SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_1343 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_1343 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3urhB Crystal structure of a dihydrolipoamide dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021
58% identity, 99% coverage: 6:463/464 of query aligns to 1:465/465 of 3urhB

query
sites
3urhB
F
 
Y
D
 
D
V
 
L
L
 
I
V
 
V
I
|
I
G
|
G
S
 
S
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
C
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
M
K
 
K
T
 
V
A
 
A
C
 
V
A
 
V
E
|
E
G
x
K
R
 
R
E
 
S
T
 
T
L
x
Y
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
M
Y
 
F
E
 
H
E
 
Q
A
 
A
A
 
Q
S
 
H
G
 
G
A
 
-
L
 
L
A
 
E
K
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
E
L
 
V
G
 
A
K
 
N
V
 
P
E
 
K
L
 
L
D
 
N
L
 
L
D
 
Q
A
 
K
M
 
M
H
 
M
A
 
A
Q
 
H
R
 
K
L
 
D
D
 
A
A
 
T
V
 
V
K
 
K
G
 
S
L
 
N
T
 
V
G
 
D
G
 
G
I
 
V
E
 
S
F
 
F
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
K
N
 
N
K
 
K
V
 
I
E
 
D
W
 
G
L
 
F
K
 
Q
G
 
G
Y
x
T
A
x
G
T
 
K
F
 
V
T
 
L
G
 
G
K
 
Q
D
 
G
S
 
K
V
 
V
K
 
S
V
 
V
-
 
T
-
 
N
-
 
E
-
 
K
G
 
G
D
 
E
R
 
E
E
 
Q
V
 
V
-
 
L
R
 
E
A
 
A
K
 
K
N
 
N
I
 
V
V
 
V
I
 
I
A
|
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
D
V
 
V
T
 
A
P
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
V
-
 
A
-
 
F
D
 
D
Q
 
E
K
 
K
I
 
T
V
 
I
V
 
V
D
 
S
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
L
A
 
E
K
 
K
V
 
V
P
 
P
E
 
A
H
 
S
L
 
M
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
A
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
Y
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
T
I
 
I
L
 
L
P
 
G
G
 
G
F
 
M
D
 
D
A
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
A
K
 
K
E
 
Q
A
 
L
A
 
Q
R
 
R
L
 
M
F
 
L
K
 
T
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
D
F
 
F
K
 
K
T
 
L
G
 
G
T
 
A
K
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
V
V
 
K
K
 
S
G
 
G
G
 
D
K
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
V
T
 
T
V
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
V
A
 
K
G
 
G
G
 
G
A
 
E
A
 
A
E
 
T
T
 
T
I
 
L
E
 
D
A
 
A
D
 
E
N
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
I
A
 
A
I
 
T
G
 
G
R
|
R
K
 
K
P
 
P
N
 
S
T
 
T
D
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
A
A
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
T
 
V
V
 
L
N
 
D
Q
 
S
R
 
R
G
 
G
Q
 
R
I
 
V
E
 
E
T
 
I
D
 
D
H
 
R
S
 
H
F
 
F
K
 
Q
T
 
T
S
 
S
V
 
I
P
 
A
G
 
G
I
 
V
W
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
V
I
 
V
P
 
R
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
Q
T
 
A
G
 
G
I
 
H
V
 
V
N
 
N
H
 
Y
D
 
D
V
 
V
I
 
I
P
 
P
S
 
G
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
M
 
Q
P
 
P
E
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
E
A
 
L
K
 
K
A
 
A
K
 
A
G
 
G
-
 
V
E
 
A
V
 
Y
K
 
K
V
 
I
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
M
 
F
A
 
T
G
 
A
N
 
N
S
 
G
R
 
R
A
 
A
K
 
R
T
 
A
N
 
M
H
 
L
E
 
Q
P
 
T
D
 
D
G
 
G
F
 
F
V
 
V
K
 
K
V
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
K
K
 
E
T
 
T
D
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
G
W
 
H
I
 
I
I
 
I
T
 
G
S
 
F
V
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
E
M
 
M
I
 
I
A
 
H
Q
 
E
A
 
I
A
 
A
Q
 
V
A
 
L
M
 
M
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
G
T
 
S
S
 
S
E
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
G
Y
 
R
T
 
T
C
 
C
H
|
H
A
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
H
 
M
S
 
S
E
|
E
A
 
A
I
 
V
K
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
S
V
 
T
T
 
F
G
 
F
K
 
K
P
 
P
I
 
I
H
 
H

P31023 Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial; Dihydrolipoamide dehydrogenase; Glycine cleavage system L protein; Pyruvate dehydrogenase complex E3 subunit; E3; PDC-E3; EC 1.8.1.4 from Pisum sativum (Garden pea) (Lathyrus oleraceus) (see 2 papers)
56% identity, 99% coverage: 7:464/464 of query aligns to 39:501/501 of P31023

query
sites
P31023
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
S
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
K
T
 
T
A
 
T
C
 
C
A
 
I
E
|
E
G
x
K
R
|
R
E
x
G
T
x
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
 
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
 
S
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
S
S
 
S
E
 
H
L
 
M
Y
 
Y
E
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
K
S
 
H
G
 
-
A
 
S
L
 
F
A
 
A
K
 
N
L
 
H
G
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
V
G
 
S
K
 
N
V
 
V
E
 
E
L
 
I
D
 
D
L
 
L
D
 
A
A
 
A
M
 
M
H
 
M
A
 
G
Q
 
Q
R
 
K
L
 
D
D
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
S
G
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
E
F
 
G
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
K
N
 
N
K
 
K
V
 
V
E
 
T
W
 
Y
L
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
A
x
G
T
 
K
F
 
F
T
 
V
G
 
S
K
 
P
D
 
S
S
 
E
V
 
I
K
 
S
V
 
V
G
 
D
D
 
T
R
 
I
E
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
N
-
 
T
-
 
V
V
 
V
R
 
K
A
 
G
K
 
K
N
 
H
I
 
I
V
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
D
V
 
V
T
 
K
P
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
V
E
 
T
I
 
I
D
 
D
Q
 
E
K
 
K
I
 
K
V
 
I
V
 
V
D
 
S
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
L
A
 
S
K
 
E
V
 
I
P
 
P
E
 
K
H
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
Y
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
M
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
G
R
 
R
V
 
I
G
 
G
A
 
S
K
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
Y
 
F
L
 
A
D
 
S
Q
 
E
I
 
I
L
 
V
P
 
P
G
 
T
F
 
M
D
 
D
A
 
A
D
 
E
V
 
I
R
 
R
K
 
K
E
 
Q
A
 
F
A
 
Q
R
 
R
L
 
S
F
 
L
K
 
E
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
M
E
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
L
G
 
K
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
D
V
 
T
K
 
S
G
 
G
G
 
D
K
 
G
A
 
V
T
 
K
I
 
L
T
 
T
V
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
E
A
 
Q
E
 
T
T
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
D
 
D
N
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
S
I
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
T
P
 
P
N
 
F
T
 
T
D
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
K
A
 
I
G
 
G
L
 
V
T
 
E
V
 
T
N
 
D
Q
 
K
R
 
L
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
E
 
L
T
 
V
D
 
N
H
 
E
S
 
R
F
 
F
K
 
S
T
 
T
S
 
N
V
 
V
P
 
S
G
 
G
I
 
V
W
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
E
E
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
A
V
 
C
A
 
V
E
 
E
N
 
Y
I
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
K
T
 
V
G
 
G
I
 
H
V
 
V
N
 
D
H
 
Y
D
 
D
V
 
K
I
 
V
P
 
P
S
 
G
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
M
 
N
P
 
P
E
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
Q
A
 
V
K
 
K
A
 
E
K
 
T
G
 
G
-
 
V
E
 
E
V
 
Y
K
 
R
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
M
 
F
A
 
M
G
 
A
N
 
N
S
 
S
R
 
R
A
 
A
K
 
K
T
 
A
N
 
I
H
 
D
E
 
N
P
 
A
D
 
E
G
 
G
F
 
L
V
 
V
K
 
K
V
 
I
I
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
K
K
 
E
T
 
T
D
 
D
R
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
V
W
 
H
I
 
I
I
 
M
T
 
A
S
 
P
V
 
N
A
 
A
G
 
G
T
 
E
M
 
L
I
 
I
A
 
H
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
I
A
 
A
M
 
L
E
 
Q
F
 
Y
G
 
D
A
 
A
T
 
S
S
 
S
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
Y
 
R
T
 
V
C
 
C
H
 
H
A
 
A
H
 
H
P
 
P
T
 
T
H
 
M
S
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
T
T
 
Y
G
 
D
K
 
K
P
 
P
I
 
I
H
 
H
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1dxlA Dihydrolipoamide dehydrogenase of glycine decarboxylase from pisum sativum (see paper)
56% identity, 99% coverage: 7:464/464 of query aligns to 5:467/467 of 1dxlA

query
sites
1dxlA
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
I
I
|
I
G
 
G
S
 
G
G
 
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
K
T
 
T
A
 
T
C
 
C
A
 
I
E
|
E
G
x
K
R
|
R
E
 
G
T
 
A
L
|
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
S
S
 
S
E
 
H
L
 
M
Y
 
Y
E
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
K
S
 
H
G
 
-
A
 
S
L
 
F
A
 
A
K
 
N
L
 
H
G
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
V
G
 
S
K
 
N
V
 
V
E
 
E
L
 
I
D
 
D
L
 
L
D
 
A
A
 
A
M
 
M
H
 
M
A
 
G
Q
 
Q
R
 
K
L
 
D
D
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
S
G
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
E
F
 
G
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
K
N
 
N
K
 
K
V
 
V
E
 
T
W
 
Y
L
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
|
Y
A
x
G
T
 
K
F
 
F
T
 
V
G
 
S
K
 
P
D
 
S
S
 
E
V
 
I
K
 
S
V
 
V
G
 
D
D
 
T
R
 
I
E
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
N
-
 
T
-
 
V
V
 
V
R
 
K
A
 
G
K
 
K
N
 
H
I
 
I
V
 
I
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
D
V
 
V
T
 
K
P
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
V
E
 
T
I
 
I
D
 
D
Q
 
E
K
 
K
I
 
K
V
 
I
V
 
V
D
 
S
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
L
A
 
S
K
 
E
V
 
I
P
 
P
E
 
K
H
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
x
Y
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
L
 
M
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
G
R
 
R
V
 
I
G
 
G
A
 
S
K
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
Y
 
F
L
 
A
D
 
S
Q
 
E
I
 
I
L
 
V
P
 
P
G
 
T
F
 
M
D
 
D
A
 
A
D
 
E
V
 
I
R
 
R
K
 
K
E
 
Q
A
 
F
A
 
Q
R
 
R
L
 
S
F
 
L
K
 
E
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
M
E
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
L
G
 
K
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
D
V
 
T
K
 
S
G
 
G
G
 
D
K
 
G
A
 
V
T
 
K
I
 
L
T
 
T
V
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
E
A
 
Q
E
 
T
T
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
D
 
D
N
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
S
I
 
A
G
 
G
R
|
R
K
 
T
P
 
P
N
 
F
T
 
T
D
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
K
A
 
I
G
 
G
L
 
V
T
 
E
V
 
T
N
 
D
Q
 
K
R
 
L
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
E
 
L
T
 
V
D
 
N
H
 
E
S
 
R
F
 
F
K
 
S
T
 
T
S
 
N
V
 
V
P
 
S
G
 
G
I
 
V
W
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
E
E
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
A
V
 
C
A
 
V
E
 
E
N
 
Y
I
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
K
T
 
V
G
 
G
I
 
H
V
 
V
N
 
D
H
 
Y
D
 
D
V
 
K
I
 
V
P
 
P
S
 
G
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
M
 
N
P
 
P
E
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
Q
A
 
V
K
 
K
A
 
E
K
 
T
G
 
G
-
 
V
E
 
E
V
 
Y
K
 
R
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
M
 
F
A
 
M
G
 
A
N
 
N
S
 
S
R
 
R
A
 
A
K
 
K
T
 
A
N
 
I
H
 
D
E
 
N
P
 
A
D
 
E
G
 
G
F
 
L
V
 
V
K
 
K
V
 
I
I
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
K
K
 
E
T
 
T
D
 
D
R
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
V
W
 
H
I
 
I
I
 
M
T
 
A
S
 
P
V
 
N
A
 
A
G
 
G
T
 
E
M
 
L
I
 
I
A
 
H
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
I
A
 
A
M
 
L
E
 
Q
F
 
Y
G
 
D
A
 
A
T
 
S
S
 
S
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
Y
 
R
T
 
V
C
 
C
H
|
H
A
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
H
 
M
S
 
S
E
|
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
T
T
 
Y
G
 
D
K
 
K
P
 
P
I
 
I
H
 
H
I
 
I

1zmdA Crystal structure of human dihydrolipoamide dehydrogenase complexed to nadh (see paper)
55% identity, 99% coverage: 5:464/464 of query aligns to 4:472/472 of 1zmdA

query
sites
1zmdA
D
 
D
F
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
T
V
 
V
I
|
I
G
|
G
S
 
S
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
K
T
 
T
A
 
V
C
 
C
A
 
I
E
|
E
G
x
K
R
x
N
E
 
E
T
 
T
L
|
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
N
A
 
N
S
 
S
E
 
H
L
 
Y
Y
 
Y
E
 
H
E
 
M
A
 
A
A
 
H
S
 
G
G
 
T
A
 
D
L
 
F
A
 
A
K
 
S
L
 
R
G
 
G
V
 
I
K
 
E
L
 
M
G
 
S
K
 
E
V
 
V
E
 
R
L
 
L
D
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
K
M
 
M
H
 
M
A
 
E
Q
 
Q
R
 
K
L
 
S
D
 
T
A
 
A
V
 
V
K
 
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
A
F
 
H
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
Q
N
 
N
K
 
K
V
 
V
E
 
V
W
 
H
L
 
V
K
 
N
G
 
G
Y
|
Y
A
x
G
T
 
K
F
 
I
T
 
T
G
 
G
K
 
K
D
 
N
S
 
Q
V
 
V
K
 
T
V
 
A
-
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
D
-
 
G
G
 
G
D
 
T
R
 
Q
E
 
V
V
 
I
R
 
D
A
 
T
K
 
K
N
 
N
I
 
I
V
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
E
V
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
E
 
T
I
 
I
D
 
D
Q
 
E
K
 
D
I
 
T
V
 
I
V
 
V
D
 
S
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
S
L
 
L
A
 
K
K
 
K
V
 
V
P
 
P
E
 
E
H
 
K
L
 
M
V
 
V
V
 
V
I
|
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
V
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
Q
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
T
 
T
V
 
A
V
 
V
E
|
E
Y
x
F
L
|
L
D
 
G
Q
 
H
I
 
V
-
 
G
L
 
G
P
 
V
G
 
G
F
 
I
D
 
D
A
 
M
D
 
E
V
 
I
R
 
S
K
 
K
E
 
N
A
 
F
A
 
Q
R
 
R
L
 
I
F
 
L
K
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
F
E
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
L
G
 
N
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
T
V
 
K
K
 
K
G
 
S
-
 
D
G
 
G
K
 
K
A
 
I
T
 
D
I
 
V
T
 
S
V
 
I
E
 
E
P
 
A
A
 
A
A
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
K
A
 
A
E
 
E
T
 
V
I
 
I
E
 
T
A
 
C
D
 
D
N
 
V
V
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
C
I
|
I
G
|
G
R
|
R
K
 
R
P
 
P
N
x
F
T
 
T
D
 
K
G
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
I
T
 
E
V
 
L
N
 
D
Q
 
P
R
 
R
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
E
 
P
T
 
V
D
 
N
H
 
T
S
 
R
F
 
F
K
 
Q
T
 
T
S
 
K
V
 
I
P
 
P
G
 
N
I
 
I
W
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
V
I
 
V
P
 
A
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
I
V
 
C
A
 
V
E
 
E
N
 
G
I
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
G
T
 
A
G
 
V
I
 
H
V
 
I
N
 
D
H
 
Y
D
 
N
V
 
C
I
 
V
P
 
P
S
 
S
V
|
V
V
 
I
Y
|
Y
T
 
T
M
 
H
P
 
P
E
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
W
V
 
V
G
 
G
L
 
K
T
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
Q
A
 
L
K
 
K
A
 
E
K
 
E
G
 
G
-
 
I
E
 
E
V
 
Y
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
A
N
 
N
S
 
S
R
 
R
A
 
A
K
 
K
T
 
T
N
 
N
H
 
A
E
 
D
P
 
T
D
 
D
G
 
G
F
 
M
V
 
V
K
 
K
V
 
I
I
 
L
A
 
G
D
 
Q
A
 
K
K
 
S
T
 
T
D
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
A
W
 
H
I
 
I
I
 
L
T
 
G
S
 
P
V
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
E
M
 
M
I
 
V
A
 
N
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
S
S
 
C
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
Y
 
R
T
 
V
C
 
C
H
|
H
A
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
H
 
L
S
 
S
E
|
E
A
 
A
I
 
F
K
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
N
M
 
L
A
 
A
V
 
A
T
 
S
-
 
F
G
 
G
K
 
K
P
 
S
I
 
I
H
 
N
I
 
F

1zmcA Crystal structure of human dihydrolipoamide dehydrogenase complexed to NAD+ (see paper)
55% identity, 99% coverage: 5:464/464 of query aligns to 4:472/472 of 1zmcA

query
sites
1zmcA
D
 
D
F
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
T
V
 
V
I
|
I
G
|
G
S
 
S
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
K
T
 
T
A
 
V
C
 
C
A
 
I
E
|
E
G
x
K
R
x
N
E
 
E
T
 
T
L
|
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
N
A
 
N
S
 
S
E
 
H
L
 
Y
Y
 
Y
E
 
H
E
 
M
A
 
A
A
 
H
S
 
G
G
 
T
A
 
D
L
 
F
A
 
A
K
 
S
L
 
R
G
 
G
V
 
I
K
 
E
L
 
M
G
 
S
K
 
E
V
 
V
E
 
R
L
 
L
D
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
K
M
 
M
H
 
M
A
 
E
Q
 
Q
R
 
K
L
 
S
D
 
T
A
 
A
V
 
V
K
 
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
A
F
 
H
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
Q
N
 
N
K
 
K
V
 
V
E
 
V
W
 
H
L
 
V
K
 
N
G
 
G
Y
|
Y
A
x
G
T
 
K
F
 
I
T
 
T
G
 
G
K
 
K
D
 
N
S
 
Q
V
 
V
K
 
T
V
 
A
-
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
D
-
 
G
G
 
G
D
 
T
R
 
Q
E
 
V
V
 
I
R
 
D
A
 
T
K
 
K
N
 
N
I
 
I
V
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
E
V
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
E
 
T
I
 
I
D
 
D
Q
 
E
K
 
D
I
 
T
V
 
I
V
 
V
D
 
S
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
S
L
 
L
A
 
K
K
 
K
V
 
V
P
 
P
E
 
E
H
 
K
L
 
M
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
V
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
Q
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
T
 
T
V
 
A
V
|
V
E
|
E
Y
x
F
L
|
L
D
 
G
Q
 
H
I
 
V
-
 
G
L
 
G
P
 
V
G
 
G
F
 
I
D
 
D
A
 
M
D
 
E
V
 
I
R
 
S
K
 
K
E
 
N
A
 
F
A
 
Q
R
 
R
L
 
I
F
 
L
K
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
F
E
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
L
G
 
N
T
 
T
K
|
K
V
|
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
T
V
 
K
K
 
K
G
 
S
-
 
D
G
 
G
K
 
K
A
 
I
T
 
D
I
 
V
T
 
S
V
 
I
E
 
E
P
 
A
A
 
A
A
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
K
A
 
A
E
 
E
T
 
V
I
 
I
E
 
T
A
 
C
D
 
D
N
 
V
V
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
C
I
|
I
G
|
G
R
|
R
K
 
R
P
 
P
N
x
F
T
 
T
D
 
K
G
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
I
T
 
E
V
 
L
N
 
D
Q
 
P
R
|
R
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
E
 
P
T
 
V
D
 
N
H
 
T
S
 
R
F
 
F
K
 
Q
T
 
T
S
 
K
V
 
I
P
 
P
G
 
N
I
 
I
W
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
V
I
 
V
P
 
A
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
I
V
 
C
A
 
V
E
 
E
N
 
G
I
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
G
T
 
A
G
 
V
I
 
H
V
 
I
N
 
D
H
 
Y
D
 
N
V
 
C
I
 
V
P
 
P
S
 
S
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
M
 
H
P
 
P
E
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
W
V
 
V
G
 
G
L
 
K
T
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
Q
A
 
L
K
 
K
A
 
E
K
 
E
G
 
G
-
 
I
E
 
E
V
 
Y
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
A
N
 
N
S
 
S
R
 
R
A
 
A
K
 
K
T
 
T
N
 
N
H
 
A
E
 
D
P
 
T
D
 
D
G
 
G
F
 
M
V
 
V
K
 
K
V
 
I
I
 
L
A
 
G
D
 
Q
A
 
K
K
 
S
T
 
T
D
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
A
W
 
H
I
 
I
I
 
L
T
 
G
S
 
P
V
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
E
M
 
M
I
 
V
A
 
N
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
S
S
 
C
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
Y
 
R
T
 
V
C
 
C
H
|
H
A
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
H
 
L
S
 
S
E
|
E
A
 
A
I
 
F
K
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
N
M
 
L
A
 
A
V
 
A
T
 
S
-
 
F
G
 
G
K
 
K
P
 
S
I
 
I
H
 
N
I
 
F

P09622 Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial; Dihydrolipoamide dehydrogenase; Glycine cleavage system L protein; EC 1.8.1.4 from Homo sapiens (Human) (see 14 papers)
55% identity, 99% coverage: 5:464/464 of query aligns to 41:509/509 of P09622

query
sites
P09622
D
 
D
F
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
T
V
 
V
I
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
K
T
 
T
A
 
V
C
 
C
A
 
I
E
|
E
G
x
K
R
x
N
E
|
E
T
|
T
L
|
L
G
|
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
 
G
C
 
C
I
 
I
P
 
P
S
 
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
N
A
 
N
S
 
S
E
 
H
L
 
Y
Y
 
Y
E
 
H
E
 
M
A
 
A
A
 
H
S
 
G
G
x
K
A
 
D
L
 
F
A
 
A
K
 
S
L
 
R
G
 
G
V
 
I
K
 
E
L
 
M
G
 
S
K
 
E
V
 
V
E
 
R
L
 
L
D
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
K
M
 
M
H
 
M
A
 
E
Q
 
Q
R
 
K
L
 
S
D
 
T
A
 
A
V
 
V
K
 
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
A
F
 
H
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
Q
N
 
N
K
 
K
V
 
V
E
 
V
W
 
H
L
 
V
K
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
x
G
T
 
K
F
 
I
T
 
T
G
 
G
K
 
K
D
 
N
S
 
Q
V
 
V
K
 
T
V
 
A
-
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
D
-
 
G
G
 
G
D
 
T
R
 
Q
E
 
V
V
 
I
R
 
D
A
 
T
K
 
K
N
 
N
I
 
I
V
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
|
S
S
 
E
V
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
E
 
T
I
 
I
D
 
D
Q
 
E
K
 
D
I
 
T
V
 
I
V
 
V
D
 
S
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
S
L
 
L
A
 
K
K
 
K
V
 
V
P
 
P
E
 
E
H
 
K
L
 
M
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
V
|
V
I
|
I
G
|
G
L
x
V
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
Q
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
T
 
T
V
 
A
V
 
V
E
|
E
Y
 
F
L
 
L
D
 
G
Q
 
H
I
 
V
-
 
G
L
 
G
P
 
V
G
 
G
F
 
I
D
 
D
A
 
M
D
 
E
V
 
I
R
 
S
K
 
K
E
 
N
A
 
F
A
 
Q
R
 
R
L
 
I
F
 
L
K
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
F
E
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
L
G
 
N
T
 
T
K
 
K
V
|
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
T
V
 
K
K
 
K
G
 
S
-
 
D
G
 
G
K
 
K
A
 
I
T
 
D
I
 
V
T
 
S
V
 
I
E
 
E
P
 
A
A
 
A
A
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
K
A
 
A
E
 
E
T
 
V
I
 
I
E
 
T
A
 
C
D
 
D
N
 
V
V
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
C
I
 
I
G
|
G
R
 
R
K
 
R
P
 
P
N
 
F
T
 
T
D
 
K
G
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
I
T
 
E
V
 
L
N
 
D
Q
 
P
R
 
R
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
E
 
P
T
 
V
D
 
N
H
 
T
S
 
R
F
 
F
K
 
Q
T
 
T
S
 
K
V
 
I
P
 
P
G
 
N
I
 
I
W
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
V
I
 
V
P
 
A
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
I
V
 
C
A
 
V
E
|
E
N
 
G
I
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
G
T
 
A
G
 
V
I
x
H
V
 
I
N
 
D
H
 
Y
D
 
N
V
 
C
I
 
V
P
 
P
S
 
S
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
M
 
H
P
 
P
E
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
W
V
 
V
G
 
G
L
 
K
T
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
Q
A
 
L
K
 
K
A
 
E
K
 
E
G
 
G
-
 
I
E
 
E
V
 
Y
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
A
N
 
N
S
 
S
R
 
R
A
 
A
K
 
K
T
 
T
N
 
N
H
 
A
E
 
D
P
 
T
D
 
D
G
 
G
F
 
M
V
 
V
K
 
K
V
 
I
I
 
L
A
 
G
D
 
Q
A
 
K
K
 
S
T
 
T
D
|
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
A
W
 
H
I
 
I
I
 
L
T
 
G
S
 
P
V
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
E
M
 
M
I
 
V
A
 
N
Q
x
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
E
F
x
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
S
S
 
C
E
 
E
D
|
D
I
 
I
A
 
A
Y
x
R
T
 
V
C
 
C
H
|
H
A
 
A
H
 
H
P
|
P
T
 
T
H
 
L
S
|
S
E
|
E
A
 
A
I
 
F
K
x
R
E
 
E
A
 
A
A
 
N
M
 
L
A
 
A
V
 
A
T
 
S
-
 
F
G
 
G
K
|
K
P
 
S
I
 
I
H
 
N
I
 
F

6hg8B Crystal structure of the r460g disease-causing mutant of the human dihydrolipoamide dehydrogenase.
55% identity, 99% coverage: 5:464/464 of query aligns to 14:482/482 of 6hg8B

query
sites
6hg8B
D
 
D
F
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
T
V
 
V
I
|
I
G
 
G
S
 
S
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
K
T
 
T
A
 
V
C
 
C
A
 
I
E
|
E
G
x
K
R
x
N
E
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
N
A
 
N
S
 
S
E
 
H
L
 
Y
Y
 
Y
E
 
H
E
 
M
A
 
A
A
 
H
S
 
G
G
 
K
A
 
D
L
 
F
A
 
A
K
 
S
L
 
R
G
 
G
V
 
I
K
 
E
L
 
M
G
 
S
K
 
E
V
 
V
E
 
R
L
 
L
D
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
K
M
 
M
H
 
M
A
 
E
Q
 
Q
R
 
K
L
 
S
D
 
T
A
 
A
V
 
V
K
 
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
A
F
 
H
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
Q
N
 
N
K
 
K
V
 
V
E
 
V
W
 
H
L
 
V
K
 
N
G
 
G
Y
|
Y
A
x
G
T
 
K
F
 
I
T
 
T
G
 
G
K
 
K
D
 
N
S
 
Q
V
 
V
K
 
T
V
 
A
-
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
D
-
 
G
G
 
G
D
 
T
R
 
Q
E
 
V
V
 
I
R
 
D
A
 
T
K
 
K
N
 
N
I
 
I
V
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
E
V
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
E
 
T
I
 
I
D
 
D
Q
 
E
K
 
D
I
 
T
V
 
I
V
 
V
D
 
S
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
S
L
 
L
A
 
K
K
 
K
V
 
V
P
 
P
E
 
E
H
 
K
L
 
M
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
V
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
Q
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
T
 
T
V
 
A
V
 
V
E
 
E
Y
 
F
L
 
L
D
 
G
Q
 
H
I
 
V
-
 
G
L
 
G
P
 
V
G
 
G
F
 
I
D
 
D
A
 
M
D
 
E
V
 
I
R
 
S
K
 
K
E
 
N
A
 
F
A
 
Q
R
 
R
L
 
I
F
 
L
K
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
F
E
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
L
G
 
N
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
T
V
 
K
K
 
K
G
 
S
-
 
D
G
 
G
K
 
K
A
 
I
T
 
D
I
 
V
T
 
S
V
 
I
E
 
E
P
 
A
A
 
A
A
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
K
A
 
A
E
 
E
T
 
V
I
 
I
E
 
T
A
 
C
D
 
D
N
 
V
V
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
C
I
 
I
G
 
G
R
|
R
K
 
R
P
 
P
N
x
F
T
 
T
D
 
K
G
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
I
T
 
E
V
 
L
N
 
D
Q
 
P
R
 
R
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
E
 
P
T
 
V
D
 
N
H
 
T
S
 
R
F
 
F
K
 
Q
T
 
T
S
 
K
V
 
I
P
 
P
G
 
N
I
 
I
W
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
V
I
 
V
P
 
A
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
I
V
 
C
A
 
V
E
 
E
N
 
G
I
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
G
T
 
A
G
 
V
I
 
H
V
 
I
N
 
D
H
 
Y
D
 
N
V
 
C
I
 
V
P
 
P
S
 
S
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
M
 
H
P
 
P
E
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
W
V
 
V
G
 
G
L
 
K
T
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
Q
A
 
L
K
 
K
A
 
E
K
 
E
G
 
G
-
 
I
E
 
E
V
 
Y
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
A
N
 
N
S
 
S
R
 
R
A
 
A
K
 
K
T
 
T
N
 
N
H
 
A
E
 
D
P
 
T
D
 
D
G
 
G
F
 
M
V
 
V
K
 
K
V
 
I
I
 
L
A
 
G
D
 
Q
A
 
K
K
 
S
T
 
T
D
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
A
W
 
H
I
 
I
I
 
L
T
 
G
S
 
P
V
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
E
M
 
M
I
 
V
A
 
N
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
S
S
 
C
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
Y
 
R
T
 
V
C
 
C
H
 
H
A
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
H
 
L
S
 
S
E
|
E
A
 
A
I
 
F
K
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
N
M
 
L
A
 
A
V
 
A
T
 
S
-
 
F
G
 
G
K
 
K
P
 
S
I
 
I
H
 
N
I
 
F

6uziC Crystal structure of dihydrolipoyl dehydrogenase from elizabethkingia anophelis nuhp1
52% identity, 99% coverage: 6:464/464 of query aligns to 7:470/470 of 6uziC

query
sites
6uziC
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
A
V
 
V
I
|
I
G
|
G
S
 
S
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
C
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
K
T
 
T
A
 
V
C
 
I
A
 
I
E
|
E
G
x
K
R
 
Y
E
 
S
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
D
A
 
S
S
 
S
E
 
E
L
 
H
Y
 
F
E
 
E
E
 
N
A
 
A
A
 
K
S
 
H
G
 
-
A
 
T
L
 
F
A
 
A
K
 
T
L
 
H
G
 
G
V
 
I
K
 
L
L
 
I
G
 
D
K
 
E
V
 
P
E
 
K
L
 
V
D
 
D
L
 
I
D
 
A
A
 
Q
M
 
M
H
 
I
A
 
S
Q
 
R
R
 
K
L
 
N
D
 
D
A
 
V
V
 
V
K
 
D
G
 
Q
L
 
T
T
 
T
G
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
N
F
 
F
L
 
L
F
 
M
K
 
D
K
 
K
N
 
N
K
 
K
V
 
I
E
 
T
W
 
V
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
Y
x
V
A
x
G
T
 
S
F
 
F
T
 
E
G
 
S
K
 
A
D
 
T
S
 
Q
V
 
I
K
 
K
V
 
V
-
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
D
G
 
G
D
 
S
R
 
S
E
 
E
V
 
V
-
 
I
R
 
E
A
 
A
K
 
K
N
 
N
I
 
T
V
 
I
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
K
V
 
P
T
 
S
P
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
F
V
 
I
E
 
T
I
 
L
D
 
D
Q
 
K
K
 
E
I
 
R
V
 
V
V
 
I
D
 
T
S
 
S
T
 
T
G
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
N
L
 
L
A
 
K
K
 
E
V
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
H
L
 
L
V
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
Y
R
 
L
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
S
K
 
D
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
Q
 
K
I
 
I
L
 
I
P
 
P
G
 
G
F
 
M
D
 
D
A
 
G
D
 
T
V
 
L
R
 
S
K
 
K
E
 
E
A
 
L
A
 
Q
R
 
K
L
 
T
F
 
L
K
 
K
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
M
E
 
K
F
 
F
K
 
M
T
 
L
G
 
S
T
 
T
K
 
A
V
 
V
T
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
E
V
 
R
K
 
N
G
 
G
G
 
D
K
 
T
A
 
V
T
 
K
I
 
V
T
 
T
V
 
A
E
 
K
P
 
D
A
 
K
A
 
K
G
 
G
G
 
E
A
 
D
A
 
V
E
 
-
T
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
G
D
 
D
N
 
Y
V
 
C
L
 
L
V
 
V
A
 
S
I
 
V
G
 
G
R
|
R
K
 
R
P
 
P
N
 
Y
T
 
T
D
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
T
 
E
V
 
L
N
 
D
Q
 
E
R
 
R
G
 
G
Q
 
R
I
 
V
E
 
K
T
 
T
D
 
N
H
 
D
S
 
H
F
 
L
K
 
Q
T
 
T
S
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
N
I
 
I
W
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
V
I
 
V
P
 
K
G
 
G
P
 
A
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
 
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
V
A
 
F
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
T
I
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
E
T
 
K
G
 
P
I
 
H
V
 
V
N
 
N
H
 
Y
D
 
N
V
 
L
I
 
I
P
 
P
S
 
G
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
M
 
W
P
 
P
E
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
Q
A
 
L
K
 
K
A
 
E
K
 
A
G
 
G
-
 
V
E
 
A
V
 
Y
K
 
K
V
 
T
G
 
G
K
 
S
F
 
F
P
 
P
M
 
M
A
 
R
G
 
A
N
 
L
S
 
G
R
 
R
A
 
S
K
 
R
T
 
A
N
 
S
H
 
M
E
 
D
P
 
T
D
 
D
G
 
G
F
 
V
V
 
I
K
 
K
V
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
E
K
 
K
T
 
T
D
 
D
R
 
E
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
V
W
 
H
I
 
M
I
 
I
T
 
G
S
 
A
V
 
R
A
 
A
G
 
A
T
 
D
M
 
M
I
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
V
Q
 
V
A
 
A
M
 
M
E
 
E
F
 
F
G
 
R
A
 
A
T
 
S
S
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
Y
 
R
T
 
I
C
 
S
H
 
H
A
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
H
 
Y
S
 
T
E
|
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
D
V
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
K
-
 
R
P
 
A
I
 
I
H
 
H
I
 
M

2qaeA Crystal structure analysis of trypanosoma cruzi lipoamide dehydrogenase
53% identity, 96% coverage: 20:464/464 of query aligns to 17:465/465 of 2qaeA

query
sites
2qaeA
A
 
A
A
 
S
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
M
K
 
K
T
 
T
A
 
A
C
 
C
A
 
V
E
|
E
G
x
K
R
|
R
E
 
G
T
 
A
L
|
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
A
S
 
T
E
 
H
L
 
L
Y
 
Y
E
 
H
E
 
D
A
 
A
A
 
H
S
 
A
G
 
N
A
 
-
L
 
F
A
 
A
K
 
R
L
 
Y
G
 
G
V
 
L
K
 
M
L
 
G
G
 
G
K
 
E
-
 
G
V
 
V
E
 
T
L
 
M
D
 
D
L
 
S
D
 
A
A
 
K
M
 
M
H
 
Q
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
L
 
E
D
 
R
A
 
A
V
 
V
K
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
V
E
 
E
F
 
Y
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
K
N
 
N
K
 
K
V
 
V
E
 
T
W
 
Y
L
 
Y
K
 
K
G
 
G
Y
x
E
A
x
G
T
 
S
F
 
F
T
 
E
G
 
T
K
 
A
D
 
H
S
 
S
V
 
I
K
 
R
V
 
V
-
 
N
-
 
G
-
 
L
-
 
D
G
 
G
D
 
K
R
 
Q
E
 
E
-
 
M
V
 
L
R
 
E
A
 
T
K
 
K
N
 
K
I
 
T
V
 
I
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
E
V
 
P
T
 
T
P
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
F
V
 
L
E
 
P
I
 
F
D
 
D
Q
 
E
K
 
K
I
 
V
V
 
V
V
 
L
D
 
S
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
L
A
 
P
K
 
R
V
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
T
L
 
M
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
A
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
Y
 
F
L
 
A
D
 
P
Q
 
R
I
 
C
L
 
A
P
 
P
G
 
T
F
 
L
D
 
D
A
 
E
D
 
D
V
 
V
R
 
T
K
 
N
E
 
A
-
 
L
A
 
V
A
 
G
R
 
A
L
 
L
F
 
A
K
 
K
K
 
N
Q
 
E
G
 
K
I
 
M
E
 
K
F
 
F
K
 
M
T
 
T
G
 
S
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
V
G
 
G
V
 
G
A
 
T
V
 
N
K
 
N
G
 
G
G
 
D
K
 
S
A
 
V
T
 
S
I
 
L
T
 
E
V
 
V
E
 
E
P
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
K
A
 
R
E
 
E
T
 
T
I
 
V
E
 
T
A
 
C
D
 
E
N
 
A
V
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
S
I
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
R
P
 
P
N
x
F
T
 
T
D
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
K
A
 
I
G
 
N
L
 
V
T
 
A
V
 
K
N
 
N
Q
 
E
R
 
R
G
 
G
Q
 
F
I
 
V
E
 
K
T
 
I
D
 
G
H
 
D
S
 
H
F
 
F
K
 
E
T
 
T
S
 
S
V
 
I
P
 
P
G
 
D
I
 
V
W
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
V
I
 
V
-
 
D
P
 
K
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
V
A
 
A
V
 
C
A
 
A
E
 
E
N
 
I
I
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
K
T
 
P
G
 
G
I
 
H
V
 
V
N
 
N
H
 
Y
D
 
G
V
 
V
I
 
I
P
 
P
S
 
A
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
M
 
M
P
 
P
E
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
K
T
 
S
E
 
E
E
 
D
A
 
E
A
 
L
K
 
K
A
 
K
K
 
E
G
 
G
-
 
V
E
 
A
V
 
Y
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
M
 
F
A
 
N
G
 
A
N
 
N
S
 
S
R
 
R
A
 
A
K
 
K
T
 
A
N
 
V
H
 
S
E
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
F
 
F
V
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
V
D
 
D
A
 
K
K
 
A
T
 
T
D
 
D
R
 
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
V
W
 
H
I
 
I
I
 
V
T
 
C
S
 
T
V
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
E
M
 
L
I
 
I
A
 
G
Q
 
E
A
 
A
A
 
C
Q
 
L
A
 
A
M
 
M
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
S
S
 
S
E
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
G
Y
 
R
T
 
T
C
 
C
H
|
H
A
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
H
 
M
S
 
S
E
|
E
A
 
A
I
 
L
K
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
C
M
 
M
A
 
A
V
 
L
T
 
F
G
 
A
K
 
K
P
 
T
I
 
I
H
 
N
I
 
F

Sites not aligning to the query:

2yquB Crystal structures and evolutionary relationship of two different lipoamide dehydrogenase(e3s) from thermus thermophilus
52% identity, 99% coverage: 6:464/464 of query aligns to 2:455/455 of 2yquB

query
sites
2yquB
F
 
Y
D
 
D
V
 
L
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
|
G
S
 
A
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
M
K
 
K
T
 
V
A
 
G
C
 
V
A
 
V
E
|
E
G
x
K
R
 
E
E
 
K
T
 
A
L
|
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
x
R
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
E
A
 
T
S
 
T
E
 
E
L
 
R
Y
 
I
E
 
Y
E
 
E
A
 
A
A
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
L
L
 
L
A
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
G
V
 
A
K
 
K
L
 
V
G
 
K
K
x
G
V
|
V
E
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
L
D
 
P
A
 
A
M
 
L
H
 
M
A
 
A
Q
 
H
R
 
K
L
 
D
D
 
K
A
 
V
V
 
V
K
 
Q
G
 
A
L
 
N
T
 
T
G
 
Q
G
 
G
I
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
K
N
 
N
K
 
G
V
 
I
E
 
A
W
 
R
L
 
H
K
 
Q
G
 
G
Y
x
T
A
|
A
T
 
R
F
 
F
T
 
L
G
 
S
K
 
E
D
 
R
S
 
K
V
 
V
K
 
L
V
 
V
G
 
E
D
 
E
-
 
T
-
 
G
R
 
E
E
 
E
V
 
L
R
 
E
A
 
A
K
 
R
N
 
Y
I
 
I
V
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
A
V
 
P
T
 
L
P
 
I
L
 
P
P
 
P
G
 
W
V
 
A
E
 
Q
I
 
V
D
 
D
Q
 
Y
K
 
E
I
 
R
V
 
V
V
 
V
D
 
T
S
 
S
T
 
T
G
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
S
L
 
F
A
 
P
K
 
E
V
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
R
L
 
L
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
V
V
 
V
W
 
W
R
 
H
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
E
V
 
V
T
 
I
V
 
V
V
 
L
E
 
E
Y
 
Y
L
 
M
D
 
D
Q
 
R
I
 
I
L
 
L
P
 
P
G
 
T
F
 
M
D
 
D
A
 
L
D
 
E
V
 
V
R
 
S
K
 
R
E
 
A
A
 
A
A
 
E
R
 
R
L
 
V
F
 
F
K
 
K
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
L
E
 
T
F
 
I
K
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
V
K
 
R
V
 
V
T
 
T
G
 
A
V
 
V
A
 
V
V
 
P
K
 
E
G
 
A
G
 
K
K
 
G
A
 
A
T
 
R
I
 
V
T
 
E
V
 
L
E
 
E
P
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
G
A
 
-
A
 
-
E
 
E
T
 
V
I
 
L
E
 
E
A
 
A
D
 
D
N
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
R
P
 
P
N
x
Y
T
 
T
D
 
E
G
 
G
L
 
L
G
 
S
L
 
L
D
 
E
A
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
S
V
 
T
N
 
D
Q
 
E
R
 
R
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
E
 
P
T
 
V
D
 
D
H
 
E
S
 
H
F
 
L
K
 
R
T
 
T
S
 
R
V
 
V
P
 
P
G
 
H
I
 
I
W
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
V
I
 
V
P
 
R
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
x
S
D
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
A
A
 
V
E
 
E
N
 
H
I
 
M
A
 
V
G
 
R
L
 
G
T
 
F
G
 
G
I
 
H
V
 
V
N
 
D
H
 
Y
D
 
Q
V
 
A
I
 
I
P
 
P
S
 
S
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
M
 
H
P
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
E
A
 
L
K
 
K
A
 
A
K
 
Q
G
 
G
-
 
I
E
 
P
V
 
Y
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
M
 
Y
A
 
S
G
 
A
N
 
S
S
 
G
R
 
R
A
 
A
K
 
R
T
 
A
N
 
M
H
 
G
E
 
E
P
 
T
D
 
E
G
 
G
F
 
F
V
 
I
K
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
H
A
 
A
K
 
K
T
 
T
D
 
D
R
 
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
V
W
 
H
I
 
G
I
 
I
T
 
G
S
 
A
V
 
R
A
 
V
G
 
G
T
 
D
M
 
V
I
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
F
F
 
F
G
 
K
A
 
A
T
x
S
S
 
A
E
 
E
D
|
D
I
 
L
A
 
G
Y
 
R
T
 
A
C
 
P
H
|
H
A
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
S
H
 
L
S
 
S
E
|
E
A
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
A
V
 
A
T
 
W
G
 
E
K
 
R
P
 
P
I
 
I
H
 
H
I
 
L

2yquA Crystal structures and evolutionary relationship of two different lipoamide dehydrogenase(e3s) from thermus thermophilus
52% identity, 99% coverage: 6:464/464 of query aligns to 2:455/455 of 2yquA

query
sites
2yquA
F
 
Y
D
 
D
V
 
L
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
|
G
S
 
A
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
M
K
 
K
T
 
V
A
 
G
C
 
V
A
 
V
E
|
E
G
x
K
R
 
E
E
 
K
T
 
A
L
|
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
x
R
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
E
A
 
T
S
 
T
E
 
E
L
 
R
Y
 
I
E
 
Y
E
 
E
A
 
A
A
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
L
L
 
L
A
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
G
V
 
A
K
 
K
L
 
V
G
 
K
K
x
G
V
|
V
E
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
L
D
 
P
A
 
A
M
 
L
H
 
M
A
 
A
Q
 
H
R
 
K
L
 
D
D
 
K
A
 
V
V
 
V
K
 
Q
G
 
A
L
 
N
T
 
T
G
 
Q
G
 
G
I
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
K
N
 
N
K
 
G
V
 
I
E
 
A
W
 
R
L
 
H
K
 
Q
G
 
G
Y
x
T
A
|
A
T
 
R
F
 
F
T
 
L
G
 
S
K
 
E
D
 
R
S
 
K
V
 
V
K
 
L
V
 
V
G
 
E
D
 
E
-
 
T
-
 
G
R
 
E
E
 
E
V
 
L
R
 
E
A
 
A
K
 
R
N
 
Y
I
 
I
V
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
A
V
 
P
T
 
L
P
 
I
L
 
P
P
 
P
G
 
W
V
 
A
E
 
Q
I
 
V
D
 
D
Q
 
Y
K
 
E
I
 
R
V
 
V
V
 
V
D
 
T
S
|
S
T
 
T
G
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
S
L
 
F
A
 
P
K
 
E
V
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
R
L
 
L
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
V
V
 
V
W
 
W
R
 
H
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
E
V
 
V
T
 
I
V
 
V
V
 
L
E
 
E
Y
 
Y
L
 
M
D
 
D
Q
 
R
I
 
I
L
 
L
P
 
P
G
 
T
F
 
M
D
 
D
A
 
L
D
 
E
V
 
V
R
 
S
K
 
R
E
 
A
A
 
A
A
 
E
R
 
R
L
 
V
F
 
F
K
 
K
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
L
E
 
T
F
 
I
K
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
V
K
 
R
V
 
V
T
 
T
G
 
A
V
 
V
A
 
V
V
 
P
K
 
E
G
 
A
G
 
K
K
 
G
A
 
A
T
 
R
I
 
V
T
 
E
V
 
L
E
 
E
P
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
G
A
 
-
A
 
-
E
 
E
T
 
V
I
 
L
E
 
E
A
 
A
D
 
D
N
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
R
P
 
P
N
x
Y
T
 
T
D
 
E
G
 
G
L
 
L
G
 
S
L
 
L
D
 
E
A
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
S
V
 
T
N
 
D
Q
 
E
R
 
R
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
E
 
P
T
 
V
D
 
D
H
 
E
S
 
H
F
 
L
K
 
R
T
 
T
S
 
R
V
 
V
P
 
P
G
 
H
I
 
I
W
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
V
I
 
V
P
 
R
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
 
H
K
 
K
A
 
A
E
x
S
D
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
A
A
 
V
E
 
E
N
 
H
I
 
M
A
 
V
G
 
R
L
 
G
T
 
F
G
 
G
I
 
H
V
 
V
N
 
D
H
 
Y
D
 
Q
V
 
A
I
 
I
P
 
P
S
 
S
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
M
 
H
P
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
E
A
 
L
K
 
K
A
 
A
K
 
Q
G
 
G
-
 
I
E
 
P
V
 
Y
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
M
 
Y
A
 
S
G
 
A
N
 
S
S
 
G
R
 
R
A
 
A
K
 
R
T
 
A
N
 
M
H
 
G
E
 
E
P
 
T
D
 
E
G
 
G
F
 
F
V
 
I
K
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
H
A
 
A
K
 
K
T
 
T
D
 
D
R
 
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
V
W
 
H
I
 
G
I
 
I
T
 
G
S
 
A
V
 
R
A
 
V
G
 
G
T
 
D
M
 
V
I
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
F
F
 
F
G
 
K
A
 
A
T
 
S
S
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
G
Y
 
R
T
 
A
C
 
P
H
|
H
A
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
S
H
 
L
S
 
S
E
|
E
A
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
A
V
 
A
T
 
W
G
 
E
K
 
R
P
 
P
I
 
I
H
 
H
I
 
L

P09624 Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial; DLD; 2-oxoglutarate dehydrogenase complex component E3; OGDC-E3; OGDHC subunit E3; Alpha-ketoglutarate dehydrogenase complex subunit E3; alpha-KGDHC subunit E3; Dihydrolipoamide dehydrogenase; Dihydrolipoamide:NAD(+) oxidoreductase; Glycine decarboxylase complex subunit L; GDC subunit L; Lipoamide dehydrogenase component of pyruvate dehydrogenase complex; Pyruvate dehydrogenase complex E3 component; PDC subunit E3; PDH complex subunit E3; EC 1.8.1.4 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 2 papers)
51% identity, 98% coverage: 7:463/464 of query aligns to 28:498/499 of P09624

query
sites
P09624
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
S
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
N
T
 
T
A
 
A
C
 
C
A
 
V
E
|
E
G
x
K
R
|
R
E
x
G
T
x
K
L
|
L
G
|
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
 
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
 
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
N
A
 
N
S
 
S
E
 
H
L
 
L
Y
 
F
E
 
H
E
 
Q
A
 
M
A
 
H
S
 
T
G
 
E
A
 
A
L
 
-
A
 
Q
K
 
K
L
 
R
G
 
G
V
 
I
K
 
D
L
 
V
-
 
N
G
 
G
K
 
D
V
 
I
E
 
K
L
 
I
D
 
N
L
 
V
D
 
A
A
 
N
M
 
F
H
 
Q
A
 
K
Q
 
A
R
 
K
L
 
D
D
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
K
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
E
F
 
L
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
K
N
 
N
K
 
K
V
 
V
E
 
T
W
 
Y
L
 
Y
K
 
K
G
 
G
Y
 
N
A
x
G
T
 
S
F
 
F
T
 
E
G
 
D
K
 
E
D
 
T
S
 
K
V
 
I
K
 
R
V
 
V
G
 
T
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
K
-
 
E
D
 
D
R
 
H
E
 
I
V
 
L
R
 
D
A
 
V
K
 
K
N
 
N
I
 
I
V
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
E
V
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
E
 
E
I
 
I
D
 
D
Q
 
E
K
 
E
I
 
K
V
 
I
V
 
V
D
 
S
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
S
L
 
L
A
 
K
K
 
E
V
 
I
P
 
P
E
 
K
H
 
R
L
 
L
V
 
T
V
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
M
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
Y
R
 
S
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
S
K
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
Y
 
F
L
 
Q
D
 
P
Q
 
Q
I
 
I
L
 
G
P
 
A
G
 
S
F
 
M
D
 
D
A
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
A
K
 
K
E
 
A
A
 
T
A
 
Q
R
 
K
L
 
F
F
 
L
K
 
K
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
L
E
 
D
F
 
F
K
 
K
T
 
L
G
 
S
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
I
G
 
S
V
 
A
A
 
K
V
 
R
K
 
N
G
 
D
G
 
D
K
 
K
-
 
N
-
 
V
A
 
V
T
 
E
I
 
I
T
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
D
A
 
T
A
 
K
G
 
T
G
 
N
A
 
K
A
 
Q
E
 
E
T
 
N
I
 
L
E
 
E
A
 
A
D
 
E
N
 
V
V
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
R
P
 
P
N
 
Y
T
 
I
D
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
A
D
 
E
A
 
K
A
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
E
V
 
V
N
 
D
Q
 
K
R
 
R
G
 
G
Q
 
R
I
 
L
E
 
V
T
 
I
D
 
D
H
 
D
S
 
Q
F
 
F
K
 
N
T
 
S
S
 
K
V
 
F
P
 
P
G
 
H
I
 
I
W
 
K
A
 
V
I
 
V
G
 
G
D
|
D
V
 
V
I
 
T
P
 
F
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
A
A
 
V
E
 
E
N
 
M
I
 
L
A
 
K
G
 
T
L
 
G
T
 
H
G
 
G
I
 
H
V
 
V
N
 
N
H
 
Y
D
 
N
V
 
N
I
 
I
P
 
P
S
 
S
V
 
V
V
 
M
Y
 
Y
T
 
S
M
 
H
P
 
P
E
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
W
V
 
V
G
 
G
L
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
Q
A
 
L
K
 
K
A
 
E
K
 
A
G
 
G
-
 
I
E
 
D
V
 
Y
K
 
K
V
 
I
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
A
N
 
N
S
 
S
R
 
R
A
 
A
K
 
K
T
 
T
N
 
N
H
 
Q
E
 
D
P
 
T
D
 
E
G
 
G
F
 
F
V
 
V
K
 
K
V
 
I
I
 
L
A
 
I
D
 
D
A
 
S
K
 
K
T
 
T
D
 
E
R
 
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
A
W
 
H
I
 
I
I
 
I
T
 
G
S
 
P
V
 
N
A
 
A
G
 
G
T
 
E
M
 
M
I
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
G
Q
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
S
S
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
A
Y
 
R
T
 
V
C
 
C
H
 
H
A
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
H
 
L
S
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
F
K
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
N
M
 
M
A
 
A
V
 
A
T
 
Y
G
 
D
K
 
K
P
 
A
I
 
I
H
 
H

Sites not aligning to the query:

1v59A Crystal structure of yeast lipoamide dehydrogenase complexed with NAD+
51% identity, 98% coverage: 7:463/464 of query aligns to 7:477/478 of 1v59A

query
sites
1v59A
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
S
 
G
G
|
G
P
|
P
G
x
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
N
T
 
T
A
 
A
C
 
C
A
 
V
E
|
E
G
x
K
R
|
R
E
 
G
T
 
K
L
|
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
N
A
 
N
S
 
S
E
 
H
L
 
L
Y
 
F
E
 
H
E
 
Q
A
 
M
A
 
H
S
 
T
G
 
E
A
 
A
L
 
-
A
 
Q
K
 
K
L
 
R
G
 
G
V
 
I
K
 
D
L
 
V
-
 
N
G
 
G
K
 
D
V
 
I
E
 
K
L
 
I
D
 
N
L
 
V
D
 
A
A
 
N
M
 
F
H
 
Q
A
 
K
Q
 
A
R
 
K
L
 
D
D
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
K
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
E
F
 
L
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
K
N
 
N
K
 
K
V
 
V
E
 
T
W
 
Y
L
 
Y
K
 
K
G
 
G
Y
x
N
A
x
G
T
 
S
F
 
F
T
 
E
G
 
D
K
 
E
D
 
T
S
 
K
V
 
I
K
 
R
V
 
V
G
 
T
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
K
-
 
E
D
 
D
R
 
H
E
 
I
V
 
L
R
 
D
A
 
V
K
 
K
N
 
N
I
 
I
V
 
I
I
 
V
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
E
V
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
E
 
E
I
 
I
D
 
D
Q
 
E
K
 
E
I
 
K
V
 
I
V
 
V
D
 
S
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
S
L
 
L
A
 
K
K
 
E
V
 
I
P
 
P
E
 
K
H
 
R
L
 
L
V
 
T
V
 
I
I
|
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
V
x
I
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
L
 
M
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
Y
R
 
S
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
S
K
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
V
E
|
E
Y
x
F
L
 
Q
D
 
P
Q
 
Q
I
 
I
L
 
G
P
 
A
G
 
S
F
 
M
D
 
D
A
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
A
K
 
K
E
 
A
A
 
T
A
 
Q
R
 
K
L
 
F
F
 
L
K
 
K
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
L
E
 
D
F
 
F
K
 
K
T
 
L
G
 
S
T
 
T
K
|
K
V
 
V
T
 
I
G
 
S
V
 
A
A
 
K
V
 
R
K
 
N
G
 
D
G
 
D
K
 
K
-
 
N
-
 
V
A
 
V
T
 
E
I
 
I
T
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
D
A
 
T
A
 
K
G
 
T
G
 
N
A
 
K
A
 
Q
E
 
E
T
 
N
I
 
L
E
 
E
A
 
A
D
 
E
N
 
V
V
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
A
I
x
V
G
 
G
R
|
R
K
 
R
P
 
P
N
x
Y
T
 
I
D
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
A
D
 
E
A
 
K
A
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
E
V
 
V
N
 
D
Q
 
K
R
 
R
G
 
G
Q
 
R
I
 
L
E
 
V
T
 
I
D
 
D
H
 
D
S
 
Q
F
 
F
K
 
N
T
 
S
S
 
K
V
 
F
P
 
P
G
 
H
I
 
I
W
 
K
A
 
V
I
 
V
G
|
G
D
|
D
V
 
V
I
 
T
P
 
F
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
A
A
 
V
E
 
E
N
 
M
I
 
L
A
 
K
G
x
T
L
 
G
T
 
H
G
 
G
I
 
H
V
 
V
N
 
N
H
 
Y
D
 
N
V
 
N
I
 
I
P
 
P
S
 
S
V
 
V
V
 
M
Y
|
Y
T
 
S
M
 
H
P
 
P
E
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
W
V
 
V
G
 
G
L
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
Q
A
 
L
K
 
K
A
 
E
K
 
A
G
 
G
-
 
I
E
 
D
V
 
Y
K
 
K
V
 
I
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
A
N
 
N
S
 
S
R
 
R
A
 
A
K
 
K
T
 
T
N
 
N
H
 
Q
E
 
D
P
 
T
D
 
E
G
 
G
F
 
F
V
 
V
K
 
K
V
 
I
I
 
L
A
 
I
D
 
D
A
 
S
K
 
K
T
 
T
D
 
E
R
 
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
A
W
 
H
I
 
I
I
 
I
T
 
G
S
 
P
V
 
N
A
 
A
G
 
G
T
 
E
M
 
M
I
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
G
Q
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
S
S
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
A
Y
 
R
T
 
V
C
 
C
H
|
H
A
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
H
 
L
S
 
S
E
|
E
A
 
A
I
 
F
K
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
N
M
 
M
A
 
A
V
 
A
T
 
Y
G
 
D
K
 
K
P
 
A
I
 
I
H
 
H

1jehA Crystal structure of yeast e3, lipoamide dehydrogenase (see paper)
51% identity, 98% coverage: 7:463/464 of query aligns to 7:477/478 of 1jehA

query
sites
1jehA
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
I
I
|
I
G
 
G
S
 
G
G
|
G
P
|
P
G
x
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
N
T
 
T
A
 
A
C
 
C
A
x
V
E
|
E
G
x
K
R
|
R
E
 
G
T
 
K
L
|
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
N
A
 
N
S
 
S
E
 
H
L
 
L
Y
 
F
E
 
H
E
 
Q
A
 
M
A
 
H
S
 
T
G
 
E
A
 
A
L
 
-
A
 
Q
K
 
K
L
 
R
G
 
G
V
 
I
K
 
D
L
 
V
-
 
N
G
 
G
K
 
D
V
 
I
E
 
K
L
 
I
D
 
N
L
 
V
D
 
A
A
 
N
M
 
F
H
 
Q
A
 
K
Q
 
A
R
 
K
L
 
D
D
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
K
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
E
F
 
L
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
K
N
 
N
K
 
K
V
 
V
E
 
T
W
 
Y
L
 
Y
K
 
K
G
 
G
Y
 
N
A
x
G
T
 
S
F
 
F
T
 
E
G
 
D
K
 
E
D
 
T
S
 
K
V
 
I
K
 
R
V
 
V
G
 
T
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
K
-
 
E
D
 
D
R
 
H
E
 
I
V
 
L
R
 
D
A
 
V
K
 
K
N
 
N
I
 
I
V
 
I
I
 
V
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
E
V
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
E
 
E
I
 
I
D
 
D
Q
 
E
K
 
E
I
 
K
V
 
I
V
 
V
D
 
S
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
S
L
 
L
A
 
K
K
 
E
V
 
I
P
 
P
E
 
K
H
 
R
L
 
L
V
 
T
V
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
x
I
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
L
 
M
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
Y
R
 
S
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
S
K
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
Y
 
F
L
 
Q
D
 
P
Q
 
Q
I
 
I
L
 
G
P
 
A
G
 
S
F
 
M
D
 
D
A
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
A
K
 
K
E
 
A
A
 
T
A
 
Q
R
 
K
L
 
F
F
 
L
K
 
K
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
L
E
 
D
F
 
F
K
 
K
T
 
L
G
 
S
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
I
G
 
S
V
 
A
A
 
K
V
 
R
K
 
N
G
 
D
G
 
D
K
 
K
-
 
N
-
 
V
A
 
V
T
 
E
I
 
I
T
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
D
A
 
T
A
 
K
G
 
T
G
 
N
A
 
K
A
 
Q
E
 
E
T
 
N
I
 
L
E
 
E
A
 
A
D
 
E
N
 
V
V
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
G
R
|
R
K
 
R
P
 
P
N
x
Y
T
 
I
D
 
A
G
 
G
L
|
L
G
 
G
L
 
A
D
 
E
A
 
K
A
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
E
V
 
V
N
 
D
Q
 
K
R
 
R
G
 
G
Q
 
R
I
 
L
E
 
V
T
 
I
D
 
D
H
 
D
S
 
Q
F
 
F
K
 
N
T
 
S
S
 
K
V
 
F
P
 
P
G
 
H
I
 
I
W
 
K
A
 
V
I
 
V
G
|
G
D
|
D
V
 
V
I
 
T
P
 
F
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
A
A
 
V
E
 
E
N
 
M
I
 
L
A
 
K
G
x
T
L
 
G
T
 
H
G
 
G
I
 
H
V
 
V
N
 
N
H
 
Y
D
 
N
V
 
N
I
 
I
P
 
P
S
 
S
V
 
V
V
 
M
Y
 
Y
T
 
S
M
 
H
P
 
P
E
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
W
V
 
V
G
 
G
L
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
Q
A
 
L
K
 
K
A
 
E
K
 
A
G
 
G
-
 
I
E
 
D
V
 
Y
K
 
K
V
 
I
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
A
N
 
N
S
 
S
R
 
R
A
 
A
K
 
K
T
 
T
N
 
N
H
 
Q
E
 
D
P
 
T
D
 
E
G
 
G
F
 
F
V
 
V
K
 
K
V
 
I
I
 
L
A
 
I
D
 
D
A
 
S
K
 
K
T
 
T
D
 
E
R
 
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
A
W
 
H
I
 
I
I
 
I
T
 
G
S
 
P
V
 
N
A
 
A
G
 
G
T
 
E
M
 
M
I
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
G
Q
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
S
S
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
A
Y
 
R
T
 
V
C
 
C
H
|
H
A
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
H
 
L
S
 
S
E
|
E
A
 
A
I
 
F
K
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
N
M
 
M
A
 
A
V
 
A
T
 
Y
G
 
D
K
 
K
P
 
A
I
 
I
H
 
H

2eq7A Crystal structure of lipoamide dehydrogenase from thermus thermophilus hb8 with psbdo
52% identity, 98% coverage: 6:461/464 of query aligns to 2:452/452 of 2eq7A

query
sites
2eq7A
F
 
Y
D
 
D
V
 
L
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
S
 
A
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
M
K
 
K
T
 
V
A
 
G
C
 
V
A
 
V
E
|
E
G
x
K
R
 
E
E
 
K
T
 
A
L
|
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
x
R
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
E
A
 
T
S
 
T
E
 
E
L
 
R
Y
 
I
E
 
Y
E
 
E
A
 
A
A
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
L
L
 
L
A
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
G
V
 
A
K
 
K
L
 
V
G
 
K
K
x
G
V
|
V
E
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
L
D
 
P
A
 
A
M
 
L
H
 
M
A
 
A
Q
 
H
R
 
K
L
 
D
D
 
K
A
 
V
V
 
V
K
 
Q
G
 
A
L
 
N
T
 
T
G
 
Q
G
 
G
I
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
K
N
 
N
K
 
G
V
 
I
E
 
A
W
 
R
L
 
H
K
 
Q
G
 
G
Y
x
T
A
|
A
T
 
R
F
 
F
T
 
L
G
 
S
K
 
E
D
 
R
S
 
K
V
 
V
K
 
L
V
 
V
G
 
E
D
 
E
-
 
T
-
 
G
R
 
E
E
 
E
V
 
L
R
 
E
A
 
A
K
 
R
N
 
Y
I
 
I
V
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
A
V
 
P
T
 
L
P
 
I
L
 
P
P
 
P
G
x
W
V
 
A
E
 
Q
I
 
V
D
 
D
Q
 
Y
K
 
E
I
 
R
V
 
V
V
 
V
D
 
T
S
|
S
T
 
T
G
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
S
L
 
F
A
 
P
K
 
E
V
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
R
L
 
L
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
V
V
 
V
W
 
W
R
 
H
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
E
V
 
V
T
 
I
V
 
V
V
 
L
E
|
E
Y
|
Y
L
 
M
D
 
D
Q
 
R
I
 
I
L
 
L
P
 
P
G
 
T
F
 
M
D
 
D
A
 
L
D
 
E
V
 
V
R
 
S
K
 
R
E
 
A
A
 
A
A
 
E
R
 
R
L
 
V
F
 
F
K
 
K
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
L
E
 
T
F
 
I
K
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
V
K
 
R
V
|
V
T
 
T
G
 
A
V
 
V
A
 
V
V
 
P
K
 
E
G
 
A
G
 
K
K
 
G
A
 
A
T
 
R
I
 
V
T
 
E
V
 
L
E
 
E
P
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
G
A
 
-
A
 
-
E
 
E
T
 
V
I
 
L
E
 
E
A
 
A
D
 
D
N
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
I
x
V
G
|
G
R
|
R
K
 
R
P
 
P
N
x
Y
T
 
T
D
 
E
G
 
G
L
 
L
G
 
S
L
 
L
D
 
E
A
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
S
V
 
T
N
 
D
Q
 
E
R
 
R
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
E
 
P
T
 
V
D
 
D
H
 
E
S
 
H
F
 
L
K
 
R
T
 
T
S
 
R
V
 
V
P
 
P
G
 
H
I
 
I
W
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
V
I
 
V
P
 
R
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
x
S
D
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
A
A
 
V
E
 
E
N
 
H
I
 
M
A
 
V
G
 
R
L
 
G
T
 
F
G
 
G
I
 
H
V
 
V
N
 
D
H
 
Y
D
 
Q
V
 
A
I
 
I
P
 
P
S
 
S
V
|
V
V
 
V
Y
|
Y
T
 
T
M
 
H
P
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
E
A
 
L
K
 
K
A
 
A
K
 
Q
G
 
G
-
 
I
E
 
P
V
 
Y
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
M
 
Y
A
 
S
G
 
A
N
 
S
S
 
G
R
 
R
A
 
A
K
 
R
T
 
A
N
 
M
H
 
G
E
 
E
P
 
T
D
 
E
G
 
G
F
 
F
V
 
I
K
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
H
A
 
A
K
 
K
T
 
T
D
 
D
R
 
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
V
W
 
H
I
 
G
I
 
I
T
 
G
S
 
A
V
 
R
A
 
V
G
 
G
T
 
D
M
 
V
I
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
F
F
 
F
G
 
K
A
 
A
T
 
S
S
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
G
Y
 
R
T
 
A
C
 
P
H
|
H
A
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
S
H
 
L
S
 
S
E
|
E
A
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
A
V
 
A
T
 
W
G
 
E
K
 
R
P
 
P

6awaA 1.83 angstrom resolution crystal structure of dihydrolipoyl dehydrogenase from pseudomonas putida in complex with fad and adenosine-5'-monophosphate.
52% identity, 99% coverage: 6:464/464 of query aligns to 5:472/475 of 6awaA

query
sites
6awaA
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
V
I
|
I
G
 
G
S
 
A
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
T
A
 
A
C
 
C
-
 
I
-
x
E
-
x
K
-
 
Y
-
 
T
-
 
D
A
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
K
E
 
L
T
 
A
L
|
L
G
 
G
G
 
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
D
A
 
S
S
 
S
E
 
W
L
 
K
Y
 
Y
E
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
K
S
 
E
G
 
-
A
 
S
L
 
F
A
 
N
K
 
V
L
 
H
G
 
G
V
 
I
K
 
S
L
 
T
G
 
G
K
 
E
V
 
V
E
 
K
L
 
M
D
 
D
L
 
V
D
 
A
A
 
A
M
 
M
H
 
V
A
 
G
Q
 
R
R
 
K
L
 
A
D
 
G
A
 
I
V
 
V
K
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
V
E
 
A
F
 
T
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
A
N
 
N
K
 
G
V
 
V
E
 
T
W
 
S
L
 
I
K
 
Q
G
 
G
Y
x
H
A
x
G
T
 
K
F
 
L
T
 
L
G
 
A
K
 
G
D
 
K
S
 
K
V
 
V
K
 
E
V
 
V
-
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
D
G
 
G
D
 
T
R
 
T
E
 
E
V
 
V
-
 
I
R
 
E
A
 
A
K
 
E
N
 
N
I
 
V
V
 
I
I
 
L
A
 
A
T
x
S
G
|
G
S
 
S
S
 
R
V
 
P
T
 
I
P
 
D
L
 
I
P
 
P
G
 
P
V
 
A
E
 
P
I
 
V
D
 
D
Q
 
Q
K
 
N
I
 
V
V
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
F
A
 
Q
K
 
A
V
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
R
L
 
L
V
 
G
V
 
V
I
|
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
A
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
L
E
|
E
Y
x
A
L
|
L
D
 
D
Q
 
T
I
 
F
L
 
L
P
 
M
G
 
A
F
 
A
D
 
D
A
 
T
D
 
A
V
 
V
R
 
S
K
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
Q
R
 
K
L
 
T
F
 
L
K
 
T
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
L
E
 
D
F
 
I
K
 
K
T
 
L
G
 
G
T
 
A
K
 
R
V
|
V
T
 
T
G
 
G
V
 
S
A
 
K
V
 
V
K
 
N
G
 
G
G
 
N
K
 
E
A
 
V
T
 
E
I
 
V
T
 
T
V
 
Y
E
 
T
P
 
N
A
 
A
A
 
E
G
 
G
G
 
-
A
 
-
A
 
E
E
 
Q
T
 
K
I
 
I
E
 
T
A
 
F
D
 
D
N
 
K
V
 
L
L
 
I
V
 
V
A
 
A
I
x
V
G
 
G
R
|
R
K
 
R
P
 
P
N
 
V
T
 
T
D
 
T
G
 
D
L
 
L
G
 
L
L
 
A
D
 
S
A
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
V
T
 
T
V
 
I
N
 
D
Q
 
E
R
 
R
G
 
G
Q
 
Y
I
 
I
E
 
F
T
 
V
D
 
D
H
 
D
S
 
Y
F
 
C
K
 
A
T
 
T
S
 
S
V
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
V
W
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
V
I
 
V
P
 
R
G
 
G
P
 
M
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
 
H
K
 
K
A
 
A
E
 
S
D
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
M
V
 
V
A
 
V
E
 
E
N
 
R
I
 
I
A
 
K
G
 
G
L
 
H
T
 
K
G
 
A
I
 
Q
V
 
M
N
 
N
H
 
Y
D
 
D
V
 
L
I
 
I
P
 
P
S
 
S
V
 
V
V
 
I
Y
|
Y
T
 
T
M
 
H
P
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
W
V
 
V
G
 
G
L
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
K
A
 
A
K
 
E
G
 
G
-
 
V
E
 
E
V
 
V
K
 
N
V
 
V
G
 
G
K
 
T
F
 
F
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
A
N
 
S
S
 
G
R
 
R
A
 
A
K
 
M
T
 
A
N
 
A
H
 
N
E
 
D
P
 
T
D
 
G
G
 
G
F
 
F
V
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
T
D
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
V
W
 
H
I
 
V
I
 
I
T
 
G
S
 
P
V
 
S
A
 
A
G
 
A
T
 
E
M
 
L
I
 
V
A
 
Q
Q
 
Q
A
 
G
A
 
A
Q
 
I
A
 
A
M
 
M
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
T
T
 
S
S
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
G
Y
 
M
T
 
M
C
 
V
H
x
F
A
 
S
H
|
H
P
 
P
T
 
T
H
 
L
S
 
S
E
|
E
A
 
A
I
 
L
K
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
N
G
 
G
K
 
G
P
 
A
I
 
I
H
 
H
I
 
V

Sites not aligning to the query:

P14218 Dihydrolipoyl dehydrogenase; Dihydrolipoamide dehydrogenase; E3 component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex; EC 1.8.1.4 from Pseudomonas fluorescens (see 2 papers)
52% identity, 99% coverage: 6:464/464 of query aligns to 5:472/478 of P14218

query
sites
P14218
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
T
A
 
A
C
 
C
-
 
I
-
x
E
-
x
K
-
x
Y
-
x
I
-
x
G
A
x
K
E
|
E
G
|
G
R
x
K
E
x
V
T
x
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
 
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
 
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
D
A
 
S
S
 
S
E
 
Y
L
 
K
Y
 
Y
E
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
K
S
 
E
G
 
-
A
 
A
L
 
F
A
 
K
K
 
V
L
 
H
G
 
G
V
 
I
K
 
E
L
 
A
G
 
K
K
 
G
V
 
V
E
 
T
L
 
I
D
 
D
L
 
V
D
 
P
A
 
A
M
 
M
H
 
V
A
 
A
Q
 
R
R
 
K
L
 
A
D
 
N
A
 
I
V
 
V
K
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
A
F
 
T
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
A
N
 
N
K
 
G
V
 
V
E
 
T
W
 
S
L
 
F
K
 
E
G
 
G
Y
 
H
A
x
G
T
 
K
F
 
L
T
 
L
G
 
A
K
 
N
D
 
K
S
 
Q
V
 
V
K
 
E
V
 
V
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
D
G
 
G
D
 
K
R
 
T
E
 
Q
V
 
V
-
 
L
R
 
E
A
 
A
K
 
E
N
 
N
I
 
V
V
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
R
V
 
P
T
 
V
P
 
E
L
 
I
P
 
P
G
 
P
V
 
A
E
 
P
I
 
L
D
 
S
Q
 
D
K
 
D
I
 
I
V
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
F
A
 
Q
K
 
A
V
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
K
L
 
L
V
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
A
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
L
E
 
E
Y
 
A
L
 
L
D
 
D
Q
 
K
I
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
A
F
 
A
D
 
D
A
 
E
D
 
Q
V
 
I
R
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
L
R
 
K
L
 
V
F
 
L
K
 
T
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
L
E
 
N
F
 
I
K
 
R
T
 
L
G
 
G
T
 
A
K
 
R
V
 
V
T
 
T
G
 
A
V
 
S
A
 
E
V
 
V
K
 
K
G
 
K
G
 
K
K
 
Q
A
 
V
T
 
T
I
 
V
T
 
T
V
 
F
E
 
T
P
 
D
A
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
E
A
 
Q
A
 
K
E
 
E
T
 
T
I
 
F
E
 
-
A
 
-
D
 
D
N
 
K
V
 
L
L
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
R
P
 
P
N
 
V
T
 
T
D
 
T
G
 
D
L
 
L
G
 
L
L
 
A
D
 
A
A
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
V
T
 
T
V
 
L
N
 
D
Q
 
E
R
 
R
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
E
 
Y
T
 
V
D
 
D
H
 
D
S
 
H
F
 
C
K
 
K
T
 
T
S
 
S
V
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
V
W
 
F
A
 
A
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
V
I
 
V
P
 
R
G
 
G
P
 
A
M
 
M
L
 
L
A
|
A
H
 
H
K
 
K
A
 
A
E
 
S
D
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
V
A
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
R
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
H
T
 
K
G
 
A
I
 
Q
V
 
M
N
 
N
H
 
Y
D
 
D
V
 
L
I
 
I
P
 
P
S
 
S
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
M
 
H
P
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
W
V
 
V
G
 
G
L
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
Q
A
 
T
A
 
L
K
 
K
A
 
A
K
 
E
G
 
G
-
 
V
E
 
E
V
 
V
K
 
N
V
 
V
G
 
G
K
 
T
F
 
F
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
A
N
 
S
S
 
G
R
 
R
A
 
A
K
 
M
T
 
A
N
 
A
H
 
N
E
 
D
P
 
T
D
 
T
G
 
G
F
 
L
V
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
T
D
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
V
W
 
H
I
 
V
I
 
I
T
 
G
S
 
P
V
 
S
A
 
A
G
 
A
T
 
E
M
 
L
I
 
V
A
 
Q
Q
 
Q
A
 
G
A
 
A
Q
 
I
A
 
G
M
 
M
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
T
T
 
S
S
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
G
Y
 
M
T
 
M
C
 
V
H
 
F
A
 
S
H
 
H
P
 
P
T
 
T
H
 
L
S
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
L
K
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
N
G
 
G
K
 
H
P
 
A
I
 
I
H
 
H
I
 
I

Sites not aligning to the query:

5u8uD Dihydrolipoamide dehydrogenase (lpdg) from pseudomonas aeruginosa (see paper)
52% identity, 99% coverage: 6:464/464 of query aligns to 7:474/477 of 5u8uD

query
sites
5u8uD
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
V
I
|
I
G
 
G
S
 
A
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
T
A
 
A
C
 
C
-
 
I
-
x
E
-
x
K
-
 
Y
-
 
I
-
 
G
A
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
K
E
 
V
T
 
A
L
|
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
D
A
 
S
S
 
S
E
 
Y
L
 
K
Y
 
Y
E
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
K
S
 
E
G
 
-
A
 
A
L
 
F
A
 
K
K
 
V
L
 
H
G
 
G
V
 
I
K
 
E
L
 
A
G
 
K
K
x
G
V
|
V
E
 
T
L
 
I
D
 
D
L
 
V
D
 
P
A
 
A
M
 
M
H
 
V
A
 
A
Q
 
R
R
 
K
L
 
A
D
 
N
A
 
I
V
 
V
K
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
A
F
 
T
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
A
N
 
N
K
 
G
V
 
V
E
 
T
W
 
S
L
 
F
K
 
E
G
 
G
Y
x
H
A
x
G
T
 
K
F
 
L
T
 
L
G
 
A
K
 
N
D
 
K
S
 
Q
V
 
V
K
 
E
V
 
V
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
D
G
 
G
D
 
K
R
 
T
E
 
Q
V
 
V
-
 
L
R
 
E
A
 
A
K
 
E
N
 
N
I
 
V
V
 
I
I
 
I
A
|
A
T
x
S
G
|
G
S
 
S
S
 
R
V
 
P
T
 
V
P
 
E
L
 
I
P
 
P
G
 
P
V
 
A
E
 
P
I
 
L
D
 
T
Q
 
D
K
 
D
I
 
I
V
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
F
A
 
Q
K
 
A
V
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
K
L
 
L
V
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
A
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
L
E
 
E
Y
 
A
L
 
L
D
 
D
Q
 
K
I
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
A
F
 
A
D
 
D
A
 
E
D
 
Q
V
 
I
R
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
L
R
 
K
L
 
V
F
 
L
K
 
T
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
L
E
 
N
F
 
I
K
 
R
T
 
L
G
 
G
T
 
A
K
 
R
V
 
V
T
 
T
G
 
A
V
 
S
A
 
E
V
 
V
K
 
K
G
 
K
G
 
K
K
 
Q
A
 
V
T
 
T
I
 
V
T
 
T
V
 
F
E
 
T
P
 
D
A
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
E
A
 
Q
A
 
K
E
 
E
T
 
T
I
 
F
E
 
-
A
 
-
D
 
D
N
 
K
V
 
L
L
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
G
R
|
R
K
 
R
P
 
P
N
 
V
T
 
T
D
 
T
G
 
D
L
 
L
G
 
L
L
 
A
D
 
A
A
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
V
T
 
T
V
 
L
N
 
D
Q
 
E
R
 
R
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
E
 
Y
T
 
V
D
 
D
H
 
D
S
 
H
F
 
C
K
 
K
T
 
T
S
 
S
V
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
V
W
 
F
A
 
A
I
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
V
I
 
V
P
 
R
G
 
G
P
 
A
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
x
S
D
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
V
A
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
R
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
H
T
 
K
G
 
A
I
 
Q
V
 
M
N
 
N
H
 
Y
D
 
D
V
 
L
I
 
I
P
 
P
S
 
S
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
M
 
H
P
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
W
V
 
V
G
 
G
L
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
Q
A
 
T
A
 
L
K
 
K
A
 
A
K
 
E
G
 
G
-
 
V
E
 
E
V
 
V
K
 
N
V
 
V
G
 
G
K
 
T
F
 
F
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
A
N
 
S
S
 
G
R
 
R
A
 
A
K
 
M
T
 
A
N
 
A
H
 
N
E
 
D
P
 
T
D
 
T
G
 
G
F
 
L
V
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
T
D
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
V
W
 
H
I
 
V
I
 
I
T
 
G
S
 
P
V
 
S
A
 
A
G
 
A
T
 
E
M
 
L
I
 
V
A
 
Q
Q
 
Q
A
 
G
A
 
A
Q
 
I
A
 
G
M
 
M
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
T
T
 
S
S
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
G
Y
 
M
T
 
M
C
 
V
H
x
F
A
 
S
H
|
H
P
|
P
T
 
T
H
 
L
S
 
S
E
|
E
A
 
A
I
 
L
K
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
N
G
 
G
K
 
H
P
 
A
I
 
I
H
 
H
I
 
I

Sites not aligning to the query:

5u8wA Dihydrolipoamide dehydrogenase (lpdg) from pseudomonas aeruginosa bound to nadh (see paper)
52% identity, 99% coverage: 6:464/464 of query aligns to 4:471/473 of 5u8wA

query
sites
5u8wA
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
V
I
|
I
G
 
G
S
 
A
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
T
A
 
A
C
 
C
-
 
I
-
x
E
-
x
K
-
 
Y
-
 
I
-
 
G
A
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
K
E
 
V
T
 
A
L
|
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
D
A
 
S
S
 
S
E
 
Y
L
 
K
Y
 
Y
E
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
K
S
 
E
G
 
-
A
 
A
L
 
F
A
 
K
K
 
V
L
 
H
G
 
G
V
 
I
K
 
E
L
 
A
G
 
K
K
x
G
V
|
V
E
 
T
L
 
I
D
 
D
L
 
V
D
 
P
A
 
A
M
 
M
H
 
V
A
 
A
Q
 
R
R
 
K
L
 
A
D
 
N
A
 
I
V
 
V
K
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
A
F
 
T
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
A
N
 
N
K
 
G
V
 
V
E
 
T
W
 
S
L
 
F
K
 
E
G
 
G
Y
x
H
A
x
G
T
 
K
F
 
L
T
 
L
G
 
A
K
 
N
D
 
K
S
 
Q
V
 
V
K
 
E
V
 
V
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
D
G
 
G
D
 
K
R
 
T
E
 
Q
V
 
V
-
 
L
R
 
E
A
 
A
K
 
E
N
 
N
I
 
V
V
 
I
I
 
I
A
|
A
T
x
S
G
|
G
S
 
S
S
 
R
V
 
P
T
 
V
P
 
E
L
 
I
P
 
P
G
 
P
V
 
A
E
 
P
I
 
L
D
 
T
Q
 
D
K
 
D
I
 
I
V
 
I
V
 
V
D
 
D
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
F
A
 
Q
K
 
A
V
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
K
L
 
L
V
 
G
V
 
V
I
|
I
G
 
G
G
 
A
G
|
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
A
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
L
E
|
E
Y
x
A
L
|
L
D
 
D
Q
 
K
I
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
A
F
 
A
D
 
D
A
 
E
D
 
Q
V
 
I
R
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
L
R
 
K
L
 
V
F
 
L
K
 
T
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
L
E
 
N
F
 
I
K
 
R
T
 
L
G
 
G
T
 
A
K
 
R
V
 
V
T
 
T
G
 
A
V
 
S
A
 
E
V
 
V
K
 
K
G
 
K
G
 
K
K
 
Q
A
 
V
T
 
T
I
 
V
T
 
T
V
 
F
E
 
T
P
 
D
A
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
E
A
 
Q
A
 
K
E
 
E
T
 
T
I
 
F
E
 
-
A
 
-
D
 
D
N
 
K
V
 
L
L
 
I
V
 
V
A
|
A
I
x
V
G
|
G
R
|
R
K
 
R
P
 
P
N
 
V
T
 
T
D
 
T
G
 
D
L
 
L
G
 
L
L
 
A
D
 
A
A
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
V
T
 
T
V
 
L
N
 
D
Q
 
E
R
 
R
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
E
 
Y
T
 
V
D
 
D
H
 
D
S
 
H
F
 
C
K
 
K
T
 
T
S
 
S
V
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
V
W
 
F
A
 
A
I
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
V
I
 
V
P
 
R
G
 
G
P
 
A
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
x
S
D
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
V
A
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
R
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
H
T
 
K
G
 
A
I
 
Q
V
 
M
N
 
N
H
 
Y
D
 
D
V
 
L
I
 
I
P
 
P
S
 
S
V
|
V
V
 
I
Y
|
Y
T
 
T
M
 
H
P
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
W
V
 
V
G
 
G
L
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
Q
A
 
T
A
 
L
K
 
K
A
 
A
K
 
E
G
 
G
-
 
V
E
 
E
V
 
V
K
 
N
V
 
V
G
 
G
K
 
T
F
 
F
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
A
N
 
S
S
 
G
R
 
R
A
 
A
K
 
M
T
 
A
N
 
A
H
 
N
E
 
D
P
 
T
D
 
T
G
 
G
F
 
L
V
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
T
D
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
V
W
 
H
I
 
V
I
 
I
T
 
G
S
 
P
V
 
S
A
 
A
G
 
A
T
 
E
M
 
L
I
 
V
A
 
Q
Q
 
Q
A
 
G
A
 
A
Q
 
I
A
 
G
M
 
M
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
T
T
 
S
S
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
G
Y
 
M
T
 
M
C
 
V
H
x
F
A
 
S
H
|
H
P
|
P
T
 
T
H
 
L
S
 
S
E
|
E
A
 
A
I
 
L
K
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
N
G
 
G
K
 
H
P
 
A
I
 
I
H
 
H
I
 
I

Sites not aligning to the query:

5u8vA Dihydrolipoamide dehydrogenase (lpdg) from pseudomonas aeruginosa bound to NAD+ (see paper)
52% identity, 99% coverage: 6:464/464 of query aligns to 3:470/472 of 5u8vA

query
sites
5u8vA
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
V
I
|
I
G
 
G
S
 
A
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
T
A
 
A
C
 
C
-
 
I
-
x
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
I
-
 
G
A
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
K
E
 
V
T
 
A
L
|
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
D
A
 
S
S
 
S
E
 
Y
L
 
K
Y
 
Y
E
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
K
S
 
E
G
 
-
A
 
A
L
 
F
A
 
K
K
 
V
L
 
H
G
 
G
V
 
I
K
 
E
L
 
A
G
 
K
K
x
G
V
|
V
E
 
T
L
 
I
D
 
D
L
 
V
D
 
P
A
 
A
M
 
M
H
 
V
A
 
A
Q
 
R
R
 
K
L
 
A
D
 
N
A
 
I
V
 
V
K
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
A
F
 
T
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
A
N
 
N
K
 
G
V
 
V
E
 
T
W
 
S
L
 
F
K
 
E
G
 
G
Y
x
H
A
x
G
T
 
K
F
 
L
T
 
L
G
 
A
K
 
N
D
 
K
S
 
Q
V
 
V
K
 
E
V
 
V
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
D
G
 
G
D
 
K
R
 
T
E
 
Q
V
 
V
-
 
L
R
 
E
A
 
A
K
 
E
N
 
N
I
 
V
V
 
I
I
 
I
A
|
A
T
x
S
G
|
G
S
 
S
S
 
R
V
 
P
T
 
V
P
 
E
L
 
I
P
 
P
G
 
P
V
 
A
E
 
P
I
 
L
D
 
T
Q
 
D
K
 
D
I
 
I
V
 
I
V
 
V
D
 
D
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
F
A
 
Q
K
 
A
V
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
K
L
 
L
V
 
G
V
 
V
I
|
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
A
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
x
L
E
|
E
Y
x
A
L
 
L
D
 
D
Q
 
K
I
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
A
F
 
A
D
 
D
A
 
E
D
 
Q
V
 
I
R
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
L
R
 
K
L
 
V
F
 
L
K
 
T
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
L
E
 
N
F
 
I
K
 
R
T
 
L
G
 
G
T
 
A
K
 
R
V
|
V
T
 
T
G
 
A
V
 
S
A
 
E
V
 
V
K
 
K
G
 
K
G
 
K
K
 
Q
A
 
V
T
 
T
I
 
V
T
 
T
V
 
F
E
 
T
P
 
D
A
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
E
A
 
Q
A
 
K
E
 
E
T
 
T
I
 
F
E
 
-
A
 
-
D
 
D
N
 
K
V
 
L
L
 
I
V
 
V
A
 
A
I
x
V
G
|
G
R
|
R
K
 
R
P
 
P
N
 
V
T
 
T
D
 
T
G
 
D
L
 
L
G
 
L
L
 
A
D
 
A
A
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
V
T
 
T
V
 
L
N
 
D
Q
 
E
R
 
R
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
E
 
Y
T
 
V
D
 
D
H
 
D
S
 
H
F
 
C
K
 
K
T
 
T
S
 
S
V
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
V
W
 
F
A
 
A
I
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
V
I
 
V
P
 
R
G
 
G
P
 
A
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
x
S
D
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
V
A
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
R
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
H
T
 
K
G
 
A
I
 
Q
V
 
M
N
 
N
H
 
Y
D
 
D
V
 
L
I
 
I
P
 
P
S
 
S
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
M
 
H
P
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
W
V
 
V
G
 
G
L
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
Q
A
 
T
A
 
L
K
 
K
A
 
A
K
 
E
G
 
G
-
 
V
E
 
E
V
 
V
K
 
N
V
 
V
G
 
G
K
 
T
F
 
F
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
A
N
 
S
S
 
G
R
 
R
A
 
A
K
 
M
T
 
A
N
 
A
H
 
N
E
 
D
P
 
T
D
 
T
G
 
G
F
 
L
V
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
T
D
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
V
W
 
H
I
 
V
I
 
I
T
 
G
S
 
P
V
 
S
A
 
A
G
 
A
T
 
E
M
 
L
I
 
V
A
 
Q
Q
 
Q
A
 
G
A
 
A
Q
 
I
A
 
G
M
 
M
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
T
T
 
S
S
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
G
Y
 
M
T
 
M
C
 
V
H
x
F
A
 
S
H
|
H
P
|
P
T
 
T
H
 
L
S
 
S
E
|
E
A
 
A
I
 
L
K
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
N
G
 
G
K
 
H
P
 
A
I
 
I
H
 
H
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Ga0059261_1343 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_1343
MAEYDFDVLVIGSGPGGYVAAIRAAQLGLKTACAEGRETLGGTCLNVGCIPSKALLHASE
LYEEAASGALAKLGVKLGKVELDLDAMHAQRLDAVKGLTGGIEFLFKKNKVEWLKGYATF
TGKDSVKVGDREVRAKNIVIATGSSVTPLPGVEIDQKIVVDSTGALELAKVPEHLVVIGG
GVIGLELGSVWRRVGAKVTVVEYLDQILPGFDADVRKEAARLFKKQGIEFKTGTKVTGVA
VKGGKATITVEPAAGGAAETIEADNVLVAIGRKPNTDGLGLDAAGLTVNQRGQIETDHSF
KTSVPGIWAIGDVIPGPMLAHKAEDEGIAVAENIAGLTGIVNHDVIPSVVYTMPEIAGVG
LTEEAAKAKGEVKVGKFPMAGNSRAKTNHEPDGFVKVIADAKTDRVLGVWIITSVAGTMI
AQAAQAMEFGATSEDIAYTCHAHPTHSEAIKEAAMAVTGKPIHI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory