F
L
 
I
V
 
V
L
 
V
A
 
A
A
x
C
P
x
S
S
 
L
T
 
T
G
 
P
D
 
A
T
|
T
H
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
C
G
 
N
T
 
K
A
 
D
E
 
F
L
 
F
A
 
Q
A
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
E
G
 
T
A
 
A
W
 
V
L
 
F
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
S
R
|
R
G
 
G
D
 
D
M
 
V
V
 
V
D
 
N
Q
 
Q
P
 
D
A
 
D
L
 
L
I
 
Y
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
S
R
 
G
R
 
K
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
A
F
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
T
D
 
S
P
 
P
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
T
D
 
N
H
 
H
P
 
P
L
 
L
W
 
L
T
 
T
T
 
L
P
 
K
N
 
N
V
 
C
I
 
V
H
 
I
S
 
L
M
 
P
H
|
H
L
 
I
-
x
G
-
 
S
-
 
A
S
 
T
G
 
H
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
A
 
N
K
 
T
M
 
M
F
 
S
M
 
L
R
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
N
L
 
N
F
 
L
L
 
L
E
 
A
N
 
G
A
 
L
R
 
R
A
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
E
P
 
P
M
 
M
K
 
P
N
 
S
V
 
E
V
 
L
D
 
K
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6ttbA Crystal structure of NAD-dependent formate dehydrogenase from staphylococcus aureus in complex with NAD
31% identity, 72% coverage: 52:274/311 of query aligns to 69:295/331 of 6ttbA

query
sites
6ttbA
T
 
T
G
 
R
E
 
E
A
 
R
A
 
I
A
 
E
A
 
K
G
 
A
V
 
P
R
 
N
L
 
L
K
 
K
W
 
L
L
 
A
S
 
I
T
 
T
I
 
A
Y
 
G
A
x
V
G
 
G
I
 
S
D
 
D
A
 
H
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
A
L
 
A
L
 
A
K
 
S
T
 
E
R
 
H
G
 
N
T
 
I
I
 
G
L
 
V
T
 
V
N
 
E
G
 
V
V
 
T
G
 
G
I
 
S
N
|
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
A
 
A
V
 
V
M
 
M
G
 
D
M
 
L
L
 
L
A
 
I
A
 
L
A
 
L
K
 
R
R
 
N
F
 
Y
D
 
E
Q
 
E
V
 
G
V
 
H
R
 
R
M
 
Q
A
 
S
D
 
V
R
 
E
R
 
G
E
 
E
W
 
W
P
 
N
A
 
L
D
 
S
A
 
Q
P
 
V
G
 
G
K
 
N
V
 
H
-
 
A
-
 
H
E
 
E
L
 
L
F
 
Q
E
 
H
T
 
K
R
 
T
A
 
I
L
 
G
I
 
I
V
x
F
G
 
G
Y
 
F
G
|
G
T
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
Q
M
 
L
I
 
V
G
 
A
D
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
P
F
 
F
G
 
N
V
 
V
D
 
T
V
 
L
T
 
Q
G
 
H
V
x
Y
T
x
D
R
x
P
-
 
I
S
 
N
G
 
Q
R
 
Q
D
 
D
G
 
H
T
 
K
L
 
L
T
 
S
P
 
K
G
 
F
-
 
V
Q
 
S
W
 
F
R
 
D
E
 
E
R
 
L
L
 
V
G
 
S
D
 
S
Y
 
S
D
 
D
W
 
A
L
 
I
V
 
T
L
 
I
A
x
H
A
|
A
P
|
P
S
 
L
T
 
T
G
 
P
D
 
E
T
|
T
H
 
D
A
 
N
L
 
L
I
 
F
G
 
D
T
 
K
A
 
D
E
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
R
M
 
M
K
 
K
P
 
K
G
 
H
A
 
S
W
 
Y
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
D
 
K
M
 
I
V
 
V
D
 
N
Q
 
R
P
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
S
R
 
E
R
 
H
I
 
L
A
 
Q
G
 
G
A
 
Y
F
 
A
L
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
W
D
 
Y
P
 
P
E
 
Q
P
 
P
L
 
A
P
 
P
D
 
A
D
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
W
W
 
R
T
 
T
T
 
M
P
 
P
N
 
R
V
 
N
I
 
A
H
 
M
S
 
T
M
 
V
H
|
H
L
 
Y
S
|
S
G
|
G

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
30% identity, 77% coverage: 61:301/311 of query aligns to 65:306/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
R
 
K
L
 
L
K
 
E
W
 
I
L
 
V
S
 
S
T
 
S
I
 
F
Y
 
S
A
x
V
G
 
G
I
 
L
D
 
D
A
 
K
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
I
L
 
K
L
 
C
K
 
E
T
 
E
R
 
K
G
 
G
T
 
V
I
 
R
L
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
V
 
P
G
 
D
I
 
V
N
x
L
A
 
T
I
 
D
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
D
Y
 
L
A
 
A
V
 
I
M
 
G
G
 
L
M
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
V
A
 
L
K
 
R
R
 
R
F
 
I
D
 
C
Q
 
E
V
 
C
V
 
D
R
 
K
M
 
Y
A
 
V
D
 
R
R
 
R
R
 
G
E
 
A
W
 
W
P
 
K
-
 
F
A
 
G
D
 
D
A
 
F
P
 
K
G
 
L
K
 
T
V
 
T
E
 
K
L
 
F
F
 
S
E
 
G
T
 
K
R
 
R
A
 
V
L
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
Y
x
L
G
|
G
T
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
L
M
 
A
I
 
V
G
 
A
D
 
E
R
 
R
L
 
A
A
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
D
V
 
C
D
 
P
V
 
I
T
 
S
G
 
Y
V
 
F
T
x
S
R
|
R
S
|
S
G
 
K
R
 
K
D
 
P
G
 
N
T
 
T
-
 
N
-
 
Y
L
 
T
T
 
Y
P
 
Y
G
 
G
Q
 
S
W
 
V
R
 
V
E
 
E
R
 
L
L
 
A
G
 
S
D
 
N
Y
 
S
D
 
D
W
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
A
A
x
C
P
|
P
S
 
L
T
 
T
G
 
P
D
 
E
T
|
T
H
 
T
A
 
H
L
 
I
I
 
I
G
 
N
T
 
R
A
 
E
E
 
V
L
 
I
A
 
D
A
 
A
M
 
L
K
 
G
P
 
P
G
 
K
A
 
G
W
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
x
G
R
|
R
G
 
G
D
 
P
M
 
H
V
 
V
D
 
D
Q
 
E
P
 
P
A
 
E
L
 
L
I
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
E
 
V
K
 
E
R
 
G
R
 
R
I
 
L
A
 
G
G
 
G
A
|
A
F
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
F
D
 
E
P
 
R
E
|
E
P
 
P
-
 
E
L
 
V
P
 
P
D
 
E
D
 
K
H
 
-
P
 
-
L
 
L
W
 
F
T
 
G
T
 
L
P
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
V
H
 
L
S
 
L
M
 
P
H
|
H
L
 
V
-
x
G
S
 
S
G
 
G
R
 
T
S
 
V
Q
 
E
A
 
T
K
 
R
M
 
K
F
 
V
M
 
M
R
 
-
A
 
-
A
 
A
A
 
D
L
 
L
F
 
V
L
 
V
E
 
G
N
 
N
A
 
L
R
 
E
A
 
A
F
 
H
A
 
F
E
 
S
G
 
G
R
 
K
P
 
P
M
 
L

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
30% identity, 77% coverage: 61:301/311 of query aligns to 67:308/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
R
 
K
L
 
L
K
 
E
W
 
I
L
 
V
S
 
S
T
 
S
I
 
F
Y
 
S
A
 
V
G
 
G
I
 
L
D
 
D
A
 
K
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
I
L
 
K
L
 
C
K
 
E
T
 
E
R
 
K
G
 
G
T
 
V
I
 
R
L
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
V
 
P
G
 
D
I
 
V
N
 
L
A
 
T
I
 
D
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
D
Y
 
L
A
 
A
V
 
I
M
 
G
G
 
L
M
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
V
A
 
L
K
 
R
R
 
R
F
 
I
D
 
C
Q
 
E
V
 
C
V
 
D
R
 
K
M
 
Y
A
 
V
D
 
R
R
 
R
R
 
G
E
 
A
W
 
W
P
 
K
-
 
F
A
 
G
D
 
D
A
 
F
P
 
K
G
 
L
K
 
T
V
 
T
E
 
K
L
 
F
F
 
S
E
 
G
T
 
K
R
 
R
A
 
V
L
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
x
L
G
|
G
T
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
L
M
 
A
I
 
V
G
 
A
D
 
E
R
 
R
L
 
A
A
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
D
V
 
C
D
 
P
V
 
I
T
 
S
G
 
Y
V
 
F
T
x
S
R
|
R
S
|
S
G
 
K
R
 
K
D
 
P
G
 
N
T
 
T
-
 
N
-
 
Y
L
 
T
T
 
Y
P
 
Y
G
 
G
Q
 
S
W
 
V
R
 
V
E
 
E
R
 
L
L
 
A
G
 
S
D
 
N
Y
 
S
D
 
D
W
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
A
A
 
C
P
 
P
S
 
L
T
 
T
G
 
P
D
 
E
T
 
T
H
 
T
A
 
H
L
 
I
I
 
I
G
 
N
T
 
R
A
 
E
E
 
V
L
 
I
A
 
D
A
 
A
M
 
L
K
 
G
P
 
P
G
 
K
A
 
G
W
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
P
M
 
H
V
 
V
D
 
D
Q
 
E
P
 
P
A
 
E
L
 
L
I
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
E
 
V
K
 
E
R
 
G
R
 
R
I
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
F
D
 
E
P
 
R
E
 
E
P
 
P
-
 
E
L
 
V
P
 
P
D
 
E
D
 
K
H
 
-
P
 
-
L
 
L
W
 
F
T
 
G
T
 
L
P
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
V
H
 
L
S
 
L
M
 
P
H
 
H
L
 
V
-
 
G
S
 
S
G
 
G
R
 
T
S
 
V
Q
 
E
A
 
T
K
 
R
M
 
K
F
 
V
M
 
M
R
 
-
A
 
-
A
 
A
A
 
D
L
 
L
F
 
V
L
 
V
E
 
G
N
 
N
A
 
L
R
 
E
A
 
A
F
 
H
A
 
F
E
 
S
G
 
G
R
 
K
P
 
P
M
 
L

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
34% identity, 87% coverage: 29:298/311 of query aligns to 35:313/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
R
 
R
E
 
E
E
 
V
A
 
L
I
 
L
A
 
E
M
 
K
V
 
V
A
 
K
D
 
D
A
 
V
D
 
D
I
 
-
A
 
A
W
 
L
V
 
V
D
 
T
M
 
M
M
 
L
R
 
S
P
 
E
D
 
K
W
 
I
T
 
D
G
 
R
E
 
E
A
 
V
A
 
F
A
 
D
A
 
A
G
 
A
V
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
R
W
 
I
L
 
V
S
 
A
T
 
N
I
 
Y
Y
 
A
A
x
V
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
A
 
N
F
 
I
D
 
D
V
 
I
D
 
E
L
 
E
L
 
A
K
 
T
T
 
K
R
 
R
G
 
G
T
 
I
I
 
Y
L
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
V
 
P
G
 
D
I
 
V
N
x
L
A
 
T
I
 
D
A
 
A
V
x
T
A
 
A
E
 
D
Y
 
L
A
 
A
V
 
W
M
 
A
G
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
R
R
 
H
F
 
V
-
 
V
-
 
K
-
 
G
D
 
D
Q
 
K
V
 
F
V
 
V
R
 
R
M
 
S
A
 
G
D
 
E
-
 
W
-
 
K
R
 
R
R
 
R
-
 
G
-
 
I
E
 
A
W
 
W
P
 
H
A
 
P
D
 
K
A
 
M
P
 
F
G
 
L
K
 
G
V
 
Y
E
 
D
L
 
V
F
 
Y
E
 
G
T
 
K
R
 
T
A
 
I
L
 
G
I
 
I
V
 
V
G
|
G
Y
x
F
G
|
G
T
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
Q
M
 
A
I
 
I
G
 
A
D
 
K
R
 
R
L
 
A
A
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
G
V
 
M
D
 
R
V
 
I
T
 
L
G
 
Y
V
 
T
T
x
A
R
|
R
S
|
S
G
 
R
R
x
K
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
L
D
 
G
G
 
A
T
 
E
L
 
F
T
 
K
P
 
P
G
 
L
Q
 
E
W
 
-
R
 
-
E
 
E
R
 
L
L
 
L
G
 
R
D
 
E
Y
 
S
D
 
D
W
 
F
L
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
A
x
V
P
|
P
S
 
L
T
 
T
G
 
K
D
x
E
T
|
T
H
 
Y
A
 
H
L
 
M
I
 
I
G
 
N
T
 
E
A
 
E
E
 
R
L
 
L
A
 
R
A
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
G
 
T
A
 
A
W
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
D
 
K
M
 
V
V
 
V
D
 
D
Q
 
T
P
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
K
K
 
E
R
 
G
R
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
A
F
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
F
D
 
E
P
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
P
 
Y
D
 
D
D
 
E
H
 
E
P
 
-
L
 
L
W
 
F
T
 
A
T
 
L
P
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
V
H
 
L
S
 
T
M
 
P
H
|
H
L
 
I
-
x
G
S
 
S
G
 
A
R
 
T
S
 
F
Q
 
G
A
 
A
K
 
R
M
 
E
F
 
G
M
 
M
R
 
-
A
 
-
A
 
A
A
 
E
L
 
L
F
 
V
L
 
A
E
 
K
N
 
N
A
 
L
R
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
K
E
 
N
G
 
G

2nadA High resolution structures of holo and apo formate dehydrogenase (see paper)
30% identity, 86% coverage: 36:303/311 of query aligns to 87:363/391 of 2nadA

query
sites
2nadA
V
 
L
A
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
V
A
 
V
W
 
-
V
 
-
D
 
-
M
 
I
M
 
S
R
 
Q
P
|
P
D
x
F
W
 
W
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
T
 
T
G
 
P
E
 
E
A
 
R
A
 
I
A
 
A
A
 
K
G
 
A
V
 
K
R
 
N
L
 
L
K
 
K
W
 
L
L
 
A
S
 
L
T
 
T
I
 
A
Y
 
G
A
x
I
G
 
G
I
 
S
D
 
D
A
 
H
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
Q
L
 
S
L
 
A
K
 
I
T
 
D
R
 
R
G
 
N
T
 
V
I
 
T
L
 
V
T
 
A
N
 
E
G
 
V
V
 
T
G
 
Y
I
 
C
N
|
N
A
 
S
I
 
I
A
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
A
 
V
V
 
V
M
 
M
G
 
M
M
 
I
L
 
L
A
 
S
A
 
L
A
 
V
K
 
R
R
 
N
F
 
Y
D
 
L
Q
 
P
V
 
S
V
 
H
R
 
E
M
 
W
A
 
A
D
 
R
R
 
K
R
 
G
E
 
G
W
 
W
P
 
N
A
 
I
D
 
-
A
 
A
P
 
D
G
 
C
K
 
V
V
 
S
E
 
H
L
 
A
F
 
Y
E
 
D
T
 
L
R
 
E
A
 
A
L
 
M
I
 
H
V
 
V
G
 
G
Y
 
T
-
 
V
-
x
A
-
 
A
G
|
G
T
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
L
M
 
A
I
 
V
G
 
L
D
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
P
F
 
F
G
 
D
V
 
V
D
 
H
V
 
L
T
 
H
G
 
Y
V
 
T
T
x
D
R
 
R
S
 
H
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
S
-
 
V
G
 
E
R
 
K
D
 
E
G
 
L
T
 
N
L
 
L
T
 
T
P
 
W
G
 
H
Q
 
A
W
 
T
R
 
R
E
 
E
R
 
D
L
 
M
G
 
Y
D
 
P
-
 
V
Y
 
C
D
 
D
W
 
V
L
 
V
V
 
T
L
 
L
A
 
N
A
 
C
P
|
P
S
 
L
T
 
H
G
 
P
D
x
E
T
|
T
H
 
E
A
 
H
L
 
M
I
 
I
G
 
N
T
 
D
A
 
E
E
 
T
L
 
L
A
 
K
A
 
L
M
 
F
K
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
A
W
 
Y
L
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
D
 
K
M
 
L
V
 
C
D
 
D
Q
 
R
P
 
D
A
 
A
L
 
V
I
 
A
E
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
E
K
 
S
R
 
G
R
 
R
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
F
 
A
L
 
G
D
|
D
V
 
V
V
 
W
D
 
F
P
 
P
E
x
Q
P
 
P
L
 
A
P
 
P
D
 
K
D
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
W
W
 
R
T
 
T
T
 
M
P
 
P
N
 
Y
V
 
N
I
 
G
H
 
M
S
 
T
M
 
P
H
|
H
L
 
I
S
|
S
G
|
G
R
 
T
S
 
T
Q
 
L
A
 
T
K
 
A
M
 
Q
F
 
-
M
 
A
R
 
R
A
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
G
F
 
T
L
 
R
E
 
E
N
 
I
A
 
L
R
 
E
A
 
C
F
 
F
A
 
F
E
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
P
M
 
I
K
 
R
N
 
D

Sites not aligning to the query:

P33160 Formate dehydrogenase; FDH; NAD-dependent formate dehydrogenase; EC 1.17.1.9 from Pseudomonas sp. (strain 101) (Achromobacter parvulus T1) (see 3 papers)
30% identity, 86% coverage: 36:303/311 of query aligns to 88:364/401 of P33160

query
sites
P33160
V
 
L
A
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
V
A
 
V
W
 
-
V
 
-
D
 
-
M
 
I
M
 
S
R
 
Q
P
 
P
D
 
F
W
 
W
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
T
 
T
G
 
P
E
 
E
A
 
R
A
 
I
A
 
A
A
 
K
G
 
A
V
 
K
R
 
N
L
 
L
K
 
K
W
 
L
L
 
A
S
 
L
T
 
T
I
 
A
Y
 
G
A
x
I
G
 
G
I
 
S
D
 
D
A
 
H
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
Q
L
 
S
L
 
A
K
 
I
T
 
D
R
 
R
G
 
N
T
 
V
I
 
T
L
 
V
T
 
A
N
 
E
G
 
V
V
 
T
G
 
Y
I
 
C
N
|
N
A
x
S
I
 
I
A
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
A
 
V
V
 
V
M
 
M
G
 
M
M
 
I
L
 
L
A
 
S
A
 
L
A
 
V
K
 
R
R
 
N
F
 
Y
D
 
L
Q
 
P
V
 
S
V
 
H
R
 
E
M
 
W
A
 
A
D
 
R
R
 
K
R
 
G
E
 
G
W
 
W
P
 
N
A
 
I
D
 
-
A
 
A
P
 
D
G
 
C
K
 
V
V
 
S
E
 
H
L
 
A
F
 
Y
E
 
D
T
 
L
R
 
E
A
 
A
L
 
M
I
 
H
V
 
V
G
 
G
Y
 
T
-
 
V
-
 
A
-
 
A
G
 
G
T
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
L
M
 
A
I
 
V
G
 
L
D
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
P
F
 
F
G
 
D
V
 
V
D
 
H
V
 
L
T
 
H
G
 
Y
V
 
T
T
x
D
R
 
R
S
 
H
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
S
-
 
V
G
 
E
R
 
K
D
 
E
G
 
L
T
 
N
L
 
L
T
 
T
P
 
W
G
 
H
Q
 
A
W
 
T
R
 
R
E
 
E
R
 
D
L
 
M
G
 
Y
D
 
P
-
 
V
Y
 
C
D
 
D
W
 
V
L
 
V
V
 
T
L
 
L
A
 
N
A
x
C
P
|
P
S
x
L
T
x
H
G
x
P
D
x
E
T
 
T
H
 
E
A
 
H
L
 
M
I
 
I
G
 
N
T
 
D
A
 
E
E
 
T
L
 
L
A
 
K
A
 
L
M
 
F
K
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
A
W
 
Y
L
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
D
 
K
M
 
L
V
 
C
D
 
D
Q
 
R
P
 
D
A
 
A
L
 
V
I
 
A
E
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
E
K
 
S
R
 
G
R
 
R
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
F
 
A
L
 
G
D
|
D
V
 
V
V
 
W
D
 
F
P
 
P
E
 
Q
P
 
P
L
 
A
P
 
P
D
 
K
D
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
W
W
 
R
T
 
T
T
 
M
P
 
P
N
 
Y
V
 
N
I
 
G
H
 
M
S
 
T
M
 
P
H
|
H
L
x
I
S
|
S
G
|
G
R
 
T
S
 
T
Q
 
L
A
 
T
K
 
A
M
 
Q
F
 
-
M
 
A
R
 
R
A
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
G
F
 
T
L
 
R
E
 
E
N
 
I
A
 
L
R
 
E
A
 
C
F
 
F
A
 
F
E
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
P
M
 
I
K
 
R
N
 
D

Sites not aligning to the query:

P0A9T0 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; PGDH; 2-oxoglutarate reductase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
29% identity, 74% coverage: 48:277/311 of query aligns to 62:298/410 of P0A9T0

query
sites
P0A9T0
R
 
R
P
 
T
D
 
H
W
 
L
T
 
T
G
 
E
E
 
D
A
 
V
A
 
I
A
 
N
A
 
A
G
 
A
V
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
V
W
 
A
L
 
I
S
 
G
T
 
C
I
 
F
Y
 
C
A
 
I
G
 
G
I
 
T
D
 
N
A
 
Q
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
D
L
 
A
L
 
A
K
 
A
T
 
K
R
 
R
G
 
G
T
 
I
I
 
P
L
 
V
T
 
F
N
 
N
G
 
A
V
 
P
G
 
F
I
 
S
N
 
N
A
 
T
I
 
R
A
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
A
 
V
V
 
I
M
 
G
G
 
E
M
 
L
L
 
L
A
 
L
A
 
L
A
 
L
K
 
R
R
 
G
F
 
V
D
 
P
Q
 
E
V
 
A
V
 
N
R
 
A
M
 
K
A
 
A
D
 
H
R
 
R
R
 
G
E
 
V
W
 
W
P
 
N
A
 
K
D
 
L
A
 
A
P
 
A
G
 
G
K
 
S
V
 
F
E
 
E
L
 
A
F
 
R
E
 
G
T
 
K
R
 
K
A
 
L
L
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
x
H
I
|
I
G
 
G
R
 
T
M
 
Q
I
 
L
G
 
G
D
 
I
R
 
L
L
 
A
A
 
E
A
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
M
D
 
Y
V
 
V
T
 
Y
G
 
F
V
 
Y
T
x
D
R
 
I
S
 
E
G
 
N
R
 
K
D
 
L
-
 
P
-
 
L
G
 
G
T
 
N
L
 
A
T
 
T
P
 
Q
G
 
V
Q
 
Q
-
 
H
W
 
L
R
 
S
E
 
D
R
 
L
L
 
L
G
 
N
D
 
M
Y
 
S
D
 
D
W
 
V
L
 
V
V
 
S
L
 
L
A
 
H
A
 
V
P
 
P
S
 
E
T
 
N
G
 
P
D
 
S
T
 
T
H
 
K
A
 
N
L
 
M
I
 
M
G
 
G
T
 
A
A
 
K
E
 
E
L
 
I
A
 
S
A
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
S
W
 
L
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
D
 
T
M
 
V
V
 
V
D
 
D
Q
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
C
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
S
R
 
K
R
 
H
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
A
L
 
I
D
|
D
V
 
V
V
 
F
D
 
P
P
 
T
E
 
E
P
 
P
L
 
A
P
 
T
D
 
N
D
 
S
H
 
D
P
 
P
L
 
-
W
 
F
T
 
T
T
 
S
P
 
P
-
 
L
-
 
C
-
 
E
-
 
F
-
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
L
H
 
L
S
 
T
M
 
P
H
|
H
L
x
I
S
x
G
G
|
G
R
 
S
S
 
T
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

1psdA The allosteric ligand site in the vmax-type cooperative enzyme phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
29% identity, 74% coverage: 48:277/311 of query aligns to 56:292/404 of 1psdA

query
sites
1psdA
R
 
R
P
 
T
D
 
H
W
 
L
T
 
T
G
 
E
E
 
D
A
 
V
A
 
I
A
 
N
A
 
A
G
 
A
V
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
V
W
 
A
L
 
I
S
 
G
T
 
C
I
 
F
Y
 
C
A
 
I
G
 
G
I
 
T
D
 
N
A
 
Q
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
D
L
 
A
L
 
A
K
 
A
T
 
K
R
 
R
G
 
G
T
 
I
I
 
P
L
 
V
T
 
F
N
 
N
G
 
A
V
 
P
G
 
F
I
 
S
N
|
N
A
 
T
I
 
R
A
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
A
 
V
V
 
I
M
 
G
G
 
E
M
 
L
L
 
L
A
 
L
A
 
L
A
 
L
K
 
R
R
 
G
F
 
V
D
 
P
Q
 
E
V
 
A
V
 
N
R
 
A
M
 
K
A
 
A
D
 
H
R
 
R
R
 
G
E
 
V
W
 
W
P
 
N
A
 
K
D
 
L
A
 
A
P
 
A
G
 
G
K
 
S
V
 
F
E
 
E
L
 
A
F
 
R
E
 
G
T
 
K
R
 
K
A
 
L
L
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
x
H
I
|
I
G
 
G
R
 
T
M
 
Q
I
 
L
G
 
G
D
 
I
R
 
L
L
 
A
A
 
E
A
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
M
D
 
Y
V
 
V
T
 
Y
G
 
F
V
 
Y
T
x
D
R
x
I
S
 
E
G
 
N
R
x
K
D
 
L
-
 
P
-
 
L
G
 
G
T
 
N
L
 
A
T
 
T
P
 
Q
G
 
V
Q
 
Q
-
 
H
W
 
L
R
 
S
E
 
D
R
 
L
L
 
L
G
 
N
D
 
M
Y
 
S
D
 
D
W
 
V
L
 
V
V
 
S
L
 
L
A
x
H
A
x
V
P
|
P
S
 
E
T
 
N
G
 
P
D
 
S
T
 
T
H
 
K
A
 
N
L
 
M
I
 
M
G
 
G
T
 
A
A
 
K
E
 
E
L
 
I
A
 
S
A
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
S
W
 
L
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
D
 
T
M
 
V
V
 
V
D
 
D
Q
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
C
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
S
R
 
K
R
 
H
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
A
L
 
I
D
|
D
V
 
V
V
 
F
D
 
P
P
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
A
P
 
T
D
 
N
D
 
S
H
 
D
P
 
P
L
 
-
W
 
F
T
 
T
T
 
S
P
 
P
-
 
L
-
 
C
-
 
E
-
 
F
-
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
L
H
 
L
S
 
T
M
 
P
H
|
H
L
 
I
S
 
G
G
 
G
R
 
S
S
 
T
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

1ybaA The active form of phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
29% identity, 74% coverage: 48:277/311 of query aligns to 58:294/406 of 1ybaA

query
sites
1ybaA
R
 
R
P
 
T
D
 
H
W
 
L
T
 
T
G
 
E
E
 
D
A
 
V
A
 
I
A
 
N
A
 
A
G
 
A
V
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
V
W
 
A
L
 
I
S
 
G
T
 
C
I
 
F
Y
x
C
A
x
I
G
|
G
I
 
T
D
x
N
A
 
Q
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
D
L
 
A
L
 
A
K
 
A
T
 
K
R
 
R
G
 
G
T
 
I
I
 
P
L
 
V
T
 
F
N
 
N
G
 
A
V
 
P
G
x
F
I
 
S
N
|
N
A
 
T
I
 
R
A
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
A
 
V
V
 
I
M
 
G
G
 
E
M
 
L
L
 
L
A
 
L
A
 
L
A
 
L
K
 
R
R
 
G
F
 
V
D
 
P
Q
 
E
V
 
A
V
 
N
R
 
A
M
 
K
A
 
A
D
 
H
R
 
R
R
 
G
E
 
V
W
 
W
P
 
N
A
 
K
D
 
L
A
 
A
P
 
A
G
 
G
K
 
S
V
 
F
E
 
E
L
 
A
F
 
R
E
 
G
T
 
K
R
 
K
A
 
L
L
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
Y
 
Y
G
|
G
T
x
H
I
|
I
G
 
G
R
 
T
M
 
Q
I
 
L
G
 
G
D
 
I
R
 
L
L
 
A
A
 
E
A
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
M
D
 
Y
V
 
V
T
 
Y
G
 
F
V
x
Y
T
x
D
R
x
I
S
 
E
G
 
N
R
x
K
D
 
L
-
 
P
-
 
L
G
 
G
T
 
N
L
 
A
T
 
T
P
 
Q
G
 
V
Q
 
Q
-
 
H
W
 
L
R
 
S
E
 
D
R
 
L
L
 
L
G
 
N
D
 
M
Y
 
S
D
 
D
W
 
V
L
 
V
V
 
S
L
 
L
A
x
H
A
x
V
P
|
P
S
 
E
T
 
N
G
 
P
D
 
S
T
 
T
H
 
K
A
 
N
L
 
M
I
 
M
G
 
G
T
 
A
A
 
K
E
 
E
L
 
I
A
 
S
A
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
S
W
 
L
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
D
 
T
M
 
V
V
 
V
D
 
D
Q
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
C
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
S
R
 
K
R
 
H
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
A
L
 
I
D
|
D
V
 
V
V
 
F
D
 
P
P
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
A
P
 
T
D
 
N
D
 
S
H
 
D
P
 
P
L
 
-
W
 
F
T
 
T
T
 
S
P
 
P
-
 
L
-
 
C
-
 
E
-
 
F
-
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
L
H
 
L
S
 
T
M
 
P
H
|
H
L
 
I
S
x
G
G
 
G
R
 
S
S
 
T
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

6jujA Crystal structure of formate dehydrogenase mutant v198i/c256i/p260s/e261p/s381n/s383f from pseudomonas sp. 101in complex with non-natural cofactor nicotinamide cytosine dinucleotide (see paper)
30% identity, 86% coverage: 36:303/311 of query aligns to 87:363/381 of 6jujA

query
sites
6jujA
V
 
L
A
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
V
A
 
V
W
 
-
V
 
-
D
 
-
M
 
I
M
 
S
R
 
Q
P
 
P
D
x
F
W
 
W
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
T
 
T
G
 
P
E
 
E
A
 
R
A
 
I
A
 
A
A
 
K
G
 
A
V
 
K
R
 
N
L
 
L
K
 
K
W
 
L
L
 
A
S
 
L
T
 
T
I
 
A
Y
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
S
D
 
D
A
 
H
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
Q
L
 
S
L
 
A
K
 
I
T
 
D
R
 
R
G
 
N
T
 
V
I
 
T
L
 
V
T
 
A
N
 
E
G
 
V
V
 
T
G
 
Y
I
 
C
N
|
N
A
 
S
I
 
I
A
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
A
 
V
V
 
V
M
 
M
G
 
M
M
 
I
L
 
L
A
 
S
A
 
L
A
 
V
K
 
R
R
 
N
F
 
Y
D
 
L
Q
 
P
V
 
S
V
 
H
R
 
E
M
 
W
A
 
A
D
 
R
R
 
K
R
 
G
E
 
G
W
 
W
P
 
N
A
 
I
D
 
-
A
 
A
P
 
D
G
 
C
K
 
V
V
 
S
E
 
H
L
 
A
F
 
Y
E
 
D
T
 
L
R
 
E
A
 
A
L
 
M
I
 
H
V
 
V
G
 
G
Y
 
T
-
 
I
-
 
A
-
 
A
G
|
G
T
 
R
I
|
I
G
 
G
R
 
L
M
 
A
I
 
V
G
 
L
D
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
P
F
 
F
G
 
D
V
 
V
D
 
H
V
 
L
T
 
H
G
 
Y
V
 
T
T
x
D
R
|
R
S
 
H
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
S
-
 
V
G
 
E
R
 
K
D
 
E
G
 
L
T
 
N
L
 
L
T
 
T
P
 
W
G
 
H
Q
 
A
W
 
T
R
 
R
E
 
E
R
 
D
L
 
M
G
 
Y
D
 
P
-
 
V
Y
 
C
D
 
D
W
 
V
L
 
V
V
 
T
L
 
L
A
 
N
A
x
I
P
|
P
S
 
L
T
x
H
G
 
S
D
 
P
T
 
T
H
 
E
A
 
H
L
 
M
I
 
I
G
 
N
T
 
D
A
 
E
E
 
T
L
 
L
A
 
K
A
 
L
M
 
F
K
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
A
W
 
Y
L
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
A
|
A
R
 
R
G
 
G
D
 
K
M
 
L
V
 
C
D
 
D
Q
 
R
P
 
D
A
 
A
L
 
V
I
 
A
E
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
E
K
 
S
R
 
G
R
 
R
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
F
 
A
L
 
G
D
|
D
V
 
V
V
 
W
D
 
F
P
 
P
E
 
Q
P
 
P
L
 
A
P
 
P
D
 
K
D
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
W
W
 
R
T
 
T
T
 
M
P
 
P
N
 
Y
V
 
N
I
 
G
H
 
M
S
 
T
M
 
P
H
|
H
L
 
I
S
|
S
G
|
G
R
 
T
S
 
T
Q
 
L
A
 
T
K
 
A
M
 
Q
F
 
-
M
 
A
R
 
R
A
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
G
F
 
T
L
 
R
E
 
E
N
 
I
A
 
L
R
 
E
A
 
C
F
 
F
A
 
F
E
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
P
M
 
I
K
 
R
N
 
D

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
30% identity, 93% coverage: 21:310/311 of query aligns to 22:315/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
I
 
V
E
 
E
P
 
V
H
 
R
W
 
W
F
 
V
-
 
D
-
 
G
A
 
P
S
 
D
R
 
R
E
 
D
E
 
K
A
 
L
I
 
L
A
 
A
M
 
A
V
 
V
A
 
P
D
 
E
A
 
A
D
 
D
I
 
A
A
 
L
W
 
L
V
 
V
D
 
-
M
 
-
M
 
-
R
 
R
P
 
S
D
 
A
W
 
T
T
 
T
-
 
V
-
 
D
G
 
A
E
 
E
A
 
V
A
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
A
V
 
P
R
 
K
L
 
L
K
 
K
W
 
I
L
 
V
S
 
A
T
 
R
I
 
A
Y
 
G
A
 
V
G
 
G
I
 
L
D
 
D
A
 
N
F
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
A
L
 
A
K
 
T
T
 
A
R
 
R
G
 
G
T
 
V
I
 
L
L
 
V
T
 
V
N
 
N
G
 
A
V
 
P
G
 
T
I
 
S
N
|
N
A
 
I
I
 
H
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
A
 
A
V
 
L
M
 
A
G
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
 
R
R
 
Q
F
 
I
D
 
P
Q
 
A
V
 
A
V
 
D
R
 
A
M
 
S
A
 
L
D
 
R
R
 
E
R
 
H
E
 
T
W
 
W
P
 
K
A
 
R
D
 
S
A
 
S
P
 
F
G
 
S
K
 
G
V
 
T
E
 
E
L
 
I
F
 
F
E
 
G
T
 
K
R
 
T
A
 
V
L
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
G
 
G
T
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
Q
M
 
L
I
 
V
G
 
A
D
 
Q
R
 
R
L
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
V
 
A
D
 
Y
V
 
V
T
 
V
G
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
A
R
 
Y
D
 
D
G
 
P
T
 
Y
L
 
V
T
 
S
P
 
P
G
 
A
Q
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
S
W
 
L
R
 
D
E
 
D
R
 
L
L
 
L
G
 
A
D
 
R
Y
 
A
D
 
D
W
 
F
L
 
I
V
 
S
L
 
V
A
 
H
A
 
L
P
 
P
S
 
K
T
 
T
G
 
P
D
 
E
T
 
T
H
 
A
A
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
D
T
 
K
A
 
E
E
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
K
M
 
T
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
V
W
 
I
L
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
D
 
G
M
 
L
V
 
V
D
 
D
Q
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
I
E
 
T
K
 
G
R
 
G
R
 
H
I
 
V
A
 
R
G
 
A
A
 
A
F
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
F
D
 
A
P
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
C
P
 
T
D
 
-
D
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
F
T
 
E
T
 
L
P
 
A
N
 
Q
V
 
V
I
 
V
H
 
V
S
 
T
M
 
P
H
|
H
L
 
L
S
 
-
G
 
G
R
 
A
S
 
S
Q
 
T
A
 
A
K
 
E
M
 
A
F
 
Q
M
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
G
A
 
T
L
 
D
F
 
V
L
 
A
E
 
E
N
 
S
A
 
V
R
 
R
A
 
L
F
 
A
A
 
L
E
 
A
G
 
G
R
 
E
P
 
F
M
 
V
K
 
P
N
 
D
V
 
A
V
 
V
D
 
N
L
 
V
D
 
G
A
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
30% identity, 93% coverage: 21:310/311 of query aligns to 23:316/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
I
 
V
E
 
E
P
 
V
H
 
R
W
 
W
F
 
V
-
 
D
-
 
G
A
 
P
S
 
D
R
 
R
E
 
D
E
 
K
A
 
L
I
 
L
A
 
A
M
 
A
V
 
V
A
 
P
D
 
E
A
 
A
D
 
D
I
 
A
A
 
L
W
 
L
V
 
V
D
 
-
M
 
-
M
 
-
R
 
R
P
 
S
D
 
A
W
 
T
T
 
T
-
 
V
-
 
D
G
 
A
E
 
E
A
 
V
A
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
A
V
 
P
R
 
K
L
 
L
K
 
K
W
 
I
L
 
V
S
 
A
T
x
R
I
 
A
Y
 
G
A
x
V
G
 
G
I
 
L
D
 
D
A
 
N
F
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
A
L
 
A
K
 
T
T
 
A
R
 
R
G
 
G
T
 
V
I
 
L
L
 
V
T
 
V
N
 
N
G
 
A
V
 
P
G
 
T
I
 
S
N
|
N
A
 
I
I
 
H
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
A
 
A
V
 
L
M
 
A
G
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
 
R
R
 
Q
F
 
I
D
 
P
Q
 
A
V
 
A
V
 
D
R
 
A
M
 
S
A
 
L
D
 
R
R
 
E
R
 
H
E
 
T
W
 
W
P
 
K
A
 
R
D
 
S
A
 
S
P
 
F
G
 
S
K
 
G
V
 
T
E
 
E
L
 
I
F
 
F
E
 
G
T
 
K
R
 
T
A
 
V
L
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
G
 
G
T
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
Q
M
 
L
I
 
V
G
 
A
D
 
Q
R
 
R
L
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
V
 
A
D
 
Y
V
 
V
T
 
V
G
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
A
R
 
Y
D
 
D
G
 
P
T
 
Y
L
 
V
T
 
S
P
 
P
G
 
A
Q
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
S
W
 
L
R
 
D
E
 
D
R
 
L
L
 
L
G
 
A
D
 
R
Y
 
A
D
 
D
W
 
F
L
 
I
V
 
S
L
 
V
A
 
H
A
 
L
P
 
P
S
 
K
T
 
T
G
 
P
D
 
E
T
 
T
H
 
A
A
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
D
T
 
K
A
 
E
E
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
K
M
 
T
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
V
W
 
I
L
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
D
 
G
M
 
L
V
 
V
D
 
D
Q
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
I
E
 
T
K
 
G
R
 
G
R
 
H
I
 
V
A
 
R
G
 
A
A
 
A
F
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
F
D
 
A
P
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
C
P
 
T
D
 
-
D
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
F
T
 
E
T
 
L
P
 
A
N
 
Q
V
 
V
I
 
V
H
 
V
S
 
T
M
 
P
H
|
H
L
 
L
S
 
-
G
 
G
R
x
A
S
 
S
Q
 
T
A
 
A
K
 
E
M
 
A
F
x
Q
M
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
G
A
 
T
L
 
D
F
 
V
L
 
A
E
 
E
N
 
S
A
 
V
R
 
R
A
 
L
F
 
A
A
 
L
E
 
A
G
 
G
R
 
E
P
 
F
M
 
V
K
 
P
N
 
D
V
 
A
V
 
V
D
 
N
L
 
V
D
 
G
A
 
G
G
 
G

7ya4A Formate dehydrogenase from novosphingobium sp. Ap12 with NAD and azide
29% identity, 77% coverage: 71:310/311 of query aligns to 123:371/384 of 7ya4A

query
sites
7ya4A
G
 
G
I
 
S
D
 
D
A
 
H
F
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
L
 
S
L
 
A
K
 
I
T
 
K
R
 
H
G
 
G
T
 
V
I
 
T
L
 
V
T
 
A
N
 
E
G
 
V
V
 
T
G
 
G
I
 
S
N
|
N
A
x
S
I
 
I
A
 
S
V
|
V
A
 
S
E
 
E
Y
 
H
A
 
A
V
 
V
M
 
M
G
 
M
M
 
I
L
 
L
A
 
S
A
 
L
A
 
V
K
 
R
R
 
N
F
 
Y
D
 
I
Q
 
P
V
 
A
V
 
H
R
 
E
M
 
W
A
 
A
D
 
E
R
 
K
R
 
G
E
 
G
W
 
W
P
 
N
-
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
C
P
 
V
G
 
E
K
 
R
V
 
S
E
 
-
L
 
-
F
 
Y
E
 
D
T
 
V
R
 
E
A
 
G
L
 
M
I
 
H
V
 
V
G
 
G
Y
 
T
-
 
V
-
x
A
-
 
A
G
|
G
T
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
L
M
 
A
I
 
I
G
 
L
D
 
K
R
 
R
L
 
M
A
 
K
A
 
P
F
 
F
G
 
D
V
 
V
D
 
H
V
 
L
T
 
H
G
 
Y
V
x
Y
T
 
A
R
|
R
-
 
H
-
 
R
-
 
L
S
 
S
G
 
K
R
 
E
D
 
E
G
 
E
T
 
E
L
 
E
T
 
L
P
 
G
G
 
L
Q
 
T
W
 
F
R
 
H
E
 
E
R
 
N
L
 
V
G
 
E
D
 
D
-
 
M
-
 
V
-
 
K
-
 
V
Y
 
C
D
 
D
W
 
V
L
 
V
V
 
T
L
 
I
A
 
N
A
 
A
P
|
P
S
 
L
T
x
H
G
 
P
D
x
E
T
|
T
H
 
H
A
 
H
L
 
M
I
 
F
G
 
D
T
 
E
A
 
A
E
 
M
L
 
I
A
 
K
A
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
A
W
 
Y
L
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
A
D
 
E
M
 
I
V
 
C
D
 
D
Q
 
R
P
 
D
A
 
A
L
 
I
I
 
V
E
 
R
A
 
A
L
 
V
E
 
E
K
 
S
R
 
G
R
 
H
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
F
 
A
L
 
G
D
|
D
V
 
V
V
 
W
D
 
N
P
 
P
E
 
Q
P
 
P
L
 
A
P
 
P
D
 
A
D
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
W
W
 
R
T
 
T
T
 
M
P
 
P
N
 
W
V
 
N
I
 
G
H
 
M
S
 
T
M
 
P
H
|
H
L
 
M
S
|
S
G
|
G
R
 
T
S
 
S
Q
 
L
A
 
S
K
 
G
M
 
Q
F
 
-
M
 
A
R
 
R
A
 
Y
A
 
T
A
 
A
L
 
G
F
 
T
L
 
R
E
 
E
N
 
I
A
 
L
R
 
E
A
 
C
F
 
W
A
 
F
E
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
P
M
 
I
K
 
R
-
 
E
N
 
D
V
 
Y
V
 
V
D
 
I
L
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Ga0059261_0925 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_0925
MKAVLPALARPLIEPGLPAGIEPHWFASREEAIAMVADADIAWVDMMRPDWTGEAAAAGV
RLKWLSTIYAGIDAFDVDLLKTRGTILTNGVGINAIAVAEYAVMGMLAAAKRFDQVVRMA
DRREWPADAPGKVELFETRALIVGYGTIGRMIGDRLAAFGVDVTGVTRSGRDGTLTPGQW
RERLGDYDWLVLAAPSTGDTHALIGTAELAAMKPGAWLVNVARGDMVDQPALIEALEKRR
IAGAFLDVVDPEPLPDDHPLWTTPNVIHSMHLSGRSQAKMFMRAAALFLENARAFAEGRP
MKNVVDLDAGY

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory