SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_1451 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_1451 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4k6fB X-ray crystal structure of a putative acetoacetyl-coa reductase from burkholderia cenocepacia bound to the co-factor NADP
54% identity, 99% coverage: 3:240/240 of query aligns to 2:245/245 of 4k6fB

query
sites
4k6fB
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
 
M
R
 
G
G
|
G
I
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
V
S
 
S
V
 
I
A
 
R
L
 
L
K
 
N
D
 
D
M
 
A
G
 
G
M
 
H
T
 
R
V
 
V
A
 
V
A
 
V
N
 
T
Y
|
Y
A
x
S
G
 
P
N
 
N
D
x
N
Q
 
T
R
 
G
A
 
A
A
 
D
E
 
R
-
 
W
F
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
M
T
 
H
G
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
E
I
 
F
K
 
H
A
 
A
F
 
Y
K
 
P
W
x
V
D
|
D
V
|
V
A
 
A
D
 
D
Y
 
H
D
 
D
A
 
S
C
 
C
Q
 
Q
Q
 
Q
G
 
C
V
 
I
A
 
E
D
 
K
V
 
I
E
 
V
A
 
R
A
 
D
L
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
M
T
 
T
I
 
L
L
 
R
K
 
K
M
 
L
T
 
D
Y
 
K
Q
 
V
M
x
N
W
 
W
K
 
D
E
 
A
V
 
V
M
 
I
D
 
R
T
 
T
N
 
N
L
 
L
G
 
D
G
 
S
C
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
M
A
 
T
K
 
K
A
 
P
T
 
V
F
 
C
P
 
D
G
 
G
M
 
M
R
 
V
E
 
E
R
 
R
K
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
G
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
S
A
 
K
G
 
G
Q
 
S
Y
 
V
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
G
 
G
I
 
M
H
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
G
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
I
 
L
D
 
A
T
 
T
D
 
K
M
 
M
V
 
V
A
 
T
A
 
A
V
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
D
V
 
I
L
 
L
E
 
D
-
 
T
K
 
K
I
 
I
V
 
L
A
 
P
K
 
Q
I
 
I
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
K
A
 
P
N
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
A
G
 
L
V
 
V
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
C
 
C
S
 
S
E
 
E
E
 
E
G
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
N
L
 
I
S
 
A
I
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
M
 
M
Y
 
H

5vt6A Crystal structure of acetoacetyl-coa reductase from burkholderia pseudomallei 1710b complexed with NADP
53% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 2:244/245 of 5vt6A

query
sites
5vt6A
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
F
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
 
M
R
x
G
G
|
G
I
x
L
G
 
G
E
 
A
A
 
A
I
 
I
S
 
S
V
 
R
A
 
R
L
 
L
K
 
H
D
 
D
M
 
A
G
 
G
M
 
M
T
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
V
N
 
S
Y
x
H
A
x
S
G
 
E
N
 
R
D
x
N
Q
 
D
R
 
H
A
 
V
A
 
S
E
 
T
F
 
W
T
 
L
-
 
M
-
 
H
E
 
E
R
 
R
T
 
D
G
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
D
I
 
F
K
 
K
A
 
A
F
 
Y
K
 
A
W
x
V
D
|
D
V
|
V
A
 
A
D
 
D
Y
 
F
D
 
E
A
 
S
C
 
C
Q
 
E
Q
 
R
G
 
C
V
 
A
A
 
E
D
 
K
V
 
V
E
 
L
A
 
A
A
 
D
L
 
F
G
 
G
P
 
K
V
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
A
T
 
T
I
 
F
L
 
M
K
 
K
M
 
M
T
 
T
Y
 
K
Q
 
G
M
x
D
W
 
W
K
 
D
E
 
A
V
 
V
M
 
M
D
 
R
T
 
T
N
 
D
L
 
L
G
 
D
G
 
A
C
 
M
F
 
F
N
 
N
M
 
V
A
 
T
K
 
K
A
 
Q
T
 
F
F
 
I
P
 
A
G
 
G
M
 
M
R
 
V
E
 
E
R
 
R
K
 
R
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
G
 
G
S
|
S
I
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
S
A
 
R
G
 
G
Q
 
A
Y
 
F
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
S
A
 
A
K
|
K
S
 
A
G
 
G
I
 
I
H
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
G
 
T
A
 
A
R
 
K
A
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
 
G
Y
|
Y
I
x
L
D
 
A
T
|
T
D
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
E
A
 
A
V
 
V
P
 
P
A
 
Q
E
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
E
-
 
A
K
 
K
I
 
I
V
 
L
A
 
P
K
 
Q
I
 
I
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
A
 
P
N
 
D
E
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
A
G
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
E
 
D
E
 
D
G
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
D
L
 
L
S
 
A
I
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
H
 
H
M
 
M

5vmlA Crystal structure of acetoacetyl-coa reductase from burkholderia pseudomallei 1710b with bound NADP
52% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 3:244/245 of 5vmlA

query
sites
5vmlA
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
 
M
R
x
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
T
A
 
S
I
 
I
S
 
C
V
 
Q
A
 
R
L
 
L
K
 
H
D
 
K
M
 
D
G
 
G
M
 
F
T
 
R
V
 
V
A
 
V
A
 
A
N
 
G
Y
x
C
A
x
G
G
 
P
N
 
N
D
 
S
Q
 
P
R
|
R
A
 
R
A
 
V
E
 
K
F
 
W
T
 
L
E
 
E
R
 
D
T
 
Q
G
 
K
I
 
A
K
 
L
A
 
G
F
 
F
K
 
D
W
 
F
-
 
Y
-
 
A
-
 
S
-
 
E
-
x
G
D
x
N
V
|
V
A
 
G
D
 
D
Y
 
W
D
 
D
A
 
S
C
 
T
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
A
V
 
F
A
 
D
D
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
E
L
 
V
G
 
G
P
 
E
V
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
V
T
 
V
I
 
F
L
 
R
K
 
K
M
 
M
T
 
T
Y
 
R
Q
 
E
M
 
D
W
 
W
K
 
Q
E
 
A
V
 
V
M
 
I
D
 
D
T
 
T
N
|
N
L
 
L
G
 
T
G
 
S
C
 
L
F
 
F
N
 
N
M
 
V
A
 
T
K
 
K
A
 
Q
T
 
V
F
 
I
P
 
D
G
 
G
M
 
M
R
 
V
E
 
E
R
 
R
K
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
G
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
A
 
K
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
F
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
T
A
 
A
K
|
K
S
 
A
G
 
G
I
 
I
H
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
M
A
 
S
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
G
 
V
A
 
A
R
 
T
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
|
G
Y
 
Y
I
|
I
D
 
G
T
 
T
D
 
D
M
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
A
V
 
I
P
 
R
A
 
P
E
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
A
K
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
G
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
S
A
 
P
N
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
S
G
 
I
V
 
V
A
 
A
F
 
W
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
E
E
 
E
G
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
S
T
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
D
L
 
F
S
 
S
I
 
L
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
L
H
 
H
M
 
M

3vzsB Crystal structure of phab from ralstonia eutropha in complex with acetoacetyl-coa and NADP (see paper)
52% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 7:248/249 of 3vzsB

query
sites
3vzsB
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
 
M
R
 
G
G
 
G
I
|
I
G
 
G
E
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
C
V
 
Q
A
 
R
L
 
L
K
 
A
D
 
K
M
 
D
G
 
G
M
 
F
T
 
R
V
 
V
A
 
V
A
 
A
N
 
G
Y
 
C
A
x
G
G
 
P
N
 
N
D
 
S
Q
 
P
R
|
R
A
 
R
A
 
E
E
 
K
F
 
W
T
 
L
E
 
E
R
 
Q
T
 
Q
G
 
K
I
 
A
K
 
L
A
 
G
F
 
F
K
 
D
W
 
F
-
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
E
-
x
G
D
x
N
V
|
V
A
 
A
D
 
D
Y
 
W
D
 
D
A
 
S
C
 
T
Q
 
K
Q
 
T
G
 
A
V
 
F
A
 
D
D
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
S
A
 
E
L
 
V
G
 
G
P
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
D
|
D
G
 
V
T
 
V
I
 
F
L
 
R
K
 
K
M
 
M
T
 
T
Y
 
R
Q
 
A
M
 
D
W
 
W
K
 
D
E
 
A
V
 
V
M
 
I
D
 
D
T
 
T
N
|
N
L
 
L
G
 
T
G
 
S
C
 
L
F
 
F
N
 
N
M
 
V
A
 
T
K
 
K
A
 
Q
T
 
V
F
 
I
P
 
D
G
 
G
M
 
M
R
 
A
E
 
D
R
 
R
K
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
G
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
A
 
K
G
 
G
Q
|
Q
Y
x
F
G
 
G
Q
|
Q
V
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
T
A
 
A
K
|
K
S
 
A
G
 
G
I
 
L
H
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
G
 
V
A
 
A
R
 
T
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
|
G
Y
|
Y
I
|
I
D
 
A
T
 
T
D
 
D
M
|
M
V
|
V
A
 
K
A
 
A
V
 
I
P
x
R
A
 
Q
E
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
A
K
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
G
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
L
A
 
P
N
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
S
G
 
I
V
 
C
A
 
A
F
 
W
L
 
L
C
 
S
S
 
S
E
 
E
E
 
E
G
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
S
T
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
D
L
 
F
S
 
S
I
 
L
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
L
H
 
H
M
 
M

P14697 Acetoacetyl-CoA reductase; EC 1.1.1.36 from Cupriavidus necator (strain ATCC 17699 / DSM 428 / KCTC 22496 / NCIMB 10442 / H16 / Stanier 337) (Ralstonia eutropha) (see 2 papers)
52% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 4:245/246 of P14697

query
sites
P14697
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
M
R
x
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
C
V
 
Q
A
 
R
L
 
L
K
 
A
D
 
K
M
 
D
G
 
G
M
 
F
T
 
R
V
 
V
A
 
V
A
 
A
N
 
G
Y
 
C
A
x
G
G
 
P
N
 
N
D
 
S
Q
 
P
R
|
R
A
 
R
A
 
E
E
 
K
F
 
W
T
 
L
E
 
E
R
x
Q
T
 
Q
G
 
K
I
 
A
K
 
L
A
 
G
F
 
F
K
 
D
W
 
F
-
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
E
-
x
G
D
x
N
V
|
V
A
 
A
D
 
D
Y
 
W
D
 
D
A
 
S
C
 
T
Q
 
K
Q
 
T
G
 
A
V
 
F
A
 
D
D
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
S
A
 
E
L
 
V
G
 
G
P
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
D
|
D
G
 
V
T
 
V
I
 
F
L
 
R
K
|
K
M
 
M
T
 
T
Y
 
R
Q
 
A
M
 
D
W
 
W
K
 
D
E
 
A
V
 
V
M
 
I
D
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
G
 
T
G
 
S
C
 
L
F
 
F
N
 
N
M
 
V
A
 
T
K
 
K
A
 
Q
T
 
V
F
 
I
P
 
D
G
 
G
M
 
M
R
 
A
E
 
D
R
 
R
K
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
G
 
S
S
 
S
I
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
A
 
K
G
 
G
Q
|
Q
Y
x
F
G
 
G
Q
|
Q
V
 
T
N
 
N
Y
 
Y
A
 
S
A
 
T
A
 
A
K
 
K
S
 
A
G
 
G
I
 
L
H
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
G
 
V
A
 
A
R
x
T
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
|
G
Y
|
Y
I
|
I
D
 
A
T
 
T
D
 
D
M
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
A
V
 
I
P
x
R
A
 
Q
E
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
A
K
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
G
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
L
A
 
P
N
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
S
G
 
I
V
 
C
A
 
A
F
 
W
L
 
L
C
 
S
S
 
S
E
 
E
E
 
E
G
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
S
T
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
D
L
 
F
S
 
S
I
 
L
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
L
H
 
H
M
 
M

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
43% identity, 100% coverage: 1:239/240 of query aligns to 3:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
M
 
M
A
 
T
R
 
K
V
 
S
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
T
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
A
 
S
I
 
I
S
 
A
V
 
L
A
 
Q
L
 
L
K
 
A
D
 
E
M
 
E
G
 
G
M
 
Y
T
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
V
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
N
 
S
D
 
K
Q
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
E
E
 
A
F
 
V
T
 
V
E
 
E
R
 
E
T
 
I
G
 
K
I
 
A
K
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
F
A
 
A
F
 
I
K
 
Q
W
 
A
D
 
N
V
 
V
A
 
A
D
 
D
Y
 
A
D
 
D
A
 
E
C
 
V
Q
 
K
Q
 
A
G
 
M
V
 
I
A
 
K
D
 
E
V
 
V
E
 
V
A
 
S
A
 
Q
L
 
F
G
 
G
P
 
S
V
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
T
 
L
I
 
L
L
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
E
Q
 
Q
M
 
E
W
 
W
K
 
D
E
 
D
V
 
V
M
 
I
D
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
G
 
K
G
 
G
C
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
C
A
 
I
K
 
Q
A
 
K
T
 
A
F
 
T
P
 
P
G
 
Q
M
 
M
R
 
L
E
 
R
R
 
Q
K
 
R
W
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
G
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
A
A
 
V
G
 
G
Q
 
N
Y
 
P
G
 
G
Q
|
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
S
 
A
G
 
G
I
 
V
H
 
I
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
G
 
L
A
 
A
R
 
S
A
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
D
 
V
T
 
S
D
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
D
A
 
A
V
 
L
P
 
S
A
 
D
E
 
E
V
 
L
L
 
K
E
 
E
K
 
Q
I
 
M
V
 
L
A
 
T
K
 
Q
I
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
Q
A
 
D
N
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
N
G
 
T
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
K
G
 
A
G
 
K
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
Q
T
 
T
L
 
I
S
 
H
I
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
H
 
Y
M
 
M

4ag3A Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with NADPH at 1.8a resolution (see paper)
44% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 13:253/254 of 4ag3A

query
sites
4ag3A
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
S
 
A
V
 
L
A
 
E
L
 
L
K
 
G
D
 
R
M
 
L
G
 
G
M
 
A
T
 
V
V
 
V
-
 
I
-
 
G
A
 
T
A
 
A
N
x
T
Y
 
S
A
 
A
G
 
S
N
 
G
D
 
A
Q
 
E
R
 
K
A
 
I
A
 
A
E
 
E
F
 
T
T
 
L
E
 
K
R
 
A
T
 
N
G
 
G
I
 
V
K
 
E
A
 
G
-
 
A
-
 
G
F
 
L
K
 
V
W
x
L
D
|
D
V
|
V
A
 
S
D
 
S
Y
 
D
D
 
E
A
 
S
C
 
V
Q
 
A
Q
 
A
G
 
T
V
 
L
A
 
E
D
 
H
V
 
I
E
 
Q
A
 
Q
A
 
H
L
 
L
G
 
G
P
 
Q
V
 
P
D
 
L
V
 
I
V
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
T
 
L
I
 
L
L
 
V
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
D
Q
 
D
M
 
E
W
 
W
K
 
F
E
 
D
V
 
V
M
 
V
D
 
N
T
 
T
N
 
N
L
 
L
G
 
N
G
 
S
C
 
L
F
 
Y
N
 
R
M
 
L
A
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
V
F
 
L
P
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
T
E
 
K
R
 
A
K
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
G
 
G
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
A
A
 
M
G
 
G
Q
 
N
Y
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
G
 
G
I
 
L
H
 
E
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
G
R
 
S
A
 
R
G
 
A
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
x
F
I
|
I
D
 
D
T
|
T
D
 
D
M
|
M
V
x
T
A
 
R
A
 
E
V
 
L
P
 
P
A
 
E
E
 
A
V
 
Q
L
 
R
E
 
E
K
 
A
I
 
L
V
 
L
A
 
G
K
 
Q
I
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
N
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
K
G
 
V
V
 
V
A
 
G
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
G
G
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
T
L
 
V
S
 
P
I
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
H
 
Y
M
 
M

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
42% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 2:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
R
 
K
V
 
S
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
S
I
 
I
S
 
A
V
 
L
A
 
Q
L
 
L
K
 
A
D
 
E
M
 
E
G
 
G
M
 
Y
T
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
V
N
|
N
Y
|
Y
A
|
A
G
|
G
N
x
S
D
 
K
Q
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
E
E
 
A
F
 
V
T
 
V
E
 
E
R
 
E
T
 
I
G
 
K
I
 
A
K
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
F
A
 
A
F
 
I
K
 
Q
W
x
A
D
x
N
V
|
V
A
 
A
D
 
D
Y
 
A
D
 
D
A
 
E
C
 
V
Q
 
K
Q
 
A
G
 
M
V
 
I
A
 
K
D
 
E
V
 
V
E
 
V
A
 
S
A
 
Q
L
 
F
G
 
G
P
 
S
V
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
T
 
L
I
 
L
L
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
E
Q
 
Q
M
 
E
W
 
W
K
 
D
E
 
D
V
 
V
M
 
I
D
 
D
T
|
T
N
 
N
L
 
L
G
 
K
G
 
G
C
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
C
A
 
I
K
 
Q
A
 
K
T
 
A
F
 
T
P
 
P
G
 
Q
M
 
M
R
 
L
E
 
R
R
 
Q
K
 
R
W
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
G
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
A
A
 
V
G
 
G
Q
 
N
Y
 
P
G
 
G
Q
|
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
S
 
A
G
 
G
I
 
V
H
 
I
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
G
 
L
A
 
A
R
 
S
A
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
I
 
I
D
 
V
T
 
S
D
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
D
E
 
E
V
 
L
L
 
K
E
 
E
K
 
Q
I
 
M
V
 
L
A
 
T
K
 
Q
I
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
Q
A
 
D
N
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
N
G
 
T
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
K
G
 
A
G
 
K
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
Q
T
 
T
L
 
I
S
 
H
I
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
H
 
Y
M
 
M

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
43% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 9:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
R
|
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
E
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
A
V
 
E
A
 
L
L
 
L
K
 
A
D
 
E
M
 
R
G
 
G
M
 
A
T
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
G
A
 
T
A
 
A
N
x
T
Y
 
S
A
 
E
G
 
S
N
 
G
D
 
A
Q
 
Q
R
 
A
A
 
I
A
 
S
E
 
D
F
 
Y
T
 
L
E
 
G
R
 
D
T
 
N
G
 
G
I
 
-
K
 
K
A
 
G
F
 
M
K
 
A
W
 
L
D
x
N
V
|
V
A
 
T
D
 
N
Y
 
P
D
 
E
A
 
S
C
 
I
Q
 
E
Q
 
A
G
 
V
V
 
L
A
 
K
D
 
A
V
 
I
E
 
T
A
 
D
A
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
T
 
L
I
 
L
L
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
E
Q
 
E
M
 
E
W
 
W
K
 
S
E
 
D
V
 
I
M
 
M
D
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
G
 
T
G
 
S
C
 
I
F
 
F
N
 
R
M
 
L
A
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
V
F
 
L
P
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
W
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
V
G
 
G
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
A
 
M
G
 
G
Q
 
N
Y
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
G
 
G
I
 
V
H
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
M
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
A
R
 
S
A
 
R
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
I
|
I
D
 
E
T
|
T
D
 
D
M
|
M
V
 
T
A
 
K
A
 
A
V
 
L
P
 
N
A
 
D
E
 
E
V
 
Q
L
 
R
E
 
T
K
 
A
I
 
T
V
 
L
A
 
A
K
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
A
 
P
N
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
S
G
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
P
E
 
E
G
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
T
 
T
L
 
L
S
 
H
I
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
H
 
Y
M
 
M

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
43% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 6:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
R
 
K
V
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
I
S
 
A
V
 
E
A
 
T
L
 
L
K
 
V
D
 
A
M
 
R
G
 
G
M
 
A
T
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
G
A
 
T
A
 
A
N
x
T
Y
 
S
A
 
E
G
 
S
N
 
G
D
 
A
Q
 
Q
R
 
A
A
 
I
A
 
S
E
 
D
F
 
Y
T
 
L
E
 
G
R
 
A
T
 
N
G
 
G
I
 
-
K
 
K
A
 
G
F
 
L
K
 
M
W
x
L
D
x
N
V
|
V
A
 
T
D
 
D
Y
 
P
D
 
A
A
 
S
C
 
I
Q
 
E
Q
 
S
G
 
V
V
 
L
A
 
E
D
 
N
V
 
V
E
 
R
A
 
A
A
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
T
 
L
I
 
L
L
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
D
Q
 
D
M
 
E
W
 
W
K
 
N
E
 
D
V
 
I
M
 
I
D
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
G
 
S
G
 
S
C
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
A
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
V
F
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
R
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
G
 
G
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
A
 
M
G
 
G
Q
 
N
Y
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
S
 
A
G
 
G
I
 
L
H
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
A
R
 
S
A
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
D
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
R
A
 
A
V
 
L
P
 
T
A
 
D
E
 
E
V
 
Q
L
 
R
E
 
A
K
 
G
I
 
T
V
 
L
A
 
A
K
 
A
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
T
A
 
P
N
 
N
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
S
G
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
E
G
 
A
G
 
S
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
T
 
T
L
 
L
S
 
H
I
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
H
 
Y
M
 
M

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
43% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 6:243/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
R
 
K
V
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
x
A
T
x
S
R
|
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
I
S
 
A
V
 
E
A
 
T
L
 
L
K
 
A
D
 
A
M
 
R
G
 
G
M
 
A
T
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
G
A
 
T
A
 
A
N
x
T
Y
 
S
A
 
E
G
 
N
N
 
G
D
 
A
Q
 
Q
R
 
A
A
 
I
A
 
S
E
 
D
F
 
Y
T
 
L
E
 
G
R
 
A
T
 
N
G
 
G
I
 
-
K
 
K
A
 
G
F
 
L
K
 
M
W
 
L
D
x
N
V
|
V
A
 
T
D
 
D
Y
 
P
D
 
A
A
 
S
C
 
I
Q
 
E
Q
 
S
G
 
V
V
 
L
A
 
E
D
 
K
V
 
I
E
 
R
A
 
A
A
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
T
 
L
I
 
L
L
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
D
Q
 
E
M
 
E
W
 
W
K
 
N
E
 
D
V
 
I
M
 
I
D
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
G
 
S
G
 
S
C
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
A
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
V
F
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
R
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
G
 
G
S
 
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
A
 
M
G
 
G
Q
 
N
Y
 
G
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
|
A
A
|
A
A
|
A
K
|
K
S
 
A
G
 
G
I
 
L
H
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
A
R
 
S
A
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
I
|
I
D
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
R
A
 
A
V
 
L
P
 
S
A
 
D
E
 
D
V
 
Q
L
 
R
E
 
A
K
 
G
I
 
I
V
 
L
A
 
A
K
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
A
 
A
N
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
E
G
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
x
E
T
 
T
L
 
L
S
 
H
I
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
H
 
Y
M
 
M

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
43% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 6:243/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
R
 
K
V
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
T
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
I
S
 
A
V
 
E
A
 
T
L
 
L
K
 
V
D
 
A
M
 
R
G
 
G
M
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
G
N
 
T
Y
 
-
A
 
A
G
 
T
N
 
S
D
 
E
Q
 
N
R
 
G
A
 
A
A
 
K
E
 
N
F
 
I
T
 
S
E
 
D
R
 
Y
T
 
L
G
 
G
I
 
A
-
 
N
-
 
G
K
 
K
A
 
G
F
 
L
K
 
M
W
 
L
D
 
N
V
 
V
A
 
T
D
 
D
Y
 
P
D
 
A
A
 
S
C
 
I
Q
 
E
Q
 
S
G
 
V
V
 
L
A
 
E
D
 
N
V
 
I
E
 
R
A
 
A
A
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
T
 
L
I
 
L
L
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
D
Q
 
D
M
 
E
W
 
W
K
 
N
E
 
D
V
 
I
M
 
I
D
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
G
 
S
G
 
S
C
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
A
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
V
F
 
M
P
 
R
G
 
A
M
|
M
R
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
W
 
C
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
G
 
G
S
 
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
A
 
M
G
 
G
Q
 
N
Y
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
S
 
A
G
 
G
I
 
L
H
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
A
R
 
S
A
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
D
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
R
A
 
A
V
 
L
P
 
S
A
 
D
E
 
D
V
 
Q
L
 
R
E
 
A
K
 
G
I
 
I
V
 
L
A
 
A
K
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
A
 
A
N
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
S
G
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
x
A
S
|
S
E
 
D
E
 
E
G
 
A
G
 
S
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
T
 
T
L
 
L
S
 
H
I
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
H
 
Y
M
 
M

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
43% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 5:242/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
R
 
K
V
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
I
S
 
A
V
 
E
A
 
T
L
 
L
K
 
A
D
 
A
M
 
R
G
 
G
M
 
A
T
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
G
A
 
T
A
 
A
N
x
T
Y
 
S
A
 
E
G
 
N
N
 
G
D
 
A
Q
 
Q
R
 
A
A
 
I
A
 
S
E
 
D
F
 
Y
T
 
L
E
 
G
R
 
A
T
 
N
G
 
G
I
 
-
K
 
K
A
 
G
F
 
L
K
 
M
W
 
L
D
x
N
V
|
V
A
 
T
D
 
D
Y
 
P
D
 
A
A
 
S
C
 
I
Q
 
E
Q
 
S
G
 
V
V
 
L
A
 
E
D
 
K
V
 
I
E
 
R
A
 
A
A
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
T
 
L
I
 
L
L
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
D
Q
 
E
M
x
E
W
 
W
K
 
N
E
 
D
V
 
I
M
 
I
D
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
G
 
S
G
 
S
C
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
A
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
V
F
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
R
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
G
 
G
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
A
 
M
G
 
G
Q
 
N
Y
 
G
G
 
G
Q
|
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
G
 
G
I
 
L
H
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
A
R
 
S
A
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
I
|
I
D
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
R
A
 
A
V
 
L
P
 
S
A
 
D
E
 
D
V
 
Q
L
 
R
E
 
A
K
 
G
I
 
I
V
 
L
A
 
A
K
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
A
 
A
N
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
E
G
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
x
E
T
|
T
L
 
L
S
 
H
I
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
H
 
Y
M
 
M

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
42% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 5:242/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
R
 
K
V
 
I
A
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
R
|
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
I
S
 
A
V
 
E
A
 
T
L
 
F
K
 
V
D
 
A
M
 
R
G
 
G
M
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
G
N
 
T
Y
 
-
A
 
A
G
x
T
N
 
S
D
 
E
Q
 
S
R
 
G
A
 
A
A
 
E
E
 
A
F
 
I
T
 
S
E
 
G
R
 
Y
T
 
L
G
 
G
I
 
A
-
 
N
-
 
G
K
 
K
A
 
G
F
 
F
K
 
M
W
 
L
D
x
N
V
|
V
A
 
K
D
 
D
Y
 
A
D
 
Q
A
 
S
C
 
I
Q
 
D
Q
 
S
G
 
V
V
 
L
A
 
A
D
 
S
V
 
I
E
 
R
A
 
A
A
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
T
 
L
I
 
L
L
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
D
Q
 
D
M
 
E
W
 
W
K
 
E
E
 
D
V
 
I
M
 
L
D
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
G
 
T
G
 
S
C
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
A
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
V
F
 
M
P
 
C
G
 
A
M
 
M
R
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
G
 
G
S
 
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
A
 
M
G
 
G
Q
 
N
Y
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
S
 
A
G
 
G
I
 
L
H
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
A
R
 
S
A
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
D
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
R
A
 
A
V
 
L
P
 
T
A
 
D
E
 
D
V
 
Q
L
 
R
E
 
A
K
 
G
I
 
I
V
 
L
A
 
S
K
 
S
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
N
R
 
R
L
 
P
G
 
G
Q
 
D
A
 
A
N
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
S
G
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
E
G
 
A
G
 
G
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
T
 
T
L
 
L
S
 
H
I
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
H
 
Y
M
 
M

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
42% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 5:242/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
R
 
K
V
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
I
S
 
A
V
 
E
A
 
T
L
 
L
K
 
A
D
 
A
M
 
R
G
 
G
M
 
A
T
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
G
A
 
T
A
|
A
N
x
T
Y
 
S
A
 
E
G
 
N
N
 
G
D
 
A
Q
 
Q
R
 
A
A
 
I
A
 
S
E
 
D
F
 
Y
T
 
L
E
 
G
R
 
A
T
 
N
G
 
G
I
 
-
K
 
K
A
 
G
F
 
L
K
 
M
W
x
L
D
x
N
V
|
V
A
 
T
D
 
D
Y
 
P
D
 
A
A
 
S
C
 
I
Q
 
E
Q
 
S
G
 
V
V
 
L
A
 
E
D
 
K
V
 
I
E
 
R
A
 
A
A
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
T
 
L
I
 
L
L
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
D
Q
 
E
M
 
E
W
 
W
K
 
N
E
 
D
V
 
I
M
 
I
D
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
G
 
S
G
 
S
C
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
A
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
V
F
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
R
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
G
 
G
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
A
 
M
G
 
G
Q
 
N
Y
 
G
G
 
G
Q
|
Q
V
 
A
N
 
N
Y
x
F
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
G
 
G
I
 
L
H
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
A
R
 
S
A
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
D
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
R
A
 
A
V
 
L
P
 
S
A
 
D
E
 
D
V
 
Q
L
 
R
E
 
A
K
 
G
I
 
I
V
 
L
A
 
A
K
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
A
 
A
N
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
E
G
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
T
 
T
L
 
L
S
 
H
I
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
H
 
Y
M
 
M

4bo4C Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with n-(2-methoxyphenyl)-3,4- dihydro-2h-quinoline-1-carboxamide at 2.7a resolution (see paper)
44% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 19:254/255 of 4bo4C

query
sites
4bo4C
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
T
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
S
 
A
V
 
L
A
 
E
L
 
L
K
 
G
D
 
R
M
 
L
G
 
G
M
 
A
T
 
V
V
 
V
-
 
I
-
 
G
A
 
T
A
 
A
N
 
T
Y
 
S
A
 
A
G
 
S
N
 
G
D
 
A
Q
 
E
R
 
K
A
 
I
A
 
A
E
 
E
F
 
T
T
 
L
E
 
K
R
 
A
T
 
N
G
 
G
I
 
V
K
 
E
A
 
G
-
 
A
-
 
G
F
 
L
K
 
V
W
 
L
D
 
D
V
 
V
A
 
S
D
 
S
Y
 
D
D
 
E
A
 
S
C
 
V
Q
 
A
Q
 
A
G
 
T
V
 
L
A
 
E
D
 
H
V
 
I
E
 
Q
A
 
Q
A
 
H
L
 
L
G
 
G
P
 
Q
V
 
P
D
 
L
V
 
I
V
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
T
 
L
I
 
L
L
 
V
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
D
Q
 
D
M
 
E
W
 
W
K
 
F
E
 
D
V
 
V
M
x
V
D
 
N
T
 
T
N
 
N
L
|
L
G
 
N
G
 
S
C
 
L
F
 
Y
N
 
R
M
 
L
A
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
V
F
 
L
P
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
T
E
 
K
R
 
A
K
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
G
 
G
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
-
A
 
-
G
 
G
Q
 
N
Y
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
G
|
G
I
 
L
H
 
E
G
|
G
F
|
F
T
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
G
R
 
S
A
 
R
G
 
A
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
D
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
R
A
 
E
V
 
A
P
 
Q
A
 
R
E
 
E
V
 
A
L
 
L
E
 
-
K
 
-
I
 
-
V
 
L
A
 
G
K
 
Q
I
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
N
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
K
G
 
V
V
 
V
A
 
G
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
G
G
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
T
L
 
V
S
 
P
I
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
H
 
Y
M
 
M

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
43% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 9:242/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
A
V
 
E
A
 
L
L
 
L
K
 
A
D
 
E
M
 
R
G
 
G
M
 
A
T
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
G
A
 
T
A
 
A
N
x
T
Y
 
S
A
 
E
G
 
S
N
 
G
D
 
A
Q
 
Q
R
 
A
A
 
I
A
 
S
E
 
D
F
 
Y
T
 
L
E
 
G
R
 
D
T
 
N
G
 
G
I
 
-
K
 
K
A
 
G
F
 
M
K
 
A
W
 
L
D
x
N
V
|
V
A
 
T
D
 
N
Y
 
P
D
 
E
A
 
S
C
 
I
Q
 
E
Q
 
A
G
 
V
V
 
L
A
 
K
D
 
A
V
 
I
E
 
T
A
 
D
A
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
T
 
L
I
 
L
L
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
E
Q
 
E
M
 
E
W
 
W
K
 
S
E
 
D
V
 
I
M
 
M
D
 
E
T
 
T
N
|
N
L
 
L
G
 
T
G
 
S
C
 
I
F
 
F
N
 
R
M
 
L
A
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
V
F
 
L
P
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
W
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
V
G
|
G
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
A
 
M
G
 
G
Q
 
N
Y
 
A
G
 
G
Q
|
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
G
 
G
I
 
V
H
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
M
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
A
R
 
S
A
 
R
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
I
 
I
D
 
E
T
|
T
D
 
D
M
 
M
V
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
N
A
 
D
E
 
E
V
 
Q
L
 
R
E
 
T
K
 
A
I
 
T
V
 
L
A
 
A
K
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
A
 
P
N
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
S
G
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
P
E
 
E
G
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
T
 
T
L
 
L
S
 
H
I
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
H
 
Y
M
 
M

4bnzA Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 1-methyl-n-phenylindole- 3-carboxamide at 2.5a resolution (see paper)
42% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 8:240/241 of 4bnzA

query
sites
4bnzA
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
T
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
S
 
A
V
 
L
A
 
E
L
 
L
K
 
G
D
 
R
M
 
L
G
 
G
M
 
A
T
 
V
V
 
V
-
 
I
-
 
G
A
 
T
A
 
A
N
 
T
Y